Les structures et les fonctions des

gènes

1. Introduction
2. La molécule d'ADN
3. La duplication de la molécule d'ADN : la réplication
3.1. Réplication et division chez les procaryotes
3.2. Réplication et division chez les eucaryotes
4. Le décodage du langage ADN en langage protéique
Transcription – traduction
5. Le code génétique
Dégénéré, imparfait, universel

Les structures et les fonctions des

gènes

6. Différences essentielles entre les gènes eucaryotes et les

gènes bactériens
7. Le gène en mosa ïque des eucaryotes
Exons et introns
8. Les bégaiements de l'ADN eucaryotique
Familles multigéniques et ADN répété s silencieux
9. La mobilité du matériel génétique
Les gènes "sauteurs" ou transposons
10. En guise de conclusion

1
 Trois événements de la génétique
moléculaire

• Découverte des chromosomes comme support

de l'information génétique, les gènes (Morgan,
1900)
• Découverte des constituants des chromosomes :
protéines et ADN (1930)
• Découverte de la nature de l'information
génétique : ADN (Avery et al.)

Matériel de travail

• Les procaryotes : bactéries

(Escherichia, Pneumococcus).
• Les bactériophages (virus)

2
 Différences entre procaryote et
eucaryote
• Procaryote : pas de noyau, le
chromonème dans le cytoplasme,
essentiellement constitué d'une molécule
d'ADN
• Eucaryote : un noyau, le chromosome à
structure chimique plus complexe, séparé
du cytoplasme par une membrane
nucléaire

3
Structure de la
molé
mol écule d'ADN. A
droite, la double
hélice. A gauche,
fragment de
double héh élice
aplatie où
o ù les liens
d'hydrogè
d'hydrog ène entre
les bases azoté
azotées
des deux brins de
l'hé
l'hélice sont
repré
repr ésent
senté és par
des pointillé
pointillés

4
 L'ADN

4 molécules de base = nucléotides

1 nucléotide = base azotée + groupe phosphate
+ sucre (désoxyribose)
1 nucléoside = base azotée + sucre (désoxyribose)
4 bases azotées
l adénine (A) et guanine (G) = purines
l cytosine (C) et thymine (T) = pyrimidines

5
 L'ADN

a4 nucléotides :

dAMP désoxyadénosine 5' – monophosphate

dGMP désoxyguanosine 5' – monophosphate
dCMP désoxycytidine 5' – monophosphate
dTMP désoxythymidine 5' – monophosphate

L'ADN

• Egalité dans les quantités de nucléotides

pyrimidiques (T+C) et puriques (A+G)
• Chaque paire de base contient une base
purique (A ou G) et pyrimidique (T ou C)
• ADN est une double hélice, chaque hélice
est une chaîne de nucléotides, les deux
hélices sont antiparallèles
5' â 3' et 3' â 5'
• Appariement des bases A = T et C = G

6
Les liaisons de covalence
entre les différents
composants d'une chaîne
polynucléotidique de
l'ADN
A. Une partie de chaîne
polynucléotidique

7
 Implication de la structure de l'ADN

1. Mode de réplication ou duplication

car chaque base spécifie la base
complémentaire
Ø Réplication semi-conservative
Ø Réplication des chromosomes à la
méiose est également semi-
conservative (chaque chromatide est
une molécule unique d'ADN)

8
Schéma représentant
la réplication semi-
conservative d'une
molécule d'ADN

9
 La réplication
de la molécule
d’ADN

Implication de la structure de l'ADN

2. La séquence des paires de

nucléotides dicte la séquence des
acides aminés de la protéine
spécifiée par le gène
Ø Code génétique

10
 Réplication et division chez les
procaryotes
• Division de la cellule bactérienne suivant de peu
la réplication
• Initiation de la réplication du chromosome unique
– le chromonème – en un seul point, de manière
bidirectionnelle
• Site d'initiation de la réplication : le mésosome
• Réplication du DNA + division cellulaire
Ú reproduction conforme

Cycle de division
bactérien

11
 Réplication et division chez les
eucaryotes
• Matériel génétique présent dans le noyau
et les organites cytoplasmiques
(mitochondries, plastes)
• Constitution plus complexe des
chromosomes (ADN, ARN + protéines)
• Réplication de l'ADN précédant la division
cellulaire

La mitose
• Deux processus distincts : la caryocinèse et la
cytodiérèse
• Deux événements principaux :
a) Doublement du matériel génétique =
interphase
b) Division ou partage de ce matériel entre deux
cellules filles identiques entre elles et
identiques à la cellule mère initiale

