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Chapitre 16

Traduction de
l’information génétique
- Les outils nécessaires à la traduction
- Mécanisme de la traduction chez les eucaryotes : les
différentes étapes et les différentes protéines mises en
jeu
- Niveaux de régulation de la traduction
- Les principales modifications post-traductionnelles (en
complément de ce qui a été traité dans le chapitre 7)

Pr. Rajaa CHAHBOUNE


Le code génétique

• L’ADN est un groupe de symboles permettant de transmettre


une information.
• L’ADN est une information sous forme codée.

Ø C’est le code génétique

5’ ATATGCCCAAGTTTCCGAGCTGACGGGACTTGA 3’
ADN
3’ TATACGGGTTCAAAGGCTCGACTGCCCTGAACT 5’

Protéine Ile Cys Pro Ser Phe Arg Ala Asp Gly Thr STOP
Le code génétique

- 4 bases vs 20 acides aminés


lecture des bases 1 à 1 : 41 = 4 combinaisons
lecture des bases 2 à 2 : 42 = 16 combinaisons
lecture des bases 3 à 3 : 43 = 64 combinaisons

Ø Motif élémentaire de lecture : le codon formé par 3


nucléotides.
Ø Chaque triplet de nucléotides sur l’ARN correspond à un
acide aminé.
Le code génétique
Le code génétique

Ø code spécifique
1 codon = 1 aa

Ø code dégénéré
1 aa = 1 à 6 codons

Ø code ponctué
- codon initiateur
- 3 codons stop

Ø code « universel » : A l’exception du codon UGA (stop) = trp dans la


mitochondrie…
Traduction
• La traduction est la lecture d’un ARN messager (ARNm) pour
synthétiser une protéine dont la structure primaire est déterminée par
celle de l’ARNm.
• L’ARNm est « lu » par groupe de trois nucléotides (appelés codons).
• Chaque triplet de nucléotides sur l'ARN correspond à un acide aminé.

Comment? Quel sont les intervenants?


Les molécules informationnelles de la
traduction

1. Les ARNm:
- Synthèse rapide par ARN pol II.
- Nombre, taille et durée de vie des transcrits variable.
- Association fonctionnelle avec ARNr et ARNt.
2. Les ARNr:

- L'ARN ribosomal (ARNr) est le composant central du ribosome.


- La fonction de l'ARNr est de fournir un mécanisme de décodage
d'ARNm en acides aminés.
C’est dans
le nucléole que se
déroule l’essentiel
des étapes de la
biogenèse des
ribosomes.
Ribosomes
• Les ribosomes sont des structures au niveau desquelles la
biosynthèse des protéines s’effectue.
• Les ribosomes sont formés de deux sous-unités: une petite et une
grande.
• Chaque unité est formée d'un mélange d'ARNr et de protéines
(~ 60% ARNr et 40% protéines)
• Les sous-unités sont assemblées dans le ou les nucléole(s) du noyau
(les nucléoles sont des points plus sombres visibles au microscope
dans le noyau).
Structure du ribosome

Exit (Site de liaison de l’ARNt-Peptidyl)


(Site de liaison de
l’ARNt-aminoacyl)
3. Les ARNt:
- 70 à 95 nt avec de nombreuses bases modifiées.
- ≈ 50 % des bases « appariées » .
- Pi en 5’, boucles DHU, anticodon, TΨC, CCA en 3 ’, sites de
reconnaissance par l’amino-acyl ARNt synthétase.

amino-acyl ARNt
synthétase
Spécificité des ARNt et des aminoacyl- ARNt
synthétases

Ø L'acide aminé est attaché au bon ARNt par l'enzyme aminoacyl-ARNt


synthétase.
Ø Il existe plusieurs sortes d’aminoacyl-ARNt synthétase. Chacune peut
attacher un acide aminé particulier à un ARNt particulier.
Reconnaissance codon vs acide aminé

Ø La reconnaissance de l’acide aminé est indépendante de


l’anticodon.
Ø C’est la conformation spatiale de l’ARNt qui permet la
reconnaissance du bon enzyme amino-acyl ARNt synthétase pour
permettre la fixation au bon acide aminé.
3’ 5’ 3’ 5’
Cystéine Alanine

Mutation de
l’ARNtcys

ACG ACG

anti-codon cystéine
• Pour synthétiser la protéine, il faut aussi des ARN de transfert (ARNt)
qui se comportent comme des adaptateurs entre l’ARNm et les
acides aminés.
• L’ARNt amène des acides aminés au complexe ribosome-ARNm où
ils seront polymérisés en chaînes protéiques.
• Chaque codon de l'ARNm (5’---3’) correspond à un anti-codon
spécifique de l'ARNt (3’---5’).
• Chaque anti-codon correspond à un acide aminé spécifique.
Activation des acides aminés par les amino-acyl ARNt
synthétases
Initiation de la traduction chez les eucaryotes

Les grandes et les petites sous-


unités ribosomales qui ne sont
pas activement engagées dans
la traduction sont séparées par
la liaison de deux facteurs
d'initiation, eIF3 et eIF6
(Eukaryotes Initiation Factor).

1- Un complexe de pré-initiation
de traduction est formé lorsque
le complexe sous-unité 40S –
eIF3 est lié à eIF1A et à un
complexe ternaire de Met-
ARNti, eIF2 et GTP.
Initiation de la traduction chez les eucaryotes

• Au cours de l'initiation de la
traduction, la coiffe 5’ d'un
ARNm à traduire est liée à la
sous-unité eIF4E du
complexe de liaison de la
coiffe eIF4.

