ACIDES -amins

1- Etude strochimique dune carboxylase vitamine K Une des tapes importantes de la cascade ractionnelle conduisant la coagulation sanguine est la carboxylation dun rsidu glutamique dune protine nomme prprothrombine, par une carboxylase vitamine K. Ltude des caractristiques de cette carboxylation est ncessaire pour la comprhension du processus de coagulation. Cette comprhension permet ventuellement ensuite de mettre au point des anticoagulants anti-vitamine K. La raction de carboxylation de lacide glutamique contenu dans la prprothrombine est la suivante :
H2N CO2H CO2 carboxylase vitamine K CO2H H2N CO2H

CO2H Glu : acide glutamique

CO2H Gla : acide -carboxyglutamique

1- Les amino-acides naturels comme lacide glutamique (Glu) appartiennent la srie L. Donner, en justifiant, la configuration absolue du carbone asymtrique de lacide glutamique et reprsenter lacide L-glutamique en perspective de Cram selon la vue : La premire partie de ltude strochimique correspond la dtermination de lhydrogne H1 ou H2 arrach lors de cette raction. En remplaant H1 ou H2 par un atome de fluor, non ractif vis-vis de la carboxylation, on saperoit que seul le driv fluor de configuration (2S,4R) pourra subir la carboxylation ultrieurement. 2- Reprsenter en perspective de Cram ce driv fluor. 3- Lhydrogne qui pourra tre arrach lors de la carboxylation est-il H1 ou H2 ?

1 H2N 2 3 4 CO2H H2 H1

CO2H 5 Glu : acide glutamique

On ralise la carboxylation de lacide glutamique avec du dioxyde de carbone marqu au carbone 13, isotope du carbone 12, repr par un astrisque *CO2 : voir schma page 2. On obtient alors le stroisomre (2S,4S). 4- Reprsenter en perspective de Cram ce stroisomre. 5- Lors de la carboxylation, le dioxyde de carbone marqu *CO2 prend-il la place de lhydrogne arrach ou se place-t-il en anti par rapport cet hydrogne arrach ? Justifier en plaant cte cte le substrat et le produit de la raction.

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H2N

CO2H *CO 2 carboxylase vitamine K

H2N 2 3

1 CO H 2

*CO H 2 4

CO2H Glu : acide glutamique

CO2H 5 Gla : acide -carboxyglutamique

2- Synthse dacide amin

On traite le N-actylaminomalonate dthyle avec de lthylate de sodium puis on ajoute lintermdiaire A O form de liodomthane. Il se forme le compos B. Une C O C 2H 5 saponification prudente (2 quivalents de soude dilue) CH 3 -C-NH-CH donne C. Par acidification avec HCl dilu de la solution C O C 2H 5 aqueuse de C, il se forme D. Par chauffage de D on obtient O un racmique E + E. N-actylaminomalonate d'thyle Une enzyme: lacylase de porc, reconnat uniquement E, lnantiomre de srie L, qui est dsactyl par lenzyme pour donner F. On obtient donc aprs laction de lenzyme un mlange de F et de E inchange. Le produit F est trait par BOC en prsence de trithylamine. Il se forme G et des sous produits. A une solution de G on ajoute du DCC, du glycinate dthyle sous forme de chlorhydrate et une mole de trithylamine. On isole H, de la dicyclohexylure et du chlorure de trithylammonium. Le produit H trait par une solution aqueuse de soude conduit I, isol sous forme de sel de sodium. Enfin, laction de lacide chlorhydrique (deux quivalents), sur I fournit J, du tertiobutanol, du chlorure de sodium et on observe un dgagement de dioxyde de carbone. J est un chlorhydrate. Donnez les formules de A, B, C, D, E, F, G, H, I et J. Reprsentez E et E selon Fischer. Indiquez les configurations absolues de E, E et H. Donnez les mcanismes de formation de B et H. Quel est le rle de la trithylamine dans les synthses de G et H ? crivez les quations quilibres des ractions de formation de G, H et J.

