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UNIVERSITE HASSAN II - MOHAMMEDIA FACULTE DES SCIENCES BEN MSIK CASABLANCA

Quels est le taux de russite des logiciels ? Dicvol - McMaille

Exemples de dtermination structurale sur poudre illustres par des logiciels DICVOL - McMaille

Le but de ces sances de travaux pratiques est de rpondre la problmatique suivante : doit on disposer de plusieurs programmes dindexation automatique complmentaires pour favoriser la russite de dtermination structurale.

Conditions pralables
Ltudiant sera plus laise au cours de cette sance de TP sil est dj familier avec lindexation de diagramme de poudre, l'extraction des intensits, les notions de plan rticulaire. Sur la base des donnes cristallographiques, ltudiant obtiendra des donnes de quelques structures cristallines simples quil sagit danalyser.

Travaux pratiques de cristallographie II

Pr. Sad BENMOKHTAR

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DICVOL - McMaille
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Introduction : A-La diffraction de rayonnement X sur chantillon polycristallin (ou poudre), est une technique trs largement utilise, en science des matriaux, lorsque l'on souhaite dterminer la structure cristalline d'un compos. Toutefois, le degr de prcision de la dtermination structurale est trs corrl au choix de la mthode utilis. Il s'en suit que la question "comment choisir une mthode de dtermination structurale la mieux adapt au compos et la problmatique ?" apparat comme fondamentale. L'objectif de ces sances de Travaux Pratiques est de tenter de rpondre cette question en suivant des stratgies de dtermination structurale sur poudre laide des Logiciels DICVOL, TREOR et McMaille, en exposant les avantages spcifiques de chaque Logiciel. B- Les choses srieuses se passent sur ordinateur, mais pas toute seules : le terme "automatique" n'est pas prendre la lettre, car en dfinitive c'est vous qui aurez choisir le plus souvent entre de multiples propositions sur des critres de qualit du rsultat (figures de mrite) mais aussi en faisant appel votre bon sens. Vous ne pouvez en aucun cas faire confiance aveuglment en ce que propose un programme d'indexation. D'ailleurs la preuve ultime qu'une indexation est correcte ne s'obtient que lorsque la structure est dtermine et affine, et mme cela n'exclut pas que l'on ait pu ngliger une maille plus petite de plus haute symtrie. Inutile de dmarrer avant d'tre sr de la fiabilit totale de vos donnes. Vous ne devez jamais vous arrter l'utilisation d'un seul programme : les plus recommands et utiliss avec succs pour des dterminations de structure sur poudre actuellement sont TREOR, DICVOL, McMaille (il y en a d'autres), ils ont chacun leurs qualits et leurs dfauts. Commencez par ingurgiter leur mode d'emploi, faites dabord des essais sur des exemples vous de phases dj connues. Si ces programmes ne vous sortent pas la solution et que vous comprenez pourquoi, vous aurez acquis ce que l'on appelle "de l'exprience". Pourquoi tous ces conseils ? cette tape est l'une des plus difficiles franchir !

Travaux pratiques de cristallographie II

Pr. Sad BENMOKHTAR

Travaux pratiques de cristallographie II

Pr. Sad BENMOKHTAR

TP : 1
Dtermination structurale sur poudre illustre par le logiciel DICVOL
Sad BENMOKHTAR Laboratoire Chimie des Matriaux Solide, Facult des Sciences Ben MSik - Universit Hassan II Mohamedia e-mail : sbenmokhtar@univh2m.ac.ma

Premire Ligne
Nom et formule du compos

Deuxime Ligne
N, ITYPE, JC, JT, JH, JO, JM, JTR N: nombre de ligne ITYPE: type de donne qui seront fournis = 1 si donne en Bragg en degr = 2 si donne en 2 Bragg en degr = 3 si donne en d distance rticulaire en JC = 0 ne pas chercher de solution dans le systme cubique = 1 chercher s'il y a des solution dans le systme cubique JT = 0 ne pas chercher de solution dans le systme quadratique = 1 chercher s'il y a des solution dans le systme quadratique JH = 0 ne pas chercher de solution dans le systme hexagonal = 1 chercher s'il y a des solution dans le systme hexagonal JO = 0 ne pas chercher de solution dans le systme orthorhombique = 1 chercher s'il y a des solution dans le systme orthorhombique JM = 0 ne pas chercher de solution dans le systme monoclinique = 1 chercher s'il y a des solution dans le systme monoclinique JTR = 0 ne pas chercher de solution dans le systme triclinique = 1 chercher s'il y a des solution dans le systme triclinique

Troisime Ligne

AMAX, BMAX, CMAX, VOLMIN, VOLMAX, BEMIN, BEMAX AMAX: valeur maximum en que peut prendre le paramtre a BMAX: valeur maximum en que peut prendre le paramtre b CMAX: valeur maximum en que peut prendre le paramtre c VOLMIN: valeur minimum en 3 que peut prendre le volume de la maille VOLMAX: valeur maximum en 3 que peut prendre le volume de la maille BEMIN: valeur minimum en () que peut prendre l'angle (par dfaut = 90) BEMAX: valeur maximum en () que peut prendre l'angle (par dfaut = 130)

Quatrime Ligne
WAVE, POIMOL, DENS, DELDEN WAVE: la longueur d'onde utilise en POIMOL : la masse molculaire par unit formulaire ( par dfaut: = 0.0 quand la masse molculaire est inconnue) DENS: la valeur de la masse volumique en (g/cm3) ( par dfaut: = 0.0 quand la masse volumique est inconnue) DELDEN: Incertitude sur la valeur de la masse volumique

