Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
2016 ; 13 : 80-86
© J.-C. Kaplan, publié par EDP Sciences, 2016
C’est un clin d’œil appuyé que le dinosaure émé- Doudna il y a à peine 4 ans, le procédé a très vite
rite vous adresse aujourd’hui. Il est déclenché par suscité un intérêt considérable, attesté par l’explo-
une percée méthodologique de première grandeur sion du rythme des publications, qui est passé de
qui bouleverse la donne en matière de biologie fon- 29 articles par mois en 2013 à 115/mois en
damentale et appliquée, myologie comprise. Il 2015, cadence encore doublée pendant le premier
s’agit de CRISPR-Cas9, ce scalpel moléculaire qui trimestre 2016. Comme toute invention majeure,
« fait le buzz » (Encadré 1). En fait, bien plus que la technologie CRISPR-Cas9 suscite non seule-
d’une mode, il s’agit d’une véritable révolution, car ment des espoirs mais des craintes, d’autant plus
en permettant l’édition génomique (Encadré 2) cet médiatisés que les enjeux scientifiques et sociétaux
outil constitue un véritable saut qualitatif. À cet sont considérables.
égard, on peut l’assimiler à ce qu’ont représenté
les enzymes de restriction dans les années 1970 et Un engouement sans précédent
la PCR dans les années 1980. En effet, la dans l’histoire de la biologie
méthode CRISPR-Cas9 permet de modifier à
volonté et à l’endroit désiré la séquence de l’ADN • L’envol de CRISPR
génomique de n’importe quel organisme, aussi Très vite l’outil CRISPR-Cas9 - perfectionné par les
bien ex vivo qu’in vivo, avec une facilité décon- chercheurs de tous bords qui se sont engouffrés dans
certante et à un prix dérisoire. Élaboré par les bio- la brèche ouverte en 2012 par le tandem Emma-
logistes Emmanuelle Charpentier et Jennifer nuelle/Jennifer et ont fait assaut d’ingéniosité pour
80 N 13 JUIN 2016
o
Les cahiers de myologie
DOI : 10.1051/myolog/201613015 Cet article est distribué sous licence « Creative Commons » : http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/deed.fr/,
permettant une ré-utilisation du contenu sans restriction à condition de mentionner clairement la source.
2 Pas de crispation terminologique autour du terme « édition » génomique
Les manipulations génomiques permises par CRISPR-Cas9 consistent à opérer ce que les Anglo-Saxons appellent
CLIN D’ŒIL
un genome editing. L’expression n’est pas traduisible littéralement en français car le mot edition est un faux ami.
En anglais, il désigne la correction d’erreurs typographiques, orthographiques ou syntaxiques, avec, éventuellement,
améliorations ponctuelles du texte au sens où on l’entend pour la révision d’un manuscrit ou d’un jeu d’épreuves
imprimées, ce qui est exactement le but recherché avec CRISPR-Cas9. En français classique, « éditer » signifie publier,
ou faire paraître un texte et éventuellement le diffuser. Parmi les équivalents linguistiquement corrects, les désigna-
tions « modifications ciblées du génome » ou « ingénierie du génome » ont la faveur de l’Académie de Médecine 5.
En fait, il suffit de se reporter au Dictionnaire Historique de la Langue Française d’Alain Rey 6 qui avalise l’acception
anglaise, déjà en vigueur dans le vocabulaire informatique français, pour adopter une fois pour toutes et sans réticence
l’expression « édition génomique ».
l’améliorer 7, 8, 9 -, s’est avéré efficace au-delà de modifications introduites. Parmi les réalisations les
toute espérance. De plus, il est d’exécution facile et plus significatives dans le domaine biomédical voici
son coût est dérisoire comparé à celui des autres quelques exemples spectaculaires donnés dans
procédés de modification génomique ciblée (méga- l’ordre chronologique :
nucléases, protéines à doigt de Zn, effecteur trans- - 2014 : obtention de réarrangements chromoso-
activateurs de type TALEN) qui sont plus coûteux, miques reproduisant des situations observées en
et moins efficaces 10. En l’espace de trois années, il oncologie 23 ;
a été appliqué avec succès dans tous les domaines - 2015 : élaboration de la méthode MCR (Muta-
de la génétique moléculaire et dans un nombre crois- genic Chain Reaction) où une modification hétéro-
sant d’espèces, y compris chez H. sapiens. Il est zygote agit en trans de manière autocatalytique pour
apparu qu’on tenait là un outil d’une formidable obtenir l’homozygotie en court-circuitant la transmis-
puissance utilisable en génomique fondamentale et sion mendélienne 24. Ce procédé d’abord validé chez
appliquée, en biomédecine, en biotechnologie. En la Drosophile a été appliqué chez l’Anophèle vecteur
ce qui concerne l’Homme et les recherches biomé- de l’agent du paludisme. Il permettrait par un méca-
dicales, le premier acquis incontestable a été le pou- nisme appelé « gene drive » 25 d’éliminer complète-
voir de produire n’importe quelle mutation ayant un ment les espèces propageant des maladies parasi-
intérêt médical dans le génome de n’importe quelle taires, et par exemple d’éradiquer le paludisme [22].
