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Le réticulum endoplasmique

et les ribosomes
UNIVERSITE EL HADJ IBRAHIMA NIASSE
ECOLE DE MEDECINE, DE PHARMACIE ET DE CHIRURGIE
DENTAIRE SAINT CHRISTOPHER IBA MAR DIOP

BIOLOGIE CELLULAIRE
L1S1 Médecine

Dr Robert DIATTA
Année Universitaire 2021-2022 Date 04 11 2021
Objectifs
1-connaitre la structure et le rôle du
RE
2-Connaitre les composants du RE et
ses différentes fonctions,
3-connaitre les composants des
Ribosomes et ses différentes
fonctions.
4- Connaitre le principe de la
traduction
5-connaitre les rôles des différents
ARN dans la synthèses des protéines.
Réticulum Endoplasmique
I. Définitions
I. Le Réticulum endoplasmique
Le réticulum endoplasmique est un système de
cavités (ou citernes ) limitées par une simple
membrane comprenant deux compartiments
qui communiquent l’un avec l’autre : le
réticulum endoplasmique lisse (REL) et le
réticulum endoplasmique granuleux (REG).
I. Définitions
I. Le Réticulum endoplasmique
Ces deux compartiments ont un constituant
commun de type membranaire, mais ils
diffèrent par la forme des cavités et par la
présence sur la face externe de celles-ci, dans
le cas du REG, des ribosomes.
I. Définitions
I. 1.Le Réticulum endoplasmique
Le REL est formé d’un « labyrinthe » de fins
canalicules interconnectés caractérisés par
l’absence de ribosomes. Ce type de réticulum
est fortement développé dans les cellules
synthétisants les stéroïdes et dans les
cellules musculaires .
I. Définitions
I. 1.Le Réticulum endoplasmique
Au sein de ces derniers , il porte le nom du
réticulum sarcoplasmique et permet le
stockage des ions calciums, mais aussi leur
libération quand les cellules se contractent.
Le REG a une organisation sacculaire ; ses
membranes sont recouvertes de ribosomes.
I. Définitions
I. 1.Le Réticulum endoplasmique
La membrane du REG est en continuité avec
la membrane externe du noyau. Il est
particulièrement abondant dans les cellules
séreuses, les plasmocytes(globules blancs)
et les neurones. Dans les cellules nerveuses,
les citernes du REG sont rassemblées autour
du noyau sous la forme d’agrégats appelés
corps de NISSL.
I. Définitions
I. 1.2.La membrane du Réticulum
endoplasmique
L’architecture moléculaire des membranes du
réticulum est semblable à celle de la
membrane plasmique (bicouche lipidique et
protéine).
I. Définitions
I. 1.2.La membrane du Réticulum
endoplasmique
Toutefois, les protéines sont en plus grande
quantité que dans la membrane plasmique.
(70% au lieu de 60 % ).
Ces membranes possèdent notamment des
enzymes nécessaires à la synthèse des
protéines, au métabolisme des lipides et
aux phénomènes de détoxification.
I. Définitions
I.2 Les ribosomes
Les ribosomes sont des particules
ribonucléoprotéides ( ou RNP ) constituées
d’ARNr couplés à des protéines . Certains
appelés ribosomes liés, sont accolés à la
face cytosolique des membranes du réticulum
ou de la membrane externe de l’enveloppe
nucléaire, d’autres appelés ribosomes libres ,
baignent au sein du cytosol.
I. Définitions
I.2 Les ribosomes
Ils assurent la synthèse des protéines en
assemblant des acides aminés dans un ordre
prédéterminé, suite à la lecture d’un ARNm.
I. Définitions
I.2 Les ribosomes
Les ribosomes sont constitués de deux sous-
unités de dimensions inégales qui sont
désignés en fonction de leur coefficient de
sédimentation :
-la petite sous-unité a un coefficient de
sédimentations de 40S (30S chez les
procaryotes).
Elle est constituée d’une molécule d’ARNr 18S
(16S chez les procaryotes) et de 33 protéines
ribosomiques (21 chez les procaryotes. Cette
sous-unité contient le site d’attachement à
l’ARNm;
I. Définitions
I.2 Les ribosomes
-la grande sous-unité possède un
coefficient de sédimentation de 60S ( 50S
chez les procaryotes) et est composée de trois
molécules d’ARNr( 28S, 5,8S et 5S) et de 49
protéines ribosomiques (34 chez les
procaryotes). Chez les procaryotes en plus de
ces 34 protéines ribosomiques, la grande
sous-unité n’est formée que de deux
molécules d’ARNr(23S et 5S).
I. Définitions
I.2 Les ribosomes
Les sous-unités des ribosomes présentent trois
sites de liaison aux ARNt :
-le site A retient l’ARNt qui porte le prochain
acide aminé qui sera ajouté à la chaine
polypeptidique naissante;
-le site P retient l’ARNt porteur de la chaine
peptidique en cours de synthèse;
-le site E est l’endroit ou’ l’ARNt déchargé
de son acide aminé quitte le ribosome.
I. Définitions
I.2 .Les ribosomes
Le ribosome fonctionnel c’est-à-dire composé
de deux sous-unités réunies, a un coefficient
de sédimentation de 80S (70S chez les
procaryotes).
La taille des ribosomes est d’environ 25 à 30nm
(20 nm chez les procaryotes).
Schéma d’un Ribosome
II. La Synthèse des protéines:
traduction
II.1 Définition
L’ADN porteur des instructions nécessaires à la
fabrication des protéines est situé dans le
noyau. Les informations que contient l’ADN sont
transcrites sous la forme d’ARNm . Après avoir
été exportés dans le cytoplasme, les ARNm
sont traduits en protéines par les ribosomes.
II. La Synthèse des protéines: traduction
II.1 Définition

