Epi-Info G3 SBM

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CONTENU DU COURS
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 Introduction à l’utilisation des outils informatiques en Médecine
et en Santé Publique
 Rappels théoriques des principes et méthodes des enquêtes en Santé 
 Recherche de la documentation scientifique sur l’internet
- Elaboration d’un protocole de recherche
 Recherche de la documentation scientifique sur l’internet
- Présentation générale de PubMed
- Modes d’interrogation de PubMed
 Recueil et analyse de données de santé
- Principes d’élaboration d’un questionnaire
- Saisie de données
Pascal KIMBA INFO MED

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Contenu du cours
Gestion et analyse statistique de données de santé avec le logiciel EPI-INFO
Création d’un masque de saisie
- Contrôle des données saisies

- Analyse des données saisies ou importées
- Interprétation statistique des résultats
Importer des données dans EPI-INFO
Exporter des données vers Microsoft Office (Excel, Word, Powerpoint)
- Présentation des résultats

- Exercices pratiques

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I. INTRODUCTION
I.1 GENERALITES SUR LA NOVELLE TECHNOLOGIE
De la technologie à l’usage professionnel des drones en faveur du développement

durable
Le drone est une technologie. L’innovation réside dans son usage. Ainsi, le drone – terrien,
marin ou aérien – trouve son utilité dans de nombreux domaines d’activités et le champ des
possibles est offert en matière d’utilisation, notamment dans les domaines liés au développement
durable. Fort des enjeux en matière d’emplois, de développement économique et social et de
préservation de l’environnement, Communautique se mobilise pour proposer une offre de
formation en construction, maintenance et pilotage de drone dès l’automne 2016 tout en la
déployant pour 2017 sur les spécificités des différents domaines d’activités.
L’objectif pour Communautique est de développer son centre de formation et

d’apprentissage des drones à destination des futurs professionnels. Il s’agit ainsi de répondre dans
un premier temps aux besoins du marché et des métiers spécifiques en associant la construction,
la maintenance et le pilotage des drones aux métiers du numérique, notamment sur les enjeux de
la collecte et de l’analyse des données et des images.
Dans un deuxième temps, Communautique a pour objectif de poursuivre le déploiement

d’une offre de formations spécialisées associant la maîtrise du drone et des technologies
numériques dédiées en fonction des spécificités métiers : audiovisuel, agriculture, environnement,
bâtiments et travaux publics, culture, surveillance et sécurité.
Efficacité, gain de productivité et impact environnemental réduit des drones
Le drone apporte davantage de flexibilité dans de nombreuses activités professionnelles. Il

s’associe également pleinement à l’innovation en matière de technologies de collecte et d’analyse
des données et des images. Il limite enfin significativement l’impact carbone des méthodes
traditionnelles en matière de vol, mais également en matière de contrôle, de livraison ou encore de
surveillance.

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Les drones permettent en conséquence d’effectuer des missions avec une faible empreinte
écologique en remplaçant parfois des avions ou hélicoptères : un prélèvement d’eau, une étude en
thermographie, une livraison en don d’organe, ou encore la surveillance d’un pont…
Ils sont aussi utilisés là où il est dangereux d’envoyer un être humain.
Un drone permet ainsi à titre d’exemple de diviser par deux le temps d’une mission de
thermographie par rapport à une opération terrestre tout en offrant 80% de gain de productivité en
jour-homme dans les activités de cartographie et de topographie.
A titre exemple, ARA Robotique – une entreprise fondée par trois diplômés de l’ÉTS et
hébergée au Centech – a collaboré avec Solutions Humanitas à la conception d’une innovation
technologique qui vise à simplifier la gestion de l’aide humanitaire en temps de crise. Elle permet
notamment aux équipes d’urgence de mieux structurer leurs opérations et de partager l’information
rapidement afin de maximiser leurs impacts au cours d’une crise.
Du savoir-faire du FabLab à l’expertise en innovation ouverte de Communautique
De même, à travers les activités de FabLab de Communautique, de nouveaux métiers se

créent autour de l’impression 3D qui permet de réduire l’utilisation de matériaux pour améliorer
l’efficacité énergétique, ou encore sur le thème de la modélisation du bruit. Communautique a pour
objectif en conséquence de développer l’évaluation environnemental du cycle de vie d’un drone
afin d’en limiter les impacts tout en leur assurant une meilleure efficacité, notamment grâce à des
solutions innovantes pour leur fabrication.
Enfin, le savoir-faire en innovation ouverte de Communautique sert les enjeux de la

recherche et développement en développement durable, notamment en permettant aux experts
multidisciplinaires de développer, déployer et tester de nouvelles technologies en environnement
réel ou réaliste. Communautique souhaite ainsi offrir un laboratoire grandeur nature ou les acteurs
économiques, territoriaux et académiques auraient l’opportunité de tester, expérimenter et
confronter leurs technologies dronautiques aux usages et aux usagers.
DRONES ET ROBOTS : « LA TECHNOLOGIE PEUT ÊTRE MAL EMPLOYÉE »
L’usage de drones pour effectuer les livraisons constitue l’un des grands sujets du moment aux
États-Unis. La Federal Aviation Administration (FAA) est censée légiférer sur le sujet d’ici fin
décembre… Pensez-vous que qu’il sera bientôt possible de commander un produit sur Amazon et

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de se le faire livrer par un drone dans la demi-heure, comme le suggère l’entreprise dans sa
dernière vidéo ?
La technologie permettrait en tout cas de mettre en place un tel dispositif rapidement,

l’enjeu est donc législatif. Et pour rendre les livraisons par drones légales, il faut au préalable
s’assurer que cela ne pose aucun problème de sécurité : être certain que les drones parcourent une
zone bien délimitée de l’espace aérien, où ils ne risquent d’entrer en collision avec aucun appareil
piloté par un humain, qu’ils ne tombent pas sur la tête des passants… La FAA est très préoccupée
par ces questions de sécurité. Récemment, un drone a failli entrer en collision avec un avion qui
approchait de JFK Airport… C’est assez effrayant.

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Des drones de livraison.

Que peuvent faire législateurs et constructeurs de drones pour limiter au maximum ce type
d’incidents ?
Loi et technologie doivent aller de paire : il est certainement possible d’affirmer que n’importe
quel appareil dépassant un certain poids doive être doté d’une puce wifi certifiée par les autorités
fédérales, incluant un GPS et un capteur d’altitude. Ainsi, si le pilote du drone est stupide ou mal
intentionné et tente de faire voler son appareil au-dessus d’un aéroport, par exemple, le drone ne
pourra pas obéir. Mais pour l’heure, d’après mes sources, les autorités veulent simplement imposer
à chaque propriétaire de drone d’enregistrer son appareil, ce qui me parait bien insuffisant. Nous
en saurons plus quand la nouvelle législation aura été mise en place.
Vous travaillez également sur l’avenir de la robotique : quel rôle les robots
pourraient-ils bientôt jouer dans notre quotidien ?
Les robots possèdent un immense potentiel, reste à savoir quelle sera la « killer
application », le type d’usage qui justifiera leur adoption massive. Dans le domaine de la foodtech,
peut-être, avec des restaurants entièrement automatisés ? La start-up Momentum
Machines confectionne déjà des burgers de manière totalement automatisée. On peut ainsi
imaginer que pour un festival, un concert ou un évènement temporaire, les organisateurs se

