Rôle de la biologie des sols

en agriculture

par Lydia et Claude Bourguignon.

Directeurs du LAMS
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L’ENVIRONNEMENT PLANETAIRE

L’agriculture actuelle n’est pas pérenne car elle détruit les sols :
- En 6000 ans d’agriculture l’homme a créé 2 milliards d’ha de désert.
- Actuellement l’agriculture créé 10 millions d’ha/an de désert.
- Nous bétonnons 5 millions d’ha/an
- Pour compenser cette perte l’humanité déforeste 15 millions d’ha/an
de forêt tropicale.
- La surface agricole n’augmente plus
- La population augmente de 70 millions d’habitants/an

- Actuellement nous cultivons : 1,800 milliards d’ha pour 6,5 milliards d’habitants
Soit moins de 3000 m²/habitant.

- Les pays développés consomment 6000 m²/habitant.

- De ce fait 1 milliard d’habitants sont sous-alimentés.

Ce scandale ne durera pas éternellement !

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1
• Dans le monde 277 millions d’ha sont irrigués (2002 source FAO) sur 1,4
milliards d’ha de terre arable soit 20%. Cette irrigation est responsable de la
salinisation et la désertification de 8 millions ha chaque année.
• 3 pays (Inde Chine ,États-unis) représente 50% des surfaces irriguées totales
• 80% de la nourriture produite au Pakistan provient de terre irriguées
• 70% pour la Chine mais moins de 2 % pour le Ghana, le Mozambique
• En 2003, 2,7 millions d’ha de terres agricoles ont étés irriguées (soit 10% de la
surface agricole utilisée. En 1970 elle était de 0,8 million soit une augmentation
de 337%.
• En France l’agriculture comme dans le reste du monde consomme plus de 50%
de l’eau et jusqu’à 80% en été. Les régions irriguant le plus sont l’Aquitaine, la
vallée du Rhône ,la Beauce, le Pays de Loire et le Poitou- Charente.
• La quantité d’eau prélevée pour l’irrigation est estimée à 4,5 milliards de m3 en
2002 dont 3/4 proviennent des eaux superficielles. Rapportée à la surface
irriguée en France le prélèvement brut moyen correspond à 300mm d’eau par
an, ce qui est comparable aux apports annuels moyens de la pluie
(évapotranspiration déduite).
• Cette eau d’irrigation apportée en été présente 3 désavantages fondamentaux
– Elle salinise les sols
– Elle détruit la matière organique par accélération de la minéralisation
– Elle vide les rivières et les nappes phréatiques.

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L’EROSION ET LA MORT DES SOLS

La dynamique de dégradation d’un sol suit toujours
la même évolution :

- biologique : L’apport d’engrais et l’irrigation accélèrent la perte de la MO

qui nourrit la faune. Celle-ci disparaît et ne remonte
plus les éléments nutritifs

- chimique : Les éléments nutritifs se lessivent (Lixiviation des

ions) Pollutions des nappes et acidification des
sols

- physique : Le Calcium étant lessivé dans les nappes il ne fixe plus le

complexe argilo-humique.
- Erosion
- Dégâts environnementaux
- Rétrogradation minérale des sous-sols
- Chute des rendements.

Pour arrêter ce processus de dégradation du capital sol, il faut accomplir

Une vraie évolution verte
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2
Naissance du sol
Minérale Organique
Les roches La litière
Attaque
Attaque Plantes Plantes
des roches acidifiantes améliorantes
des roches
par les racines
par l’eau
et les microbes
de pluie et
qui secrètent
le climat Prêles, fougères Feuillus, graminées
des acides
Résineux, toxiques
Pierres
Attaque par la faune,
Pas de faune
Boulettes fécales
Sables
Attaque très lente par
Attaque très par
les champignons
les champignons

Limons
Polymérisation Polymérisation
Lessiv age d’une partie
des acides Sols acides Sols calcaires

Argiles Humus Humus Humus

Colloïdes- Mor Moder Mull
Colloïdes- Colloïdes- Colloïdes-

La
Lapédogenèse
pédogenèse
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Naissance du sol
Roche mère Litière organique

Dégradation physicochimique Dégradation biologique

et biologique

Argiles chargées Cations ayant deux Humus chargés

négativement Charges positives négativement
Ca++
Fe ++…

Complexe argilo-humique

La
Laformation
formationdu
ducomplexe
complexeargilo-humique
argilo-humique
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3
Maturation du sol

• A) Physique du sol.

