Plan dexprience

F. KOHLER

Notion de plan dexprience

Exprience
preuve, essai effectus pour tudier un
phnomne
dans le langage scientifique, fait provoqu ou
attendu pour vrifier une hypothse, une loi, et arriver
ainsi une connaissance thorique de la faon dont
se passent les choses

La notion dexprience soppose celle

denqute.
Enqute : on observe des phnomnes tels quil se
prsentent naturellement sans les influencer
Exprience : on provoque les phnomnes auquel on
sintresse en matrisant certains facteurs

Facteurs contrls et non contrls

On introduit la notion de plan dexprience pour matriser
quelques facteurs
Mais il reste de nombreux facteurs non matriss, non
contrls
Les concepts ont t introduits au dbut du sicle (1919)
en Angleterre par Ronald A Fisher dans le secteur
agronomique puis dans lindustrie et dans le domaine
biologique et mdical
Le passage dun domaine lautre est essentiellement
une question de vocabulaire et dquilibre entre les
diverses composantes du plan dexprience

Les types de facteurs

Matrise en attribution :
Lexprimentateur peut dcider de lattribution du
facteur :
Pour un problme mdical donn : Soins domicile / Soins
lhpital

Matrise en niveau :
Le niveau du facteur peut tre dcid par
lexprimentateur :
Pour un problme mdical donn : Matrise de la dose de
mdicament administre

Facteurs totalement contrls :

Matriss en Attribution et en Niveau

Plan dexprience ou protocole

Doit tre crit et comporter les lments suivants :
La dfinition du ou des buts et des conditions de
lexprience
La dfinition du ou des facteurs dont on dsire tudier
linfluence, et de ses ou de leurs modalits, auxquelles on
associe la notion dobjets
La dfinition des individus ou dune manire plus gnrale,
des units exprimentales quon se propose dobserver
La dfinition des observations qui doivent tre ralises
La manire dont les diffrents objets devront tre affects
aux diffrentes units exprimentales, en constituant le
dispositif exprimental
Des informations gnrales relatives lanalyse des
rsultats

Treatment design et experimental

design

Il y a lieu de distinguer
Le choix des facteurs, leurs modalits et les combinaisons de modalits :
organisation des objets ou des traitements : treatment design

Le choix du dispositif exprimental

experimental design

Exemple : on dsire tudier trois mdicaments avec deux doses chacun

Treatment design (plan) :
Mdicaments/Doses

Experimental design (dispositif) :

Chaque sujets peut recevoir toutes les modalits des traitements et des doses dans un
plan adquat
Chaque sujets peut ne recevoir quun mdicament et quune dose dans un autre plan

Lobjectif du dispositif exprimental est dobtenir un essai

Dune puissance maximale
Dune interprtation simple et permettant raisonnablement dattribuer la causalit
des phnomnes observs
Dun faisabilit pratique et thique

Plan exprimentaux et analyse de

la variance
Lobjectif de lanalyse de la variance est de
comparer des ensembles de deux ou plusieurs
moyennes
Dveloppe par R.A. Fisher pour linterprtation
des rsultats dexprience
En fonction du nombre de facteurs ou de critres
de classification pris en considration on parle
danalyse de la variance un facteur ou une
voie, deux facteurs
Lanalyse de la variance peut tre considre comme
un cas particulier de la rgression linaire ou du
modle linaire gnral (Procdure GLM de SAS)

Exemple agronomique
But :
comparer 4 produits fongicides avec un tmoin ne subissant
aucun traitement fongicide, et de comparer les traitements
fongicides entre eux sur une culture de pomme de terre ralise
en petites parcelles

Objets :
les quatre fongicides sont dsigns par les chiffres 1 4, le
tmoin par le chiffre 5

Units exprimentales
Parcelle de 15m par 3m. Les cinq objets sont rpts 4 fois,
lexprience se fait sur 20 parcelles

Observations
Critre principal : rendement
Critre secondaire dveloppement de la culture, incidents
(maladies, parasites)

