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These La Migration Cellulaire
Année : 2010 N° 75
THESE
pour le
D I P L O M E D’E T A T D E D O C T E U R E N P H A R M A C I E
Par
JURY
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REMERCIEMENTS
Je tiens en premier lieu à remercier le Docteur V. Eder et le Professeur P. Bonnet de m’avoir très
gentiment accueillie dans le Laboratoire de Physiologie Artérielle pour y préparer ma thèse
d’exercice de pharmacie, pour leur soutien et leurs échanges durant mon travail ainsi que ceux
d’ordre plus familiaux. Sans eux, ce mémoire n’aurait jamais vu le jour.
Cette thèse n’aurait pas été la même sans Georges, Elvis et Karim qui ont su prendre le
temps en particulier au début de mon travail pour les conseils pratiques concernant la partie
expérimentale .
Les premières expériences auraient été plus difficiles sans Georges dont la patience, le
calme et la gentillesse m’ont beaucoup aidée quand les difficultés venaient perturber notre travail,
que ce soit de petits problèmes de matériel ou d’initiatives à prendre en cours de « manips ». Mais
je n’oublierai pas non plus les moments d’échanges conviviaux… Je n’oublierai pas non plus
Marie-Astrid toujours disponible et avec un petit mot gentil à m’adresser ainsi que son aide
précieuse dans les derniers jours…
Que l’ensemble des personnes du premier étage et plus particulièrement Harris, Elfi et
Marie-Christine soient également certains de ma reconnaissance pour leurs conseils, remarques,
encouragements… et dépannages de dernière minute ! Merci à Harris pour nos échanges, ses
questions et réflexions enrichissants tout au long des expériences mais aussi pour les discussions sur
la vie.
Et puis, je n’oublierai jamais les discussions avec Valérie en particulier celles concernant
l’importance de l’atmosphère de travail sur la migration des cellules douées d’une forme de vie
sensible, discussions qui m’ont beaucoup touchée témoignant une sensibilité que je partage…
Je tiens à ne pas oublier Jean, mon époux qui n’a pas hésité à donner de son temps et de son
énergie afin de terminer ce travail.
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SOMMAIRE
I. Introduction bibliographique……………………………………………….………………..p 13
III- Rôle des petites protéines G de la famille Rho dans la migration mésenchymateuse ….p 31
III.1. Les petites protéines G de la famille Rho
III.1.1.Présentation de la famille des protéines RhoGTPases
III.1.2.Activation des GTPases
III.2. Réorganisation du cytosquelette d’actine par les petites protéines G de la famille Rho.
III. 3 Activation de la voie Rac1, Pak1 et Lim-K1
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II. Résultats personnels…………………………………………………………………………p 71
A. Matériel et méthodes……………………………………………………………………...….p 72
III.Techniques utilisées……………………………………………..……………………………p 74
III.1.Expériences de migration de CSM.
III.2.Immunofluorescence.
III.3.RT-PCR (Reverse Transcription-PolyméraseChain Reaction)
III.4.Western-Blott
III .5.Test d'activation de la NADPH
III.6. Analyse statistique
B. Résultats …………………………………………..………………………………….……….p 81
C. Discussion ……………………………………………………………………………..………p 89
D. Conclusion ……………………………………………………………………...……………..p 93
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Liste des Figures :
Figure I.1 : La migration : un processus en trois étapes (d’après Li, 2005)
Figure I.2 : Structure des petites GTPases Rho
Figure I.3 : Domaines Switch des GTPases.
Figure I.4 : Structure du domaine catalytique des protéines de la famille Ras (d’après Paluch et
al, 2005)
Figure I.5: Cycle d’activation des petites GTPases de la famille des protéines Rho.
Figure I.6 : Cascade des GTPases RhoA, Rac1 et Cdc42 impliquées dans l’organisation du
cytosquelette des cellules Swiss 3T3 (d’après Mackay and Hall, 1998).
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Figure I.22: Fonctions de Nox4
Figure I.23 : Régulation de l’activité du cytochrome b558 en deux étapes (d’après Bokoch and
Diebold, 2002).
Figure I.24 : Phosphatase , protéine sensible au voltage (Murata and Okamura, 2007)
Figure I.25 : Pompe à protons.
Figure II.1 : Expression de HIF-1α.
Figure II.2 : migration différentielle des CSM hypoxiques.
Figure II.3 : activité enzymatique de la NADPHoxydase et expression de la PI3kinasE ;
Figure II.4 : expression de Rac-1 (Rac1-GTP) et de ROCK-1
Figure II.5 : expression de p47et de la forme phosphorylé de la cofiline
Figure II.6 : 6A : expression de LIM kinase-1 et de LIM kinase-2
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Liste des abréviations :
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PIP2 : Phosphatidyl Inositol (4,5)-biphosphate
ADF : Actin Dépolymerizing Factor
PI3K : Phosphatidyl Inositol 3 Kinase
WASP : Wiskott-Aldrich Syndrom Protein
WAVE : WASP-like verprolin homologuous protein
PaO2 : Pression artérielle en Oxygène
EPO : Erythropoïétine
PaPO2 : Pression artérielle Partielle intracellulaire en Oxygène
RLO : Radicaux libres d l’oxygène.
ERO: Espèces radicalaires de l’oxygène ERO
SOD : SuperOxyde Dismutase
HIF : Hypoxia Inducible Factor
AP-1: Activator Protein-1 (AP-1)
Nfkb : facteur-KB nucléaire
Egr-1 : Early Growth Response-1
PAS : PER-ARNT-SIM PAS
TADs : domaines de transactivation
PHD prolyl-hydroxylases
ECV : Elongin/Cullin2/VHL
ODD : dégradation dépendant de l'oxygène (ODD),
pVHL : facteur de suppression tumorale von Hippel-Lindau
PHD : prolylhydroxylases
HO-1 : hème oxygénase-1
HGF : hepatocyte growth factor
PBS : phosphate buffer saline
CREB : CRE Binding protein
phox : phagocyte oxydase
NOX : NADPH oxydase
FCS : Fetal Calf Serum
DMSO : dimethyl sulfoxide
EDTA : acide éthylène diamine tétra acétique
RPMI : Roswell Park Memorial Institute medium
SVF : Sérum de Veau Fœtal
TBS : Tris Buffered Saline
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Introduction et Objectifs du travail
L'objectif de notre travail était d’étudier l’impact de l'hypoxie chronique sur la migration des
cellules souches mésenchymateuses (CSM) issues de la moelle osseuse de rats.
Dans un précédent travail nous avions montré chez des rats Wistar soumis à l’hypoxie chronique,
une augmentation spécifique de la mise en circulation de progéniteurs de cellules souches
mésenchymateuses (Rochefort et al., 2007). Dans ce même modèle des CSM injectées par voie
systémique avaient une domiciliation accrue au niveau de la moelle osseuse (Rochefortet al., 2005).
Ces travaux permettaient de suspecter soit l’existence de facteurs chimiotactiques augmentés par
l’hypoxie chronique soit des modifications des propriétés migratoires des CSM.
La migration cellulaire est un processus essentiel utilisé au sein de tous les organismes
multicellulaires et elle est importante non seulement pendant le développement embryonnaire mais
aussi tout au long de la vie pour la cicatrisation. La capacité des CSM à réparer l'os, le cartilage, les
tendons, mais aussi les muscles lisses, cardiaques et squelettiques rend ces cellules particulièrement
intéressantes pour la thérapie cellulaire. Néanmoins, l'efficacité thérapeutique de telles cellules
dépend de leur capacité à migrer dans les tissus endommagés en réponse à certains signaux
chimiotactiques produits localement. Contrairement aux CSH, ces signaux ne sont pas encore bien
connus. L’étude des mécanismes fondamentaux de cette migration cellulaire est pourtant
indispensable pour mettre au point des techniques des biothérapies utilisant les cellules souches
mésenchymateuses.
La NADPHoxydase est un système annexe impliqué dans les phosphorylations oxydatives. Son
importance physiologique par rapport aux systèmes d’oxydation mitochondrial ou aux autres
11
systèmes Red/Ox tels que le cytochrome p450 annexé au réticulum sarcoplasmique reste mal
connue. La NADPH est impliquée dans la surproduction de radicaux libres oxygénés et notamment
d’H2O2 en réponse à stress environnemental exagéré et a été mise en cause dans le stress oxydant de
processus de dégénérescence. La NADPHoxydase est un système couplé à la membrane lorsque
l’enzyme est activée et certaines de ces sous-unités sont aussi couplées à des protéines contrôlant le
réarrangement du cytosquelette au cours de la migration cellulaire. Toutefois son rôle précis dans
l’activation de la migration cellulaire n’a pas été très étudié notamment au niveau des cellules
mésenchymateuses.
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Chapitre I :
Introduction
Bibliographique
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A. Migration des cellules souches mésenchymateuses
I.1.1.définitions
Les cellules souches sont des cellules indifférenciées capables d'une part, de s' autorenouveler pour
maintenir un pool permanent de ce type cellulaire et d'autre part, de donner naissance à des cellules
différenciées.
- Les cellules souches totipotentes : il s'agit de l'œuf fécondé (le zygote) et des cellules de
l'embryon dans les quatre premiers jours de sa croissance (morula de 2 à 8 cellules). Seules ces
cellules ont la capacité de former l'embryon entier ainsi que ses annexes (amnios et placenta) et ainsi
de conduire au développement d'un être humain.
- Les cellules souches pluripotentes : elles proviennent de la masse cellulaire interne (provenant de
feuillets ectodermique, mésodermique et endodermique) du blastocyte (au stade de 40 cellules) ;
elles ont vocation à former tous les tissus de l'organisme mais ne peuvent à elles seules aboutir à la
création d'un individu complet.
- Les cellules souches multipotentes : présentes dans l'organisme adulte, elles sont à l'origine de
plusieurs types de cellules différenciées au sein du même feuillet embryonnaire dans un nombre
limité de lignages cellulaires appropriés à leur emplacement.
- Les cellules souches unipotentes sont seulement capables de produire un seul type de cellules
différenciées. C'est le cas des précurseurs épithéliaux intestinaux, des précurseurs épithéliaux
gastriques ou des cellules de la spermatogonie testiculaire (Preston et al., 2003)
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Ces cellules présentent des caractéristiques communes :
- Clonalité: capacité de générer une population cellulaire homogène à partir d’une cellule initiale.
Les cellules souches embryonnaires (ESC = Embryonic Stem Cells), sont les seules cellules
pluripotentes de l'organisme. Elles sont présentes dès le stade blastocyste, soit quatre à cinq jours
après la fécondation de l'œuf et avant son implantation utérine. Ces cellules sont capables de se
multiplier indéfiniment pour donner de grandes quantités de cellules non spécialisées pluripotentes,
puisqu'elles peuvent produire tous les feuillets embryonnaires (mésoderme, endoderme et
ectoderme) et les tissus qui en dérivent.
Les souches tissulaires de l'adulte (CSA) sont présentes au cœur des organes. Elles sont connues
depuis longtemps dans les tissus à renouvellement rapide comme le sang, la peau et l'épithélium
intestinal. Les cellules souches adultes sont présentes dans plusieurs tissus et sont, pour la plupart,
déjà engagées dans un programme tissulaire spécifique, ce qui explique leur hétérogénéité. Même si
certaines d'entre elles peuvent conduire à la formation ou à la génération de tissus distincts
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provenant du même feuillet embryonnaire (multipotence), elles ne sont pas, comme leurs
homologues embryonnaires, pluripotentes.
Chez l'adulte, les cellules souches servent à restaurer les tissus lésés, malades, ou simplement
vieillissants. Des cellules souches capables de « restaurer » les tissus ont été identifiés chez l'homme
dans les tissus suivants la moelle osseuse, la cornée et la rétine, le muscle squelettique, la pulpe
dentaire, la peau, et le tractus gastro-intestinal. Les cellules souches du sang, de la peau et de
l'intestin fonctionnent en permanence pour renouveler régulièrement l'ensemble des cellules.
Un type rare de cellules multipotentes, les MAPC (Multipotent Adult Progenitor Cells), a été
décrit comme étant l'ancêtre de toutes les populations hématopoïétiques et mésenchymateuses
présentes dans la moelle osseuse humaine. La localisation des MAPC n'est probablement pas
restreinte à la moelle osseuse (Jiang et al., 2002). Elles possèdent un grand pouvoir prolifératif, elles
peuvent se différencier en de multiples types tissulaires, émanant de feuillets embryonnaires
différents (mésoderme, endoderme et ectoderme).
Nous nous limiterons, dans ce travail, à l'une des deux principales cellules souches adultes de
la moelle osseuse: les Cellules Souches Mésenchymateuses (CSM) issues de la moelle osseuse.
Friedenstein fut le premier à observer des cellules adhérentes de type fibroblastique dans les
cultures de moelle osseuse, aussi appelée Colony Forming Unit Fibroblast (CFU-F) (Friedenstein et
al., 1970); (Friedenstein et al., 1974) ; (Dazzi et al., 2006). Lorsqu'elles étaient ensemencées à faible
densité en milieu liquide contenant du sérum, des cellules de moelle osseuse de lapins ou de
rongeurs formaient après quelques jours de petites colonies fibroblastiques, adhérentes, ovales et
non phagocytaires. Une fois réensemencées individuellement sous la capsule rénale d'animaux
syngéniques, chaque colonie constituait, après quelques semaines, du tissu fibreux et de l'os
contenant de la moelle osseuse. Dans les années 60, l'intérêt principal de cette fraction « stromale »,
support d'adhérence autant que pourvoyeur de cytokines, était d'offrir un environnement propice in
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vitro à l'autorenouvellement et à la différenciation de cellules souches hématopoïétique. L'analyse de
leur potentiel était secondaire.
Au début des années 90, Arnold Caplan a définit les CSM comme des cellules produisant de
l'os et du stroma médullaire, mais également du cartilage, du tissu tendineux et du muscle ((Caplan,
1991)). Au fil du temps, plusieurs désignations et abréviations lui ont été attribuées. Maureen Owen
(Owen, 1988); (Owen and Friedenstein, 1988) a utilisé le terme de « cellule souche stromale » pour
souligner le fait que les CSM étaient produites à partir de la couche stromale médullaire de culture à
long terme. Par la suite, Darwin Prockop (Prockop, 1997) a proposé que l'abréviation CSM
convienne pour « cellule souche mésenchymateuse » et pour « cellule stromale médullaire ». Puis,
James Dennis (Dennis et al., 1999) a utilisé le terme de « cellule progénitrice mésenchymateuse »
afin d'indiquer que ces cellules pouvaient représenter des cellules progénitrices issues initialement
de cellules souches. Dans les années 2000, plusieurs chercheurs (Bianco and Gehron Robey, 2000);
(Bianco et al., 2001) ; (Kuznetsov et al., 2001) ; (Bhagavati and Xu, 2004) les ont appelées « cellule
souche squelettique » pour souligner leur spécificité à engendrer les différentes cellules des tissus
squelettiques. Enfin, Catherine Verfaillie a décrit une population de cellules qui pourrait représenter
un type cellulaire plus primitif, avec un plus grand potentiel de différenciation que celle des CSM,
qu'elle a désigné en tant que « cellules progénitrices mésodermales » (Reyes et al., 2001) et
« cellules progénitrices adultes multipotentes » (Jiang et al., 2002).
I.2.2 Localisation.
Les CSM ont pu être isolées dans de nombreuses espèces différentes. Les CSM les mieux
caractérisées proviennent de source humaine (Pittenger et al., 1999); (Zvaifler et al., 2000);
(Kuznetsov et al., 2001) ; (Covas et al., 2003); (Zhang et al., 2004); (Miao et al., 2006), de souris
(Phinney et al., 1999); (Baddoo et al., 2003); (Tropel et al., 2004) et de rats (Santa Maria et al.,
2004), mais d'autres sources provenant de cobayes ou de chats (Martin et al., 2002), de babouins
(Devine et al., 2001), de moutons (Airey et al., 2004), de chiens (Silva et al., 2005), de porcs
(Moscoso et al., 2005); (Bosch et al., 2006), de vaches (Bosnakovski et al., 2005), ou encore de
chevaux (Worster et al., 2000); (Ringe et al., 2003) sont actuellement exploitées.
Les CSM sont présentes, avec une proportion variable, dans divers tissus fœtaux et de
l'organisme adulte (Pountos and Giannoudis, 2005). Néanmoins, elles représentent une population
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rare au sein de ces tissus. C'est en 1976 que des CSM ont été isolées à partir de la moelle osseuse
pour la première fois (Friedenstein et al., 1976). Elles peuvent être isolées à partir de divers tissus
incluant le cartilage (Alsalameh et al., 2004), le périoste (Cuevas et al., 2004), la membrane
synoviale (De Bari et al., 2001), le liquide synovial (Jones et al., 2004), les muscles (Young et al.,
2001) et les tendons (Salingcarnboriboon et al., 2003). Il a été également mise en évidence que le
tissu fœtal (Hu et al., 2003), le placenta, la veine ombilicale (Romanov et al., 2003), les tissus
adipeux (Dicker et al., 2005) et le système vasculaire (Abedin et al., 2004) contiennent des CSM.
