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INTERPRETATIV
E
D’UN
ANTIBIOGRAMM
D E L A T H E O R I E A L A P R AT I Q U E
E
TRABELSI BECEM HUMTM NABEUL
AVRIL 2021
PLAN
I. LES BACTERIES
II. LES ANTIBIOTIQUES
II. LES DEFINITIONS
III. Le Staphylocoque
IV. Le Pneumocoque
V. L’Entérocoque
STRUCTURE DE LA PAROI DES BACTERIES
Structure schématique
du peptidoglycane
GRAMBACTERIES
+ GRAM-
AEROBIES
COCCI COCCI
Staphylocoque -Neisseria
Streptocoque -Méningocoque
Pneumocoque -Gonocoque
Entérocoque
BACILLES
BACILLES - Entérobactéries
Listeria (Shigelle,Salmonelle,
Corynebactéries E.coli, klebsielle…)
Bacillus - P.aeruginosa
Acinetobacter est un cocco- - Haemophilus
bacille Gram négatif, non
fermentant, aérobies strictes, à
- Campylobacter
métabolisme respiratoire strict. - Leginonella
- Bordetella pertussis
GRAM +
BACTERIES GRAM-
ANAEROBIES
COCCI COCCI
Peptostreptococcus Veillonella
BACILLES BACILLES
-Clostridium Bacteroides
(Perfringens; Tetani; Prevotella
Botulinum; Difficile) Porphyromonas
- Propionibacterium Fusobacterium
-Bifidobacterium
-Actinomyces
-Lactobacille
-Propionibacterium
TAXONOMIE
• Taxonomie: Science de la classification biologique
délimitation des bactéries en groupes (familles, genres,
espèces…); Exp:
– Famille: Enterobacteriaceae
– Genre: Escherichia
– Espèce: E. coli
• Les bactéries sont désignés par deux noms latins :
– le nom de genre, écrit avec une majuscule au début,
– suivi du nom d'espèce, écrit en minuscule.
– L'ensemble du nom est écrit en italiques (Ex : Escherichia
coli).
PLAN
I. LES BACTERIES
II. LES ANTIBIOTIQUES
II. LES DEFINITIONS
III. Le Staphylocoque
IV. Le Pneumocoque
V. L’Entérocoque
MODE D’ACTION DES ANTIBIOTIQUES
3-CARBAPENEMES
• Glycopeptides: Spectre étroit :
• Bactéries à Gram + aérobies ou anaérobies (ces ATB de grande taille
ne pénètrent pas au travers des membranes externes des bactéries à
Gram -) : staphylocoques (y compris SARM) et entérocoques.
Anaérobies;
Inefficaces contre les bactéries Gram négatives car elles possèdent une
membrane externe qui isole la paroi de l'extérieur.
Vancomycine (Vanco®),
Teicoplanine (Targocid®)
• Fosfomycine: Spectre large : Staphylocoques ; entérobactéries;
Pseudomonas aeruginosa.
CLASSIFICATION DES ANTIBIOTIQUES
INHIBITION DE LA SYNTHESE DE LA MEMBRANE CYTOPLASMIQUE
POLYMIXINES
• Colistine
• Spectre : active sur les BGN.
• Bactéries naturellement résistantes:
– Proteus mirabilis; Proteus vulgaris
– Providencia,
– Serratia.
– Morganella morganii
– Burkholderia cepacia
CLASSIFICATION DES ANTIBIOTIQUES
INHIBITION DE LA SYNTHESE DE LA MEMBRANE CYTOPLASMIQUE
DAPTOMYCINE
• Spectre :
– Assez comparable à celui de la péni G : CG+ et CG-, BG+.
– Totalement inactifs sur les entérobactéries et
sur Pseudomonas.
1/ MACROLIDES: Spiramycine, Erythromycine, Josamycine,
Roxithromycine, Clarithromycine, Azithromycine.
2/ LINCOSAMIDES: Lincomycine, Clindamycine (Dalacine®).