espèce animale y compris les primates non- - 2016 : l’année a commencé en fanfare avec les
humains, ceci aux fins d’élargir la panoplie des premiers possibles succès thérapeutiques obtenus
modèles animaux expérimentaux 11. Par exemple, par édition génomique post-natale de modèles ani-
en myologie, l’une des premières réalisations a maux après injection par voie systémique de l’outil
consisté à enrichir la palette des modèles animaux CRISPR-Cas9. Ces POC ont été apportées notam-
de dystrophinopathie (rat 12, singe rhésus 13). ment dans le modèle murin de tyrosinémie 26, et chez
La méthode CRISPR-Cas9 a été très vite utilisée à des la souris mdx modèle murin de dystrophinopa-
fins thérapeutiques et on a assisté à une explosion de thie 27, 28, 29, 30. Dans ce dernier cas, l’édition consistait
travaux visant à apporter des preuves de concept - les à faire sauter l’exon 23 du gène dmd porteur d’une
POC du Clin d’œil précédent 14 - laissant espérer que mutation stop pour rétablir le cadre de lecture. Ici le
l’édition génomique pourrait être exploitée à des fins saut d’exon thérapeutique a lieu au niveau géno-
médicales 15, 16, 17 : (1) pour la correction in situ de mique, c’est donc un exon snipping 31 et non un exon
mutations pathogènes constitutionnelles (maladies skipping lequel intervient au niveau de l’épissage 32.
génétiques monogéniques) ou somatiques (cancers 18) ; L’effet thérapeutique est a priori pérenne dans les
(2) pour la destruction du génome d’agents infectieux myocytes post-mitotiques et une injection unique
viraux (HIV 19, HBV 20, HPV 21) ; (3) pour l’élimination devrait suffire 33. De plus, le génome des cellules satel-
des insectes vecteurs d’organismes pathogènes 22. lites semble être accessible à l’édition [30].
• Quelques pépites dans la moisson de résultats • Une ambiance de ruée vers l’or
obtenus chez l’animal Une véritable course de vitesse s’est engagée entre
Depuis l’article princeps [1], la plupart des les laboratoires académiques renommés, les grands
2 600 publications relatives à CRISPR visent à per- groupes pharmaceutiques. C’est à qui sera le pre-
fectionner la méthode et à démontrer que l’édition mier à apporter sa POC, source d’espoirs thérapeu-
génomique est opérationnelle dans des modèles tiques, et, en attendant la première guérison, source
expérimentaux très variés. Beaucoup moins vont au- de prestige et de brevets. Les start-up fleurissent, les
delà pour analyser les conséquences biologiques des capitaux affluent, Wall-Street est en effervescence.
82 N 13 JUIN 2016
o
Les cahiers de myologie
manque de spécificité (nombreux événements off- contre le mésusage de l’édition génomique chez
target) ; (2) en mettant au premier plan les problèmes l’Homme, l’effort de réflexion ne doit pas se relâcher.
CLIN D’ŒIL
éthiques inhérents aux manipulations du génome Enfin, dans les tout derniers jours du mois d’avril
germinal humain, objectif d’ailleurs revendiqué par 2016, un deuxième sommet international post-Was-
les auteurs. Sur ce dernier point, le succès a été total hington s’est tenu à Paris, suivi d’une réunion de
puisque la publication a soulevé une émotion consi- consensus 57.
dérable au niveau mondial 47. Dans une atmosphère Ce remue ménage n’a pas empêché la Chine d’aller
rappelant l’ère des débuts de la génétique moléculaire de l’avant et de pratiquer une seconde expérience
des années 1970 avec le moratoire de Berg et la d’édition germinale dans des embryons humains non
conférence d’Asilomar en 1975 48, la communauté viables, ciblant cette fois le gène codant le récepteur
scientifique a appelé à une réunion internationale CCR5 pour y introduire la mutation conférant une
pour réfléchir aux inquiétantes potentialités de l’édi- résistance au virus HIV 58, 59. Les résultats on été
tion du génome germinal et, semble-t-il, pour la décevants, prouvant que la technique était loin d’être
bannir 49, 50, 51, 52, 53. Cette réunion a eu lieu à Was- maîtrisée, et les auteurs concluent à la nécessité de
hington en décembre 2015, rassemblant autour des proscrire la pratique de l’édition génomique des
inventeurs et utilisateurs de CRISPR des biologistes embryons tant qu’elle ne serait pas fiable...