Cependant, la source la plus riche, la plus étudiée et la plus accessible aux chercheurs et aux
cliniciens est la moelle osseuse adulte (Phinney et al., 1999); (Pittenger et al., 1999); (Howell et al.,
2003); (Tropel et al., 2004); (Tuli et al., 2003), où la fréquence a été estimée à 0,01-0,001% des
cellules nuclées humaines de moelle osseuse adulte (Zhang et al., 2004); (Miao et al., 2006).
-Isolement.
Les CSM peuvent être obtenues à partir de différentes sources. Les procédures sont très
nombreuses et diffèrent selon les sources tissulaires, les espèces étudiées et les publications.
Toutefois, on retrouve certains paramètres communs concernant la culture de CSM provenant de la
moelle osseuse. Les CSM sont obtenues après aspiration du contenu médullaire de l'os du fémur,
puis lavées et cultivées sur plastique à une densité de 10 4 à 105 cellules/cm2. Entre 2 et 3 jours, le
milieu de culture est changé pour la première fois et les cellules adhérentes au plastique sont ainsi
cultivées pendant 2 à 3 semaines jusqu'à ce qu'elles atteignent un taux de confluence de 80 à 90%.
- CFU-F
Lorsque ces cellules étaient ensemencées à des densités plus élevées, les colonies fusionnent pour
former une monocouche de cellules adhérentes. Pour visualiser et énumérer les CFU-F, les cellules
sont habituellement colorées avec une solution de Giemsa, lavées et puis séchées à l'air. Les
colonies ont typiquement un diamètre de 1 à 8 mm et sont dénombrées macroscopiquement.
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- Une Population hétérogène.
Après culture, les CSM forment des colonies de cellules adhérentes ressemblant à des
fibroblastes qui peuvent croître en présence de divers facteurs de croissance (Gronthos and
Simmons, 1995); (Kuznetsov et al., 1997), tandis que la préparation initiale présente également des
macrophages adhérents au plastique. Morphologiquement, les CSM initialement cultivées
ressemblent à de petites cellules fibroblastiques avec, en particulier dans les cultures murines, des
extensions minces de type filopodes. Les CSM semblent être une population homogène. Cependant,
l'homogénéité de la population dépend des conditions de culture.
Cette hétérogénéité au niveau morphologique est également retrouvée pour les capacités de
prolifération et de différenciation (Kuznetsov et al., 2001); (Phinney et al., 1999); (Pittenger, 1999 );
(Muraglia et al., 2000); (Satomura et al., 2000); (Okamoto et al., 2002), bien qu'elle ne se traduise
pas par l'absence ou la présence d'un marqueur membranaire particulier (Gronthos et al., 1999);
(Bensidhoum et al., 2004). Ainsi, les CSM constituent une population hétérogène, ce qui peut
refléter une hiérarchie au sein de ces cellules souches comme cela a été décrit pour les CSH.
En 2000, l'étude à l'échelon clonal de la capacité à proliférer a montré qu'un tiers des clones
isolés présentait la capacité de différenciation dans les trois lignages (adipocytaire, ostéogénique et
chondrocytaire). Muraglia et ses collaborateurs ont alors proposé un modèle de hiérarchie basé sur
des études clonales, où le premiers ancêtres mésenchymateux sont tripotents (adipocytaire,
ostéogénique et chondrocytaire) et présentent une perte séquentielle de leur potentiel de
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différenciation au fil des divisions pour générer des ancêtres bipotents puis unipotents (Muraglia et
al., 2000). Néanmoins, à partir des observations, les CSM peuvent être définies comme une
population hétérogène dont le modèle hiérarchique n'est pas complètement établi.
- Phénotype.
Jusqu'à présent, aucun marqueur immuno-phénotypique particulier n'a été identifié pour
permettre l'isolement phénotypique des CSM. Néanmoins, elles expriment une grande variété
d'antigènes présentés par beaucoup d'autres types de cellules. En 2004, Pittenger et Martin ont
publié une liste des marqueurs de surface des CSM qui définissent leur phénotype (Tableau, p28).
Par conséquent, leur identification est basée sur l'expression exhaustive de marqueurs membranaires,
comprenant des marqueurs de différenciation et de lignage, des molécules d'adhérence, de la matrice
extra-cellulaire, et des récepteurs à des facteurs de croissance (Simmons and Torok-Storb,
1991); (Simmons et al., 1992); (Gronthos and Simmons, 1995). De plus, quelques molécules sont
exprimées de façon variable selon le temps passé en culture et le potentiel de différenciation des
CSM (Vogel et al., 2003); (Dazzi et al., 2006). L'ensemble de ces marqueurs de surface a été étudié
par cytométrie en flux (Haynesworth et al., 1992); (Pittenger et al., 1999); (Barry et al., 2001);
(Caceres et al., 2008); (De Ugarte et al., 2003); (Vogel et al., 2003); (Zhang et al., 2004).
-Potentiel de prolifération.
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Une étude sur des cellules fraîchement isolées a révélé que les CFU-F n'entraient pas dans le
cycle cellulaire in vivo (Friedenstein et al., 1974), et que leur développement ultérieur en colonies et
leur entrée dans le cycle cellulaire dépendait de facteurs de croissance présents dans le sérum in
vitro (Castro-Malaspina et al., 1980). En effet, il est possible d'augmenter le nombre de divisions
cellulaires en ajoutant des facteurs de croissance au milieu de culture initial (E.G. le facteur de
croissance fibroblasique, basic Fibroblast Growth, b FGF) (Bianchi et al, 2003). L'ensemencement
cellulaire joue également un rôle critique dans la capacité d'expansion des CSM. En effet, on obtient
un profil d'expansion plus élevé (2000 fois) quand les CSM sont ensemencées à faible densité (1,5-3
10 4 cellules/cm2) tandis qu'on observe un profil d'expansion plus faible (60 fois) pour une densité
d'ensemencement plus élevée (Colter et al., 2000).
- Capacité d'auto-renouvellement.
La multipotence est définie comme la capacité d'une cellule à donner naissance à différents
types de cellules. Comme nous l'avons mentionné auparavant, les CSM sont capables de produire
des descendants différenciés du tissu mésodermique. Elles sont aussi capables, dans des conditions
environnementales particulières , de se différencier en une grande variété de types cellulaires tels
que les cardiomyocytes, les myofibroblates, les péricytes, les myocytes squelettiques, et elle
permettent d'obtenir des cellules non mésodermiques ayant un phénotype de cellules rétiniennes,
neuronales, astrocytaires, gliales, hépatocytaires et pancréatiques.
La capacité des CSM de se nicher dans le cartilage, la rate, la moelle osseuse et de l'os a déjà
été montrée depuis plusieurs années (Pereira et al., 1995). Plus récemment, des CSM greffées par
voie systémique ont subi une différenciation organo-spécifique en chondrocytes, adipocytes,
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myocytes, cardiomyocytes et cellules stromales, ce qui montre leur capacité à se nicher au sein de
microenvironnements différents (Liechty et al., 2000).
Les CSM ont aussi la capacité de modifier leur voie de différenciation selon le microenvironnement
dans lequel elles sont placées. Par exemple, les CSM différenciées en chondrocytes peuvent se
réorienter dans la voie de différenciation ostéoblastique (Bianco et al., 1999), ou alors des
adipocytes peuvent se différencier en ostéoblastes (Bennett et al., 1991); (Dennis and Charbord,
2002).
-Plasticité intra-tissulaire
La plasticité peut être définie comme la capacité des cellules à modifier leur voie de
différenciation selon le microenvironnement dans lequel elles sont placées. Par exemple, des CSM
différenciées en chodrocytes peuvent ainsi se réorienter dans la voie de différenciation
ostéoblastique (Bianco et al., 1999), ou alors des adipocytes peuvent se différencier en ostéoblastes
(Bennett et al., 1991); (Dennis and Charbord, 2002).
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II. Migration des cellules mésenchymateuse.
La mobilité amoeboïde est caractéristique des cellules hématopoïétiques appelées les leucocytes.
Elle a été mise en évidence dans un premier temps chez l’amibe Dictyostelium discoideum (Yumura
et al., 1984). Elle dépend beaucoup moins des phénomènes d’adhérence et est indépendante des
intégrines (Friedl et al., 1998). Les cellules sont ici très déformables du fait de l’absence de points
d’adhérence focaux, ce qui leur permet de se déplacer 10 à 20 fois plus vite que lors d’une migration
mésenchymateuse. Les cellules avancent par contraction de l’actine corticale et des flux internes de
cytoplasme qui les font « rouler » sur elles-mêmes (Friedl et al., 1998). L’étude de l’expression
génique dans ce type de cellules motiles a révélé que des régulateurs liés à l’actine sont surexprimés
tels que la cofiline, Arp2/3, N-WASP, les LIM Kinases, Rock et RhoA (Friedl and Wolf, 2003).
Une étude récente a permis une meilleure compréhension des mouvements amoeboides de
Dictyostelium (Yoshida and Soldati, 2006). Deux modèles y sont présentés :
- Une mobilité de type « blebbing » est caractérisée par une rupture de l’équilibre membranaire
généré entre la membrane et le cortex d’actine. Des forces intérieures à la cellule permettent alors la
création d’un blebb dans lequel est vite régénéré le cortex d’actine.
- L’autre mode est caractérisé par la formation d’un filopode se transformant rapidement en
lamellipode sans dépolymérisation du cortex d’actine à cet endroit.
Ces cellules déforment leur corps cellulaire pour se mouvoir dans un environnement en 3D
(Friedl et al., 1998). Elles ne dégradent pas la matrice extracellulaire mais utilisent la déformation de
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leur corps pour contourner les fibres constituant cette matrice. Des études récentes ont mis le doigt
sur les éléments provoquant une transition mésenchymato-amoeboïde dans différents types
cellulaires (Pinner and Sahai, 2008); (Sahai et al., 2007); (Wolf et al., 2003a). Ces études
démontrent que RhoA et Rock sont des protéines essentielles au passage vers un type de mobilité
amoeboïde, sans dégradation de matrice extracellulaire (MEC), contrairement aux cellules utilisant
un mode mésenchymateux durant lequel on observe une dégradation de la MEC par l’action des
MMPs (Wolf et al., 2003a); (Wolf et al., 2003b).
La migration mésenchymateuse est représentée par la migration des fibroblastes et les CSM
migrent selon ce type de migration. En pathologie, elle est principalement observée dans les
fibrosarcomes, les gliomes et les cancers épithéliaux (Friedl and Wolf, 2003). Les cellules adoptent
une morphologie polarisée, présentant une partie antérieure (leading edge) étalée et très dynamique
et une partie postérieure (tail) allongée. Cette morphologie est dépendante de grandes forces de
traction au niveau des pôles cellulaires ainsi que de la dynamique de l’adhérence par les intégrines.
La migration de cellules à travers des tissus riches en collagène nécessite des réactions d'adhérence
à la matrice extracellulaire et de protéolyse des composants matriciels, en même temps qu'un
cytosquelette d'actine dynamique permettant des changements de forme polarisés (Lauffenburger
and Horwitz, 1996). Si les mécanismes cellulaires et moléculaires des cellules en chaîne et en
groupe ne sont pas encore connus en détail, la migration des cellules isolées, dans différents
modèles, obéit à différents paramètres comme la taille, l'adaptabilité morphodynamique,
l'expression et la fonction des intégrines et les vitesses de renouvellement des interactions cellule-
matrice (Friedl and Wolf, 2003). Ce type de migration est caractérisé par l’activation, au niveau
des points d’ancrage de la cellule, de protéinases et métallo-protéinases qui dégradent la matrice
extracellulaire environnante (Wolf et al., 2003a). Du fait du renouvellement des PAF de 10 à 120
minutes, les cellules migrent dans un modèle en trois dimensions (3D) entre 0,1 à 2 μm par minute
(Friedl et al., 1998). Ce type de migration est dépendant des intégrines, des GTPases de la famille
Rho (RhoA, Rac1 et Cdc42), de la MLCK et des MMPs (Métalloproteinases matricielles) (Friedl,
2004); (Kaneko et al., 2002).
24
Le cytosquelette est constitué de filaments protéiques très abondants dans les cellules
eucaryotes, dont les éléments sont très conservés au cours de l'évolution. En effet, certains
procaryotes possèdent des protéines homologues aux protéines du cytosquelette des eucaryotes
(Shih and Rothfield, 2006).
Il existe trois types de filaments dans les cellules eucaryotes. Chacun a une fonction
particulière, correspondant à une échelle d'action différente, même s'il existe des interactions entre
les différents types de filaments (Gordon-Weeks, 2004). Les microtubules, qui sont rigides,
participent à la structure et à l'organisation globale de la cellule ainsi qu'au trafic vésiculaire
(Kodama et al., 2004). L'actine, qui forme un réseau plus déformable, agit plus localement sur la
membrane de la cellule et permet sa déformation. Certains métazoaires, dont les mollusques et les
vertébrés, sont aussi constitués d'un troisième de type de filament, les filaments intermédiaires,
dont les fonctions sont moins bien connues mais qui semblent jouer un rôle dans le maintien de la
forme cellulaire et l'ancrage des organites cellulaires. Ils interviennent aussi dans l'adhérence et la
cohésion tissulaire car ils sont en relation avec les desmosomes et les hémidesmosomes (Yin and
Green, 2004).
Ces trois types de filaments ont des propriétés structurelles communes : ce sont des
polymères constitués d'un assemblage de protéines élémentaires. Ils sont très dynamiques,
principalement aux extrémités où s'effectuent l'assemblage et le désassemblage de sous-unités. Ces
événements de polymérisation et de dépolymérisation permettent au cytosquelette de se réarranger
très rapidement et de s'adapter aux signaux mécaniques et chimiques de l'environnement extérieur
(Stephens et al., 2008). Les premières observations de l’actine ont été réalisées en 1887 par W.D.
Halliburton qui a extrait une protéine de muscles qui précipitait avec la myosine. Cette protéine a été
caractérisée en 1942 par B.F. Straub qui l’a purifiée et baptisée actine. Le Dr Straub continua à
travailler sur l’actine pendant de nombreuses années découvrant que l’actine liait l’ATP.
25
• extension des lamellipodes et des filopodes, suite à l’élongation des filaments d’actine, au niveau
du front de migration de la cellule assurant une large surface de contact vers la matrice
extracellulaire.
• formation de nouvelles adhérences au niveau du front de migration de la cellule via les intégrines
La migration cellulaire est dirigée, dans la plupart des cas, par des signaux
extracellulaires attractifs ou répulsifs. Ces signaux peuvent être des facteurs solubles qui peuvent
agir à distance ou plus généralement à partir des cellules voisines (Stephens et al., 2008). Ils
induisent une grande variété de signaux intracellulaires qui comprennent des changements dans
l’organisation du cytosquelette d’actine et microtubulaire, dans le transport vésiculaire et dans la
26
transcription (Stephens et al., 2008). Nous détaillerons cet aspect de la migration mésenchymateuse
ultérieurement.
De nombreux facteurs de croissance ont été rapportés comme induisant la migration des CSM.
Ainsi, l'hépatocyte Growth Factor (HGF) est exprimé de façon constitutive par les cellules stromales
médullaires (Takai et al., 1997) et induit une augmentation de la migration in vitro des CSM avec
une diminution de la prolifération cellulaire (Neuss et al., 2004); (Forte et al., 2006), (Son et al.,
2006). D'autres facteurs de croissance, comme le Platelet Derived Growth Factor BB (PDGF-BB),
la Bone Morphogenetic Protein-2 (BMP-2), la Bone Morphogenetic Protein-4 (BMP-4), le
Transforming Growth Factor beta 1 (TGF-β1), le basic Fibroblast Growth Factor (bFGF), le
Vascular Edothélial Growth Factor A (VEGF-A) et insulin-like Growth Factor (IGF) ont été
27
rapportés comme stimulant la migration des CSM (Fiedler et al., 2002); (Fiedler et al., 2004);
(Fiedler et al., 2005); (Fiedler et al., 2006), le PDGF et l'IGF-1 (Ponte et al., 2007). Des petites
protéines, les chimiokines, ont été rapportées comme induisant la migration des CSM (Sordi et al.,
2005); (Honczarenko et al., 2006); (Ponte et al., 2007). C'est le cas de la chimiokine de SDF-
1(CXCL12) mais aussi de Fractaline (CXC3CL1), BCA-1(CXCL13), SIC B6 (CXCL16), MIP-3β
(CCL19), 6CKine (CCL21), TECK (CCL25), MIP-1α (CCL3), et RANTES (CCL5) et moins
activement de la chimiokine MDC (CCL22). En effet, les CSM exprimeraient les récepteurs
CXCR4, CXCR5, CXCR6, CX3CR1, CCR1 ET CCR7 et CCR9 (Sordi et al., 2005); (Honczarenko
et al., 2006). Le Tumor Necrosis Factor α (TNF α) a été rapporté comme induisant une augmentation
de la sensibilité des CSM pour toute chimiokine (Ponte et al., 2007).
