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Universit Paris-VI

Virologie
DCEM1
2006 - 2007
Jean-Marie Huraux
Avec la participation de Henri Agut, Anne-Marie Fillet
Vincent Calvez, Vincent Thibault, Agns Gautheret-Dejean
Anne-Genevive Marcelin, Claire Deback
Mise jour : 5 fvrier 2008
2/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Sommaire
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 3/307
Sommaire
3 Sommaire
11 Introduction
11 1 Introduction gnrale et buts de lenseignement de la virologie en DCEM1
13 2 Conseils du Pr J.M. Huraux aux tudiants pour les examens
14 3 Objectifs de lenseignement de virologie aux tudiants en mdecine
15 3.1 Objectifs gnraux
16 3.2 Objectifs particuliers aux diffrents virus dintrt mdical
24 3.3 Dmarches diagnostiques, pidmiologiques et prventives
25 4 Liste de questions rdactionnelles pour lexamen de DCEM-1 2007
29 Chapitre 1 : Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des
infections virales
29 1.1 Quest-ce quun virus ?
30 1.1.1 Gnome
31 1.1.2 Capside
31 1.1.3 Enveloppe ou pplos
35 1.1.4 Classification des virus
39 1.1.5 Agents des encphalopathies spongiformes transmissibles ou ATNC (agents
transmissibles non conventionnels)
39 1.2 Multiplication des virus
39 1.2.1 Conditions ncessaires la multiplication dun virus
40 1.2.2 La multiplication dun virus comporte six tapes
43 1.2.3 Consquences de la multiplication virale pour la cellule infecte
46 1.3 Moyens de dfense contre linfection virale
46 1.3.1 la frontire, la peau et les muqueuses
47 1.3.2 Immunit naturelle, inne
49 1.3.3 Immunit acquise, spcifique
53 1.3.4 Interactions et ambivalence des moyens de dfenses
54 1.3.5 Immunodpression et infections virales
55 1.3.6 chappement des virus aux dfenses immunitaires
57 1.4 Expression clinique de linfection
60 1.4.1 Infections aigus
61 1.4.2 Infections chroniques
61 1.5 Lutte contre les infections virales
61 1.5.1 Immunothrapie passive
62 1.5.2 Immunothrapie active
63 1.5.3 Chimiothrapie antivirale
66 1.5.4 Mesures dhygine : last but not least
Sommaire
4/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
66 1.6 Points importants
69 Chapitre 2 : Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
69 2.1 Gnralits sur les Herpesviridae
75 2.2 Les deux virus de lherps, ou herpes simplex virus type 1 et type 2 (HSV-1,
HSV2)
76 2.2.1 LHSV-1 et lHSV-2 se partagent le corps
76 2.2.2 Manifestations habituelles des infections HSV-1
79 2.2.3 Herpes simplex virus type 2 (HSV-2)
79 2.2.4 Infections graves
82 2.2.5 Diagnostic au laboratoire de virologie des infections HSV-1 et HSV-2
85 2.2.6 Traitement
86 2.2.7 Points importants
87 2.3 Virus de la varicelle et du zona (VZV)
87 2.3.1 Varicelle
89 2.3.2 Zona
90 2.3.3 Transmission de linfection VZV
90 2.3.4 Diagnostic
91 2.3.5 Traitement des infections VZV
92 2.3.6 Points importants
95 Chapitre 3 : Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6,
HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
95 3.1 Le cytomgalovirus humain (HCMV ou plus couramment CMV)
95 3.1.1 Le virus
96 3.1.2 pidmiologie
97 3.1.3 Infection du nouveau-n
98 3.1.4 Ladulte immunocomptent
98 3.1.5 Les personnes immunodprimes
99 3.1.6 Diagnostic au laboratoire
100 3.1.7 Prvention et traitement
102 3.1.8 Points importants
103 3.2 Le virus Epstein-Barr (virus E-B ou EBV)
103 3.2.1 Historique
103 3.2.2 Mononuclose infectieuse
105 3.2.3 Physiopathologie de la mononuclose infectieuse
106 3.2.4 Infection latente
107 3.2.5 EBV et cancer
109 3.2.6 Diagnostic de linfection par EBV et de la mononuclose infectieuse au
laboratoire
110 3.2.7 LEBV, outil de laboratoire
110 3.2.8 Points importants
111 3.3 Herpsvirus humain type 6 ou HHV-6
Sommaire
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 5/307
111 3.4 Herpsvirus humain type 8 ou HHV-8
112 3.5 Herpesvirus simi ou virus B du singe
113 Chapitre 4 : Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
113 4.1 Introduction : gnralits sur les rtrovirus
113 4.2 LHIV ou VIH, virus de limmunodficience humaine
115 4.2.1 Structure du virus
117 4.2.2 Cycle de multiplication de lHIV au niveau de la cellule
121 4.2.3 La multiplication virale au niveau de lorganisme
123 4.2.4 pidmiologie
123 4.2.5 LHIV-2
124 4.2.6 Diagnostic virologique et suivi au laboratoire de linfection VIH
127 4.2.7 Thrapeutique antivirale
131 4.2.8 Prospective
134 4.2.9 Points importants
137 Chapitre 5 : Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des
hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
hpatite B - VHB ou HBV)
137 5.1 Rtrovirus humains - 2me partie : HTLV
139 5.2 Les virus des hpatites
139 5.3 Caractres gnraux des hpatites virales aigus
140 5.4 Le virus de lhpatite A (VHA ou HAV)
141 5.5 Le virus de lhpatite B (VHB ou HBV)
142 5.5.1 Structure du virus
143 5.5.2 Multiplication
144 5.5.3 La transmission de lHBV
146 5.5.4 Histoire naturelle de linfection et volution des antignes, des anticorps et
de lADN viral dans le srum
150 5.5.5 Traitement
153 5.5.6 Un problme trs important de sant publique
153 5.5.7 HBV et mutations
154 5.6 Points importants
155 Chapitre 6 : Virus des hpatites - 2me partie
156 6.1 Le virus delta ou virus de lhpatite D (HDV)
157 6.2 Le virus de lhpatite C (HCV)
157 6.2.1 Le virus
159 6.2.2 pidmiologie et histoire naturelle
161 6.2.3 Diagnostic
161 6.2.4 Le traitement
162 6.3 Le virus de lhpatite E ou HEV
Sommaire
6/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
163 6.4 Le virus dit de lhpatite G et le TTV
163 6.5 Points importants
165 Chapitre 7 : Les virus respiratoires - 1re partie
165 7.1 Virus de la grippe ou virus influenza
166 7.1.1 Clinique de la grippe
166 7.1.2 Parcours du virus de la grippe dans lorganisme
167 7.1.3 Morts par grippe
169 7.1.4 Virus de la grippe ou virus influenza et modifications antigniques
175 7.1.5 Diagnostic au laboratoire
176 7.1.6 Traitement et prvention de la grippe
179 7.1.7 Points importants
181 Chapitre 8 : Les virus respiratoires - 2me partie.
Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
181 8.1 Virus respiratoires (2me partie)
181 8.1.1 Gnralits sur la famille des Paramyxoviridae
182 8.1.2 Les virus para-influenza
184 8.1.3 Virus respiratoire syncytial
185 8.1.4 Coronavirus
186 8.1.5 Rhinovirus
186 8.2 Virus des oreillons ou virus ourlien
186 8.2.1 Le virus
187 8.2.2 Diagnostic virologique
187 8.2.3 Traitement
187 8.3 Virus de la rougeole
187 8.3.1 Manifestations cliniques
188 8.3.2 Diagnostic virologique
189 8.3.3 Vaccin
189 8.4 Points importants
190 8.5 Virus de la rubole
190 8.5.1 Le virus
191 8.5.2 Primo-infection rubolique
194 8.5.3 Rinfection rubolique
195 8.5.4 Rubole congnitale
196 8.5.5 Conduite tenir chez une femme enceinte
198 8.5.6 Rcapitulatif des dates des prlvements et des indications de la recherche
des IgM ruboliques
199 8.5.7 Traitement
200 8.5.8 Points importants
Sommaire
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 7/307
201 Chapitre 9 : Entrovirus et virus des gastroentrites
201 9.1 Entrovirus
201 9.1.1 Gnralits sur les entrovirus
205 9.1.2 Poliomylite et poliovirus
211 9.1.3 chovirus et coxsackievirus
212 9.2 Virus des gastroentrites
212 9.2.1 Rotavirus
213 9.2.2 Petits virus nus ARN responsable de gastroentrites
213 9.2.3 Adnovirus des gastroentrites
213 9.3 Points importants
215 Chapitre 10 : Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus,
papillomavirus, parvovirus, poxvirus
215 10.1 Adnovirus
215 10.1.1 Clinique
217 10.1.2 Diagnostic au laboratoire
219 10.1.3 Pouvoir cancrigne des adnovirus
219 10.1.4 Traitement
220 10.2 Papovavirus
220 10.2.1 Gnralits
220 10.2.2 Famille des Polyomaviridae
223 10.2.3 Famille des Papillomaviridae
226 10.3 Parvovirus
227 10.4 Poxvirus
227 10.4.1 Gnralits
227 10.4.2 Variole
228 10.4.3 Vaccine
228 10.4.4 Actualit de la variole
229 10.4.5 Poxviroses professionnelles
229 10.4.6 Monkey pox
229 10.4.7 Molluscum contagiosum
230 10.5 Points importants
230 10.5.1 Adnovirus ou ADV
230 10.5.2 Polyomavirus humains, BK et JC virus
230 10.5.3 Papillomavirus humains ou HPV
231 10.5.4 Parvovirus humain B19
231 10.5.5 Poxvirus
233 Chapitre 11 : Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC
(agents transmissibles non conventionnels)
233 11.1 Des maladies extraordinaires
233 11.2 Des agents extraordinaires
Sommaire
8/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
235 11.3 Lhypothse du prion ou de la protine seule
236 11.4 ESB et nvMCJ
237 11.5 Les diffrentes catgories de MCJ
239 Chapitre 12 : Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
239 12.1 Virus de la rage
239 12.1.1 Le virus rabique
240 12.1.2 Rservoir du virus
240 12.1.3 La contamination de lhomme
242 12.1.4 Trajet du virus
242 12.1.5 Signes de la rage
243 12.1.6 Mesure prendre
246 12.1.7 Points importants
246 12.2 Arbovirus
246 12.2.1 Dfinition
247 12.2.2 Parcours habituel du virus dans lorganisme
248 12.2.3 Fivre jaune (virus amaril)
250 12.2.4 Encphalites arbovirus
251 12.2.5 La dengue
252 12.2.6 Points importants
252 12.3 Infections forte mortalit par filovirus, arnavirus, et hantavirus et autres
virus mergents
252 12.3.1 Les filovirus : le virus Marburg et le virus Ebola
253 12.3.2 Les arnavirus
254 12.3.3 Le virus Hantaan
254 12.3.4 Conditions de manipulation
254 12.4 En guise de conclusion au cours de virologie mdicale
257 Annexe A : Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
261 Annexe B : Calendrier vaccinal 2005
261 B.1 Nouvelles recommandations
262 B.2 Recommandations gnrales
264 B.3 Risques professionnels
266 B.4 Recommandations particulires
268 B.5 Recommandations vaccinales aux voyageurs
Sommaire
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 9/307
269 Annexe C : Rcapitulatif : diagnostic, prvention, traitement
271 Annexe D : Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
277 Annexe E : Les examens virologiques en pratique mdicale
277 E.1 Diagnostic des infections virales
277 E.1.1 Deux approches
277 E.1.2 Diagnostic direct
285 E.1.3 Diagnostic indirect
290 E.2 Rle du praticien
290 E.2.1 Les prlvements
290 E.2.2 Renseignements cliniques et interprtation des rsultats
291 E.2.3 Indication des examens virologiques en pratique mdicale
292 E.3 Quantification de la virmie, seuil dintervention et traitement anticip
(preemptive)
294 E.4 Suivi des traitements antiviraux
296 E.5 Conclusion
297 Annexe F : Recommandations de traitement pour hpatite chronique
299 Annexe G : Vingt ans aprs
305 Annexe H : valuation de lenseignement de la virologie. Anne 2007
307 Annexe I : Remerciements
Sommaire
10/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 11/307
Introduction
1 Introduction gnrale et buts de
lenseignement de la virologie en DCEM1
Les objectifs nationaux de lenseignement de la virologie au cours des tudes mdicales vous
sont donns plus loin. Cest tout au long de votre cursus quils vous seront prsents.
Le but de ce cours en DCEM 1, et des TP qui suivront, est de donner aux futurs Mdecins que
vous serez, quelle que soit votre mode dactivit, les notions de virologie essentielles la pratique
courante de la mdecine, diagnostic, traitement curatif et prvention.
Sont examins les principaux virus ou familles de virus pathognes pour lhomme. Ltude de
leur structure et de leur rplication est centre sur les lments importants pour la transmission
de linfection et pour la comprhension des tests diagnostiques, et sur les cibles de la chimiothra-
pie. Ltude du trajet de linfection dans lorganisme (notion de porte dentre, dorgane-cible)
explique le droulement des signes cliniques, les possibilits dintervention immunologiques dans
les infections incubation longue. Lors de ltude des diffrents virus pathognes pour lhomme,
laccent est mis sur les formes frquentes (ventuellement bnignes) et les formes graves, sur les
problmes de sant publique, en France et dans le Monde (au-del de la Piti-Salptrire, nombril
de la Virologie). Sont expliques les grandes lignes du calendrier vaccinal, remis jour annuel-
lement par la Direction Gnrale de la Sant.
Lquipe mdicale enseignante comporte trois Professeurs des Universits-Praticiens Hospita-
liers (PU-PH), Henri AGUT, Vincent CALVEZ et J ean-Marie HURAUX, un Matre de Confren-
ces des Universits-Praticien Hospitalier (MCU-PH), Anne-Genevive MARCELIN, et deux
Assistants hospitalo-universitaires (AHU), David BOUTOLLEAU et Claire DEBACK. Un Prati-
cien hospitalier, Vincent THIBAULT, contribue galement votre enseignement (dans le domaine
des virus des hpatites). Il en va de mme dAgns GAUTHERET-DEJ EAN, MCU en facult de
Pharmacie Paris V.
Lenseignement magistral comporte 12heures de cours. Lenseignement pratique comporte
4sances de TP et ED, obligatoires, organises par binmes. Son but est de vous permettre de com-
prendre les principales dmarches du diagnostic virologique en pratique mdicale courante, o
vous serez invitablement prescripteurs. Il importe que vous respectiez et fassiez respecter les bon-
nes pratiques dhygine et que vos vaccinations soient jour.
Le polycopi nest pas apprendre par cur. Amoureusement remis jour chaque anne, cest un
document de base pour qui voudrait vrifier des notions vues lors de cours, approfondir un pro-
blme, prparer les questions dexamen. Les passages en petits caractres sont rservs aux pas-
sionn(e)s de virologie. Les questions dexamen (cf liste plus loin) portent sur le cours, les ED et
les TP.
Celles ou ceux dentre vous qui souhaiteraient avoir une formation relle la pratique du diagnos-
tic virologique et la recherche en Virologie sont invits, au del de ce cours de base de Virologie
en DCEM-1, prendre dans quelques annes un poste dInterne en Virologie dans notre labora-
Introduction
12/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
toire. Nous nous y intressons particulirement au HIV, aux virus des hpatites, aux herpsvirus
et autres virus responsables dinfections opportunistes chez les sujets immunodprims de toute
cause (SIDA, mais aussi greffes, chimiothrapie anti-cancreuse). Pour tous ces virus, nous tu-
dions les traitements antiviraux et les phnomnes de rsistance quils engendrent.
Une visite guide du laboratoire de Virologie du CERVI o travaillent 60personnes peut tre or-
ganise pour les tudiants qui voudraient en savoir ou en voir davantage.
Dix livres rcents traitant de Virologie mdicale, en langue franaise. Chronologiquement :
Les Virus transmissibles par le sang. J J Lefrre, J ohn Libbey Eurotext, 1996.
Virologie molculaire mdicale. J M Seigneurin et P Morand, Technique et Documentation
Lavoisier, 1997.
Les herpesvirus humains. V Marchal, M Segondy, J C Nicolas, Collection Option/Bio, El-
sevier, 1999.
Les virus transmissibles de la mre lenfant. F Denis, Collection Mdecine-Sciences. Edi-
tions J ohn Libbey Eurotext, 1999.
il et virus. H Offret, Masson, 2000.
La traduction franaise de Human virology, L Collier, J Oxford, 2000, par V J oly, Mdecine-
Sciences. Editions Flammarion, 2004.
Le Dictionnaire de Virologie. Henri Agut. Editions Phase 5, 2002.
Virologie mdicale. Collection Azay. A. Mammette. Presses universitaires de Lyon, 2002.
Last (en 2003) but not least : Trait de Virologie mdicale. Coordonnateurs: J ean-Marie
Huraux, J ean-Claude Nicolas, Henri Agut, Hlne Peigue-Lafeuille,. Editions ESTEM De
Boeck, 2003. Si vous navez pas les moyens de vous loffrir, plutt que de le voler, vous pou-
vez le consulter la bibliothque de notre Facult qui en possde plusieurs exemplaires.
Prise en charge thrapeutique des personnes infectes par le VIH. P. Yny. Mdecine-
Sciences. Editions Flammarion, 2006. Remise jour tous les un ou deux ans.
Pour vous cultiver, avec ce que vous a laiss de neurones le cruel concours de PCEM1:
par Claude Chastel, Histoire des virus, de la variole au Sida, Editions Boube, 1992
et Virus mergents: vers de nouvelles pandmies? , Editions Vuibert/Adapt-SNES
la revue Virologie, seule revue en langue franaise entirement consacre la virologie.
Si vous devez bientt rdiger un mmoire, consultez mes conseils aux jeunes crivains, sur le
site de notre Facult, sur lintranet de notre Groupe Hospitalier, ou dans la lettre de linfectiologue,
n5 de septembre/octobre 2006 Faut-il publier en franais, et comment ? Rflexions dun
Tlphones Pr Henri AGUT
Pr Vincent CALVEZ
Pr Jean-Marie HURAUX
Dr Anne-Genevive MARCELIN
Dr Claire DEBACK
Dr David BOUTOLLEAU
Dr Vincent THIBAULT
Dr Agns GAUTHERET-DEJEAN
01 42 17 74 01
01 42 17 74 16
01 40 77 97 41
01 42 17 75 14
01 42 17 74 02
01 42 17 74 02
01 42 17 74 26
01 42 17 74 27
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 13/307
ancien, ou lisez aussi le livre de M. Huguier et H Maisonneuve La rdaction mdicale, de la
thse larticle original. La communication orale Editions Doin. Pour apprendre vous exprimer
clairement, et reconnatre sans perte de temps les articles qui ne mritent pas dtre lus.
Vous avez de nombreux sites concernant la virologie mdicale sur http://www.
Vous trouverez une fiche dvaluation de lenseignement en fin de polycopi, remplir et remet-
tre vos Enseignants en fin de TP-ED.
2 Conseils du Pr J.M. Huraux aux tudiants
pour les examens
assortis dune modeste contribution lamlioration de leur anglais scientifique.
Prenez le temps de bien lire lnonc des questions, pour viter de rpondre hors sujet. Take
time to read the questions carefully, so that you wont answer out of context.
Soignez la prsentation, lenseignant nayant pas mission de dchiffrer les copies illisibles ou
de reconstituer un expos non structur. Exprimez-vous de faon logique, claire et simple,
afin que je naie pas me prendre la tte pour comprendre votre rponse, de mme que plus
tard vos patients devront comprendre sans difficults vos explications sur leurs examens, leur
diagnostic, leur traitement. Write neatly. The professors duty is not to decipher your scrawll
or to rewrite a loosely-structured assay. Express yourself clearly, logically and simply so that
I wont have any trouble understanding you. In the same way, your future patients should be
able to understand your explanations of their tests, diagnosis and treatment easily.
Evitez la rgurgitation dun flot de rsidus mnsiques mal digrs, au milieu desquels lensei-
gnant devrait trier ce qui vous vaudrait la meilleure note. Sachez que je ne corrige pas la
grille. Avoid verbal diarrhea so that the professor doesnt have to fish for your meaning. I
dont correct by the key words alone.
Un enseignant qui se respecte ne peut avoir la moindre indulgence en cas de fraude. Ltudiant
pris en fraude verrait immdiatement lever lanonymat de sa copie, pour commencer. No self-
respecting professor tolerates cheating. The paper of any student caught cheating will no lon-
microbes-edu.org
invs.sante.fr (institut de veille sanitaire) sante.gouv.fr pasteur.fr
anaes.fr (confrences de consensus) eurosurveillance.org who.int/fr/ (lOMS)
hc-sc.gc.ca/francais (site du Canada) cdc.gov/ncidod/ (les CDC) hivandhepatitis.com
cdc.gov/mmwr (le clbre morbidity mortality weekly report) unaids.org (ONUSIDA)
virology.net (images de virus) cochrane.org (levidence based medicine)
ihmf.org (forum sur les herpsvirus) medscape.com/infectiousdiseaseshome
Introduction
14/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
ger be anonymous, to begin with.
Si vous schez, contentez-vous dexposer clairement le peu que vous savez, mais ne baratinez
pas. Comportez-vous lgard de lenseignant comme vous le ferez plus tard comme mdecin
lgard dun malade vous posant un problme qui vous dpasse. Dont try to fake it if you
dont know the subject thoroughly. Just say the little you do know. Behave with the professor
exactly as you would later as a physician with a patient who has a problem which is beyond
you.
Ne rendez pas copie blanche: je ne pourrais remonter votre note, mme dun demi-point,
quand bien mme jy serais invit par les autres membres du jury de DCEM-1, reconnaissant
en vous, malgr votre nullit crasse en virologie, le futur prix Nobel de notre Facult. Ainsi,
dites en quelques mots le peu que vous savez sur la question. Dont hand in a blank copy be-
cause I wouldnt be able to give you a better mark, even a half-point more, even if I were asked
to by the other members of the jury. You cant away with this even if they see in you a futur
Nobel prize winner despite your notorious incompetence in the virological field. Just say in a
few words the little you know about the subject.
Si vous tes pris(e) par le temps, rappelez-vous quun tableau ou un schma bien faits sont
plus informatifs et gnralement plus exacts quun texte rdig la hte. If you are short of
time, dont forget that a well-drawn table or graph is always more informative than a hastily-
written text.
Rien ne minterdit de poser la mme question un an dintervalle: mme question ne signifie
pas mme rponse, tant la virologie progresse. There is no reason I shouldnt ask the same
question two years in a row : because of the fantastic pace of virology, the same question
doesnt necessarily mean the same answer.
Le but de lexamen est de vrifier que vous ferez des praticiens dignes de confiance
(suffisamment bons). The aim of the exam is to make sure you become doctors worthy of
confidence ( good enough ).
3 Objectifs de lenseignement de virologie aux
tudiants en mdecine
Pour la virologie, les objectifs ont t prpars par J ean-Marie Huraux, Paul Dny, Hlne Peigue-
Lafeuille, J ean-Marie Seigneurin, Pierre Wattr et examins la runion du groupe AZAY Li-
moges, le 11/09/01. Les avis dAnne-Marie Magnier et Philippe Cornet, du dpartement de mde-
cine gnrale de la facult Piti-Salptrire, ont galement t trs prcieux.
Les objectifs denseignement sont classs en trois catgories.
1. Objectifs denseignement de virologie gnrale. Ils concernent dune part la structure des vi-
rus, leur multiplication, leurs relations avec lhte au niveau de la cellule, de lorganisme, des
populations. Ils concernent dautre part les consquences gnrales de ces lments de viro-
logie fondamentale pour le diagnostic, le traitement, et la prvention des infections virales, et
cela au niveau individuel et au niveau collectif.
2. Objectifs denseignement particuliers aux diffrents virus dintrt mdical.
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 15/307
3. Objectifs denseignement de virologie pratique ncessaire certaines dmarches diagnos-
tiques, thrapeutiques et prventives.
Ces objectifs se conforment au programme officiel du nouveau concours de linternat 2004. Ils
entrent pour la majorit dentre eux dans le cadre des maladies infectieuses et tropicales confor-
mment au programme du module 7 Sant et environnement - maladies transmissibles . Cer-
tains objectifs correspondent dautres modules de cette rforme: au module 1 Apprentissage
de lexercice mdical , au module 2 De la conception la naissance , au module 3
Maturation et vulnrabilit , au module 8 Immunopathologie-raction inflammatoire , au
module 10 Cancrologie-oncohmatologie , au module 11 Synthse clinique et
thrapeutique . Enfin dautres entrent dans le cadre des deuxime et troisime partie de cette
rforme: Maladies et grands syndromes et Orientation diagnostique devant .
Les objectifs pdagogiques ont t classs, titre indicatif, en rang A, B ou C :
Rang A : leur mconnaissance engage le pronostic vital du patient ou peut lui laisser des s-
quelles invalidantes dfinitives.
Rang B : objectifs de connaissance ou de savoir faire, sans consquence vitale immdiate,
mais dont les situations sont parfois graves ou frquemment rencontres dans la pratique
mdicale.
Rang C : objectifs de connaissance ou de savoir faire, sans consquence vitale immdiate,
mais qui sont ncessaires la comprhension des problmes rencontrs en virologie ou dont
les situations sont plus rarement rencontres dans la pratique mdicale.
A la mention A, B ou C font suite celle(s) des 345 questions officielles du nouveau programme
de linternat 2004.
Ces objectifs ne sont pas assortis dhoraires denseignement de bactriologie de virologie et dhy-
gine hospitalire dans une anne particulire du cursus mdical. En effet, latteinte de ces objectifs
mobilise bactriologistes, virologistes et cliniciens de diverses disciplines selon des modalits de
collaboration et des techniques pdagogiques propres chaque CHU, et cela tout au long du cursus
mdical.
3.1 Objectifs gnraux
1.1. Connatre la dfinition des virus, des virodes et des ATNC, et les critres de classification
des virus (C).
1.2. Connatre les tapes du cycle de rplication des virus, et expliquer les possibilits quelles
offrent de chimiothrapie antivirale selon les diffrents types de cycle de rplication (B).
1.3. Connatre les diffrences entre virus nus et virus enveloppe en termes de rsistance aux
conditions physico-chimiques et de modes de transmission de linfection (B). 73, 75, 91
1.4. Connatre les mcanismes des variations gntiques des virus et leurs consquences sur
lpidmiologie, le traitement et la prvention des infections virales (C).
1.5. Connatre les diffrents modes dinteraction virus-cellule hte: infection lytique, infec-
tion tempre, transformation (C). 138
1.6. Connatre les diffrents modes doncogense virale, et les expliquer laide dexemples
(C). 138
Introduction
16/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.7. Connatre et expliquer laide dexemples les diffrents modes de diffusion des virus dans
lorganisme, la distinction entre porte dentre et organe-cible, infection virale localise et infec-
tion virale gnralise (C).
1.8. Connatre les moyens de dfense spcifiques et non spcifiques de lorganisme contre les
infections virales et les mcanismes dchappement des virus ces moyens de dfense (C). 76,
127
1.9. Connatre les diffrents modes volutifs des infections virales: infections aigus, infections
latentes, infections chroniques (C).
1.10. Connatre le rle des virus dans les phnomnes immunopathologiques (C) 116
1.11. Connatre les rgles gnrales du diagnostic virologique au laboratoire: indications,
principe des diffrentes techniques, interprtation des rsultats (A). 2, 4
1.12. Connatre les rgles pratiques des prlvements virologiques: nature, mise en uvre,
conditions de transport, renseignements fournir au laboratoire (A). 2, 127
1.13. Connatre les diffrentes classes dantiviraux, leur mode daction et leurs limites (B).
1.14. Connatre les examens virologiques mettre en uvre par le clinicien pour le suivi dun
traitement et la caractrisation des mutants rsistants (B).
1.15. Connatre les diffrents types de vaccins antiviraux, vaccins inactivs, vaccins attnus,
vaccins de gnie gntique, leurs avantages et inconvnients (B). 76
1.16. Connatre les bases virologiques du calendrier vaccinal en France pour la population g-
nrale et pour les personnes exposes des risques particuliers, professionnels et touristiques no-
tamment (B). 76, 107, 108
1.17. Connatre les principes de lpidmiologie et de lcologie virales, les mthodes dtude
de la traabilit virale et les moyens virologiques de contrle des pidmies (B). 75, 91
1.18. Connatre les principes de la thrapie gnique par vecteurs viraux et du suivi virologique
des patients en bnficiant (C).
3.2 Objectifs particuliers aux diffrents virus dintrt
mdical
2.1. Herpesviridae
Gnralits
2.1.1. Connatre le schma gnral de la structure du virion, de lorganisation gnomique et de
la rplication des herpesvirus humains (C).
2.1.2. Connatre les particularits de la physiopathologie (tropisme cellulaire, organes-cibles,
sige de linfection latente), de la transmission, et de lpidmiologie des diffrents herpesvirus
humains (B). 91, 127
Herpes Simplex virus (HSV)
2.1.3. Connatre les manifestations cliniques de lherps chez le sujet sain aux diffrents ges
de la vie et chez le sujet aux dfenses amoindries, les indications, et la mise en uvre par le clini-
cien des diffrents examens virologiques utiles et des traitements antiviraux disponibles (B). 4,
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 17/307
84, 94
2.1.4. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion de mningo-encphalite herp-
tique, dherps nonatal, deczma herptis (A). 84, 96, 184, 190, 199, 285
2.1.5. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion dherps oculaire (A). 212
2.1.6. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion dherps gnital (B). 88, 89, 343
2.1.7. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion de gingivostomatite herptique
(B). 256, 343
2.1.8. Savoir prvenir et traiter lherps cutanomuqueux progressif des sujets immunodpri-
ms (B). 88, 89, 181, 127, 343
2.1.9. Connatre les mesures de prvention de lherps nonatal, et savoir les expliquer aux
personnes concernes (A). 16, 20, 23, 84, 88, 89, 343
Virus de la varicelle et du zona (VZV)
2.1.10. Connatre la physiopathologie et les diffrentes manifestations cliniques de linfection
VZV chez le sujet sain aux diffrents ges de la vie et chez le sujet aux dfenses amoindries, les
indications et la mise en uvre par le clinicien des diffrents examens virologiques utiles et des
traitements antiviraux disponibles (B). 4, 84, 94, 96, 314, 326, 339
2.1.11. Connatre les modalits du traitement et les mesures de prvention des formes svres
dinfection VZV : varicelle nonatale, varicelle ou zona progressif du sujet immunodprim,
encphalite, pneumonie de ladulte, zona ophtalmologique, algies post-zostriennes (A). 76, 84,
86, 91, 96, 127, 181, 339
2.1.12. Savoir appliquer la conduite tenir en cas dinfection VZV chez une femme enceinte
(B). 20.
Cytomgalovirus (CMV)
2.1.13. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, et les manifestations cliniques de lin-
fection CMV aux diffrents ges de la vie, chez ladulte sain et chez le sujet immunodprim, les
indications des diffrents examens virologiques utiles et des traitements antiviraux disponibles
(B). 4, 81, 83, 120, 127, 178, 203, 320, 334
2.1.14. Connatre les mesures de prvention des infections graves CMV des sujets immuno-
dprims (B). 81, 86, 120, 127, 178, 181
2.1.15. Savoir faire le diagnostic viral dune infection maternoftale grave CMV et conna-
tre les mesures de prvention disponibles (B). 20, 21
Virus Epstein-Barr (EBV)
2.1.16. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie et les manifestations cliniques de lin-
fection EBV aux diffrents ges de la vie, chez ladulte sain et chez le sujet immunodprim, les
indications des diffrents examens virologiques utiles et des traitements antiviraux disponibles
(B). 4, 77, 83, 94, 96, 127, 164, 203, 291, 314, 316, 320, 330, 332, 334, 335
2.1.17. Connatre les relations entre infection EBV, mitogense et oncogense (C) 138
2.1.18. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion de mononuclose infectieuse (B)
334
2.1.19. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion de lymphoprolifration EBV
Introduction
18/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
chez un immunodprim (B) 85, 127, 144, 164
Autres herpesvirus
2.1.20. Connatre les manifestations cliniques des infections HHV-6, 7 et 8 et les mesures th-
rapeutiques disponibles (C). 94, 127, 138, 139, 164, 190, 314
2.1.21. Connatre les risques pour lhomme de linfection herpesvirus simi et la conduite
tenir en cas de morsure de singe (C). 96, 213.
_________________________________________
2.2. Adenoviridae
2.2.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie et les manifestations cliniques de lin-
fection adnovirus aux diffrents ges de la vie, chez ladulte sain et chez le sujet immunodpri-
m, les indications des diffrents examens virologiques utiles et des traitements antiviraux
disponibles (C). 4, 77, 81, 86, 91, 94, 127, 212, 314, 315
_________________________________________
2.3. Papillomaviridae
2.3.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie et les manifestations cliniques des infec-
tions papillomavirus humains et leur rapport avec le cancer du col de lutrus (B). 88, 89, 138,
139, 147, 149
2.3.2. Connatre la place des examens virologiques utiles pour la surveillance des dysplasies
du col de lutrus (C). 4, 88, 139, 147
2.3.3. Connatre les bases du traitement des papillomes humains et la prvention du cancer
du col utrin (B). 76, 88, 89
_________________________________________
2.4. Polyomaviridae
2.4.1. Connatre les manifestations cliniques des infections polymavirus humain J C et BK et
savoir prescrire les examens virologiques ncessaires leur diagnostic (C). 4, 127, 199, 315
_________________________________________
2.5. Parvoviridae
2.5.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques de linfec-
tion parvovirus B19, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologi-
que et du traitement (B). 4, 20, 94, 297, 307, 314
2.5.2. Savoir faire le diagnostic viral dune infection maternoftale grave parvovirus B19 et
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 19/307
connatre les mesures prendre (C). 20, 297
_________________________________________
2.6. Poxviridae
2.6.1. Connatre lhistoire de lradication de la variole (C). 76
2.6.2. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques des infec-
tions poxvirus actuellement observables et les indications et la mise en uvre par le clinicien
du diagnostic virologique et du traitement disponible, ainsi que la possibilit dutiliser la variole
comme agent de bioterrorisme (C) 4, 75, 149, 203, 314.
_________________________________________
2.7. Picornaviridae
2.7.1. Connatre le schma gnral de la structure et de la rplication des entrovirus (C).
2.7.2. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques des infec-
tions entrovirus, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologique
et des mesures thrapeutiques curatives et prventives (B). 4, 73, 75, 77, 94, 96, 192, 265, 301,
314
2.7.3. Connatre les bases virologiques de la vaccination contre la poliomylite, le calendrier
vaccinal en France et ltat actuel de la campagne dradication de la poliomylite (B). 76
2.7.4. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques, lvolu-
tion des infections HAV, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic viro-
logique et du traitement (B). 4, 75, 83, 107, 203
2.7.5. Connatre les bases virologiques du vaccin contre lhpatite A et les recommandations
de la DGS (C). 76, 107
2.7.6. Connatre les manifestations cliniques des infections rhinovirus (C), 226
_________________________________________
2.8. Rotavirus
2.8.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques des infec-
tions rotavirus, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologique, des
mesures thrapeutiques, et de la prvention (B). 4, 73, 76, 91, 302, 345
_________________________________________
2.9. Caliciviridae, Astroviridae, et virus de lhpatite E (HEV)
2.9.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques des infec-
tions calicivirus et astrovirus, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic
virologique, des mesures thrapeutiques, et de la prvention (C). 4, 73, 302, 345
Introduction
20/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
2.9.2. Connatre les particularits pidmiologiques et volutives des hpatites E, les indica-
tions et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologique (B), 4, 17, 73, 83, 320
_________________________________________
2.10. Myxoviridae - virus influenza 82
2.10.1. Connatre le schma gnral de la structure du virion, de lorganisation gnomique et
de la rplication des virus influenza (C).
2.10.2. Connatre les bases de la variabilit gntique des virus influenza et leurs consquences
sur la taxonomie, lpidmiologie, la politique vaccinale (B), 1, 21
2.10.3. Connatre la physiopathologie, les manifestations cliniques de la grippe simple et com-
plique, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologique (B). 4, 82,
86, 198
2.10.4. Connatre la place des antiviraux dans le traitement curatif et prventif de la grippe (B)
82
2.10.5. Connatre les bases virologiques de la vaccination et ses indications en fonction des in-
formations fournies par les rseaux de surveillance de la grippe et les recommandations de la DGS
(A) 76, 82, 108
_________________________________________
2.11. Paramyxoviridae
2.11.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques des infec-
tions, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologique et du traite-
ment des infections virus RS (A). 4, 86, 91, 198
2.11.2. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques des infec-
tions, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic virologique et du traite-
ment des infections virus parainfluenza, virus des oreillons, et virus de la rougeole (B). 4, 75, 86,
94, 96, 97, 268, 270, 314
2.11.3. Connatre les bases virologiques de la vaccination contre la rougeole et les oreillons, le
calendrier vaccinal en France et les recommandations de lOMS pour les PED (B) 76
_________________________________________
2.12. Coronaviridae
2.12.1. Connatre le schma gnral de la structure et les manifestations cliniques des corona-
virus humains (C). 86, 181, 198
_________________________________________
2.13. Rubivirus
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 21/307
2.13.1. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques de linfec-
tion virus de la rubole aux diffrents ges de la vie, les indications et la mise en uvre par le
clinicien par le clinicien des examens virologiques utiles et linterprtation de leur rsultat (B). 4,
20, 94, 291, 307, 314, 330, 335
2.13.2. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion dexanthme rubolique chez une
femme enceinte (A). 20, 314
2.13.3. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion de contage rubolique chez une
femme enceinte (A). 20
2.13.4. Connatre les bases virologiques de la vaccination contre la rubole et savoir appliquer
la politique vaccinale recommandable en France (B). 15, 16, 20, 76
_________________________________________
2.14. Lyssavirus
2.14.1. Connatre lpidmiologie et la physiopathologie et les manifestations cliniques de la
rage humaine et animale (B) 96, 101, 102, 107, 122
2.14.2. Connatre les bases virologiques de la conduite tenir en cas de morsure par animal sus-
pect de rage et de la vaccination antirabique, et les recommandations de la DGS en France et de
lOMS pour les PED (A). 75, 76, 107, 213
_________________________________________
2.15. Virus transmis par athropodes, par rongeurs et virus des fivres h-
morragiques appartenant aux Togaviridae, Flaviviridae, Bunyaviridae, Arenavi-
ridae et Filoviridae.
2.15.1. Connatre les bases structurales de la classification de ces virus et les caractres gnraux
de leur pidmiologie avec leurs risques dmergence, les principales maladies quils entranent,
leur physiopathologie et les moyens de diagnostic, de traitement et de prvention disponibles,
(B). 4, 75, 76, 83, 86, 91, 96, 107, 192, 199, 200, 203, 307, 314, 320, 330, 339
2.15.2. Connatre les deux cycles pidmiques de la fivre jaune, la base virologique de la vac-
cination et les recommandations de la DGS (B). 75, 76, 107
2.15.3. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie et les manifestations cliniques de la
dengue, les indications et la mise en uvre par le clinicien du diagnostic et du traitement (B).
107, 200, 330, 339
2.15.4. Connatre lpidmiologie et les manifestations cliniques des infections Hantavirus
(C). 86, 107, 339
2.15.5. Connatre lpidmiologie et les manifestations cliniques des infections Arenavirus
(C). 91, 96, 107, 339
2.15.6. Connatre lpidmiologie, les manifestations cliniques et la prvention des infections
virus de lencphalite tique. (C), 76, 96, 101
_________________________________________
Introduction
22/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
2.16. Hepacivirus - Virus de lhpatite C (HCV) 83
2.16.1. Connatre la structure du virion, son organisation gnomique, son mode de rplication,
le mcanisme des mutations (C).
2.16.2. Connatre lpidmiologie du HCV en France et dans le monde (C). 45, 91, 101, 102,
109, 178, 181, 202
2.16.3. Connatre la physiopathologie de linfection, ses manifestations cliniques, ses modes
volutifs (B). 83, 138, 151, 186, 228, 320, 330, 335
2.16.4. Connatre les bases virologiques des diffrents examens utiliss par le clinicien pour le
diagnostic et le traitement de linfection, leurs indications et leur interprtation (B). 4, 30, 83,
178, 320
2.16.5. Connatre les bases virologiques du traitement des infections par HCV et de sa sur-
veillance (B), 83
2.16.6. Connatre les bases virologiques de la prvention de linfection par HCV et savoir les
appliquer (B). 45, 107, 108, 127, 139, 181, 178, 202
_________________________________________
2.17. Hepadnaviridae - Virus de lhpatite B (HBV). Virus de lhpatite Delta
(HDV) 83
2.17.1. Connatre la structure du virion, son organisation gnomique, son mode de rplication,
le mcanisme des mutations (C).
2.17.2. Connatre lpidmiologie de lHBV en France et dans le monde (C). 20, 45, 91, 101,
107, 108, 202
2.17.3. Connatre la physiopathologie de linfection par HBV, ses manifestations cliniques, ses
modes volutifs (B). 20, 45, 83, 138, 151, 228, 320
2.17.4. Connatre les bases virologiques des diffrents examens utiliss par le clinicien pour le
diagnostic et le traitement de linfection, leurs indications et leur interprtation (B). 4, 15, 16,
20, 30, 83, 178, 320
2.17.5. Connatre les bases virologiques du traitement des infections par HBV et de sa sur-
veillance (B), 83
2.17.6. Connatre les bases virologiques de la vaccination contre lHBV et savoir appliquer la
politique de vaccination recommandable en France et connatre les principes de la prvention dans
les pays en dveloppement PED (B). 76, 91, 102, 107, 108, 139, 151
2.17.7. Savoir appliquer la conduite tenir en cas de suspicion de contamination par lHBV (A).
91
2.17.8. Savoir appliquer les mesures de prvention de linfection par HBV (B). 15, 16, 20, 45,
75, 76, 91, 107, 108, 139, 178, 181, 202
2.17.9. Connatre la structure et lorganisation gnomique et la rplication de lHDV (C)
2.17.10. Connatre lpidmiologie, les manifestations cliniques, les modalits volutives et le
diagnostic virologique de linfection par HDV (C). 4, 45, 320
_________________________________________
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 23/307
2.18. Retroviridae
Gnralits
2.18.1. Connatre la structure, lorganisation gnomique des rtrovirus et leur mode de rplica-
tion (C).
2.18.2. Connatre le principe des diffrents mcanismes de cancrogense par retrovirus ani-
maux et humains (C). 138
Virus de limmunodficience humaine (HIV) 85
2.18.3. Connatre la structure du virion, lorganisation gnomique, les bases virologiques de la
variabilit gntique et antignique des HIV et ses consquences (C).
2.18.4. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie, les manifestations cliniques et les mo-
des volutifs de linfection par HIV (B). 20, 45, 77, 94, 96, 101, 147, 164, 199, 202, 203, 291, 295,
303, 314, 330, 334, 343
2.18.5. Connatre les cibles de la thrapeutique antirtrovirale actuelle et les perspectives en ex-
ploration (B), 85
2.18.6. Connatre les bases virologiques des diffrents examens utiliss pour le diagnostic et le
suivi thrapeutique des sujets infects par HIV (B), 4
2.18.7. Connatre leurs indications, leur interprtation dans les diffrentes circonstances de
consultation: femme enceinte, suspicion de primo-infection, demande de dpistage, suspicion de
SIDA, contrle de traitement, chec thrapeutique (A). 4, 15, 16, 20, 30, 45, 75, 178
2.18.8. Savoir appliquer la conduite tenir en urgence en cas de suspicion de contamination par
HIV (A). 101, 108, 202
2.18.9. Connatre les bases virologiques de la politique de prvention de linfection par HIV, en
France et dans les PED (B). 15, 16, 20, 24, 45, 91, 101, 102, 107, 108, 178, 181, 202
Virus des leucmies et lymphomes T humain (HTLV)
2.18.10. Connatre la structure du virion et lorganisation gnomique des HTLV (C),
2.18.11. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie et les manifestations cliniques de lin-
fection et les modes volutifs HTLV (C), 138, 164, 192
2.18.12. Connatre les bases virologiques des diffrents examens utiliss pour le diagnostic de
linfection par HTLV, leurs indications, leur interprtation (B). 4
2.18.13. Connatre les mesures de prvention de linfection par HTLV (C). 24, 139, 178
_________________________________________
2.19. Agents transmissibles non conventionnels (ATNC)
2.19.1. Savoir ltat actuel des connaissances en matire de structure et de rplication des
ATNC et les principes de la thorie du prion (C).
2.19.2. Connatre les principaux caractres physicochimiques des ATNC et leurs consquen-
ces pratiques (C). 91
2.19.3. Connatre lpidmiologie, la physiopathologie et les manifestations cliniques des in-
Introduction
24/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
fections par ATNC (B). 63, 127, 199
2.19.4. Connatre les principes de prvention des infections par ATNC (B). 75, 91, 181
3.3 Dmarches diagnostiques, pidmiologiques et
prventives
Dans les situations cliniques ou biocliniques suivantes, chez le sujet sain aux diffrents ges de la
vie ou chez le sujet immunodprim:
syndrome grippal 81, 82, 203
fivre prolonge ou au retour dun pays tropical, 83, 85
atteinte du systme nerveux central aigu ou chronique, 84, 85, 96, 127, 199
atteinte oculaire, 84, 212
atteinte bucco-pharynge, respiratoire, 84, 85, 127
gastro-entrite, 73, 302
hpatite aigu ou chronique, 83, 320
exanthme, 84, 85, 94, 314
ulcration gnitale, 84, 88, 89, 343
polyadnopathie, 84, 85, 291
purpura, thrombopnie, anmie, syndrome mononuclosique, 84, 85, 316, 330, 334, 335
anomalie du dveloppement intra-utrin, 84
3.1. Connatre les tiologiques virales voquer systmatiquement dans les situations ci-des-
sus (B).
3.2. Savoir prescrire les examens virologiques utiles, connatre les rgles de bonne pratique et
dacheminement des prlvements, indiquer au laboratoire les donnes ncessaires, savoir le prin-
cipe des examens virologiques utiles, les rgles de leur interprtation en fonction de la chronologie
des vnements (A). 4
3.3. Connatre les principes de lutilisation des antiviraux dusage courant (B), 82 85, 96, 202
3.4. Savoir les examens et mesures prventives mettre en place en cas dpidmie prsume
virale (C). 75, 76, 82, 83, 86, 91, 107
3.5. Connatre les risques virologiques particuliers la grossesse et la naissance et leur pr-
vention (B). 15, 20, 30, 76, 83, 84, 85, 88, 89, 94
3.6. Connatre les risques virologiques particuliers aux migrants ou aux voyageurs et leur
prvention (B), 76, 83, 85, 101, 102, 107
3.7. Connatre les textes lgislatifs en matire dinfections nosocomiales, communautaires et
professionnelles (B). 8, 76, 83, 84, 85, 91, 101, 108, 109, 127, 178, 202
3.8. Connatre les risques virologiques particuliers la toxicomanie et leur prvention (B).
45, 76, 83, 85, 101
3.9. Connatre les risques virologiques particuliers la consommation deau et daliments de
mauvaise qualit et leur prvention (B). 73, 83, 107
3.10. Connatre les risques virologiques particuliers lusage du sang et les produits drivs du
sang, et leur prvention (B). 76, 83, 84, 85, 91, 178
3.11. Connatre les risques virologiques particuliers aux transplantations dorganes et aux
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 25/307
greffes de tissus, et leur prvention (B). 8, 76, 85, 91, 127
3.12. Connatre les risques virologiques particuliers aux piqres et morsures, et savoir appli-
quer la conduite tenir (A). 76, 83, 84, 85, 101, 107, 108, 109, 202, 213
3.13. Connatre les risques virologiques particuliers lexposition des liquides biologiques
infects, en particulier les accidents dexposition au sang (AES), et savoir appliquer la conduite
tenir (A). 76, 83, 85, 91, 101, 108, 109, 202
3.14. Connatre les principes des programmes internationaux actuels de lutte contre les pid-
mies et endmies virales (C). 73, 75, 76, 82, 83, 85
4 Liste de questions rdactionnelles pour
lexamen de DCEM-1 2007
1. Opposez, laide dexemples, la transmission de virus nus et de virus enveloppe ou pplos.
2. Dcrivez les moyens de dfenses de lorganisme contre les virus.
3. Opposez, laide dexemples, le parcours du virus dans lorganisme pour une infection locale
et une infection gnralise.
4. Comparez les modes daction de laciclovir et de lAZT.
5. Dcrivez les formes graves de linfection herpes simplex virus (HSV).
6. Dcrivez le diagnostic au laboratoire des infections HSV.
7. Dcrivez le diagnostic clinique et virologique des infections virus de la varicelle et du zona
(VZV).
8. Dcrivez le pouvoir pathogne chez lhomme du cytomgalovirus (CMV).
9. Dcrivez le diagnostic au laboratoire de linfection CMV.
10. Dcrivez le diagnostic clinique, biologique et virologique de la mononuclose infectieuse
virus Epstein-Barr (EBV).
11. Dcrivez le pouvoir pathogne des papillomavirus humains (HPV).
12. Dcrivez la vaccination contre la poliomylite: nature des vaccins, leurs avantages et incon-
vnients, leur mode dadministration.
13. Dcrivez les manifestations cliniques de la grippe simple et des complications de la grippe.
14. Dcrivez les variations antigniques des virus de la grippe, leurs causes et leurs consquences
sur la taxinomie, lpidmiologie et la vaccination.
15. Dcrivez le traitement curatif et la prvention de la grippe.
16. Dcrivez les manifestations cliniques et le diagnostic virologique de la rougeole.
17. Dcrivez le parcours du virus dans lorganisme au cours de la rage et les signes cliniques cor-
respondants.
18. Indiquez les mesures prendre pour viter la rage en cas de morsure par un chien.
19. Dcrivez les manifestations cliniques et les risques de la primo-infection rubolique.
20. Dcrivez le diagnostic virologique de linfection rubolique. Des rsultats de tests vous seront
fournis, que vous aurez interprter (Signification, que faire, que dire la personne
concerne?).
21. Dcrivez la prvention de la rubole congnitale.
22. Dcrivez lpidmiologie et la prvention de la fivre jaune.
Introduction
26/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
23. Dcrivez la structure de lHIV et lorganisation de son gnome.
24. Dcrivez le cycle de multiplication de lHIV au niveau des cellules infectes.
25. Dcrivez le dpistage au laboratoire de linfection par HIV dans notre pays. Des rsultats de
tests vous seront fournis, que vous aurez interprter (Signification, que faire, que dire la
personne concerne?).
26. Expliquez les indications des examens virologiques de lHIV.
27. Dcrivez les moyens et les principes de la thrapeutique antivirale dans linfection par HIV.
28. Dcrivez la structure de lHBV et les marqueurs de linfection. Des rsultats de tests vous se-
ront fournis, que vous aurez interprter (Signification, que faire, que dire la personne
concerne?)
29. Dcrivez les modalits volutives de linfection par HBV.
30. Dcrivez la transmission de lHBV et sa prvention.
31. Dcrivez la structure du gnome de lHCV et les marqueurs de linfection.
32. Dcrivez lpidmiologie de lHCV et la prvention de linfection.
33. Dcrivez le dpistage au laboratoire de linfection par les virus des hpatites. Des rsultats de
tests vous seront fournis, que vous aurez interprter (Signification, que faire, que dire la
personne concerne?).
34. Citez les virus dont on craint la transmission lors dun accident dexposition au sang. Dcrivez
la conduite tenir en pareil cas.
35. Dcrivez la structure du virus de la variole, son parcours dans lorganisme et les principaux
lments de son expression clinique.
36. Dcrivez le principe de la vaccination antivariolique et ses risques.
Questions de synthse
1. Citez les virus voquer en priorit devant une infection respiratoire grave.
2. Citez les virus voquer en priorit devant une encphalite.
3. Citez les principaux virus sexuellement transmissibles.
4. Citez les virus responsables dinfections ftales et dcrivez brivement les moyens de pr-
vention disponibles.
5. Avoir dans le srum des anticorps contre un virus est-il une bonne ou une mauvaise chose?
Argumentez votre rponse laide dexemples.
6. Citez les principaux virus responsables de cancer chez lhomme en indiquant pour chacun
le(s) mcanisme(s) de la cancrogense et les ventuels moyens de prvention.
7. Illustrez par un exemple de votre choix la notion de fentre et ses consquences pour le dia-
gnostic virologique.
8. Illustrez par un exemple de votre choix la notion de traitement anticip (preemptive en an-
glais) et son intrt en virologie.
9. Expliquez laide dexemple(s) lintrt de quantifier un virus pour la pratique mdicale.
10. Expliquez laide dexemple(s) lintrt de dterminer la squence de gnes viraux pour la
pratique mdicale.
11. Expliquez laide dexemples les conditions dans lesquelles se vacciner aprs avoir t con-
tamin(e) peut viter le dveloppement dune maladie virale.
12. Dcrivez cinq circonstances exigeant une chimiothrapie ou une immunothrapie antivirales
en urgence, et prciser en quoi celles-ci consistent.
Introduction
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 27/307
13. Citez les infections virales lies des voyages ltranger et dcrivez brivement les moyens
de prvention disponibles.
Introduction
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Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 29/307
Chapitre 1
Structure des virus, cycle
viral, physiopathologie des
infections virales
1.1 Quest-ce quun virus ?
Cest un agent infectieux trs simple, dfini par une structure se rsumant deux ou trois lments,
selon les virus. Les virus sont donc totalement diffrents des bactries ou des parasites, qui sont
des cellules, ce que ne sont pas les virus. Les virus sont les virus Andr Lwoff
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
30/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.1.1 Gnome
Un virus comporte toujours un gnome qui est de lADN ou de lARN, de sorte que dans la clas-
sification des virus on distingue en premier lieu virus ADN et virus ARN.
Ce gnome peut-tre monocatnaire ( simple brin) ou bicatnaire ( double brin).
Dune faon gnrale, la rplication du gnome des virus ARN est beaucoup moins fidle que
celle du gnome des virus ADN (les ARN polymrases nayant pas les mcanismes de dtection
et correction derreurs quont les ADN polymrases des virus ADN). Ainsi, les virus ARN sont
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 31/307
particulirement sujets aux variations gntiques (HIV, virus de lhpatite C, par exemple), con-
trairement aux virus ADN.
La taille du gnome - et donc les capacits de codage - diffre considrablement parmi les virus
ADN (3 300kpb), alors quelle est comprise entre 10 et 20 kb pour la plupart des virus ARN.
La capacit somme toute rduite de codage des gnomes viraux (par comparaison aux quelques
25000 gnes du gnome humain) est souvent compense par un chevauchement des cadres de
lecture et par le phnomne dpissage des ARN messagers (dcouvert chez les adnovirus).
1.1.2 Capside
Le gnome est emball dans une structure protique appele CAPSIDE, dun mot grec, capsa, si-
gnifiant bote. La capside protge le gnome. Elle a une conformation gomtrique qui, selon les
virus est, soit tubulaire, soit polydrique. On appelle nuclocapside la structure compacte forme
par lassemblage de la capside autour du gnome.
Il faut retenir que les capsides, tubulaires comme polydriques, 1) sont faites de protines virales
polymrises, les virus ayant trop peu de gnes pour soffrir autant de protines distinctes quil
leur en faut pour recouvrir et protger le gnome, et que 2) ces structures ont t slectionnes dans
la nature en raison de leur grande stabilit.
1.1.2.1 Nuclocapside tubulaire ou hlicodale
Cest un tube enroul en peloton (pour ce qui concerne les virus humains ou animaux, ce peloton
est lui-mme envelopp dans un 3
e
lment appel pplos).
1.1.2.2 Nuclocapside polydrique
Ce nest pas nimporte quel polydre mais un ICOSADRE : polydre 20faces qui sont des
triangles quilatraux, et 12sommets. Vu sous un certain angle, licosadre prsente un contour
hexagonal.
Licosadre est utilis en architecture (coupole du Palais des Sports) et le ballon de football 12pices noires et
20pices blanches a pour structure de base un icosadre. Le d icosadrique est, par ses 20faces, un instrument de
docimologie utilis volontiers par vos enseignants, confronts la correction dun nombre excessif de copies.
Un exemple de virus icosadrique trs simple: les poliovirus
1.1.3 Enveloppe ou pplos
Dun mot grec signifiant manteau, cest llment le plus externe de certains virus. La prsence
ou labsence denveloppe rgle en grande partie le mode de transmission des maladies.
Tous les virus humains et animaux capside tubulaire ont un pplos, mais certains virus capside icosadrique en sont
galement pourvus (Herpesviridae, Togaviridae, Flaviviridae).
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
32/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.1.3.1 Dfinition
Ce terme voque une structure souple et, de fait, le pplos est une membrane, drive des membra-
nes cellulaires, cytoplasmique, golgienne, ou nuclaire selon les virus. En effet, les virus pplos
terminent leur multiplication dans la cellule par bourgeonnement. Des glycoprotines dorigine
virale sinsrent dans la bicouche lipidique caractristique des membranes cellulaires.
Ainsi, la capside et le gnome dun virus envelopp comme le virus de la grippe sassemblent en
une nuclocapside sous la membrane cytoplasmique. Le virus va sortir de la cellule (ou plutt tre
relargu hors de la cellule, les virus tant passifs), non par clatement de cette cellule, mais par for-
mation dun bourgeon au dtriment de la membrane cytoplasmique, bourgeon qui va sisoler pour
former un virus entier, libre, capable dinfecter une nouvelle cellule ou un nouveau sujet. Lenve-
loppe de ce virus de la grippe est la membrane cytoplasmique de la cellule infecte, mais modifie
par ladjonction de glycoprotines virales. Les lipides de lenveloppe sont, eux, dorigine cellulai-
re.
Cest dans le noyau que sassemblent la capside et le gnome des virus de la famille des
Herpesviridae. Le virus va sortir de la cellule aprs bourgeonnement de la membrane nuclaire,
puis de la membrane de lappareil de Golgi.
1.1.3.2 Virus nus
Ce sont les virus sans pplos, les poliovirus par exemple.
1.1.3.3 Que cela change-t-il davoir ou de ne pas avoir de pplos ?
Avoir un pplos rend le virus trs fragile. Le pplos a, en effet, la fragilit des membranes cel-
lulaires dont il drive. Or, un virus, quel quil soit, doit tre entier pour tre infectant, et il est deux
endroits o les virus enveloppe vont dgrader rapidement leur enveloppe et du mme coup perdre
leur pouvoir infectieux: dans le milieu extrieur et le tube digestif. Dans ces mmes endroits,
les virus nus, sans pplos, qui ont seulement un gnome et une capside (capside icosadrique),
rsistent beaucoup plus longtemps.
Cela explique lpidmiologie virale, qui a trait la transmission des infections virales dun indi-
vidu un autre. Le virus de la fivre aphteuse est videmment un virus nu.
Dans le milieu extrieur, les virus pplos ne vont pas survivre longtemps car ils vont tre inactivs
par deux facteurs: la temprature, mme la temprature ordinaire, et la dessiccation.
Cela na rien de surprenant : les membranes cellulaires sont dtruites dans le milieu extrieur et si les cellules bact-
riennes y survivent trs bien, cest parce quelles protgent leur membrane cytoplasmique par leur paroi. Si une cellule
bactrienne se trouve sans paroi (traitement par la pnicilline), la bactrie fragilise meurt. Les virus pplos sont aussi
fragiles que des bactries dont on aurait supprim la paroi !
Dans le tube digestif, le pplos est rapidement dgrad par les enzymes digestives et le pH acide
de lestomac.
Donc, les virus pplos, comme les virus de la grippe, les virus de la famille des Herpesviridae,
ne rsistent pas dans les selles. A linverse, les poliovirus sont trouvs dans les selles qui sont le
moyen essentiel de dissmination de la maladie (contamination fcale-orale). Le pplos nest pas
une cuirasse pour les virus envelopps, mais leur tendon dAchille.
De tout ce qui prcde, il rsulte quon peut opposer presque point par point la transmission de la
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 33/307
grippe et la transmission de la poliomylite
ENVELOPPE ET TRANSMISSION DES VIRUS
Cours I - illustration 2/19
Lgende
Des particularits viennent nuancer ce schma :
Les coronavirus des gastroentrites, virus envelopps, sont limins dans les selles;
celui du SARS aussi !
Certains virus enveloppe exigent une inoculation transcutane:
les arbovirus: piqres de moustiques ou de tiques,
le virus de la rage: morsure danimal enrag ou contact salivaire sur excoriations
cutanes.
La transmission par contacts troits intermuqueux, par rapport sexuel, est exige pour
des virus comme le virus de lherpes simplex de type 2 (HSV 2), lHIV.
La contamination sexuelle est lun des modes de transmission du virus de lhpatite
B, du cytomgalovirus, des virus des papillomes gnitaux.
Les poxvirus ont un ensemble denveloppes complexes, ne drivant pas des membra-
nes cellulaires mais purement virales et synthtises de novo, et ils sont dailleurs par-
ticulirement rsistants dans le milieu extrieur. Les orthopoxvirus rsistent lther.
Le virus de lhpatite B (HBV) a une enveloppe qui, bien quacquise au niveau de la
membrane cytoplasmique de lhpatocyte et comprenant outre lantigne HBs des li-
pides et protines cellulaires, ne montre pas en microscopie lectronique la bicouche
lipidique hrisse des spicules glycoprotiques des virus enveloppe classique.
Dailleurs, plus rsistant que ces derniers, lHBV nest pas inactiv par lther et son
inactivation par lhypochlorite de soude exige une concentration leve de 5%.
Virus pplos Virus sans pplos
Stabilit dans lenvironnement 0 +
Elimination dans les selles 0 +
Elimination dans la gorge + +
Contamination interhumaine directe, res-
piratoire ou salivaire
+ +
Contamination interhumaine indirecte,
fcale-orale
0 +
Temprature de stockage de longue
dure des prlvements pour isolement
-80C -20C suffit
Inactivation par lther + -
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
34/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.1.3.4 La transmission de la grippe
Elle se fait directement par contact rapproch de deux sujets, et par voie arienne uniquement.
On respire les microgouttelettes infectantes projetes par la toux du sujet gripp. Les virus de la
grippe ne rsistent pas longtemps lair. On ne les retrouve pas dans la poussire. Ils ne sont pas
excrts dans les selles; on ne les retrouve pas dans les eaux uses. On ne sinfecte pas par inges-
tion mais par inhalation, face au sujet gripp.
Dautre part, la brve survie des virus de la grippe dans lair, autour des sujets infects, est favori-
se quand lair est humide et froid, le pplos craignant la chaleur et la dessiccation. Rien dton-
nant ce que, dans les hmisphres Nord et Sud, la grippe svisse lhiver et non lt.
1.1.3.5 La transmission de la poliomylite, du virus de lhpatite A et des
entrovirus en gnral
On a affaire des virus relativement rsistants qui peuvent persister plusieurs jours dans le milieu
extrieur, surtout dans leau. Ils sont excrts non seulement dans les microgouttelettes respiratoi-
res mais plus encore dans les selles et cela pendant des semaines. On les trouve donc dans les eaux
uses. Ainsi, la transmission se fait de deux faons:
1. comme pour la grippe, par contact direct rapproch, respiratoire, face un sujet infect;
2. mais surtout par contamination indirecte faisant intervenir les selles, par contamination f-
cale-orale, cest--dire, ingestion du virus avec des aliments contamins, consommation
deau contamine, bains de rivire. La transmission est videmment favorise par les mau-
vaises conditions dhygine. Les pidmies de poliomylite survenaient surtout lt o lon
se baigne, o lon consomme des vgtaux crus, o les orages perturbent la circulation des
eaux uses (normalement les eaux de W.C. passent par des circuits spars mais en cas dora-
ge brutal les vannes qui les contiennent sont dbordes). Les cas de poliomylite ne survien-
nent plus que dans les pays du Tiers Monde o la vaccination fait dfaut.
En somme, le virus de la poliomylite et le virus de lhpatite A, qui sont des entrovirus, ont
tous gards un mode de propagation superposable celui des entrobactries.
Chaque fois quon tudiera un virus, il vous faudra savoir sil a ou non un pplos. La nature
du gnome, ADN ou ARN, intervient pour comprendre la variabilit gntique et la chimio-
thrapie.
Quant la conformation de la capside, tubulaire ou icosadrique, elle a en elle-mme peu de consquence pour
ce qui intresse la virologie mdicale, mais il se trouve que tous les virus humains capside tubulaire ont un
pplos et donc une transmission par contacts rapprochs.
Vous verrez deux exceptions importantes lquation virus enveloppe =virus fragile,
avec le virus de lhpatite B (HBV) et les Poxviridae (dont la variole) : ce sont des virus r-
sistants mais, justement, leur enveloppe est trs particulire, compacte, bien diffrente du p-
plos bicouche lipidique driv par bourgeonnement des membranes cellulaires.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 35/307
1.1.4 Classification des virus
1. Elle repose dsormais sur la structure des virus et non plus sur leur pouvoir pathogne ou leur
taille. Les trois premiers critres de la classification sont, dans lordre, la nature de lacide nu-
clique du gnome (ADN ou ARN), la conformation de la capside (tubulaire ou icosadrique),
et enfin la prsence ou labsence de pplos.
2. Classement ultra-simplifi (non orthodoxe mais suffisante en DCEM 1) des virus selon les
critres 1 et 3 seulement.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
36/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 37/307
CLASSIFICATION SIMPLIFIE DES VIRUS
A. VIRUS ADN
*Infection mortelle pour lhomme.
Virus pplos Virus sans pplos
= Virus herptiques
Herpes simplex virus 1 & 2 (HSV 1 & 2)
Virus de la varicelle et du zona (VZV)
Cytomgalovirus (CMV)
v. Eptein-Barr (virus EB)
6
e
, 7
e
et 8
e
herpesvirus humains
Herpesvirus simi (virus B)*
Adnovirus
Poxvirus
Papillomavirus
Polyomavirus
Parvovirus
Virus de lhpatite B (HBV) : enveloppe non acquise par bourgeonnement
Poxvirus : virus enveloppe complexe, non acquise par bourgeonnement, et trs rsis-
tants.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
38/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
B. VIRUS ARN
*Infections mortelles pour lhomme.
Chez lhomme, les virus nus sont tous capside icosadrique et tous les virus capside
tubulaire sont envelopps.
Cours I - illustration 5/19
Virus enveloppe Virus sans enveloppe
Myxoviridae = virus influenza A, B, C
Paramyxoviridae
Virus parainfluenza 1 4
Virus des oreillons
Virus de la rougeole
Virus respiratoire syncytial (RS)
Coronavirus
Virus de la rage*
Togavirus et Flavivirus (anciens arbovi-
rus)
Virus de lhpatite C (HCV)
Arenaviridae
Virus de la choriomningite
Virus de la fivre de Lassa*
Filoviridae :
Virus Marburg*
Virus EBOLA*
Hantavirus
Virus de la rubole (cest un
Togaviridae)
Retroviridae
HTLV-1 et 2
HIV-1 et 2*
Picornavirus
Entrovirus
Poliovirus 1 3
Coxsackievirus ( 30)
chovirus ( 30)
Virus de lhpatite A (HAV)
Rhinovirus
Virus de lhpatite E
Rotavirus
Calicivirus
Virus de lhpatite D (Delta) ou HDV : gnome et core de lHDV sous enveloppe de l HBV
(Ag HBs).
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 39/307
1.1.5 Agents des encphalopathies spongiformes
transmissibles ou ATNC (agents transmissibles non
conventionnels)
Ils se situent part, au-del des frontires de la virologie : non dceles mme au microscope
lectronique, ils rsistent de faon extraordinaire aux procds dinactivation physico-chimi-
ques qui dtruisent le pouvoir infectieux des bactries et des virus, chaleur, formol, ultraviolets. Ils
font lobjet du cours XI.
1.2 Multiplication des virus
1.2.1 Conditions ncessaires la multiplication dun virus
Leur simplicit extrme empche les virus de se multiplier, du moins par eux-mmes.
Se multiplier pour un tre vivant est reproduire un difice fait dun enchevtrement de macromolcules qui est la fois
trs complexe et trs prcis, trs organis. Pour russir un tel difice, il faut quatre sortes dlments.
1. Un plan de travail : cest linformation gntique. Le virus a cette information dans son gnome: cest la squen-
ce des bases de son gnome, ADN ou ARN.
2. La matire premire: en biologie, de petites molcules, acides amins, acides gras, molcules organiques sim-
ples, sels minraux. Le virus qui doit se multiplier na pas de rserves de petites molcules. Pas de vacuoles, pas
de systme digestif, mme primitif, qui lui permettrait de puiser ces composants dans le milieu extrieur.
3. Autre lment manquant au virus: des sources dnergie. Toute dification consomme de lnergie. En biologie,
cest trs souvent lnergie libre par hydrolyse de composs tels que lATP. Le virus na pas de rserve dATP
ni les moyens den constituer ; il na aucune source dnergie propre.
4. Enfin, un lment manque encore au virus: lassemblage des petites molcules en macromolcules exige des
acclrateurs biologiques, des enzymes. Sans enzymes, les assemblages ne se feraient pas ou si lentement que
les difices biologiques, minemment prissables, tomberaient en ruine durant leur construction. Les virus nont
pas les chanes enzymatiques des grandes voies des synthses biologiques.
Donc, un virus est incapable de synthtiser un autre virus, alors quune bactrie est capable de faire une autre bactrie.
Pour se multiplier un virus na que son gnome. Il lui faut mettre son gnome dans un endroit o combler ses manques
et trouver des sources de matire premire, des sources dnergie, des enzymes. Dans la nature, un tel rassemblement
nexiste actuellement qu lintrieur dune cellule (il a pu en aller diffremment au tout dbut de lapparition de la vie
sur terre).
Donc, la multiplication dun virus consiste en lintroduction du gnome viral dans une cellule et
cest elle qui va fabriquer de nouveaux virus, selon un procd de biosynthse que lon appelle
rplication.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
40/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.2.2 La multiplication dun virus comporte six tapes
1.2.2.1 Attachement
Elle commence par lentre en contact du virus et de la cellule. Cest lATTACHEMENT de la
surface virale sur la surface cellulaire. Il se fait donc par des protines de la capside pour les virus
nus, par des glycoprotines du pplos pour les virus pplos. Ces protines ou glycoprotines sat-
tachent des rcepteurs situs sur la membrane cytoplasmique de la cellule hte.
Ce besoin de rcepteurs cellulaires de la membrane cytoplasmique pour les virus explique quun
virus donn ne peut infecter quun nombre restreint despces animales (tropisme dhte) avec des
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 41/307
tropismes tissulaires et cellulaires prcis.
Ainsi, les poliovirus ninfectent que lhomme et, exprimentalement, les singes suprieurs, mais pas les oiseaux, ni les
poulets: cest parce que les poliovirus ne trouvent de rcepteurs pour leur attachement que sur les cellules de primates
et non sur les cellules de poulet. Mais si, artificiellement, on extrait le gnome dun poliovirus de sa capside et si arti-
ficiellement on le transfecte lintrieur dune cellule de poulet, cette cellule de poulet va produire des poliovirus.
Le virus de la fivre jaune qui se multiplie chez lhomme, chez le singe et chez lanophle trouve des rcepteurs la
surface des cellules de ces trois espces dtres vivants. On ne connat pas les rcepteurs de tous les virus.
Les virus de limmunodficience humaine (HIV) infectent principalement les lymphocytes T
CD4+car leur enveloppe peut sattacher sur la molcule CD4, rcepteur spcifique de ces virus.
La structure dattachement de lHIV est la glycoprotine de surface de lenveloppe, la gp120 (gly-
coprotine de 120000 daltons, 120kDa de poids molculaire, do son nom).
1.2.2.2 Pntration
Le virus pntre lintrieur de la cellule, le plus souvent par endocytose pour les virus nus et,
pour les virus envelopps, par fusion de lenveloppe virale et de la membrane cytoplasmique en
une membrane unique, fusion suivie de lyse, par formation dun pore (trou) qui slargit et laisse
passer la capside dans le cytoplasme. Cette fusion-lyse rsulte de laction dune glycoprotine
de lenveloppe virale : pour lHIV, cest la gp41. Certains virus envelopps pntrent par endo-
cytose, puis fusion de leur enveloppe avec la membrane de la vsicule dendocytose.
1.2.2.3 Dcapsidation
Les structures virales sont ensuite dgrades, lexception du gnome qui, dbarrass de la cap-
side, se trouve libr. Il est ncessaire que la capside soit dtruite pour que le gnome, dcortiqu,
puisse fonctionner, livrer son information gntique la machinerie cellulaire.
Ainsi, paradoxalement, la multiplication virale commence par une destruction du virus, destruction mnage qui res-
pecte le gnome. Aprs ces tapes dinitiation de linfection, prend place la phase de rplication et dexpression du
gnome viral.
1.2.2.4 Rplication
Le gnome viral libr prend la direction des synthses, dans la cellule.
Il se substitue en totalit ou en partie au gnome cellulaire qui jusqualors organisait les synthses cellulaires. Le g-
nome cellulaire faisait en sorte que la cellule produise des scrtions, exocrines ou endocrines, et ventuellement des
lments pour faire une deuxime cellule. Dsormais, la cellule va produire des virus.
Plus prcisment, elle va faire des copies, (rpliques) du gnome viral, des rpliques de protines
virales, protines de capside et glycoprotines de pplos pour les virus pplos.
Il y a donc un changement radical dans la direction des synthses. Le mcanisme de cette rpli-
cation virale varie selon que le gnome est ARN ou ADN. Mais dans tous les cas, cest par
des ARN messagers viraux que les gnomes viraux transmettent leur information, donnent leurs
ordres la machinerie cellulaire.
Ds que des ARN messagers viraux apparaissent dans la cellule, celle-ci est pige: elle lit sur les ribosomes ces
messagers viraux comme si ctait des messagers cellulaires et elle les traduit en protines virales. Les virus ont t
compars des agents subversifs.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
42/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1. Suivant les virus, llaboration des messagers viraux ou transcription est une opration plus
ou moins complexe. Pour les poliovirus, tout est simple : le gnome est un ARN qui sert
tel quel de messager ; de ce fait il est dit positif et donc il est immdiatement traduit par
les ribosomes cellulaires en protines de capside (et enzymes viro-induites). Pour les poliovi-
rus, il ny a pas de transcription. Pour les virus ADN, il faut ncessairement une trans-
cription. Pour les rtrovirus - virus des sarcomes et leucmies animales, HTLV et HIV - il
y a galement une transcription, transcription du gnome ARN en une copie de ADN qui
sera intgre dans lADN cellulaire, cela par une transcriptase virale dite inverse (elle cata-
lyse lopration inverse de la transcription cellulaire normale de ADN en ARN). Le terme an-
glais est reverse transcriptase (RT).
2. Les enzymes viro-induites. La synthse des composants viraux par la cellule exige gnra-
lement un rajustement de la machinerie cellulaire. Ainsi, la cellule normale est incapable
de rpliquer lARN des poliovirus. Cette opration consiste polymriser de lARN sur une
matrice dARN, sur le gnome du poliovirus infectant. Cela ncessite une enzyme appele r-
plicase, qui est une ARN polymrase ARN-dpendante (cest--dire travaillant sur une ma-
trice dARN). Or, dans la cellule normale, une telle opration et une telle enzyme nont pas
de raison dtre et nexistent pas:
les ARN cellulaires, quil sagisse des ARN messagers, ribosomiques ou de transfert, sont synthtiss par des
ARN polymrases ADN-dpendantes, travaillant sur une matrice dADN, le gnome cellulaire. Donc, pour se
multiplier dans une cellule, un poliovirus et dune faon gnrale tous les virus ARN, doivent faire fabriquer
la cellule infecte une ARN rplicase, enzyme nouvelle, viro-induite, absente de la cellule normale, inutile au
fonctionnement normal de la cellule, mais ncessaire la multiplication virale.
La transcriptase inverse (TI) ou rtrotranscriptase (RT) des rtrovirus est galement une
enzyme viro-induite.
Certains gnes viraux codent des protines transactivatrices. Tel est le cas de lHIV produi-
sant la protine TAT (p14).
Elle transactive dun facteur x 50 la transcription des messagers viraux partir de lADN proviral intgr
dans la cellule. Cette transcription des messagers viraux est galement active dans le cas de lHIV par des fac-
teurs cellulaires comme le NF Kappa B.
Enfin, la synthse des diffrentes protines virales passe, pour certains virus, par la synthse
dun prcurseur unique, donc dun polypeptide gant, secondairement cliv par des prota-
ses pour produire les diffrentes protines virales. Certaines de ces protases (cas du HIV et
du virus de lhpatite C) sont des enzymes virales, qui vont donc sautocliver (cf cours 3 page
95).
1.2.2.5 Assemblage
Les nouveaux gnomes fabriqus par la cellule sentourent de nouvelles protines virales fabri-
ques par la cellule. Cet emballage est lencapsidation (linverse de la dcapsidation) des gnomes
qui aboutit la formation de nouveaux virus.
1.2.2.6 Libration
Ces nouveaux virus sont relargus hors de la cellule par clatement pour les virus nus, par bour-
geonnement pour les virus pplos. Cest lors du bourgeonnement que les virus enveloppe re-
oivent leur enveloppe qui est une bicouche lipidique cellulaire hrisse de spicules
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 43/307
glycoprotiques. Une cellule produit de lordre de 100 1000virus.