3- Formation dacides amins A- Quels sont les acides -amins forms par les ractions ci-dessous, suivies dhydrolyse acide chaud pendant quelques heures ?
O CO2C2H5 N C CO2C2H5 O 3-CH2=CH-CO2CH2CH3 + 1-Cl -CH2-CH2-SCH3

2-Cl -CH2CO2CH2CH3

B- Mmes questions pour les deux cas ci-dessous aprs avoir identifier (X) et (Y).

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H3C CH-CH2OH H3C O CH3SH + CH2=CH-C H

CrO3,pyridine CH2Cl 2

NH4 (X) H

CN

(Y)

Na CN (NH4)2CO3

4- Identification dacides amins Trois acides amins (A), (B) et (C) de masse molculaire M = 117 g.mol-1 donnent respectivement, aprs chauffage, trois composs (A), (B) et (C). 9 Lanalyse de (A) montre quil sagit dune diisopropyldicto-1,4-piprazine. 9 (B) est obtenu en mme temps quun dgagement gazeux ; le gaz, soluble dans leau, colore la solution obtenue en rose si celle-ci contient de la phnol-phtaleine. (B) par ozonolyse dans des conditions rductrices fournit du propanal et de lacide glyoxylique : O=CH-COOH. 9 (C) est une -mthylpyrrolidone. Identifier (A), (B) et (C) et expliquer la formation de (A) , (B) et (C).
H iPr (A') O N H iPr N O (C') N H O

5- Synthse de la thyroxine La thyroxine est une hormone isole dextraits thyrodiens. Sa synthse a t ralise partir de la tyrosine , acide amin naturel.

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HO NH2 Tyrosine H (C) COOH

+ (CH3CO)2O

pyridine (A) EtOH H

(B)

TsCl (C) pyridine

HNO3 (D) qui possde 3 atomes d'azote H2SO 4 \ H2/Pd (F) HNO2 (G) (D) + paramthoxyphnol B (E) 0C I I (H) HIcc (J) ICl Al Cl3 HO I O I H

KI

(H)

thyroxine NH2 COOH

6-Synthse partir de la phnylalanine Il existe des enzymes capables de dgrader des peptides. Pour inhiber une enzyme de ce type, il est commode de synthtiser un compos ressemblant au dipeptide et bloquant le site actif de lenzyme. On envisage la synthse de la molcule (J) de formule : HS-CH2-CH-NH-CO-CH-COOH

CH2 La synthse se fait en trois tapes :

MeOH,H 1-H2N-CH-COOH CH2- (A) (R)-phnylalanine 1-EtO 2-CH3Cl pyridine 3- (D) + (G) (E)

CH3

1-LiAl H4,ther (B) 2-H3O

PCl 5 (C)

(D)

2- CH2(COOEt)2

1-HO ,1 quivalent, (F) 2-neutralisation O (H); (H) + H3C S

SOCl 2

(G)

