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Biologie Cellulaire
Biologie Cellulaire
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Mars 2015
Par :
CHAPITRE 1 : LA CELLULE
I. INTRODUCTION
Les organismes animaux ou vgtaux sont des ensembles complexes constitus de
plusieurs parties agences entre elles pour accomplir les fonctions vitales telles que la
croissance, la nutrition ou la reproduction. Un organisme tel que le notre est constitu de
plusieurs organes spcialiss chacun dans une fonction qui contribue la vie de lensemble
(Ex Appareil digestif: langue, estomac, foie pancras etc...). Lanatomie permet dtudier la
disposition, la forme et la structure des organes. Chaque organe est son tour constitu dun
assemblage de minuscules compartiments dlimits chacun par une membrane entourant une
suspension aqueuse de macromolcules. Ces compartiments sont des cellules.
La biologie cellulaire tudie les cellules et leurs organites, les processus vitaux qui
s'y droulent ainsi que les mcanismes permettant leur survie.
1858 : Louis Pasteur rfute la gnration spontane, croyance selon laquelle des
formes de vie peuvent apparatre spontanment.
1665 : Robert Hooke dcouvre des cellules dans du lige en utilisant les
premiers microscopes.
1839 : Theodor Schwann dcouvre que les plantes et les animaux sont faits de
cellules, concluant que la cellule est l'unit commune de structure et de
dveloppement: thorie cellulaire. Il donna son nom aux cellules de Schwann.
1858 : Rudolph Virchow affirme que les cellules naissent du rsultat de la
division cellulaire ( omnis cellula ex cellula )
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Les procaryotes sont identifis aux bactries : la plupart vivent comme des
organismes monocellulaires mais certaines bactries sassocient en chanette. Les
procaryotes ont leur ADN dans le cytoplasme de la cellule.
Les eucaryotes (ou noyau-vrai ) possdent un noyau, compartiment spar du
reste du contenu cellulaire, qui contient lADN.
Attention !!! Les virus, ou acaryotes, sont des lments (et non des cellules) qui ne
possdent ni de noyaux ni de cytoplasme et ne peuvent se reproduire quen parasitant une
cellule hte en dtournant la machinerie cellulaire.
Schma 1 : plan
dorganisation des cellules
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Les eubactries (ou vraie-bactrie ) sont les plus proches des bactries actuelles.
Elles prennent en compte les bactries contemporaines, les mycoplasmes et les
cyanobactries.
Le procaryote classique est Escherichia-coli (ou E-coli), qui est une bactrie habitant dans la
flore intestinale humaine grce une paroi cellulaire rigide.
Les bactries se distinguent de part leurs parois cellulaires mise en vidence par la
coloration de Gram. On trouve des bactries gram + et des bactries gram :
Les bactries gram + retiennent le colorant, coloration violette. Leurs parois
possdent une couche unique de peptidoglycane qui repose sur la membrane plasmique, les
deux constituent la paroi cellulaire. On pourra prendre comme exemple les staphylocoques.
Les bactries gram sont beaucoup plus permables au colorant, coloration rose.
Leurs parois sont constitues dune couche fine de peptidoglycanes qui repose sur la
membrane plasmique entoure par une membrane externe : il y a donc trois couches.
Lexemple le plus pertinent sera Escherichia coli.
Les cellules procaryotes contiennent un compartiment unique, le cytoplasme, contenant un
chromosome ou une molcule dADN unique qui est le plus souvent circulaire et que lon
appelle le nuclode. Les bactries se rpliquent rapidement par division cellulaire ou
scissiparit. Elles peuvent tre pathognes ou non pathognes.
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Schma 3 : Organisation
gnrale de la cellule animale
eucaryote
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Globules Neurone
rouges
Cellule
dendriti Cellule
que musculai
re
Fibrobla
stes
V. COMPOSITION DE LA CELLULE
Les organites constituant la cellule dont les mitochondries, rticulum endoplasmique,
chloroplastes, noyau, membrane cellulaire, abritent des molcules et matriaux de base en
biochimie, dont les protines, lipides, glucides et acides nucliques. Les chanes du mtabolisme
prennent lieu dans diffrents organites.