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contenteront d’aborder de grands containers avec du pain, des tomates, de la viande, des oignons,
des cornichons, bref, tous les ingrédients pour composer un burger, après quoi les participants
n’auront qu’à passer commande via une application sur leur smartphone et se rendre au stand pour
récupérer leur burger fraîchement confectionné par un robot. Les possibilités sont immenses dans
le domaine médical, également, autour de la chirurgie… Un robot n’a d’ailleurs pas besoin d’être
intelligent pour être utile : prenez Roomba, c’est un robot stupide, mais il cartonne, car il effectue
très bien une tâche simple, à savoir faire le ménage…
L’usage potentiel de robots à des fins militaires amène son lot de questionnements.
Les robots apportent eux aussi leur lot de problématiques… On parle beaucoup de leur
potentiel destructeur en termes d’emplois, quels sont les autres risques potentiels, selon
vous ?
Le problème de toute technologie est qu’elle peut être mal employée. En changeant radicalement
la manière dont notre quotidien se structure, les systèmes autonomes ouvrent une myriade
d’opportunités, mais aussi une foule de scenarii terrifiants. Imaginez qu’un hacker parvienne à
prendre le contrôle de voitures autonomes à distance pour les envoyer dans le décor ! En outre, la
robotique implique un bouleversement total de la manière dont les rapports de force ont existé au
sein de l’humanité jusqu’à présent, puisqu’il est désormais en théorie possible de confectionner
une armée de robots. On assiste déjà à l’emploi des drones à des fins militaires, mais bientôt les
robots pourront également constituer une force au sol. La guerre va ainsi changer de nature :
aujourd’hui, le principal problème rencontré par les pays les plus puissants lorsqu’ils mènent une
guerre à l’étranger est qu’ils ne peuvent gagner définitivement sans envoyer des troupes au sol, or
les pertes militaires créent toujours des remous dans l’opinion publique… Si demain, les États-
Unis peuvent envoyer des robots à la place de leurs soldats, cela change fondamentalement la
donne.
Mais ça ne s’applique pas seulement aux pays : pour la première fois dans l’histoire de
l’humanité, n’importe qui pourrait se constituer une armée personnelle. Un gangster pourrait
ainsi envoyer des robots piller des banques à sa place, un terroriste les utiliser pour faire exploser
des bombes parmi la foule… autant de problèmes inédits que nous allons devoir prendre en
considération. Tout l’enjeu consiste donc à exploiter au mieux les nombreuses possibilités
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offertes par les systèmes autonomes pour l’amélioration de notre quotidien, tout en étant
conscient des risques potentiels afin d’être capables de les contrer.
Les outils de collecte de données sont utilisés pour réaliser la récolte des informations
recherchées auprès des répondants. Les plus utilisés sont les formulaires (en ligne, papier,
entrevue), les grilles d’observation et les outils de suivi. Outils S’inspirer d’outils existants! On
peut trouver sur internet beaucoup d’outils déjà construits que l’on peut adapter à une démarche
d’évaluation. Par ailleurs, Avenir d’enfants a mis en place un inventaire d’outils de collecte de
données en évaluation généreusement partagés par les regroupements en petite enfance et leurs
ressources externes en évaluation : À la suite de l’élaboration de votre plan d’évaluation, il faut
maintenant préparer les outils appropriés qui permettront de recueillir les données ciblées en vue
de l’évaluation des objets choisis. Dans une approche participative, il est fréquent que les
porteurs de projet et autres partenaires collaborent à la collecte de données.
Open Data Kit (ODK)
Open Data Kit (ODK) un générateur d’applications Open Source pour créer des masques de
saisie et applications personnalisées sur smartphones Android et accessible hors connexion
(pratique en montagne par ex.). Il est possible d’intégrer dans les formulaires créés la prise de
photos, de vidéos, de sons, de point GPS, flashcode…
GeoODK apporte plus de fonctionnalités géographiques avec notamment la possibilité de placer
un point sur une carte, enregistrer une trace, ou dessiner un polygone. Cette solution permet
également de convertir les données au formats courant notamment le shapefile.
Il y a 3 grandes phases:
1. “Build”: Construction du formulaire. Différents outils sont disponibles pour

cela; XLSForm est le format recommandé, mais on peut passer par des solutions simplifiées.
2. “Agregate”: Ce formulaire est intégré à ODK Agregate qui est un serveur où l’on dépose le
formulaire et qui accueillera les données récoltées. Il peut:
o soit être installé sur son propre serveur (nécessité de Apache Tomcat)
o soit être déposé sur un compte Google Apps
o soit utiliser des solutions prêtes à l’emploi (gratuite ou non)
3. “Collect”: Collecter les données sur un terminal mobile Android soit via une application
(quelques unes disponibles: ODK Collect , GeoODK Collect , Makina Collect , Kobo
Collect , etc.), soit via un navigateur internet courant (Firefox, Chrome, etc.) via Enketo par
exemple.
Il existe de plus en plus de solutions basés sur ODK:

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 FormHub : propose gratuitement une plateforme pour la conception et le déploiement de

solutions basées sur ODK, propose également la construction de formulaire sur Enketo pour
l’utilisation sur navigateur internet.
 ONA: Un dérivé de FormHub qui propose les mêmes fonctionnalités.
 KoboToolBox qui permet d’aller un peu plus loin qu’ODK dans les conditions et
paramétrages d’ODK.
 Makina Collect qui est une amélioration de l’application ODK Collect. Elle apporte
notamment un meilleur support français mais aussi la possibilité de placé des points sur une
carte (point différent de la position GPS)
Epi Info est un progiciel gratuit de gestion et d’analyse de données issues d’une enquête en
santé, développé par les centres américains de contrôle et de prévention de maladies (CDC: Centers
for Disease Control) à Atlanta et librement diffusé.
Il permet la réalisation d’une étude. Cela comprend notamment : la création d’un

questionnaire électronique sous forme de masque de saisie, la saisie et manipulation de données
collectées, l’analyse statistique et épidémiologique de données, la création des graphiques et
cartes.
Il permet également d’implémenter un système électronique d’information sanitaire et peut
servir de support pour une puissante base de données dans un système de surveillance de maladie.
EPIINFO7 fonctionne sur un PC équipé d’un système d’exploitation Windows NT, XP, 7 ou 8. Il
ne fonctionne pas sous environnement Mac Apple à moins que cet ordinateur ne soit équipé d’un
émulateur Windows 7 et d’une mémoire suffisante.
Le logiciel peut être téléchargé sur Internet à l’adresse : http://www.cdc.gov/epiinfo.
Dans le cadre des travaux pratiques en Informatique Médicale l’exercice suivant sera
effectué avec le logiciel EPI-INFO7.

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BIG DATA
Les éléments qui vous aideront à comprendre le Big data
• Big Data…c’est quoi
Aujourd’hui, nous vivons dans un océan de données. C’est le moins que l’on puisse dire
• Big veut dire grand’ et data veut dire données. Mais sait-on ce que le « Big data »?

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Volume : données massives (1 V)
En Big data, les données sont en masses selon Cisco, ce graphe représente l’évolution annuelle.
Nous y constatons aussi le prévisionnel du trafic des données pour l’année 2017.
Comme vous le voyez, depuis 2013, d’années en année, les volumes sont entrain de doubler.
• Aujourd’hui nous sommes déjà en train de mesurer en zettaoctet et yottaoctet , et bientôt

en brontoctet et Geopoctet
• Big data les sources de données sont multiples: Réseau sociaux, Pc, GPS, Télévision,

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Variété: sources diverses (2 V)
• De plus en plus, la connectivité va envahir notre quotidien. nous serons complètement

assistes.
• On parlera donc de l’informatique ubiquitaire ou bien l’informatique ambiante.
• Il s’agit d’un monde où ce ne sera pas à l’informatique de faire partie de notre système,
Mais ça sera plutôt à nous de faire partie du système

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Vélocité: Rapidité des flux de données. (3 V)
• En Big Data les données sont capturées, stockées et traitées très rapidement.
• Et cette rapidité ne cesse d’augmenter. L’exemple illustratif est la téléphonie mobile.
• En 2020, avec la 5G, les téléphones intègreront tout environnement connecté.

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Véracité: incertitude des données.

• En Big data les données ne sont pas vérifiées. il n’y a aucun moyen d’acter sur leur
certitude.
• Les vieilles données des archives, les faux profils des réseaux sociaux et les transactions
faites sur internet par délégation de tierces personnes ou organismes sont des exemples de
sources de fausses données mais susceptibles d’être exploitées.
• Ces 4 caractérisent le BD: les données sont massives, rapides, variées et incertaines.
BIG DATA ET SANTE

• 90% des données mondiales existantes ont été produites au court des deux dernières
années
• Emergence très forte , avant tout liée aux capacités mais aussi aux besoins
OBJECTIFS
• Etablire des corrélations pour comprendre des mécanismes ou des facteurs de risque Les
pronostics des maladies Et bien sûr, être prédictif et préventif
• Le big data a l’ambition de remplir ou de répondre à de besoins en santé vis-à-vis des

grande imperfection de la médecine
QUELS TYPES DE DONNEES?

