TD 01

ENZYMOLOGIE APPROFONDIE
L3 BIOCHIMIE

Exercice 01
Complétez le tableau suivant
Réaction catalysée Description Exemple Spécificité Classe
d’action de
l’enzyme
(EC)

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Exercice 02 :
L’uréase est une enzyme qui joue un rôle important au sein des organismes vivants dans la décomposition
d’une molécule organique (l’urée). On trouve l’uréase dans des organismes végétaux (comme le haricot sabre)
mais également dans des bactéries pathogènes (telles que Helicobacter pylori). Pour étudier le rôle de l’uréase
et l’influence de certains paramètres physico-chimiques sur son activité enzymatique. Un ensemble des
expériences a été réalisé :

➢ On dissout de l’urée (NH2 – CO – NH2) dans de l’eau. Aucune réaction ne semble avoir lieu. Le temps
de demi-réaction est estimé à 60 ans.
➢ On dissout de l’urée dans de l’eau en présence d’uréase. Il se forme quasi-immédiatement les produits
attendus (l’ammoniac NH3 et le dioxyde de carbone). Le temps de demi-réaction est 210-5 s.

1. Donnez l’équation de la réaction chimique entre l’urée et l’eau.

2. A quelle classe appartient cette enzyme
3. Définissez les termes suivants : temps de demi-réaction, catalyseur
4. En quoi les résultats des expériences permettent-ils de considérer l’uréase comme un catalyseur ?
expliquez ?

La cinétique de la réaction catalysée et l’activité de l’enzyme dans certaines conditions de température et

de pH sont représentées dans les courbes ci-dessous :

Document 2. Influence du pH sur l’activité enzymatique
Activité relative (en pourcentage) de l’uréase en fonction
du pH
Document 1. Influence de la température sur l’activité
enzymatique
Activité relative (en pourcentage) de l’uréase en
fonction de la température

θ en °C
pH

2
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1. En utilisant les documents 1 et 2, expliquez l’influence de la température et le pH sur la cinétique de

la réaction catalysée.
2. Quelle est l’influence de la température et le pH sur la structure de l’uréase ?

La bactérie Helicobacter pylori (H.pylori) est responsable de la plupart des ulcères de l’estomac chez
l’Homme. On souhaite savoir comment elle réussit à survivre dans un milieu très acide, comme l’estomac,
en attendant de rejoindre la muqueuse stomacale où elle pourra se développer.

La bactérie utilise son uréase pour catalyser la réaction de dégradation de l’urée en présence d’eau, ainsi elle
sécrète de l’ammoniac dans son environnement proche. Dans l’estomac, l’ammoniac réagit avec les ions
H3O+ selon l’équation chimique :

NH3(aq) + H3O+(aq) NH4+(aq) + H2O(l).

1. Quelle est la conséquence de la sécrétion d’ammoniac par la bactérie sur le pH de la solution autour
d’elle ?
2. Le document 2 illustre le fait que l’uréase seule ne peut pas agir dans l’estomac. Alors comment
cette bactérie réussit à survivre dans ce milieu très acide ?

Exercice 03 :

1. Titrez et légendez la figure suivante.

2. Définissez la structure n°1
3. Décrivez la structure n°4.
4. Expliquez les différentes étapes de la réaction illustrée.