Académique Documents
Professionnel Documents
Culture Documents
d'onolyses
biomédic'oles 2. éd*.n
Tout-en-un:
les cours et
les opplicotions
cliniques
I
/
I
I
I
tEE Lauoisier
Table des matières
v
Liste des auteurs ï "'
Sigles et abréviations utilisés """""""""' 'i""""' xxvtt
ChaPitre 1
3
1. Acides nucléiques... 3
1.1. Structure des nucléotides""""""""' 6
1.2. Structure de IADN 8
1.3. Structure des ARN 11
2. Enzymes 11
2.1. EnzYmologie 24
2.2. Utilisation oei propriétés des enzymes au laboratoire................'......'. 34
2.3. Physiop"Ûtor"ô" i"' "n'yt"' séiiques 49
2.4. Explorations iJnctionnellÉs à l'aide d'enzymes"""""" 54
3. Bio-énergétique
3.1'Variationd,énergieIibreetcoup|ageentreréactions..............'....'...'..55 55
3.2. Motécut", i,npiiqie"idans tes écfrànges énergétiques...................'.... 57
3.3. Extraction o"-t;e1làigi" à partir des aliments i
4. Eau et ions minéraux :: oz
4.1. Grandeurs utiles """""" 63
4.2. Équilibre hYdrique" 64
4.3. Métabolisme minéral"""" 73
4.4. Méthodes de dosage
5. acidobasique
Équilibre " 79
79
5.'1. Rappels de physiologie""""""""" 82
5.2. Exploration fonctioÀnelle """"""""" 87
5.3. Variations pathologiques """""" 89
6. Glucides. 89
5.'1. Structure 95
6.2. Métabolisme des glucides 112
6.3. Variations physioplathologiques lto
I ro
6.4. Exploration fonctionnelle """"""""" 128
7. Lipides 128
7.1. Structure des liPides"' 134
7.2. Lipoprotéines .'....""""""'
7.3. Métabolisml-A"t fiôia"t et des lipoprotéines
143
Chapitre 4
Hématologie - Hémobiologie (Céline Loiseau).'.'... 625
1
Génératités.. 625
1.1. Composition du sang 625
1.2. Fonctions du sang 626
2, Hématopoièse ................. 628
2.1. Généralités.. 628
2.2. Cinétique - Régulation - Cytochimie et immunophénotypage..'.'...'.. 631
2.3. Exploration de l'hématopoÏèse............ 647
2.4. Organes hématopoiétiques - Organes lymphoÏdes. ........ dF49
3. Éléments figurés : structure et fonction 653
3.1. Globules rouges 653
3.2. Leucocytes............. 664
3.3. Plaquettes.............. 672
4. Hémogramme................... 672
Données de l'hémogramme..........
4.1. 674
Hémogramme automatisé..
4.2. 675
Exemple d'utilisation d'un automate.....'...........
4.3. 678
Pathologie cellulaire 682
5.1. Globules rouges 682
5.2. Globules blancs 685
Principales hémopathies................... 686
6'1' Anémies 685
6.2. Polyglobulies .......... 7O2
6.3. Leucopénies............ 703
6.4. Hyperleucocytoses 7O5
6.5. Aplasies médu||aires................... 7O9
6.5. Syndromes myéloprolifératifs.... 71O
6.7. Syndromes lymphoprolifératifs.......... 714
6.8. Leucémies aiguës 719
Hémostase normale et pathologique.......".....' 723
7.1. Hémostase primaire....... 723
7.2. Coagulation 729
7.3. Physiologie de la fibrinolyse .............. 736
7.4. Exploration de I'hémostase................. 739
7.5. Bilan de l'hémostase. 745
7.5. Pathologies de l'hémostase ................. 747
8. lmmuno-hématologie 769
8.1. Groupes sanguins...... 770
8.2. Techniques de base en immuno-hématologie....... 779
8.3. Applications de l'immuno-hématologie 787
Chapitre 5
lmmunologie (lacques Dainat, Serge Herbuté, Bernard Romestand
en collaboration avec Jean-Claude Chapalain, Benoît Chevalien
Wahib Mahana)...... 799
1. I'immunité..............
Mécanismes de .' 799
1.1. lntroduction 799
xlll
Table des matières
800
Antigènes..............""
