Parasites obligatoires

Des virus qui mangent les bactéries

Tous les
virus
Une structure stable chez les virus (Tous les
Sp d'une virus possèdent des capsides)
phage

Comme seringue
 Les virus sont plus abondants que
les bactéries et les archées et les
eucaryotes

Sont les virus qui détermine

la composition d'un
écosystème
 Eclatement des cell bactériennes
et libération des phages formés

Queue
Utilisée la machinerie
cell

Le virus qui gagne

Plage de lyse : découverte par Hérelle

Non soignés par ATB

 Un choix quand l'antibiothérapie ne marche pas, cette phagothérapie porte un avantage tres important

Tq : Microbiote

Tq : sur les reins

Ne peuvent
pas être
attaqués par
les
bactériophages
prend son temps
Exemple : Le transfert d'un gène de résistance aux ATB d'une bactérie résistante à
une autre non résistante (Souvent les 2 bactéries sont du même espèce)

phénomène de transduction
 (Les étapes de la transduction)

Intégration / Introduction
du fragment de l'ADN de
la cellule donneuse dans
l'ADN de la cell
receveuse se fait par
recombinaison
homologue (Car les 2
bactéries sont de la
meme espèce)
Fonction métabolique du lactose

Homologie car même espèce

Fragmenté

Recombinaison homologue
Tjrs pour : phage tempéré

Réparer un gène
 Phage tempéré se termine par devient phage lytique

Mais
Donc la bactérie doit développer
 La bactérie secrète des protéines qui vont masquer le Rec

La bactérie n'exprime pas à sa surface le Rec

Rec muté et donc non reconnu par le phage

Très élevé pour la bactérie (Cout chère de mettre en

place ces stratégie par la bactérie)
Sp de

Good

But
Phage tempéré confère à la bactérie qu'elle
infecte la capacité de synthétiser des
protéines empêchant la surinfection par un
autre phage

Ceci est utilisé en secteur de production

agroalimentaire particulièrement des produits
laitières (Tq les bactéries qui seront utilisés
pour synthétiser des produits laitières :
Bifidobacterium)
 La bactérie utilise un Sys de méthylation pour protéger son ADN de la coupure : Tous ce qu'il est méthylé sera protéger de la coupure et donc la bactérie va méthylé son propre ADN

(Coupe aléatoire et à l'aveugle)

Assure le transfert de groupement méthyl sur ADN bactérien Couper l'ADN non méthylé (Etranger pour la cell bactérienne y compris celui phagique)
Echappement des virus :

Donc l'ADN ne sera plus reconnu

par les enzymes de Restriction

ADN phagique devient également méthylé et donc

protéger des endonucléases
Equivalente du Sys d'apoptose chez la cell eucaryote

Les phages ne se multiplient pas

et vont mourir avec la cell et les
bactéries avoisinantes ne seront
pas infectées
Déclanchement du Sys abortif = Abi (qu'est
normalement réprimé)
Les mécanismes que nous avons vus au départ fait
partie de l'immunité innée mais celui ci fait partie de
l'immunité adptative car la bactérie doit rencontrer deja
la phage pour ensuite se protéger contre lui
Ont trouvés

Seq complémentaires entre elle : Le brin peut se remplie sur lui même et formant des structures en épingle à cheveux
 par le phage qui comporte dans son génome la Seq
d'ADN qui s'intércale entre les répitions de CRISPER que
la bactérie possède dans son génome
Comme : Une auto-vaccination des bactéries contre les phage
En 2020

Protéine d'activité enzymatique de type nucléase
Mémoire de l'épisode d'infection
cette bactérie à été au départ infecté par phage 1
puis phage 2 (chronologie par rapport au promoteur)
Seq d'ADN viral acquit lors l'infection des bactéries par le phage
En gros : Endonucléase qui sera guider par CRISPER
ADN viral qui n'a pas encore Mémoire de la nature de l'infection
intégrer le génome bactérien
spacer de couleur rouge : ADN d'un phage 1
spacer de couleur jaune : ADEN d'un phage 2
lutte contre 2 phages différents
ADN viral archivé après infection par un phage
qu'il s'agit d'ADN phagique

qui Indique pour

Au niveau moléculaire

Seq indique à la bactérie le protospacer

Découper + l'intégrer dans le génome bactérien

Réplication
(Etape de transcription)

Guidant la Cas 9
Lors l'infection par le phage
Un phage pour lequel la bactérie est immunisé Un phage pour lequel la bactérie n'est pas immunisé
 Ce que nous avons développé est Cas type 2

Différent par :

Se sont les guides

C'est la nucléase qui sera guidé par CRISPR
II et qui va dégrader l'ADN phagique
 (Par les phages)

Action sur les protéines du Sys de CAPERCAS9 :

La rendre inactive
le virus est le plus abondants
A cause des mécanismes d'échappement à ce mécanisme