RÉPUBLIQUE ALGÉRIENNE DÉMOCRATIQUE ET POPULAIRE

MINISTÈRE DE L’ENSEIGNEMENT SUPÉRIEURE ET DE LA RECHERCHE

SCIENTIFIQUE

UNIVERSITE BELHADJ BOUCHAIB D’AÏN-TÉMOUCHENT

Institut des Sciences

Département des Sciences de la Nature et de la Vie

Examen de biodiversité microbien

Réaliser par :

 Boudieb Soumia

Enseignant :

M.Zian

Année universitaire 2020 /2021

Introduction :

La biodiversité a une valeur en soi, sans devoir apporter un bénéfice pour l’être humain. La
biodiversité est le patrimoine naturel que nous laissons en héritage aux générations futures.
Notre société en est donc responsable éthiquement et moralement. Pour en savoir plus,
consultez notre argumentation.

La biodiversité est essentielle pour le développement naturel de tous les écosystèmes de

notre planète. Une grande biodiversité augmente la stabilité et l'adaptabilité de la biosphère
face aux modifications des conditions environnementales.

La biodiversité est indispensable au bien-être et à la santé des êtres humains: toutes les
sociétés et cultures de notre planète dépendent de l'utilisation d'une nature diversifiée . La
biodiversité possède une valeur à la fois économique, sociale, culturelle et esthétique.

Les avantages économiques de la biodiverstié sont fournis en grande partie par les services
écosystémiques, comme la pollinisation des cultures, le maintien d'un sol fertile pour la
production alimentaire, la transformation de déchets et de polluants, la régulations des
ravageurs des cultures par leurs ennemis naturels, la mise à disposition de matières
premières pour l'industrie ou encore la production de médicaments.
La théorie de l'évolution permet d'expliquer la diversité des formes de vie rencontrées dans la
nature, en partant du principe que chaque espèce vivante se transforme progressivement au cours
des générations, tant sur un plan morphologique que génétique. Or, l'évolution, un terme pour la
première fois employé par Charles Darwin en 1859, peut amener à l'apparition de nouvelles espèces.
Malgré son nom, il ne s'agit pas d'une théorie, et donc d'une hypothèse, mais bien d'un concept
aujourd'hui scientifiquement établi .

Définition de la théorie de l’évolution :

Une théorie de l'évolution est la description scientifique et cohérente de la formation et du

changement d'unités biologiques, en particulier d'espèces, à la suite de l'évolution biologique, c'est-
à-dire un processus de développement au cours de l'histoire de la Terre qui a eu lieu et se poursuit.

La théorie de l'évolution signifie généralement l'intégration de la théorie de l'évolution des

espèces par la sélection naturelle sélection naturelle de Charles Darwin avec le darwinisme, la
théorie génétique de Gregor Mendel comme base du patrimoine génétique, la mutation aléatoire
comme source de variation et la génétique des populations.

Les théories de l'évolution sont naturellement un produit de l'époque où elles ont été créées et
reflètent les connaissances respectives, les faits et les approches scientifiques de l'époque. Les
principaux architectes de cette intégration ont été Ronald Fisher, JBS Haldane et Sewall Green
Wright.

Essentiellement, la synthèse moderne de l'évolutionnisme introduit deux découvertes

importantes: l'unité de l'évolution (gènes) avec le mécanisme d'évolution (sélection naturelle). La
théorie synthétique de l'évolution représente également l'unification de plusieurs branches de
la biologie qui avaient peu de points communs auparavant, notamment la génétique, la cytologie,
la systématique, la botanique et la paléontologie.
 La théorie synthétique de l'évolution explique le changement d'espèce, y compris
les transformations du plan directeur (macroévolution), depuis environ 1950. C'est l'extension
cohérente des théories évolutionnistes classiques de Charles Darwin et Alfred Russel Wallace,
complétée par August Weismann, grâce à la connaissance combinée de la génétique,
Paléontologie, zoologie, botanique et systématique. Dans l'oeuvre de Darwin, The Origin
of species (1859, 6ème édition 1872), ces découvertes, découvertes ou développées seulement après
sa mort, manquaient en premier lieu aux recherches de Weismann. Jusqu'à la synthèse, ces
disciplines étaient séparées.

La théorie synthétique de l'évolution est parfois confondue avec le "néo-darwinisme".