La multiplication dun virus est trs diffrente de la multiplication dune bactrie. Une bactrie
est une cellule, particulire, mais cest une cellule, alors quun virus nest pas une cellule.
Ainsi, un virus ne crot pas, ne se divise pas, sort complet, termin de la cellule, et ne se modifie
plus.
1.2.3 Consquences de la multiplication virale pour la cellule
infecte
Trois consquences sont possibles:
1.2.3.1 Mort de la cellule
La cellule en meurt, les synthses cellulaires ayant t gravement perturbes par les virus. Cest
lINFECTION LYTIQUE. Cest ce que donnent la plupart des virus humains dans les cellules.
Cest in vivo lquivalent de leffet cytopathique (ECP = altration morphologique de la cellule
infecte, visible en microscope optique) observ in vitro en culture de cellules (cf illustrations
de lannexe E page 277). Lors de linfection lytique, laccumulation dans la cellule infecte de
matriel viral dsorganise les structures et les fonctions cellulaires. La cellule infecte meurt, soit
par ncrose, soit par apoptose. Tout le problme est de savoir si ces cellules peuvent tre rem-
places par dautres cellules au sein de lorganisme.
Ainsi, au cours des infections par poliovirus, la destruction des neurones de la corne antrieure de la moelle donne des
paralysies dfinitives, car un neurone dtruit nest pas remplac. En revanche, si ce sont les cellules gliales qui sont
dtruites, les paralysies peuvent rgresser.
1.2.3.2 Tolrance de linfection
Deuxime ventualit: la cellule tolre linfection. Le gnome viral et le gnome cellulaire se par-
tagent le potentiel de synthse de la cellule et les deux mtabolismes, cellulaire et viral, coexistent,
selon un compromis acceptable. LINFECTION TEMPRE traduit ce modus vivendi.
1.2.3.3 Transformation cellulaire maligne
Troisime ventualit, la cellule se multiplie de faon anarchique : cest la TRANSFORMA-
TION CELLULAIRE MALIGNE, la cellule infecte acqurant des caractres gnralement at-
tribus aux cellules cancreuses.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
44/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Rappelons quune cellule normale est une cellule diplode, 2 N chromosomes; quelle a in vitro
un potentiel de multiplication limit, ne pouvant dans les meilleurs cas se diviser plus de 50 fois;
elle connat linhibition de contact : des cellules normales en culture sur le verre cessent de se
multiplier ds quelles entrent en contact les unes avec les autres par leur membrane cytoplasmi-
que, de sorte quelles forment une couche strictement monocellulaire. Au contraire, les cellules
transformes ou cancreuses sont aneuplodes (2 N chromosomes) ; elles ont un pouvoir de
multiplication in vitro illimite (cest lexemple des cellules KB qui ne cessent de se multiplier
depuis quon les a mises en culture partir dun cancer buccal, il y a cinquante ans) ; elles ont per-
du linhibition de contact, de sorte quelles forment en culture sur le verre des couches pluricel-
lulaires. Elles portent des antignes particuliers, tumoraux, notamment sur leur membrane
cytoplasmique, de sorte que les lymphocytes T les reconnaissent trangres lorganisme et, nor-
malement, les rejettent. Enfin, leur cytosquelette est dsagrg.
Les cellules transformes sobtiennent partir de tissus cancreux ou partir de cellules normales
transformes in vitro, soit spontanment au cours de la culture, soit par laction de cancrognes
chimiques, de radiations ionisantes ou de virus cancrignes. Il existe en effet, des virus
cancrignes.
Le premier virus cancrigne, reconnu au dbut du sicle par ROUS, est responsable de sarcomes
dveloppement rapide chez le poulet. Cest un rtrovirus. ce titre, son gnome ARN mo-
nocatnaire est transcrit par une transcriptase inverse (reverse) virale en ADN bicatnaire qui va
sintgrer dans lADN du gnome cellulaire. De l, il exprime son information virale: il comporte
des gnes pour les protines constituant le virus (gnes gag pour antigne de groupe, pol pour po-
lymrase =transcriptase inverse et env pour enveloppe) et de plus un oncogne responsable du
pouvoir sarcomatogne rapide de ce virus. Cet oncogne sarc est en fait un gne cellulaire
normal du poulet, rcupr par le gnome du virus.
Cela a conduit se demander quel est le rle de loncogne sarc et des autres oncognes en gnral,
dune part chez les poulets normaux, et dautre part chez les poulets inoculs par le virus de ROUS
ou par dautres virus sarcomatognes.
Chez le poulet normal, loncogne cellulaire sarcomatogne, appel c-sarc (c pour cellule) code
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 45/307
en fait un facteur de croissance cellulaire ; son expression est indispensable au poulet pour as-
surer lembryogense au dbut de la vie, et plus tard les processus de rparation ncessaires aux
poulets adultes, cicatrisation par exemple.
Quand le gne sarc est au sein du gnome viral lui-mme intgr dans lADN cellulaire, son ex-
pression se trouve trs augmente, cela de faon inapproprie, avec pour consquence le sarcome.
Dans le gnome viral, loncogne se trouve en effet sous contrle des promoteurs viraux qui
sont considrablement plus actifs que les promoteurs du gnome cellulaire. Il existe dautres onco-
gnes cellulaires (c onc), et des oncognes viraux (v onc) correspondants, chez les souris, les chats
et autres mammifres: ces v onc, inclus dans les virus sarcomatognes rapides, sont, chez ces
animaux aussi, responsables de tumeurs rapidement mortelles.
Dautres rtrovirus du poulet, de la souris, du chat, sont, eux, lorigine de leucmies qui survien-
nent aprs une longue dure de linfection et cela de faon inconstante. Il sagit cette fois de rtro-
virus leucmognes lents , dpourvus de v onc, responsables dune infection chronique de
lhte animal. Cette infection est asymptomatique jusqu ce que, ventuellement, lADN viral
vienne sinsrer dans le gnome cellulaire au contact dun c onc qui passe alors sous contrle de
promoteurs viraux et se trouve ainsi exprim de faon inapproprie. On parle de cancrogense
insertionnelle. Cest un risque de la thrapie gnique par vecteur rtroviraux.
Chez lhomme, dune faon gnrale, on reconnat toute une srie doncognes cellulaires (par
exemple le gne c myc) mais, par chance, pas dquivalent des rtrovirus sarcomatognes rapides
ou leucmognes lents.
Chez lhomme, les mcanismes de la cancrogense peuvent tre rsums comme suit :
1. Il peut sagir dune activation doncogne cellulaire, soit par mutation, soit par amplifica-
tion, ou soit par passage sous contrle dun promoteur rapide, lors dune translocationchro-
mosomique (rappelons que la cancrognse insertionnelle virale na pas t dcrite chez
lhomme).
2. Mais, loppos, il existe des cancers lis linactivation dun anti-oncogne, par exemple
le gne de la protine p53 ou de la protine Rb, soit par mutation, soit par insertion dun virus
en son milieu (autre forme de cancrogense insertionnelle).
Chez lhomme, cinq catgories de virus sont lies un cancer :
1. lHTLV-1 humain (human T lymphotrope virus type 1) qui est un rtrovirus responsable de
leucmies et sarcomes lymphocyte T de ladulte dans des zones gographiques particuli-
res (Carabe, J apon, Afrique).
2. le virus de lhpatite B ou HBV, responsable du cancer primitif du foie, endmique dans
la zone intertropicale. Le virus de lhpatite C ou HCV participe galement ltiologie du
cancer primitif du foie.
3. les HPV-16 18 et 31, virus des papillomes humains associs au cancer du col utrin.
4. le virus Epstein-Barr ou EBV, associ notamment au lymphome africain de Burkitt, au car-
cinome nasopharyng des Chinois de la rgion de Canton, aux lymphomes des sujets immu-
nodprims.
5. Le 8
e
herpsvirus humain ou HHV-8 associ la maladie de Kaposi et au lymphome diffus
des sreuses. Nous y reviendrons dans les cours consacrs ces diffrents virus.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
46/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.3 Moyens de dfense contre linfection
virale
Dans ces conditions, il faut bien quexistent dans lorganisme des MOYENS DE DFENSE
CONTRE LINFECTION VIRALE.
Sinon, la premire infection virale, les cellules de lorganisme seraient dtruites les unes la suite des autres. De fait,
trois lignes de dfense successives sopposent linfection virale: 1/ la frontire de lorganisme, la peau et les
muqueuses; 2/ limmunit naturelle, inne; 3/ limmunit acquise.
1.3.1 la frontire, la peau et les muqueuses
LA PEAU. Elle prsente en surface une couche de kratinocytes morts, de sorte quune peau sai-
ne constitue une barrire efficace contre les infections virales sauf accident : cette barrire
peut tre franchie par les virus en cas de piqre, rosion ou morsure (ou artificiellement par
transfusion de sang, greffe dorgane ou de tissu).
LES MUQUEUSES. Au niveau de lil, larbre respiratoire, le tube digestif, le tractus gnito-uri-
naire, les muqueuses prsentent en surface des cellules vivantes. Ainsi elles constituent une bar-
rire moins efficace que la peau, en dpit de divers lments associs aux muqueuses: scrtion
de mucus, pH extrmes (tube digestif, vagin), enzymes protolytiques (larmes, tube digestif), tapis
muco-ciliaire (bronches).
De fait, de nombreuses infections virales ont une porte dentre muqueuse, les virus infectant
lhomme par inhalation (grippe), ingestion (entrovirus) ou par rapport sexuel (HIV, herps gni-
tal). Plus rarement, linfection se fait par voie transcutane. noter que des altrations de la mu-
queuse gnitale par une maladie sexuellement transmissible (MST) comportant des ulcrations,
comme lherps, favorisent lacquisition comme la transmission de lHIV.
[Dans le mme sens, lutilisation dun spermicide tel que le nonoxylol (ou N9), pour prvenir lacquisition de lHIV,
la, au contraire, facilite, cela par altration de la muqueuse vaginale, de sorte que la recherche de nouveaux micro-
bicides met laccent sur leur innocuit pour les muqueuses, autant que sur leur activit virucide.]
En cas de FRANCHISSEMENT DE LA FRONTIRE, et dinfection au niveau de la porte den-
tre, un 1
er
mcanisme de dfense est le passage en APOPTOSE des cellules en dbut de cycle
viral : par leur suicide avant la phase dassemblage et de libration de nouvelles particules virales,
ces cellules infectes mais sacrifies temps ne propageront pas linfection.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 47/307
1.3.2 Immunit naturelle, inne
Elle est non spcifique, large, distinguant seulement entre soi et non-soi (self et non-self ), tant
dirige contre ce dernier. Les virus sont constitus de mosaques dantignes, qui sont fabriqus
par nos cellules mais qui, tant dinformation virale, sont perus comme trangers par lorganisme.
Limmunit naturelle est inne, prexistant linfection, ne ncessitant pas dimmunisation pra-
lable. Ainsi, elle intervient dans les heures, voire les minutes suivant linfection. Elle met en jeu
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
48/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de nombreux acteurs (cytokines, cellules sentinelles, cellules NK) aux actions diverses et
enchevtres: action proprement antivirale, mais aussi potentialisation mutuelle de ces l-
ments de dfense naturelle, et prparation de la ligne de dfense suivante constitue par limmu-
nit acquise.
1. Ainsi, parmi une 20
aine
de CYTOKINES, les INTERFRONS alpha et bta (IFN- /)
sont produits par les cellules infectes et les cellules dendritiques. En se fixant aux cellules
saines, ils y induisent un tat antiviral par la synthse de protines antivirales dinformation
cellulaire. Ces dernires bloquent la traduction des ARN messagers viraux en protines vi-
rales par des mcanismes complexes. Par ailleurs, ces IFN stimulent les cellules NK.
Ces IFN ont une spcificit despce ( quelques exceptions prs, seuls les interfrons humains protgent les cel-
lules humaines) mais ils nont pas de spcificit de virus: les virus sont tous inducteurs dinterfrons et sensibles
aux interfrons, mais des degrs divers. Donc large spectre. Ils sont, comme les hormones, actifs trs faibles
doses et trs peu toxiques. Leur rle dans les dfenses naturelles antivirales est probablement trs important : des
animaux des laboratoires infects de faon asymptomatique par divers virus font aprs administration de srum
anti-interfron une infection mortelle. La fixation dIFN sur la cellule y induit la transcription de plus de
300gnes, et lon est loin de connatre tous leurs effets!
Le traitement par IFN- a une activit partielle mais bien dmontre dans les hpatites B et C.
2. CELLULES SENTINELLES : CELLULES DENDRITIQUES et MACROPHAGES.
Elles produisent de lIFN et dautres cytokines et elles prsident la mise en place de lim-
munit acquise : elles internalisent et apprtent (processing) les antignes viraux et elles
migrent dans les ganglions lymphatiques pour y informer (duquer ) les cellules T et B.
3. CELLULES NK (natural killer). Elles ont une activit antivirale directe : elles reconnais-
sent les cellules infectes comme tant anormales et les lysent (comme elles lysent les cellu-
les cancreuses). Par ailleurs, elles secrtent diverses cytokines.
4. COMPLMENT. En coopration avec des anticorps naturels, spcificit large, il lyse les
cellules infectes et les virus enveloppe.
5. LA FIVRE est un autre moyen de dfense de premire ligne car, au fur et mesure que la
temprature augmente, la multiplication virale diminue.
La plupart des virus ne se multiplient pas ou mal 40C : du fait des rats des synthses virales (travail vite
fait, mal fait ), les protines virales prsentent des anomalies qui se rvlent quand la temprature slve.
Au total, limmunit naturelle, inne, est un ensemble de dfenses primitives, dj prsentes chez les animaux inf-
rieurs, les insectes. Cest chez eux que lon a dcouvert les rcepteurs Toll, prsents la surface des cellules impli-
ques dans limmunit naturelle, inne, et intervenant dans la reconnaissance du non-soi (non-self ). Ainsi, vis--vis
dune tentative denvahissement de lorganisme par un agent infectieux ou par une cellule cancreuse, se dveloppe
une manifestation de xnophobie primaire, indiffrencie, rapide et brutale, et bien souvent efficace. A contrario, la
sensibilit particulire du nouveau-n certaines infections virale, comme lherps, sexplique par limmaturit phy-
siologique transitoire de ses macrophages et de ses cellules NK
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1.3.3 Immunit acquise, spcifique
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1.3.3.1 Schma gnral
Limmunit acquise est plus subtile que limmunit inne.
Les cellules effectrices sont, pour lessentiel, les lymphocytes B (aboutissant lexcrtion
danticorps) et les lymphocytes T CD8+ (aboutissant la lyse des cellules infectes, et ap-
pels alors CTL pour cytotoxic T lymphocytes en anglais). Chaque lymphocyte cible un anti-
gne particulier, fait de quelques peptides (pitopes), par un rcepteur spcifique situ sa
surface. Il sagit danticorps pour les lymphocytes B, et de TCR (T cell receptor) pour les
lymphocytes T.
Pour sattacher de faon spcifique aux divers pitopes des innombrables agents infectieux
menaant notre organisme, une varit considrable des rcepteurs doit tre produite et donc
code par notre organisme: alors que quelques centaines de gnes suffisent coder les rcep-
teurs impliqus dans limmunit inne, il en faut environ 10
14
pour les anticorps et 10
18
pour
les TCR. Le gnome humain ne comportant quenviron 25000gnes, ces gnes codant cette
multitude danticorps et de TCR proviennent de rarrangements de segments gnomiques,
cela entre quelques centaines de gnes du gnome humain.
Les lymphocytes T CD4+ sont, en position centrale, les chefs dorchestre de limmunit
acquise: une fois informs par les cellules dendritiques qui leur prsentent les antignes vi-
raux labors partir du virus infectant (processing ou apprtement), des lymphocytes CD4+
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 51/307
auxiliaires (helper ou Th) favorisent, par la scrtion de diverses cytokines, dune part lvo-
lution des lymphocytes B en plasmocytes producteurs danticorps circulants, et dautre part
lvolution des lymphocytes T CD8+en CTL.
La mise en place de limmunit acquise demande un dlai de plusieurs jours ou semaines. Il
persiste une mmoire immunitaire: grce la constitution de cellules mmoire B ou T,
longue dure de vie et spcifiques de lantigne immuno-inducteur, une rinfection par le
mme virus entrane un redploiement rapide de limmunit acquise (anticorps et CTL spci-
fiques),
et cela particulirement au niveau des muqueuses, porte dentre dans lorganisme de la plu-
part des virus.
1.3.3.2 Anticorps
Les anticorps sont produits par les lymphocytes B (dont ils sont les rcepteurs de surface) et excr-
ts sous forme circulante (dans le sang et les liquides biologiques) par les plasmocytes. Les anti-
corps protecteurs peuvent tre assimils aux anticorps neutralisants. Ceux-ci annulent ou
rduisent le pouvoir infectieux dune prparation virale in vitro en culture cellulaire, ou in vivo
chez lanimal dexprience.
Les anticorps neutralisants sont dirigs contre les antignes de surface du virus (capside pour
les virus nus, pplos pour les virus pplos). Les anticorps dirigs contre les antignes internes du
virus, galement suscits par linfection, ne sont pas protecteurs; ils tmoignent simplement de
linfection. En effet, le mcanisme de la neutralisation est le suivant : les anticorps neutralisants
perturbent les premiers temps de la multiplication virale : lattachement (par interposition en-
tre la surface virale et les rcepteurs de la membrane cytoplasmique), mais aussi la pntration, voi-
re la dcapsidation. Les anticorps ne pntrent pas dans les cellules et sont donc sans action sur la
rplication. Les anticorps neutralisants ont pour cible les virus extracellulaires, puisquils ne peu-
vent entrer dans la cellule.
Les anticorps viraux appartiennent essentiellement aux IgA dans les scrtions muqueuses, et aux
IgG et IgM dans le srum. Les IgM antivirales disparaissent gnralement quelques semaines aprs
la primo-infection.
Le titre des anticorps viraux culmine la convalescence. Ils interviennent moins dans la gurison
de linfection que dans la protection vis--vis dune rinfection ultrieure.
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1.3.3.3 Lymphocytes T CD8+ Cytotoxiques ou CTL
Les antignes impliqus ici sont les antignes viraux prsents par la cellule infecte au ni-
veau de sa membrane cytoplasmique. Ces antignes proviennent des protines virales produites
lintrieur de la cellule infecte et apprtes par passage travers le protasome (processing, qui
fragmente la protine en courts polypeptides ou pitopes). Point important, ces antignes viraux ne
sont reconnus par le TCR de la surface des lymphocytes T CD8+que sils sont transports et pr-
sents la surface de la cellule infecte par un composant du complexe majeur dhistocompatibilit
(CMH ou MHC en anglais) de classe-I. On dit que la cytolyse par les CTL connat une restriction
CMH-I. Cette lyse exige le contact entre cellules cibles et cellules immunitaires travers une dou-
ble reconnaissance de lantigne viral, par le CMH-I et par le TCR (complexe ternaire). Cest
le baiser qui tue, avec les deux bras du CTL : scrtion dune part de perforines et de gran-
zymes (srines protases) qui ncrosent la cellule infecte, et dautre part de fas-ligand qui en se
liant au Fas de la cellule infecte y dclenche un signal de mort programme (apoptose).
Il existe dautres mcanismes de cytotoxicit mdiation cellulaire, notamment la cytotoxicit des cellules tueuses
(cellules K, pour Killer) dpendant des anticorps. Par un rcepteur au fragment Fc des IgG, elles reconnaissent et tuent
les cellules infectes recouvertes danticorps viraux IgG, dont il suffit dune trs faible concentration. Cest lADCC
(antibody-dependant cell-mediated cytotoxicity, cytotoxicit mdiation cellulaire dpendante des anticorps). Les cel-
lules K sont ni B ni T, ni macrophages, ni polynuclaires.
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1.3.4 Interactions et ambivalence des moyens de dfenses
1. Il nest pas facile de dissocier les diffrents moyens de dfense, tant ils sont la fois redon-
dants et complmentaires
LADCC met en jeu limmunit humorale (anticorps) et limmunit cellulaire.
A ct des cytotoxicits mdiation cellulaire par les cellules NK, les lymphocytes T, les cellules K, il
existe une cytotoxicit par anticorps dpendant du complment, aboutissant elle aussi la lyse des cellules
infectes: cellule infecte +anticorps viraux +complment lyse.
Une certaine varit dinterfron (linterfron immun ou ) est secrte par les cellules NK ou les lympho-
cytes T sous leffet dune stimulation antignique virale (ou dune stimulation non spcifique).
Les interfrons / activent les cellules NK. En augmentant lexposition du CMH-I la surface des cel-
lules infectes, ils en favorisent la lyse par les CTL.
Linjection thrapeutique dinterfron donne souvent de la fivre.
On pourrait multiplier linfini les exemples de tels enchevtrements. Il y a finalement
surdtermination des divers mcanismes de dfenses contre linfection virale (un mme
effet est produit par diffrents acteurs), et un mme acteur, les cytokines notamment, joue
dans plusieurs pices (pliotropisme).
2. Ces moyens de dfense sont ambivalents, cest--dire tantt favorables, mais tantt dfa-
vorables (immunopathologie).
La cytotoxicit, par CTL ou cellules NK, dbarrasse lorganisme de cellules infectes avant quelles
naient pu produire de nouveaux virus infectieux, mais cest au prix dune cytolyse, qui peut apparatre
indsirable lorsque linfection virale nest pas cytolytique.
Les macrophages ont un rle favorable lorsquils digrent par leurs enzymes lysosomiaux les virus pha-
gocyts et prsentent les antignes viraux aux cellules immunes. Mais ils peuvent aussi, dans certains cas,
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multiplier les virus et les dissminer dans tout lorganisme puisque ce sont des cellules trs mobiles et ubi-
quitaires (cas de lHIV). On parle alors des macrophages comme cheval de Troie .
dose infra-neutralisante, les anticorps antivirus de la dengue stimulent linfection, in vitro en culture de
cellule, comme in vivo chez le singe infect exprimentalement (anticorps facilitants).
Trop dimmunit tue limmunit. Ainsi, le systme immunitaire comporte ncessairement
des facteurs de rgulation ngative, par exemple les lymphocytes T CD4+ suppresseurs,
car lorsque linfection est jugule, mieux vaut mettre au repos certains lments du systme
de dfense. Il existe aussi un quilibre entre la rponse par production danticorps et la rpon-
se par CTL
(les cytokines IL-4 et 10 qui favorisent la production danticorps ont un effet ngatif sur la production de CTL,
et inversement, lIL-12 et lIFN- qui favorisent la production de CTL ont un effet ngatif sur la production dan-
ticorps, selon la philosophie du Ying-Yang).
Certains virus dtournent leur profit ces mcanismes de rgulation.
1.3.5 Immunodpression et infections virales
Quoiquil en soit, les tats dimmunodpression aggravent les infections virales, surtout quand
la dpression porte sur limmunit cellulaire: destruction des lymphocytes T CD4 +par lHIV au
cours du SIDA, traitement immunodpresseurs anti-lymphocytes T CD8+pour viter le rejet de
greffe. Tous les tats dimmunodpression contre-indiquent les vaccins vivants, infectieux.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 55/307
1.3.6 chappement des virus aux dfenses immunitaires
Les virus ont volu en dveloppant des mcanismes dchappement aux dfenses immunitai-
res. Ce sont le camouflage et le sabotage.
Il doit en effet y avoir un modus vivendi entre virus et hte car la destruction mutuelle assure ou MAD des joyeux
stratges de la guerre nuclaire nest pas une option viable en matire dvolution biologique. Lhte a des mcanismes
de dfense contre les virus mais, en revanche, les virus ont des mcanismes dchappement aux dfenses de lhte.
1.3.6.1 Le camouflage
Le camouflage des virus consiste en deux mcanismes.
La modification des pitopes de neutralisation ou de cytolyse par les lymphocytes T (CTL),
cela par mutations. Sy prtent particulirement les virus ARN, comme les virus de la grip-
pe et le virus de lhpatite C, car lARN polymrase ARN-dpendante qui rplique le gnome
na pas de mcanisme de lecture et de correction des erreurs, do la facilit des mutations.
Sy prte galement lHIV, dont la rtrotranscriptase (RT, ADN polymrase ARN-dpendan-
te) manque galement dun mcanisme de correction derreur.
Linfection latente. Bien des virus en sont capables. Cest le cas, notamment, des
Herpesviridae, des polyomavirus, des papillomavirus, du virus de lhpatite B, des rtrovirus.
Aprs la primo-infection, le gnome viral persiste dans la cellule avec, dans certains cas, in-
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
56/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
tgration dans le gnome cellulaire, mais il ne sexprime pas, ou nexprime quune partie de
son information gntique. Ainsi, il ne produit pas dantigne et chappe donc aux dfenses
immunitaires; de mme, il ne se multiplie pas et chappe donc aux antiviraux qui sont es-
sentiellement des inhibiteurs de la multiplication virale. Donc, le virus en phase de latence
survit en faisant le mort , et il est difficile ou impossible de le dloger.
1.3.6.2 Sabotage
Le sabotage des mcanismes de dfense de lhte peut tre brutal comme dans le cas de lHIV d-
truisant les lymphocytes T CD4+. Ailleurs, plus subtil, il repose sur la production de protines vi-
rales altrant ou bloquant les diffrents mcanismes de dfense. Cest le fait des plus gros virus
donc des gros virus ADN (poxvirus, adnovirus, herpsvirus) qui sont suffisamment riches en
gnes pour, outre se faire reproduire par la cellule, en consacrer la production de protines virales
capables de remanier la cellule: il sagit en particulier de protines capables dantagoniser les in-
terfrons et autres cytokines antivirales ou le complment, de perturber la prsentation des antig-
nes viraux, de dtruire ou bloquer lexpression du CMH-I, dinhiber lapoptose, etc. Les protines
virales excutant ces remaniements sont, pour une part, des homologues de protines cellulaires de
notre systme de dfenses antivirales, jouant ainsi le rle de leurres. Elles viennent sans doute du
piratage de gnes cellulaires.
Ainsi on parle de virokines, analogues de cytokines cellulaires, de virorcepteurs, analogues des rcepteurs de viroki-
nes cellulaires.
Il y a donc adaptation rciproque et co-volution des virus et des systmes de dfense de lhte.
A noter une troite analogie entre virus biologiques et virus informatiques, tant en ce qui concerne la physiologie que
le traitement (Philippe Descamps. Du gne loctet : les virus informatiques. Virologie 1998; 2: 393-400). On peut
voir galement des analogies entre le systme immunitaire et lappareil psychique, tous deux en relation avec le monde
extrieur et le monde intrieur pour assurer notre identit et notre survie, analogies qui ont une traduction dans le
vocabulaire: mcanismes de dfense, rsistance, moi/self, ambivalence, surdtermination, chappement/vitement,
latence, ractivation, transfert, suicide (programm). Un rapprochement particulirement tonnant est celui fait par des
psychanalystes comme Andr Green et des immunologistes comme J ean-Claude Ameisen entre la pulsion de mort,
pierre angulaire de la deuxime topique freudienne, et lapoptose ou mort cellulaire programme.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 57/307
1.4 Expression clinique de linfection
Porte dentre des virus
Cours I -illustration 15/19
OCULAIRE RESPIRATOIRE ORALE SEXUELLE
HSV
adnovirus
vaccine
HBV
entrovirus des
conjonctivites
v. rougeole
HVSimi par
projection
[v.de la rage et
agent de la
maladie de
Creutzfeldt-
Jakob par greffe
de corne]
VZV
adnovirus
v. variole
Parvovirus B19
v. de la grippe
v. para-
influenza
v. ourlien
v. de la rougeole
v. RS
v. de la rubole
coronavirus,
arnavirus
rhinovirus
entrovirus
HSV
CMV
EBV
adnovirus
HBV
v. ourlien
entrovirus
rotavirus
calicivirus
astrovirus
HSV
CMV
HBV
papillomavirus
HIV
HTLV
SANGUINE
a
a. Le risque rsiduel dinfection post-transfusionnelle par lHIV, lHBV et lHCV est devenu ngligeable
dans notre pays, suite au dpistage des donneurs par recherche des marqueurs viraux et entretien
mdical : par don, il est tomb 1/ 2 740 000 pour HIV ; 1/470 000 pour HBV (il baisserait encore si les
donneurs et receveurs se faisaient vacciner !) ; 1/8 150 000 pour HCV. Dans certains pays du Tiers
Monde, ce dpistage est dfectueux, voire inexistant, malgr une prvalence considrable de ces infec-
tions.
CUTANEE MERE-ENFANT GREFFE
HBV
CMV
EBV
parvovirus B19
HIV
HTLV
HCV
HSV
HVSimi
poxvirus cutans
HBV
papillomavirus
arbovirus
(arthropode)
v. de la rage
v. de la rubole
HSV
CMV
VZV
HBV
parvovirus B19
HIV
HTLV
CMV
EBV
HBV
HIV
HTLV
HCV
agent de la
maladie de
Creutzfeldt-
Jakob [v. de la
rage et par
greffe de cor-
ne]
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
58/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
ORGANES CIBLE DES INFECTIONS VIRALES
Les virus apparaissent arbitrairement dans lordre o ils sont traits dans le cours et non par ordre
dimportance. Celui-ci varie dailleurs largement selon les circonstances : tat immunitaire,
origine gographique ou sociale des personnes.
DFINITION IL SYSTME NER-
VEUX CENTRAL
(SNC)
a
OROPHA-
RYNX,VOIES RES-
PIRATOIRES
SUPRIEURES
Organe-cible =
organe dont
latteinte au cours
de linfection virale
donne les signes cli-
niques caractristi-
ques de la maladie.
HSV
VZV
CMV
adnovirus
vaccine
entrovirus des
conjonctivites
v. de la rubole
HSV
HVSimi
CMV
JCV
entrovirus
v. ourlien,
v. de la rougeole
v. de la rage,
arbovirus
v. choriomnin-
gite lymphocy-
taire
HIV
HTLV
agent de la
maladie de
Creutzfeldt-
Jakob
HSV
EBV
adnovirus
coxsackievirus
A
rhinovirus
v. de la grippe
virus para-
influenza
v. de la rou-
geole,
v. RS
coronavirus
banaux
PAROTIDES
v. ourlien
VOIES RESPIRA-
TOIRES INF-
RIEURES
TUBE DIGESTIF FOIE PEAU
VZV
CMV
adnovirus
v. de la grippe
v. para-influenza
v. de la rougeole
v. RS
coronavirus du
SARS
rotavirus
adnovirus ent-
riques
astrovirus
calicivirus
coronavirus
entriques (?)
HAV, HBV,
HCV
EBV, CMV,
HSV
v. de la fivre
jaune
v. Marburg et v.
Ebola
HSV
VZV
HHV-6
HHV-8
poxvirus
papillomavirus
v. de la rougeole
v. de la rubole
coxsackie
chovirus
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 59/307
Cours I - illustration 16/19
Diffrentes modalits dinfection (1)
Diffrentes modalits dinfection(2)
ORGANES
GNITAUX
VESSIE EMBRYON/
FTUS
LIGNES
SANGUINES
HSV
papillomavirus
adnovirus type
11 (cystite
hmorragique)
BKV
papillomavirus
HSV
CMV
VZV
v. de la rubole
HIV
[HBV
b
]
EBV
CMV
parvovirus
HTLV
HIV
a. The brain is my second favorite organ (Woody Allen).
b. Linfection nonatale HBV est presque toujours asymptomatique. Cest tardivement quelle donne des
signes, cirrhose et/ou cancer du foie. Cest le principal mcanisme de prennisation de lendmie, justi-
fiant la campagne dradication de lOMS par la vaccination universelle, rencourager dans la franco-
phonie.
Infection localise Infection gnralise
Porte dentre Respiratoire, digestive ou
cutanomuqueuse selon les
cas
Respiratoire, digestive ou
cutanomuqueuse, selon les
cas
Multiplication initiale de
linoculum
Au niveau de la porte
dentre
Au niveau de la porte
dentre
Multiplication secondaire,
dans les organes profonds
avec virmie
Non Oui
Localisation de lorgane
cible
= Porte dentre distance de la porte
dentre
Dure de lincubation Quelques jours Plusieurs semaines
Exemples Grippe, rhume Poliomylite, rubole, hpa-
tite B
Infection symptomatique : 10 % des infections poliovirus ; versus infection
asymptomatique : 90 % des infections poliovirus.
Infection aigu rgressive : grippe, 90 % des hpatites B chez ladulte ; versus infection aigu
suivie dune infection chronique : 5 10 % des hpatites B chez ladulte et environ 100 % des
infections du nouveau-n par ce virus donnent un portage chronique, conduisant une fois sur
trois la cirrhose et/ou au cancer primitif du foie.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
60/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Cours I - illustration 17/19
Linteraction de linfection virale avec les mcanismes de dfense de lorganisme et la constitution
gntique de lhte modle le trajet du virus dans lorganisme et dtermine lexpression clinique
de linfection, cest--dire la maladie. Toute infection ne donne pas de maladie. Nous distingue-
rons les infections aigus et les infections chroniques.
1.4.1 Infections aigus
Dans le domaine des INFECTIONS AIGUS
1. On oppose INFECTIONS LOCALISES et INFECTIONS GNRALISES.
Dans les infections aigus localises, le virus se multiplie au niveau de la porte dentre du
virus dans lorganisme et sy cantonne. Porte dentre et organe cible (= organe dont lin-
fection donne les signes cliniques de la maladie) sont confondus, do une incubation
courte, de lordre de deux jours. Lexemple en est la grippe.
Dans les infections gnralises, aprs infection et multiplication du virus au niveau de la
porte dentre, linfection gagne les organes cibles situs distance, do lexistence dun
trajet par voie sanguine, lymphatique ou neuronale selon les virus, avec une incubation n-
cessairement longue, de lordre de deux semaines, si ce nest plus.
Rappelons que le temps dincubation de la maladie est le temps sparant la contamina-
tion initiale (ou contage) et lapparition des premiers signes cliniques.
Un exemple dinfection aigu gnralise incubation longue : la poliomylite o, aprs
contage respiratoire ou digestif et trajet par voie sanguine linfection, touche les motoneuro-
nes de la corne antrieure de la moelle (polio, en grec, signifie gris).
Certaines maladies incubation longue (pas toutes, malheureusement) laissent le temps une
vaccination efficace pour enrayer le dveloppement de la maladie si cette vaccination inter-
vient assez tt aprs la contamination: cas de la variole, de la rougeole, de lhpatite B, de la
rage, le maximum defficacit tant obtenu par lassociation au vaccin de ladministration
dimmunoglobulines spcifiques (srovaccination).
2. Une autre distinction essentielle oppose infection aigu ASYMPTOMATIQUE et infec-
tion aigu CLINIQUEMENT MANIFESTE. Ainsi, dans linfection poliovirus, on obser-
ve un cas dinfection manifeste avec paralysies pour 100cas dinfection asymptomatique.
Pour la rougeole, cest linverse puisque toutes les infections donnent lruption morbilleuse.
A lextrme, linfection par le virus de la rage est toujours symptomatique et toujours mortel-
le.
Le terrain joue un rle: gravit de linfection herpes simplex chez le nouveau-n ou chez le
nourrisson atteint deczma, gravit gnrale des infections Herpesviridae chez les sujets
Infection aigu suivie dune infection latente vraie, avec possibilit de rcurrence par
ractivation : varicelle, latence dans un ganglion neurosensitif, puis zona.
La phase asymptomatique de linfection HIV, entre la primo-infection aigu et le SIDA
nest pas une phase de latence : multiplication abondante du virus dans les ganglions lymphati-
ques, virmie et contagiosit sexuelle.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 61/307
immunodprims.
Lge intervient, avec, paradoxalement pour certains virus, davantage de formes symptoma-
tiques chez ladulte que chez lenfant : pour les infections poliovirus (paralysies), virus de
lhpatite A (ictre), virus Epstein-Barr (mononuclose infectieuse).
3. RADICATION versus LATENCE. Toujours dans le cadre des infections aigus, cer-
taines voluent non seulement vers la gurison mais, de plus, le virus se trouve limin
de lorganisme. Cest le cas dinfections plus ou moins graves initialement comme la grippe,
les oreillons, les infections poliovirus, la variole, la fivre jaune. Dans dautres cas, au-del
de linfection initiale asymptomatique ou cliniquement manifeste, malgr la gurison clini-
que, sinstalle vie dans lorganisme une infection latente, non seulement asymptomatique
mais sans multiplication virale. Ainsi, aprs la varicelle de lenfance, le virus VZV persiste
dormant dans les refuges que sont les ganglions nerveux sensitifs, linfection pouvant sy
ractiver lge mr en donnant le zona.
1.4.2 Infections chroniques
Au-del de linfection initiale asymptomatique ou cliniquement manifeste, persiste une infection
chronique, plus ou moins symptomatique, mais active, avec risque de transmission dautres
sujets: cest le cas de linfection HIV o, aprs la primo-infection marque par une multiplica-
tion virale intense, persiste une infection bas bruit, partiellement contrle par le systme immu-
nitaire jusqu leffondrement immunitaire final du SIDA marqu par, nouveau, une
multiplication finale intense.
Dans linfection par virus de lhpatite B (HBV), lvolution chez ladulte se fait 9fois sur
10vers la gurison complte, dfinitive. Une fois sur 10 (chez ladulte, mais 9fois sur 10chez le
nouveau-n) persiste une infection plus ou moins intense, plus ou moins symptomatique, plus ou
moins contagieuse, avec terme un risque de complications sous forme dinsuffisance hpatique,
de cirrhose ou de cancer primitif du foie. Chez le nouveau-n contamin par sa mre, lvolution
vers linfection chronique est au contraire quasi constante, du moins en labsence de srovaccina-
tion contre lHBV. Pour le virus de lhpatite C (HCV), lvolution chronique survient dans 70%
80% des cas, avec l aussi risque de cirrhose et de cancer primitif du foie.
1.5 Lutte contre les infections virales
1.5.1 Immunothrapie passive
Cest ladministration titre prventif dimmunoglobulines humaines prpares partir du
plasma de donneurs, et injectes gnralement par voie intra-musculaire.
Donneurs de sang tout-venants pour la prparation dimmunoglobulines ordinaires efficaces
dans la prvention de la rougeole et de lhpatite A.
Des donneurs slectionns fournissent des immunoglobulines spciales visant tel ou tel virus.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
62/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Trois exemples: les immunoglobulines varicelle-zona obtenues grce des donneurs convales-
cents de zona (non disponible en France) ; les immunoglobulines antirabiques provenant de sujets
vaccins contre la rage; les immunoglobulines anti-HBs contre le virus de lhpatite B, obtenues
partir de plasmas riches en anticorps contre ce virus.
La perfusion de CTL spcifiques dun virus donn est une mthode encore exprimentale, tente dans certaines infec-
tions Herpesviridae chez les personnes immunodprimes.
1.5.2 Immunothrapie active
Cest la vaccination
1.5.2.1 Vaccins inactivs ( tus )
Ce sont des prparations de virus dont on a - par traitement physico-chimique (chaleur ou formol
par exemple) - dtruit le pouvoir infectieux sans en altrer le pouvoir immunogne. Ce sont des
antignes inertes, injects par voie intra-musculaire, sous cutane voire intradermique, pour sti-
muler le systme immunitaire et protger lorganisme vis--vis dune infection future ventuelle
par le virus correspondant.
1.5.2.2 Vaccins attnus ( vivants )
Ils visent le mme but, mais ce sont des mutants du virus vis--vis duquel on veut protger lor-
ganisme, mutants non pathognes - du moins pour lhomme aux dfenses normales - et admi-
nistrs sous forme infectante, ventuellement par voie naturelle: exemple des poliovaccins oraux.
Deux contre-indications : les tats daffaiblissement des dfenses antivirales - les tats dimmu-
nodpression notamment - et la grossesse.
1.5.2.3 Trois nouvelles catgories de vaccin
1. les vaccins base de protines recombinantes, cest--dire fabriques par des cellules en
culture ayant incorpor par gnie gntique un gne viral (exemple: le vaccin actuel contre
lhpatite B est de lantigne de surface du virus, produit par des cellules en culture ou dans
dautres cas par des levures) ;
2. les peptides viraux produits par synthse chimique ;
3. la vaccination par inoculation dun gne viral isol sous forme dADN nu, encore exprimen-
tale, semble trs prometteuse. Il peut sagir dun segment dADN viral soit nu (approche
encore exprimentale), soit intgr par transgense dans un vaccin vivant (la vaccination
des renards contre la rage utilise un vaccin antivariolique ayant intgr le gne de la glycopro-
tine denveloppe du virus de la rage).
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 63/307
1.5.3 Chimiothrapie antivirale
Cest lintroduction dans lorganisme de molcules de synthse pour inhiber la multiplication
virale
Elle comporte de grandes difficults thoriques. Elle ne vise pas directement les virus eux-mmes; une fois fabriqus,
les virus sont par eux-mmes mtaboliquement inertes, et leurs constituants ne peuvent tre dtruits sans risque pour
les constituants cellulaires de lhte. La chimiothrapie antivirale vise la fabrique virus, nos cellules, o elle pr-
tend rectifier le mtabolisme, inhiber la dviation mtabolique qui mne la synthse des constituants viraux, sans
altrer le mtabolisme cellulaire normal, sans cytotoxicit. Les antiviraux applicables lorganisme sont
virostatiques et non virucides. Voici des exemples de chimiothrapie.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
64/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1.5.3.1 IDU (Iduviran)
Cest le 1
er
antiviral ; mis au point par William Prusoff cest un nucloside artificiel base modi-
fie, iode. Cest la 5 iodo 2 dsoxyuridine, analogue structural de la 5 mthyl 2 dsoxyuridine
qui est la thymidine, le nucloside caractristique de lADN. LIdU est comme tout nucloside actif
sous la forme triphosphoryle (IdUTP).
Ainsi, lADN se rpliquant en prsence dIdU va incorporer de lIdU la place de la thymidine. Il
en rsulte des erreurs de codage, de sorte que, par voie gnrale, lIdU est, exprimentalement,
aplasiant, tratogne, cancrigne, hpato-toxique, alopciant. Son usage thrapeutique nest pos-
sible que par voie locale dans les conditions trs particulires de la kratoconjonctivite herpti-
que o lADN des cellules cornennes divisions trs espaces incorpore infiniment moins dIdU
que lADN viral rplication rapide.
1.5.3.2 Aciclovir (ACV)
Cest le 1
er
antiviral bien tolr, mis au point par Gertrude Elion; il a pour nom scientifique lacy-
cloguanosine. Dans ce nucloside artificiel, la modification ne porte pas sur la base, la guanine,
mais sur le pentose remplac par une structure acyclique, une chane hydrocarbone linaire, et
donc dpourvue de 3OH (et voir plus loin Cours II illustration II-9 (voir page 64))
LACV est principalement utilis dans la prvention et le traitement des infections herps sim-
plex virus (HSV-1 et -2) et virus de la varicelle et du zona (VZV).
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 65/307
Ce nucloside agit, comme tout nucloside (et comme lIdU), sous la forme de nuclotide triphos-
phate ACV-TP, mais deux phnomnes vont faire de lACV un produit trs peu toxique par voie
gnrale (intraveineuse, ou orale).
1. Dabord le fait que la 1
re
phosphorylation en ACV-MP (monophosphate) nest assure
que par une enzyme virale, la thymidine kinase (TK) de lHSV et du VZV. Cela fait que
lACV nest actif que dans les cellules infectes par ces virus.
2. LACV-TP interagit de faon lective avec une autre enzyme virale, lADN polymrase de
lHSV et du VZV, sans interagir avec aucune des ADN polymrases cellulaires. La produc-
tion dADN viral sera bloque, de deux faons: tantt lADN polymrase virale est bloque
de faon comptitive par lACV-TP agissant comme leurre, tantt lACV-TP est incorpor
dans la chane dADN viral en formation, ce qui bloque la croissance de cet ADN viral car
lACV est un arrt de chane, une bute : cela par manque du radical 3OH ncessaire
laccrochage dun autre nuclotide triphosphate (liaison sucre-phosphate constituant le mon-
tant de lchelle pour la construction de lADN, les paires de base apparies constituant les
barreaux). LACV-TP agit donc comme leurre et comme bute. Do un excellent index de
slectivit (rapport de la dose cytotoxique sur la dose antivirale) de lordre de 1000 10 000.
En termes de spcificit antivirale, datoxicit, lACV na gure dquivalent dans la pharma-
cope antivirale. Tout vient de ce que laction de lACV passe par deux enzymes virales: la
TK virale, enzyme activatrice et lADN polymrase virale, enzyme cible.
Grce sa TK, le virus est assez stupide pour activer lantiviral quon lui prsente! mais il apprend rsister !!
1.5.3.3 Nuclosides anti-HIV
Lazidothymidine (AZT), premier antiviral anti-HIV, est, elle aussi, un nucloside base normale
mais pentose modifi: sans 3OH, remplac par un radical azide N3; cest donc un 2 3 did-
soxynucloside (ddN). L encore, lAZT ncessite, pour tre active, une triphosphorylation en
AZT-TP. La diffrence avec lACV est que les 3 tapes de phosphorylation de lAZT sont toutes
assures par des kinases cellulaires. Heureusement, car lHIV ne code aucune kinase. Cela tant,
sa transcriptase inverse (reverse transcriptase, RT) est spcifiquement sensible lAZT-TP avec,
l encore, deux mcanismes possibles, leurre ou bute: ou bien inhibition de la RT ou bien incor-
poration de lAZT-TP dans lADN proviral avec arrt dlongation de chane
(Peut-tre avez-vous appris que ce mcanisme darrt de chane est la base du squenage de lADN selon la tech-
nique de Sanger ou dye terminator qui utilise prcisment des ddN, dont le ddC, autre nucloside anti-HIV)
Une diffrence avec lACV est que lAZT-TP nest pas aussi bien cible que lACV-TP. LAZT-
TP, contrairement lACV-TP, a une action parallle sur lADN polymrase gamma (mitochon-
driale) de la cellule. Cela, joint au fait que lactivation de lAZT en AZT-TP se passe denzyme
virale, aboutit ce que lAZT soit notablement plus cytotoxique que lACV, avec des effets se-
condaires, indsirables (dommages collatraux ou bavures, selon la terminologie belliqueuse la
mode) : anmie et neuropathies priphriques.
Les autres nuclosides anti-HIV privs de 3OH [la didsoxyinosine (ddI), la didsoxycytidine (ddC), la d4T (didhy-
drodsoxythymidine)] ont les mmes mcanismes daction que lAZT (inhibition de la RT et arrt de chane), avec
galement une cytoxicit notable, en particulier par inhibition de lADN polymrase gamma des mitochondries (index
de slectivit de lordre de 100 et non de 1000 comme cest le cas de lACV). Seule la 3TC (la didsoxythiacytidine),
qui na pas deffet secondaire sur lADN polymrase gamma des mitochondries, est relativement bien tolre.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
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1.5.3.4 Trois autres catgories danti-HIV ont t mises au point
les inhibiteurs non nuclosidiques de la transcriptase inverse ou rtrotranscriptase (INNTI
ou NNRTI en anglais) qui agissent spcifiquement sur lHIV-1 (et non sur lHIV-2).
les inhibiteurs de la protase de lHIV (IP ou PI en anglais) (voir chapitre 4 page 113).
les inhibiteurs de la fusion, fusion de lenveloppe virale la membrane cytoplasmique qui
rsulte de laction de la gp41 virale. Le T20 est un peptide de synthse qui bloque laction de
la gp41.
1.5.4 Mesures dhygine : last but not least
Elles sont cruciales. Ayant fait preuve dune efficacit incontestable, indpendamment des vaccins
et des chimiothrapies antivirales, elles restent la base de la lutte contre les infections virales et
sont dans bien des cas les seules mesures disponibles.
Ce sont la fourniture en eau potable, une alimentation quantitativement et qualitativement suffi-
sante, le lavage des mains, la lutte et la protection contre moustiques, lducation et notamment
lducation sexuelle, les bonnes pratiques de soins et notamment la dsinfection du matriel et
le contrle des dons de sang.
1.6 Points importants
Les virus sont des agents infectieux tout fait particuliers, ni bactries, ni parasites. Ils com-
portent deux ou trois lments structuraux essentiels: le gnome (ADN ou ARN), la capside
(tubulaire ou icosadrique) et, pour certains, lenveloppe. La classification actuelle des virus
repose sur leur structure, la nature du gnome, la conformation de la capside et la prsence ou
absence denveloppe, et de plus en plus sur les donnes de squenage des gnomes viraux.
Les virus ARN sont sujets une grande variabilit gntique.
Les agents des encphalopathies spongiformes sont trs part, ATNC pour agents transmis-
sibles non conventionnels, cest dire ni bactries, ni parasites, ni virus. Non immunognes,
purement protiques semble-t-il selon lhypothse du prion, ils rsistent extraordinaire-
ment aux procdures les plus courantes dinactivation des agents infectieux. Ils sont lorigi-
ne de la maladie de Creuztfeldt-J akob, inluctablement mortelle.
La propagation des virus dans la population diffre grandement selon quils ont ou nont pas
denveloppe, celle-ci tant un point de fragilit du virus.
Les virus ne se multiplient pas mais, passifs, ils se font rpliquer par les cellules humaines
en trois phases essentielles: initiation de linfection, rplication et expression du gnome vi-
ral, relargage de nouveaux virus hors de la cellule. Cela fait intervenir des ARN messagers
viraux et des enzymes virales qui sont des cibles potentielles de chimiothrapie antivirale.
La cible du virus tant la cellule, la rplication virale y a des consquences diverses: selon les
cas, infection lytique, infection tempre ou infection transformante .
Au niveau de lorganisme entier, lexpression clinique est trs diverse selon les cas: infec-
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 67/307
tion inapparente versus infection manifeste, infection aigu vs infection chronique, infection
totalement rgressive vs infection latente vie avec possibilit de rveil (rcurrence) de lin-
fection, infections mortelles vs infections curables spontanment.
Lorganisme dispose de trois lignes de dfenses : successivement les barrires cutano-mu-
queuses, limmunit naturelle, inne, et limmunit acquise, spcifique. Il existe des coopra-
tions troites entre les diffrents acteurs de limmunit. Les virus ont des mcanismes
dchappement ces dfenses.
Le parcours de linfection dans lorganisme oppose, dune part les infections localises in-
cubation courte o porte dentre et organe-cible sont confondus, et dautre part les infec-
tions gnralises incubation longue o lorgane cible est distinct et loin de la porte
dentre du virus dans lorganisme; une longue incubation laisse souvent place une sro-
vaccination post-contamination, capable, si elle est prcoce, dviter latteinte de lorgane-
cible, donc la maladie.
Les thrapeutiques antivirales, pour certaines, reproduisent ou renforcent nos moyens de
dfense contre linfection virale (interfrons, immunoglobulines, vaccins). Pour dautres,
on introduit dans lorganisme les molcules artificielles de la chimiothrapie antivirale, qui
sopposent diverses phases de la rplication virale.
Hygine et vaccinations restent des lments essentiels de la lutte contre les virus.
Structure des virus, cycle viral, physiopathologie des infections virales
68/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 69/307
Chapitre 2
Les Herpesviridae - 1
re
partie
(HSV et VZV)
2.1 Gnralits sur les Herpesviridae
La famille des Herpesviridae comporte prs de 120 herpsvirus. Les 8 herpesvirus strictement hu-
mains sont rpartis dans les 3 sous-familles des Herpesviridae
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
70/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
(voir plus loin, illustration III-2 (voir page 97)) :
Alphaherpesvirinae
le virus de lherps proprement dit, ou herpes simplex virus (HSV), de type 1 ou de type 2
(HSV-1; HSV-2).
le virus de la varicelle et du zona ou herpesvirus varicell(VZV)
Betaherpesvirinae
le cytomgalovirus (CMV)
6
e
et 7
e
herpsvirus humains (HHV-6, HHV-7)
Gammaherpesvirinae
le virus EPSTEIN-BARR ou virus E-B (EBV)
le 8
e
herpsvirus humain (HHV-8)
Ces herpsvirus ont en commun certains caractres. Ce sont des virus ADN de poids molcu-
laire lev (150 230.000 paires de bases), codant donc un grand nombre de protines (une cen-
taine). Ils ont une capside icosadrique faite sur le mme modle (162capsomres, titre
indicatif). Ils ont un pplos ou enveloppe, driv de la membrane nuclaire.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 71/307
En effet, lencapsidation de lADN viral lintrieur de la capside se fait dans le noyau, puis le
virus quitte le noyau par bourgeonnement de la membrane nuclaire; lacquisition de lenveloppe
dfinitive se fait par bourgeonnement de la membrane de lappareil de Golgi, modifie par lad-
jonction de glycoprotines virales. LECP des herpsvirus, quand il existe (HSV, VZV, CMV),
consiste donc principalement en modifications du noyau, avec inclusion nuclaire.
Au niveau molculaire la rplication des Herpesviridae comporte trois phases : trs prcoce
avec synthse de protines activatrices; prcoce avec synthse de protines enzymatiques dont
une ADN polymrase virale; et tardive avec synthse des composants protiques de la capside
et des glycoprotines denveloppes. La rplication de lADN viral spare les phases prcoces et
tardives.
La rplication de lADN viral, trs diffrent de lADN cellulaire, ne peut tre assure par les enzy-
mes cellulaires: elle exige la synthse pralable, en phase prcoce, de lADN polymrase virale.
Celle-ci est la cible des antiviraux actuellement disponibles. Les HSV et le VZV ont de plus une
thymidine kinase virale, le CMV et lHHV-6 ont une phosphotransfrase, ces enzymes phospho-
rylant les nuclosides naturels mais aussi les nuclosides synthtiques antiviraux, phosphorylation
indispensable leur activit.
Enfin, le pplos est trs fragile. Do une transmission inter-humaine directe de linfection, nces-
sitant des contacts troits, intimes.
Certains de ces virus ont un pouvoir cancrigne, dans des conditions particulires (EBV et
HHV-8)
Du point de vue tymologique, herps vient du grec et implique lide de ramper comme un ser-
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
72/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
pent (illustration II-3A). De fait, aprs primo-infection, ces virus herptiques restent tapis dans
lorganisme sous forme dormante, ralisant une infection latente qui les soustrait au sys-
tme immunitaire comme aux antiviraux (camouflage). Ainsi, ces virus quon ne peut radiquer
deviennent, aprs la primo-infection, des constituants de notre organisme. Cest une faon de pal-
lier leur fragilit dans le milieu extrieur. Linfection latente peut se ractiver, donnant alors une
rinfection endogne, ce quon appelle une rcurrence. Les rcurrences sont loccasion dune
excrtion virale, souvent asymptomatique, assurant linfection de nouveaux htes.
Quant au sige de linfection latente, pour les HSV-1 et 2 et le VZV dermoneurotropes , il
sagit du ou de ganglion(s) sensitif(s) du territoire de la primo-infection. Pour les autres
Herpesviridae humains qualifiables de leucotropes, il sagit des cellules immunes.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 73/307
Les herpsvirus se propageant surtout directement de cellule cellule, cellules NK et CTL ont le
rle principal dans les dfenses antivirales
Ces gros virus grand gnome, riches en protines immunognes, seraient des cibles faciles pour
nos dfenses antivirales, sils ne consacraient nombre de leurs gnes contrer nos dfenses. Soit
passivement par camouflage grce aux gnes de latence. Soit activement par sabotage de la pr-
sentation des antignes par le CMH, de la lyse des cellules infectes par les CTL, de laction des
Interfrons etc, cela par des leurres =homologues de protines cellulaires modifies produites
grce des gnes pris aux cellules par piraterie gnique.
Ainsi au cours dune co-volution sur des millions dannes, homme et Herpesviridae ont trouv
un modus vivendi leur vitant la destruction mutuelle, bon nombre dinfections tant asymptoma-
tiques ou bnignes. Cependant cette situation est remise en question en cas dimmunodpres-
sion, qui majore les manifestations cliniques de linfection par Herpesviridae. Ainsi, les
herpsvirus sont des tres craintifs et sournois; limmunodpression les rend mchants.
Un site trs utile: www.ihmf.org
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
74/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 75/307
2.2 Les deux virus de lherps, ou herpes
simplex virus type 1 et type 2 (HSV-1, HSV2)
Ce sont des virus dermo-neurotropes donnant aprs la primo-infection une infection latente dans
le ganglion sensitif du territoire de la primo-infection. Cest le ganglion de Gasser aprs primo-in-
fection orale par HSV-1, les ganglions sacrs aprs primo-infection gnitale par HSV-2. Cela as-
sure la persistance du virus dans la population. A partir de ces sites dinfection latente peuvent
survenir des ractivations conduisant des pousses dherps rcurrent (ou rcidivant) ou des ex-
crtions asymptomatiques de virus dans la salive ou les scrtions gnitales. Cela assure la diss-
mination de linfection aux personnes rceptives. A ct des manifestations cutano-muqueuses
banales, localises, de lherps oral et de lherps gnital, on observe dans certaines conditions des
infections mortelles o lusage de laciclovir a un intrt vital.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
76/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
2.2.1 LHSV-1 et lHSV-2 se partagent le corps
LHSV-1 responsable de lherps oral, rgne au-dessus de la ceinture, avec infection latente du
ganglion de Gasser, lHSV-2 responsable de lherps gnital, au-dessous de la ceinture, avec in-
fection latente des ganglions sacrs. Cependant les contacts oro-gnitaux peuvent remettre en
question ce partage du territoire.
Il existe une immunit croise mais partielle seulement entre HSV-1 et HSV-2.
Ainsi, une primo-infection orale et mme des rinfections endognes avec lHSV1, nempchent
pas de sinfecter ultrieurement avec lHSV-2 au niveau gnital.
Nous examinerons donc ce que donnent habituellement chez lhomme, la primo-infection et les
rinfections endognes par lHSV-1, puis la primo-infection et les rinfections endognes par
lHSV-2. Nous verrons ensuite quatre infections inhabituelles, graves, qui font intervenir tantt
lHSV-1 et tantt lHSV-2.
2.2.2 Manifestations habituelles des infections HSV-1
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 77/307
Revoir illustration II-4 (voir page 74)
Selon les populations, 50 % prs de 100 % des adultes sont infects par HSV-1.
1. Cest vers 6mois un an, aprs la perte des anticorps maternels, que la plupart des personnes
sinfectent par HSV-1 partir de lexcrtion salivaire dune personne de lentourage, enfant
ou adulte. Des tudes srologiques ont prouv que le plus souvent cette PRIMO-INFECTION
orale est inapparente. Ce nest que chez 10 15 % des personnes quelle donne des mani-
festations cliniques: une gingivo-stomatite faite de vsicules multiples sur la muqueuse buc-
cale et sur les lvres.
Sur les muqueuses, les vsicules sont fragiles et elles sulcrent rapidement. Ces ulcrations
sont douloureuses et gnent considrablement lalimentation, de sorte quon est parfois ame-
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
78/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
n nourrir ces jeunes enfants par perfusion intra-veineuse, ou par sonde nasopharynge, le
temps que les lsions gurissent. Il sy associe habituellement de la fivre et des adnopathies
cervicales, parfois une virmie.
La gingivo-stomatite herptique saccompagne parfois dun panaris herptique des doigts
ou des orteils, par auto-inoculation (succion). Un panaris herptique sobserve parfois chez
les dentistes; lincision chirurgicale est contre-indique: il ny a pas de pus.
Cette primo-infection suscite une rponse immunitaire locale et gnrale avec lapparition
danticorps (sroconversion).
2. Aprs gurison de cette primo-infection, nombre de personnes ont des RCURRENCES,
dans le mme territoire que la primo-infection, cela malgr la prsence danticorps. Lin-
fection est plus limite que durant la primo-infection: bouquet de vsicules la jonction de
la peau et de la muqueuse buccale, sur le bord des lvres: cest lherps labial rcidivant. Il
existe galement des rcurrences inapparentes cliniquement, se limitant des excrtions sa-
livaires asymptomatiques dHSV-1. Herps labial rcidivant et excrtion salivaire asymp-
tomatique permettent la diffusion de linfection aux individus plus jeunes et rceptifs.
3. Lexplication de ces phnomnes est la suivante: entre la primo-infection et la ou les rcur-
rences, le virus reste LATENT dans lorganisme, prcisment dans le corps cellulaire des
neurones sensitifs priphriques innervant le territoire de la primo-infection (II-6). Ces
corps cellulaires forment un renflement, un ganglion sensitif sur la racine postrieure des
nerfs. Pour la cavit orale, le nerf sensitif est le trijumeau dont la racine postrieure porte le
ganglion de GASSER. Le virus y est latent, sous forme dADN viral, sans particules virales
visibles en microscopie lectronique.
Chez certaines personnes, ce virus latent est soudain rpliqu dans le corps cellulaire des neu-
rones sensitifs, (ractivation) et gagne par voie neuronale centrifuge la jonction cutano-
muqueuse, donnant l les vsicules caractristiques de la rcurrence dherps labial qui est
donc une rinfection endogne. Le virus est prsent dans les vsicules mais entre les rcur-
rences, il nest pas retrouv dans la peau, ni dans les muqueuses.
Paradoxalement, la ractivation de linfection dans le ganglion de Gasser ne dtruit pas le gan-
glion, alors que le virus est trs neurotrope.
Le terme virus de sortie souvent employ par les cliniciens est trs appropri.
Quest-ce qui induit cette multiplication virale intermittente, cette ractivation? Ce sont des
stimulus divers qui, chez certaines personnes, sont la fivre, quelle quen soit la cause, mais
plus particulirement certaines infections bactriennes, comme la mningite crbro-spinale,
la pneumonie pneumocoque, la leptospirose ictro-hmorragique; chez dautres personnes
cest lapproche des rgles ou lexposition aux rayonnements ultraviolets, le sjour en mon-
tagne, les contrarits pour lherps labial.
A dfaut de connatre le mcanisme intime des rcurrences dherps labial, on peut seulement constater que la
latence sige dans une cellule vraiment trs particulire, le neurone sensitif, en relation tant avec le monde ext-
rieur et ses agressions physiques quavec le monde intrieur et ses affects, entre soma et psych. Do le carac-
tre psychosomatique de lherps labial rcurrent.
En tout cas, la plupart des personnes bien portantes ont de temps en temps de lHSV-1
sur les lvres, dans la salive et cest essentiellement par la salive des personnes de leur
entourage que les enfants trs tt sinfectent avec lHSV-1.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 79/307
2.2.3 Herpes simplex virus type 2 (HSV-2)
LHSV-2 est prsent dans les scrtions gnitales et cest surtout lors des premiers rapports sexuels
que survient la primo-infection. Primo-infection asymptomatique dans 2/3 des cas, manifeste dans
lautre tiers sous forme de vsicules sur le gland et le prpuce, ou sur la vulve et le vagin, voire le
col utrin, donnant une vulvo-vaginite avec cervicite. Ce sont des vsicules ulcres, douloureu-
ses. Cette primo-infection HSV-2 saccompagne souvent de fivre, dadnopathies inguinales,
parfois dune rtention durine, et mme de mningite liquide clair. La frquence de lherps g-
nital augmente invitablement avec le nombre de partenaires sexuels, comme pour toute MST. La
femme est plus susceptible que lhomme la contamination, en raison dune plus grande surface
de la muqueuse gnitale.
Les rcurrences qui frappent certaines personnes sont moins intenses que la primo-infection, mais
cependant douloureuses. LHSV-2 reste latent dans les ganglions sacrs. Cest de l que viennent
les pousses dherps gnital rcidivant mais aussi une excrtion asymptomatique intermittente
de virus rendant la personne potentiellement contagieuse, mme en labsence de lsions. On parle
alors de contamination innocente .
noter que lherps gnital rcidivant facilite la contamination sexuelle par HIV, comme toute af-
fection gnitale ulcrative. Le risque dacquisition de lHIV sen trouve doubl.
Lherps gnital de la petite fille peut tre d un abus sexuel, mais aussi une contamination
par le linge de toilette dun parent atteint dherps gnital ou labial, ce qui impose vigilance et
discernement !
2.2.4 Infections graves
A ct de ces manifestations gnantes, les HSV-1 et HSV-2 peuvent donner quatre infections gra-
ves.
2.2.4.1 Parfois la primo-infection HSV-1 touche lil
Il peut sagir simplement dune conjonctivite, se traduisant par une congestion de la conjonctive
oculaire et palpbrale. Lil est rouge, avec impression de douleur ou de sable dans lil . Il
arrive que linfection dpasse la conjonctive pour toucher la corne, ce qui donne alors une kra-
tite. Une kratite avec ulcre dendritique (=dentel en feuille de fougre) est pathognomonique de
lherps oculaire. Cest une infection grave, car les lsions de la corne peuvent laisser une cicatri-
ce fibreuse opaque, appele taie. Si elle se trouve face la pupille, elle rend aveugle. Cette taie peut
se constituer lors dune kratite de primo-infection ou plus souvent lors de rcurrences. Il arrive
que le passage de la conjonctivite la kratite soit d lapplication locale de corticodes.
Cest une lourde erreur que de donner un collyre aux corticodes une personne qui a un il
rouge pour calmer la douleur, sans avoir auparavant limin une conjonctivite herptique. On ris-
que en effet une perforation de la corne.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
80/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
2.2.4.2 Lherps du nouveau-n est une infection encore plus grave
Lincidence de lherps nonatal est estime de lordre de 1 5 pour 10000 grossesses, comme
pour la rubole congnitale.
Linfection du nouveau-n vient presque toujours dun herps gnital maternel avec contamina-
tion de lenfant au passage dans la filire gnitale maternelle infecte. Dans les 2/3 des cas, lher-
ps maternel est asymptomatique, rvl par lherps du nouveau-n. Cette explication de lherps
du nouveau-n par un herps gnital maternel vient de la proportion leve (4/5) des herps du nou-
veau-n HSV-2, et aussi du sige habituel des lsions cutanes au niveau de la prsentation.
En fait, il existe pour la mre 4 situations possibles :
Situation I : la situation la plus grave pour lenfant tant heureusement la plus rare, cest lherps
gnital initial au moment du travail ou dans le mois prcdant laccouchement. Le risque est
maximal pour lenfant car cest l que les lsions dherps gnital peuvent tre les plus importan-
tes, avec une excrtion virale titre lev et durant en moyenne 3semaines, cela sans anticorps
maternels transmis. Le risque est de 50, voire 75%.
Situation II : cest un herps gnital rcurrent durant le travail ou dans la semaine prcdant
laccouchement. Cest une situation plus frquente que la prcdente mais moins dangereuse pour
lenfant (risque 2%) du fait de lsions moins importantes, avec excrtion virale plus limite en
titre et en dure (3 jours en moyenne) et prsence danticorps maternels transmis.
La situation III, simple histoire antrieure de pousse dherps gnital (chez la mre elle-mme
ou son partenaire) sans lsion gnitale lexamen, comporte un risque pour lenfant estim 1/
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 81/307
1000.
La situation IV est la situation des femmes tout-venantes, sans lsions et sans histoire passe
dherps gnital, ni chez elles, ni chez leur partenaire. Le risque pour lenfant est le plus rduit soit
1/10000 (=valeur basse de la fourchette) mais puisquil concerne la population gnrale, il est pa-
radoxalement lorigine des 2/3 des herps du nouveau-n.
Contrairement ladulte, le nouveau-n ne fait pas dherps asymptomatique. Les formes b-
nignes (10%) sont les formes strictement localises et qui le restent, cutanes (vsicules en bou-
quet), buccales ou oculaires (conjonctivite). Les formes graves dominent et sont de 2types: 1)
linfection dissmine tous les organes, notamment hpatite ncrosante grave avec ictre, purpu-
ra, hmorragies muqueuses; pneumonie avec dtresse respiratoire; mningo-encphalite avec
trouble de la conscience, hypotonie, crises convulsives; 2) linfection localise au systme ner-
veux central est galement grave.
Au total, la mortalit sans traitement est de 50 % avec des squelles neuropsychiques graves
chez 50 % des survivants.
Le traitement de lherps nonatal dclar ou mme simplement souponn est ladministration
en urgence par voie i.v. dACV forte dose durant 2 3semaines, suivie dun traitement de con-
solidation par ACV par voie orale pour viter les rcurrences au niveau crbral.
Les moyens de prvention sont au nombre de quatre:
1. lducation sexuelle avec, durant le dernier trimestre, stabilit du couple et usage du prser-
vatif,
2. la dsinfection de la filire gnitale par un dsinfectant comme la povidone iode (Btadine)
ou la Chlorexidine au moment du travail,
3. la csarienne,
4. lACV la mre et lenfant en cas de risque majeur. Ces moyens 1 et 2 sont sans effets se-
condaires contrairement aux 2derniers: risque de lanesthsie pour la csarienne (qui aug-
mente par 3 la mortalit maternelle par rapport laccouchement par voie basse) et pour
lenfant, risque thorique (faible) long terme danomalies tardives par effet de lACV sur
lADN de lenfant.
Le bon usage de ces 4moyens de prvention demande du discernement, repose sur une estimation
du rapport cot/bnfice et est reprsent dans le tableau joint (illustration II-7). Les modalits
dapplication, qui caractrisent ce quest une dmarche mdicale seront revues en DCEM 2 ou 3.
Il existe des herps du nouveau-n par HSV-1 qui ne sont pas dorigine maternelle gnitale mais
qui proviennent dune autre personne de lentourage: pre ou personnel soignant excrteur salivai-
re de virus. Donc une personne souffrant dune rcurrence dherps labial ne doit pas embras-
ser un nouveau-n.
2.2.4.3 Troisime forme redoutable dinfection herptique : lencphalite
herptique de ladulte
Elle touche surtout ladulte avec mme un pic de frquence vers 40-50ans. Il en survient environ
cent cas par an en France. Diffrente de lencphalite qui fait partie du tableau de lherps nonatal,
cest une maladie tout fait part, toujours due lHSV-1. Cest dailleurs la plus frquente des
encphalites virales, en France. Cest une encphalite par multiplication intracrbrale du virus
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
82/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
au niveau des neurones. Elle est gnralement localise au lobe temporal, souvent dun seul
ct, sous forme dun foyer de ncrose hmorragique. Do le nom dencphalite aigu ncrosante
herptique (EANH). Elle dbute brutalement par un syndrome infectieux, de la fivre, et des signes
encphalitiques.
Selon les cas, ce sont des crises convulsives ou des manifestations pileptiques sensorielles (hallu-
cinations visuelles ou auditives), des troubles du comportement, des paralysies, une aphasie, le plus
souvent accompagns de troubles de la conscience qui vont aller en saggravant jusquau coma.
Prcocement, llectroencphalogramme est presque toujours perturb. Les signes de localisation
temporaux unilatraux la tomodensitomtrie (TDM) sont plus tardifs (cependant, lIRM se po-
sitive avant la TDM).
Ainsi, en pratique, ds quon suspecte cliniquement une encphalite herptique, on met en place
durgence deux mesures simultanes:
1. le traitement par ACV i.v., sans attendre les rsultats de
2. la recherche dADN viral dans le LCR par PCR (parfois ngative au tout dbut).
Car seul un traitement prcoce, entrepris ds la suspicion clinique, offre une chance de survie
sans squelle. Tout retard la perfusion i.v. dACV constitue une perte de chance.
Ainsi, un virus avec lequel nous vivons habituellement en bonne entente peut, exceptionnellement
(50 100cas par an en France), donner une maladie redoutable. On ne sait pas actuellement ce qui
en dtermine la survenue exceptionnelle. Elle frappe des personnes saines. Tantt cest une primo-
infection, tantt et plus souvent, cest une rinfection. On suppose alors une rcurrence
rebours, du ganglion de Gasser vers le lobe temporal.
2.2.4.4 Lherps chez lhte aux dfenses antivirales affaiblies
(revoir illustration II-4 (voir page 74) et illustration II-5 (voir page 75))
1. Chez la personne immunodprime, greffe de rein ou malade du SIDA par exemple, il est
frquent et banal dobserver une limination orale ou gnitale dHSV-1 ou 2. Parfois, ces in-
fections se traduisent par les lsions extensives chroniques et dlabrantes de lherps cuta-
no-muqueux progressif : ulcrations buccales ou gnitales, creusantes et persistantes,
trachite, sophagite douloureuse; chez certaines personnes, une dissmination de linfec-
tion aboutit une hpatite, une pneumonie, une encphalite
2. Chez une personne la peau abrase par une brlure ou par une dermatose suintante, un ec-
zma par exemple, linoculation dun HSV peut aboutir des lsions qui ont la dimension de
la dermatose. Tel est leczma herptis, grave et parfois mortel chez le nourrisson, et justi-
ciable dun traitement durgence lAciclovir i.v. Un nourrisson eczmateux ne doit pas
tre embrass par une personne souffrant dherps labial.
2.2.5 Diagnostic au laboratoire de virologie des infections
HSV-1 et HSV-2
Cf annexe E page 277.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 83/307
Quatre points sont considrer pour tout diagnostic virologique mdical : les indications, les
prlvements, les et linterprtation des rsultats
2.2.5.1 Les indications : faire ou ne pas faire un examen virologique ?
Lherps labial rcidivant se passe de diagnostic au laboratoire, car la clinique suffit devant les
lsions vsiculeuses et ulcres de la jonction cutano-muqueuse.
En revanche, lherps gnital de lhomme ou de la femme exige confirmation virologique car
cest un diagnostic aux consquences importantes pour lavenir de la personne, homme ou femme:
elle est potentiellement contagieuse pour le partenaire, mme en dehors de rcurrence manifeste,
de par une excrtion asymptomatique. De plus, la clinique est trompeuse. Enfin, reconnatre le type
1 au cours dune primo-infection gnitale permet de prdire quavec ce type les rcurrences seront
rares: seul le type 2 donne un herps gnital hautement rcidivant.
Il va de soi que les manifestations graves de lherps exigent chaque fois que possible, confirma-
tion virologique.
Il en va de mme quand la personne est incluse dans un protocole dessai thrapeutique.
Enfin, le diagnostic virologique est utile en cas de rsistance au traitement antiviral.
Les moyens du diagnostic virologique sont, dune faon gnrale, classs en deux catgories: dia-
gnostic direct par dtection du virus ou de ses composants dans des prlvements virologiques;
diagnostic indirect la recherche dune rponse immune (humorale, anticorps) dans le srum. Mais
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
84/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
cela est moduler en fonction de chaque virus.
Ici, seul le diagnostic direct est significatif car il est gnralement facile et rapide alors que la
rponse immunitaire humorale ne se dveloppe quaprs une ou deux semaines dvolution et ne
se modifie gure par la suite lors des rcurrences. Oublions donc le srodiagnostic, mme sil est
souvent demand par des prescripteurs peu instruits de ce quest lherps.
2.2.5.2 Prlvement
Ainsi, les prlvements visent dtecter le virus. Ils porteront chaque fois que possible sur les
lsions : liquide de vsicule prlev la seringue, couvillonnage nergique du plancher de la v-
sicule ou de lulcre avec expression de lcouvillon dans un tube de milieu de transport. On fait
un prlvement de liquide cphalorachidien en cas dencphalite herptique ou dherps diss-
min du nouveau-n. Il est important de noter que les prlvements sur lsion doivent intervenir
avant toute application de dsinfectant et sur des lsions fraches ; au stade de crote, cest trop
tard.
Les prlvements pour recherche dune excrtion gnitale asymptomatique chez une femme en-
ceinte antcdents dherps gnital pour elle-mme ou son partenaire mritent quon sy arrte
(situation III du paragraphe 4.2.). Cest une recherche faire une seule fois, lors du travail
(avant toute dsinfection la Btadine ou la Chlorhexidine), par couvillonnage aprs avoir li-
min, laide dun couvillon quon jette, le bouchon muqueux du canal cervical, un deuxime
couvillon est introduit sur 1 ou 2cm dans le canal cervical, tourn dans ce canal puis pass la
surface du col utrin, puis exprim dans un tube de milieu de transport. Un troisime couvillon
est pass sur les faces interne et externe des petites lvres pour tre exprim dans le mme tube que
lcouvillon prcdent.
2.2.5.3 Technique de dtection
Les techniques de dtection du virus dans les prlvements sont, dune faon gnrale, au nom-
bre de trois: lisolement du virus en culture de cellule, la dtection dantigne viral, la dtection
de squences gnomiques virales par PCR.
1. Lisolement en culture de cellules est la technique de rfrence car HSV-1 et 2 se multi-
plient trs bien, en cultures couramment utilises au laboratoire (cellules VERO, fibroblastes
humains, cellules KB). Ces virus donnent rapidement (en 24h 4jours) un effet cytopathi-
que (ECP) trs vocateur : cellules rondes en foyer (grappe de raisin). Le diagnostic de type
1 ou 2 est confirm en immunofluorescence (IF) ou en immuno-peroxydase (IP) avec des an-
ticorps monoclonaux spcifiques de type 1 ou 2. Cette technique, classique et sensible, sap-
plique aussi bien la recherche dune excrtion gnitale asymptomatique quaux lsions
suspectes dherps.
2. La recherche dantigne peut se faire de deux faons: 1) sur un frottis des lsions apportant
des cellules infectes o lon va rechercher lantigne par IF ou IP (comme pour les cultures
infectes) cest limmunocytodiagnostic ; 2) par ELISA sur du liquide charg dantigne
comme le liquide de vsicule ou le produit dexpression de lcouvillonnage de lsions, ou
encore le LCR en cas de mningo-encphalite. Cette recherche dantigne nest pas aussi sen-
sible, ni spcifique, que lisolement en culture en cas dherps oral ou gnital. Son avantage
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 85/307
est la rapidit de rponse. Elle ne sapplique pas la recherche dune excrtion asympto-
matique car elle y serait faussement ngative.