12
La réplication
de la molécule
d’ADN

13
 La mitose
• Réplication de l'ADN durant l'interphase, avec les
3 stades G1 – S – G2
Ú G1 : 1 chromosome = 1 chromatide = 1 molécule d’ADN
Ú S : synthè se d'une molécule d’ ADN en cours
ÚG2 : 1 chromosome = 2 chromatides = 2 molécules d’ADN
G 1 = 2n ADN S = 4 n ADN G2 = 4 n ADN
• Mode de réplication des chromosomes
eucaryotiques est semi-conservatif, conséquence
du processus de réplication de ADN

Réplication et division chez les

eucaryotes
• Mode de r éplication des chromosomes est
semi-conservatif et est la conséquence
directe du processus de réplication de
l'ADN
• Plusieurs sites de réplication sur le
chromosome
• Vitesse de réplication moins rapide

14
 Extension et fusion
de deux unités de
réplication

Décodage du langage ADN en langage

protéique

• Information génétique de l'ADN lue sous une

copie conforme : "messager" (ARNm)
• Gènes recopiés en fonction des besoins de la
cellule
• Copie du gène est mobile
• Synthèse de la protéine dans le même
compartiment cellulaire chez les procaryotes,
dans un compartiment différent chez les
eucaryotes (cytoplasme)

15
Décodage du langage ADN en langage
protéique

• Décodage se fait à travers deux étapes :

transcription et traduction
Ø Transcription : ARN messager composé de codons
(groupe de 3 bases adjacentes ou triplets)
Ø Traduction : ribosomes, ARNt, ARNr, acides aminés –
ARNr avec anticodon
• Mécanismes de régulation (promoteur –
répresseur ou inducteur – opérateurs)

Schéma de la synthèse protéique chez les eucaryotes 1. ADN du gène

comprenant 3 exons (a, b, c) séparés par des introns. 2. transcription du
gène en ARN prémessager 3. ARN messager fonctionnel

16
 Les composants de l’ARN différents de ceux de l’ADN

Transcription
ADN â ARN polymérase â ARN messager

17
 Transcription

Traduction

• Ribosomes, ARN de transfert, ARN ribosomiques,

acides aminés
• Ribosomes; en association avec ARNr
Ú système de lecture
• ARNt Ú système d'adaptateurs, en assemblant
les acides aminés, outil de décodage
• Acides aminés Ú chaîne polypeptidique (20 a.a.)

18
19
 Mécanismes de régulation

• Expression des gènes en fonction des

besoins de la cellule
• Promoteur : séquence de l'ADN où est
initié la synthèse du messager
• Protéines : répresseurs et inducteurs,
reconnaissant des segments ADN,
appelés opérateurs
Údébut ou non de la transcription

20
21
 Le code génétique
• Règle de correspondance entre l'alphabet
nucléique (4 lettres) et protéique (20 lettres)
• ADN contient les séquences de base
Ú copie exacte mais complémentaire grâce à
l'ARNm
• Les 4 lettres du code = A, U, G, C
• La clé du code = anticodon présent dans ARNt
"adaptateur "

Le code génétique
• Les codons = des triplets ou séquence de 3
bases
• Pourquoi ?
• Avec les 4 lettres A, U, G, C un code impliquant 3
lettre donne 4 3 ou 64 combinaisons, ce qui est
nécessaire pour diriger l'insertion de 20 acides
aminés différents dans la synthèse des chaînes
polypeptidiques
Ø Le code à 3 lettres doit être retenu même s'il est
surcapacitaire

22
Quelques propriétés du code génétique

• 1 acide aminé peut correspondre à 1 Ú6 codons

seul methionine et tryptophane = 1 codon
• 3 codons UAA, UGA et UAG ne correspondent
pas à un acide aminé, mais marquent une fin de
chaîne
• 1 codon code pour un acide aminé tout en étant
initiateur de chaîne :AUG (méthionine)
Ü
code dégénéré, imparfait, universel

23
 Différences entre gènes d'eucaryotes et
gènes bactériens

• Chez les organismes inférieurs

tout l'ADN a une fonction génétique, suite
de gènes de structure (protéines) et de
régulation, colinéarité parfaite entre la
séquence des bases du gène et celles des
acides aminés dans la protéine
correspondante