– Texture.
– Surface interne des argile
– Structure

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Maturation du sol
B Chimique.
• 1 La géologie:
– Roches acides: 90% des roches du monde
– Roches calcaire : 7% des roches du monde
– Roches volcaniques: 3% des roches du monde

• 2 Composition chimiques des sols

– -En fonction de leur géologie et de leur profondeur les
sols contiennent plus ou moins d’éléments nutritifs :
calcium, phosphore etc ….
Ces éléments sont rendu assimilables par les
microbes

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4
 C biologie des sols
• -La faune

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C Biologique.
3 Les microbes.
Ils rendent les éléments du sol OXYDATION CHELATION

assimilables par 2 voies

NH4 + → NO3- Oligo éléments
Nitrates
+
S → SO4 - -
sulfates acide organique
synthétisé par les microbes
-- -
Pour « oxyder » ou « chélater » P → PO4
Phosphates R – C OO-
des éléments les microbes fixent
↓
l’oxygène sur les atomes
Chélat
Ex : Citrate de fer.
Pour fixer de l’oxygène Succinate de
fer..etc.
Il faut que le sol soit aéré
C’est la « faune »
qui aère les sols
•
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5
 Ce que l’on trouve dans 1 gramme de sol :

10 000 à 100 millions 10 millions à 10 milliards

d’actinomycètes de bactéries

1000 à 1 millions 10 000 à 1 millions de

100 à 10 000 algues
© 2009Lams,Marey sur Tille. de protozoaires germes de champignons

Plante Hu
rhize Le mi fic
sc
M yco ha ma tio n
Complexe pig pa r
non
Argilo-humique s
Ré trog
ra datio
n M in
éra lis
PO4 ion phosphate ation
m ic
robie
nne
Humus

Sol calcaire Sol acide 60%

pH > 7.5 pH < 5.5
Minéralisation
microbienne
Précipitation Précipitation Aspergillus, Penicillium…
avec le calcaire avec le fer

Phosphate de la roche
40%
Phosphate de fer
Apatite

Le
Lecycle
cyclebiologique
biologiquedu
duphosphore
phosphore

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6
 ATMOSPHERE
CO2
Photosynthèse
Respiration
Fixation Consommation

Bactéries Plantes
chimiolithotrophes Autres
organismes Bactéries

Transformation
Dans les marais Humification

TOURBE HUMUS SOL

Fossilisation

CHARBON
PETROLE ROCHES
CALCAIRES
CARBONATES

Le
Lecycle
cycledu
ducarbone
carbone
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N2O+ N2 Azote ATMOSPHERE

Ozone de la
stratosphère

Acide Fixation Fixation Fixation par

nitrique industrielle biologique Les éclairs

Pluies acides LEGUMINEUSES

PLANTES
2N4+
Ammonium

Assimilation
Assimilation SOL
Oxydation MICROBES
industrielle
Dénitrification Humification
microbienne microbienne

NO3
Nitrate NO2 N4+ HUMUS
Nitrite Ammonium
Lessivage dû
aux engrais Minéralisation microbienne de l’humus

Nappes
phréatiques
Le
Lecycle
cyclede
del’azote
l’azote
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7
Gestion de vos sols
• La fertilisation
B des plantes
• Dans l’atmosphère.

Elle fournit 94 % de la matière sèche.

3 atomes sont prélevés : C, O, H
Carbone : 44 % Photosynthèse
CO2 C6H 12O6
Oxygène : 44 % Respiration Sucres
O2
Hydrogène : 6 % H 2O
Eau de
pluie
-Le sol ne fournit que 6% de la matière sèche mais
28 atomes connus sont prélevés
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Gestion de vos sols

Sève élaborée sucres
Les cations + Énergie = ATP
Sève brute NO3-
+ + Na+PO4---
+
SO4--
H+ Mg++
+ ATP Ca++PO4---
Ca++ SO4--
K+ +
K+ SO4--
H+ H+ + ADPPO --- 4 K+ NO3-
Ca++
Ca++ anions fabriqués par
+ NO3-
+ les microbes et attirés
cations stockés dans le par les charges +
complexe argilo humique
© 2009Lams,Marey sur Tille. +
H+

8
 Gestion de vos sols
• Déséquilibre par les engrais
K+ + +
K+
ENGRAIS K
+ +
NO3- H2O
N turgescence
ATP
P K+ K+
K sels
+ Récolte diluée
K+ + ADP
Mg++
Ca++ K+ +
Mg++
+ K+ Ca++
Ca++ +
Manque de sucre Mg++
Carences induites
© 2009Lams,Marey sur Tille. Pourriture

Gestion de vos sols .