3/ SYNERGISTINES: antistaphylococciques, anti CG+ :
Pristinamycine (Pyostacine®).
CLASSIFICATION DES ANTIBIOTIQUES
INHIBITION DE LA SYNTHESE DE LA SYNTHESE PROTEIQUE
III- CYCLINES
• Les tétracyclines sont actives contre les bactéries à G- et G+ , les
tréponèmes, les Borrelia, les rickettsies, divers
anaérobies, Mycoplasma pneumoniae et les chlamydiae.
• Tétracycline, Doxycycline, Minocycline, Tigécycline (Glycylcyclines).
• Bactéries naturellement Résistantes Tigécycline (Tygacil®) = 3P:
– P. aeroginosa
– Proteus mirabilis, penneri, vulgaris,
– Providencia rettgeri, stuartii
– Morganella morganii.
CLASSIFICATION DES ANTIBIOTIQUES
INHIBITION DE LA SYNTHESE DE LA SYNTHESE PROTEIQUE
IV- PÉNICOLÉS
• Chloramphénicol, Thiamphénicol
V- ACIDE FUSIDIQUE
Fucidine®
Spectre limité : surtout utilisé comme antistaphylococcique
VI- OXAZOLIDINONES
Linézolide : Zyvoxid® 2001
Spectre : anti CG+ résistants aux traitements habituels.
CLASSIFICATION DES ANTIBIOTIQUES
INHIBITION DE LA SYNTHESE DE L’ADN
QUINOLONES
QUINOLONES
I. LES BACTERIES
II. LES ANTIBIOTIQUES
II. LES DEFINITIONS
III. Le Staphylocoque
IV. Le Pneumocoque
V. L’Entérocoque
II-DEFINITIONS
HARMONISATION EUROPEENNE
Culture
II-DEFINITIONS
Concentration minimale inhibitrice: CMI
Détermination de la CMI
Croissance bactérienne
CMI CMI
CMI en milieu liquide: Concentration dans le
Bandelettes à gradient
premier tube pour lequel il n’ya pas de croissance
de concentration : E test
visible après 24h à 37°C
II-DEFINITIONS
Concentration minimale inhibitrice: CMI
II-DEFINITIONS
CHOIX DES ATB A TESTER PAR ÈSPÈCE
1
• ANTIBIOGRAMME
2
• RESULTATS BRUTS
3
• RESULTATS INTERPRETES
II-DEFINITIONS
LECTURE INTERPRÉTATIVE DE L’ANTIBIOGRAMME
RESISTANCE ACQUISE
• Caractéristique de certaines souches au sein d’une espèce bactérienne.
• Instable le plus souvent
• Résulte d’une modification génétique.
• Définit des phénotypes « RESISTANTS ».
II-DEFINITIONS
MECANISMES DE RESISTANCE
II-DEFINITIONS
SUPPORT DE RESISTANCE
MEC, Mécillinam ; AZT, aztréonam ; CAZ, ceftazidime ; NAL, acide nalidixique ; PEF, péfloxacine ; FUS, acide fusidique ; OXA, oxacilline ;
C1-4G, céphalosporines de 1ère à 4ème génération (sauf ceftobiprole); ERT, ertapénème ; LINC, lincomycine ; STR, streptogramines A ;
VAN, vancomycine ; TEC, teicoplanine ; FOS, fosfomycine ; NOV, novobiocine ; SUF, sulfamides ; COL, colistine ; PMB, polymyxine B.