'1.2.
802
1.3. Complexe t"i"ui d'histocompatibilité 806
1.4. SYstème immunitaire 823
1.5. Anticorps...'. 832
1.6. Médiateurs o, iftiet" immunitaire 845
1.7. Réaction lttrnit"i," non spécifique """""""" 848
1.8. Réaction immunitaire spécifique"' 857
1.9. lmmunité anti-infectieuse"""""""' 862
2. Dysfonctionnements du système immunitaire 852
2.1. Réactions d'hypersensibilités """"" 864
2.2. Tolérance immlnitaire et maladies auto-immunes"""""""'ji"""""""
2.3. Syndrorn", i*tunoprolifératifs
fi 866
858
2.4. Pathologies du complément 868
2.5. Déficits immunitaires"""""""""' 859
2.6. Greffe et transplantation d'organe""""""""' 870
3. immunologiques"""""""'
Thérapies
de < remplacement >"""""""""'
87'l
3.1. lmmunité 876
4. lmmuno-analYse....-..' 876
4.1. Techniques d'immuno-analyses
ChaPitre 6
903
Physiopathologie (GuY Modat)
903
1. Démarche diagnostique
903
1.1. Examen clinique
904
1.2. Examens paracliniques""""""""""
905
2. Vieillissement."......'...."
905
2.1. Généralités.. 906
2'2.Viei||issementdesdifférentssystèmesetappareiIs 909
2.3. Prévention du vieillissement """""""' 909
3. Malnutrition.............'. 910
3.1 .
Malnutrition par carence alimentaire 911
3.2. Malnutrition par excès alimentaire """""" 912
4. lnflammation..'...'.'."..
912
4.1. Mécanismes 915
4.2. Marqueurs biologiques de I'inflammation 915
4.3. Différents types d'inflammation """""""' 916
5. Fièvre......
916
5.1. Thermorégulation"""""' 918
5.2. Mécanismes de la fièvre 919
5.3. Signification de la fièvre"""' 919
5. Mortcellulaire.'... 919
5.1. Nécrose 920
5.2. APoPtose ..........'...." 922
6.3. Marqueurs de la mort cellulaire """"""""' 922
7. Athérosclérose."...'..".
923
7.1. Facteurs de risque 923
7.2. Athérogenèse.....'....""""'
Le technicien d'analyses biomédicales
924
8. États de choc........
924
8.1. Typologie des chocs
925
8.2. Cliniqueetparaclinique.'.......""' 925
8.3. Traitement'..........'...
926
9. Amyloses
926
9.1. DéPôts amYloTdes.... 927
9.2. Diagnostic biologique". 927
9,3. Typologie des amyloses ..""""""'
928
10. Oncogenèse'.'............
929
10.'1. Cancérogenèse..."....
10.2. Extension et classification des cancers
t{' 930
931
10.3. Marqueurs tumoraux'.'......"""""
ChaPitre 7
Bactériofogie (Marie-Louise Abalain-Colloc, Jacques Béraud'
Adissa Tran-Minoui) 933
Geneviève Le Lay-Roguès, Didier Tandé,
933
1. Techniques microbiologiques...'.........
933
1.1. Conditions de travail au laboratoire"""""""""
934
1.2. Examen microscopique des bactéries""""""""
939
l.3.Techniquesd,ensemencementetd,isolementdesbactéries.....'..'.'...'.