de tous bords - dont Paul Berg et David Baltimore déjà
présents à Asilomar exactement 40 ans plus tôt -
ainsi que des juristes, des éthiciens et des représen-
tants de la société civile, y compris les usagers poten-
tiels, en provenance de nombreux pays. On y a
débattu des perspectives bénéfiques de l’édition
génomique germinale et réfléchi aux aspects poten-
tiellement néfastes de ce genre de manipulation en
évoquant le spectre d’un retour à l’eugénisme devenu
moléculaire, voire même d’une utilisation pour des
objectifs transhumanistes 54. Dans sa résolution
finale 55, l’assemblée a considéré que la seule justifica-
tion de l’édition génomique germinale dans l’espèce
humaine était d’ordre cognitif, avec pour objectif de
déchiffrer les mécanismes moléculaires mis en jeu
lors des premières divisions du zygote, et à condition
de ne pas le réimplanter dans un utérus préparé.
Figure 2
Toute édition germinale humaine à des fins reproduc- Janus est le dieu romain des commencements et des fins, des
tives était jugée « irresponsable » dans l’état actuel de choix, du passage et des portes. Il a deux visages (bifrons), l’un
tourné vers l’avenir, l’autre vers le passé. Le symbole est ici
nos connaissances. Bertrand Jordan a judicieuse-
détourné pour représenter la dualité des réactions suscitées
ment résumé ce point de vue en intitulant son article par CRISPR : éclat prométhéen des lendemains qui
« Feu orange pour la thérapie germinale ? » 56. En chantent/peurs cassandresques de lendemains incertains.
© Fubar Obfusco - Foto taken himself, upload to English wikipedia by Fubar Obfusco,
attendant que le sujet mûrisse, la communauté scien- Domaine public, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=177247
84 N 13 JUIN 2016
o
Les cahiers de myologie
récréatif 79, voire criminel. En attendant, il ne serait gagneront des fluxions de poitrine, des pleurésies...
pas étonnant que des aventuriers de la science sans Il est possible qu’une machine locomotive éclate... ;
CLIN D’ŒIL
conscience franchissent le pas, quelque part dans le là, vous auriez à craindre les coups directs et les
global village, en effectuant la réimplantation d’un coups réfléchis ; là, vous auriez à craindre que la
embryon humain édité... « juste pour voir ». Ce serait voûte ne s’éboulât sur vos têtes ! ».
le dernier degré de la réification de l’individu puisque Rapport d’Arago présenté au nom de la commis-
les exemplaires défectueux seraient voués au pilon sion des chemins de fer lors de la première dis-
comme il est d’usage chez les éditeurs. cussion générale à la Chambre, 1838.
2. « There may come a time when, ethically, we
• Moralité en forme de sujet pour le bac philo can’t not do this. » (un jour viendra peut-être où on
Commentez les citations suivantes et expliquez en ne pourra pas ne pas le faire), propos tenus lors du
quoi elles se rapportent au débat actuel portant sur premier colloque sur les incidences éthiques de
CRISPR. CRISPR organisé par J. Doudna en 2015 à Napa
1. En 1838, François Arago, astronome, physicien Valley [73].
et homme politique français, fait part de ses craintes
The Emeritus Dinosaur’s viewpoint
sur la naissance du chemin de fer.
Elation and crispations about CRISPR: when
« Les malheureux voyageurs sont transportés brus-
truth is stranger than science-fiction
quement de la température extérieure dans l’atmo-
sphère glaciale des tunnels... J’affirme sans hésiter
LIENS D’INTÉRÊT
que dans ce passage subit les personnes sujettes à L’auteur regrette de n’avoir aucun lien d’intérêt concernant les
la transpiration seront incommodées, qu’elles données publiées dans cet article.