ENGRAIS TOXIQUES ENGRAIS NON TOXIQUES

Chlorures Oxydes Nitrates Sulfates Carbonates

KCl CaO KNO3 K2SO4 CaCO3

Chlorure Chaux Nitrate de Sulfate de Craie
de potasse potassium potassium

CaCl2 MgO NaNO3 MgSO4 MgCO3

Chlorure de Chaux Nitrate de soude Kiesérite Dolomie
calcium magnésienne

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9
 – En Europe plus 90% des eaux de surfaces et souterraines sont
pollués par les nitrates et en France 98% sont polluées par les
pesticides.

– Le vignoble et l’arboriculture sont très concerné par ce problème

car sur les 3% de la SAU qu’ils représentent ils consomment 30%
des pesticides.

– De plus l’agriculture européenne est surfertilisée en particulier en

potasse et en phosphore nos mesures montrent des réserves en
potasse et en phosphore pour plus de 3 siècles

– La population demande à l’agriculture de produire de la qualité et

de respecter l’environnement .Pour cela il faut apprendre à
fertiliser en fonction du sol et a diminuer les doses de pesticides.

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Gestion de vos sols

• La fertilisation.
A Du sol.
• Les amendements .
• Le compost: calcul des doses .

CEC sol surface= CEC argiles + CEC de la Matière

organique.

Pour arrêter l’érosion il faut que la

CEC des argiles ≈ CEC de la Matière organique

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10
 Gestion de vos sols
Du sol Des microbes De la faune De la vigne
Amendements Amendements Amendements Engrais

+ - - + et -
La CEC: - De la minéralisation: - Épigée:
• Engrais verts • Compost. • chimique.
•Humus : à C/N bas.
Compostage. - Anécique: • organique.
- De l’humification: • Compost .
•Les argiles: • Compost ( limités à
par le marnage. à C/N élevé - Endogée: l’exportation.
• enherbement )
•Les liens: - De la rhizosphère: hivernal.
- • association
Calcium(lithothamne) enherbement .
- Fer ( par le
basalte)

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Gestion de vos sols

Dans le sol
Les anions -

Leurs teneurs dépendent de l’activité biologique qui fournit

les -
400-
Activité
Biologique Sol normal
+ Sol en amélioration
+ Sol fatigué
+
100 - +

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Profondeur

11
 pH CEC MO P 2O5 K2 O MgO CaO
Analyse 0 cm Valeurs exprimée en ppm Indice
6.2 10.7 4.9 78 253 93 1765 AB =
classique
Conseil d’apport en kg/ha/3ans 19/20

30 cm 200 175 110 2000

Activité
Arg Bio =
Tests de terrain
6.5 Réserve utilisable en kg/ha 116/500
0 cm 6.2 10.7 4.9 250 1732 617 12007

Analyse M.O. Conseil d’apport en kg/ha/3ans

4.2 Activité
LAMS 30 cm 0 0 60 600 Bio =
Arg 6/50
8.8
6.2 9.5 1.4 200 175 50 1400
Profondeur des racines Gains sur 3 ans en kg/ha
M.O.
100 cm
© 2009Lams,Marey sur Tille. 0.7
 2 003 , LAMS, 21120 Marey sur Ti lle

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12
 Comment réparer les sols détruits
• Notre laboratoire développe depuis 1990 des
techniques agricoles pour restaurer les sols.
• Elles sont basées sur :
– L’apport de carbone en surface: Mulch
BRF
– L’emploi de plantes restauratrices de fertilité: semis
direct sous couvert
• Leur but est de relancer les champignons et la
faune qui sont les grand agents de la fertilité des
sols.

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Les petits agriculteurs en zone tropicale

Madagascar

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13
 Comparaison de l'activité biologique sur sol de la Réunion

2000

1800

1600
AB µg PNP/g sol sec/heure

1400

1200

1000

800

600

400

200

0
0-5cm 5-10cm 40-50cm 80-100cm 130-150cm

Forêt vierge 1952 900 425 570 605

Jachère d'acacia 4230 2018 530 125 100
6 ans de culture 925 520 420 330 315
30 ans de culture 180 220 250 110 155
1 an SDSC après 30 ans 350 370 300 90 220

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Comparaison de l'activité biologique sur sol ferralitique (Brésil)

en fonction de la profondeur et de la culture
700

600
AB µg PNP/g sol sec/heure

500

400

300

200

100

0
0-5cm 5-10cm 10-20cm 20-40cm 40-100cm 100-150cm

Forêt 629 208 190 114 9 5

Forêt dégradée 159 138 98 72 39 27
18 ans de culture 79 63 31 34 9 12
1 an SDSC après 18ans 202 50 40 32 35 10