"""""""""'
des bactéries 943
1.4. Méthode de dénombrement
944
2. Organisation fonctionnelle des bactéries """"""""
945
2.1. Morphologie bactérienne 945
2.2. Structure et composition de la cellule bactérienne
956
2.3. Comparaison entre cellules procaryote et eucaryote
957
3. Agents antibactériens......"...........
957
3.1. Antibiotiques..'......".'......
998
3.2. Antiseptiques et désinfectants."""""""
1003
3.3. Agents PhYsiques
1006
4. Métabolisme bactérien...'.
1006
4.1. Croissance des populations bactériennes """"""'
1009
4.2. Métabolisme des bactéries chimio-organotrophes"
4.3. Applications à I'identification bactérienne """"""""" 1017
'1034
5. Génétique bactérienne'....'...'.'.......
1034
5.1 . Organisation du matériel génétique""
S.2. Coitrôle du fonctionnement et de I'expression des gènes""""""""" 1034
1040
5.3. Mutations
1042
5.4. Transferts génétiques'............""
1047
6. Écologiebactérienne
1047
6.1. Relations hôte-parasite .'......'....."" 1048
6.2. Infection microbienne ........'......'..
1049
6.3. Floresmicrobiennes......'......'.....
1051
6.4. Biofi1ms...........".'.'..
7. Taxonomie bactérienne'......."....'.... " 1052
7.6.Galeriesd'identificationbiochimique"""""""""""""""'1057
7.7. ldentificatiJÀ p"ltpàttt"Àetti" de masse iÎ?:
7.8. Marqueurs épidémiologiques""""""
8. Applications de la biologie moléculaire' """""""' 1061
8.1. Sondes nucléiques"' """"""""" 1061
8.2. PCR "' 1062
8.3. Polymotpftit." électrophorétique des enzymes """"""' 1063
9. Systématique ..."...'.... "" 1063
9.1. Staphylococcus.."""""""' """"' 1063
g.2. streptococcaceae """"""' """"' 1072
9.3. Neisseriaceae......""""""' """"" 1080
g.4. Enterobacteriaceae........'. "! 1999
9.5. Vibrionaceae """"""':"""""""' 1104
9.6. Bacilles à é;;; ;ag"tif non fermentants - Pseudomonadaceae..... 119:
9.7. Bacilles à Gram négatif divers """""' ;;:;
9.8. Bacilles à Gram positif aérobies ;;:;' v
9.9. Bactéries anaérobies strictes """"' ''
9.10. Spirochè1es........""' """""""""' 1181
1260
10.g. Examen cytouacteriâlogique des prélèvements oRLet,ophtalmiques.
10.10. Exame" génitaux chez l'homme et chez la femme .. 1265
à'"rïàa""meits
10.11. Examen des prélèvements sur dispositifs
médicaux i1a^
t1'+
(cathéters, chambre implantable)
10.12. Diagnostic ààs infectioÀs ostéo-articulaires """"""
"""' 1277
I 1.2. """"""'
Chaîne épidémiologique """"""""" 1291
I
r
I
I
XVI Le technicien d'analyses biomédicales
ChaPitre 10
Mycologie (Didier Blaha, Patrick Boiron)""" """""' 1345
I
XVII
Table des matières
2.5'Interférenceavec|esmécanismesdedéfensedel,hÔte.......'........'..'...1355
2.6. Facteurs favorisants """""""""
1356
'1357
des mycoses............'.
2.7. classification .ii"iq"" "t aspects pathologiques
3. Diagnostic des mycoses.......'..""""""":"""""""
"" 1362
3.1. Diagnostic clinique"""" """""" 1362
3.2. Diagnostic mycologique """"""' """""""""' 1363
Virologie
1376
1. Généralités sur les virus...'....""
'1.1. 1376
Déf inition des virus......