La mise en place des acides aminés en


position correcte dans l’enchainement
polypeptidique suivant le message codé de
l’ARNm nécessite des intermédiaires : les
ARNt.
II. La Synthèse des protéines
:traduction
La Synthèse des protéines : dans le cytoplasme (au
niveau des ribosomes du réticulum endoplasmique)
L'ADN ne sort pas du noyau.
L'information passe au cytoplasme sous forme d'une
copie : l'ARN.

ARN = Acide RiboNucléique


ARN diffère de l'ADN:
Sucre des nucléotides = ribose et non
désoxyribose comme dans l’ADN d’où le
nom ARN, acide ribonucléique.

Première étape de la synthèse d'une


protéine = copie du gène (ADN) en une
molécule d'ARN = transcription.
Copie du gène en ARN = ARNm (ARN
messager)
L'ARNm se détache et la molécule d'ADN
se referme
Synthèse de l'ARNm se fait par l'enzyme
ARN polymérase
Réticulum Endoplasmique
II. La Synthèse des protéines :traduction
TRADUCTION
Pour synthétiser la protéine, il faut:
 ARNm = information (la recette)
 Ribosome = machine à assembler les
acides aminés
 Acides aminés = pièces de construction
 ARNt (ARN de transfert) = molécules
qui transportent les acides aminés du
cytoplasme au ribosome où ils sont
assemblés en protéine.
L'ARN de transfert (ARNt)

ARNt = brin d'ARN qui se


replie sur lui-même pour
former une structure en 3D
II. La Synthèse des protéines :traduction
 Anticodon = zone formée de trois
nucléotides pouvant se lier à l'ARNm
 Chaque ARNt est caractérisé par son
anticodon.
 Un ARNt ne transporte pas n'importe
quel acide aminé: ça dépend de
l'anticodon
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Le code génétique est un système qui permet
la conversion d’une séquence de nucléotides
(ADN puis ARN) en séquences d’acides aminés
(protéines).
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Exemple:
 ARNt AAA transporte toujours l'acide
aminé PHE
 ARNt GAU transporte toujours l'acide
aminé LEU
 L'acide aminé est attaché au bon
ARNt par l'enzyme aminoacyl-ARNt
synthétase
Le brin d’ARNm Deux ARNt peuvent se fixer par leur
S’attache au Anticodon sur l’ARNm au niveau du
Ribosome.
Ribosome (un sur la zone appelée site P et
En fait il s’attache
d’abord à la petite sous L’autre sur la zone appelée site A
Unité.
C’est en ce moment que la
grosse sous unité vient se t
fixer
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Chaque ARNt se fixe par son anticodon sur trois
nucléotides de l’ARNm. Ces trois nucléotides de
l’ARNm constituent ce qu’on appelle un codon.
Après leur fixation, les acides aminés qu’ils
transportent sont reliés entre eux (le catalyseur
est constitué d’une partie de l’ARN du ribosome
et non d’une enzyme protéique).
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Tous les ARNm se terminent par le codon
(triplet de bases) UAA, UAG ou UGA =
codons STOP.