Génomique /Données biologiques/Donnée environnementales, comportementales ….
Quelle sont le données schématiquement les données interne aux patients génomique/biologique
et surtout oximes des données qui veut dire des autres paramètres génétique
Mais l’enjeu aujourd’hui est de recueillir aussi les données qui nous entoure environnementales,
comportementales et psychosociale et en essayant de converger ces différents type de données on
espère pouvoir trouver des paternes pour pouvoir mettre en évidence des corrélations qui en
suite seront autant d’hypothèses à valider
• Attention aux faux-positifs qualités des données ?
• Signification ?
• Trouver un signal n’est que la 1ère étape
• Validation ultime d’une hypothèse=méthode expérimentale

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LIMITES
- D’abord quand vous avait une grande quantité des données le hasard met en évidence une
association statistique afin de constituer ce qu’on appelle des faux positifs qui peuvent
être considérer comme des fausse alertes
- Deuxièmement la qualité des données toutes les données ne sont pas de bonne qualité et
quand vous associé les données de bonne et mauvaise qualités la précision finale de
votre estimation elle sera tire vers le bas par les données de mauvaise qualité
- En suite la signification des données le big data vous met en évidence une association
statistique entre deux ou plusieurs éléments mais ne vous donne pas le sens de cet
association
- Et puis après le big data reste une science observationnelle
- Pour l’instant, intérêt encore limité en particulier, les données n’ont pas été rassemblées.
Recommandation
Votre apport doit être de montrer clairement que vous allez délivrer de la valeur en
Augmentant l’efficacité et/ou la sécurité des traitements Baissant les couts
Pour l’instant le big data n’a pas fait grande chose dans la santé on en est au stade
expérimental on se dit ce qu’on va arriver à faire avec le big data et aujourd’hui le big data n’a
découvert un nouveau test diagnostique un nouveau médicament et la plus part des expert disent
que les données qui existe sont inutilisable, inadéquat ou elles n’ont pas été rassemblée
correctement
Or l’un des enjeux du big data c’est de rassembler des données des sources différentes et
ensuite de les mettre en cohérence
Une société qui veut analyser les données en termes de santé pour l’instant

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Epi Info™ 7 est un ensemble de programmes appartenant au domaine public conçus par le
Center for Disease Control and Prevention (CDC) et fonctionnant sous le système d'exploitation
Microsoft
Windows. Epi Info™ 7 est utilisé par les professionnels de la santé publique pour l'étude des
épidémies, la gestion de bases de données pour la surveillance de la santé publique ainsi que
d'autres tâches et, de façon générale, les applications statistiques et les bases de données.
La dernière version du logiciel Epi Info™ 7 au moment de l'élaboration du présent manuel est la
V7.2.0.1 datant de l’Aout 2016.
Avec Epi Info™ 7 et un ordinateur, les médecins, les épidémiologistes ainsi que d'autres
professionnels de la santé peuvent rapidement concevoir un questionnaire, personnaliser la saisie
et l'enregistrement des données et analyser les données.
Les statistiques épidémiologiques, les tableaux, les graphiques et les cartes peuvent être produits
avec des commandes simples comme LIRE, FREQ, LISTE, TABLEAUX et GRAPHIQUE.
EpiMap affiche des cartes géographiques avec des données de différents formats.
AVANTAGES D’EPI INFO
- Compatibilité maximale avec les normes de l'industrie, y compris :

Soit Microsoft Access, SQL Server, en plus des bases de données ODBC et autres.
Soit Microsoft. NET ou des navigateurs Web et HTML
- Extensibilité, des organismes extérieurs au CDC peuvent produire des modules
Supplémentaires
- Compatibilité de EpiMap, et ArcView® - avec le GIS
- La régression logistique et l'analyse de survie de Kaplan-Meier
- Tutoriels

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CONFIGURATION REQUISE
 Infrastructure Microsoft. NET 3.5

 Infrastructure Microsoft. NET 3.5 ou supérieur
 Windows XP, Windows Vista, Windows 7
 32 Mo de mémoire vive
 Augmentation de la RAM: 64 Mo pour Windows 4.0 et 2000, 128 Mo pour Windows XP
 Un microprocesseur de 1 GHz
 Au moins 256 mégaoctets d'espace libre sur le disque dur (lecteur C) pour l'installation,
et 130 mégaoctets après l'installation.
La dernière version peut être obtenue à l'adresse :
www.cdc.gov/epiinfo/html/downloads.htm.

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RESSOURCES EPI INFO™
De la documentation pour la formation, des

traductions, des informations techniques et d'autres
ressources sont disponibles sur le site web Epi Info™
à l'adresse : http://www.cdc.gov/epiinfo.
Si vous avez des questions ou des problèmes avec le
logiciel, ou si vous voulez avoir plus d'informations,
vous pouvez envoyer un courriel au centre d'assistance d'Epi Info™ à
epiinfo@cdc.gov ou composer le 404.498.6190.
Un forum Internet consacré à Epi Info™ a été récemment mis en place à l'adresse :
https://epiinfo.atlassian.net/wiki/questions les utilisateurs du monde entier peuvent se poser des
questions et demander des conseils.
TÉLÉCHARGEMENT ET INSTALLATION
Epi Info™ 7 peut être téléchargé à partir de http://epiinfo.codeplex.com. Jusqu'à ce qu'il soit
accessible au grand public, il est recommandé que vous contactiez epiinfo@cdc.gov pour obtenir
des instructions sur la façon d'obtenir la dernière version.
Le fichier que vous allez télécharger est connu sous le nom de fichier "ZIP", également appelé
fichier d'archive ou fichier compressé. Ces fichiers d'archive devraient s'ouvrir sur n'importe quel
ordinateur Windows, bien que différentes applications puissent être utilisées pour les ouvrir en
fonction de la configuration système de l'ordinateur. Le présent guide montrera au lecteur
comment utiliser la visionneuse de fichiers d'archive de
Windows 7 pour extraire les fichiers.
1. Télécharger la dernière version du logiciel Epi Info™ 7 et la placer sur le bureau de votre
ordinateur.
Le fichier aura généralement un nom similaire à Epi Info 7.zip.
2. Double-cliquer sur le fichier téléchargé (dans la figure 1.1, ce fichier aurait pour nom Epi Info
7).
Windows 7 ou 8 ouvrira le fichier d'archive comme s'il s'agissait d'un dossier normal et affichera
le contenu.

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3. Sélectionner les éléments contenus dans l'archive et

les faire glisser pour les déposer sur le bureau.
Cette action permet de copier les fichiers programme
d'Epi Info™ 7 sur le bureau.
4. Double-cliquer sur l'icône de Lancement d'Epi Info
qui apparaît après l'étape 3. Epi Info™ 7 est lancé.
CRÉER UN QUESTIONNAIRE /
UN FORMULAIRE
Les formulaires d'Epi Info™ 7 et les données recueillies au moyen de ces formulaires sont stockés
par défaut dans les bases de données de Microsoft Access 2003. Un fichier de projet correspondant
sert de lien vers la base également utiliser les bases de données de Microsoft SQL Server si elles
sont disponibles. La base de données et le fichier de projet Info™7. Chaque projet contient un ou
plusieurs formulaires et chaque formulaire peut contenir une ou plusieurs pages.
Il n’y a pas de limite dans le nombre de champs que l'on peut placer sur un formulaire, même s'il
n'est possible d'ajouter que jusqu'à 255 champs par page. Vous pouvez avoir jusqu'à 1000 pages à
travers l'ensemble des formulaires d'un seul projet Epi Info™ 7.
Vous pouvez utiliser la composante Check Code Editor (Éditeur de code de contrôle) du Créer
Questionnaire pour ajouter la validation de la saisie des données à votre formulaire. Un exemple
utilisé dans le tutoriel, décrit comment calculer la différence en années entre deux dates. Vous
allez créer un code de contrôle indiquant que lorsqu'une date de naissance est saisi dans un champ,
l'âge d'un individu est automatiquement calculé et
placé dans un autre champ.
Cela vous permet de personnaliser votre questionnaire
et rend la saisie de données plus rapide et plus précise.
PREMIERE PARTIE. CREER UN PROJET
PREMIERE PARTIE. CREER UN PROJET
Epi Info™ 7 organise les bases de données à l'aide de
projets. Pour créer un nouveau projet, cliquer sur le
bouton Créer Questionnaire à partir du menu principal
du logiciel Epi Info™ 7. Un projet peut contenir
plusieurs formulaires et chaque formulaire peut
contenir des informations sur une série de données.
ÉTAPE 1: CREER UN NOUVEAU PROJET

1. Pour créer un nouveau questionnaire ou formulaire cliquer sur le bouton Créer Questionnaire
dans le menu principal du logiciel Epi Info™ 7. La fenêtre principale du module Créer
Questionnaire apparaît.
2. Sélectionner Nouveau Projet situé dans la partie supérieure gauche de l'écran.