1377
1.2. Structure des virus.. 1381
1.3. Classif ication des virus """ 1384
1.4. Réplication des virus dans la cellule infectée"""' 1386
1.5. ÉpiOemiotogie des infections à virus" 1391
1.6. Lutte antivirale..'....."""" 1392
1.7. Sécurité au laboratoire """"""""'
1395
2. Diagnostic virologique au laboratoire """"""" 1396
21. Diagnostic direct.....'.."' 1403
2.2. Diagnostic indirect' 1405
2.3. Tests raPides
1406
3. Virus et Pathologies associées
1406
3.'1. Virus et oncogenèse 1410
3.2. Virus et déficits immunitaires """""""""' 1413
3.3. Virus et grossesse 1416
3.4. Virus et maladies sexuellement transmissibles """""""" 1418
3.5. Virus et maladies hépatiques " 1420
I Princioaux virus d'intérêt médical
1420
4.1. lnfluenzavirus'..".........""' 1421
4.2. ParamYxoviridae.'... 1422
4.3. Entérovirus ."'.'.."" 1423
4.4. Virus de la rubéole 1423
RotavirL,s et autres virus de gastro-entérites
humains
1.5. 1424
4.5. Virus de la rage 1426
1.7. Rétrovirus 1427
1.8. Adénovirus'..'...'..'.
Le technicien d'analyses biomédicales
XVIII
1594
1.6. Classification des médicaments """"""' 1595
1.7. Nocivité des médicaments """"""' 1595
2. Conception et fabrication des médicaments """""
1595
2..|.PrincipaIesvoiesderecherchedenouveauxmédicaments.....'....'....... 596
Z.Z. C"nOs" du médicament - Phases de développement""""" 1
1 598
2.3. Autorisation de mise sur le marché 1 598
2.4. Fabrication industrielle des médicaments """""""""' 1 600
Passage du médicament dans l'organisme
1600
3.1 .
Voies d'administration "' 1601
3.2. Traversée des membranes biologiques par les médicaments"""""""' 1602
3.3. Absorption des médicaments """""""""' """"";r""""""'
:.+. f ixation des médicaments au niveau du sang '.i""""""' 1603
dans l'organisme' 1605
3.5. Distribution des médicaments 1606
3.6. Métabolisme des médicaments """"""' 't608
3.7. Élimination des médicaments """"""' 1509
4. Pharmacocinétique et suivi thérapeutique"""""""""' 1609
4.1. Définition de la pharmacocinétique' 1609
4.2. Principe des essais pharmacocinétiques"""" 1609
4.3. Notion de modèle pharmacocinétique 1611
4.4. Principaux paramètres pharmacocinétiques'
4.5. Interprétation d'une cinétique plasmatique """"""""
16'13
1620
4.6. Administrationchronique 1623
4.7. Suivi théraPeutique 1624
4.8. Méthodologie des prélèvements""""""" 1624
5. Essais cliniques..'.'.
1625
5.1. Bonnes pratiquescliniques"""
1625
5.2. Phases du développement clinique
1525
. Mode d'action des médicaments"""""""
1627
5.1. Principaux mécanismes d'action des médicaments""""""" 1631
6.2. lnteraction médicament-récepteur """""""""' 1634
6.3. Réponses pharmacologiques""""'t'::"""""""' 1634
6.4. Caiactérisation des effets d'un médicament"""""" 1635
5.5. Détermination des effets d'un médicament"""""" médicament " 1637
6.5. Principaux paramètres de détermination de l'action d'un 1638
.CaractèresgénérauxdesprincipaIesc|assesthérapeutiques.........'.'......'.....
