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PASS/LASS
Noyau-Mitochondries-Peroxysomes
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Le noyau:
- Enveloppe, pores nucléaires et transport nucléo-
cytoplasmique
- Organisation de l'ADN dans le noyau
- Le nucléole et la biogénèse des ribosomes
- Les caryotypes
Mitochondries
Peroxysomes

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Noyau
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Membrane plasmique lysosome

R.E. rugueux
Vésicule
sécrétoires
noyau

membrane
Enveloppe interne
nucléaire membrane
externe
Appareil
de Golgi

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Noyau
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Le noyau: généralités

Présent chez tous les organismes eucaryotes


Limité par l’enveloppe nucléaire
Contient presque la totalité de l’information génétique (le génome nucléaire)
Cas général: 1 noyau par cellule (cellules multinucléées, syncitium, plasmode…)

Mise en évidence en microscopie:


- fluorescence: agents intercalant de l’ADN (DAPI, Bet…)
- colorants basiques: hematoxyline, bleu de méthylène…
- réaction de Feulgen: hydrolyse acide de l’ADN et révélation avec le
réactif de Schiff (détecte les aldéhydes)

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Noyau
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Le noyau: généralités
Exemple de syncytium: fibres musculaires
(muscles striés) Myofibrille

Sarcoplasme

Coupe
transversale

Le syncytium contient
plusieurs noyaux dans un Noyaux
cytoplasme unique périphériques
Sarcolemme

Le muscle strié :
Coupe
la fibre musculaire longitudinale
PASS/LASS Planche donnée pour information
Noyau
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Le noyau: généralités
Les cellules anucléées:

Organismes eucaryotes pluricellulaires peuvent contenir des cellules sans noyau,


issues de la maturation de cellules nucléées:

- érythrocyte chez les mammifères: perte du noyau de l’érythroblaste

- cellules du cristallin

- kératinocytes superficiels

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Le noyau: généralités

Polyribosomes libres

Nucléole
Enveloppe nucléaire

Noyau

Euchromatine

Chromatine
Hétérochromatine Reticulum endoplasmique rugueux

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Noyau
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Le noyau: généralités
Morphologie:

Forme variable:
- arrondi: neurones, hépatocytes…
- ovoïde: cellule musculaire, fibroblaste…
- polylobé: polynucléaires

Taille: 5 à 6 µm de diamètre

6% du volume cellulaire

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Le noyau: généralités
Morphologie:

6% du volume cellulaire: variable selon activité et type cellulaire

Rapport nucléo-protoplasmique:
(ou nucléo-cytoplasmique)

N/P : volume noyau/volume cellule

N/P faible: cellule différenciée adulte


N/P élevé: cellule jeune ou cancéreuse

Tableau donné pour information

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Noyau
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L’enveloppe nucléaire
Description:
Enveloppe constituée de 2 membranes:
- membrane externe: en continuité avec le RE
- membrane interne Nucléole
- espace périnucléaire
Nucléoplasme
Interface entre cytosquelette (cytosol) et le
nucléosquelette (nucléoplasme)

Enveloppe « percée » par les pores nucléaires

Pore nucléaire

Enveloppe nucléaire

Réticulum endoplasmique rugueux


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L’enveloppe nucléaire
La membrane externe:

Continuité membranaire avec le RER: contenu et fonction similaires

Interactions avec le
cytosquelette (MF d’actine,
microtubules et FI) par des
protéines transmembranaires

lamina
Récepteur
pour histones
ou protéines
PASS/LASS associées
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L’enveloppe nucléaire
La membrane interne:

Composition différente de la mb externe:

Canaux calciques: permet


libération de Ca dans le
nucléoplasme

Protéines transmembranaires
interagissent avec les
récepteurs cytosquelette (mb.
externe) et MF nucléaires:
continuité mécanique
cytosquelette-
nucléosquelette
lamina
Récepteur
pour histones
ou protéines
PASS/LASS associées
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L’enveloppe nucléaire
La membrane interne:

Interactions avec l’ADN et la lamina:

Récepteurs pour lamines:


Recrutement des lamines

Récepteurs pour histones ou


protéines associées:
Recrutement de complexes
ADN-histones-protéines
associées: rôle dans la
régulation de l’expression
des gènes
lamina
Récepteur
pour histones
ou protéines
PASS/LASS associées
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L’enveloppe nucléaire
Le pore nucléaire: structure

Diamètre: 120 nm 120 nm


Hauteur: 50 nm
Cytoplasme
Organisation en 8 unités répétées
(symétrie axiale d’ordre 8 et plan de symétrie) 50 nm

Nucléoplasme

120 nm

Pore Nucléaire 120 nm

MET
coloration négative
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L’enveloppe nucléaire
Le pore nucléaire: structure
Diamètre: 120 nm
Hauteur: 50 nm Symétrie d’ordre 8
Organisation en 8 unités répétées
(symétrie axiale d’ordre 8 et plan de symétrie)

Protéines constituant le pore nucléaire:


Nucléoporines (Nup) Plan de symétrie
~ 30 protéines connues

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L’enveloppe nucléaire

Le pore nucléaire: structure

2 anneaux centraux:
- cytosolique
- nucléoplasmique

1 petit anneau
nucléoplasmique

16 bras radiaires (2x8)

16 filaments (8 cytosoliques et
8 filaments de cage)

1 transporteur central
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L’enveloppe nucléaire
Le pore nucléaire: fonction
Huit canaux latéraux Transporteur central
Diffusion molécules < 40 kDa Diffusion molécules > 40 kDa

Fonctions de transport:
-Canaux latéraux: diffusion facilitée de
molécules < 40 kDa

-Transporteur central: translocation de


molécules > 40 kDa

Anneau cytosolique

Huit bras
Enveloppe nucléaire
radiaires
(face cytosolique)
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L’enveloppe nucléaire
Le pore nucléaire: fonction

Origine des nucléoporines:


-RE: protéines
transmembranaires, N-glycosylées
(coté lumière)

-Cytosol: autoassemblage de
protéines solubles, dont certaines
O-glycosylées

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L’enveloppe nucléaire
Le pore nucléaire: fonction

Fonctions des nucléoporines:


-Rôle structural: x 8

-Rôle de transport :
- séquence FG:
(répétition d’aa, ~ 30 % des Nup)
interactions avec complexes
import/export
- liaison à l’ADN
- sélectivité du pore

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L’enveloppe nucléaire Zone réservée pour
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Le pore nucléaire: fonction

Simulation numérique
des répétitions FG au
sein d’un transporteur
central du port
nucléaire

Les répétitions FG forment un « gel »: obturation de la lumière du transporteur central


Interactions FG-transporteur nucléaire (importines/exportines) nécessaires pour le franchissement

PASS/LASS Sci. Rep. 6, 29991; doi: 10.1038/srep29991 (2016).


