LIAISON GENETIQUE ET

CARTOGRAPHIE DES GENES

Pr. Ag. Rania SAKKA

Année universitaire: 2022-2023

Définitions

• La liaison génétique fait référence à la transmission comme une seule

unité de gènes situés sur le même chromosome.

• Des gènes liés désignent des gènes portés par un même chromosome et
suffisamment proches pour être transmis ensemble.

• Les gènes liés ne s'assortissent pas indépendamment et ne donnent

pas les proportions mendéliennes attendues pour des gènes
indépendants
Liaison génétique: Comment identifier ?
Croisement: fleurs violettes et à des grains de pollen
longs (génotype PPLL) avec des plantes pures à fleurs [PL ]
rouges et à des grains de pollen ronds (génotype
P: × [pl]
ppll)
Caractères: PPLL ppll
G:

C1: couleur des fleurs chez le petit pois .

C2: forme des grains de pollen chez le petit pois. 1 pl
Gamètes 1 PL
Gènes: 2 gènes
Localisation: autosomale F1: 100% PpLl
Allèles : G1: P (couleur violette)
[PL ]
p (couleur rouge)
G2: L (forme longue)
l (forme ronde)
Relation entre les allèles:
P>p et L>l
Liaison génétique: Comment identifier ?

Comportement des gènes liés lors de la

méiose chez un individu de la F1.
Liaison génétique: Comment identifier ?

F1x F1: P: [PL ] × [PL ]

G: PpLl PpLl

Gamètes: ½ PL ½ pl ½ PL ½ pl

Gènes liés et il n’ ya pas eu lieu de

recombinaison entre les gènes G1 et G2
pendant la méiose.

¼ PPLL ¼ PpLl ¼ ppll ¼ PpLl

=
Génotypes: ¼ PPLL + ½ PpLl + ¼ ppll

Phénotypes: ¾ [PL] + ¼ [pl]

Liaison génétique: Comment identifier ?
Il y a eu une recombinaison entre les
gènes G1 et G2 pendant la méiose. P: [PL ] × [PL ]
F1x F1:
(?: proportion inconnue) G: PpLl PpLl

PL pl Pl pL PL pl Pl pL
Gamètes:
? ? ? ?
? ? ? ?

? PPll

? ppLl

? PPLL ? PpLl ?ppll ?PpLl

Génotypes:

Phénotypes: 15 [PL] + 4[pl] + 1 [pL] + 1[Pl]

La liaison génétique :comment identifier ?

• Exception à la loi de l‘assortiment indépendant des gènes

(3ème loi de Mendel)

• Modifications du rapports 9:3:3:1 en cas de dihybridisme

• Le crossing over perturbe la liaison.

• Le crossing over rassemble les combinaisons alléliques recombinantes des

gènes dans les gamètes.
Liaison génétique: Gènes en couplage/répulsion :
Couplage/répulsion: termes utilisés pour décrire les configurations des gènes liés chez
les dihybrides.
Gènes en « couplage » Gènes en « répulsion »

Deux allèles dominants sont sur un chromosome Un allèle dominant et un allèle récessif sur
Deux allèles récessifs sont transmis sur l'autre chaque chromosome
chromosome
 Gènes liés : comment mesurer la distance qui les sépare?
• Hunt Morgan:
- Etude de la transmission de plusieurs de
couples de gènes liés chez la drosophile.
- Résultats:
la taille des classes avec des génotypes
recombinants variait en fonction des
combinaisons des gènes étudiés.
- Hypothèse: Les différences pourraient-elles
refléter la relation physique des gènes sur le
chromosome ?
• Sturtevant:
Explication:
- la variation est due à la variation de
la fréquence de recombinaison
- plus les deux gènes sont éloignés l'un
de l'autre sur un même chromosome,
plus il y a une chance de
recombinaison entre ces deux gènes.
= Une corrélation entre la fréquence de
recombinaison et la distance entre les gènes
Corrélation entre la fréquence de recombinaison et la distance entre les gènes

Le crossing over est plus susceptible de se

produire entre les gènes liés A et B
ou entre A et C, largement espacés, qu'entre les
gènes liés B et C plus étroitement espacés
Estimation de la distance entre deux gènes par la fréquence de recombinaison

• 1 % de recombinaison= 1cM (centimorgan: unité cartographique)

• Gènes A et B distants de 1 cM équivaut à 1 % de recombinaison entre les gènes A et B.
• Physiquement, 1 cM est approximativement égal à 1 million de paires de bases d'ADN
(1 Mb).
• Comment déduire la fréquence (pourcentage ou le taux) de recombinaison entre deux
gènes liés?