(I) + Cl

Comment passer de (I) (J) ? Prciser le nombre de stroisomres forms et la configuration des carbones asymtriques de (J). Rappeler la mthode permettant disoler le stroisomre (R,R).
7-De la mthionine aux protines La formule semi-developpe de la mthionine est : CH3S(CH2)2CH(COOH)(NH2). Le soufre, constituant important de la matire vivante, est notamment prsent dans de nombreux polypeptides biologiques comme le glutathion et dans ses protines comme linsuline, par exemple.
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1. La mthionine, un acide amin, 1.1. Que signifie dans acide amin ? 1.2. La mthionine est obtenue sous forme dun mlange racmique. De quoi est constitu un tel mlange ? 1.3. Dessiner, en reprsentation de Fisher, les deux stroisomres D et L de mthionine et prciser la relation de stroisomrie qui les lie. 1.4. Reprsenter suivant la reprsentation de CRAM ces deux stroisomres et indiquer les configurations R ou S du(es) carbone(s) asymtrique(s). 1.5. La cystine est lautre acide amin essentiel soufr. De formule brute C3H7O2NS, elle possde un groupe mthylthiol (-CH2SH). a. Quelle est sa formule semi dveloppe ? b. Dessiner lnantiomre (R) en reprsentations de Cram et de Fisher. 2. De la mthionine aux protines 2.1.Combien de dipeptide(s) peut-on obtenir en mlangeant la mthionine et la cystine ? 2.2.Ecrire lquation de la raction de formation dun de ce(s) dipeptide(s). 2.3.Une nomenclature simplifie des peptides consiste crire la suite des radicaux corespondant aux acides amins (met pour mthionine, cys pour cystine, gly pour glycine, glu pour acide glutamique) en mettant gauche lacide amin ayant mis en jeu sa fonction acide dans la formation de la liaison peptidique. a. Nommer le dipeptide que vous avez reprsent la question 3.2.2. b. Donner la formule semi-dveloppe du tripeptide met-cys-met. c. Le glutathion est le tripeptide glu-cys-gly (le sigle devant glu indique que cest, dans le cas de lacide glutamique, lacide lextrmit de la chane qui est engag dans la liaison peptidique) ; il est prsent dans les cellules vivantes et joue le rle dagent de rduction des processus biochimiques en se laissant facilement oxyder, par voie enzymatique, au niveau du groupe mercapto (-SH) en un dimre avec pont disulfure (-S-S-). c1. Donner la formule semi-dveloppe du glutathion c2. Montrer que le passage du groupe mercapto au pont disulfure correspond bien une oxydation. Donnes : Formules semi-dveloppes de la glycine : H2NCH2(COOH) et de lacide glutamique H2NCH(COOH)CH2CH2COOH 8- Identification de quatre acides amins On donne ci-aprs le spectre R.M.N. du proton de 4 acides amins :

Alanine
H3C COOH

-Alanine

Valine
CH3

Acide 2aminobutanoque
COOH
COOH

COOH H2N
H3C

H3C NH2

NH2

NH2

Ces spectres ont t raliss en prsence dune petite quantit de D2O : cela permet de supprimer les signaux relatifs N-H et O-H par suite dchanges rapides avec D2O ; par contre il apparat un pic large correspondant H-OD. Attribuer chaque spectre lacide amin correspondant, en justifiant la rponse. Aucune table de dplacement chimique nest ncessaire pour rpondre la question.

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9-Acides amins et pKa Un acide amin pour formule gnrale :

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NH2 R=H H C COOH R = CH3 alanine R

CH3 1- Lalanine est-elle chirale ? Dfinir ce terme. 2- Reprsenter la (R)-alanine en recopiant et compltant le schma cicontre. Expliquer. 3- Une solution de (R)-alanine a-t-elle une action sur la lumire H polarise rectilignement ? Expliquer. 4- Les acides amins possdent des proprits acido-basiques dues aux fonctions amine et acide carboxylique. On sintresse la glycine. Les pKa des fonctions acido-basiques sont les suivants : pKa1(CO2H/CO2\) = 2,4 et pKa2(NH3/NH2) = 9,8 298K. a- tracer le diagramme de prdominance de la glycine en fonction du pH. b- En utilisant la mthode de la raction prpondrante, dterminer le pH dune solution aqueuse de glycine de concentration 0,1 mol.L-1. Donner la formule de lespce prdominante en solution.

