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Les ribosomes bactériens:

structure et fonction

Présenté par: Abdelaziz Nadia


Belakehal Hanifa
Bouabbache Soumia
PLAN
I. INTRODUCTION
II. DEFINITION
III. STRUCTURE
IV. FONCTION
V. APPLICATIONS
VI. CONCLUSION
VII.BIBLIOGRAPHIE
INTRODUCTION
• Dans une usine, le bon fonctionnement de la
machinerie est une condition essentielle pour que
se réalise les différents travaux propres à chaque
usine.
• Dans une cellule, il en va de même. La vie est un
processus actif qui dépend continuellement de la
réalisation de différents types de travaux
cellulaires. Un de ces travaux essentiels au maintien
de l'intégrité cellulaire est la biosynthèse de milliers
de protéines à fonctions très diverses.
INTRODUCTION
• Le cytoplasme bactérien ,entouré par la membrane
cytoplasmique ,est de structure simple constitué
d’un hydrogel colloïdal avec une phase dispersante
composée de protéines et de sels minéraux en
solution et d’une phase dispersée formée de
ribosomes et d’inclusions diverses .
• Une cellule bactérienne contient environ 20.000
ribosomes , qui sont libres dans le cytoplasme ou
ancrés à la membrane cytoplasmique. Ceux-ci sont
responsables de la synthèse des protéines.
DEFINITION
• les ribosomes ressemblent
à des petites particules
uniformes mais en fait ce
sont des éléments très
complexes constitués de
protéines (35%) et d’acide
ribonucléique (65%). D’où
leur appellation
« complexes
ribonucléoprotéique ».
STRUCTURE
STRUCTURE
• Mesurent 14 a 15 nm sur 20 nm ont une
masse moléculaire de 2,7 millions

• Ils sont formes de 2 sous-unites une grande


sous unité (L pour large),une petite sous unité
(S pour small)
STRUCTURE
• Ces 2 s/u sont désignés par leur coefficient de
sédimentation *unité svedberg* qui dépend
de la masse moléculaire de la particule, de son
volume et de sa forme.

• Les particules lourdes et compactes


sédimentent plus vite lors de la centrifugation
et ont donc un coefficient de sédimentation
plus grand.
STRUCTURE
• s/u 50s : ARN 23S (2300 nucleotides) et d’ARN
5S (120 nucleotides) et 33 protéines.

• s/u 30s : ARN 16S (1540 nucleotides) et 21


protéines.

• Au total, le ribosome fonctionnel (composé des


deux sous-unités réunies) a un coefficient de
sédimentation de 70 S.
STRUCTURE
• il existe aussi dans cette s/u 3
sites :
• A : site aminoacyl est occupe
par un ARNt porteur d’AA en
attente d’être lié à la chaine
polypeptidique.
• P : site peptidyl occupé par un
ARNt porteur d’un AA lié à la
chaine polypeptidique
résultante.
• E : site exit qui permet la
libération de l’ARNt désacétylé
qui a libère son AA.
STRUCTURE
• La grande s/u contient également un tunnel
par lequel sort la chaine protéique en cours
de synthèse
STRUCTURE
• Les sous-unités sont construites autour d'un
cœur d'ARN ribosomique possédant une
structure très compacte, autour duquel sont
accrochées les protéines ribosomiques.