Noyau
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L’enveloppe nucléaire
Le pore nucléaire: fonction

Les protéines à la périphérie du


pore:

-Importines et exportines

-Protéine G monomérique Ran

-Effecteurs de Ran:
-RanGAP: cytosolique
-RanGEF: nucléoplasmique

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L’enveloppe nucléaire

Biogénèse et rôle de l’enveloppe nucléaire

Pendant la division cellulaire:


- désassemblée en prométaphase
- réassemblée en télophase

Fonctions durant l’interphase:


- interactions avec l’ADN: contrôle de l’expression des gènes
- séparation physique et métabolique: échanges nucléo-cytoplasmiques

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Noyau
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Le transport nucléo-cytoplasmique:
Le cycle de la protéine Ran:

Effecteurs de Ran:
- gradient RanGTP
- gradient RanGDP

Translocation de Ran
(transporteur central)
sous forme de complexe :
- importine
- exportine

Transporteur central:
échanges bidirectionnels
= recyclage des constituants
des complexes
Double gradient de Ran : orientation du transport
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Le transport nucléo-cytoplasmique:
Complexes d’importation et d’exportation:

Importines et exportines: récepteurs à multiples affinités


-Liaison à la charge (cargo)
-Liaison aux motifs FG des Nup

Signaux d’adressage:
-NLS « classique » (Nuclear Localisation Signal), riche en aa basiques (K, R)
-NES (Nuclear Exportation Signal)
-NRS (Nuclear Retention Signal)
Translocation des protéines cargo sous forme repliées

Masquage/démasquage des signaux d’adressage par partenaires d’interaction


Modulation par modification post-traductionelles (phosphorylations)
REM: 40 % des protéines nucléaires ne possèdent pas de NLS classique…
(signaux encore inconnus)
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Noyau
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Le transport nucléo-cytoplasmique:
Formation du complexe d’importation (cytosol)

Imp. a Imp. b

Imp. b
Imp. a Imp. a
cargo cargo cargo

Importine a Importine b reconnaît l’imp. a Complexe compétent


reconnaît le NLS liée à la protéine à transporter pour translocation

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Le transport nucléo-cytoplasmique:
L’importation:

3: interaction RanGTP- imp. b


induit dissociation imp. a-cargo
cargo

Imp. a

Imp. b

cytosol

nucléoplasme RanGTP
RanGTP Imp. b
Imp. b
Imp. a

1: interactions 2: translocation cargo


Imp. a
imp. b – motifs FG par transporteur
central cargo

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Le transport nucléo-cytoplasmique:
Le recyclage des importines

RanGDP 2: hydrolyse du GTP après translocation:


libération d’imp. b à nouveau fonctionnelle
RanGTP
RanGAP
Imp. b Imp. b

cytosol

nucléoplasme

RanGTP 1: complexe RanGTP-imp. b


Imp. b

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Le transport nucléo-cytoplasmique:
Le recyclage des importines
RanGDP
RanGTP
2: hydrolyse du RanGDP
RanGAP GTP: dissociation
exportine
exportine
du complexe et
Imp. a
Imp. a
libération de imp. a exportine

cytosol

nucléoplasme

RanGTP
RanGTP 1: RanGTP- 3: retour de
exportine exportine exportine se exportine
Imp. a
lie à imp. a
Imp. a (signal NES)
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Noyau
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Le transport nucléo-cytoplasmique:

Transport de macromolécules: export


- ARNm
- sous-unités des ribosomes
- ARNt…

Transport de macromolécules: import


- protéines (histones, polymérase…)

Transport de petites molécules: diffusion libre à travers les pores nucléaires

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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Exemple du génome humain:

génome haploïde = 3.2 109 pb


=> Noyau = 6,4 109 pb

23 paires de chromosomes: ADN réparti en 46 molécules


- 1 chromosome = 50.106 à 250. 106 pb
1,7 cm à 8.5 cm si l’ADN était déroulé
=> noyau cellule humaine ≈ 2 m d’ADN
=> nécessité d’un compactage

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Double
hélice d’ADN

Collier de perles

Chromatine: ADN + protéines


Fibre de 30 nm
- euchromatine: chromatine
dispersée
Repliement
en boucle -Héterochromatine: chromatine
condensée

Forme condensée -Chromosome mitotique:


Spirale
interphasique chromatine hypercondensée

Chromosome mitotique
Chromosome métaphasique
Facteur
PASS/LASScompaction = 50 000
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Double
hélice d’ADN

Euchromatine active
(10 % euchromatine)
Collier de perles

Fibre de 30 nm
Euchromatine

Repliement
en boucle
Hétérochromatine

Forme condensée
Spirale
interphasique

Rem: hétéro/euchromatine: termes issus d’observations microscopiques


Autres méthodes pour structure et compaction de la chromatine (biophysique, etc…)
PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Le nucléosome: unité de base de
la chromatine

Enroulement de l’ADN sur cœur


d’histone (octamère): 1er niveau de
compactage:
- 1,65 tour d’ADN (146 pb)
- 2 copies/octamère de
chaque histone nucléosomique
(H2A, H2B, H3, H4)

Schéma donné
pour information

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Les histones

Petites protéines basiques:


- riches en K et R (longue extrémité N- ADN enroulé Région
terminale: site d’interaction) linker

- liaison à l’ADN indépendante de la


séquence (groupement phosphate) ( 11 nm)

- liaison à protéines
transmembranaires (mb. interne enveloppe
nucléaire)

Histones nucléosomiques: H2A, H2B, H3, H4


+ histone H1 Octamère histones
PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Protéines associées à l’ADN (chromatine)

- Les histones: modifications post-traductionelles modulent leur


fonctions/interactions: code histone

- Les protéines HMG (High Mobility Group): interactions avec l’ADN

- les protéines de structure : (ex: ADN topoisomérase II)

- autres protéines minoritaires

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Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: la fibre de 11 nm

Fibre nucléosomique (11 nm de diamètre):


- aspect en « collier de perles »: 1 « perle » = 1 nucléosome (1,65 tour, 146 pb)
- entre les « perles »: ADN de liaison (linker) de 0 à qqes pb

Chromatine décondensée expérimentalement: fibre de 11 nm


Barre = 50 nm

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Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: la fibre de 30 nm

Chromatine isolée directement à partir d’un noyau en interphase


Barre = 50 nm

Histone H1 intervient dans l’empilement de nucléosome (fibre 30 nm)

