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• Fossiles
– Différents types (restes, empreintes, traces
d’activité biologique du passé)
• Biocénose (êtres vivants coexistant dans un
espace défini)
• Paléobiocénose (Assemblage de fossiles)
• Thanatocénose (histoire post-mortem des
être vivants)
• Taphonomie (processus de la fossilisation,
entre la biocénose et la thanatocénose)
– Necrolyse
– dissolution
– diagenèse
RETOUR SUR LA SEMAINE DERNIÈRE:
2
Informations palébiologiques
Paléobioénose
Thanatocénose
Enfouissement...
Taphonomie
Érosion
Cours 2 – Les débuts de la vie sur terre
2a: Les origines de la vie
Quelques hypothèses
L’évolution de l’atmosphère
Les premières cellules : les monères ou procaryotes
Vestiges de la vie les plus anciens (et les plus simples): les
monères ayant contribué à l’édification de biohermes
Début de la vie
Milieu azoïque
LE PRÉCAMBRIEN
Émergence de la vie
Précambrien
6
Campbell, 1995
L'origine de la vie : l’une des plus grandes énigmes….
Quelques hypothèses
« Créationnisme »
-Théorie de la génération spontanée
-L'ontogénèse (Antoine van Leeuwenhoek)
-Théorie de l’évolution (Lamarck, Darwin)
-Panspermie (cf. Richter, Kelvin, fin du XIXème et début du XXème)
-Hypothèse d'Oparin & Haldane ("bouillon primitif"; 1925-1930)
Expériences de Miller et Urey (1953).
-Hydrothermalisme (cf. Corliss 1981)
-Chimie de surface (ou catalyse hétérogène) (cf. Cairns-Smith 1974)
-Chimie prébiototique et ARN
-Endosymbiose (cf. Margulis, 1970)
Créationnisme : XVI-XVème siècle
La création divine
“Théorie” créationniste
Au sens large, dieu à créé l’univers et la vie
Pas d’évolution!
Les expériences de Francesco Redi (1668): Seule la vie peut donner la vie
(expérience de morceaux de viande en putréfaction)
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Ontogénèse : développement de l’individu de la fécondation à l’âge adulte
James Hutton
(1726-1797)
James Hutton s’opposait au catastrophisme de Père de la géologie
George Cuvier…
Biostratographie et catastrophisme
La théorie de l’évolution
Théorie publiée en 1809 (Philosophie zoologique )
(année de naissance de Darwin)
Toujours plausible…
Près de 100 kg de fragments ont été récoltés rapidement (faible risques contaminations)…
Protéines terrestres
l’ADN et de l’ARN (matériel génétiques des êtres vivants sur Terre)
D-valine L-valine
Mais….
Ces acides aminés aurait été formés de façon abiotique, de configuration
différente de celle des AA terrestres!? (réactions chimiques dans l’espace?!)
Note:
On a trouvé aussi des substance complexe d'alcanes (hydrocarbures saturés; CH) similaire à celle trouvée dans l'expérience de Miller-Urey
synthétisés en laboratoire à l'aide d'un mélange de méthane, d'azote, d'eau et d'ammonium,
Théorie de la panspermie:
cheminées
Les études des années 1980 indiquent que l’ARN peut servir de
de code génétique en dépit de l’absence de protéine-enzyme et
la formation des macromolécules d’ARN et leur réplication
peuvent se faire dans les argiles.
26
26
Température de l’océan
(Robert et Chaussidon, Nature 2006)
27
Origine et composition chimique de l’atmosphère
L’air contient:
21 % d’oxygène (O2)
78 % d’azote (N2) et
H2O
L’atmosphère
Condensation + pluies
N2
primitive
CO2
Précipitation, dépôts
Dégazage
Océans
L’atmosphère X
H2O
Condensation + pluies
N2
XCO2
Précipitation, dépôts
O2
O2
Sédiment ?
La vie terrestre? 2 milliards d’années
Rayonnement UV
O3
OZONE O3 O3 O3 O3 O3
O3 O3 O3
O3 O3 O3
Ozone : quelques ppm à basse altitude O3 O3 O3
jusqu’à 12 ppm vers 30 km d’altitude.