3. La recherche dADN par PCR sur le LCR : cest le meilleur moyen de diagnostic rapide
dune mningo-encphalite herptique. Cette technique est trs sensible, positive dans plus
de 90% des encphalites herptiques et trs spcifique. En cas de ngativit, lexamen doit
tre rpt sur un deuxime prlvement mme si la personne est traite par aciclovir. En cas
de suspicion dherpes nonatal, la PCR est effectue non seulement sur le LCR mais aussi sur
le srum.
Retenez que, dune faon gnrale, le laboratoire doit choisir entre diverses techniques, choix
principalement dict par les renseignements cliniques, sans lesquels il ne sait quoi faire.
2.2.5.4 Interprtation
La dcouverte du virus au niveau des lsions est un argument trs fort en faveur de leur origine
herptique. En revanche, une excrtion de virus dans la salive au cours dun syndrome encpha-
litique fbrile nest pas le signe certain de son origine herptique: ce peut tre un virus de sortie
au cours dune encphalite dautre nature!
Retenez limportance, l encore, des renseignements cliniques, sans lesquels le laboratoire ne
peut interprter lexamen quil a pu faire.
2.2.6 Traitement
Cest essentiellement lacycloguanosine appele aciclovir (ACV ou Zovirax). LACV est admi-
nistr selon les cas par perfusion i.v. (formes graves), par la bouche (pour les affections moins s-
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
86/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
vres) ou en application oculaire dans la krato-conjonctivite HSV-1. On a vu que par application
locale, on pouvait utiliser des nuclosides antiviraux plus ou moins cytotoxiques comme lIdU. Il
en va de mme de la trifluorothymidine ou TFT.
Une indication de lACV par voie orale est lherps gnital hautement rcidivant o la prise conti-
nue de 0,6 0,8 g/j permet de prvenir provisoirement les pousses. LACV, en tant quinhibiteur
de la rplication de lADN viral, na pas daction sur les virus latents dans les ganglions sensi-
tifs, puisque leur ADN ne se rplique pas. Ainsi, lACV nradique pas linfection, de sorte que
les pousses sont simplement suspendues et reviennent larrt du traitement. Le valaciclovir
(Zlitrex), converti rapidement en ACV, a une biodisponibilit orale 5 fois suprieure celle de
ACV, permettant un traitement prventif des rcurrences de lherps gnital avec seulement deux,
voire une, prise quotidienne par la bouche (p.o. =per os).
Un driv de pyrophosphate, lacide phosphonoformique ou foscarnet (Foscavir), est utilis
quand le virus est rsistant lACV. Ce peut tre le cas lorsque sont traites les lsions herpti-
ques charge virale trs leve des personnes immunodprimes.
Il ny a malheureusement pas de vaccin actuellement valid contre lherps, maladie essen-
tiellement locale. Dune faon gnrale, cest vis--vis des infections virales gnralises que nous
avons des vaccins trs performants (poliomylite, rougeole, rubole, oreillons, variole, rage, fivre
jaune; quant au vaccin contre la grippe, fort utile, il nest pas aussi efficace que les prcdents)
2.2.7 Points importants
La primo-infection HSV-1 et HSV-2 est habituellement asymptomatique.
Il peut survenir des excrtions asymptomatiques de virus dans la salive ou les scrtions g-
nitales, assurant la dissmination de linfection aux personnes rceptives, aux jeunes enfants
par relation de maternage, aux adultes par relation sexuelle. Cest le portage asymptomati-
que qui propage linfection HSV, par des contaminations souvent innocentes .
Cest une faute grave (risque de perforation cornenne) de mettre un collyre aux corticodes
sur un il rouge et douloureux sans avoir limin une conjonctivite herptique.
Il faut apprendre suspecter cliniquement une encphalite herptique, car seul un traite-
ment trs prcoce assure une survie sans squelle.
Dune faon gnrale, devant toute suspicion dinfection par HSV potentiellement mortelle,
on met durgence sous ACV i.v., sans attendre le rsultat de la recherche directe du virus
(par PCR dans le LCR pour encphalite par exemple). Cogner dabord, causer ensuite!
La prvention de lherps nonatal repose sur la prvention de lherps gnital de la mre et
du partenaire avant la naissance, grce lducation sexuelle.
Un nourrisson eczmateux ne doit pas tre embrass par une personne souffrant dherps la-
bial.
Lherps gnital de lhomme et de la femme exige une confirmation virologique par culture
ou immunocytodiagnostic des prlvements de lsions suspectes.
Le traitement des infections herptiques repose sur ladministration daciclovir (i.v., p.o., ap-
plication oculaire) ou de valaciclovir (p.o.). Toutefois, il ne permet pas dradiquer linfec-
tion herptique latente du ganglion sensitif. Ainsi, il ny a pas de traitement curatif mais
seulement suspensif de lherps rcidivant labial ou gnital.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 87/307
2.3 Virus de la varicelle et du zona (VZV)
Le virus de la varicelle et du zona (VZV) est un Herpesviridae dermo-neurotrope, la varicelle
tant la primo-infection et le zona une rcurrence, gnralement unique.
La varicelle est une infection gnralise point de dpart respiratoire. Elle peut tre mortelle
chez la personne immunodprime, justifiant le recours laciclovir.
Le zona est une rcurrence localisation radiculaire. Il peut se compliquer chez la personne ge
de douleurs rsiduelles trs intenses.
Cest le mme virus qui dtermine ces deux maladies. La varicelle est la primo-infection de len-
fant. Le zona est la rcurrence de cette infection et touche habituellement ladulte.
Ce virus de la famille des Herpesviridae a quelques particularits.
Il est strictement humain. Au laboratoire, il se multiplie dans les cultures de cellules humaines (fi-
broblastes humains) ou des cellules de singe (cellules Vero). Il donne un effet cytopathique ana-
logue celui des HSV-1 et 2, mais lent, trs difficile transmettre aux cultures de cellules.
Lisolement du virus par inoculation de cultures cellulaires est donc alatoire. Cela contraste avec
le caractre trs contagieux de la varicelle chez lhomme. Une personne qui na jamais eu la va-
ricelle est presque sre de contracter cette maladie en approchant un malade.
2.3.1 Varicelle
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
88/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
(voir plus loin illustration III-1 (voir page 96)
1. Cest donc la primo-infection. Elle est presque toujours apparente et peu y chappent, la
sroprvalence approchant 100 % chez ladulte. Le virus est inhal. Il se multiplie la por-
te dentre dans larbre respiratoire puis se dissmine dans lorganisme par virmie. Ce che-
minement du virus se fait sans manifestations cliniques, do une priode dincubation de 12
20 jours (en moyenne de 15jours), silencieuse, jusqu lapparition de lruption varicelleu-
se. La varicelle est ainsi une virose gnralise ; donc elle a une incubation longue.
2. Pratiquement, il ny a pas de phase dinvasion et lruption dans la moiti des cas apparat en
mme temps quune fivre modre 38-38,5C. Cette ruption comporte un exanthme et
un nanthme. Lexanthme apparat sur le tronc sous la chemise. Il parcourt les stades
suivants: macules, papules, vsicules. Il ny a pas de pustules. Les lments ne vont donc pas
au-del du stade de vsicules, vsicules pleines dun liquide clair, transparent en goutte de
rose. Ultrieurement la vsicule saplatit, se dessche, apparat une crote, et la gurison
se fait sans cicatrice, moins que lenfant ne se soit gratt, ce qui nest pas rare.
Fait essentiel, il y a plusieurs pousses, 2 3, de sorte qu un moment donn on observe
dans un territoire la juxtaposition dlments dge diffrent : des macules mlanges des
papules, et des vsicules. Ce signe permet le diagnostic de la varicelle au premier coup
dil par toute mre de famille exprimente.
La varicelle est une maladie bnigne. Les complications sont rares. Lencphalite de la vari-
celle est exceptionnelle (2/10000). Cest une encphalite par dmylinisation priveineuse
et non pas par multiplication intracrbrale de virus. Trs souvent elle est localise au cerve-
let, ralisant une ataxie crbelleuse aigu, cest--dire des troubles de lquilibre. Cette
ataxie rgresse sans squelles. Elle na donc pas la gravit de lencphalite aigu ncrosante
herptique.
Lencphalite de la varicelle est une encphalite post-ruptive apparaissant en moyenne 5jours aprs lexanth-
me. Plus grave mais exceptionnel : le syndrome de Reye (encphalopathie dmateuse +dgnrescence grais-
seuse aigu du foie) qui survient parfois au dcours dune varicelle comme dune grippe B. La prise daspirine
joue un rle dans lapparition de ce syndrome.
3. Les formes graves de la varicelle se voient dans trois circonstances:
Chez le nouveau-n
On peut observer une varicelle no-natale grave la suite dun fcheux concours de
circonstances: il faut 1) une mre parvenue lge adulte sans avoir fait la varicelle,
de sorte que son enfant ne reoit pas danticorps maternels anti-VZV ; 2) que cet en-
fant soit contamin peu avant sa naissance, par une varicelle de sa mre. Cette vari-
celle de nouveau-n est mortelle dans 20 30% des cas par dissmination de
linfection tous les organes (atteinte polyviscrale).
La varicelle en dbut de grossesse (24semaines) donne de faon exceptionnelle (2%)
une embryopathie, dont la forme la plus grave est caractrise par une atrophie cica-
tricielle des membres, des anomalies de la peau et du cortex crbral. Cette infection
in utero rsulte du passage transplacentaire de la virmie caractristique de linfection
gnralise sous-tendant la varicelle.
Chez ladulte
Lorsque la primo-infection survient tardivement chez un adulte, on risque une pneu-
monie nodulaire diffuse, qui est mortelle dans 10 % des cas. Quand elle gurit, elle
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 89/307
laisse souvent des nodules calcifis dans le parenchyme pulmonaire.
Donc il y a un bon ge pour faire la varicelle, ni trop tt, ni trop tard.
Chez les personnes immunodprimes
La varicelle est souvent grave ralisant ce quon appelle une varicelle progressive qui
comporte 5facteurs de gravit. 1) les lments ruptifs sont nombreux, de grande
taille, hmorragiques, ncrotiques parfois, sans tendance la gurison. 2) une diss-
mination du virus tous les organes, foie, poumons, encphale (atteinte polyviscra-
le). 3) un risque de se compliquer de coagulation intravasculaire dissmine
(CIVD) annonc avant toute ruption par des douleurs et un ballonnement abdomi-
nal, 4) des surinfections bactriennes graves. 5) enfin, chez un enfant leucmique ou
trait pour tumeur maligne, le risque de varicelle grave - la simple annonce dun con-
tage - conduit interrompre ou rduire la chimiothrapie, perturbation qui peut faire
manquer la gurison de la leucmie ou de la tumeur maligne (perte de chance).
La mortalit de cette varicelle progressive est donc trs leve si on ne traite par
Aciclovir. Cette volution se voit chez des personnes soumises un traitement immu-
nodpresseur ou des corticodes, surtout lorsque ces traitements sont prescrits pour
une maladie leucmique ou cancreuse (qui en elle-mme est dj immuno-dpriman-
te). Cependant, un simple traitement par corticodes pour asthme peut favoriser une
varicelle maligne. En pratique, de tels enfants, sils nont pas fait la varicelle, doivent
tre carts de tout risque de contage et vaccins en priode de rmission. Sils sont
soumis un contage, il faut de toute urgence leur administrer des gamma-globulines
spciales provenant de donneurs slectionns sur un titre danticorps lev vis--vis
du virus VZ (par exemple des adultes qui viennent de faire un zona), ainsi que de laci-
clovir per os ou i.v.
2.3.2 Zona
Il survient le plus souvent lge mr mais parfois plus tt en cas dimmunodpression, et ex-
ceptionnellement chez lenfant
1. Le zona est une rinfection endogne, une rcurrence ou rsurgence de linfection chez une
personne qui a dj fait la varicelle, et qui possde donc des anticorps. Dautre part cest une
maladie essentiellement locale (la virmie tant transitoire et faible). On ne sait pas si lors
de la varicelle, le virus se localise dans un seul ganglion sensitif, mais plus tard, cest gnra-
lement dans un seul ganglion sensitif que linfection se trouve ractive pour donner le zona.
2. Cest un ganglion qui correspond au territoire o lruption de la varicelle avait t particu-
lirement intense: cest en gnral le tronc, et vient ensuite la tte. Une fois ractive linfec-
tion migre par voie neuronale centrifuge vers la peau et les muqueuses. On a alors deux
manifestations cliniques: dabord une nvralgie, cest--dire une douleur type de brlures,
sur le trajet du nerf, puis une ruption vsiculeuse localise au territoire cutano-muqueux in-
nerv par ce ganglion sensitif. Donc une ruption topographie nerveuse, radiculaire, uni-
latrale, douloureuse
Le zona le plus frquent est le zona thoracique ou abdominal mais il y a aussi des zonas sacrs
(touchant le prine, les organes gnitaux, la fesse) et lautre extrmit, des zonas cphali-
ques correspondant latteinte des nerfs crniens.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
90/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
3. Le zona est souvent bnin, mais il pose des problmes dans trois circonstances :
1. Chez la personne de plus de 60ans, le zona laisse souvent, aprs la gurison des vsicu-
les, des douleurs nvralgiques extrmement vives, et tenaces, cause dtat dpressif con-
duisant parfois au suicide. Ce sont les algies post-zostriennes (APZ). Elles sont
dfinies par la persistance de douleurs au-del de 6mois.
2. Il existe un risque datteinte cornenne en cas de zona ophtalmique, cest--dire de zona
dans le territoire du nerf ophtalmique de Willis, branche du trijumeau.
Ce risque se voit particulirement en cas datteinte de la branche nasale externe du nerf ophtalmique de
Willis, ce qui se traduit par lapparition de vsicules sur laile du nez. Aile du nez et corne sont innerves
par le mme nerf ; il existe aussi un risque datteinte rtinienne responsable dune ncrose rtinienne aigu
ayant tendance se bilatraliser, ncessitant un traitement par aciclovir vie.
3. Chez la personne immunodprime (pour cancer ou hmopathie maligne, ou SIDA par
exemple) le zona survient nimporte quel ge et il est volontiers extensif. Il peut y avoir
virmie, lruption peut dpasser le territoire du ganglion sensitif sous forme dune rup-
tion gnralise ressemblant fort la varicelle de primo-infection; il peut y avoir une at-
teinte polyviscrale.
Contrairement la varicelle, le zona en cours de grossesse ne fait courir aucun risque au
ftus, car cest une maladie localise, sans virmie.
2.3.3 Transmission de linfection VZV
La varicelle se transmet partir du liquide de vsicules et surtout partir des scrtions respira-
toires des personnes atteintes de la varicelle. Ds le stade des crotes, qui ne contiennent pas de ce
virus trs peu rsistant, la contagiosit cesse. La transmission est strictement interhumaine, directe,
respiratoire, en face de personnes atteintes de varicelle. Un varicelleux est dj contagieux quel-
ques jours avant lapparition de lruption. Les pidmies de varicelle sont plus frquentes lhiver
que lt.
En ce qui concerne le zona, il ny a pas de transmission du zona, puisque cest une rinfection en-
dogne. Parler de contage ou dincubation en matire de zona est un non-sens. Les rcurrences de
zona se rptent rarement (un seul zona gnralement dans la vie dune personne immunocomp-
tante), alors que les rcurrences dherps sont gnralement multiples.
Il ny a donc pas dpidmie de zona, mais les vsicules de zona contenant le virus, un zona peut
tre lorigine dune pidmie de varicelle, par exemple dans les units de cancrologie ou dh-
matologie infantile. Le zona dun grand-parent peut tre lorigine de la varicelle de ses petits-
enfants.
2.3.4 Diagnostic
1. Le diagnostic de la varicelle et du zona est essentiellement clinique. Cependant il y a des in-
dications du diagnostic virologique exact : 1) les formes graves de varicelle ou de zona. 2)
une ruption atypique dans lentourage dune personne immunodprime. 3) toute tude vi-
se pidmiologique, smiologique, pronostique ou thrapeutique, sur la varicelle ou le zona.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 91/307
4) la dtermination de limmunit chez une personne jeune avant mise sous un traitement im-
munodpresseur.
On dispose pour cela de deux approches, le diagnostic direct et le diagnostic indirect
2. Diagnostic direct par dtection du virus ou de ses composants dans les vsicules, avec
trois techniques, comme dhabitude
1. La technique de rfrence est linoculation du liquide de vsicules directement sur cul-
tures de cellules, si possible au lit du malade. En effet, cest un virus trs fragile et cul-
tivant difficilement, lECP apparaissant au plus tt 3jours aprs linoculation;
2. La recherche dantigne viral par immuno-cytodiagnostic en immunofluorescence sur
frottis ou en immuno-peroxydase partir de cellules du liquide de vsicule ou du plan-
cher de la vsicule constitue un diagnostic rapide;
3. La recherche du gnome viral par PCR seffectue sur liquide de vsicule mais surtout
sur le LCR en cas de signe neurologiques et sur le liquide amniotique en cas de varicelle
maternelle.
3. Srodiagnostic, diagnostic indirect, la recherche dune rponse immune (humorale, anti-
corps) dans le srum, se fait en pratique essentiellement en ELISA. Comme dans le cas des
HSV de type 1 et 2, le srodiagnostic est surtout intressant en cas de primo-infection, cest-
-dire, en cas de varicelle. L lexamen simultan de S1 et S2 dcle une lvation significa-
tive du titre des anticorps, si les dates de prlvement sont correctes. Pour le zona, le srodia-
gnostic a moins dintrt car llvation du titre des anticorps sobserve moins constamment.
Il faut donc privilgier le diagnostic direct si lon veut vraiment faire un diagnostic virologi-
que.
En revanche, il est intressant de faire un srodiagnostic en ELISA aux personnes adultes sans
antcdents connus de varicelle exposes un contage, pour dterminer leur statut immu-
nitaire et en labsence danticorps VZV instituer un traitement prventif afin dviter la vari-
celle grave de ladulte.
2.3.5 Traitement des infections VZV
2.3.5.1 Traitement curatif
Rien dans les formes habituelles, bnignes, si ce nest des soins locaux (et couper les ongles de
lenfant pour viter les lsions de grattage).
Dans les formes graves dinfections VZV, lacycloguanosine ou aciclovir (ACV ou Zovirax) a
prouv son activit par voie i.v. Cependant, le VZV tant moins sensible lACV que les HSV,
les doses actives per os sur le VZV sont de 4g/j [le quintuple des doses actives per os sur les HSV
(0,8 g/j)]. Cest pourquoi, chez limmunodprim, le traitement seffectue par voie veineuse.
Des produits proches de lACV, le valaciclovir (Zlitrex) et le famciclovir (Oravir) ont pour
eux de passer plus aisment que lACV la barrire intestinale (meilleure biodisponibilit orale). Ils
ont la prfrence sur lACV pour le traitement des formes non graves mais cependant
proccupantes: le zona ophtalmique (fort douloureux et avec risque pour la vision) et le zona aprs
60ans, pour tenter de rduire le risque dalgies post-zostrienne.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
92/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
2.3.5.2 Traitement prventif
1. A court terme, face un contage, une mesure logique consiste en ladministration de gam-
maglobulines. Il les faut titre lev en anticorps varicelle-zona, gammaglobulines spciales
anti-VZV. [Ces gammaglobulines sont sans intrt pour le traitement curatif de la varicelle
et du zona].
Ce traitement prventif sadresse aux personnes rceptives et risque de varicelle grave et
soumises un contage. Malheureusement, les immunoglobulines ne sont pas aisment dispo-
nibles en France actuellement.
De toute faon, il faut aussi, pour la prvention des varicelles graves, un traitement antiviral,
effectu selon les cas soit par voie i.v. laciclovir, ou soit par voie orale au valaciclovir
ou au famciclovir. Cela concerne les personnes immunodprimes ou les femmes enceintes
reconnues srongatives par une recherche danticorps en urgence laide dun test rapide.
2. Le vaccin VZV Oka
Cest un vaccin vivant attnu, obtenu partir dune souche naturelle (sauvage) isole
dun enfant japonais appel Oka et passe en srie en cultures de cellules.
Il a dabord t destin aux enfants immunodprims rceptifs au virus de la varicelle. Cest
le seul exemple de vaccin vivant administrable des personnes immunodprimes. On a
pris ainsi des risques, mais des risques trs infrieurs ceux de la varicelle naturelle chez ces
enfants. Dailleurs, on a vaccin en priode dimmunodpression modre, en dehors du trai-
tement dattaque de la leucmie, ou avant greffe dorgane. Ce fut un succs : 1) ce vaccin
nest pas dangereux pour ces enfants immunodprims, bien quil puisse donner quelques
vsicules (une minivaricelle) et quil puisse installer une infection latente dans les gan-
glions sensitifs comme le fait le virus sauvage. 2) il vite aux enfants vaccins de faire une
varicelle grave en cas de rencontre du VZV sauvage.
Ce vaccin est galement intressant pour un adulte sain rceptif, surtout sil est profession-
nellement expos, afin de lui viter la pneumonie VZV qui au-del de lenfance peut tre
mortelle.
La vaccination universelle des nourrissons entre 12 et 18 mois pratique aux USA
nest pas actuellement retenue en France :
on peut craindre que limmunit vaccinale, moins solide que limmunit naturelle, repousse lge dacquisition
de linfection naturelle, avec un risque accru de pneumonie grave. Une revaccination ladolescence sera assu-
rment ncessaire. Dautre part, remplacer le VZV sauvage par le vaccin Oka au niveau de nos ganglions sensi-
tifs lchelle de la population est une intervention artificielle dans une covolution millnaire homme-virus,
aux consquences inconnues. Et puis, on estime avoir dautres soucis de Sant Publique en France que labsen-
tisme parental pour cause de varicelle: nos morts annuelles par le tabac (60000), lalcool (25000), lauto/moto
(5000), le suicide (12000). Cela peut videmment changer. Donc, suivre
2.3.6 Points importants
Le VZV est un herpsvirus dermo-neurotrope.
La varicelle, primo-infection, gnralise, par le VZV, est presque toujours apparente et
peut tre mortelle chez les personnes immunodprimes (mme une simple corticothra-
pie), justifiant alors le traitement par laciclovir titre curatif et mme prventif.
Curieusement, la varicelle inhabituellement tardive (la varicelle de ladulte) peut tre inha-
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 93/307
bituellement grave, du fait dune pneumonie svre
Le zona est une rinfection endogne, localise, une rcurrence gnralement unique
Le zona donne une ruption de topographie radiculaire, unilatrale et douloureuse (douleurs
avant, pendant et aprs lruption).
Il ny a pas dpidmie de zona, mais les vsicules contenant le virus, un zona peut tre lori-
gine dune pidmie de varicelle.
La varicelle de la femme enceinte (mais non le zona) peut-tre grave, pour la femme elle-m-
me, et pour lenfant.
Le traitement curatif de formes graves repose sur ladministration daciclovir par voie vei-
neuse chez limmunodprim. Pour les formes non graves de limmunocomptent qui sont
traites, le traitement repose sur le valaciclovir ou le famciclovir.
Pour tenter de prvenir les algies post-zostriennes chez la personne de plus de 50 ans, on
recourt au valaciclovir ou au famciclovir par voie orale, administr imprativement dans
les 72heures aprs le dbut du zona.
Les Herpesviridae - 1re partie (HSV et VZV)
94/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 95/307
Chapitre 3
Les Herpesviridae - 2
me

partie (CMV, EBV, HHV-6,
HHV-7, HHV-8 et virus B du
singe)
3.1 Le cytomgalovirus humain (HCMV ou
plus couramment CMV)
3.1.1 Le virus
Cest un Herpesviridae trs ubiquitaire, responsable dinfections souvent asymptomatiques, mais
aussi dinfections graves voire mortelles. Sa rplication comporte, comme pour les autres
Herpesviridae, trois phases (revoir illustration II-2 (voir page 71)) : trs prcoce avec syn-
thse de protines activatrices; prcoce avec synthse de protines enzymatiques dont une
ADN polymrase virale; et tardive avec synthse des composants protiques de la capside et
des glycoprotines denveloppes. La rplication de lADN viral spare les phases prcoces et tar-
dives. Il ny a pas de Thymidine kinase virale. LADN polymrase virale est sensible lacide
phosphoformique (PFA ou foscarnet) et la forme triphosphate de la DHPG (dihydroxypropoxy-
mthyl guanine, ganciclovir). La premire phosphorylation de la DHPG est assure par le produit
dun gne du CMV appel U97 fonction phosphotransfrase. Comme tout virus enveloppe, le
CMV est fragile mais il peut persister quelques temps sur des objets inertes (jouets des enfants en
crche, couches). Le CMV est lun des virus les plus dou pour le sabotage de nos dfenses immu-
nitaires, de par le nombre de gnes pirats au gnome cellulaire et fonctionnant comme leurres
des lments du systme immunitaire.
Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
96/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
3.1.2 pidmiologie
Virus strictement humain, le CMV est trs ubiquitaire, infectant dans nos pays la 1/2 de la popu-
lation (prs de 100% dans le Tiers Monde). Un pour cent des nouveaux-ns sont infects con-
gnitalement et ont une virurie. Il est latent vie dans les monocytes (il fait partie avec lEBV et
lHHV-6 des Herpesviridae leucotropes) mais aussi dans les cellules endothliales vasculaires.
Il est lorigine de rinfections endognes : ainsi il est prsent dans les scrtions cervicales de
1/10 1/4 des femmes enceintes.
Il est transmis par contacts intimes: la grossesse, laccouchement, les soins de maternage dont lal-
laitement et le changement des couches, les jeux entre enfants en crche, les rapports sexuels. Il
tait transmissible par transfusion sanguine (2,5 5% des dons du sang non slectionns taient
contaminants, la dleucocytation systmatique du sang en France depuis 1998 ayant presque annu-
l ce risque). Artificiellement, il est transmissible par greffe dorganes ou de moelle.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 97/307
3.1.3 Infection du nouveau-n
1. Le CMV est le responsable de la maladies des inclusions cytomgaliques (MIC) du nou-
veau-n.
Ce sont des nouveau-ns qui naissent infects, avec deux sries de symptmes graves.
1. des signes dinfection gnrale : hpatosplnomgalie, ictre, thrombopnie, pneumo-
nie, chez un enfant de petit poids (< 2,5 kg, retard de croissance).
2. des signes datteinte cphalique : microcphalie, calcifications intracrbrales priven-
triculaires, choriortinite.
Il en rsulte une mortalit leve ou de lourdes squelles psychomotrices et sensorielles :
ces enfants, sils survivent, sont sourds, aveugles et infirmes moteur-crbraux. Cette MIC se
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voit chez 2 5 nouveau-ns sur 10.000 naissances. Elle est donc 30 fois plus rare que linfec-
tion inapparente des nouveau-ns touchant 1% de tous les nouveau-ns.
La MIC rsulte le plus souvent dune concidence malheureuse entre une grossesse et une
primo-infection inhabituellement tardive dans la vie de la mre. Celle-ci est en rgle gnrale
transmise lintrieur de la famille par un an vivant en collectivit (crche) et y ayant con-
tract linfection.
Dans ces conditions, lenfant est infect in utero, alors quil ny a pas danticorps maternels
prexistants pour le protger, do une infection grave de lembryon. La primo-infection ma-
ternelle est presque toujours inapparente, donc imprvisible. Parfois linjection congnitale
est souponne puis diagnostique sur des signes chographiques: retard de croissance intra-
utrin (RCIU), placentite, calcifications ventriculaires crbrales.
2. Bien plus souvent, la mre, loccasion de la grossesse, a une rinfection endogne, peut-
tre lie limmunodpression physiologique de la grossesse. Ces 1/10 1/4des femmes
ayant du CMV au niveau du col utrin en fin de grossesse peuvent contaminer leur enfant in
utero ou au moment de la naissance, mais ce nest pas aussi grave quen cas de primo-infec-
tion maternelle car lenfant est protg par les anticorps maternels prexistants. Cela explique
que 1 % de tous les nouveau-ns normaux soient infects.
Actuellement, on se demande si ces nouveau-ns normaux la naissance se dvelopperont
normalement, et des tudes prospectives ont t faites. Elles laissent planer un doute sur le
quotient intellectuel et lacuit auditive ultrieurs de ces enfants; ce risque pourrait con-
cerner 10% des enfants infects asymptomatiques. Il faut poursuivre ces tudes pour avoir
une valuation dfinitive de ce risque.
3. Dans la petite enfance, une surveillance virologique montrerait la survenue dune excrtion
urinaire de virus identifiable chez un enfant sur deux.
3.1.4 Ladulte immunocomptent
Chez ladulte immunocomptent, linfection, gnralement asymptomatique, peut rarement se
manifester sous forme de fivre et/ou dasthnie prolonge, de syndrome mononuclosique (
diffrencier de la mononuclose virus Epstein-Barr et de la primo-infection HIV, de la toxo-
plasmose), de leucopnie, sous forme dhpatite aigu (ni A, ni B, ni C), exceptionnellement sous
forme de syndrome de Guillain-Barr, de pneumonie ou dencphalite.
3.1.5 Les personnes immunodprimes
Le CMV, virus opportuniste chez les personnes immunodprimes
1. Il peut sagir dune primo-infection exogne par administration un sujet CMV srongatif,
essentiellement partir dune greffe dorgane, de donneur CMV sropositif. Il peut sagir tout
autant dune rinfection endogne dclenche par limmunodpression (ou mme par le rejet
de greffe).
2. La gravit de linfection dpend du degr de limmunodpression.
En cas dimmunodpression lgre (greffe de rein, greffe de foie) seule la primo-infection est
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 99/307
habituellement symptomatique.
Chez les sujets plus profondment immunodprims (cas des greffes de moelle et du SIDA),
primo-infection et rinfection endogne sont galement capables de donner des infections
graves: encphalite, choriortinite avec au fond dil infiltrats cotonneux privasculaires
lorigine de ccit (SIDA), ulcrations digestives (bouche, sophage, colon, anus), glom-
rulopathie, pneumonie, pancytopnie par infection mdullaire.
Il faut considrer part la pneumonie interstitielle des greffs de moelle, en raison de sa
gravit (50% de mortalit lorsquelle est dclare, mme traite par un antiviral anti-CMV
efficace) et sa nature probablement immunopathologique : elle survient, non pas en pleine
immunodpression mais, au contraire, au moment o la greffe prend (au sortir de
laplasie) ; et le traitement de linfection par antiviraux, une fois la pneumonie dclare, est
efficace sur linfection elle-mme, sans pour autant empcher les volutions mortelles.
3.1.6 Diagnostic au laboratoire
Cf annexe E page 277.
Il ne faut pas perdre de vue quune excrtion urinaire de CMV est chose banale chez les jeunes
enfants et chez les immunodprims o elle na pas de valeur diagnostique.
3.1.6.1 Diagnostic direct
La dcouverte du virus dans le sang, cela en quantit leve, est beaucoup plus significative dune
infection active CMV et prdictionnelle dune maladie CMV.
1. Pour lisolement, seule convient la culture de fibroblastes humains o apparat en quelques
jours un mois (voire 6semaines) un ECP sous forme de grosses cellules rondes en foyer.
Il existe une grosse inclusion nuclaire, do le nom de cytomgalie.
Linfection des cultures peut tre mise en vidence de faon acclre, 24 48heures aprs
linoculation, bien avant lapparition de lECP, par examen immuno-cytologique sur la
culture cellulaire elle-mme en immunofluorescence (IF) ou en immuno-peroxydase (IP). On
utilise pour cela un anticorps monoclonal spcifique des antignes trs prcoces.
2. Plus rapide encore, et prdictionnelle dune infection svre, est la dtection et la quantifi-
cation dantigne viral directement sur le sang, en immunofluorescence (IF), dans les noyaux
des polynuclaires du sang circulant : cest lantignmie CMV.
3. La recherche de squences gnomiques virales en PCR (voir illustration III-2) a transfor-
m le diagnostic des infections du systme nerveux, de lil et congnitales.
Rapide, trs sensible et quantifiable, elle est trs utile au diagnostic dinfection active quand
elle porte sur des compartiments clos comme le LCR pour le diagnostic dencphalite, lhu-
meur aqueuse pour le diagnostic de choriortinite, le liquide amniotique pour le diagnostic
dinfection congnitale CMV. La PCR sur le sang, pour recherche et quantification
dADN viral, tend remplacer actuellement la recherche de lantignmie.
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100/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
3.1.6.2 Diagnostic indirect
Il est dintrt limit.
La recherche dIgG spcifiques en technique ELISA nest utile que pour classer donneurs et re-
ceveurs dorgane ou de sang en sropositifs ou srongatifs, et pour dpister les femmes sronga-
tives avant la grossesse.
La dtection dIgM spcifiques en technique ELISA est un argument en faveur dune infection ac-
tuelle active mais ce test nest pas assez sr pour quon le pratique titre systmatique chez
les femmes enceintes. Cest la mesure de lavidit des IgG spcifiques qui permet dliminer ven-
tuellement une infection rcente lorsque lavidit est leve.
3.1.6.3 Interprtation
Avec un virus aussi ubiquitaire que le CMV, linterprtation des rsultats virologiques nest pas
sans difficult, dautant quelle dbouche sur des indications de traitements antiviraux non d-
pourvus de toxicit.
Chez les sujets immunodprims des indications existent de traitement anticip (premptif en
franglais), cest dire administr avant les signes datteinte viscrale sur la seule dtection du virus
lorsque celle-ci est considre comme prdictionnelle datteinte viscrale (du fait de son sige et
de sa quantification). Ainsi, chez les greffs de moelle au sortir de laplasie, on recherche syst-
matiquement chaque semaine une antignmie CMV et la seule dtection de polynuclaires infec-
ts dans le sang (1 polynuclaire infect sur 200000 polynuclaires) dclenche, avant toute
manifestation de pneumonie, un traitement anticip par DHPG ou PFA. Pour les greffs dorgane
solide, o le traitement immunodpresseur est plus lger et le risque de maladie svre CMV
moindre, le seuil dintervention est plus lev (gnralement de 50 100 polynuclaires in-
fects pour 200000). Actuellement, on sefforce de dterminer par PCR en temps rel ces seuils
dintervention, en nombre de copies dADN par mL de sang.
Enfin, pour compliquer la situation, il arrive que latteinte viscrale soit due lassociation de lin-
fection CMV et dune autre infection, en particulier bactrienne ou parasitaire, favorise par lim-
munodpression que peut induire le CMV lui-mme.
3.1.7 Prvention et traitement
1. Pas de vaccin actuellement au point contre le CMV, champion de lchappement au systme
immunitaire par camouflage (latence) et sabotage (piraterie gnique), et cest trs regrettable.
2. On dispose de deux mdicaments antiviraux, la DHPG ou Ganciclovir et lacide phos-
phonoformique (PFA) ou Foscarnet, administrs par perfusion iv dans le traitement des in-
fections graves des sujets immunodprims. Ces deux antiviraux spcifiquement anti-CMV
ont (contrairement laciclovir, si bien tolr et actif sur HSV et VZV mais bien peu actif sur
le CMV) des effets secondaires srieux : neutropnie pour la DHPG, anmie et insuffisance
rnale pour le PFA (I-9 p. 31-10). Un troisime mdicament, lHPMPC (Cidofovir ou Visti-
de), nphrotoxique, est rserv aux cas de rsistance aux deux prcdents. Le ganciclovir
existe sous la forme dun promdicament administrable par voie orale, le valganciclovir (Ro-
valcyte).
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 101/307
3. Les gammaglobulines haut titre danticorps CMV (de par le choix des donneurs) ont, en
injections rptes, une activit prventive, en particulier pour les receveurs srongatifs de
greffon de sujets donneurs sropositifs.
4. On sefforce dviter, autant que faire se peut, de tels couples R
-
D
+
mais il y a des urgen-
ces vitales (greffe de cur ou de foie) qui ne laissent pas le choix. Dans le mme ordre dide,
on vitait la transfusion de sang de donneur sropositif pour le CMV un receveur srongatif
risque dinfection grave (immunodprim ou femme enceinte), lusage de sang dleucocyt
donnant maintenant une bonne scurit vis vis du risque de transmission transfusionnelle du
CMV.
5. Les mesures pour tenter dviter les infections congnitales sont de porte trs limite
du fait que les signes dalarme chez la femme enceinte sont trs rares, du fait de labsence
de vaccin efficace, de la signification alatoire de la prsence dIgM spcifiques en cours
de grossesse. Do, par opposition ce quil en est en matire de rubole, labsence dune po-
litique consensuelle systmatique de prvention comme la montr la conclusion dune con-
frence de consensus rcente sur le sujet. Cela ne fait que souligner lintrt des mesures
ponctuelles suivantes, en attendant la mise au point dun vaccin:
1. Contrler limmunit des femmes jeunes en ge dtre enceintes et susceptibles de soi-
gner des nouveau-ns atteints de maladie des inclusions cytomgaliques et carter si pos-
sible les femmes enceintes srongatives des soins de tels enfants.
2. En labsence de connaissance du statut immunitaire ou en cas de srongativit chez
une femme enceinte, ce dautant quelle a dj un premier enfant, appliquer les mesures
prventives suivantes durant les soins ce premier enfant : se laver les mains aprs
le changement de couche, ne pas partager le linge de toilette ni la nourriture (ne pas sucer
la ttine des biberons ou finir les petits pots). Ces mesures sont appliques la mre et
au pre, la primo-infection de celui-ci pouvant secondairement tre transmise la mre.
3. Faire respecter les mesures universelles dhygine aux Puricultrices des crches.
4. Avant de transfuser du sang frais une femme enceinte ou un sujet fragile, vrifier
quon nest pas en train de lui crer une primo-infection iatrogne CMV : pas de trans-
fusion de sang de donneur sropositif une femme enceinte srongative ou un
sujet fragile, immunodprim, nouveau-n. Depuis 1998, les culots de globules rou-
ges transfuss sont systmatiquement dleucocyts (ce nest en fait quune leucorduc-
tion).
5. En cas de syndrome mononuclosique non d au virus EB chez une femme enceinte,
vrifier que ce nest pas une primo-infection CMV, de mme quil faut vrifier que ce
nest pas une toxoplasmose ou une primo-infection HIV-1. Mme prcaution en cas
dhpatite qui napparatrait pas due aux virus habituels des hpatites (virus A, B et C).
6. Exceptionnellement, lalarme peut tre donne la femme enceinte par un retard de
croissance intra-utrin avec microcphalie, dclenchant alors une exploration intra-
utrine du ftus (recherche dans le liquide amniotique du virus par culture et par PCR).
Cela tant, les indications de lavortement prophylactique sont exceptionnelles.
En conclusion, on est assez dmuni vis--vis du CMV, dont le pouvoir pathogne varie
beaucoup en fonction de lhte.
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102/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
3.1.8 Points importants
1% des nouveau-ns naissent infects, la majorit dentre eux tant asymptomatiques, et cette
infection CMV est mise en vidence par une excrtion urinaire (virurie) avant J 15.
Le CMV est responsable de la maladie des inclusions cytomgaliques (MIC) du nouveau-n,
greve dune mortalit leve ou de lourdes squelles sensorielles et psychomotrices.
La MIC est presque toujours conscutive une primo-infection maternelle et concerne donc
surtout les femmes srongatives avant la grossesse en contact avec un enfant gard en
collectivit.
Linfection CMV de ladulte immunocomptent est presque toujours asymptomatique, seule
la primo-infection pouvant donner, rarement, une fivre prolonge, un syndrome mononu-
closique, une hpatite aigu.
Le CMV est un virus opportuniste chez les sujets immunodprims: rtinite (apanage du SI-
DA), encphalite, pneumonie, ulcrations du tube digestif, pancytopnie chez les greffs de
moelle.
Le srodiagnostic nest utile que pour classer les donneurs et receveurs dorganes en sro-
positifs et srongatifs et pour dpister les femmes srongatives avant la grossesse.
La dtection de lADN viral par PCR a transform le diagnostic des infections du systme
nerveux (LCR), oculaires (humeur aqueuse) et des infections congnitales (liquide amnioti-
que).
Notion de seuil dintervention en matire de virmie CMV. La prsence du CMV dans
le sang annonce la survenue dune maladie CMV chez les sujets immunodprims. Sa re-
cherche rgulire est donc systmatique aprs greffe et au cours du SIDA. Sa quantification
- par antignmie ou, de plus en plus, par PCR en temps rel - conditionne la mise en place
dun traitement anticip (preemptive) par ganciclovir ou foscarnet. Ce traitement est mis
en route au-del dun certain niveau de virmie qualifi de seuil dintervention.
La prvention des infections congnitales repose essentiellement sur le dpistage des femmes
srongatives en contact avec des enfants (mre dun premier enfant, personnels de crche ou
de service de pdiatrie et de maternit). En labsence de connaissance du statut immunitai-
re ou en cas de srongativit chez une femme enceinte ayant dj un premier enfant, il
faut appliquer les mesures suivantes la mre et au pre lors des soins ce premier enfant :
se laver les mains aprs le changement de couches, ne pas sucer la ttine des biberons et les
cuillres, et ne pas finir les petits pots.
Il ny a malheureusement pas de vaccin actuellement au point contre le CMV.
Au demeurant, le CMV maltraitant les enfants dans le sein de leur mre, les nouveau-ns, les
personnes fragilises, immunodprimes, et se tenant tranquille devant les adultes en mesure
de se dfendre, na dcidment rien dun gentleman.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 103/307
3.2 Le virus Epstein-Barr (virus E-B ou EBV)
3.2.1 Historique
1. LEBV est un Herpesviridae dcouvert dans une tumeur par EPSTEIN et BARR en 1964
La tumeur en question est le lymphome malin africain ou tumeur de Burkitt. Elle touche
les enfants au niveau des mchoires. Elle svit dans la zone intertropicale en zone dendmie
palustre, sous forme de petits foyers pidmiques. Elle est monstrueuse mais trs radiosensi-
ble.
EPSTEIN et BARR ont montr que dans les cultures in vitro de cellules faites partir du lym-
phome de Burkitt, apparaissait, au fur et mesure des subcultures, un Herpesviridae (virus
ADN, icosadrique 162capsomres, pplos). Ctait un herpsvirus nouveau, inconnu,
lEBV. Les enfants porteurs de tumeur de Burkitt avaient tous dans leur srum des anticorps
vis--vis de ce virus en immunofluorescence.
2. Trs vite, il est apparu que ce nouveau virus infectait bien dautres sujets que les enfants afri-
cains porteurs de tumeur de Burkitt : 90 % dentre nous, adultes europens, avons des anti-
corps anti-EBV, et linfection par lEBV se fait trs tt dans lenfance, puisqu lge de 4
ans, un enfant sur deux, dans nos pays, possde dj des anticorps. De temps en temps, ce vi-
rus tait trouv dans les lymphocytes en cultures provenant de sujets normaux.
Dans ces conditions, lEBV posait deux problmes:
1. Quel est son rle dans la tumeur de Burkitt ? Est-il la cause du processus cancreux?
2. Que donne-t-il chez les sujets normaux au moment de la primo-infection? Des infections
inapparentes ou une maladie particulire?
3. Le premier problme nest pas totalement rsolu. Le deuxime problme a t rsolu en 1967
dans un laboratoire o lon manipulait lEBV. Lune des techniciennes tait connue pour ne
pas avoir danticorps anti-EBV et, quand on avait besoin dun srum tmoin ngatif, on lui
prlevait du sang. Elle sest absente cause dune mononuclose infectieuse, et son retour,
elle avait des anticorps anti-EBV. Elle stait contamine au laboratoire.
Il est apparu que la mononuclose infectieuse, dont on cherchait depuis longtemps le virus
responsable, est en fait due lEBV. La primo-infection EBV, quand elle survient tardi-
vement chez ladulte, donne dans 50 % des cas une mononuclose infectieuse. Mais lim-
mense majorit des primo-infections EBV se font tt dans lenfance, et cela sans
maladie apparente.
3.2.2 Mononuclose infectieuse
3.2.2.1 Description
Cest une maladie bnigne de ladulte jeune, caractrise par lassociation de 3 lments cliniques
et de 3 lments biologiques
Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
104/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Signes cliniques
1. Fivre + fatigue trs marque
2. Langine se traduit par une douleur la dglutition. Cest le plus souvent une simple
angine exsudative, mais parfois une angine fausses membranes simulant une diph-
trie ou une leucose aigu. Cest, dans tous les cas, une angine tenace, ce qui est in-
habituel pour une angine.
3. Les adnopathies, en particulier cervicales postrieures, sont quasi constantes. Une
splnomgalie est frquente, et cette rate est fragile : exceptionnels cas de rupture
spontane.
En cas dadministration dampicilline, une ruption rythmateuse allergique sobserve
souvent, contre-indiquant cet antibiotique.
Signes biologiques
1. Signes hmatologiques : la numration formule sanguine, existe une augmentation
du nombre des lments mononucls, monocytes et lymphocytes, qui forment alors
plus de 50% de la formule blanche. Surtout, en plus des lymphocytes et des monocy-
tes normaux, on observe dans le sang des cellules mononucles anormales, car il
sagit de lymphocytes de grande taille et hyperbasophiles. Ces lymphocytes anor-
maux font au moins 10% des leucocytes. Le chiffre total des globules blancs nest que
modrment augment, dpassant rarement 20000/mm
3
. Au dbut, il est dailleurs
normal. Tout cela constitue le syndrome mononuclosique.
2. Les signes biologiques de cytolyse hpatique : une augmentation du taux des enzy-
mes dorigine hpatique, transaminases, est observe dans presque tous les cas.
3. Le troisime lment biologique est la prsence passagre danticorps htrophiles
particuliers dans le srum.
Ce sont des anticorps htrophiles, cest--dire dirigs vers dautres espces que
lhomme: anticorps anti-globules rouges de mouton, anti-globules rouges de buf,
anti-globules rouges de cheval. Avoir de tels anticorps htrophiles anti-mouton est
une chose banale. Mais, ce qui est particulier la mononuclose infectieuse, cest que
les anticorps htrophiles propres cette maladie sont dcels par des ractions sp-
ciales dont le MNI test, qui est une agglutination sur lame de globules rouges formo-
ls de cheval. Ces globules rouges sont agglutins par une goutte de srum du malade.
Ce test sur lame est trs rapide et commode, mais il ne vaut pas pour la primo-infection
du jeune enfant. Il est en revanche trs utile en cas de mononuclose infectieuse (qui
est la forme symptomatique de primo-infection telle quon lobserve une fois sur deux
chez ladolescent ou ladulte), mme sil peut tre ngatif au dbut de la mononuclo-
se infectieuse; il permet le diagnostic diffrentiel en urgence avec une leucmie aigu.
Ces anticorps htrophiles ont la particularit dtre transitoires.
4. Ces anticorps htrophiles ne sont pas les anticorps antivirus EB qui, eux, apparaissent
et persistent toute la vie. Le virus persiste galement, dans les globules blancs, dans
les lymphocytes B uniquement, et cette infection latente se traduit de temps en temps
par lexcrtion du virus dans la gorge, dans la salive. Cest ainsi que le virus persiste
et se rpand dans la population humaine.
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3.2.2.2 Complications
Elles sont rares: encphalite, myocardite, purpura, thrombopnie et rupture spontane de la rate.
La plus importante est une lymphoprolifration B ventuellement mortelle chez les sujets im-
munodprims. Cette lymphoprolifration est, dans un premier temps, polyclonale et rgressive
si lon peut corriger limmunodpression, puis elle peut voluer pour son propre compte sur un
mode monoclonal et malin, incontrlable (lymphome B non hodgkinien).
3.2.2.3 pidmiologie de la mononuclose infectieuse
Pour quapparaisse une mononuclose infectieuse, il faut un adulte jeune, sans anticorps anti-EBV,
soumis une contamination interhumaine directe, comme pour tous les herpsvirus. La contami-
nation salivaire joue un rle important, tel point quon a parl pour la mononuclose infectieuse
de maladie des fiancs ou du baiser . La primo-infection de lenfant, elle, est presque tou-
jours inapparente, sans les lments cliniques et biologiques de la mononuclose infectieuse.
La mononuclose infectieuse est une maladie de riches. Chez les pauvres, ce que les hyginistes
appellent promiscuit entrane une primo-infection prcoce un ge o lexpression clinique de
linfection EBV est trs rduite. Dune faon gnrale - mis part le cas de la varicelle trs con-
tagieuse laquelle peu denfants chappent - les infections humaines Herpesviridae sont plus fr-
quentes et plus prcoces parmi les classes socio-conomiques dfavorises.
3.2.3 Physiopathologie de la mononuclose infectieuse
La mononuclose infectieuse est une lymphoprolifration bnigne, du moins chez ladulte im-
munocomptent.
Le virus infecte dabord de faon lytique les cellules pithliales du pharynx et des glandes
salivaires, puisquon le retrouve ce niveau ltat infectieux. Il infecte aussi les lymphocytes B
mais cette infection est abortive, bien que lADN viral soit entirement prsent sous forme dpi-
some dans les lymphocytes B infects. Infection abortive signifie expression partielle du gnome
viral, ne concernant pas les protines tardives. Elle entrane une prolifration polyclonale des
lymphocytes B qui va elle-mme induire une rponse immunologique sous forme dune prolif-
ration polyclonale de lymphocytes T CD8
+
. Cest cette dernire qui est responsable du syndrome
mononuclosique. Les lymphocytes anormaux hyperbasophiles sont ces lymphocytes T CD8
+
qui
vont limiter la prolifration des lymphocytes B infects. Les anticorps htrophiles de la mononu-
close infectieuse sont produits par les lymphocytes B infects en phase de prolifration temporai-
re.
Les adnopathies et le syndrome mononuclosique sont interprts comme une raction immuni-
taire cellulaire, des lymphocytes T CD8
+
, visant les lymphocytes B infects par le virus. Langine
et lhpatite seraient lexpression clinique des destructions cellulaires entranes par cette raction
dimmunit cellulaire T.
Une hyporactivit des lymphocytes T, telle quon en voit au cours de divers dficits immunolo-
giques hrditaires ou acquis (SIDA, traitement anti-rejet de greffe), va favoriser une mononu-
close grave, qui est en fait une prolifration, sans frein, de lymphocytes B infects. Dabord
polyclonale et rversible en cas de rtablissement de limmunit, cette lymphoprolifration B peut
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devenir monoclonale et alors irrversible et maligne, sous forme de lymphome B non-hodgki-
nien.
LEBV apparat donc, par lexpression de ses gnes prcoces, comme un immunostimulant
des lymphocytes B, comme un mitogne B , et la mononuclose infectieuse est une maladie
humaine lie une stimulation cellulaire dorigine virale. On parle de stimulation des mitoses
plutt que de transformation cellulaire, ce dernier terme voquant un processus malin tranger aux
mononucloses courantes.
3.2.4 Infection latente
Aprs primo-infection, lEBV persiste vie dans quelques lymphocytes B (un sur 10
6
) chez le
sujet immunocomptent, sous forme de quelques copies de gnome circulaire (pisomes). Ces
lymphocytes B sen trouvent immortaliss et les pisomes dEBV se dupliquent chaque mitose.
Cette infection latente saccompagne de lexpression dune partie du gnome viral sous forme
dantignes de latence, dont les EBNA (Epstein-Barr nuclear antigen).
Sporadiquement, une minorit de lymphocytes B infects de faon latente entrent en infection
lytique, par expression dune protine virale transactivatrice appele ZEBRA. Il sen suit lexpres-
sion des protines tardives, structurales de lEBV, dont la protine de capside VCA (pour viral cap-
side antigen) et les glycoprotines denveloppe. Ainsi sont fabriqus et librs quelques virus
infectieux. Paralllement, ces sujets sains anciennement infects, sropositifs pour lEBV, excr-
tent sporadiquement du virus dans leur salive.
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3.2.5 EBV et cancer
Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
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1. Le rle de lEBV dans la tumeur de Burkitt nest pas encore connu. Est-ce la cause du lym-
phome ou est-ce un virus de passage qui profite des cellules tumorales pour sy
multiplier ? Dautant que le lymphome de Burkitt europen, contrairement au lymphome de
Burkitt africain, nest pas spcifiquement associ une infection EBV.
Le point commun tous les lymphomes de Burkitt est une anomalie chromosomique: des
translocations qui font passer loncogne myc situ dans le chromosome 8 sous contrle des
promoteurs des immunoglobulines des chromosomes 14, 2 ou 22 (translocations 8:14; 8:2;
8:22), promoteurs trs puissants car nous avons constamment besoin dimmunoglobulines.
On pense que cette translocation est le rsultat accidentel dune multiplication prolonge et
intense des lymphocytes B sous linfluence du gnome viral (ou sous linfluence du paludis-
me dans les lymphomes de la zone dendmie selon une hypothse de Burkitt lui-mme, le
lymphome de Burkitt reculant en Afrique l o le paludisme recule).
2. Le carcinome nasopharyng (CNP) est la premire cause de cancer chez les Chinois de la
rgion de Canton, mme quand ils ont migr. Les cellules pithliales malignes contiennent
toutes le gnome de lEBV. On souponne lintervention dun facteur alimentaire dans la d-
termination de cette tumeur. Un titre lev dIgA VCA est un signe prdicteur de ce cancer.
3. Les personnes immunodprimes sont exposes au risque de lymphome B non-hodgki-
nien, aprs primo-infection ou rinfection endogne (ractivation de linfection latente) par
lEBV. Ainsi, lymphoprolifrations malignes induites par EBV et complications de linfec-
tion par CMV sont les deux principales causes de mort par infection des immunodprims.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 109/307
3.2.6 Diagnostic de linfection par EBV et de la mononuclose
infectieuse au laboratoire
1. Diagnostic direct. Lisolement du virus dans la gorge ou dans les globules blancs est impra-
ticable en virologie courante car ce virus ne se multiplie in vitro que dans les lymphocytes,
lymphocytes B, et sans donner deffet cytopathique.
Lisolement du virus se fait par un test de transformation de lymphocytes de sang de cordon ombilical en cel-
lules lymphoblastodes par inoculation de lymphocytes ou de salive du patient. Les lymphocytes de sang de cor-
don (prlev la naissance) sont incapables de se maintenir, de se multiplier en culture in vitro tant quils sont
vierges de toute infection par le virus E-B (cest le cas du nouveau-n donneur de ces lymphocytes). En re-
vanche, sous leffet de linfection par le virus E-B, ces lymphocytes acquirent la proprit de se multiplier in-
dfiniment sous forme de cellules lymphoblastodes immortelles (comme une ligne cellulaire continue de type
KB). Do le nom de test de transformation.
Il est plus facile de dtecter le gnome du virus par PCR.
2. Diagnostic indirect. Cest le srodiagnostic spcifique de lEBV. Il est possible de titrer les
anticorps anti-EBV, mais llvation du titre de certains dentre eux chappe souvent aux in-
vestigations du fait que la mononuclose infectieuse dbute trs progressivement : ainsi les
anticorps VCA (contre lantigne de la capside virale) sont en gnral leur titre maximal
(au plateau) dans le premier srum, et on ne peut donc plus observer dlvation de titre
lexamen comparatif des 2 srums. Cependant, il existe dautres anticorps antivirus E-B, les
anticorps EBNA (contre un antigne nuclaire) dapparition beaucoup plus tardive.
Ainsi, la prsence dans le srum danticorps VCA sans anticorps EBNA voque une pri-
mo-infection rcente. Ce qui est confirm par la mise en vidence danticorps VCA de la
classe des IgM.
3. Application au diagnostic de la mononuclose infestieuse EBV. Il repose sur la recherche
des anticorps htrophiles par MNI test et sur le diagnostic indirect : IgG VCA+et IgG
EBNA-, avec confirmation par IgM VCA+. Le diagnostic diffrentiel de la mononuclose
EBV est pour lessentiel le syndrome mononuclosique de la primo-infection CMV ou sur-
tout HIV, et aussi la toxoplasmose.
4. Application aux lymphoprolifrations B induites par lEBV chez les immunodprims.
Pour les prvenir, on saide de la quantification du gnome viral par PCR dans les lympho-
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cytes sanguins : pass un certain seuil, on craint la constitution dun lymphome B, quon sef-
force dviter en rduisant, si possible, limmunodpression (diminution du traitement anti-
rejet de greffe, au risque de perdre le greffon; correction du dficit en lymphocytes CD4+
dun malade du SIDA, en optimisant le traitement anti-rtroviral). Ce seuil
dintervention est en cours de dtermination, sachant que la simple positivit de la PCR
dans ces lymphocytes sanguins est normale (1lymphocyte infect sur 10
6
, environ).
3.2.7 LEBV, outil de laboratoire
Il sert immortaliser les lymphocytes B de sujets atteints de maladies gntiques intressantes
explorer.
3.2.8 Points importants
LEBV est un Herpesviridae lymphotrope.
Dans la majorit des cas, la primo-infection survient dans lenfance et est asymptomatique,
comme pour le CMV.
Quand elle survient tardivement chez ladulte, elle donne dans 1 cas sur 2 la mononuclose
infectieuse (MNI).
Le virus infecte de manire complte, lytique, les cellules pithliales du pharynx et des glan-
des salivaires, avec excrtion de virus dans la salive. Il infecte les lymphocytes B, mais de
faon abortive, provoquant une prolifration polyclonale des lymphocytes B. Celle-ci induit
une rponse immunologique faite dune prolifration polyclonale des lymphocytes T CD8+
qui la contrle et qui est la responsable du syndrome mononuclosique. Le virus persiste
vie dans les lymphocytes B sous forme dADN gnomique, donnant une infection latente,
abortive et immortalisant ces cellules.
La MNI associe des signes cliniques (fivre, asthnie, angine et adnopathies) et des signes
biologiques non spcifiques (syndrome mononuclosique, cytolyse hpatique et anticorps h-
trophiles).
La MNI est une lymphoprolifration B EBV-induite bnigne contrle par les lymphocy-
tes T
En cas dimmunodpression portant sur les lymphocytes T, la lymphoprolifration B in-
duite par lEBV se trouve incontrle et peut aboutir un lymphome B non-hodgkinien,
malin.
Au cours dune primo-infection rcente, le diagnostic biologique repose sur la mise en vi-
dence danticorps anti-EBV IgM et IgG VCA (viral capsid antigen), sans anticorps anti-
EBNA (nuclear antigen). Le MNI-test est trs utile au diagnostic de la mononuclose infec-
tieuse en pratique mdicale courante, mais il nest pas toujours positif au dbut de la maladie.
Les 4 principaux agents responsables de syndrome mononuclosique sont lEBV, le CMV,
lHIV et Toxoplasma Gondii.
LEBV est associ au lymphome de Burkitt et au carcinome nasopharyng.
Lymphome B non-hodgkinien li lEBV et pneumonie CMV sont les deux principales cau-
ses de mort par infection des personnes immunodprimes, tels les malades du SIDA ou les
Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 111/307
greffs dorganes ou de moelle osseuse.
3.3 Herpsvirus humain type 6 ou HHV-6
Dcouvert dans le sang de sujets immunodprims (SIDA notamment) il se multiplie dans les lym-
phocytes T CD4+en culture de cellules, avec un effet cytopathique marqu. Il est largement rpan-
du dans la population. La primo-infection survient le plus souvent entre 6 mois et 2 ans, et est le
plus souvent asymptomatique. En dehors de la 6
e
maladie (ruptive) ou exanthme subit du
nourrisson, elle est responsable dun tiers des convulsions fbriles de lenfant.
LHHV-6 est leucotrope, mais galement neurotrope, et hpatotrope. Chez les personnes immu-
nodprimes, il est lorigine dencphalites. Chez le greff de moelle, il est responsable, en plus
dencphalites, de syndromes fbriles accompagns dinsuffisance mdullaire, avec anmie. Il est
responsable dhpatites aigus, surtout chez lenfant, o il a t mis en cause dans des cas dhpa-
tite fulminante. Ces divers tropismes le rapprochent donc du CMV et de lEBV.
LHHV-7, proche de lHHV-6, trs largement rpandu, parait orphelin de maladie.
3.4 Herpsvirus humain type 8 ou HHV-8
Identifi initialement par des fragments de squence gnomique, ce nouvel herpsvirus apparat
proche du virus Epstein-Barr. Il est associ la maladie de Kaposi (appele autrefois sarcome de
Kaposi), que celle-ci soit ou non associe linfection HIV. On le trouve aussi dans deux mala-
dies lymphoprolifratives rares: le lymphome diffus des sreuses et la maladie Castleman. Ces as-
sociations voquent le rle causal du virus dans ces maladies.
Ce virus semble, pour une part du moins, transmis par voie sexuelle.
Le diagnostic repose sur la recherche des anticorps spcifiques et la recherche du gnome viral par
PCR.
Sa prvalence est de lordre de quelques% dans nos rgions, alors quil est beaucoup plus rpandu
en Afrique (prvalence de 50 % en Ouganda, avec acquisition avant la pubert) (revoir illus-
tration III-1 (voir page 96)). Chez le receveur de greffe de rein sropositif, sa ractivation du fait
de limmunodpression est cause de sarcome de Kaposi.
LHHV-8 est un virus opportuniste pathogne chez les personnes immunodprimes, greffs
dorganes, malades du SIDA.
Ainsi, deux herpsvirus se trouvent associs des prolifrations cellulaire potentiellement
malignes : lEBV et lHHV-8
Les Herpesviridae - 2me partie (CMV, EBV, HHV-6, HHV-7, HHV-8 et virus B du singe)
112/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
3.5 Herpesvirus simi ou virus B du singe
Cet Herpesviridae animal mrite dtre connu. Il dtermine chez le singe une maladie buccale ro-
sive banale, quivalent de lherps humain, bnigne pour cet animal. En revanche, sa transmission
accidentelle lhomme, par morsure ou manipulation au laboratoire de tissu infect, entrane une
encphalomylite constamment mortelle sans traitement. Do lintrt des animaleries contr-
les cet gard! Le virus est heureusement sensible, exprimentalement, lACV et plus encore
la DHPG (ganciclovir).
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 113/307
Chapitre 4
Rtrovirus humains - 1
re

partie (le VIH ou HIV)
4.1 Introduction : gnralits sur les
rtrovirus
Virus ARN monocatnaire, capside polydrique, enveloppe membranaire, les rtrovirus ont
en commun le fait que leur gnome doit tre transcrit en ADN par une ADN polymrase ARN-
dpendante (synthtisant lADN sur une matrice qui est lARN gnomique), autrement dit une
transcriptase inverse (TI ou RT pour reverse transcriptase en anglais). lADN proviral ainsi syn-
thtis sinsre dans lADN cellulaire par ses deux extrmits appeles LTR (pour long terminal
repeat =squences terminales redondantes). Linformation gntique virale se trouve intgre d-
finitivement dans le gnome cellulaire (archive), do elle sera exprime, comme celles des
gnes cellulaires, par lappareil de transcription de la cellule. Cette transcription cellulaire aboutit
la synthse de nouveaux gnomes viraux et dARN messagers viraux qui seront traduits en
protines: protines Gag (pour group antigen), protines Pol (pour polymrase virale =transcrip-
tase inverse, associe des activits de protase et dintgrase) et protines Env (la glycoprotine
de surface gp120 et la glycoprotine transmembranaire gp41 du HIV-1).
On compte parmi les rtrovirus: 1) des rtrovirus oncognes animaux, oncognes lents ou rapides
(cf premier cours) ; 2) les HTLV (cf cours suivant) ; 3) les lentivirus comportant les HIV ct
de virus animaux (virus du visna, virus des syndromes dimmunodficience du singe, du chat, du
buf).
4.2 LHIV ou VIH, virus de
limmunodficience humaine
La dcouverte de lHIV-1, sous le nom de LAV en 1983, revient Franoise BARR-SINOUSSI,
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
114/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
J ean-Claude CHERMANN et leurs Collgues Cliniciens, Virologistes et Immunologistes u-
vrant autour de Luc MONTAGNIER de lInstitut Pasteur. Le virus dcouvert lanne suivante
par Robert GALLO ntait autre que cette mme souche, reue de L. MONTAGNIER.
La plus ancienne souche caractrise rtrospectivement par PCR sur du matriel anatomique con-
serv remonte 1959. Daprs lhorloge molculaire, lHIV-1 serait apparu vers 1930, dun
passage lhomme dun virus de limmunodficience simienne du chimpanz (SIV
cpz
).
En 1986 un deuxime type dHIV a t dcouvert par lquipe de Virologie de lHpital Claude
Bernard sous la direction de Franoise BRUN-VZINET, et caractris par Franois CLAVEL de
lInstitut Pasteur comme HIV-2, en raison de diffrences sensibles dans la structure du virus.
LHIV-2 est trs proche du SIV
mn
, virus de limmunodficience simienne du mangabey
enfum (sooty mangabey, apparent aux macaques). Dans ce qui va suivre, il sera essentielle-
ment question de lHIV-1, le responsable de la pandmie actuelle de syndrome dimmunodficien-
ce acquise (SIDA).
Prcisons que la plupart des HIV-1 appartiennent au groupe M (pour most ), compos des sous-ty-
pes ou clades A K, le sous-type ou clade B tant le plus rpandu dans les pays occidentaux;
lAfrique, origine de lpidmie, tant le continent le plus riche en sous-types diffrents, avec des
recombinants entre sous-types (mosaques A/E, B/C, A/G par exemple). Le groupe O (pour
outlier) comporte des HIV-1 rares et surtout localiss en Afrique de lOuest, au Cameroun notam-
ment, trs diffrents des sous-types du groupe M.
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 115/307
4.2.1 Structure du virus
Il comporte, de lextrieur vers lintrieur, une enveloppe membranaire ou pplos dont la bicouche
lipidique provient de la membrane cytoplasmique et se trouve hrisse de spicules glycoprotiques.
Celles-ci comportent une partie interne, la gp41 ou glycoprotine transmembranaire (TM) et une
partie externe, la gp120 (SU pour surface).
La face interne de lenveloppe est tapisse dune matrice protique faite de la p17 (MA). La cap-
side virale en forme de cne tronqu est faite de p24 (CA). lintrieur se trouve lARN, entour
de la protine de nuclocapside (NC).
La transcriptase inverse (TI) ou RT pour rtro-transcriptase (ou en anglais reverse
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
116/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
transcriptase), qui intervient en dbut de cycle, est lintrieur de la capside, associe une int-
grase (IN, enzyme ncessaire lintgration de lADN proviral dans lADN cellulaire) et une
protase (PR). Ces 3enzymes sont des cibles potentielles pour la chimiothrapie antirtrovirale.
LARN viral se trouve en deux exemplaires, sans quon sache la raison de cette diplodie.
Le gnome viral (que lon analyse ici sous forme dADN proviral) comporte en plus des gnes
classiques de structure qui sont les gnes gag, pol et env, des gnes de rgulation qui ont un rle
essentiel dans le pouvoir pathogne du virus: parmi ces derniers tat, rev et nef ont t les premiers
tudis. Tous ces gnes de lHIV utilisent les 3 phases de lecture du gnome comme lindique leur
disposition en 3strates sur lillustration IV-1. Dautre part, pour utiliser au maximum les possibi-
lits dinformation du gnome, certains gnes fonctionnent avec un pissage des ARN messagers;
cest en particulier le cas de tat et de rev.
Certains gnes expriment leur information sous forme de prcurseurs polypeptidiques secondai-
rement clivs. Il en est ainsi de Gag et Pol dune part, et dautre part de gp120 et gp41. Le clivage
du prcurseur Gag-Pol, assur par la protase virale, est ncessaire laccomplissement du cy-
cle viral ; elle intervient en fin de cycle. En revanche, le clivage de la gp160, prcurseur des deux
glycoprotines denveloppe, en gp41 et gp120, est assur par des protases cellulaires.
Indiquons ds prsent que les 2 enzymes cibles des chimiothrapies antivirales actuelles sont la
rtrotranscriptase et la protase. Des antiviraux anti-intgrase sont en essais cliniques, et lon dis-
pose par ailleurs danti-gp41, inhibiteurs de la fusion-lyse.
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 117/307
4.2.2 Cycle de multiplication de lHIV au niveau de la cellule
Trois caractristiques sont mettre en avant :
1. lHIV a une affinit obligatoire pour les cellules portant la molcule CD4, qui vont rpliquer
le virus, mais il lui faut aussi trouver une 2
e
molcule cellulaire, le corcepteur (CXCR4 ou
CCR5). Il existe trois types de cellules cibles : les lymphocytes CD4+, les monocytes-macro-
phages et les cellules dendritiques.
2. un taux trs lev de mutations survient pendant la rtrotranscription.
3. le prognome ou ADN proviral, au-del de son intgration dans le gnome cellulaire par lin-
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
118/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
tgrase virale, est transcrit par lappareil de transcription de lhte, comme le seraient
dautres gnes cellulaires. Cependant cette expression du prognome viral est sous le con-
trle de facteurs cellulaires (le NF-kappaB par exemple) et viraux, ces derniers tant les pro-
tines de rgulation de lHIV, en particulier Tat et Rev...
4.2.2.1 Lattachement
Le cycle viral commence par lattachement des particules virales sur la cellule cible.
1. Rcepteurs et Corcepteurs. Lattachement est d une interaction trs forte entre la gp120
du ct viral et le rcepteur cellulaire qui est lextrmit de la molcule CD4 du ct cellulaire
(D. KLATZMANN, Piti-Salptrire et A.G. DALGLEISH, Chester Beatty labs, Londres).
De plus, lattachement du HIV exige, ct du rcepteur CD4, un corcepteur. Cest une mo-
lcule protique fauxfile dans la membrane cytoplasmique. Sur les monocytes-macro-
phages infectables par les souches monocytotropes (M-tropes), cest la molcule CCR5
(rcepteur des chimiokines RANTES, MIP1- et MIP1-) ; sur les lymphocytes T infectables
par les souches lymphotropes (L-tropes), cest la molcule CXCR4 (rcepteur de la chimio-
kine SDF-1) Revoir illustration IV-1 (voir page 115)
2. Fusion-Lyse. Les interactions de la gp120 avec le CD4 et le corcepteur induisent un chan-
gement de conformation de la gp120, avec clivage de cette molcule et, fait important, dga-
gement de la gp41 et arrimage de la gp41 dans la membrane cytoplasmique. Le
raccourcissement de la gp 41 (par repliement sur elle-mme, comme les baleines dun para-
pluie que lon referme) entrane le contact entre enveloppe virale et membrane cytoplasmique
avec, au niveau de la gp41, un phnomne de fusion-lyse qui cre un trou (pore). Cela intro-
duit, travers ce pore, la capside virale et son contenu dans le cytoplasme. Donc, la gp120 est
responsable de lattachement, et la gp41 de la fusion-lyse
3. Trois principales catgories de cellules sont infectes par le virus : les lymphocytes T
CD4+ mais aussi les cellules du systme monocytes - macrophages, ces dernires exprimant
la molcule CD4 un niveau moindre que pour les lymphocytes T CD4+, mais nanmoins
significatif, et les cellules dendritiques.
Linfection virale a sur les lymphocytes T CD4+ un effet ltal qui, dans les cas les plus d-
monstratifs, consiste en un ECP type de syncytiums et aboutit la mort des cellules. (Or les
lymphocytes T CD4+auxiliaires ont un rle essentiel dans la rgulation de lactivit des lym-
phocytes B et des lymphocytes T CD8+).
En revanche, monocytes et macrophages peuvent supporter sans ECP et sans dommage lin-
fection, constituant ainsi un rservoir pour les virus, mais aussi un vhicule pour infecter pr-
cocement, ds la primo-infection, divers compartiments de lorganisme, et en particulier le
systme nerveux central.
Dans les follicules lymphodes (qui sont le principal organe/tissu cible de linfection virale),
les cellules folliculaires dendritiques, lment architectural essentiel de ces follicules, cap-
turent les particules virales et les prsentent aux cellules lymphodes. un stade avanc de
linfection, les cellules folliculaires dendritiques sont dtruites, ce qui participe latrophie
finale des formations lymphodes au stade du SIDA.
Chez un individu infect, les souches virales sont monocytotropes (macrophagetrope) en d-
but dinfection, mais gnralement lymphotropes et de plus en plus cytolytiques lorsque lin-
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
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fection est volue.
4.2.2.2 La transcriptase inverse ou rtrotranscriptase (RT)
Une enzyme volage, et incorrigiblement infidle
Elle procde une opration complexe. En forme de main droite, elle reoit la matrice dARN
entre le pouce et la base des autres doigts. Cest l quest synthtis, en dbut de cycle, avec
comme matrice lARN gnomique, lADN proviral ou cDNA.
En outre, lenzyme fonctions multiples quest la RT assure la duplication de cet ADN, lhydro-
lyse de la matrice dARN, avec des oprations de transfert dADN, notamment pour produire les
deux LTR. La RT doit donc, de faon rpte, sattacher et se dtacher de lADN et de lARN viral,
avec un risque derreur par drapage (frameshift ) chaque r-attachement. Autrement dit, par n-
cessit, la RT papillonne, se montre trs infidle.
Comme par ailleurs la RT na pas de mcanisme de correction, une incorporation errone sur-
vient tous les 10000 nuclotides. Sachant que le gnome viral est fait de 10000 nuclotides, il faut
sattendre une mutation chaque cycle viral. Il en rsulte que la population virale est un m-
lange en quilibre instable de virus gntiquement diffrents mais voisins: on parle de quasi-esp-
ce, dessaim de gnomes viraux distincts, do vont merger les variants antigniques et les
mutants rsistants aux antiviraux.
Dautre part, un 10 milliards de virus composant la population virale sont renouvels tous les
2 jours par lorganisme infect (dure de vie moyenne des particules virales), et lon assiste,
grce ce turn over trs important et linfidlit de la RT, une drive de la population virale
au cours du temps, drive impose par les facteurs de slection que sont la rponse immunitaire et
la chimiothrapie antivirale.
De fait, on observe une drive progressive de la population virale vers la rsistance aux antivi-
raux, tout comme vers lchappement aux anticorps neutralisants et aux lymphocytes CD8+
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
120/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
anti-HIV, initialement produits en rponse la primo-infection. Cela est dautant moins vitable
quau dcours de la primo-infection, on part avec une population initiale dune dimension consi-
drable, linfection des formations lymphodes profondes et du systme monocytes- macrophages
reprsentant un norme rservoir de virus, trs suprieur ce quon pourrait imaginer en ne con-
sidrant que la virmie modeste de la priode de latence clinique. La plasticit de lHIV est re-
doutable. Cest particulirement le cas de la structure virale o se fixent les anticorps neutralisants,
la boucle V3 (V pour variable) de la gp120.
Cela rduit considrablement les possibilits de neutralisation efficace par les anticorps ou les CTL
du sujet infect ou de tout autre source. Cest un obstacle norme toute stratgie vaccinale.
Quant aux mutants rsistants aux antiviraux, ils sont slectionns inluctablement sous monoth-
rapie (traitement par un seul antiviral). Linfection par lHIV na pu tre contrle (avec rgression
des symptmes du SIDA et retour une infection asymptomatique) qu partir du moment o lon
a pu associer simultanment plusieurs antirtroviraux vis--vis desquels il ny a pas de rsistance
croise (c.a.d. des antirtroviraux slectionnant chacun des mutations de rsistance diffrentes).
4.2.2.3 Un mcanisme complexe de rgulation
Lexpression du cDNA proviral est soumise un mcanisme complexe de rgulation, pas encore
totalement lucid.
Le LTR nest pas quun site dinsertion de lADN proviral dans le gnome cellulaire. Cest aussi
le site dattachement de lARN polymrase cellulaire, o sinitie la transcription. Le LTR est sen-
sible diffrents facteurs de transcription, certains viraux comme les protines Tat et Rev,
dautres cellulaires comme le facteur nuclaire B (NF-kappaB).
Ce NF-kappa B est activ par des mitognes, des cytokines ou par la surinfection par un autre
virus; il se fixe alors sur un site spcifique du LTR.
Quant la protine Tat, elle se fixe non pas sur le LTR mais proximit, sur la structure en pingle
cheveux marquant en 5 le dbut de tous les messagers viraux prcoces dont elle stimule la
synthse par un facteur de x 50. Rev intervient plus tard sur les messagers tardifs traduits en
prcurseurs des protines de structure: prcurseur Gag-Pol, autocliv par la protase virale, pr-
curseur Env, cliv par des protases cellulaires. Le rle des autres facteurs viraux rgulant la trans-
cription est moins bien connu.
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 121/307
4.2.3 La multiplication virale au niveau de lorganisme
Lorgane cible principal est constitu par les formations lymphodes, mais le cerveau peut tre
galement un organe cible. Linfection volue en 3 phases: primo-infection, phase asymptomati-
que et SIDA
1. Le virus est transmis par les rapports sexuels homo ou htrosexuels ou par transfusion
avec du sang de sujet infect ou par change de seringue chez les drogus. La transmission
materno-infantile qui selon les tudes frappe 10 40% des enfants de mre infecte survient
en fin de grossesse et laccouchement. Le virus peut tre transmis par le lait quand la mre
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
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nourrit son enfant, surtout si elle est en phase de primo-infection. La transmission sexuelle de
cette MST se trouve facilit par la multiplicit des partenaires et par la prexistence des l-
sions gnitales rosives telles quen donnent les autres MST.
