BACTERIOLOGY

 #RoadToRMT     MMY  (2015)  

  OXIDASE  (+)   OXIDASE  (-­‐)  
CATAL Neisseria         Alcaligenes   Staphylococcus   Haemophilus  segnis  
ASE  (+)   Moraxella   Oligella   Enterobacteriaceae   Bordetella  parapertussis  
Vibrio*   Flavobacterium   Vibrio  metschnikovii   Francisella  
Aeromonas   Haemophilus*   Stenotrophomonas   Bacteroides  
Plesiomonas   Brucella   maltophila   Propionibacterium  
Campylobacter   Bordetella   Acinetobacter  
Helicobacter   Pasteurella  
Pseudomonas   Legionella  
Burkholderia   Corynebacterium  
CATAL Neisseria  elongata   Staph  saccharolyticus  &   Capnocytophaga  
ASE  (-­‐)   Kingella   anaerobius   Bartonella  
Eikenella   Streptococcus   Clostridium  
Cardiobacterium   Streptobacillus  moniliformis   Lactobacillus  
  Gardnerella  
 
 
OXIDASE  (+)   OXIDASE  (-­‐)   CATALASE  (+)     CATALASE  (-­‐)  
Shewanella   Anaerobes   Bacillus   Kuthria   Actinobacillus  
Chromobacterium   Listeria   Rothia   Leuconostoc  
Chryseobacterium   Nocardia   Oerskovia   Treponema  
Micrococcus   Rhodococcus   Achromobacter   Borrelia  
(modified)   Gordonia   Mycobacterium   Arcanobacterium  
Tsukamurella   Leptospira   Erysipelothrix  
 
Obligate  Anaerobes   Facultative  anaerobes   Microaerophile   Capnophilic   Obligate  aerobe  
G+  bacilli   G  -­‐    bacilli   Staphylococcus   Campylobacter   Streptococcus   Neisseria,  Moraxella  
Clostridium   Campy  rectus  &   Streptococcus   Helicobacter   Neisseria   Pseudomonas  
Actinomyces   carvus   Enterobacteriaceae   Treponema   Helicobacter   Acinetobacter  
Propionibact   Bacteroides   Vibrio,  Aero,  Plesio   Borrelia   Haemophilus   Stenotrophomonas  
Bifidobacterium   Fusobacterium   Haemophilus     HACEK   Burkholderia  
Eubacterium   Leptotrichia   Bacillus   Brucella  abortus   Alcaligenes  
  Porphyromonas   Coryne   MTB   Brucella  
G+  cocci   Prevotella   Listeria   Bordetella  
Peptostrepto   Mobiluncus   Streptobacillus   Francisella  
Peptococcus     Mycoplasma   C.  jeikeium  &  urealyticum  
Ruminococcus   G  –  cocci   Lactobacillus   Nocardia  
Coprococcus   Veilonella     Spirillum  minus/minor  
S.  anaerobius  &   Megasphera   Leptospira  
saccharolyticus     Acidoaminococcus   MTB  
 
Beta-­‐hemolytic   Alpha   Non-­‐hemolytic   Double  zone   CAMP  
Staph  aureus,   C.  ulcerans   S.  pneumoniae     Coag  Neg  Staph   V.  parahemolyticus   Arrowhead/bowtie  
haemolyticus   Listeria     Viridans  strep   S.  bovis  (D)   (Kanagawa   –  Strep  B  (agalactiae)  
S.  pyogenes,   Arcanobacterium   (alpha  prime/   Neisseria   phenomenon-­‐ Block-­‐type–  Listeria  
agalactiae,  ABCGF   Rhodococcus   wide  zone)   Enterobacteriaceae   Wagatsuma  agar)   Reverse,  inverted  
E.  coli   C.  tetani  &   Alcaligenes   Plesiomonas   Clostridium   triangle  
Aeromonas   botulinum   Cardiobacterium   B.  anthracis   perfringens    –  Arcanobacterium  
Pseudomonas   Mycobacterium   hominis   C.  urealyticum   Reverse,  arrowhead  
Chromobacterium   haemophilum   Erysipelothrix   –  C.  perfringens  
H.  haemolyticus  &   C.  difficile   (+)  Rhodococcus  
parahaemolyticus  
B.  cereus  &  subtilis  
Coryne  (Mitis)  
   