• Quelques sites web dédiés à CRISPR-Cas9 où l’on trouvera d’excellentes revues générales
Nature genome editing outlook : http://www.nature.com/nature/outlook/genome-editing/
Nature special : http://www.nature.com/news/crispr-1.17547#/Special-sponsored-supplement
Science : http://www.sciencemag.org/tags/crispr
Cell : http://onlinedigeditions.com/publication/frame.php?i=223322&p=&pn=&ver=flex
The Scientist : http://www.the-scientist.com/articles.list/categoryNo/2625/category/The-Scientist/tagNo/6252/
tag/CRISPR-Cas/
25. Gene drive : échappement génétique avec propagation non 53. Caplan AL, et al. No time to waste: the ethical challenges
mendélienne rapide d’un variant génique dans une population created by CRISPR. EMBO Rep 2015 ; 16 : 1421-6.
entière, pouvant aboutir à son extinction en deux générations si le 54. Travis J. Genetic engineering. Germline editing dominates
variant porte une mutation délétère. DNA summit. Science 2015 ; 350 : 1299-300.
26. Yin H, et al. Therapeutic genome editing by combined viral 55. The National Academies of Sciences. Engineering medicine
and non-viral delivery of CRISPR system components in vivo. Nat on human gene editing: international summit statement.
Biotechnol 2016 ; 34 : 328-33. http://www8.nationalacademies.org/onpinews/new-
27. Xu L, et al. CRISPR-mediated genome editing restores dys- sitem.aspx?RecordID=12032015a
trophin expression and function in mdx Mice. Mol Ther 2016 ; 56. Jordan B. Sommet de Washington : feu orange pour la thé-
24 : 564-9. rapie germinale ? Med Sci (Paris) 2016 ; 32 : 217-20.
28. Long C, et al. Postnatal genome editing partially restores dys- 57. https://www.ipscell.com/2016/04/meeting-summary-of-
trophin expression in a mouse model of muscular dystrophy. paris-human-gene-editing-workshop/
Science 2016 ; 351 : 400-3. 58. Kang X, et al. 2016. Introducing precise genetic modifica-
29. Nelson CE, et al. In vivo genome editing improves muscle tions into human 3PN embryos by CRISPR/Cas-mediated genome
function in a mouse model of Duchenne muscular dystrophy. editing. J Assist Reprod Genet. 10.1007/s10815-016-0710-8
Science 2016 ; 351 : 403-7. 59. Callaway E. Second Chinese team reports gene editing in
30. Tabebordbar M, et al. In vivo gene editing in dystrophic mouse human embryos. Nat News 2016 ; 532 : 289-90.
muscle and muscle stem cells. Science 2016 ; 351 : 407-11. 60. http://www.linternaute.com/expression/langue-francaise/
31. Kemaladewi DU, Cohn RD. Exon snipping in Duchenne mus- 19373/voir-les-choses-du-point-de-vue-de-sirius/
cular dystrophy. Trends Mol Med 2016 ; 22 : 187-9. 61. Orkin SH, Motulsky AG. Report and recommendations of the
32. Kaplan JC. DMD et saut d’exon thérapeutique : tout ce qu’il panel toassess the NIH investment in research on gene therapy.
faut savoir en deux leçons. Cahiers de Myologie 2011 (octobre) ; http://www.nih.gov/news/panelrep.html. 7 décembre 1995.
46-47. 62. Sauf les rares exceptions de type SCID décrites dans [11].
33. Ce qui règle le problème de l’immunisation contre les pro- 63. Hawkes N. Cautious welcome for gene editing of Duchenne
téines du vecteur viral, inévitable après injections itératives. muscular dystrophy in animal model. BMJ 2016 ; 351 : h7033.
34. Voir la remarquable synthèse de M. Specter : The gene hac- 64. Cet obstacle pourrait être levé par des astuces permettant
kers The New Yorker. Annals of Science 16 novembre 2015, l’inactivation du bistouri après usage.
consultable sur http://www.moseslab.csb.utoronto.ca/alan/ 65. Peng R, et al. Potential pitfalls of CRISPR/Cas9-mediated
Specter_New_Yorker_2015.pdf genome editing. FEBS J 2016 ; 283 : 1218-31.
35. Begley S (2016). Controversial CRISPR history sets off an 66. Kaiser J. The gene editor CRISPR won’t fully fix sick people
online firestorm. anytime soon. Here’s why. Science 2016. Doi : 10.1126/
https://www.statnews.com/2016/01/19/crispr-history-firestorm/ science.aaf568.