glycine

11-L'lectrophorse

L'lectrophorse est une technique qui consiste sparer des espces chimiques charges l'aide d'un champ lectrique. Le mlange analyser est dpos sur une bande de papier imbibe d'une solution tampon dont le pH est fix ; la concentration des espces sparer est telle que le tampon impose son pH tout instant. Un champ lectrique est appliqu aux extrmits du papier durant un temps variable selon les espces sparer. Les composs spars sont ensuite dtects. On examine la sparation de deux aminoacides selon cette technique dans une solution tampon de pH = 6. Les pKa des deux -aminoacides sont
COOH NH2 COOH H2N NH2 Acide aspartique pKa1=2,09 pKa2=3,86 pKa3=9,82 H N COOH NH Arginine

pKa1=2,17 pKa2=9,04 pKa3=12,48

Le profil de concentration le long de la bande de papier, en fonction de la distance x l'extrmit de la bande constituant le ple \, a l'allure suivante pour le mlange de dpart (schma de gauche). Aprs application du champ lectrique durant un temps t, on obtient le profil de concentration suivant le schma de droite :
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1. Rappeler en quelques lignes la dfinition d'une solution tampon. 2. Le pKa des acides carboxyliques des -aminoacides est compris entre 2 et 4 et le pKa des fonctions amines primaires des -aminoacides est compris entre 9 et 10 ; justifier la valeur du pKa du groupe fonctionnel spcifique de l'arginine. 3. crire les quilibres acido-basiques pour l'arginine et l'acide aspartique en solution aqueuse. 4. Comment volue la charge des deux -aminoacides en fonction du pH ? 5. Quelle est la charge nette des deux -aminoacides pH = 6 ? 6. Identifier les acides amins sur le profil de concentration final, en justifiant leur position.
12-La liaison peptidique

On considre deux acides amins : la L-alanine, note Ala, et la L-cystine, note Cys
O O H3C OH NH2 [Ala] NH2 [Cys] HS OH

1. Quelle est la signification du prfixe L dans le nom conventionnel de ces deux acides amins ? Dessiner la L-Ala et la L-Cys en reprsentation de Fischer. Quelle est leur configuration absolue en nomenclature de Cahn-Ingold-Prelog ? 2. Ces deux acides amins ragissent, en milieu neutre, pour former un ou plusieurs dipeptides. Donner le mcanisme de cette raction. A quelle classe appartient-il ? 3. Combien de dipeptides peuvent tre forms ? Donner leur formule semi-dveloppe. 4. Dans les acides amins, on peut protger la fonction amine -NH2 , en formant un driv not BocNH-, et la fonction acide en formant un ester. Montrer qu'en choisissant judicieusement la
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position des groupements protecteurs, on peut former un seul dipeptide, obtenu aprs dprotection des extrmits. La synthse en phase solide de chanes peptidiques Dans la synthse par le procd Merrifield, le polystyrne utilis comprend un substituant R identique CH2Cl. On fixe un premier acide amin, l'alanine, sur le polystyrne selon la raction :

O H3C O NH2 [Ala] CH2 Cl O NH2 CH3 + CH2 O + Cl

1. De quel type de raction s'agit-il ? 2. On utilise alors un acide amin N-protg qui ragit avec l'acide amin fix sur la rsine polymrique. Ecrire l'quation de la raction. 3. On souhaite fabriquer le polypeptide (AlaCysAla). On rappelle que, dans l'criture d'une chane peptidique, l'extrmit amine (donc l'acide amin N-terminal) est gauche et l'extrmit carboxylique (donc l'acide amin C-terminal) est droite. Montrer comment on peut faire crotre la chane peptidique par une succession de ractions chimiques. 4. Pourquoi cette mthode de synthse en phase solide est-elle plus efficace qu'une mthode en solution, comme celle voque dans la question 4 du paragraphe prcdent? 5. On spare le peptide obtenu de la rsine polymrique. Comment est dfinie la structure primaire d'un peptide ? Quel type de liaison assure la structure secondaire d'un peptide ? Citer des exemples de structures secondaires de peptides. 6. Si le rendement de chaque tape (fixation d'un acide amin supplmentaire) est de 98 %, quel est, au 50 eme acide amin fix, le rendement global de formation du polymre ? Commenter, et proposer une solution permettant d'amliorer le rendement.