   
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
MICROSCOPIC   Question  Mark,  hook  ends   Leptospira  
Bunch  of  grapes   Staphylococcus   Cording,  serpentine   Mycobacterium  tuberculosis  
Tetrads   Aerococcus   Rods  w/  cross-­‐barring   M.  marinum,  szulgai  
Diplococci  (in  pairs)   Strep  pneumonia   Cross-­‐banding,  Shepherds   M.  kansasii  
Neisseria  (Except  elongata  &   crook  
weaver  =  rods)   Cigar  packet,  picket  fence   M.  leprae  
Moraxella    
Oval/Lancet  shaped   Strep  pneumoniae    
Coffee/Kidney  bean   Neisseria     MOTILITY    
Capsulated   H.  influenza   Rapid  darting/  shooting  star   Vibrio  (monotrichous)  
Strep  pyogenes  (A)   Francisella,  Pasteurella   Darting   Campylobacter  
S.  agalactiae  (B)   B.  anthracis   Twitching   Kingella  
S.    pneumoniae   C.  perfringens   Bartonella  
Neisseria,  Moraxella   Bacteroides  fragilis   Tumbling  (end  over  end)   Listeria  
Klebsiella,  Enterobacter   C.  granulomatis   Gliding   Capnocytophaga  
Stacked  brick,  clumps   EAEC/DAEC   Mycoplasma  pneumoniae  
Slime  layer   Pseudomonas   Corkscrew  (axial  filaments)   Spirochetes  
Curved   Vibrio,  Campy,  Chromo   Spinning   Leptospira  
Bacteroides  ureolyticus   Non-­‐motile   B.  anthracis  &  mycoides  
S-­‐shaped,  spiral   Campy,  Helicobacter     Corynebacterium  
Lactobacillus   Staph,  Strep   Erysipelothrix  
Seagull  wing   Campy,  Eubacterium   Neisseria,  Moraxella   Gordonia  
Faint/Pale  staining   Campy,  Bacteroides   Klebsiella,  Shigella,  Yersinia   C.  perfringens,  ramosum,  
Incomplete  stain,  beaded,   Mycobacterium   Salmonella  pullorum  &   innosum  
clump,  Gram  neutral/ghost   gallinarum   Lactobacillus  
Bipolar  staining  (safety  pin)   Yersinia  pestis   Burkholderia    mallei   Bacteroides  
Burk  pseudomallei   Acinetobacter   Strepto  moniliformis  
Bordetella  pertussis   Oligella  urethralis   C.  granulomatis  
Francisella  tularensis   Chryseobacterium   Gardnerella  
Pasteurella  multocida   Haemophilus   Lactobacillus  
Bacteroides  fragilis   Francisella   Rickettsia  
Calym  granulomatis   Brucella,  Bordetella  (except   Chlamydia  
Fingerprints,  railroad  tracks,   H.  ducreyi   bronchiseptica)   Mycobacteria  
school  of  fish    
Dots  &  dashes,  Morse  code   Agg.actinomycetemcomitans    
Teardrop   Cardiobacterium  hominis   ODOR    
Squared  ends   Kingella,  Bacillus   Burnt  chocolate/gun  powder   Proteus  
Sand   Brucella   Sweet  honeysuckle/   Streptococcus  anginosus  
Spores,  boxcar  shaped   Bacillus,  Clostridium   butterscotch  
Bamboo  fishing  rod,  string  of   Bacillus  anthracis   Fruity  grape-­‐like/corn  tortilla   Pseudomonas  aeruginosa  
pearl   Fruity  apple/strawberries   Alcaligenes  faecalis  
Club,  Chinese  letters   Corynebacterium   Ammonia   Stenotropho.  maltophila  
X,  V,  Y,  L  formation   Coryne,  MTB   Ammonium  cyanide   Chromobacterium  
Palisade   Coryne,  Propionibacterium   Earthy/dirt-­‐like  odor   B.  cepacia,  B.  pseudomallei  
Branching,  filamentous   Nocardia  asteroides      
Actinomyces   Mousy   Haemophilus,  Pasteurella  
Capnocytophaga   Bleach-­‐like   Haemophilus  ,  Eikenella,  
M.  xenopi,  fortuitum   Coryne  (Mitis)  
Zigzag   Rhodococcus  equi   Musty,  mushroom   Pasteurella  
Drumstick,  lollipop,  tennis   Clostridium    tetani   Musty  basement   Streptomyces  
racket   Musty  pungent,  potato-­‐like   Serratia  odorifera  
Pointed,  bifurcated,  forked,   Bifidobacterium   Horse  stable/  barnyard   C.  difficile  
dog  bones   Foul   anaerobes  
Spindle   Capno,  Fusobacterium   Fishy  amine   Gardnerella  vaginalis  
Necklace,  string  of  beads   Strepto.    moniliformis   (Whiff/Sniff  test:  10%  KOH)  
Mulberry/Morula   Ehrlichia    
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
COLONY   Mercury  drops/  pearl  like   Bordetella  
Creamy,  buttery  gold   Staphylococcus  aureus   Ground-­‐glass/  Cut  glass   Legionella  pneumophila  
Mauve-­‐colored   MRSA   B.  subtilis,  C.  difficile  
Pinhead,  white   Staphylococcus   Sticky   Legionella  
Pinpoint   Streptococcus   Irreg    swirling  projections   B.  anthracis  
Depressed  center,  coin  with   Streptococcus  pneumoniae   Beaten  egg  white,  Comet  
a  raised  rim,  dimple,  donut   tail,  inverted  pine  tree,  
Mucoid   With  capsule/  slime  layer   curly  lock  
Hockey  puck,  Wagon  wheel   Moraxella  catarrhalis   Medusa  head   B.  anthracis,  Kuthria  
(elevated  center,  thinner   Clostridium  septicum  
wavelike  periphery)   Feathery,  spreading,   B.  cereus  
Green  metallic  sheen  (EMB)   Escherichia  coli   frosted  glass  
Fish  eye  (EMB)   Enterobacter  aerogenes   Moist,  blister   B.  pumilus  
Swarming   Proteus   Black   Coryne,  S.  aureus  (Tellurite)  
Clostridium  septicum  &  tetani   Brown  halo  (Tinsdale)   Corynebacterium  
Stalactite  (broth)   Yersinia  pestis   Daisy  head   Coryne  (Gravis)  
Iridescent  w/  greenish  hue   Vibrio   Fried  egg   Coryne  (Mitis)  
Apron-­‐like   Aeromonas  ,  Plesiomonas   Streptobacillus  moniliformis  
Bull’s  eye   Aeromonas,  Y.  enterocolitica   Mycoplasma  
Tailing,  runny  spreading   Campy,  Capno   Mulberry   Mycoplasma  
Wrinkled,  dry   P.  stutzeri,  B.  pseudomallei   Black  opaque  dot   Arcanobacterium  
Nocardia,  M.  smegmatis,   Umbrella   Listeria  monocytogenes  
Neisseria  sicca   inverted  Xmas  tree  
Feather-­‐edge   Alcaligenes   Test  tube  brush   Erysipelothrix  rhusiopathiae  
Spreading,  flat,  serrated     Pseudomonas   pipe  cleaner  
Bluish  green/red/brown   Pseudomonas   Chalky  white   Nocardia,  Streptomyces  
Purple,  gummy   Acinetobacter   Velvety,  waxy,  bumpy   Nocardia  
Lavender  green,  lght  purple   Stenotroph.  maltophila   Breadcrumbs   Nocardia,  Neisseria  sicca  
Yellow     N.  flavescens,flava,subflava   Fusobacterium  nucleatum  
Escherichia  hermanii   Streptobacillus  moniliformis  
Cronobacter  sakazakii   Fluff  balls   Streptobacillus  moniliformis  
B.  cepacia,  Agg.  Aprophilus,   Coral-­‐like,  slimy   Rhodococcus  equi  
Flavo/Chryseobacterium   Slimy,  glossy,  irreg  edges   Gordonia  
Eikenella,  Capnocytophaga   Rhizoid   Tsukamurella,  Kuthria  
Green   P.  fluorescens/putida   C.  septicum  
Fusobacterium  nucleatum   Waxy,  cerebriform   Actinomadura  
Buff     P.  stutzeri,  MTB   Molar  tooth   Actinomadura,  Actinomyces  
Pink   Klebsiella,  Enterobacter   Spiderlike,  wooly   Actinomyces  
B.  pseudomallei   Stormy  milk  fermentation     Clostridium  perfringens  
Rhodococcus  equi   Fluoresce  chartreuse   C.  difficile,  Fusobacterium,  
Red  (prodigiosin)   Serratia  marscesens,   Eubacterium  
plymuthica,  rubidea   Fluoresce  red   Porpyromonas,  Prevotella,  
Violet  (violacein)   Chromobacterium  violaceum   Veilonella,  Clost  ramosum  
Pitting/corrode   Moraxella  lacunata   Raspberry  like   Leptotrichia  
Cardiobacterium  hominis   Adherent   Capnocytophaga  
Eikenella  corrodens   Neisseria  sicca,  mucosa  
Arcanobacterium   Cauliflower   Mycobacterium  tuberculosis  
Bacteroides  ureolyticus   Yersinia  pestis  
Satellitism   H.  influenza  (S.  aureus)   Wrinkled,  deep  blue   M.  marinum  
NVS  (E.  coli,  Klebsiella,   Dark  red  (B  carotene),   M.  kansasii  
Enterobacter,  yeasts)   Waxy  edges  
Dew  drop   H.  influenzae   Dark/dense  center   M.  kansasii,  scrofulaceum,  
Clumpy   H.  ducreyi   xenopi,malmoense,smegmatis  
Star-­‐shaped   Aggregatibacter/Actinobacillus   Bird’s  nest,  sticklike,   M.  xenopi  
actinomycetemcomitans   Filamentous,  Branching  
Rosette,  sticklike   Cardiobacterium  hominis  
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
 