Cinquime Ligne
EPS,FOM,ZERO EPS =0.0 aucune erreur sur les valeurs de =1.0 existence d'erreur sur les valeurs de FOM = imprimer Facteur de mrite M(N) (dfaut =0.0 IF LOWER M(N)=5.0). ZERO = Zero point to pour ou 2
On lance le programme DICVOL avec une fentre DOS Le fichier de donne est prparer en Format doc. Il devra tre en extension .dat Le fichier rsultat sera en extension .imp

TP : 2
Dtermination structurale sur poudre illustre par le logiciel MacMaille
Sad BENMOKHTAR Laboratoire Chimie des Matriaux Solide, Facult des Sciences Ben MSik - Universit Hassan II Mohamedia e-mail : sbenmokhtar@univh2m.ac.ma

Premire Ligne
Nom et formule du compos

Deuxime Ligne
Wavelength, Zeropoint, Ngrid Wavelength: la longueur d'onde utilise en . Zeropoint : dcalage lorigine. Ngrid : code pour que le processus soit appliqu Ngrid = 0 : Monte Carlo Ngrid = 1 : recherche de grille Ngrid = 2 : les deux processus Ngrid = 3 : mode de bote noire - Monte Carlo sur toutes les symtries. Ngrid = 4 : mode de bote noire - Monte Carlo sur toutes les symtries + recherche de grille

Troisime Ligne
Codes de symtrie 6 codes pour choisir le systme cristallin explorer. 1er code : Si 0, aucune recherche, Si 1, recherche dans le systme cubique 2 ime code : Si 0, aucune recherche, Si 1, recherche dans le systme hexagonal/trigonal 3 ime code : Si 0, aucune recherche, Si 1, recherche dans le systme tetragonal 4 ime code : Si 0, aucune recherche, Si 1, recherche dans le systme orthorhombique 5 ime code : Si 0, aucune recherche, Si 1, recherche dans le systme monoclinique 6 ime code : Si 0, aucune recherche, Si 1, recherche dans le systme triclinique

Quatrime Ligne
W Nind

W : La largeur mi Hauteur en degr. Il est recommand de choisir W = 2 * FWHM, comme minimum. Utiliser 0.1 < W < 0.3 pour une acquisition par diffraction X. 0.05 < W < 0.15 pour une acquisition par synchrotron. Nind : Nombre de rflexion non index.

Cinquime Ligne
Pmin Pmax Vmin Vmax Rmin Rmax Rmaxref minimum et maximum pour paramtres de maille. minimum et maximum pour volume de maille. minimum et maximum pour facteur de rabilit (Rp). Il doit tre : Rmin < Rmax < Rmaxref

Sixime Ligne
Spar, Sang Spar : l'tape de recherche de grille applique aux paramtres de maille. Valeurs recommandes (le petit temps de calcul d'augmentation de valeurs, mais valeurs trop grandes ne permettra pas la maille d'tre dtermine) : cubique : 0.01 or 0.005 hexagonal/rhombohedral/tetragonal : 0.01-0.05 orthorhombique : 0.03-0.20 (0.01 bien, mais voir temps) monoclinique : 0.05-0.30 (0.01 bien, mais voir temps) triclinique : not implemented Sang : grid search step applied to the cell angles. Recommended values (small values influence calculation time): monoclinic : 0.05-0.20 (0.01 would be best, but see the time) triclinic : pas en application

Septime Ligne
Ntests, Nruns Ntests : nombre de teste Monte Carlo. utiliser 500-10000000000 ou plus. cubic : 500-1000 hexagonal/tetragonal : 10000-100000 orthorhombic : 1000000 to 10000000 monoclinic : 10000000 to 100000000 triclinic : 1000000000 Nruns : nombre de cycle Monte Carlo. Un cycle execute Ntests tests. En raison de la gnration de nombre alatoire de Monte Carlo, l'excution de 10 cycles de 1000 essais peut ne pas mener au mme rsultat que 1 cycle de 10000 essais. De toute faon Nruns = 1 could lead to the expected result.

Huitime Ligne

! 2-theta, Intensity On donne les rsultats de diffraction X de deux composs not A, B enregistrs l'aide du diffractogramme Philips PW 3040 (-), dans les conditions suivantes: Domaine balay en 2 : 10 60 Pas de mesure (2) : 0.02 Temps de comptage 40s. La dur totale d'acquisition du diagramme est de 60 heures. 1) A l'aide des programmes d'indexation automatique DICVOL, McMaille trouver la solution probable, les facteurs de mrite, M(N); FN ; le systme, la maille, les paramtres de maille donnes par chaque programme. 2) Quels sont les avantages et les limites de chaque Logiciels utiliss. Lequel vous proposez pour une bonne rsolution ? 3) A laide de la banque des donnes en consultant les fichiers ASTM trouver la formule des composs A(=2,34 g/cm3) , B(= 4,65 g/cm3) 4) Donner la Fiche ASTM correspondante. Le choix des rflexions sera ici de ne retenir que les vingt premires rflexions d'intensit suprieure 0.1% de la raie la plus intense, en veillant carter d'ventuelles harmoniques des premires rflexions situes aux bas angles. 5) Donner le rsultat sou forme de tableau. 2obs.() dobs. () hkl Intensit (100%)

Compos A

Compos B

12,707 14,646 24,423 19,497

20,693 20,848

22,551 27,709 32,104 37,837 39,584 41,290 47,550 51,857 57,241 61,078 25,252

25,573 29,539 32,373 33,020 36,526 38,778 42,102 44,076 47,431 49,597 50,054 54,157 57,200 58,758 61,310 63,534 65,746 67,060 71,077

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