L’atmosphère
O2
O2
X
H2O
Condensation + pluies
N2 O2
O2
XCO2
Précipitation, dépôts
O2
O2
Sédiment ?
À quoi ressemblait l’atmosphère primitif?
Composition semblable à celle des émissions volcaniques! ou cosmiques!
(N2 (azote), CO2, H2O (vapeur d’eau), CH4 (méthane), NH3 (ammoniac), et H2
(hydrogène)
John Haldane
Généticien anglais
(1892-1964)
Formation de coacervats à
métabolisme rudimentaire.
Sidney Fox, 1957
Microsphères synthétisées au laboratoire par mélanges des acides aminés
« BOUILLON PRIMITIF » (OPALIN ET HALDANE)
Source d’énergie
Source d’énergie
composés dissous
C-H-O-N Source d’énergie
http://www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/s4/origine.vie.html
Test du « bouillon primitif » par Miller et Urey en 1953
Vérification in vitro
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L’expérience de Urey et Miller a été reproduite des centaines
de fois avec des variantes
Gaz de l’atmosphère
Primitif (hypothèse):
vapeur d’eau (H2O) Décharges de Décharges
Méthane (CH4)
60 000 volts de 60 000
Ammoniac (NH3) volts
Hydrogène (H2)
Monoxyde de carbone (CO)
etc.
Sources d’énergie:
éclairs, foudre, chocs Condensation
thermiques (volcanisme), UV
et vent solaires, rayons X et
rayons gamma
On arrive a synthétiser des acides aminés très simples (Soit 10 des 22 qui
existent dans les protéines actuelles).
En plus……..
-Météorites?
CH4 NH3
N2
H2O
CO2 O2
Présence de O2 dans les océans, sinon la précipitation du fer n’est pas possible.
Le fer ferrique (Fe3+) est insoluble dans l’eau contrairement au fer ferreux (Fe2+)
Oxygène dans l’atmosphère
CO2 + H2O + énergie solaire CH2O (hydrate de carbone) + O2
Plus de 3 Milliards d’années entre les premières molécules organiques
et la vie pluricellulaire !
Ozone
Monères ~ 4 Ga
Les monères : cellules procaryotes
• LES PROCARYOTES - MONERES
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LES PREMIÈRES CELLULES: LES PROCARYOTES
= Eubacteria = Archaeobacteria
membrane cellulaire avec acide membrane cellulaire monocouche de
muramique. composition distincte (glycerol-ester).
Chimiotrophes, hétérotrophes ou Extrêmophiles (chaud, froid, acide;
autotrophes halophile), méthanogènes, milieux
anaérobies 50
50
Les archaebactéries: vivent dans des milieux hostiles.
Formes adaptées à des conditions extrêmes comme les source hydrothermales avec tapis de bactéries thermophiles
Nanoarchaeum equitans sur son hôte, Ignicoccus (autre Halobacteria sp. (~ 5 µm) – espèce halophile
archaea des sources hydrothermales marine)
Les eubactéries (bactéries): milieux moins hostiles.
Chimiotrophes, hétérotrophes ou autotrophes
• EX EUBACTÉRIES (= bactéries)
Escherichia coli
Anabaena sperica, une
cyanobacterie filamenteuse
EUBACTÉRIES (= bactéries)
• Se distingue des Archaea par leur ARN et leur membrane cellulaire complexe
• Ubiquistes (occupent la plupart des milieux)
• Constituent la plus grande partie du vivant (en nombre, et en masse)
• Jouent un rôle important sur le cycle de N et du S et sur le recyclage des
déchets organiques
• Certaines sont phototrophes, d’autres chimiotrophes ou hétérotrophes
vs.
ARCHAEBACTÉRIES
• Se distinguent des bactéries par leur ARN et leur membrane cellulaire
monocouche (glycerol-ester).
• Extrêmement résistantes (extrêmophiles): milieux chauds, froids, basiques,
hyperhalins, anaérobies, résistentes au UV.