DISEASE/  COMMON  NAMES/  other  notes  
Staphylococcus  aureus  –  most  virulent  sp.   #1  food  poisoning  (noodles)  Enterotoxin  A,  B  D  
-­‐ Coagulase,  Lipase,  Staphylokinase,DNase,gelatinase   #1:  burns,  osteomyelitis,  nosocomial  infxn  
-­‐ Hyaluronidase/Spreading  Factor/  DURAN  REYNAL   SSS  Scalded  Skin  Syndrome,  Ritter’s  dx  –  exfoliatin/epidermolytic    
-­‐ PVL  Panton  Valentine  Leukocidin   TSS  Toxic  Shock  Syndrome  –  enterotoxin  F/  TSST-­‐1/  pyogenic  toxin  
-­‐ Hemolysin  (Beta  –  hot  cold,  sphingomyelinase  C)   Folliculitis,  Furuncles,  Carbncles,  Bullous  Impetigo,  Cellulitis  
-­‐ Protein  A   Bacteremia,  sepsis,  UTI,  endocarditis,  septic  arthritis  (children)  
Staphylococccus  epidermidis  –  slime  layer   Contaminant:  Prosthetic  heart  valves,  catheters,  CSF  shunts,  etc  
nd
Staphylococcus  saprophyticus   UTI  (sexually  active  females)  –  2  most  common  
Staphylococcus  lugdunensis   More  aggressive/virulent,  catheter-­‐rel  bacteremia  &  endocarditis  
(A)  Streptococcus  pyogenes   Pyogenic  (fever  producing),  Flesh  eating  bacteria  syndrome  
 -­‐  M  protein,  Protein  F,  Streptoknase,  Pyrogenic(Spes)  toxins   #1  Pharyngitis,  tonsillitis,  Strep  throat  
Streptolysin  O   Streptolysin  S   Scarlet  fever/Scarlatina  –  diffuse  red  rash,  strawberry  tongue  
Oxygen  labile  (anaerobic)   Oxygen  stable  (aerobic)   Erysipelas,  Pyoderma  (Galloping  gangrene,  Necrotizing  fasciitis)  
Highly  antigenic   Non-­‐antigenic   Cellulitis,  impetigo,  burn,  wound  infxn,  streptococcal  TSS  
Subsurface  hemolysis   Surface  hemolysis   RF,  RHD,  AGN  (Bright’s  dx)  
(B)  Streptococcus  agalactiae   #1  neonatal  meningitis  
Viridans  streptococci  (S.  mutans  –  most  common)   #1  oral/mouth  flora  (opportunistic),  SBE  (most  common)  
Gingivitis,  dental  plaques/caries,  meningitis,osteomyelitis,empyema  
(D)  S.  bovis/S.  equinus   GI/colon  cancer/carcinoma  
Streptococcus  pneumoniae   Diplococcus/Pneumococcus  
Lobar  pneumonia  (most  common  in  elderly;  rust  tinged  sputum)  
#1  bacterial  meningitis  (adults),  #1  otitis  media  
Abiotrophia  &  Granulicatella   NVS  Nutritionally  Variant  Streptococci  –  pyridoxal  (Vit  B6),  thiol  dep.  
Neisseria  gonorrheae  –  “flow  of  seed”  “brothel”   Gonococci,  Clap  agent  
-­‐ needs  iron;  w/  pili,  IgA  protease,  por  B   #2  STD,  PID;  Purulent  urethritis/cervicitis  -­‐  sterility,  perihepatitis  
-­‐ T1  &  T2  =  virulent;  T3  to  T5=  avirulent   (Fitz-­‐Hugh-­‐Curtis  syndrome);  rectal  gono,  salphingitis,  epididymitis  
-­‐ Auxotypes:  AHU  arginine,  hypoxanthine,  uracil   Ophthalmia  neonatorum,  pharyngitis,  purulent  arthrit  is  
Neisseria  meningitides  –  por  B   Meningococcal  meningitis,  meningococcemia,  Epidemic  meningitis  
  Cerebrospinal  fever,  Spotted  fever  
*Neisseria  sp.  sensitive  to:  SPS,  cotton  swab,  cold   Waterhouse  Friderichsen  syndrome  (hemorrhage  in  adrenals)  
Moraxella/Branhamella  catarrhalis  –  most  common  sp.   #3  otitis  media,  sinusitis  (children)  
Escherichia  coli  –  45-­‐50C   Colon  bacillus,  #1  UTI,  #2  neonatal  meningitis  
EPEC  –  Pathogenic  (O55,  111,  114)   Infantile  diarrhea  (w/out  blood),  pathogenicity  island  
ETEC  –  Toxigenic  (O6  ,8,  25,  27,  63)   Traveler’s  diarrhea/  Montezuma’s  revenge,  watery  diarrhea  
-­‐  Achlorydia  @  risk;  heat  stable  &  heat  labile  (cholera-­‐like)  toxins  
EIEC  –  Invasive  (O124,  143,  164)   Dysentery/Shigella-­‐like,  watery  diarrhea  (w/  WBC)  -­‐  invasin  
EHEC/STEC/VTEC  –  Hemorrhagic,  Verotoxin,  Shiga-­‐like  Toxin   Hemorrhagic  colitis,  HUS  Hemolytic  Uremic  Syndrome  
(O157:H7)   TTP  Thrombotic  Thrombocytopenic  Purpura,  Bloody  diarrhea  
EAEC/DAEC  -­‐  Aggregative/Diffusely  Adherent   Watery  diarrhea,  UTI  –  aggregative  adhesion  fimbriae  
UPEC  -­‐  Uropathogenic   #1  UTI    -­‐  pili,  type  1  fimbria  
Klebsiella  pneumoniae   Friedlander’s  bacillus,  Bacillus  mucosus  capsulatus  
CAP  Community-­‐acquired  pneumonia  (currant  jelly-­‐like  sputum)  
Klebsiella  pneumonia  subsp.  ozanae   Chronic  atrophic  rhinitis  (foul  smelling)  
Klebsiella  pneumonia  subsp.  rhinoscleromatis   Frisch  bacillus,  Granuloma  of  the  nose  &  oropharynx  
Enterobacter  aerogenes   Aerobacter  
Enterobacter  cancerogenous/taylorae   osteomyelitis  
Cronobacter/Enterobacter  sakazakii   Meningitis,  bacteremia    -­‐  powdered  infant  formula  
Pantoea  agglomerans  “triple  negative”  LOA  -­‐  -­‐  -­‐     Nosocomial,  sepsis  –  contaminated  IV  fluids  
Serratia  marscesens  –  1-­‐5C   Nosocomial  outbreaks  in  nurseries,  cardiac  surgery  &  burn  units  
Contaminant  in  antiseptic  soln’s,  epidemic  of  septic  arthritis  
Serratia  plymuthica   Osteomyelitis  in  motorcycle  accidents  
Proteus  vulgaris  (OX2,  OX19),  mirabilis  (OXK)   #1  UTI,  renal  stone/calculi  fromation  (ammonium  bicarbonate)  
