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Avant Beijerinck
1. Histoire des virus
Biologie I Après Beijerinck
Acide nucléique
Structure et Enzyme
2. Qu’est-ce qu’un virus ?
fonctionnement Capside
Enveloppe
Océans
Écosystème
Forêt
3. D’où proviennent les virus ? Démographie
Contacts
Comportement Alimentation
Déplacements
101-701-RE
VIH
Virus 4. Étude de cas
SRAS-CoV2
Chapitre 19
F R É D É R I C D E M E R S, I S A B E L L E T R E M B L A Y, O L I V I E R D’ A M O U R S Prévention
Hiver 2021
Mesures
5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccins
3 4
Avant Beijerinck Avant Beijerinck
1. Histoire des virus 1. Histoire des virus
Après Beijerinck Après Beijerinck
Capsomères
Bactérie (protéines formant la capside)
7 Acide nucléique 8
Structure de base d’un virus Structure et Enzyme
2. Qu’est-ce qu’un virus ?
(avec membrane) fonctionnement Capside
Spicules Enveloppe
(glycoprotéines
situées sur 1 Récepteur
enveloppe ou sur la 1. Attachement virus-cellule hôte
capside) 2 Génome
2. Pénétration et décapsidation viral
Enzymes
Ex.: Transcriptase
Capside inverse 3.Réplication 4.Synthèse 4 3
du génome des protéines
viral virales
5
Acide nucléique
5. Assemblage
(ARN ou ADN)
6
Enveloppe 6. Libération
Capsomères Protéines
(protéines formant la capside) membraneuse virales
9 10
1 2. Qu’est-ce qu’un virus ? Virus à ARN
2. Qu’est-ce qu’un virus ? Virus à ADN
6 6
5. Assemblage
6. Libération
Océans 11 Océans 12
Écosystème Écosystème
Forêt Forêt
3. D’où proviennent les virus ? Démographie 3. D’où proviennent les virus ? Démographie
Contacts Contacts
Comportement Alimentation Comportement Alimentation
Déplacements Déplacements
Les virus sont présents les écosystèmes :
• Dans les océans, il y a environ dix millions de virus /ml. Rôles des écosystèmes:
• si vous allez près d’un lac et que vous prenez de l'eau • Les virus participent aussi au maintien de la biodiversité
entre vos deux mains, vous tenez plus de virus qu’il y a des écosystèmes aquatiques et facilitent le brassage
d'humains sur Terre - Sylvain Moineau (UL) génétique.
• Les virus voyagent dans l’air. Il « pleut » quotidiennement • En laboratoire, les virus sont également utiles pour
800 millions de virus / m2 de surface terrestre (Curtis Suttle). effectuer de fines manipulation sur les cellules.
• La grande majorité des virus ne sont pas dangereux • Les virus jouent donc aussi des rôles très positifs
• Les milieux possédant plus de biodiversité et étant les moins dans les écosystèmes et en recherche.
modifiés par l’Homme contiennent un grand nombre de virus
pouvant potentiellement franchir la barrière des espèces et
nous nuire:
• Sud-Est de l’Asie
• Afrique Centrale
• Amérique du Sud
Océans 13 Océans 14
Écosystème Écosystème
Forêt Forêt
3. D’où proviennent les virus ? Démographie 3. D’où proviennent les virus ? Démographie
Contacts Contacts
Comportement Alimentation Comportement Alimentation
Déplacements Déplacements
Augmentation de la
taille de la population
Besoins
grandissants
Pression sur
Déplacements
les
rapides
écosystèmes
4-5 nouvelles
Changements Émergence de
maladies
climatiques nouveaux virus
infectieuses/an.
Océans 15 16
Écosystème VIH Virus: VIH:
Forêt 4. Étude de cas Virus de l’Immunodéficiente Humaine
3. D’où proviennent les virus ? Démographie SRAS-CoV2 Maladie : SIDA:
Contacts Syndrome d’Immunodéficience acquise
Comportement Alimentation
Spicules
Déplacements
Manuguerra, 2004, Pour la science, 317.