*Sauf ceftobiprole et E.faecalis
II-DEFINITIONS
RESISTANCE NATURELLE : COQUES GRAM+
I. LES BACTERIES
II. LES ANTIBIOTIQUES
II. LES DEFINITIONS
III. Le Staphylocoque
IV. Le Pneumocoque
V. L’Entérocoque
STAPHYLOCOQUE
STAPHYLOCOQUE
MÉCANISMES DE R ACQUISE AUX ß-LACTAMINES
Pénicillinase
Acquisition de
PLP2a
STAPHYLOCOQUE
MÉCANISMES DE R ACQUISE AUX ß-LACTAMINES
Pénicillinase R S S S
Acquisition de
PLP2a
STAPHYLOCOQUE
MÉCANISMES DE R ACQUISE AUX ß-LACTAMINES
1. Inactivation enzymatique :
• Production inductible de Pénicillinases,
plasmidique (transposon); Concerne > 90%
des souches de S. aureus et des souches de
S. non aureus.
1. Modification de la cible :
• Gène mec A = codant une protéine liant la
pénicilline additionnelle (PLP2a). Cette
transpeptidase PLP2 a une affinité faible vis-
à-vis des ß-lactamines (SARM).
STAPHYLOCOQUE
DIAGNOSTIC MICROBIOLOGIQUE SARM
3. VRSA :
– Résistance vraie ;
– Haut niveau de résistance, mécanisme différent.
– Co-infection préalable ERG-SARM
– Acquisition de l’opéron Van A décrit chez les entérocoques : haut
niveau de résistance
STAPHYLOCOQUE
CAS CLINIQUE 1
• Un homme âgé de 50 ans est hospitalisé en réanimation pour
intoxication médicamenteuse, il a présenté une PAVM. Un
traitement empirique par Pipéracilline a été instauré avec à
l’examen bactério un S. aureus .
Pénicilline : R
Pipéracilline : S Pénicillinase
Oxacilline (Méticilline) : S
Tous les autres ATB : S
• Qu’est ce que vous pensez de l’antibiothérapie?
STAPHYLOCOQUE
CAS CLINIQUE 1
• Réponse: FAUX
• Une souche résistante à la Pénicilline résistante à la
Pipéracilline par production d’une Pénicillinase.
Pénicillinase = Péni R = Pip R = Ticar R
• L’ activité est restaurée par un inhibiteur de la
Bétalactamase.
Mécanisme Pénicilline G ß-lactamine + Oxacilline Céphalosporines
Amino, Carbox, inhibiteur de Carbapénèmes
Uréido-P bêtalactamase
Pénicillinase R S S S
STAPHYLOCOQUE
CAS CLINIQUE 2
• Un homme âgé de 40 ans porteur d’un RVM mécanique a
présenté une infection liée à un KTVC avec des HC + S. aureus.
Pénicilline : R Kanamycine : R
Oxacilline : R Gentamicine : S
Imipénème : S Tobramycine : R
Tétracycline : R Amikacine : S
Vancomycine : R Netilmicine : S
LART
LART
STAPHYLOCOQUE
CAS CLINIQUE 2
Kanamycine : R
• Réponse : Faux Gentamicine : S
• SA Kanamycine R = Amikacine R Tobramycine : R
Amikacine : S
• Genta: très actif sur le SA Netilmicine : S
LART 2017
PNEUMOCOQUE
CAS CLINIQUE 1
• Un Homme âgé de 35 ans est hospitalisé en réanimation pour
pneumopathie hypoxémiante à Streptococcus pneumoniae,
qu’est ce que vous pensez de cet antibiogramme ?
PSDP.
Mécanisme : acquisition de gènes mosaïques codant pour des PLP de
faible affinité pour les β-lactamines.
PNEUMOCOQUE
QCM
• Chez Streptocoque pneumoniae qu’elles sont les FQ
antipneumococciques:
Ciproflo
Ciprofloxacine xacine
Ofloxaci Activité Anti BGN +++
Péfloxacine ne Infections Genito-
Lévofloxacine Lévoflo Urinaires !!!
xacine
Ofloxacine + ACTIVITE +++
Moxifloxacine ANTI PNEUMOCOCCIQUE
Infection BP !!!
ENTEROCOQUE
ENTEROCOQUE
• 18 espèces ,
• Deux principales espèces isolées lors des infections cliniques
– E.faecalis
– et E.faecium.
• Parmi toutes les souches: 10 E.faecalis pour 1 E.faecium
• Parmi les ERG: 1 E.faecalis pour 10 E.faecium.