2- Le complexe ARNm-eIF4
s'associe ensuite au complexe
de pré-initiation via une
interaction de la sous-unité
eIF4G et de eIF3, formant le
complexe d'initiation.
Initiation de la traduction chez les eucaryotes

3- Le complexe d'initiation glisse ou


scanne l'ARNm associé, car l'activité
hélicase de eIF4A utilise l'énergie de
l'hydrolyse de l'ATP pour dérouler la
structure secondaire de l'ARN.

• La numérisation s'interrompt
lorsque l'anti-codon de l'ARNt Met
reconnaît le codon de départ, qui
est le premier AUG en aval de
l'extrémité 5’ de la plupart des
ARNm eucaryotes.

• La reconnaissance du codon
d'initiation conduit à l'hydrolyse du
GTP associé à eIF2, une étape
irréversible qui empêche tout
balayage supplémentaire.
Initiation de la traduction chez les eucaryotes

4- Une fois que la petite sous-unité


ribosomale avec son Met-ARNt lié
est correctement positionnée au
codon de départ, l'union avec la
grande sous-unité ribosomale (60S)
achève la formation d'un ribosome
80S.

• Cela nécessite l'action d'un autre


facteur (eIF5) et l'hydrolyse d'un
GTP qui lui est associé.

• Pendant l'élongation de la
chaîne, le polypeptide en
croissance reste attaché à l'ARNt
au niveau de ce site P dans le
ribosome.
Élongation de la traduction chez les eucaryotes

1- L'aminoacyl-ARNt est introduit dans


le ribosome en tant que complexe
ternaire en association avec EF1GTP
et devient lié au site A.

2- Si l'anticodon du deuxième
aminoacyl-ARNt est complémentaire
en paires de bases avec le deuxième
codon de l'ARNm, le GTP dans le
EF1GTP associé est hydrolysé.

L'hydrolyse du GTP favorise un


changement de conformation du
ribosome qui conduit à une liaison
étroite de l'aminoacyl-ARNt dans le
site A et à la libération du complexe
EF1GDP obtenu.
Élongation de la traduction chez les eucaryotes
3- Avec le Met-ARNti sur le site P et le
deuxième aminoacyl-ARNt étroitement
lié au site A, le groupement amine du
deuxième acide aminé réagit avec la
méthionine sur l'ARNt initiateur,
formant une liaison peptidique.

4- Le ribosome est transloqué le long


de l'ARNm sur une distance égale à
un codon. Cette étape de translocation
est favorisée par l'hydrolyse du GTP
dans EF2GTP. À la suite de la
translocation, l'ARNt Met, maintenant
sans sa méthionine, est déplacé vers
le site E du ribosome et le deuxième
ARNt, maintenant lié de manière
covalente à un dipeptide, est déplacé
vers le site P.
Terminaison de la traduction
• La dernière étape de la traduction,
comme l’initiation et l’élongation,
nécessite des signaux moléculaires très
spécifiques qui déterminent le sort du
complexe ARNm – ribosome – ARNt-
peptidyle. Deux types de facteurs de
relâchement de protéines (RF)
spécifiques ont été découverts.

• Le Facteur de relâchement (Release


Factor) eRF1, dont la forme est similaire
à celle des ARNt, agit en se liant au site
ribosomal A et en reconnaissant
directement les codons d'arrêt.
Le second facteur, eRF3, est une
protéine liant le GTP. ERF3-GTP agit
avec eRF1 pour favoriser le clivage du
peptidyl-ARNt, libérant ainsi la chaîne
protéique terminée.
Coût énergétique de la synthèse
protéique
Synthèse protéique: polyribosomes

Ø Pour accroître l’efficacité du


système de traduction, les
ribosomes peuvent s’assembler
en polyribosomes sur un même
ARNm permettant une synthèse
simultanée de plusieurs chaînes
protéiques.
Synthèse protéique
Synthèse protéique au niveau du RER
Inhibiteurs de la traduction
Phases de lectures

• Supposons la séquence nucléotidique suivante, quelle est la


séquence du polypeptide produite par cet ARNm?
5’ ATAAGCCCAAGTTTCCGAGCTGACGGGACTTGA 3’
ADN
3’ TATTCGGGTTCAAAGGCTCGACTGCCCTGAACT 5’

ARNm 5’ AUA AGC CCA AGU UUC CGA GCU GAC GGG ACU UGA 3’

Protéine Ile Ser Pro Ser Phe Arg Ala Asp Gly Thr Stop
Phases de lectures

• Mais, cet ARNm peut être traduit autrement:

5’ A TAA GCC CAA GTT TCC GAG CTG ACG GGA CTT GA 3’
ADN
3’ T ATT CGG GTT CAA AGG CTC GAC TGC CCT GAA CT 5’

ARNm 5’ A UAA GCC CAA GUU UCC GAG CUG ACG GGA CUU GA 3’

Protéine Stop Ala Gln Val Ser Glu Leu Thr Gly Leu
Phases de lectures

• Ou:

5’ AT ATG CCC AAG TTT CCG AGC TGA CGG GAC TTG A 3’
ADN
3’ TA TAC GGG TTC AAA GGC TCG ACT GCC CTG AAC T 5’

ARNm 5’ AU AUG CCC AAG UUU CCG AGC UGA CGG GAC UUG A 3’

Protéine Met Pro Lys Phe Pro Ser Stop


Régulation de l’expression génique chez les
eucaryotes

La régulation de toute voie métabolique est à plusieurs niveaux pour ne pas


synthétiser d’intermédiaires inutiles.
• Pour l’expression d’un gène, la régulation à lieu à quatre niveaux :
1. lors de la transcription (Régulation transcriptionnelle)
2. lors de la maturation du transcrit (Régulation post transcriptionnelle)
3. lors de la traduction (Régulation traductionnelle)
4. lors de l’activation de la protéine mature (Régulation post traductionnelle)
• Le point de contrôle principal est la transcription
Niveaux de régulation de l’expression

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