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: la fibre de 30 nm

Rôle des histones dans le compactage en fibre de 30 nm:


- extrémité N-terminale: « queue » flexible des histones
- site d’interaction: entre nucléosome, autres protéines…
- modifications post-traductionnelles: code histone

Fibre de 30 nm interrompue par courtes régions


sans nucléosomes (constitutives ou régulées)

Octamère d’histone
Schéma donné pour information
PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Double
hélice d’ADN

Collier de perles

Fibre de 30 nm

Repliement Niveau de compaction de


en boucle
l’ADN: les boucles

Forme condensée
Spirale
interphasique

Chromosome mitotique
Chromosome métaphasique
Facteur
PASS/LASScompaction = 50 000
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: les boucles

Nécessité du repliement en boucle:


- compaction de l’ADN
- zones décondensées permettant la transcription

Mise en évidence:
- chromosomes en écouvillon: prophase de 1ère division de
méïose (ovocytes d’amphibien)
- chromosomes polyténiques: larves de certains insectes
(drosophile, chironome…)

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: les boucles

Chromosomes en écouvillon: prophase de 1ère division de méïose


(ovocytes d’amphibien)

PASS/LASS
Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: les boucles

Chromosomes polyténiques: larves de certains insectes (drosophile,


chironome…)

Nombreux cycles de réplication de l’ADN


sans division cellulaires

Chromosomes restent appariés:


chromosomes polyténiques

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Niveau de compaction de l’ADN: les boucles

Boucle fonctionnelle = boucle MAR


Mécanisme de fixation des boucles:
Fibre
- régions MAR : nucléosomique
(Matrix Attachment Region) à la base des
Unité de
boucles
transcription

- charpente protéique:
Pendant division: dans les chromosomes
En interphase: matrice nucléaire
Région
régulatrice
Position des boucles variables
MAR
(selon cycle, type cellulaire…) MAR

Réseau fibreux de la matrice


PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau: la vidéo
Niveau de compaction de l’ADN: les boucles

Rôle des boucles MAR


dans la régulation de
l’expression des gènes

PASS/LASS
Noyau
Organisation de l’ADN dans le noyau: Zone réservée pour
la vidéo
Niveau de compaction de l’ADN: les boucles

Position des boucles variable


au cours du cycle cellulaire

Rôle dans l’organisation de la


réplication de l’ADN

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Condensation de l’ADN en chromosomes mitotiques
Cf cours Mitose-Méïose

De la fin de prophase au début de télophase:

- condensines: condensation de l’ADN des chromosomes


interphasiques en chromosomes mitotiques

- cohésines: appariement des chromatides sœurs

- condensation maximale à la métaphase

- centromère: séquence répétée, liaison au kinétochore

PASS/LASS
Noyau
Zone réservée pour
Organisation de l’ADN dans le noyau: la vidéo
Condensation de l’ADN dans les chromosomes interphasiques

Interphase: chromosomes décondensés


pas d’enchevêtrement aléatoire: territoires
chromosomiques

-Attachement à l’enveloppe nucléaire

-Localisation selon l’activité transcriptionelle

-Condensation variable le long d’un chromosome

Transcription: zones les moins condensées Territoires


chromosomiques

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau: la vidéo
Condensation de l’ADN dans les chromosomes interphasiques

Localisation de régions de chromosomes


selon l’activité transcriptionnelle:

Pas de transcription: zones proches de


l’enveloppe nucléaire

Forte transcription: zones particulière du


nucléoplasme

Rôle de la matrice nucléaire dans la


régulation de l’expression génique

Schéma donné pour information


PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Condensation de l’ADN dans les chromosomes interphasiques

Hétérochromatine constitutive: centromère, télomère, constrictions secondaires


- séquences d’ADN répétées
- pas de structure génique (pas de transcription)

Hétérochromatine facultative:
- contrôle l’expression génique (hétérochromatine = pas de transcription)
- niveau variable (cycle, type cellulaire, niveau de différenciation…)

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Condensation de l’ADN dans les chromosomes interphasiques

Le corpuscule de Barr:

-Hétérochromatine sexuelle
-Chromosome X inactivé dans noyau
mammifères femelles
-Inactivation au hasard de l’X paternel ou de l’X
maternel

Dosage génique entre mâle et femelle

PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Condensation de l’ADN dans les chromosomes interphasiques

Le corpuscule de Barr:

- présent dans toutes les cellules somatiques

- mis en place après le début de


l’embryogénèse:
femelles mammifères = mosaïque

- Réversible durant l’ovogénèse

Schéma donné pour information


PASS/LASS
Noyau
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Organisation de l’ADN dans le noyau:
Séquences d’ADN nécessaires à la formation d’un
chromosome eucaryote stable

- Les origines de réplication: Télomère


- réparties le long des chromosomes
- synchronisation partielle en phase S

- Séquences centromériques:
- formation du kinétochore
- attachement de l’ADN sur le fuseau mitotique Centromère

- Les télomères:
- extrémité des chromosomes: 5-10 kpb de
séquence répétée 5’-TTAGGG-3’
- vieillissement: raccourcissement

5’ (…)TTAGGGTTAGGGTTAGGG 3’ Subtélomère
PASS/LASS 3’ (…)AATCCCAATCCCAATCCC 5’
Noyau
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La matrice nucléaire:
La lamina nucléaire

- Organisation:
Face nucléoplasmique de la membrane interne: formation de l’enveloppe nucléaire

- Rôle des lamines (FI)


- lamine B ancrée par groupement farnésyl
- lamine A et C non ancrées
- récepteurs des lamines: prot.
transmembranaires

PASS/LASS
Noyau
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La matrice nucléaire:
La lamina nucléaire

- rôle dans la régulation de l’expression des gènes

- Liaison avec les pores nucléaires

- au cours du cycle cellulaire (cf cours


Mitose):
- désorganisation en prométaphase
(phosphorylation des lamines…): rupture
de l’enveloppe en prométaphase
- réassemblage en début de télophase

PASS/LASS
Noyau
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La matrice nucléaire:
Constitution fibreuse du nucléoplasme

- réseau sous-membranaire:
- composition inconnue, organisation ≠ du feutrage de lamines
- englobe le petit anneau nucleoplasmique des pores nucléaires

- Réseau fibreux (+ granules aux intersections)


- occupe l’ensemble du nucléoplasme
- rôle dans l’organisation de la chromatine

- Protéines variées:
- actine (MF) et protéines associées
- lamines A et C hors lamina
- particules ribonucléoprotéiques (RNP)
- enzymes du métabolisme ADN et ARN