= pourcentages des descendants qui sont recombinants

= nombre de génotypes recombinants

× 100
nombre total des génotypes
Estimation de la distance entre deux gènes par la fréquence de recombinaison

- Si le taux de recombinaison est de 0% : les gènes sont très proches et liés

- Si le taux de recombinaison est de 50% : les gènes sont éloignés et ne sont pas liés
Cartographie génétique
= établir la carte de liaison génétique = établir la fréquence de recombinaison entre
toutes les paires possibles des gènes liés à cartographier.
Ex: Cartographier les gènes X, Y et Z:

- Le pourcentage de recombinaison entre X et Y = 10

- Le pourcentage de recombinaison entre entre X et Z = 4
- Le pourcentage de recombinaison entre entre Z et Y = 6

l'ordre des gènes sur le chromosome est X-Z-Y

 Cartographie des gènes en pratique médicale
❖Intérêt:
• Clonage des gènes de maladies
• Tests de diagnostic génétiques

❖ Approches:

• Mesure de la fréquence de recombinaison entre un marqueur et le gène

d’intérêt

• Mesure déséquilibre de liaison entre les allèles de plusieurs marqueurs liés et

le gène d’intérêt.
Cartographier des gènes à l’aide de marqueurs de l’ADN
❖Marqueurs de l’ADN:

• Des segments particuliers de l’ADN très polymorphes dans la

population (RFLP, minisatellites , microsatellites , SNP)
• Proches des gènes d'intérêt et servent comme points de repère.
• Ces marqueurs n’ont pas nécessairement une fonction particulière
(code une protéine, ARN…)
• Nous avons la possibilité de les identifier en laboratoire
Fréquence de recombinaison entre un marqueur et un gène d’intérêt

❖Avec deux allèles particuliers (un allèle du marqueur et un autre du gène) , nous
pouvons déterminer si ces deux allèles sont transmis ensemble dans les gamètes
(liés) ou si ses allèles se séparent (non liés) .
1- les allèles sont sur deux chromosomes différents :
• Non liés
• 50% de recombinaison

2- les allèles se trouvent éloignés sur le même chromosome:

• Non liés
• 50% de recombinaison

3- se trouvent proches sur le même chromosome

• Liés
• Moins de 50% de recombinaison
 Le gène et le marqueur
sur des chromosomes
différents.
Si une cellule obtient G1
alors il y 50% de chance
G est le gène à localiser : allèles G1 et G2 G1 qu’elle aura M1 et 50%
M: allèles M1 et M2
de chance qu’elle aura
M1 M2
G et M ne sont pas liés
G1 G2
Pas de recombinaison

M1 M2
G1

M2

recombinaison

G: allèles G1 et G2
M: allèles M1 et M2
Le gène et le marqueur
sont proches sur la même
chromosome.
G1
M1 Si une cellule obtient G1
alors elle a plus de chance
d’avoir aussi M1.

G1 G2
M1 M2 Plus de 50% de chance G et M sont liés

G1
M2

Moins de 50% de chance

Fréquence de recombinaison et cartographie

Maladie autosomique dominante

à pénétrance complète

M: Marqueur à deux allèles (1 ou 2)

- Existe t-il un lien entre l’allèle d’un marquer et l’allèle de la maladie ?

- Quelle est la distance entre le gène et le marqueur?

1. Établir la phase de liaison entre l'allèle pathogène du gène et un

allèle du marqueur dans la famille.

2. Déterminer s'il existe un liaison entre les deux allèles (allèle

pathogène et un allèle du marqueur).

3. Si la liaison existe, estimez la fréquence de recombinaison.

Fréquence de recombinaison et cartographie

Maladie autosomique dominante

à pénétrance complète
AM1/aM2

M: Marqueur à deux allèles (1 ou 2) AM1/aM2

A: allèle pathogène
A: allèle normal

Un haplotype est la combinaison

d'allèles sur un seul chromosome: AM1/aM1 AM1/aM1 AM1/aM1 AM1/aM1
Haplotypes AM1 et aM2 chez II2
Recombinant
Fréquence de recombinaison et cartographie

• Estimer la fréquence de recombinaison:

Sur six enfants, il n'y a qu'un seul recombinant (III-6). La fréquence de

recombinaison estimée dans cette famille est de 1/6, soit 17 %.

• On combine les résultats de plusieurs familles

• Des logiciels numériques comptabilisent la fréquence à laquelle les gènes
et les marqueurs sont hérités ensemble et expriment « l'étroitesse » de
la liaison entre un marqueur et le gène d'intérêt sous la forme d'un LOD
score (le logarithme des côtes).

• Un LOD score de valeur de 3 ou plus signifie une liaison.

Déséquilibre de liaison et gène d’intérêt
• Séquences d’ADN en déséquilibre de liaison: sont presque toujours
héritées ensemble
• Diagnostic indirect des maladies/ suivre la transmission d’un chromosome
porteur d’un allèle muté

Mucoviscidose

Autosomique récessive

L'haplotype 2222 est

Un haplotype est la combinaison
lié à l'allèle mutant d'allèles sur un seul chromosome.
du gène CFTR
Objectifs éducationnels :

1-Définir le concept de la liaison génétique .

2-Reconnaitre l'historique de la cartographie par recombinaison
génétique.
3-calculer la distance génétique entre deux gènes liés en se basant sur
la fréquence de recombinaison.
4- Utiliser les haplotypes pour déterminer la transmission des
chromosomes.
 A suivre….

Epigénétique et empreinte parentale