1reSVT CHAPITRE 1-PARTIE 1 :

Reproduction de la cellule et
ACTIVITE 6 : Type de mutation, fréquence et réparation variabilité du patrimoine génétique

PARTIE 1 : Les différents types de mutation

L’étude porte sur les bêta-thalassémies. Il s’agit de maladies liées à une
altération de la synthèse de la chaine bêta de l’hémoglobine, molécule
indispensable au transport du dioxygène dans le sang. Les individus atteints
produisent moins ou aucune chaine bêta, ce qui a des incidences sur la
fabrication de l’hémoglobine. Les formes les plus sévères provoquent des
anémies graves qui nécessites transfusions et greffe de moelle osseuse. Les
différentes bêta-thalassémies reposent sur des mutations du gène (séquence
de nucléotides) responsable de la fabrication de la chaine bêta de
l’hémoglobine. On se propose de comparer les différentes séquences du
gène de la bêta-thalassémie pour découvrir les types de mutations qui
peuvent affecter l’ADN.

CONSIGNE : Utiliser le logiciel Anagène et le protocole proposé ci-après pour remplir le tableau ci-dessous et définir les types
de mutations possibles de la molécule d’ADN.

ADN modifié / ADN normal Type de mutation

Il existe 3 modifications ponctuelles possibles de la
Caractères du changement molécule d’ADN, la mutation par substitution, par délétion
ou par addition
Longueur de
Position Nature du l’allèle (nombre de Type de
Définition (à trouver par vous-même)
nucléotides changement nucléotides en mutation
bases)

THA1

THA5

THA6

THA8

Protocole :
1) Ouvrir ANAGENE 2 : allez dans « Ordinateur » > « Windows C » > « Program FilesX86 » > « Anagene 2 » choisir le fichier
application « Anagène 2 ».
2) Pour charger les séquences d’ADN depuis Anagene : allez dans : « Fichier » puis dans « Banque de séquences », choisissez
« Les chaînes de l’hémoglobine » et parmi ces chaînes « Bêta ».
3) Sélectionner alors :
- "les séquences normales" puis "betacod.adn"
- "les séquences mutées" et dans ces séquences " les "thalassémies" à savoir « tha1cod.adn », «
tha5cod.adn","tha6cod.adn », « tha8cod.adn" ;

4) En utilisant la fonction information (icône ), remplir la colonne « longueur » du tableau exprimé en bases.
5) Pour comparer toutes ces séquences à betacod.adn (qui sera placé en première ligne pour la définir comme référence
de compraison):
- Sélectionnez toutes les séquences en enfonçant le carré devant la séquence.
- Allez dans la barre de menu, choisissez « Traiter" puis "Comparer les séquences" puis « Alignement avec
discontinuité ».
NB : Seuls les nucléotides différents (par rapport à la référence) sont indiqués les nucléotides identiques sont siglé par un « - ».
Utilisez la règle pour voir la position des nucléotides. Un tiret du 8 « _ » signifie qu’il manque de nucléotide par rapport aux autres
séquences.
6) N’oubliez pas de répondre à la consigne générale : remplir le tableau ci-dessous et définir les types de mutations.
 PARTIE 2 : Etude de la diversité allélique du gène XPf et la maladie Xeroderma pigmentosum
Chez les personnes atteintes de la maladie Xeroderma pigmentosum, la photolyase (enzyme du système de photoréparation) est
inactive. Ces malades présentent une sensibilité extrême à l’action mutagène de rayons UV, qui se manifeste par une fréquence
accrue de cancers de la peau. L’activité des systèmes de réparation est donc indispensable au maintien d’un faible taux de
mutation. Dans ce cas les mutations à l’origine du cancer de la peau sont causées par les rayons UV du soleil : c’est un agent
mutagène.

CONSIGNE : Réaliser sur votre cahier un tableau comparatif des allèles du gène XPF. Pour cela ouvrir les fichiers depuis
Anagène depuis le chemin suivant dans la banque de séquence d’Anagène : Première S > Génotype, phénotype et
environnement > Complexité des relations…> Xeroderma > plusieurs génotypes pour un même phénotype > ouvrir
les fichiers xpf1, xpf2, xpf3, xpf4, xpf5, xpf6 et xpfnormal (qui sera votre référence).
Utiliser les fonctionnalités du logiciel (comme dans la partie 1) pour faire une comparaison avec alignement et réaliser
votre tableau comparatif. Ce tableau vous sera utile pour une analyse ultérieure.

PARTIE 3 : Fréquence et nature des mutation spontanées

Nombre de mutation et taux de mutation selon les lignées cellulaires : Les taux de mutation sont établis à partir du séquençage
compléter la comparaison des génomes de cellules de différents organes. Selon les lignées cellulaires et selon l’âge, on peut
déterminer le nombre de mutation accumulés par cellule au cours des nombreuses divisions cellulaires.