PASS/LASS
Noyau
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Le nucléole:
Définition
Région intranucléaire bien individualisée:
- biogénèse des ribosomes
- présent à l’interphase
- contient des portions de chromosomes: régions NOR (codant pour 3
des ARNr)
Cellule eucaryote fabrique 2000-3000 ribosomes par minute

Régions NOR

PASS/LASS 5 chromosomes = 10 régions NOR


Noyau
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Le nucléole:
Notion d’organisateur nucléolaire: régions NOR

Organisation des gènes en tandem


(environ 20 copies)
Espaceur intergénique
non transcrit

ADNr ADNr ADNr ADNr

ARNr 45S

PASS/LASS
Noyau
Le nucléole: Zone réservée pour
Notion d’organisateur nucléolaire: régions NOR la vidéo

IGS: intergenic spacer


TU: transcription unit

Décondensation locale au sein des


constrictions secondaires
PASS/LASS
Noyau
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Le nucléole:
Notion d’organisateur nucléolaire: régions NOR
Tous les ribosomes d’une cellule (sauf
mitoch. et chloroplastes) sont fabriqués
dans le nucléole

ADNr
Fin
Début

Transcription ADNr par ARN pol I: ARN 45S

ADN

PASS/LASS
Noyau
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Le nucléole:
Structure

Microscopie photonique:
- forme, taille, nombre
- observation sur cellule
vivante ou après coloration Héterochromatine périphérique

Enveloppe
Microscopie électronique nucléaire
(MET): nucléole
- Région périphérique
granulaire
- Centre fibrillaire (1 ou pls)

PASS/LASS
Noyau
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Le nucléole:
Biogénèse des ribosomes
ARN 45S

Importation de Grande RNP


protéines:
-Polymérases
5S
-Protéines ribosomales Prot.
ribosomales
-Protéines de
maturation

Formation d’une Maturation


grande particule réalisée par
ribonucléoprotéique protéines et
(RNP) ARNsno (petits
ARN nucléolaires)
PASS/LASS
Noyau
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Le nucléole:
Biogénèse des ribosomes:

- action des 3 ARN polymérases (pol I, II et III)


- transfert des sous-unités par le pore nucléaire vers le cytosol
- assemblage des sous-unités dans le cytosol sur ARNm

Autres fonctions du nucléole:

Assurées en liaison avec d’autres régions du nucléoplasme:


- production de la PRS (Particule de Reconnaissance du Signal)
- maturation des pré-ARNt en ARNt
- etc…

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Définitions:

L’étude du caryotype « classique » est l’étude des chromosomes dans leur état
maximal de condensation

Selon nombre de copie de chaque chromosome: espèces haploïdes, diploïdes…


(1n: haploïde, 2n: diploïde…)

Autosomes et gonosomes (chromosomes sexuels, X et Y chez mammifères)

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:

Métaphase classée chez l’homme

Exemples :
Certaines fourmis 2n = 2
Drosophile 2n = 8
Lis 2n = 24
Homme 2n = 46
Chien 2n = 78
Carpe 2n = 104

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Définitions:

- Le caryotype est réalisé sur cellules somatiques

- Cellules isolées en mitose (généralement en métaphase)

- en biologie humaine:
- sur lymphocyte
- sur cellules fœtales (amniotiques par amniocentèse ou villosité choriales)

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Caryotypage classique sur lymphocytes:

1: prélèvement de sang
2: mise en culture (+ mitogène):
lymphocyte en lymphoblaste
3: synchronisation des cultures
(traitement colchicine)
4: rupture des membranes cellulaires
5: coloration
6: photographie
7: appariement par paire et
classement des chromosomes

Schéma donné
pour information
PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:

Observation après rupture des


membranes cellulaires et coloration

Métaphases à l’objectif 10X :


Culture de liquide amniotique
PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Métaphase à l’objectif 100X

Photographie

Culture de
lymphocytes

PASS/LASS
Noyau
Zone réservée pour
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Caryotypes:

Métaphase classée chez l’homme

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Observations après coloration standard (Giemsa):
Télomère

- Taille Bras court p

- position du centromère:
- bras court p
Centromère
- bras long q
- indice centromérique: Ic= p/(p+q)

- Constrictions secondaires (NOR)


Bras long q
- satellites Chromatide

- télomères
Télomère

PASS/LASS Structure d’un chromosome métaphasique


Noyau
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Caryotypes:
Observations après coloration standard (Giemsa):

Indice centromérique: Ic= p/(p+q)

PASS/LASS
Noyau
Zone réservée pour
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Caryotypes:
Classement d’après la longueur et l’index centromérique :
7 groupes de A–>G

métacentriques
A B

submétacentriques C
13 14 15

acrocentriques D E
21 22

F acrocentriques G C G
PASS/LASS
Noyau
Zone réservée pour
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Caryotypes:
Les gonosomes:

Région pseudo-autosomique 1
Chromosome Y: gène du PAR 1
déterminisme sexuel (SRY): Crossing-over obligatoire
transformation de la gonade primitive des chromatides non-soeurs
en testicule
SRY
Appariement X-X: comme
autosomes Centre d’inactivation en Xq13

Appariement X-Y partiel: régions


X Y
pseudo-autosomiques (PAR1 et
PAR2)

Méïose: crossing-over obligatoire


en PAR1 Région pseudo-autosomique 2
PAR 2
PASS/LASS
Noyau
Zone réservée pour
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Caryotypes:
Mise en évidence de bandes chromosomiques:

Traitement préalable à coloration Giemsa ou Molécules fluorescentes

Traitement physico-chimique (AT/GC): succession de bandes horizontales +/-


fortement colorées:
- caractéristiques d’une paire de chromosome
- reproductibles d’une mitose à l’autre
- caractéristiques d’une espèce donnée

Nombre de bande variable selon condensation de la chromatine:


métaphase: 200-500 bandes

Résolution: 5-10 Mpb

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Mise en évidence de bandes chromosomiques: Bandes Q

Bandes G et bandes Q:
-Bandes G:
- digestion enzymatique ménagée
- coloration Giemsa
-Bandes Q:
- quinacrine (fluo)
- profil Q = profil G

-ADN riche en AT

-Réplication tardive

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Mise en évidence de bandes chromosomiques:

Idéogramme Bandes G Bandes R


Bandes R:
-Dénaturation thermique ménagée
-Coloration Giemsa

-ADN riche en GC

-Réplication précoce

Technique haute résolution


prophase, prométaphase:
synchronisation des cellules

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Mise en évidence de bandes chromosomiques:
Bandes C NOR

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Cytogénétique moléculaire:

Bras ou bande
Télomérique

spécifique
(TTAGGG)n
FISH: Fluorescent in situ hybridization

-Cytogénétique et biologie moléculaire Sub-télomérique

Chromosome entier
-Fondée sur l’hybridation moléculaire Centromérique
(brins d’ADN complémentaire)

-Utilisation de sondes moléculaires


(ADN ou ARN)
Locus
spécifique
Sub-télomérique
Télomérique
(TTAGGG)n
Différents types de sondes ADN
PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes: Cytogénétique moléculaire:

sondes

chromosome

Longueur et nombre des sondes: résolution +/- élevée

Hybridation d’une sonde marquée sur échantillon ADN fixé sur support solide: FISH, Southern blot…

Hybridation de l’échantillon ADN marqué sur un ensemble de sondes fixées au support solide:
« puces » à ADN, hybridation génomique comparative (CGH)…

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Cytogénétique moléculaire:

FISH: Fluorescent in situ hybridization:

Avantages: Inconvénients:
- Ne nécessite pas de cellules en division: Étude ciblée conditionnée par le
- noyaux en métaphase ou interphase choix de la sonde: « on ne trouve
- applicable à nbreux tissus que ce que l’on cherche… »

- Bonne résolution

- Outils de recherche

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Cytogénétique moléculaire:
FISH: Fluorescent in situ hybridization:

Sondes télomériques Peintures chromosomiques

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes: Cytogénétique moléculaire:
FISH: Fluorescent in situ hybridization:

Diagnostic Prénatal (Trisomie 18)


sur amniocytes non cultivés Multifluorescence

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes: Cytogénétique moléculaire:
CGH: exemple de méthode basée sur l’hybridation

ADN à analyser: patient, tumeur…

ADN témoin: non malade, parents, tissus sain…

CGH au format « puce à ADN »: les 2 échantillons d’ADN sont marqués


(2 couleurs) et fragmentés avant l’hybridation sur la puce

Mesure des variations de quantité d’ADN à un locus précis par rapport


à un échantillon témoin

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes: Cytogénétique moléculaire:
CGH: exemple de méthode basée sur l’hybridation

« puce » à ADN pour CGH après hybridation

Quantification du signal fluorescent et


comparaison avec ADN témoin
rapport de fluorescence (Intensity Ratio)

Ex: mise en évidence d’une duplication

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Différentes méthodes d’étude:

Caryotype classique: bandes après coloration


Observation
Caryotype moléculaire: FISH (hybridation de sondes) microscopique

PCR (Polymerase Chain Reaction) et méthodes Analyse par


dérivées électrophorèse ou
mesure de
Hybridation génomique comparative (et autres types fluorescence
de puces ADN)

Séquençage Analyse de séquence


(bioinformatique)
PASS/LASS
Noyau
Zone réservée pour
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Caryotypes:
Formulation en cytogénétique humaine: Nomenclature
internationale
ISCN
Caryotype normal: 46, XX ou 46, XY

Caryotype anormal: (nbre de chromosome,


sexe chromosomique, description des anomalies
chromosomiques)

Description des anomalies chromosomiques:


- type: délétion, translocation…
- repère chromosomique: bras, région,
bande

DIFFERENTES
RESOLUTIONS
PASS/LASS Schéma donné pour information
Noyau
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Caryotypes:
Formulation en cytogénétique humaine:

Anomalies chromosomiques:
- constitutionnelles ou acquises
- homogène ou en mosaïque

Anomalies de nombre: 2n +/- 1, 2, 3,…chromosomes


47, XY, +21 45, X

Anomalies de structure:
- translocation réciproque: 46, XX, t(3;21)(p13;q22)
- translocation robertsonienne: 45, XY, der(14;21)(q10;q10)
- délétion: del(13)(q13q22)

Triploïdie (3n): 69, XXX ou 69, XXY: dispermie (accident de fécondation)

Tétraploïde, …
PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Anomalies de nombre: trisomies et monosomies

Origine de ces anomalies: non disjonction des chromosomes


- méïose: organisme homogène 47,XY,+21
- mitose: organisme mosaïque

Trisomie des autosomes:


- syndrome de Down
(mongolisme): 47, XX, +21 ou 47, XY, +21
1/900 naissance
- trisomie 18
- trisomie 13

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Anomalies de structure des chromosomes:
Anomalies touchant 2 (ou +) chromosomes:
46,XX,t(7;8)(q11.1;q21.2)

-Insertions

- Translocations:
- réciproques:
- robertsonienne: fusion
centrique de chromosomes
acrocentriques q11.1 q21.2

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Anomalies de structure des chromosomes:
Anomalies touchant 2 (ou +) chromosomes:
45,XY,der(14;21)(q10;q10)

-Insertions

- Translocations:
- réciproques:
- robertsonienne: fusion
centrique de chromosomes
acrocentriques

PASS/LASS
Noyau
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Caryotypes:
Anomalies cytogénétiques et pathologies humaines:

Anomalies présentes dans les lignées germinales (génération suivante):


- Avortements spontanés (fausses couches)
- Maladies congénitales:
- anomalies de nombre (ex: Trisomie 21)
- anomalies « visibles » de structure (ex: Cri du chat)
- anomalies identifiées au niveau génique (ex: mucoviscidose,
drépanocytose…)
- maladies autosomiques récessives

Anomalies acquises:
anomalies des cellules cancéreuses
Ex: le chromosome Philadelphie dans la Leucémie Myéloïde Chronique (LMC)
= création d’une protéine de fusion Bcr-Abl (activité kinase constitutive…)

PASS/LASS
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PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries:
- origine, caractéristiques morphologiques et biochimiques
- fonctions
- mitochondrie: source principale d’ATP
- cycle biologique des mitochondries
- adressage des protéines mitochondriales d’origine nucléaire

Peroxysomes:
- caractéristiques et biogénèse
- fonctions
- adressage des protéines aux peroxysomes

Fonctions oxydatives chez les deux organites

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: origine
Formation
du noyau
Transfert de gènes endosymbiote vers noyau

Cellule
ancestrale Cellule eucaryote Cellule eucaryote
anaérobie avec endosymbiote avec mitochondrie

Procaryote aérobie
PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: caractéristiques morphologiques

Matrice
Double membrane
Formation de crêtes par la mb interne

Membrane interne

Diamètre : 0.5-1 µm
Similaire aux bactéries

Membrane externe

Espace intermembranaire

PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)


MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: caractéristiques morphologiques
Méthodes d’étude
Fractionnement:
Lyse osmotique et centrifugation (différentielle et en gradient de densité):
Séparation des fractions:
- espace intermembranaire
- membrane interne
- membrane externe
- matrice
Analyse de la composition des différents compartiments de la mitochondrie