Différences entre gènes d'eucaryotes et

gènes bactériens
• Chez les organismes supérieurs
Une grande partie du génome ne dirige la
synthèse d'aucune protéine ou ARN, séquences
non codantes à l'intérieur des gènes, quantités
importantes de séquences répétées
Aucune proportion entre le nombre de gènes et la
quantité d'ADN d'une cellule
Escherichia coli 4.000 gènes Ú 3 millions de pb
Etre humain 100.000 gènes Ú 3 milliards de pb

24
25
 Taille du génome haploïde d’organismes choisis comme
systèmes génétiques modèles (en paire de nucléotides)

Organisme Groupe Taille du

génome
T4 bactériophage 2.0 x 105
E. Coli bactérie 4.2 x 106
Saccharomyces cerevisiae levure 1.8 x 107
Neurospora crassa moisissure 2.7 x 107
Arabidopsis thaliana plante 1.0 x 108
Drosophila melanogaster insecte 1.4 x 108
Mus musculus mammifère 3.0 x 109
Homo sapiens mammifère 3.3 x 109
Zea mays plante 5.4 x 109

Les classes au sein de l’ADN

eucaryotique
• ADN non répétitif
50 à 70% du génome, une partie Ú introns
• ADN modérément répétitif
1 à 30% du génome
• ADN hautement répétitif
5 à 10 % du génome
- à séquences courtes ou ADN satellite
- à séquences plus longues
- ADN en palindrome

26
 ADN en palindrome

Le concept des gènes « mosaïque » chez les

eucaryotes
• L'hybride ADN – ARN Ú mise en évidence de boucles
d'ADN simple brin, séparées par des régions en
hétéroduplex
-------------------------------------------------------------------------- m ARN

IntronsÖ Exons

• Conséquence de cette structure du gène en mosa ïque

Transcription Ú ARN prémessager (exons + introns )
Excision et épissage de ARN prémessager Ú ARN messager
• Rôle des introns : contrôle de l'expression par des
mécanismes de recombinaison

27
 Schéma de la synthèse protéique chez les eucaryotes 1. ADN du gène
comprenant 3 exons (a, b, c) séparés par des introns. 2. transcription du
gène en ARN prémessager 3. ARN messager fonctionnel

28
 Importance du morcellement des
gènes chez les eucaryotes

Ø Réassortiment de fragments de gènes par

des mécanismes de recombinaison
(échanges de segments chromosomiques par
cassure et réassociation au niveau de régions
homologues)

Importance du morcellement des

gènes chez les eucaryotes

Ø Grande variété de produits fabriqués par le

gène
Ex les lymphocytes produisent de nombreux anticorps à
partir du réassortiment de fragments chromosomiques
Ø L'ADN eucaryote possède non seulement des
séquences non codantes dans le gène (c.à.d.
les introns) mais également des séquences
non codantes entre les gènes

29
 Familles multigéniques et ADN répétés
silencieux chez les organismes supérieurs
• Redondance génétique
• Si les séquences codantes sont répétées
Ø formation de famille "multigénique", duplication de gènes et
apparition d'isogènes
• Famille « multigénique»
Ø permet la fabrication simultanée ou successive de produits de
même nature mais adaptés aux différentes situations de
l'organisme
• Séquences non codantes répétées
Ø polymorphisme génétique, régulation dans l'expression des
gènes ?

Mobilité du matériel génétique : gènes

"sauteurs" ou transposons
• Les transposons sont des segments
d'ADN de longueur variable, renfermant ou
non des régions codantes, presque
toujours encadrés par de courtes
séquences nucléotidiques identiques (TR
"terminal repeat")
• La structure du transposon permet son
intégration ou son excision des
chromosomes qui l'abritent

30
Mobilité du matériel génétique : gènes
"sauteurs" ou transposons
• Rôle : modifie l'expression du gène
(activateur ou inhibiteur), introduit de
nouveaux facteurs dans le génome
Ø Exemple : rétrovirus Ú modifiant la régulation
des oncogènes cellulaires
• Séquences répétées et transposables : 80
à 90% du génome eucaryote
Ø modifications transitoires ou irréversibles du
matériel génétique

31
 Structures et fonctions des gènes

• mécanisme de r éplication Ú reproduction

fidèle
• séquences de bases Ú expression
particulière des génotypes
• séquences codantes et non codantes,
gènes sauteurs ou transposons, motifs
répétés dans le génome Ú
polymorphisme génétique des individus

Structures et fonctions des gènes

• mutation, recombinaison intra- et

interchromosomique, environnement
Úmodulation de l'expression des
génotypes
Ø ce polymorphisme intervient dans l'analyse de
la transmission des caractères

32
 Questions relatives au chapitre sur les
structures et la fonction des gènes

• quelles sont les différences essentielles

au niveau de l'organisation de
l'information génétique entre eucaryotes
et procaryotes ?
• quelles sont les deux propriétés
fondamentales de la molécule d'ADN ? et
leur signification ?
• quel est le rôle de l'interphase dans le
cycle de division cellulaire et nucléaire ?