Lorsque le ribosome atteint un codon


STOP, une enzyme (facteur de
terminaison) s'y fixe et détache l'ARNm
du ribosome.
Polypeptide

ARNm

RIBOSOME
La protéine synthétisée pénètre dans le reticulum
endoplasmique où elle prendra sa forme finale
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Le codon AUG (code pour MET) =
codon d'initiation.
Tous les gènes commencent par ce codon
MET est souvent enlevée à la fin de la
synthèse.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Les mutations
 Mutation = modification de l'information
génétique (ADN) Une mutation peut être:
 Chromosomique = altération d'un
chromosome complet
 Ponctuelle = anomalie dans la séquence des
nucléotides
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Les mutations
Une erreur dans l'ADN peut entraîner une
erreur dans la protéine codée.

Cette erreur peut changer un ou plusieurs


acides aminés de la protéine et la rendre non
fonctionnelle.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Les mutations
Erreur dans l'ADN = mutation
Les mutations peuvent être causées par:
◦ Des erreurs lors de la reproduction des cellules
◦ Des substances chimiques toxiques
(substances mutagènes)
◦ Des radiations nocives (rayons X, UV)
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Les mutations
Exemple:
Anémie falciforme = maladie génétique
caractérisée par une hémoglobine anormale.
Anomalie dans la chaîne ß de l'hémoglobine :
6e acide aminé = VAL alors qu'il devrait être GLU
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
L’ARNm est composé de la succession de
quatre types de bases nucléotidiques :
adénine (A), la cytosine (C),
guanine (G) uracile (U), qui représente une
sorte d’alphabet.
Le code génétique associe à des combinaisons
de trois lettres de cet alphabet (un codon) un
acide aminé donné.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.2 Code génétique
Ces codons se succèdent tout au long de
l’ARNm . L’ordre des codons détermine l’ordre
des acides aminés dans la protéine. Le code
génétique comporte 64 codons différents,
codent directement les 20 acides aminés
différents rencontrés dans les protéines chez
les eucaryotes. Trois de ces codons n’ont pas
d’acides aminés équivalents, ils fonctionnent
comme signaux de terminaison (le codon stop).
II. La Synthèse des protéines : traduction
II.2 Code génétique
Les 61 autres codons correspondent à un acide
aminé déterminé . Parmi ceux-ci, il existe un
codon particulier, AUG, qui est reconnu comme
codon initiateur de la traduction. A ce codon
correspond l’acide aminé méthionine .
Un acide aminé peut être codé par un ou
plusieurs codons : le code génétique est dit
« dégénéré »
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.3. ARN de transfert
Aucune molécule d’acide aminé n’a de
configuration complémentaire à un triplet de
nucléotides. En revanche il existe des
adaptateurs moléculaires capables, chacun, de
reconnaitre à la fois un type d’acide aminé et
le codon correspondant: ce sont des ARNt.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.3. ARN de transfert
Les ARNt sont des ARN les plus abondants de
la cellule après les ARNr.
.Tous les ARNt contiennent des séquences de
bases complémentaires qui, se liant, constituent
des régions appariées bicaténaires alternant
avec des boucles monocaténaires, donnant à
l’ensemble une structure complexe comportant
plusieurs tiges boucles.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.3. ARN de transfert
Une extrémité est toujours constituée de trois
nucléotides. C-C-A non appariés.
Le nucléotide terminal A est le site
d’attachement de l’acide aminé correspondant à
cet ARNt.
L’acide aminé réagit avec le groupement
hydroxyl (-OH) lié au carbone 2’ ou 3’ du ribose
entrant dans la composition du dernier
nucléotide de l’ARNt, grâce à l’intervention
d’une enzyme (l’aminoacyl-ARNt synthétase).
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.3. ARN de transfert
Cette enzyme est hautement spécifique , aussi
bien vis-à-vis de l’acide aminé et de l’ARNt.
La boucle composée à la terminaison A
comprend une séquence de trois nucléotides,
l’anticodont, dont les bases azotées sont
complémentaires du codont de l’ARNm.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.3. ARN de transfert
Il existe plusieurs ARNt différents qui peuvent
prendre en charge un même acide aminé, ils
sont dits isoaccepteurs . Chacun des
isoaccepteurs comprend un anticodont
capable de s’apparier à un codont de l’ARNm
correspondant à cet acide aminé.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.4 Les étapes de la traduction
La traduction, au niveau du ribosome, d’un
ARNm en polypeptide comprend trois étapes
successives:
-Initiation;
-élongation;
-terminaison.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.4 Les étapes de la traduction
II.4.1 L’Initiation
Cette étape est plus lente de la synthèse du
polypeptide. En premier lieu la petite sous-unité
ribosomique s’attache à un ARNm et à un
ARNt spécifique d’ initiation portant un acide
aminé méthionine modifiée . La petite sous
unité ribosomique effectue un balayage sur
l’ARNm jusqu’à ce qu’elle atteigne le codon
d’initiation AUG, qui précise le point de départ
de la traduction.
II. La Synthèse des protéines :traduction
II.4 Les étapes de la traduction
II.4.1 L’Initiation
L’anticodon de l’ARNt d’initiation établit des liaisons
hydrogènes avec le codon AUG de départ.