Microscopie:
- lumière visible: coloration au vert Janus B
- fluorescence: Rhodamine 123 et MitoTracker, GFP avec signal
d’adressage mitochondrial
Visualisation et suivi de la dynamique des mitochondries
PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: caractéristiques morphologiques

Membrane externe:
- transporteurs dont porines: pores aqueux laissant passer les petites
molécules (<10 kDa) vers et du cytosol
- les porines ne laissent pas passer les protons (H+)
- protéines de régulation de la fusion/fission des mitochondries
- complexes protéiques permettant l’accolement des 2 mb

Espace intermembranaire:
- accumulation des protons venant de la matrice
- procaspases et cytochrome C (implication dans l’apoptose)

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: caractéristiques morphologiques

Membrane interne:
- crêtes: surface x3 par rapport à mb externe
- présence de crêtes liée à la présence d’ATP-synthase (morphologie et
surface dépendent de la demande en ATP, ex: cellules cardiaques +++)
- perméases pour co-transport proton-molécules
- contient de la cardiolipine: phospholipide à 4 chaînes d’acide gras
- contient les enzymes de la chaîne respiratoire
- complexe protéiques permettant l’accolement des 2 mb

Matrice:
- enzymes du cycle de Krebs
- enzymes de dégradation des acides gras et pyruvate
- ADN mitochondrial, mitoribosomes, ARNt…

PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)


MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: caractéristiques morphologiques

PASS/LASS Biologie cellulaire, P. Cau, Ellipses


MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: caractéristiques morphologiques

Marquage fluorescent des mitochondries Marquage fluorescent des microtubules


(rhodamine 123) (anticorps)

Mitochondries: réseau dynamique associé au cytosquelette (déplacements)


PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: fonctions

fonctions principales:
- « respiration cellulaire »: production d’ATP et de CO2, consommation
d’oxygène et de molécule carbonées
- dégradation des acides gras (b-oxydation)
- participation à l’apoptose
- synthèse de métabolites: hème, hormones stéroïdes, hydroxylation de
molécules par cytochrome P450…
- contrôle des concentration cytosoliques en calcium, balance redox
(cofacteurs réduits ou oxydés),…

Intégration du métabolisme procaryote ancestral chez la cellule eucaryote

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
Membrane externe
Membrane interne
Matrice: transformation du
pyruvate et des acides gras
en acétyl-CoA

Cycle de Krebs: convertit


acétyl-CoA en CO2, produit
des cofacteurs réduit NADH et
Cycle FADH2
de
Krebs Chaîne de transport
d’électron: génère gradient H+,
O2=accepteur final d’e-
AG
ATP synthase: convertit
l’énergie du gradient H+ en
ATP
pyruvate acides gras
PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
Échanges avec le cytosol
Mb externe: échange
par perméases
Transport des e-
(cofacteurs réduits
cytosoliques) par
navettes passant
librement la mb ext.

Antiport ADP/ATP:
Symports
métabolite-proton:
Cotransports actifs

Différence de potentiel et gradient H+ permettent le co-transport actif à travers


mb interne: entrée ADP et métabolites (pyruvate, AG, phosphate), sortie ATP
PASS/LASS Biologie cellulaire, P. Cau, Ellipses
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
Échanges avec le cytosol: les zones d’accolement

Mégacanal: rôle dans


le déclenchement de
l’apoptose

Accolement entre les


mb grâce à complexes
protéiques

Cholésterol: précurseurs d’hormones stéroïdes

PASS/LASS Biologie cellulaire, P. Cau, Ellipses


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Mitochondries: fonction de génération d’énergie

Oxydoréduction et transfert d’électron

e- H+ 1:Transfert d’un électron du substrat


A A- AH vers un accepteur oxydé
2: un proton de l’eau neutralise la
Accepteur Intermédiaire Accepteur charge négative
d’e- oxydé transitoire d’e- réduit

1:Transfert d’un électron de l’accepteur


réduit vers une autre molécule (UQ…) AH AH+ A
2: un proton retourne à l’eau
e- H+
Glycolyse: production cytosolique de NADH
Cycle de Krebs et b-oxydation: production dans la matrice de NADH et FADH2
Accepteur final d’électron, l’oxygène: ½ O2 + H2 H20
PASS/LASS
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
Un métabolite central: l’acétylcoenzyme A

Pyruvate (glycolyse et catabolisme cytosolique des acides aminés): convertit en


acétyl CoA dans la matrice (rem: pyruvate convertit en éthanol ou acide lactique en
cas de fermentation)

Acides gras: formation cytosolique d’acyl CoA qui subit 4 réactions enzymatiques
dans la matrice (b-oxydation ou hélice de Lynen) aboutissant à une molécule
d’acyl CoA (-2 carbones) et un acétyl CoA + NADH et FADH2 par cycle

Acétyl CoA: alimente le cycle de Krebs qui aboutit à l’oxydation totale du groupe
acétyl de l’acétyl CoA en CO2 et génère des électrons de haute énergie. Ces
électrons sont captés par les cofacteurs (production de NADH et FADH2)
Les électrons sont ensuite transférés à la chaîne respiratoire de la mb interne
puis finalement à l’oxygène.
L’énergie dégagée est utilisée par l’ATP synthase pour réaliser la
phosphorylation oxydative (production d’ATP à partir d’ADP)
PASS/LASS
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
La chaîne respiratoire

Composée de 4 complexes protéiques membranaires contenant des atomes


métalliques récepteurs d’électrons (Fe, Cu et centres Fe-S) et 2 transporteurs
d’électrons (ubiquinone dans la membrane interne et cytochrome c soluble dans
l’espace intermembranaire)

Complexe I (NADH déshydrogénase): contient flavoprotéine, entrée des électrons


provenant du NADH et transfert à UQ
Complexe II (succinate déshydrogénase): enzyme du cycle de Krebs, entrée des
électrons provenant du FADH2 et transfert à UQ
Complexe III (complexe b-c1): récupération des électrons de l’ubiquinone réduit
(UQH2) et transfert au cytochrome c
Complexe IV (cytochrome c oxydase): récupère les électrons du cytochrome c
réduit et transfert à l’oxygène (formation d’eau)
Perte d’énergie des électrons à chaque étape
Complexes I, III et IV sont des pompes à proton (énergie dans gradient H+)
PASS/LASS
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
La chaîne respiratoire

PASS/LASS Biologie cellulaire et moléculaire, Karp, de Boeck


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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
La chaîne respiratoire

3 sources d’électrons pour la chaîne respiratoire:


- transfert d’électrons du NADH cytosolique à l’ubiquinone (navette glycérol-
phosphate)
- transfert d’électrons au NAD+ de la matrice (navette malate-aspartate)
- cycle de Krebs et b-oxydation dans la matrice (NADH et FADH2)

Génération du gradient de proton: stockage de l’énergie récupérée lors du


transfert d’électrons sous forme de gradient électrochimique (ddp et concentration)

Rem: cyanure et azide se fixent au cyt c et bloquent le transport d’électrons

PASS/LASS
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie

L’ATP synthase

Complexe protéique > 500 kDa


- « pied » transmembranaire : ATPase F0
- « tête »: ATPase F1

Complexe composé d’un rotor et d’un stator: passage de proton entraîne une
rotation qui active les sous-unités de la tête: phosphorylation ADP en ATP

Énergie électrochimique Énergie mécanique Énergie chimique


(gradient de proton) (rotation) (liaison phosphate ATP)

ATP synthase peut consommer de l’ATP pour pomper des protons dans
l’espace intermembranaire (régénération du gradient)

PASS/LASS
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie

L’ATP synthase

Espace intermb.

matrice

Synthèse d’ATP Hydrolyse d’ATP

PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)


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Mitochondries: fonction de génération d’énergie
métabolites Transport des protons
H+ H+
H+ H+ H+

Espace intermb

Mb interne

matrice

H+
H+
métabolites
H+
Protéines de découplage
symports Chaîne respiratoire ATP synthase (UCP UnCoupling Protein)

PASS/LASS
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Mitochondries: fonction de génération d’énergie

Les protons sont transportés à travers la mb interne des mitochondries:


- par l’ATP synthase (réversible)
- par les protéines de la chaîne respiratoire (vers l’espace intermb.)
- par les symports proton-métabolites (dont phosphate, pyruvate et AG)
vers matrice
- par les protéines de découplage vers la matrice

Protéines de découplages: permettent la génération de chaleur par la « graisse


brune » chez certains animaux (hibernation…) et les nouveaux-nés

La mitochondrie fournit également au cytosol:


- citrate pour biosynthèse d’ AG et de stérols
- OAA, a-cétoglutarate pour biosynthèse (AA…)
- cofacteurs réduits (ex: NADPH) pour biosynthèse
- régénère le NADH produit par la glycolyse (balance redox)
PASS/LASS
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Mitochondries: synthèses et coopération avec les autres
compartiments cellulaires

Synthèse des stéroïdes: mitochondries et RE lisse

Cytochrome P450 (mitoch: site actif dans la matrice, RE: dans le cytosol) utilisent
des électrons fournit par du NADPH via 2 transporteurs:

Les hormones stéroïdes sont libérées dans le milieu extracellulaire par des
transporteurs ABC (ATP Binding Cassette)

+ importation de phospholipides depuis la face cytosolique du RE

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: synthèses et coopération avec les autres
compartiments cellulaires

Stockage du calcium (en liaison avec RE):


La mitochondrie participe à l’homéostasie calcique de la cellule (+ libération dans
l’apoptose). Calcium influence le métabolisme mitochondrial

Communication mitochondrie-noyau: activation cytosolique de facteurs de


transcriptions (ex: NF-kB)

Radicaux superoxydes (02-):


Produit et catabolise ces radicaux toxiques. Peut également générer des radicaux
libres (implication dans le vieillissement…)

Défense antivirale:
Activation par l’ARN viral double brin (dsRNA) d’une protéine à la surface des
mitochondrie: activation de NF-kB (facteur de transcription)

PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)


MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: synthèses et coopération avec les autres
compartiments cellulaires
Rôle dans l’apoptose

Libération dans le cytosol de


cyt. c et procaspases
(apoptose)

Libération de calcium et de
proton (acidification cytosol)

Effondrement des gradients


et arrêt de la production
d’ATP

Ouverture des mégacanaux: parmi les premières étapes de l’apoptose


PASS/LASS Biologie cellulaire, P. Cau, Ellipses
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: cycle biologique
Les mitochondries sont des organites semi-autonomes

Présence d’un génome mitochondrial:


- variable selon les espèces
- circulaire (chez l’homme)
- contient les gènes pour ARNr des mitoribosomes et ARNt
- contient les gènes codant pour 13 protéines mitochondriales

Réplication de l’ADNmt indépendante du cycle cellulaire

Ribosomes mitochondriaux de type procaryote

Cycle de division/fusion régulé par GTPase sur les deux membranes

PASS/LASS
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Mitochondries: cycle biologique
Les mitochondries sont des organites semi-autonomes

Nombre de mitoch/cellule variable:


- type cellulaire
- demande en ATP (ex: cellule
musculaire)

Contrôle par la cellule hôte

Microscopie en fluorescence: Euglena


avec GFP mitochondriale et bromure
d’éthidium (ADN)
PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: adressage des protéines

Génome mitochondrial humain:


13 protéines synthétisées par mitoribosomes dans la matrice
Génome nucléaire:
400-500 protéines synthétisées par ribosomes libres dans cytosol
Les protéines mitochondriales codées par le génome nucléaire sont
adressées à la mitochondrie de manière post-traductionnelle

Majorité des protéine de la matrice: peptide signal N-terminal amphiphile (env


20 aa ) clivé après transport
Toutes les protéines de la mb externe + plusieurs de l’espace intermb et mb
interne: séquence signale interne non clivée

La translocation met en jeux des complexes protéiques:


- TOM ( Translocator Outer Membrane): à travers la mb externe
- TIM (Translocator Inner Membrane): à travers la mb interne
PASS/LASS- chaperonnes
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: adressage des protéines

+ chaperonnes
cytosol
TOM MME

Espace
intermb

TIM MMI

matrice
Clivage par signal
peptidase mitoch.

Protéines solubles de la matrice


PASS/LASS
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Mitochondries: adressage des protéines

cytosol
TOM MME

Protéines
Espace
Protéines solubles membranaires
intermb

TIM MMI

matrice

Protéines de la mb externe et espace intermembranaire


PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: adressage des protéines

Protéines codées par le génome mitochondrial

ARNm traduit dans la matrice par les ribosomes mitochondriaux

Protéines transmembranaires:
translocation co-traductionnelle dans la mb interne grâce à la translocase (OXA)
similaire au translocon du RE , puis association avec les sous-unités d’origine
cytosolique

Ex: sous-unité de l’ATP synthase et de la chaîne respiratoire

Les protéines nécessaires à la réplication de l’ADNmt et à son expression


(protéines ribosomales, polymérases…) sont codées par le noyau

REM: les protéines de la mb interne codées par le génome nucléaire sont insérées
dans la membrane de façon post-traductionnelle
PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: adressage des protéines

cytosol
TOM MME

Espace
intermb

OXA TIM MMI

matrice
Clivage par signal
ARNm peptidase mitoch.