Providencia  rettgeri,  stuartii,  alcalifaciens   UTI,  diarrheal  dx  among  traveles,  nosocomial  outbreaks  in  burn  units  
Citrobacter  freundii   Diarrhea,  UTI,  pneumonia,  endocarditis  in  IV  drug  users  
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
Citrobacter  koseri/diversus   Nursery  outbreaks  of  neonatal  meningitis,  brain  abscesses  
Hafnia  alvei   Beer  wort  of  breweries  
Erwinia   Plant  pathogen,  in  sol,  vegetation  
Salmonella  Typhi   Eberthella  typhosa,  Eberth’s  bacillus  
Typhoid  fever,  Enteric  Fever  –  rose  spots,  frontal  dull  headache  
*complications:gall  bladder(necrotizing  cholecystitis),Peyer’s  patches  
Salmonella  Paratyphi  A,  B   Paratyphoid  Fever  (milder)  
Salmonella  Paratyphi  C,  Choleraesus   Hog  Cholera  bacillus,  Septicemia  
Salmonella  enteritidis   Gartner’s  bacillus,  Gastroenteritis/food  poisoning  (poultry)  #1  Phils  
Salmonella  Typhimurium   Peanut  butter  outbreak  
(A)  Shigella  dysenteriae  –  most  virulent   Shiga  bacillus  
Bacillary  dysentery  –  acute  inflammatory  colitis,  bloody  diarrhea  
Rectal  prolapse,  tenesmus  (painful  bowel  movement)  
(B)  Shigella  flexneri   Strong/Flexner/Hiss/Russel/Stanley  bacillus;  Gay  bowel  syndrome  
(C)  Shigella  boydii   Boyd’s/Newcastle-­‐Manchester  bacillus  
(D)  Shigella  sonnei  –  only  LLF  (ONPG+)   Sonne-­‐Duval’s  bacillus  
Yersinia  pestis  –25-­‐30C;    w/  flea  vector   Safety  pin  bacillus  
th
Plague  bacillus,  Bubonic  plague  (Black  death,  6  century  pandemic)  
Yersinia  enterocolitica  –  4C;  motile  @  22C   Enterocolitis,  waterborne  gastroenteritis,  appendicitis,  arthritis,  
erythema  nodosum,  contaminated  packed  RBCs  
Yersinia  pseudotuberculosis  –  motile  @  18-­‐25C   Mesenteric  lymphadenitis,  septicemia  
Vibrio  cholerae  (O1:  Inaba,  Ogawa,  Hikojima)   Comma/Curved  bacillus,  Cholera  (asiatic/epidemic)–  rice  watery  
-­‐ salt  water,  alkalinophilic   stool,  Dehydration    -­‐  washerwoman’s  hands,  sunken  eyes  
Vibrio  parahemolyticus  -­‐  halophlic   Summer  diarrhea  (#1  in  Japan)  
nd
-­‐ 2  most  common  Vibrio  sp.  in  gastroenteritis   Seafood  poisoning  
Plesiomonas  shigelloides  “triple  positive”  LOA  +++   Cold-­‐blooded  animal  exposure  
-­‐ fresh  water  –  warmer  climates)   Gastroenteritis  
Aeromonas  hydrophila   Red  leg  disease  (frogs)  
-­‐ fresh  water   Traveler’s  diarrhea  (also  ETEC),  HUS  (also  EHEC/STEC)  
Campylobacter  jejuni  &  Chlamydia  pneumoniae   Guillain  Barre  syndrome  
Campylobacter  jejuni  –  grows  at  42C   #1  gastroenteritis  (poultry)  –  invades  small  intestine  
Septic  arthritis  (AIDS)  
Campylobacter  fetus  –  most  frequently  from  blood  culture   Sterility  &  abortion  (zoonotic  –  cattle  &  swine)  
Helicobacter  pylori  –  Urease  +   Peptic  ulcer,  Type  B  gastritis,  gastric  carcinoma  (invades  stomach)  
Pseudomonas    aeruginosa  -­‐    42C   Water  bug  organism,  #1  NFO  (non-­‐fermentative);  #1  opportunistic  
–  pyocyanin,  pyoverdin,  pyorubin,  pyomelanin   Blue  pus,  #1  cystic  fibrosis,  Ecthyma  gangrenosum  (wound  infxn),  
(+)  gluconate,  ADH,  acetamide,  citrate,  cetrimide   Swimmer’s  ear  (otitis  extedna),  Hot  tub/Jacuzzi  syndrome  
(-­‐)  LDC   (necrotizing  skin  rash),  Shanghai  fever,  pneumonia,  meningitis  
#2:  burn  px,  endocarditis,  UTI,  contact  lens  infxn  
Acinetobacter  baumanii/lwoffi/hemolyticus   #2  NFO,  UTI,  wound  infxn,  diarrhea  
Stenotrophomonas  maltophila  –  maltose  loving   #3  NFO,  “pseudoinfections”  (contaminated  tubes)  
Burkholderia  cepacia   #2  cystic  fibrosis,  onion  bulb/foot  rot,  pneumonia,  sepsis  
Burkholderia  mallei   Glander’s,  Farcy  (horses,  donkeys)  
Burkholderia  pseudomallei   Meloidosis  (glander’s  like),  Vietnamese  Time  Bomb,  Whitmore’s  dx  
Moraxella  lacunata   Morax-­‐Axemfeld  bacillus;  Blemphano/Angular  conjunctivitis  
Chryseobacterium  meningosepticum   In  nebulizers,  neonatal  meningitis,  sepsis  
Haemophilus  influenzae  “blood  lover”  X  (hemin)  &  V  (NAD)   Pfeiffer’s  bacillus,  #2  otitis  media,  #3  meningitis  in  children  
 acute  epiglottitis,  cystic  fibrosis,  sepsis,  cellulitis  (reddish  blue)  
Haemophilus  ducreyi  –  33C,  X  only   Ducrey’s  bacillus,  Chancroid/  soft  chancre  (STD),  buboes  
Haemophilus  aegypticus   Koch-­‐Weeks  bacillus,  Pinkeye  conjunctivitis,  Brazilian  Purpuric  Fever  
HACEK   SBE  subacute  bacterial  endocarditis  
Aggregatibacter  aphrophilus  “foam  loving”  -­‐    most  prevalent  
Cardiobacterium  hominis  –  affects  aortic  valve  more  freq.  
Eikenella  corrodens  –  least  common  HACEK  in  SBE   Corroding  bacilli,  human  bites/clenched  fist  wounds  
Kingella  kingae  (most  pathogenic),  oralis,  denitrificans   osteoarthritis  
Brucella  abortus,  melitensis,  canis,  suis   Bang’s  bacillus,  Spontaneous  abortion  (zoonotic)  