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3. Lorsque la fenêtre s'affiche, taper Basic Epi dans le champ "Nom" pour le nom du projet.
4. Ne pas modifier le réglage par défaut de l'emplacement.
- Note: Vous pouvez spécifier l'emplacement exact d'un nouveau projet en modifiant le chemin
de l'emplacement. Epi Info 7 sauvegarde le projet dans le dossier Projets, mais vous pouvez le
sauvegarder où vous voulez.
5. Préciser le nom du nouveau formulaire à créer Outbreak1 (Épidémie1).

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6. Cliquer sur OK. Une fois cela fait, vous avez

créé un projetappelé BasicEpi qui contient un
formulaire appelé « G3SAPU »
CREER DES CHAMPS DANS LE

QUESTIONNAIRE AVEC LE MODULE
CREER QUESTIONNAIRE
Dans cette section, divers champs de saisie

seront placés dans le questionnaire. Pour
ajouter un
champ à votre formulaire, appuyer sur le
bouton droit de la souris et sélectionner le type
de champ
à ajouter. Une fenêtre de définition de champ pour chaque type de champ apparaît et vous devez
remplir, question (taper votre question ou invite) et nom du champ ou de la variable (il est
recommandé que les noms de champ soient courts, d'environ huit caractères.).
ÉTAPE 2: AJOUTER DES CHAMPS DANS LE QUESTIONNAIRE
LES ATTRIBUTS DE CHAMP

Parmi les attributs les plus couramment observées figurent:
- Intervalle. L’attribut intervalle permet au concepteur de spécifier des valeurs
supérieures et inférieures pour le champ. Toutes les données qui se retrouvent en
dehors des limites supérieures et inférieures de l’attribut de la plage seront écartées.
- Requis (Obligatoire). Les champs obligatoires doivent être remplis avant que
l'enregistrement soit effectué.

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- Répéter le dernier. Les champs marqués de l’attribut Répéter le dernier seront

automatiquement remplis avec la valeur de l'enregistrement précédent.
- Lecture seule. Un champ en lecture seule ne peut être modifié par l'utilisateur. Cet
attribut n'est généralement utile que pour les utilisateurs plus avancés.

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1. Cliquer sur le canevas avec le bouton droit de la

souris. Un menu contextuel apparaîtra.
2. Déplacer la souris sur l'option Nouveau champ. Un
sous-menu apparaîtra.
3. Sélectionner Nombre à partir de la liste de choix.
Une boîte de dialogue titrée Nombre apparaîtra.
4. Taper “Age” dans le champ Question ou Invite.
5. Appuyer sur la touche de tabulation du clavier.
Remarquez comment le curseur saute dans le champ
réservé
Au Nom du champ et le remplit automatiquement pour
vous en fonction de l'invite.
6. Dans la liste déroulante Modèle sélectionner ###.
Cocher l'attribut Lecture seule.
7. Cliquer sur OK. Le champ Âge est créé et affiché sur le canevas.
MODIFICATION DES POLICES DES CHAMPS
La modification des polices des champs existants doit se faire de façon individuelle. Pour
changer la police d'un champ, cliquer sur ce champ avec le bouton droit de la souris et
sélectionner Propriétés à partir du menu contextuel.
La boîte de dialogue de définition des champs s'affichera de nouveau. Vous pouvez utiliser les
boutons Prompt Font (police d'invite) et Input Font (police de saisie) pour modifier les
paramètres de police.
COUPER, COPIER ET COLLER

Vous pouvez couper, copier et coller les champs dans le Créer Questionnaires. Pour copier et
coller un ensemble de champs, vous devez d'abord faire glisser un rectangle de sélection autour
de ces champs, sélectionner Éditer > Copier dans le menu, puis cliquer avec le bouton droit de la
souris sur le canevas à l'emplacement de destination souhaité et sélectionner Coller dans le menu
contextuel.
Important: En raison du fait que les champs collés contiennent le nom de champ du champ
originel avec un 1 annexé, ces noms de champs par défaut ne sont généralement pas utiles.
Lorsque vous collez un champ après le début de la collecte des données, vous serez empêché de
changer le nom de champ par défaut.
DICTIONNAIRE DE DONNEES
Le dictionnaire de données affiche l'ensemble des champs du formulaire actuel dans une vue de
type tableur. Parmi les informations figurant dans le dictionnaire figurent le numéro de page,
l'invite, le nom du champ, le type de champ, une mise en forme éventuelle du champ, et toute autre
information spécifique à ce champ. Une revue du dictionnaire de données avant d'entamer la
collecte des données peut contribuer à identifier les faiblesses dans les normes de dénomination
des champs et constitue également un bon moyen de vérifier que tous les champs de date et les
champs numériques ont des configurations et des valeurs de plages cohérentes.
Le dictionnaire peut être trié en cliquant sur chaque titre de colonne. En outre, le dictionnaire
peut-être affiché dans un navigateur Web (où il est plus facile à imprimer) en cliquant sur le
bouton Afficher/Imprimer comme page Web.
Pour afficher le dictionnaire de données pour le formulaire, suivre les étapes ci-dessous:

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Accéder à Outils > Dictionnaire des Données des à partir menu du Créer Questionnaires. La
fenêtre du dictionnaire de données apparaît
Pour définir la propriété Lecture seule dans un champ, cocher la case appropriée dans le sous
menu.
Dans cet exemple, le champ âge est réglé en Lecture seule. L'âge sera automatiquement calculé
après la saisie de la date de naissance à l'aide de la date du système.
Une autre propriété de champ est Requis (Obligatoire). Les champs obligatoires doivent
contenir une valeur et ne peuvent pas être laissés vides lors de la saisie de données. Cette
propriété a des avantages et des
inconvénients.
Une autre propriété est Intervalle qui
peut fixer des limites minimales et
maximales à un champ numérique.
Étape 3: Renommer la page courante

1. Localiser sous la barre de navigation "Page 1" (dans la partie supérieure gauche de l'écran).
Placer le curseur sur cette ligne et cliquer sur le bouton droit de la souris.
Utiliser Renommer la page et taper IDENTIFICATION. Cliquer sur OK lorsque vous aurez
terminé.
Epi Info™ 7 peut créer plusieurs pages dans un formulaire. Chaque page peut
correspondre à une page du questionnaire sur papier ou avoir des variables organisées
d'une manière que vous trouvez pratique.
ÉTAPE 4: AJOUTER UNE NOUVELLE PAGE AU QUESTIONNAIRE

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1. Pour ajouter une nouvelle page, cliquer avec le bouton droit de la souris sur le nom du
formulaire, Outbreak1, situé dans l'Explorateur de projets, à gauche de l'écran.
2. Sélectionner Ajouter une page
ÉTAPE 6: CREER UN GROUPE

Nous avons regroupé les informations relatives aux différents types d'aliments. Les variables
d'EpiInfo™ 7 peuvent être regroupées de sorte que leur manipulation lors de l'analyse soit plus
facile. Procéder comme suit:
1. Cliquer sur le coin supérieur gauche d'un carré théorique qui entoure l'ensemble des variables
à regrouper (nausées, vomissements, diarrhée, crampes abdominales et fièvre) et tout en
maintenant enfoncé le bouton de la souris, tirer le coin inférieur droit d'un carré temporaire
autour des champs sélectionnés. Relâcher le bouton de la souris.
2. Aller dans le menu principal et choisir Insert > Group

26
 Si vous souhaitez modifier une partie du groupe

qui vient d'être créé, par exemple le titre, cliquer
avec le bouton droit de la souris sur le titre du
groupe Symptômes et sélectionner Propriétés.
 Pour supprimer un groupe cliquer avec le
bouton droit de la souris sur le groupe et
sélectionner Supprimer.
3. Maintenant, vous devez attribuer un nom à ce groupe.