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14
 Evolution de l'activité biologique suivant la saison des pluies et la saison sèche
au Mato Grosso (Brésil)
700

600
AB µg PNP/g de sol sec/heure

500

400

300

200

100

0
Septembre Novembre Février
Forêt 119 292 629
Forêt dégradée 149 226 159
Plante de couverture 68 142 202
Soja 29 36 24

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Maturation du sol

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15
 Evolution des activités m icrobiologiques des sols
en fonction du travail du sol.

u g d e P N P /g d e 350
300
b io lo g iq u e e n
s o l s e c /h
250
A c tiv ité

200
150

100

50
0
0-5 cm 5-10 cm 10-30 cm 30-60 cm 60-100 cm
Horizo ns

Rôtis T.C.S. 8ans Rôtis labour

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Com paraison de l'acticité biologique entr e le labour et le sem is direct

Par celle : Le Parc

4 50

4 00
Activité biologique

3 50

3 00

2 50

2 00

15 0

10 0

50

0
f é vr - ma a v r- ma i- ju i n- jui l - a oû t - se p t - oct- n ov- dé c - ja nv - f é v r- ma a v r- m a i- j u in -
04 rs - 0 4 04 04 04 04 04 04 04 04 04 05 05 rs - 0 5 05 05 05

Le Parc SD Le Parc labour

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16
 Activité biologique en µg PNP/g de sol sec/h T au x d 'h u mid ité en %
15
/0 15
3 /0
2

0
50
100
150
200
250
300
350
400
450
0 5 /2 0 /2

0
5
10
15
20
25
30
00
/0 00 29 4
5/ /0
2/
0 1 2 00 20
/0 0 14 04
7 /0
3/
25 20 20
/0 00 28 04
9 /0
0 1 /2 0 3/
20
/1 00 04
1 11
/0
0 1 /2 0 4/

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© 2009Lams,M arey sur Tille.
/0 00 20
1 25 04
0 1 /2 0 /0
4/
/0 01 20
3 09 04
0 1 /2 0 /0
5/
/0 01 20
5 23 04
0 1 /2 0 /0
/0 01 5/
7 20
06 04
0 1 /2 0 /0
/0 01 6/
9 20
20 04
0 1 /2 0 /0
/1 01 6/
1 20
04
0 1 /2 0 04
/0

Le parc SD
/0 01 7 /2
1 00
0 1 /2 0 18
/0 4
/0 02 7 /2
3 00
0 1 /2 0 01 4

Semis direct
/0 02 /0
5 8 /2
00
0 1 /2 0 15 4
/0 02 /0
7 8
/2
0 1 /2 0 00
/0 02
29
/0 4
Parcelle : Le Parc

9 8
/2
0 1 /2 0 00
/1 02
12
/0 4
1 9
/2
0 1 /2 0 00

Labour
/0 02 26 4

Comparaison de l'a ctivité biologique

1 /0
Le Parc labour

9/
0 1 /2 0 20
/0 03 10 04
3 /1
0/
0 1 /2 0 20

d'un sol séchant entre le labour e t le semis direct.

/0 03 24 04
5 /1
0/
0 1 /2 0 20
/0 03 07 04
7 /1
0 1 /2 0 1/
20
/0 03 21 04
9 /1
0 1 /2 0 1/
20
Evolution du taux de matière sèche entre le labour et le semis direct

/1 03 04
1 05
/1
0 1 /2 0 2/
/0 03 20
2/ 19 04
20 /1
2/
04 20
04

17
 % h u m id it é
15
/ 03

0
2
4
6
8
10
12
14
16
/
05 2 00
/0 0
5/
2
01 00 0
/07
25 2 00
/0 0
9/
01 2 00
/1 0
1/

© 2009Lams,M arey sur Tille.

© 2009Lams,M arey sur Tille.
01 2 00
/ 01 0
/
01 2 00
/0 1
3/
01 2 00
/ 05 1
/2 0
01
/0 01
7/
01 2 00
/0 1

Introduction.
9/
01 2 00
/ 11 1
/
01 2 00
/0 1
1/

Taux d'humidité SD
01 2 00
/0 2
3/
01 2 00
sur un sol séchant

/ 05 2
/
01 2 00
/0 2
7/
20
01 0
/ 09 2
/
01 2 00
/1 2
1/
01 2 00
2
Taux d'hum idité labour

/0
1/
01 2 00
/ 03 3
/
Comparaison du taux d'humidité en fonction des pratiques culturales

01 2 00
/0 3
5/
01 2 00
/ 07 3
/
01 2 00
/0 3
9/
01 2 00
/1 3
1/
20
03

18
Matériel et méthodes
1 - Situation géographique des domaines.

Domaine de Mas Amiel.