Le zoologiste August Weismann (1834–1914) a fourni les concepts de la théorie de Neodarwin, qui a
fait évoluer les biologistes évolutionnistes au 20e siècle. La théorie de la synthèse a été créée en 1937
pour la première fois par Theodosius Dobzhansky et en 1942 par Ernst Mayr et Julian Huxley.
Puisque la biologie évolutionniste moderne traite de nombreuses approches et analyses parfois
très différentes, où des hypothèses temporaires sont souvent conçues puis abandonnées à nouveau
au profit d'hypothèses plus raffinées, il existe maintenant un consensus sur le fait qu'il ne faut pas
parler d'une "théorie de l'évolution" réelle et globale, plutôt, qu'il existe, pour ainsi dire, une
construction de théories, où de nombreux brins de connaissances allant de la paléontologie à
la biologie moléculaire se rejoignent et se complètent pour former une vue d'ensemble. Un aperçu et
d'autres liens sur le contenu central des théories actuelles sont sous Évolution, les hypothèses et
théories actuellement discutées sur l'origine de la vie.

Lorsqu’on observe un groupe d’organismes vivants, on voit que tous possèdent des caractères
spécifiques propres à l’espèce à laquelle ils appartiennent, mais que tous les individus d’une même
espèce sont différents les uns des autres. Ils ont des caractères propres à chaque individu
(le phénotype), qu’ils soient morphologiques (taille, couleur des yeux ou forme des poils),
anatomique (caractères sexuels), physiologiques voire pathologiques (maladies génétiques, par
exemple)

Selon Darwin, chaque nouvelle génération d’une espèce donnée est constituée d’individus qui ont,
malgré leur ressemblance, des aptitudes différentes pour survivre dans leur milieu. Chaque individu
présente ainsi une combinaison unique de caractères (physiques, génétiques, d’aptitude à s’adapter
au milieu…) de l’espèce à laquelle il appartient. Face aux contraintes et aux changements de leur
environnement (climat, prédation, parasites, ressources…), certains auront du mal à survivre et à se
reproduire et finiront par disparaître. D’autres s’adapteront plus facilement et survivront. Ils
transmettront alors leurs caractères avantageux à leur descendance.

L’ensemble des individus d’une même espèce, génétiquement différents, vivant dans une aire
géographique relativement restreinte représente une population. Lorsque une population d’une
espèce donnée se retrouve géographiquement isolée, les individus vont se développer plus ou moins
rapidement si les conditions de vie sont satisfaisantes. Génération après génération, ils vont
développer des caractères ou aptitudes différents de ceux des populations d’origine. On parle de
diversité au sein d’une même espèce ou intraspécifique. L’étape ultime de cette divergence est
lorsque les individus de cette population sont devenus incapables de se reproduire avec les individus
de l’espèce d’origine. Une nouvelle espèce est née (Figure 1). Un exemple classique est celui
des pinsons de Darwin .
 L’importance de la géographie dans la spéciation, déjà imaginée par Alfred R. Wallace  au
19e siècle, sera utilisée par Alfred Wegener lorsqu’il émet, en 1915, l’hypothèse de la dérive des
continents (ancêtre de la Tectonique des plaques actuelle). Ayant constaté que les espèces fossiles
animales et végétales étaient très semblables sur les continents américain et africain jusqu’au début
de l’ère secondaire (-200 millions d’années), époque à partir de laquelle les fossiles divergent sur
chacun des continents, Wegener imagine alors que ces derniers ont été formés à partir de
l’éclatement d’un super-continent, la Pangée. Un exemple classique est celui des oiseaux du groupe
des Ratites : Autruche d’Afrique, Nandous d’Amérique-du-Sud, Émeus d’Australie, Kiwis de Nouvelle-
Zélande qui se sont différenciés à partir d’un ancêtre, sorte de « paléo-autruche », répandu sur la
Pangée.

Figure 1. Représentation théorique de la

spéciation au cours de l’évolution. Chaque boule représente un individu et les traits symbolisent des
croisements. Une espèce correspond donc à une sous-partie du réseau généalogique qui est
définitivement divergente du reste du réseau. Du point de vue temporel, une espèce est encadrée
par un événement de spéciation, à l’origine de cette espèce, et par un événement mettant fin à cette
espèce (soit une spéciation, soit une extinction).

Une spéciation se définit par la division définitive de fragments du réseau généalogique: D’après
Lecointre C’est l’ensemble de ces processus (biologiques, géologiques…) qui fait qu’au cours des 3,8
milliards d’années qui ont permis à la vie de se développer, les espèces vivantes ont pu se diversifier.
On est passé successivement d’un monde exclusivement constitué d’organismes sans noyau (Archées
et Bactéries) aux organismes monocellulaires puis pluricellulaires avec un noyau individualisé (les
Eucaryotes), devenant ainsi de plus en plus diversifiés La formation et l’extinction naturelle des
espèces sont des processus lents. On estime en effet que la durée de vie moyenne d’une espèce est
de 2 à 10 millions d’années. Mais quels sont les mécanismes responsables de l’évolution ?
Alors que Darwin développe sa théorie, Mendel  découvre comment les caractères d’un organisme
vivant se transmettent de génération en génération. Cette découverte, passée inaperçue à l’époque,
est à l’origine du développement de la génétique qui allait permettre de comprendre les mécanismes
à l’origine de l’évolution des espèces. L’intégration de la génétique à la théorie de Darwin s’est
progressivement faite dans la première moitié du 20 e siècle. Il faudra cependant attendre la
découverte, en 1953, de la structure de l’ADN (acide désoxyribonucléique) par Watson et Crick  et la
caractérisation de son fonctionnement pour reconnaître le rôle de l’ADN comme support de
l’hérédité et marqueur de la descendance d’un organisme vivant.