Plusieurs études in vivo reposant sur une grande variété des modèles animaux ont montré
l'utilité des CSM dans la réparation ou la régénération des tissus lésés comme l'os, le cartilage ou le
muscle cardiaque (Bianco and Gehron Robey, 2000); (Pereira et al., 1998); (Toma et al., 2002), mais
aussi dans des stratégies de thérapie génique (Bartholomew et al., 2002); (Duan et al., 2003);
(Pereira et al., 1995).
L'injection systémique de CSM est une stratégie non invasive permettant l'administration d'un
grand nombre de cellules avec un potentiel d'application clinique (Bianco et al., 2001); (Koc et al.,
2002) pour la réparation des tissus ou des organes. Les CSM peuvent migrer in vivo vers différents
organes non hématopoïétiques (comme le poumon, le foie, le rein, la peau ou le thymus) et proliférer
après irradiation létale chez des babouins (Devine et al., 2003) et des macaques (Chapel et al., 2003)
28
mais également chez des rongeurs (Anjos-Afonso et al., 2004); (Francois et al., 2006). D'autre part,
il a été montré que les CSM humaines transplantées à des brebis gestantes peuvent persister 13 mois
après leur transplantation en ayant subi une différenciation organe-spécifique en chondrocytes, en
adipocytes, en myocytes et en cardiomyocytes, ainsi qu'en cellules stromales de la moelle osseuse
(Liechty et al., 2000), comme cela a été rapporté par d'autres (Pereira et al., 1995). Nous avons dans
un précédent travail décrit la différenciation vasculaire musculaire lisse de CSM implantées sur des
patchs prothétiques au niveau de l’aorte abdominale (Mirza et al., 2008); (Bonnet et al., 2008).
Pour l'instant, il existe peu de publications décrivant les résultats de l'utilisation thérapeutique
des CSM chez l'homme. Koc et al ont montré, chez des patients atteints du cancer ayant été traités
par chimiothérapie à dose intensive, qu'une greffe autologue de CSM combinée avec une greffe de
CSH du sang périphérique, entraînait une accélération de la reprise hématopoïétique (Koc et al.,
2000). Les données les plus documentées concernent la reconstruction locale de CSM (Quarto et al.,
2001) ou le traitement des désordres génétiques comme l'osteogenesis imperfecta après leur
administration systémique (Horwitz et al., 2002).
Un autre aspect de la migration des CSM est leur capacité de mobilisation dans le sang
périphérique. Une telle propriété présenterait un intérêt évident pour permettre d'envisager
l'utilisation de CSM endogènes pour la réparation tissulaire sans passer par une étape de culture. Les
études sur ce sujet montrent des résultats contradictoires synthétisées dans le tableau suivant :
29
D'après l'ensemble de ces résultats, il semble exister une petite population de CSM circulantes,
qui varie en fonction de la méthode d'isolement et de culture, et du modèle utilisé. L'utilisation de
tels modèles animaux a aidé à l'étude de cette population de CSM circulantes, en montrant
l'existence d'un pool circulant de CSM capables de coloniser la moelle osseuse ainsi que des
organes endommagés (Wu et al., 2003).
Un moyen spécifique de mobilisation pourrait être initié par stimulation répétée avec des
cytokines tels que le facteur de stimulation des colonies granulocytaires (granulocyte colony
stimulating factor, G-CSF), le facteur de stimulation des colonies granulocytaires-macrophagiques
(granulocyte-macrophage colony stimulating factor, GM-CSF) (Fernandez et al., 1997); (Kucia et
al., 2004), ou récemment par plusieurs circonstances physiopathologiques comme l'infarctus du
myocarde ou l'encépholopathie (Zyuz'kov et al., 2005).
30
la migration des CSM injectés par voie intraveineuse vers le coeur. Toutefois, la fonction cardiaque
ne s'était pas améliorée (Zhang et al., 2007). Très récemment, Vallabhaneni et al. ont suggèré un
récepteur un rôle de guide et de contrôle du récepteur uPAR sur la migration des CSM en réponse à
une blessure ou une ischémie ainsi que sur leur différentiation en VMCs fonctionnelle
(Vallabhaneni et al., 2008).
Les petites protéines G constituent une super famille d’au moins une centaine de protéines
qui sont apparentées à la protéine Ras présente chez tous les eucaryotes (Rat Sarcoma). Elles
présentent entre elles d’importantes homologies de séquence qui traduisent une organisation très
similaire en domaines structuraux et fonctionnels. Selon des critères d’homologie de séquence et de
fonction, ces protéines sont regroupées en 5 familles principales composée de 8 groupes distribués
dans 4 clusters (Boureux et al., 2007).
Les protéines Ras comprend en particulier les protéines H-Ras, K-Ras et N-Ras qui sont impliquées
dans le contrôle de la prolifération cellulaire, la survie cellulaire, la différenciation, l’organisation du
cytosquelette d’actine, la transcription ou encore le trafic vésiculaire (Mitin et al., 2005). Les
protéines de la famille Rab (ras-related in brain) participent à la régulation du transport vésiculaire
31
et du trafic protéique entre les différents organelles des voies endocytaires et sécrétoire (Fukuda,
2008). Les protéines de la famille Sarl/Atf (Adp ribolysation factor) sont impliquées plus
particulièrement dans le trafic vésiculaire golgien ((Donaldson and Honda, 2005)). Les protéines de
la famille Ran (Ras related in nucléar import and export) sont impliquées dans la régulation du
transport nucléocytoplasmique et des protéines (Weis, 2003).
La famille Rho comprend 22 membres dont les plus connus sont RhoA, Rac1 et Cdc42Hs, nommée
plus communément Cdc42 (Jaffe and Hall, 2005).La fonction principale des petites protéines G de
cette famille est de contrôler l’organisation du cytosquelette d’actine (Aspenstrom et al., 2004). La
régulation du cytosquelette d'actine par trois GTPases: Rac1, Cdc 42 et RhoA est la plus connue.
Toutefois, les GTPases de la famille Rho agissent aussi au niveau de nombreuses voies de
signalisation, telles que celles de l’apoptose, la prolifération ou la différenciation (Jaffe et al, 2005;
Ridley, 2006). La localisation cellulaire très variée des GTPases Rho traduit la grande diversité des
fonctions cellulaires auxquelles elles participent. Les protéines Rac-1 et Cdc42 sont retrouvées
essentiellement au niveau de l'enveloppe nucléaire, du réticulum endoplasmique et de l'appareil de
Golgi.
Les petites protéines G partagent environ 30% à 60% d’homologie de séquence en acides
aminés sur leur domaine GTPase avec les protéines Ras et 40 à 95 % entre elles (Wennerberg and
Der, 2004). La structure de Ras est classiquement utilisée comme modèle pour tous les membres de
la super famille. Dans la partie N-terminale de ces protéines, se trouve la majorité des acides aminés
impliqués dans la liaison et l’hydrolyse du GTP.
32
Elles partagent un ensemble d’éléments contenant des motifs de liaison au GDP/GTP
(Bourne et al., 1991). Des analyses de cristallographie et par résonance magnétique nucléaire de ces
petites protéines ont révélé la présence d’un domaine catalytique unique pour touts les membres de
cette superfamille. Ce domaine est constitué de cinq hélices (A1-A5), six feuillets (B1-B6) et de
cinq boucles peptidiques (G1-G5). Deux régions fonctionnelles y ont été mises en évidence : la
région Switch I qui correspond à la boucle G2 et la région Switch II qui est formée par la boucle G3
et une partie de l’hélice A2 (Paduch et al., 2001). La région C-terminale est une région dite
« hypervariable » car l’essentiel des différences de séquence primaire entre les protéines Rho se
trouve concentré dans cette région de 25 acides aminés, site de modifications post–traductionnelles
(Allal et al., 2002).
La plupart des protéines de la super famille Ras agissent comme des interrupteurs moléculaires
grâce à leurs interactions au niveau de la boucle polypeptidique G5 avec des nucléotides
guanidiques. En effet, ces protéines oscillent entre une conformation inactive lorsqu’elles sont liées
au GDP (guanosine diphosphate) (figure I.4 B) et une conformation active (figure I.4 A) quand elles
sont liées au GTP. Ce domaine est commun à tous les membres de cette super famille mais aussi
aux sous-unités des des protéines G hétéromériques.
33
Figure I.4 : Structure du domaine catalytique des protéines de la famille Ras (d’après Paluch et
al, 2005)
L’activation des Rho-GTPases est déclenchée en réponse à divers signaux extracellulaires qui
stimulent l’échange du GDP contre le GTP. Elle nécessite aussi un ancrage à la membrane
plasmatique. Le motif CAAX situé à l’extrémité C-teminale des petites protéines G (figure I.2) est
modifié par l’adjonction d’un groupement isoprényl, soit farnésyl (15 carbones) pour les protéines
dont le résidu X est une sérine ou une méthionine, soit géranylgéranyl (20 carbones) lorsque le
résidu X est une leucine (Winter-Vann et al., 2003). Les résidus AAX sont ensuite clivés et
exposent la fonction carboxylique en C-terminal alors méthyl-estérifiée (Konstantinopoulos et al.,
2007). Ensuite, les GTPases présentant en N-terminal de la séquence CAAX un groupement de
cystéines subissent à ce niveau une palmitoylation qui augmente alors l’ancrage à des secteurs
spécifiques de la membrane plasmique (Hancock et al., 1991). Les petites protéines G présentent
une grande affinité pour les nucléotides guanidiques et une faible activité enzymatique intrinsèque
34
d’hydrolyse du GTP et d’échange du GDP/GTP (Wennerberg and Der, 2004).Trois classes de
protéines régulatrices contrôlent le passage d’un état à l’autre: les GEFs, les GAPs et les GDIs.
Les GEFs (GTP Exchange Factors) favorisent l’échange d’une molécule de GDP par une molécule
de GTP en se liant à la forme Rho-GDP. Elles déstabilisent le complexe GDP-GTPase et stabilisent
la forme intermédiaire non liée aux nucléotides. Étant donné que le rapport de la concentration
intracellulaire GTP/GDP est élevé, le GDP libéré est remplacé par un par un GTP menant ainsi à
l’activation des GTPases (Schmidt et al, 2002). La plupart des GEFs comportent un « domaine
DH » (Dbl homology), responsable de leur activité catalytique, associé en C-terminal à un
« domaine PH » (Pleckstrin Homology) pouvant moduler l’activité d’échange ou interagir avec des
phospholipides et des protéines et ainsi cibler les GEFs à la membrane (Rossman et al., 2005). Le
domaine PH est également impliqué dans l’inhibition des GEFs par son association intramoléculaire
suite à un changement de conformation comme pour la protéine Vav 3, GEF spécifique de Rac1 par
exemple. Cette inhibition peut être levée grâce à la phosphorylation des GEFs, à leur interaction
avec les sous unités des protéines G hétérodimériques ou avec le phosphatidylinositol 3, 4, 5
triphosphate (PIP3).
Les GAPs (GTPases Activating Protein) stimulent l’activité d’hydrolyse enzymatique intrinsèque
faible des Rho GTPases ramenant la protéine à l’état inactif sous la forme Rho-GDP. Elles
présentent une région commune de 170 acides aminés nommée « domaine RhoGAP » ou « domaine
BH » correspondant à l’activité catalytique (Peck et al, 2002). Ces protéines peuvent être régulées
positivement et négativement par interactions avec d’autres protéines en induisant un changement
de conformation au niveau des sites catalytiques mais également par des modulations du niveau de
leur phosphorylation en régulant leur localisation subcellulaire, leur dégradation avec d’autres
protéines ou des phospholipides (Sordella et al., 2003); (Bernards, 2003).
Les GDIs (Guanine nucléotide Dissociation Inhibitor) jouent un rôle important dans l’adressage
des RhoGTPases à la membrane. Les GDIs jouent un rôle important dans l’adressage des
RhoGTPases à la membrane. Tout d’abord, elles inhibent l’activité d’échange de GDP contre du
GTP de la protéine. Ensuite, elles ont la capacité de se lier à la forme active des GTPases, bloquant
ainsi l’hydrolyse du GTP et empêchant leur interaction avec des effecteurs. Enfin, elles jouent un
rôle important dans la localisation cellulaire des GTPases. En masquant le résidu hydrophobe C-
terminal, les protéines GDI empêchent leur ancrage à la membrane plasmique et maintiennent un
pool de GTPases cytoplasmique. Ces GTPases monomériques sont, par conséquent, cytosolubles
sous forme inactive et membranaires sous forme active.
35
De plus, il est intéressant de noter que certains effecteurs des GTPases peuvent réguler
l’activité des GDI et donc créer une boucle de régulation. Par exemple, PAK (p21-activated kinase),
un effecteur de Rac1, phosphoryle RhoGDI sur deux résidus sérine situés dans la poche de fixation
du groupement isoprényl de la GTPase.et provoque le relargage de Rac1. Elle permet alors une
activation de la GTPase par un GEF (DerMardirossian et al., 2004). L’ubiquitinilation de la ligase
E3 smurf1 stimulée par un effecteur Rac1 favorise l’activité de la RhoGTPase. (Lemonnier et al.,
2007)
La régulation de l’état d’activation des GTPases de la famille Rho passe donc non seulement par les
trois types de partenaires que sont les GEF, les GAP et les RhoGDI, mais semble aussi passer par
une boucle de régulation dépendante des effecteurs.
Figure I.5: Cycle d’activation des petites GTPases de la famille des protéines Rho.
Les protéines Rho activées interagissent avec de nombreux effecteurs à différents niveaux pour
permettre la transduction du signal.
36
III.2. Réorganisation du cytosquelette d’actine par les petites protéines G de la
famille Rho.
Le rôle de ces protéines dans l’organisation du cytosquelette d’actine a été démontré dans les
études sur les cellules fibroblastiques mobiles. Ces cellules fibroblastiques, les Swiss 3T3, ont été
micro-injectées avec les formes sauvages, mutantes activées ou inactivées de RhoA, Rac1 ou Cdc42.
Le marquage par immunofluorescence de l’actine, la vinculine, la taline ou encore la paxilline a
permis de déterminer l’action spécifique des trois petites protéines G de la famille Rho dans la
réorganisation du cytosquelette d’actine, en réponse à différents stimuli.
Figure I.6 : Cascade des GTPases RhoA, Rac1 et Cdc42 impliquées dans l’organisation du
cytosquelette des cellules Swiss 3T3 (d’après (Mackay and Hall, 1998).
37
Figure I.7 : image de microscopie électronique d’une cellule en migration
De plus, après stimulation par Cdc42G12V, il a été observé, dans un deuxième temps,
l’apparition de lamellipodes qui sont de larges avancées de membrane sur une faible épaisseur en
forme de lamelle, sous-tendues par un ensemble de filaments d’actine associés en réseau. Puis, dans
un délai plus long, apparait une augmentation du nombre et de la taille des fibres de stress, câbles
d’actine associés à de la myosine qui traversent de part en part la cellule.
La micro-injection de Rac1 sous forme sauvage ou dominant positif (Rac1G12V) dans les
cellules Swiss 3T3, ou la stimulation des cellules par du PDGF, de l’EGF ou de l’insuline entraîne
une accumulation d’actine filamenteuse au niveau de la membrane et la formation de replis
membranaires (Ridley and Hall, 1992); (Ridley et al., 1992). Rac1 est également responsable de la
mise en place de lamellipodes. Ces lamellipodes sont formés au front de migration cellulaire où ils
dirigent la progression des cellules mobiles. La formation des lamellipodes semble être coordonnée
avec celles des filopodes. Des replis membranaires, structuralement similaires aux lamellipodes
mais formés sur la face dorsale des cellules adhérentes ou des leucocytes, sont également induits par
Rac1 (Makino et al., 2007) (Figures I6 et I7). Enfin, dans les conditions de microinjection de
Rac1G12V, et de manière plus tardive, on observe l’apparition de fibres de stress accompagnées de
l’agrégation de la vinculine et de la taline dans des points d’adhérence focaux (PAF).
La forme activée de RhoA (RhoAG14V) micro-injectée dans les cellules Swiss 3T3
entraine la mise en place de fibres de stress et de PAF (Paterson et al., 1990); (Ridley and Hall,
1992). Ces fibres en tension interagissent avec la matrice extracellulaire au niveau des PAF. Leur
formation est corrélée avec une mobilité cellulaire moindre et un ancrage plus important à la
38
matrice. L’acide lysophosphatidique (LPA) contenu dans le sérum est capable de reproduire la
formation de fibres de stress et de PAF (Ridley and Hall, 1992) (Figures I.6 et I.7).