[Lutilisation dun spermicide tel que le nonoxylol (ou N9), pour prvenir lacquisition de lHIV, la, au contrai-
re, facilite, cela par altration de la muqueuse vaginale, de sorte que la recherche de nouveaux microbicides met
laccent sur leur innocuit pour les muqueuses, autant que sur leur activit virucide.]
Donc, transmission par les 3S sang, sexe et seringue, transmission mre-enfant, comme
pour lHBV mais, contrairement lHBV et fort heureusement, pas de transmission sous
le toit par simple cohabitation. La salive est considre comme non contagieuse et le virus
nest pas transmis par les insectes hmatophages (moustiques ou punaises). Ainsi les jeunes
qui ont chapp la transmission mre-enfant prinatale restent labri de linfection jusqu
lge des rapports sexuels et des scarifications rituelles.
La contamination professionnelle des soignants, par piqre accidentelle, est rare mais existe
(risque de 0,3%) et lon a dnombr prs de 100 de par le monde. Le risque est bien moindre
que pour la transmission professionnelle de lHBV avant la vaccination anti-HBV (rappelez-
vous la rgle des 3 : le risque moyen dinfection est de 30%, 3%, 0,3% et 0,03% pour, res-
pectivement, un accident dexposition au sang HBV+, HCV+, HIV+et pour une exposition
sexuelle lHIV).
On attribue actuellement un rle important aux cellules dendritiques au site dinoculation
muqueux. Ce sont ces cellules qui fixent le virus et qui le transportent aux organes lympho-
des. Cette fixation se fait par un rcepteur, une lectine appele DC-SIGN.
2. La primo-infection
Elle est symptomatique une fois sur deux environ, pouvant associer de la fivre, des ad-
nopathies avec angine, ruption, mningite, voire encphalite. Un syndrome mononuclosi-
que peut tre le signe dune primo-infection HIV. Donc un syndrome parfois proche dune
mononuclose infectieuse (MNI). Tous ces signes vont rtrocder.
Cependant, cette phase est marque par un premier pic, trs lev, de virmie (antignmie
p24 positive et nombreuses copies dARN viral dans le plasma) (revoir illustration IV-4
(voir page 121)), linfection stablit dans les ganglions lymphatiques, le virus y tant ap-
port par les ramifications des cellules folliculaires dendritiques. Cest l que les deux princi-
pales catgories de cellules cibles, les lymphocytes T CD4+et les monocytes-macrophages
viennent sinfecter par le virus. Au stade du SIDA, qui survient en moyenne aprs 10ans
dvolution, le rseau des cellules folliculaires dendritiques est dtruit et les virus sont relar-
gus dans la circulation.
La consquence la plus frappante de linfection HIV est la baisse des lymphocytes T CD4+
telle quon lobserve dans le sang. Elle survient dj durant la primo-infection, puis se corrige
partiellement en mme temps quapparaissent les anticorps neutralisants et les lymphocytes
T CD8+cytotoxiques spcifiques du virus. Puis durant la phase de latence clinique la baisse
des lymphocytes T CD4+procde lentement pour sacclrer lors du passage au stade de SI-
DA.
3. SIDA. Le passage des lymphocytes T CD4+circulants sous la barre des 200/mm
3
de sang
(normale =1000), marque lentre dans le SIDA, en moyenne aprs 10ans dvolution. Le
rseau des cellules folliculaires dendritiques est dtruit, et avec lui les centres germinatifs des
formations lymphodes, tandis que les virus sont relargus dans la circulation: lantigne p24
rapparat, avec titre nouveau lev de virus dans le plasma ou les lymphocytes sanguins
priphriques, et en miroir une baisse des anticorps anti-p24. Cette phase de multiplication
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 123/307
virale incontrle est aussi celle o les souches de virus rsistant aux antiviraux deviennent
prdominantes. Le SIDA est caractris par la survenue dinfections opportunistes, dune
encphalite HIV (marque par un tat de dmence), ou de noplasies dont il existe 3 varits
lies 3catgories de virus: une maladie de Kaposi extensive (HHV-8), des lymphomes B
(EBV), des cancers anognitaux et notamment des cancer du col extensif (HPV-16 et 18).
4. Soulignons le fait que la priode asymptomatique, qui spare primo-infection et SIDA,
nest pas une priode dinfection virale latente : le taux de lymphocytes T CD4+sanguins
ne retrouve pas son niveau initial et, si lantigne p24 a gnralement disparu, la virmie nest
pas supprime: persistance de lymphocytes sanguins circulants infects et de molcules
dARN viral dans le plasma. Dailleurs, durant cette phase dinfection cliniquement asymp-
tomatique, la transmission au partenaire sexuel, ou la transmission par transfusion ou chan-
ge de seringue sont malheureusement possibles.
5. Chez lenfant, on distingue deux formes cliniques : la forme prcoce et rapide, minoritaire,
menant en quelques mois la mort dans un tableau dencphalopathie subaigu et lie une
infection in utero ; la forme majoritaire, lie une infection en fin de grossesse ou laccou-
chement, et de symptomatologie tardive, proche de celle de ladulte.
Actuellement, dans les pays en voie de dveloppement, la forme lie une infection en fin de
grossesse est majoritaire mais, dans les pays qui ont accs la prophylaxie de la transmission
materno-ftale de lHIV par utilisation des antirtroviraux en fin de grossesse, la forme con-
tamination in utero est pratiquement maintenant exclusivement observe mais elle est relati-
vement peu frquente.
4.2.4 pidmiologie
Les premiers cas de SIDA reconnus a posteriori sont, semble-t-il, ceux dune famille de marins
norvgiens (1960).
Cependant, le berceau de lHIV-1 est lAfrique intertropicale, qui reste la zone la plus touche avec
une estimation denviron 28millions de sujets infects. La transmission y est essentiellement h-
trosexuelle et materno-infantile. Dans les mgapoles du monde occidental, les homosexuels et les
toxicomanes usant de la voie veineuse ont jou un rle important dans linitiation de lpidmie.
Partout, la prostitution sans protection est un facteur de risque. Ainsi lAmrique du Sud et lAsie
du Sud-Est, et lEurope de lEst prennent le chemin menant une situation de type africain.
On estime actuellement prs de 40 millions le nombre de sujets infects, avec 16 000 nouveaux
cas par jour (1200 nouveau-ns par jour), dont 95 % au moins dans le Tiers Monde. Dans cer-
taines zones de lAfrique, plus de 30% des sujets sont infects. En labsence de vaccin prvisible
court terme, on ne peut freiner lextension catastrophique du SIDA que par des modifica-
tions comportementales (qui ont suffit faire rgresser lpidmie en Thalande et en Ougan-
da).
4.2.5 LHIV-2
LHIV-2 a pour particularit dtre lorigine localis la partie Ouest de lAfrique noire, davoir
un potentiel pidmique moindre que lHIV-1 et dvoluer plus lentement vers le SIDA. Du point
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
124/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de vue phylognique, lHIV-2 est plus proche du virus de limmunodficience du singe (SIV)
que ne lest lHIV-1. Il existe des ractions antigniques croises entre les 2types dHIV, notam-
ment pour la protine de capside, p24 pour lHIV-1 et p26 pour lHIV-2, mais pas pour lenvelop-
pe, gp120 et gp 41. Sa sensibilit aux antirtroviraux diffre de celle de lHIV-1 (insensibilit aux
INN et au T20), do limportance de ne pas les confondre.
4.2.6 Diagnostic virologique et suivi au laboratoire de
linfection VIH
Revoir illustration IV-4 (voir page 121)
4.2.6.1 Dpistage
1. Indications et principes
Le dpistage de linfection est dans notre pays volontaire mais largement propos et tou-
jours prescrit par un mdecin, mdecin, gnraliste, spcialiste, ou travaillant dans un centre
de dpistage anonyme et gratuit. Le dpistage est obligatoire pour don du sang, dorgane de
tissu ou de sperme. La confidentialit de lexamen est requise pour garder la coopration des
sujets infects, sans laquelle on ne saurait lutter efficacement contre une maladie sexuelle-
ment transmissible mortelle.
Le dpistage de linfection repose sur la recherche des anticorps par ELISA, avec confirma-
tion par Western blot. En France lELISA est fait en double test chez les sujets sinquitant
de leur tat, mais en simple test chez les donneurs de sang. Il sagit dELISA mixte , cest-
-dire dcelant les anticorps anti-HIV-1 et anti-HIV-2.
2. Dpistage des anticorps par ELISA
Il met en jeu un mlange dantignes viraux, initialement extrait de culture cellulaire infec-
te, maintenant constitu de protines recombinantes. En tant que test de dpistage, cet ELISA
se doit de ratisser largement et il donne de fait quelques faux positifs (0,5% dans la po-
pulation gnrale), de sorte que tout rsultat positif ou douteux (discordance entre les
2ELISA par exemple) exige un contrle par Western blot HIV-1 et un 2
e
prlvement de
srum, indispensable pour parer toute erreur dtiquetage sur le premier prlvement, comp-
te tenu de la gravit du diagnostic.
3. Confirmation par WESTERN BLOT
On oppose au srum du sujet les principaux antignes viraux spars les uns des autres par
lectrophorse et disposs en bandes sur une languette de nitrocellulose. On dclare le Wes-
tern blot positif quand le srum du sujet contient des anticorps rendant visibles au moins
deux bandes, correspondant soit 2 des 3 glycoprotines virales (gp160, 120 ou 41), soit
la p24 et la gp160 (dbut de sroconversion). Un Western blot douteux, anticorps anti-
p24 isols par exemple, oblige un nouveau test 3 semaines plus tard et un Western blot
HIV-2 car cette situation peut correspondre 3ventualits: un dbut de sroconversion
qui se compltera en 3 semaines, une positivit en HIV-2, ou le plus souvent une raction
non spcifique (non lie lHIV).
4. Dtection de lantignmie P24
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
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Elle se fait en ELISA. Son intrt actuel est le diagnostic avant la sroconversion des anti-
corps en ELISA ou Western blot. Celle-ci apparat 6 8 semaines aprs le contage, laissant
avant elle une priode o labsence danticorps concide avec le pic de virmie de primo-in-
fection. Lantignmie p24 est prescrite chaque fois quaprs un contage possible on craint de
se trouver dans cette priode. Cela ne dispense pas de rechercher lapparition des anticorps en
ELISA, avec un dernier test 3 mois aprs le contage possible.
5. Dtection de LARN VIRAL par PCR
Plus sensible que la dtection de lantignmie p24, elle tend remplacer celle-ci.
4.2.6.2 Isolement du virus en culture de cellules
Cest un examen de principe simple mais dexcution fastidieuse
[Il est effectu dans un laboratoire de scurit P2 accs contrl. Le virus est recherch soit partir du plasma, soit
partir des cellules mononucles sanguines (PBMC pour peripheral blood mononuclear cells). On inocule ces pr-
lvements des PBMC de donneurs sains pralablement stimuls par la phytohmagglutinine (PHA) et cultivs en
suspension. La multiplication du virus dans cette culture est dtecte par lapparition dans le surnageant de lantigne
p24 de lHIV-1 ou plus universellement par lapparition dune activit rtrotranscriptase. On maintient la culture en
bon tat (sans souillure) pendant 3 4semaines, en changeant rgulirement le milieu de culture et en ajustant la den-
sit de PBMC. La recherche dune virmie partir des PBMC de patients (virmie cellulaire) est presque toujours
positive tandis que la virmie plasmatique nest rgulirement positive quaux stades avancs de linfection, SIDA
et prSIDA]
Les principales indications de lisolement en culture de PBMC sont restreintes 1) aux cas dinfection atypique en
ce qui concerne les rsultats des examens biologiques, la clinique ou lpidmiologie; 2) la mise en place et le suivi
de certains essais cliniques pour lobtention de la souche en vue de ltude de la sensibilit des souches aux antiviraux.
4.2.6.3 Virologie molculaire
Les techniques damplification de squences nuclotidiques, dont la PCR, ont pour avantage
de se faire sur des prlvements inactivs et non dangereux, de donner des rsultats en un ou deux
jours, de se prter une automatisation et surtout dtre trs sensibles. La PCR ADN, sur les PBMC
du patient ( la recherche de lADN proviral intgr), est rgulirement positive. La PCR ARN sur
le plasma ( la recherche du gnome viral) est elle aussi rgulirement positive. Elle comporte une
tape initiale de rtrotranscription (faite avec une RT de virus murin, et lon parle donc de RT-
PCR), ce qui en complique lexcution. Elle peut tre qualitative ou quantitative.
Il existe des substituts la PCR ARN quantitative, appels technique de lADN branch et NAS-
BA, et permettant une quantification de lARN gnomique.
Toutes ces techniques sont dexcution dlicate avec un risque de faux ngatifs mais surtout de
faux positifs en raison des contaminations possibles, du fait que les PCR multiplient par un facteur
dun million le nombre de copies dADN ou dARN contenues dans le prlvement, ce risque de
contamination tant la contrepartie dune telle sensibilit.
Cela tant, une amlioration considrable de la pratique mdicale est intervenue depuis juin 96
avec la mise disposition de tous les laboratoires de virologie de trousses de quantification de
lARN viral plasmatique, par RT-PCR, ADN branch ou NASBA. Elles permettent de dtermi-
ner la charge virale , cest--dire le nombre de copies dARN viral par mL de plasma. Plus ce
nombre est lev, plus linfection volue rapidement vers le SIDA. Dsormais, une dtermina-
tion de la charge du plasma en ARN viral est propose en pratique mdicale courante de faon sys-
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
126/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
tmatique (en France du moins) raison de 1 2 tests par an chez les sujets asymptomatiques non
traits et raison de 2 4 tests par an chez les sujets sous traitement antiviral.
4.2.6.4 Indications des examens
En rsum, les indications des examens virologiques de lHIV sont les suivantes :
1. Le dpistage de linfection de ladulte. Ce sont 1) deux tests ELISA pour dtection danti-
corps anti- HIV-1 et 2 sur un srum; 2) en cas de rsultat positif ou douteux, confirmation
par Western blot sur le mme srum; et 3) vrification du test ELISA positif ou douteux
sur un 2
e
prlvement de srum, que le Western blot soit positif ou ngatif, cela pour deux
raisons: se mettre labri dune part dune erreur dtiquetage du 1
er
srum et dautre part
dun dbut dinfection, vu que lELISA se positive avant le Western blot. Ce dpistage est
systmatiquement propos, gratuitement, aux femmes enceintes (1/3 des femmes sropositi-
ves en France ont t dpistes loccasion dune grossesse).
Le dpistage est insuffisamment pratiqu, mme en France!
Linfection y est dcele une fois sur deux au stade SIDA, ce qui augmente dun facteur 16 le risque de mort
dans les six premiers mois du traitement, par rapport aux rsultats, favorables, dun traitement prcoce.
Tout diagnostic de MST ou tout comportement risque doit mener la prescription du dpis-
tage HIV ; et tout diagnostic dinfection par HIV doit mener la prescription dun dpistage
HBV et HCV, tant sont frquentes les co-infections HIV+HBV ou HIV+HCV (10 et 20% des
infections HIV, respectivement), auquel il convient maintenant dajouter TPHA et VDRL,
pour la syphilis.
2. Les dons du sang, mme dmarche, si ce nest quun seul test ELISA est requis (cest ainsi !).
Un dpistage des donneurs risque est effectu auparavant par un entretien mdical appro-
fondi, aussi important que le test lui-mme. En rapprocher le dpistage chez les personnes
donneuses de tissus, de sperme, de lait, dorgane.
3. Un syndrome vocateur de primo-infection : ELISA sur 2srums, avec recherche dantig-
nmie p24 et, de plus en plus, dARN viral dans le plasma.
4. Le suivi individuel dun sujet infect, sur :
la charge plasmatique en ARN viral plasmatique, 1 4 fois par an
la dtermination de la sensibilit de la souche aux antiviraux avant mise en route et
en cas dchec du traitement (charge virale restant ou redevenant leve) :
la caractrisation phnotypique par calcul de la concentration inhibitrice 50% de
lantiviral test (CI 50%) nest pas pratique car fastidieuse.
cest donc la caractrisation gnotypique par squenage des gnes impliqus (RT
et protase) la recherche de mutations de rsistance
5. Le dpistage de linfection du nouveau-n ; lELISA pour dtection danticorps HIV est
sans valeur (anticorps HIV maternels transmis) et lon doit rechercher le virus par PCR ADN
dans les PBMC ou RT-PCR ARN dans le plasma.
6. Pour un accident dexposition du sang (AES), recherche des anticorps HIV par ELISA de
toute urgence chez la personne source pour dcider dun traitement antirtroviral adapt de
la personne accidente, le plus vite possible.
(on dit dans les 4 heures, mais dans lheure, cest encore mieux, et possible, grce aux tests rapides sur bandelette
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vus plus bas; dautre part, si la personne accidente a tard consulter, le traitement dans les 48 72heures,
bien que defficacit a priori limite, lui sera quand mme propos). On procde une recherche des anticorps
HIV chez la victime aussitt laccident et tous les mois pendant 3mois puis, par principe, 6mois (bien qu
3mois on puisse se sentir rassur).
AES est aussi labrviation daccident dexposition sexuelle (rupture de prservatif, par
exemple), o la dmarche est analogue.
A noter que pour le Tiers-Monde, o un automate ELISA est considr comme dentretien
trop complexe et trop cher, on utilise pour dtecter les anticorps HIV des tests plus simples
dexcution, tels des tests dagglutination (mme principe que le test au latex pour dtermi-
nations des anticorps CMV) ou des tests unitaires comme les savonnettes ou
bandelette utilisant limmunofiltration. On dveloppe aussi les recherches danticorps sur
salive ou urine pour viter les prises de sang.
4.2.7 Thrapeutique antivirale
(revoir illustration IV-2 (voir page 117))
Quatre classes de mdicaments se rpartissent sur les trois cibles que sont la RT, la protase et
lenveloppe: 1) les analogues de nuclosides inhibiteurs de la rtrotranscriptase (INTI ou NRTI,
pour nucleoside reverse transcriptase inhibitors ou simplement IN), 2) les inhibiteurs non nuclo-
sidiques de la rtrotranscriptase (INNTI ou NNRTI pour non nucloside reverse transcriptase
inhibitors ou INN), 3) les inhibiteurs de la protase (antiprotases, IP ou PI, pour protease
inhibitors) et 4) les inhibiteurs dentre (le chewing gum dans la serrure, selon ma collgue H-
lne Peigue-Lafeuille, de Clermont Ferrand), de deux sortes: les inhibiteurs de la fusion, cibls sur
la gp41, comme le T-20 ou enfuvirtide (se fixant sur la gp-41, ils en empchent le repliement), et
les agonistes des corcepteurs, avec notamment ceux agissant au niveau du CCR5 (revoir il-
lustration IV-2 (voir page 117)).
1. Le premier antirtroviral a t lazidothymidine (AZT).
Cest un 23 didsoxynucloside dont la forme triphosphate (AZT-TP), obtenue in vivo par
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laction de kinases cellulaires, interagit avec lADN polymrase virale, cest dire avec la
transcriptase inverse ou rtrotranscriptase (TI ou RT). Il en rsulte, ou bien une inhibition de
cette enzyme, ou bien une incorporation de lAZT avec arrt de chane au niveau de lADN
viral naissant. Cela tient au fait que lAZT, en tant que didsoxynucloside, manque de ra-
dical 3OH pour accrocher de nouveaux nuclotides. LAZT est administre par voie orale
la dose de 600mg par jour chez ladulte.
La concentration dans le LCR est la moiti de la concentration plasmatique et des doses de 1200mg par jour
sont ncessaires pour les formes neurologiques du SIDA.
Un succs marquant de lAZT a t la rduction de deux tiers de la contamination materno-
ftale, cela par un traitement pre-, per- et post-partum.
Des rsistances lAZT sont slectionnes. On les dfinit sur un plan thorique par une aug-
mentation des concentrations inhibitrices 50% ou 90%. Elles sont lies des mutations por-
tant sur la transcriptase inverse elle-mme, certaines bien rpertories telles la mutation au
niveau de lacide amin 215 (de thronine en tyrosine). On souponne lapparition de ces mu-
tations de rsistance sur la remonte de la charge virale en ARN plasmatique ou sur son
maintien un niveau lev, cela malgr une bonne observation du traitement par le patient.
On les objective, en pratique, par le squenage du gne de la RT.
2. Dautres 23 didsoxynuclosides anti-HIV sont apparus: la ddC pour 23 didsoxycyto-
sine, la ddI pour 23didsoxyinosine, la d4T pour didhydro dsoxythymidine, la 3TC pour
23 didsoxythiacytidine, la FTC, voisine de la prcdente, et labacavir.
Leur cytotoxicit est diffrente: principalement anmie pour lAZT, neuropathies priphri-
ques pour la ddC et la d4T, pancratite pour la ddI. Ces effets secondaires sont attribus une
inhibition de lADN polymrase des mitochondries, inhibition quon ne trouve pas avec la
3TC et la FTC qui sont donc particulirement bien supportes.
Une fonte de tissu adipeux est observe (lipoatrophie) chez un pourcentage lev de patients,
par lutilisation des nuclosides. Do la recherche de drivs moins toxiques pour les
mitochondries: cest le cas dun analogue de nuclotide appel tnofovir.
A noter que certains de ces analogues de nucloside ou de nuclotide sont actifs galement
sur lADN polymrase du virus de lhpatite B (HBV), ce qui est dun grand intrt, vu la
frquence des co-infections HIV+HBV : cest la cas de la 3TC, de la FTC et du tnofovir.
3. Sur la rtrotranscriptase peuvent agir aussi des inhibiteurs non nuclosidiques (INNTI ou
NNRTI pour non nucloside reverse transcriptase inhibitors). Certains sont des benzodiaz-
pines. Les principaux sont la Nvirapine et lEfavirenz.
Ils sont cibls trs prcisment sur une petite poche hydrophobe situ au-dessous du site catalytique de la rtro-
transcriptase, la jonction du pouce et des autres doigts. Leur inclusion dans cette poche fait perdre la RT
sa mobilit, indispensable son fonctionnement car la main doit alternativement souvrir et se refermer pour
admettre les nuclotides et expulser les radicaux pyrophosphates. Ce ciblage trs prcis les rend actifs doses
nanomolaires (les nuclosides le sont doses micromolaires), ce qui a malheureusement une contrepartie.
Cest la slection rapide de mutants rsistants (avec rsistance croise pour toute la classe des NNRTI), pouvant,
en cas de monothrapie, apparatre en quelque jours de traitement seulement. Une mutation de rsistance suffit
pour augmenter considrablement la CI50 et lon parle donc dune barrire gntique basse des INN la r-
sistance. Ils doivent donc imprativement tre utiliss lors de triples combinaisons.
4. Les antiprotases : une autre famille danti-HIV a pour cible la protase, donc une cible si-
tue, non pas au dbut du cycle virus comme pour les IN ou les INN, mais en fin du cycle,
tardivement, lors de la maturation de la particule virale. Il en rsulte la production de par-
ticules virales non infectieuses.
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
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Huit antiprotases sont actuellement disponibles: le saquinavir, le ritonavir, lindinavir, le
nelfinavir, lamprnavir, le lopinavir, latazanavir, et le tipranavir.
Ces molcules ont toutes t synthtises, non par criblage (screening), mais par modelage
molculaire sur le site actif de la protase. Ainsi, troitement adaptes leur cible, elles agis-
sent elles aussi doses nanomolaires. Elles ont heureusement un barrire gntique haute la
rsistance: celle-ci napparat gnralement quaprs accumulation dun nombre lev de
mutations de rsistance. Elles entranent des effets secondaires gnants, notamment digestifs
et mtaboliques (lipohypertrophie, hyperlipidmie, diabte) et donnent des interactions avec
nombre de mdicaments, positives ou ngatives selon les cas. Une interaction positive est ap-
parue intressante: de faibles doses de ritonavir renforcent (boost en anglais) la concentration
sanguine (laire sous courbe) des autres IP, et leur sont donc quasi systmatiquement
associes; on parle dIP/r.
En tout cas, en association avec les nuclosides, les IP/r ont donn des rsultats spectacu-
laires chez 80% des sujets avec chute de la charge plasmatique en ARN viral, remonte du
taux des lymphocytes T CD4+de 100/mm
3
ou plus, avec dans certains cas disparition des
symptmes de SIDA (retour la phase asymptomatique).
5. Le T-20, utilisable seulement par voie parentrale, est rserv aux personnes infectes par une
souche dHIV-1 multirsistante; toutefois, son action inhibitrice au tout dbut du cycle vi-
ral fait envisager son utilisation en urgence en cas daccident de contamination (AES)
6. En dveloppement, on trouve actuellement
des inhibiteurs dentre du virus fonctionnant comme agonistes des corcepteurs :
ce sont des substances synthtiques qui miment les chimiokines dont CCR5 et CXCR4
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
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sont les rcepteurs, de sortent quils entrent en concurrence avec lHIV et en barrent lac-
cs au CCR5 ou au CXCR4.
des inhibiteurs dintgrase.
7. Modalits du traitement
Notion essentielle : quelle que soit sa modalit, le traitement antiviral ne fait rien sur le
cDNA viral intgr dans le gnome cellulaire, qui persiste tant que vit la cellule. Or les lym-
phocytes CD4+ mmoire, qui comme les autres lymphocytes CD4+se trouvent infects, ont
une dure de vie trs longue et offrent un sanctuaire au virus. Donc lradication de linfec-
tion par traitement antiviral est illusoire et de fait il na, comme laciclovir sur linfection
par HSV, quune action suspensive : en cas darrt du traitement, la virmie, qui a pu
seffacer sous traitement, remonte invitablement.
La monothrapie a vcu. Dsormais le but du traitement est que la charge plasmatique en
ARN viral devienne indtectable ou du moins aussi basse que possible, cela par une asso-
ciation de trois antiviraux, pour viter lapparition de rsistances, qui est invitable en cas
de monothrapie. Deux types de trithrapie defficacit quivalentes sont prconises dans le
cas gnral : 2 IN + 1 IP/r ou 2 IN + 1 INN. Pour un traitement de sauvetage en cas
dchec, il arrive que lon donne des combinaisons de 4 ou 5 antiviraux,
mais cest l une dcision collgiale, prendre, comme pour un traitement anticancreux, par une quipe pluri-
disciplinaire qui considre les rsultats du squenage de la RT, de la protase, de la gp41, lhistorique des trai-
tements antrieurs, des effets secondaires, le dosage des antiviraux dans le plasma, et les desiderata du patient.
Une difficult est de dcider de la date de dmarrage du traitement : en raison de son effi-
cacit, en terme de survie et de contrle des symptmes, mais aussi en raison de son incapacit
radiquer linfection, on part pour un traitement qui durera des annes (le reste de la vie),
avec le risque inhrent deffets secondaires insupportables, menant invitablement larrt de
certains mdicaments et lchec du traitement.
Lindication du traitement, qui doit associer efficacit et tolrance au long cours, repose sur
le taux de lymphocytes T CD4+ en premier lieu (il faut intervenir imprativement bien avant
de descendre au taux fatidique de 200/mm
3
, mais on peut attendre tant quon est 350/
mm
3
), et en second lieu sur la charge virale (>100000 copies dARN/mL est assurment de
mauvais pronostic).
On a compar lvolution de linfection vers le SIDA un train fou roulant vers le prcipice, la distance au pr-
cipice tant proportionnelle au taux de lymphocytes CD4+, et la vitesse du train proportionnelle la charge vi-
rale. Ainsi, pour esprer remonter le taux des lymphocytes CD4+, on attend du traitement un freinage de la
charge de viral d1log aprs un mois de traitement et lindtectabilit de cette charge virale au bout de 6mois.
Dans votre pratique future, vous aurez vous reporter aux Recommandations du groupe
dexperts du Ministre charg de la Sant , remis jour tous les ans (comme ce gnial po-
lycopi).
Sachez que le traitement est indiqu lorsque lon assiste au dbut dune primo-infection
symptomatique, ou en cas daccident srieux dexposition du sang contamin.
Enfin, chez la femme enceinte et le nouveau-n, on a amlior la prvention de la transmis-
sion materno-ftale (TMF) en remplaant la monothrapie lAZT par une trithrapie. Ce
traitement antirtroviral est systmatique, quels que soient taux de lymphocytes CD4+et
charge virale.
Si la femme est dj sous traitement, celui-ci est poursuivi. Si, comme souvent, la grossesse est loccasion de
dcouvrir la sropositivit, le traitement est commenc demble si ltat de la mre le ncessite, sinon au
3etrimestre de grossesse. Dans tous les cas, une perfusion i.v. dAZT est mise en route ds le dbut du travail,
et lenfant reoit de lAZT par voie orale durant 6semaines.
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Ainsi ne naissent en France que 20enfants infects (1000par jour dans le monde). Mais il y
a lieu de craindre le risque de toxicit mdicamenteuse pour lenfant.
Quant la csarienne froid (c.a.d. hors indication obsttricale) visant, viter la trans-
mission du virus lenfant lors des contractions utrines et lors du passage dans la filire g-
nitale, elle ne serait prendre en considration quen cas dchec du traitement antiviral.
Dans le Tiers Monde, on a pu rduire de moiti la TMF par dose unique de nvirapine la
mre durant le travail et au nouveau-n, ce qui est un trs grand progrs peu de frais. Ce-
pendant, cette faon de faire slectionne invitablement des mutants rsistant la nvirapine,
de sorte que lon sefforce de faire bnficier les pays du Tiers Monde de tri-, sinon de bi-
thrapies. On sefforce aussi dviter lallaitement au sein, source de TMF post-natale, si tou-
tefois les conditions de vie dans la socit considre permettent un allaitement artificiel sans
danger.
4.2.8 Prospective
1. Il serait bienvenu de terminer sur des perspectives optimistes. Les faits qui donnent actuelle-
ment quelques espoirs sont rares mais - souhaitons le- significatifs de progrs venir :
lexistence de rares patients asymptomatiques long terme, chez qui linfection remonte
plus de 10ans; de mme lexistence de rares sujets chappant linfection malgr un
comportement sexuel haut risque (pas de prservatif et partenaires infects). Dans cer-
tains de ces cas, on a pu retrouver une dltion dans le gne codant pour le CCR5.
la diminution des 2/3 du risque de transmission materno-ftale par traitement lAZT,
rien quen monothrapie. De mme la diminution de 80% du risque dinfection aprs
accident dexposition au sang contamin par le traitement lAZT rien quen monoth-
rapie.
lexistence dun modle animal -le chimpanz- chez qui linfection reste asymptomati-
que.
la publication de cas denfants infects la naissance mais ayant apparemment radiqu
le virus.
la perspective dantiviraux actifs sur de nouvelles cibles: inhibiteurs dentre agonistes
des corcepteurs et inhibiteurs dintgrase.
la rduction dans notre pays de la prvalence de linfection chez les usagers de drogues
par voie i.v., cela par une moindre pratique du partage des seringues.
2. Le succs des trithrapies dge pose ses propres questions :
1. Comment expliquer les checs qui concernent 20 % des trithrapies ? Il sagit avant
tout de dfauts dobservance (do limportance de la consultation initiale dexplica-
tion du traitement et du suivi de son acceptation), puis, consquemment, de la slection
de souches rsistantes au traitement Dsormais, la dtection des mutations de rsis-
tance est entre dans la pratique des pays riches. Elle repose sur le squenage des gnes
correspondant aux deux cibles de la chimiothrapie antirtrovirale actuelle: la trans-
criptase inverse (en dbut de cycle) et la protase (en fin de cycle). On dtecte les muta-
tions qui rendent inefficace tel ou tel antiviral, ce qui aide choisir le meilleur traitement
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
132/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
alternatif possible (cf http://www.hivfrenchresistance.org)
2. Les bons rsultats se maintiendront-ils long terme?
3. Les patients supporteront-ils longtemps un traitement trs astreignant ? Ils souffrent
deffets secondaires et ont des difficults dobservance bien comprhensibles.
4. On a donc renonc lradication du virus: ds quon arrte le traitement, mme aprs
des annes de succs (ARN viral plasmatique indtectable) la virmie rapparat.
5. La prolongation de lesprance de vie des patients oblige sintresser la co-infection
HIV + HCV (20% des infections par HIV en moyenne; 60 90% des usagers de dro-
gues par voie i.v. infects par HIV), les deux infections saggravant mutuellement. Do
le dpistage HCV systmatique chez les sujets HIV positifs avec ventuellement d-
cision de traiter linfection HCV. La co-infection HIV +HBV est galement dceler
(10% des infections par HIV en moyenne) et les personnes non infectes par HBV
sont vacciner imprativement contre ce virus. [La syphilis aussi fait partie des MST
associes rechercher systmatiquement, par TPHA et VDRL].
6. Le vaccin nest pas pour demain, car on ignore toujours quel mcanisme de dfense
immunitaire stimuler (sans risque dimmunopathologie), ni comment y parvenir effica-
cement.
7. Last but not least , les succs du traitement ne doivent pas banaliser linfection et d-
motiver les jeunes vis--vis des mesures comportementales de prvention.
3. En effet, le seul traitement reste la prvention, fonde sur lducation sexuelle : fidlit (r-
ciproque) et recours aux prservatifs, lun nexcluant pas lautre, bien au contraire, et cela
concernant htrosexuels et homosexuels. Cest lABC approach pour Abstinence-Be fai-
thful-Condom use, le C contrariant, comme prvisible, les fondamentalistes de toute obdien-
ce. Importance aussi de la lutte contre la toxicomanie et contre le partage de seringue.
4. La situation dans le Tiers Monde qui regroupe 95% des 40 millions de sujets actuellement
infects (avec prdominance fminine) est trs grave, du fait du dnuement de certains pays
(ni antiviraux, ni mme tests de dpistage).
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 133/307
Linfection ne fait que stendre en Afrique (prvalence dpassant 30 % dans certains
pays) en Asie, en Amrique du Sud, en Europe de lEst.
Toutefois, une politique de prvention de linfection fonde sur lducation en gnral dont
lducation sexuelle, a donn des rsultats encourageants en Ouganda et en Thalande, ainsi
quau Sngal. On ne dnoncera pas assez lenseignement officiel de certaines religions ou
sectes, dont lopposition irrationnelle lusage du prservatif est partout un trs grave
Quelques priorits sanitaires, leur perception - dcevante parfois - par le public,
nos mdias, nos dcideurs
Pr Jean-Marie Huraux, cours en DCEM-1, CHU Piti-Salptrire, Fvrier 2001
Nouveaux-ns infects par le HIV : 15 cas actuellement attendus par an en France, rsultat remar-
quable, d une prise en charge exemplaire, tant sociale que mdicale. Par ailleurs 1000 cas par
jour dans le Tiers Monde, mais est-ce que cela constitue une priorit qui puisse nous concerner ?
Risque thorique actuel dinfection par HIV aprs transfusion en France
a
: un cas pour 1.700.000
moins de 2 cas attendus par an, grce la mise en place, suite au scandale du sang contamin,
de la dtection des anticorps HIV et dun vritable entretien mdical avec don contre lavis
des experts, dcision ministrielle dy ajouter le dpistage gnomique, dpense supplmentaire de
200.000.000 F par an. Qute sans trve du risque nul, par et pour nos dcideurs. Aucun dpistage
HIV des dons du sang dans certaines rgions dmunies dAfrique, mais sommes-nous
concerns ?
Nouveau variant de m. de Creutzfeldt-Jakob : 9 cas franais ce jour. Pic ou dbut dune
importante pidmie ? Vraie question : on ne sait pas.
Tabagisme 60.000 morts en France (augmentation prvue pour les femmes). Doit-on condamner
la vente des cigarettes aux classes laborieuses, ses sympathiques commerces de proximit, ses uti-
les retombes fiscales ?
Alcoolisme chronique 25.000 morts par an. Naccusons pas labus de nos merveilleux crus,
"lesprit bire" et limmense talent de nos publicistes.
Suicides russis recenss : 12.000 par an en France. A ce jour, le malaise des personnes dpressi-
ves, des enfants abuss, inaptes au lobbying, na t lorigine daucun barrage routier.
8.000 personnes tues par an en 2001 sur les routes de France - ne comptons pas les handicaps
vie - 3.000 en Grande-Bretagne. Certains critiquent sans retenue un prtendu lobby national de
lautomobile, notre sens inn de la conduite sportive, notre admirable mpris pour la marchausse
et les faibles desprit respectueux du code de la route, the French panache. En 1999, dans un lan
de compassion pour les personnes blesses par ce cruel matraquage, 97 dputs, dont un professeur
en sant publique ex-ministre de la sant, demandent, par saisine, dabolir le projet de dlit de
grande vitesse.
Remue-mnage au Chteau : pas de risque dmontr de sclrose en plaque par vaccination
anti-hpatite B mais 1000 morts par hpatite B par an en France et 1.700.000 dans le monde
Application du principe de prcaution : rvision de nos modalits de vaccination. Dans le
Tiers Monde, nos ex-coloniss, candides, sinterrogent, et dsormais renclent la campagne mon-
diale dradication du virus lance par lOMS.
a. Le risque rsiduel dinfection aprs transfusion sanguine a t estim en 2003-2005 1 pour 1,7
millions de dons pour lHBV, 1 pour 2,6 millions de dons pour lHIV, 1 pour 6,5 millions de
dons pour lHCV.
Cours IV
Illustration 7/8
Ce monde est-il srieux ? La corrida, Francis Cabrel
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
134/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
obstacle la prvention du SIDA. Croire quon puisse la faire reposer sur la seule incitation
labstinence ou la fidlit (A ou B sans C) est de langlisme, association inconsciente
de stupidit et de mchancet.
Autre difficult, propre au Tiers Monde: lallaitement au sein est facteur de transmission
mre enfant post-natale de lHIV, mais son remplacement par un allaitement artificiel, si ce-
lui-ci est mal conduit, est cause de morts par dnutrition ou infections dorigine hydrique. La
misre sauto-entretient.
4.2.9 Points importants
Lorganisation du gnome et de la particule virale, avec les structures intervenant dans les tests dia-
gnostiques.
Le cycle de multiplication du virus, avec larchivage du gnome, et les diverses cibles de la chi-
miothrapie antivirale.
Le caractre volage et incorrigiblement infidle de la transcriptase inverse.
La variabilit gntique et antignique de lHIV et ses consquences sur le traitement.
Les cellules et organes-cibles de linfection et lvolution de la primo-infection au SIDA.
La stratgie du diagnostic dans notre pays.
Les principes et suivi du traitement.
Les modes de contamination et la prvention.
Les signes cliniques de la primo-infection.
La conduite tenir devant un accident dexposition au sang (voir les TP). Cela concerne HIV, HBV
et HCV).
Pour comparaison entre HIV, HBV, HCV, voir illustration IV-8
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 135/307
Rtrovirus humains - 1re partie (le VIH ou HIV)
136/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 137/307
Chapitre 5
Rtrovirus humains - 2
me

partie (HTLV) et virus des
hpatites - 1
re
partie (hpatite
A - VHA ou HAV, hpatite B -
VHB ou HBV)
5.1 Rtrovirus humains - 2
me
partie : HTLV
Dcouvert simultanment par lquipe de R. GALLO et celle dY. HINUMA, lHTLV-1 est un
rtrovirus oncogne humain. Il tire son nom de son tropisme pour les lymphocytes T et de son
implication dans deux processus malins : certaines leucmies lymphodes T de ladulte et cer-
tains lymphomes cellules T. Il sagit dans les deux cas de lymphocytes T matures. Il est gale-
ment responsable de la paraparsie spastique tropicale qui a des similarits cliniques avec la
sclrose en plaques.
Ces manifestations graves sont une complication non inluctable de linfection HTLV-1 (1
5% des cas seulement sur les 20millions de sujets infects par HTLV-1 dans le monde). Celle-ci
svit de faon endmique en Afrique intertropicale. Du fait du commerce maritime et de lescla-
vage, elle sest tablie galement dans le bassin des Carabes comme dans les provinces mridio-
nales du Japon. Sa prvalence dans la Carabe est de 2% (de lordre de 0,05% en mtropole).
Il sagit ici de lHTLV type 1. Le type 2 est beaucoup plus restreint et concerne surtout les usagers
de drogue partageant leur seringue; son pouvoir pathogne chez lhomme nest pas tabli.
Inocul des PBMC (peripheral blood mononuclear cells) de donneurs sains, lHTLV-1 nentra-
ne, au contraire de lHIV, aucun ECP. En de telles cultures in vitro, lHTLV-1 donne une prolif-
ration des lymphocytes T CD4+ qui intgrent lADN proviral et produisent des antignes viraux.
LHTLV-1, bien que dou de pouvoir oncogne, ne porte aucun oncogne ; le mcanisme des
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
138/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
leucmies et lymphomes fait intervenir la protine virale TAX, transactivateur quivalent de la pro-
tine TAT de lHIV. On admet que la protine TAX stimule la production dinterleukine 2ainsi
que lexpression sur les lymphocytes T CD4+du rcepteur lIL2. Cette stimulation autocrine
des lymphocytes T CD4+ aboutit, dans une minorit de cas seulement, lapparition du clone ma-
lin responsable de la leucmie ou du lymphome T. LHTLV-1 est un mitogne T cause de lym-
phomes T, de mme que lEBV est un mitogne B cause de lymphomes B.
Bien que la RT de lHTLV-1 soit par nature aussi infidle que la RT du HIV-1, la variabilit
de lHTLV-1 est trs rduite (1 4% de diffrence entre les souches dHTLV-1 au niveau des nu-
clotides contre 30% pour les souches dHIV-1). Cest d au fait que la transmission de lHTLV-
1 et son maintien dans la population se fait essentiellement par les cellules ayant intgr le cDNA,
par mitose, et non par les particules virales extracellulaires.
Dans les conditions naturelles, lHTLV-1 connat, comme lHIV, une transmission materno-f-
tale et par lallaitement, ainsi quune transmission par les rapports sexuels, par transfusion san-
guine et par partage de seringues ( les 3 S ). La transmission par le lait semble le principal
vecteur. Une rduction de la prvalence est donc possible.
Le diagnostic de linfection HTLV-1 ou -2 comporte diffrentes mesures: le criblage par ELISA
est devenu systmatique chez les candidats au don du sang, de sperme ou dorgane.
Il est ncessaire de confirmer tout ELISA positif par un Western blot.
On sefforce de faire la diffrence entre 1 et 2. Les critres de positivit du Western blot sont la prsence la fois dan-
ticorps dirigs vers lenveloppe (antigp 62/68 ou gp 46 ou gp21 pour respectivement le prcurseur, la glycoprotine
de surface et la glycoprotine transmembranaire) et danticorps dirigs vers les structures internes (anti p24 ou p19,
pour respectivement le core et la matrice.
La lecture du Western blot HTLV nest pas toujours vidente de sorte que lon peut tre amen
pratiquer une PCR.
Lisolement du virus est fastidieux et alatoire, donc peu pratiqu.
Une coculture de PBMC du patient et de PBMC de donneur sain, stimuls par la PHA est maintenue 8 semaines. On
y recherche partir de la 4e semaine, la prsence de transcriptase inverse dans le surnageant ou bien une fluorescence
spcifique laide dun anticorps monoclonal ou la transformation des PBMC qui se mettent alors prolifrer.
Les difficults du diagnostic srologique comme de lisolement viral renforce lintrt pour la
PCR. Il existe des amorces spcifiques du type 1 et dautres du type 2. La PCR se pratique sur les
PBMC du patient ds leur prlvement mais aussi aprs coculture avec PBMC des donneurs sains.
Points importants :
lHTLV-1 est un rtrovirus oncogne et neuropathogne
cela chez quelques% seulement des personnes infectes
il a une rpartition gographique particulire
cest un mitogne T
sa transmission se fait de cellule cellule
par les 3 S et surtout le lait
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 139/307
5.2 Les virus des hpatites
Bien que des virus comme lEBV, le CMV ou le virus de la fivre jaune puissent donner dauthen-
tiques hpatites, on rserve le nom gnrique de virus des hpatites aux virus des hpatites A, B,
C, D, E.
Ces derniers ont en commun, outre leur hpatotropisme, des difficults, voire une impossibilit
disolement en culture, ce qui explique lapport dterminant de la virologie molculaire dans leur
tude.
Une particularit remarquable des virus B, C et D est leur aptitude donner une hpatite chroni-
que, greve des complications long terme que sont la cirrhose et le cancer primitif du foie, alors
que les hpatites A et E se limitent une hpatite aigu.
Les virus des hpatites exposent un risque dinfection nosocomiale.
On dispose de deux vaccins, efficaces et bien tolrs: le vaccin contre lhpatite B et le vaccin
contre lhpatite A (voir calendrier des vaccinations page257 et page261).
5.3 Caractres gnraux des hpatites virales
aigus
Dans les formes expression clinique, latteinte hpatique se traduit par linstallation dune ano-
rexie importante avec asthnie. La dcoloration des selles et la couleur fonce des urines tmoi-
gnent de ce que lictre qui suit est en partie par obstruction. La fivre est surtout le fait de
lhpatite A. Le signe biologique essentiel est laugmentation des transaminases ALAT dans le s-
rum, tmoin de la cytolyse hpatique.
Histologiquement, 3lments sont prsents: une ncrose cellulaire, prdominance centrolobu-
laire, une raction inflammatoire qui mobilise surtout des cellules mononucles et prdomine
dans les espaces portes, une rgnration des cellules hpatiques. Le diagnostic diffrentiel est la
mononuclose infectieuse, les hpatites mdicamenteuses ou toxiques, et en pays tropical la fivre
jaune.
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
140/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
5.4 Le virus de lhpatite A (VHA ou HAV)
Class pour un temps parmi les entrovirus, cest un virus nu ARN. Comme pour les entrovi-
rus ou les salmonelles, la transmission, inter-humaine, est essentiellement fcale-orale, avec un
large rservoir de virus dans le Tiers Monde. Un risque particulier est li la consommation de
coquillages et de crudits souilles. Comme pour les poliovirus, lexpression clinique est
dautant plus marque que lge est plus avanc.
Ainsi la circulation de lHAV, intense dans les pays chauds et pauvres, y passe souvent inaperue
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 141/307
car les enfants sont infects tt un ge o lexpression clinique de la maladie est restreinte. Les
visiteurs venus de pays riches, exempts danticorps, y risquent une infection cliniquement ma-
nifeste avec hpatite. La circulation des poliovirus dans les mmes pays pose un problme analo-
gue. La contagiosit de linfection HAV va environ de deux semaines avant une semaine aprs
lapparition de lictre, (voire plus longtemps).
Le virus a t dtect pour la premire fois dans les selles par une technique dimmuno-lectromi-
croscopie. Cela a consist traiter en phase aigu un extrait de selles avec un srum de convales-
cent dhpatite A. Les anticorps spcifiques anti-HAV rassemblent les particules virales en
agglomrats plus faciles voir en microscopie lectronique que des particules disperses.
En fait en pratique mdicale courante, le diagnostic dhpatite A repose sur la dtection dans le
srum danticorps spcifiques de classe IgM par technique ELISA. La recherche dune sro-
conversion en IgG anti-HAV nest pas faite car, avec une incubation de dure moyenne de 3 5
semaines, le patient est vu aprs la sroconversion. [Ainsi, chez un individu sans signe dhpatite,
la prsence dIgG anti-HAV signe soit un contact antrieur avec le virus soit une vaccination; cette
immunit confre une protection contre linfection.]
Lvolution de lhpatite A est favorable car le risque dhpatite aigu fulminante est faible et
linfection chronique inexistante. Cependant la svrit de linfection augmente avec lge : on
a avanc un risque dhpatite fulminante de 1% si linfection survient aprs 40ans.
Le vaccin inactiv ( tu ) est recommand aux voyageurs, aux adultes non immuniss et en-
fants au-dessus de 1 an voyageant en zone dendmie, jeunes des internats des tablissements et
services pour lenfance et la jeunesse handicapes, et les personnes exposes des risques particu-
liers (personnes atteintes de maladie chronique du foie, qui peut se dcompenser par survenue
dune hpatite A). Ce vaccin, administr en 2injections (0-M6 ou 12), est efficace et bien tolr.
Limmunisation passive par gammaglobulines ordinaires tait recommande avant que napparais-
se le vaccin. Avec llvation du niveau de vie dans nos rgions, la sroprvalence des anticorps
anti-VHA diminue (do lintrt de se vacciner) et les donneurs de sang fournissent des prpara-
tions de gammaglobulines de moins en moins riches en anticorps anti-HAV. Il nexiste pas de trai-
tement de lhpatite aigu autre que symptomatique.
5.5 Le virus de lhpatite B (VHB ou HBV)
Revoir illustration IV-8 (voir page 134)
Il est trs diffrent du virus de lhpatite A, tant pour sa structure que par son pouvoir pathogne.
Il expose au risque dhpatite fulminante, dhpatite chronique active, de cirrhose et de cancer pri-
mitif du foie.
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
142/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
5.5.1 Structure du virus
Il est class parmi les Hepadnaviridae en raison de son tropisme hpatique et de la nature ADN de
son gnome.
Celui-ci est un ADN circulaire, bicatnaire sur environ 3/4 de sa circonfrence, de petite taille
(1,6 millions de Dalton =3200 paires de base =le plus petit gnome viral humain ADN), associ
une ADN polymrase ADN-dpendante. La capside ou core qui contient le gnome est faite
dantigne HBc (c pour capside) ; elle a 27nm de diamtre, elle est entoure dune enveloppe non
membranaire forme de lipides cellulaires et de protine virale appele antigne HBs (s pour sur-
face). En cas dinfection les synthses virales produisent un excs dantignes HBs qui sauto-as-
semblent en tubules et sphrules de 22nm de diamtre et dpourvus de gnome viral. Lantigne
HBc, associ la capside, ne passe pas tel quel dans le srum mais sy trouve excrt sous une for-
me tronque qui est lantigne HBe.
Le virus infectant est comme toujours la particule virale complte, appel particule de Dane, de
42nm de diamtre, o la nuclocapside est entoure dantigne HBs. Les particules de Dane sont
trs minoritaires par rapport aux sphrules et tubules dantignes HBs en excs (10
8
versus
10
13
particules/ml de srum). Nayant pas denveloppe membranaire au sens dun pplos, le virus
est rsistant (il rsiste lther, une temprature de 56 C, pendant 30minutes). On ne sait pas
cultiver lHBV mais on a russi transformer des cellules et/ou obtenir une forme dinfection
productive aprs transfeation par le gnome complet du virus.
Pour pallier la petitesse du gnome, les protines virales sont codes dans des cadres de lecture
partiellement chevauchants. Ce sont le gne S pour lantigne HBs (subdivis en prS1 prS2 et
S), le gne C pour lantigne HBc (subdivis en prC et C) et pour lantigne HBe, le gne P
pour lADN polymrase virale et le gne X pour une protine transactivatrice. Donc 4 gnes
au total.
Lantigne HBs comporte un dterminant constamment prsent, a, auquel sajoutent des dtermi-
nants spcifiques de sous-types diversement associs: adw, adr, ayw et ayr pour les plus frquents.
Lantigne HBs est le principal marqueur srique dinfection. Il est prsent dans le cytoplasme
des hpatocytes. Lantigne HBc associ la capside ou core, prsent dans le noyau, napparat pas
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 143/307
libre dans le srum malgr sa prsence dans les particules de Dane. Cest lantigne HBe, le pro-
duit de scrtion, tronqu, de lantigne HBc qui apparat dans le srum, sa prsence dans le s-
rum tmoignant dune infection active.
5.5.2 Multiplication
On a avanc que lattachement du virus sur la cellule-cible (les hpatocytes) se faisait par interac-
tion entre lantigne prS1 ct virus et par lalbumine humaine polymrise ct hpatocyte. La
nature du rcepteur de lHBV nest toutefois pas encore dfinie.
Dans le noyau de lhpatocyte, lADN viral se circularise sous tension (cccDNA pour covalently
closed circular DNA). Ce cccDNA (qui a quelque analogie avec un minichromosome) persiste
mme au-del de la gurison.
La rplication du virus passe par un ARN prgnomique encapsid qui est ensuite transcrit en
ADN gnomique par lADN polymrase virale, doue ainsi dune activit transcriptase inverse.
On en rapproche la sensibilit de linfection au traitement par la 3TC qui a dabord t connue pour
son activit anti-HIV.
Le principal site de multiplication de lHBV est constitu par le foie et ses hpatocytes. Il est pos-
sible que les lymphocytes constituent un rservoir accessoire extrahpatique expliquant la recolo-
nisation par lHBV du foie greff pour hpatite fulminante (constante en labsence de traitement
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
144/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
antiviral post-greffe). LHBV nest pas un virus cytopathique et sa multiplication au sein des h-
patocytes ne provoque gnralement pas de cytolyse. Cest la rponse immune de lhte, en parti-
culier limmunit mdiation cellulaire, dirige contre les protines virales exprimes la surface
des hpatocytes qui est responsable de la cytolyse. Schmatiquement, une rponse immune adapte
mnera la gurison, une rponse trop intense se traduira par une hpatite svre voire fulminante
alors quune rponse de faible intensit conduira au portage chronique.
5.5.3 La transmission de lHBV
1. Le principal vecteur du virus est le sang do ce quon appelle une contamination parent-
rale, cest--dire par transfusion de sang, par injection ou piqre accidentelle avec du ma-
triel mal strilis. LHBV est trs rpandu chez les drogus par voie veineuse partageant
leurs seringues, contamination galement par acupuncture, rasage, tatouage. Les soins
dentaires sont source de contamination dans le sens dentiste patient ou patient dentiste.
Avec ce virus rsistant et titre lev dans le sang, une effraction cutane ou muqueuse
mme minime peut tre lorigine dune contamination sil y a mise en contact de cette plaie
minime avec du sang contenant le virus. Une piqre dun personnel avec une aiguille ayant
servi pour un malade infect expose un risque dinfection du personnel non vaccin denvi-
ron 30% (cest un risque de 3% pour le virus de lhpatite C et de 0,3% pour lHIV).
Le virus HB se transmet par voie buccale par exemple dans les laboratoires o lon a long-
temps aspir la pipette les chantillons de sang ou de srum dont certains, on le sait, sont
contaminants.
2. Dautre part le virus est prsent en petite quantit dans toute sorte de liquides biologiques :
salive, urines, selles, scrtions gnitales. Donc les rapports sexuels mais aussi la simple co-
habitation avec des personnes infectes, des porteurs chroniques, sont sources de contamina-
tion. Linfection HBV fait partie des MST (favorise par les rapports sexuels prcoces et
nombreux partenaires) mais elle est aussi transmise sous le toit contrairement lHIV.
De fait, cest dans les rgions pauvres dAsie et dAfrique ou dAsie o lon ignore les
transfusions et les injections mdicamenteuses que sobservent les taux les plus levs de
portage chronique : jusqu 20 % de la population a du virus HB dans le sang. La trans-
mission se fait ici, pour lessentiel, la naissance.
3. La transmission mre-enfant est trs importante par sa frquence et sa gravit long ter-
me. Les femmes enceintes porteuses chroniques, mme asymptomatiques, de lantigne
HBs (porteuses inactives) peuvent transmettre le virus leur enfant. La frquence de
cette transmission est moindre dans les pays occidentaux quen Extrme Orient. Elle est ac-
crue par la prsence de lantigne HBe dans le srum (risque de 90 % en cas dHBe+ et 5
20 % en cas dHBe-). La transmission du virus lenfant est exceptionnelle en cas dhpatite
B aigu de la mre au dbut de grossesse. En revanche lenfant court un risque dinfection
dans 50% des cas dhpatite B aigu maternelle durant le troisime trimestre de la grossesse.
Sauf exception, la contamination nest pas intra-utrine, mais pernatale ( J 0) et postnatale
efficacit de la srovaccination du nouveau-n, condition dtre commence dans les
12 premires heures de vie.
La majorit des enfants infects sont anictriques, sans signes dhpatite aigu et lhpatite B
fulminante y est exceptionnelle. Cependant, ils restent porteurs chroniques, ce qui est trs
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 145/307
grave terme, puisquils auront toute la vie pour faire les complications tardives redoutables
que sont lhpatite chronique active, la cirrhose et le cancer primitif du foie: pour un nou-
veau-n infect ce risque de complications tardives redoutables est de 40% aprs 30 ou 40ans
de vie.
Cest par cette transmission mre-enfant quon a lendmie de portage chronique propre
au Tiers-Monde, soit 350 millions de porteurs chroniques.
Il faut bien retenir que le sang est le vecteur principal mais non exclusif de lHBV et quil exis-
te des professions risque : le personnel de laboratoire et le personnel soignant, les ser-
vices les plus dangereux tant de loin les centres dhmodialyse chronique et les laboratoires
qui leur sont attachs.
J usqu la vaccination il y avait dans les centres dhmodialyse une situation endmique, avec de nombreux pa-
tients porteurs chroniques; le personnel soignant y tait expos un risque dhpatite B de 10 20fois suprieur
celui encouru par le personnel soignant dans son ensemble.
Dentiste est galement une profession expose, mais le risque concerne aussi les patients de
dentistes infects par le VHB.
Cette situation sest transforme depuis la vaccination systmatique des sujets exposs ou en-
trant dans une profession expose. Il importe en effet de vacciner, avant exposition au ris-
que, tous les tudiants futurs mdecins, dentistes, infirmiers, sages-femmes, et techniciens
danalyses biologiques mdicales.
Les dernires donnes indiquent quen Mtropole la transmission sexuelle est devenue la
premire cause dinfection par HBV, depuis quon dpiste systmatiquement lag HBs chez
les femmes enceintes et que la plupart des usagers de drogue ne partagent plus leurs seringues.
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
146/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
5.5.4 Histoire naturelle de linfection et volution des
antignes, des anticorps et de lADN viral dans le srum
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 147/307
1. Alors que lincubation est en moyenne de 3mois (2 semaines 6mois), lantigne HBs ap-
parat dans le sang un mois en moyenne aprs le contage, donc avant laugmentation des
transaminases ALAT et lictre. Il persiste environ deux mois et cest au cours de la conva-
lescence quil disparat dans les formes habituelles qui gurissent (9 formes ictriques
sur 10), mais il persiste chez les porteurs chroniques (1 forme ictrique sur 10). On dfi-
nit le portage chronique par la persistance de lantigne HBs au-del de 6 mois.
2. Lantigne HBc est masqu par lantigne HBs et nest pas dtect par les tests usuels.
3. Les anticorps apparaissent aprs les antignes.
Ce sont dabord les anti-HBc. Les IgM HBc, fugaces, signent linfection aigu, tandis que
les IgG HBc sont trs durables, probablement toute la vie.
Les anti-HBs apparaissent les derniers, durant la convalescence, mais ils persistent des an-
nes voire toute la vie. Cest un signe de gurison. Ce sont des anticorps neutralisants. Ils
manquent chez les porteurs chroniques. Entre la disparition de lantigne HBs et lappari-
tion des anticorps HBs il peut y avoir une fentre o le diagnostic dinfection rcente ne peut
tre port que sur la prsence des anticorps IgM anti-HBc ou de lADN viral srique.
4. Quant lantigne HBe, il a une signification pronostique. Il apparat en phase aigu. Sa dis-
parition est de bon pronostic, comme lapparition des anticorps correspondants. Ainsi
chez les porteurs chroniques, ceux qui ont lanticorps HBe sont moins contagieux. Le systme
e/anti-e est donc un indicateur dvolutivit et dinfectiosit. Il en va de mme de lADN s-
rique de lHBV.
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
148/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
5. Evolution et pronostic
Une hpatite B gurie est, du fait de la persistance du cccDNA, susceptible de ractivation ventuellement
grave en cas dimmunodpression (chimiothrapie anticancreuse, par exemple).
*
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 149/307
Le portage chronique qui est une infection chronique apparat chez environ 10% des sujets
ayant fait une hpatite aigu clinique. Le nombre de porteurs chroniques varie selon les pays
de 20% 0,1% (en Europe 0,1%). La dernire estimation de lInstitut national de veille sa-
nitaire (InVS) pour la France est denviron 300000 (0,65% de la population) porteurs
dAgHBs et denviron 1500 morts par an. En outre, la prvalence des anticorps anti-HBc
serait de 7,3%, indiquant que 3,1millions de personnes auraient eu un contact antrieur avec
le VHB.
Dans 1/3 des cas, ce portage chronique se fait sans aucune lsion hpatique. Les sujets sont
des porteurs inactifs dont le sang peut tre infectant.
Dans 1/3 des cas, ce portage chronique saccompagne de lsions histologiques stables et
sans gravit, ralisant lhpatite chronique persistante (HCP).
Dans 1/3 des cas, les lsions sont volutives = menant la mort soit par hpatite chronique
active (HCA), soit par cirrhose, soit par cancer primitif du foie (CPF). Lvolution de la
cirrhose se fait vers le cancer du foie dans 30 50% des cas aprs 10ans dvolution
En phase aigu, la complication redouter est lhpatite fulminante, mortelle spontanment
dans 90% des cas et indication la greffe de foie en urgence. Les 2critres principaux dhos-
pitalisation en urgence sont un taux de prothrombine < 50% et des signes dencphalopathie.
On connat deux lments conditionnant le pronostic :
1. lge: plus le sujet est jeune, plus linfection est bnigne court terme, mais plus le
risque de chronicit est lev : le nouveau-n dveloppe presque toujours un portage
chronique. Le risque de passage la chronicit est de 90 % pour le nouveau-n, de
25% pour lenfant dge prscolaire, de 5 % pour ladulte.
2. la dose de virus reue intervient : avant le dpistage de lAg HBs chez les donneurs de
sang les hpatites aigus post-transfusionnelles virus HB taient les plus graves et
tuaient dans 10% des cas. Le risque dhpatite fulminante est actuellement estim en-
viron 0,1%.
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
150/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
6. Le diagnostic au laboratoire repose en pratique courante par la mise en vidence dans le
sang des marqueurs du virus de lhpatite B, principalement de lantigne HBs. Les techni-
ques de dtection sont varies. Actuellement la plus utilise est lELISA.
En pratique devant un ictre par hpatite (transaminases ALAT augmentes), on demande
une recherche dans le srum dantigne HBs, dIgM HBc et dIgM HAV, en ELISA.
La prsence dIgM HAV signe lhpatite A actuelle.
La prsence dantigne HBs signe linfection VHB mais celle-ci ne peut tre considre
coup sr comme actuelle que si les IgM HBc sont galement prsentes. La prsence dantig-
ne HBs sans IgM HBc voque soit une hpatite aigu vue son tout dbut, soit un portage
chronique, qui serait associ ici un ictre par hpatite dautre tiologie (hpatite A, hpatite
C, hpatite CMV, virus EB, hpatite toxique).
Une hpatite aigu B peut tre vue juste aprs la disparition de lantigne HBs et avant lap-
parition de lanticorps HBs, cest dire dans la fentre. On fait alors le diagnostic dinfection
rcente virus HB par la dtection des IgM HBc. On notera que les IgM HBc peuvent parfois
rapparatre au dcours dune hpatite chronique lors dune ractivation virale; en labsence
de donnes antrieures srologiques il nest donc pas toujours possible daffirmer le caractre
aigu de linfection.
Le portage chronique est dfini par la dtection dantigne HBs dans le srum 2 fois 6 mois
dintervalle. Il ny a en gnral pas danticorps HBs quand lantigne est prsent.
Il est important dapprcier lintensit de la multiplication virale qui est parallle la
contagiosit du sujet, une faon de faire consistant dterminer ltat du sujet dans le syst-
me HBe. La prsence dantigne HBe sans anticorps HBe est ( lexception prs des virus
mutants HBe ngatifs) signe dinfectiosit importante. La prsence danticorps HBe sans an-
tigne HBe est signe dune rplication moindre.
LADN viral dans le srum recherch par amplification gnomique (PCR), est le
meilleur marqueur dinfectiosit. Il a lintrt de dceler une minorit de porteurs chroni-
ques sans antigne HBs srique.
Les anticorps HBc sont un marqueur trs sensible et durable dinfection. Un sujet anticorps
IgG HBc positif, antigne HBs ngatif et anticorps HBs positif est un sujet guri dune an-
cienne infection et protg (protection non absolue: le cccDNA persistant peut, en cas dim-
munodpression, ractiver une infection, ventuellement grave) ; un sujet anticorps IgG HBc
positif, antigne HBs positif et anticorps HBs ngatif est probablement un porteur chronique
dont on prcise linfectiosit par tude du systme HBe et de lADN viral. Il faut savoir quil
est totalement inutile dtudier le systme HBe chez un sujet antigne HBs ngatif.
Quant au profil IgG HBc ngatif, antigne HBs ngatif et anticorps HBs positif, cest celui
dun(e) tudiant(e) en mdecine nayant pas rencontr le virus mais sen tant protg par la
vaccination.
5.5.5 Traitement
5.5.5.1 Traitement curatif
Dans les formes volutives par hpatite chronique des rsultats partiels sont obtenus par traitement
linterfron alpha recombinant ou sa forme retard (linterfron coupl une molcule de poly-
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 151/307
thylne glycol). Cest un traitement lourd, la dose de 5millions dunits internationales intramus-
culaires ou sous cutanes, 3fois par semaine pour la forme standard ou 180g/semaine pour la
forme pgyle durant 6 12mois. Les effets secondaires sont notables, en particulier syndrome
pseudogrippal, neutropnie et plus rarement tat dpressif potentiellement dangereux (suicide) ou
un dysfonctionnement thyrodien. Les rsultats sont inconstants.
Les analogues de nuclosides sont galement efficaces mais doivent tre administrs pendant une
dure plus longue. La 3TC a donn des rsultats encourageants, avec peu deffets secondaires mais
lmergence de mutants rsistants (incidence denviron 15% par anne de traitement) (Revoir il-
lustration I-9 (voir page 47)). Ladfovir, sous sa forme dipivoxyl, possde une efficacit com-
parable la 3TC mais est associ une moindre slection de virus rsistants (incidence de lordre
de 29% aprs 5 ans de traitement). Un nouvel analogue nuclosidique, lentcavir, est maintenant
disponible avec lavantage dtre trs actif et de ne slectionner que rarement des formes rsistan-
tes. Dautres analogues nuclosidiques sont en cours dvaluation et une multithrapie est envisa-
ge, comme pour le HIV.
Le traitement de lhpatite fulminante est la transplantation de foie en urgence
5.5.5.2 Prvention
1. On carte systmatiquement les candidats donneurs de sang porteurs dantigne HBs et
mme danticorps HBc dans le sang, par dpistage systmatique. Mme chose pour les
dons dorgane, de moelle, de sperme. En revanche, il est conseill aux donneurs vivants de
se vacciner.
2. Il existe des globulines spciales titre lev danticorps HBs prpares partir de don-
neurs slectionns. Elles ont deux indications:
1. une indication durgence en cas de contamination prcise dun sujet non vaccin partir
de produit sanguin provenant de sujet infect. Quil sagisse de piqre avec du matriel
souill de sang, dingestion ou mme de projection dans lil ou sur le visage. Il y a
urgence injecter ces globulines spciales quon se procure au Centre de Transfu-
sion le plus proche. Simultanment, on commence une vaccination.
2. la protection de la greffe de foie pour viter la reprise de lhpatite B.
Ces globulines sont en revanche contre-indiques au cours des hpatites aigus car dans les
formes graves on a pu observer des complexes ag-ac dans le sang, les parois vasculaires, les
glomrules. Un excs danticorps HBs semble dangereux.
3. Une troisime srie de mesures prventives concerne la faon de travailler du personnel
risque.
Ce sont des mesures videntes qui, en pratique sont trop souvent ngliges.
Il ne faut pas pipeter la bouche les produits pathologiques, mais adapter une poire sur
la pipette.
Il ne faut ni fumer, ni manger, ni boire dans les services dangereux, les laboratoires et les
centres dhmodialyse.
Il ne faut pas recapuchonner les aiguilles mais les transfrer dans une bote anti-pique
parois dures.
En cas dcorchure au niveau des doigts il faut mettre au minimum un pansement occlu-
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
152/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
sif (du type Tricostril ou Urgoplaie).
Port de gants lors de la manipulation de prlvements contamins et les prises de sang.
4. Lutte contre les MST : ducation sexuelle, fidlit, usage de prservatifs.
5. Lutte contre la drogue, avec fournitures de seringues individuelles
6. Le vaccin contre lhpatite B est une acquisition remarquable
Le gne de lantigne HBs ayant t clon dans une levure, cest sur un vaccin de gnie gn-
tique base dantigne HBs recombinant que repose dsormais la vaccination. Lefficacit
du vaccin et son innocuit sont certaines. Le risque de sclrose en plaque (SEP) nest quune
rumeur sans fondement : lassociation nest pas statistiquement suprieure au hasard (mme
situation pour la mort subite du nourrisson et le vaccin anticoqueluche, lautisme et le ROR,
la maladie de Crohn et le ROR). Ne plus vacciner contre lhpatite B par crainte de SEP com-
me le conseillent parfois certains mdecins est une erreur propre la France (Revoir illustra-
tion IV-7 (voir page 132)
Le vaccin se donne en 3 injections 1mois dintervalle avec rappel 1 an plus tard. Il existe
aussi un protocole avec 2 injections un mois dintervalle, protocole recommand actuelle-
ment, puis rappel 6mois. Il donne des anticorps HBs (qui sont neutralisants, protec-
teurs) mais sans anticorps HBc.
La vaccination est faire sans recherche pralable de limmunit.
Il y a quelques annes, on croyait une telle recherche ncessaire pour deux raisons: viter de vacciner un sujet
dj infect voir porteur chronique dantigne HBs par crainte de dclencher des phnomnes dimmunopatho-
logie et viter de gaspiller le vaccin en lutilisant pour des sujets qui nen nauraient pas besoin. En fait la crainte
dimmunopathologie sefface daprs les donnes de lexprience et les tudes cot-bnfice montrent que le
dpistage pralable de limmunit nest rentable que pour des populations o 25% au moins des sujets ont un
marqueur HB. Actuellement, le pourcentage est de 14 dans le personnel hospitalier et de 7 dans la population
gnrale. Enfin, toute recherche dimmunit pralable la vaccination ne fait qualourdir la procdure et retarder
dautant la vaccination. Une politique de prvention efficace repose sur un minimum dtapes: le lion ne bon-
dit quune fois.
La vaccination contre lhpatite B est imprative pour les sujets des groupes risques: tu-
diants des mtiers de la sant, drogus par voie intraveineuse, partenaires sexuels et proches
dun sujet infect aigu ou chronique, sujets partenaires sexuels multiples, cooprants
partant en zone dendmie et bien sr nouveau-ns de mre dpiste porteuse dantigne
HBs.
Comme la contamination de lenfant se fait essentiellement la naissance et dans les semaines
qui suivent, les mesures visant prvenir linfection de lenfant consistent lui injecter des
immunoglobulines spciales titre lev danticorps HBs ds la naissance si la mre a eu
une hpatite B en fin de grossesse ou si elle est porteuse chronique dantigne HBs. On dbute
simultanment une vaccination. Dans notre pays, le dpistage de lantigne HBs est deve-
nu obligatoire en cours de grossesse, pour la naissance instituer en urgence, dans les
12 heures, la srovaccination de lenfant.
La vaccination largie. Pour tenter dradiquer linfection HBV lchelle mondiale une
campagne vient dtre lance pour une vaccination systmatique aux deux priodes critiques
de la vie: la vaccination des nouveau-ns ou des nourrissons 2, 3 et 4mois (+DT Coq
Polio et Haemophilus influenzae b) et la vaccination des pradolescents (11-13ans) avant
lge des premiers rapports sexuels (en mme temps que le 3
me
rappel DT Coq Polio et un
ventuel rattrapage ROR) (voir calendrier des vaccinations page257 et page261).
Un vaccin trs original est lessai : des souris nourries de pommes de terre transgniques
pour le gne S produisent des anticorps anti-HBs!
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 153/307
5.5.6 Un problme trs important de sant publique
Il existe une association indiscutable entre le CANCER PRIMITIF DU FOIE qui svit particu-
lirement en Asie et en Afrique et linfection HBV. La relation de cause effet ne fait plus aucun
doute. On sait que lADN de lHBV peut tre intgr dans les hpatocytes. Par ailleurs, la cirrhose
en soi est un processus cancrigne par la multiplication cellulaire anarchique dans les nodules de
rgnration hpatique.
Le risque de cancer primitif du foie (hpatocarcinome), daprs une tude ralise Tawan
est multipli par 200 en cas dinfection chronique par HBV. Chez les sujets infects la naissan-
ce, le risque long terme dhpatocarcinome est de 50% pour les hommes et de 20% pour les fem-
mes. On a dit aussi 40% 40ans. Do lintrt des vastes campagnes de vaccination grande
chelle contre lhpatite B en pays dendmie. Cest le succs de la vaccination en matire de
prvention de lhpatocarcinome qui a permis de dmontrer pour la premire fois chez lhomme
une relation de cause effet entre un processus cancreux et une infection virale. Le vaccin contre
lhpatite B est le premier vaccin anti-cancreux efficace.
5.5.7 HBV et mutations
Le passage par une rtrotranscription pour la rplication de lHBV, avec une ADN polymrase
ne corrigeant pas ses erreurs, prte 3catgories de mutations:
1. Mutations de rsistance aux antiviraux, sous traitement prolong par des analogues nuclo-
sidiques (-tidiques), portant sur le gne P de lADN polymrase.
2. Mutations dchappement la srothrapie par immunoglobulines riches en ac HBs et en
mme temps dchappement la vaccination (faite dag HBs). Cela consiste en des muta-
tions au niveau du gne S, apparaissant lors de traitement prventif de la transmission
mre-enfant ou des campagnes de vaccination de masse. Elles nont pas jusqu prsent
conduit modifier la stratgie de ces mesures prventives mais cest quand mme une invita-
tion la vigilance.
3. Mutants prcore ou pr-C, au niveau du gne C, rendus incapables de synthtiser lag
HBe. Les malades sont devenus ag HBe ngatifs mais ce nest pas chez eux un signe de con-
trle, de rmission de linfection virale comme ce serait le cas pour des malades infects par
le virus classique: ils continuent au contraire rpliquer activement ce virus mutation
prC, avec une abondance de ADN viral dans le srum, et une volution possible vers lh-
patite fulminante ou vers une hpatite chronique svre, rpondant mal linterfron.
Rtrovirus humains - 2me partie (HTLV) et virus des hpatites - 1re partie (hpatite A - VHA ou HAV,
154/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
5.6 Points importants
Le virus de lhpatite A
Cest un picornavirus (genre hepatovirus) qui a lpidmiologie des entrobactries.
Lexpression clinique augmente avec lge.
Lhpatite fulminante A est rare.
La protection par infection naturelle diminue avec le dveloppement de lhygine.
Le vaccin.
Le virus de lhpatite B
Cest un hepadnavirus.
350millions de sujets infects dans le monde.
La structure du gnome et de la particule virale.
Sa rplication par une phase de transcription inverse.
Les modalits volutives de linfection aux diffrents ges.
Les diffrents marqueurs de linfection et leur volution dans linfection aigu et dans linfec-
tion chronique (qui mne la cirrhose et au cancer du foie).
La transmission du virus et sa prvention.
Le principe du traitement.
La vaccination, principe, modalit, innocuit, efficacit: 1
er
vaccin anticancreux.
La co-infection trois ou quatre virus: HIV, HBV, HDV, HCV, due au mode de contamination.
Virus des hpatites - 2me partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 155/307
Chapitre 6
Virus des hpatites - 2
me

partie
Virus des hpatites D (VHD ou HDV), C (VHC ou HCV), E (HEV), et GBV-C
Virus des hpatites - 2me partie
156/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
6.1 Le virus delta ou virus de lhpatite D
(HDV)
Cest un trs petit virus ARN (avec 1700 nuclotides soit 1,7 kb, cest le plus petit gnome de
virus de mammifre), virus dfectif, incapable de se rpliquer sans lHBV qui lui prte son en-
veloppe, son antigne HBs. Linfection virus DELTA ne survient quen mme temps quune in-
fection HBV dont le pronostic sen trouve aggrav: risque accru dhpatite fulminante et de
passage lhpatite chronique active.
Le virus Delta est surtout rpandu dans le bassin mditerranen et chez les drogus par voie vei-
neuse.
Virus des hpatites - 2me partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 157/307
La recherche dune infection par lHDV doit se faire chez tout porteur de lAg HBs par la recherche
des Ac dirigs contre le virus. Des tests de type ELISA permettent la dtection des Ac totaux, des
IgM ou de lantigne Delta (trs fugace) dans le srum. On se protge du virus Delta par vacci-
nation contre lHBV !
6.2 Le virus de lhpatite C (HCV)
Lorsquon a contrl les dons de sang en en excluant les donneurs porteurs dantigne HBs, on
sest aperu quon ne diminuait que de moiti le nombre dhpatites virales post-transfusionnelles.
Do la notion de virus ni A-ni B . En fait en 1989 le virus de lhpatite C qui rend compte de
la plupart des hpatites niA niB post-transfusionnelles a t dcouvert par technique de biologie
molculaire, sans isolement pralable de la particule virale. Ce nest que tout rcemment quon a
russi cultiver ce virus et le seul modle animal est le chimpanz. Cest un virus ARN, enve-
loppe, de 50nm de diamtre.