1638
7.1. Médicaments du système nerveux central""""' 1641
7.2. Médicaments du système locomoteur - Myorelaxants""""""""""""' 1642
7.3. Médicaments de I'inflammation et de l'allergie' 1643
7.4. Médicaments de I'appareil digestif et du métabolisme 1645
7.5. Médicaments du système cardiovasculaire """"""" 1647
7.6. Médicaments du système respiratoire - Anti-asthmatiques 1648
7.7. Médicaments de l'hémostase """"""' 1648
7.8. Diurétiques 1649
7.g. Médica ments anti-i nfectieux - Antibiotiques 1649
7.10. Médicaments anticancéreux
XX Le technicien d'analyses biomédicales
Chapitre 14
Chapitre 15
Chapitre 16
1763
1763
5.1. PrinciPe général 1764
5.2. Mise en æuvre de l'inclusion 1765
5.3. Paraff ines histologiques """""""' 1765
6. Confection des couPes
1765
6.1. Taille du bloc'.'.'..'.""' 1766
6.2. Principe de fonctionnement du microtome"""""""""' 1766
6.3. Du bloc taillé à la première coupe"""""' 1769
6.4. Déboires au cours de ces opérations """""" 1770
6.5. Recueil des couPes 1770
7. Étalement des couPes.. -4 1771
8. Déparaffinage et hydratation' """""""1r"""""""'
1771
9. Coloration histologique 9énérale"' 1772
9.1 . Notion de colorant" 1773
9.2. Principes de coloration """""""' 1774
9.3. Exemples de méthodes générales
1775
1 0. Coloration histochimique """"""""' 1775
'10.1. Diversité et répartition des composés glucidiques"
1776
10.2. Méthode d'identification """"""" 1777
à IAPS
10.3. Contrôle de la spécificité de la réaction
1777
11. Méthodes histo-enzymologiques ""
1777
12. Méthodes imniunohistochimiques
1778
13. Montage des préparations"""""""
ChaPitre'17
Anatomie et cytologie pathologiques (Marie-Laure Quintyn-Ranty) ""'
1779
pathologiques'.... 1779
1. euerques définitions et buts de ranatomie et cytorogie
'f.1. Définition.... """"" 1779
41. extemporané""""""""""':i""""""""'
Examen """"""""' 1795
1798
4.2. Colorations coÀplémentaires usuelles""""
4.3. lmmunohistochimie """"""""" 1800
6. """""""""""""""" 1815
Embryologie, développement normal et pathologique
6.1. Embryon et fcetus """"""""""' 1815
6.2. Fætopathologie """":"""""" "' 1817
5.3. Causes 0", *jiàttations congénitales ""' 1818
ChaPitre 19
1935
Physique-Physiqueinstrumenta|e(Atain-ClaudeRoudot)..',...........'.'....
193 5
1. États de la matière
1935
1.1. La matière......'..... 1 936
1.2. État solide 1 936
1.3. État liquide 1937
1.4. État gazeux. 1938
1.5. Changements de Phase 1939
1.6. Solutions'...'.'........'. 1940
2. Grandeurs PhYsiques..
1940
2.1. Historique 1940
2.2. Étapesd'une mesure"""""""""' 1941
2.3. Erreurs de mesure 1942
2.4. Caractéristiques d'une chaîne de mesure 1943
2.5. Calcul des incertitudes"""""""' 1944
2.6. Équation aux dimensions """"""""' 1945
2.7. Unités 1947
3. Optique.
1947
3.1. Généralités'. 1948
3.2. Réflexion et réfraction"""""""""' 1949
3.3. 1enti11es.....".......""' 1951
3.4. MicroscoPe........'.....' 1952
3.5. Prisme.....'.'.. 1954
3.6. Source lumineuse 1956
3.7. Récepteurs lumineux - Photomultiplicateur""' 1957
3.8. Interactions matière-rayonnement """"""""' 1958
i.g. Spectrophotométrie _ UV visible, tR et absorption atomique............. 1960
3.10. Fluorescence atomique et moléculaire"""""""
1962
Électricité - Electronique.'.....""""""
1962
4.1. Définitions 1965
4.2. Aspect technique de quelques composants 1968
4.3. Quelques instruments de mesure 1970
4.4. Semi-conducteurs 1973
4.5. Diodes 1973
4.5. Sécurité des alimentations 1974
Mécanique des f luides...
