Acide ribonucléique

ribosomique
composé chimique

L'ARN ribosomique (ARNr) ou ARN ribosomal par anglicisme

(ribosomal RNA, rRNA, en anglais) est le constituant principal des
ribosomes, auxquels il donne leur nom.

Structure atomique de la grande

sous-unité 50S des ribosomes de
procaryotes.
Les protéines sont colorées en bleu
et les ARN en orange. Le site actif,
l'adénine 2486 est coloré en rouge

Les différents ARNr sont à la fois l'ossature et le cœur du

ribosome, un complexe ribonucléoprotéique (composé de
protéines et d'ARN) servant à la traduction de l'information
génétique codée sur un ARN messager (ARNm). Celui-ci est issu
de la transcription d'une portion du génome, à partir de laquelle il
synthétise les protéines au sein de la cellule. En plus des ARNr, le
ribosome est constitué d'une cinquantaine de protéines appelées
protéines ribosomiques.
Les ARN ribosomiques sont eux-mêmes produits à partir de gènes
codés dans l'ADN. Ils sont transcrits sous forme de précurseurs
plus longs qui sont ensuite clivés pour donner les différents ARNr.
Chez les eucaryotes, ce processus de maturation/clivage se
déroule dans le nucléole. À partir des ribosomes situés dans le
cytosol, les ARNr sont repliés sur eux-mêmes, formant une
structure tridimensionnelle compacte. Cette structure protège les
ARNr, qui sont très stables, par opposition aux ARN messagers
qui ont en général une durée de vie courte.

Synthèse

Eucaryotes

Chez les eucaryotes, l'ARN polymérase I effectue la transcription

de précurseur d'ARN 5,8S, 18S et 28S (précurseur 45S) qui sont
ensuite maturés en subissant différentes modifications
chimiques.

Il est ensuite clivé par les snoRNP (small nucleosomal

RiboNucleoProtein ou « Petite ribonucléoprotéine
nucléosomique »), qui sont des complexes ribonucléoprotéiques
(des complexes formés d'acide ribonucléique et de protéines).

Comme la plupart des ARN, l'ARN ribosomique est codé par des
gènes. Il en existe de nombreuses copies dans le génome (200)
situées dans le nucléole sur 5 chromosome acrocentriques. Les
gènes codant les ARNs sont disposés en paires, et comme chez
les procaryotes, séparés par les Espaceurs Non Transcrits, des
régions d'ADN qui ne codent pas.

Procaryotes

Composition

Eucaryotes

La grande sous-unité ribosomique 60S des eucaryotes est

composée de 49 protéines et des ARNr suivants :
ARNr 28S chez les animaux (5 070 nucléotides chez
l'homme) et ARNr 25S chez les plantes ;
ARNr 5,8S (156 nucléotides chez l'homme) ; dans le
ribosome, l'ARNr 5,8S est lié à l'ARNr 28S ;
ARNr 5S (121 nucléotides chez l'homme), lié ni à l'ARNr 28S
ni à l'ARNr 5,8S.
La petite sous-unité ribosomique 40S est composée de 33
protéines et d'un ARNr :
ARNr 18S (1 869 nucléotides chez l'homme).

Les ARNr 28S, ARNr 5,8S et ARNr 18S sont synthétisés dans le
nucléole tandis que l'ARNr 5S est synthétisé à l'extérieur du
nucléole, dans le nucléoplasme, mais toujours dans le noyau.
L'unité S est le symbole de Svedberg qui correspond à une
constante de sédimentation.

Cas particulier de l'ARNr 5,8S des Diptères[1]

Chez les insectes de l'ordre des diptères, la région de l'ARNr 5,8S

se présente en deux sous-unités au lieu d'une : l'ARNr 5,8S (123
nucléotides chez la drosophile) et l'ARNr 2S (30 nucléotides chez
la drosophile). La sous-unité 2S n'est toutefois pas présente chez
les moustiques qui possèdent comme la majorité des Eucaryotes
une seule région (environ 154 nucléotides).

Procaryotes

La grande sous-unité ribosomique 50S des procaryotes contient

les ARNr suivants :
ARNr 23S (2904 nucléotides chez E. coli[2]) ;
ARNr 5S ; il n'est pas lié à l'ARNr 23S.
La petite sous-unité ribosomique 30S contient l'ARNr suivant :
ARNr 16S (1541 nucléotides chez E. coli[3]).

Fonctions des différents ARNr

ARNr de la petite sous-unité (16S ou 18S)

L'ARN de la petite sous-unité est impliqué dans la lecture de l'ARN

messager. C'est lui qui vérifie que l'interaction entre le codon situé
dans le site A du ribosome et l'anticodon de l'ARNt est correcte.
L'ARN de la petite sous-unité est donc le contrôleur de la fidélité
de la traduction en protéine du message génétique.