Ce nom sera affiché en tant que titre du groupe dans la
partie supérieure gauche. Taper Symptômes.
ÉTAPE 7: ÉDITER UN CHAMP ET CREER UNE LISTE DE VALEURS AUTORISEES

Pour modifier un champ existant, le sous-menu de la définition du champ doit réapparaître. Pour
éditer les propriétés d'un champ, cliquer avec le bouton droit de la souris sur le champ question
ou texte et sélectionner Propriétés.
L'utilisation de la fonction "Valeur Légales" (Valeurs autorisées) est l'un des moyens les plus
faciles d'assurer une saisie exacte des données. Valeur Légales désigne une liste de valeurs
possibles en réponse à une question en utilisant une liste déroulant. Cette fonction est très utile
lors de la saisie des données dans un champ qui ne peut renfermer qu'un nombre limité d'options.
Les valeurs autorisées assurent une meilleure qualité des données et réduire la saisie des
données. Les valeurs autorisées ne peuvent être ajoutées qu'aux champs de texte.
Pour intégrer les valeurs autorisées à la question "Sexe", par exemple, procéder comme suit:
1. Cliquer avec le bouton droit de la souris dans le texte de cette question.
2. Sélectionner Changer en.
3. Sélectionner Valeur Légales
4. Appuyer sur le bouton parcourir pour accéder à la table des valeurs.
5. L'utilisateur pourrait utiliser une table de valeurs autorisées existante ou en créer
une nouvelle. Cliquer sur le bouton Créer un nouveau.
6. Ajouter les valeurs possibles pour le sexe: Féminin, Masculin. Si l'ordre

desenregistrements de cette liste est l'ordre que vous souhaitez afficher à
l'écran,sélectionner Ne pas trier.

27
7. Cliquer sur OK pour enregistrer la liste des valeurs autorisées puis cliquer sur OK unefois de
plus pour enregistrer la nouvelle configuration du champ.
Maintenant, nous allons ajouter des valeurs autorisées au champ Pays.
1. Cliquer sur Page 1 Identification et éditer la question "Paye".
2. Sélectionner Changer En.
3. Sélectionner Valeur légales
4. Appuyer sur le bouton parcourir pour accéder à la table des valeurs
5. Une table de valeurs autorisées existante ou de nouvelles valeurs autorisées peut être utilisée.
Cliquer sur le bouton Créer Nouveau.
6. Lister les valeurs possibles pour pays: Ghana, Côte d'Ivoire, Togo, Burkina Faso,
Bénin. Ne pas marquer
"Ne pas trier" parce que nous
souhaitons trier la liste par ordre
alphabétique.
7. Cliquer sur OK pour enregistrer
la liste et OK une fois de plus pour
enregistrer la nouvelle
configuration du champ.
ÉTAPE 8: ÉDITER UN CHAMP

ET CREER UN CHAMP
''COMMENTAIRE LEGAL ''
Les champs ''Commentaire Légal ''
sont des champs de texte avec un
code qui affiche le texte
correspondant au code affiché.
Dans cet exemple, le code et le texte affichés sont délimités par un trait d'union. Aussi bien le
code que l'intitulé sont affichés à des fins de saisie de données. Dans la base de données, seul le
code est stocké à des fins d'analyse (par exemple, C-Confirmé, P-Probable).
Pour ajouter des valeurs aux champs ''Commentaire Légal '', comme la question statut du cas,
procéder comme suit:
1. Cliquer avec le bouton droit de la souris dans le champ Statut du cas.
2. Sélectionner Changer en.
3. Sélectionner Commentaire Légal.
4. Vous pourriez utiliser une table de valeurs existante ou en créer une nouvelle.
Cliquer sur le bouton Changer En.
5. Ajouter les valeurs possibles pour Statut du cas. Rappelez-vous que la syntaxe
requiert un trait d'union entre le code et Commentaire Légal. Saisir C-Confirmé, P-
Probable,S-Suspect, E-Écarté. Si l'ordre des enregistrements de cette liste est l'ordre
que vous souhaitez afficher à l'écran, sélectionné "Ne pas trier". Si cette option n'est
pas sélectionnée la liste est triée par ordre alphabétique.
6. Cliquer sur OK pour enregistrer la liste des valeurs puis cliquer sur OK une fois de
plus pour enregistrer la nouvelle configuration du champ.

28
ÉTAPE 09 : CHANGER L'ORDRE DE TABULATION

Lors de la saisie des
données, Epi Info™ 7
déplace automatiquement le
curseur à travers les champs
dans l'ordre dans lequel ils
sont disposés sur l'écran de
gauche à droite et de haut
en bas. Pour changer l'ordre
dans lequel le curseur se
déplace d'un champ à
l'autre, vous devez modifier
l'ordre de tabulation dans
chacune des pages.
1. Cliquer avec le
bouton droit de la
souris sur le canevas
du Créer
Questionnaires.
2. Sélectionner
Montre l'ordre des tabulations.
3. Vous désignez l'ordre dans lequel le curseur se déplace sur l'écran lors de la saisie des
données.
4. Pour changer l'ordre pour certains champs uniquement, cliquer sur le numéro correspondant au
champ.
ÉTAPE 10: ALIGNER LES CHAMPS

En plus de déplacer et positionner manuellement les champs comme il l'a fait avant, le module
Créer Questionnaires aligne automatiquement les champs.
Sur Identification, les champs de numéro d'identification, Malade et Date de Notification
devraient être alignés horizontalement. Pour aligner les champs procéder comme suit:
1. Sélectionner les champs comme précédemment pour créer un groupe en cochant une
case autour des champs que vous souhaitez aligner.
2. Cliquer sur le coin supérieur gauche et faire glisser la souris vers le coin inférieur droit.
Relâcher la souris.
3. Une fois que vous avez sélectionné les champs, Clic droit sur le canevas puis
alignement de la sélection sur une, deux, trios, quatre colonnes and sur une ligne.
Introduction à Epi Info 7
ÉTAPE 13: CREER LA TABLE DE DONNEES DANS LA BASE DE DONNEES
Le Concepteur de formulaire permet de montrer à quoi ressemblera le formulaire lors de la

saisie des données. Lors de la saisie des données, une table distincte est créée pour le stockage
des données. C'est le moment de la créer.
1. Cliquer sur le bouton Saisie des données disponible dans le menu situé dans la partie
supérieure de l'écran.
2. Pour accepter les paramètres par défaut, cliquer sur OK lorsqu'on est informé qu'une
nouvelle table sera créée (Outbreak1).

29
- Rappelez-vous que le programme ne vous posera la question qu'une seule fois au sujet
de la création de la table. Les programmes Créer Questionnaires et Saisie des données
permettent de basculer d'un programme à l'autre sans avoir à quitter l'un pour entrer dans
l'autre. EDIT FORMS

