6.

Molécules informationnelles

● LES ACIDES NUCLÉIQUES

- Chromosome bactérien :

Constitué d ’1 ou plusieurs ADN, il contient la majorité de l’

information génétique, il est localisé dans une zone
appelée nucléoïde : Exemple : Streptomyces (bactéries
filamenteuses Gram-positif non pathogènes appartenant à l'ordre
des Actinomycètes avec un ADN linéaire de taille +++ entre 8-11
Mb)

NB : L’ ADN est aussi dans les plasmides dans la bactérie

- Les acides nucléiques :

➔ Les acides désoxyribonucléique (ADN) et

ribonucléique (ARN) sont composées de
nucléotides

➔ Le pentose est relié à une base azotée (A, U,

G, T ou C) avec le ribose (nucléoside) et à un
groupement phosphate situé sur le carbone
5’.
Les nucléotides sont reliés par liaison covalente
(liaison phosphodiester)

Nucléoside = base azotée + sucre ribose /

Nucléotide = base azotée + sucre ribose +
groupe phosphate

! RAPPELS : ribose avec groupe hydroxyle (OH) et désoxyribose avec seulement H !

Bases pyrimidiques : Thymine, Cytosine, Uracile

Bases puriques : Adenine, Guanine

Chaque nucléotide possède au moins 1 groupement phosphate : monophosphate,

diphosphate, triphosphate…
 ➔ SQUELETTE PHOSPHOGLUCIDIQUE :

Permet la formation d’hélice bi-caténaire

Les nucléotides sont polymérisés depuis l'extrémité 5’ phosphate vers l'extrémité 3’ OH

- Les acides désoxyribonucléiques

➔ En double hélice
➔ L'ADN est une macromolécule séquencée
formée par l'enroulement de 2 chaînes de
nucléotides monophosphates (1
groupement phosphate) reliés par des
liaisons phosphodiester
 ➔ Adénine (A) toujours associée à thymine (T) et inversement, par deux liaisons hydrogène

➔ Guanine (G) toujours associée à cytosine (C) et inversement, par trois liaisons hydrogène

➔ Les deux brins d ’une double hélice d ’ADN sont complémentaires

Les deux squelettes moléculaires des chaînes d’ADN sont dits antiparallèles (deux directions
opposées), dans une direction donnée un brin est orienté de 3 ’ vers 5 ’ et l ’autre de 5 ’vers 3 ’.

Modélisation de l’organisation de la double hélice :

Les deux brins s’enroulent l’un autour de l’autre pour former

une double hélice contenant un petit (largeur : 6A) et un
grand (largeur : 12A) sillons avec lequel des protéines
peuvent interagir

Les 2 squelettes phosphoglucidiques sont représentés en

bleu et vert.
Les bases pyrimidiques sont en rouge et les bases puriques en
jaune.
Il y a 10,4 pb (= paires de base) par tour d’hélice
- Les acides
ribonucléiques

➔ ARN (acide
ribonucléique) : une seule chaîne polynucléotidique
➔ Habituellement monocaténaire : (une seule chaîne
polynucléotidique)
➔ Appariement possible de bases complémentaires de la
même molécule (structure en épingle à cheveux)

➔ 3 classes qui diffèrent suivant leur taille,

localisation et fonction :

*ARN messager (ARNm) = copie de la séquence codante d'un

gène (= matrice pour l'expression en protéine) : il a une très
courte durée de vie (de quelques minutes à quelques heures) et
il est le seul ARN à être traduit dans le cytosol (= une matrice
liquide autour des organites)

* ARN ribosomiques ou ribosomal (ARNr) : participation à la formation des liaisons peptidiques lors
de la traduction

* ARN de transfert (ARNt) : fournissent les structures et les outils nécessaires à l'expression de l'ARN
messager en protéine = Intermédiaire entre l’ARNm et les acides aminés lors de la traduction
* Petit ARN nucléaire (ARNsn) : Pour l’épissage alternatif chez les Eucaryotes

* ARN interférent (siARN et mi-ARN) : Contrôle des expression des gènes eucaryotes