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
Malta/Crimean/Mediterranean/Gibraltar/Cyprus/Undulant  fever  
Bordetella  pertussis  –  needs  cysteine,  methionine   Bordet-­‐Gengou  bacillus,  Whooping  cough/  100-­‐day  cough  
Bordetella  bronchiseptica   Kennel-­‐Cough  
Francisella  tularensis  –  most  impt  bact;    needs  iron,  cysteine   Tularemia,  Deerfly/Rabbit/Lemming/Glandular  Fever,  Water  Rat  
trapper’s  dx,  Market  men’s  dx,  Ohara,  
Pasteurella  multocida-­‐    most  frequently  isolated   Shipping  Fever  (zoonotic)  
Legionella  pneumophila  –  most  common;  need  cysteine,iron   Legionnaire’s  dx  (Broad  Street  Pneumonia)  
-­‐ air  conditioning  ducts,  water  cooling  system   Pontiac  Fever,    wound  abscess,  encephalitis  
Legionella  micdadei   Pittsburg  pneumonia  
Legionella  bozemanii   Wiga  
Bacillus  anthracis  -­‐    largest   Anthrax:  Pulmonary  (Woolsorter’s/Ragpicker’s  dx),  
Cutaneous  (black  eschar),  Gastrointestinal  
Bacillus  cereus  -­‐    45C,  most  common  sp.   Fried  Rice  bacillus,  food  poisoning/gastroenteritis  (diarrheal,  emetic)  
Bacillus  subtilis  –  common  lab  contaminant,  central  spore   Hay  bacillus  
-­‐ source  of  Bacitracin  antibiotic,  QC  for  oven  
Corynebacterium  diptheriae  –  most  pathogenic   Kleb-­‐Loeffler’s  bacillus,  Pseudomembranous  (bull  neck  appearance  
-­‐ Babes  Ernst  metachromatic  granules   –  respiratory  obstruction),  Velat  sore/Barcoo  rot  (cutaneous)  
Corynebacterium  ulcerans   Mastitis  (cattles),  diphtheria-­‐like  sore  throat  
Corynebacterium  pseudotuberculosis  –  dermonecrotic  toxin   Granulomatous  lymphadenitis  
Corynebacterium  pseudodiphtheriticum   Hoffman’s  bacillus,  Respiratory  infxn,  UTI,  wound  infxn  in  AIDS  px  
Corynebacterium  jeikeium    -­‐lipophilic   Diphtheroid  prosthetic  valve  endocarditis,  HIV  px  
Corynebacterium  urealyticum  -­‐  lipophilic   Urinary  pathogen  
Corynebacterium  xerosis   conjunctivitis  
Corynebacterium  minutissimum   Erythrasma  
-­‐ Coral  red  fluorescens  (Wood’s  lamp)  =  porphyrin  
Arcanobacterium  haemolyticum   Pharyngitis,  pruritic  scarlatiniform  rash,  desquamation  of  skin  of  
hands  and  feet  
Listeria  monocytogenes  –  4C   Granulomatous  infantiseptica,  spontaneous  abortion,  stillbirth  
-­‐ Ingestion  of  coleslaw,  soft  cheeses   Neonatal  meningitis  
Erysipelothrix  rhusiopathiae   Red  dx,  Erysipeloid  (purplish  red  lesion),  Butcher’s  cut  
Rhodococcus  equi  -­‐  coccobacilli   Pink  bacteria,  granulomatous  pneumonia  (HIV)  
Tropheryma  whippelii   Whipple’s  dx  
Clostridium  perfringens/welchii  –  most  common  isolate   Bacillus  aerogenes  capsulatus,  Welch’s  bacillus  
Gas  gangrene/Myonecrosis/eating  sore  (bullae)  
Food  poisoning,  Enteriris  necrotans/  Pig  bel  
Clostridium  tetani  –  terminal  oval  spore;  tetanospasmin   Tackhead  bacillus,  spastic  paralysis,  risus  sardonicus  (distorted  grin),  
trismus  (lockjaw),  opisthotonus  (arched  back)  Tetanus  neonatorum  
Clostridium  botulinum  –  subterminal   Canned  good  bacillus,  flaccid  paralysis,  Wound  botulism  (Wounds)  
-­‐ Botulism  -­‐  most  potent  toxin  (treat   Foodborne  botulism  –  preformed  toxin  
strabismus/wandering  eye,  botox)   Infant  botulism  (Honey  bees,  Floppy  baby)  –  ingest  organism  
Clostridium  difficile   Pseudomembranous  colitis,  antibiotic  assoc.  diarrhea  (Clindamycin)  
Actinomyces  israelii  –  sulfur  granules   Lumpy  jaw  
Lactobacillus  acidophilus   Boas-­‐Oppler  bacillus  (stomach)  
Dorderlein  bacillus  (vagina),  promote  Candida  albicans  (acidic)  
Fusobacterium  necrophorum   Lemierre’s  dx,  Vincent’s  angina  (if  with  Borrelia  vincenti)  
Streptobacillus  moniliformis   Haverhill  fever  (ingestion)  
Streptobacillus  moniliformis  &  Spirillum  minus/minor   Rat  bite  fever  
Spirillum  minus/minor   Sodoku  fever  
Calymmatobacterium  granulomatis  –  Donovan  bodies   Granuloma  inguinale,  Donovanosis  
Gardnerella  vaginalis   Bacterial  vaginosis,  malodorous  discharge,  clue  cells  
Rickettsia  conorii  -­‐  tick   Fievre  Boutonneuse/  Mediterranean/  Israeli  spotted  fever  
South  African/Kenya/Indian  tick  fever/typhus  
Rickettsia  ricketsii  –  tick   Rocky  Mountain  Spotted  Fever  
Rickettsia  sibrica  -­‐tick   Siberian/North  Asian  tick  typhus  
Rickettsia  africae  -­‐  tick   African  tick  bite  fever  
Rickettsia  japonica-­‐tick   Japan  spotted  fever  
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
Rickettsia  honei  –  tick   Flinders  island  spotted  fever  
Rickettsia  slovaca  -­‐  tick   Tick-­‐borne  lymphadenopathy  
Rickettsia  akari  –  Gamasid  mite   Rickettsial  pox  
Rickettsia  felis  -­‐  flea   Flea-­‐borne  spotted  fever  
Rickettsia  prowazekii  -­‐  louse   Epidemic  typhus,  Brill-­‐Zinsser,  Recrudescent,  Flying  squirrel  typhus  
Rickettsia  typhi  –  rat  flea   Endemic  murine  typhus  