Sol superficiel calcoschisto sableux: argile 23%,limon27%,sable 50%
Pluviométrie:450mm /an

Domaine Podere Forte.

Sol superficiel calcoschisto sableux: argile 26%,limon33%,sable 42%.
Ce sol a été très perturbé lors de l’installation du vignoble
Pluviométrie:700mm /an

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Analyses et Protocoles
1. Analyses

– Activité biologique mesurée selon la méthode

Tabatai 1982 agronomy n°9 part 2
– Faune comptée selon la méthode Berlèze Tullgren
1918
– L‘humidité du sol est mesurée par dessiccation du
sol à 105°c
2. Protocole.

– Mas Amiel
– La Tour figeac
– Podere forte.
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19
 Résultats
1. Sol sablo-schisteux:400mm/an
Figure 4 : Moyenne de l'activité biologique, de la faune et de
la teneur en eau sur l'année 2006/2007
450 14,0
407
400
11,6 12,0

350
310 9,6 10,0
300

Teneur en eau en %
µg PNP/g sol sec et par heure
Faune du sol en millions/ha

8,0
250
6,8 6,6

200
6,0
151
150
126
108 4,0
100
100
59
42 2,0
50

0 0,0
Rien inter rang BRF inter rang Rien Rang BRF Rang

© 2009Lams,M arey sur Tille. Activité biologique Faune du sol % Eau

Résultats.
3 . Sol sablo-schisteux:700mm/an
Figure 1 : Comparaison de l'activité biologique sur sol argileux
en fonction du temps
160

137
140

120
µg PNP/g sol sec/heure.

100 92
84
80 70
65

60
44 45
39
40

20

0
Sol nu BR F sur le rang

19/03/2006 22/04/2006 10/06/2006 05/07/2006

© 2009Lams,M arey sur Tille.

20
Résultats.
3 . Sol sablo-schisteux:700mm/an
Figure 2 : Comparaison du taux d'humidité sur sol argileux
en fonction du temps
20,0
18,3
17,9
18,0

16,0 15,4
14,3
13,9
14,0

12,0
10,7
% eauu

10,0

8,0

6,0 5,2 5,6

4,0

2,0

0,0
Sol nu BRF s ur le rang

19/03/2006 22/04/2006 10/06/2006 05/07/2006

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Résultats.
3 . Sol sablo-schisteux:700mm/an

Figure 4 : Effet du BRF sur la température à 2 profondeur

40
3 8,5
38

36
34 ,5

34
Tem pérature °C

32

30 29 ,4

2 7,8
28
2 6,6 26, 4
26
24,5
24 22 ,9

22

20
Sans BRF à 5cm Avec B RF à 5cm Sans BRF à 10 cm Avec BRF à 10 cm

à 15 h à 18 h

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Gestion de vos sols
• Influence de la biodynamie.
C Biologie
COMPARASON ENTRE BIOLOGIE ET
BIODYNAMIE

500
Activité biologique.

400
300
200
100
0
0-5 cm 5-10 cm 10-25 cm 25-60 c m 60-100 cm
Profondeur

Biologie Biody namie

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Gestion de vos sols

• Influence de la biodynamie.
A Chimique.
a Les éléments

Les éléments
Biologique Biodynamique
(exprimé en ppm)
Phosphore surface 258 198
P2O5 fond 9 97
Potassium. surface 726 672
K2O fond 242 402
Magnésium. surface 241 246
MgO fond 159 199
Soufre. surface 40 23
SO4 fond 10 43
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Gestion de vos sols
Influence de la biodynamie
A Chimique.
b Les oligo éléments

Les oligoéléments
Biologique Biodynamique
(exprimé en ppm)
surface 14.7 10.8
Zinc
fond 0.8 4.2
surface 29.3 26.6
Fer
fond 14 25.9
surface 5.5 5
Manganèse
fond 1.5 5.6
surface 82 81
Cuivre
fond 81 48
surface 0.8 0.8
Bore.
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fond 0.5 0.5

Nous vous remercions pour votre

attention.

Laboratoire d’Analyses
Microbiologiques des Sols
5 rue de Charmont .
21120 Marey sur Tille
Contact@lams-21.com
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