STRUCTURE :
* Base Uracil (U) (pas de Thymine)
* Sucre de type Ribose
* Simple brin
* En tige-boucle (épingle à cheveux)

● LES RIBOSOMES

Ils sont responsables de la synthèse des protéines lors de la traduction

➔ ARNr : formation des liaisons peptidiques, catalyseur direct de la

synthèse des protéines

Le ribosome des procaryotes :

* Comprend 2 sous-unités de tailles différentes :

- GRANDE SOUS-UNITÉ 50 S (LSU = "Large Sub-Unit") : avec ARNr 23S + 5S + protéines
- PETITE SOUS-UNITÉ 30 S (SSU = "Small Sub-Unit") : avec ARNr 16S + protéines

* Association de chaînes d’ARNr et de protéines

➔ ➔ DOCUMENT ASSOCIÉ
UNIQUEMENT POUR LES
PROCARYOTES

Chez les eucaryotes, la petite sous-unité est

associée à L’ARN 18S

RAPPELS : Synthèse protéines :

● TRANSCRIPTION

● MATURATION = excision + épissage alternatif

● TRADUCTION : Ribosomes permettent de traduire en protéines

Un autre schéma :

- ARN :

NB : L’ARN 16S est une marque

phylogénétique des ribosomes, en
utilisant la méthode PCR, on peut
connaître tous les composés :
détection de n'importe quel génome
bactérien ainsi que son identification.
Elle cible une séquence génomique
commune à toutes les bactéries : un
gène codant pour l'ARN ribosomal
16S
 ● LES PROTÉINES

Les protéines sont des polymères

d’acides aminés unis par des
liaisons covalentes (peptidiques)

Ce sont les macromolécules les

plus représentées dans la cellule
(55 % PS)

➔ Séquence linéaire des

acides aminés : structure
primaire : Les interactions
entre les chaînes latérales
des acides aminés contraignent la molécule à se
plier pour former des structures secondaires
(hélice α).

Les polypeptides continuent à se replier pour former

des structures tertiaires tridimensionnelles qui montre
des régions exposées ou des crevasses qui peuvent fixer
d’autres molécules

Structure quaternaire : 2 chaînes d'acides aminés

NB : Pour dénaturer des protéines, il faut les chauffer a au moins 60°C : cela entraîne la mort de la
cellule car pas de protéine ⇒ pas de cellule

➔ Les fonctions variées des protéines :

* Fonctions structurales : maintien de la morphologie (membranes, paroi)

* Enzymes : catalyse des réactions cellulaires

* Transport : dans la cellule, l’organisme et au travers de la paroi cellulaire

(perméases = chacune des enzymes de la membrane des bactéries et de certains
organites, assurant le transport actif d'ions et de molécules organiques au
travers de la membrane cellulaire. Elles sont indépendantes de l'ATP.
Les perméases appartiennent aux protéines de transport de perméabilité

* Communication : récepteurs, quorum sensing ( = mode de communication

et de perception utilisé par les bactéries. Il se fonde sur la production de petites
molécules, les autoinducteurs (AI), qui peuvent diffuser à travers la membrane
ou être transportés à l’extérieur de la cellule)

* Défense : peptides antimicrobiens (bactériocines, colicines..)

* Réserve : stockage des acides aminés pour une utilisation ultérieure

 La fonction d’une protéine dépend de sa structure 3D (conformation). Elle doit être en 3D pour
être fonctionnelle.

7. Processus moléculaires

La machinerie cellulaire effectue les transformations

cellulaires : les catalyseurs de ces réactions
chimiques sont les enzymes, des protéines qui
accélèrent énormément leur vitesse

Le dispositifs de codage produit des informations

génétiques (ADN) qui sont transmises à la
descendance lors de la reproduction

Concept de réplication de l’ADN, de transcription de

l’ADN en ARN et de traduction des ARN en
protéines

● RÔLE DES ENZYMES

Certaines protéines exercent des fonctions structurales (membranes, paroi) et d’autres des
fonctions catalytiques (enzymes) :