Exemple agronomique
Dispositif exprimental

Dispositif en blocs alatoires complets

Analyse des rsultats

Analyse de la variance 2 critres de classification
avec interaction (Traitements, Blocs)
Complte si ncessaire par un test de Dunnett pour
comparer les 4 fongicides au tmoin et de Newman et
Keuls pour la comparaison des 4 fongicides entre eux

Buts et conditions de ralisation

Les buts peuvent tre varis :
tudier un certain nombre de facteurs en vue didentifier celui ou
ceux qui savrent les plus influents
tudier un ou plusieurs facteurs en vue de dterminer des
conditions optimales de production ou de fabrication

Mais :
De telles dfinitions ne sont pas suffisantes
tudier un ou plusieurs facteurs avec ou sans leurs interactions ?
Comparer plusieurs moyennes sagit-il de comparer un certain
nombre de traitements entre eux ou sagit-il de comparer un certain
nombre de traitements avec un ou plusieurs tmoins

Quand plusieurs objectifs sont poursuivis, il est ncessaire

dtablir un ordre de priorit.

Conditions de ralisation
Lexprience est conduite :
A lchelle du laboratoire exemple CIC
A lchelle de la pratique hospitalire
A lchelle de la pratique de ville

Lexprience est elle isole ou sinsre-telle dans un ensemble dexpriences de

mme nature poursuivant le mme objectif
en mme temps ou des temps diffrents

Facteurs et objets
Un facteur est constitu dune srie dlments :
diffrents produits ou diffrentes doses dun
produit par exemple
Un facteur est qualitatif : exemple diurtique, anti
enzyme de conversion
Un facteur est quantitatif : exemple dose dun
mdicament, poids du foie dun individu

Les diffrents lments individuels qui

constituent un mme facteur sont appels
modalits. On peut introduire la notion de
variantes pour les facteurs qualitatifs et de
niveaux pour les facteurs quantitatifs

Facteurs et objets
Un, deux, plusieurs facteurs peuvent tre pris en
compte au cours de la mme exprience
Le terme dobjet dsigne
soit les diffrentes modalits dune exprience qui ne
fait intervenir quun facteur
soit les diffrentes combinaisons des diffrentes
modalits des diffrents facteurs qui interviennent
Dans lexprience des fongicides
Traitements : 5 modalits => 5 objets
Blocs : 4 modalits => 4 blocs

Ce concept global est souvent dsign comme

traitement

Notion de placebo, simple aveugle

double aveugle

Placebo
Dans le domaine mdical, lvaluation dun traitement se fait par rapport une
substance inactive appele placebo

Simple aveugle :
Dans cette procdure, le malade ne connat pas la modalit du traitement qui lui
est administr. (En France la rglementation oblige un consentement libre et
clair du patient participer lessai)

Double aveugle
Dans cette procdure, ni le mdecin, ni le patient ne connaissent la modalit du
traitement qui est administr.

Double aveugle double placebo

Quand des raisons pratiques permettent didentifier le traitement, on peut avoir
recours cette technique : le patient reoit en mme temps les deux traitements
dont dans une modalit, le premier est le placebo du premier et le second le
produit actif et rciproquement.
Exemple essai de comparaison dun produit disponible uniquement en IV et dun
comprim. On ralise un essai dans lequel la premire modalit de traitement associe
[IV placebo et comprim actif] et la deuxime [IV actif et comprim placebo]

A noter que non seulement ladministration peut se faire en aveugle mais

galement la lecture et linterprtation des examens

Plans factoriels complets

Le plan factoriel est complet quand chacune des
modalits de chacun des facteurs est associe
chacune des modalits des autres facteurs.
Lensemble des objets ainsi dfini constitue un maillage
carr ou rectangulaire dans un plan 2 facteurs et
cubique ou paralllpipdique dans le cadre de 3
facteurs
Autrement dit, toutes les combinaisons de toutes les
modalits des diffrents facteurs sont examines.
Dans lexemple des fongicides
Chaque bloc comporte les 4 modalits des fongicides et le placebo
Les 4 modalits des fongicides et le placebo se retrouvent dans
chaque bloc