30
RESUME
Cet exercice explique comment créer des questionnaires/des formulaires et une table de données
dans un projet EpiInfo™ 7 (extension de fichier PRJ). Plusieurs pages ont été créées sur un
formulaire. Cet exercice a traité des groupes de champs, du changement de la mise en page d'un
formulaire, la création de listes de valeurs autorisées et d'autres fonctions de base liées à la
création de formulaires. Au cours de cette leçon, vous avez été initié au concept de création de
formulaires de saisie de données électroniques à l'aide du module Créer Questionnaire
(Concepteur de formulaire)d'Epi Info™ 7. Vous pouvez maintenant:
- Créer un nouveau projet Epi Info™ 7
- Ajouter des pages à un formulaire
- Ajouter des champs à un formulaire
- Définir l'ordre de tabulation sur le formulaire et modifier les options de mise en forme
- Travailler avec des modèles
Q&R
Q: Pourquoi ne suis-je pas en mesure de modifier les noms de champ sur mon formulaire?
Je regarde la boîte de dialogue de définition des champs pour chacun des champs de mon
formulaire, mais la zone "nom de champ" est désactivée et je ne peux pas la modifier.
R: Les noms de champs ne peuvent pas être modifiés une fois que la saisie des données a
commencé. Le fait même de tester votre formulaire en mode de saisie de données est considéré
comme une saisie de données, de sorte que même une vérification rapide pour s'assurer que
l'ordre de tabulation fonctionne peut vous empêcher de modifier les noms de champ. Pour
résoudre ce problème ouvrir le formulaire dans le module Créer Questionnaires et sélectionner
Tools (Outils) >Supprimer la table de données à partir du menu. Cette action effacera toutes
les données recueillies jusqu'à ce point.
Q: Quelle est la différence entre le type de champ "texte" et le type de champ multiligne?
R: Le champ de type "texte" crée une zone de texte à une seule ligne sur le formulaire. Il peut
accepter jusqu'à 255caractères de saisie. Le champ de type multi lignes crée une zone de texte à
plusieurs lignes sur le formulaire. Il peut-être redimensionné verticalement, contrairement au
champ "texte", et peut stocker 2 Go de données textuelles.
Utiliser le champ multiligne lorsque de grandes quantités de texte peuvent être requises.
Q: Comment puis-je réorganiser les pages du formulaire?
R: Les pages peuvent être réorganisées par un clic gauche sur celles-ci et en les faisant glisser à
la position souhaitée. Suivre les étapes ci-dessous pour déplacer la deuxième page jusqu'à la
première position, et puis de nouveau à la deuxième position:
1. Cliquer avec le bouton gauche de la souris sur la Page 2 dans le volet de
l'Explorateur de projets. La ligne
Page 2 est mise en surbrillance.
2. Cliquer avec le bouton gauche de la souris et maintenir enfoncé l'élément dans le
volet de l'Explorateur de projets tout en faisant glisser la souris sur l'élément Case
information.
3. Relâcher le bouton gauche de la souris. La Page 2 s'affiche désormais en premier.
4. Cliquer avec le bouton gauche de la souris et maintenir enfoncé l'élément Case
information dans le volet de l'Explorateur de projets tout en faisant glisser la souris
sur l'élément.
5. Relâcher le bouton gauche de la souris. La Page 1 s'affiche désormais en premier.

31
Démarrer avec le Code de contrôle
Dans Epi Info™ 7, il existe un mécanisme pour intégrer la validation des données. Cette validation
des données est appelé Check code ou Code de contrôle. Un Code de contrôle peut être utilisé pour
assister l'utilisateur durant le processus de saisie de données. Le Code de contrôle peut calculer
automatiquement des valeurs telles que l'âge du patient, appliquer des formes de saut, afficher des
messages ou des questions pour l'utilisateur au cours du traitement des données, remplir les champs
sur les pages et masquer les champs à l'utilisateur.
Le Code de contrôle peut être intégré à l'aide de boîtes de dialogue disponibles dans le module
Créer Questionnaires qui permet la mise en œuvre de la logique souhaitée sans avoir des
compétences en programmation.
ÉTAPE 1: OUVRIR LE FORMULAIRE ACCESS ET LE CODE DE CONTROLE

Pour accéder au code de vérification, vous devez d'abord ouvrir un formulaire. Pour ce faire,
procéder comme suit:
1. À partir du module Créer Questionnaires, sélectionner Open Project (Ouvrir un projet).
2. Accéder au répertoire du projet Epi Info 7 et sélectionner le projetBasicEpi.Mdb et le
formulaire Outbreak1
3. Après l'ouverture du formulaire, cliquer sur le bouton intitulé Code de Contrôle qui active
l'éditeur de code de contrôle.
Tous les codes de contrôle doivent être associés à une variable existante dans le formulaire. La
liste des variables disponibles dans la boîte de défilement appelé Choisir le champ ou
l’action aura lieu.
Les variables sont organisées en pages. N'oubliez pas que vous ne verrez pas la question ou le
texte, mais le nom abrégé de la variable.
4 Lecture message

32
Le code de contrôle est utilisé pour contrôler les erreurs de saisie (mise en place de contraintes
d’intégrité), réaliser des calculs pendant la saisie et guider le processus de saisie des données. Ce
code peut être très simple mais aussi très compliqué.
Le code de contrôle peut être associé à un champ, une page, une forme ou un enregistrement. Les
commandes associées à un champ sont exécutées quand le curseur de saisie de données entre
dans le champ.
Nous allons l’utiliser pour calculer les variables « AGE » « âge à la date de début de suivi »,
«IMC » « Indice de masse corporelle » et Durée de suivi « DUREESUIVI ».
L’âge est calculé à partir de la date de naissance d’un patient et de la date de début de suivi.
Formule : AGE=YEARS(DATENAIS, DATEDSUI).
L’IMC est calculé moyennant la formule suivante : IMC=POIDS/TAILLE2. Le poids en
kilogramme (kg) et la taille en mètre (m).
La durée de suivi en jours est calculée comme suit : DUREESUIVI=DATEDN-DATEDSUI.

33

34

35

36
SAISIE DE DONNEES
Saisir les données

La saisie des données se fait d’une manière séquentielle en tapant les valeurs des champs dans le
masque vide. Validez chaque saisie en tapant sur la touche « ENTREE » du clavier.
A la fin de chaque enregistrement « Record », cliquez sur « New Record » pour saisir un nouvel
enregistrement.
Supprimer un enregistrement
Pour supprimer un enregistrement, cliquez sur « Delete » de la barre d’outils. Les données sont
alors supprimées logiquement, mais elles existent physiquement dans la base de données et
peuvent être restaurées à tout moment en cliquant sur « Undelete ».
Naviguer dans les données d’un questionnaire
Les données d’une table sont organisées en enregistrements. L’ordre de saisie est dit
« séquentiel ». Pour passer d’un enregistrement à un autre dans un ordre séquentiel, la barre
d’outils comporte plusieurs éléments :
• Le nombre d’enregistrements
• Le numéro de l’enregistrement affiché
• Un bouton « premier enregistrement»
• Un bouton « enregistrement précédent »
• Un bouton « enregistrement suivant »
Un bouton « dernier enregistrement»
Si vous souhaitez afficher un enregistrement dont vous connaissez le numéro séquentiel,
double-cliquez sur le numéro d’enregistrement affiché ; saisissez au clavier le numéro
séquentiel de l’enregistrement que vous recherchez. Puis appuyez sur la touche « Enter ».

37
ANALYSE DE BASE À L'AIDE DU TABLEAU DE BORD VISUEL
Une des nouvelles fonctionnalités disponibles dans Epi Info 7 est le Tableau de bord de
Visualisation. Tableau De Bord Visuel est un mécanisme permettant aux utilisateurs de voir
rapidement le type de renseignements recueillis. L'analyse est menée dans le tableau de bord
grâce à l'utilisation de gadgets. Les gadgets sont des éléments mobiles de l'écran qui exécutent
des fonctions statistiques spécifiques. À titre d'exemple, il existe un gadget de régression
logistique qui peut effectuer une régression logistique conditionnelle et inconditionnelle. Montré
dans est un exemple de gadget de fréquence.
Étape 1: Ouvrir Tableau De Bord Visuel

Pour ouvrir Tableau De Bord Visuel à partir du menu principal du logiciel Epi Info 7,
cliquer dans Analyse des
Données > sur Tableau De Bord Visuel. Le Tableau De Bord Visuel est également
accessible à partir du module
Saisir des Données.
Le menu principal du Tableau de bord comporte trois
zones différentes:
• Le nombre d'enregistrements
• Les gadgets pour Définir et Recoder
• Les filtres de données