ARNr de la grande sous-unité (23S ou 28S)

Le grand ARN de la grande sous-unité du ribosome est impliqué

dans la formation des liaisons peptidiques. C'est lui qui est le
catalyseur direct de la biosynthèse des protéines. Le centre actif
du ribosome, appelé peptidyltransférase, est constitué
exclusivement d'ARN ribosomique. La structure cristallographique
du ribosome a montré qu'il n'y avait pas de protéine à moins de
50 à 60 Å de ce site actif. L'ARNr de la grande sous-unité est donc
un ribozyme[4].

ARNr et antibiotiques

Les ARN ribosomiques bactériens (procaryotes) sont la cible de

près de la moitié des antibiotiques utilisés en thérapeutique
humaine ou vétérinaire. Ces antibiotiques, pour la plupart dérivés
de produits naturels, agissent soit en bloquant la traduction, soit
en faisant faire des erreurs au ribosome.

Principales familles d'antibiotiques agissant sur l'ARNr :

 ARNr 16S : aminoglycosides (gentamicine, amikacine,
isépamicine), tétracyclines, phénicols. Ces antibiotiques
agissent sur la fidélité de lecture du ribosome. En provoquant
des erreurs, ils provoquent la synthèse de protéines anormales
dont l'accumulation finit par être létale ;
ARNr 23S : macrolides (érythromycine, azithromycine), kétolides
(télithromycine ), oxazolidinones
(en) (en) (linézolide). Ces
antibiotiques agissent en perturbant la synthèse de la liaison
peptidique.

ARN ribosomique et évolution

L'ARN de la petite sous-unité du ribosome est une molécule dont
la séquence est très utilisée pour faire des études de phylogénie
au moyen d'outils bio-informatiques. On la trouve conservée dans
l'ensemble des organismes vivants. En comparant les séquences
du gène de cet ARN chez différentes espèces, il est possible
d'évaluer leur parenté évolutive. La base de données du
« Ribosomal database project » rdp.cme.msu.edu (http://rdp.cme.
msu.edu/) [archive] recense les séquences de l'ARN ribosomique
16S ou 18S de plus de 270 000 espèces vivantes. Ces données
permettent de reconstituer un arbre phylogénétique des espèces.

Notes et références
G. Witzany, « Noncoding RNAs: Persistent Viral Agents as
Modular Tools for Cellular Needs », Ann. N. Y. Acad. Sci., vol.
1178, pages 244-267, 2009.
1. T. Shimada, « Distribution of split 5.8S ribosomal RNA in
Diptera », Insect Molecular Biology, vol. 1, no 1,‎août 1992,
p. 45–48 (ISSN 0962-1075 (https://portal.issn.org/resource/is
sn/0962-1075) et 1365-2583 (https://portal.issn.org/resourc
e/issn/1365-2583) ,
DOI
10.1111/j.1365-2583.1993.tb00076.x (https://dx.doi.org/10.1111/j.
, lire en ligne (https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2583.1993.tb0
0076.x) [archive], consulté le 25 mai 2023)
2. J. Brosius, T. J. Dull et H. F. Noller, « Complete nucleotide
sequence of a 23S ribosomal RNA gene from Escherichia
coli », Proceedings of the National Academy of Sciences of the
United States of America, vol. 77,‎1er janvier 1980, p. 201–204
(ISSN 0027-8424 (https://portal.issn.org/resource/issn/0027-8
424) , lire en ligne (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/615
3795) [archive], consulté le 15 octobre 2016)
3. J. Brosius, M. L. Palmer, P. J. Kennedy et H. F. Noller,
« Complete nucleotide sequence of a 16S ribosomal RNA
gene from Escherichia coli », Proceedings of the National
Academy of Sciences of the United States of America, vol. 75,‎
1er octobre 1978, p. 4801–4805 (ISSN 0027-8424 (https://port
al.issn.org/resource/issn/0027-8424) , lire en ligne (https://ww
w.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/368799) [archive], consulté le
15 octobre 2016)
 4. P. Nissen, J. Hansen, N. Ban et P. B. Moore, « The structural
basis of ribosome activity in peptide bond synthesis »,
Science (New York, N.Y.), vol. 289,‎11 août 2000, p. 920–930
(ISSN 0036-8075 (https://portal.issn.org/resource/issn/0036-8
075) , lire en ligne (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/109
37990) [archive], consulté le 15 octobre 2016)

Articles connexes
Acide ribonucléique (ARN)
Structure de l'ARN
Ribosome
Traduction génétique
Transcription
Une liste des différents types d'ARN
Liste d'abréviations de biologie cellulaire et moléculaire

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