6.2.1 Le virus
Virus des hpatites - 2me partie
158/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Partant du plasma dun chimpanz infect, les acides nucliques ARN en ont t purifis pour tre
transcrits en ADN complmentaires. Ceux-ci ont t insrs dans le gnome dun bactriophage
pour expression de linformation sous forme de protines. Parmi les trs nombreux clones ainsi
produits, lun deux a t reconnu comme exprimant une protine virale, car cette protine a t
reconnue par un srum de convalescent dhpatite ni A ni B.
partir de ce premier clone, utilis comme sonde nuclique, on a pu, de proche en proche, recons-
tituer tout le gnome. On sest aperu que ce gnome ARN a une organisation proche de celle
des flavivirus avec 9500nuclotides (9,5kb), des extrmits 5 et 3 non codantes, et en partant
de lextrmit 5 des gnes de capside (C), denveloppe (E1 et E2) et de protines non structu-
rales (NS2 NS5), la protine NS3 tant une protase virale et la protine NS5 tant la rplicase.
Toutes ces protines virales sont produites sous forme dun prcurseur polypeptidique unique
Virus des hpatites - 2me partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 159/307
gant, dont le clivage implique la protase virale et des protases cellulaires. La rgion 5 non
codante est la mieux conserve parmi les diffrents isolats.
La variabilit gntique de ce virus est considrable. Elle est lie aux rats de lARN polym-
rase qui, comme la rtrotranscriptase du HIV, est dpourvue de mcanisme de correction des er-
reurs. Cela dfinit 6 gnotypes, eux-mmes subdiviss en sous-types (1a, 1b, 2a, 2b, 3a, 3b...) et,
chez un mme individu, on trouve souvent simultanment une myriade de variants dun mme
sous-type dfinissant une quasi-espce, les variations antigniques portant surtout, comme
cest le cas dune faon gnrale pour les virus, sur la surface virale, cest dire ici lenvelop-
pe (E1 et E2). Lanalogie avec lHIV est frappante.
Comme pour lHIV, les anticorps neutralisants dirigs contre les glycoprotines denveloppe sont
trs peu protecteurs (cela semble d au fait que le virus sassocie aux lipoprotines de lhte). De
fait, les virus infectieux sont apparus agrgs et entours de lipoprotines de faibles densit (LDL,
pour low-density lipoprotein), en viro-lipo-particules, qui ne sont synthtisables que dans les cel-
lules productrices de tels lipoprotines, cest--dire dans les hpatocytes, auxquels elles sattachent
par les rcepteurs des LDL. Ainsi sexplique le tropisme trs troit de lHCV, ainsi que son
chappement au systme immunitaire. Autre analogie avec lHIV, son niveau lv de
rplication : jusqu 10
12
virions produits par jour, avec une demi-vie de 2 3heures. Autre
valuation: chaque hpatocyte infect produirait une cinquantaine de virus par jour.
6.2.2 pidmiologie et histoire naturelle
(Revoir illustration IV-8 (voir page 134)
LHCV est strictement humain. Il se transmet par le sang contamin.
Le mode de contamination est principalement parentral. Dans les pays pauvres, cest par
transfusion de sang sans dpistage des donneurs ou par utilisation daiguilles non strilises.
Chez nous, cest surtout par partage de seringue chez les utilisateurs de drogue par voie veineuse.
Virus des hpatites - 2me partie
160/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
De ce fait, la co-infection HCV/HIV est frquente et tout utilisateur de drogue par voie IV doit
bnficier du double dpistage HCV/HIV (30% des sujets HIV+sont infects par HCV).
Fait important, il est des cas sporadiques ( 10% 25% des cas) quon ne sait expliquer.
Les contacts sexuels ou la transmission materno-ftale (risque dans ce dernier cas denviron 5%)
et lallaitement interviennent trs peu, contrairement ce quil en est pour lHBV ou lHIV.
Dans les couples srodiscordants (lun avec, lautre sans anticorps HCV), lusage du prservatif
nest pas formellement recommand, contrairement ce quil en serait pour lHIV.
On pense quil existe une transmission nosocomiale (fibroscopie? soins dentaires??). En cas de
piqre par seringue ayant servi prlever une personne infecte (AES, accident dexposition au
sang) le risque de contamination est estim 3% (30% pour AES lHBV et 0,3% pour AES
lHIV ; et 0,03% pour exposition sexuelle lHIV).
Cette transmission nosocomiale se fait principalement aux dpens des malades mais parfois aussi aux dpens des
soignants: un chirurgien aurait, pour toute la dure de sa carrire un risque dinfection estim entre 1 10%.
Lincubation dtermine dans le cas des hpatites C post-transfusionnelles peut tre de dure trs
variable (2semaines 6mois) mais est en gnral de 2mois.
LHCV a la particularit, pour un virus enveloppe, de rsister au fractionnement de Cohn utilis
dans la prparation dimmunoglobulines usage thrapeutique, dont certains lots ont t respon-
sables dpidmie dhpatite C.
La prvalence de linfection dans le monde, juge daprs la prvalence des anticorps est denvi-
ron 1 % dans les pays occidentaux, alors quelle peut approcher les 10 % en Afrique, avec
170millions de personnes infectes dans le monde.
Llment le plus remarquable de lhpatite C est, quau-del dune primo-infection gnrale-
ment asymptomatique (90% des cas) et sans forte lvation des transaminases, lvolution se fait
dans 70 80 % des cas vers la chronicit, avec chez 25% des infects chroniques un risque de
cirrhose et de cancer primitif du foie aprs une incubation de 20ans en moyenne pour la cirrhose
et de 30ans pour le cancer. Le risque dhpatocarcinome est multipli par 100chez les sujets in-
fects chroniquement par lHCV et atteints de cirrhose. Cette infection concerne environ 400 000
Franais
1
(et 170.000.000 Terriens) ! Linfection HCV est sournoise et constitue donc un trs
grave problme de sant publique terme. Lvolution vers la cirrhose, par fibrose, est
dautant plus craindre que le sujet est g, du sexe masculin et consommateur dalcool. On esti-
me que 3000Franais meurent chaque anne de cirrhose ou cancer HCV-induits et ce devrait tre
4500 en 2020.
Une cryoglobulinmie, phnomne immunopathologique li une lymphoprolifration B bni-
gne, est une complication frquente de linfection HCV. Plus rares sont les lymphoprolifrations
B malignes lies lHCV ( type de lymphomes non hodgkinien).
Une question non rsolue : quel est le mcanisme de linfection chronique de lHCV ? Cest
un virus gnome ARN, comme celui de lHIV, mais contrairement ce dernier il nest pas r-
trotranscrit en cDNA proviral et il nest pas intgrable dans lADN cellulaire. Parmi les hypothses
vraisemblables, la chronicit de linfection serait due non seulement la production incessante de
mutants chappant aux anticorps et aux CTL mais aussi des mcanismes dinteraction des pro-
tines virales avec des protines cellulaires impliques dans les dfenses anti-microbiennes.
Dautres mcanismes restent certainement dcouvrir.
1. On retrouve des anticorps dans 0,84 % de la population franaise.
Virus des hpatites - 2me partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 161/307
6.2.3 Diagnostic
Les circonstances justifiant le diagnostic virologique de linfection HCV sont : lappartenance
un groupe risque, une asthnie persistante (signe dalarme dune hpatite chronique), une aug-
mentation des transaminases, des manifestations extrahpatiques de linfection (cryoglobulin-
mie, vascularite).
Le diagnostic de linfection repose sur la recherche des anticorps en ELISA, qui depuis les pre-
mires trousses, a gagn en sensibilit et en spcificit. Avec les premires trousses (antigne uni-
que NS4) les anticorps se positivaient au cours du 3
e
mois, dlai actuellement raccourci avec les
nouvelles trousses (environ 2mois, ce qui est encore bien long). Elles mettent en jeu des antignes
structuraux (C) et non structuraux (NS). En cas dELISA positif, un second srum est analys par
une technique srologique pour se mettre labri de toute erreur intervenue sur le premier srum
(tiquetage notamment). En cas dexploration dune hpatite aigu qui risque fort dtre vue avant
la sroconversion, une recherche directe de lARN gnomique par technique damplification g-
nomique peut-tre faite. On utilise gnralemnt une RT-PCR (RT-PCR : dans un premier temps,
lARN gnomique est transcrit en ADN complmentaire ou cDNA par une prparation de trans-
criptase inverse de rtrovirus murin puis ce cDNA est amplifi par raction de polymrisation en
chane ou PCR).
Sil y a objectivation dune rplication virale par ces tests qualitatifs de dtection du gnome, une
quantification de lARN viral srique par technique dhybridation (bDNA : branched DNA) ou
par RT-PCR peut tre faite. Cette quantification permettra davoir une valeur initiale de charge
virale avant la prise en charge thrapeutique.
Ainsi, dtection et quantification de lARN gnomique viral (charge virale) dans le srum sont
utiles titre diagnostic mais aussi pour dcider du traitement linterfron et pour en suivre les
effets.
Rcemment un test combin (dtectant simultanment lAg et les Ac du VHC) a t mis au point.
Il se positive avant lapparition des anticorps, permettant de rduire la fentre diagnostique,
et cela un prix moindre que celui de la dtection de lARN gnomique dans le srum. Lintrt
de ce test rside principalement dans la rduction significative de la fentre diagnostique et son uti-
lisation chez des personnes immunodprimes chez lesquelles la production danticorps est incons-
tante.
Quoiquil en soit et ds prsent, on estime que le dpistage actuel des donneurs de sang ayant des
anticorps ou de lARN HCV ne laisse plus passer quun don contaminant sur 8150000 dons (ce
taux est de 1/470000 pour lhpatite B et de 1/2740000 pour linfection HIV). La scurit
transfusionnelle est donc assure au mieux, dans notre pays et les pays riches du moins.
6.2.4 Le traitement
Il peut prtendre, contrairement au traitement de linfection HIV, lradication du virus,
prouv par la ngativation de la recherche de lARN viral srique, mais ce but nest actuelle-
ment atteint que dans environ la moiti des cas.
Le premier traitement dont on a dispos a t linterfron (IFN) alpha recombinant administr
par injection sous cutane la dose de 3millions dUI 3fois par semaine durant 6 ou 12mois. Une
gurison ntait obtenue que chez 20 25% des patients, au mieux. Un progrs rcent dans la pra-
Virus des hpatites - 2me partie
162/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
tique de la chimiothrapie de lHCV vient de la liaison de linterfron alpha au polythylne
glycol : le PEGG-interfron a une demi-vie augmente, de sorte quune injection hebdomadaire
unique assure un taux plasmatique stable dinterfron et donne des rsultats suprieurs linterf-
ron seul en 3 injections hebdomadaires.
On associe actuellement linterfron alpha recombinant la ribavirine, analogue de nucloside
antiviral non dpourvu de risque (tratogne) et de mode daction complexe (il agit par renforce-
ment des effets de linterfron, plus que par inhibition directe de la rplication virale).
Les rsultats rcents des traitements associant le PEG-IFN et la ribavirine (10,6mg/kg) indiquent
une gurison de plus de 80 % pour les patients infects par un virus de gnotype 2 ou 3 et de prs
de 50 % pour le gnotype 1.
Les lments de mauvais pronostic, de risque dchec du traitement, sont un gnotype 1, au d-
part une charge virale leve dARN dans le srum, une atteinte histologique svre la biopsie
hpatique, un ge avanc et la consommation dalcool, mme modre.
Des donnes rcentes indiquent quun traitement par PEG-IFN instaur dans la phase aigu de la
maladie (dans les 6mois suivant le contage) aboutit une gurison dans 98% des cas. Ces rsultats
sont confirmer mais ils incitent un traitement prcoce lors dune hpatite C aigu.
Les premiers rsultats obtenus avec les inhibiteurs de la protase du VHC sont extrmement pro-
metteurs mme si une slection rapide de virus rsistants a t observe lors des traitements de
courte dure avec ces molcules. Nous attendons avec impatience les rsultats des essais en cours
qui associent ces nouveaux inhibiteurs avec les PEG-ITN et/ou la ribavirine.
La principale mesure de prvention est le rejet des donneurs de sang anticorps ou ARN HCV.
Importance galement de la lutte contre la toxicomanie et le partage de seringue. Importance
des bonnes pratiques de soins (mdicaux et dentaires) pour viter les accidents dexposition au
sang (AES) et la contamination des patients par un matriel mal strilis. Mais la prvention des
cas sporadiques dhpatite C nous chappera tant quon nen saura pas plus sur cette catgorie
dhpatites C qui reprsente 10 25% des cas. Les espoirs reposent en une vaccination, qui nest
pas pour demain.
La cirrhose par HCV est une indication la greffe de foie (Cen est actuellement une des plus fr-
quentes indications) mais malheureusement linfection rcidive aprs 100% des greffes (cela
viendrait de linfection des lymphocytes B, cible extrahpatique probable de lHCV).
Au total, contrairement ce quil en est pour lHIV, lincidence de linfection par HCV est en baisse dans nos pays,
mais les complications tardives des infections passes (accumules avant la dcouverte du virus et les mesures de d-
pistage) y sont venir, do les estimations de mortalit la hausse pour les prochaines annes et le fait que lHCV
est devenu la premire cause de greffe de foie dans nos pays.
6.3 Le virus de lhpatite E ou HEV
Class au sein de la famille des Hepeviridae dans le genre Hepevirus, cest un petit virus nu
ARN.
Le HEV est difficilement cultivable, mais il existe une trousse pour dtection des anticorps spci-
fiques en ELISA. Ce sont des contaminations fcale-orales massives qui donnent des pidmies
principalement dans le Tiers Monde. La 1
re
pidmie reconnue, en Inde, suivait la contamination
de citernes par des eaux dgout. Il existe cependant aussi des cas sporadiques en Europe.
Virus des hpatites - 2me partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 163/307
Cette hpatite E, qui comme lhpatite A ne passe pas la chronicit, a toutefois une particularit
mal explique: une mortalit > 10 % chez les femmes enceintes.
Certains animaux constituent probablement un rservoir de ce virus (rongeurs, porcs, sangliers).
6.4 Le virus dit de lhpatite G et le TTV
LHGV, comme lHCV, a t mis en vidence par des techniques de biologie molculaire ayant
permis disoler des squences gnomiques dans du srum de sujet infect. Ce nouveau virus est
proche de lHCV et se classe parmi les flavivirus. Il est assez rpandu (4% de la population gn-
rale Paris, donneurs de sang compris). Son pouvoir pathogne est en premire analyse trs li-
mit et il ne semble pas hpatotrope. Mieux vaudrait donc lappeler virus G plutt que HGV. On
le dtecte par RT-PCR dans le srum et une srologie en ELISA est disponible. Celle-ci se positive
lors de la disparition du virus de la circulation (marqueur de gurison?)
LE TTV, le dernier des virus dcouvert associ la transfusion. TT tant les initiales de la person-
ne chez qui ce virus a t dcouvert. Cest un petit virus ADN, nu, largement rpandu dans la
population (prvalence variable, suprieure 50%), de pouvoir pathogne encore imprcis, en
premire analyse trs limit.
On voit que le raffinement des techniques de virologie molculaire mne la dtection de virus
nouveaux, largement rpandus dans la population et bien peu pathognes.
6.5 Points importants
Le virus de lhpatite D
Les particularits de sa structure.
Sa dpendance vis--vis du virus de lhpatite B.
Le bnfice du vaccin contre lhpatite B
Le virus de lhpatite C
Cest un flavivirus, virus ARN et enveloppe.
170millions de sujets infects dans le monde dont 600000 en France.
La structure du gnome et de la particule virale.
Les modalits volutives de linfection (chronique dans 80% des cas, menant la cirrhose et
au cancer du foie).
Les marqueurs de linfection et les modalits du diagnostic.
La transmission du virus, ses inconnues, sa prvention.
Le principe du traitement.
La co-infection 2 virus ou plus: HIV, HBV, HDV, HCV, due au mode de contamination.
Virus des hpatites - 2me partie
164/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 165/307
Chapitre 7
Les virus respiratoires - 1
re

partie
Ce sont, daprs une convention quelque peu arbitraire, les virus qui ont pour organe-cible habi-
tuel et principal larbre respiratoire. Il peut sagir de la partie haute de larbre respiratoire (rhini-
te, pharyngite, laryngite) ou de la partie basse (bronchite, pneumonie). La plupart des infections
virus respiratoires sont des infections localises , cest dire tablies au niveau de la mu-
queuse respiratoire et nallant pas plus loin, de sorte que porte dentre et organe cible sont con-
fondus et que lincubation de la maladie, courte, nest que de quelques jours, ce qui favorise une
diffusion rapide de linfection dans la communaut. Cest le cas de la grippe, des laryngites virus
para-influenza, de la rhinite rhinovirus, de la bronchiolite ou de la pneumonie virus respiratoire
syncytial.
Nentrent pas dans ce cadre conventionnel des virus respiratoires dautres virus pour lesquels lat-
teinte de larbre respiratoire apparat essentiellement comme une complication de linfection ou
comme une manifestation parmi dautres dune atteinte polyviscrale (VZV, CMV, virus de la va-
riole). Enfin dans certains cas, des membres dune famille virale se caractrisent par des manifes-
tations respiratoires marques alors que dautres ne sont responsables que de manifestations
digestives (Adenoviridae).
Ainsi, nous tudierons ici les virus de la grippe ou virus influenza, les virus para-influenza, le virus
respiratoire syncytial ou virus RS, les coronavirus, les rhinovirus, et les adnovirus responsables
dinfections respiratoires. A lexception des adnovirus (virus ADN, nus), il sagit de virus
ARN, et lexception des rhinovirus (virus ARN, nus), ce sont des virus pourvus dune enve-
loppe ou pplos.
7.1 Virus de la grippe ou virus influenza
La grippe est une infection virale souvent bnigne et trs frquente. La plupart des sujets font plu-
sieurs fois la grippe dans leur vie. Cependant la grippe peut tuer : lpidmie de 1918 aurait fait 20
40millions de morts, voire 100 selon lestimation maximale, soit 1% de la population mondiale.
En tout cas, elle a incontestablement surpass nos glorieux massacres de la premire guerre mon-
diale.
Les virus respiratoires - 1re partie
166/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
7.1.1 Clinique de la grippe
Cest une maladie qui svit lhiver. Chaque anne, survient alors une pidmie de grippe, avec,
tous les 10 ans environ, une pidmie dune tendue trs inhabituelle qui touche pratiquement toute
la population mondiale: on parle alors de pandmie. Il en fut ainsi en 1947, en 1957 et en 1968.
Le mot influenza, dorigine italienne, rappelle quautrefois on croyait que la grippe survenait sous
linfluence des astres. Cest une tendance de lesprit humain dattribuer au cosmos les grandes pi-
dmies, quelles quelles soient (cf. le virus Apollo).
Le mot grippe vient dagripp et suggre une maladie brutale. De fait, aprs une incubation de 1
2 jours, cest soudainement une fivre, 40C, accompagne de douleurs diffuses, de cpha-
les, de rachialgies, de myalgies; le malade a limpression dtre rou de coups.
Il existe des signes respiratoires, mais ils sont discrets : un coulement nasal, une toux sche, par-
fois des douleurs pharynges, larynges, trachales, ou un saignement de nez (une pistaxis). Voil
quoi se rsument les symptmes de la grippe. Il faut ajouter que chez le jeune enfant une fivre
de cette intensit peut dclencher une crise convulsive hyperpyrtique.
Lexamen physique est habituellement ngatif, contrastant avec lintensit des signes gnraux.
Lauscultation pulmonaire est le plus souvent normale. La radiographie pulmonaire galement. On
ne trouve de foyer pulmonaire que dans 10% des cas. Il ne faut donc pas compter sur la radio-
graphie pulmonaire pour confirmer un diagnostic de grippe, et il est hors de question de pro-
poser une radiographie pulmonaire en cas dpidmie de grippe tous les malades suspects: ce
serait une source de dpenses et dirradiation considrables, en pure perte.
Trois 4 jours plus tard tout est rentr dans lordre, la fivre a disparu, du moins dans les for-
mes simples. Donc la grippe donne un syndrome fbrile de dure limite qui ressemble la
phase dinvasion de bon nombre de maladies infectieuses.
Sur quoi va-t-on penser la grippe? Essentiellement sur les arguments pidmiologiques trs
simples: cest lhiver, et lon a appris par les mdias quil y avait une pidmie de grippe, pidmie
apparue en gnral en Orient (Chine), et qui, un endroit donn, dure en moyenne six semaines.
On sait en effet cela grce un rseau de surveillance de la grippe, plac sous lgide de lO.M.S.,
avec comme relais local le Centre National de Rfrence (CNR) de la Grippe de lInstitut Pasteur
de Paris, pour le Nord de la France, celui de Lyon pour le Sud. Il sappuie sur un rseau-sentinelle
mobilisant des volontaires Pdiatres et Gnralistes surveillant particulirement les collectivits
denfants qui ont un rle damplificateur pour la propagation des virus de la grippe.
Le classique V grippal de la courbe thermique (reprise de la fivre aprs un intervalle libre) sob-
serve surtout en cas de complications secondaires, de surinfection bactrienne.
Au total, la clinique ntant pas caractristique, ce quon qualifie cliniquement de grippe nest rel-
lement la grippe - infection virus influenza A ou B - que dans 20% des cas.
7.1.2 Parcours du virus de la grippe dans lorganisme
La grippe est lexemple mme dune maladie locale, localise larbre respiratoire, bien quon
observe des signes gnraux trs diffus et trs intenses. Le virus, qui est un virus enveloppe, fra-
gile, pntre dans lorganisme par inhalation des microgouttelettes projetes par les personnes
infectes; il se multiplie aussitt dans larbre respiratoire cili qui va du nez jusquaux bron-
chioles. Linfection ne va pas au del, dans les formes habituelles. Le virus ne se multiplie pas dans
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 167/307
lalvole. En profondeur, il ne dpasse pas la membrane basale. Sauf exception, il ny a pas de
virmie. Donc, la multiplication virale reste localise la porte dentre du virus dans lorganisme.
Do la brivet de lincubation, 1 2 jours. Cette multiplication locale donne une ncrose de
lpithlium respiratoire cili, donc des lsions intenses, mais rversibles. Cette ncrose sac-
compagne dhyperscrtion de mucus bronchique et dune hypertension modre dans la petite cir-
culation.
Cette ncrose explique la toux, lpistaxis inconstante. On pense que fivre et myalgies sont dues
la scrtion de cytokines, dinterfron (ladministration mdicale dinterfron donne de fait
une fivre brutale et des myalgies pseudogrippales) et dinterleukine 6.
Cela tant, pour une infection grippale cliniquement exprime, il y a 3 9infections
asymptomatiques.
A loppos, la grippe tue parfois. Les pidmies de grippe se traduisent toujours par un excs
de dcs. On estime la mortalit moyenne de la grippe 0,1 %
Rappel sur la notion dorgane-cible. On appelle organe-cible dun virus le ou les organes dont lin-
fection est lorigine des signes cliniques caractristiques de la maladie. Ainsi, la corne antrieure
de la moelle pour les poliovirus et non la muqueuse digestive pourtant infecte mais cliniquement
muette; lpithlium respiratoire cili pour les virus de la grippe ; les glandes salivaires, les
glandes gnitales, les mninges pour le virus des oreillons et non la muqueuse respiratoire qui re-
prsente pourtant la porte dentre, muette, du virus.
Dans les maladies virales localises, incubation courte, porte dentre et organe cible sont
confondus : grippe, gingivostomatite herptique. Dans les maladies virales gnralises, les orga-
nes cibles sont distance de la porte dentre du virus, do lincubation longue.
7.1.3 Morts par grippe
Habituellement 0,5-1 10
6
par an, dont 1500 en France, mais bien plus en cas de pandmie.
1. Elles sexpliquent parfois par une surinfection bactrienne : la ncrose de lpithlium res-
piratoire cili et lhyperscrtion de mucus font de larbre respiratoire lquivalent dun tube
de culture pour bactries, dautant que les macrophages infects par les virus grippaux ont
un pouvoir phagocytaire diminu. Do la possibilit de surinfection Haemophilus influen-
za, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Neisseria, cest--dire des bactries
commensales de larbre respiratoire suprieur qui profitent de la destruction du tapis muco-
ciliaire pour faire une descente dans larbre respiratoire infrieur, normalement strile
(grce ce tapis roulant). Cest surtout en cas de surinfection bactrienne que lon voit le clas-
sique V grippal de la courbe thermique, et une hyperleucocytose polynuclaires. La pneu-
monie Staphylococcus aureus est la surinfection la plus grave (mortalit de 30 50%).
Cette surinfection bactrienne, qui est difficile prvoir, nexplique quune proportion des
morts par grippe.
2. Car dans la majorit des cas mortels, on a, lautopsie, une pneumopathie purement virale, la
pneumonie grippale primitive, qui associe la ncrose de la muqueuse respiratoire cilie,
un dme hmorragique massif. Celui-ci remplit compltement les alvoles, distend les
poumons qui sont vritablement noys.
On connat des circonstances qui favorisent lapparition de cette pneumonie grippale
maligne: ce sont tous les tats dinsuffisance cardiaque ou respiratoire : les bronchites
Les virus respiratoires - 1re partie
168/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
chroniques de ladulte, la dilatation des bronches ou la mucoviscidose de lenfant, les cardio-
pathies du sujet g ou les malformations cardiaques congnitales de lenfant. Ces sujets fra-
giles situs aux deux extrmes de la vie supportent mal lhyperscrtion bronchique et la
surcharge modre de la petite circulation qui accompagnent linfection grippale. La scr-
tion inapproprie de cytokines est galement tenue responsable de la grippe maligne
( orage cytokinique ).
Un autre catgorie de sujets risque plus que les autres la grippe maligne: ce sont les femmes
enceintes qui ont, ltat physiologique en cours de grossesse, une surcharge de la petite cir-
culation.
Il reste que bon nombre de pneumonies grippales mortelles surviennent sans cause favorisante
connue, chez des sujets en pleine force de lge, sans explication.
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 169/307
7.1.4 Virus de la grippe ou virus influenza et modifications
antigniques
Les virus influenza appartiennent la famille des Orthomyxoviridae.
Ce sont des virus ARN, ARN en 8 molcules distinctes, ce qui favorise considrablement les
rassortiments gntiques. Ces ARN sont dans une capside protique tubulaire (symtrie hlico-
dale) en huit morceaux.
Il existe trois types de virus grippaux distincts par lantignicit de leurs protines de capside:
les virus influenza A, les virus influenza B et les virus influenza C (ces derniers pour mmoire, car
ils ne donnent pratiquement que des infections inapparentes).
Les virus respiratoires - 1re partie
170/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les virus de la grippe ont une enveloppe ou pplos (comme tous les virus humains capside tubu-
laire), pplos driv de la membrane cytoplasmique. Donc, ils sont transmis directement, par voie
respiratoire, par inhalation en face de sujets infects.
Il est important dtudier la structure dtaille de ce pplos. Il porte deux sortes de spicules, qui
sont des glycoprotines virales: les spicules dhmagglutinine, en abrg H, et des spicules de
neuraminidase, en abrg N. Ce sont des antignes viraux. Ces structures jouent un rle dans la
multiplication virale. Lhmagglutinine intervient pour lattachement du virus sur la membrane
cytoplasmique des cellules infecter et pour la fusion du pplos la membrane cytoplasmique. La
neuramidase joue un rle au moment du dtachement des bourgeons lors de la formation des
nouveaux virus et dautre part elle lyse le mucus bronchique qui a des proprits antivirales (voir
plus loin illustration VII-3 (voir page 178)).
Linfection produit des anticorps contre lhmagglutinine, et des anticorps contre la neurami-
nidase. Ces anticorps vont sopposer la multiplication virale; ils sont donc neutralisants et cela
a des implications pidmiologiques.
Aprs une pidmie de grippe, lhiver suivant, la plupart des sujets ont des anticorps anti-H ou anti-
N. Cela cre dans la population humaine une barrire immunitaire vis--vis du virus de lpidmie
prcdente. Cest alors que les virus influenza utilisent leur facult dadaptation, surtout les virus
influenza A. Quelque part dans le monde, en Chine Centrale le plus souvent, apparat un mutant,
un virus influenza A nouveau qui va pouvoir surmonter la barrire immunitaire, grce une modi-
fication antignique de la neuraminidase ou de lhmagglutinine.
Ces modifications par mutation comportent deux niveaux, des mutations radicales qui changent
compltement la constitution antignique de la neuraminidase ou de lhmagglutinine et des mo-
difications plus lgres.
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 171/307

Les virus respiratoires - 1re partie
172/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
1. Les modifications radicales sont ce quon appelle une cassure ou saut antignique.
Ainsi, les premiers virus influenza A isols en 1933 avaient une hmagglutinine H0, une neu-
ramidase N0. En 1947, est apparu un virus influenza A H1N1. En 1957, un virus influenza A
H2N2 (grippe asiatique). En 1968, un virus influenza A H3N2 (grippe de Hong Kong).
Ces modifications antigniques majeures de la neuraminidase ou de lhmagglutinine ne
concernent que les virus de type A, et ont fait apparatre, lintrieur des virus de type A
autant de sous-types diffrents, chaque sous-type nouveau remplaant dans la population le
sous-type prcdent et crant une pandmie (pidmie de toute ou quasiment toute la popu-
lation mondiale), puisque le virus est radicalement nouveau pour la population mondiale. Ain-
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 173/307
si la dernire pandmie a t celle de Hong Kong en 1968.
2. Dautre part, entre chaque saut antignique, se produit un deuxime type de modification an-
tignique, qui modifie lgrement la neuraminidase N ou lhmagglutinine H. Cest un glis-
sement antignique survenant tous les ans ou tous les deux ans. Ces modifications
antigniques mineures donnent, non pas des pandmies mais, tous les ans ou tous les deux
ans, des pidmies limites touchant une fraction seulement de la population. Ce glissement
antignique aboutit tout de mme au fait que la souche de grippe A H3N2 de lhiver 2005-
2006, par exemple, est notablement diffrente de la souche A H3N2 initiale apparue en 1968.
Les glissements antigniques concernent les virus influenza A et les virus influenza B.
Le glissement antignique dtermine lapparition de nouveaux variants, alors que les sauts
donnent de nouveaux sous-types.
Le substrat gntique des modifications antigniques des virus grippaux est le suivant :
Les glissements antigniques, modifications mineures, sont favorises par linstabilit gntique
de lARN (par opposition au ADN) et le caractre infidle des ARN polymrases virales (pas de
mcanisme de relecture ni de correction derreur). Ils rsultent du changement ponctuel de quel-
ques bases nucliques dans le gne correspondant lhmagglutinine ou/et le gne correspondant
la neuraminidase (2 ou 3 par an). Par glissement, apparaissent lintrieur du mme sous-type,
H3N2 par exemple, toute une srie de variants qui sloignent progressivement de la souche
dorigine: les variants A H3N2 actuels sont, comme on la dit, trs diffrents de la souche A H3N2
initiale apparue en 1968.
Les cassures antigniques ou sauts correspondent des remaniements gntiques beaucoup plus
importants que des mutations ponctuelles (illustration VII-2). Ce sont des rassortiments g-
ntiques, cest dire des changes complets de gnes entiers. Ces changes portant sur les gnes
de lhmagglutinine et/ou de la neuraminidase se font avec des virus influenza A animaux, des
porcs, des chevaux, des oiseaux aquatiques (canards). Les sauts aboutissent lapparition de nou-
veaux sous-types lintrieur du type A. Le rservoir des virus influenza A est constitu par les
oiseaux aquatiques, domestiques ou sauvages, migrateurs, ces animaux ne manifestant pas de
maladie. Le porc, qui a des rcepteurs la fois pour les virus influenza A aviaires et pour les virus
influenza A humains, est un hte intermdiaire, le creuset o se font les rassortiments gnti-
ques. Les nouveaux sous-type A et donc les nouvelles pandmies naissent gnralement en Chine
rurale o voisinent ltroit hommes, cochons et canards (cf menus des restaurants chinois). Ce-
pendant, des passages directs de souches aviaires lhomme sont possibles (grippe du poulet
Hong Kong en 1997 puis 1999, au Vitnam en 2004). Il ny a pas de virus influenza B animaux
[avec la rserve que les phoques pourraient constituer des htes potentiels de virus influenza B] et
donc pas de sauts pour les virus influenza B humains qui ne font que glisser. On a pu prouver r-
cemment que la souche de grippe A espagnole de 1918 avait une origine aviaire. Cela tant, on na
pas dexplication simple son redoutable pouvoir pathogne. La virulence des virus de la grippe
est probablement polygnique.
En pratique, pour se protger dune pidmie, il faudrait que la souche de virus contenue dans le
vaccin soit la souche de lpidmie, mais cest difficile en pratique car on na souvent pas le temps
au cours de lhiver disoler la souche pidmique, de lidentifier, de prparer le vaccin, de le con-
trler et de le diffuser toute la population susceptible dtre atteinte. Cette course contre la mon-
tre mne gnralement au mois de mars et lpidmie est passe. Pendant lanne du saut, on est
en manque de vaccin efficace.
On ne peut donc que prendre la souche de lpidmie prcdente qui protge partiellement pour
Les virus respiratoires - 1re partie
174/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
lhiver suivant, condition quil ny ait pas eu entre-temps de saut antignique. En cas de saut
antignique, les vaccins dont on dispose sont compltement prims.
Si on voulait bien faire, il faudrait prvoir. Or, cest bien difficile car, par exemple, en 1977-78 les
choses ne se sont pas du tout passes comme dhabitude et les virus influenza A ont djou les
prvisions des pidmiologistes sur deux points importants.
1. Il y a eu coexistence de deux sous-types de virus influenza A en circulation: une souche
H3N2, trs modifie par rapport la souche H3N2 de 1968 mais appartenant nanmoins au
sous-type H3N2 et surtout une souche du sous-type H1N1 qui avait prvalu de 1947 1957
est rapparue. Il sagit l de la rsurgence dun sous-type historique, fossile , teint en
1957. Entre temps, o taient passes les souches H1N1, si ce nest dans les souchiers des
laboratoires? Pourquoi et comment sont-elles rapparues? La rgle qui voulait quun sous-
type chasse le prcdent na pas t vrifie et depuis 1977 on isole tous les ans des sou-
ches A H3N2 et A H1N1.
2. On avait prvu ds la rapparition du sous-type H1N1 que cette souche allait infecter tous les
sujets ns aprs 1957 (< 22ans) et entraner dans ce groupe dge une vritable pandmie. Or,
lhiver 1977-78 a t caractris par une pidmie de grippe fort discrte, mme chez les jeu-
nes.
Il faut en conclure que nous ne comprenons que partiellement lpidmiologie de la grippe et
la politique de vaccination sen ressent fortement.
Depuis 1977 circulent, en France et ailleurs, simultanment trois sortes de souches de virus
grippaux :
1. des souches de grippe A H3N2, variants trs loigns de la souche dorigine de 1968: nous
sommes peut-tre en fin de glissement, menacs par lapparition prochaine dun saut antig-
nique. Lavenir le dira.
2. des souches de grippe A H1N1 qui, comme les souches H3N2, glissent tous les ans ou tous
les 2ans.
3. des souches de grippe B, qui glissent plus lentement.
Les vaccins grippaux sont donc trivalents depuis 1977.
Une grande question deux volets : quand la prochaine pandmie, invitable, et quelle en
sera la gravit (comme en 1918 ou comme en 1968 seulement) ? La grippe du poulet virus A
H5N1 qui en 1997 a donn quelques cas dinfections humaines mortelles Hong-Kong a fait trem-
bler. Mais ses capacits pidmiologiques chez lhomme se sont en fait rvles trs limites, peut-
tre grce labattage de millions de poulets immdiatement entrepris Hong-Kong. Un nouveau
virus du poulet, A H9N2, a infect quelques Chinois en Avril 99. Affaire suivre. Aux Pays Bas
en 2003, un virus A H7N7 venant des mouettes et responsable dune pidmie svre de peste
aviaire chez les poulets est pass lhomme avec plus de cent cas de conjonctivite mais aussi deux
cas de syndromes grippaux dont un mortel. Dbut 2004 au Vitnam, nouvelle alerte la grippe
du poulet A H5N1 avec quelques cas humains svres. On redoute lhumanisation de ces
souches de grippe aviaire, cest--dire lacquisition du pouvoir de passer dhomme homme
(revoir illustration 1bis).
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 175/307
7.1.5 Diagnostic au laboratoire
(revoir illustration II-8 (voir page 83)
7.1.5.1 Dtection du virus
A partir des scrtions nasales prleves au tout dbut de lvolution, par couvillonnage (et non
par prlvement au niveau de la gorge qui nest pas tapisse par lpithlium respiratoire cili!).
Ces virus sont fragiles, do limportance du milieu de transport.
1. Inoculation pour isolement . Elle se fait en culture cellulaire, mais pas sur nimporte quelle
culture de cellules, par exemple sur cellules MDCK. Les cellules KB ne conviennent pas. Un
autre systme cellulaire utilisable est reprsent par luf de poule embryonn, inocul dans
la cavit amniotique, cest--dire dans la poche o dbouchent les voies respiratoires de lem-
bryon.
La multiplication virale est dcele par lapparition dune hmagglutinine dans le liquide
de culture, dans le liquide amniotique, et les virus influenza sont typs trs facilement en in-
hibition de lhmagglutination (IHA).
2. Une autre faon de dtecter le virus consiste dtecter des antignes viraux. Il existe des m-
thodes dimmunocytodiagnostic rapide, consistant rechercher dans les cellules desqua-
mes du tractus respiratoire lexistence dune fluorescence laide dimmunsrums
antivirus influenza A ou B conjugus la fluorescine. On peut galement recourir sur les s-
crtions respiratoires une technique immunoenzymatique, soit classique sur support solide
(ELISA), soit ultrarapide sur une membrane filtrante (savonnette ).
3. La dtection dacides nucliques viraux, par RT-PCR par exemple, est une mthode trs sen-
sible mais encore rserve actuellement des laboratoire spcialiss.
7.1.5.2 Srodiagnoctic
On dispose de 4 ractions pour le srodiagnostic:
1. La raction de neutralisation.
Elle existe toujours en virologie et elle est toujours trs sensible et trs spcifique (de sous-type et mme de va-
riant). Ainsi, elle distingue les anticorps vis--vis dun sous-type donn et mme vis--vis dun variant donn.
Elle a linconvnient dtre fastidieuse
2. La raction de fixation du complment
Elle a lavantage dtre de ralisation commode. Elle est peu sensible (chez lenfant, il est frquent quelle ne
dtecte aucune lvation du titre des anticorps). Sa spcificit est large: spcificit de type, soit A, soit B. Elle
ne distingue pas les anticorps vis--vis des diffrents sous-types dun mme type. Elle met en jeu lantigne de
nuclocapside interne; il est commun tous les virus influenza dun mme type, par exemple tous les virus
influenza de type A, quil sagisse des sous-types H0 N1, H1 N1; H2 N2 ou H3 N2, et, sil apparaissait demain,
dun nouveau sous-type A (H4 N3?). Contrairement aux antignes du pplos (H et N), cet antigne nuclocap-
sidique varie peu.
3. LIHA a les mmes avantages que la neutralisation: sensibilit, spcificit troite de sous-type et mme de va-
riant, et de plus, sa ralisation est trs simple
4. La technique ELISA, trs commode, automatisable.
Les virus respiratoires - 1re partie
176/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
De toute faon, le srodiagnostic doit porter sur une paire de srums, S1 prlev le plus tt possible
la premire fois o lon voit le malade, et S2 prlev trois semaines plus tard. Un dlai de 2 se-
maines est insuffisant pour une maladie incubation courte. On recherche une lvation du taux
des anticorps dau moins 1 4 lexamen simultan de deux srums. Le rsultat du srodiagnostic
parvient donc toujours au moment de la convalescence, do son absence dintrt pour le pa-
tient. Rappelons quun srodiagnostic portant sur un seul srum na aucune valeur diagnostique
dinfection actuelle; il na dintrt qupidmiologique. Dans le cas de la grippe il faut privi-
lgier lisolement et le diagnostic rapide.
7.1.5.3 Indications
Quand est-il intressant de faire un diagnostic virologique exact par examen de laboratoire, au
cours de la grippe? Dabord dans toutes les formes graves. Mais aussi dans les formes banales
o il est ncessaire, dans une vise pidmiologique, de procder sur quelques cas lisolement
du virus, pour tudier les modifications antigniques ventuelles au Centre National de la Grippe
de lInstitut Pasteur de Paris ou celui, de Lyon, cela pour actualiser les vaccins. Enfin, quand les
cliniciens font une tude particulire vise cognitive, par exemple, ltude de lefficacit dun
vaccin antigrippal ou dune chimiothrapie antivirale, il faut, pour que les conclusions de telles tu-
des soient valables, que le diagnostic de grippe soit confirm, et seul le laboratoire peut apporter
cette confirmation.
7.1.6 Traitement et prvention de la grippe
7.1.6.1 Traitement symptomatique
Le traitement est essentiellement symptomatique. Pas dantibiothrapie vise prventive pour
viter la surinfection bactrienne : elle na pas prouv son efficacit. En revanche, une antibio-
thrapie est prescrite si lon a des signes objectifs en faveur dune surinfection bactrienne
dbutante: persistance de la fivre au del des trois jours habituels (a fortiori V grippal), expecto-
ration devenant purulente, apparition de signes de signes de pneumonie; cest alors une antibio-
thrapie a priori active sur Streptococcus pneumoniae et sur Haemophilus influenzae, comme
lassociation amoxicilline +acide clavulanique (augmentin) ou, moins communment, cphalos-
porines de 1
re
gnration. Rappelons que les sujets fragiles bnficient de la vaccination anti-
pneumococcique, en mesure dviter certaines surinfections graves.
7.1.6.2 Vaccination
Voir calendrier des vaccinations page257 et page261.
La vaccination nest pas parfaite. Son taux de protection a t valu entre 40 et 80%, ce qui
nest pas ngliger.
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 177/307
La grippe est la dernire des grandes maladies pandmiques des temps passs que lon ne sait pas
contrler. Cependant, fait rconfortant, une mta-analyse portant sur 20tudes a indiqu une r-
duction par la vaccination de 68 % des morts par grippe.
On dispose dun vaccin tu formol, qui contient les deux souches rcentes de virus grippal A (H1
N1 et H3 N2) et une souche rcente de virus grippal B. Son efficacit est limite (mais relle)
pour deux raisons. Le vaccin se trouve toujours en retard dune mutation et si cette mutation
donne une cassure, le vaccin disponible ne vaut plus rien. Dautre part, cest un vaccin qui, inject,
par voie sous-cutane ou IM, suscite surtout des anticorps dans le sang, et peu dIgA dans les
scrtions respiratoires. Donc, il protge pas trs bien la seule zone o les virus grippaux se mul-
tiplient, cest--dire lpithlium respiratoire cili. Enfin, il faut recommencer la vaccination tous
les ans, car la protection apporte est brve, et de toutes faons le virus change tous les deux ans.
Dans ces conditions, la vaccination nest pas obligatoire. Il est cependant conseill de la faire chez
des sujets risque que sont les insuffisants cardiaques et les insuffisants respiratoires chroni-
ques de tous ges (le jeune enfant atteint de mucoviscidose comme le sujet dge mr atteint dem-
physme, le jeune atteint de cardiopathie congnitale comme ladulte atteint de cardiopathie
dgnrative), les sujets fragiles (transplants, dialyss), les vieillards, et les femmes encein-
tes... et tous ceux qui la demandent pour tenter dviter la grippe. Enfin, la vaccination des per-
sonnels soignant des sujets fragiles est tout fait recommande dans lintrt de ces derniers:
vaccination altruiste qui a pu dans certaines communauts rduire la mortalit par grippe chez
les patients.
Lavenir de la vaccination est peut-tre dans des prparations antigniques labores pour admi-
nistration par voie nasale. Un vaccin vivant par souche attnue aprs passages en culture de cel-
lules 25C (souche adapte au froid) est lessai en administration par voie nasale.
7.1.6.3 Rimantadine
Cest une substance antivirale qui agit sur la pntration et la dcapsidation des virus, par voie ora-
le. Sa cible est la protine de matrice M2 qui tapisse intrieurement lenveloppe virale. Elle est ac-
tive sur les souches de grippe A mais non de grippe B, et surtout titre prventif. Ce produit peut
donner des syndromes dpressifs et des troubles du sommeil et des troubles de la marche, en par-
ticulier chez les personnes ges, mais au total il nest pas si mal tolr. Il faudrait lutiliser en cas
de menace de grippe A par nouveau sous-type chez des sujets particulirement fragiles.
Le traitement se fait par voie orale, tant que dure la vague pidmique.
En traitement curatif la Rimantadine ne donne que des rsultats modestes mais significatifs: abr-
gement de 24heures de la symptomatologie, ce qui pour une maladie aussi courte que la grippe (3
4 jours de manifestations aigus) nest pas trs spectaculaire.
Les virus de la grippe A, en raison du manque de fidlit de lARN polymrase virale, slection-
(% de gripps dans le groupe tmoin) - (% de gripps chez les vaccins) x 100
(% de gripps dans le groupe tmoin)
Les virus respiratoires - 1re partie
178/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
nent aisment des mutants rsistants. Cela joint aux effets secondaires et des ventes modestes a
fait arrter la commercialisation du produit.
7.1.6.4 Zanamir et oseltamivir
Ces produits nouveaux sont des inhibiteurs de la neuraminidase des virus de la grippe A com-
me de la grippe B. Le Zanamivir est administr en pulvrisation par voie respiratoire (risque de
bronchospasme chez les personnes asthmatiques) et lOseltamivir per os (Tamiflu).
Ces inhibiteurs de la neuraminidase ont une activit curative modeste sur la grippe dclare, en rac-
courcissant la dure des symptmes. Lactivit est plus nette titre prventif.
Il faudra avoir des grands stocks de ces antiviraux, pour le cas o surviendrait une pandmie.
7.1.6.5 Au total
Les communications faites dans la presse propos de ces deux nouveaux antiviraux ne doivent pas
faire perdre de vue que le principal moyen de prvention - en partie efficace - des complica-
tions de la grippe est la vaccination. La chimiothrapie par Zanamivir ou Oseltamivir (Tamiflu),
voire Rimantadine, est indique titre prventif pour les personnes risque de complications
de grippe qui nauraient pas t vaccines ou qui rpondent mal la vaccination (immunodpri-
mes), et titre curatif pour les mmes personnes si elles dclaraient la grippe.
Les virus respiratoires - 1re partie
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 179/307
7.1.7 Points importants
La grippe A et la grippe B sont des des virus ARN segment, chaque segment correspond
un gne. Ils sont envelopps et portent deux sortes de spicules glycoprotiques, lhmag-
glutinine et la neuraminidase qui toutes deux suscitent des anticorps neutralisants, protec-
teurs.
La grippe est une infection virale localise, ayant pour organe-cible lpithlium respiratoi-
re cili, peu accessible la vaccination.
Dautant que les virus grippaux sont sujets des variations antigniques : sauts pour les vi-
rus influenza A et glissements pour les virus influenza A et B.
Les sauts ont pour origine des rassortiments de gnes entre souches de virus influenza A
humains et animaux.
Ce rassortiment se fait gnralement par une infection mixte chez le porc : des souches
aviaires, provenant initialement doiseaux aquatiques domestiques (canards) ou sauvages
(oiseaux migrateurs), passent au porc o elles rencontrent des souches humaines ayant infect
ce dernier. Le porc est donc, jusqu prsent le creuset des rassortiments qui ont men aux
pandmies de grippe A.
Cependant, des cas sporadiques de passage de souches aviaires (grippe du poulet) direc-
tement lhomme, sans passer par le porc ont t rcemment observs en Asie, avec quel-
ques cas mortels, mais sans passage dhomme homme jusqu prsent.
Quoiquil en soit, on a toute raison de redouter court ou moyen terme une humanisation,
indirecte via le porc ou mme directe, des souches aviaires qui, les rendant capables de
passer dhomme homme, entranera une pandmie dvastatrice, peut-tre quivalente
celle de 1918.
Les rseaux de surveillance pidmiologique de la grippe pour isolement et caractrisation
des nouvelles souches mobilisent des mdecins de famille. Ils sont indispensables la prpa-
ration de vaccins actualiss.
Ces vaccins sont trivalents (AH3N2, AH1N1 et B), administrer tous les ans aux sujets fra-
giles et leurs personnels soignants.
Le potentiel de nuisance des virus influenza est imprvisible mais redoutable.
Les virus respiratoires - 1re partie
180/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 181/307
Chapitre 8
Les virus respiratoires - 2
me

partie.
Les virus des oreillons, de la
rougeole, de la rubole
8.1 Virus respiratoires (2
me
partie)
Aprs les virus influenza, il reste traiter sous le chapitre virus respiratoires les virus para-in-
fluenza (PIV), le virus respiratoire syncytial (RSV), les coronavirus humains banals et le corona-
virus du syndrome respiratoire aigu svre (SRAS), et les rhinovirus.
PIV et RSV appartiennent la famille des Paramyxoviridae qui est voisine de la famille des
Orthomyxoviridae (virus de la grippe ou influenza) et qui comprend aussi le virus des oreillons et
le virus de la rougeole. Les coronavirus appartiennent une famille trs diffrente, celle des
Coronaviridae. Quant aux rhinovirus, ils appartiennent la famille des Picornaviridae.
8.1.1 Gnralits sur la famille des Paramyxoviridae
Aux cts de la famille des Orthomyxoviridae (virus influenza), la famille des Paramyxoviridae
comporte deux sous-familles :
les Paramyxovirinae avec les virus para-influenza (genre Respirovirus), le virus des oreillons
(Rubulavirus) et le virus de la rougeole (Morbillivirus) ;
les Pneumovirinae avec le virus respiratoire syncytial ou virus RS.
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
182/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
8.1.1.1 Structure
Tous sont des virus ARN, capside tubulaire, envelopps. Cette enveloppe ou pplos drive de
la membrane cytoplasmique, par bourgeonnement et porte des spicules de glycoprotines qui in-
terviennent dans lattachement et la pntration.
Sauf dans le cas du VRS, ces spicules sont dous de proprits hmagglutinantes, tandis que les cellules infectes h-
madsorbent. Hmagglutination et hmadsorption sobservent donc avec tous ces virus lexception du virus RS.
Chez ces virus, on ne voit pas de variations antigniques importantes dans le temps, rien qui
ressemble aux cassures et glissement des virus de la grippe. Les srotypes sont relativement sta-
bles, fixs. Do labsence de pandmie. Mais on observe tous les ans de petites pidmies du-
rant la saison froide et humide.
8.1.1.2 Transmission
Comme tous les virus pplos, ce sont des virus fragiles. Leur transmission est respiratoire, inter-
humaine directe, favorise par un temps froid et humide. Ils sont excrts dans les scrtions res-
piratoires mais pas dans les selles. Ils ne persistent pas longtemps dans lenvironnement. Il ny a
pas de transmission hydrique, fcale-orale.
Les prlvements pour isolements supportent mal le transport et sont inoculer si possible au lit du malade, sinon
transporter rapidement au laboratoire dans de la glace ou bien congeler dans la carboglace (-80C).
Cependant, pour faire un diagnostic direct en immuno-fluorescence ou en immuno-peroxydase
(immunocytodiagnostic) sur les cellules respiratoires desquames, il suffit de transporter dans la
glace le produit de laspiration naso-pharynge ou de lcouvillonage nasal et il ne faut surtout pas
congeler le prlvement (cela dtruirait les structures cellulaires et empcherait limmuno-cytodia-
gnostic).
Dans lorganisme infect, ces virus, entrs par inhalation, se multiplient dans lpithlium respira-
toire. Pour les virus para-influenza et le virus RS, linfection reste localise larbre respira-
toire, sans virmie, do une maladie locale incubation courte, respiratoire haute ou basse.
Pour les virus des oreillons, le virus de la rougeole, linfection diffuse par virmie et lon a une
maladie gnralise, incubation longue.
Toutes ces infections surviennent habituellement tt dans lenfance.
8.1.2 Les virus para-influenza
Ils sont 4, les virus para-influenza 1 4.
8.1.2.1 Manifestations cliniques
A ct de nombreuses infections inapparentes, ces virus donnent, comme leur nom lvoque, des
infections assez voisines de la grippe, localises larbre respiratoire, incubation courte. Ce
sont des infections survenant dans la petite enfance, des infections respiratoires surtout hautes,
notamment des laryngites.
Les virus para-influenza 1 4 sont de fait les principaux agents des laryngites aigus de lenfant
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 183/307
ou du nourrisson. Elles donnent, cliniquement de la fivre avec une toux rauque, des modifications
de la voix, enroue, et dans les formes svres une dyspne inspiratoire (comme toutes les dys-
pnes larynges).
8.1.2.2 Traitement de ces laryngites
Il comporte une succession de mesures gradues selon la gravit des signes. Dabord une associa-
tion dantipyrtique et de sdatif. Puis lhumidification de latmosphre. Si cela ne suffit pas, il
faut donner des corticodes (1 ampoule de soludcadron i.m.) et dans les cas les plus graves, recou-
rir une intubation larynge. Ne pas examiner la gorge labaisse-langue en cas de laryngite aigu
sous-piglottique, du fait dun risque de spasme laryng.
8.1.2.3 Diagnostic virologique
1. Indications : Il nest intressant que pour les formes svres ou lorsquon procde une en-
qute pidmiologique ou thrapeutique.
2. Isolement
Cest lisolement des virus dans les scrtions respiratoires, non dans les selles. Ils se multi-
plient en cultures de cellules courantes, donnant souvent un ECP fait de syncytiums avec in-
clusions cytoplasmiques et toujours une hmadsorption. La seule difficult lisolement de
ces virus vient de leur fragilit.
3. Srodiagnotic. Il na pas dintrt en pratique mdicale courante.
Il faudrait examiner simultanment deux srums, prcoce et tardif, la recherche dune lvation significative
du taux des anticorps, soit une variation dau moins 1 4. Il ny a pas un antigne commun entre les 4 virus para-
influenza, mais une certaine parent antignique, de sorte que linfection par lun de ces virus donne souvent une
sroconversion vis--vis de plusieurs virus para-influenza. Mais il ny a pas proprement parler dantigne de
groupe, pas de raction de groupe: il y a 4 srodiagnostics para-influenza distincts, ce qui en fait une procdure
lourde. Par ailleurs, la ncessit dexaminer simultanment 2 srums, prcoce et tardif fait que le rsultat ne vien-
drait qu la convalescence et ne changerait donc rien la prise en charge du patient.
4. Diagnostic direct rapide : dtection dantigne par examen en immunofluorescence ou im-
munoperoxydase des cellules respiratoires desquames (frottis nasal ou aspiration naso
trachale). Cet immunocytodiagnostic est privilgier. Il a lintrt, outre sa rapidit, dtre
praticable sur des prlvements transports simplement dans de la glace, sans conglation.
8.1.2.4 Vaccination
PAS DE VACCIN DISPONIBLE NI DE CHIMIOTHRAPIE VALIDE.
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
184/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
8.1.3 Virus respiratoire syncytial
Noter le deuxime y comme dans cytologie.
8.1.3.1 Linfection
Il donne des infections localises larbre respiratoire, particulirement chez le tout jeune en-
fant. A lge de 2ans, presque tous les enfants ont rencontr ce virus. Les trois-quarts des bron-
chiolites du nourrisson sont dus au virus RS. Ce virus donne aussi des pneumonies du
nourrisson. Ces manifestations respiratoires basses surviennent par pidmies tous les hivers, en-
tranant alors (avec les diarrhes concomitantes rotavirus) une surcharge dactivit des pdiatres
et des infections nosocomiales. Chez certains nourrissons, en particulier les prmaturs, elles sont
trs svres, entranant une insuffisance respiratoire aigu qui oblige des mesures de ranimation.
La mortalit est alors de 2%.
On distingue des souches de groupe A et des souches de groupe B, qui gnralement circulent simultanment dans la
population.
Par ailleurs, une infection virus RS est souvent retrouve dans les poumons lautopsie de nourrissons morts su-
bitement. Ce nest probablement l quun facteur dclenchant sur fond de tendance lapne du sommeil.
Dautre part, il est remarquable que ce virus RS infecte des enfants trs jeunes qui, pour la plupart,
ont encore des anticorps maternels.
Il donne aussi des rinfections chez les adultes en contact avec de jeunes enfants. Ces adultes, sauf
tat dimmunodpression, ne font habituellement quune infection respiratoire bnigne. Une infec-
tion svre peut sobserver chez les adultes immunodprims ou chez les vieillards o la priode
dpidmie virus RS est lorigine dun excs de mortalit.
Linfection virus RS est, comme la grippe, un srieux problme de sant publique.
8.1.3.2 Diagnostic au laboratoire
1. Le virus se multiplie en culture de cellules courantes en donnant des syncytiums (comme son
nom lindique) avec inclusions cytoplasmiques. Ce virus est encore plus fragile que le virus
de la grippe, de sorte quil faudrait inoculer les cultures au lit du malade.
2. En fait, il faut privilgier le diagnostic rapide, sur les scrtions respiratoires, avec plusieurs
techniques disponibles. 1/ Limmunocytodiagnostic : on soumet les cellules des scrtions
respiratoires obtenues par frottis nasal (ou aspiration trachale ou bronchique chez les enfants
intubs) un immunsrum fluorescent anti-virus RS, et en cas dinfection virus RS on ob-
serve une fluorescence du cytoplasme qui traduit la prsence dantigne viral en immuno-
fluorescence. 2/ On peut galement recourir une technique immunoenzymatique
classique sur support solide (ELISA), ou encore 3/ une technique immunoenzymatique ultra
rapide par immunofitration sur membrane (savonnette ). 3/ La RT-PCR reste pour le mo-
ment cantonne aux laboratoires spcialiss en virologie.
3. Le srodiagnostic na pas dintrt.
La sroconversion est inconstante: linfection survient souvent sous anticorps maternels et lenfant jeune rpond
mal en anticorps et, de toute faon, toujours tardivement, la convalescence.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 185/307
8.1.3.3 Traitement
Les infections respiratoires svres virus RS ont fait lobjet de traitements par arosol de ribavirine, nucloside an-
tiviral spectre large et assez toxique (sauf en arosol). Lefficacit en est trs discute.
Un vaccin contre le virus RS serait trs utile. Malheureusement nous nen avons pas actuel-
lement.
Un vaccin tu avait t prpar. Il suscitait des anticorps, mais ne protgeait pas, bien au contraire: il entranait une
sensibilisation des enfants qui, rencontrant ultrieurement le virus, dveloppaient une maladie plus svre que les su-
jets non vaccins! Cest rapprocher du fait que bronchiolites et pneumonies du nourrisson de moins de 6mois sur-
viennent sous anticorps transmis de la mre.
Toutefois, ladministration danticorps monoclonaux pour prvenir les pidmies de crche est
lessai avec des rsultats encourageants mais un prix trs lev (30000F/enfant !). Comprenne
qui peut !
8.1.3.4 Mtapneumovirus humain
On a dcouvert en 2001 quune part des broncho-alvolites du nourrisson est attribuable en fait
un virus voisin mais diffrent du virus RS, le METAPNEUMOVIRUS HUMAIN. Il est ubiqui-
taire, comme le virus RS, mais plus difficile isoler en culture de cellules (do sa dcouverte tar-
dive) et son principal test est la RT-PCR, si lon tient le reconnatre.
8.1.4 Coronavirus
1. Ce sont des virus ARN, envelopps, avec certaines particularits : le gnome le plus long
des virus ARN (30kb) ; de trs larges spicules denveloppe, donnant la particule virale
un aspect en couronne; une relative rsistance dans lenvironnement et la prsence dans les
selles (en rapport avec cette enveloppe particulire?).
2. Les coronavirus humains banals. Ils comptent parmi les agents du rhume, derrire les
rhinovirus. La difficult de leur isolement en culture de cellules, la bnignit du rhume et lab-
sence de traitement antiviral font que le diagnostic virologique, hors enqutes spcifiques,
nen est pas fait.
3. SRAS-CoV
Le SRAS (SARS, en anglais)
Cest la premire menace de pandmie du troisime millnaire. Cette pneumonie s-
vre, apparue en novembre 2002 dans la province de Guangdong (ex Canton) en Chi-
ne, a diffus jusquen avril 2003, touchant plus de 8000personnes. Elle est due un
coronavirus nouveau, dorigine trs probablement animale (la civette), les coronavirus
humains dj connus ne donnant que des rhumes. Limplication de ce nouveau virus
(isol initialement en culture de cellules Vero) comme agent du SRAS a t dmontre
par la reproduction de la maladie chez le singe (cynomolgus).
Physiopathologie
Le SRAS diffre de la grippe par les caractres suivants: mortalit plus leve
(10%) ; incubation plus longue (six jours, avec des extrmes de 14jours) ; caractre
gnralis de linfection (le virus est prsent dans les scrtions respiratoires, mais
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aussi dans les urines, les selles, le sang) ; pic de multiplication virale relativement tar-
dif (10jours aprs le dbut des signes cliniques) ; raret des affections
asymptomatiques ; frquence de la pneumonie plus grande chez ladulte que chez
lenfant (comme pour la pneumonie de la varicelle) ; contagiosit limite (deux
quatre cas secondaires par cas index, mais exceptionnellement beaucoup plus; pour
la grippe, cest 5 10cas, voire 15 en cas de pandmie) ; diffusion nosocomiale im-
portante parmi le personnel (maladie des blouses blanches) ; enfin contrle pos-
sible de lpidmie par des mesures dhygine (isolement, quarantaine,
bannissement des arosols) ds que les cas sont reconnus.
Diagnotic virologique
Il est ncessaire. En phase aigu, on recherche le gnome viral par RT-PCR en temps
rel sur les scrtions respiratoires, les urines, les selles. Le diagnostic rtrospectif
peut se faire par la recherche dune sroconversion sur deux prlvements sriques,
prcoce et tardif (IF ou ELISA si le patient survit).
Traitement
Il ny a actuellement pas de traitement antiviral valid. La question: cette pidmie
lie une zoonose peut-elle reprendre tous les ans? Importance de la surveillance en
Chine de la civette et autres animaux sauvages vendus sur les marchs et utiliss en
plats cuisins.
8.1.5 Rhinovirus
Les rhinovirus de la famille des Picornaviridae, petits virus ARN, nus, sont trs voisins des cho-
virus, mais ils sont dtruits pH acide et se multiplient prfrentiellement 32C. Donc ils ne
passent pas lestomac, contrairement aux entrovirus. Linfection se limite ainsi larbre respi-
ratoire suprieur. Ce sont ainsi les principaux responsables des rhumes de cerveau. Il en existe
prs de 100 srotypes distincts sans immunit croise. Donc, pas de vaccination en perspective
et la possibilit pour chacun de nous de faire plusieurs rhumes par an tout au long de notre vie. Leur
isolement est rarement fait ; il exigerait des cultures de fibroblastes humains maintenus 32C,
temprature de larbre respiratoire suprieur.
8.2 Virus des oreillons ou virus ourlien
8.2.1 Le virus
Cest un virus unique. Il est antigniquement apparent aux virus para-influenza mais son pouvoir
pathogne est tout fait diffrent, puisquil donne une infection gnralise incubation longue
et tmoigne dun tropisme extra-respiratoire pour le systme glandulaire et le systme nerveux
central.
Il y a dabord une phase de multiplication virale dans la muqueuse respiratoire et cela habituelle-
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 187/307
ment sans signes cliniques, contrairement aux virus influenza et para-influenza. Puis le virus passe
dans le sang et par virmie diffuse tout lorganisme (on le retrouve dans les urines), toujours sans
signes cliniques. Cest aprs une incubation fort longue, de 21 jours en moyenne, quapparat la
parotidite bilatrale, signe habituel de linfection virus ourlien. Mais les glandes salivaires ne
sont pas les seuls organes cibles. Le virus ourlien est capable de donner une pancratite, une or-
chite chez ladulte jeune, une mningite lymphocytaire, voire exceptionnellement une encpha-
lite. Ces manifestations sont diversement associes.
La parotidite nest pas constante. Il existe des mningites ourliennes isoles sans autres signes. Vi-
rus des oreillons, coxsackie, chovirus et VIH sont les principaux agents de mningites lymphocy-
taires aigus virales, les causes bactriennes tant Listeria, Brucella et la tuberculose.
Un tiers des infections virus ourlien sont asymptomatiques (inapparentes).
Les oreillons chez la femme enceinte nentranent pas de malformations de lembryon, mais ils
peuvent aboutir, en dbut de grossesse, un avortement.
8.2.2 Diagnostic virologique
Quand on souhaite un diagnostic virologique, on peut rechercher le virus par isolement partir de la salive, mais aussi
partir des urines et, dans les formes mninges, partir du L.C.R. Le virus se multiplie facilement en cultures de
cellules courantes donnant des syncytiums avec inclusions cytoplasmiques et une hmadsorption. Le seul problme
tient sa fragilit, les prlvements supportant mal le transport.
Le plus commode est le srodiagnostic par ELISA, avec, simplement, la recherche dIgM sp-
cifiques dans un srum prlev en phase aigu
8.2.3 Traitement
Il existe un vaccin vivant attnu, injectable. On peut lassocier au vaccin contre la rougeole et
au vaccin contre la rubole (vaccin ROR). On peut aussi ladministrer seul aux adolescents ou
aux jeunes adultes sans antcdents connus doreillons. En pratique, on administre le ROR entre
12 et 14 mois et rappel entre 3 et 6 ans (voir le calendrier vaccinal page 257 et page 261)
8.3 Virus de la rougeole
Cest un Paramyxoviridae tout fait distinct des prcdents, antigniquement unique.
8.3.1 Manifestations cliniques
Avant la vaccination, presque personne ny chappait. Il donne, contrairement aux virus prc-
dents, une infection presque toujours apparente, symptomatique, avec ruption. Cest une virose
gnralise, point de dpart respiratoire. Le virus diffuse par virmie. Il y a galement une viru-
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rie. Aprs une incubation silencieuse de 10 jours, on observe une phase dinvasion marque par
une fivre leve, 40 C, et deux signes particuliers, vocateurs: le catarrhe et lnanthme. Ca-
tarrhe vient dun mot grec qui signifie couler : lenfant a en effet un larmoiement et une hypers-
crtion des voies respiratoires avec laryngite (toux rauque) et bronchite, et parfois une diarrhe.
Lnanthme est fait de petits points blancs en grain de semoule sur la muqueuse des joues;
cest le signe de Koplik.
Lexanthme survient 14 jours aprs le contage (incubation longue des infections virales gnra-
lises). Il est constitu dune ruption maculopapuleuse diffuse, mais dbute la tte derrire
les oreilles. Lruption est attribue lapparition dans le sang dimmuns complexes circulants
virus-anticorps. Elle apparat en mme temps que les anticorps. Les complications les plus fr-
quentes sont les otites.
Lencphalite de la rougeole est une encphalite post-ruptive. Elle nest pas due une multipli-
cation du virus dans le cerveau, mais est probablement dorigine allergique. Cest une encphalite
par dmylinisation priveineuse. On en voit un cas pour 1.000 rougeoles et sa mortalit est de
10%. Ce nest donc pas une raret. Elle est responsable dun dcs pour 10.000 rougeoles.
Il y a dans nos pays autant de dcs par pneumonie, pneumonies de surinfections bactriennes ou
pneumonies virales pures. Parmi ces dernires, la pneumonie cellules gantes, gravissime, sur-
vient chez les sujets immunodprims. Cela tant, des images radiologiques pulmonaires anorma-
les sont banales au cours des rougeoles bnignes.
Dans les pays pauvres la rougeole est catastrophique, avec 2 millions de dcs chaque anne.
Elle entrane une dcompensation des carences immunitaires et dans certaines populations sous-
alimentes elle tue un quart des enfants. La conjonctivite, lorigine du larmoiement, banal chez
nous, est par surinfection bactrienne lorigine de ccit! Il faut signaler que linfection par le
virus de la rougeole saccompagne et entrane pour quelques mois une immunodpression, qui
dans les pays du Tiers Monde apporte sa part de complications de surinfection.
Enfin il existe une trs rare encphalite subaigu mortelle due au virus de la rougeole: cest la pa-
nencphalite sclrosante subaigu (PESS). Elle comporte des lsions de sclrose de la substance
blanche et de la substance grise. Elle survient des annes aprs la rougeole, 7 ans en moyenne et
touche un enfant sur un million.
Dans les cellules crbrales, neurones et cellules gliales, on observe des inclusions nuclaires et cytoplasmiques, qui
en microscopie lectronique apparaissent formes dlments tubulaires de 18nm de diamtre; ce sont des nuclocap-
sides, comme on en voit en cultures de cellules infectes in vitro par le virus de la rougeole. Cest donc une encphalite
due la multiplication dans le cerveau du virus de la rougeole, cela des annes aprs la rougeole.
Depuis la diffusion de la vaccination antirougeole, la PESS rgresse trs nettement, comme
toute complication de la rougeole.
Contrairement la rubole, la rougeole en cours de grossesse ne donne pas de malformations.
8.3.2 Diagnostic virologique
1. Indications
Habituellement, il nest pas ncessaire en pratique mdicale courante puisque la clinique est
trs vocatrice. Cependant il est utile pour un diagnostic de certitude devant une forme atypi-
que. Il est ncessaire pour distinguer rougeole et rubole, chez une femme enceinte ou dans
lentourage dune femme enceinte.
2. Lisolement est difficile car le virus lisolement pousse assez mal en cultures cellulaires. Il
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 189/307
lui faut des cultures cellulaires particulires, de rein ou damnios humains, de rein de singe. Il
donne des syncytiums avec inclusions nuclaires et cytoplasmiques et une hmadsorption des
globules rouges de singe.
3. Limmunocytodiagnostic rapide par immunofluorescence ou immunoperoxydase directe-
ment sur les cellules respiratoires du frottis nasal ou de laspiration nasopharynge est beau-
coup plus pratique.
4. Le plus commode est le SERODIAGNOSTIC par ELISA, avec, simplement, la recherche
dIgM spcifiques dans un srum prlev en phase aigu.
8.3.3 Vaccin
Il existe un VACCIN attnu vivant, injectable, donner vers 12-14 mois, aprs la disparition
des anticorps maternels mais avant que lenfant ne rencontre la rougeole. Il est associ aux
vaccins contre les oreillons et la rubole : cest le ROR. Il est, comme tout vaccin vivant, contre-
indiqu chez les sujets immunodprims. Pour les enfants du Tiers Monde ou mme pour les en-
fants vivant en crche, il existe un srieux risque de rougeole trs prcoce survenant ds la chute
des anticorps maternels, cest--dire dans les derniers mois de la 1re anne de vie. Aussi, dans ces
conditions de vie, prconise-t-on une premire vaccination par le vaccin rougeole seul (Rouvax)
lge de 8-9 mois, avec une revaccination 12-14 mois par le ROR. Un rappel de ROR est recom-
mand dans tous les cas, entre 3 et 6 ans. En effet, la vaccination ntant efficace qu 90-95%,
il se constituerait peu peu, en labsence de rappel, un ensemble de sujets rceptifs lorigine
dune pousse pidmique (voir calendrier des vaccinations page257 et page261).
La France sillustre par une mauvaise couverture vaccinale par le ROR. En Grande Bretagne le
ROR a t accus tort de causer lautisme. chaque pays ses rumeurs: en France, cest laccu-
sation du vaccin contre lhpatite B de causer la sclrose en plaques.
Les GAMMA-GLOBULINES ORDINAIRES injectes aussitt aprs un contage prviennent la
rougeole. Il en va de mme de la vaccination, puisquon a affaire une infection virale gnralise
incubation longue.
8.4 Points importants
Les Paramyxoviridae sont des virus ARN, envelopps, porte dentre respiratoire. Ils
nont pas la variabilit antignique des Orthomyxoviridae (=virus influenza de la grippe). Ils
comprennent les virus para-influenza, le virus des oreillons, le virus de la rougeole, le virus
RS et le mtapneumovirus.
Les virus para-influenza donnent des infections localises larbre respiratoire et notamment
des laryngites.
Le virus des oreillons est un paramyxovirus tropisme glandulaire et nerveux, donnant donc
une infection gnralise, incubation de 3 semaines.
La rougeole est une infection virale gnralise, presque constamment symptomatique, avec
ruption.
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Dans les pays industrialiss, les principaux risques de la rougeole sont actuellement la pneu-
monie rougeoleuse et lencphalite post-ruptive, survenant chacune dans un cas pour 1000
rougeoles, avec une mortalit de 10%.
Dans le Tiers Monde, avant les campagnes de vaccination, survenaient des pidmies de rou-
geole avec une mortalit pouvant dpasser 25%.
Le virus respiratoire syncytial (RS) est le principal agent des pidmies hivernales de bron-
chiolites du nourrisson. Il pose un vritable problme de sant publique.
Il ny a pas actuellement de vaccin contre linfection virus RS et ni de chimiothrapie vali-
de.
Le vaccin ROR - Rougeole Oreillons Rubole - est lassociation de 3 vaccins vivants attnus.
Il est indiqu entre 12 et 14mois, avec un rappel entre 3 et 6ans.
Dans les pays du Tiers Monde et pour les enfants de nos pays vivants en collectivit, on re-
commande, avant le ROR, une vaccination pralable par le seul vaccin rougeole (Rouvax) ds
8-9 mois.
Parmi les Coronaviridae, le coronavirus du SARS-CoV est un virus ARN envelopp mais
assez rsistant, dorigine probablement animale, donnant une infection gnralise avec pneu-
monie grave, moins pidmique que la grippe.
Parmi les Picornaviridae (aux cts des entrovirus) les rhinovirus, dont il existe une centaine
de srotypes distincts, sont les principaux agents du rhume, pour lequel nous navons ni vac-
cin, ni antiviral (sujet de moquerie vis--vis des virologistes!).
8.5 Virus de la rubole
Lintrt de la rubole tient au risque de rubole congnitale et sa prvention. Nous disposons
actuellement de moyens diagnostiques et dune vaccination efficaces, le seul problme tant de les
utiliser bon escient. Or, des erreurs sont souvent faites lors de linterprtation des srodiagnostics
de la rubole, notamment chez la femme enceinte. Nous rappellerons les proprits du virus, les
caractristiques cliniques et srologiques de la primo-infection postnatale, de la rinfection, de la
rubole congnitale, la conduite tenir chez la femme enceinte, et le traitement prventif de la ru-
bole congnitale.
8.5.1 Le virus
Cest un virus ARN, icosadrique, enveloppe (pplos). Parmi les Togaviridae, il est unique,
bien individualis. Comme tout virus pplos, il ne persiste pas dans lenvironnement, sinactive
rapidement dans les selles, ne se transmet pas distance. Fragile et strictement humain, il est
transmis par contacts interhumains directs, respiratoires.
Bien que strictement humain, il se multiplie dans des cultures cellulaires humaines ou animales
dorigines trs diverses.
Son ECP est tardif, trs limit et discret. Et mme, dans certaines cultures de cellules, il ny a
aucun ECP : la culture parat normale. Mais la prsence du virus est rvle par immuno-cytodia-
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 191/307
gnostic (immunofluorescence ou immunoperoxydase). Ce virus trs peu lytique donne nanmoins
des cassures chromosiques et un ralentissement des mitoses dans les cultures de cellules infec-
tes.
Enfin, il hmagglutine, do la possibilit dune raction dIHA pour le srodiagnostic, vrai dire
supplante maintenant par la technique ELISA.
Le virus est dcelable dans la gorge des sujets infects et la priode de contagiosit (quil nest
pas possible de dlimiter de faon tranche) va de 5 8 jours avant 5 8 jours aprs le dbut
de lruption. La rubole est moins contagieuse que la varicelle ou la rougeole.
On observe des cas tout au long de lanne, mais avec prdominance au printemps.
8.5.2 Primo-infection rubolique
Il est important de distinguer primo-infection et rinfection car le risque de rubole congnitale
est, de trs rares exceptions, li aux seules primo-infections maternelles en dbut de gros-
sesse.
Chez un sujet infect pour la premire fois, le virus inhal se multiplie dans les voies respiratoires,
puis diffuse largement, par virmie, tout lorganisme, entranant donc une infection gnralise.
8.5.2.1 Diagnostic clinique
Lruption apparat au terme dune incubation de 16 jours en moyenne, cette incubation longue
tant une caractristique des infections gnralises avec virmie. Apparaissant en mme temps
que les anticorps circulants, elle est trs probablement due laction des immuns complexes virus-
anticorps sur les capillaires sanguins.
Quoi quil en soit, lruption de la rubole peut prendre plusieurs aspects. Il en est un considr
tort comme typique de rubole et quil vaudrait mieux qualifier simplement de ruboliforme:
ruption dbutant sur le visage, rapidement gnralise, faite de petites macules ( 3 mm,) rose p-
le, durant 3jours. Le syndrome infectieux est discret, la fivre ne dpassant pas 38,5 C. Deux si-
gnes compltent le tableau: des adnopathies quasi-constantes, apparues avant lruption,
gnralises et notamment cervicales postrieures, et, chez ladulte, des arthralgies.
On pourrait donc opposer point par point lruption de la rubole celle de la rougeole, prcde
dune fivre 40 C, avec catarrhe et signe de Koplik, faite de maculopapules 5 mm et dun rouge
plus intense. Mais assimiler les ruptions ruboliformes la rubole serait tout fait faux,
pour trois raisons:
1. La rubole donne parfois des ruptions intenses, morbilliformes (=ressemblant la rou-
geole), scarlatiniformes ou purpuriques
2. Au cours de la primo-infection, lruption est inconstante, et lon observe un grand nombre
de primo-infections inapparentes: en France, 9femmes sur 10en ge dtre enceintes ont
dj fait la rubole, alors qu linterrogatoire, on ne retrouve dantcdents plus ou moins
vocateurs de rubole que dans la moiti des cas. En contrepartie, une femme enceinte sou-
mise un contage peut infecter son ftus sans faire elle-mme de manifestations clini-
ques.