V.1. La paroi cellulaire
La paroi des cellules est une caractristique structurale de plusieurs tres vivants dont
les vgtaux. Elle est constitue principalement de cellulose, hmicellulose, pectines,
polymres phnoliques, protines structurales et enzymatiques et diffrents ions. De
nombreuses hydrolases (glucanases, pectine Methyle Estrase,...) sont prsentes dans
la paroi des cellules.
Les oses constituent les lments de base des polysaccharides de la paroi cellulaire. Ce sont
des composs carbons possdant des fonctions alcool et des fonctions rductrices
(aldhydes et ctones). Il existe de nombreux isomres pour chacun des oses.
Les membranes cellulaires sont des doubles couches phospholipidiques dans lesquelles
sinsrent de manire asymtrique et inhomogne dautres structures les caractrisant.
La membrane dlimitant la cellule est appele membrane plasmique et les membranes des
organites sont appeles par le nom de lorganite concern (membrane nuclaire, membrane
mitochondriale, etc.).
En microscopie lectronique on observe une tri-lamination de la membrane : un
feuillet clair de 3 nm (environ 2 fois la longueur dune chane dacide gras) entour par 2
feuillets sombres de 2,5 nm chacun ; lpaisseur totale est donc denviron 8 nm. Ceci a
permis de mettre en vidence la structure en bicouche phospholipidique de la membrane
plasmique.
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b) Glycolipides
Ils sont de deux types : les glycroglycolipides et les sphingoglycolipides. Il est intressant
de prciser que les glycolipides des membranes des rythrocytes (globules-rouges),
dfinissent le groupe sanguin de lindividu.
c) Cholestrol
Le cholestrol est uniquement prsent dans les membranes des cellules animales, en
effet, il est absent des cellules vgtales et des bactries. Le cholestrol est compos dun
noyau strode hydrophobe, dune queue hydrophobe et dune fonction alcool hydrophile.
La molcule est donc amphiphile, reprsente environ un quart des lipides membranaires et
influence la fluidit membranaire.
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Les protoglycanes sont galement des glycoprotines, mais qui contiennent des
polysaccharides chane longue compose dunits disaccharidiques rptes linfini,
reprsentant jusqu 90% du poids molculaire globale. Souvent un des deux sucres de
lunit est amin, on parle alors de glyco-amino-glycane (ou GAG) dont le plus simple
est lacide hyaluronique.
Pour information, les protoglycanes scrtoires composent la matrice extracellulaire (tissu
conjonctif, cartilage, etc.) et sont diffrents des protoglycanes cellulaire.
V.2.2. Proprits des membranes
V.2.2.1. Auto-assemblage des lipides
Les phospholipides, dus leurs proprits physico-chimiques, sassemblent de manire
automatique en diffrentes sortes de structures suivant lenvironnement :
Les monocouches sont des couches mono-molculaires dont les ttes hydrophiles sont
diriges vers le milieu aqueux et les queues hydrophobes vers le milieu lipidiques.
Les micelles sont des formations sous la forme de gouttelettes rondes, o dans un milieu
aqueux les ttes hydrophiles sont diriges vers lextrieur de la sphre et les queues hydrophobes
sont diriges vers lintrieur (dans un milieu lipidique la conformation est inverse).
Les bicouches phospholipidiques permettent la formation de vsicules sphriques
appeles liposomes. Les bicouches phospholipides rentrent dans la formation des bicouches
membranaires. Pour information, les liposomes sont actuellement utiliss en thrapeutique pour
encapsuler des substances mdicamenteuses.
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Les cadhrines sont des glycoprotines sous la forme de monomre, possdant une extrmit
N-terminale extracellulaire et tant calcium (Ca2+) dpendante. Les diffrents types de
cadhrines sont spcifiques au tissu.
Ces molcules jouent un rle principal dans les jonctions intercellulaires de type
desmosomes. De cette manire leurs extrmits intracellulaires C-terminale interagiront
avec les plaques denses ou directement avec les protines du cytosquelette, et leurs
extrmits extracellulaires N-terminale raliseront des interactions homophiles et
htrophiles avec des autres cadhrines, des intgrines et des protines de la matrice
extracellulaire.
