Mtabolisme bactrien et fongique

Le mtabolisme dun organisme est constitu par la somme totale des ractions chimiques qui se produisent au niveau de ce mme organisme. Il comprend dune part, des ractions de dgradation de substrats (catabolisme) et dautre part, des ractions de biosynthse de substrats (anabolisme). Ces deux types de ractions ncessitent toujours lintervention de catalyseurs qui sont des enzymes.

1 Le mtabolisme nergtique : En phase exponentielle de croissance, la synthse de tous les constituants bactriens se ralise partir des nutriments prsents dans le milieu. La transformation et lassemblage de ces constituants ncessitent de lnergie. Cest le mtabolisme nergtique qui fournit cette nergie.

1.1. La molcule de transfert dnergie : Cest la molcule dATP. On peut dfinir deux types trophiques selon lorigine de lnergie : Phototrophes :

Utilisent lnergie lumineuse pour produire de lATP. Chimiotrophes :

Utilisent lnergie doxydation de produit chimique pour produire de lATP. Produits chimiques dorigine minrale : chimiolitotrophes. Produits chimiques dorigine organique : chimioorganotrophes.

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Arnaud Delahaye

1.2. Source dnergie pour les bactries chimioorganotrophes : Par oxydation dun substrat organique prsent dans le milieu. Loxydation dun substrat peut tre dfinie comme le processus au cours duquel il perd ses lectrons. Il sera appel donneur dlectrons, et donne naissance un produit oxyd. Le substrat tant un compos organique, il est hydrogn et dans ces conditions loxydation est en effet une dshydrognation. XH2 X + 2H+ + 2 Ses lectrons sont capts par un oxydant, par lintermdiaire de coenzymes : NAD+/NADH, H+. FAD/FADH2. NADP/NADPH, H+.

1.3. Nature de laccepteur final des lectrons : 1.3.1. La respiration : Les lectrons passent sur une chane de transporteurs dlectrons et sont accepts par une molcule minrale : Si dioxygne, cest une respiration arobie. Si autres molcules ou ions minraux, cest une respiration anarobie.

1.3.2. La fermentation : Les lectrons ne sont pas pris en charge par une chane de transporteurs dlectrons, laccepteur final est une molcule organique.

1.4. Mcanismes de production dATP : 1.4.1. Phosphorylation au niveau du substrat : Si loxydation de la source de carbone est exothermique, le couplage avec la synthse dATP est possible.

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1.4.2. Couplage avec la chane respiratoire : La chane respiratoire se situe dans la membrane cytoplasmique de la bactrie et seffectue laide denzymes : Cytochrome c et a. Cytochrome o. Cytochrome b.

1.5. Etude du mtabolisme nergtique : 1.5.1. Les types respiratoires : Voir fiche technique.

1.5.2. Les enzymes de la respiration : Oxydase :

Enzyme de la chane respiratoire qui assure le transfert dlectrons sur le dioxygne. Catalase et peroxydase :

Enzyme catalysant lhydrolyse du peroxyde dhydrogne form lors de ractions en arobiose. Nitrate rductase :

Enzyme catalysant la rduction des nitrates en nitrites qui peut tre coupl la formation dATP.

2 Le mtabolisme glucidique : La dgradation dun glucide saccompagne dune production dacide visible par acidification du milieu. Les diffrentes voies de ce mtabolisme sont : La respiration : Le glucose est oxyd. La fermentation : Le glucose est oxyd en acides ou alcools.

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2.1. Les diffrentes voies de dgradation : De nombreux glucides peuvent tre utiliss comme substrat. La plupart sont transforms en glucose qui est dgrad, ensuite, en pyruvate, par la chane de la glycolyse. Si le pyruvate est oxyd, il y a utilisation du cycle de Krebs : Pyruvate Actyl CoA 2 CO2 Si le pyruvate est rduit, il y a fermentation en anarobiose : Homolactique : Glucose 2 Pyruvates Lactate Alcoolique : Glucose 2 Pyruvates 2 thanol Htrolactique : Glucose-6-phosphates ribulose-5-phosphates thanol ou lactate Acide mixte : Glucose 2 Pyruvates succinate, thanol, etc.

2.2. Etude des diffrents types mtaboliques : Les micro-organismes peuvent tre : Arobie stricte. Aro-anarobie facultatif. Anarobie stricte. Pour tudier le catabolisme glucidique, on utilise les milieux Hugh et Leifson, TAB, Kligler, Mannitol-mobilit, Citrate, Clark et Lubs.

3 Le mtabolisme protique : 3.1. Activit protolytique : Elle sexerce sur la glatine, la casine, le collagne, etc. grce des protases. Les protases bactriennes permettent la putrfaction de la matire organique. Les protases des moisissures contribuent llaboration de diffrents produits alimentaires traditionnels.

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3.2. Catabolisme des acides amins : La dgradation des acides amins est trs frquemment opre par es bactries Gram ngatif et parfois par dautres. On sintresse deux types de catabolisme des acides amins : la dsamination et la dcarboxylation. Les conditions exprimentales doivent tre parfaitement dfinies : Le pH du milieu. La composition du milieu. La pression partielle en oxygne. La dsamination est vu par le milieu ure-indole, TDA et la dcarboxylation par les bouillons Moeller.

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