Rickettsia  australis  -­‐  tick   Queensland  tick  typhus  
Orientia  tsutsugamushi  –  Chigger  mite   Scrub  typhus  
Ehrlichia  chaffeensis  –  lone  star  tick   Human  Monocytic  Ehrlichiosis  HME  
Ehrlichia  ewingii  –  tick   Neutrophilic  
Ehrlichia  equi  -­‐  tick   Granulocytic  
Ehrlichia/Neorickettsia  sennetsu   Sennetsu  fever  
Anaplasma  phagocytophila  –  deer  tick   Human  Granulocytic  Anaplasmosis  HGA  
Coxiella  burnetti   Q/Query  fever  
Bartonella  (Rochalimea)  quintana   Trench  fever  
Bartonella  henselae  &  (clarridgeiea  –  cat  scratch  dx  only)     Cat  scratch  dx,  bacillary  angiomatosis,  peliosis,  endocarditis  
Bartonella  elizabetheae   Infectious  endocarditis  
Bartonella  bacilliformis  -­‐  sandfly   Carrion’s  dx:  Oroya  fever,  verruca  peruana  
Chlamydia  trachomatis   #1  NGU  non-­‐gonococcal  urethritis,  PID,  infertility,  #1  STD  (USA)  
-­‐ Halbertstadler-­‐Prowazek  inclusions   TRIC  trachoma  inclusion  conjunctivitis,  blindness  
Lymphogranuloma  venereum  LGV  (buboes)  
Reiter’s  syndrome  (Arthritis)  
Chlamydophila  psittaci  –  Levinthal-­‐Cole-­‐Lillie  inclusions   Parrot  fever  
rd
Chlamydophila  pneumonia   TWAR  –  Taiwan  Acute  Respiratory,  3  infxs  respi  dx,  Guillain  Barre  
Mycoplasma  pneumonia-­‐  require  sterols,  need  glucose   Eaton  agt,  PAP  primary  atypical  pneumonia,  Walking  pneumonia  
Mycoplasma  hominis-­‐  need  arginine   STD,  Post  abortal  &  postpartum  fever  
Ureaplasma  urealyticum  –  need  urea;  “T  strain”   NGU  
Treponema  pallidum   Syphilis,  French/Italian  dx,  Greta  pox,  Great  imitator,  oldest  STD  
-­‐ Herxheimer  reaction  –  post  treatment   1-­‐ Hunterian/hard  chancre  
  2-­‐ Condyloma  acuminatum,  rashes  
3-­‐ Gummas,  neurosyphylis  
Treponema  pallidum  subsp.  pertenue   Yaws/Frambesia  tropica/Framboise/Pian/parangi/paru/buba  
Treponema  pallidum  subsp.endemicum   Endemic  syphilis/Bejel  
Treponema  carateum.   Pinta/carate/  mal  de  pinto/  azul  
Treponema  denticola  &  socranski    Ulcerative  gingivitis,  chronic  periodontitis  
Borrelia  recurrentis   Epidemic/European  relapsing  fever  
Borreliahermsi/turicatae/dutoni/parkeri   Endemic/American  relapsing  fever  
Borrelia  burgdorferi   Lyme  dx/Great  imitator:  erythema  chronicum  migrans  
Bannworth  syndrome  (nerve  palsy),  chronic  arthritis  
Leptospira  interrogans  (canicola  –  dog  urine)   Weil’s  dx,  infectious  Jaundice  
Leptospira  interrogans  autumnalis   Fort  Bragg  Fever  –  pretibial  rash  
Mycobacterium  tuberculosis  –  most  common  sp.   Koch’s  bacillus,  Pumonary  Tuberculosis  (consumption)  –  cheeselike  
-­‐ Much  granules   caseous  lesion,  Ghon  complexes  (calcified),  granuloma  
Pott’s  dx  (tuberculosis  spondylitis,  skeletal  TB  of  the  spine)  
Miliary  tuberculosis  (extrapulmonary,  hematogenous  spread)  
Mycobacterium  bovis   Bacillus-­‐Calmette-­‐Guerin/BCG  vaccine  (attenuated  strain)  
Intestinal  TB,  TB  in  cattle,  dogs  cats,  swine,  parrots,  humans,  frm  milk  
MDR-­‐TB   R  to  Isoniazid  &  Rifampin  
nd
XDR-­‐TB   R  to  isoniazid,  Rifampin,  &  Fluoroquinolone  +  1  of  3  injectable  2 -­‐
line  drugs:  Aminoglycosides,  Amikacin,  Kanamycin/Capreomycin)  
(Grp  I)  Mycobacterium  marinum  –  28-­‐32C   Swimming  pool  granuloma  (blue-­‐red  subQ  nodule)  
(I)  Mycobacterium  kansasii   Yellow  bacillus,  NTM  lung  dx  (chronic  cavitary  pulmonary  lesions)  -­‐  
nd
2  to  M.  avium  complex  
(II)  Mycobacterium  scrofulaceum   Scrofula,  Cervical  lymphadenitis  
(II)  Mycobacterium  gordonae/aquae  –  22-­‐37C   Tap  Water  bacillus  
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
(II)  Mycobacterium  xenopi  –  42C   From  hot  &  cold  water  taps  
(III)  M.  avium-­‐intracellulare  –  most  common  NTM   Battey  bacillus,  Lady  Windermere  syndrome,    common  in  AIDS  
(III)  Mycobacterium  avium  subsp.    silvaticum   Wood  pigeon  bacillus  
(III)  Mycobacterium  avium  subsp.  paratuberculosis   Johne’s  dx  (inflammatory  bowel  dx),  Crohn’s  dx  
(III)  Mycobacterium  malmoense  –  22C   Cervical  lymphadenitis  
rd
(III)  Mycobacterium  ulcerans  -­‐  30-­‐33C  –  3  most  common  sp.   Buruli  ulcer  (painless  nodule)  
(III)  Mycobacterium  gastri   J  bacillus  
(III)  Mycobacterium  terrae  (smooth)   Radish  bacillus   Arthritis  
(III)  Mycobacterium  triviale  (rough,  dry)   V  bacillus   osteomyelitis  
(IV)  Mycobacterium  fortuitum  –  most  common  rapid   Localized  cutaneous  infxn  
(IV)  Mycobacterium  chelonae   Disseminated  cutaneous  infxn  
(IV)  Mycobacterium  abscessus   chronic  lung  dx,  otitis  media  
(IV)  Mycobacterium  smegmatis   Uncircumcised  males,  confused  w/  MTB  in  urine  (use  Pappenheim’s)  
Mycobacterium  leprae   Hansen’s;  Leprosy    (scaly,  scaby,  rough,  hypopigment,  nodules)  
Tuberculoid  Leprosy  (neural)  –  localized  
Lepromatous  Leprosy  (progressive)  –  disseminated  –  Leonine  face  
 