Dans les tissus, les cellules inhibent leurs propres croissances en interagissant les unes avec
les autres et ceci grce la prsence des cadhrines qui sont responsables de ce phnomne
appel inhibition de contact.
c) Slectine
Les slectines sont des glycoprotines sous forme de monomre possdant une extrmit N-
terminale extracellulaire. Les slectines sont des lectines calcium (Ca2+) dpendante qui ont
la spcificit de reconnatre les groupements glucidiques dautres glycoprotines.
Les slectines permettent la formation de liaison brve et de trs haute spcificit. Elles ne
sont pas exprimes en permanence, mais ncessite une activation entranant son endocytose.
Elles interviennent dans des interactions htrophiles lors de la diapdse.
d) Intgrine
Les intgrines sont des glycoprotines sous forme de dimre () prsentant une
extrmit extracellulaire N-terminale et tant elles aussi calcium (Ca2+) dpendante.
Les intgrines interagissent avec les composants de la matrice extracellulaire et de la lame
basale tels que les fibronectines, les laminines et le collagne. Elles interagissent galement
par des interactions htrognes avec des immunoglobulines et des cadhrines, et dans le
milieu intracellulaire avec le cytosquelette.
2) Jonctions intercellulaires et jonctions cellules-matrice extracellulaire
Les jonctions intercellulaires sont des rgions diffrencies de la membrane plasmique
responsable de ladhrence intercellulaire et au niveau desquelles on distingue une
concentration importante de molcules dadhrence. Parmi elles on distingue les jonctions
serres (ou Zonula Occludens), les jonctions intermdiaires (ou Zonula Adherens), les
desmosomes, les jonctions communicantes (de type nexus ou jonctions gap).
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c) Les desmosomes
Les desmosomes ne sont cette fois-ci plus des zonulas,
mais des macula-adherens qui sont des zones
dancrage des filaments intermdiaires sous la forme
de tche, do le terme de macula . Ils permettent la
formation de jonctions intercellulaires, contrairement
aux hmidesmosomes qui crs des jonctions entre
cellules et lame basale. On trouve les desmosomes
principalement au niveau des pithliums, mais pas
exclusivement.
Ils sont composs de desmocolline et desmogline qui
sont des cadhrines (calcium dpendantes) spcifiques
formant des interactions homophiles et htrophiles
Production Mariana RUIZ
entre elles, ainsi que des molcules de la superfamille
(LadyofHats)
des immunoglobulines.
La plaque dense a cette fois-ci une forme arrondie et est compose de desmoplakine, o se
fixent les filaments intermdiaires de cytokratine. Il est important de noter que deux
molcules font office dintermdiaire entre les molcules transmembranaires(desmocolline
et desmogline), et les molcules de la plaque dense (desmoplakine) : la plakoglobine et la
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plakophiline.
Les desmosomes permettent ladhrence intercellulaire, le maintien de la forme des cellules
et une rsistance cytoplasmique.
d) Les hmidesmosomes
Les hmidesmosomes sont prsents au niveau du ple basal et forment, comme dit
prcdemment, des jonctions avec la lame basale par interaction entre les intgrines des
hmidesmosomes et les laminines de la lame basale.
Comme les desmosomes, les hmidesmosomes prsentent une plaque dense qui permet
dancr les filaments intermdiaires de cytokratine. Ces derniers forment un rseau entre
les plaques des desmosomes et hmidesmosomes permettant le maintient de la cohsion
cellulaire.
e) Les jonctions communicantes de type nexus (ou jonction gap)
Au niveau des nexus on observe un espace intercellulaire de 2 3 nm. On les trouve au
niveau des faces latrales des cellules pithliales et galement des cellules non pithliales
(fibroblastes, cellules musculaires, cellules osseuses, neurones, etc.).
Ils sont composs de plusieurs centaines de canaux bidirectionnels par association de lun
lautre provenant dune cellule et de lautre. Chaque canal est un connexon form de 6 sous-
units, dont chaque sous-unit est une connexine qui possde 4 segments
transmembranaires. Les nexus permettent une cooprativit mtabolique intercellulaire en
fonction du gradient de concentration (ions et petites molcules) et permet ainsi le transfert
dinformations (second messagers tels que lAMP cyclique, le calcium Ca2+ et certains
enzymes).