• Et le site actif du ribosome qui catalyse


la liaison peptidique est constitué d'ARN.
STRUCTURE
• La structure des ribosomes et leur fonctionnement à
l'échelle atomique a été déterminée grâce à l’utilisation,
dés 1970, de la méthode de cristallographie par rayon X
pour cartographier chacun des centaines de milliers
d'atomes qui composent le ribosome.
• Le prix Nobel de chimie 2009 a été décerné à 3
chercheurs pour la détermination de cette structure en
3D avec une précisons de O,1 nm
• En 1980,l’un de ces trois chercheurs avait déjà reussi à
réaliser une première image «grossière » en 3D de la
machinerie ribosomale.
La même unité 50 S vue avec une résolution de 0,9 nm (à gauche), de 0,5 nm (au
centre) et de 0,1 nm (à droite). Le nm (nanomètre) et un milliardième de mètre. À
droite les tresses bleuâtres sont de l’ARN ribosomique et les éléments jaunâtres sont
des protéines intrinsèques de l’unité 50 S.
STRUCTURE
• Les ARNr sont produits à partir de gènes codés
dans l’ADN ,ils sont transcrits sous forme de
précurseurs plus long qui sont ensuite clivés pour
donner les différents ARNr.

• Les ARNr sont repliés sur eux-mêmes, formant une


structure tridimensionnelle compacte. Cette
structure protège les ARNr qui sont très stables,
par opposition aux ARN messagers qui ont en
général une durée de vie courte.
STRUCTURE
• Les protéines ribosomales sont synthétisées
de la même manière que les autres protéines
bactériennes.

• L’assemblage des protéines et des ARNr


s’effectue dans le cytoplasme.
l’unité 30 S (verdâtre) et l’unité 50 S (bleuâtre).
Le ribosome fixe des ARN de transfert qui assurent l’addition des acides aminés l’un
après l’autre depuis le premier jusqu’au dernier. L’ARN messager n’a pas été
représenté sur cette figure.
Caractéristiques cellule Procaryote cellule Eucaryote

dispersés dans le cytoplasme ou


Localisation des ribosomes dispersés dans le cytoplasme
liés au réticulum endoplasmique

Constante de sédimentation 80 S, sauf mitochondries et


70 S
(Densité) chloroplastes

Constantes de sédimentation des


16S, 23S, 5S 18S, 28S, 5,8S, 5S
ARN ribosomaux

Taille 20 nm 22 nm

NOMBRE DE PROTEINES 55 80
Fonction du ribosome
Synthèse protéique
SYNTHESE PROTEIQUE
• Les ribosomes décodent l’ information
contenue dans l’ARNm lui même issue de la
transcription d’une portion du génome
bactrien (ADN).

• Le code génétique assure la correspondance


entre la séquence de l’ARNm et celle du
polypeptide synthétisé.
CODE GENETIQUE
SYNTHESE PROTEIQUE

• petite s/u 30s lit l’ARNm (l’ARNr contrôle la


fidélité de la traduction du message en vérifiant
que l’interaction codon-anticodon est correcte)
• le ribosome utilise les ARN de transfert ARNt
comme adaptateur entre l’ARNm et les AA
l’ARNm passe à travers la petite s/u 30s qui
contient les sites de fixation de l’ARNt sur
l’ARNm.
SYNTHESE PROTEIQUE
• La grande s/u 50s qui se charge de la synthèse de la
protéine correspondante.

• Elle contient la partie catalytique (peptidyl-


transferase )qui effectue la synthèse de la liaison
peptidique entre les AA consécutifs de la protéine.
SYNTHESE PROTEIQUE
• Le ribosome est de plus un moteur
moléculaire qui avance sur l’ARNm en
consommant l’énergie fournie par l’hydrolyse
de la GTP ,plusieurs protéines, appelées
facteurs d’élongation sont associées à ce
mouvement de translocation.
SYNTHESE PROTEIQUE