Questions relatives au chapitre sur les

structures et la fonction des gènes
• comment s'établit la correspondance
entre le langage nucléique et le langage
protéique ?
• pourquoi le code g énétique est-il qualifié
de dégénéré et d'imparfait ?
• la redondance génétique des eucaryotes
a-t-elle des conséquences génétiques
substantielles ?
• existe-t-il une relation entre norme de
réaction et redondance génétique ?

33
 Les phénomènes épigénétiques

« Phénomènes qui engendrent des

modifications au niveau du
fonctionnement des gènes, héréditaires au
niveau de la mitose et/ou de la méiose,
sans modification concomitante du
séquençage ADN »

Hérédité épigénétique

Epigénétique
Le génome est considéré comme un
système régulateur complexe; c’est un
élément stable et stabilisateur mais
non suffisant pour expliquer le
processus dynamique de la vie ð
d’autres instructions interviennent
dans l’organisation du vivant

34
 Epigénétique
Les gènes sont régulés par des facteurs génétiques
mais également non-génétiques

• A quel(s) niveau(x) se manifestent ces facteurs

non génétiques ? Chromosome – cellule –
organe – contexte écologique ou social ?
• Comment se développe et évolue le génome au
cours du temps ?
• Le génome est-il stable ?
• Quelle approche génétique doit-on adopter pour
son étude ?

Epigénétique
• La fonction d’un gène ne dépend pas
uniquement de sa séquence mais
également de la structure génétique,
chromosomique et environnementale
dans laquelle il se trouve et dont il subit
les effets.
• L’ADN hérité n’est pas seul à intervenir
dans l’étude de la transmission des
caractères.

35
 Epigénétique
• Un gène endommagé peut être réparé ou
remplacé par un gène semblable avec une
fonction analogue.
• Un même gène peut coder pour
différentes protéines dont la production
est induite en fonction de circonstances
variables.
• Le génome peut être influencé par des
facteurs extérieurs et environnementaux.

Epigénétique
L’environnement et l’organisme sont liés;
cette interaction se traduit par une vision de
la génétique plus globale que celle du gène
isolé. Seul l’organisme entier, avec tous ses
stades d’évolution et ses différents milieux
ambiants, permet la compréhension de la
régulation génique.
On considère la fonction des gènes au
départ de l’organisme (et non
l’organisme au départ des gènes)

36
 Les composants de l’ADN

Thymine
Adénine Guanine (2,4-dihydroxy -5-
(6-aminopurine) (2-amino-6-hydroxypurine)
Cytosine
méthylpyrimidine)
(2-hydroxy -4-
aminopyrimidine)

Désoxyribose Acide
phosphorique

37
Les liaisons de covalence entre les différents composants
d'une chaîne polynucléotidique de l'ADN

B. Liaison glucosidique
entre une pyrimidine et
un sucre :
désoxyribonucléoside,
désoxycytidine ou
désoxythymidine

C. Liaison glucosidique
entre une purine et un
sucre : désoxyadénosine
ou désoxyguanosine

38
D. Formation d’un
nucléotide ou
désoxyribonucléoside 3’
– monophosphate par
liaison entre un
nucléoside et l’acide
phosphorique, la liaison
se faisant à partir du
carbone 3 du sucre

E. Formation d’un
désoxyribonucléoside 5’
– monophosphate, la
liaison entre nucléoside
et acide phosphorique se
faisant à partir du
carbone 5 du sucre

39
 Appariement des bases azotées par liaisons hydrogène

A. La thymine est
liée à l'adénine
par deux liaisons
hydrogène

B. La cytosine est
liée à la guanine par
trois liaisons
hydrogène

Schéma d'un
ribosome occupé à
traduire un ARN
messager. En bas,
schéma de la
structure d'un ARN
de transfert. La
molécule est en
réalité enroulée sur
elle-même, elle est
aplatie pour la
clarté du schéma

40
Déplacement

Traduction

41