Ces résultats mettent en lumière une cascade d'activation entre les GTPases Cd 42, Rac1 et
Rho A induisant de manière séquentielle la formation de structures membranaires distinctes.
L’activation de Cdc42, sous sa forme GTP, permet la formation de filopodes et entraine l’activation
de Rac1. Cette activation conduit à la formation de replis membranaires et de lamellipodes. Enfin,
l’activation de Rac1 conduit à une activation de RhoA, entraînant la formation de plaques
d’adhérence et de fibres de stress. Il existe un contrôle coordonné de la mobilité cellulaire par les
petites protéines G de la famille Rho, à la fois sur le plan temporel et sur le plan spatial dans les
fibroblastes Swiss 3T3 mais également dans d’autres types cellulaires (Malliri and Collard, 2003);
(Nobes and Hall, 1999) (Figures I.6 et I.7). De nombreux effecteurs de Rac1 et Cdc42 contribuent
au réarrangement du cytosquelette d’actine en aval de l’activation de ces deux GTPases
(Raftopoulou and Hall, 2004).
Figure I.8 : Les différentes étapes de la migration cellulaire. Cdc42 régule la direction de la
migration, Rac1 induit la formation de protrusions membranaires au niveau du front de
migration de la cellule et RhoA permet la contraction des filaments d’actomyosine à l’arrière de
la cellule.(D’après (Raftopoulou and Hall, 2004))
39
Ainsi, Rho, Rac-1 et CD42 jouent un rôle essentiel dans ces processus de remodelage de la
membrane plasmique par la réorganisation du cytosquelette d'actine (Fackler and Grosse, 2008). Rac
régule directement l'allongement des filaments d'actine en démasquant leur extrémité barbée, et ce
en agissant sur la synthèse du phosphatidylinositol (4,5)-biphosphate (PIP2).
En fait, Rac active son effecteur PAK qui lui même stimule la LIMKinase qui va phosphoryler
et inactiver l’activité déstabilisatrice de la cofiline (Disanza et al., 2005) (figure I.9). Celle-ci
provoque ainsi la stabilisation des filaments d’actine. L’activation des LIMKinases est aussi
contrôlée par Rho via son effecteur de la Rho Kinase (Rock). Dans ce cas, le comportement
migratoire des CSM
Figure I.9: Rôle des RhoGtPases dans la polymérisation de l’actine (d’après (Ridley, 2006)).
40
PAK1 appartient à la famille des kinases. Les PAKs (p21 Activated Kinase) ont été les
premières kinases régulées par les petites protéines G identifiées lors d’une évaluation de partenaires
des GTPases activées dans le cytosol de cerveau de rat (Manser et al., 1995). Ces protéines sont les
effecteurs directs de Rac1 et de Cdc42 mais pas de RhoA. Il existe plusieurs isoformes de PAK :
PAK1 ou αPAK, PAK2 ou γPAK et PAK3 ou βPAK, et un PAK non conventionnel appelé PAK4,
relativement proche de PAK2/γPAK. Les PAKs se lient uniquement aux formes GTP de Rac1 et
Cdc42 par leurs domaines CRIB (Cdc42/Rac1 Interactive Binding) (Burbelo et al., 1995); (Manser
et al., 1995). In vitro, les isoformes PAK1 et PAK3 se fixent de manière identique à Rac1 et Cdc42.
cependant Cdc42, sous forme GTP, stimule l’activité de PAK1 de manière plus importante par
rapport à Rac1 (Manser et al., 1995). Une fois activées par Rac1 et Cdc42, les PAKs peuvent activer
d’autres protéines via leur activité sérine/thréonine kinase (Zhao and Manser, 2005).
Parmi celles-ci, les LIMKinases, protéines activées à serine Kinase, prennent une place importante
dans la signalisation induite par Rac 1/ Cdc 42 via les PAKs (Arber et al., 1998). Les LIMkinases
sont caractérisées par la présence de deux domaines LIM suivis par un domaine PDZ ainsi qu’un
domaine Kinase C terminal. A l’heure actuelle, deux isoformes sont connues, LIMK1 et LIMK2,
dont les seuls substrats connus sont des protéines de la famille ADF (actin dépolymerizing factor)
(Scott and Olson, 2007).
Il a été aussi décrit l’activation par Rac1 de la PI3K, dont le substrat est PIP2. Si les effets de
cette activation sur les voies de contrôle de l’apoptose représentent un élément important de cette
voie (Rioux-Bilan et al., 2008), la synthèse de PIP3 en réponse à Rac1 est également un élément très
important dans la régulation de la mobilité cellulaire (Sidani et al., 2007); (Van Troys et al., 2008).
41
Diverses protéines favorisent la polymérisation de l’actine. La protéine WASP, absente ou
mutée chez les patients atteints du syndrome de Wiskott-Aldrich, est exclusivement exprimée dans
les cellules hématopoïétiques (Symons et al., 1996). Les cellules de ces patients présentaient une
surface cellulaire anormalement irrégulière, ce qui laissait présager un rôle de WASP sur le
cytosquelette. Les protéines de la famille WASP peuvent être séparées en deux groupes : les
protéines WASP et N-WASP et les protéines WAVE. Les protéines WAVE ne possèdent pas de site
de liaison direct aux GTPases mais une connexion fonctionnelle avec Rac1 (Miki et al., 1998). Elles
semblent jouer un rôle important dans la formation des lamellipodes induits par Rac1 (Jaffe and
Hall, 2005). En effet, il a été montré d’une part que WAVE est localisé préférentiellement au niveau
des lamellipodes et d’autre part que la surexpression d’un mutant d’un domaine C-terminal de
WAVE conduit à l’inhibition de la formation des replis membranaires induits par Rac1.
Figure I.10 : Voies de signalisation activées par Rac1 et Cdc42 et contrôlant la formation des
lamellipodes et des filopodes. Rac1 et Cdc42 interagissent avec différentes cibles, comme la
serine/thréonine kinase PAK, la lipide kinase PIP-5 kinase, les protéines de la famille
WASP/WAVE qui sont toutes impliquées dans la réorganisation du cytosquelette.
42
B. Hypoxie chronique et migration mésenchymateuse
43
l'ATP-synthase (Mitchell, 1961). Ces réactions sont assurées par des complexes enzymatiques
constitués de sous-unités codées à la fois par l'ADN nucléaire et par l'ADN mitochondrial.
L'ATP ainsi produit est continuellement utilisé par la cellule pour de nombreuses réactions
du métabolisme. Dans le cytosol, l'ATP représente alors le principal intermédiaire énergétique: le
couplage de l'hydrolyse de l'ATP avec une réaction endergonique permet de transférer l'énergie de
ces deux liaisons phosphate. Dans l'organisme, cette transduction d'énergie s'opère au cours des
processus biologiques comme les mouvements cellulaires, les biosynthèses ou les transports actifs.
Le complexe I (NADH ubiquinone oxydoréductase) est le plus gros des complexes enzymatiques de
la chaîne respiratoire avec une masse d'environ 980000 daltons et 45 ou 46 sous-unités
polypeptidiques différentes. Il accepte les électrons du NADH et les transmet, par l'intermédiaire
d'une flavine et de sept ou huit centres fer-soufre, à l'ubiquinone UQ qui transfère secondairement
ses électrons au complexe III. L’hydrogène, substrat de l’enzyme, est apporté par le NADH puis est
transféré vers le coenzyme Q. Ce complexe expulse les protons de la matrice vers l'espace
intermembranaire. Plus de 60 familles différentes de composés sont identifiées comme des
inhibiteurs du complexe I, dont le plus connu est la roténone.
Le complexe II (succinate ubiquinone oxydoréductase) a une masse d'environ 200000 daltons. Il est
commun au cycle de Krebs et à la chaîne respiratoire. En effet, ce complexe réalise l'oxydation du
succinate en fumarate pour réduire le FAD en FADH 2, puis il prend en charge deux électrons du
FADH2 et les transmet au pool quinonique situé dans la membrane interne mitochondriale mais ce
transport n'est pas couplé à un transfert de protons vers l'espace intermembranaire. Il est composé de
quatre sous-unités et contient un FAD et quelques centres fer-soufre.
Le complexe III (ubiquinone cytochrome c oxydoréductase). Sa forme active est un dimère. Chaque
monomère est composé de 11 sous-unités polypeptidiques et possède une masse de 240000 daltons.
Il comprend un cytochrome b, un cytochrome c 1, appelé coenzymeQ-cytochrome c oxydoréductase
44
et une protéine fer-soufre. Il transporte les électrons de l'ubiquinol au cytochrome c qui se déplace
dans l’espace inter membranaire. Il est inhibé par l'antimycine ou le myxothiazol.
Chaque complexe de la chaîne respiratoire a une plus grande affinité pour les électrons que son
prédécesseur. La chaîne respiratoire catalyse ainsi des réactions d'oxydoréduction successives entre
des couples de potentiel redox croissant. Les électrons passent ainsi en cascade d'un complexe à
l'autre grâce à des transporteurs. Ils sont finalement transférés à l'oxygène, qui a l'affinité la plus
grande pour les électrons.
45
Le transfert des électrons est couplé à des modifications allostériques des protéines des
complexes I, III et IV associées à l'expulsion de protons de la matrice mitochondriale vers l'espace
intermembranaire. Ce mouvement de protons a deux conséquences majeures:
- crée un gradient de pH (ΔpH) à travers la membrane mitochondriale interne avec une concentration
matricielle de protons plus faible que celle de l'espace intermembranaire :
Dans une cellule à l'état de repos, 1 à 2% des électrons transportés au niveau de la chaîne
respiratoire mitochondriale vont aboutir à la production d'anions superoxydes à partir des complexes
I et III (Ksenzenko et al., 1992); (Beyer, 1990). Ces anions sont, soit libérés dans le cytosol, soit
neutralisés dans la mitochondrie par une superoxyde dismutase sensible au manganèse (MnSOD).
En l'absence de stress oxydatif majeur, les systèmes antioxydants neutralisent les effets de la
46
production de RLO. En effet, les organismes sont capables de s'adapter à des augmentations de RLO
prolongées en augmentant l'expression des enzymes antioxydantes et en stimulant les différents
systèmes de défense pour lutter ou réparer les dommages cellulaires (Demple, 1999) ; (Hermes-
Lima and Zenteno-Savin, 2002)
L’hypoxie place la cellule face à un défit métabolique qui lui impose de devoir adapter son
métabolisme pour subsister. Chez les eucaryotes, la plus grande partie de la formation d’ATP
aérobie se déroule dans la mitochondrie, véritable usine énergétique. Pour beaucoup d’organismes,
l’accepteur ultime d’électrons est l’oxygène. La forme réduite de cet accepteur est l’eau qui est donc
le produit final de ce métabolisme. Ce processus qui consomme de l’oxygène dans ses étapes finales
est appelé respiration aérobie. Au contraire, les métabolismes qui mettent en jeu des accepteurs
d’électrons qui ne nécessitent pas d’oxygène correspondent à la respiration anaérobie. Ainsi,
l’oxygène est l’élément central du métabolisme cellulaire car il permet la synthèse d’ATP en étant
le dernier accepteur d’électrons au sein de la phosphorylation oxydative.
Lors d’une hypoxie, la cellule risque de ne plus disposer de suffisamment d’oxygène pour
assurer la synthèse d’ATP qui était la sienne et maintenir son métabolisme énergétique. Une
diminution critique de la synthèse d’ATP peut induire alors une dépolarisation de la membrane
plasmatique, une ouverture des canaux voltage-dépendants du sarcolemme et une chute du potentiel
de membrane mitochondrial (Piper, 1988). Il en résulte une accumulation de Ca++ dans la cellule et
dans la mitochondrie qui provoque des lésions cellulaires irréversibles (ouverture du pore de
transition mitochondrial) (Snyder and Chandel, 2009).
Cependant, la cellule est susceptible de maintenir un taux d’ATP suffisant pour sa survie
grâce à la possibilité de moduler son métabolisme et de produire de l’ATP par voie anaérobique.
Plusieurs mécanismes d’adaptation à l’hypoxie permettent aux cellules de compenser les variations
aiguës et chroniques en oxygène. Par exemple, les chémorécepteurs artériels sont sensibles aux
variations de pression artérielle en oxygène (PaO2) et stimulent immédiatement les systèmes
47
cardiovasculaires et respiratoires en cas de diminution de la PaO 2. De même, les cellules rénales sont
capables d’ajuster leur sécrétion d’érythropoïétine (EPO) en cas d’oxygénation rénale inadéquate.
Ainsi, toutes les cellules ont la capacité de détecter des variations de PaO 2 et d’initier l’expression de
gènes par l’activation de facteurs induits par hypoxie (Semenza, 1994). De plus en plus d’arguments
dans la littérature suggèrent que la mitochondrie pourrait jouer un rôle central dans l’adaptation
cellulaire à l’hypoxie en détectant les variations de PaO 2 et en initiant la génération des facteurs
induits par hypoxie (Brunelle et al., 2005) ; (Bell et al., 2005) ; (Chandel et al., 1998) ; (Bell et al.,
2007); (Harrois et al., 2009).
Au cours de ces dernières années, plusieurs théories ont été avancées pour expliquer
comment une cellule pouvait percevoir la pression partielle intracellulaire en oxygène (oxygen
sensing). Malgré une meilleure compréhension des mécanismes mis en jeu, le sujet reste
actuellement extrêmement discuté. La mitochondrie est depuis longtemps suggérée comme pouvant
être un détecteur de la quantité d’oxygène au sein de la cellule. En effet, c’est elle qui consomme
l’oxygène et elle représente donc le site intracellulaire où la pression partielle en oxygène est la plus
basse. Dans cette hypothèse, les espèces radicalaires de l’oxygène (ERO) pourraient jouer un rôle de
médiateurs intracellulaires entre la mitochondrie et les mécanismes d’adaptations cellulaires à
l’hypoxie. Lors du fonctionnement normal de la chaîne respiratoire, les électrons provenant du
cytochrome c sont transférés vers l’oxygène provenant d’une simple diffusion à partir des
capillaires. 0,4 à 4% de l’oxygène consommé s’échappe sous forme d’anion superoxyde (O 2-) libéré
au niveau des complexes I et III mitochondriaux. Cet anion est rapidement transformé par l’enzyme
superoxyde dismutase (SOD) en une ERO plus stable mais hautement diffusible, le peroxyde
d’hydrogène (H2O2). Lors d’une hypoxie, la diminution d’oxygène au niveau du dernier complexe
mitochondrial (complexe IV – cytochrome oxydase) impliquerait une diminution de l’activité de ce
complexe et une production accrue d’ERO au niveau du complexe III mitochondrial avec une
48
élévation brutale de la quantité d’anion superoxyde qui s’échappe de la mitochondrie (Chandel et al.,
1998) et (Duranteau et al., 1998). Cette élévation d’O2− serait le signal initiateur de plusieurs
mécanismes d’adaptation cellulaire à l’hypoxie comme la régulation de hypoxia inducible factor
(HIF), la synthèse d’EPO, de facteurs de croissance vasculaire ou de transporteur du glucose
(GLUT-1). Cette diminution de l’activité de l’enzyme cytochrome oxydase s’accompagne d’une
diminution du métabolisme cellulaire (Duranteau et al., 1998) et (Budinger et al., 1998). Ce
phénomène appelé « hypoxic conformance of metabolism » entraîne une diminution d’utilisation de
l’ATP cellulaire et donc une préservation des capacités énergétiques cellulaires.
Les facteurs induits par l’hypoxie sont à l’origine de l’augmentation de l’expression de plus
de 200 gènes impliqués dans la réponse cellulaire à l’hypoxie et/ou l’ischémie (Schumacker, 2005)
et (Safran and Kaelin, 2003).
Parmi ces facteurs de transcription activés par une faible concentration d’oxygène, se
trouvent la protéine liant l’élément de réponse à l’AMP cyclique (CREB) (Beitner-Johnson and
Millhorn, 1998), l'Activator Protein-1 (AP-1) (Finkenzeller et al., 1995); (Bandyopadhyay et al.,
1995), le facteur-KB nucléaire (Nfkb) (Koong et al., 1994a); (Koong et al., 1994b) et la protéine
Early Growth Response-1 (Egr-1) (Yan et al., 1999); (Yan et al., 1998); (Lo et al., 2001); (Nishi et
al., 2002). Cependant, le facteur de transcription inductible par l’hypoxie ou « Hypoxia Inducible
Factor 1 » (HIF-1) est le régulateur le plus important dans le contrôle de l'homéostasie de l'oxygène.