13-Le glutathion Le glutathion est le tripeptide -L-glutamyl-L-cystinyl-glycine de formule brute C10H17N3O6S

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O H2N C N H COOH

SH H N C O COOH

1. Liaison peptidique

1.1. Donner la dfinition d'une liaison peptidique. 1.2. Des tudes ralises sur des peptides cristalliss ont montr que les quatre atomes de la liaison peptidique et les deux carbones situs de part et d'autre sont dans un mme plan les angles au niveau de l'azote sont voisins de 120 la liaison CN est plus courte que celle existant dans une amine. Proposer des formes msomres, accompagnes d ' un bref commentaire, pour expliquer les observations exprimentales. Citer un type de structure secondaire de protines o l'on retrouve cette gomtrie.
2. Hydrolyse du peptide

Un chauffage du glutathion pendant 24 heures dans de l'acide chlorhydrique assez concentr conduit l'hydrolyse des fonctions amides. 2.l. Rappeler l'quation-bilan puis le mcanisme de la raction d'hydrolyse acide d'un amide (utiliser une criture simplie pour reprsenter l'amide). 2.2. L'acide glutamique (acide N-terminal du glutathion) est alors transform en lactame ou amide cyclique. Ecrire la formule semi-dveloppe du lactame obtenu.
3. tude de la cystine

3.1. Reprsenter l ' aide d' une projection de Fischer la L-cystine qui est le deuxime acide amin dans le glutathion. Dterminer la configuration absolue du carbone asymtrique, en utilisant les conventions de Cahn, Ingold, Prelog. 3.2. La cystine et la srine ne diffrent que par un atome : l'atome d'oxygne de la srine est remplac dans la cystine par un atome de soufre. 3.2.a. Quelle fonction chimique cet atome confre-t-il la cystine ? 3.2.b. Trois pKa sont attribus la cystine : 1,7; 8,3 ; 10,8. Attribuer chaque valeur aux diffrents couples acido-basiques de la cystine. 3.2.c. Pour la srine, deux valeurs de pKa sont mesurables en solution aqueuse: 2,2 9,2. Proposer un solvant protique dans lequel on pourrait mettre en vidence le troisime couple acido-basique de la srine. 3.2.d. Comparer la basicit et la nuclophilie de ce troisime couple celui qui lui est comparable dans la cystine. 3.3. Pour identifier la cystine en prsence d'autres acides amins non soufrs, on ralise une chromatographie sur papier. La rvlation est effectue en vaporisant successivement une solution contenant du diiode puis une solution d'empois d'amidon. Les taches de cystine sont incolores sur fond bleu. Interprter cette exprience illustrant le rle rducteur de la cystine. Ecrire l'quation-bilan de la raction en donnant la formule semi-dveloppe du compos organique obtenu.

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14-Sparation dacides amins On veut raliser la sparation de 5 acides amins (Glu, Met, Tyr, Lys, Ser). On utilise pour cela 5 g de rsine sche de polystyrne sulfon que l'on dispose dans une colonne ouverte. La rsine est lave par une solution d'HCl (1 M) en excs. Aprs ce traitement, la rsine est lave l'eau distille. On fait alors passer une solution de NaCl (2 M) en excs. Questions :

1 - Les 5 acides amins sparer sont solubiliss dans un tampon pH = 3,8. A ce pH, quels sont les composs qui seront retenus sur la rsine ? 2 - Aprs avoir charg la colonne par les 5 acides amins pralablement solubiliss dans le tampon pH 3,8, l'lution est ralise en gradient de pH, en augmentant le pH. Dans quel ordre les acides amins vont-ils tre lus ?

On se servira des donnes ci-aprs : acide amin : Glu Met Tyr Lys Ser pK - COOH 2,19 2,28 2,20 2,18 2,21 pK - NH2 9,67 9,21 9,11 8,95 9,15 pK -R 4,25 10,07 10,53 -

15-Synthse dun acide amin 1- Combien existe-t-il de stroisomres de lacide cinnamique ? Dessiner les et nommer les.