Ces jonctions ne sont pas exprimes de manire constitutionnelle mais possdent des demi-
vies de lordre de 24 heures. La rgulation de la permabilit dpend donc de la
concentration des nexus qui varie selon lactivit cellulaire.
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V.3. Le cytoplasme
Dans le cytoplasme, baignent des lments appels organites ou organelles.(le 1er
organite dcrit fut lappareil de Golgi, par Golgi en 1898 grce une coloration des cellules
au nitrate dargent). C'est le lieu de la glycolyse o les sucres simples sont convertis en
pyruvate. C'est ce niveau aussi que les cellules ralisent le repliement des protines.
V.4. Le noyau
Il existe suivant les cellules un ou plusieurs noyaux, certaines cellules mme n'en
contiennent pas (les hmaties). Sa forme est en gnral sphrique ou ovode. Sa taille est
proportionnelle la cellule (environ 1/3 de la cellule. Les constituants du noyau sont varis:
une enveloppe nuclaire, le nucloplasme, la chromatine et un ou plusieurs nucloles.
1- L'enveloppe nuclaire
Elle est constitue de 2 membranes (6nm d'paisseur),
une membrane externe au contact du cytoplasme
une membrane interne au contact du nucloplasme
Elles sont spares par un espace prinuclaire de 40nm. La membrane interne est
tapise par une structure fibreuse: la lamina. La lamina correspond a un rseau protique qui
relie la membrane interne l'ADN chromatidien. Elle est constitue de 3 types de protines:
la lamine A
la lamine B
la lamine C.
2- La chromatine
L'ADN contenu dans le noyau est li des proteines de liaisons formant ainsi la
chromatine. Il existe deux types de protines:
Les protines histones qui assurent une forte liaison avec l'ADN
Les protines non histones
L'association de l'ADN aux proteines histones se fait selon un modle dfini: la fibre
nuclosomique, considr comme l'unit chromatidienne. Diffrents types de chromatines
sont mis en vidence:
la chromatine disperse (ou euchromatine) constitue principalement de fibres A
(ensemble de nuclosomes enrouls en spirale et lis chacun par un histone H1)
la chromatine condense (ou htrochomatine) constitue principalement de fibres B
(spiralisation des fibres A en fibres B)
3- Le nuclole
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Le nuclole est le site de production des ribosomes. C'est l'activit de segment d'ADN, les
organisateurs nuclolaires, qui expriment les gnes sous forme d'ARNr. Le nuclole contient
trois composants:
un composant fibrillaire clair: correspond aux organisateurs nuclolaires.
un composant fibrillaire dense: correspond aux transcrits primaires donc a la partie
active du nuclole.
un composant granulaire priphrique: correspond la zone de stockage des pr-
ribosomes.
Schma 8 : Le Noyau
V. 5. Le rticulum endoplasmique
Au niveau des cellules, le rticulum endoplasmique est un ensemble de cavits de formes
varies. Si la face hyaloplasmique des cavits peut tre couverte de petits grains
(ribosomes) : le rticulum est dit granuleux. Sinon, il est dit lisse. Les ribosomes sont
impliqus dans la synthse des chanes polypeptidiques. Ils dcodent le message port par le
RNA messager. Les chanes polypeptidiques traversent les membranes et sont libres dans
les cavits. Les protines sont constitues d'acides amins de diffrentes catgories.
Une face gnralement oriente vers la surface cellulaire, ou face trans (= face de
maturation ou concave ou distale) ; cest la face produisant des vsicules.
Rappel: les saccules de la face cis ont une structure proche du RE 6m dpaisseur alors
que celles de la face trans sont proches de la membrane cytoplasmique 7,5m.
Entre les compartiments cis et trans se trouve le compartiment mdian.
Le nombre de saccules est variable (4-8) chez certains protozoaires, plus de 40 chez les
mtazoaires. Il y en a en moyenne une vingtaine par cellule.
Les vsicules faisant suite aux saccules du compartiment de maturation constituent le rseau
trans golgien (Trans Golgi Network, TGN). Les diffrents types de transport par
lintermdiaire des signaux cellulaires sont effectus par des vsicules tapisses de clathrine
bourgeonnant du rseau trans golgien.