• Tolèrent des milieux dépourvus de lumière.
• Pourraient représenter jusqu’à 30% de la biomasse.
LES PREMIÈRES CELLULES: LES PROCARYOTES
ARCHAEBACTÉRIES EUBACTÉRIES
vs.
EUCARYOTE (apparition ~1.5 Ga) (10-100 µm)
55
Premiers organismes:
les monères
= procaryotes
~ Eubactéries et
archées
Absence de mitochondries
(particules cytoplasmiques
associées à la respiration
intracellulaire),
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On ne peut discuter de la vie au Précambrien sans parler des stromatolites:
structures organo-sédimentaires construites par les cyanobactéries.
- Définition
- Distribution stratigraphique
Importance en paléontologie:
Premières traces de vie sur Terre
Susceptibles de nous renseigner sur l'histoire des bactéries
Les formations stromatolitiques ont constitué un volume impressionnant de
calcaires (CaCO3) à certaines époques du précambrien et, donc séquestration
du CO2, modifiant ainsi l'atmosphère terrestre
Traceurs Paléoenvironnementaux
• LES STROMATOLITES
63
Protérozoïque
(dolomie à
stromatolite)
~ 2.6 Ga
Archéen
(gneiss, lave)
Baie d’Hudson
• LES STROMATOLITES
65
Stromatolites d’Afrique du Sud-est Stromatolites d’Australie
Jusqu’à la fin des années 1950, on arrivaient mal à expliquer l'origine de
telles structures.
les plus anciens êtres vivants connus et qui sont de la même lignée depuis
3,5 milliards d’années.
Photosynthèse
CO2 + H2O = CH2O + O2
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Les mécanismes de formation des stromatolites
Filaments
cyanobactériens
2 emprisonnant des
particules sédimentaires
Filaments
1 Cyanobactériens
et bactéries
70
• LES STROMATOLITES
71
• MORPHOLOGIES EN FONCTION DE L’ENVIRONNEMENT
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• LITTORAL Ex. Dômes subsphériques
• LITTORAL Ex. Formes columnaires
• LITTORAL Ex. Formes columnaires
http://stromatolitesgl2019.wordpress.com/anatomy/
• LITTORAL Ex. Formes planaires et ondulées
http://stromatolitesgl2019.wordpress.com/anatomy/
• HAUTE ÉNERGIE Ex. Oncolithes
Oncolites: (de onkos = nodule) nodule ou oncoïde formé dans les eaux marines
ou lacustres par encroûtement autour d'un débris (nucléus).
* PAS NÉCESSAIREMENT BIOGÉNIQUES
• HAUTE ÉNERGIE Ex. Oncolithes
Importance des stromatolites au Précambrien
Phanérozoïque
Acmé
Précambrien
Cyanophytes
Début de la
vie sur terre
Acmé des stromatolites
à la fin du Protérozoïque 80
Les stromatolites au Précambrien:
abondants (pas de compétition – les monères représentaient pendant longtemps les
seules formes de vie).
Photosynthèse:
CO2 + H2O + énergie solaire CH2O (hydrate de carbone) + O2
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Distribution connue des stromatolites précambriens
82 82
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Shark Bay, Australie
Shark Bay à marée basse : formes columnaires coalescentes
Croissance annuelle d’environ 0,4 mm/an
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Stromatolites actuels : milieux hyperalcalins d’Afrique de l’est
87 87
Les différents types de stromatolites et de cyanophytes en relation
avec le milieu
des stromatolites
Procaryotes à
l’origine des
stromatolite
APPLICATION PALÉOÉCOLOGIE: PALÉOHYDROLOGIE
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APPLICATION PALÉOÉCOLOGIE: PALÉOHYDROLOGIE
STROMATOLITE
SUBSPHÉRIQUE
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APPLICATION PALÉOÉCOLOGIE: PALÉOHYDROLOGIE
91
APPLICATION PALÉOÉCOLOGIE: PALÉOHYDROLOGIE
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EXEMPLE SPÉCIMEN
3ième génération
Hyatus
Laminations columnaires
2ième génération
Oncolithes
Laminations planaires