• Plusieurs ribosomes
peuvent traduire une
même molécule d’ARNm
donnant ainsi une structure
en chapelet.
SYNTHESE PROTEIQUE
• Le polypeptide nouvellement forme se replie
en sa forme finale soit au moment de la
synthèse au niveau des ribosomes soit peu
après la terminaison de cette synthèse
• Il y a des protéines spécialisées appelées
chaperonnes qui aident au reploiement
correct du polypeptide
SYNTHESE PROTEIQUE
• La synthèse des protéines a lieu au niveau des
ribosomes. Les ribosomes présents dans le
cytoplasme synthétisent les protéines intra
cellulaires tandis que les ribosomes lies à la
membrane plasmique fabriquent les protéines
qui sont exportées.
APPLICATIONS
CIBLE D’ANTIBIOTIQUES
Cibles d’antibiotiques
• En raison des différences entre ribosomes
humains et procaryotes, les ATB peuvent tuer
la cellule bactérienne sans porter préjudice
aux cellules humaines
• Les aminosides et les tétracyclines agissent au
niveau de la s/u 30S, les macrolides et les
phénicolés agissent au niveau de la 50S.
structure d'un ribosome de bactérie par Rayon-X : les molécules d'ARN sont en orange ; les
protéines de la petite sous-unité en bleues, celles de la grande sous-unité en vert. Une molécule
d'antibiotique (en rouge) est lié à la petite sous-unité du ribosome.
MAIS DEVELOPPEMENT DE
RESISTANCES !!!
• Par modification de la cible ribosomale entrainant
l’absence de liaison ATB-ribosome.
• Aminosides: Mutation de gène
– Codant pour les protéines ribosomales
– Codant pour l’ARN 16S
(ex: E.coli).
• Macrolides: Modification de la cible ribosomale
par une ARN méthylase qui méthyle l’ARN 23 S de
la s/u 50 S par acquisition d’un plasmide de
résistance (ex: staph).
RIBOTYPAGE
• La comparaison de la séquence de certaines
macromolécules permet d’établir des liens de
parenté phylogénétique. Les macromolécules
constituant le ribosome, en particulier les ARN
ribosomiques, sont d’excellents marqueurs
phylogénétiques. Or, toutes les cellules
contiennent des ribosomes, c’est pourquoi les
ARN ribosomiques ont été utilisés pour construire
l’arbre phylogénétique universel de tous les
organismes vivants
RIBOTYPAGE
• Etapes de la construction d’un arbre phylogénétique à
partir d’ARN :
- l’alignement des séquences codantes pour l’ARN
ribosomique, obtenues par le séquençage d’un ou
plusieurs organismes, est analysé avec un outil
informatique.
- Plus la différence des séquences de l’ARN ribosomique
entre deux ou plusieurs organismes est importante, plus
leur distance évolutive est grande. Ces distances sont
ensuite transcrites sous la forme d’un arbre
phylogénétique
RIBOTYPAGE
• La comparaison des ARN ribosomiques a
permis de mettre en évidence trois domaines
phylogénétiquement distincts qui sont les
Bacteria, les Archaea et les Eukarya
(eucaryotes)
• la phylogénie moléculaire a aidé à affiner la
notion d’espèce bactérienne, rendant possible
l’identification d’organismes sans avoir à les
cultiver
RIBOTYPAGE
• Association RFLP et Southern blot pour le
ribotypage des bactéries.
• Elle utilise des sondes spécifiques des gènes
codant pour les ARN ribosomaux (16S ou 23S).
• Le ribotypage est suffisamment reproductible
pour avoir donné naissance à des banques de
données internationales.
CONCLUSION
• La connaissance de la structure fine et des
mécanismes intimes du fonctionnement des
ribosomes offre de nouvelles perspectives
thérapeutique en permettant le développement
de nouvelles molécules actives.
• Le séquençage des gènes correspondants a
permis la réorganisation de la systématique
ainsi que l’introduction de techniques de
diagnostique.
BIBLIOGRAPHIE
• Tortora: microbiologie
• Microbiologie: Prescott; Harley; Klein; 2° édition
française
• Microbiologie générale: la bactérie et le monde
bactérien; Leclerc; Gaillard; Simonet
• TECHNIQUES D’ETUDE MOLECULAIRE DES
ISOLATS :PRINCIPES ET FIABILITE
• ÉPREUVES: Vue d’ensemble de la vie microbienne
• www.futura-sciences.com
Merci de votre
attention

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