3. En dehors dune pidmie de rubole caractrise, la moiti des ruptions ruboliformes
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typiques viennent en fait dune infection par un virus autre : adnovirus, chovirus ou
coxsackievirus, EBV, parvovirus B19, voire HHV-6.
Il faut bien admettre que le diagnostic de la rubole nest pas clinique. Cest un diagnostic de la-
boratoire qui comporte, comme lexamen clinique, ses rgles et ses limites. En pratique, toute
ruption maculopapuleuse ou purpurique, survenant chez une femme enceinte ou dans son
entourage, doit tre considre comme suspecte de rubole, et impose un diagnostic au labo-
ratoire.
8.5.2.2 Diagnostic au laboratoire
Ce nest pas le diagnostic direct dans ltat actuel des techniques. Lisolement du virus, trop
fragile et trop difficile multiplier en cultures de cellules in vitro, est trop long et surtout de rsultat
trop alatoire pour tre propos au mdecin praticien. La recherche du virus par RT-PCR est en
valuation dans les laboratoires spcialiss.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 193/307
En fait, le diagnostic de laboratoire repose sur le diagnostic indirect, le srodiagnostic. On a la
chance davoir affaire un virus antigniquement unique et hmagglutinant, ce qui a permis une
raction dinhibition de lhmagglutination (IHA), raction la fois commode et sensible. Elle est
actuellement supplante par lELISA ou par un test rapide au latex.
LIHA utilise la proprit du virus dagglutiner les hmaties de poussins. Les anticorps de la rubole, se fixant sur le
virus, en empchent laccs aux hmaties: do linhibition de lhmagglutination. Pour rechercher le titre en anti-
corps de la rubole dun srum, il faut mettre des dilutions croissantes de ce srum (1/10, 1/20, 1/40... 1/1280) en
contact avec une quantit fixe de virus de la rubole (4 units hmagglutinantes) et dterminer jusqu quelle dilution
il y a encore IHA. Le rsultat de lexamen est donn sous la forme dun nombre, 640 par exemple. Cela signifie que
la dilution au 1/640
me
du srum est la dernire dilution qui inhibe lhmagglutination; cest le titre du srum en an-
ticorps ruboliques inhibant lhmagglutination. En ELISA, le rsultat est exprim en densit optique (DO) ou plus
couramment en units internationales (UI) ; en gros, 1/10correspondant 12,5 UI, 1/40 50 UI.
Utilis pour faire le diagnostic dune ruption suspecte de rubole, le srodiagnostic recherche
non pas un titre danticorps lev mais une lvation du titre des anticorps, ce qui implique trois
conditions:
1. Le prlvement dates convenables de deux srums permettant dencadrer llvation du ti-
tre des anticorps, cest--dire un premier srum prlev le plus tt possible et un deuxime
srum prlev 15 jours aprs lapparition de lruption.
2. Ces deux srums doivent tre examins simultanment en parallle au cours de la mme
preuve, bien videmment dans le mme laboratoire.
3. Pour parler dlvation significative, il faut observer, dans ces conditions dexamen correctes,
une variation dau moins 1 4 du titre des anticorps entre le premier et le deuxime s-
rum en IHA ou une variation de 1 2 de la densit optique en ELISA.
Cest sur le praticien que repose lobtention du premier srum le plus tt possible. Avec un s-
rum prlev plus de 3 jours aprs lapparition de lruption, on peut manquer llvation du titre
des anticorps (et donc le diagnostic) et rassurer tort une femme enceinte en dbut de grossesse.
Quant au titre danticorps en soi, il na pas de valeur diagnostique: un titre lev (1.280) nest nul-
lement significatif dinfection rcente car on en observe des annes aprs primo-infection et lin-
verse on a des primo-infections sans que le titre danticorps ruboliques dpasse 80 voire 40. Il faut
admettre la variabilit individuelle extrme de la rponse immunitaire. Il ny a pas de norme
en matire de titre danticorps ruboliques ; ce nest pas une constante biologique.
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8.5.3 Rinfection rubolique
Les sujets qui, aprs primo-infection, ont gard un titre danticorps ruboliques insuffisant peuvent
se rinfecter au contact dun sujet contagieux. Mais alors, aprs inhalation du virus, linfection se
limite la porte dentre respiratoire, aux voies respiratoires, sans donner de virmie, donc sans
ruption et surtout sans risque de rubole congnitale. La rinfection rubolique est localise.
La rinfection est asymptomatique : chez une personne expose un contage suspect, la sur-
veillance par srodiagnostic dcle une augmentation significative du titre des anticorps lexa-
men des deux srums. Une rinfection se prsente exactement comme une primo-infection
asymptomatique et ce nest pas le srodiagnostic ordinaire qui peut faire la distinction. Il faut pour
cela caractriser les anticorps ruboliques apparus aprs le contage :
Dans les primo-infections, ce sont des IgG et des IgM ruboliques, la prsence de ces dernires
ntant que temporaire. Dans la rinfection, on ne trouve que des IgG ruboliques.
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8.5.4 Rubole congnitale
On en observe seulement une vingtaine de cas par an en France grce la vaccination.
8.5.4.1 Signes
Diversement associs, ils se groupent sous deux rubriques, embryopathie et ftopathie. En effet,
des malformations dues un trouble de lembryogense peuvent toucher simultanment ou iso-
lment trois organes: lil, sige de cataracte et de chorio-rtinite; loreille, o latteinte de la co-
chle et de lorgane de Corti entrane une surdit; et le cur, dont les deux malformations les plus
frquentes sont la persistance du canal artriel et la stnose de lartre pulmonaire.
La ftopathie rsulte de linfection persistante des diffrents organes au-del de leur forma-
tion et donne, outre une hypotrophie, une hpatite avec ictre et purpura thrombopnique, une
pneumonie, des bandes claires mtaphysaires la radiographie des os longs. Ces enfants suppor-
tent une multiplication virale intense et prolonge sur un an, avec excrtion du virus dans la gorge,
les urines, les larmes, les rendant trs contagieux.
La ftopathie rubolique apparat cliniquement assez proche des autres ftopathies infectieuses (
cytomgalovirus, herpes simplex virus, Toxoplasma gondii, Treponema pallidum, Listeria
monocytogenes, streptocoque B, Escherichia Coli ), alors que lembryopathie est beaucoup mieux
individualise.
Bien que lestimation des squelles psychiques varie beaucoup dune tude lautre, le retard men-
tal est moins frquent quau cours de lembryo-ftopathie cytomgalovirus, et lon peut retenir
lincidence de 15%.
Linfection de lenfant suppose une virmie maternelle lors dune primo-infection. Dans
lembryon infect par voie transplacentaire, le virus dtermine une angiopathie, pas de cytolyse
majeure - on la vu - mais un ralentissement des mitoses, do les malformations et, la naissance,
un nouveau-n de poids insuffisant par dficit quantitatif en cellules. Ce virus, in vivo comme in
vitro, ne donne quun effet cytopathique modr, do son pouvoir tratogne. Un virus plus
cytolytique tuerait purement et simplement lembryon dans 100% des cas.
[A noter une analogie dans le dterminisme de lembryopathie rubolique et de la maladie des in-
clusions cytomgaliques du nouveau-n. Il sagit gnralement dune femme enceinte non immu-
nise vis--vis du virus en question, et mre dun premier enfant lui aussi non immunis;
cet enfant contracte, auprs de ses petits camarades, linfection cytomgalovirus ou la rubole
quil rapporte la maison. Do les mesures de prvention: vaccination rubolique avant sortie de
la maternit (cf plus loin page199) et, pour le CMV, en labsence de vaccin, mesures dhygine
lors des soins de la mre (et du pre) au premier enfant (cf 3
e
cours, page100).]
8.5.4.2 Diagnostic au laboratoire
Le diagnostic de rubole congnitale repose sur deux examens: la dtection du virus, favoris ici
par son abondance et sa persistance dans tous les prlvements (par isolement en culture de cellules
ou par RT-PCR), et la recherche, la naissance ou dans les mois qui suivent, dIgM ruboliques
dans le sang.
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8.5.4.3 Evaluation du risque
Le risque de malformation varie selon lge gestationnel lors de linfection, et C.A. Alford indique
un pourcentage danomalies dtectes 4ans de 85% pour un ge gestationnel de 5 8semaines,
de 52% entre 9 et 12semaines, de 16% entre 13 et 20 semaines, et nul au-del.
Quoi quil en soit, le risque danomalies congnitales, maximal pour le premier mois, persiste
encore, bien que rduit, au-del du premier trimestre de grossesse, avec notamment un ris-
que de surdit rvlation retarde. Cela impose, aprs la naissance dun enfant apparemment
indemne, des bilans rgulirement rpts.
Il ny a pas de risque dembryopathie en cas de rubole avant la date des dernires rgles.
8.5.5 Conduite tenir chez une femme enceinte
Chez une femme enceinte, la conduite tenir en matire dexamen srologique de la rubole et lin-
terprtation des rsultats sont totalement diffrents selon les motifs de lexamen. Il faut bien
distinguer trois situations, qui exigent chacune une dmarche radicalement diffrente:
ruption plus ou moins suspecte de rubole?
contage plus ou moins suspect de rubole?
un examen srologique de rubole demand sans notion druption ni de contage suspect et
que lon qualifie de ce fait dexamen systmatique ?
Une rponse claire ces questions est le pralable toute prescription dexamen srologique
de rubole une femme enceinte
8.5.5.1 Examen pour ruption en cours de grossesse
Une lvation significative du titre des anticorps de la rubole, dans des conditions dexamen
correctes, fait conclure la rubole, et il reste valuer le risque danomalies congnitales en fonc-
tion de lge de la grossesse pour aider la patiente prendre la dcision dinterrompre ou de pour-
suivre sa grossesse. La recherche des IgM ruboliques demande en pareil cas apporte un rsultat
attendu, positif.
En revanche, un titre danticorps ruboliques notable (40 ou plus en IHA, 50 UI ou plus en ELI-
SA) et stable peut correspondre deux situations: une ruption non rubolique et/ou une rubole
vue aprs llvation du titre des anticorps. Si, dans la majorit des cas, celle-ci se poursuit sur
8 15 jours, il arrive parfois quelle soit termine 3 jours aprs le dbut de lruption (illustra-
tion VIII-1). Il est capital de dissocier ces deux ventualits, cela par la recherche des IgM rubo-
liques, la prsence dIgM ruboliques signant la primo-infection rcente.
8.5.5.2 Examen pour contage en cours de grossesse
Il faut immdiatement prlever un premier srum cette femme, prciser les circonstances du con-
tage, les risques rels de contamination.
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 197/307
On recherchera donc des renseignements sur le contaminateur prsum : date dapparition et
aspect de son ruption, jours passs en prsence de la femme enceinte durant la priode de conta-
giosit. On essaiera de titrer les anticorps ruboliques de ce sujet suspect car sans cela, rien ne prou-
ve quil ait eu la rubole. Chez la femme enceinte, on recherchera des antcdents de rubole,
prouvs par un titrage antrieur des anticorps, ou simplement prsums sur la longue pratique
dune profession expose, puriculture, enseignement, pdiatrie, et bien sr des antcdents de
vaccination. Des antcdents certains de rubole ou de vaccination permettraient de rassurer la
femme sans autre investigation.
Labsence danticorps dans le premier srum, ou un titre minime (<10 ou 10 en IHA ou 12,5
UI), indique que la femme est rceptive et il faudra rechercher une primo-infection en prle-
vant un second srum. Fait essentiel, ce second srum est prlever non pas 15jours aprs la date
du contage, mais 4 ou la rigueur 3 semaines aprs le contage : chez une femme srongative,
ou considre comme telle, (< 10 ou 10; < 12,5 ou 12,5 UI), il faut en effet laisser passer les 15
jours dincubation dune ventuelle primo-infection, plus les 10 15jours ncessaires pour obtenir
coup sr une lvation significative du titre des anticorps.
8.5.5.3 Examen systmatique en cours de grossesse
Cest--dire sans notion de contage ni ruption.
Il est clair que cet examen aurait d tre fait avant grossesse, mais la grossesse est parfois locca-
sion de rattraper un tel oubli. Il existe pourtant des dispositions lgales connatre :
Dcret n 92-143 du 14 fvrier 1992 relatif aux examens obligatoires prnuptiaux, pr et pos-
tnatal
Art. 1
er
. - Le mdecin ne peut dlivrer le certificat prnuptial prvu larticle L.153 du code de
la sant publique quau vu du rsultat pour les femmes ges de moins de
cinquante ans:
a. Des examens srologiques de la rubole et de la toxoplasmose qui sont obligatoirement ef-
fectus lors de lexamen prnuptial en labsence de documents crits permettant de consi-
drer limmunit comme acquise ;
b. ...
Art. 2. - Les examens mdicaux obligatoires des femmes enceintes prvus larticle L.154 du
code de la sant publique sont au nombre de sept pour une grossesse voluant jusqu son terme.
Le premier examen mdical prnatal doit avoir lieu avant la fin du troisime mois de grosses-
se... sont effectus: 1. Lors du premier examen prnatal : b) Dans tous les cas, les dpistages
de la syphilis, de la rubole et de la toxoplasmose en labsence de rsultats crits permettant de
considrer limmunit comme acquise,...
Si cette femme enceinte est srongative, il lui faudra viter les occasions de contamination, sur-
tout durant les 3 4 premiers mois de sa grossesse et procder un titrage chaque mois. Naturel-
lement, cette femme devra imprativement tre vaccine en post-partum, avant la sortie de
maternit.
Si cette femme a un titre danticorps suffisant (40 voire 20 en IHA ; 50 voire 25 UI en ELISA),
elle na pas besoin dtre vaccine en post-partum.
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
198/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Tels sont les seuls renseignements utiles apports par le srodiagnostic systmatique en cours de
grossesse. Il nest pas possible de dduire du titre danticorps lui-mme la date de la rubole.
8.5.6 Rcapitulatif des dates des prlvements et des
indications de la recherche des IgM ruboliques
8.5.6.1 Dates de prlvement
Le premier srum est toujours prlever le plus tt possible. Le second srum est prlever,
en cas druption, 15 jours aprs celle-ci ; en cas de contage, 4 ou 3 semaines aprs celui-ci,
lorsque le premier srum indique un titre danticorps 10 en IHA ou 12,5 UI en ELISA.
Lorsque le premier srum indique un titre danticorps 20 en IHA ou 25 UI en ELISA, il
suffit dun dlai de 15 jours pour prlever le second srum.
Pour un examen systmatique, un srum suffit.
Les srums sont adresser au mme laboratoire, avec des renseignements cliniques sur le motif
de lexamen, renseignement prcis, dats. Sans eux, il est impossible de dcider de lutilit et de
la date dun deuxime prlvement ou de la ncessit dune recherche des IgM ruboliques.
8.5.6.2 Indications de la recherche des IgM ruboliques
Elles sont beaucoup plus restreintes. Il y a quatre indications intressantes:
1. Une augmentation significative du titre des anticorps aprs ruption pour confirmer le
diagnostic de primo-infection.
2. Une augmentation significative du titre des anticorps aprs contage non suivi drup-
tion, pour distinguer primo-infection et rinfection.
3. Le retard lexamen, soit aprs ruption, soit aprs contage. Pour tenir compte des l-
vations acclres du titre des anticorps observes chez certains individus, il parat ncessaire
de rechercher les IgM ruboliques lorsque le premier srum na pas t prlev dans les
2 premiers jours de lruption ou dans les 2 premires semaines suivant le contage.
Cela tant, la recherche des IgM ruboliques, comme tout examen, a ses limites: les IgM ru-
boliques ne durent que 3 6 semaines aprs lruption, soit 5 8 semaines aprs le con-
tage, ce qui leur donne leur signification diagnostique. En contrepartie, au-del de ce dlai, la
recherche des IgM ruboliques nest plus valable et un rsultat ngatif rassurerait peut-tre
tort. A titre dultime recours, on a pu, exceptionnellement rechercher les IgM ruboliques ou
le virus par RT-PCR dans le sang ftal ou dterminer laffinit des IgG ruboliques
maternelles: faible en cas de primo-infection relativement rcente, forte au del.
4. Le diagnostic dinfection congnitale chez le nouveau-n o les IgM ruboliques persistent
plusieurs semaines.
Lexistence dun titre lev danticorps en IHA ou ELISA nest pas une indication de la re-
cherche des IgM ruboliques, cet examen vraiment dlicat tant la source de quelques faux po-
sitifs. La recherche de ces IgM ruboliques ne doit donc pas tre systmatique.
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 199/307
8.5.7 Traitement
Les gammaglobulines mme titre lev danticorps ruboliques sont sans effet protecteur vis-
-vis dun contage, ce qui est paradoxal pour une infection gnralise.
8.5.7.1 Le vaccin
Le vaccin utilis en France est un vaccin (RA 27/3) attnu par passages en srie sur fibroblastes
embryonnaires humains. Cest donc un vaccin vivant, donn en une injection sous-cutane unique.
Il est contre-indiqu chez les sujets immunodprims et chez la femme enceinte (bien que la
vaccination accidentelle de femmes enceintes srongatives nait entran aucune anomalie
congnitale!) (voir calendrier des vaccinations page257 et page261).
8.5.7.2 Qui vacciner ?
Il faut vacciner les femmes ayant un titre danticorps de la rubole 10 en IHA ou 12 UI
en ELISA. Avec un titre de 40 (50 UI), la vaccination nentrane que rarement une lvation dan-
ticorps et apparat donc inutile. Le titre intermdiaire de 20 (25 UI) invite une vaccination de pru-
dence. En fait il faut vacciner toute femme en ge dtre enceinte, ignorant son statut
immunitaire et non vaccine.
Les virus respiratoires - 2me partie. Les virus des oreillons, de la rougeole, de la rubole
200/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Surtout, on a entrepris indpendamment de tout contrle des anticorps une vaccination large
renforce : elle vise les tous jeunes enfants des deux sexes, entre 12 et 14 mois, en association
avec la vaccination anti-rougeole et oreillons (ROR), puis rappel du ROR entre 3 et 6 ans ou au
besoin rattrapage 11-13ans en mme temps quun rappel DT Polio hpatite B et enfin les jeu-
nes femmes adultes qui nauraient pas t vaccines, cela avant grossesse, sous contraception.
Mme pour ces dernires, on peut trs bien se passer du contrle pralable des anticorps afin
dallger la mise en uvre de la vaccination. On ne doit pas dispenser de la vaccination une fem-
me sous le prtexte quelle aurait des antcdents druption prtendue typique de rubole.
Question aux Etudiantes : tes vous bien vaccines ?
Il est mme conseill de vrifier cela chez les hommes devant travailler en maternit :
vaccination altruiste (comme la vaccination du personnel soignant contre la grippe, des don-
neurs de sang contre lhpatite B et lhpatite A).
8.5.8 Points importants
Le virus de la rubole est ARN et enveloppe.
Le diagnostic de la rubole est impossible cliniquement car la clinique est trompeuse (pour
trois raisons) ; il passe obligatoirement par la srologie, examen de base en pratique mdicale.
Les raffinements de la vieille clinique dermatologique franaise nont pas leur place ici.
Le principal risque de la rubole est les malformations congnitales, cardiaques, oculaires et
auditives.
Le risque est dautant plus lev que la rubole survient plus tt durant la grossesse (1
er
mois
surtout). Il ny a pratiquement plus de risque au-del de 20semaines.
La srologie de la rubole ne peut pas - et donc ne doit pas - tre interprte si lon nen con-
nat pas le motif et la chronologie prcise des vnements motivants.
Avant toute prescription dun examen srologique de la rubole une femme enceinte, il faut
en dterminer le motif (Parle avec elle!) : pour ruption, pour contage, ou examen systma-
tique.
La rponse en anticorps ruboliques dbute avec lruption (quand elle existe) et cest, avec
ou sans ruption, 16 jours environ aprs le contage.
Cette rponse en anticorps ruboliques comporte des variations individuelles trs importantes
quant la pente de la monte des anticorps, le niveau du plateau, et le niveau des anticorps
ruboliques rsiduels.
Le vaccin, vivant cest--dire attnu, doit tre largement prescrit. Cest un composant du
ROR, administr aux garons et aux filles entre 12 et 14mois, puis entre 3 et 6ans (ou au be-
soin rattrapage 11-13ans).
Toute accouche dont la srologie rubolique est ngative ou inconnue doit tre vaccine
avant de quitter la maternit.
Avec les tests et le vaccin disponibles depuis un quart de sicle, la rubole chez la femme en-
ceinte devrait tre un problme rsolu.
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 201/307
Chapitre 9
Entrovirus et virus des
gastroentrites
Ce chapitre rassemble les virus nus ARN ; on y trouve aussi, comme virus ADN, les ad-
novirus de gastroentrites. Tous ces virus sont des virus nus, limins dans les selles.
Notons demble que les entrovirus et les virus des gastroentrites sont deux entits
distinctes : les entrovirus, en dpit de leur nom, ne donnent pas de gastroentrites.
9.1 Entrovirus
9.1.1 Gnralits sur les entrovirus
9.1.1.1 Dfinition
Poliovirus, coxsackievirus, chovirus, rhinovirus et virus de lhpatite A (vu plus haut) font partie
de la famille des Picornaviridae, petits (pico en grec) virus ARN, monobrin, en un seul seg-
ment. Les rotavirus, plus gros virus ARN deux brins en plusieurs segments, sont en dehors de
cette famille.
Les entrovirus (poliovirus, coxsackievirus et chovirus) ont des proprits communes. Ce sont,
dans les conditions naturelles, des virus strictement humains. Petits virus ARN, sans pplos, ils
ont la mme morphologie en microscopie lectronique: virus icosadriques nus (de 27nm de dia-
mtre).
Comme tous les virus nus, ce sont des virus rsistants. Une nouvelle classification divise ce en-
semble de virus en entrovirus A, B, C, D et poliovirus.
A titre indicatif, les entrovirus persistent de quelques jours 5mois dans leau du robinet, la mer ou le sol, 2 3mois
dans les hutres. Ils rsistent mieux la chloration et aux autres traitements des eaux que les bactries.
9.1.1.2 Structure et implications pidmiologiques
Ces virus sans pplos sont stables, dans le milieu extrieur et le tube digestif. Ils rsistent aux pH
acides, lacidit gastrique. Ils sont capables de se multiplier sur toute la hauteur de la muqueuse
Entrovirus et virus des gastroentrites
202/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
du tube digestif, de la gorge lintestin. Ils sont donc limins dans les selles. Ces virus, qui se
multiplient dans la gorge, peuvent tre projets par la toux et donner lieu une contamination res-
piratoire directe en face du sujet infect. Mais llimination fcale favorise une contamination f-
cale-orale indirecte par lintermdiaire daliments souills par de leau infecte, et cette
contamination est plus frquente lt et dans les pays surpeupls mauvaises conditions dhy-
gine. Cest l que la circulation des entrovirus est la plus dense. Cest essentiellement par con-
tamination fcale-orale que se propagent les entrovirus. Lpidmiologie des entrovirus
partage videmment beaucoup de caractres avec celle des entrobactries. Leur diffusion se
trouve limite par les mesures dhygine collectives et individuelles, mise disposition deau
propre et lavage des mains.
Dans limmense majorit des cas, les entrovirus donnent des infections inapparentes, asympto-
matiques, qui ne dpassent gure le tube digestif. Les infections expression clinique sont lex-
ception, et rsultent pour la plupart dune diffusion du virus dans lorganisme, dune maladie
gnralise avec virmie.
9.1.1.3 Multiplication
La plupart des entrovirus se multiplient en culture de cellules: les trois poliovirus, certains cox-
sackie A, les six coxsackie B et la trentaine dchovirus. La multiplication de ces virus ARN est
intra-cytoplasmique. Elle donne un effet cytopathique (ECP) qui est le mme pour tous les
entrovirus: une vaste inclusion cytoplasmique osinophile repousse et aplatit le noyau contre
le bord de la cellule (Cf annexe E page 277).
Du point de vue molculaire, lARN viral est positif cest dire immdiatement traduit sur les
ribosomes en protines virales. Cet ARN est donc la fois gnome et messager. Dautre part, il
est traduit dun coup en une polyprotine gante secondairement clive en une protase virale (qui
va devoir sautocliver), en une ARN rplicase ARN-dpendante (indispensable la rplication
du gnome viral car il nexiste pas denzyme ayant cette fonction dans la cellule) et en protines
structurales constituant la capside.
9.1.1.4 Caractres antigniques
Tous ces virus sont antigniquement distincts. Il ny a pas de raction de groupe, ni pour lensem-
ble des entrovirus, ni pour les poliovirus, ni pour les coxsackievirus, ni pour les chovirus. Aucu-
ne raction de groupe, contrairement aux adnovirus.
Cela a des consquences pratiques pour le typage, le srodiagnostic et les possibilits de vaccina-
tion.
1. Il nexiste pas un srodiagnostic de groupe entrovirus, ni un srodiagnostic de groupe po-
liovirus, mais trois srodiagnostics poliovirus sspcifiques, un pour chacun des trois types de
poliovirus.
2. En ce qui concerne lidentification des entrovirus, il ny a pas de raction immunologique de
groupage pour lensemble des entrovirus, ni mme de raction de groupage pour lensemble
des poliovirus.
Il nexiste pas une raction permettant de dire dun entrovirus que cest un poliovirus, mais il existe trois rac-
tions de typage permettant de dire quun entrovirus est ou bien un polio de type 1, ou bien un polio de type 2,
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 203/307
ou bien un polio de type 3, ou bien quil nest pas un poliovirus.
Toutefois, par PCR, il est possible de dpister des squences nuclotidiques
conserves cest dire communes tous les entrovirus. Cela a transform le diagnostic
des infections entrovirus, grce une PCR entrovirus consensus .
3. Il ny a pas un vaccin polio, mais trois vaccins polio associs en un vaccin trivalent.
Les quelques 60entrovirus existants sont tous antigniquement distincts, et leur regroupement en
poliovirus, coxsackievirus et chovirus, ne repose pas sur des communauts antigniques, mais es-
sentiellement sur leur pouvoir pathogne. La nouvelle classification repose sur des critres gnti-
ques.
9.1.1.5 Pouvoir pathogne
Les poliovirus sont les plus neurotropes des entrovirus: ils donnent des paralysies chez les pri-
Entrovirus et virus des gastroentrites
204/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
mates, lhomme et les singes suprieurs, mais en revanche ils ne sont pas pathognes pour les sou-
riceaux nouveau-ns.
Les coxsackievirus ne sont pas pathognes pour le singe. En revanche ils sont pathognes pour le
souriceau nouveau-n.
Les coxsackie A donnent des paralysies flasques avec myosite diffuse et les coxsackie B donnent des paralysies
spasmodiques par ncrose crbrale, cela chez les souriceaux inoculs la naissance. Certains coxsackie A ne se mul-
tiplient que chez le souriceau nouveau-n et pas en culture de cellules, en particulier le coxsackie A1. Tous les coxsac-
kie B se multiplient en culture de cellules. Le nom de coxsackie vient de la ville des USA o lon a isol le premier
dentre eux.
Les chovirus se multiplient uniquement en culture de cellules, o ils donnent leffet cytopathi-
que des entrovirus. Ils nont aucun pouvoir pathogne chez le souriceau nouveau-n.
Ce sont les moins neurotropes des entrovirus. Echo est un sigle, E pour entrique, C pour cytopathique, H pour Hu-
main et O pour orphelins, orphelins de maladie: lpoque de leur dcouverte on ne leur connaissait aucune ma-
ladie associe, ce qui nest plus vrai maintenant.
On a eu des difficults pour classer certaines souches dentrovirus comme coxsackie ou comme
chovirus. Aussi, les derniers entrovirus dcouverts, qui ne sont pas des poliovirus, ont t sim-
plement tiquets entrovirus (EV). Cest le cas de lEV 70 responsable dune pidmie mondiale
(pandmie) de conjonctivite hmorragique ; il a t appel lpoque virus Apollo, car il sest
manifest pour la premire fois en mme temps que lalunissage dApollo 11 (sic!). Ces difficults
de classification ont t en partie rsolues par la dfinition des nouveaux groupes (espces) den-
trovirus.
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 205/307
9.1.2 Poliomylite et poliovirus
9.1.2.1 Clinique
Polio (sans y) veut dire gris en grec. La poliomylite est en effet une mylite de la substance grise,
plus prcisment de la corne antrieure de la moelle. La poliomylite est caractrise par des pa-
ralysies priphriques apparues au cours dun syndrome infectieux environ deux semaines aprs le
contage.
1. Il y a donc une longue incubation (2 semaines) parfois marque par la succession de deux
Entrovirus et virus des gastroentrites
206/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
sries de signes: une angine et une diarrhe, toutes deux discrtes, puis une semaine plus tard,
un malaise gnral fbrile durant trois jours, rgressif. Mais tout cela est inconstant, et lincu-
bation de deux semaines est gnralement totalement silencieuse
2. Les paralysies apparaissent au cours dun syndrome infectieux fait de fivre et de douleurs
diffuses. Ces paralysies sont parfois prcdes de rtention durine et dun syndrome
mning: cphale et raideur de la nuque. Ce sont des paralysies brutales, priphriques,
cest--dire flasques avec abolition des rflexes osto-tendineux correspondants, sans signe
de Babinski, sans troubles de la sensibilit objective. Ce sont des paralysies asymtriques.
Elles ont des facteurs favorisants: leur apparition et leur extension sont favorises par la fatigue, les traumatis-
mes, les inoculations, lamygdalectomie, la grossesse et lge. Ces facteurs naugmentent pas la frquence des
infections poliovirus mais augmentent la frquence des paralysies au cours des infections poliovirus.
En tout cas, chez ladulte, on observe des paralysies plus graves et plus frquentes que chez
lenfant.
3. La rgression des paralysies commence au bout de deux semaines. Elle est trs lente, pouvant
staler sur deux ans, et trs souvent incomplte: les squelles sous forme de paralysies sont
le principal problme de la poliomylite. Des annes plus tard, certains malades atteints de
squelles vont connatre une aggravation de leurs paralysies: cest le syndrome post-polio-
mylitique dont le mcanisme nous chappe.
4. Un autre problme est, en phase aigu, la possibilit datteinte respiratoire.
Elle peut rsulter de trois mcanismes:
paralysie des muscles respiratoires,
atteinte du centre respiratoire bulbaire
ou atteinte du noyau du IX, ce qui donne des troubles de la dglutition et donc des atlectasies pulmonaires.
5. Les formes neurologiques, cest--dire avec paralysies, sont lexception, ne reprsentant
pas plus de 1 2 % des infections poliovirus. Dans 5% des cas linfection poliovirus don-
ne uniquement le malaise gnral fbrile de trois jours. Dans limmense majorit des cas, les
infections poliovirus sont inapparentes, surtout chez les jeunes.
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 207/307
9.1.2.2 Parcours de linfection dans lorganisme
Cette diversit dans lexpression clinique correspond au fait que, dans lorganisme, le parcours
du virus va plus ou moins loin. Ce parcours, lorsquil est complet, comporte quatre phases suc-
cessives.
1. Phase digestive : le virus, inhal ou plus souvent ingr, se multiplie dans la muqueuse pha-
rynge et intestinale, de sorte quil est prsent dans la gorge et dans les selles. A cela corres-
pond linconstante angine ou diarrhe initiale.
2. Phase de multiplication lymphatique, dans les formations lymphatiques, les amygdales, les
ganglions cervicaux profonds pour la gorge, et pour le tube digestif dans les plaques de Peyer
Entrovirus et virus des gastroentrites
208/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
et les ganglions msentriques.
3. Phase de virmie. Chez certains sujets, partir des ganglions lymphatiques, le virus gagne
par virmie, le systme monocytes-macrophages (systme rticuloendothlial et graisse bru-
ne). Il sy multiplie, ce qui donne le malaise fbrile de trois jours, et alimente la virmie.
4. La 4
e
phase ne concerne donc que 1 2% des sujets infects: cest latteinte du systme ner-
veux central. Elle suppose toutes les phases prcdentes, en particulier la virmie. Cette at-
teinte du systme nerveux central donne les paralysies ou une mningite lymphocytaire, ou
ces deux manifestations associes. Selon les cellules nerveuses atteintes, neurones ou cellules
gliales, les paralysies seront dfinitives ou rgressives.
9.1.2.3 Diagnostic au laboratoire
1. Isolement du virus. Il est prsent en abondance dans la gorge et les selles au dbut de la ma-
ladie. Il ne reste que quelques jours dans la gorge, mais il persiste durant des semaines dans
les selles, et contamine ainsi lenvironnement.
Les trois virus sont trs faciles isoler car rsistants : pas de problmes de transport des
prlvements qui peut se faire simplement dans la glace ordinaire. Les trois poliovirus se mul-
tiplient trs bien, trs rapidement en cultures de cellules courantes (KB ou cellules rnales
de singe). Le typage par sro-neutralisation se fait en trois jours. On diffrencie souches sau-
vages et souches vaccinales par anticorps monoclonaux.
2. Srodiagnostic.Cest la recherche dune lvation du titre des anticorps sur deux srums, pr-
coce (S1) et tardif (S2).
Il se fait en neutralisation avec la souche du virus isol chez le malade. Si lon na pas fait ou pas russi lisole-
ment, il faut faire, avec une souche de rfrence, trois srodiagnostics, un pour chaque srotype. En raison de la
longue incubation de la maladie, le srodiagnostic est souvent en dfaut : lors du prlvement de S1, les anti-
corps sont dj leur maximum dans la moiti des cas et lon manque llvation du titre des anticorps.
3. Diagnostic rapide par RT-PCR est de plus en plus pratiqu par les laboratoires spcialiss.
Il utilise des amorces correspondant une rgion conserve du gnome parmi les entrovirus
qui, dfaut dantignes communs, ont des squences gnomiques communes.
En pratique, isolement en culture et RT-PCR sont les meilleures techniques de diagnostic.
4. Indication : devant une suspicion de poliomylite, la gravit de la maladie impose ici sans
contestation de faire un diagnostic virologique. Lintrt pidmiologique est vident.
9.1.2.4 Vaccination contre la poliomylite
On na pas ce jour de chimiothrapie active sur ces virus, malgr lexistence dune ARN po-
lymrase virale ARN dpendante, et dune protase virale qui auraient pu constituer de trs bonnes
cibles. Le seul traitement est prventif.
Cest la vaccination, trs efficace, par un vaccin triple antipolio 1 +polio 2 +polio 3. Il en existe
deux sortes, le vaccin inactiv (tu) et le vaccin attnu (vivant), mais la prfrence va maintenant
en France au vaccin inactiv (voir calendrier des vaccinations page257 et page261).
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 209/307
1. Vaccin tu . Il est prpar partir de virus inactivs par divers moyens physico-
chimiques: le formol et la chaleur. Ce vaccin fait dantigne inerte ne se multiplie pas. Il
sadministre en injection par voie intra-musculaire ou sous-cutane; il faut procder trois
injections spares par un mois dintervalle. Ce vaccin protge 70-90%.
Il suscite des anticorps circulants, qui empchent la virmie en cas de contamination ult-
rieure par les poliovirus: il prvient la phase 3 et donc la phase 4 de la progression des polio-
virus. Grce cela, il ny a pas datteinte du systme nerveux central. Le vaccin tu ne suscite
pratiquement pas danticorps IgA dans les scrtions digestives, donc pas de barrire immu-
nitaire digestive. Il nempche pas ultrieurement une infection par les poliovirus, mais cette
infection, si elle survient, ne dpassera pas les phases 1 et 2.
Il faut pratiquer des rappels tous les 5 ou 10 ans. Le vaccin tu a lavantage de ne prsenter
aucun danger, il est utilisable et mme recommand chez la femme enceinte, dont il pro-
tgera le nouveau-n. Il nest pas contre-indiqu chez les sujets immunodprims.
2. Vaccin vivant. Il est fait de mutants attnus obtenus de la faon suivante: on a pass en s-
rie une cinquantaine de fois des poliovirus naturels, donc neuropathognes au dpart, en cul-
ture de cellules, cultures de cellules rnales de singe en particulier. Cette opration a
slectionn des mutants qui se sont bien adapts ces cellules, mais du mme coup
dsadapts au systme nerveux central : ils sont quasiment non neuropathognes.
Ce vaccin est fait de virus vivants qui se multiplient dans lorganisme mais qui ne vont pas
jusqu la phase 4, natteignent pas le systme nerveux central, chez lhte normal du
Entrovirus et virus des gastroentrites
210/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
moins.
Quand on les inocule au singe directement dans la moelle pinire, ils se multiplient parfois au point dinocula-
tion, mais pas au-del, alors que les poliovirus naturels, dits sauvages, donneraient par cette voie des paralysies
foudroyantes du fait dune extension de linfection tout le systme nerveux central.
Ces mutants ont donc un pouvoir neuropathogne extrmement rduit, chez lhte normal
du moins.
Donc, le vaccin vivant est administr par voie naturelle, buccale (en gouttes), ce qui le rend
beaucoup moins coteux que le vaccin tu. On donne, comme pour le vaccin inactiv, trois
doses de vaccin trivalent un mois dintervalle. Le vaccin se multiplie dans le tube digestif.
Comme cest un mlange dentrovirus, il peut diffuser aux membres de lentourage. Il
suscite des anticorps IgA digestifs et ralise ainsi une barrire immunitaire locale.
Il est efficace presque 100%, et son action est plus durable que celle du vaccin tu. Nan-
moins par prudence on conseille un rappel tous les 5 ans 10 ans.
Comme tout vaccin vivant, le vaccin polio vivant est contre-indiqu chez la femme encein-
te. Il est formellement contre-indiqu chez les sujets immunodprims, ou mme dans
lentourage dun sujet immunodprim (risque de diffusion) : il donne parfois chez les su-
jets immunodprims une atteinte du systme nerveux central plus grave encore que la polio-
mylite normale, faite de paralysies progressives et dune encphalite souvent
mortelles.
De plus, mme chez le sujet immunocomptent, il donne exceptionnellement des paralysies
identiques la poliomylite. Cela par mutation rverse qui restaure la neurovirulence. Un tel
vnement survient une fois pour plusieurs millions de prises du vaccin et concerne le sujet
vaccin lui-mme, et plus souvent encore les membres de lentourage. Ces mutations rverses
sont en effet favorises par les passages dhomme homme, telles quon en voit dans lentou-
rage des sujets vaccins. Donc, quand on vaccine un enfant par le vaccin vivant, il est conseill
de vacciner simultanment les parents sils ne lont t et il est impratif de vrifier labsence
de sujets immunodprims dans lentourage (leucmie, greffe, par exemple).
Autre inconvnient du vaccin vivant : il est plus thermolabile que le vaccin inactiv et rapi-
dement invalid par rupture de la chane du froid comme cela se voit parfois dans le Tiers
Monde. Cest l aussi quil peut tre concurrenc dans lintestin par dautres entrovirus qui
vont lempcher de se multiplier (interfrence).
3. Rsultats de la vaccination
Avant la vaccination dans tous les pays riches, le nombre de paralysies allait en augmentant
tous les ans. On a compt 18.000 cas de polio en 1955 aux U.S.A., 7 cas en 1975 grce la
vaccination.
Nanmoins la poliomylite nest pas radique. Notamment dans le Tiers Monde, o jus-
qu ces dernires annes le nombre de paralysies augmentait tous les ans dans les pays o
lon ne vaccinait pas correctement. En effet, lorsque lhygine samliore dans ces pays, les
risques de contamination fcale-orale diminuent et ainsi les sujets rencontrent les poliovirus
plus tard dans la vie, un ge o le taux de paralysies au cours des infections est plus lev.
On a vu le mme phnomne avec un autre picornavirus, le virus de lhpatite A, donnant lhpatite plus souvent
et plus svrement chez ladulte que chez lenfant.
En France, o la circulation des poliovirus est trs rduite depuis plusieurs annes, seul est
utilis le vaccin inactiv, sans danger (alors que le risque de paralysies vaccinales par le vac-
cin buvable chez le sujet vaccin ou dans son entourage est de lordre de 1/1.000.000). Appli-
qu correctement dans les pays nordiques, il y a fait disparatre totalement la poliomylite,
sans les risques du vaccin vivant.
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 211/307
4. Pratique de la vaccination : quel que soit le type de vaccin, on vaccine 2, 3, 4 mois et rappel
16-18 mois (+Diphtrie Ttanos Coqueluche Hemophilus influenza b et hpatite B) puis 6
ans (+DT), 11-13 ans (+DT, hpatite B et Rougeole Oreillons Rubole), 16-18 ans (+DT) puis
tous les 10 ans (+DT). Voir calendrier vaccinal en fin de polycopi (page257 et page261).
Avant un voyage dans le Tiers-Monde, il est vivement recommand de vrifier la mise
jour de son tat vaccinal et si besoin de faire un rappel.
LOMS a lanc une campagne dradication de la poliomylite dans le monde, avec par exem-
ple la vaccination de 250millions dAsiatiques en deux mois en dcembre 96 et janvier 97.
Le programme dradication apparat en bonne voie puisquil ny a plus de poliomylite en
Amrique ni du Nord, ni du Sud. Cependant, en Afrique, les guerres et les troubles politi-
ques vont coup sr retarder lradication.
9.1.3 chovirus et coxsackievirus
9.1.3.1 Clinique
Se reporter lillustration IX-1. Insistons sur les infections asymptomatiques ou fbriles sim-
ples, sur les pidmies de mningites lymphocytaires aigus bnignes, de fivres ruptives.
Ajoutons que des infections coxsackie B ont pu tre associes au dclenchement dun diabte ju-
vnile et que lentrovirus 70 est lorigine de conjonctivites hmorragiques. Rcemment lent-
rovirus 71 a donn des formes neurologiques graves avec cas mortels lors dpidmies en Asie du
Sud-Est.
9.1.3.2 Diagnostic
Lisolement du virus se fait partir de prlvement de gorge et de selles, ventuellement du liquide
cphalo-rachidien ou du liquide de vsicule. Ces virus stables se multiplient en culture de cellules,
sauf certains coxsackie A qui exigent linoculation aux souriceaux nouveau-ns.
Le srodiagnostic passe par lisolement du virus, car il ny a pas un srodiagnostic coxsackie,
mais 30srodiagnostics distincts. Idem pour les chovirus. Donc srodiagnostic uniquement vis-
-vis du virus isol chez le malade.
Il existe, comme on la vu, un test de dtection des entrovirus par RT PCR sur squence gno-
mique conserve, qui est devenu lexamen essentiel du diagnostic virologique.
9.1.3.3 Traitement
Il ny pas de vaccin, vu la multiplicit des srotypes (une trentaine de coxsackie et autant dcho-
virus). Ce qui est intressant pour ces virus cest la diversit des manifestations cliniques rsumes
dans le tableau de lillustration IX-1.
Entrovirus et virus des gastroentrites
212/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
9.2 Virus des gastroentrites
Ils sont responsables de plus de la moiti des gastroentrites, celles-ci causant, par dshydra-
tation, la mort de 2 x 10
6
enfants par an dans le monde. Il ne sagit pas des entrovirus, pour
lesquels linfection du tube digestif, constante, est asymptomatique. Il sagit de virus longtemps
mconnus, car difficiles ou impossibles isoler en culture de cellule in vitro et reconnus initiale-
ment par examen en microscopie lectronique des selles o ils sont excrts en abondance. Lin-
fection par ces virus de gastroentrite est une infection localise la porte dentre digestive, les
signes apparaissant aprs une courte incubation de quelques jours. Ces infections procdent par
pidmies. Le diagnostic de lagent responsable nest pas clinique, mais lon dispose de tests viro-
logiques directs faciles mettre en uvre, comme le test au latex pour les rotavirus.
9.2.1 Rotavirus
Les rotavirus sont responsables de la moiti des gastro-entrites (vomissements + diarrhe)
aigus du nourrisson. Ils ne se multiplient pas en culture de cellules.
On les reconnat uniquement par examen direct des selles, initialement en microscopie lectro-
nique et dsormais en pratique courante par ELISA ou plus simplement encore par un test au latex
(Rotalex), test sur lame utilisant des particules de latex enrobes danticorps rotavirus: un extrait
de selles contenant du virus les agglutine.
Leur nom vient de lexistence dune double capside qui, en lectro-microscopie dun extrait de sel-
les, leur donne un aspect en roue trs vocateur. Ce ne sont pas des picornavirus, mais ce sont
des virus nus ARN: contrairement aux entrovirus et aux rhinovirus qui sont ARN monocat-
naire et de petite taille, les rotavirus ont un ARN bicatnaire et en 11segments, et une taille sup-
rieure.
On dispose dun srodiagnostic mais il est sans aucun intrt pour une maladie virale localise avec
du virus en abondance au niveau des lsions.
Curieusement, les gastro-entrites de lenfant rotavirus svissent surtout lhiver (et constituent,
avec les infections virus RS, les deux 1
res
causes de la surcharge de travail des pdiatres en cette
saison). Elles donnent frquemment des vomissements et une dshydratation. Finalement, parmi
les gastro-entrites de lenfant, 20% sont de causes inconnues, 20 30% dorigine bactrienne
(Salmonelles, Shigelles, E. coli) et 50% rotavirus.
Dans les pays du Tiers Monde o lon ne sait pas traiter temps la dshydratation cause par la
diarrhe et les vomissements, les rotavirus sont responsables de nombreux dcs au cours de
la petite enfance ( 1 million par an).
Diverses formules de vaccin vivant ont t mises au point et sont actuellement en cours dessais
mais aucune nest disponible actuellement dans le commerce. Dans le Tiers Monde, en attendant
les futurs vaccins, la stratgie actuelle est de centrer les ressources et les efforts sur le traitement
symptomatique de la dshydratation, qui vaut pour les diarrhes de toute cause et en a, dans tous
les pays, rduit spectaculairement la mortalit.
Une formule de vaccin vivant a t abandonne par le fabricant aprs avoir t associe de rares cas dinvagination
intestinale aigu (IIA) du nourrisson (1 cas pour 10000). Cela tant, ce risque dIIA faible vaut probablement la peine
dtre couru dans les pays du Tiers Monde. Affaire dlicate, suivre (les rapport cot/bnfices et risques/bnfices
peuvent diffrer selon les pays).
Entrovirus et virus des gastroentrites
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 213/307
Les rotavirus peuvent donner des diarrhes svres chez les sujets immunodprims et chez les per-
sonnes ges.
9.2.2 Petits virus nus ARN responsable de gastroentrites
Ce sont les astrovirus et les calicivirus (dont les norovirus, anciennement agent de Norwalk et vi-
rus voisins). Ils donnent des pidmies brutales, dorigine alimentaire ou hydriques, dans les col-
lectivits (cantines, croisires), cela tous les ges.
9.2.3 Adnovirus des gastroentrites
Ce sont les srotypes 40 et 41. Ils sont responsables dune faible proportion des gastroentrites du
jeune enfant et peuvent donner des invaginations intestinales aigus. Leur isolement en culture de
cellules est pratiquement impossible, mais lon dispose dun test au latex (Adnolex) si lon veut
les dceler dans les selles.
9.3 Points importants
Entrovirus, virus nus ARN 1 brin
Les entrovirus (poliovirus, coxsackievirus, chovirus et entrovirus numrots au-
del de 70) ont lpidmiologie des entrobactries, mais ils ne donnent pas de gas-
troentrites.
Les poliovirus comportent 3srotypes, les paralysies sobservent dans 1 2% des in-
fections, au terme dune infection gnralise aboutissant latteinte de la corne ant-
rieure de la moelle.
La poliomylite, grce la vaccination de masse, est en voie dradication, mais per-
siste encore en Afrique.
Le vaccin antipoliomylitique inactiv, tu, est prfrer au vaccin vivant attnu, car
il est dpourvu de risque.
Le vaccin vivant est trs efficace et peu coteux mais il est trs dangereux pour les su-
jets immunodprims (sujets vaccins ou vivant dans lentourage dun sujet vaccin)
et fragile
Les vaccins antipoliomylitiques sont trivalents et administrs en trois prises un
mois dintervalle partir de 2mois, avec une dose de rappel 16-18mois, puis tous
les 10ans.
Il y a environ 30srotypes de coxsackievirus et autant dchovirus, de sorte quil ny
a pas de vaccin disponible.
Les entrovirus sont la principale cause des mningites lymphocytaires pures (penser
Entrovirus et virus des gastroentrites
214/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
aussi au virus des oreillons, au VIH, Listeria monocytogenes, la tuberculose).
La RT PCR est de plus en plus utilise pour le diagnostic des infections entrovirus.
Rotavirus, virus nus ARN 2 brins
Ils sont les principaux responsables des gastro-entrites du nourrisson et en tuent un
million par an de par le monde.
Ils ne sont pas isolables en culture de cellules, mais il existe des tests directs simples
sur selles, comme le test au latex.
Le vaccin nest pas au point actuellement.
Lessentiel du traitement est la rhydratation.
Astrovirus & Calicivirus
Ce sont les responsables des pidmies de diarrhes virales dorigine alimentaire en
collectivits.
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 215/307
Chapitre 10
Autres virus ADN :
adnovirus, polyomavirus,
papillomavirus, parvovirus,
poxvirus
Autres virus ADN
Ayant vu les herpsvirus (cours II et III) et le virus de lhpatite B (cours V), il sagit des adnovi-
rus, des polyomavirus, des papillomavirus, des parvovirus, et des poxvirus.
Ils ont en commun dtre des virus ADN, soit nus, soit, en ce qui concerne les poxvirus, des virus
dpourvus de pplos au sens strict du terme; tous sont donc des virus particulirement rsistants.
10.1 Adnovirus
Ce sont des virus ADN, sans pplos, donc nus ; leur capside est icosadrique. Les 12capsomres
de sommet portent un spicule dou in vitro de proprits hmagglutinantes. La base des capso-
mres de sommet a des proprits cellulotoxiques directes: de forte concentration de virus donnent
un ECP en quelques heures avant toute rplication du virus. Plus de 40srotypes humains ont t
reconnus. Ces virus ont une affinit pour le tissu lymphode o certains srotypes dterminent une
infection latente, particulirement dans les amygdales. Cest de l quils tirent leur nom (tissu ad-
nodien). Nombre dadnovirus sont des virus exprimentalement cancrignes.
Aux srotypes initialement reconnus, il faut ajouter des adnovirus associs des diarrhes du
nourrisson, non cultivables en cellules in vitro, dtectables seulement lexamen des selles en mi-
croscopie lectronique ou par test au latex (cf plus loin).
10.1.1 Clinique
Les adnovirus se multiplient surtout dans larbre respiratoire, lil et le tube digestif. Les infec-
tions induites par les adnovirus peuvent se classer sous huit rubriques.
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
216/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
La clinique est trs varie en raison de laffinit des adnovirus pour le tissu lymphode, qui est
ubiquitaire.
1. Pharyngites
Pharyngite aigu banale congestive donnant de la fivre, de la dysphagie, de la toux, une rou-
geur pharynge. Parfois cest une pharyngite exsudative, sous forme de points blancs sur
les amygdales. Il sy associe des adnopathies cervicales.
2. Broncho-pneumothapies
Il en existe deux formes:
1. Forme habituelle rsolutive.
Elle se traduit par fivre, toux, coulement nasal ; on entend des rles de bronchite, ou de broncho-alvolite
dans la moiti des cas. A la radio on voit des infiltrats pulmonaires dans 10% des cas, qui peuvent persister
plusieurs semaines. Au total, cest un tableau de broncho-pneumopathie virale sans particularits clini-
ques.
2. Forme grave, voire mortelle, touche surtout les trs jeunes enfants. Cest une broncho-
pneumopathie brutale, avec des signes de dtresse respiratoire (polypne, cyanose, tirage
sus et sous-sternal, battement des ailes du nez). Des signes sont trs vocateurs de pneu-
mopathie grave adnovirus: ce sont dune part le mningisme, cest--dire une raideur
mninge, mais sans signes biologiques de mningite (LCR normal), et dautre part des
troubles de la conscience, irritabilit, somnolence, voire des convulsions ou un vrita-
ble coma.
Dautres signes associs trs divers sont galement frquents: des signes de dfaillance cardio-vasculaire,
un mtorisme abdominal, une ruption maculo-papuleuse tendance hmorragique, une albuminurie, des
dmes des extrmits.
La mort survient dans un tiers des cas. En cas de survie, il se dveloppe souvent, plus tard, des lsions
rsiduelles, type de dilatation des bronches, datlectasie.
Cette pneumonie grave adnovirus implique presque toujours le srotype 7, quon re-
trouve lautopsie non seulement dans lpithlium tracho-bronchique mais dans le
foie, la rate, le srum, parfois le systme nerveux central.
Donc cette pneumopathie grave adnovirus type 7 est une infection gnralise avec, entre autres, une
localisation pulmonaire. Elle survient sans prdominance saisonnire, aussi bien lhiver que lt, puis-
quil sagit de virus sans pplos et cela soppose aux pneumopathies graves dues la grippe ou au virus
respiratoire syncytial.
Dautres virus que les adnovirus sont responsables de pneumonies graves :
le virus respiratoire syncytial, les virus influenza types A et B, les hantavirus, le virus de la rougeole, le
CMV, ces deux derniers virus donnant des pneumopathies graves chez les sujets immunodprims. Parmi
les diagnostics bactriologiques voquer, vient en premire place la lgionellose. A cette liste, sajoute
dsormais le coronavirus du SRAS ou SARS CoV.
3. Conjonctivites
Conjonctivite congestive simple ou folliculaire, avec adnopathie satellite, cest--dire ad-
nopathie prtragienne, devant le conduit de loreille. On a souvent une atteinte simultane de
lil et du pharynx, cest la fivre adno-pharyngo-conjonctivale (APC).
4. Krato-conjonctivite pidmique
Curieusement, elle est due trs souvent ladnovirus type 8. Cest une kratite superficielle
ponctue qui gurit habituellement sans squelles.
Elle survient surtout chez des sujets aux conjonctives pralablement lses par des microtraumatismes, par
exemple chez les ouvriers mtallurgistes qui travaillent en atmosphre trs empoussire (ouvriers sableurs).
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 217/307
Les atteintes oculaires adnovirus, quil sagisse de conjonctivite ou de krato-conjonctivite
procdent parfois par pidmies dans les services dophtalmologie car les adnovirus qui sont
des virus nus persistent dans lenvironnement et notamment sur les appareils dexamens oph-
talmologiques ou sur les compte-gouttes pour collyre, ces derniers devant tre individuels.
5. Exanthmes
Les infections adnovirus saccompagnent parfois druptions maculo-papuleuses pouvant
simuler la rougeole.
6. Certaines invaginations intestinales aigus de lenfant sont dues une adnite msentrique
adnovirus.
7. Des gastro-entrites infantiles sont dues des adnovirus que lon ne peut isoler en culture
de cellule. Mais ils sont si abondants dans les selles quon peut les y dtecter par microscopie
lectronique ou plus simplement par agglutination de particules de latex porteuses danticorps
anti-adnovirus (Adnolex).
8. Ladnovirus type 11 donne chez lenfant des cystites hmorragiques.
9. Un grand nombre dinfections adnovirus sont inapparentes. On a pu estimer que dans
sa vie un homme fait plus de 10infections adnovirus.
Lorsque lon met en culture du tissu amygdalien prlev lors dune amygdalectomie, on trouve un adnovirus
dans plus de la moiti des cas (cest ainsi que ROWE a dcouvert les adnovirus en 1953).
10. Chez les immunodprims, notamment chez les greffs de moelle, on a linverse dcrit
des formes graves polyviscrales dissmines (avec hpatite) ou localises lencphale.
10.1.2 Diagnostic au laboratoire
On dispose de trois moyens diagnostiques: lisolement du virus, le diagnostic virologique rapide
et le srodiagnostic, les deux premiers pouvant tre regroups en un paragraphe dtection directe
du virus.
10.1.2.1 Diagnostic direct
La dtection du virus est habituellement le meilleur moyen de faire le diagnostic virologique, le
plus direct, le plus spcifique. Il faut rechercher le virus dans les scrtions respiratoires par cou-
villonnage de gorge, ou mieux par aspiration des mucosits naso-pharynges.
Il faut galement rechercher le virus dans les selles puisque les adnovirus sont des virus nus, ca-
pables de se multiplier dans le tube digestif.
En cas de conjonctivite ou de kratite, on procde un frottis de la conjonctive palpbrale avec
un couvillon exprim dans un tube de milieu de transport. En cas de cystite hmorragique, on pr-
lve les urines dune seule miction.
Dans les infections graves des immunodprims, le virus est prsent dans le sang.
Pour le transport au laboratoire, la glace suffit puisque lon a affaire des virus nus, relativement
thermorsistants.
1. Pour lisolement, les adnovirus humains se multiplient essentiellement en culture de cellules
humaines, notamment en culture de cellules KB. Leffet cytopathique consiste en un aspect
en dentel de la nappe cellulaire, par rtraction du cytoplasme des cellules infectes sur un
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218/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
noyau altr. Ce virus ADN se multiplie dans le noyau, sige dune inclusion centro-nuclai-
re basophile. Cet effet cytopathique est relativement lent, il peut napparatre quaprs plu-
sieurs passages (repiquages). On procde ensuite au typage du virus qui indiquera auquel des
40srotypes humains on a affaire.
Donc, lisolement est facile, car ces virus rsistants se multiplient bien dans des cultures cel-
lulaires trs courantes comme les cellules KB, mais cet isolement peut parfois demander
du temps. Indpendamment de lECP habituel par multiplication virale, un inoculum massif
peut donner en quelques heures une altration particulire de la morphologie cellulaire (d-
collement de la nappe cellulaire) par action cytotoxique directe.
2. Do lintrt du diagnostic virologique rapide
Dans les scrtions naso-pharynges, bronchiques ou dans les frottis conjonctivaux on peut
dtecter en immunofluorescence des cellules infectes au cours des infections respiratoires
et oculaires adnovirus. Cet immuno-cytodiagnostic est ralisable avec le mme anticorps
anti-adnovirus car tous les adnovirus ont en commun une protine de capside porteuse de
la mme spcificit antignique.
Les diarrhes adnovirus non cultivables sont reconnus par examen direct des selles en mi-
croscopie lectronique ou plus communment par agglutination de particules de latex
porteuses danticorps dirig contre lantigne commun aux adnovirus (Adnolex).
Pour les adnovirus comme pour dautres virus, la PCR est de plus en plus utilise, notam-
ment pour les greffs de moelle, sur le sang (analogie avec le CMV).
10.1.2.2 Diagnostic indirect : le srodiagnostic
La mise en vidence dune sroconversion a pour intrt de confirmer le diagnostic dinfection ac-
tuelle (par opposition aux infections inapparentes chroniques).
Lidal est de faire le srodiagnostic vis--vis de la souche du virus isol chez le malade, srodiagnostic en neutralisa-
tion, en inhibition de lhmagglutination car la plupart des adnovirus sont dous de proprits hmagglutinantes. La
raction dinhibition dhmagglutination (IHA) est une raction physico-chimique, rapide, facile, contrairement la
neutralisation qui est une raction longue, puisquelle implique la multiplication du virus en culture de cellules.
Si lon na pas isol le virus chez le malade, et que lon souponne malgr tout une infection adnovirus, on a la
possibilit de recourir au srodiagnostic de groupe en fixation du complment, comme en immunofluorescence, vala-
ble pour nimporte quel adnovirus. En effet tous les adnovirus ont en commun un antigne fixant le complment
correspondant une protine de capside. Donc une raction de fixation du complment utilisant cet antigne commun,
permet de rechercher une augmentation du titre des anticorps en cas dinfection par lun des 40 adnovirus quel quil
soit.
Soulignons que les adnovirus sont les seuls virus pour lesquels existe un tel srodiagnostic
de groupe. Ce srodiagnostic de groupe en fixation du complment est commode puisquil nexige
pas lisolement du virus. Mais il ne donne aucune indication sur le type du virus, ce qui est insuf-
fisant pour une tude pidmiologique srieuse.
Rappel : srodiagnostic =examen simultan dune paire de srums encadrant lventuelle sro-
conversion ou llvation du titre des anticorps qui est une variation dau moins 1 4. Le rsultat
du srodiagnostic demande au moins trois semaines, le temps de prlever le deuxime srum
et de faire la raction. Donc il faut privilgier la dtection du virus par isolement ou par diagnos-
tic virologique rapide, si lon a dcid de faire un diagnostic virologique exact.
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10.1.2.3 Indications de ces examens virologiques
Un diagnostic virologique exact nest certainement pas indispensable en pratique mdicale couran-
te pour une infection bnigne isole et sans chimiothrapie antivirale. En revanche il est intressant
en cas dpidmie, ou bien encore en cas de forme grave. Enfin ce diagnostic virologique exact
est ncessaire quand on prtend faire une tude srieuse, par exemple un essai thrapeutique sur
les infections respiratoires virales.
10.1.3 Pouvoir cancrigne des adnovirus
Certains adnovirus humains ont un pouvoir cancrigne, mais il sagit dun pouvoir cancrigne
purement exprimental, chez lanimal.
Les adnovirus humains ne se multiplient bien quen culture de cellules humaines. Il ny a pas danimal de laboratoire
permettant une multiplication aise du virus. Pourtant, si lon inocule certains adnovirus humains (par exemple les
types 12, 18 ou 31) au hamster nouveau-n, on observe lapparition de tumeur maligne au point dinoculation aprs
un dlai de 1 2mois. Ce pouvoir cancrigne se manifeste galement en culture de cellules: si lon inocule ces ad-
novirus humains des cellules de hamster cultives in vitro, les cellules normales ainsi infectes se transforment en
cellules anormales qui ont tous les caractres des cellules cancreuses.
Il y a dans les cellules animales une infection abortive cest--dire un dbut de multiplication virale qui naboutit pas
la production de nouveaux virus: pas de fabrication de protines constituant le virus (pas de fabrication de protines
de capside virales) mais expression dune partie de linformation gntique virale avec des messagers viraux et fabri-
cation dune protine dorigine virale nentrant pas dans la constitution du virus: cest lantigne T (T=tumeur). Cette
infection incomplte (abortive) est transformante, et dans toute la descendance de ces cellules tumorales, on retrou-
ve une partie de lADN viral incorpor lADN cellulaire, ainsi que des messagers viraux et lantigne T.
La transformation des cellules normales de rongeurs en cellules cancreuses suppose lintgration dune partie du g-
nome viral dans le gnome cellulaire. Il sagit dune rgion codant pour les protines prcoces 1EA et 1EB (E pour
early). La cancrisation se fait en 2 tapes: lexpression du gne E1A entrane limmortalisation et celle du gne E1B
entrane la cancrisation avec possibilit de mtastases. Le mcanisme menant la cancrogense est attribu la
capacit de la protine E1B se fixer sur la protine Rb pour linhiber, cette protine Rb tant le produit dex-
pression dun anti-oncogne normal (indispensable) du gnome cellulaire.
Il sagit bien dun pouvoir cancrigne exprimental. Chez lhomme, dans les cellules tumorales humaines dorigine
trs diverses, on a recherch lantigne T des adnovirus, des messagers viraux propres aux adnovirus, des fragments
dADN viral : toutes ces recherches ont t ngatives. Donc, les adnovirus humains cancrignes chez lanimal ne
semblent pas cancrignes chez lhomme.
10.1.4 Traitement
Un vaccin a t mis au point, notamment contre le type 7 mais il est peu utilis et indisponible en
France. Surtout, un antiviral est actuellement lessai dans les formes graves, lHPMPC ou
cidofovir : chez les greffs de moelle, on recherche par PCR dans le srum - et lon quantifie - une
virmie qui, si elle est importante, dclenche un traitement anticip avant toute apparition de si-
gnes cliniques (donc, comme pour le CMV chez ce type de malades).
Lutilisation des adnovirus comme vecteur en thrapie gnique a entran un regain dintrt
pour cette famille. On sadresse, bien sr, des adnovirus non oncognes chez les hamsters (le
type 5 par exemple). Deux obstacles la thrapie gnique sont lexistence danticorps de groupe
chez les patients, rduisant lefficacit du traitement, et le caractre cytotoxique des fortes con-
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220/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
centrations dadnovirus (accident mortel de J esse Gelsinger, par mconnaissance de cette notion
de virologie trs classique).
10.2 Papovavirus
10.2.1 Gnralits
On a appel papovavirus des virus nus ADN, remarquables par leur pouvoir oncogne.
Papova a t un sigle construit avec les deux premires lettres du nom des premiers membres de cet ensemble: virus
des papillomes, virus du polyome de la souris, agent vacuolant (ancienne dnomination du virus simien n 40 ou SV
40).
Les papovavirus comportent en fait deux familles distinctes, les Polyomaviridae et
Papillomaviridae. Leur structure diffre par le diamtre de la particule virale et le poids molcu-
laire de lADN: 45nm et 3,5x10
6
daltons pour les polyomavirus, 55 nm et 5x10
6
daltons pour
les papillomavirus.
lADN viral des polyomavirus et des papillomavirus est bicatnaire, circulaire, torsad, com-
bin des histones cellulaires, de sorte que lon a pu parler de minichromosome. On observe par-
fois lincorporation dans la particule virale dADN cellulaire, ce qui permet des expriences de
transfert gntique entre cellules eucaryotes. La rplication de lADN viral se fait par lADN po-
lymrase cellulaire; il ny a pas dADN polymrase virale, do labsence de chimiothrapie an-
tivirale comparable celle qui existe pour les Herpesviridae. Lactivit dmontre du cidofovir
contre ces virus na donc pas encore dexplication claire.
Dpourvus de pplos, les virus de ces deux familles apparaissent relativement rsistants aux pro-
cds dinactivation physico-chimique. Ainsi, dans les premiers temps de la vaccination contre la
poliomylite, certains lots de vaccins prpars partir de cellules rnales de singe contamines par
le SV40, contenaient, malgr linactivation des poliovirus au formol, des SV40 encore infectieux
10.2.2 Famille des Polyomaviridae
1. Lespce type en est le virus du polyome, virus murin infectant de faon endmique et inapparente les souris
dlevages et les souris sauvages. Ce nest quexprimentalement et chez les rongeurs nouveau-ns que ce virus
peut induire des tumeurs, leur polymorphisme extrme justifiant la dnomination de polyomavirus.
2. Le SV40 infecte de faon inapparente lhte naturel, le singe asiatique rhsus. Le SV40 a t inocul involon-
tairement des millions denfants avec certains lots de vaccins poliomylitiques, attnus ou inactivs. Or, il
induit exprimentalement des tumeurs exprimentales chez les rongeurs nouveau-ns - comme le virus du
polyome- et il peut mme transformer des cellules fibroblastiques humaines in vitro, les cellules tumorales ex-
primant des antignes tumoraux de spcificit virale T et t linstar des adnovirus. Par chance, cette msaven-
ture neut pas de consquences fcheuses pour les enfants vaccins mais elle a utilement marqu les esprits et
inspir les mesures de scurit appliques depuis la prparation des vaccins viraux.
3. Le JC virus tire son nom des initiales du malade chez qui il a t isol, un sujet atteint de
leucoencphalopathie multifocale progressive (LEMP ou LMP). Cest une complication
rare et terminale dtats dimmunodpression cellulaire prolonge: leucmie lymphode
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 221/307
chronique, maladie de Hodgkin, dficits immunitaires congnitaux, greffes allogniques,
arthrite rhumatode ou asthme chronique traits par immunodpresseurs. Lpidmie de SIDA
a ouvert un nouveau champ daction au virus J C, des lsions de LMP apparaissant chez 20%
des sujets lautopsie.
Dans les oligodendrocytes augments de volume, au sein dune inclusion nuclaire basophi-
le, la microscopie lectronique met en vidence des amas de nombreuses particules virales.
Cette multiplication virale abondante est certainement responsable de la dmylinisation en
foyers coalescents caractristique de la LMP, chaque oligodendrocyte tant dans le cerveau
responsable de la mylinisation denviron 50neurones. A la priphrie des foyers de dmy-
linisation, on note souvent des astrocytes gants multinucls semblables aux astrocytes ma-
lins de certains glioblastomes.
Lisolement du virus J C est fastidieux, exigeant linoculation de cultures primaires de cellules
gliales de ftus humain (!), quil dtruit au bout dun mois.
4. Le BK virus fut initialement isol des urines dun sujet transplant rnal, aux initiales B.K,
souffrant dun rtrcissement de luretre greffe, avec cellules inclusion au niveau de lpi-
thlium urinaire.
Il a fallu 3mois dincubation aux cellules VERO inocules pour manifester un ECP peu caractristique (fait de
cellules vacuoles et frippes).
5. Epidmiologie des polyomavirus humains :
Ce sont des virus ubiquaires
Les virus J C et BK apparaissent trs largement rpandus, la majorit (60 90%) des adultes
ayant des anticorps dans le srum.
On ignore comment se contaminent les sujets infects. Ces polyomavirus humains nont pas
dautres rservoirs que lhomme. On ignore galement les manifestations cliniques de la pri-
mo-infection par ces virus. On admet quau-del de la primo-infection, BK et J C virus don-
nent une infection chronique latente lorigine de ractivation, en particulier au cours des
tats dimmunodpression et au cours de la grossesse.
Au cours dune tude portant sur 1235femmes enceintes, 2% dentre elles ont eu dans les urines une infection
polyomavirus, le virus le plus souvent en cause tant le J C virus.
Il sest toujours agi de rinfection (probablement endogne) sans transmission prouve au
ftus et sans consquence pour la mre.
Finalement, les seules manifestations cliniques consistantes des infections polyomavirus
humain concernent les immunodprims
Pour le JC virus, neurotrope, cest la LEMP o, dans plusieurs cas, lexamen dun srum
prlev avant cette complication neurologique a pu prouver quil sagissait alors dune rin-
fection.
Pour le BK virus qui a un tropisme pour lappareil urinaire, cest, au dcours des greffes
de moelle, une excrtion urinaire associe une cystite hmorragique o intervient aussi la
toxicit de la chimiothrapie immunodpressive pour la muqueuse vsicale; chez les trans-
plants rnaux, ce sont des nphropathies avec ncrose tubulaire qui obligent allger le
traitement immunosuppresseur au risque dun rejet du greffon.
6. Pouvoir oncogne des polyomavirus humains
J C et BK virus partagent avec le SV40 et avec le virus du polyome laptitude induire des
tumeurs chez le hamster nouveau-n et transformer des cellules en culture in vitro.
Des deux virus humains, le J C apparat le plus oncogne, donnant exprimentalement des tumeurs crbrales
malignes (astrocytomes stade IV) dans certaines espces de singes.
La similitude gnomique du J C, du BK virus et du SV40 se traduit par une parent immunologique de leur an-
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
222/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
tigne T.
On na pas de preuve dun pouvoir oncogne naturel du virus JC chez lhomme mais simplement des l-
ments de prsomption: lassociation chez un patient de LEMP et de gliomes multiples alors que le J C induit
prcisment des gliomes chez le hamster nouveau-n; on a signal laspect pseudo-tumoral des astrocytes bor-
dant les foyers de LEMP. Par contre, la recherche de virus, dantigne T et de squences dADN viral dans des
tumeurs humaines varies, ou la recherche danticorps anti-T dans les srums des patients na donn aucun r-
sultat convaincant.
7. Diagnostic virologique des infections polyomavirus humains
La srologie nest vraiment pas le bon moyen de diagnostic des infections polyomavirus (on a souvent affaire
des rinfections, la signification des IgM dites spcifiques de ces virus nest pas claire et une lvation du titre
des anticorps sriques chez un sujet limmunit profondment perturbe ne saurait tre tenue pour preuve for-
melle dinfection).
Lisolement du virus nest fait que dans des laboratoires trs spcialiss car ces virus se multiplient trs lente-
ment et dans des cellules qui, pour le virus J C, sont trs particulires.
Le diagnostic virologique de LEMP a repos longtemps sur la biopsie crbrale ( lautop-
sie) montrant en microscopie lectronique, dans les inclusions des oligodendrocytes, les
amas de particules virales caractristiques.
Depuis peu, on peut obtenir une forte prsomption de LEMP par la mise en vidence de s-
quences du virus JC par PCR sur le liquide cphalorachidien. Cest devenu lexamen es-
sentiel en pratique virologique mdicale.
Chez les transplants du rein, la dtection dADN par PCR BK dans le plasma est annoncia-
trice de nphropathie
8. Traitement
Il nexiste malheureusement aucun traitement reconnu de la LEMP. Cependant, des mala-
des ont vu leur LEMP rgresser par correction de leur immunodpression: malades du SIDA
sous trithrapie efficace.
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 223/307
10.2.3 Famille des Papillomaviridae
1. On trouve des papillomavirus lorigine de tumeurs bnignes de la peau et des muqueuses
malpighiennes chez lhomme (et avec des virus diffrents chez les animaux, particulirement
chez le btail, le lapin et le chien). Ce sont les HPV pour human papillomavirus.
Ces tumeurs appeles papillomes sont classes en plusieurs catgories: les verrues cutanes
(verrues vulgaires, verrues plantaires et verrues planes) ; les condylomes ano-gnitaux acu-
mins ou crtes de coq ; les condylomes plans gnitaux ; les condylomes laryngs.
Dune faon gnrale, on appelle verrues les lsions cutanes, et condylomes les lsions des
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224/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
muqueuses, en distinguant les condylomes acumins (=en relief) et les condylomes plans.
Parmi les condylomes plans ano-gnitaux, il convient de distinguer les condylomes plans ex-
ternes, des organes gnitaux externes, et les condylomes plans du col utrin, ces derniers,
particulirement intressants en terme dpidmiologie du cancer du col.
2. La rplication de ces virus, quon ne sait pas reproduire in vitro, ne prend place que dans les
cellules pithliales (illustration X-1). Ils sont dits pithliotropes. Initialement, par une
brche dans le revtement cutan ou muqueux, le virus est inocul aux cellules basales de
lpithelium qui, en se multipliant, montent vers la surface tout en se diffrenciant. Or seu-
les les cellules les plus diffrencies des couches superficielles - les cellules en voie de
kratinisation - assurent le cycle viral complet (expression des gnes prcoces, non struc-
turaux, et des gnes tardifs, structuraux) avec une abondante production de particules
virales ; la desquamation de ces kratinocytes infects assure la diffusion du virus dans la po-
pulation. En revanche, une expression des seuls gnes viraux prcoces dans les couches ba-
sales de lpithlium rend compte de lacanthose et de lhyperplasie lorigine de la tumeur.
3. Les virus des papillomes humains (HPV) sont strictement humains et la contamination se fait
par contact direct travers des abrasions cutanes (bord des piscines) ou bien par rapports
sexuels. Comme pour toute maladie sexuellement transmissible (MST), les HPV sacqui-
rent dautant plus facilement que les rapports sexuels ont dbut tt et ont impliqu un nombre
lev de partenaires. Cela tant, ces virus nus, trs rsistants dans le milieu extrieur, ont pu
tre trouvs par PCR sur des tampons priodiques de jeunes filles vierges, ou sur les cheveux!
Ces virus sont vritablement ubiquitaires. Des lsions gnitales par HPV chez un enfant ne
signifient pas abus sexuel.
Des rinfections endognes sont probablement lorigine de lclosion des lsions verruqueuses ou papilloma-
teuses souvent observe au cours de la grossesse, et surtout aprs transplantation dorgane et chez les ma-
lades du SIDA.
4. Plus de 150 HPV ont t identifis, trs diffrents les uns des autres par leur ADN, extrait
des tumeurs. On parle ainsi de gnotypes. Chaque gnotype parat associ prfrentiellement
une certaine catgorie de tumeur : ainsi le lHPV-1 et les verrues plantaires; lHPV-2 et les
verrues vulgaires; lHPV-3 et les verrues planes; lHPV-4 et les verrues palmaires; les
HPV-6 et 11 et les condylomes ano-gnitaux sans potentiel cancreux ou les condylomes
laryngs; les HPV-16, 18, 31 et les lsions dysplasiques pr-cancreuses du col utrin.
5. Transformation maligne
Elle peut apparatre, non pas avec les verrues cutanes, mais avec les condylomes plans g-
nitaux, et aussi avec les papillomes (condylomes) laryngs (aprs radiothrapie), les papillo-
mes (condylomes) oraux. Une transformation maligne complique souvent
lpidermodysplasie verruciforme, maladie rare, autosomale et rcessive; cette
gnodermatose est marque de verrues planes cutanes.
Un tiers des patients vont avoir une transformation maligne des lsions, en particulier dans les zones exposes
au soleil, sous forme de cancer intra-pithlial ou mme de carcinome invasif, mtastatique. Lpidermodyspla-
sie verruciforme a contribu allonger la liste des gnotypes dHPV, certains patients pouvant tre simultan-
ment infects par plusieurs types. Cependant cest essentiellement lHPV-5 qui est apparu associ aux lsions
malignes, avec prsence de copies dADN viral dans les cellules malignes.
6. Condylomes plans du col et cancer du col utrin, problme important de sant publique
Ces lsions planes sont reconnaissables en colposcopie, aprs application dune solution
dacide actique 5%, qui les fait apparatre en blanc.
Ces lsions cervicales ont une marque cytologique dinfection par HPV, la prsence de
kolocytes : cellules large halo clair cytoplasmique (kolos =creux en grec) refoulant le
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 225/307
noyau qui contient des particules virales visibles en microscopie lectronique.