PASS/LASS Protéine de la mb interne


MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: adressage des protéines

Autres acteurs de la translocation des protéines adressées à la mitochondrie:

- chaperonnes cytosoliques (dont Hsp70): liaison au peptide signal et


maintient de la protéine sous forme dépliée

- Hsp70 mitochondriale dans la matrice: « tire » la protéine vers la matrice


(consommation d’ATP), Hsp60 mitochondriale aide au repliement de la protéine

- potentiel de membrane (interne): composante électrique du gradient de


proton, permet la translocation de la protéine à travers le complexe TIM

- signal peptidase de la matrice: clive les peptides signaux N-terminaux

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Mitochondries: transmission et pathologies

Chez l’homme: transmission des mitochondries maternelles uniquement


(idem chez 2/3 des plantes à fleurs)

Il existe des sous-unités (codées par le noyau) de la chaîne respiratoire


spécifiques de certains tissus (ex: muscles squelettiques, cœur…)

Anomalies du génome mitochondrial (congénitales ou acquise) s’expriment


dans des cellules caractérisées par:
- forte consommation d’oxygène
- pas ou peu de renouvellement (ex: neurones et cellules musculaires)

Contribution au vieillissement: production d’ions superoxydes (O2-)

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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PEROXYSOMES

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Peroxysomes: caractéristiques et biogénèse

Organites à simple membrane


Taille: 0,1 à 1 µm
Vésicules reliées par des canalicules

Pas de génome ni ribosomes: totalité des protéines codées par gènes nucléaires:
majorité des protéines importées du cytosol + quelques protéines membranaires
du RE
Hors du système endomembranaire

Utilisent O2 dans 3 voies métaboliques:


- b- oxydation des acides gras à très longues chaînes
- production/dégradation du peroxyde d’hydrogène H2O2
- hydroxylation des molécules

PASS/LASS
MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Peroxysomes: caractéristiques et biogénèse

Vésicules + canalicules: matrice

Vésicules: peut contenir une région


paracristalline riche en protéines (ex: urate
oxydase chez le rat)

Transports à travers la mb:


- peroxines (importation des
protéines)
- transporteurs ABC (métabolites)

Rem: urate oxydase absente chez


Peroxysomes dans cellule de foie de rat les primates

PASS/LASS Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008)


MITOCHONDRIES ET PEROXYSOMES
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Peroxysomes: caractéristiques et biogénèse

Détection cytoenzymologique
de la catalase (x 28 600,
DAB+ H2O2)
de l’urate oxydase (x 50 400) Cellules de foie de rat

Localisation
Immunomarquage (billes d’or) d’enzymes dans
de la catalase (x 72 000) et la matrice ou
urate oxydase (x 61 600) dans la région
paracristalline

PASS/LASS
Histochem Cell Biol (2008) 129:421–440
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Peroxysomes: caractéristiques et biogénèse

Immunolocalisation par microscopie à


fluorescence

En rouge: anticorps contre SOD


mitochondriale

En vert: anticorps contre protéine de


membrane de peroxysome PMP70

Flèche: aspect « en collier de perles »


Insert: vésicules et tubules

Cellule d’hépatome humain (foie)

PASS/LASS Histochem Cell Biol (2008) 129:421–440


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Peroxysomes: caractéristiques et biogénèse
cytosol

fusion

noyau Rem: canalicules


non représentés
fission

Domaine
particulier du
RE Cycles de fusion/fission:
Bourgeonnement de Fusion (réseau) implication de Dynamin-related
vésicules et maturation protein (ex: Drp1)

Multiplication + création de peroxysomes au cours du cycle: nombre constant


PASS/LASS Prolifération en cas de changements métaboliques
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Peroxysomes: adressage des protéines

Toutes les protéines des peroxysomes sont synthétisées dans le cytosol


Des peroxines cytosoliques prennent en charge les protéines adressées au peroxysome

Protéines solubles:
- signal PTS-1: extrémité C-terminale
- signal PTS-2: extrémité N-terminale
- translocation grâce à peroxines cytosoliques + complexe d’importation

Protéines transmembranaires:
- PTS-2 si un seul domaine transmembranaire
- signal dans boucle matricielle entre 2 domaines transmembranaires
- insertion dans la membrane grâce à des peroxines cytosoliques

Intervention de protéines chaperonnes consommant de l’ATP: maintient de la


protéine sous forme dépliée
Pas de clivage des signaux d’adressages
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Peroxysomes: adressage des protéines
cytosol

Protéines membranaires Protéines de la matrice


Classe II
fusion

noyau

fission

Protéines membranaires
Classe I
Importation séquentielle des protéines du peroxysome:
- protéines membranaires de classe II (ou peroxines précoces) au
niveau du RE, rôle dans bourgeonnement et importation des autres protéines
- protéines membranaires de classe I, ex: transporteurs ABC
- protéines soluble de la matrice, ex: enzymes
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Peroxysomes: adressage des protéines solubles Zone réservée pour
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e: extraction de la
peroxine de la
membrane
f: déubiquitinylation
(recyclage)

a: fixation de la peroxine cytosolique (Pex5) sur la protéine cargo


b: arrimage du complexe sur un récepteur (peroxines)
c: insertion du complexe dans la membrane et relargage du cargo
d: ubiquitinylation de la peroxine cytosolique

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noyau

Transport RE—mitochondrie-peroxysome:
- vésiculaire: protéines et lipides
- non-vésiculaire: échange de lipides par protéines porteuses

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Peroxysomes: fonctions

Changements métaboliques: prolifération des peroxysomes (augmentation du


nombre par cellule)
ex: changement de source de carbone (glucose vers méthanol ou acides gras) chez la
levure

PPAR (Peroxysome Proliferator-Activated Receptor): famille de récepteurs nucléaires


contrôlant la prolifération des peroxysomes en réponse à différents lipides

Dynamique des peroxysomes: variable selon type de cellule, métabolisme,


médicaments, stress…

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Peroxysomes: fonctions

Dégradations (catabolisme et détoxification, génère H2O2 consommé par catalase):


- oxydation de nombreux métabolites (ex: éthanol)
- oxydation des acides aminés D (ex: D-proline, NMDA…)
- oxydation des purines
- b-oxydation des acides gras à très longues chaînes

Synthèses:
- acides biliaires: oxydation du cholestérol
- plasmalogène: phopholipide particulier (liaison ether avec un alcool gras)
présent par exemple dans le cerveau et coeur

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