Résumé:

La mondialisation a intensifié l'exploitation de nos ressources naturelles, causant une pollution

environnementale. La phytoremédiation, une forme de bioremédiation utilisant les plantes pour éliminer
les polluants, est cruciale pour remédier à cette situation. La restauration des écosystèmes et la
préservation de l'équilibre écologique sont primordiales. Les hydrocarbures polyaromatiques issus de
diverses industries polluent l'environnement, mais des méthodes telles que la rhizofiltration et la
phytoextraction avec des plantes comme la moutarde indienne et le saule peuvent les éliminer. Ce
chapitre explorera ces méthodes.

introduction:

Les changements économiques drastiques et les avancées technologiques intenses ont conduit au
progrès de l'humanité. Presque toutes les industries œuvrant à l'utilisation des ressources et à
l'amélioration des produits/services mettent quotidiennement de nouveaux produits sur le marché. À
mesure que les ressources s'épuisent, l'équilibre écologique est perturbé. De nombreuses ONG et des
militants sociaux travaillent à y remédier. Malgré toutes ces actions menées, l'environnement se trouve
contaminé. Les contaminants se présentent sous différentes formes, allant des déchets solides aux gaz
toxiques émis par les industries, les réacteurs et les centrales électriques. Les hydrocarbures
aromatiques polycycliques (HAP), composés de carbone et d'hydrogène, se sont révélés toxiques pour
les organismes et les êtres humains. Une exposition prolongée aux HAP entraîne des maladies rénales et
hépatiques. Le Centre de contrôle et de prévention des maladies affirme que les humains deviennent
susceptibles aux HAP lorsqu'ils inhalent les gaz d'échappement des véhicules ou consomment des
aliments grillés. Bien que les HAP soient excrétés par l'urine et les selles, il existe une possibilité de
présence microscopique de HAP dans le corps. À long terme, cette accumulation entraîne des maladies
graves comme le cancer. Lorsque les humains entrent en contact avec les HAP, que ce soit par inhalation
ou par la consommation de produits chimiques contenant des HAP, cela peut causer des cancers (cancer
de la peau, cancer de l'estomac et cancer du poumon). Cela a été prouvé lors de tests sur des animaux
de laboratoire.

Les contaminants d'hydrocarbures polyaromatiques sont la principale caractéristique à contrôler ;

différentes méthodes de restauration pourraient être mises en œuvre pour prévenir cette
contamination. Les HAP peuvent être classés en :

(a) HAP à poids moléculaire élevé - ayant quatre anneaux ou plus, peuvent dépendre du sol et des
sédiments ; également difficilement dégradables par les microbes en raison de leur hydrophobicité ;
peuvent être nocifs pour les cellules bactériennes.

(b) HAP à poids moléculaire faible - ayant deux ou trois anneaux ; leur nature volatile et soluble les rend
hautement dégradables.
En incluant les aspects de la bioremédiation dans les traitements de contamination, diverses stratégies
ont été développées pour limiter les effets intrusifs (Sandeep et al. 2015). Les HAP se trouvent dans le
charbon, le pétrole brut et sont également émis lors de la combustion de charbon, de déchets ou de
tabac brûlé ; en tant que réserves naturelles. En raison de leur faible biodégradation et de leur
hydrophobicité, ils s'accumulent facilement dans l'environnement, rendant leur contrôle obligatoire (Sun
et al. 2008) ; l'impact sur l'environnement doit être pris en compte et traité rapidement, car cela pourrait
entraîner des impacts graves (Dua et al. 2002). Statistiquement, la contribution des HAP à la pollution
mondiale s'élève à environ 90 %, car elle résulte de nombreuses activités de combustion de matières
organiques à la surface du sol (Andreoni et Gianfreda 2007).