HIF-1, en induisant une batterie de gènes cibles, permet la réponse et l'adaptation des cellules dans
un micro-environnement pauvre en oxygène. Ce facteur de transcription a été identifié pour la
première fois en 1992 par Gregg Semenza comme régulateur crucial de l’expression du gène de
l’érythropoïétine (EPO) en réponse à une faible concentration en oxygène (Semenza and Wang,
1992); (Wang and Semenza, 1993). A l’heure actuelle, plus d’une centaine de gènes ont été
identifiés comme cible de HIF-1. Ces gènes, permettant la réponse et l’adaptation des cellules à
l’hypoxie, sont impliqués dans les phénomènes d’angiogénèse, de glycolyse, de prolifération et
survie, de régulation du pH, d’invasion et de migration (Semenza, 2003); (Ke and Costa, 2006).
49
HIF-1, est une protéine qui est un hétérodimère composé de deux sous-unités, HIF-1α et
HIF-1β. Chacune de ces sous-unités a une structure de base du type hélice, boucle, hélice ainsi que
deux domaines, chacun appartenant à la famille des facteurs de transcription du type PER-ARNT-
SIM (PAS-A et PAS-B). HIF-1β est exprimé de manière constante et indépendante du taux
d’oxygène. Au contraire, HIF-1α est régulé par l’oxygène et est rapidement dégradée en normoxie
par des prolylhydroxylases (PHD).
La protéine HIF-1α est constituée par plusieurs domaines ou régions. La région basique
(bHLH) est impliquée dans la dimérisation et dans la liaison directe avec l’ADN. Le domaine Per-
ARNT-Sim (PAS) contient des régions hydrophobes nommées PAS A et PAS B. Ce domaine forme
une seconde zone de dimérisation entre les sous-unités α et β (Jiang et al., 1996). Le domaine PAS
est également connu pour lier la protéine chaperone HSP90 qui joue un rôle dans la stabilisation et
l'accumulation de la sous-unité HIF-1α. En plus de la région basique N-terminale (bHLH) et des
domaines PAS, la protéine HIF-1α possède dans sa moitié C-terminale, deux domaines de
transactivation (TADs) impliqués dans la régulation et la stimulation de la transcription : le domaine
de transactivation N-teminal (N-TAD) et le domaine de transactivation C-terminal (C-TAD) (Pugh
et al., 1997). Le domaine C-TAD a été montré comme agissant dans l’activation de la transcription
via l’interaction avec des co-activateurs comme p300/CBP (Lando et al., 2002); (Hewitson et al.,
2002). En amont du domaine N-TAD, se trouve un domaine de dégradation dépendant de l'oxygène
(ODD), qui confère une certaine instabilité à la sous-unité HIF-1α en présence d’oxygène ((Jiang et
al., 1997); (Huang et al., 1998)). Ce domaine comporte des résidus reconnus et hydroxylés par des
prolyl-hydroxylases (PHD). Ce domaine, situé dans sa partie centrale, s’étend sur environ 200 acides
aminés (401-603). Il contient deux prolines 402 et 564. HIF va s’associer par l’intermédiaire d’une
50
des prolines hydroxylées au complexe E3 ubiquitine ligase appelé ECV (Elongin/Cullin2/VHL)
(Figure I.13).
51
Figure I.14 : en situation de normoxie la sous-unité Hypoxia inductible factors (HIF-1α) est
hydroxylée sur ses acides aminés par des prolylhydroxylases (pHD). Cette hydroxylation permet
à HIF-1α d’être reconnu par le facteur de suppression tumorale Von Hippel-Lindeau et d’être
degradé.
Lorsque l’apport en O2 devient insuffisant, l’activité des PHD est inhibée et HIF-1α
s’accumule, migre vers le noyau cellulaire et s’associe à HIF-β pour initier la transcription des gènes
impliqués dans la réponse à l’hypoxie (figure I.15, Dupic L et al, 2010). Les mécanismes prévenant
l’hydroxylation de HIF-1α restent débattus, mais là encore, il apparaît que cette hydroxylation
pourrait être prévenue par la génération d’ERO mitochondriaux (Bell et al., 2007) ; (Schumacker,
2005) ; (Loor and Schumacker, 2008) ; (Chandel et al., 2000). Cette hypothèse s’appuie sur le fait
que les cellules dépourvues d’ADN mitochondrial (cellules ρ°) semblent incapables d’assurer la
stabilisation d’HIF-1α au cours de l’hypoxie (Chandel et al., 2000). De même, l’administration
d’inhibiteurs de la chaîne respiratoire mitochondriale inhibe la stabilisation hypoxique de HIF-1α
(Chandel et al., 2000) et HiF-1, via l’hypoxie, engendre un changement dans l’expression d’un
intermédiaire de la chaîne de transport d’électrons (« cytochrome c oxidase complex IV »),
augmentant ainsi l’efficacité de la respiration sous des conditions pauvres en oxygène (Fuduka et al,
52
2007). Gerald et ses collaborateurs, en utilisant un modèle cellulaire ayant perdu ses capacités
antioxydantes, ont montré qu’il existait un lien entre stress oxydatif et inhibition de HIF. Ces
différentes approches suggèrent que la voie de signalisation de HIF en situation d’hypoxie est
dépendante d’une altération de la fonction mitochondriale par l’intermédiaire de la production
d’ERO. L’accumulation d’ERO serait due à une inactivation de Jun D (une des protéines de la
famille multigénique Jun, facteur de transcription AP-1 du VGEF) et favoriserait l’accumulation
des ROS parmi lesquels le peroxyde d’hydrogène (H 2O2). Conformément à la réaction de Fenton, le
H2O2 réagit avec l’ion ferreux (Fe2+) pour produire l’ion ferrique (Fe3+). La diminution d’ion ferreux
(Fe2+) et l’accumulation de l’ion ferrique (Fe 3+) produit par réaction inhiberait l’activité enzymatique
des PHD (figure 3) (Gerald et al., 2004)
Figure I.15 : Dans des conditions d’hypoxie, les espèces radicalaires en oxygène (ERO) produites
en quelques secondes inhibent l’activité des PHD ce qui empêche la dégradation de Hypoxia
inducible factors (HIF-1α) qui va alors se lier à HIF-1 . La partie N-terminale de HIF-1
contient les domaines Basis helix Loop helix (bHLH) et PAS qui permettent la dimérisation de
HIF-1 et leur fixation sur le promoteur de nombreux genes impliqués dans la glycolyse
l’angiogénèse et la survie cellulaire.
53
utilisation de l’oxygène disponible dans la cellule. Les PHD qui interviennent dans l’hydroxylation
de HIF-1α ont un Km plus élevée. Ainsi en situation d’hypoxie les cytochromes utiliseraient tout
l’oxygène, ce qui empêcherait les PHD de fonctionner et permettrait l’activation de HIF-1 (Hagen
et al., 2003) ; (Taylor, 2008).
Ainsi, l’activation de HIF pourrait générer l’expression de gènes impliqués dans la glycolyse
et renforcer la protection cellulaire à l’hypoxie en augmentant la capacité cellulaire à générer de
l’ATP par la glycolyse anaérobie. HIF stimule également la synthèse de l’EPO qui permet la
stimulation de l’érythroblastose médullaire (Semenza, 1994) ; (Semenza, 1998) ;(Semenza, 2000) ;
(Semenza et al., 2006). HIF -1 joue également un rôle important dans la détermination de la capacité
antioxydante d’une cellule. Par exemple, des souris délètées de HIF-2α développent des
dysfonctions d’organes associées à des diminutions d’expression des antioxydants enzymatiques et
au développement de lésions de stress oxydant (Scortegagna et al., 2003). L’activation de HIF
conduit également à l’expression de l’hème oxygénase-1 (HO-1), susceptible de réguler la survie
cellulaire lors des phénomènes d’ischémie ou de reperfusion et de stress oxydant, de la NO synthase
inductible, ou du vascular endothelial growth factor (VEGF) impliqué dans l’adaptation locale
microvasculaire. Ainsi, l’activation de HIF apparaît améliorer la survie cellulaire lors de l’hypoxie
par le biais de multiples mécanismes dont l’augmentation des capacités antioxydantes, la stimulation
de l’angiogénèse, des effets anti-apoptotiques et reprogramme le métabolisme énergétique cellulaire
ainsi que le métabolisme glucidique (Semenza, 2008) (Figure I.16).
54
Figure I.16 : Représentation schématique de la régulation de HIF (Carroll and Ashcroft, 2005)
Il a été montré que lors de la mobilisation des CSM induite par hypoxie ces cellules
exprimaient le facteur HIF ((Eder et al., 2004)). D’autres auteurs ont démontré que la sous-unité
sensible à l’oxygène de la protéine HIF-1α avait la capacité de réguler le recrutement de cellules
souches progénitrices dérivant de la moelle osseuse au site de lésion du tissu afin d’amorcer sa
régénération (Ceradini and Gurtner, 2005).
55
II.Hypoxie et migration des cellules souches mésenchymateuses.
Au sein de la moelle osseuse, les cellules souches adultes sont physiologiquement exposées à
une faible teneur en oxygène, évaluée à 7% à l'état stable (Ishikawa and Ito, 1988).
Des modèles mathématiques ont ainsi indiqué l'existence d'un gradient de concentration en
oxygène au sein de la moelle osseuse allant de la zone plutôt bien oxygénée (sinus vasculaires) à
une zone relativement hypoxique (près de l'endostéum) (Chow et al., 2001). La moelle osseuse est le
lieu de résidence des Cellules Souches Mésenchymateuses (CSM) et la teneur en oxygène a été
démontrée comme modulant certaines de leurs caractéristiques. En particulier, la culture de CSM
sous une tension réduite en oxygène (5-8%) augmenterait in vitro leur potentiel de différenciation
osseuse (Lennon et al., 2001), adipocytaire (Fink et al., 2004); (Honczarenko et al., 2006) et
chondrocytaire (Moussavi-Harami et al., 2004); (Robins et al., 2005).
Une étude a montré sur des CSM humaines qu'une courte exposition à l'hypoxie (24
heures) stimulait leur prolifération et leur entrée dans le cycle cellulaire ((Martin-Rendon et al.,
2007)) avec une expression différentielle de nombreux gènes, tandis que le potentiel de
différenciation était maintenu pour les voies ostéocytaire et adipocytaire et augmenté pour la voie de
différenciation chondrocytaire.
Les CSM peuvent être isolées à partir de la plupart des organes et tissus fœtaux et adultes
(da Silva Meirelles et al., 2006). Cependant elles sont habituellement isolées à partir de la moelle
osseuse. La présence constitutive des CSM dans le sang périphérique chez l'adulte a longtemps été
débattue et controversée chez l'homme, que cela soit en situation physiologique ou après
stimulation. Ainsi, la circulation des CSM semble un événement rare chez l'homme. La présence
d'un contexte physiopathologique particulier, tels que l'infarctus du myocarde ou l'encéphalopathie
56
((Zyuz'kov et al., 2005)) ont été rapportées comme permettant la mobilisation des CSM dans la
circulation périphérique dans le cadre d'une adaptation à l'hypoxie induite (Kuznetsov et al., 2001).
Des cellules souches provenant de la moelle osseuse ont été rapportées comme pouvant contribuer
au remodelage vasculaire induit par l'hypoxie chronique (Hayashida et al., 2005). Toutefois, une
étude précédente de notre équipe a montré qu'une exposition de rats à l'hypoxie chronique (3
semaines) entraînait une mobilisation spécifique des CSM de ces rats dans la circulation
périphérique (Rochefort et al., 2006). La poursuite de l'étude a démontré la viabilité à long terme des
CSM après injection intraveineuse in vivo ainsi qu'une absence de domiciliation spécifique des CSM
dans la paroi artérielle pulmonaire au cours du développement de l'hypertension pulmonaire induite
par l'hypoxie chronique (Rochefort et al 2005). En effet, après une injection de CSM radiomarquées
à l'indium-111 en intraveineuse chez des animaux hypoxiques et normoxiques, la radioactivité s'était
accumulée dans un premier temps dans la zone pulmonaire. Puis graduellement et séquentiellement,
la radioactivité a été observée dans le foie, la rate, les reins et le tissu osseux. On a pu observer une
répartition stable et homogène au bout de 24 heures dans les deux groupes. Enfin, on a retrouvé une
domiciliation médullaire de ces CSM marquées après injection intraveineuse significativement
augmentée chez les animaux exposés à l'hypoxie chronique par rapport aux animaux normoxiques.
L'absence de domiciliation spécifique des CSM dans la paroi artérielle pulmonaire au cours
du développement de l'hypertension pulmonaire induite par l'hypoxie chronique sans discontinuité
de l'endothélium intimal, mais avec une localisation au sein du parenchyme pulmonaire autorise une
action paracrine de ces cellules, comme cela avait été évoqué par l'équipe de Baber (Baber et al.,
2007).
Les résultats ont permis d'établir que le mécanisme de mobilisation serait différent de celui
responsable de la mobilisation des progéniteurs hématopoïétiques. Pour expliquer ce phénomène de
mobilisation, des hypothèses ont été proposées, parmi lesquelles les auteurs ont évoqué: (1) une
action locale de la perméabilité vasculaire; (2) l'apparition d'un gradient chimiotactique entre la
moelle osseuse et le sang périphérique; (3) la sécrétion de molécules inflammatoires et/ou
chimiotactiques d'origine pulmonaire lors de la mise en place des remodelages vasculaires
pulmonaires conduisant au développement de l'hypertension pulmonaire induite par l'hypoxie
chronique. La stimulation hypoxique des CSM induit l'expression de nombreux facteurs de
croissance intervenant dans la prolifération et la survie cellulaire tels que le VEGF-D (Vascular
57
endothelial growth factor-D), le PGF (placenta growth factor), le HB-EGF (heparin-binding
epidermal growth factor), certaines métalloprotéases (Ohnishi et al., 2007) ou encore l’Interleukine-
6 (Rattigan et al.) qui augmente parallèlement leur capacité migratoire. Rosova et al ont aussi
montré une activation de la voie Akt intervenant dans la survie cellulaire avec une augmentation de
l’expression du récepteur c-Met pour HGF (hepatocyte growth factor) et une augmentation du
potentiel de migration chez des CSM précultivées sous hypoxie (Rosova et al., 2008). Ainsi, ces
données suggèrent l'existence d'un senseur à l'hypoxie et de mécanismes de régulation associés.
La NADPH oxydase est un complexe enzymatique dissocié dans la cellule au repos. Les
différents constituants qui la composent s’assemblent pour former un complexe multiprotéique actif
sous l’effet d’une stimulation extracellulaire. L’activation de la NADPH oxydase a été décrite
initialement au niveau de la NADPH oxydase phagocytaire. Le facteur p47-phox cytosolique de
l’oxydase lorsqu’il est phosphorylé migre à la membrane plasmique.
58
Figure I.17 : Modèle d’activation de la NADPH oxydase phagocytaire.
La consommation d’oxygène par les neutrophiles durant la phagocytose avait été observée
par Baldrige et Gerard (1933), et différenciée de la respiration mitochondriale par Sbarra et
Karnovsky (1959). Ce sont Babior et coll. (1973) qui identifient l’anion superoxyde comme le
produit de la NADPH oxydase, avec le NADPH comme donneur spécifique d’électron (Rossi and
Zatti, 1964) selon la réaction (Wientjes and Segal, 1995):
L’électron est transféré du NADPH au FAD qui est réduit, puis au cytochrome b 558 dont le
fer ferrique (Fe3+) du premier hème passe à l’état de fer ferreux (Fe 2+). De la même façon, le fer du
second hème est réduit, puis l’accepteur final d’électron, l’oxygène moléculaire est réduit en anion
superoxyde O2-. Les ions superoxyde produits sont instables et vont dismuter en peroxyde
d’hydrogène spontanément ou sous l’action de la superoxyde dismutase :
Différentes NADPHoxydases.
59
Les NADPHoxydases ont la capacité de transporter des électrons à travers la membrane
plasmique afin de produire des anions superoxydes, précurseurs de différentes formes réactives de
l’oxygène. Récemment, six homologues de la sous-unité catalytique Nox2 ont été identifiés
(Guichard et al., 2006); (Bedard and Krause, 2007) : Nox1 – Nox2 – Nox3 – Nox4 – Nox5 et les
Duox 1 et 2 (FigureI.18). Les Ros provenant des Nox sont impliqués dans la réorganisation du
cytosquelette, l’expression des gènes, la prolifération, la différenciation, la migration et la mort
cellulaire (Brown and Griendling, 2009). Ces enzymes sont souvent exprimées dans les mêmes
cellules et les mêmes tissus mais elles régulent fonctions différentes dans chacun de ces types
cellulaires.