Acide cinnamique

2. Quelle relation de strochimie relie ces acides cinnamiques ? 3. Le compos A est trait selon la squence de ractions suivantes :

H COOH HO SOCl 2 B H (-)Menthol C

Donner la structure de B et C.

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4. Dnombrer les carbones asymtriques du (-) menthol et donner leur configuration absolue en prcisant les ordres de priorit.

5. Le compos C obtenu en question 3, est trait par le brome pour conduire deux produits D et D.
Br2 C D + D'

Donner la structure de D et D en projection de Fischer. Le groupement (-) menthyle est reprsent par M* et le groupement phnyle par C6H5.
COOM'

COOM'

C6H5

C6H5

Ces composs D et D sont-ils : conformres, nantiomres, diastroisomres ou identiques ? 6. Donner le mcanisme de formation de D et D. On simplifiera les critures en notant le groupement (-) menthyle par M* et le groupement phnyle par ou C6H5. 7. En traitant le mlange D + D par lammoniac puis en sparant les produits obtenus, on obtient laziridine E. Ce compos est alors trait par un thiol pour conduire F. F est transform en plusieurs tapes en G, un analogue de la cystne.
COOM* H R-SH N H Aziridine E C6H5 F R= H3CO CH2 C6H5 G H RS COOM* NH2 H H HS

C6H5 H D + D' NH3

COOM* NH2 H

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Proposer un mcanisme pour la transformation de E en F qui explique la strochimie de la raction. On sinspirera de louverture dpoxydes en milieu basique. A quel type de mcanisme a-t-on affaire ici ? Et quelle est la consquence de ce mcanisme du point de vue de la strochimie? 8. A quelle srie appartient lacide amin G ?
16-Configurations Reprsenter selon Fischer lnantiomre de srie L des deux aminoacides suivants. Indiquer la configuration absolue de ces deux composs.
NH2 HS COOH NH2 S COOH

17-Configurations La thronine et lisoleucine sont des acides amins possdant deux carbones asymtriques. Les nommer en configuration absolue et les reprsenter selon Fisher.
HO H H OH H2N O H2N O H H OH

thronine

isoleucine

18-Synthse partir dun acide amin 1- Le monoester mthylique de lacide (R) glutamique A est chauff reflux et conduit lacide pyroglutamique B.
O CH3-O-C-(CH2)2-CH-COOH A NH2 O N H B H C2H5OH COOH H C 2-H3O

1-LiAl H4,ther D

B trait par lthanol en milieu acide conduit C ; ce dernier soumis laction de LiAlH4 puis hydrolys donne le produit D (prolinol) de formule molculaire C5H11ON. a- Complter la reprsentation perspective du compos A en la justifiant :

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O COOH H3C

b- A quel type de raction correspond la transformation AB ? dtailler le mcanisme de cette raction. Quelle est la strochimie du compos form B ? c- Dtailler le mcanisme de la raction BC ; donner les formules de C et D ; prciser la strochimie de D. 2- La fonction amine du prolinol est protge sous la forme du driv actyl E ; Ce dernier est soumis aux ractions suivantes :

OH N

TsCl pyridine

F (C14H19O4NS)

H2N-(CH2)3-CH3 en excs

E
H3C O

NaOH,H2O reflux

H (C9H20N2) + I

a- Indiquer les structures des produits F, G, H et I. On prcisera uniquement la strochimie de H. b- A quel type de raction correspond le passage FG ? c- Prciser le mcanisme de la raction GH + I.
19-Second principe de la thermodynamique La combustion de lalanine solide CH3-CH(NH2)-COOH, qui fournit CO2(g) , H2O(l) et N2(g) a une enthalpie standard 298 K de -1616kJ.mol-1.
1- Connaissant les enthalpies standards de formation 298K :

fH(CO2,g)= -393,1 kJ.mol-1 fH(H2O,l)= -285,2 kJ.mol-1 calculer lenthalpie standard de formation de lalanine solide 298K.
2- Lalanine ragit avec la glycine pour donner, sous certaines conditions,

lalanylglycine : (1) alanine(s) + glycine(s) alanylglycine (s) + H2O(l) Connaissant 298K les enthalpies, en kJ.mol-1 : fH(glycine,s)= -536,7 rH(1)= +34,15 calculer lenthalpie standard de formation de lalanylglycine solide 298K.
3- A laide des donnes du tableau ci-dessous, calculer rS(1), entropie de la raction