Surtout, ces lsions correspondent des dysplasies du col et sont classes en CIN de grade
I III (CIN pour Cervical Intraepithelial Neoplasia). Elles risquent en effet dvoluer vers
le cancer du col.
Dans une proportion proche des 100%, les personnes atteintes de cancer du col ont t in-
fectes par les HPV 16 ou 18 (plus rarement par quelques autres HPV) et le restent. On trou-
ve lADN de ces virus intgr dans les cellules cancreuses (alors quil est sous forme
dpisome libre dans les tumeurs bnignes). Mais dans le sens inverse, la relation est beau-
coup moins nette : nombre de personnes infectes par ces HPV risque de cancer nauront
pas de cancer, puisquon estime que 80 % des femmes sont un jour infectes par HPV 16
ou 18, et les liminent, et que mme les dysplasies du col de haut grade ne mnent pas
forcment au cancer du col. Une sensibilit de lhte intervient certainement dans la sur-
venue du cancer. Rle possible de cofacteurs comme le tabagisme. Lassociation aux HPV
16 ou 18 se retrouve pour le cancer anal chez les homo ou bisexuels.
Le caractre cancrigne des HPV-16 et 18 est attribu lactivit des produits des gnes
prcoces 6 et 7 (E6 et E7, E pour early). Les protines codes par ces gnes se lient et inhi-
bent les produits danti-oncognes pro-apoptotiques que sont (pour E6) la protine p53
(appele parfois le gardien du gnome ) et (pour E7) la protine Rb. Ainsi E6 et E7
dHPV 16 et 18 sont anti-anti-oncognes et anti-apoptotiques. Ces HPV sont considrs
comme des cancrignes ncessaires mais non suffisants pour le cancer du col utrin. Ce
cancer pose un problme important de sant publique: 500.000 cas par an dans le monde, 2
e
cause de cancer de la femme aprs le cancer du sein. Comme toute affection dorigine virale,
sa prvalence est fortement augmente par le SIDA (comme pour la maladie de Kaposi).
7. Diagnostic des infections HPV
Le diagnostic est avant tout clinique, cytologique (frottis cervical) ou histologique (sur
biopsie dexrse).
Ainsi, on fait le diagnostic de condylome plan avec prsence de kolocytes, et lon classe les
dysplasies du col utrin en CIN I III, recherchant des foyers de micro-invasion.
La place des examens virologiques est discute et discutable
intrt rduit de la microscopie lectronique permettant de visualiser les particules vira-
les dans le broyat ultrasonn dune tumeur, condition quelle soit riche en kratinocy-
tes.
la discussion porte sur les techniques de biologie molculaire, de dtection des gnomes
viraux. Y-a-t-il en pratique courante une place pour la dtection des HPV indpen-
damment des examens de cytologie sur frottis cervical, base de la prvention du cancer
du col ? Sachant que les HPV-16 ou 18prcdent lapparition de la dysplasie mais quen
cas dinfection par ces HPV lvolution vers le cancer est tout fait inconstante, que tou-
te lsion de dysplasie inquitante fait lobjet dune exrse, quelle que soit la virologie.
La rponse pour le moment est non mais wait and see. Cela tant, il existe des PCR
(revoir illustration III-1 (voir page 96) et illustration III-2 (voir page 97)) avec des
amorces consensus permettant de dtecter les HPV les plus frquents au niveau gnital,
cela en 2 blocs, dune part les HPV 16, 18 potentiel cancrigne, dautre part les
gentils HPV-6, 11
donc le frottis classique reste le test de dpistage du cancer du col, la biologie mol-
culaire des HPV pouvant constituer un appoint dans les cas o ce frottis donne un rsultat
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
226/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
inclassable: la mise en vidence dune infection par HPV 16 ou 18 caractre persistant
constitue alors un signe dalarme supplmentaire conduisant une surveillance plus ser-
re.
8. Traitement des verrues et des condylomes
Il consiste tout simplement dtruire les tumeurs par lectro-coagulation, cryothrapie ou
application de podophylline.
La papillomatose larynge juvnile qui obstrue les voies ariennes et qui, mme en labsence de transforma-
tion maligne, rcidive rgulirement aprs cure chirurgicale ragit favorablement ladministration dinterf-
ron intra-musculaire. Une relation possible entre papillomatose larynge juvnile et pousse de
condylomatose vnrienne chez la mre durant la grossesse fait discuter lintrt en pareille circonstance
dun accouchement par csarienne.
Lutilisation du cidofovir ou HPMPC, nuclotide antiviral, est lessai en traitement local,
mais il est mal tolr, en raison de sa toxicit locale.
Limiquimod, immunostimulant et donc intellectuellement sduisant, donne lui aussi une
toxicit locale.
Une question: faut-il traiter, alors que souvent ces tumeurs rgressent spontanment ?
On traite assurment les tumeurs gnantes, les dysplasies cervicales inquitantes.
9. Plusieurs essais de vaccin ont suscit de grands espoirs. Ils sont constitus de la principale
protine de capside (produite par recombinaison gntique en cellule de levure) ; elle sauto-
assemble en particules dallure virale (VLP, pour virus-like particules) ; ces VLP dpourvues
dADN sont non infectieuses; mais elles suscitent des anticorps neutralisants (puisque di-
rigs contre la surface virale qui, pour les virus nus, est la capside). On a fait des vaccins au
moins bivalents, contre les deux principaux HPV potentiel cancrigne (anti-HPV-16 +anti-
HPV-18). De fait, on rduit considrablement, chez les personnes vaccines par rapport au
groupe tmoin, la survenue dinfection par ces virus ainsi que la survenue de dysplasies du
col de lutrus. Ce sera donc le 2
e
vaccin contre le cancer (le 1
er
tant le vaccin anti-HBV,
contre le cancer du foie), vaccin contre le 2
e
cancer de la femme!
10.3 Parvovirus
Leur nom vient de leur trs petite taille ( 20nm). Ce sont des virus ADN, icosadriques et nus,
ce dernier caractre expliquant leur rsistance dans le milieu extrieur, leur transmission facile
dans la communaut (probablement par voie respiratoire).
Certains dentre eux appartiennent la catgorie des dependovirus, du fait que leur multiplication dpend dune
co-infection par un autre virus: tel est le cas des virus satellites des adnovirus humains, qui semblent bien dpourvus
de pouvoir pathogne pour lhomme mais sont utiliss en thrapie gnique.
Parmi les parvovirus indpendants, seul nous intresse le PARVOVIRUS B19.
Ce virus a une affinit lective pour les rythroblastes, prcurseurs de la ligne rouge. Il est le
responsable dans plus de la moiti des infections dune ruption congestive pidmique, bnigne,
principalement observe chez les enfants et appele 5
e
maladie (ou mgalrythme pidmique).
Elle a un aspect en aile de papillon sur les deux joues. Un autre signe consiste, chez ladulte, en
une arthropathie des grosses articulations.
Linfection par parvovirus B19 est galement responsable de la plupart des cas de crises aigus
danmie aplastique survenant de faon pidmique chez les sujets atteints danmie hmoly-
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 227/307
tique chronique (comme la drpanocytose). Linfection des sujets immunodprims peut se tra-
duire par une anmie chronique. Ces deux catgories de sujets ont en commun de ne pouvoir
rgnrer assez vite les lments de la ligne rouge dtruits par le parvovirus B19.
Enfin, linfection de la femme enceinte, sans tre tratogne, entrane, dans quelques cas seule-
ment, un anasarque ftoplacentaire ou/et un avortement.
La culture sur rythroblastes tant difficile pratiquer, le diagnostic de linfection repose sur la re-
cherche dIgM anti-B19 dans le srum, complte ventuellement par la recherche de gnome
viral par PCR dans le sang o le virus se trouve des concentrations trs leves. On na pas de
chimiothrapie opposer ce virus. Mais on peut traiter lanmie responsable de lanasarque f-
toplacentaire par une transfusion sanguine in utero.
Rcemment, un nouveau parvovirus humain a t dcouvert, le Bocavirus, responsable dinfec-
tions respiratoires chez lenfant, venant en 3
me
position aprs le RSV et le mtapneumovirus hu-
main.
10.4 Poxvirus
10.4.1 Gnralits
Ce sont les plus gros des virus (1/3 de micron), en forme de brique. Leur structure est complexe.
Leur ADN est associ des protines lintrieur dune coque interne paisse (core) trs rsistante
et flanqu de 2 corps latraux.
Lensemble est emball dans des enveloppes dorigine purement virale qui ne constituent pas un
pplos stricto sensu. Au contraire, les poxvirus sont les plus rsistants des virus dans le milieu
extrieur : transmission volontaire de la variole par des habits ports par les malades!
Pour des virus ADN, ils sont la particularit de se multiplier dans le cytoplasme. Ce qui suppose
une autonomie dun degr inhabituel pour un virus.
Ils sont sensibles un antiviral particulier, le marboran (mthisazone). Mais la production en a t arrte avec lra-
dication de la variole. Il se trouve heureusement que le cidofovir est actif sur les poxvirus, comme sur le CMV et les
adnovirus.
10.4.2 Variole
(Revoir illustration II-10 (voir page 87)
Elle a t radique et officiellement son virus nexiste plus que dans deux laboratoires de rf-
rence ( Moscou et Atlanta). Sa destruction est lobjet de dbats passionns.
La variole tait une virose gnralise donnant une ruption pustuleuse aprs deux semaines din-
cubation. Lruption, secondaire la virmie, prcde et associe une fivre leve avec pneu-
monie, ne comportait (contrairement la varicelle) quune seule pousse, de sorte qu un moment
donn tous les lments (contrairement la varicelle) en taient au mme stade : macules, puis
papules, puis vsicules enchsses dans le derme (et non pas en goutte de rose) puis pustules, puis
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228/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
crotes (contagieuses) et enfin cicatrices indlbiles (chez les survivants, la petite vrole).
Donc ruption monomorphe. Lexanthme tait accompagn dun nanthme (ulcrations en-
dobucales) particulirement contagieux, la toux de la pneumonie associe aidant la propagation
du virus.
La mortalit, variable selon les pidmies, tait de lordre de 20%, la mort survenant avant lrup-
tion dans les formes foudroyantes. A lpoque de J enner, un tre humain sur six tait destin mou-
rir de la variole.
Ce pouvoir pathogne du virus de la variole viendrait dune protine virale antagonisant le complment.
10.4.3 Vaccine
1. Mise au point par Jenner (1796), la vaccine drivait initialement dune poxvirose de la va-
che, le cowpox, qui est aussi une maladie professionnelle de vachers. Cest un vaccin vivant
dont linoculation dans le derme donne une lsion localise (pustule), immunisant cependant
contre linfection gnralise quest la variole. La longue incubation laissait la vaccina-
tion antivariolique par la vaccine, faite aussitt aprs le contage, le temps darrter la
progression de linfection variolique.
2. On ne lemployait plus pour prvenir la variole. En effet, suite lradication de la variole,
la vaccination avait t interrompue, dautant quelle comportait un risque de mort de 1/10
6
,
par complications de deux ordres: soit encphalite post-vaccinale dorigine allergique sans
multiplication virale dans le cerveau; soit vaccine gnralise (semblable la variole) ou
gangrne vaccinale par multiplication virale, chez les sujets immunodprims ou atteints
deczma, cela la suite dune vaccination malencontreuse du sujet lui-mme ou, bien plus
souvent, dun membre de lentourage (analogie avec les complications du vaccin vivant con-
tre la poliomylite).
3. Le virus de la vaccine est rest trs utilis comme vecteur en gntique, par exemple vise
immunisant (encore quon prfre pour cela utiliser un poxvirus aviaire, le canarypox qui
ne donne chez lhomme quune infection abortive sans aucun danger mme chez les sujets im-
munodprims). Exemples: vaccins recombinants anti-hpatite B (comportant le gne de
lantigne HBs) ou antirabique (comportant le gne de la glycoprotine de surface).
10.4.4 Actualit de la variole
La variole et la vaccination anti-variolique sont tristement redevenues dactualit avec la menace
de bioterrorisme, sachant que du virus de la variole produit en masse en Russie se trouve dans une
dizaine de pays et que la reprise aux USA de manipulations du virus pour mise au point de nou-
veaux antiviraux antivarioliques nest pas non plus dpourvue de risque (cf lorigine des cas de
charbon aux USA).
Ainsi sont redevenus lordre du jour :
lenseignement du diagnostic de la variole, avec comme diagnostic diffrentiel principal la
varicelle svre (revoir illustration II-10 (voir page 87)), comme test virologique la PCR
sur liquide de vsicule ou de pustule.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 229/307
la vaccination ou revaccination antivariolique, en commenant par les quipes mdicales et
mdicotechniques ddies.
la constitution de stocks de lantiviral actuellement efficace, lHPMP (cidofovir), utilis par
voie intraveineuse et la mise au point dautres antiviraux utilisables p.o.
la mise au point de nouvelles souches de vaccin, mieux tolres que celles utilises pour lra-
dication de la variole.
Paradoxalement, la nature de la vaccine (de vacca, vache) mise au point reste un mystre, car sa squence g-
nomique est aussi loigne de celle du cowpox que de celle de la variole. Peut-tre sagirait-il du horsepox, un
moment utilis par J enner, disparu spontanment depuis. A noter que le gne de la protine virale qui antagonise
le complment chez le virus de la variole se trouve, chez le virus de la vaccine, mut en de nombreux points et
bien moins actif.
La fabrication dimmunoglobulines spcifiques partir du plasma de donneurs vaccins ou
revaccins contre la variole.
10.4.5 Poxviroses professionnelles
On observe occasionnellement deux autres poxviroses professionnelles dorigine animale chez les
leveurs de btail : le nodule des trayeurs et lorf. Ce dernier peut tre transmis par les fils de fer
barbels des parcs o paissent les animaux malades.
10.4.6 Monkey pox
Une poxvirose gnralise svit en Afrique, le monkey pox, transmissible du singe lhomme qui
fait une ruption pustuleuse parfois mortelle, ressemblant cliniquement la variole mais sans en
avoir le gnie pidmique.
Le virus est, comme la variole et la vaccine, sensible lHPMPC ou cidofovir. Le rat de Gambie en est un des
rservoirs. Une pidmie de cas humains sest dveloppe aux USA transmise par des chiens de prairie utiliss
comme animaux de compagnie, contamins suite lintroduction dun rat de Gambie infect. Mfiez-vous de la mode
des nouveaux animaux de compagnie, surtout sils mordent !
10.4.7 Molluscum contagiosum
Cest une (ou plusieurs) petite tumeur cutane, touchant les enfants, de nature contagieuse, bni-
gne. Toutefois ces lsions peuvent tre extensives chez les malades du SIDA.
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230/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
10.5 Points importants
10.5.1 Adnovirus ou ADV
Il y a plus de 40srotypes humains.
Ils sont trs rpandus.
Ils donnent le plus souvent des infections asymptomatiques mais aussi des maladies trs
diverses: oculaires, respiratoires, digestives. Certaines sont graves: la pneumonie adnovi-
rus type 7, les infections chez les sujets immunodprims.
Ils sont dous pour la plupart dun pouvoir oncogne mais uniquement exprimental, sans im-
plication dans les cancers humains.
Nous navons pas de chimiothrapie dusage courant, mais lHPMPC ou cidofovir est lessai
pour les formes graves.
10.5.2 Polyomavirus humains, BK et JC virus
Ils sont trs rpandus mais dpourvus de pouvoir pathogne chez les sujets sains, enfants,
adultes ou femmes enceintes (ces dernires ayant souvent une ractivation asymptomatique).
Chez les sujets immunodprims, les ractivations endognes dune infection latente donnent
une cystite hmorragique et des nphropathies avec ncrose tubulaire pour le BK virus et une
leucoencphalite multifocale progressive pour le virus J C.
Ces virus sont de culture trs fastidieuse et le diagnostic de linfection repose sur la PCR
10.5.3 Papillomavirus humains ou HPV
Ils ne sont pas cultivables in vitro et ils sont caractriss en plus de 100 gnotypes par
lanalyse de leur ADN.
Ils sont responsables de tumeurs bnignes: des verrues sur la peau et des condylomes sur les
muqueuses, condylomes qui sont acumins (crtes de coq) ou plans
Le cycle viral est parfaitement adapt la physiologie du kratinocyte: les virus ne se multi-
plient compltement que dans les couches superficielles en voie de kratinisation des pith-
liums malpighiens. Dans les couches basales, linfection est abortive mais responsable de la
prolifration cellulaire lorigine des verrues et des condylomes.
Les HPV-16, -18 et quelques autres sont responsables de lsions de lpithlium du col utrin
qui vont de la dysplasie au cancer du col utrin.
Les infections gnitales HPV sont transmission sexuelle et des rapports sexuels prcoces
impliquant un nombre important de partenaires sont le principal facteur de risque du cancer
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 231/307
du col utrin.
Limmunodpression du SIDA favorise le dveloppement des condylomes, des dysplasies s-
vres et du cancer du col utrin, de mme que le cancer ano-rectal chez les homosexuels mas-
culins.
Le vaccin contre les HPV-16 et 18 est en cours de dveloppement.
10.5.4 Parvovirus humain B19
Cest un trs petit virus ADN, nu, ubiquitaire, transmission interhumaine trs facile
Il a pour cellules cibles les prcurseurs de la ligne rouge.
Il donne chez lenfant la 5
e
maladie (ruption) et chez ladulte des arthropathies.
Il donne des crises danmie aigu chez les sujets atteints danmie hmolytique chronique,
des anmies chroniques chez les immunodprims, quelques cas danasarque fto-placentai-
re chez la femme enceinte.
10.5.5 Poxvirus
Ce sont les plus volumineux et les plus rsistants des virus.
Leurs enveloppes ne constituent pas un pplos stricto sensu.
Bien qu ADN, ils se rpliquent dans le cytoplasme.
La variole a t radique et le monkeypox nen a pas pris le relais.
La menace de bioterrorisme oblige rapprendre le diagnostic de la variole et rutiliser,
malgr ses risques de complications, la vaccination anti-variolique.
Lantiviral actuellement disponible contre les poxvirus est lHPMPC (cidofovir)
La vaccine ou le canarypox sont utilisables comme vecteurs de gne pour vaccin contre la
rage ou lhpatite B.
Autres virus ADN : adnovirus, polyomavirus, papillomavirus, parvovirus, poxvirus
232/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 233/307
Chapitre 11
Agents des encphalopathies
spongiformes ou ATNC
(agents transmissibles non
conventionnels)
11.1 Des maladies extraordinaires
Ces agents donnent chez lhomme une dmence prsnile progressive et mortelle, rare (1 cas
pour 1 million de sujets par an en France) et dite sporadique, caractrise par une vacuolisation
des neurones do le terme spongiforme, la maladie de Creutzfeldt-Jakob (MCJ). Ils ne sont
pas cultivables in vitro. La seule faon de les tudier consiste inoculer lanimal dexprience,
au singe, un extrait de cerveau qui reproduit chez le singe une maladie analogue la maladie hu-
maine, aprs une incubation trs prolonge dpassant un an, voire mme 10 ans.
Par ailleurs, des animaux souffrent et meurent dencphalopathies spongiformes distinctes, dues
des agents diffrents, les plus connues tant la tremblante du mouton et de la chvre (ou scrapie,
ou gratte), le dprissement chronique des cervids (aux USA) et la maladie de la vache folle. Le
scrapie a pu tre exprimentalement transmise la souris, ce qui en a facilit ltude mais la tech-
nique de base de ltude de ces agents reste linoculation lanimal de dilutions en srie pour
calcul de la dose ltale 50% (DL50). Cest de la virologie du Moyen Age! Les titres de virus dans
le cerveau peuvent dpasser 10
10
DL50/g.
11.2 Des agents extraordinaires
Ils se situent part, au-del des frontires de la virologie : non dtects jusqu prsent, mme
au microscope lectronique, ils rsistent de faon extraordinaire aux procds dinactivation
physico-chimiques qui dtruisent le pouvoir infectieux des bactries et des virus, chaleur, formol,
Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
234/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
ultraviolets. Ils rsistent une heure 100 C et les pices anatomiques crbrales conserves des
annes dans le formol, non seulement restent infectantes, mais voient leur rsistance linactiva-
tion augmente. Ainsi peut-on dire que le formol (ou le glutaraldhyde) ninactive pas mais, au
contraire, blinde les agents des encphalopathies spongiformes!
En revanche, ces agents sont sensibles aux 3 mesures drastiques suivantes: la chaleur humide
(autoclavage) 134C pendant 1/2 heure, la soude 1N durant 1 heure 20C, leau de Javel di-
lue au demi (6 chlorimtriques) durant 1 heure 20C.
Il ny a pas de rponse immunitaire au cours des encphalopathies spongiformes. Cependant, le
scrapie exprimental est marqu par une multiplication initiale de lagent dans la rate et ncessite
un systme immunitaire fonctionnel, en particulier des lymphocytes B matures et des cellules den-
dritiques, sans lesquelles il ny a pas datteinte du systme nerveux central.
Bien quon nait jamais vu ces agents au microscope lectronique, on a mis en vidence dans le
cerveau des sujets infects une protine fibrillaire qui correspond en totalit ou en partie lagent
infectieux. Les agents des encphalopathies spongiformes sont qualifis dagents transmissibles
non conventionnels (ATNC).
Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 235/307
11.3 Lhypothse du prion ou de la protine
seule
La thorie en vogue est celle du prion pour protine infectieuse ou proteinaceous infectious
particles, de Prusiner, prix Nobel (Notez lhomologie de squence entre P. R. I. O. N. et P. R. U.
S. I. N. E. R.). Elle fait des ATNC des agents extraordinaires, composs uniquement dune proti-
ne rsistante aux protases (PrP
res
ou PrP
r
), cette protine tant une forme isomorphe (cest-
-dire plie anormalement) dune protine cellulaire normale, PrP
c
. Celle-ci, code par le gnome
Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
236/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de lhte, est ubiquitaire mais surexprime sur les neurones. PrP
c
et PrP
res
ont la mme squence,
mais la PrP
res
a plusieurs feuillets bta que na pas la PrP
c
, la place dhlices alpha de la PrP
c
,
expliquant ses nouvelles proprits : rsistance, insolubilit, non-mtabolisation et agrgation
en fibrilles. La PrP
res
aurait la proprit de convertir, par simple contact (hybrides htroduplex
protine-protine) la PrP
c
en PrP
res
, forant la PrP
c
prendre la forme PrP
res
, par
transconformation , transformation dhlices alpha en feuillets bta. Donc propagation dune
information plutt que dune molcule. Laccumulation dans les neurones de lindestructible PrP
res
donne les vacuoles caractristiques (avec perte neuronale) et des plaques amylodes, expliquant
les troubles neurologiques.
Il reste bien des mystres : quoi sert la PrP
c
, glycoprotine localise la surface de nos cellules?
Les souris dpourvues gntiquement de PrP
c
(souris knock-out , invalides pour la PrP
c
)
se portent bien et sont totalement insensibles linoculation de lagent du scrapie. Linjection de
la PrP
res
seule ne transmet pas les encphalopathies spongiformes! Faut-il un cofacteur (acide
nuclique?) pour la transconformation? pour transmettre lencphalopathie?
11.4 ESB et nvMCJ
On attribue lexplosion de lpidmie de la maladie de la vache folle ou encphalopathie spon-
giforme bovine (ESB) au Royaume Uni la consommation de farines carnes de vaches folles
en incubation (recyclage des ATNC par transformation des bovins, herbivores, en carnivores,
pour des raisons conomiques).
Cette pidmie bovine a t suivie au Royaume-Uni puis en France par lmergence chez lhomme
dune forme atypique de MCJ , apparition prcoce dans la vie et volution rapide, la nvMCJ (nv
pour nouveau variant). La relation de cause effet est pratiquement certaine. Il faut bien voir
quentre ATNC la barrire despce
1
nest pas infranchissable, mme si nous avons depuis des
sicles mang des moutons atteints de tremblante sans quil y ait eu ce jour de transmission de la
tremblante lhomme. LESB a t transmise exprimentalement aux carnivores (chat) par voie
orale et on a calcul quune cervelle de bovin atteint dESB pouvait contaminer 2 100hommes.
On ignore actuellement si la centaine de cas de nvMCJ observs au Royaume Uni et en France
correspond au pic de lpidmie humaine (dans lhypothse o lincubation de la nvMCJ ne serait
que de 10 ans) ou au contraire au dbut dune trs importante pidmie (certains ont parl
d1 million de cas, dans lhypothse o lincubation de la nvMCJ serait de 30 ou 40ans, ce qui a
priori nest pas impossible pour une maladie ATNC).
Autre souci : les farines carnes nont-elles pu transmettre lATNC de lESB au mouton ou la
chvre, avec la perspective dune pidmie ovine (qui avancerait sous le masque de la tremblante
classique) et dun risque de transmission lhomme qui nexistait pas avec la tremblante naturelle
du mouton et de la chvre?
Le test actuel appliqu aux bovins pour cerner lpidmie dESB consiste dtecter dans le cer-
veau des animaux en incubation dESB (avant les signes de la maladie) la PrP
res
laide dun an-
ticorps anti-PrP
c
(qui reconnat aussi la PrP
res
, les deux protines ayant la mme squence). On
traite auparavant lextrait de cerveau par protase. Sil ny a pas de PrP
res
, lanticorps ne dcle
1. La barrire despce, relative, est lie des diffrences de squence entre PrP
c
dune espce lautre.
Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 237/307
rien car la PrP
c
prsente a t digre. Si lanticorps marque lextrait (en ELISA, Western blot ou
autre technique), cest quil y a de la PrP
res
.
Quoiquil en soit, lpidmie dESB est en fin de course en Grande Bretagne et le risque de trans-
mission dATNC lhomme partir de la vache est maintenant trs bien contrl, par comparaison
ce quil a pu tre.
11.5 Les diffrentes catgories de MCJ
Par ailleurs, la maladie de Creutzfeldt-J akob est entre aussi dans la liste des infections iatrognes
(gnres par le mdecin, iatros en grec) : une prparation dhormone de croissance naturelle faite
partir dextraits dhypophyses humaines sest en effet rvle contamine par lagent de la mala-
die de CJ , donnant celle-ci des enfants traits pour leur petite taille.
Enfin, ct de la maladie de Creutzfeldt-Jakob sporadique, classique, il existe des formes fa-
miliales de maladie de Creutzfeldt-J akob (env. 10%), caractrises, comme on peut sy attendre,
par des mutations du gne de la PrP au niveau de la ligne germinale. Mais dans les MCJ spora-
diques, des mutations, somatiques cette fois, ou un polymorphisme gntique au niveau du gne
de la PrP, pourraient intervenir dans la survenue de la maladie ou dans une susceptibilit la sur-
venue de la maladie.
On constate dailleurs que presque tous les cas de nvMJ C actuels (survenant chez les jeunes) ont
un certain polymorphisme (Mt/Mt) au niveau du codon 129 de la PrP. On peut cependant crain-
dre que des nvMCJ puissent aussi survenir chez les personnes sans ce polymorphisme (la majorit
des gens sont, non pas Mt/Mt, mais Mt/Val), mais alors plus tardivement, en une deuxime va-
gue (comme cela sest vu pour la maladie de Creutzfeldt-J akob par hormone de croissance conta-
mine et pour le kuru), pourvoyant une importante pidmie venir.
Au total trois catgories de maladies de Creutzfeldt-Jakob peuvent tre individualises, avec
un double dterminisme, infectieux et gntique :
1. les MJ C sporadiques, prsniles, classiques : 1 cas/1million/an en France
2. les MJ C familiales, gntiques : incidence =10% des prcdentes
3. les MJ C transmises, infectieuses :
iatrognes, par hormone de croissance extractive, greffe de corne, de dure-mre,
nvMCJ, par consommation de bovins atteints dESB (cerveau ou produits drivs surtout),
pour mmoire, le kuru, par cannibalisme rituel dans la tribu Fore en Nouvelle Guine.
Mais les MCJ de ces 3 catgories sont exprimentalement transmissibles lanimal, au singe.
Noubliez pas de remplir la fiche dvaluation page 305
Agents des encphalopathies spongiformes ou ATNC (agents transmissibles non conventionnels)
238/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 239/307
Chapitre 12
Virus de la rage, arbovirus,
autres virus dits mergents
Il sagit dun regroupement quelque peu artificiel de virus qui svissent principalement en territoi-
res exotiques mais dont lHexagone nest pas labri. La notion de virus mergents est elle aussi
empreinte dambigut. Quoiquil en soit, lessentiel demeure de connatre le pouvoir pathogne
de ces virus trs divers, pour sen prmunir, que lon vive en Occident ou dans le Tiers Monde, en
rsident permanent ou temporaire, le brassage des populations humaines et animales assurant la
circulation de ces virus fort dangereux.
12.1 Virus de la rage
La rage est une encphalomylite animale touchant les mammifres, transmise accidentellement
lhomme par inoculation transcutane, en gnral par morsure.
La rage humaine, une fois les signes cliniques apparus, est toujours mortelle. Cependant, elle
comporte une incubation en gnral suffisamment longue pour quon ait le temps, aprs une
morsure contaminante, de faire une srovaccination du sujet et de le protger de la maladie avant
que le virus nait atteint le cerveau. Toutefois, ds que le cerveau est atteint et quapparaissent les
signes dencphalite rabique, la mort est inluctable.
Ainsi, aucun progrs majeur na t fait en matire de traitement de la rage depuis Louis Pasteur
(rendu clbre par la vaccination de J oseph Meister en 1885) si ce nest quon a amlior la tol-
rance des vaccins (qui en avaient grand besoin) et quon contrle mieux la rage animale, du moins
dans les pays riches.
12.1.1 Le virus rabique
Le virus rabique (lyssavirus, lyssa signifiant rage en grec) est un virus ARN, totalement diffrent
des prcdents. Il a une capside tubulaire. Il est de forme allonge, en balle de revolver ou dobus,
limage de sa mchancet. Son pplos, driv de la membrane cytoplasmique, porte des spicules
dhmagglutinine constitues dune glycoprotine. Cest lantigne immunoprotecteur : les an-
ticorps anti-glycoprotine induits par la vaccination protgent de linfection, et sont donc neutrali-
sants.
Le virus rabique est extrmement fragile, ne survit pas dans le milieu extrieur et cest son mode
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
240/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de transmission transcutan par morsure qui lui permet de remdier cette fragilit. Pas
dantiviral au point, malgr la cible potentielle quest lARN rplicase virale.
12.1.2 Rservoir du virus
Dans nos rgions, le RESERVOIR DU VIRUS tait, du temps de Pasteur, constitu par les
chiens errants. Puis ce fut les renards aprs la 2
e
guerre mondiale et actuellement, depuis peu, les
chauves-souris insectivores.
Cette modification du rservoir animal est apparue durant la 2e guerre mondiale en Pologne.
Il existait en Europe du Nord un foyer limit de rage du renard, lorsquen 1939 la Pologne a t envahie par les armes
de ses deux puissants voisins. Il en est rsult un dsquilibre cologique: massacre dun dixime de la population
polonaise, ravage de villages par les Einsatzgruppen (escadrons de la mort nazis dvolus lextermination des J uifs
et des opposants la politique du Reich), avec libration des animaux de basse cours dans la campagne labandon,
disparition de la chasse traditionnelle du renard pour sa fourrure, faute de chasseurs, et de fourreurs. Le renard, aimable
prdateur, a profit du dsastre pour prolifrer, amplifiant ainsi lendmie rabique.
La guerre termine, la prolifration des renards, et avec elle lextension de la rage, a gagn lEurope centrale, toujours
du fait dun dsquilibre cologique, induit celui-l par certains faits de civilisation: la destruction des prdateurs du
renard (loup, lynx, ours, aigle), de ses concurrents pour la nourriture (petits rapaces, belettes et putois) htivement qua-
lifis de nuisibles, le repeuplement des rserves de gibier en animaux dlevage, inaptes la vie sauvage, proies faciles
pour le chasseur maladroit mais aussi pour le renard. Celui-ci, petit carnassier de second ordre, sest donc trouv promu
indment roi de la faune sauvage, avec dsormais pour seul ennemi le virus rabique. Le 22 mars 1968, date de la cra-
tion du mouvement tudiant du mme nom par les Enrags de Nanterre, on dcouvrait, venant dAllemagne, un
renard enrag sur le sol de France au bord de la Moselle.
La rage du renard sest rpandue dans tout le Nord et lEst de la France, et serait Gibraltar sans
la vaccination du renard.
Dans la plupart des pays du Tiers-Monde le rservoir est constitu, comme du temps de Pas-
teur en Europe, par les chiens errants. cela sajoutent quelques particularits: les loups en
Iran, les vampires (chauves-souris hmatophages) en Amrique du Sud, la mouffette (sorte de
putois) en Amrique du Nord. Il sagit cependant de souches de rage classique (gnotype
1, rage des carnivores),
A ct de cela, les chauves-souris insectivores sont apparues comme un rservoir de varits
particulires de virus rabique, dans diverses parties du monde, dont lEurope, France com-
prise, avec lEBL-1 et lEBL-2 (EBL pour European Bat Lyssavirus) (=gnotypes 5 et 6).
Il faut dsormais en tenir compte, mme si les cas de rage par ces deux gnotypes en Europe
se comptent sur les doigts de la main.
Dailleurs, lanalyse des squences virales (et de lhorloge molculaire) suggre que les souches de rage des
chiroptres (chauves-souris) ont, au cours de lvolution, prcd celles des carnivores; les chiroptres sont
sans doute encore des rservoirs potentiel de nouvelles souches de rage qui risquent dmerger quand la rage
classique du chien et des carnivores (gnotype 1) aura quitt le devant de la scne. La rage des chiroptres tait
sans doute en Amrique la cause essentielle de rage humaine, avant larrive des Europens et de leurs chiens.
La rage des carnivores est le sommet de liceberg, la base tant sans doute la rage des chauves-souris.
12.1.3 La contamination de lhomme
Lhomme aurait pu tre contamin par morsure de renard enrag, mais il risquait de ltre bien da-
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 241/307
vantage par lintermdiaire danimaux domestiques en contact avec les renards et mordus par
eux: chiens, chats et btail.
Dans tous les cas, cest la salive des animaux qui est infectante. Chez lanimal enrag, le virus est
dans le cerveau, surtout dans le lobe temporal et dans la corne dAmmon ou hippocampe (systme
limbique dont dpend lhumeur de lanimal). Mais il passe aussi dans la salive, et cela quelques
jours avant les premiers signes de rage. Cette excrtion salivaire pr-clinique fait que la rage peut
tre transmise par un animal apparemment sain.
Ce virus prsent dans la salive nest pas capable par lui-mme de traverser la peau saine, mais il
pntre travers la peau par le fait de morsure, de griffure ou mme par de simples excoriations
cutanes, lchage sur peau lse par exemple. Ainsi les herbivores domestiques enrags ne mor-
dent gnralement pas, mais leur salive peut fort bien contaminer les paysans qui ont trs souvent
sur les mains de petites excoriations cutanes.
Notons que le tropisme pour le systme limbique est un coup de matre en terme dadaptation
volutive: ce virus incapable de survivre dans lenvironnement, en touchant cette zone du cerveau,
dclenche gnralement un comportement agressif chez sa victime, ds lors contrainte de le trans-
mettre la victime suivante: virus trs fragile mais diabolique .
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
242/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
12.1.4 Trajet du virus
Dans lorganisme, linfection va gagner le cerveau en cheminant le long des nerfs, par voie axonale
centripte (cest ce quon appelle la neuroprobasie). Ce trajet correspond lincubation de la rage,
incubation trs variable de 6 jours un an ou plus (jusqu 5ans) (!)
Elle est dautant plus brve que la morsure sige plus prs du cerveau ( la face), ou dans une
zone richement innerve (doigts, organes gnitaux), ou que linoculum est massif, par morsures
multiples ou profondes.
Ultrieurement, le virus diffuse du cerveau tout lorganisme par voie nerveuse centrifuge (septi-
nvrite), retrouv alors au niveau de la peau, des muqueuses, des glandes salivaires.
12.1.5 Signes de la rage
Les prodromes consistent en une insomnie, de lanxit, une hyperesthsie gnralise: le
sujet ne supporte pas le contact de ses vtements; parfois il souffre de priapisme.
Lhydrophobie est un signe classique de rage. Cest, en relation avec lhyperesthsie pharyn-
go-larynge, un spasme pharyngo-laryng la dglutition des liquides. Il entrane des touf-
fements par fausse route, stend largement jusqu la musculature respiratoire et, tel un
rflexe pavlovien, sinstalle la seule vue ou vocation de leau.
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 243/307
Larophobie est un spasme facio-cervical extensif, dclench par insufflation dair derrire
loreille.
Lencphalite proprement dite est plus tardive.
On ne comprend pas bien le mcanisme de la rage (perturbation de la neurotransmission?), ni dailleurs le m-
canisme exact de la protection par le vaccin aprs morsure. On peut voir, mtaphoriquement du moins, une ana-
logie entre les deux infections constamment mortelles que sont la rage et le SIDA, caractrises toutes deux par
un tat dhyperactivation dtruisant par surmenage neurones et systme nerveux central dans la rage, lympho-
cytes et systme immunitaire dans le SIDA.
A noter que 10 % des cas de rage humaine sont purement paralytiques, sans hydrophobie,
sous forme de paralysies ascendantes voquant la poliomylite ou le syndrome de Guillain-
Barr. Cest un pige diagnostique auquel il faut penser.
Les mesures de ranimation les plus modernes ne font que retarder la mort, inluctable.
Chez lanimal, la rage peut tre furieuse (cas habituel chez le chien, le chat, le renard) ou pa-
ralytique (cas habituel chez les ovins et les bovins). Chez lanimal sauvage, le premier signe
est la perte de linstinct de conservation, ce qui fait que lanimal approche lhomme sans
crainte.
Le virus est cherch du vivant du malade dans les cellules du frottis conjonctival ou nasal
ou dans une biopsie cutane. Le diagnostic rapide se fait par RT-PCR, ou par immunocyto-
diagnostic (immunofluorescence ou immunoperoxydase) cherchant des corps de Negri (in-
clusions intracytoplasmiques).
On faisait classiquement une inoculation la souris ou des cellules neuronales en culture (cherchant des corps
de Negri galement).
La recherche de virus peut tre effectue aussi dans la salive, le liquide cphalorachidien, les
urines, voire une biopsie crbrale.
12.1.6 Mesure prendre
12.1.6.1 Vis--vis de lanimal
1. Sil a des signes neurologiques dencphalomylite, cest--dire des troubles du comporte-
ment, il faut le considrer comme enrag, labattre et joindre un laboratoire spcialis (lIns-
titut Pasteur Paris) pour rechercher le virus dans le cerveau en particulier au niveau de
lhippocampe.
On a besoin dun diagnostic direct rapide : limmunocytodiagnostic par immunofluores-
cence (IF) ou immunoperoxydase (IP) recherche directement de lantigne viral sous forme
de corps de Negri dans les cellules de la corne dAmmon. Surtout, on utilise de plus en plus
la recherche de gnome viral par RT-PCR.
Classiquement on procdait une inoculation dun broyat de cerveau de jeunes souris dont certaines taient
sacrifies intervalles de temps rguliers pour rechercher lapparition de corps de Negri dans leur cerveau en IF
ou en IP. On inoculait aussi des cultures in vitro de cellules nerveuses, toujours la recherche de corps de Negri.
2. Si lanimal domestique mordeur est apparemment sain, il faut le faire examiner par un v-
trinaire toutes les semaines pendant 3 semaines, la recherche des signes cliniques de la
rage (rage furieuse chez le chien ou le chat). Le vtrinaire tablit un certificat chaque vi-
site. Le mdecin a tout pouvoir - y compris de police- pour exiger cette dmarche dun pro-
pritaire ventuellement rcalcitrant.
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
244/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
12.1.6.2 Vis--vis du sujet mordu
1. Dans limmdiat, il faut procder une dsinfection de la plaie (autrefois, on la cautrisait
au fer rouge). Cest urgent et capital, en raison de la fragilit du virus. Mme leau savonneu-
se est efficace. Ne pas oublier la prophylaxie antittanique ni lantibiothrapie.
2. La dcision du traitement antirabique est facile prendre en cas de morsure par un renard
ou par nimporte quel animal sauvage. Un tel animal est srement enrag. En effet, lins-
tinct de conservation fait que les animaux sauvages fuient lhomme, moins davoir des trou-
bles du comportement dus une encphalite dont la cause majeure dans nos pays est la rage.
De mme, il faut traiter sans discussion en cas de morsure par un chien qui a disparu. Idem
en cas de blessure risquant de donner une rage incubation courte (morsure la tte, en
zone richement innerve comme les doigts ou les organes gnitaux externes, ou bien morsures
multiples ou profondes).
Il y a des cas o il est difficile de prendre la dcision de traiter ou de ne pas traiter. De toute
faon, il faut toujours demander conseil un centre de traitement antirabique. Il en existe
plus de 80 en France (Institut Pasteur pour Paris). Le traitement est la vaccination sans retard,
laquelle il faut adjoindre une srothrapie antirabique (immunoglobulines antirabiques)
ds quon a la moindre raison de craindre une incubation courte.
Le vaccin destin lhomme est un vaccin inactiv (tu) prpar partir de virus fixe:
une souche dj attnue par Pasteur par passages en srie sur cerveau de lapin.
Actuellement, on dispose de vaccins prpars en culture de cellules (fibroblastes embryon-
naires humains ou cellules VERO). Les vaccins actuels de culture cellulaire sont bien
mieux tolrs que les vaccins antrieurs qui donnaient parfois une encphalomylite aller-
gique, car contenant du matriel crbral danimaux adultes (cas du premier vaccin de Pasteur
prpar sur moelle de lapin).
Il faut durgence dbuter une srie de 4injections sous-cutanes, intramusculaires
(deltode) : deux injections J 0 (une dans chaque deltode) puis une J 21 et J 30 (voir ca-
lendrier des vaccinations page257 et page261).
12.1.6.3 Cas particuliers des chauves-souris
Est suspect tout animal au sol ou au comportement agressif. En cas de rencontre inattendue
mme sans morsure vidente (les morsures de chauve-souris, gnralement minimes, passent ina-
perues), dsinfecter immdiatement et joindre le Centre de Traitement Antirabique le plus proche.
12.1.6.4 Prvention
1. En France, il a fallu vacciner chien, chat et btail en zone endmique et autour de cette zone.
On vaccine titre prventif les sujets professionnellement exposs: vtrinaires, gardes-chas-
ses, techniciens de laboratoire, voire ranimateurs en neurologie. Lefficacit de la vaccina-
tion prventive est suivie sur le titre des anticorps anti-glycoprotine denveloppe (anticorps
neutralisants).
2. Concernant la rage du renard, on a cherch rduire la densit des renards [par de vastes battues et lusage des
gaz (la chloropicrine, et mme le zyklon B de sinistre mmoire!)], esprant quainsi les animaux enrags mour-
raient de la maladie avant davoir pu rencontrer, mordre et contaminer un congnre. Ce fut partout un chec.
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 245/307
En revanche, un remarquable succs a t obtenu par la vaccination des renards.. Cela
consiste rpandre par hlicoptre dans la zone dendmie des croquettes tudies au
got du renard, contenant dans une ampoule de verre cassable du vaccin vivant attnu (vi-
rus de la vaccine recombinant exprimant le gne de la glycoprotine denveloppe). Il en est
rsult un arrt puis un recul du front de la rage dans lEst de la France, et depuis peu sa
disparition.
Un autre lment que le vaccin a sans doute jou: au fur et mesure de la progression de len-
dmie, le virus rabique sest si bien adapt au renard quil a rduit le temps dincubation de
la rage, tuant son hte avant que ce dernier ne puisse le transmettre. Le virus sest finalement
montr plus efficace que nos valeureux chasseurs: lagressivit du virus sest retourn con-
tre lui.
Lefficacit des mesures disponibles a t prouve par le fait quen France, mme sous len-
dmie de rage du renard, on na observ aucun cas de rage humaine autochtone. En 1995, on
avait observ en France 40cas de rage animale (3000au maximum de lpidmie) et lon
avait procd prs de 6.000 traitements antirabiques chez lhomme. Zro cas de rage ani-
male autochtone dsormais en France.
Mais il ne faut pas oublier la menace que constitue toujours pour lhomme la rage du renard
hors de France, et surtout la rage canine dans le Tiers Monde.
3. En effet dans le Tiers Monde, la situation est trs proccupante: environ 1.000morts par an
en Thalande qui a la population de la France. Au total dans le monde, ce sont par an 55000
morts dclares (plus en ralit, et 60% chez les enfants), dont 35.000 en Inde; 2.000.000
sujets par an ne reoivent pas le traitement antirabique souhaitable (illustration du foss Nord-
Sud). Ainsi, on envisage dinclure la vaccination antirabique parmi les vaccinations obli-
gatoires et de vacciner les chiens errants linstar des renards en Europe.
Il vous est recommand de vous vacciner contre la rage si vous devez sjourner de faon
prolonge ou aller laventure dans le Tiers Monde : vous pouvez vous faire mordre par
un chien enrag, loin de toute ressource mdicale, et en un lieu o les vaccins sont parfois trs
mdiocres en termes defficacit et de tolrance ( Karachi, 40% des cas de rage surviennent
aprs vaccin!)
Si vous avez t vaccin(e), donnez votre sang pour fabriquer des immunoglobulines antira-
biques.
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
246/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
12.1.7 Points importants
Le virus rabique est un virus ARN envelopp, trs fragile, pour lequel on na actuellement
aucune chimiothrapie, malgr lexistence dune cible thorique, lARN rplicase.
La rage est une zoonose accidentellement transmise de lanimal lhomme, par la salive in-
fecte, loccasion dune morsure, griffure, lchage sur peau lse.
Lanimal enrag (le chien le plus souvent) est la fois rservoir et vecteur.
Il peut exister chez le chien une excrtion salivaire prclinique
La rage donne dans 100% des cas une encphalite, qui mme actuellement est mortelle quoi-
quon fasse
Lorgane cible du virus est le cerveau et en particulier le systme limbique.
Lhydrophobie est un signe vocateur mais non constant.
Il existe des formes paralytiques de rage chez lhomme
Lincubation de la rage varie, selon le sige et limportance de la morsure, de 6 jours un an
ou plus (jusqu 5ans).
Pour prvenir la rage incubation courte, la vaccination ne suffit pas: il faut y adjoindre
une srothrapie antirabique.
Le traitement de la morsure est une urgence pour laquelle on trouve de laide en tlphonant
au centre antirabique du dpartement ou au centre de rfrence national (Institut Pasteur de
Paris)
1
. Mais la dsinfection de la plaie est un geste faire immdiatement.
Limportance de la rage dans le Tiers Monde justifie dinclure la vaccination antirabique dans
les vaccinations obligatoires des enfants et de vacciner prventivement les touristes aven-
tureux.
La rage du renard a disparu de France grce la diffusion de vaccin vivant dans des cro-
quettes, technique qui pourrait sappliquer la rage canine prvalant toujours dans le Tiers
Monde.
En France, on peut actuellement contracter la rage suite une morsure par chauve-souris
enrage (souche virale europenne), par les nouveaux animaux de compagnie illgalement
imports, ou loccasion dun voyage en zone dendmie.
12.2 Arbovirus
12.2.1 Dfinition
Il en existe plusieurs centaines dont une cinquantaine intressent lhomme. Le modle de ces vi-
rus est le virus de la fivre jaune ou virus amaril.
Le terme arbovirus signifie arthropod-borne virus = qui est port par les arthropodes.
De fait, les arbovirus se multiplient la fois chez les vertbrs (ventuellement lhomme) et chez
des arthropodes. Il sagit dinsectes piqueurs, moustiques ou anophles ou bien tiques. Linsecte
1. www.pasteur.fr, cliquez sur sant, puis centre antirabique, puis votre destination.
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 247/307
sinfecte en aspirant le sang de ces vertbrs. Le virus se multiplie dans le tube digestif de linsecte
puis diffuse et gagne les glandes salivaires. ce niveau la multiplication virale donne des concen-
trations de virus trs leves. Ainsi, linsecte, qui ne souffre aucunement de cette infection, trans-
mettra le virus par sa salive au prochain vertbr quil va piquer. Linsecte est un vecteur, vecteur
actif dans lequel se multiplie le virus, et non une seringue volante
Quant aux vertbrs, ils constituent le rservoir du virus et ce sont presque toujours des animaux
sauvages. Dans la plupart des cas, linfection de lhomme piqu par le vecteur nest quun phno-
mne accidentel, en impasse, lhomme ne perptuant pas, habituellement, linfection.
La plupart des arboviroses sont des maladies animales, des zoonoses.
Les arboviroses exigent donc la coexistence du rservoir et du vecteur, do une distribution
gographique trs prcise, la plupart des arboviroses tant des maladies tropicales. Cependant, il
en existe jusque dans le Grand Nord et, en France mtropolitaine, on isole des arbovirus en Lan-
guedoc et en Camargue dune part, en Alsace dautre part. Par ailleurs les variations climatiques
ou les mouvements de populations animales ou humaines modifient lpidmiologie des
arboviroses; le rchauffement de la plante est bon pour les arbovirus !
La dfinition des arbovirus est donc cologique et ne repose pas sur la structure des virus. Pour-
tant la plupart des arbovirus intressant lhomme sont rpartis dans trois familles - Togaviridae,
Flaviridae et Bunyaviridae - et ont des caractres structuraux communs: virus ARN et pplos
driv de la membrane cytoplasmique et portant des spicules de glycoprotines. Ces virus se mul-
tiplient au laboratoire chez le souriceau nouveau-n inocul par voie intra-crbrale. Cest ainsi
quon les isolait classiquement en partant de prlvement de sang des malades ou des animaux, ou
en partant dinsectes broys.
Ils se multiplient galement en culture de cellules varies, ce qui facilite leur tude au laboratoire
une fois quon les a isols.
Il y a des parents antigniques entre certains virus. A lintrieur dune mme famille ou dun
mme groupe ( lintrieur des Togaviridae, par exemple), il y a un certain degr de protection
croise et des ractions croises en srodiagnostic.
Il faut retenir que les Arbovirus sont des virus pplos, la transmission par piqre reprsentant
probablement pour ces virus le moyen de remdier leur fragilit dans le milieu extrieur.
Actuellement, il nexiste pas dantiviral valid ; on dispose heureusement de vaccins efficaces
vis--vis de certains dentre eux.
12.2.2 Parcours habituel du virus dans lorganisme
1. leur phase initiale, toutes les arboviroses humaines se ressemblent : le virus est inject dans
le sang par linsecte piqueur, puis capt dans les monocytes-macrophages (systme rticulo-
endothlial) o il se multiplie. Il se multiplie ainsi dans la rate et les ganglions lymphatiques,
ce qui donne une virmie. Cest la phase systmique de la maladie.
Trs souvent, linfection en reste l et la plupart des arboviroses humaines sont asymptoma-
tiques ou se rsument un simple syndrome fbrile avec des douleurs diffuses. On parle de
syndrome grippal bnin. Cest vrai mme pour le virus de la fivre jaune.
2. Dans une deuxime phase, ventuellement, linfection gagne divers organes cibles et donne,
selon les virus, une encphalite, une hpatonphrite, une fivre hmorragique.
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12.2.3 Fivre jaune (virus amaril)
12.2.3.1 Historique
LHISTOIRE de la fivre jaune est trs instructive. Cest une hpatonphrite connue depuis le 17
e
sicle pour donner des grandes pidmies urbaines de part et dautre de lAtlantique, principale-
ment en Afrique et en Amrique. Mais de temps en temps, elle tait introduite dans les ports dEu-
rope Occidentale, en France. Cest la fivre jaune qui a dcim les Franais qui sous la direction
de Ferdinand De Lesseps tentaient de creuser le canal de Panama. Cest en 1901 que le virus amaril
a t reconnu par Walter Reed, mdecin militaire amricain. La fivre jaune ravageait les troupes
amricaines qui combattaient Cuba contre les Espagnols. Walter Reed a tir profit de lobserva-
tion dun mdecin cubain, Carlos Finlay, qui avait reconnu que la fivre jaune svissait l o il y
avait le plus de moustiques.
Walter Reed a pris des volontaires (Amricains, Cubains, ou Espagnols?) et a dmontr quon
pouvait transmettre la maladie par inoculation du sang de malades. Il a dmontr le caractre fil-
trant de lagent ( lpoque, ctait le seul critre dfinissant un virus) et le rle des moustiques
comme vecteur.
Ds lors, des campagnes dradication des moustiques ont t lances, et ont abouti une dispari-
tion rapide de la fivre jaune de Cuba et des grands centres dpidmies.
Mais en 1928, Rio de J aneiro, clatait malgr tout une pidmie qui prouvait que lpidmiologie
de la fivre jaune ntait pas aussi simple que le pensait Walter Reed.
12.2.3.2 Les cycles
On dcouvrit quil existait en fait DEUX CYCLES DE LA FIVRE JAUNE.
Ainsi, la fivre jaune est, pour lessentiel, une maladie de singes de la fort tropicale, et lon na
aucun moyen de contrler ce cycle.
Il existe des passerelles entre ces deux cycles. Les hommes allant en fort peuvent tre piqus par
des moustiques de singes (notamment les bcherons qui abattant des arbres amnent au niveau du
sol les moustiques qui vivent avec les singes au sommet des arbres). Inversement, les singes pous-
ss par la faim sapprochent parfois des villages et des vergers et se font piquer par Aedes aegypti .
Dans les deux cas, samorce un cycle humain.
Fivre jaune urbaine
et
Fivre jaune forestire
Homme Singes
moustiques de singe
moustiques domestiques
(Aedes gypti)
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12.2.3.3 Clinique
La fivre jaune est la forme la plus complte de linfection virus amaril, la majorit des infections
tant inapparentes ou rduites un syndrome fbrile douloureux. Ces formes inapparentes sont la
rgle chez les autochtones, partiellement protgs par des infections dautres arbovirus apparen-
ts au virus amaril mais non pathognes.
La fivre jaune volue en deux phases:
Aprs une incubation de 3 6jours, la phase rouge est faite de fivre, douleurs, nauses, et dun
aspect congestif du visage avec douleurs diffuses, rachialgies. La fivre disparat souvent transitoi-
rement avant la deuxime phase qui est marque par une hpatonphrite: phase jaune.
Dans les formes graves apparaissent des hmorragies, notamment digestives, avec vomissements
de sang noir (vomito negro).
La mortalit de la fivre jaune varie de 5% 50%. La marque histologique est une ncrose hpa-
tique mdiolobulaire sans raction inflammatoire.
12.2.3.4 Diagnostic
Le virus amaril est un Flaviviridae (flavus =jaune) que lon isole partir du sang prlev en phase
aigu, rapidement transport et inocul par voie intracrbrale au souriceau nouveau-n. On peut
aussi inoculer des Toxorhynchites, moustiques de grande taille, non piqueurs, o lon recherche la
multiplication virale par immuno-cytodiagnostic sur un talement du cerveau obtenu par crase-
ment de la tte du moustique entre deux lames.
Le titrage des anticorps partir de 2srums (prcoce et tardif) se fait en IHA ou en ELISA. La re-
cherche dIgM spcifiques dans le srum donne plus prcocement le diagnostic.
12.2.3.5 Traitement prventif
Il repose sur deux mesures.
1. La VACCINATION avec le vaccin 17 D, vivant, attnu, prpar par passages sur embryon
de poulet est trs efficace. Une seule injection donne une immunit trs solide, durant au
moins 10ans et probablement bien davantage. Bien que vivant, il nest pas contre-indiqu
chez la femme enceinte qui en aurait besoin, compte tenu de la gravit de la fivre jaune.
Toute personne se rendant en zone dendmie doit avoir t vaccine (voir annexe page261).
2. La DESTRUCTION DES MOUSTIQUES ET DE LEURS REPAIRES ET LA PRO-
TECTION PAR HABITS COUVRANTS, REPULSIFS ET MOUSTIQUAIRE.
On contrle ainsi la fivre jaune urbaine, mais la fivre jaune des singes persiste en Amrique
et en Afrique intertropicales o, incontrlable, elle est une menace permanente pour lhomme.
3. Le relchement des campagnes de vaccination de la population des pays dendmie, en
raison de la pauvret et des guerres, fait quil y a chaque anne actuellement 200 000 cas
de fivre jaune, en Afrique essentiellement, le Bnin tant particulirement touch.
La fivre jaune nexiste pas en Asie, mais il y a tout ce quil faut pour quelle apparaisse:
des singes et des moustiques sensibles aux virus. Les autorits sanitaires des pays asiatiques
sont donc trs vigilantes en matire de vaccination de voyageurs venant de zone dendmie.
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12.2.4 Encphalites arbovirus
Trois encphalites arbovirus intressent la France mtroploitaine.
1. EN CAMARGUE, on trouve en abondance des moustiques, des chevaux et des oiseaux mi-
grateurs. Par intermittence les chevaux et les hommes sont victimes dencphalites due au vi-
rus West Nile (Nil occidental) virus en fait trs rpandu en Afrique et en Asie. Il a pour
rservoir des oiseaux sauvages migrateurs et pour vecteur les moustiques ornithophiles
de ces oiseaux qui, occasionnellement, piquent lhomme ou le cheval. Tous deux reprsentant
une impasse:
Surtout, suite aux perturbations climatiques lies El Nio et la prolifration conscutive
du vecteur (culex), le virus West Nile est en voie dexpansion, avec une nouvelle souche trs
virulente originaire dIsral : en 1999 New York, elle a initi une pidmie marque par
une mortalit jamais observe des oiseaux rservoirs et par des cas humains mortels, point de
dpart dune mergence attendue dans toute lAmrique. Mmes craintes pour lEurope
mridionale avec une pidmie en Roumanie.
2. EN ALSACE, on touche au domaine dune autre encphalite: lencphalite tique dEu-
rope centrale. Le virus a pour rservoir des rongeurs sauvages et pour vecteur les tiques qui
parasitent ces rongeurs et qui occasionnellement piquent lhomme loccasion de promena-
des en prairies. Il existe un vaccin inactiv, recommand avant randonne en zone dendmie,
Autriche notamment.
3. LE POURTOUR DE LA MDITERRANE subit depuis peu lmergence dencphali-
tes et mningites Toscanavirus, transmis par des phlbotomes.
4. Ces encphalites mtropolitaines sont des rarets compares aux encphalites quines ar-
bovirus qui svissent en Amrique du Nord et du Sud (encphalite de Saint-Louis,
encphalite quine de lEst, encphalite quine de lOuest, encphalite quine du Venezuela).
Ces encphalites amricaines arbovirus surviennent par pidmies dont certaines ont un taux
oiseaux
sauvages
moustiques
cheval
homme
rongeurs
sauvages
tiques
homme
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2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 251/307
de mortalit ou un taux de squelles psychomotrices impressionnant.
5. Lencphalite japonaise est largement rpandue dans les zones rurales de tout lExtrme
Orient, le rservoir tant les porcs et les oiseaux aquatiques. Le vaccin, inactiv, est faire
avant tout sjour en zone de rizires.
6. Dans tous les cas, les encphalites arbovirus sont - comme lencphalite rabique,
lencphalite aigu ncrosante HSV-1, la PESS virus de la rougeole, la LEMP virus J C -
dues la multiplication du virus dans le cerveau, contrairement ce quon a vu pour les
encphalites post-rougeoleuses ou post-ruboliques qui sont des encphalites post-ruptives
avec dmylinisation priveineuse, de nature probablement allergique.
12.2.5 La dengue
Troisime type clinique darbovirose: la DENGUE, modle des fivres hmorragiques arbo-
virus. Cest larbovirose de trs loin la plus frquente actuellement de par le monde o elle est
trs largement rpandue: on estime que 2,5 milliards de personnes ont t infectes, parmi la po-
pulation mondiale actuelle.
On en observe des cas la Runion, dans le Sud Est Asiatique, en Amrique Centrale et du Sud,
dans le Pacifique, dans les Antilles. Du fait de El Nio, Aedes aegypti remonte dans le Nord et la
dengue menace le Sud de lEurope.
Dans la plupart des cas, ce nest quun syndrome fbrile douloureux de quelques jours, avec algies:
dengue viendrait de dandy en espagnol, en raison de la dmarche et des gestes manirs imposs
par les douleurs. Dans la forme complte, il y a deux vagues successives de fivre avec adnopa-
thies, exanthme maculo-papuleux et lympho-thrombopnie. La principale complication de la den-
gue est la survenue dun syndrome hmorragique ou dun syndrome de choc, surtout observs
chez les enfants, entranant la mort dans 5 10% des cas; on en observe 10millions de cas par an
dans le monde.
Il existe 4 types de virus de la Dengue, sans rservoir animal connu (exception la rgle).
Lhomme est seul rservoir ; le vecteur est Aedes gypti. Cest une arbovirose essentiellement
urbaine.
On sest demand si les formes graves, hmorragiques ou avec choc, ne seraient pas dues une
rinfection par un type de virus diffrent du type de la primo-infection; on invoque un mcanisme
de sensibilisation, lintervention danticorps facilitant linfection, plutt que neutralisants,
lorigine de ces formes graves. Tout cela est hypothtique. Cette pathognie obscure et complexe
(souvent, pathognie rime avec patauger) doit rendre prudent dans la recherche dun vaccin :
on peut craindre quil soit plus nocif quutile !
homme
aedes gypti
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12.2.6 Points importants
La dfinition des arbovirus est cologique mais la plupart des arbovirus appartiennent aux To-
gaviridae, Flaviridae et Bunyaviridae, qui sont des virus ARN avec enveloppe, donc fragi-
les.
Il ny a pas actuellement de chimiothrapie valide pour les arboviroses.
Notion de rservoir, de vecteur arthropode actif, distribution gographique particulire et
sensible aux perturbations climatiques, cologiques.
Linventaire des arbovirus nest pas termin.
La fivre jaune est une maladie des singes de la fort intertropicale, en Amrique et en Afri-
que.
Le vaccin contre la fivre jaune est trs efficace.
Le relchement de la vaccination humaine entrane invitablement une reprise des pidmies
de fivre jaune chez lhomme.
La dengue est larbovirose humaine la plus rpandue. Elle na pas dautre rservoir que
lhomme.
Elle comporte des formes graves avec choc hmorragique de mcanisme mal lucid.
Les encphalites arbovirus sont dues, comme pour la rage, une multiplication du virus dans
le cerveau.
12.3 Infections forte mortalit par filovirus,
arnavirus, et hantavirus et autres virus
mergents
Classiquement tudies avec les arbovirus, ce ne sont pas en fait des arboviroses car leur transmis-
sion se passe darthropode vecteur. Mais, pour les arnavirus et le virus Hantaan du moins, un r-
servoir animal - rongeur sauvage- a t identifi.
12.3.1 Les filovirus : le virus Marburg et le virus Ebola
A lorigine de fivres hmorragiques mortalit leve et cas secondaires dans lentourage hos-
pitalier ou familial, ce sont des virus africains mais exportables:
1. Le VIRUS MARBURG tire son nom de la ville de Marbourg en Allemagne, car cest l
quest survenue une pidmie de fivre hmorragique mortelle dans un laboratoire o lon
prparait des cultures de cellules primaires partir de reins de singes verts venant dOuganda.
Ce virus a une morphologie tout fait extraordinaire : long filament atteignant le micron,
avec des boucles et des ramifications. Il sagit en fait de virus ARN et enveloppe drive
de la membrane cytoplasmique.
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Des cas sporadiques dinfection humaine ont t nots par la suite.
2. Un virus voisin mais antigniquement distinct, le VIRUS EBOLA, a donn deux pidmies
hospitalires avec des cas secondaires et une mortalit leve (87%) au Zare et Soudan. Par
la suite le virus Ebola a t isol aux USA partir de singes rhsus en provenance des Philip-
pines, puis nouveau, rcemment lors dpidmies au Zare et au Gabon.
Il ne semble pas que les singes soient le rservoir des filovirus, ce serait des htes accidentels
comme lhomme ; les donnes les plus rcentes incriminent les chauves-souris frugivores
comme rservoirs de ces virus. Le traitement de ces infections filovirus est symptomatique
avec de plus administration de srum de convalescent, en sachant quil ny a pas de protection
croise entre virus Marburg et Ebola.
3. Dans la mesure o il sagit dun virus enveloppe, fragile, la mise en place rapide de mesures
dhygine lmentaires a toujours permis le contrle des pidmies, qui se propagent essen-
tiellement par les fluides biologiques des patients.
Ces filovirus (et les mchants virus des fivres hmorragiques en gnral) ont comme parti-
cularit de ne pas avoir co-volu avec les mammifres suprieurs et lhomme, de se multi-
plier intensment dans les macrophages et les cellules dendritiques, de saboter les dfenses
innes, antagonisant linterfron, de se multiplier dans les cellules endothliales.
12.3.2 Les arnavirus
Ce sont des virus ARN qui englobent sous leur enveloppe des granules denses dorigine cellulaire
(ribosomes). Leur rle exact nest pas connu mais ils donnent leur nom ces virus (arena =sable
en latin). Ils infectent des rongeurs, dont les urines trs riches en virus sont source de contamination
pour lhomme.
1. Le plus rpandu est le virus de la choriomningite lymphocytaire (CML). Il est trouv chez
les souris sauvages ou dlevage, ainsi que chez les hamsters. Sa transmission lhomme en-
trane un syndrome fbrile gnralement bnin, mais parfois une mningite ou mnin-
goencphalite (do son nom), une pneumonie et exceptionnellement un syndrome
hmorragique mortel.
2. Le VIRUS LASSA. La fivre de Lassa (Nigeria) est en Afrique de lOuest lorigine de fi-
vres hmorragiques graves avec cas secondaires (chez les soignants ou chez les autres mala-
des). Son rservoir est un petit rongeur appel mastomys natalensis, dont laire dhabitat
stend aux 2/3 de lAfrique (le Natal est une province dAfrique du Sud).
Le traitement associe mesures symptomatiques, administration de srum de convalescent et
ribavirine.
3. Dans deux rgions dAmrique du Sud, la priode des rcoltes est marque dans la population
rurale par la survenue de la fivre hmorragique dArgentine (virus Junin) et de la fivre h-
morragique de Bolivie (virus Machupo). L encore, un petit rongeur sauvage infect de faon
chronique, le calomys, est le rservoir de virus, ses djections transmettant linfection
lhomme. La ribavirine sest montre active sur ces arnavirus.
Virus de la rage, arbovirus, autres virus dits mergents
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12.3.3 Le virus Hantaan
A ARN, nuclocapside tubulaire et enveloppe, il est class parmi les Bunyavirus, sans tre
pour autant un arbovirus: il a pour rservoir des souris sauvages et se transmet lhomme sans
intervention darthropode vecteur.
Les maladies humaines correspondantes sont la fivre hmorragique de Core, la nephropathia
epidemica en Scandinavie et dans les Balkans, le syndrome pulmonaire Hantavirus des USA.
Une atteinte rnale accompagne les autres manifestations cliniques. ct des formes graves, des
formes bnignes sont observes, notamment dans lEst de la France dans les Ardennes.
Lors de lpidmie de syndrome pulmonaire aux USA, le diagnostic a t rapidement confirm par
PCR et la ribavirine a pu tre administre avec, semble-t-il, un effet partiel sur la mortalit (65%
50%).
12.3.4 Conditions de manipulation
Pour lisolement de ces virus, il faut passer ds que possible les prlvements dans un laboratoire
de haute scurit (P4), tel quil en existe Lyon, au laboratoire Mrieux. Cependant, la manipu-
lation de prlvements biologiques sans amplification du virus (sans inoculation de culture de cel-
lules), par exemple pour diagnostic diffrentiel de paludisme, de salmonellose, pour bilan
biochimique ou hmatologique, peut se faire dans des conditions de confinement moins svres :
une hotte daspiration de type BK ou une hotte flux laminaire suffisent, condition de travailler
dans une pice accs contrl et selon les bonnes pratiques habituelles de manipulation. On r-
duira tout de mme les examens biologiques ce qui est vraiment indispensable. Les malades sont
soigner en chambre spciale pourvue si possible dun systme de dpression, lessentiel restant
toutefois lapplication rigoureuse des mesures dhygine habituelles vis--vis des fluides biolo-
giques des patients infects.
12.4 En guise de conclusion au cours de
virologie mdicale
Ce dernier chapitre confirme que les capacits de nuisance des virus sont largement imprvisibles,
les virus dits mergents les plus frappants ayant dailleurs t vus dj lors de chapitres pr-
cdents. Ainsi les HIV-1 et 2 venus de singes (qui ont bien dautres rtrovirus en rserve), le pro-
chain sous-type de grippe A (en attente), le nouveau variant de la maladie de Creutzfedt-J akob, le
SRAS-CoV (qui prouve quaucune famille virale, celle des Coronaviridae, en loccurrence, nest
ngligeable).
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A cet gard, la famille des Paramyxoviridae, ct de membres historiques tels que virus de la
rougeole et virus des oreillons (dsormais sous contrle, dans nos pays), vient de se signaler par la
mise en circulation du virus Nipah: venu de chauves-souris frugivores rpandues dans le Sud Est
asiatique, il a, en Malaisie, t transmis au porc et a tu environ 100leveurs de porc, par encpha-
lite ou pneumopathie.
On constate aussi, ct dmergences, des extensions de virus connus : le virus de la dengue
partout dans le monde, le virus West Nile et le Monkey pox dcouvrant lAmrique du Nord, le
virus de la fivre de la valle du Rift traversant la Mer Rouge, et rcemment le chikungunya.
On assiste des reprises dinfections virales : le retour de la fivre jaune et de la fivre Ebola
en Afrique rappelle que guerres et pidmies ont toujours fait bon mnage. Mme motif la rap-
parition en Afrique de paralysies poliomylitiques en zones libres de polio aprs le lancement de
la campagne de vaccination gnralise (10pays concerns en 2004).
La virologie mdicale - et dune faon gnrale, la co-volution entre les virus et leurs htes, ani-
maux et homme- nest pas un long fleuve tranquille.
Ces perturbations ont, la base, une origine virale, la plasticit remarquable des gnomes viraux
(des virus ARN, notamment) et, partant, le caractre non absolu de bien des barrires
despce entre homme et animaux. J ouent aussi des changements affectant les vecteurs : lex-
pansion rcente dAedes albopictus - plus dynamique que le classique Aedes aegypti - explique
lexpansion du virus West Nile en Amrique du nord, et du Chikungunya la Runion. Ce mous-
tique davenir sest implant dans le sud-est de la mtropole.
A cela sajoutent toute une srie de facteurs lis notre mode de vie dans le monde moderne. Ce
sont ainsi la croissance de la population et lurbanisation; le dveloppement des transports inter-
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nationaux, des changes commerciaux; les modifications dans les modes dlevage des animaux
et de prparation des aliments; les modifications des comportements humains; les changements
du climat, de lcologie; les progrs de la mdecine (geste invasifs, traitements immunodpres-
seurs, greffes) ; les troubles politiques avec la dgradation, voire lanantissement des structures
sanitaires.
Sans parler de la tentation du bioterrorisme individuel (cf la dispersion du virus du bacille du char-
bon par un microbiologiste dvoy) ou collectif (conflit nuclaire privant des populations entires
de toute dfense immunitaire).
Vis--vis de ce risque viral, que faire ? Une fois admis quon ne peut attendre des virus eux-m-
mes un comportement raisonnable, il nous faudrait, daprs ce qui prcde, vivre dans des pays en
paix civile depuis quelques dcennies, pays pourvus de dirigeants honntes uvrant sur le long ter-
me, avec des conseillers capables dune vision globale des problmes de sant, une population du-
que et raisonnablement confiante, o les illumins ne trouvent ni complice ni souche de variole
mettre sous enveloppe, enfin des pays o chacun admettrait lintrt de participer substantiellement
lamlioration des conditions de sant dans les secteurs dshrits de la plante. Rien qui sob-
tienne par un claquement de doigt.
Cependant, les signes encourageants ne manquent pas: on a vu notamment lradication en mar-
che du virus de lhpatite B par ce qui savre le 1
er
vaccin contre le cancer ; la mise au point dun
autre vaccin - anti-papillomavirus- contre le 2
e
cancer de la femme; la disparition de la rage du
renard en Europe par un vaccin aussi astucieux que lanimal en question; la rgression de linci-
dence de linfection HIV dans des pays du Tiers Monde, comme la Thalande, lOuganda, le S-
ngal, cela par la volont politique des dirigeants et le dynamisme des associations de malades, de
femmes tout particulirement.
Et puis, un magnifique encouragement ne nous vient-il pas de Sophocle qui, sans exclure la fatalit,
faisait dire en pleine guerre du Ploponnse - marque par la peste dAthnes, 430av. J C -, par le
coryphe dune de ses plus belles tragdies, Antigone: Il est bien des merveilles en ce monde;
il nen est pas de plus grande que lhomme ?
Trivialement, pensez remplir la fiche dvaluation situe en fin de polycopi, pour la remettre
entre les mains de vos enseignants de TP-ED, lors de lexamen quils vous feront passer
Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 257/307
Annexe A
Calendrier des vaccinations
2005 - Tableau synoptique
Conseil Suprieur dHygine Publique en France - http://www.sante.gouv.fr
BEH N 29-30/2005
Le calendrier 2006 ne comporte que quelques modifications; dit dans le BEH N 29-30/2006, il
est consultable sur le mme site http://www.sante.gouv.fr.
Lorsquun retard est intervenu dans la ralisation du calendrier de vaccinations indiqu, il nest pas ncessaire
de recommencer tout le programme des vaccinations imposant des injections rptes. Il suffit de reprendre ce
programme au stade o il a t interrompu et de complter la vaccination en ralisant le nombre dinjections
requis en fonction de lge.
LGENDE DU TABLEAU
Les vaccins indiqus sur fond gris existent sous forme combine :
Diphtrie, ttanos, coqueluche corps bactriens entiers, polio;
Diphtrie (titrage adulte), ttanos, polio;
Diphtrie, ttanos, polio, plus coquelucheux acellulaire;
Diphtrie (titrage adulte), ttanos, polio, plus coquelucheux acellulaire;
Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
258/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Diphtrie, ttanos, polio, plus coquelucheux acellulaire, plus Hib;
Diphtrie, ttanos, polio, plus coquelucheux acellulaire, plus Hib, plus Hpatite B.
Les vaccins indiqus en italique ne sont proposs que pour des risques spcifiques
1. Le vaccin poliomylitique inactiv est le seul utilis pour les primo-vaccinations et les rap-
pels.
2. La vaccination BCG prcoce est rserve aux enfants vivant dans un milieu risque. La vac-
cination BCG est obligatoire lentre en collectivit, incluant la garde par une assistante ma-
ternelle. Il nest pas ncessaire de contrler les ractions tuberculiniques aprs vaccination.
3. A la naissance pour les enfants ns de mre Ag HBs positif : vaccination dans les 24 heures
qui suivent la naissance et immunoglobulines anti-HBs administres simultanment en des
points diffrents. Deuxime et troisime dose respectivement 1 et 6 mois. Contrle srolo-
gique entre 7 et 12 mois.
4. La vaccination peut tre pratique indiffremment avec le vaccin coquelucheux germes en-
tiers (Ce) ou le vaccin acellulaire (Ca).
5. La vaccination contre lhpatite B est recommande pour tous les enfants avant 13 ans, en pri-
vilgiant la vaccination du nourrisson.
6. La vaccination par le vaccin pneumococcique heptavalent conjugu (Pn7) est fortement re-
commande partir de 2 mois pour les enfants prsentant une pathologie les exposant un
risque lev dinfection invasive pneumocoque. La vaccination par le vaccin anti-pneumo-
coccique heptavalent conjugu est galement recommande pour les enfants gs de moins
de 2 ans exposs un ou des facteurs de risque li(s) au mode de vie identifis dans la
littrature : enfant gard plus de quatre heures par semaine en compagnie de plus de deux
enfants en dehors de la fratrie, enfant ayant reu moins de deux mois dallaitement maternel,
enfant appartenant une fratrie dau moins trois enfants (dge pr-scolaire).
7. Vaccin combin contre la rougeole, les oreillons et la rubole. Pour les nourrissons entrant en
collectivit avant 12 mois, il est recommand dadministrer ds lge de 9 mois le vaccin con-
tre la rougeole-oreillons-rubole. Dans ce cas, la deuxime dose est recommande entre 12 et
15 mois et suffit. Si le vaccin monovalent rougeoleux a t utilis 9 mois, lenfant devra re-
cevoir deux injections de vaccin trivalent au moins un mois dintervalle partir de 12 mois.
8. La vaccination complte comprend deux doses, premire dose 12 mois, deuxime dose au
moins un mois aprs la premire, si possible avant lge de 24 mois.
9. Pour les enfants partir de 6 mois, les adolescents et les adultes, sils sont atteints de patho-
logies spcifiques (voir dtails en 4.3 du calendrier complet) ou dont ltat de sant ncessite
un traitement prolong par lacide actylsalicylique (essentiellement pour syndrome de
Kawasaki compliqu et arthrite chronique juvnile).
10. La vaccination peut tre pratique indiffremment avec le vaccin coquelucheux germes en-
tiers (Ce) ou le vaccin acellulaire (Ca).
11. En cas de pnurie de DT Polio, le vaccin contenant une dose rduite danatoxine diphtrique
(dTPolio) peut tre utilis partir de lge de 6 ans.