1974
5.1. Définitions 1975
1977
5.3. Hydrodynamique..."."""' 1979
Le technicien d'analyses biomédicales
XXIV
"""""""""" 1982
5.5. Pertes de charge"" """"""""" 1983
5.6. Capillarité """""""" "" 1985
6. ThermodYnamique"" """""""" 1985
6.1. Notions préliminaires
6.2.Coefficientsthermodynamiques'.'...'....'..'.'.1986 ""' 1987
6.3. Gazaux faibles pressions""' """"" 1988
6.4' GazParfaits "' 1990
6.5. Premie, p'intip"'J" i"ir'"ittovnamique
premler principe"""' """"" 1993
6.6. Principales conséquences du """""""' 1994
6.7. Capacités calorifiques """':"":"""" gaz parfaits """""' 1t?4
aux
6.8. Application du premier principe """""""""' 1995
7. Radio-activité """"""""" " 1995
7.1. Structure du noyau atomique """"" 1995
7.2. Radio-activité """"""""" """"" 1998
7.3. Applications " 1999
8. Chromatographie"""" """"""""' 1999
8.1. Principe .'""""""""" 2000
8.2. Classification"""""
8.3'Grandeurscaractéristiques'....'.............'....'...2001
ChaPitre 20
Informatique(RenéDÔrr,JeanSievert,VincentQuiniou,MartineÔtter)'''.'2005
2005 "'
1. Généralités""""""""" ? " 2005
1.1. Qu'est-ce que l'informatique """""""""' """' 2006
'1.2. Anatomie d'un ordinateur
"""""""" 2008
1.3. Logiciels """""""" 2010
1.4. Réseaux et Internet"' ""' 2012
2. Traitement o" r,inioriation dans les 1aboratoires..................""""" 2012
2.1' Préambule"' i"Ïott"tique de laboratoire (slL) ' 2012
2.2. lnformations traitées par le systèm" ' 2013
2.3. Dossier biologique du patient """""""""" 2013
2.4. Notions de codification """""""1"""""""""' sequ"ntiel de I'information" 2015
2.5. Enchaîn"r"nî", "Livités et traitement """"""""" 2032
2.6' Fonctionsgénérales"""":"""1""' relatif à un SlL -
2.7. Élauoratiori dlun car,i"r des charges ""' 2042
Procédures d'appel d'offres """ 2044
ru". le fournisseur""""""""""
2.g. Mise *rJrl-i, slL et relationr "" 2047
"n et suivi du S11"""".''
2'9' Gestion "' 2048
2.10' Optimisation du système"""' ".'"""""""' 2049
2.11' Exemples de documents""""""' """""""""' 2053
2.12. Glossaire"""""""""
ChaPitre 21
Coutté' Blandine Mellouet-Fort'
Santé publique (Marie-Bénédicte
MarcCarpentier,PhitippeSaliou,RonanGarlantézec)'...''..'.'.'2057
2057 "
1. Déf inition """"""""' 2058
z. population"""""""
État de santé de la
""""" 2058
2.1' lndicateurs"
_l
Table des matières XXV
Chapitre 22
Préf èvement sanguin - Approche du patient (Anne-Marie Dalger
avec la collaboration de Catherine Pochet et Michèle Poirot) . 2071
', Notions générales sur les prélèvements sanguins.... ................. 2071
1.1. Généralités.. ..........2071
1.2. Principales analyses sanguines.... .................. 2072
1.3. Modalités de réalisation et de transmission du prélèvement .............. 2073
: Moyens techniques ..................... ....... 2075
2.1 . Équipement et environnement............ ......... 2075
2.2. Matériels utilisés .. 2076
2.3. Entretien des matérie1s................... ............... 2078
: r,4éthodes de orélèvements.............. . 2078
3.1 Points de ponction
. .................... 2078
3.2. Technique de prélèvement.......... .................. 2080
: icnduite à tenir en cas d'incident ou d'accident . 2084
4.1. Au niveau du prélèvement............... ............. 2084
4.2. Au niveau du patient... ............. 2084
4.3. Au niveau du préleveur ............ 2084
i lcmportement vis-à-vis du patient .. 2086
Annexe
Ualeurs biochimiques usuelles (Nicolas Sicard, Philippe Chomard) ........... 2087
www.editions.lovoisier.fr
tililtilililliltilililril
978-2-7430-1299-1