(1), puis lentropie absolue standard de lalanylglycine 298K fG (kJ.mol-1) - 368,7 - 377,5 - 237,2 S (J.K-1.mol-1) 129,1 103,4 69,9
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alanine solide glycine solide H2O liquide

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alanylglycine solide

- 489,5

Quels commentaires pouvez-vous faire sur les deux valeurs que vous venez de calculer : rS(1) et S(alanylglycine,s) ?
20- Synthse de la valine 1- Par action du dichromate de potassium, le 2-mthylpropan-2-ol, A, est transform en B. On prcise que le spectre I.R. de B comporte une absorption 1720 cm-1 et son spectre R.M.N. du NH2 proton un signal vers 9,5 ppm. 2- Laction de HCN sur B conduit C. Donner C et OH prciser le mcanisme de la raction. 3- Par action de lammoniac chaud sur C on obtient D. Donner la formule de D, de formule molculaire O valine C5H10N2, et le type de raction utilis. 4- Lhydrolyse de D conduit la valine : Combien la valine prsente-t-elle de stroisomres ? Les reprsenter et les nommer. Quelle est leur relation de stroisomrie ? 21-Synthse de la phnylalanine 1- Le malonate de dithyle E conduit au compos F par action du dibrome en prsence de phosphore rouge. Donner la formule semi dveloppe de F. Justifier son obtention. 2- Par action du phtalimide de potassium sur F on obtient G. Donner la formule de G. 3- Par action successive de lthanolate de sodium puis du bromure de benzyle sur G on obtient H. Donner la formule de H et prciser le mcanisme de la raction. 4- Lhydrolyse chaud de H conduit notamment un compos I de formule molculaire C10H11O4N. Donner la formule de I. 5- Indiquer comment obtenir la phnylalanine partir de I.
O NH2 OH N-K

phnylalanine

phtalimide de potassium

22-Citrulline et pouvoir rotatoire

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La citrulline est un acide amin isol du melon deau et ensuite retrouve dans la plupart des tissus animaux. La citrulline nexiste pas dans les protines mais elle est le prcurseur de larginine et H NH2 N de lure. A 25C, un tube de 20 cm empli dune solution de citrulline 5% dans HCl de concentration 0,3 O H NH2 mol.L-1 fait tourner le plan de polarisation de la lumire de 1,79 vers la droite. citrulline 1- Quel est le pouvoir rotatoire spcifique de la COOH citrulline ? 2- Cette rotation spcifique permet-elle de dier si la citrulline est un acide amin de la srie D ou L ? 3- A partir de la structure donne dterminer si la citrulline est un acide amin de la srie D ou L .
23-Identification On veut identifier un acide amin A. 1- 30 mg de A sont traits par le nitrite de sodium en milieu chlorhydrique. On obtient un dgagement gazeux de 5,13 mL de diazote, mesurs 0C et 1 atm, et un produit B. 2- B soumis une oxydation douce donne naissance C qui, oxyd nergiquement chaud donne D et du dioxyde de carbone. D est estrifi par lalcool mthylique puis trait par LiAlH4 en milieu ther anhydre. Une hydrolyse ultrieure conduit un alcool primaire E prsentant lisomrie optique. Identifier A, B, C, D et E. 24-Protection et activation La bupivacane dont la formule est propose ci-contre est une substance employe comme anesthsique local et dans le traitement du cancer ou de certaines inflammations. On en propose ci dessous une synthse partir de la lysine.