Les propriétés du génome des êtres vivants. vont être disséquées, de même que les mécanismes
conduisant aux mutations et recombinaisons affectant les individus et indispensables pour
l’adaptation des populations aux modifications du milieu, c’est-à-dire pour l’évolution. La diversité
 intraspécifique est en fait une diversité génétique. Les variations induites par les mutations
génétiques sont responsables du polymorphisme  des individus .Ces mutations peuvent être «
neutres », « faiblement délétères » ou « favorables » du point de vue de la sélection naturelle. Elles
sont, ou non, conservées dans le patrimoine génétique de l’espèce ou d’une sous-population par
différentes adaptations. Chaque espèce présente donc une combinaison unique de gènes, mais
chaque individu d’une même espèce va présenter des caractéristiques qui permettent de le
distinguer des autres individus de cette espèce.

Un niveau de régulation encore plus fin permet de comprendre, par exemple, les différences
existant chez des vrais jumeaux. C’est la régulation épigénétique qui concerne toutes les
modifications, matérialisées par des modifications biochimiques (un groupement méthyle CH 3, par
exemple) de l’ADN et qui ne sont pas codées par la séquence d’ADN. Elles permettent une lecture
différente d’un même code génétique et s’expriment lors du développement de l’organisme. Si
certaines marques épigénétiques sont transitoires, d’autres ont une remarquable pérennité et
pourraient même passer à la descendance, mais généralement de manière transitoire. Cependant,
ne reposant pas sur des changements de la séquence d’ADN, ils ne modifient pas la structure
génétique de la lignée concernée et un processus de spéciation est donc exclu .

Une théorie de l’évolution, mais plusieurs modèles

Différents modèles ont vu le jour au cours de l'histoire pour expliquer l'évolution des espèces. Les
principaux sont :

 le transformisme de Jean-Baptiste Lamarck, qui dit que les organismes s'adaptent à leur

milieu ;
 l'évolutionnisme de Charles Darwin, qui avance que l'évolution se fait par sélection naturelle.
En d'autres termes, ce sont les organismes les mieux adaptés à leur environnement, grâce à de
nouvelles mutations, qui survivent et transmettent leurs gènes ;
 le néodarwinisme, qui conserve le concept de sélection naturelle, mais qui précise en plus
que l'évolution est graduelle et que les changements évolutifs par mutation sont soit de type
anagenèse (une nouvelle lignée remplace une ancienne), soit de type cladogenèse (deux nouvelles
lignées se scindent à partir d'une lignée ancestrale) ;
 les équilibres ponctués de Stephen Jay Gould et Niles Eldredge ne diffèrent du précédent
modèle que sur un point : les espèces évolueraient lors de périodes ponctuelles séparées par des
périodes stagnantes, et non de manière graduelle.

Pendant ces derniers siècles de nombreux scientifiques ont essayé  de comprendre le

fonctionnement de la vie, pour cela ils ont  fait de nombreuse théories (comme le transformisme).Le
plus célèbre parmi ces scientifiques est certainement Charles Darwin. Il a mis au point la théorie de
l’évolution dans son célèbre livre l’origine des espèces. Il dit que les espèces évoluent grâce à la
sélection naturelle : les animaux qui obtiennent des caractères « bénéfique » pour leur survie ont
plus de chance de se reproduire et de transmettre leur caractère au génération futur (c’est
l’hérédité).

Lorsque Darwin a fait connaître sa théorie au grand publique il y eu une grande polémique :
l’église de l’époque mais aussi de nombreux scientifiques croient seulement à la version biblique de
la création de la vie.

Aujourd’hui encore la polémique persiste entre scientifiques qui défendent la théorie de

l’évolution de Darwin améliorée (néo-darwinisme) et les créationnistes qui contredisent toutes les
preuves des scientifiques et croient aussi seulement à la version biblique.
Ceci est un grand problème comme surtout aux Etats-Unis ou le sujet de l’évolution est tabou
cela  posent des problèmes par exemple pour l’éducation.