Plans factoriels complets

La structure gnrale de lensemble des objets des plans factoriels est
reprsente par des expressions du type :

h1
1

h2
2

h3
3

P P P ....
O P1, P2, dsignent les nombres des diffrentes modalits des
diffrents facteurs et h1, h2, les nombres de facteurs correspondant.
Exemple 324 dsigne un plan ou deux facteurs font intervenir 3
modalits et 1 facteur 4 modalits
La somme h1+ h2 + Correspond aux nombre de facteurs tendis que le
produit P1 ^ h1 * p2 ^h2 * donne le nombre total dobjets
soit 36 dans le cas 324

Les diffrents objets peuvent tre reprsents par la combinaison des

modalits des diffrents facteurs

Exemple
Dans un plan 2 facteurs 22
Traitement :diurtique, anti-enzyme de
conversion
Dose : dose 1 et dose 2

Les diffrents objets sont :

11, 12, 21, 22

Cest ainsi quil doivent tre identifi dans

un fichier qui doit tre trait pas SAS

Plans factoriel factionnaires

Ils ont constitus dun sous ensemble
dobjets judicieusement choisis dun plan
complets
Il y a perte dinformation notamment de
linteraction

Plan non factoriel

Utilis pour dterminer les relations qui
expriment au mieux la ou les
caractristiques observes en fonction
des facteurs mis en exprience.
Les relations sont le plus souvent des
quations de rgression quadratique
Lobjectif final est de dterminer des
conditions optimales de production

Unit exprimentale
Lunit exprimentale est llment de
base de lexprience qui est considr
individuellement durant tout le processus
exprimental
Exemple
Un animal, un lot , un patient, un lot de
patient, une partie de patient (lame)

Nombre de sujets ncessaires,

prcision des rsultats
Pour une exprience donne, en fonction
de diffrents paramtres (risques alpha,
beta, variabilit attendue du phnomne,
diffrence minimale) on peut dterminer
le nombre de patients devant constituer un
groupe de patient
Pour une exprience donne, on peut
calculer la prcision des rsultats

Dispositif compltement alatoire

Principe :
Affecter les diffrents objets ou units
exprimentales de manire totalement
alatoire laide dune table de nombre
alatoire

Dune manire gnrale,lanalyse de la

variance comporte autant de critres de
classification quil y a de facteurs

Dispositif en blocs alatoires

complets
Principe :
Constituer des groupes dunits exprimentales aussi
homognes que possible. Les effectifs des diffrents
groupes tant tous gaux au nombre dobjets
Rpartir ensuite tous les objets de manire alatoire
lintrieur de chacun des groupes et indpendamment
dun groupe lautre
Les groupes ainsi constitus sont appels blocs. Ils
correspondent des rptitions

Il peut sagir :
De patients ayant les mmes antcdents
De patients de mme tranche dge

Dispositif en blocs alatoires complets

Lanalyse de la variance comprend toujours un
critre de classification (facteur bloc) de plus
que le nombre de facteur tudis
Lobjectif et de gagner en prcision ou en
puissance en rduisant la variabilit alatoire :
moindre variabilit intra bloc par comparaison
la variabilit de lensemble du matriel
disponible.
=> Intra bloc aussi homogne que possible et
grande variabilit inter blocs

Dispositifs en carr latin

Cest un double rseau
de bloc
Ensemble de lignes et de
colonnes tel que chacun
des objets est prsent
une seule fois dans
chacune des lignes et
chacune des colonnes

Dispositifs en Cross-Over
Cest une extension du carr latin
Le nombre de ligne est gal au nombre
dobjets, le nombre de colonnes est un
multiple du nombre de lignes
Exemple :
4 objets => 4 lignes et 8 colonnes (8
rptitions) chaque objet figure une fois dans
chaque colonne et deux fois dans chaque
ligne