Structurellement, tous les membres des Nox possèdent au moins six domaines
transmembranaires (obtenus selon le profil d’hydrophobicité de la séquence protéique) contenant
deux hèmes, un site de fixation au NADPH et un site de liaison au FAD cytosoliques. En plus, la
protéine Nox5 présente en partie N-terminale, quatre domaines EF-hand nécessaires lors de
l’activation de la protéine par le calcium (Banfi et al., 2001); (Banfi et al., 2004). Les Duox
possèdent les mêmes domaines que Nox 5 mais disposent, en plus, d’un domaine extra-cellulaire
Peroxydase-like et un domaine d’homologie gp91phox (Nox2) (Brown and Griendling, 2009).
L’activation de l’oxydase a lieu quand la NADPH se lie à la protéine Nox sur le côté
cytosolique de la membrane où les électrons sont transférés au FAD, puis à travers la chaîne
respiratoire jusqu’à l’oxygène au niveau de la face externe de la membrane, aboutissant à la
formation d’anion superoxide (O2-). Dans les Nox 1-4, la sous-unité transmembranaire p22phox
s’associe avec la protéine Nox à l’état actif et inactif. Il semblerait que les enzymes Nox
interagissent principalement avec les sous-unités du cytosol NoxO 1, NoxA1 et Rac-GTP. Cependant,
p47phox, p67phox peuvent remplacer respectivement NoxO1 et NoxA1. L’activation de la protéine
Nox2 implique son association avec Rac-GTP, p47phox, p67phox et p40phox. L’activation de
Nox3 est moins bien définie, mais on pense que Rac-GTP p47phox et NoxA 1 sont impliqués. Nox4
est activée de manière constitutive quand elle est associée avec la sous-unité p22phox. L’activation
des protéines Nox5 et Duox1/2 implique la présence de Calcium (Ca 2+) lié au domaine «EF-Hand
» dans le cytosol. (Geiszt and Leto, 2004).
Les sous-unités catalytiques Nox1 – Nox2 – Nox3 – Nox4 – Nox5 sont présentes dans de
nombreux tissus dans lesquelles elles exercent différentes fonctions (Figure I.19).
60
Figure I.18 : Les membres de la famille NOx et leurs sous-unités régulatrices (d’après (Brown
and Griendling, 2009)).
61
Figure I.19 : Distribution tissulaire et fonctions des Nox/Duox ((Guichard et al., 2006)).
Nous ne nous détaillerons que Nox1, Nox2 et No4x qui ont été décrites comme intervenant
dans la migration.
Nox1 Cette protéine a été clonée à partir d’une banque d’ADNc issue de cellules épithéliales du
colon (Suh et al, 1999). Elle est très exprimée dans les cellules épithéliales du colon (Rokutan et al.,
2008) et à un moindre degré dans les cellules musculaires lisses, endothéliales, dans les tissus utérin
et prostatique (Bedard and Krause, 2007). Elle présente 56 % d’homologie avec Nox2 sur ses 564
acides aminés (Banfi et al., 2000). Sa présence est associée notamment à une régulation de la
pression sanguine via l’angiotensine II mais l’hypothèse d’un rôle dans la défense immunitaire n’est
pas exclue depuis que des ROS ont été détectés au niveau du colon (Lambeth, 2002). De plus, un
homologue de p47phox, NoxO1 a été découvert dans l’épithélium colique et serait colocalisé avec
Nox1 (Banfi et al., 2003). L’induction des ARNm de Nox1 par l’IFN-g dans des cellules
épithéliales de l’intestin conforte cette hypothèse (Kuwano et al., 2006). D’autres recherches ont
montré son rôle dans la régulation de la croissance et la migration des cellules musculaires lisses
(Brewer et al., 2006); (Garrido and Griendling, 2009). Enfin, une étude récente suggère que
62
l’augmentation de l’activité de Nox 1 promeut la migration de l’adénocarcinome du colon ((Sadok
et al., 2008)) (Figure I.20).
Nox2 : C’est la protéine qui a été la plus étudiée et toutes autres les Nox sont décrites en référence à
cette protéine. Elle est synthétisée dans le réticulum endoplasmique sous sa forme précurseur
gp65phox partiellement glycosylée (Porter et al., 1994). Si la glycosylation de la protéine Nox2 n’est
pas essentielle à son activité catalytique, elle augmenterait la résistance contre la digestion par les
protéases cellulaires et permettrait un bon adressage de la protéine à la membrane (Paclet et al.,
2001) ; (Murillo and Henderson, 2005). Nox2 possède un poids moléculaire théorique de 65,339 Da
pour 570 acides aminés.
Elle est essentiellement connue pour son rôle dans la défense innée de l’hôte par production
de ROS et initialisation d’un certain nombre de réponse inflammatoire et immunoprotectrices. Dans
les cellules vasculaires Nox2 est activée par VGEF, l’Angiotensine-II, la thrombine, le VGEF, le
TNF et les forces mécaniques (Dworakowski et al., 2008). Les anions superoxides produits par
Nox2 peuvent réagir avec No (élément protecteur majeur des fonctions vasculaires) dans la cellule
63
pour en réguler sa biodisponibilité avec pour conséquence la création de NO 3- impliqué dans le
stress oxydatif (Oakley et al., 2009). Des études ont aussi montré leur implication dans l’apoptose
(Li et al., 2009); (Shen et al., 2004), la prolifération, la migration des cellules endothéliales ((Ushio-
Fukai, 2007)) et sur la réorganisation du cytosquelette (Yan et al., 1995) et sur les voies de
signalisation (Chen et al., 2009).
Nox4 La protéine Nox4 a été initialement identifiée comme la NADPH oxydase rénale. Sa structure
composée de 578 acides aminés présente une homologie de 39 % avec Nox2. Comme pour Nox1 et
Nox2, la présence de la protéine p22phox est absolument nécessaire pour l’activité oxydase.
Néanmoins, son activation semble être indépendante des facteurs cytosoliques (Martyn et al., 2006);
(Serrander et al., 2007) permettant une production constitutive d’anions superoxydes. La
modulation de l’activité de Nox4 se ferait par la régulation de son niveau d’expression (Touyz et al.,
2002).
Les ROS dérivés de Nox4 sont impliqués dans de très nombreux processus physiologiques
(Guichard, 2006) tels le vieillissement cellulaire (Schilder et al., 2009), l’apoptose, la survie , la
64
signalisation de l’insuline (Mahadev et al., 2004) et la migration (Meng et al., 2008); (Pendyala et
al., 2009). Cependant, en ce qui concerne la migration, les études sont sujet à controverse. Certaines
études ont montré son rôle activateur (Mahadev et al., 2004) alors que d’autres l’ont décrite
comme inhibitrice ((Lyle et al., 2009); (Haurani et al., 2008)) (Figure I.22).
65
synergie. L’intensité et la durée de l’activité NADPH oxydase dépendent des stimuli présents et de
leur quantité.
La région N_terminale de Rac est le site de fixation du GDP et du GTP. Comme nous
l’avons décrit précédemment, elle contient deux régions « Switch » (Switch I et II), c’est-à-dire
deux régions adoptant une conformation différente selon la nature du nucléotide lié à Rac. Les
66
régions Rac impliquées dans l’activation de l’oxydase sont la région Switch I (résidus 25-45), les
résidus 145-175 pour la liaison p67phox et sa région « insert » (résidus 124-135) probablement via
son interaction via le cytochrome b558 (Freeman et al., 1996); (Nisimoto et al., 1997).
Figure I.23 : Régulation de l’activité du cytochrome b558 en deux étapes d’après (Bokoch and
Diebold, 2002).
D’autres auteurs ont aussi montré que Rac 1/2 lié au GTP lié à p67-phox, entraînant le
changement dans sa conformation au niveau de la partie C-terminale, conduisait à la dissociation
du complexe p67-phox/p40-phox, pour permettre à p67-phox libre d’agir avec le cytochrome b 558
(Rinckel et al., 1999), (Heyworth et al., 1994). Une des conséquences de la stimulation de Rac est
l’activation de la NADPHoxydase via un démasquage de la sous-unité p47phox qui permet la
translocation de cette sous-unité vers la membrane et l’accrochage au cytochrome b 558 formant la
NADPHoxydase active. La participation de Rac2 à l’activation de la NADPHoxydase est
directement impliquée dans la physiopathologie du syndrôme de Wiskott-Aldrich.
67
Par ailleurs, il semblerait que Rac contrôle le chimiotactisme des neutrophiles et le
processus d’exocytose des granules primaires au cours de la dégranulation (Sun et al., 2004); (Koh
et al., 2005); (Mitchell et al., 2008). Enfin, Rac1 et les ROS intracellulaires moduleraient le potentiel
migratoire des cellules par l’intermédiaire d’un mécanisme dépendant de NFB et de la NADPH
oxydase (Tobar et al., 2008).
L’activation de la NADPH oxydase est reliée à la migration induite par l’hypoxie des
cellules endothéliales et la migration des cellules phagocytaires (neutrophiles). Le rôle de la
NADPH oxydase dans la migration des cellules mésenchymateuses n’a pas été étudié. Le
mécanisme exact reliant l’activation de la NADPHoxydase et la migration n’est pas parfaitement
connu.
68
Récemment, cette hypothèse a été modifiée par la mise en évidence du rôle de la pompe à
protons voltage dépendante VSOP couplée à l’activation de la NADPHoxydase. Cette pompe
permet, par l’évacuation de protons, de contrebalancer l’acidification induite par l’activité de
l’oxydase. Cette pompe est couplée à une ATPase membranaire (DeCoursey, 2008). Le gène humain
HV1 du canal proton a été caractérisé (Ramsey et al., 2006). D’autres canaux protons ont été
identifiés dans des espèces animales, le CiVSOP chez le requin (Sasaki et al., 2006), le mVSOP
chez la souris. Un gène codant pour une phosphatase sensible au voltage avait été précédemment
identifié (Murata et al., 2005). Ce canal est particulier par le fait qu’il comporte 4 domaines
transmembranaires mais ne possèderait pas les domaines S5-S6 correspondant au pore
conventionnel. Il s’agirait donc plus d’une protéine sensible au voltage que d’un véritable canal
ionique (Sasaki et al., 2006); (Ramsey et al., 2006) ; (Murata et al., 2005). Cette phosphatase
pourrait jouer un rôle dans la transformation d’un signal électrique en un signal chimique (Murata
and Okamura, 2007) (Figure I.24). Elle connecterait son domaine VSD à son domaine lipidique PD
induisant ainsi un changement de conformation allostérique à l’origine de son activation. Elle
s’autorégule par l’intermédiaire de son substrat PI(4,5)P2. En effet, un faible niveau de PI(4,5)P2
provoque le découplage de VSD de l’enzyme (Kohout et al., 2010).
Figure I.24 : Phosphatase, protéine sensible au voltage (Murata and Okamura, 2007)
L’activation de la NADPH oxydase modifie localement le pH (acidose), ce qui est compensé par la
pompe à protons et ce qui induit secondairement un flux calcique entrant. La pompe à protons est
couplée à l’ATPase membranaire.
69
Figure I.25 : Pompe à protons.
Ainsi l’hypothèse de ce travail était que la NADPH oxydase qui n’est décrite dans la littérature
que comme un système production de ROS pourrait avoir un rôle physiologique dans l’apport
d’ATP et de calcium de façon polarisée dans la cellule soumis à l’hypoxie chronique initiant les
changements de conformations du cytosquelette à proximité du front de migration.
70
Chapitre II :
Résultats personnels
71
A. Matériel et méthodes
Des rats Wistar adultes mâles (7semaines, 220 g; Harlan, Gannat, france
http://www.harlan.com) ont été hébergés pendant trois semaines dans une chambre hypobarique (50
kPa), induisant une baisse de 50% de la pression artérielle en oxygène. Cette exposition qui est un
équivalent d’une exposition à une Fi02 de 10% et induit un remodelage de l’artère pulmonaire
générant une hypertension artérielle pulmonaire en trois semaines validé par des études antérieures.
Les rats soumis à l’hypoxie chronique ont été comparés à des rats de contrôle appariés en âge
hébergés dans des conditions normoxiques (101 kPa). Le sang périphérique et la moelle osseuse ont
été collectées après sacrifice des animaux dans l’heure suivant leur sortie du caisson.
72
II.Préparation des cellules
Les techniques d'isolement et de cultures des CSM ont été réalisées selon le protocole
de la Société Française de Greffe de Moelle Osseuse et de Thérapie Cellulaire (SFGM-TC). Nous
avons prélevé en condition d'asepsie les fémurs. La surface de l'os a été débarrassée de tout tissu
adhérent. La moelle osseuse a été récupérée après irrigation de la cavité médullaire à l'aide d'une
aiguille 20 Gauge par du milieu murin composé de milieu de croissance Modified Eagle Medium
Alpha (α-MEM; Introven Corporation, Carlsbad, Californie), de 10% de serum de veau fœtal (Fetal
Calf Serum FCS; Hyclone, Logan, Utah), de solution antbiotique (1% penicilline/streptomycine;
Introgen), d'une solution antifongique (0,01% fungizone; Bristol Myers, New York) et d'un acide
aminé (1% L-glutamine, Introvigen). Les cellules ont été dispersées en passant le mélange dans une
aiguille de 20 Gauge de manière à obtenir une couche monocellulaire. Les cellules ont été
centrifugées 8 minutes à 1200 tours/mn à 20°C puis remises en suspension dans du milieu de
4
culture. Elles ont été comptées sur cellule Fastride puis étalées sur une flasque à une densité de 10
cellules/cm2, avant d'être incubées à 37°C dans une étuve à atmosphère contrôlée (air 95%, CO 2
5%). Le milieu de culture a été renouvelé à J4 puis deux fois par semaine. Les CSM ont été purifiées
selon leurs propriétés d'adhérence au plastique. Lorsque les CSM ont atteint 90% de confluence,
elles ont été mises en présence de trypsine (trypsin-EDTA, Introvigen) puis comptées sur cellule
Fastride et étalées à une densité de 1500 cellules/cm2.
73
Pour un lot de cellules issues des mêmes rats, marqueurs à la surface des cellules
positifs pour CD90 (78%) et CD73 (80%) et négatifs pour CD31 et CD45 (détermination par
cytométrie cytométrie en flux)
Congélation
-La congélation rapide en milieu humide : elle a été effectuée à l'aide du DMSO à 10% à partir d'une
suspension de cellules RPMI (v/v).
-La congélation rapide sur culot sec : elle est utilisée pour les expériences de biologie moléculaire.
Les cellules subissent 2 lavages au PBS suivis d’une centrifugation (10 minutes à 4° / 1500 tours
minutes) dans des eppendorfs de 500 μl. Après la dernière centrifugation, on retire totalement le
PBS et on place très rapidement les tubes à -80°C directement (Protocole Evry-Genopole).
Décongélation
Nous avons utilisé une méthode de décongélation rapide. Le tube congelé stocké à -80°C est
immergé dans un bain-marie à 37°C. Le petit tube est tenu jusqu'à l'obtention d'un petit glaçon. On
transvase alors très rapidement le contenu dans un falcon stérile préalablement rempli avec du
milieu de culture (milieu murin) afin de neutraliser la toxicité du dimethyl sulfoxide (DMSO, Sigma
Aldrich). Après centrifugation à 1200 tours/mn pendant 6 mn, on reprend le culot dans du milieu
murin et les cellules sont mises en culture après comptage sur cellule Fastride.
74
III.Techniques utilisées
®
Les tests de migration ont été réalisés dans des Transwells (pores de 8 μm de
diamètre) (Corning, Costar, Cambridge) en milieu de migration (RPMI avec 0,025 de sérum
albumine bovine, Fisher). La face supérieure des filtres a été recouverte avec 0,1% de gélatine puis
®
les Transwells ont été incubés pendant une heure à 37°C dans une étuve. 300 μl de CSM
médullaires issues de rats normoxiques et hypoxiques en suspension (2,5x10 5 cellules) ont été
déposées dans la chambre supérieure et 400 μl de sérum de rats normoxique dilué au demi, de
solution de SVF à des concentrations différentes (10% ET 20%) ou de milieu de migration seul ont
été déposés dans les puits. La migration observée avec le milieu de migration seul (RPMI/BSA
0,25%) a été considéré comme contrôle négatif. Le lendemain, après 18 heures de migration, nous
avons lavé la face supérieure des inserts avec du PBS froid et les cellules qui n'ont pas migré (donc
restée à la face supérieure du filtre) ont été enlevées avec un coton-tige. Ensuite, nous avons
récupéré dans des tubes eppendorf les CSM qui avaient migré dans les puits. Afin de ne perdre
aucune cellule ayant migré, nous avons trypsiné le fond de chaque insert avec 300 µl de
trypsine/EDTA 0,5% et reposé les inserts sur les puits. Après 10 mn à l'étuve à 37°C, nous avons
récupéré la trypsine de chaque puit que nous avons ajouté à la suspension de CSM puis lavé chaque
puit avec du RPMI/SVF 10%. Après centrifugation à 3000 tours/mn pendant 10 mn à 4°C, le
surnageant a été éliminé et chaque culot a été repris avec du RPMI et compté sur cellule Fastride.