36. Dessibourg O. Guerre des brevets pour la « chirurgie du gène ». http://www.sciencemag.org/news/2016/05/gene-editor-crispr-
Le Temps 22/02/16. http://www.letemps.ch/sciences/ won-t-fully-fix-sick-people-anytime-soon-here-s-why
2016/02/22/guerre-brevets-chirurgie-gene 67. Himeda CL, et al. 2016. CRISPR/dCas9-mediated transcrip-
37. Lander ES. The heroes of CRISPR. Cell 2016 ; 164 : 18-28. tional inhibition ameliorates the epigenetic dysregulation at D4Z4
38. Hall J. The embarrassing, destructive fight over biotech’s big and represses DUX4-fl in FSH muscular dystrophy. Mol Ther 24 :
breakthrough. Scientific American 2016 (4 février). 527-535.
39. Begley S. 2016. Controversial CRISPR history sets off an 68. Kaplan JC. Le génome low cost : entre Cassandre et Promé-
online firestorm. Site internet statnews. https://www.stat- thée. Clin d’œil. Cahiers de Myologie 2010 ; no 10 : 43-5.
news.com/2016/01/19/crispr-history-firestorm/ 69. La formule est de Hervé Chneiweiss, Président du Comité
40. Oye KA, et al. Regulating gene drives. Science 2014 ; 345 : d’Éthique de l’Inserm.
626-8. 70. https://fr.wikipedia.org/wiki/Le_Hasard_et_la_
41. Esvelt KM (2016). Strategies for responsible gene editing. N%C3%A9cessit%C3%A9
https://www.project-syndicate.org/commentary/crispr-gene- 71. https://fr.wikipedia.org/wiki/Livre_de_la_Gen%C3%A8se
drive-editing-rules-by-kevin-m--esvelt-2016-01 72. Regalado A. Patients favor changing the genes of the next
42. Wu Y, et al. Correction of a genetic disease by CRISPR- generation with CRISPR. MIT Technology Review 2015 ;
Cas9-mediated gene editing in mouse spermatogonial stem cells. december 2, 2015. (http://www.technologyreview.com/biomedi-
Cell Res 2015 ; 25 : 67-79. cine/).
43. Maury Y, et al. Les cellules souches pluripotentes humaines : 73. Jennifer Doudna a relaté ses angoisses d’apprentie-sorcière
un outil-clé pour décrypter les mécanismes physiopathologiques. dans Doudna J. Genome-editing revolution: my whirlwind year
Med Sci (Paris) 2011 ; 27 : 443-6. with CRISPR. Nature 2015 ; 528 : 469-71.
44. Li HL, et al. Precise correction of the dystrophin gene in 74. Church G (2015). A conversation with George Church on
duchenne muscular dystrophy patient induced pluripotent stem genomics and germline human genetic modification.
cells by TALEN and CRISPR-Cas9. Stem Cell Rep 2015 ; 4 : https://www.ipscell.com/2015/03/georgechurchinterview/
143-54. 75. Church G. Encourage the innovators. Nature 2015 ; 528 :
45. Xue H, et al. Genetic modification in human pluripotent stem S7.
cells by homologous recombination and CRISPR/Cas9 system. 76. George Church est non seulement un savant incontestable
Meth Mol Biol 2016 ; 1307 : 173-90. mais aussi un businessman avisé dans le domaine de la génomique,
46. Liang P, et al. CRISPR/Cas9-mediated gene editing in human voire de la génomancie.
tripronuclear zygotes. Protein Cell 2015 ; 6 : 363-72. 77. Voir l’analyse très pertinente donnée par le spécialiste de bioé-
47. Cyranoski D, Reardon S. Embryo editing sparks epic debate. thique Hank Greely dans son compte rendu de la première réunion
Nature 2015 ; 520 : 593-4. organisée sur le sujet en janvier 2015. Greely HT. Of science,
48. Berg P. Meetings that changed the world. Asilomar 1975: CRISPR-Cas9, and Asilomar, April 4, 2015.
DNA modification secured. Nature 2008 ; 455 : 290-1. https://law.stanford.edu/2015/04/04/of-science-crispr-
49. Lanphier E, et al. Don’t edit the human germ line. Nature cas9-and-asilomar/#comments
2015 ; 519 : 410-1. 78. Doudna J. Embryo editing needs scrutiny. Nature 2015 ;
50. Ledford H. CRISPR, the disruptor. Nature 2015 ; 522 : 528 : S6.
20-4. 79. Allusion aux micro-cochons fabriqués en Chine comme ani-
51. Doudna J. Embryo editing needs scrutiny. Nature 2015 ; maux d’agréments. Cyranoski D. Gene-edited “micropigs” to be
528 : S6. sold as pets at Chinese institute. Nature 2015 ; 526 : 18.
86 N 13 JUIN 2016
o
Les cahiers de myologie