Dispositifs en Cross-Over
En mdecine, les colonnes correspondent des patients
et les lignes des priodes successives au cours
desquelles diffrents traitements sont administrs aux
mme individus. En gnral on utilise un cross-over
deux lignes
Lanalyse de la variance comporte deux critres de
classification de plus (les lignes et les colonnes) que le
nombre de facteurs envisags
Les dispositifs en carr latin et cross-over sont souvent
plus prcis que les dispositifs en bloc complets mais leurs
possibilits de ralisation sont plus limites en particulier
pour le cross-over du fait de des interfrences possibles
de deux traitements conscutifs

Autres dispositifs
Blocs incomplet quilibrs
Sont utiles quand le nombre dobjets est lev
et quand le nombre dobjets est rduit mais
que le nombre dunits exprimentales par
bloc est nanmoins infrieur au nombre
dobjets

Carr grco-latin
Carr de Youden (carr latin incomplets)

Quelques plans classiques

Plan un facteur
On dsire comparer lefficacit de 2 traitements
antimigraineux et dun placebo. Le critre de
jugement est le nombre de crises de migraine dans le
mois qui suit la mise sous traitement. Lessai doit
porter sur 90 sujets
1 facteur 3 modalits
On attribue aux diffrents patients un numro de 1
90. Alatoirement par une table de nombre au hasard
on attribue les 3 modalits de traitements

Table de randomisation

Plan avec deux facteurs sans

rptition
On dsire connatre leffet de 1
antihypertenseur chez 20 patients en
mesurant la tension artrielle systolique
au moment de la mise sous traitement
(J0), 1 mois et 2 mois de traitement
2 facteurs : Temps avec 3 modalits,
Sujets avec 20 modalits

Tableau des rsultats

et fichier de donnes

Extrait du fichier de donnes

Plan deux facteurs avec

rptitions
On dsire connatre leffet de 1
antihypertenseur chez 6 patients en
mesurant la tension artrielle systolique 3
fois au moment de la mise sous
traitement, 1 mois et 2 mois de
traitement
2 facteurs + 1 facteur bloc : Temps avec 3
modalits, Sujets avec 6 modalits, Bloc
avec 18 modalits

Tableau des donnes

Plan en carr latin

On administre 4 doses (A, B, C, D) dun
traitement 4 sujets

Plan 3 facteurs sans rptition

On dsire connatre leffet de 3 traitements
antihypertenseurs 4 temps diffrents sur 10
sujets en mesurant la TAS
3 facteurs :
Traitements : 3 modalits
Sujets : 10 modalits
Temps : 4 modalits

Tous les sujets reoivent tous les traitements et

sont examins tous les temps

Tableau des donnes

Plan 3 facteurs avec rptition

On dsire connatre leffet de 3 traitements
antihypertenseurs 4 temps diffrents sur
5 sujets en mesurant la TAS 2 fois.
3 facteurs + 1 facteur bloc
Traitements : 3 modalits
Sujets : 5 modalits
Temps : 4 modalits
Bloc : 60 modalits

Tableau des donnes

Plan 3 facteurs, facteur sujet

embot dans le facteur traitement
On dsire connatre leffet de 3 traitements
antihypertenseurs 4 temps diffrents sur 30 sujets
mais si tous les sujets sont examins tous les temps,
chaque groupe de 10 sujets ne reoit quun traitement
3 facteurs
Facteur traitement : 3 modalits, crois avec le facteur temps
Facteur temps : 4 modalits, crois avec le facteur sujet et le
facteur traitement
Facteur sujet : 30 modalits crois avec le facteur temps et
inclut dans le facteur traitement

Tous les sujets sont examins tous les temps mais ne

reoivent pas tous les traitements

Tableau des donnes

Cross over
On dsire comparer un placebo un
produit actif en cross-over chez 10 sujets

Bibliographie
Plans dexpriences. Application
lentreprise. Jean Jacques DROESBEKE,
Jeanne Fine, Gibert Saporta. Edition
TECHNIP 1997
Thorie et mthodes statistiques. Pierre
Dagnelie Vol 2. edition Presse
agronomique de Gembloux 1986