Figure 10 b : Modle
hypothtique de transport de
protines dans une cellule non
polarise
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Les prcurseurs denzymes (protines nayant pas encore atteint leur stade actif final)
dont la synthse dbute dans les ribosomes et se poursuit dans le RE y subissent une O ou
N-glycosylation (O=Serine HO-CH2-, Thronine; HO-CHCH3-R), envelopps et stocks
dans les saccules de Golgi do ils migrent progressivement. La migration des diffrentes
protines vers la face de maturation (cis) saccompagne dincorporations progressives de
sucres spcifiques chaque tape. Le contenu des saccules golgiens subit une sgrgation au
niveau du TGN. Les vsicules de transport provenant du TGN portent les produits
synthtiss vers leur destination finale (structure, scrtion, etc...).
V.8. Les mitochondries
Elles sont prsentes en grand nombre chez tous les eucaryotes (1000 2000 dans les
hpatocytes).
Schma 11 : La mitochondrie
V.8.1. Structure
Ce sont des organites cellulaires enveloppe dont la taille varie (longueur 2-4m,
paisseur 0,5-1m). Elles apparaissent arrondies ou allonges mais sont en fait trs
dformables.
Elles sont en forme:
- danneau autour de la pice intermdiaire des spermatozodes
- de btonnet allong chez les trypanosomes
- ramifie dans les cellules des glandes muqueuses descargot.
On y distingue 04 principales parties :
La matrice mitochondriale: elle contient un mlange fortement concentr de
plusieurs centaines denzymes dont celles ncessaires pour loxydation du pyruvate, et des
acides gras et celle du cycle de Krebs.
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La membrane interne : cest une bicouche lipidique. Elle sinvagine pour donner
plusieurs crtes qui augmentent sa surface totale. Elle contient des protines possdant 3
principales fonctions:
- Celles qui effectuent les ractions doxydation avec la chane respiratoire.
- Un complexe enzymatique appel ATP synthtase (=F0F1ATPase) qui produit lATP
dans la matrice (15% des protines de la membrane interne).
- Des protines de transport spcifiques qui rglent le passage des mtabolites vers la
matrice et en provenance de celle-ci.
La membrane externe est galement une bicouche lipidique. Elle contient une
grande protine-canal appele porine, elle est permable toutes les molcules de moins de
10 000 daltons. Elle contient galement des enzymes impliques dans la synthse des lipides
mitochondriaux
Lespace inter membranaire : Il contient plusieurs enzymes qui utilisent lATP
traversant la matrice pour phosphoryler dautres nuclotides.
V.8.2. Fonctions
La mitochondrie est le site des ractions d'oxydation de la respiration. Il en rsulte une
production d'nergie stocke sous forme d'ATP dans les cellules.
Elles constituent les centrales nergtiques de la cellule par leur production dATP,
directement au niveau des sites o cette molcule est fortement consomme. Les
mitochondries sont donc plus frquentes dans les cellules consommatrices dnergie
(Exemple : muscle cardiaque, tubules rnaux, spermatozodes).
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En 1939 Theodor Schwann dcrit les cellules animales comme semblables aux
cellules vgtales. Cest ainsi que naquit la cytologie avec la cell doctrine de Schleiden &
Schwann qui stipule que toutes les plantes et les tissus animaux sont des aggrgats de
cellules individuelles. Lorganisme humain compte environ 1018 cellules (= un trillion). La
cellule animale typique mesure 10 20m de diamtre (environ 5 fois plus petite que la plus
petite particule visible) En gnral, la taille dune cellule varie de 0,2m 100m.
La cytologie est la partie de la biologie qui tudie la structure et les fonctions de la
cellule. (= biologie cellulaire).
Les cellules sont de trs petite taille et dorganisation trs complexe. Ltude de leur
structure, de leur composition chimique et de leur fonctionnement (physiologie) a ncessit
la mise au point doutils et de techniques appropris qui ont t perfectionns au fur et
mesure des progrs scientifiques et technologiques raliss dans divers domaines. Pour
comprendre la biologie cellulaire, il est indispensable de se familiariser avec les mthodes et
les appareillages utiliss pour son tude.