38
Vous pouvez déplacer les gadgets autour de l'écran là où vous voulez. Il y a également
un ensemble de boutons dans le coin supérieur droit de chaque gadget qui vous permet
d'interagir avec eux autrement. Ces boutons sont les suivants:
Modifier les propriétés du Gadget: L'utiliser pour définir les champs que le gadget va
traiter.
Réduire/Agrandir la fenêtre de résultat du Gadget: L'utiliser pour réduire et agrandir la
fenêtre de résultat du gadget.
Fermer: Supprime le gadget. Les gadgets les plus couramment utilisés sont listés ci-
dessous.
Listing (Liste de ligne)
L'utiliser pour afficher une liste des lignes de données de la source actuelle de données.
Frequency (Fréquence)
L'utiliser pour produire un tableau montrant comment les données sont distribuées, le
nombre de n'importe quel intervalle donné, et le nombre d'enregistrements ayant chaque
valeur d'une variable
sélectionnée. Les limites de confiance pour chaque proportion sont incluses.
Means (Moyennes)
L'utiliser pour calculer les statistiques descriptives pour une variable numérique
continue. La moyenne d'un ensemble de données est égale à la somme des données
divisée par le nombre d'éléments dans l'ensemble de données. Lorsqu'il est utilisé avec
une variable d'une table d'analyse croisée, il calcule aussi les statistiques montrant la
probabilité que les moyennes des groupes soient égales. La moyenne d'une variable
oui/non est la proportion de répondants qui ont répondu oui. Le gadget Moyennes
produit les tests statistiques suivants: des tests paramétriques, l'analyse de variance ou
ANOVA (pour deux ou plusieurs échantillons), des tests non paramétriques, le test de
Bartlett pour l'inégalité des variances de population, l'analyse de variance
unidirectionnelle de Kruskal-Wallis (pour deux ou plusieurs échantillons),et le test à
deux échantillons de Mann-Whitney/Wilcoxon.
Introduction à Epi Info 7
2x2 / MxN Table (Table 2x2 / MXN)

L'utiliser pour créer des tableaux croisés de variables catégorielles. Le gadget 2x2/MxN
peut aider à déterminer la probabilité qu'un facteur de risque soit lié à un résultat. Pour
que ces valeurs aient leurs significations épidémiologiques reconnues, la valeur
représentant la présence de l'exposition (valeur indépendante) et les conditions du
résultat (variable dépendante) doit apparaître dans la première ligne et colonne de la
table. Les variables oui/non d'Epi Info™ sont automatiquement triées. Les valeurs de la
première variable sélectionnée apparaissent dans la partie supérieure de la table, et
celles de la seconde seront sur la marge gauche de la table. Normalement, les cellules
contiennent les nombres des enregistrements correspondant aux valeurs dans les
étiquettes marginales correspondantes.
Pour les tables 2x2, la commande génère des rapports de côtes et des risques relatifs.
Pour les tables autres que2x2, les statistiques du chi carré sont calculées. Le Chi carré
pour les tests de tendance pour la présence d’une tendance dans le rapport dose-réponse
ou d'autres études de contrôle de cas où une série d’expositions croissantes ou
décroissantes est étudiée. La valeur prédictive est la probabilité que l ‘association entre
deux variables puisse être due au hasard. Une valeur prédictive faible <.05 signifie que
le facteur de risque peut être étroitement associé à la maladie.
Chart (Graphique)

39
L'utiliser pour afficher les données visuellement. Parmi les types de graphiques pris en
charge figurent courbes épidémiologique (histogrammes), graphiques à secteurs, à
barres, à colonnes, à colonnes empilées, de dispersion et de Pareto.
Aberration Detection (Détection des aberrations)
L'utiliser pour trouver des aberrations dans les comptes de syndrome prévus sur une
période de temps.
CombinedFrequency (Fréquence combinée)
L'utiliser pour traiter un groupe de champs comme s'ils n'étaient qu'un seul champ afin
de générer un résultat de fréquence.
Matched Pair Case Control (Témoins appariés)
L'utiliser pour générer des statistiques de témoins appariés.
LinearRegression (Régression Linéaire)
L'utiliser pour exécuter une régression linéaire.
LogisticRegression (Régression logistique)
L'utiliser pour exécuter une régression logistique conditionnelle et inconditionnelle.
Étape 2: Ouvrir une base de données existante
La première étape nécessaire pour importer des informations dans Tableau

De Bord Visuel.
1. Cliquer avec le bouton droit de la souris sur le canevas/canevas.
2. Sélectionner Configure data source (Configurer la source de données)
3. Sélectionner Epi Info 7 comme type de base de données
4. Cliquer sur le bouton parcourir ( ) pour parcourir et sélectionner un projet.
5. Accéder au répertoire du logiciel Epi Info 7 et sélectionner Ecoli.prjdisponible dans
le dossier Projets.
6. Sélectionner le formulaire Food History (Anamnèse alimentaire) et appuyer sur OK.
Immédiatement, le module me montre qu'il y a 359 enregistrements, et me dit également de
cliquer avec le bouton droit de la souris sur le canevas pour ajouter du contenu. Cliquer avec le
bouton droit de la souris, et afficher une liste d'options de gadget à ajouter comme Fréquence,
Tableaux 2X2, Socks, Calculatoire et Graphique StatCalc
NutStat entre autres.
Parmi les différents gadgets disponibles, je peux ajouter une table 2x2, un gadget pour
une fréquence combinée peut aussi ajouter des gadgets pour la régression linéaire et logistique, et
divers types de graphiques.

40
Étape 3: Obtenir un listage

Pour voir l'information saisie dans la base de données, vous devrez générer une liste de données.
1. Faire un clic droit sur le canevas.
2. Sélectionner le Ajouter un gadget d’Analyse
3. Sélectionner Listing
Sélectionner les variables d'intérêt en cliquant sur chaque variable. En l'occurrence,

sélectionner
FirstName (Prénom), LastName (Nom de famille), DdN (Date de Naissance), ILL
(Malade),
Fever (Fièvre), Died (Décédé).
5. Cliquer sur le bouton OK.
6. Cela va générer une liste pour vous permettre de visualiser les informations, si vous
souhaitez exporter la liste vers MS Excel, vous n'avez qu'à faire un clic droit et
sélectionner Exporter vers Excel.
Étape 4: Obtenir une distribution statistique
Une distribution statistique contient la fréquence ou le nombre d'occurrences des valeurs

d'une variable/d'un champ particulier. Le tableau résume la distribution des valeurs d'un champ
spécifique. Créer un tableau indiquant le nombre d’enregistrements de chaque valeur des variables
spécifiées. Supposons que je souhaite voir la fréquence des patients malades dans cette base de
données. Le gadget Fréquence doit être sélectionné pour la distribution statistique.
2. Sélectionner le gadget Ajouter un gadget d’Analyse.
3. Sélectionner Fréquence.
4.Sélectionner la variable ILL (MALADE) à partir de la liste.

41

42
Une distribution de cette variable sera présentée à l'utilisateur.

Vous pouvez modifier la fréquence à l'aide de plusieurs options disponibles sur le gadget. En
outre, si vous souhaitez stratifier avec une fréquence de variables dans la base de données,
procéder comme suit.
1. Cliquer sur la flèche située dans la partie supérieure droite du gadget fréquences sur le ouvre
le panneau de configuration du gadget.
2. Cliquer sur Regroupement and Tri.
3. Sélectionner une variable dans la liste de la section Groupement: Dans cet exemple,
sélectionner Sex.
Vous pouvez voir maintenant qu'il y a deux fréquences représentées au niveau des
valeurs saisies
1. dans la variable Sexe.
Étape 5: Comparer les moyennes

La comparaison des moyennes est effectuée à l'aide du gadget Moyennes. Pour connaître l'âge
moyen des patients dans cette base de données, procéder comme suit.
2. Sélectionner le Gadget Ajouter une Analyse.
3. Sélectionner Moyennes.
4. Sélectionnez la variable Age.

43

44
I. ANALYSE STATISTIQUE
Il faut sélection les variables qualitatives et quantitatives.
Les variables qualitatives sont présentées sous forme des tableaux de distribution et de
fréquence.
I.1. Analyse des variables quantitatives
Obs = Nombre enregistré
Total = somme de toutes les valeurs
Std Dev = Ecart-type
Means = moyenne
Mode = mode <>≥≤
Si le nombre est inférieure à 5 (< 5) on prend le test de Ficher exact, (valeur

exacte de ficher)
On prend le chi-deux Uncorrected
P> 0,05 = pas d’association.
On ne prend chi-deux que si 75% des valeurs sont > à 5.
- Chi -2 d’indépendance ou d’association pour étudier les associations
- Chi – 2 d’homogénéité pour comparer les proportions dans les différents groupes.
Analyse bivarié entre variable qualitative et quantitative cela pourra nous aider à comparer les
moyennes.
Commande : Means / means of = âge
Cross-tabulate by value of = Exposition
Arrondir IMC
Assign = Assign variable (IMC) = f(x) = Numeric fonction = Round (< variable) remplacer
IMC = ok

45
Age et Exposition
Test Z = ANOVA.
1. Condition pour Anova test : Les variances doivent être homogène (d’où test de Bartlett’s).
2. Si N ≥ 30 = la distribution est normale
Si p de bartletts est < 0,05 on ne peut pas utiliser Anova.

