TP 5 : Xeroderma pigmentosum et systèmes de réparation

Q1-A l’aide des documents 1, 2 et 3, montrez qu’il existe un système limitant l’apparition de mutations.

Votre réponse comprendra une analyse des documents 2 et 3.

Q2- Indiquez en quoi consiste l’action des UV sur l’ADN en réalisant le protocole Libmol 1. (voir doc1 et doc 4)
Votre réponse comprendra une capture d’écran légendée, titrée, utilisant un code couleur pour les 4 nucléotides et
mettant en évidence le mésappariement .

Q3- Habituellement, plus de 90% de l’ADN est réparé en 15 minutes grâce à des protéines réparatrices. (chez les
individus xérodermiques moins de 10 % des réparations ont lieu) La réparation de l’ADN fait intervenir un certain
nombre de protéines dont l’enzyme XPC. L’enzyme XPC est codée par le gène XPC localisé sur le chromosome 9.
Indiquez comment agit l’enzyme XPC en réalisant le protocole Libmol 2 (voir doc 5) et grâce à l’animation doc 1.
Votre réponse comprendra une capture d’écran légendée, titrée, montrant XPc et l’ADN lésé distingués par un affichage
différent avec un zoom sur la zone d’interaction , l’objectif étant de montrer que : la molécule d’ADN est déformée au
niveau des dimères de thymine, cela peut créer un mésappariement, mais XPC peut repérer ces endroits lésés et se fixer
dessus.

Q4-En plus de la XPC normale, on connaît des versions mutées. L’individu qui possède l’enzyme XPC 2 ou 3 présente une
hypersensibilité très forte aux UV ; il n’y a pas réparation de son ADN. L’individu qui possède l’enzyme XPC 1 présente
une sensibilité moins marquée aux UV ; son ADN peut être réparé mais l’efficacité de ces réparations est diminuée.
Expliquez le manque d’efficacité des protéines réparatrices XPc chez les individus xérodermiques en réalisant le
protocole geniegen2 . (voir doc 6)
Votre réponse comprendra une capture d’écran présentant le résultat de la comparaison entre les séquences de
nucléotides de l’allèle XPC normal et des allèles d’Individus xérodermiques.

Q5-Réalisez un schéma bilan expliquant la maladie.

Document 1 : formation de dimères de thymine sous l’effet des UV

Chez les individus atteints de la maladie génétique Xeroderma pigmentosum, la mortalité cellulaire
importante est due au fait que les radiations ultraviolettes (UV) peuvent affecter l'ADN des cellules
en entraînant, par exemple, la formation d'une liaison entre 2 thymines successives. Ces deux
thymines liées par une liaison covalente forment alors un dimère de thymine.
https://www.youtube.com/watch?v=GBIIYb_TCTs
C’est la présence de ces dimères qui perturbe le fonctionnement cellulaire et provoque la mort des
cellules se traduisant par l’apparition de taches brunes sur la peau.
Aide : Lecture de la légende Da = nucléotide sont le glucide est un Désoxyribose est la base azotée une adénine

-vérifiez les appariements entre brins

-sachant que A et T sont appariés grâce à deux liaisons faibles, et C et G grâce à 3 liaisons faibles, que remarquez-vous ?
 C

Document 6: Étude du xeroderma pigmentosum à l’échelle génétique avec le logiciel geniegen2

Taper genieGen2 dans Google puis cliquer sur le premier lien.
Cliquer sur « ouvrir la bande de séquence »
Chercher le pack «Comparaison de différents allèles de XPc (xeroderma pigmentosum» présent dans la banque de séquence.
Cliquez dessus.
Cliquer sur « charger ces séquences » . Vous pouvez alors visualiser les séquences de nucléotides de quatre allèles du gène
(remarque : un seul brin est représenté). Les individus non atteints ont XPC normal en un ou deux exemplaires.
Les individus atteints sont porteurs d’une version mutée (XPC mut 1 ou XPC mut 2 ou XPC mut «3) en deux exemplaires.

Comparer les allèles (voir rappel en bas de l’écran)

Ceux qui ont le temps peuvent essayer de transformer ces séquences de nucléotides en séquences d’acides aminés.