Les HAP couramment trouvés comprennent l'anthracène, le naphtalène, le fluorène et le pyrène. Les
hydrocarbures aromatiques polycycliques sont utilisés dans les plastiques, les colorants et certains
médicaments. On les trouve dans le sol, l'eau et l'air. La contamination du sol ouvre la voie aux HAP pour
pénétrer dans la nappe phréatique, qui atteint à son tour les terres domestiques (Fig. 9.1). Toutes ces
ressources naturelles se retrouvent contaminées, entraînant l'apparition de différentes maladies chez les
organismes. Les centrales électriques et les industries ont des points de contrôle pour surveiller la
quantité de HAP libérée dans l'atmosphère. Les contaminants de HAP dans le sol nécessitent une
remédiation pour éviter d'affecter la croissance des arbres et les nappes phréatiques. La remédiation par
des méthodes/techniques biologiques est actuellement à la mode et s'avère efficace.

"9.2 Mode opératoire des types de remédiation et des HAP

Selon la méthode par laquelle les HAP sont dégradés ou métabolisés en complexes plus simples, il existe
quelques types de remédiation. La technique la plus courante est la phytodégradation ou la
phytotransformation, qui implique que les plantes métabolisent les contaminants organiques par une
absorption directe depuis le sol (Edwards et al. 2011). Avec l'aide des racines et de leurs nodules, la
capacité de dégradation des microbes est améliorée dans la rhizosphère. Ce type est appelé
rhizodégradation/rhizorémédiation (Corgie et al. 2003). L'action de dégradation par les microbes peut
également être augmentée par le compostage (Barker et Bryson 2002). La non-polarité, l'hydrophobicité
et le lien fort avec la fraction organique du sol limitent l'absorption par les plantes et l'accumulation des
contaminants (Kim et al. 2001). Les propriétés du sol, les concentrations, les facteurs environnementaux
et les propriétés des contaminants sont des facteurs clés qui influencent l'absorption, l'accumulation et
l'absorption des HAP par les plantes (Kapusta et al. 2004). Diverses méthodologies sont développées
pour permettre une bioremédiation efficace de la contamination par les HAP dans l'environnement
naturel. L'utilisation de microbes et de microorganismes génétiquement modifiés qui utilisent les
hydrocarbures comme seule source de carbone et d'énergie s'est révélée significative (Liste and
Felgentreu 2006; Liang et al. 2011). Des recherches ultérieures affirment et prouvent que les microbes
tels que les bactéries et les champignons, associés aux plantes, contribuent à la réduction significative
des contaminants de HAP dans l'environnement (Fig. 9.2).
Cependant, des bactéries telles qu'Alcaligenes, Arthrobacter, Bacillus, Micrococcus, Mycobacterium et
Pseudomonas jouent un rôle vital et ont été trouvées pour améliorer la croissance des plantes,
augmentant ainsi le processus de phytoremédiation (Couilleror et al. 2013) (Tejeda-Agredano et al.
2013). Des expériences en laboratoire humide menées par les chercheurs ont prouvé l'efficacité de la
bioremédiation des sols contaminés par les HAP (Ciesielczuk et al. 2014). Lorsque Azospirillum et
d'autres espèces bactériennes sont utilisées avec des plantes inoculées déclarant que le sol a été
presque entièrement débarrassé des contaminants, il est essentiel de réaliser des tests de toxicité
appropriés pour confirmer cela (Mendonca and Picado 2002). La phytoremédiation est l'un des différents
types de processus de remédiation impliquant des plantes pour éliminer les contaminants de
l'environnement, en particulier du sol. Les HAP, l'un des contaminants organiques du sol, peuvent être
éliminés directement ou indirectement. Directement - les HAP sont dégradés par l'action d'enzymes.
Indirectement - création d'un environnement favorable pour les microbes qui aident à la dégradation des
HAP à un taux accru (Rasmussen and Olsen 2004).

La phytoremédiation, en tant que technologie émergente, présente plusieurs avantages car elle utilise
les plantes pour modifier de manière écologique les caractéristiques des contaminants. Les divers
moyens de phytoremédiation incluent la volatilisation, la rhizorémédiation, la phytotransformation, la
phytostabilisation et le contrôle hydraulique. L'incorporation de contaminants en molécules simples
dégradées dans les tissus végétaux est appelée phytodégradation (également connue sous le nom de
phytotransformation) (Newman and Reynolds 2004). L'utilisation de nutriments inorganiques avec E.
crassipes a été trouvée pour donner une dégradation et une phytodégradation combinées, devenant
ainsi une approche innovante largement acceptée (Gupte et al. 2016) (Fig. 9.3; Tableau 9.1).