Si p de bartlett’s est supérieur à > 0,05 on utilise le test de Anova.
P value de Anova = 0,16833 c.à.d supérieur à > 0,05 = pas de différence significative.
Si p Anova< 0,05 = différence significative.
Bref :
1. On vent comparer 2 moyennes
2. On vérifie si les effectifs sont supérieur à > 30 (= égale à la distribution normale).
3.
Si le test de Bartlett’s est < 0,05 c’est-à-dire non homogène
2. Possibilités = différence significative.
1. Test non paramétrique (= si un des effectifs est inferieur < 30 m des effectif est < 30 or les
variances ou se pas homogènes) on prend le test non paramétrique de Mann Whitney Wilcoxon.
Si plus de 2 groupes on utilise le test de Kruskal-wallis.
On utilise le test de Mann Whitney- Wilcoxon pour deux groupes et Kruskal- wallis pour
plus de deux groupes.
IMC et sexe
Ef Mean Variance St dev (écart types)
F 49 23,5 11,08 3,32
M 51 24,35 31,07 5,57
- Bartletts p est < 0,05 = variance non homogène.
- On prend le test de Mann Whitney- Wilcoxon

46
Comme ici dans cet exemple p est = 0,070 c’est-à-dire supérieur > 0,05 pas de différence
significative.
Si l’un des deux (2) effectifs ou tous les 2 effectifs sont inferieur à < 30 passer directement
au test de Mann Whitney-( Wilcoxon) .
Si la distribution est normale, on peut utiliser le test de Student à condition que les des
effectifs soient < 30 (condition pour T test : distribution un des effectifs < 30)
Étape 6: Stratifier les données

Le gadget de la table 2X2 peut croiser deux variables. Étant donné qu'il s'agit d'un
questionnaire sur l'historique de la consommation alimentaire lors d'une épidémie, choisir l'un des
aliments qui ont été consommés en sélectionnant le champ de l'exposition, tel que les fraises, si le
patient a mangé des fraises (exposition), et si le patient est malade(résultat).
Pour générer cette table, procéder comme suit:
2. Sélectionner le gadget Ajouter un gadget d’Analyse.
3. Sélectionner Table 2X2.
4. Sélectionner la variable Strawberries (Fraises) de la liste pour le champ exposition.
5. Sélectionner la variable ILL (MALADE) de la liste pour le résultat.
Dans le questionnaire originel, il y a un certain nombre de cases qui correspondent à chacun des
différents aliments que le patient pourrait avoir ingéré. Ces aliments sont tous inclus dans une
zone de groupe des aliments consommés. Pour exécuter une table à deux entrées pour chaque
aliment du groupe individuellement, il est fort probable que cela prenne un bon laps de temps.
Epi Info 7 donne différents résultats statistiques dans chacun des différents aliments pris dans un
groupe que, dans cet exemple, nous appelons FoodsEaten (Aliments consommés)de façon
automatique. Par conséquent procéder comme suit:
2. Sélectionner le Gadget Ajouter un gadget d’Analyse.
3. Sélectionner Table 2X2
4. Sélectionner la variable FoodsEaten (Aliments consommés) au bas de la liste pour
l'exposition.
5. Sélectionner la variable ILL (MALADE) de la liste pour le résultat.
L'âge moyen ou l'âge médian s'affiche, trente-six virgule cinq (36,5). Ouvrir le panneau
Options avancées et croiser par sexe.

47
Étape 7: Faire des graphiques
Représentation graphique diagramme a moustache

48

49
Vous pouvez également générer différents types de graphiques. Par exemple, prenons une
courbe épidémique, àl'aide d’OnsetDate(Date d'apparition). Pour générer ce résultat, procéder
comme suit:

50

2. Sélectionner Ajouter un gadget d’Analyse.
3. Sélectionner Graphique.
4. Sélectionner Courbe Graphique Epi dans la liste des types de graphiques.
5. Sélectionner OnsetDatedans la liste.
6. Appuyer sur OK.

51
TABLES DE MATIERES
 La démonstration en ligne d’un outil de suivi des données travaux développé par
le Conservatoire des Espaces Naturels de Rhône-Alpes (partie ODK et
QGis) : http://prezi.com/nwqplzd-mo-
l/?utm_campaign=share&utm_medium=copy&rc=ex0share
 La page sur la fonction search() : https://opendatakit.org/help/form-design/data-preloading/
 Le projet GéoODK qui permet d’améliorer les fonctionnalités de saisie de données (partie
collect) : http://geoodk.com/
 Le standard xlsForm pour voir tous les types de données saisissables dans ce
système : xlsform.org
 Les tutoriels d’installation de la partie serveur (Aggregate) sur différentes
plateformes : https://opendatakit.org/use/aggregate/
 La démonstration en ligne de l’interface web
serveur : http://opendatakit.appspot.com/Aggregate.html#submissions/filter///
 Le projet ODK 2.0, encore en alpha mais à suivre : https://opendatakit.org/use/2_0_tools/
 Une page présentant l’ensemble des possibilités avec
ODK https://opendatakit.org/help/form-design/examples/
 Des tutoriels: https://www.google.com/earth/outreach/tutorials/index.html#odk

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1

 Rappels théoriques des principes et méthodes des enquêtes en Santé 

 Recherche de la documentation scientifique sur l’internet

- Elaboration d’un protocole de recherche

 Recherche de la documentation scientifique sur l’internet

- Présentation générale de PubMed

- Modes d’interrogation de PubMed

 Recueil et analyse de données de santé

- Principes d’élaboration d’un questionnaire

Pascal KIMBA INFO MED

- Contrôle des données saisies

Importer des données dans EPI-INFO

Exporter des données vers Microsoft Office (Excel, Word, Powerpoint)

- Présentation des résultats

Pascal KIMBA INFO MED

I.1 GENERALITES SUR LA NOVELLE TECHNOLOGIE

De la technologie à l’usage professionnel des drones en faveur du développement

L’objectif pour Communautique est de développer son centre de formation et

Dans un deuxième temps, Communautique a pour objectif de poursuivre le déploiement

Efficacité, gain de productivité et impact environnemental réduit des drones

Le drone apporte davantage de flexibilité dans de nombreuses activités professionnelles. Il

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Du savoir-faire du FabLab à l’expertise en innovation ouverte de Communautique

De même, à travers les activités de FabLab de Communautique, de nouveaux métiers se

Enfin, le savoir-faire en innovation ouverte de Communautique sert les enjeux de la

DRONES ET ROBOTS : « LA TECHNOLOGIE PEUT ÊTRE MAL EMPLOYÉE »

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La technologie permettrait en tout cas de mettre en place un tel dispositif rapidement,

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Des drones de livraison.

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Open Data Kit (ODK)

1. “Build”: Construction du formulaire. Différents outils sont disponibles pour

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 FormHub : propose gratuitement une plateforme pour la conception et le déploiement de

Il permet la réalisation d’une étude. Cela comprend notamment : la création d’un

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Les éléments qui vous aideront à comprendre le Big data

• Big Data…c’est quoi

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Volume : données massives (1 V)

• Aujourd’hui nous sommes déjà en train de mesurer en zettaoctet et yottaoctet , et bientôt

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Variété: sources diverses (2 V)

• De plus en plus, la connectivité va envahir notre quotidien. nous serons complètement

• On parlera donc de l’informatique ubiquitaire ou bien l’informatique ambiante.

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Vélocité: Rapidité des flux de données. (3 V)

• Et cette rapidité ne cesse d’augmenter. L’exemple illustratif est la téléphonie mobile.

• En 2020, avec la 5G, les téléphones intègreront tout environnement connecté.

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Véracité: incertitude des données.

BIG DATA ET SANTE

• Le big data a l’ambition de remplir ou de répondre à de besoins en santé vis-à-vis des

QUELS TYPES DE DONNEES?

• Attention aux faux-positifs qualités des données ?

• Trouver un signal n’est que la 1ère étape

• Validation ultime d’une hypothèse=méthode expérimentale

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- Et puis après le big data reste une science observationnelle

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AVANTAGES D’EPI INFO

- Compatibilité maximale avec les normes de l'industrie, y compris :