Mutation du sars-cov-2

Introduction
• La transmission communautaire du virus, ainsi que les traitements
antiviraux, peuvent engendrer de nouvelles mutations dans le virus,
entraînant potentiellement des souches plus virulentes avec des taux
de mortalité plus élevés ou l’émergence de souches résistantes au
traitement.
• Nous avons utilisé la séquence du génome de référence SARS-CoV-2 établi, NC_045512.17 ce
génome a été séquencé en décembre 2019.
• Nous avons identifié 5775 variantes distinctes du génome, y compris 2969 mutations
maladantes, 1965 mutations synonymes, 484 mutations dans les régions non codantes, 142
suppressions non codantes, 100 suppressions dans le cadre, 66 insertions non codantes, 36
variantes stop-gained, 11 suppressions de frameshift et deux insertions dans le cadre.
• Détecté en novembre au Royaume-Uni, le variant B.1.1.7, désormais appelé VOC 202012/01,
trouve « probablement » son origine dans le sud-est de l’Angleterre en septembre, selon
l’Imperial College de Londres. Il s’est rapidement étendu dans tout le Royaume-Uni et a
désormais été détecté dans des dizaines de pays du monde, des États-Unis à la Corée du Sud
en passant par l’Inde, la France ou le Danemark.
• Un autre variant, appelé 501.V2, est désormais majoritaire en Afrique du Sud. Il a été détecté
dans des échantillons remontant au mois d’octobre, puis a été repéré dans quelques autres
pays du monde, notamment le Royaume-Uni et la France.
• Ces deux variants présentent plusieurs mutations dont l’une, nommée
N501Y, est au centre de toutes les attentions. Elle se situe sur la
protéine spike du coronavirus, une pointe à sa surface qui lui permet
de s’attacher au récepteur ACE2 des cellules humaines pour les
pénétrer et joue ainsi un rôle clé dans l’infection virale.
• Nous avons constaté que plusieurs variantes du génome du SRAS-
CoV-2 existent et que le clade D614G est devenu la variante la plus
courante depuis décembre 2019. L’analyse évolutive a indiqué une
transmission structurée, avec la possibilité d’introductions multiples
dans la population.