Les plantes supérieures sont utilisées pour dépolluer et reverdir les sites pollués par phytoremédiation
(Robinson et al. 2009). La phytoremédiation comprend des processus simples qui diffèrent selon la
capacité des plantes à éliminer, immobiliser ou dégrader les contaminants."

9.3 Phytoremédiation et ses techniques

La phytoremédiation peut être définie comme "l'utilisation planifiée de plantes vertes pour éliminer,
contenir ou rendre inoffensifs des contaminants environnementaux tels que les métaux lourds, les
éléments traces, les composés organiques et les composés radioactifs dans le sol ou l'eau" (Hinchman et
al. 1998). Le taux de réussite des techniques de phytoremédiation est déterminé par la quantité de
composés mères éliminés, en ignorant leurs métabolites. La responsabilité des métabolites est observée
comme étant la toxicité pour les organismes biologiques. Il est donc essentiel que les contaminants
soient détoxifiés pour prévenir les risques élevés pour les organismes. Avant de déclarer que le sol a été
presque entièrement débarrassé des contaminants, il est essentiel de réaliser des tests de toxicité
appropriés pour confirmer cela (Mendonca and Picado 2002).
La phytoremédiation est l'un des différents types de processus de remédiation impliquant les plantes
pour exclure les contaminants de l'environnement, en particulier du sol. Les HAP, l'un des contaminants
organiques du sol, peuvent être éliminés directement ou indirectement. Directement - les HAP sont
dégradés par l'action d'enzymes. Indirectement - création d'un environnement favorable pour les
microbes qui aident à la dégradation des HAP à un taux accru (Rasmussen and Olsen 2004).

La phytoremédiation, en tant que technologie émergente, présente plusieurs avantages car elle utilise
les plantes pour modifier de manière écologique les caractéristiques des contaminants. Les différents
moyens de phytoremédiation incluent la volatilisation, la rhizorémédiation, la phytotransformation, la
phytostabilisation et le contrôle hydraulique. L'incorporation de contaminants dégradés en molécules
simples dans les tissus végétaux est appelée phytodégradation (également connue sous le nom de
phytotransformation) (Newman and Reynolds 2004). L'utilisation de nutriments inorganiques avec E.
crassipes a été trouvée pour donner une dégradation et une phytodégradation combinées, devenant
ainsi une approche innovante largement acceptée (Gupte et al. 2016) (Fig. 9.3; Tableau 9.1).

Des plantes supérieures sont utilisées pour nettoyer et reverdir les sites pollués par la phytoremédiation
(Robinson et al. 2009). La phytoremédiation comprend des processus simples qui diffèrent selon la
capacité des plantes à éliminer, immobiliser ou dégrader les contaminants.