Chaque expérience a été réalisée en duplicata et reproduite plusieurs fois. Les résultats ont été
exprimés en nombre de cellules ayant migré dans chaque puit puis comparés à ceux obtenus pour la
migration des CSM normoxiques et hypoxiques du contrôle (milieu de migration sans SVF).
75
III.2.Immunofluorescence.
Les cellules ont été ensuite lavées avec du PBS 1% à température ambiante avec deux lavages
courts suivis d'un lavage long. Les boîtes ont été alors préparées pour le marquage de l'actine par
300 μl d'une solution de Phalloïdine (25 μl/ ml)/PBS pendant 30 minutes suivi d’un lavage au PBS
1% (2 rinçages courts et un rinçage long).
76
Les bords de chaque boîte ont été découpés à l'aide d'une pince puis les lames obtenues
ont été rincées au PBS et séchées sur un papier absorbant. 300 μl d'une solution d’Anticorps primaires
a été déposés sur un papier parafilm recouvert par le fond des boites (annexe-tableau1). Au bout de
deux heures, les lames ont été rincées avec une solution de PBS 1% à température ambiante (2
rinçages courts et un rinçage long) et séchées sur un papier absorbant. 300 μl d'une solution
d’Anticorps secondaires ont été appliqués de la même façon avec un temps d’incubation de 1H00. Les
lames ont été conservées à 4°C avant d'être lues au microscope confocal.
-d’un balayage de l’échantillon point par point à l’aide d’un ou plusieurs faisceaux lasers.
-d’une limitation des signaux collectés en retour à l’aide de diaphragme ou pinhole placés en avant
des photomultiplicateurs.
Elle a été réalisée à partir de deux populations de cellules (CSM hypoxiques et CSM
normoxiques) pour comparer l'expression de gènes codant pour l'expression de HIF-1α
comparativement au 18S.
Extraction d’ARN
Aux culots secs contenant les cellules CSM normoxiques et les CSM hypoxiques conservés
au congélateur à -80 ° C a été ajouté 500 μl de Trizol et les tubes ont été de nouveau placés 30
minutes au congélateur à -80 ° C. Après ajout de 300 μl de chloroforme pendant 6 minutes les tubes
ont été centrifugés à 10 000 rpm pendant 15 minutes à 4°C. Le surnageant des échantillons
contenant l’ARN ont été prélevé puis 500 μl d’isopropanol a été ajouté suivi 5 minutes après d’une
nouvelle centrifugation. Le surnageant a été totalement enlevé puis de l’éthanol à 70% a été
77
rajouté suivi d’une nouvelle centrifugation. Après élimination totale du surnageant, de l’eau milliQ
RNAse free a permis de récupérer l’éluât contenant les ARN dosé et stocké à -80°C. La
concentration en ARN des différents échantillons a mesurée par spectrophotométrie (Nanodrop) à
une absorbance de 260nm. L’absorbance à 280nm permettait de vérifier l’absence de contamination
par l’ADN et l’absorbance 230 l’absence de contamination par l’éthanol. Le ratio Absorbance à
260nm sur absorbance à 280nm était toujours compris entre 1.8 et 2.1.
PCR quantitative
TM
La PCR quantitative a été réalisée à l'aide du kit SuperScript One-step RT-PCR avec du
®
Platinium Taq (Invitrogen). Les constituants tant pour la synthèse de l'ADNc et la PCR sont
combinés ensemble dans un même tube, utilisant des amorces spécifiques de gènes et en ciblant
l'ARNs de l'ARNtotal ou l'ARNm. La RT suit automatiquement le cycle PCR sans étapes
additionnelles.
®
-le mélange RT/Platinium Taq qui contient un mélange d'ADN polymérase pour une synthèse
d'ADNc et l'amplification de la PCR complexée à un anticorps qui inhibe l'activité de la polymérase
à température ambiante.cet anticorps est dénaturé et l'activité de la polymérase est restaurée durant
l'étape du cycle PCR à 94°C.
78
La PCR quantitative a été réalisée dans un appareil iCycler (BIO-RAD). La technique de
RT-PCR semi quantitative permet d’évaluer l’augmentation relative de l’expression de gènes. La
détection des amplicons est effectuée en temps réel grâce à un procédé de mesure de la fluorescence
tout au long de l’amplification sur ABIPRISM 7700 (Applied Biosystems). La chimie Taqman est
utilisée. La sonde Taqman est un nucléotide de 20 pairs de bases comportant en son extrémité 5’ un
fluochrome dit « reporter » et à son extrémité 3’ un fluochrome dit « quencher », inhibiteur de
fluorescence (TAMRA). Au cours de la PCR, la sonde s’hybride spécifiquement entre les amorces
sens et anti-sens. Pendant l’élongation, la sonde est clivée par l’activité exonucléasique 5’-3’de la
Taq polymérase. Le fluorochrome est libéré et peut ainsi fluorescer. Au cours de la phase
exponentielle, la quantité de brins néo-synthétisés est proportionnelle à la quantité de matrice
initiale. A fluorescence constante, le nombre de cycle est donc proportionnel à la quantité de matrice
initiale. Les différents contrôles sont : un contrôle de l’absence de contamination de la PCR où
l’ADNc est remplacé par de l’eau, un contrôle de l’absence d’ADN génomique résiduel où l’ADNc
est remplacé par une quantité similaire d’ARN (non rétro transcrit), le dernier contrôle est constitué
d’une gamme d’ADNc (courbe de calibration) qui permet de contrôler que l’efficacité de la PCR est
proche de 100%. La lecture de fluorescence a été faite en fin d'élongation après synthèse de tous les
ADN alors organisés en double brin.
III.4.Western-Blott
Nous avons utilisé la méthode de Bradford pour déterminer des quantités de protéines de
l'ordre du microgramme. A l’échantillon contenant les protéines dans un volume de 20 μl on ajoutait
1 ml du réactif de Bradford. Après agitation et incubation pendant 5 minutes, l'absorbance était
79
mesurée à 595 nm. Une gamme protéique de sérum albumine bovine (BSA) était mesurée en
parallèle et en duplicate pour établir une courbe d’étalonnage permettant de calcul la concentration
de l’échantillon.
Cette technique permet la séparation de protéines en fonction de leur masse relative (Mr).
Les gels de résolution et de focalisation sont coulés successivement entre deux plaques de verre (une
fine et une épaisse).
b.Electrophorèse
On charge au niveau des gels 20 μL de chaque aliquot ainsi que 5μL de marqueurs
colorés de poids moléculaires connus (de 14 à 220 kD) (RainbowTM protein molecular weight
marker, Amersham) dans les puits du gel de concentration de SDS-polyacrylamide de focalisation de
7% à 12% en fonction du PM de la protéine recherchée (0.5M TRIS/HCL pH 6.8, glycine(v/v),
10% SDS (p/v)). La migration s'effectue à 50mA.
80
Electrotransfert sur membrane de nitrocellulose.
Les protéines sont ensuite transférées sur une membrane de nitrocellulose 0,45 μm
(Protan BA85, GE Healthcare). Dans la cuve à électrotransfert, le sandwich est placé de telle sorte
que le gel est du côté de la borne négative et la membrane de nitrocellulose du côté de la borne
positive de la cuve. Le transfert est effectué à 4°C 20V constant, sous agitation, pendant 45 minutes
à une heure, suivant la taille des protéines à transférer, dans un tampon de transfert Tris-Glycérine
(25 mM Tris pH 8.3, 192 mM glycine). Après transfert, la membrane est lavée trois fois 5 minutes
dans du TBS-Tween.
a. Blocage de la membrane.
La membrane est d'abord saturée dans une solution de TBS-Tween 0,1% (20 mM Tris pH
7.6, 150 mM NaCl et 0.2% Tween 20 contenant 5% de lait écrémé en poudre (sauf pour la recherche
des protéines phosphorylées) pendant une heure. Elle est ensuite rincée 3 fois 10 à 15 minutes sous
agitation dans une solution de TBS-Tween.
La membrane est déposée dans une solution de tampon bloquant TBS-Tween-lait, de façon
à la recouvrir, en présence d'un anticorps primaire dirigé contre la proteine d'intérêt et placée 12H à
4°C (annexe-tableau 2). Elle est ensuite lavée trois fois dans du TBS-Tween 0,2% puis mise en
présence de l'anticorps secondaire couplé à la peroxydase et dirigé contre l'espèce qui a servi à
fabriquer l'immunoglobuline de l'anticorps primaire. On laisse l'anticorps agir pendant une heure
puis la membrane est de nouveau lavée trois fois pendant 10 minutes avec du TBS-Tween 0,2%.
81
Révélation.
La membrane est ensuite impressionnée sur un film photo placé au contact de la membrane pendant
un temps approprié. Dès l'apparition de bandes le film est sorti, plongé dans une solution de fixation,
puis séché.
Les résultats de Western-Blot sont ensuite quantifiés par les mesures de densitométrie avec le
logiciel Image J. Les résultats sont exprimés par rapport à l’expression de l’actine ou de la tubuline.
Dans un premier temps, on procède à l'élaboration d'une courbe étalon préparée à partir
du NADPH standard : 10 μl de NADPH standard (1 nmol/μl) et 990 μl de NADP/NADPH
Extraction Buffer (10 pmol/μl).
82
Ensuite, le NADPH standard est déposé dans chaque puit à des concentrations différentes
(0, 20, 40, 60, 80 et 100 pmol de NADP/puit). Chaque puit est alors complété à 50 μl de
NADP/NADPH Extraction Buffer. Chaque échantillon est réalisé en duplicata.
La courbe étalon étant établie, les échantillons sont alors dosés. 50 μl d'échantillons sont
déposés par puit en duplicata. On ajoute alors 100 μl de mix dans chaque puit (NaDP Cycling
Buffer Mix: 98 μl + NaDP Cycling Enzyme Mix 2 μl). Après incubation pendant 5 minutes à
température ambiante pour convertir le NADP en NADPH. Le NADPH est ainsi développé dans
chaque puit. Après un temps de réaction variable de 4 heures, la DO est lue à 450 nm. Une nouvelle
lecture est réalisée à 24H00 après addition d’une solution stoppant la réaction.
Les résultats ont étaient exprimés comme la moyenne±SEM. Un test de normalité à précédé la
réalisation de test d’Anova pour séries indépendantes suivi par un test de Mann Whitney pour
comparer chaque groupe deux à deux. Le seuil P<0,05 a été considéré comme significatif. Les
analyses ont été effectuées par le logiciel STAEL (Ad Science, France).
83
B. Résultats
Les CSM soumises à l’hypoxie chronique et cultivées en normoxie pour la réalisation des
expériences exprimaient encore la protéine HIF 1 alpha comme montré en immunofluorescence
(Figure II.1A), et en Western Blotting (Figure II.1B). La RT-PCR confirmait l’augmentation des
transcrits (Figure 1C).
Figure II.1 : Expression de HIF-1α au niveau des CSM normoxiques et hypoxiques évaluée en
immunofluorescence (1A), Western Blotting (1B, n=8pour chaque groupe) et RT-PCR (1C, n=6
pour chaque groupe). Comparaison groupe hypoxique versus normoxique n=8; Δ : seuil de
significativité; P>0,05.
La figure II.2A présente les résultats obtenus pour les CSM hypoxiques en présence d’un
gradient de SVF à 10% et 20% comparativement à CSM normal utilisé comme contrôle. On
observait une très faible migration spontanée des cellules en absence de SVF. Toutefois il existait un
passage non nul des CSM hypoxiques comparativement aux CSM normoxiques. On observait une
augmentation de la migration des CSM hypoxiques comparativement aux normoxiques. Ce
différentiel de migration était significatif avec la concentration la plus forte de SVF (20%)
(respectivement nombre de cellules ayant migré : en présence de SVF 10% ; CSMH =2392±387 vs.
CSMN =1360±268 ; pNS ; en présence de SVF 20% CSMH =6506±336 vs. CSMN =3014±245 ;
p<0,001). Le serum de rat normoxique augmentait de façon importante la migration des CSM
hypoxiques par rapport au SVF 20% (rapport nombre cellules ayant migré sérum
hypoxique/SVF20% = 6,02). Inversement le serum de rat hypoxique avait un effet sur la migration
des CSM normales peu augmenté par rapport au SVF 20% (rapport nombre cellules ayant migrés
sérum hypoxique/SVF20% = 1,32) (Figure II.2B). On observait par ailleurs en immunofluorescence
84
(Figure II.2C) une augmentation de l’expression de l’inhibiteur de l’activateur du plasminogène 1
(PAI-1) au niveau du cytosol des CSM hypoxiques.
Les Tests de migration en présence d’apocynine, inhibiteur de la PI3K, montrent à t=18h des effets
paradoxaux avec une inhibition très importante des CSM hypoxiques et des CSM normoxiques
mais à un moindre degré pour les CSM normoxiques.
85
Figure II.2 : 2A : migration différentielle des CSM hypoxiques (H) en comparaison avec les
CSM normoxiques (N) en présence de SVF10% et SVF20% comparativement au milieu
RPMIseul (blanc). * : comparaison avec blanc. Δ : comparaison CSM H versus CSMN. Seuil de
significativité : P<0,05. 2B : migration différentielle des CSM hypoxiques (H) en présence de
sérum issus de rats normoxiques (serum N) et normales (N) en présence de sérum issus de rats)
hypoxiques (sérum H). 2C : expression de PAI-1 en immunofluorescence.
86
III. Activation de la NADPHoxydase et rôle dans la migration
87
Figure II.3 : 3A : dosage de l’activité enzymatique de la NADPHoxydase après stimulation avec
du SVF20%. L’effet de l’apocynine est évalué à 30min. L’apocynine a été ajoutée au temps t=0.
n=. 3B : expression de la PI3kinase après stimulation du SVF20%. n=3.
88
IV. Activation de PI3kinase, RAC1 et activation de la NADPHoxydase.
L’activité de Rac1 total n’était pas différents au niveau des CSM hypoxiques
comparativement au normoxiques. Par contre l’activité Rac-GTP correspondant à la forme active
était augmentée au niveau des cellules hypoxiques (Figure II.4A). L’activation de Rac1 a été reliée à
l’activation de la PI3kinase. De façon parallèle, on retrouvait une activation de Rock-1 au niveau des
CSM hypoxiques en Western Blot (Figure II.4B) confirmé par immunofluorescence (Figure II.4C).
89
V. Activation de p47 et modifications de phosphorylation de la Cofiline
90
VI. Modification de l’expression des LIM kinases
6A CSM N CSM H
6B CSM N CSM H
91
C. Discussion
Nos résultats ont montré que les CSM issues de rats hypoxiques gardaient une augmentation
de l’expression de HIF1 α même après expansion en culture en milieu normoxique. Cette expression
de HIF1 α s’accompagnait d’une augmentation de l’expression de PI3kinase et d’une augmentation
de l’activation de l’activité et de la réactivité de la NADPHoxydase membranaire. Ceci avait un
impact sur la migration des CSM hypoxiques en lien probablement avec un switch vers la voie
Rock/LIMkinase-1 lorsqu’elles étaient stimulées avec du SVF20%.
Le modèle utilisé était un modèle d’hypoxie de réoxygénation dans la mesure où les caissons
d’hypobarie étaient ouverts deux fois par semaine pour assurer la maintenance des animaux. Ceci a
pu avoir une influence importante sur les résultats.
Nous avons relié l’activation de Rac1 à l’hypoxie chronique. En effet Xue Y (Xue et al.,
2006) a montré que l’augmentation de l’expression génique et de l’activation de Rac1 et de Cdc42
était reliée à la teneur en oxygène d’une manière dépendante du temps d’exposition à l’hypoxie.
Turcott (Turcotte et al., 2003; Turcotte et al., 2004) avait décrit également une augmentation de
l’expression de Rac1, Cdc42 et RhoA au niveau de cellules cancéreuses de rein soumises à
l’hypoxie. L’activation de Rac1 avec augmentation des transcrits a été aussi retrouvée au niveau de
lignées de cellules cancéreuses gastriques soumises à l’hypoxie (Xue et al., 2006). Cependant, des
résultats contradictoires ont été apportés sur des cellules musculaires lisses de porc nouveau né
soumises à des conditions d’hypoxie chronique ou aigüe, où Rac1 n’était pas activé (Bailly et al.,
2004). Inversement, les petites protéines Rho peuvent jouer un rôle sur la modulation de
92
l’expression de HIF-1α avec un impact sur la sécrétion de VEGF et l’angiogénèse. Hue et al (Xue et
al., 2006) ont montré, en effet, que l’utilisation d’un dominant négatif de Rac1 ou de Cdc42
augmentait l’expression de la protéine de Von Hippel Lindau (VHL) et diminuait la stabilité de HIF-
1α et par conséquent l’expression de VEGF.