ENTEROCOQUE
-LACTAMINES
• Résistance naturelle: PLP5 naturelle faible affinité pour PéniG
– Resistance haut niveau aux céphalosporines (+ oxacilline)
– Sensibilité diminuée aux pénicillines
• Résistance acquise
– Production de pénicillinase: décrite mais très rare.
– Hyperproduction de PLP5: Fréquente chez E. faecium plus rare chez
E. faecalis
E. faecalis E. faecium
• Résistance à toutes les céphalosporines • Les souches d'E. faecium résistantes aux
• Rien de mieux que l’amoxicilline. pénicillines doivent être considérées
• Pas de bactéricidie (association nécessaire comme résistantes aux autres β-lactamines,
aux aminosides si effet bactéricide y compris les carbapénèmes
recherché)
ENTEROCOQUE
AMINOSIDES
SENSIBLE RESISTANT
Vancomycine CMI ≤ 4 mg/L CMI > 4 mg/L
Teicoplanine CMI ≤ 2 mg/L CMI > 2 mg/L
ENTEROCOQUE
GLYCOPEPTIDES
Enterococcus faecium :
Evolution du % de la résistance à la vancomycine en Tunisie
ENTEROCOQUE
GLYCOPEPTIDES
E. faecalis E. faecium
• Résistance Naturelle sauf pour • Résistance naturelle
Lévofloxacine/Ciprofloxacine (cystites
non compliquées et prostatites)
ENTEROCOQUE
Résistances E. faecium
LART 2017
ENTEROCOQUE
BASES THERAPEUTIQUES
LINEZOLIDE
POUR CONTRE
• Effet « temps-dépendant » • Activité anti-Gram(+) stricte
• Bactéricide sur le Pneumocoque et • Bactériostatique sur le
l’Entérocoque staphylocoque
• Bonne Diffusion Tissulaire • 2x/j
• Biodisponibilité 100% par VO • Effets indésirables
• Effet post antibiotique • Interaction médicamenteuse
• Aucune adaptation de doses en cas • Prix
d’insuffisance rénale.
ENTEROCOQUE
BASES THERAPEUTIQUES
DAPTOMYCINE
POUR CONTRE
• Spectre étroit • Activité anti-Gram (+) stricte
• rapidement bactéricide • Inactif dans la pneumonie
• 1 x /j • ↑CMI chez les VISA
• Toxicité musculaire: éviter la
combinaison avec les statines
• Non étudiées chez < 18 ans
• Prix
ENTEROCOQUE
BASES THERAPEUTIQUES
TIGECYCLINE
POUR CONTRE
• Spectre XL (Infections • Bactériostatique
polymicrobiennes) • 2x/j
• Pas affecté par certains • CI : grossesse, allaitement, enfants
mécanismes de résistance aux • Pas de voie orale
tétracyclines ( efflux, protection • Prix
ribosomale)
• Réduction de la pression de
sélection
• Bonne Diffusion Tissulaire
• Sécurité d'emploi
ENTEROCOQUE
Cas clinique 1
• Une femme âgée de 45 ans, diabétique est hospitalisée en
réanimation pour bactériémie à Enterococcus faecalis:
• Amoxicilline : S
• Céphalotine (C1G) : S
• Gentamicine : S
• Erythromycine : S VRAI ou FAUX ?
• Clindamycine : R
• Vancomycine : S
Réponse: Faux car R naturelle aux Céphalosporines; R naturelle
aux aminosides; R naturelle à la Clindamycine
ENTEROCOQUE
CAS CLINIQUE 2
Mr SA; 30 ans hospitalisé en réanimation pour traumatisme crânien grave. Il a
présenté une fièvre en plateau. Vous recevez cet antibiogramme (HC).
ENTEROCOQUE
QROC
Parmi ces souches, lesquelles sont naturellement résistantes à la
Vancomycine:
1. Entérococcus faecium
2. Entérococcus faecalis
3. Entérococcus gallinarum
4. Entérococcus caseliflavus
5. Escherichia coli
CONCLUSION