H N N Bu O H3C Bupivacane

CH3

ETAPE 1 avex X = ? H3N Cl A NH3 CO2 1- 1 quivalent de LiOH(aq) 2 mol.L-1 2- PhCHO, 4C, 2h XN B CO2

NH3

ETAPE 2 XN B CO2 1- NaOH, PhCH2OCOCl solvant EtOH/H2O 2- H3O , Cl 3- puis on ajuste le pH 6,2C H3N C avec CBZ = -OCOCH2Ph CO2

NH3

NHCBZ

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ETAPE 3 H3N C CO2 NaNO2

NaOAc

AcO D

CO2H

NHCBZ

solvant AcOH

NHCBZ

NH2 AcO D CO2H

ETAPE 4 HN

NHCBZ

DCC: N C N

AcO O E NHCBZ

ETAPE 5 HN K2CO3 AcO O E NHCBZ solvant MeOH F NHCBZ HO O HN

ETAPE 6

HN TsCl , NEt3 HO O F NHCBZ

ETAPE 7 HN TsO O G NHCBZ H2/10%Pd/C K2CO3 solvantEtOH

HN TsO O G NHCBZ

HN TsO O H NH2

ETAPE 8 HN cyclisation TsO O H NH2 N H O I

H N

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ETAPE 9 H N N H I O alkylation N Bu O J H N

Questions : Etape 1 : donner le mcanisme de laction de laldhyde et la formule dveloppe complte de B ; Etape 2 : quel est le mcanisme de la raction avec PhCH2OCOCl ? Etape 3 : quelle est la forme de lintermdiaire probable ? quelle est la nature de la raction qui permet de passer de cet intermdiaire D ? Etape 4 : rappeler le mcanisme de cette transformation faisant intervenir le DCC ; Etape 6 : quel est lintrt de passer de la fonction alcool au tosylate ? Etape 7 : en plus de H on obtient deux sous produits ; lesquels ? Etape 8 : crire le mcanisme de la cyclisation ; Etape 9 : quel ractif doit-on utiliser pour cette dernire raction ?
25-Synthse dun dipeptide Le compos initial est un ester benzylique de lacide glutamique :
NH2 O COOH O

Trait par le BOC anhydre en prsence dun excs de trithylamine, il se forme, aprs acidification par HCl dilu, un produit A , du tertiobutanol, du chlorure de trithylammonium et du dioxyde de carbone. A trait par le chloroformiate dthyle en prsence de trithylamine fourni B et du chlorure de trithylammonium. On ajoute B lester benzylique de lalanine sous forme de chlorure et de la trithylamine. On isole C et il se fixe galement du chlorure de trithylammonium, de lthanol et du dioxyde de carbone.

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NH3 Cl O Cl O

O chloroformiate d'thyle

O ester benzylique de l'alanine(forme chlorure)

C, sous laction de lacide chlorhydrique donne du tertiobutanol, du dioxyde de carbone et un sel D. D conduit E et du chlorure de sodium par action dune solution aqueuse dilue de soude. Enfin, E, sous laction de lhydrogne en prsence de catalyseur (Pc/C) donne F et deux molcules de tolune. F est le dipeptide glu-ala. Donner la formule semi dveloppe des composs de A F. Quel est le mcanisme de formation de A ?

Table des exercices

1234567891011121314151617181920212223tude strochimique dune carboxylase vitamine K Synthse dacide amin Formation dacides amins Identification dacides amins Synthse de la thyroxine Synthse partir de la phnylalanine De la mthionine aux protines Identification spectroscopique de quatre acides amins Acides amins et pKa Llectrophorse La liaison peptidique Le glutathion Sparation dacides amins Synthse dun acide amin Configuration Configuration Synthse partir dun acide amin Second principe de la thermodynamique Synthse de la valine Synthse de la phnylalanine Citrulline et pouvoir rotatoire Identification dun acide amin Protection et activation
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Synthse dun dipeptide

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