9.5.2 Méthodologies pour l'estimation des HAP

Les protocoles adoptés pour évaluer et étudier les effets toxiques des HAP par Altschul et al. (1997)
comprenaient la méthode de numération sur plaque, l'isolement des souches et la distinction des
cultures bactériennes. Des échantillons positifs alternatifs de boue, 15 mL chacun, ont été prélevés pour
surveiller l'évolution microbienne correspondante. Pour le décompte observé des spécimens bactériens,
des moratoires ont d'abord été établis pour permettre la séparation distincte du sédiment et du culot.
Ensuite, 0,1 mL du surnageant clair a été prélevé pour effectuer une dilution sériée décimale de dix pour
les plaques ensemencées avec un milieu GAE (asparagine, glucose, extrait de levure) (composé de 10 g/L
de glucose ; 0,5 g/L d'extrait de levure ; 1 g/L de L-asparagine ; 20 g/L d'agar ; 0,01 g/L de FeSO4 ; 0,5 g/L
de MgSO4.7H2O). Ensuite, les plaques annexées ont été incubées pendant environ 48 à 72 heures à une
température de 30 °C. Les colonies viables observées ont ensuite été stoppées et indiquées en tant
qu'unités formant des colonies par ml (UFC/ml). Suite aux étapes subséquentes du protocole, les
morphologies perceptibles des colonies ont été stipulées sur la base de leur abondance relative. Par la
suite, elles ont été affinées dans le substratum catalogué similaire jusqu'à ce que leur pureté soit
modérée. Les bactéries purifiées obtenues ont été séquencées consécutivement par le gène 16S rDNA
après amplification du gène par réaction de polymérisation en chaîne (PCR) en utilisant un MinicyclerTM
(MJ research). Une séquence d'ADN bactérien 16S presque complète (1500 pb) a été amplifiée en
recrutant les amorces 27F et 1492R (Ikenaga et al. 2002) et purifiée avec le kit de purification d'ADN PCR
et de bande de gel GFXTM (Amersham Biosciences) pour le séquençage automatisé de l'ADN. Par la
suite, les séquences d'ADN 16S ont été exprimées comme un profil similaire disposé en tant que
ribotype unique. Un échantillon exclusif de chaque ribotype a été considéré pour le séquençage, aux
côtés des séquences d'ADN 16S précédemment obtenues, en utilisant un Analyseur Génétique ABI
PrismTM 3100 (Perking Elmer). Ensuite, une comparaison avec les séquences de la base de données
GenBank a été réalisée à l'aide de l'outil de recherche d'alignement local de base (BLAST) du Centre
national d'information sur la biotechnologie (NCBI) des États-Unis (Altschul et al. 1997). Les identités
taxonomiques subséquentes ont été conclues suivant le RDP II (Cole et al. 2009).

Conformément au travail réalisé par Guarino et al. (2019), il a été conclu que la phytoremédiation
assistée par des microbes était une méthode hautement bénéfique par rapport à d'autres stratégies car
cette méthode entraînait des taux de dégradation plus élevés. Cette méthode a également démontré
que la symbiose de Lotus corniculatus, Piptatherum miliaceum et Plantago lanceolata pourrait être une
méthode écologique pour le traitement des sols très contaminés par des hydrocarbures aromatiques
polycycliques anciens. Le travail de Forján et al. (2020) a révélé l'application de la bioaugmentation dans
la dégradation des HAP dans des expériences de bioréacteur de boue, et a également permis de mieux
comprendre la complexité des relations microbiennes. Les conditions environnantes contrôlées dans le
bioréacteur ont favorisé la bioaccessibilité des polluants, entraînant ainsi une augmentation significative
de l'épuisement des HAP. Dans une étude de cas, il y a eu environ 40 % de dégradation des HAP en 60
jours dans une biorémédiation en tas, alors qu'au contraire dans ce travail, les rendements ont été
reproduits pendant une courte période d'environ 15 jours, et il a été conclu que la dégénérescence
affectait notablement les HAP lourds et d'autres matières organiques. Cela a été estimé à l'aide
d'analyses quantitatives et de la chromatographie en phase gazeuse - spectrométrie de masse (GC-MS)
qualitative.

La technique de la boue biologique est assez simple et économique par rapport à d'autres stratégies
telles que les bio-piles ; par conséquent, la conception devrait être réalisée de manière à inclure la boue
biologique, afin que cette méthode puisse être utilisée pour le traitement des HAP lourds (Dhir 2009)
(Tableau 9.2).

Les critères considérés lors du choix des plantes pour la remédiation sont la disponibilité du sol et le type
de nodules racinaires présents. Cette approche fournit les plantes globales qui peuvent être considérées
comme des modèles végétaux pour l'étude.
Une étude menée par Jeelani et al. (2017) a exploré la capacité de phytoremédiation d'A. calamus dans
un sol co-contaminé par le cadmium et les hydrocarbures aromatiques polycycliques. Les résultats
obtenus ont conclu qu'A. calamus s'avère opérationnel pour la phytoremédiation des sols pollués par les
HAP et le Cd. Les résultats obtenus dans le travail de Gałązka et Gałązka, 2005 ont conclu que la
sollicitation de l'inoculation d'herbe avec P. stutzeri et Azospirillum spp. a manifesté une réponse efficace
dans les procédures de dégradation des hydrocarbures aromatiques polycycliques. Différents modes de
traitement ont donné des résultats variés ; le processus assisté par surfactant a eu un taux d'éradication
de