93
membrane et contribue à augmenter l’affinité de p67phox pour le cytochrome p558 (Paclet et al.,
2001).
Nous avons montré que la migration des CSM hypoxiques était inhibée par l’utilisation
d’inhibiteurs de la NADPHoxydase. L’implication de l’activation de la NADPHoxydase dans la
migration cellulaire a également fait l’objet de travaux antérieurs. Les effets « paradoxaux » de
l’apocynine ont déjà été rapportés avec l’hypothèse d’une première phase d’augmentation de
l’activité enzymatique précédent son inhibition ce qui pourrait expliquer l’augmentation de
migration des CSM normale sous l’action de l’apocynine non retrouvé par utilisation de l’inhibiteur
de gp91. Dans des lignées de cellules leucémiques myéloïde ou lymphoïde, la migration cellulaire
est abolie par l’inhibition de l’expression de NOX2 ou 4 (Reddy et al.). Dans un modèle de co-
culture de cellules stromales avec des lignées épithéliales de cancer du sein, Tobar N (Tobar et al.) a
montré que l’augmentation de l’activation de NOX4 par du TGFβ augmentait le potentiel de
migration en lien avec la libération accrue de radicaux libres alors que la « down-régulation » de
l’expression de NOX4 inhibait au contraire la migration. L’activation de la NADPHoxydase a été
également impliquée dans la migration de cellules non tumorales telles que les cellules musculaires
lisses mises en causes dans les remodelages vasculaires pathologiques (Sundaresan et al., 1995) .
De façon parallèle, Marcelo G. Binker a montré une augmentation de l’invasivité de cellules
cancéreuses de pancréas par stimulation de la voie Rac1 (Binker et al., 2009). Nous montrons aussi
que les CSM hypoxiques expriment le facteur PAI-1 (inhibiteur de l’activateur du plasminogène)
qui a été impliqué dans l’invasivité de nombreux cancers en lien avec la migration ameboïde (Malo
et al., 2006).
94
La mécanistique reliant l’activation de la NADPHoxydase et l’augmentation de la migration
mésenchymateuse n’est pas parfaitement comprise. Nous avons montré au niveau des CSM
hypoxiques que la cofiline était phosphorylée. Les modifications de l’état de phosphorylation de la
cofiline sur une sérine3 sont nécessaires pour le réarrangement du cytosquelette (Ridley et al.,
2003). La phosphorylation inhibe l’activité de la cofiline permettant la polymérisation de la F-
actine, qui est le premier événement initiateur de la migration cellulaire. Le rôle de la
phosphorylation de p47 dans la phosphorylation de la cofiline a déjà été évoqué (Nagaishi et al.,
1999). La production de H2O2 modifie la phosphorylation de la cofiline par une action sur le
régulateur Slingshot-1L (SSH-1L) (Kim et al., 2009).
Dans notre expérimentation nous avons retrouvé une augmentation de l’expression des
LIMkinase 1 et 2 qui modifient également l’état de phosphorylation de la cofiline. LIMKinase 1
serait responsable des modifications de phosphorylation de la cofiline liée à l’activation de Rac-1
(Yang et al., 1998). De façon intéressante, une expérimentation a montré que des clones de cellules
dominant négatif pour la prolyl-2-hydroxylase avaient une absence de phosphorylation de la
cofiline diminuant la migration cellulaire sur un test de blessure (Vogel et al.). La régulation
différentielle des voie Rac1/LIMkinase2 et Rock1/LIMkinase1 due à l’hypoxie chronique et/ou à la
stimulation par le SVF pourrait rendre compte de l’état différentiel de migration entre les cellules
hypoxiques stimulées ou non et les cellules normoxiques. En effet, il existe potentiellement des
relations entre la voie Rac1/LIMK2 et Rock1/LIMK1 qui ont été précédemment évoquées pour
expliquer les transitions de migration mésenchymo-ameboïde au niveau des cellules cancéreuses
(Mishima et al.); (Pankova et al.). L’activation initiale de Rac1 en condition hypoxiques pourrait
favoriser le switch vers Rock1/LIMK1 lors de la stimulation par le SVF. Nos résultats montrent en
effet une augmentation de l’expression de Rock1/LIMK1 au niveau des CSM stimulées par le SVF
20%. L’utilisation dans la suite de nos expérimentations de dominant négatif pour LIMK1 pourrait
confirmer cette hypothèse.
95
Conclusion
Cette expérimentation confirme les résultats de la littérature concernant le rôle de l’activation de la
PI3kinase de Rac1 et de la NADPHoxydase dans la migration cellulaire. Il n’y avait jusqu’à présent
pas de données concernant les cellules souches mésenchymateuses. Il conviendra d’étudier
également la libération des radicaux libres oxygénés en lien avec cette activation de la
NADPHoxydase au niveau des cellules hypoxiques. La rémanence des ces activations au niveau des
cellules hypoxiques revenues dans un environnement normoxique reste à comprendre. La nature
exacte de la migration des CSM hypoxiques n’a pas pu être définie. Des images de migration en
chambre de migration 3D, en présence de PAI-1 matriciel, en microscopie confocale temps réel
(lames avec chambre de migration Ibidi, Biovalley, France) pourraient permettre de visualiser la
morphologie de ces cellules en cours de migration. La régulation différentielle des voies
Rac1/Rock1, LIMK2/LIMK1 reste à étudier. Nous sommes confrontés à la difficulté de trouver à la
fois des anticorps et des oligonucléotides spécifiques au rat permettant de réaliser les analyses en
Western Blotting et RT-PCR. Enfin, le lien mécanistique exact existant entre l’activation de la
PI3kinase et de la NADPHoxydase dans ce contexte d’hypoxie chronique reste à trouver. Au final
nous proposons le schéma mécanistique suivant qu’il conviendra de confirmer en poursuivant cette
expérimentation.
96
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116
IV Annexes
Annexe 1 : Protocoles
I.Migration sur Transwells
8. Faire 2 lavages des cellules avec le milieu de migration (milieu sans sérum).
117
11. Complétez le culot cellulaire pour obtenir une concentration cellulaire de
2x105 cellules /300 l de milieu de RPMI /BSA 0,25%.
13. Déposer dans chaque puits 400 l de sérum +/- chimiokines ou cytokines à tester.
14. Déposer 300 l de suspension cellulaire (2x105 cellules) dans chaque insert et poser l’insert
sur les puits. Vérifier l’absence de bulles d’air sous la membrane de chaque insert.
15. Mettre la plaque de 24 puits 18h à 37° pour permettre la migration cellulaire.
Jour-3 :
Récupération et comptage des cellules :
16. Eliminer à la pipette le contenu de chaque insert.
17. Récupérer le contenu de chaque puits dans un tube eppendorf 1,5 ml.
18. Nettoyer chaque insert à l’aide d’un coton tige imbibé de RPMI pour éliminer les cellules
n’ayant pas migré.
19. Trypsiner le fond de chaque insert : pour cela ajouter 500 l de trypsine/EDTA0,5% dans
chaque puits et poser l’insert sur le puits.
22. Eliminer le surnageant et reprendre chaque culot cellulaire avec entre 50 et 100 l de RPMI
dans un eppendorf de 500 l.
118
migration: Références :
Pour 150 ml Nom Fournisseur Référence
119
II.Western-Blott
Ac. Desoxycholique1% 1g
Mélanger. Conserver à 4°
120
2-Broyats tissulaires
Mettre des gants
Préparer de la glace pilée
Prendre un échantillon de tissu, le placer dans un aliquot
Immerger l’aliquot dans la glace
Ajouter 400µl de tampon Lysis Buffer (100µl pour tissus moins riches en protéines)
Laisser dans la glace 15min.
Homogénéiser avec broyeur 30 à 45 secondes dans la glace.
Si l’homogénéisation ne semble pas correcte laisser dans la glace 5Min. supplémentaires,
broyer à nouveau tous les échantillons quelques secondes.
Les broyats homogénéisés sont conservés à -20°C
Nettoyer le broyeur entre chaque broyat de chaque aliquot avec eau
A la fin des broyages nettoyer le broyeur sous l’eau. Le démonter, le brosser (brosse à dent)
passer sous l’eau distillée. Tremper dans éthanol 70%. Sécher et ranger ou tremper dans
Falcon rempli d’éthanol 95%, scotcher le tube avec parafilm.
Le jour de la manipulation. Mettre des gants, rincer le broyeur abondamment à l’eau distillée
pour enlever l’éthanol. (S’il était sec, le laver à l’eau, puis à l’éthanol puis le rincer à l’eau).
Le remonter, le placer dans Falcon rempli de Lysis Buffer et l’immerger dans la glace pilée.
Centrifuger 5 minutes à 10000tours. Pipeter le surnageant, c’est lui qui contient les
protéines.
Préparer une courbe étalon comme suit après avoir dilué un peu de LB au 1/10
121
A 2mg/ml 10 µl BSA 0.99 ml LB
1/10
122
Quit
« Fixed wavelenght » cliquer sur 500 et remplacer par 595
Cliquer sur « Read mod » (Abs)
Cliquer sur « Vis on » (en bas) , allume la lampe
Cliquer sur « Blank » après avoir mis la cuve de référence contenant de l’eau, met à zéro.
Cliquer sur « Read samples ». Mettre un tube sous le faisceau , cliquer sur « read samples »,
affiche l’absorption de la cuve. Changer de cuve. Enfin de manipulation Cliquer sur Quit
Modification OK
Eteindre la lampe « Vis of »
Eteindre l’appareil brutalement derrière.
TRIS 3.03g 25 mM
Ajuster le pH à
8.3
H2O QSP
1000ml
123
Préparer 1 quantité concentratio
litre n
NaCl 8g
ajuster le ph
7.6 HCl 1M
H2O QSP
1000ml
Solution TBS-TWEEN 20
Ajouter 1ml de TWEEN 20 ( détergent) à la solution de TBS
Solution TBS-TWEEN20-Lait
Ajouter du lait à 5% (5g/100ml) à la solution TBS-TWEEN20
Dans cuve remplie d’H2O, tremper et presser les deux bandes de caoutchouc,
évacuer les bulles, les laisser tremper.
Laver 4 plaques de verre (deux fines et deux épaisses) à l’eau du robinet, puis à
l’éthanol 96%, puis à l’eau distillée, essuyer avec du papier.
Glisser deux plaques de verre, la fine à l’avant, la plus épaisse à l’arrière dans les
portoirs verts. Bloquer.
Remettre les deux bandes de caoutchouc dans le bas du support des portoirs verts.
Poser le portoir vert sur la bande et fixer avec la pince supérieure.
Gel de résolution
124
Gel de résolution :
4%
H2O 3.1ml
TEMED 5µl
125
Attendre la polymérisation du premier gel avant d’introduire le persulfate
d’ammonium et le TEMED. Quand le gel est pris, retirer l’isopropanol en renversant le
portoir sur le côté. Pipeter le reste aux extrémités.
Ajouter 1ml de tampon TRIS HCl pH 6.8, rincer le gel, agiter doucement retourner et
éliminer le tampon, pipeter le reste.
Remplir la cuve à raz bord avec le deuxième gel à travers un filtre.
Insérer les peignes latéralement pour éviter les bulles. Allumer le Thermoblock 95°C ;
Attendre la polymérisation du deuxième gel 20 à 30 min.
Préparer 500ml de tampon de migration.
Retirer les gels des portoirs, les monter dans la cuve d’électrophorèse. Les puits
doivent être dirigés vers l’intérieur.
Verser le tampon de migration entre les deux gels, le tampon déborde de part et
d’autre. Retirer les peignes. Placer le guide ad hoc pour les puits.
Recouvrir.
Electrophorèse
Migration à courant constant U=RI, I= 25 à 30 mA/gel.
Régler I et fixer I =50 ou 60 mA
S’assurer que le volume du tampon de migration entre les deux gels soit supérieur à la
ligne supérieure des puits, pour assurer la circulation du courant.
Mettre le couvercle. Allumer le générateur. S’assurer de la progression du front de
migration (ligne bleue) 30 min plus tard.
126
Attendre que le front de migration atteigne la limite inférieure du gel (sans jamais la
dépasser). Arrêter le générateur. Enlever le chapeau.
Placer 2 papiers buvards (dans tiroir sous paillasse) dans le tampon anode 1, 2 dans
cathode. Découper une membrane de nitrocellulose de la taille du papier buvard.(si
membrane PVDF, la tremper 15 secondes dans du méthanol, puis la rincer et la
tremper dans le tampon précédent).
Rincer la membrane 10 secondes dans H2O. La placer 15 minutes dans le tampon
anode.
Démouler le gel avec le pied de biche (vert). Retirer avec le grattoir le gel de
focalisation (gel où sont les puits). Décoller le gel avec pied de biche, l’attraper avec
les doigts et le transporter dans le bac cathode et l’y laisser 15 minutes.
127
Blocage de la membrane
Prendre un flacon 50ml, prendre l’Ac1 (exemple AcAnti-actine (congélateur tiroir 4),
utiliser une dilution prévue par le fournisseur, le diluer dans TBS-Teen-Lait et y
ajouter la membrane transportée à la pince.
Agitation sur plaque 1 heure ou 24h à 4° selon l’Ac.
Rinçage
Retirer TBS-Tween-LaitA1. Trois Rinçages de 10 minutes dans TBS-Tween.
8-Révélation
128
Saisir la membrane et la faire sécher sur un grand buvard.
Préparer le Kit ECL de révélation (réfrigérateur). Dans un Falcon de 15 ml mélanger 3
ml du gros flacon et 75 µl du petit. Conserver à l’abri de la lumière. Placer la
membrane sèche dans une pochette plastique. Verser la solution de révélation dans la
pochette sur la membrane. Eviter les bulles d’air. Attendre 5 minutes.
Enlever la membrane, la faire sécher sur le buvard. La placer dans une boîte noire dans
une pochette.
Installer dans la pièce photo les trois bacs. Les remplir de la solution de révélation,
d’eau, et de fixation.
Dans le noir découper un morceau de film photo (1/2film) de la taille de la membrane.
Placer le film 5 à 15 secondes au contact de la membrane. Puis tremper le film dans le
bac de révélation. Arrêter dès que quelque chose apparaît. Rincer, puis plonger
quelques minutes dans le bac de fixation. Sortir du bac Laver et faire sécher le film
toute la nuit en le suspendant. Si trop d’exposition, retailler un autre film et
recommencer le contact membrane film pendant moins longtemps. Reprendre comme
précédemment.
III. RT-PCR
PROTOCOLE RT
129
DTT 2,5 µl X n puits à remplir
+ ARN 3,3
Total 25 µl
NB : Préparer le mix total en fonction du nombre total de puits à remplir (vortexer le mix 10
secondes).
Faire les échantillons en double
2-Marquages supplémentaires
130
Rincer avec 500µL de PBS2- : 2 rinçages courts + 1 rinçage long
MARQUAGE ADN (que pour les marquages 4, 5, 6) : 500µL solution DAPI, 4min COUVERT
Rincer avec 500µL de PBS2- : 2 rinçages courts + 1 rinçage long
ANTICORPS 1aire : 200µL solution d’anticorps 1aire, 2H en chambre humide COUVERT
Rincer avec 500µL de PBS2- : 2 rinçages courts + 1 rinçage long
ANTICORPS 2aire : 300µL solution d’anticorps 2aire, 1H en chambre humide COUVERT
Rincer avec 500µL de PBS2- : 2 rinçages courts + 1 rinçage long
Préparation de la solution d’anticorps secondaires vert (Alexa Fluor 488, chèvre) anti-
souris (pour uPAR et Intégrine β1) et rouge (TRITC, chèvre) anti-lapin (pour PAI-1, uPA
et MT1-MMP)
18 puits, 300µL/puits, dilution 1/100 : 5 400µL sont nécessaire, on prépare une solution de
5 700µL.
57µL de solution mère anti-souris + 57µL de solution mère anti-lapin
+ 5 586µL de PBS2- 1% BSA
Préparation de la solution d’anticorps secondaire vert (Alexa Fluor 488, chèvre) anti-
lapin (pour PAI-1 et uPA)
12 puits, 300µL/puits, dilution 1/100 : 3 600µL sont nécessaire, on prépare une solution de
131
3 900µL.
39µL de solution mère anti-lapin + 3 861µL de PBS2- 1% BSA
Préparation de la solution d’anticorps secondaire vert (Alexa Fluor 488, chèvre) anti-
souris (pour uPAR)
6 puits, 300µL/puits, dilution 1/100 : 1 800µL sont nécessaire, on prépare une solution de
2 100µL.
21µL de solution mère anti-lapin + 2 079µL de PBS2- 1% BSA
132
Annexe 2 : Tableaux
133
Le Directeur de Thèse :
Tours, le
Vu et Transmis :
Le Doyen
134
135