Université Paris Cité 2022-23 1

Physique pour biologistes

TD 3 : Dynamique

À apprendre dans ce TD :
— Principe fondamental de la dynamique
— Force de rappel d’un ressort
— Les primitives

1 Microscope à force atomique

Un microscope à force atomique (AFM) permet de mesurer les propriétés de forces de type
élastique de biomolécules (protéines, ADN). Il s’agit de déterminer la relation entre la force
appliqué à a molécule et son allongement. L’élasticité des biomolécules intervient dans de
nombreux processus cellulaires (par exemple à chaque fois que des enzymes agissent pour
couper des molécules d’ADN, les forces de tension dans celles-ci déterminent les conforma-
tions adoptées).

L’AFM consiste en une fine tige dont la déformation permet contrôler la force F exercée sur
une molécule à laquelle elle est attachée. La variation de la position de la pointe permet de
déterminer l’allongement de la molécule sur laquelle on tire.
La molécule dont on veut étudier l’élasticité ne peut pas en général se fixer directement sur la
tige de l’AFM. Une protéine de liaison cellulaire est nécessaire pour établir le contact (servir
de colle !). Cette molécule de liaison possède elle même une certaine élasticité.
Pour représenter simplement ce système, on utilise un modèle
de deux ressorts en série attachés d’un côté sur un substrat fixe
F
et de l’autre étiré sous l’effet d’une force de traction F⃗ (force
appliquée par la pointe de l’AFM, voir figure). La molécule d’in- F l2 k2
Pointe
térêt, dont on veut déterminer la raideur, est représentée par AFM
un ressort de constante k1 et longueur à vide l10 attaché à un l1 k1
support ; un second ressort de raideur k2 et longueur à vide l20 ,
supposée connue, relie la molécule à la la tige exerçant la force Substrat Substrat
F et représente la molécule d’adhésion. L’ordre de grandeur
des longueurs et des forces mises en joue est respectivement d’une dizaines de nanomètres et
d’une centaine de piconewton.

a) Dessinez les forces dans chaque ressort et sur le substrat.

b) Exprimez l’allongement de chaque ressort en fonction de la norme F de la force, k1 , k2 et

en notant l1 , l2 les longueurs respectives des deux ressorts sous l’effet de la force de traction.
Exprimez la raideur inconnue k1 en fonction de l’allongement l1 − l10 de la molécule.

c) On ne peut pas mesurer directement l1 − l10 . Mais la position de la pointe de l’AFM

permet de mesurer la longueur totale d du système des deux ressorts (dont on notera d0 la
longueur à vide).
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Dans quelle limite des paramètres peut-on considérer que l’allongement total est dominé par
l’allongement de la molécule étudiée (càd d − d0 ∼ l1 − l10 ) ?

Expliquez comment dans cette limite, en tirant sur le système avec une force F connue, et
en mesurant l’allongement total on peut déterminer la raideur k1 du premier ressort.

d) En utilisant le résultat de la partie c), quelles sont les propriétés que l’on souhaiterait
avoir pour le lien moléculaire fixant la molécule étudiée à la pointe de l’AFM ?

2 Attention aux genoux !

Une personne se tient verticalement sur un support rigide. Sa masse est de 80 kg environ.
1. Quelle est la valeur de la force exercée par la personne sur le support ? Quel est son
sens le long de la verticale ?
2. Quelle est la valeur de la force exercée par le support sur la personne ? Quel est son
sens le long de la verticale ?
3. Une trappe dans le support s’ouvre sous les pieds de la personne. Quelle force s’exerce
sur la personne : quelle est sa valeur et son sens ? Ecrivez l’équation du PFD qui
s’applique ici.
4. On considère que le support est à 1 m du sol avant que la trappe ne s’ouvre. Supposant
que sa vitesse initiale au moment de l’ouverture est nulle, quelle est la vitesse de la
personne au moment où ses pieds touchent le sol ?
5. Décrivez qualitativement ce qui se passe quand un objet légèrement déformable (comme
une balle, ou une bouteille plastique ou un cartilage) heurte une surface dure (à vitesse
suffisamment modérée pour ne pas détruire les objets).
6. Supposant que la personne chute avec les jambes raides (pas de flexion des genoux) et
que le choc avec le sol dure 50 ms entre le premier contact avec le sol et l’arrêt de tout
mouvement et déformation.
(a) Quelle est l’accélération subie par la personne dans ce choc ?
(b) Déduisez-en la force ressentie par la personne durant le choc.
(c) Quelle est la force exercée sur le sol ?
(d) Lors du choc avec le sol, les cartilages des genoux ont une élasticité caractérisée par
une constante de raideur k = 4.105 N/m et se compriment. Calculer la compression
du cartilage lors d’une chute de 1 m. On indique que l’épaisseur de cartilage dans
les genoux est d’environ 4 mm. Conclusions

3 Les Primitives
Calculer les primitives des fonctions suivantes, où A, B, r, ω sont des constantes :
1. f (t) = Atr
2. f (t) = Aeωt
3. f (t) = Aeωt + Btr
4. f (t) = A cos ωt
5. f (t) = A sin(ωt + ϕ)
B
6. f (t) = 1+t
7. f (t) = At + Bt2 + rt3