RLF   LLF  (ONPG+)   NLF   Gelatin  +   Malonate  +   KCN  +   Urease  +  
 E.  coli   C.  freundii   Proteus   Serratia   Enterobacter   Proteus   Proteus  
Enterobacter   S.  arizonae   Povidencia   Proteus   Klebsiella   Providencia   Providencia  rettgeri  
Klebsiella   Shigella  sonnei   Morganella   Citrobacter   Morganella   Citrobacter  
Serratia   Edwardsiella   Salmonella   Citrobacter   Klebsiella  
Hafnia   Erwinia   Hafnia   Klebsiella   Yersinia  enterocolitica,  
Salmonella   Enterobacter   pseuotuberculosis  
Shigella   Serratia    
Yersinia   Hafnia  
C.  koseri    
Pantoea  
 
I   M   V   C     L   O   A    
+   +   -­‐   -­‐   Escherichia  coli   +   +   +   Plesiomonas  
Edwardsiella   Salmonella  enteritidis  
Morganella  morganii   +   +   -­‐   Vibrio,  E.coli  
Plesiomonas   Enterobacter  aerogenes,  gergoviae  
Shigella  flexneri,  boydii   Edwardsiella  
+   +   -­‐   +   Proteus  vulgaris   Serratia  marcescens  
Providencia  rettgeri   Harfnia  
Citrobacter  koseri/diversus   +   -­‐   +   Aeromonas  
Arizona  sp.   -­‐   +   +   Enterobacter  cloacae,  taylorae  
-­‐   +   -­‐   +   Proteus  mirabilis   Cronobacter  sakazakii  
Citrobacter  freundii   Citrobacter  koseri,  braakii  
Salmonella  enteritidis   +   -­‐   -­‐   Klebsiella  
Klebsiella  ozanae   Shigella  sonnei  
-­‐   +   -­‐   -­‐   Salmonella  typhi   Salmonella  typhi  
Shigella  dysenteriae,  sonnei   Serratia  odorifera  
Yersinia   -­‐   +   -­‐   Proteus  mirabilis,  Morganella  morganii  
-­‐   -­‐   +   +   Klebsiella  pneumoniae   Yersinia  enterocolitica  
Enterobacter   Citrobacter  freundii  
Cronobacter   -­‐   -­‐   -­‐   Pantoea  agglomerans  
Serratia   Proteus  vulgaris,  Providencia  
+   -­‐   +   +   Klebsiella  oxytoca   Shigella,  Yersinia,  Ewingella  
-­‐   -­‐   +   -­‐   Pantoea,  Hafnia  (?)   -­‐   ?   ?   Pseudomonas  
-­‐   -­‐   -­‐   +   Pseudomonas,  Alcaligenes,    
Acinetobacter  (NFO)    
 