Trois approches sont dveloppes pour tudier les divers aspects de la cellule :
- les techniques morphologiques.
- les techniques chimiques et biochimiques.
- les techniques physiologiques.
Ces techniques sont toutes bases sur lemploi de microscopes optiques et lectroniques.
I. LA MICROSCOPIE
La microscopie est un ensemble de techniques permettant d'obtenir une image des
structures biologiques. Principe : une onde est envoye sur la prparation ou mise par la
prparation. Cette onde est capte par un objectif qui la concentre et passe par un oculaire
qui cre une image observable. Cette image est soit observe l'il nu, soit photographie,
soit enregistre par camra CCD et stock sur ordinateur pour retraitement.
Aujourd'hui la microscopie est divise en deux grands groupes, diffrents par la
nature de la particule lmentaire implique : le microscope optique, aussi appel
photonique, parce qu'il utilise des photons et le microscope lectronique qui utilise des
lectrons pour tudier l'objet.
I.1. Caractristiques du microscope
Le microscope est caractris par :
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Lgende
1 : oculaire
2 : tube optique
3 : tourelle ou revolver
4 : objectif
5 : potence
6 : platine
7 : prparation
8 : diaphragme
9 : condenseur
10 : clairage, source lumineuse
11 : socle
12 : vis macromtrique
13 : vis micromtrique
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Rflexion : le microscope ne capte que les rayons rflchis par les parois de la prparation.
Ce type de microscopie donne une image de la surface des objets et non de leur structure
interne.
Lintensit tant fonction de lorientation des parois par rapport au systme optique, cela
donne une image en relief de lobjet. Elles ne sont donc pas applicables des objets sans
relief comme les coupes de tissus ! Elles ncessitent un clairage latral de lobjet. Ce
mode de microscopie est peu utilis, il correspond aux loupes binoculaires ou
stromicroscopes, au microscope fond noir en microscopie optique et au microscope
lectronique balayage (MEB) en microscopie lectronique.
I.4. Conditions dobservation en microscopie :
Pour effectuer une observation en microscopie deux exigences simposent : lpaisseur de
lchantillon et le contraste.
Lpaisseur de lchantillon : pour une observation par transmission lchantillon doit
prsenter une faible paisseur afin de permettre le passage du faisceau incident des photons
ou dlectrons do la ncessit de faire des coupes trs trs fines. Les coupes exiges en
(MO) varient entre 2 m 10 m et de 0,03m 0,05m
Le contraste : Lobservation par transmission nest possible que si certaines rgions de la
cupe absorbent les photons ou les lectrons plus que dautres (effet contraste). En rgle
gnrale, les constituants cellulaires prsentent des contrastes naturels faibles do
lutilisation de certains artifices tels que les montages optiques qui amplifient les contrastes
naturels comme le microscope contraste de phase ou des colorants vitaux slectifs (MO)
ou encore des sels de mtaux lourds comme les sels de plomb (ME).
I.5. Types de microscopes optiques :
Un certain nombre de microscopes ayant chacun des montages optiques spciaux ont
t mis au point pour permettre lobservation des cellules dans certaines conditions et
amliorer la qualit de celle ci. Le dveloppement de ces microscopes rpond
principalement 2 objectifs :
- augmenter les contrastes pour mieux visualiser les structures subcellulaires
- amliorer le pouvoir de rsolution (voir des dtails de plus en plus petits !)
Parmi ces microscopes, nous avons :
I.5.1. Les microscopes optiques, lumire ou photoniques
Il existe divers types de microscopes lumire :
- les microscopes par transmission ; ils permettent l'observation directe de structures
dont les dimensions sont de l'ordre de 0,2 m : ce sont les autres microscopes donnant des
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Tableau 3: Les marqueurs fluorescents les plus courants et leur lumire d'excitation.
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Mycobacterium
tuberculosis
Cellules
pithliales
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Tableau 4 : Comparaison entre le microscope optique et lectronique
Exemple de fixation
au glutaraldhyde
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Les ombrages mtalliques permettent daccentuer les reliefs dun objet en vaporisant sous
vide une trs fine couche mtallique avec un certain angle dincidence entranant la
formation dombre porte.
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Schma 17 : Cultures
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