L’association de l’ARNm, de l’ARNt d’initiation et


de la petite sous-unité ribosomique est suivie de
l’arrivée de la grande sous-unité ribosomique,
qui vient compléter le complexe d’initiation.
II.4.1 L’Initiation
Pour former un complexe d’initiation, la cellule
puise de l’énergie dans la GTP.
A la fin du processus d’initiation, l’ARNt
d’initiation se retrouve sur le site P du
ribosome, et le site A, vacant , est prêt à
accueillir le prochain ARNt aminoacylé, c’est-à-
dire portant un acide aminé estérifié sur son
extrémité 3’.
II.4.1 L’Initiation
Notez qu’un polypeptide est toujours
synthétisé dans le même sens, à partir de la
méthionine à l’extrémité amine, aussi appelée
N-terminale, vers l’acide aminé final à
l’extrémité carboxyle, ou C –terminale.
II.4.2.élongation
Au cours de cette étape, les acides aminés
sont ajoutés un à un, l’un à la suite de l’autre.
Un cycle d’élongation comporte trois phases :
la reconnaissance du codon, la formation
d’une liaison peptidique et la translocation.
II.4.2 élongation

La première et la troisième phase dépensent de


l’énergie (GTP). La formation de la liaison
peptidique est catalysé par une enzyme, la
peptidyl-transférase, qui est une partie du
grand ARNr de la grande sous-unité (ARNr 28S
chez les eucaryotes).
II.4.2 élongation
L’ARNm traverse toujours le ribosome dans la
même direction, en commençant par l’extrémité
5’. Le ribosome se déplace donc dans le sens
5’……..3’ sur l’ARNm . Le cycle d’élongation se
répète chaque fois qu’un acide aminé est ajouté
à la chaine polypeptidique, et ce , jusqu’à ce
que celle-ci soit complète.
II.4.3 Terminaison
L’élongation se poursuit jusqu’à ce que l’ un
des codons d’arrêt (codon stop) de l’ARNm
atteigne le site A du ribosome. Une protéine
appelée facteur de liaison se lie alors
directement au codon de terminaison du site A
et ajoute une molécule d’eau au lieu d’un acide
aminé à la chaine polypeptidique enfin
terminée.
II.4.3 Terminaison
La liaison entre la chaine polypeptidique et
l’ARNt qui se trouve au site P est hydroxylée afin
que le polypeptique puisse se détacher de la
grande sous-unité ribosomique. Le reste du
complexe de traduction se dissocie alors; les
ribosomes retournent donc dans la réserve de
ribosomes sous la forme de sous-unités
dissociées.
III. Rôles du réticulum endoplasmique
Le réticulum endoplasmique joue plusieurs
rôles:
-la synthèse de protéines : REG
-synthèse des lipides: REL
-glycosylations;
-détoxification;
-stockage et cheminement intracellulaire;
-biogenèses des membranes.
 synthèse de protéines
Très abondant dans les cellules spécialisées
dans la production de protéines secrétées .
Exemple: Cellules acineuses pancréatiques
 synthèse des lipides et détoxification de
substances chimiques
-Synthèse des acides gras et des
phospholipides.
-Quantité variable, abondant dans les
hépatocytes: modification ou détoxification de
substances chimiques (pesticides,
carcinogènes, médicaments) par enzymes à
cytochrome P450.
synthèse des lipides et détoxification de
substances chimiques
-Assemblage des bicouches lipidiques dans
le RE avec synthèse de toutes les classes
majeures de lipides, phospholipides et
cholestérol du coté cytosolique.
-Synthèse et assemblage des lipoprotéines.
-Synthèse des céramides, exportés dans le
Golgi.
-Source de lipides pour la membrane
externe de la mitochondrie
Enzymes à cytochrome P450
Prolifération de REL après traitement
d’hépatocytes par Phénobarbital


Détoxification Elimination

stockage et cheminement
intracellulaire
Le reticulum Sarcoplasmique
GLYCOSYLATION
La glycosylation est une réaction enzymatique
consistant à lier de façon covalente un glucide
à une chaîne peptidique, une protéine, un
lipide ou d'autres molécules…
Le processus de glycosylation débute dans
le réticulum endoplasmique rugueux (RER) et
s'achève dans l'appareil de Golgi.
FIN

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