Catalyseur = substance qui abaisse l’énergie d’activation d’une réaction et augmente la vitesse de
la réaction sans subir de transformation permanente
Les enzymes accélèrent les réactions cellulaires = catalyseur
biologique très spécifique

réactifs = substrats
produits = substances formées

Les noms d’enzymes se terminent souvent par le suffixe « ase »

(lactase…). Cas particulier : le lysozyme ⇛ elle détruit la paroi cellulaire
des bactéries Gram + en catalysant l’hydrolyse (destruction) des
peptidoglycanes elle est retrouvée principalement dans les sécretions
telles que le blanc d’oeuf, les larmes, salive (devouverte par Alexander
Fleming comme la pénicilline)

- Les enzymes sont réutilisées dans les cellules

- 2 cas : Réaction 1 : le substrat donne des élections

Réaction 2 : le substrat reçoit des électrons
 ● RÉPLICATION DE L’ADN ( = doublement de la molécule d’ADN) : modèle retenu
⇛ semi-conservative

➔ Réplication grâce à l’ADN polymérase (et non pas l’ARN polymérase pour la transcription) :
Des enzymes (hélicases) écartent les deux brins de la double hélice d’ADN en supprimant les liaisons
hydrogènes. Puis, les ADN polymérases se déplacent le long des brins libres de l’ADN en polymérisant les
nucléotides. Elles associent ainsi à chaque nucléotide de l’ADN ouvert des nucléotides « libres » du noyau en
respectant la complémentarité : si le brin matrice comprend un NT à A, elle incorpore en face un NT à T, si le
brin matrice comprend un NT à G, elle incorpore en face un NT à C, etc…

L’ADN polymérase peut faire des erreurs : il existe des mécanismes de réparation de l’ADN
reposant sur des enzymes capables de se fixer à l’ADN endommagé et de catalyser les réactions de
réparation.

Mais parfois, les modifications de l’ADN ne sont pas réparés, alors elles se transforment en
mutations :
 - Type sauvage : pas d’anomalie de réplication

- Mutation silencieuse : mutation ponctuelle de

la molécule d’ADN (souvent 1 seul nucléotide
est changé) ⇛ Changement d’un triplet
codant en 1 autre triplet codant pour le
même nucléotide : Protéine normale donc
pas de modification du phénotype

- Mutation non sens : Mutation ponctuelle d’1

seul nucléotide : remplacement d’un codon
codant un acide aminé en un codon-stop ⇛
Conséquence : cela induit une protéine
tronquée, incomplète, elle ne peut pas
assurer sa fonction car il a arrêt du processus
(codon-stop)

- Mutation faux sens : Mutation ponctuelle d’1

nucleotide entraînant la modification d’un
acide aminé en un autre ⇛ Conséquence :
Cela peut rendre la protéine non fonctionnelle

➔ Certaines mutations entraînent des modifications phénotypiques

RAPPELS :
- 1 codon = 3 nucléotides = 1 acide aminé

- Dans le code génétique : 3 codons-stop, 64 codons possibles, 1 acide aminé initiateur (N-
Formylmethionine pour les bactéries et le Méthionine pour les Archées)

RÉSUMÉ DU FONCTIONNEMENT DE LA CELLULE :

● LA FONCTION CODANTE

polysome = ensemble de ribosomes

reliés par un ARNm

Chez les procaryotes, le chromosome

se situe dans le nucléoïde

- Le code génétique
 ● POTENTIEL GÉNÉTIQUE D’UNE CELLULE

Une bactérie comme Escherichia coli (E.coli) (dans le tube digestif chez l’Homme, durée de division :
20 min) : Escherichia coli : informations et traitements - Institut Pasteur

- Taille du chromosome : 4,7 millions de paires de bases (humain: 3400 Mpb)

- Génome = ensemble du matériel génétique contenu dans une cellule ~ 70 % du génome est
codant (3% chez l’Homme)
Si un gène ~ 1100 bases cela donne 4300 gènes
Or 3000 gènes seulement codent pour 1 protéine (le nombre de gènes augmente peu selon la
complexité des organismes)

- 2,4 millions de molécules protéiques dans une cellule, 1900 types différents de protéines à
un moment donné

Chaque type de protéines est constitué de quelques molécules à 100 000 molécules