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Cours 1 – 2019/2020
Cellule eucaryote
Cytoplasme
Noyau
ADN
Unité de TRANSCRIPTION
transcripLon
Introns Exons
Coiffe MATURATION DE L’ARN
ARNm
TRANSPORT
ARNm
TRADUCTION
Protéine
LE RIBOSOME EST LE LIEU DE SYNTHÈSE DES PROTÉINES À PARTIR DE L’ARNm
LE RIBOSOME EST CONSTITUÉ D’UNE ASSOCIATION DE PROTÉINES ET D’ARNr
LES RIBOSOMES SONT FABRIQUÉS DANS LE NUCLÉOLE
LES RIBOSOMES SONT DANS LE CYTOPLASME ET ATTACHÉS AUX MEMBRANES
DU RETICULUM ENDOPLASMIQUE RUGEUX (RER)
HétérochromaLne
à la périphérie
Enveloppe
du noyau
Nucléole
MODIFICATIONS CHIMIQUES
L e S v e d b e r g , d e s y m b o l e S , e s t u n e
unité de mesure du taux de sédimentation. Elle fut nommée ainsi en
l'honneur du chimiste et physicien suédois Theodor Svedberg (1884-1971),
lauréat du prix Nobel de chimie en 1926 pour ses travaux en chimie des
colloïdes et son invention de l'ultracentrifugeuse.
Le taux ou coefficient de sédimentation d'une particule ou
macromolécule est calculé en divisant la vitesse constante à laquelle la
particule sédimente (en m/s) par l'accélération appliquée (en m/s²). La
vitesse est constante, car l'accélération appliquée par l'ultra-centrifugeuse
(se mesurant typiquement en millions de gravités) est contrebalancée par la
résistance visqueuse du médium (normalement de l'eau) au travers duquel
la particule se déplace. Le résultat a les dimensions d'une unité de temps et
est exprimé en svedbergs. Un svedberg vaut exactement 10-13s.
Le svedberg n'est pas additif : une particule formée de deux particules de
5S n'aura pas un coefficient de sédimentation de 10 S (le
ribosome et ses deux sous-unités rassemblées en donnent un exemple
classique).
Dans le nucléole, assemblage des ARNr et des protéines
5’ ARNr précurseur de 45 S 3’
ppp OH
13.000 nucléoLdes
MODIFICATIONS CHIMIQUES
ARNr 5 S (noyau)
2.800.000 Da 1.400.000 Da
45 protéines 33 protéines
Comme il y a 400 gènes codant l’ARN 45 S par génome diploïde, chaque unité de transcripLon
est transcrite 25.000 fois pour fabriquer 10 millions de ribosomes.
François Jacob André Lwoff Jacques Monod
1920-2013 1902-1994 1910-1976
Nobel lectures
Les ribosomes traduisent les ARNm de 5’ vers 3’
Extrémité 5’
Bases
Ribose
Extrémité 3’
ARNm
Le code généLque
Dégénérescence (du code généLque) : définie par l'existence possible de plusieurs triplets
spécifiant un même acide aminé (61 codons pour 20 acides aminés). La dégénérescence porte
principalement sur la 3ème base du codon.
Exemple Alanine: GCA, GCC, GCG, GCU
Codon : triplet nucléoLdique de l'ARNm qui spécifie un acide aminé donné (codon signifiant) ou
un signal de fin de traducLon (codon non-sens). Sur les 64 combinaisons possibles entre A, U, C
et G il y a 61 codons signifiant les 20 acides aminés précurseurs des protéines, ainsi que 3
codons non-sens (codon stop). Plusieurs codons peuvent spécifier un même acide aminé en
raison de la dégénérescence du code généLque.
Cadre de lecture : une des trois phases possibles de lecture de l'enchaînement des
triplets sur un brin d'ADN/ARNm. Lorsqu'il ne renferme pas de codon stop on dit qu'il
est ouvert ; dans le cas contraire il est dit fermé.
Trois cadres de lecture - trois protéines différentes
Le code généLque
Les extrémités 5’ et 3’ d’un ARNm ne sont pas traduites
Chaîne
polypepLdique
100 nm 100 nm
3’ ARNm
eIF-4G
Coiffe
en 5’
eIF-4E
Codon Codon de
stop départ
PABP
Chaîne
polypepLdique
100 nm
PeLte devineze:
1 ribosome couvre 80 nt.
Combien de ribosomes peuvent être azachés
à la fois sur un ARNm de 960 nt?
Les ribosomes peuvent être libres ou associés en polyribosomes
Ou azachés au ReLculum Endoplasmique Rugeux
I.2 LE RETICULUM ENDOPLASMIQUE RUGEUX
Endosome Cytosol
Lysosome
Appareil de Golgi
Peroxysome
Mitochondrie
RéLculum
RéLculum endoplasmique
endoplasmique
avec des ribosomes
Polyribosomes
libres Noyau
Membrane plasmique
15 µm
NOYAU
200 nm
RéLculum endoplasmique granulaire ou rugeux (ME)
Membrane du Lumière du réLculum
réLculum endoplasmique Cytosol endoplasmique
Homogé- Centri-
Microsomes
néisaLon fugaLon
lisses
RE lisse Microsomes
Microsomes
lisses et granulaires
granulaires
Gradient de
saccharose
SéparaLon selon densité
Les microsomes granulaires peuvent être purifiés et correspondent à des vésicles sur lesquelles
sont azachées des ribosomes.
Les microsomes lisses sont consLtués d'un mélange de vésicules d’origines différentes (REL,
vésicules de sécréLon, lysosomes, peroxysomes…).
200 nm
RétenLon
RIBOSOMES
NOYAU
aa hydrophobes
Les séquences de signalisaLon: les codes postaux
Séquence
de signalisaLon Séquence
de signalisaLon
Domaine de
signalisaLon
Cytosol
Lumière du RE
Site de liaison Site de liaison
du peptide de du peptide de Peptidase du
signalisation signalisation peptide de
d’arrêt de départ signalisation
hydrophobe hydrophobe
Translocon Protéine
transmembranaire
arrivée à maturité
Protéine à un passage transmembranaire
avec le N-terminal dans la lumière du RE
(C) Le cas des protéines à deux segments transmembranaires
PepLde de
signalisaLon
d’arrêt
et d’ancrage
Peptide de
signalisation
de départ
Cytosol
Lumière du RE
Site de liaison Site de liaison
du peptide de du peptide de
signalisation signalisation
d’arrêt de départ
hydrophobe hydrophobe
Translocon Protéine
transmembranaire
arrivée à maturité
Protéine à deux passages transmembranaires avec le N- et le C-terminal
dans le cytosol grâce à un peptide de signalisation de départ interne
(D) Le cas des protéines à plusieurs segments transmembranaires
H 2N
NH2
LUMIÈRE du RE Inositol
Protéine liée à
NH2 la face interne
de la membrane
par un GPI
NH2