12. A cet ge, le vaccin coquelucheux acellulaire doit tre utilis.
13. Si la vaccination contre lhpatite B na pas t pratique dans lenfance: un schma complet
en trois injections, les deux premires un mois dintervalle, la troisime 5 12 mois aprs
la date de la deuxime injection.
14. Deux doses de vaccin triple associ rougeole, oreillons, rubole au moins un mois dinter-
Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 259/307
valle sont recommandes pour tous les enfants nen ayant pas bnfici, quels que soient leur
antcdents vis--vis des trois maladies.
15. Une dose de vaccin trivalent pour les personnes de 13 25 ans nayant pas t vaccines con-
tre la rougeole auparavant.
16. A renouveler tous les 10 ans.
17. A partir de 18 ans, on effectue le vaccin diphtrique contenant une dose rduite danatoxine
diphtrique (dTPolio).
18. Pour certains professionnels de sant et les adultes susceptibles de devenir parents dans les
mois ou les annes venir, et nayant pas reu de vaccination coquelucheuse au cours des dix
dernires annes, un rappel de vaccination coquelucheuse acellulaire est recommand.
19. Chez lenfant de plus de 2 ans et ladulte, la vaccination anti-pneumococcique avec le vaccin
polyosidique 23 valent (Pn 23) est recommande, tous les 5 ans, pour les sujets splnectomi-
ss, les drpanocytaires homozygotes, les patients atteints de syndrome nphrotique, les in-
suffisants respiratoires, les patients alcooliques avec hpatopathie chronique, les insuffisants
cardiaques et les sujets ayant des antcdents dinfection pulmonaire ou invasive
pneumocoque.
20. La vaccination contre la rubole est recommande pour les jeunes femmes en ge de procrer
non vaccines, par exemple lors dune visite de contraception ou prnuptiale. Si la srologie
prnatale est ngative ou inconnue, la vaccination devra tre pratique immdiatement aprs
laccouchement, de prfrence avant la sortie de la maternit ou dfaut au plus tt aprs la
sortie.
21. Tous les ans.
Calendrier des vaccinations 2005 - Tableau synoptique
260/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Calendrier vaccinal 2005
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 261/307
Annexe B
Calendrier vaccinal 2005
Conseil Suprieur dHygine Publique en France - http://www.sante.gouv.fr
BEH N 29-30/2005
[Extraits concernant la Virologie]
Le calendrier vaccinal 2005 introduit de nouvelles recommandations qui concernent la vaccination
contre la rougeole, les oreillons, la rubole, la diphtrie et la rage.
Le calendrier 2006 ne comporte que quelques modifications; dit dans le BEH N 29-30/2006, il
est consultable sur le mme site http://www.sante.gouv.fr.
B.1 Nouvelles recommandations
1.1 VACCINATION CONTRE LA ROUGEOLE, LES OREILLONS ET LA RUBOLE
Dans le cadre du programme dlimination de la rougeole et de la rubole congnitale de lOMS,
la France a propos les mesures suivantes qui ont t approuves par le CSHPF du 18 mars 2005.
La premire dose de vaccin trivalent est recommande 12 mois (et non plus partir de 12 mois)
et la deuxime dose au cours de la deuxime anne, soit entre 13 et 24 mois (respecter un intervalle
dau moins un mois entre deux injections).
Deux doses de vaccin trivalent sont recommandes pour les enfants de plus de 24 mois, ns en 1992
ou aprs (de 24 mois 13 ans en 2005) et nen ayant pas dj bnfici.
Une dose de vaccin trivalent est recommande pour les personnes nes entre 1980 et 1991 et
nayant jamais t vaccines contre la rougeole auparavant. Il sagit des personnes ges de 14
25 ans en 2004.
Les deux mesures ci-dessus, concernant les sujets gs de plus de 24 mois et ns aprs 1979, nin-
duisent pas dlargissement des cibles vaccinales. En effet, elles consistent essentiellement, pour
les sujets qui nont pas respect dans le pass le calendrier prconis de vaccination contre la rou-
geole, les oreillons et la rubole, en un rattrapage de la ou des doses de vaccin qui nont pas t
administres.
Pour les nourrissons entrant en collectivit avant 12 mois : il est recommand dadministrer
lge de 9 mois le vaccin contre la rougeole-rubole-oreillons. Dans ce cas, la deuxime dose est
recommande entre 12 et 15 mois et suffit. Si le vaccin monovalent contre la rougeole est utilis,
le sujet devra alors recevoir deux autres injections de vaccin trivalent.
Des recommandations de vaccinations spcifiques ont t mises pour la vaccination autour dun
cas ou de cas groups incluant les 6-9 mois et les plus de 25 ans.
Par ailleurs les personnes de plus de 25 ans non vaccines et sans antcdents de rougeole (ou
Calendrier vaccinal 2005
262/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
dont lhistoire est douteuse) et dont la srologie est ngative, qui exercent les professions de san-
t en formation, lembauche ou en poste en priorit dans les services accueillant des sujets ris-
que de rougeole grave doivent recevoir une dose de vaccin trivalent.
1.2 VACCINATION CONTRE LA DIPHTERIE
1.3 VACCINATION CONTRE LA RAGE
La vaccination contre la rage est recommande pour les personnes rgulirement exposes au virus
de la rage des chauves-souris en France mtropolitaine (voir recommandations particulires).
B.2 Recommandations gnrales
2.1 VACCINATION CONTRE LA COQUELUCHE
2.2 VACCINATION CONTRE LHPATITE B
Dans son avis du 8 mars 2002, le CSHPF a recommand la vaccination systmatique de tous les
enfants avant 13 ans, en privilgiant la vaccination du nourrisson, ainsi que la vaccination des
groupes risque (cf. recommandations particulires). La vaccination est recommande partir de
lge de 2 mois (sauf pour les enfants ns de mre antigne HBs positif chez lesquels elle doit
tre pratique imprativement la naissance, associe ladministration dimmunoglobuli-
nes anti-HBs). Cette recommandation a t confirme par les runions de consensus de 2003 et
2004, et par lavis du 14 et 26 septembre 2004 du CTV et du CSHPF qui a considr quil ny avait
pas lieu de modifier les recommandations concernant la vaccination contre lhpatite B en France.
Un schma vaccinal unique en trois injections, du type 0-1-6, qui respecte un intervalle dau
moins un mois entre la premire et la deuxime injection, et un intervalle compris entre cinq et dou-
ze mois entre la deuxime et la troisime injection, est recommand. Un schma adapt certains
cas particuliers, incluant trois doses rapproches et une quatrime dose 1 an plus tard, peut tre
propos lorsquune immunit doit tre rapidement acquise (tudiants non vaccins des filires m-
dicales et paramdicales, dpart imminent pour un sjour prolong en zone de moyenne ou de forte
endmie).
Au-del des trois injections de ce schma initial, les rappels systmatiques de vaccin contre lh-
patite B ne restent recommands que dans des situations particulires (voir risques profession-
nels et recommandations particulires).
Pour les nourrissons dont les parents prfrent que la vaccination contre lhpatite B soit fai-
te en mme temps que les autres vaccins par une seule injection, les vaccins combins hexava-
lents contre la diphtrie, le ttanos, la coqueluche (vaccin acellulaire), la poliomylite (vaccin
inactiv), les infections Haemophilus influenzae de type b et lhpatite B peuvent tre utiliss. Il
est alors recommand lutilisation du calendrier suivant :
Calendrier vaccinal 2005
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 263/307
2.3 VACCINATION CONTRE LA ROUGEOLE, LES OREILLONS ET LA RUBOLE
Laugmentation de la couverture vaccinale, depuis que le vaccin contre la rougeole a t introduit
dans le calendrier vaccinal franais pour tous les nourrissons (en 1983), a t progressive et sest
accompagne dune forte diminution de lincidence de la rougeole et donc dune diminution de la
probabilit de rencontrer le virus sauvage. Ce fait, ajout aux taux actuels de couverture vacci-
nale voisins de 85%, a conduit la situation daujourdhui, dans laquelle un certain nombre
dadolescents et de jeunes adultes ne sont pas immuniss contre la rougeole, nayant ni rencon-
tr le virus sauvage ni t vaccins entranant un risque de survenue dpidmies de rougeole.
Laugmentation de la couverture vaccinale des enfants avant lge de 2 ans (qui doit atteindre au
moins 95%), ladministration dune seconde dose plus tt et la vaccination des sujets rceptifs
(adolescents et jeunes adultes) dont le nombre sest accru ces dernires annes devraient permettre
terme dinterrompre la transmission des trois maladies.
Tous les enfants gs de 24 mois devraient avoir reu deux doses du vaccin contre la rou-
geole, les oreillons et la rubole.
La premire dose est recommande lge de 12 mois et la seconde entre 13 et 24 mois
(respecter un dlai dau moins 1 mois entre les deux vaccinations). Cette seconde vaccination
ne constitue pas un rappel, limmunit acquise aprs une premire vaccination tant de longue
dure. Elle constitue un rattrapage pour les enfants nayant pas sro-converti, pour un ou plu-
sieurs des antignes, lors de la premire vaccination. La seconde dose peut tre administre
plus tard si elle na pu tre effectue au cours de la deuxime anne.
Les enfants peuvent tre vaccins par un vaccin trivalent ds lge de 9 mois (recommand en
cas dentre en collectivit), dans ce cas, la deuxime dose entre 12 et 15 mois est recomman-
de et suffit. Si le vaccin monovalent contre la rougeole est utilis avant 12 mois, deux doses
de vaccin trivalent seront ensuite ncessaires pour obtenir une immunit efficace contre les
oreillons.
Les enfants de plus de 24 mois, ns en 1992 ou aprs (soit entre 24 mois et 13 ans en 2005)
ge Vaccin Valences
Deux mois Vaccin
hexavalent
Diphtrie, Ttanos, Coqueluche a,
Polio, infections Haemophilus influenzae b,
Hpatite B
Trois mois Vaccin pen-
tavalent a
a
a. a = acellulaire
Diphtrie, Ttanos, Coqueluche a,
Polio, infections Haemophilus influenzae b
Quatre mois Vaccin
hexavalent
Diphtrie, Ttanos, Coqueluche a,
Polio, infections Haemophilus influenzae b,
Hpatite B
Seize dix-
huit mois
Vaccin
hexavalent
Diphtrie, Ttanos, Coqueluche a,
Polio, infections Haemophilus influenzae b,
Hpatite B
Calendrier vaccinal 2005
264/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
devraient avoir reu deux doses de vaccin trivalent.
Les personnes nes entre 1980 et 1991 et nayant jamais t vaccines contre la rougeole
auparavant (il sagit des personnes ges de 14 25 ans en 2005), devraient avoir reu une
dose de vaccin trivalent. Il est ncessaire de sassurer de labsence dune grossesse dbutante
et dviter toute grossesse dans les 2 mois suivant la vaccination, en raison dun risque tra-
togne thorique.
Chez les femmes nes avant 1980 (de plus de 25 ans en 2005) non vaccines, la vaccination con-
tre la rubole est recommande, par exemple lors dune consultation de contraception ou
prnuptiale; la srologie pralable et post-vaccinale nest pas utile. Cependant, si les rsultats
dune srologie confirmant limmunit de la femme vis--vis de la rubole sont disponibles, il nest
pas utile de la vacciner. Il est ncessaire de sassurer de labsence dune grossesse dbutante et
dviter toute grossesse dans les deux mois suivant la vaccination, en raison dun risque tratogne
thorique.
Chez les femmes enceintes, si la srologie prnatale est ngative ou inconnue, la vaccination ne
pouvant tre pratique pendant la grossesse, elle devra tre pratique immdiatement aprs lac-
couchement, de prfrence avant la sortie de la maternit (ce peut tre par les sages-femmes), ou
dfaut au plus tt aprs la sortie.
2.4 VACCINATION CONTRE LA TUBERCULOSE
B.3 Risques professionnels
En milieu professionnel, le risque dexposition est valu par le mdecin du travail.
3.1 VACCINATIONS OBLIGATOIRES POUR LES PROFESSIONNELS DE SANT
3.1.a Personnels viss par larticle L.3111-4. du Code de la sant publique (ancien article
L.10), loi du 18 janvier 1991, arrt du 15 mars 199112, arrt du 23 aot 199113
Diphtrie
rappel tous les 10 ans avec un vaccin contenant une dose rduite danatoxine.
Ttanos-polio
rappel tous les 10 ans.
Hpatite B
trois injections (schma 0-1-6). Si la primovaccination a t pratique avant lge de
25 ans, il ny a pas lieu de faire de rappel. Si la primovaccination a t effectue aprs
lge de 25 ans, et que lon ne dispose pas de rsultats dun dosage mme ancien des anti-
corps anti-HBs montrant une valeur suprieure 10 mUI/ml, le rappel 5 ans doit tre ef-
fectu, suivi dun contrle srologique un deux mois plus tard. Si le taux danticorps anti-
HBs est suprieur au seuil considr comme protecteur (en pratique 10 mUI/ml), aucun
autre rappel nest prvoir. Si le taux danticorps anti-HBs est infrieur au seuil, le mdecin
du travail procdera lvaluation de lopportunit de doses additionnelles, sans excder
un nombre de 6 injections au total (y compris les 3 injections de la premire srie vaccina-
Calendrier vaccinal 2005
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 265/307
le). Cette stratgie de contrle de limmunit chez les personnes vaccines aprs lge
de 25 ans est aussi applicable aux personnes haut risque dexposition (cf. recomman-
dations particulires: 4.5. - i et j).
Typhode
Une injection puis revaccination tous les trois ans pour les personnels de laboratoire dana-
lyse de biologie mdicale
3.1.b Personnels des tablissements de sant et autres viss par le dcret dapplication de lar-
ticle L. 3112-1 du Code de la sant publique
Tuberculose
3.2 VACCINATIONS RECOMMANDES
3.2.a Grippe
professionnels de sant et tout professionnel en contact rgulier et prolong avec des sujets
risque (cf 4.3), personnel naviguant des bateaux de croisire et des avions, et personnel de lindus-
trie des voyages accompagnant les groupes de voyageurs (guides). [On est pass en 2006 de la re-
commandation lobligation pour les professionnels de sant et tout professionnel en contact
rgulier et prolong avec des sujets risque]
3.2.b Coqueluche
3.2.c Varicelle
les personnes sans antcdents de varicelle (ou dont lhistoire est douteuse) et dont la srologie
est ngative qui exercent les professions suivantes : professionnels en contact avec la petite en-
fance (crches et collectivits denfants notamment), professions de sant en formation, lembau-
che ou en poste en priorit dans les services accueillant des sujets risque de varicelle grave
(immuno-dprims, services de gynco-obsttrique, nonatologie, maladies infectieuses).
3.2.d Rougeole
les personnes de plus de 25 ans non vaccines et sans antcdents de rougeole (ou dont lhis-
toire est douteuse) et dont la srologie est ngative, qui exercent les professions de sant en for-
mation, lembauche ou en poste en priorit dans les services accueillant des sujets risque de
rougeole grave doivent recevoir une dose de vaccin trivalent.
3.2.e Hpatite A
sujets exposs professionnellement un risque de contamination : personnels de crches, din-
ternats des tablissements et services pour lenfance et la jeunesse handicape, personnels de trai-
tement des eaux uses, personnels impliqus dans la prparation alimentaire en restauration
collective.
3.2.f Leptospirose
3.2.g Rage
services vtrinaires, personnels des laboratoires manipulant du matriel contamin ou susceptible
Calendrier vaccinal 2005
266/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de ltre, quarrisseurs, personnels des fourrires, naturalistes, taxidermistes, gardes-chasse, gar-
des forestiers, personnels des abattoirs.
B.4 Recommandations particulires
4.1 VACCINATION CONTRE LA DIPHTERIE
4.2 VACCINATION CONTRE LA FIVRE JAUNE
Chez les voyageurs et en particulier chez les rsidents en zone dendmie, partir de lge de 6
mois. La vaccination ne doit pas tre effectue chez la femme enceinte. Cependant, en cas de cir-
constances particulires (impossibilit de report dun voyage dans une zone dendmie) le bnfice
de la vaccination devra tre valu en fonction du risque par le mdecin vaccinateur. La vaccina-
tion contre la fivre jaune est obligatoire en Guyane.
4.3 VACCINATION CONTRE LA GRIPPE
personnes ges de 65 ans et plus ;
personnes atteintes dune des pathologies suivantes : affections broncho-pulmonaires chro-
niques, dont asthme, dysplasie broncho-pulmonaires et mucoviscidose; cardiopathies cong-
nitales mal tolres, insuffisances cardiaques graves et valvulopathies graves; nphropathies
chroniques graves, syndromes nphrotiques purs et primitifs; drpanocytoses, homozygotes
et doubles htrozygotes S/C, thalassodrpanocytose; diabtes insulino-dpendant ou non-
insulino-dpendant ne pouvant tre quilibrs par le seul rgime; dficit immunitaires cellu-
laires (chez les personnes atteintes par le VIH, lindication doit tre faite par lquipe qui suit
le patient) ;
personnes sjournant dans un tablissement de sant de moyen ou long sjour, quel que
soit leur ge;
enfants et adolescents (de 6 mois 18 ans) dont ltat de sant ncessite un traitement pro-
long par lacide actylsalicylique (essentiellement pour syndrome de Kawasaki compliqu
et arthrite chronique juvnile).
4.4 VACCINATION CONTRE LHPATITE A
Adultes non immuniss et enfants au-dessus de lge de 1 an voyageant en zone dendmie, jeunes
des internats des tablissements et services pour lenfance et la jeunesse handicaps et les person-
nes exposes des risques particuliers, patients infects chroniques par le virus de lhpatite B
ou porteurs dune maladie chronique du foie, homosexuels masculins.
4.5 VACCINATION CONTRE LHPATITE B
a. nouveau-ns de mre porteuse de lantigne HBs ;
b. enfants accueillis dans les services et institutions pour lenfance et la jeunesse handicapes ;
c. enfants et adultes accueillis dans les institutions psychiatriques ;
Calendrier vaccinal 2005
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 267/307
d. enfants dge prscolaire accueillis en collectivit ;
e. personnes ayant des relations sexuelles avec des partenaires multiples ;
f. toxicomanes utilisant des drogues parentrales ;
g. voyageurs dans les pays de moyenne ou de forte endmie (essentiellement lAfrique sub-
saharienne, lAsie, certains pays de lAmrique centrale et du nord de lAmrique du sud) : le
risque doit tre valu au cas par cas par le mdecin vaccinateur en fonction de la dure et des
conditions du voyage, du type dactivits et dventuels risques iatrognes;
h. personnes amenes rsider en zones de moyenne ou de forte endmie;
i. personnes qui, dans le cadre dactivits professionnelles ou bnvoles, sont susceptibles
dtre en contact direct avec des patients et/ou dtre exposes au sang et autres produits
biologiques, soit directement (contact direct, projections), soit indirectement (manipulation
et transport de dispositifs mdicaux, de prlvements biologiques, de linge, de dchets), [ ti-
tre indicatif et non limitatif sont concerns: les professionnels de sant libraux, les secouris-
tes, les gardiens de prison, les boueurs, les goutiers, les policiers, les tatoueurs] ;
j. patients susceptibles de recevoir des transfusions massives et/ou itratives (hmophiles,
dialyss, insuffisants rnaux, candidats une greffe dorgane...) ;
k. entourage dun sujet infect par le virus de lhpatite B ou porteur chronique de lantigne
HBs (famille vivant sous le mme toit) ;
l. partenaires sexuels dun sujet infect par le virus de lhpatite B ou porteur chronique de
lantigne HBs.
La pertinence dun contrle de limmunit pour les personnes vaccines aprs 25 ans, en dehors
des catgories i et j (voir risques professionnels, 3.1.a) est examiner au cas par cas en fonction de
lintensit de lexposition et de la prsence de facteurs de non rponse la vaccination.
La recommandation de suppression des rappels systmatiques ne sapplique pas aux insuffi-
sants rnaux chroniques dialyss chez qui une srologie annuelle est recommande avec rappel
ds que le taux danticorps descend au-dessous du seuil protecteur, quel que soit lge.
4.6-9 VACCINATIONS CONTRE LES INFECTIONS INVASIVES A MENINGOCOQUE
DE SEROGROUPE C, LES INFECTIONS INVASIVES A PNEUMOCOQUE, CONTRE
LA TYPHOIDE, LA COQUELUCHE
4.10 VACCINATION CONTRE LA VARICELLE pour les personnes sans antcdents de va-
ricelle (ou dont lhistoire est douteuse) et dont la srologie est ngative, lors des situations
suivantes: personnes en contact troit avec des personnes immunodprimes (les sujets vacci-
ns doivent tre informs de la ncessit, en cas de rash gnralis, dviter les contacts avec les
personnes immunodprimes pendant 10 jours), adultes de plus de 18 ans exposs la varicelle
(dans les 3 jours suivant lexposition un patient avec ruption).
4.11 VACCINATION CONTRE LENCPHALITE TIQUES
Le comit technique des vaccinations dans sa sance du 29 janvier 2004 a estim au vu des donnes
prsentes par lInstitut de veille sanitaire et par le Centre national de rfrence quil ny avait pas
dindication de recommandation officielle de ce vaccin pour certaines zones franaises. La pres-
cription de ce vaccin devra tre pose au cas par cas.
4.12 VACCINATION CONTRE LA RAGE pour les personnes rgulirement exposes au virus
Calendrier vaccinal 2005
268/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de la rage des chauves-souris en France mtropolitaine (chiroptrologues).
B.5 Recommandations vaccinales aux
voyageurs
Des recommandations sanitaires pour les voyageurs sont labores par le Comit des maladies
dimportation et des maladies lies au voyage, comit permanent (Arrt du 25 septembre 2002)
du Conseil suprieur dhygine publique de France. Le programme de vaccination raliser doit
tre adapt lge et au statut vaccinal du voyageur, la situation sanitaire du pays visit, aux con-
ditions et la dure du sjour.
Outre la mise jour des vaccinations inscrites au calendrier vaccinal (diphtrie, ttanos, poliomy-
lite) et de celles qui figurent dans la rubrique recommandations particulires (fivre jaune, h-
patite A, hpatite B, typhode), dautres vaccinations peuvent tre indiques pour certains
voyageurs (encphalite japonaise, encphalite tiques, mningite mningocoques A, C, Y,
W135, rage).
Ces vaccinations sont dtailles dans les recommandations sanitaires pour les voyageurs, approu-
ves par le Conseil suprieur dhygine publique de France, qui sont publies chaque anne dans
le Bulletin pidmiologique hebdomadaire et qui peuvent tre consultes sur le site Internet du
ministre: www.sante.gouv.fr et de lInstitut de veille sanitaire: www.invs.sante.fr
Rcapitulatif : diagnostic, prvention, traitement
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 269/307
Annexe C
Rcapitulatif : diagnostic,
prvention, traitement
Diagnotic Prvention Traitement antiviral
direct indirect vaccin immunoglobulines
HSV + # O O O aciclovir
VZV + (+) + (vivant) + (spciales) aciclovir
CMV + (+) O (+) ganciclovir, foscarnet,
cidofovir
EBV # O + O O non
Adnovirus + # O O O cidofovir
Papillomavirus + [PCR] O O (en essai) O cidofovir (?)
Parvovirus + + O O O
v. Variole + O + (=vaccine,
vivant)
+ (spciales) cidofovir
Poliovirus + + (inactiv et
vivant)
O
Coxsackie- & Echovi-
rus
+ O O O O
Rhinovirus (+) O (+) O O
Rotavirus + O (en essai) O O
Astro- & Calicivirus + O O O O
v. Influenza (grippe) + # O + (inactiv) O inhibiteur de neuramini-
dase, rimantadine
v. Para-influenza + O O O O
v. Oreillons + + + (vivant) abandonnes O
v. Rougeole # O + + (vivant) + O
Rcapitulatif : diagnostic, prvention, traitement
270/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
v. RS + O O + (ac monoclonal) O
v. Rage + O + (inactiv) + (spciales) O
v. Rubole O + + (vivant) O O
v. Fivre jaune + + + (vivant) O O
v. Dengue + + O O O
v. Ebola + + O (spciales) ribavirine
v. Hantaan + + O O ribavirine (?)
HAV O + + (inactiv) + O
HBV + + + (inactiv + (spciales) IFN, 3TC / adfovir
HCV + + O O IFN+ribavirine
HDV + + + (=vaccin
anti-HBV)
O IFN
HEV (+) + O O O
HIV + + O O inhibiteurs de transcriptase
inverse, de protase, de
fusion, dintgrase
HTLV (+) + O O O
ATNC (+) O O O O
Diagnotic Prvention Traitement antiviral
Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 271/307
Annexe D
Aide-mmoire de
chimiothrapie antivirale
Abacavir [Ziagen] : PO, cp 300 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
600 mg/24h en 2 prises ou en 1 prise
Effets indsirables: allergie majeure avec risque vital en cas de reprise du traitement
Aciclovir [Zovirax] : PO, cp 200 mg et 800 mg ; IV, perf.
Pousse dherps gnital (HG) :
5 cp/24h x 10 j pour HG primaire
5 cp/24h x 5 j pour HG rcurrent
Prvention de lherps simplex chez limmunodprim Ad / Enfant >2 ans: 4 cp/24h
Prvention de lherps simplex hautement rcidivant chez limmunocomptent : 4 cp/24h
x 6 j 9 mois
Infections graves HSV ou VZV (perf. IV sur 1h) : 3 perf./24h de 10 mg/kg x 1 2 sem.
Dose dattaque de 15 mg/kg dans les formes les plus graves?
Varicelle, zona chez limmunocomptent : cp 800 mg, 4 g/24h Ad.
Tolrance bonne, rares effets indsirables: rnaux, neuropsychiques
Adfovir [PMEA] : PO, cp 10 mg
Traitement de linfection chronique par le virus de lhpatite B
10 mg/24h
Bonne tolrance, rares effets indsirables digestifs, quelques augmentations de cratinmie
Ajustement de posologie en cas dinsuffisance rnale
Amprenavir (Agenerase) : PO, caps 150 mg ou Fos amprnavir (TELZIR) cp 700 mg
Antiprotase, en association dans le traitement de linfection VIH
1200mg/24h associ ritonavir faible dose (200mg/24h), en 2 prises
ou 1400mg/24h (sous forme TELZIR) en 2 prises avec ritonavir faible dose (200mg/
Henri AGUT, Jean-Marie HURAUX, Vincent CALVEZ, Anne-Marie FILLET,
Anne-Genevive MARCELIN, Vincent THIBAULT,
Agns GAUTHERET-DEJEAN, Claire DEBACK
Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
272/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
24h)
Effets indsirables: nauses, diarrhes, toxicit cutane, nombreuses interactions mdica-
menteuses
Atazanavir (Reyataz) : PO, glules 150 et 200 mg
Antiprotase, en association dans le traitement de linfection VIH
300 mg /24h en 1 prise en association avec ritonavir (100 mg)
Effets indsirables: ictre bilirubine libre, nombreuses interactions mdicamenteuses
Cidofovir [Vistide, HPMPC, CDV] : IV, perfusion d1 heure
Infections CMV (rtinites), actuellement lessai dans les infections papillomavirus.
5mg/kg 1 fois par semaine en association avec le probncide et une bonne hydratation
Effets indsirables: insuffisance rnale.
Didanosine [Videx, DDI] : PO
gel 250 400 mg en 1 prise jeun
En association dans le traitement de linfection VIH
Effets indsirables: pancratite (cas mortels), troubles gastro-intestinaux, neuropathies p-
riphriques
Contre-indiqu en association avec la stavudine; 250mg par jour si association au tnofo-
vir
Contre-indiqu si ATCD de pancratite, de neuropathie, si traitement la rifampicine.
Efavirenz [Sustiva] : PO, gel. 600 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
600 mg/24h en 1 prise
Effets indsirables: rashs cutans, troubles neuropsychiques
Enfuvirtide (T20, Fuzeon, peptide de 36 acides amins)
En association dans le traitement de linfection VIH
90mg X 2/24h en injection S.C.
Effets indsirables: nodules au point dinjection
Famciclovir [Oravir] : PO, cp 500 mg
Transform en penciclovir lors du passage dans le foie
Traitement des infections HSV et VZV
500mg x 3/24h pendant 7jours dans le traitement du zona
Foscarnet [Foscavir, PFA] IV, perf
Rtinite CMV du SIDA :
Traitement dattaque: 180 mg/kg/24h en 3 perf. IV x 2-3 sem.
Traitement dentretien: 90-120mg/kg/24h en 1 perf. IV.
Infections HSV rsistant laciclovir : 80 120mg/kg/24h en 2 3perf. IV x 2-3 sem.
(ou jusqu cicatrisation)
Adapter les doses la fonction rnale.
Hydratation ++(2,5 l/24h NaCl 0,9% IV)
Effets indsirables: troubles de la fonction rnale, anmie, modification du bilan phospho-
calcique.
Ganciclovir [Cymevan, DHPG, GCV] : IV, perf.
Infections graves CMV des immunodprims (cas gnral) :
Attaque: 5mg/kg x 2 perf/24h x 2-3 sem.
Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 273/307
Entretien: 6mg/kg x 1 perf/24h x 5 j/7 ou 5mg/kg x 1 perf/24h vie chez les sidens
en cas de rtinite.
Prvention des infections graves CMV chez les transplants de moelle avec virmie
CMV ou lavage broncho-alvolaire positif pour le CMV :
Attaque (QS) si prise de greffe confirme et polynuclaires neutrophiles >500/mm3
Entretien (QS) x 2 sem. jusqu J 100 ou J 120
Contre-indiqu si polynuclaires neutrophiles<500/mm
3
, plaquettes<25.000/mm
3
, hb<
8g/ L
Effets indsirables: hmatologiques, neuropsychiques et sur la fertilit masculine
Arrter lAZT pour le traitement dattaque (2-3 sem.)
Risque de rsistance croise avec laciclovir (de structure chimique proche)
Ganciclovir oral [Cymevan, DHPG, GCV] : PO, gel. 250 et 500 mg
1000mg x 3/24h en traitement dentretien (si GCV voie IV impossible)
Voir valganciclovir qui a une bien meilleure biodisponibilit orale.
Indinavir [Crixivan, IDV] : PO, gel. 200 et 400 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
400mg 600mg 2 fois par jour en association avec du ritonavir (100mg x 2)
Effets secondaires: hyperbilirubinmies, lithiases urinaires, cphales, vertiges, xrose,
augmentation des transaminases
Interfron alpha [Introna, Rofron, Virafron, Virafronpeg, Pegasys, IFN] : SC
Interfrons classiques:
Alpha 2a: Rofron
Alpha 2b: Virafron, Introna
Hpatite chronique B : 5 10MUI SC x3/sem. ou 2,5 5 MUI/m
2
SC x 3/sem.
Pendant 4 6 mois
Hpatite chronique C : 3 MUI SC x 3/sem. pendant 6 12 mois selon le gnotype
et en association avec la ribavirine.
Interfrons pgyls
Alpha 2a: Pegasys
Alpha 2b: VirafronPeg
Hpatite chronique B : la forme pgyle na pas dAMM pour le moment dans
cette indication.
Hpatite C chronique: 180g/sem. (2a) ou 1,5 g/kg (2b) pendant 6 12mois
selon le gnotype et en association avec la ribavirine.
Effets indsirables trs frquents: syndrome pseudogrippal (fatigue, fivre, frissons), d-
pression, asthnie, leucopnie
Ne pas administrer durant la grossesse.
Lamivudine [3TC] : PO, cp 150 mg [Epivir]
150mg x 2 ou 300mg en 1 prise
En association dans le traitement de linfection VIH (existe sous forme combine unique
Combivir[3TC +AZT] et Trizivir[3TC +AZT +abacavir] 300mg/24h en
Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
274/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
2prises
Hpatite chronique B : PO, cp 100 mg [Zeffix] ou solution buvable 5 mg/ml
100mg/24h
Effets indsirables exceptionnels
Lopinavir [association avec ritonavir, Kaletra] : PO, caps 133 mg lopinavir/33 mg de ri-
tonavir
En association dans le traitement de linfection VIH
800/200mg/24h en 2 prises
Effets indsirables: nauses, augmentation des triglycrides, nombreuses interactions m-
dicamenteuses
Nelfinavir [Viracept] : PO, cp 250 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
2500mg/24h en 2 prises
Effets indsirables: nauses, diarrhe, ractions cutanes, trs nombreuses interactions m-
dicamenteuses
Nevirapine [Viramune] : PO, cp 200 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
400mg/24h en 1 ou 2 prises
Effets indsirables: rashs cutans, interactions mdicamenteuses
Oseltamivir [Tamiflu] : gel. 75 mg
Traitement de la grippe A et B
150mg/24h en 2 prises pendant 5 jours
Effets indsirables: nauses, vomissements, insomnies, vertiges
Ribavirine : PO, gel. 200 mg [Rebetol] ou [Copegus]
Hpatite chronique C (en association avec interfron alpha)
Copgus: 800 1200 mg/24h en 2 prises selon le poids et le gnotype
Rbtol: <65kg: 800mg; 65-85 kg : 1000mg; >85kg: 1200mg/24h en 2 prises
Effets indsirables trs frquents: anmie (concentration dans les globules rouges), un sui-
vi rigoureux de la numration est indispensable en dbut de traitement.
Ne pas administrer durant la grossesse; une contraception efficace (mme sil sagit du par-
tenaire masculin qui est trait) doit tre assure durant la prise du traitement et pendant 6
mois aprs larrt de celui-ci.
Ritonavir [Norvir] : PO, caps 100 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
1200 mg/24h en 2 prises, ou mini dose: 200mg/24h en 2 prises pour augmenter la biodis-
ponibilit dun autre inhibiteur de protase
Effets indsirables: troubles gastro-intestinaux, paresthsies, neuropathie, rythme et pru-
rit, augmentation des triglycrides, trs nombreuses interactions mdicamenteuses
Saquinavir : PO gel. HGC 200mg [Invirase]
En association dans le traitement de linfection VIH
Faible biodisponibilit, associ en gnral ritonavir en mini dose pour augmenter la
biodisponibilit: 1600mg saquinavir +200mg ritonavir /24h
Stavudine [Zerit, D4T] : PO, gel. 15, 20, 30, 40 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 275/307
Adulte =60 kg: 40mg X 2 prises/24h
Adulte <60 kg: 30mg X 2 prises/24h
Effets indsirables: neuropathie priphrique, atteinte hpatique, lipoatrophie trs frquen-
te
Association contre-indique avec AZT (interaction majeure)
Tnofovir [PMPA, Viread] : PO, cp 300 mg
En association dans le traitement de linfection VIH
300 mg/24h en 1 prise un repas
Interactions mdicamenteuses avec des inhibiteurs de protase, troubles de la fonction r-
nale
Tipranavir : PO, capsules 250 mg
Antiprotase, en association dans le traitement de linfection VIH
1000mg /24h en 2 prises en association avec ritonavir 200mg/24h
Effets secondaires: cytolyse hpatique, trs nombreuses interactions mdicamenteuses
Valaciclovir [Zelitrex] : ester de valine et daciclovir, PO, cp 500 mg
500mg x 2/24h pendant 10jours pour linfection gnitale HSV
1000mg x 3/24h pendant 7 jours pour le zona
2000mg x 4/24h pendant 90jours pour la prvention de linfection CMV chez les trans-
plants
Valganciclovir [Rovalcyte, Val-GCV] : PO, cp 450 mg
Traitement et prvention des infections CMV
Attaque: 1800mg/24h en deux prises
Entretien/Prvention: 900mg/24h
Effets secondaires identiques celui du ganciclovir (le valganciclovir est un promdica-
ment du ganciclovir)
Zalcitabine [Hivid, DDC] : PO
En association dans le traitement de linfection VIH
2,25mg/24h en 3 prises
Effets indsirables: neuropathie priphrique (gnralement rgressive si interruption pr-
coce) rarement pancratite, ulcrations buccales
Zanamivir [Relenza] : poudre inhaler
Grippe A et B en traitement curatif.
2 inhalations (5 mg x 2) 2 fois par jour soit 20mg/24h pendant 5 jours
Zidovudine [Retrovir, AZT] : PO, gel. 100 et 250 mg, cp 300 mg
En association dans le traitement de linfection VIH (voir formes combines la lamivu-
dine)
500 600mg/24h en 2 prises, contre-indique avec stavudine
Effets indsirables: anmie, neutropnie, troubles digestifs et neurologiques plus rares
avec les posologies actuelles
Aide-mmoire de chimiothrapie antivirale
276/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 277/307
Annexe E
Les examens virologiques en
pratique mdicale
But : le diagnostic des infections virales, le suivi du traitement, le contrle de la prvention.
E.1 Diagnostic des infections virales
E.1.1 Deux approches
Revoir lillustration II-8 (voir page 83) Les 4 points du diagnostic virologique mdical .
Le diagnostic virologique repose, comme le diagnostic bactriologique, sur deux approches: le
diagnostic direct, dcelant dans les produits biologiques la prsence du virus ou de ses composants,
antignes ou gnomes viraux, et le diagnostic indirect, dcelant lapparition dans le sang dune r-
ponse immunitaire sous forme danticorps spcifiques du virus. Ces deux approches ne sexcluent
pas et sont parfois complmentaires.
Indiquons demble que recherche dantignes et recherche danticorps utilisent des ractions an-
tigne-anticorps au mcanisme identique, la diffrence venant de lorigine des composants de la
raction. Dans le diagnostic direct, on recherche, laide danticorps antiviraux de rfrence con-
nus (souvent monoclonaux), contenus dans la trousse de ractifs (kit), la prsence ventuelle dans
les produits biologiques dantignes viraux correspondants. En revanche, dans le diagnostic indi-
rect, on recherche, laide dantignes viraux de rfrence connus, contenus dans la trousse de
ractifs, la prsence ventuelle dans le sang danticorps anti-viraux correspondants.
E.1.2 Diagnostic direct
Diverses techniques sont utillisables. Certaines illustrations correspondantes peuvent tre vues en
consultant la bibliothque de la facult le Trait de virologie mdicale EMSTEM - Deboeck
2003.
Les examens virologiques en pratique mdicale
278/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
E.1.2.1 Microscopie lectronique
Elle recherche des particules virales; elles ne sont dcelables quen concentration suffisante dans
les prlvements examins (10
6
par mL), seuil rarement atteint en dehors des diarrhes virales ou
des liquides de vsicules.
E.1.2.2 Recherche de virus infectieux aprs inoculation de culture cellulaire in
vitro
Cest une technique classique qui amplifie (multiplie) les virus (comme les cultures en bouillon ou
sur glose amplifient les bactries) ; on parle aussi disolement du virus en culture cellulaire. La
multiplication virale qui suppose plusieurs cycles de rplication (comme lapparition des colonies
bactriennes) demande quelques jours, voire quelques semaines. Tous les virus ne se multiplient
pas en culture de cellules in vitro et il nexiste pas un type de culture polyvalent, de sorte que pour
ratisser au plus large, le laboratoire doit recourir plusieurs types de cultures.
Dans les cas les plus vidents, la multiplication virale se traduit par un effet cytopathique ou ECP.
Cest le tmoin visible en microscopie optique de la multiplication lytique du virus. Les cellules en
cultures in vitro (qui sur le support de verre ou de plastique, apparaissent normalement plates, con-
fluentes, peu rfringentes) sarrondissent, deviennent rfringentes et se dtachent du support dans
le milieu de culture; certains virus induisent lapparition de syncytiums par fusion de la membrane
cytoplasmique de cellules voisines, de proche en proche.
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 279/307
La coloration de la culture cellulaire (par exemple lhmalun-osine) permet, dans certains cas,
Les examens virologiques en pratique mdicale
280/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
de voir des inclusions de matriel anormal. Laspect de lECP est plus ou moins vocateur dun
virus ou dune famille virale. Gnralement, les virus ARN, multiplication cytoplasmique, don-
nent des inclusions cytoplasmiques, tandis que les virus ADN, qui sassemblent dans le noyau,
donnent des inclusions nuclaires.
Lorsque lECP est tardif ou lorsquil est absent, on peut tre conduit rechercher dans des cultures
apparemment normales de lantigne viral (immuno-cytodiagnostic) ou des gnomes viraux.
Lisolement en culture de cellules in vitro est parfois fastidieux, mais il garde lavantage de pro-
duire des virus infectants, utiles pour certaines caractrisations ultrieures comme la capacit de
multiplication, la dtermination de la concentration inhibitrice dun antiviral
E.1.2.3 Dtection rapide dantigne viral directement dans les produits
biologiques
Ce diagnostic direct pratiqu laide danticorps antiviraux (souvent monoclonaux) est trs large-
ment utilis car cest une technique rapide, vitant les alas de la culture cellulaire in vitro, pou-
vant sappliquer des virus impossibles cultiver.
Cest, sur un prlvement cellulaire (scrtions muqueuses, frottis de lsion, sang ou biop-
sie), un immuno-cytodiagnostic.
Il consiste en la recherche de matriel viral dans le cytoplasme ou le noyau (correspondant
ventuellement des inclusions), cela en immunofluorescence ou immunoperoxydase (anti-
corps antiviraux conjugus un fluorochromes ou une enzyme catalysant une raction co-
lore).
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 281/307
Cest, ailleurs, la dtection dantignes solubles (indpendants de tout support cellulaire)
dans les produits pathologiques liquides ou extraits liquides, selon plusieurs techniques:
technique ELISA o la raction antigne-anticorps implique une adsorption de ractifs
sur le font dun puits en plastique, puis une raction enzymatique colore dans le liquide
du puits (Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay),
immunodiffusion sur bandelette de papier,
Les examens virologiques en pratique mdicale
282/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
immunofiltration (savonnette ),
test au latex o une suspension de particules de latex enrobes danticorps antiviraux est
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 283/307
mlang un extrait liquide de produits biologiques; les particules de latex vont se trou-
ver agglutines par lintermdiaire de lantigne viral correspondant, et lil nu, la sus-
pension de particules de latex, dhomogne et laiteuse, va devenir granuleuse.
E.1.2.4 Dtection des gnomes viraux directement dans les produits
biologiques
Comme lapproche prcdente, elle est applicable a priori tous les virus, notamment des virus
difficiles ou impossibles isoler. Elle repose sur lhybridation par une sonde nuclique spcifique
(complmentaires dun segment dacide nuclique viral connu) avec les acides nucliques du virus
correspondant ventuellement prsents dans le produit biologique.
Cette raction dhybridation peut se faire directement sur les produits biologiques ou aprs ampli-
fication in vitro de la squence nuclique virale, cest--dire par raction de polymrisation en
chane ou PCR. La PCR (dont il existe diverses variantes) a rvolutionn le diagnostic virologique
en raison de sa sensibilit, de sa spcificit, de son automatisation.
Les examens virologiques en pratique mdicale
284/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Elle a cependant quelques inconvnients: sa sensibilit extrme expose au risque de contamination
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 285/307
dun chantillon lautre entre malades diffrents, tandis que sa spcificit expose au risque de m-
connatre les variantes gntiques dun virus.
Avec la technique des biopuces, on peut rechercher par hybridation les gnomes dune grande di-
versit de virus, en utilisant un support microscopique sur lequel ont t fixes des sondes corres-
pondant tous les virus (ou bactries) ventuellement impliqus dans un syndrome clinique
donn: biopuces pour infections respiratoires, neuromninges, nonatales, fivres hmorragi-
ques, alerte au bioterrorisme. Il sagit l dune technique encore exprimentale, prsentant actuel-
lement un dficit de sensibilit par rapport aux techniques recherchant spcifiquement un agent
infectieux.
E.1.3 Diagnostic indirect
Il sagit ici de caractriser les anticorps ventuellement prsents dans le srum du sujet, anticorps
spcifiques du virus ou des virus que lon estime impliqu(s) dans le syndrome clinique
E.1.3.1 Diffrentes techniques
Citons, sans prtendre lexhaustivit:
la raction de neutralisation ; cest une raction de rfrence car les anticorps neutralisants
sont parmi les plus spcifiques (pas ou peu de ractions croises entre les espces dune mme
famille virale) et ils ont de plus une signification de protection. Cependant, il sagit l dune
raction fastidieuse puisquelle se pratique en culture de cellules in vitro ;
Les examens virologiques en pratique mdicale
286/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
la raction ELISA a pour elle dtre automatisable et de permettre la recherche soit des IgG,
soit des IgM spcifiques dun virus donn;
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 287/307
la raction dimmuno-empreinte ou Western blot est gnralement utilise comme confirma-
tion dune raction de dpistage positif en ELISA. Elle analyse sparment les diffrents an-
Les examens virologiques en pratique mdicale
288/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
ticorps produits vis--vis des diffrents composants antigniques dun virus donn;
le test au latex o les particules, ici enrobes dantigne viral, vont se trouver agglutines par
lintermdiaire des anticorps viraux correspondants prsents dans le srum.
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 289/307
E.1.3.2 Que chercher par le diagnostic indirect ou srodiagnostic ?
Pour le diagnostic dune infection actuelle, on recherche:
soit une augmentation significative du titre des anticorps lexamen de deux s-
rums, le premier prcoce prlev le plus tt possible, le deuxime tardif prlev lors de
la convalescence, tous deux examins simultanment au cours de la mme manipu-
lation pour viter toute erreur due la variabilit intermanipulation.
soit la prsence dIgM spcifiques qui thoriquement, du fait de leur fugacit, signent,
par leur seule prsence, une primo-infection en cours. Ce nest vrai que pour certaines
infections virales aigus telle que la rubole ou lhpatite A.
La seule prsence dIgG spcifiques dans un srum unique signifie trace immunitaire de
linfection mais ne permet pas de dater cette infection. En effet :
un titre lev ne signe pas une infection rcente chez un individu donn, tant est gran-
de la variabilit individuelle de la rponse immunitaire humorale, en termes de rapidit,
de niveau danticorps et de persistance. Le niveau des anticorps vis--vis dun virus ne
saurait tre considr comme une constante biologique, avec valeur normale et cart-
type;
cela tant, la seule prsence dIgG spcifiques dans un srum constitue une information
suffisante pour le praticien, en cas dinfection chronique telle quune infection par
HIV (une telle personne, infecte, peut transmettre lHIV, par rapport sexuel ou don
de sang),
ou bien dans dautres cas pour dterminer si le patient est protg vis--vis du virus
correspondant (titre danticorps anti-HBs 10 units internationales par mL pour pro-
tger vis--vis du virus de lhpatite B),
encore que la politique actuelle en matire de vaccination contre lhpatite B - ou contre
la rubole- soit de vacciner sans contrle pralable de limmunit: ce contrle a alour-
di la procdure, au point que certaines personnes ne sont pas alles jusqu la vaccina-
tion.
E.1.3.3 Limites du diagnostic indirect
tant la dtection dune rponse immunitaire, il peut tre faussement ngatif en cas dimmuno-
dpression ou chez lenfant jeune du fait de son immaturit immunologique. Chez le nourrisson,
les anticorps maternels transmis faussent le rsultat
Le dlai de mise en uvre par lorganisme de la rponse immunitaire est gnralement incompa-
tible avec un diagnostic en temps utile pour la mise en route du traitement dune infection aigu,
le rsultat du srodiagnostic parvenant la convalescence.
Le srodiagnostic peut tre faussement positif du fait de ractions croises entre les membres
dune mme famille virale ou du fait que certains virus sont capables de dclencher par stimula-
tion polyclonale B des ractions immunitaires trs larges, non spcifiques, par exemple la scr-
tion dIgM ruboliques au cours dune infection parvovirus B19.
Enfin, il ne renseigne que vis--vis du virus tudi, alors que lisolement en culture, par exemple,
est une technique plus polyvalente: bien des virus peuvent pousser en culture de cellules.
Les examens virologiques en pratique mdicale
290/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
E.2 Rle du praticien
Le choix des techniques du diagnostic direct ou du diagnostic indirect appartient au biologiste mais
celui-ci a besoin dtre orient par les renseignements cliniques fournis par le praticien et cest
ce dernier que revient de mettre en uvre les prlvements ncessaires au diagnostic direct ou au
diagnostic indirect.
E.2.1 Les prlvements
O, quand, comment, pourquoi faire?
1. Pour le diagnostic indirect, ils sont relativement simples: cest du sang ou du srum, trans-
portable temprature ambiante, raison dun tube, ou de deux si lon recherche une lva-
tion significative du titre des anticorps.
2. Les prlvements pour diagnostic direct sont plus divers et complexes. Indiquons seule-
ment que:
en cas de lsion accessible, les prlvements porteront ce niveau (liquide cphalo-ra-
chidien pour mningite, liquide de vsicule - avant toute application de topique-, frottis
conjonctival pour conjonctivite, par exemple), sinon ils porteront au niveau de la porte
dentre du virus, respiratoire (scrtions nasopharynges) ou digestive (selles) ou en-
core au niveau de la voie dexcrtion des virus (urine, selles), ou encore au niveau du
sang (virmie) ;
pour les infections aigus, en raison de la fugacit de la multiplication virale en pareil
cas, les prlvements sont faire au plus tt, sous peine dtre ngatifs;
pour la recherche des virus les plus fragiles par isolement en culture de cellules, il faudra
transporter les prlvements en vitant la perte de linfectiosit du virus (linactivation)
par la dessiccation ou la temprature ambiante (transport dans la glace, expression dun
ventuel couvillon dans du milieu de transport liquide) ; la conglation - 20C est d-
ltre pour la plupart des virus enveloppe et toute conglation est proscrire si lon pr-
voit de faire un immunocytodiagnostic direct sur le prlvement, dont les cellules
doivent rester intactes.
les virus les plus dangereux exigent un triple emballage de scurit des prlvements,
les modalits prcises des prlvements variant en fonction du syndrome clinique et des
techniques utilisables par le laboratoire, il faudra sen remettre des protocoles tablis
en concertation entre clinicien et virologiste.
E.2.2 Renseignements cliniques et interprtation des
rsultats
Le biologiste se doit dinterprter ses rsultats mais, comme pour le choix des techniques, ce nest
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 291/307
possible que si le praticien lui a fourni des renseignements cliniques succincts mais prcis: motif
de la demande, principaux symptmes et date de dbut des troubles. Ainsi, un rsultat ngatif de
dpistage des anticorps IgG anti-HIV par ELISA est-il pleinement rassurant si le patient na pas
pris de risque dans les trois mois prcdant lexamen. En revanche, avec une prise de risque dans
les jours prcdents, ce rsultat est tout fait compatible avec une primo-infection en cours par
HIV, qui comporte un risque lev de contagion par rapport sexuel ou par don du sang.
Aprs contamination par agent infectieux, de mme quexiste une priode dincubation avant lap-
parition des signes cliniques, il existe pour tout examen virologique, direct ou indirect, une fentre,
avant sa positivation.
Ainsi, un examen aussi simple et courant quun dpistage des anticorps IgG anti-HIV par
ELISA est strictement ininterprtable sans la connaissance de son motif et de la chronologie
des vnements layant ventuellement motiv. On ne saurait trop insister sur ce point.
Par ailleurs, linterprtation dun test diagnostique doit prendre en compte les paramtres classi-
ques de tout signal que sont sa sensibilit [probabilit que le test soit positif chez les individus
ayant (ou ayant eu) linfection recherche], sa spcificit [probabilit que le test soit ngatif chez
les individus nayant pas (ou nayant pas eu) linfection recherche], ses valeurs prdictionnelles
positive [probabilit que lindividu ait (ou ait eu) linfection si le test est positif] et ngative [pro-
babilit que lindividu nait pas (ou nait pas eu) linfection si le test est ngatif].
E.2.3 Indication des examens virologiques en pratique
mdicale
Ils sont utiles pour la personne elle-mme quand il sagit de confirmer le diagnostic dune
infection potentiellement grave (mme si le traitement spcifique antiviral doit tre mis en
route en urgence, sans attendre le rsultat des examens virologiques).
Ils sont utiles en cas dinfection bnigne quand dans lentourage se trouvent des personnes
susceptibles de dvelopper, elles, une infection grave (diagnostic dune ruption ressemblant
de prs ou de loin la rubole dans lentourage dune femme enceinte non vaccine et sus-
ceptible de transmettre lenfant natre une rubole congnitale; diagnostic dune ruption
vsiculeuse pouvant tre due au virus de la varicelle et du zona dans lentourage dun enfant
immunodprim, susceptible de dvelopper une varicelle maligne).
Un diagnostic virologique rapide par un test simple peut viter un traitement coteux par
antibiotiques, pour une mningite entrovirus (PCR sur le LCR), pour une diarrhe rota-
virus (ELISA ou test au latex sur les selles), pour une grippe ou une infection respiratoire
virus RS (savonnettes spcifiques de ces virus sur les scrtions nasales).
Il est des indications dintrt collectif : pidmies (isoler des virus de la grippe, mme au
cours de cas bnins, sans attendre la survenue de cas mortels, est ncessaire la prparation
des vaccins), tudes scientifiques visant lamlioration des connaissances en matire de dia-
gnostic, pronostic, physiopathologie, traitement curatif ou prventif (la publication de telles
tudes suppose un diagnostic virologique confirm par le laboratoire).
Les examens virologiques en pratique mdicale
292/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
E.3 Quantification de la virmie, seuil
dintervention et traitement anticip
(preemptive)
Dans certains cas, la mise en vidence de linfection virale ne suffit pas au praticien. Avec certains
virus lymphotropes donnant une infection latente, il est tout fait banal de trouver des gno-
mes viraux dans le sang (la plupart des adultes bien portants ont de lordre de un gnome de virus
EBV par million de lymphocytes sanguins circulants). On est donc conduit, dans certaines circons-
tances, quantifier le virus dans le sang, et lune des techniques les plus performantes est la quan-
tification du gnome viral par PCR en temps rel sur le sang.
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 293/307
Ainsi, on dtermine, chez les sujets immunodprims (greffs de moelle ou dorgane solide, par
Les examens virologiques en pratique mdicale
294/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
exemple), un seuil de virmie (un certain nombre de copies de gnome EBV par mL de sang ou
million de lymphocytes sanguins circulants) au-del duquel lEBV, latent dans lorganisme, risque
fort de dclencher un lymphome malin. Ainsi, au-del de ce seuil de virmie, on va prendre des
mesures thrapeutiques pour tenter dviter lapparition de ce lymphome: allger, autant que faire
se peut, le traitement anti-rejet de greffe, discuter une immunothrapie par anticorps monoclonal
visant limiter la prolifration lymphoblastique. On parle donc de seuil dintervention.
Vis--vis du cytomgalovirus (CMV), autre virus latent, capable de dclencher une pneumonie
mortelle chez ce mme type de malades, le franchissement en virmie du seuil dintervention d-
clenche un traitement antiviral anti-CMV, dit traitement anticip (preemptive en anglais). Mme
attitude vis--vis des adnovirus chez les greffs de moelle.
E.4 Suivi des traitements antiviraux
1. La quantification virale est galement un moyen de suivre leffet de certains traitements an-
tiviraux. Ainsi, on attend du traitement anti-HIV quil diminue la quantit de virus prsent
dans le sang, jusqu, si possible, le rendre indcelable en PCR.
En labsence dune telle rponse, en cas dchappement au traitement , on doit revoir le
traitement : chercher si le patient prend bien les mdicaments prescrits (observance, vrifier
si besoin par le dosage de lantiviral dans le sang), et si tel est le cas, rechercher lmergence
de virus rsistant aux antiviraux prescrits, ce qui obligerait modifier le traitement anti-HIV.
2. Test gnotypique de rsistance. Disposant de prs de 20mdicaments antiviraux contre
lHIV, on dtermine vis--vis desquels le virus du malade, par slection de mutants, est deve-
nu rsistant, et vis--vis desquels il reste sensible, pour composer une 2
e
ligne de traitement.
On cherche donc les mutations de rsistance dans les gnes codant la cible des antiviraux
contre lHIV, gne de la transcriptase inverse et gne de la protase. La constellation de mu-
tations de rsistance indique les antiviraux auxquels lHIV du patient est devenu rsistant et
ceux auxquels il reste sensible. Le squenage de ces gnes de lHIV est entr dans la pratique
courante, grce des automates dont disposent dans nos pays les laboratoires de virologie
mdicale.
3. Test phnotypique de rsistance.
Les examens virologiques en pratique mdicale
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 295/307
Cest la mesure de la concentration inhibitrice ou efficace 50% (CI ou CE50) ou de la con-
centration inhibitrice ou efficace 90% (CI ou CE90) dun antiviral vis--vis dun virus don-
n, en culture de cellules in vitro, pour dterminer si ce virus est sensible ou rsistant cet
Les examens virologiques en pratique mdicale
296/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
antiviral (analogie avec la CMI en bactriologie). Pour cela, on ajoute une srie de cultures
de cellules in vitro, infectes par un inoculum viral fixe, des concentrations croissantes dan-
tiviral, puis lon dtermine, au bout de quelques jours dincubation des cultures 37C, les
quantits de virus produites sous ces diffrentes concentrations dantiviral, et on les compare
celle produite par une culture tmoin, infecte mais laisse sans antiviral. CI50 et CI90 sont
les concentrations rduisant respectivement de 50% et de 90% la production virale par rap-
port au tmoin. On parle de virus rsistant quand ces valeurs sont significativement
augmentes par rapport un virus de rfrence normal, sensible (significativement augmen-
tes voulant dire, non sans quelque arbitraire, x3 ou x5, selon les cas).
4. Que choisir ? Pour lHIV, lapproche par test phnotypique de rsistance est impraticable, vu
le nombre dantiviraux tester, la lourdeur des manipulations de ce virus en culture de cellules
in vitro, contrastant avec la relative facilit du squenage des gnes viraux, relativement
courts, impliqus dans la rsistance, transcriptase inverse et protase (rgions de 700 et
300nuclotides, respectivement). A linverse, pour un virus comme celui de lherps simplex
(HSV-1 ou HSV-2), lapproche par test gnotypique de rsistance est plus difficile, vu la lon-
gueur des gnes de lADN polymrase ou de la thymidine kinase (de lordre de 3000 et
1000nuclotides, respectivement), contrastant avec la facilit de la manipulation de ce virus
en culture de cellules in vitro, et le nombre rduit dantiviraux tester (2 ou 3).
E.5 Conclusion
Ainsi, des examens de complexit diverse, choisis en fonctions des techniques disponibles et des
renseignements cliniques, donc par concertation permanente entre praticien et virologiste, et
effectus au bon moment, concourent au diagnostic, au traitement et la prvention des infections
virales.
Recommandations de traitement pour hpatite chronique
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 297/307
Annexe F
Recommandations de
traitement pour hpatite
chronique
HBV
But : viter cirrhose et cancer du foie, par une rduction durable de la rplication virale.
Indication : une virmie leve (ADN 10
5
copies/mL), avec un certain degr daltration
de lhistologie hpatique se traduisant par un taux dALT 2N et associant fibrose (F 2,
sur un score allant de 0 4) et activit ncro-inflammatoire (A 2, sur un score de 0 3),
tabli par biopsie hpatique ou plus simplement par fibrotest (quation prenant en compte
divers marqueurs sriques, dont les ALT) et/ou FibroScan.
Critre de succs : llimination de lagHBs, souhaitable, est rare, et lradication de la r-
plication virale hors de porte. On se contente de la disparition de lagHBe (quand il
prexistait au traitement) et surtout dune rduction de la virmie (ADN indcelable, sinon
<10
4
copies/mL, le seuil de mise sous traitement tant 10
5
copies/mL).
Deux catgories de mdicaments sont utilisables :
1/ linterfron- (coupl une molcule de polythylne glycol : PEG-IFN), action im-
munostimulante et antivirale, pour une dure de 6 mois un an
2/ des analogues de nuclosides (dont la 3TC, et la FTC, driv fluor de la 3TC) ou de
nuclotides (ladfovir sous sa forme dipivoxyl, et depuis peu le tnofovir), action anti-
virale, pour une dure indtermine. La monothrapie par 3TC slectionne invitablement
des virus rsistants, mais encore sensibles aux analogues de nuclotides.
On choisit souvent en premire intention entre PEG-IFN ou 3TC ou adfovir. Une bithra-
pie aurait une certaine logique (PEG-IFN +analogue de nuclosi/tide ou deux analogues
de nuclosi/tide. Ces analogues de nuclosi/tide anti-HBV ont aussi une action anti-HIV.
HCV
But : viter cirrhose et cancer du foie, par une radication durable de la rplication virale.
Indication : une virmie, quelle quen soit le niveau (test ARN qualitatif +), avec un certain
degr daltration de lhistologie hpatique associant fibrose (F 2, sur un score allant de
0 4) et activit ncro-inflammatoire (A 2, sur un score allant de 0 3).
Critre de succs : indtectabilit durable de la virmie, au del du traitement (test ARN
qualitatif).
Bithrapie par PEG-IFN + ribavirine (analogue distant de nucloside, activit comple-
Recommandations de traitement pour hpatite chronique
298/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
xe, antivirale et immuno-modulatrice), pour soit 6mois, soit un an (selon que lHCV est
soit de gnotype 2 ou 3, soit de gnotype 1, moins sensible au traitement). Le succs du
traitement est annonc par une baisse prcoce de la virmie (chute de lARN de 2 log
10
sur
les 3 1
ers
mois de traitement) et obtenu pour 40% des hpatites C par gnotype 1, 80% des
hpatites C par gnotype 2 ou 3.
Conclusion
Le traitement de lhpatite B chronique est moins consensuel que celui de lhpatite C chro-
nique, et il ne peut prtendre dbarrasser le patient de linfection. Raison supplmentaire
la gnralisation de la vaccination contre lHBV, qui vise lgitimement radiquer linfec-
tion au niveau plantaire.
Ne pas oublier de rechercher une infection mixte, HBV+HDV ou HBV/HCV+HIV, qui
pourrait changer les modalits du traitement.
Vingt ans aprs
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 299/307
Annexe G
Vingt ans aprs
Editorial du n doctobre 2003 de la revue Virologie. J M Huraux
Ce dbut danne, qui marque le 20
e
anniversaire de la dcouverte du virus du SIDA, est une ex-
cellente occasion pour tenter dtablir un bilan des acquis et des espoirs de la virologie, particuli-
rement dans ses applications mdicales.
Ce sont en effet deux publications de lanne 1983 qui ont signal le premier isolement du virus de
limmunodficience humaine, sous le nom de LAV, pour lymphadenopathy-associated virus. Ces
publications dans Science et dans Antibiotic and Chemotherapy avaient pour signataire en premi-
re position Franoise Barr-Sinoussi et J ean-Claude Chermann, respectivement, tous deux du la-
boratoire de Luc Montagnier lInstitut Pasteur de Paris. Cet isolement tait laboutissement des
travaux dun groupe de rflexion multidisciplinaire, associant cliniciens, virologistes et immuno-
logistes. Ds lors, la pratique de la virologie connt une impulsion sans prcdent. De solides ac-
quisitions ly avait assurment prpare avec, parmi les plus rcentes, la mise en place du
diagnostic rapide des infections respiratoires ou de lencphalite herptique, les premiers succs de
la chimiothrapie antivirale par lusage de ladnine arabinoside puis de laciclovir dans des infec-
tions ltales herpsvirus. Sur un plan fondamental, la dtermination de la squence complte du
gnome dun virus-phare tel que le SV40 avait ouvert la voie une comprhension approfondie de
la rplication et de la cancrogense virale.
Un des effets immdiats de la dcouverte du VIH fut dintroduire la rtrovirologie dans la pratique
de bien des laboratoires de virologie mdicale, les enrichissant en aptitudes techniques jusqualors
peu rpandues: la manipulation de culture de cellules en suspension pour isolement de virus lym-
photropes, la dtection de la transcriptase inverse, le travail en conditions de scurit renforce (la-
boratoires L2 ou L3). La gravit de linfection et de son diagnostic obligea faire passer dans la
pratique des tests des notions classiques mais souvent ngliges, comme les valeurs prdictionnel-
les positive ou ngative, les contrles de qualit, la confidentialit des rsultats, laccompagnement
psychologique de leur rendu.
Paralllement, la pratique des essais thrapeutiques sest trouve transforme par linstauration
dune vritable collaboration entre cliniciens, biologistes et mthodologistes tout au long du pro-
cessus, par la contribution des associations de malades, cela lchelle nationale ou internationale
et avec le soutien dorganismes comme les ACTG (AIDS clinical trial groups) aux Etats-Unis, le
MRC (medical research council ) en Grande Bretagne, lANRS (agence nationale de recherche sur
le SIDA) en France. Cette rigueur scientifique et ce respect des patients sont apparus trs rconfor-
tants aux virologistes qui, laube de la chimiothrapie antivirale, avaient eu lutter - au sein de
la commission du mdicament dirige par Marcel Legrain - contre la promotion, par des essais cli-
niques inqualifiables, dantiviraux aussi improbables que le virustat, lassur, le neutravir vieux
souvenirs.
Chemin faisant, des notions classiques qui nintressaient quune recherche damont sont passes
Vingt ans aprs
300/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
dans la pratique clinique: la quantification virale, rendue accessible par la PCR et ses variantes, la
dtermination des mutations de rsistance aux antiviraux grce lutilisation dautomates de s-
quenage, la variabilit des virus allant jusqu des quasi-espces au sein de chaque individu, tou-
tes notions sappliquant dautres virus que le VIH.
De fait, les avances obtenues dans le domaine du VIH ont profit ltude dautres virus, dont
certains fort proccupants en sant publique. Ce ft ainsi, pour le virus de lhpatite B, la dcou-
verte de lintervention dune transcriptase inverse dans sa rplication et, par l, de sa sensibilit
certains antiviraux actifs sur le VIH, le revers de la mdaille tant la variabilit gntique impor-
tante de ce virus ADN et ses consquences: slection de mutants rsistant aux antiviraux, de mu-
tants prC, de mutants S, ces derniers prendre sans doute en compte pour mener son terme la
campagne dradication de ce virus par la vaccination universelle.
Sur un plan fondamental, grce aux investissements en faveur du VIH, des progrs dcisifs ont t
obtenus dans ltude des interactions entre virus et cellules, avec lanalyse systmatique des parte-
naires cellulaires des diffrentes structures virales ou tapes de la rplication virale. La comprhen-
sion des cascades de signalisation ou des mcanismes dadressage intracellulaires, et de leurs
altrations par les virus, sen est accrue. Il nest jusqu ltude des antirtroviraux et de leurs effets
secondaires qui nait contribu approfondir nos connaissances sur la mitochondrie. Le dfi tou-
jours ouvert de la vaccination contre le VIH - puis celui de la vaccination contre le virus de lh-
patite C - a constitu un stimulant sans pareil pour limmunologie, en particulier limmunologie
cellulaire et limmunologie des muqueuses. Dailleurs, dautres virus restent, comme le VIH, en
attente dun vaccin: le virus respiratoire syncytial et tout particulirement le cytomgalovirus hu-
main, dont on a pu, ces derniers temps, dterminer comment, par un mcanisme de piratage de
gnes cellulaires, ce compagnon de lodysse de lespce humaine a trouv le moyen dchapper
nos dfenses immunitaires, et ce jour nos recherches dun vaccin efficace.
Cela tant, on peut se demander si les importants investissements consentis en faveur du VIH nont
pas nuis dautres secteurs de la virologie. La rponse est oui, invitablement, les ressources de
notre pays ntant pas illimites, en matire de crdits de fonctionnement, dquipement et, plus
significatif encore, de postes. Ainsi, ltude de certains virus moins dangereux - pour les pays ri-
ches - trouve assurment moins de doctorants et de post-doctorants quon pourrait le souhaiter. Ce
principe de ralit accept au nom de la sant publique, il reste reconnatre, toujours au nom de
la sant publique, que 1/ des lments dcisifs pour la lutte contre les virus les plus dangereux pour
lhumanit peuvent rsulter de ltude dsintresse de virus infectant les animaux infrieurs,
les plantes, les bactries, voire les ordinateurs 2/ que, dans lignorance o nous sommes des capa-
cits dexpansion ou de rebond de certaines infections virales apparemment contrles, il est sou-
haitable de maintenir certaines capacits dexpertise, chaque virus ayant ses particularits, dans le
domaine de la thorie comme de la pratique. Lactualit de la variole et de la fivre aphteuse nous
la rappel, tandis que lapparition du syndrome respiratoire svre confirme que toute famille vi-
rale est digne dintrt.
Dune faon gnrale, le maintien dune diversit des comptences en virologie est le garant dun
bon choix des stratgies, tant pour la recherche damont que pour les applications mdicales. Les
avances extraordinaires de la virologie molculaire, qui a permis la caractrisation tant attendue
du virus de lhpatite C, ne dispensent pas de la mise au point de systmes de culture in vitro et
dune amlioration des modles animaux. On peut noter qu lpoque o, par la force des choses,
la dtection des virus reposait sur lisolement des virus en culture de cellules, les virologistes se
voyaient rappeler journellement le pouvoir cytopathique des virus et, par exemple, nignoraient pas
leffet cellulo-dtachant, indpendant de toute rplication virale, des fortes concentrations dad-
Vingt ans aprs
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 301/307
novirus qui ont pu tre utilises imprudemment dans certains essais de thrapie gnique [mort de
ltudiant J esse Gelsinger, Philadelphie, USA, 1999]
Tout en reconnaissant lapport dterminant des techniques molculaires, bientt de biopuces, il im-
porte de ne pas perdre de vue la spcificit des virus, agents infectieux interfrant de faon parti-
culirement intime avec leur hte. Le test du RVA (recombinant virus assay) saffranchissant de
lisolement en cultures de cellules constitue, certes, un grand progrs en termes de praticabilit
pour ltude de la sensibilit de certains virus aux antiviraux (les virus difficilement isolables),
mais, se centrer trop exclusivement sur le gne cible de lantiviral, ce test molculaire nglige les
interactions de la totalit du gnome avec lensemble de la cellule. La synthse chimique du polio-
virus par lquipe de E. Wimmer, exploit spectaculaire, na pas pour autant rsolu certains probl-
mes encore poss par le pouvoir pathogne de ce virus, comme le mcanisme du syndrome post-
poliomylitique ou, plus proccupant en phase de prradication, les capacits de recombinaison
des poliovirus vaccinaux avec les autres entrovirus.
Enfin, un dernier lment a, naturellement, marqu lvolution de la virologie durant ces
20dernires annes, le facteur humain et ses ambivalences. Sur le versant sombre, ce ft la sous-
estimation de la contamination des donneurs de sang par le VIH, ce drame ayant, par contre coup,
conduit des applications irrationnelles du principe de prcaution. La plus dltre ft assurment,
chez nous, la remise en question du programme dradication du virus de lhpatite B sous prtexte
dun risque non dmontr de sclrose en plaques induit par la vaccination, alors que la France
compte plusieurs centaines de morts du fait de ce virus et que sa politique de sant influence, en
bien comme en mal, celle de pays francophones de haute endmicit.
Ce ft aussi lirresponsabilit de virologistes dvoys rpliquant la tonne le virus de la variole
1
pour en proposer au plus offrant, obligeant la communaut sinvestir nouveau dans ltude
dune maladie virale radique.
Il a fallut par ailleurs grer le got du paradoxe dun de nos plus brillants spcialistes de loncoge-
nse virale
2
, niant contre toute vidence le pouvoir pathogne du VIH. Cet amour de la controverse
a malheureusement rejoint lintgrisme de certains religieux hostiles lusage du prservatif, pour
encourager linaction vis--vis du SIDA et contribuer lhcatombe dans le sud de lAfrique.
Quant au strugle for life, irremplaable moteur du progrs scientifique, il na pas toujours t men
suivant les lois de la chevalerie. Lune de ses manifestations, fort mdiatise mais sans mort
dhomme, la controverse Luc Montagnier versus Robert Gallo sur lantriorit de la dcouverte du
VIH a toutefois pu tre arbitre comme on sait, grce au squenage du gnome de leur champion
respectif, LAV versus HTLV-III, la chronologie du Medline nayant, curieusement, pas t juge
suffisamment convaincante. Esprons que linjonction publish or perish et lhybris de lhomme de
science (qui nous a dj valu un virus informatique du mme nom) ne conduiront pas certains des
manipulations htives dans des conditions de scurit mdiocres sur des virus dangereux, attirant
sur lhumanit la vengeance des dieux. Incidemment, faut-il vraiment, par les temps qui courent,
sacharner dterrer le virus de la grippe espagnole qui a russi tuer plus de monde que nos glo-
rieux massacres de 14-18?
Ne sombrons pas dans le pessimisme car, sur le versant positif, que dinitiatives humaines encou-
rageantes depuis ces 20 dernires annes. Par exemple, il nest gure dquipe de virologie qui
nait investi dans la coopration entre le Nord et le Sud, dans le domaine mdical mais aussi dans
la recherche damont. Ainsi se sont cres des solidarits nouvelles, soit lchelle des continents
1. au centre Vector, prs de Novosibirsk
2. Peter Duesberg
Vingt ans aprs
302/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
par de vastes programmes internationaux, soit une chelle plus modeste par des actions ponctuel-
les, destines faire tache dhuile. Dans cet lan, certaines firmes pharmaceutiques, loppos de
la terrible ThreeBees de la fiction de J ohn Le Carr, ont ralis assez tt que la mise disposition
de mdicaments antiviraux gnriques au profit de populations dmunies, sous contrle dautorits
sanitaires locales honntes et efficaces, ne nuisait pas la recherche de nouvelles molcules. Le
got dinitiatives vise humanitaire dans la lutte contre les maladies infectieuses ne date certes
pas de la dcouverte du VIH mais ce genre dinitiative a incontestablement bnfici ds lors dune
multidisciplinarit inhabituelle, impliquant, aux cts des virologistes et des cliniciens, des experts
en mthodologie, en biomathmatiques, ou mme en sciences sociales.
En conclusion, pourquoi ne pas dire quau sein de la communaut scientifique les virologistes ont
dans leur ensemble, ces dernires annes, contribu la marche du monde vers une meilleure com-
prhension de la complexit des phnomnes biologiques mais aussi vers une plus grande ouver-
ture desprit et de cur vis--vis de diffrents composants de notre socit, homosexuels, usagers
de drogues, prostitu(e)s, citoyens du Tiers Monde, en lutte pour leur dignit.
Enfin, affranchissons nous du respect des bonnes manires et proclamons firement que la naissan-
ce en Francophonie, il y a 6ans, de la jeune revue Virologie a t un vnement merveilleux: loin
des scoops et des luttes dinfluence agitant les journaux scientifiques indice de notorit (impact
factor) crasant, cette revue originale a su cultiver en nous, avec la constance du jardinier, lamour
de tous les virus, de lhomme son ordinateur, en passant par llphant, lhutre, le ptunia ou le
freezia. Souhaitons-lui une adolescence radieuse.
Vingt ans aprs
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 303/307
Notes personnelles
Vingt ans aprs
304/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
valuation de lenseignement de la virologie. Anne 2007
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 305/307
Annexe H
valuation de lenseignement
de la virologie. Anne 2007
dcouper et remettre soit la loge du 91 pour les Prs Agut et Huraux, soit aux Matres de conf-
rences la fin des TP-ED.
Merci de prendre quelques minutes pour remplir ce questionnaire de faon individuelle. Lvalua-
tion et les critiques constructives de la part des tudiants vis--vis de leur enseignement jouent un
rle important pour amliorer celui-ci dans lintrt de tous.
valuation de lenseignement de la virologie. Anne 2007
306/307 Virologie - Jean-Marie Huraux 2006 - 2007
Les cours magistraux
Vous avez assist A : presque tous les cours B : environ la moiti
des cours C : deux ou trois cours* D : aucun cours*.
Globalement : A (a va bien) B (a peut aller) C (a ne va pas)
Citez les deux meilleurs cours.................................................................................
les deux moins bons......................................................................................
Que faut-il changer (points faibles) ?.......................................................................
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Que faut-il conserver (points forts) ?.......................................................................
Y a-t-il un sujet que vous auriez aim voir traiter et qui ne la pas t ? Lequel ?
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*Commentaires gnraux.......................................................................................
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Le polycopi
Globalement : A (a va bien) B (a peut aller) C (a ne va pas)
Citez les deux meilleurs cours................................................................................
les deux moins bons.....................................................................................
Que faut-il changer (points faibles) ?......................................................................
..............................................................................................................................
Que faut-il conserver (points forts) ?.......................................................................
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Y a-t-il un sujet que vous auriez aim voir traiter et qui ne la pas t ? Lequel ?
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Commentaires gnraux :.......................................................................................
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Les TP-ED
Globalement : A (a va bien) B (a peut aller) C (a ne va pas)
Citez les deux meilleurs TP-ED..............................................................................
les deux moins bons......................................................................................
Que faut-il changer (points faibles) ?.......................................................................
..............................................................................................................................
Que faut-il conserver (points forts) ?.......................................................................
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Y a-t-il un sujet que vous auriez aim voir traiter et qui ne la pas t ? Lequel ?
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Commentaires gnraux :.......................................................................................
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Remerciements
2006 - 2007 Virologie - Jean-Marie Huraux 307/307
Annexe I
Remerciements
La composition de ce polycopi doit beaucoup au travail de Mmes Marie-Christine PAPUCHON,
Isabelle COUSIN-BLANCHARD, Sylvie LETOFFE, Virginie RUBI, Cdrine FAURE, Pierre
VOUJ ON et de mon professeur danglais Andrew SHERWOOD. Que chacun(e) en soit remer-
ci(e).
Les auteurs sont trs redevables Vincent MORICE, Myrtha FLEURANTIN, Dominique HAS-
BOUN et Guy RICHART, du laboratoire de pdagogie et multimdia de la facult de Mdecine
Pierre et Marie Curie pour la mise sur internet de ce cours.

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