CONSIGNE : A partir du document ci-avant :

1) Choisir un type cellulaire (ex : ovocyte) : ……………………..
2) Choisir un âge précis (ex : 22 ans) :……………………….
3) Calculer le nombre de mutation obtenue à cet âge pour ce type cellulaire choisi (précision du calcul attendu). Prendre la
valeur la plus pour T quand il y a une minimale et une maximale (ex : si T = 0,2 à 0.6 prendre 0.2).
4) Sachant qu’une cellule humaine compte 3.109 paires de bases par lot de chromosomes, calculer le nombre de mutations
de novo attendues chez un nouveau-né comparé à ses parents à partir du doc 3 p34. (Calcul et explication attendus).

PARTIE 4 : La nécessité d’un système de réparation de l’ADN

La faculté de réparer l’ADN est essentielle parce que les erreurs liées à la réplication ou la présence d’agent mutagène (UV,
radioactivité, amiante…) peuvent provoquer des mutations. Les cellules possèdent de nombreux systèmes de réparation (une
centaine chez la bactérie E.coli et environs 130 chez Homo sapiens) ; certains sont
spécifiques d’un seul type de dommage, comme la photoréparation qui scinde les
dimères de thymine (voir doc 2 p36) provoqués par les UV. D’autres systèmes ne sont
pas spécifiques, comme la réparation de l’ADN par excision ou combinaison. Voyons
comment réparent ces molécules qualifiées d’enzymes…et c’est quoi une enzyme ?
Vidéo ressources : se trouvant sur le liens dans document en consultation
https://www.youtube.com/watch?v=vP8-5Bhd2ag
https://www.youtube.com/watch?v=TNKWgcFPHqw
https://www.youtube.com/watch?v=e4VbuNe0QRQ
https://www.youtube.com/watch?v=p3MXIKWAi2w

Consigne :
1) Visionner les vidéos (pour faire le visionnage français sous-titré aller dans l’onglet paramètre)
2) Réaliser un schéma d’un œil de réplication avec les enzymes (il faut utiliser les vidéos).
3) Donner 3 exemples concrets d’enzymes intervenants dans le cadre de la réplication de l’ADN (Nom + fonction).
4) Rechercher sur internet les 4 principales caractéristiques d’une enzyme et les définir (attention croiser votre recherche
avec plusieurs sources), afin de donner une définition générique de celle-ci.
 Documents du LIVRE

Doc 2 p36

Les UVs induisent la formation de liaisons entre deux

thymines adjacentes. Ces dimères de thymine
déforment la double hélice et font barrage à la
plupart des ADN polymérases lors de la réplication,
induisant la mort de la cellule. Certaines ADN
polymérases parviennent à les franchir, mais elles
commettent des erreurs d’appariement bien plus
fréquentes que spontanément.

Doc 3 p34
Doc 4 p37
 TD ACTIVITE 1 : COMPOSITION ET STRUCTURE DES CHROMOSOMES
Objectifs de connaissances et de capacités : Au cours de la phase S, l’ADN subit la réplication semi-conservative. Il s’agit
de la formation de deux copies qui, en observant les règles d’appariement des bases, conservent chacune la séquence des
nucléotides de la molécule initiale. Ainsi, les deux cellules provenant par mitose d'une cellule initiale possèdent exactement
la même information génétique. La succession de mitoses produit un ensemble de cellules, toutes génétiquement
identiques que l’on appelle un clone. REPLICATION SEMI CONSERVATIVE, ADN POLYMERASE, CLONE.

Exploiter les informations d’une expérience historique ayant permis de montrer que la réplication est un mécanisme
semi-conservatif.
Analyser des documents permettant de comprendre le mécanisme de réplication semi-conservative.
Observer des images montrant des molécules d'ADN en cours de réplication.
Calculer la vitesse et la durée de réplication chez une bactérie (E. coli) et chez un eucaryote.
-Concevoir et/ou réaliser une réaction de PCR (amplification en chaîne par polymérase) en déterminant la durée de
chaque étape du cycle de PCR. Calculer le nombre de copies obtenues après chaque cycle
Capacités travaillées : C1-Schéma

Modalité : Individuellement 30 min

Supports : Fiche TD + vidéo
Mise en commun : Au vidéoprojecteur par le professeur (visionnage vidéo compaction ADN)
Trace écrite : Schéma ADN + bilan + ressource n°2 + Doc activité complété + correction des calculs
Travail maison : Travail préparatoire ECE mitose + Prévoir 15 min pour lecture FT microscope + FT Lame mince + FT
ECE + (re)visionnage 2 vidéo
https://www.youtube.com/watch?v=gbSIBhFwQ4s
https://www.youtube.com/watch?v=0c0y9V6-J_A