BACTERIOLOGY  #RoadToRMT     MMY  (2015)  
TSI  
A/AG  H2S   A/AG   A/A   K/AG  H2S   K/A  H2S   K/AG   K/A   K/K  
C.  freundii   E.coli   Providencia   Proteus   Salmonella   Morganella   Shigella   Pseudomonas  
S.  arizonae   Enterobacter   S.  sonnei   Salmonella   typhi   S.  paratyphi   Providencia   Alcaligenes  
Cronobacter   Vibrio   Edwardsiella   C.  koseri   Yersinia   Acinetobacter  
Klebsiella   Serratia   Pantoea  
Aeromonas   Plesiomonas  
S.  marcescens  
Hafnia  alvei  
 
LIA  
R/A  &  PAD+   K/K  H2S   K/K   K/A  H2S   K/A  
Proteus   Salmonella   Escherichia,  Enterobacter   Salmonella   E.  coli,  E.  cloacae  
Providencia   Edwardsiella   Klebsiella,  Salmonella   Serratia   Shigella,  Citrobacter  
Morganella   Serratia,  Hafnia   Yersinia,  Aeromonas  
Plesiomonas,  Pseudomonas    
 
*BB  contaminants  (4C)  
1. Yersinia  enterocolitica  
2. Pseudomonas  fluorescens  
3.  Serratia  liquefasciens  
*BB  contam  (RT)  
1. Staphylococcus  epidermidis  
2. Bacillus  cereus  
 
*BIOTERRORISM  AGENTS:  
Burkholderia  mallei  &  pseudomallei  
Francisella  -­‐  BSL3  
Bacillus  anthracis  
Clostridium  botulinum  
Rickettsia  ricketsii  
Coxiella  burnetti  
 
*SKIN  TESTS:  
Dick’s  test  –  suscept.  Test  –  S.  pyogenes  erythrogenic  toxin  (Scarlet  fever)  (+  erythema/redness)  
Schultz-­‐Charlton  –  diagnostic  test,  current  infxn  –  S.  pyogenes  (+  blanching/fading)  
Francis  Test  –S.  pneumonia  
Foshay  test  –  Francisella  
Schick’s  test  –  C.  diphtheriae  
Frei’s  test  –  Chlamydia  
Tuberculin  test  –  PPD  (purified  protein  derivative)  –  MTB  
Fernandez  reaction  –(2-­‐3  days)  -­‐    M.  leprae  
Mitsuda  reaction  –(3-­‐4  weeks)  -­‐  M.  leprae  
 
*OTHER  TESTS:  
Sereny  test  –  guinea  pig  virulence  (keratoconjunctivitis)  –  Shigella  &  EIEC  
Cholera  Red  (nitrosoindole  test  +)  –  V.  cholerae  
String  test-­‐    (0.5%  Na  desoxycholate)  –  V.  cholera;  (no  rgt)  -­‐  Klebsiella  
McFadyean’s  rxn  –  capsular  stain  –  B.  anthracis  
Ascoli  pptn  –  B.  anthracis  
Elek  test  –  immunodiffusion,  definitive  –  C.  diphtheria  
Ocular  Anton  -­‐  mouse  virulence  test  -­‐  Listeria  monocytogenes  
 
*Sources:  
Books:  Rodriguez,  Mahon  
Lectures/Notes:  Aldave  (Acts/Pioneer),  Tiburcio  (UST)