Enzymes
(Transcriptase inverse)
Capside
ARN du VIH
Capsomères Enveloppe
(protéines formant la capside) membraneuse
17 18
VIH VIH Réplication d’un
4. Étude de cas 4. Étude de cas rétrovirus
SRAS-CoV2 SRAS-CoV2 (VIH)
Réplication d’un
rétrovirus
(VIH)
19 20
Virus: VIH:
VIH VIH Virus de l’Immunodéficiente Humaine
4. Étude de cas 4. Étude de cas
SRAS-CoV2 SRAS-CoV2 Maladie : SIDA:
Syndrome d’Immunodéficience acquise
Capside
ARN du SRAS-
Cov2
Capsomères Enveloppe
Hartenberger, 2020, Pour la science. (protéines formant la capside) membraneuse
21 22
VIH VIH
4. Étude de cas 4. Étude de cas
SRAS-CoV2 SRAS-CoV2
Protéine membranaire
ACE2
23 24
VIH Provoque la libération massive de Prévention Mesures
4. Étude de cas cytokine (orage de cytokines) qui 5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccin
SRAS-CoV2 induit une réaction inflammatoire :
1. Vasodilatation des vaisseaux sanguins entraîne une… 1. Quels sont les rôles de la science ?
2. Libération de liquide dans les tissus (ex.: poumons) ;
a. Recherche fondamentale: en connaître le maximum sur le
3. Baisse de la pression sanguine (moins de liquide dans le sang) ; vivant (fonctionnement, mécanismes, structure, interactions,
4. Les poumons se remplissent de liquide, ce qui diminue les échanges gazeux ; liens écosystémiques, etc.)
5. Les organes manquent d’O2.
b. Recherche appliquée: proposer des solutions (vaccins,
6. Les cytokines provoquent aussi la coagulation dans les petits vaisseaux sanguins. médicaments, traitements, etc.)
7. Les cytokines provoquent aussi un choc toxique pour le cœur.
c. Conseiller: proposer des plans d’action basés sur la
connaissance: recherche, prévention et traitement
2. Quels sont les rôles des citoyens et du politique ?
a. Être au courant des avancées de la science.
b. Poser des questions.
c. Prioriser et faire des choix.
25 26
Prévention Mesures Prévention Mesures
5. Quelles leçons tirer ? Recherche 5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccin Traitement Vaccin
SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2 SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2
(2003) recommandations ? (2020) (2003) recommandations ? (2020)
2000 2005 2010 2015 2020 2000 2005 2010 2015 2020
27 28
Prévention Mesures Prévention Mesures
5. Quelles leçons tirer ? Recherche 5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccin Traitement Vaccin
Recommandations «Bien qu’elle reste dans une large mesure Recommandations « Les économistes et les analystes du
mystérieuse et véritablement énigmatique, marché s’efforcent dans le même temps de
de l’OMS de l’OMS
elle a clairement montré sa capacité à se chiffrer les coûts présents et futurs de la
(2003) propager le long des voies internationales (2003)
maladie, coûts initialement estimés à 30
du transport aérien. » milliards de dollars rien que pour l’Extrême-
Orient. »
SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2 SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2
(2003) recommandations ? (2020) (2003) recommandations ? (2020)
2000 2005 2010 2015 2020 2000 2005 2010 2015 2020
29 30
Prévention Mesures Prévention Mesures
5. Quelles leçons tirer ? Recherche 5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccin Traitement Vaccin
Recommandations « plusieurs raisons de tenir le SRAS pour Recommandations « Les priorités scientifiques immédiates
de l’OMS une menace extrêmement sérieuse. La sont la mise au point d’un test de
de l’OMS
principale étant qu’il n’existe ni vaccin ni diagnostic adéquat et fiable, une meilleure
(2003) (2003)
traitement, ce qui contraint les autorités connaissance des modes de transmission
sanitaires à revenir à des outils de contrôle et la mise au point d’un traitement efficace.
datant des premiers temps de la Si… la maladie devient endémique, l’OMS
microbiologie empirique : isolement et et ses partenaires internationaux devront
quarantaine. » s’engager dans une lutte longue et
difficile..»
SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2 SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2
(2003) recommandations ? (2020) (2003) recommandations ? (2020)
2000 2005 2010 2015 2020 2000 2005 2010 2015 2020
31 32
Prévention Mesures Prévention Mesures
5. Quelles leçons tirer ? Recherche 5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccin Traitement Vaccin
Recommandations “Scientists were close to a coronavirus Recommandations “Scientists were close to a coronavirus
de l’OMS vaccine years ago. Then the money dried up. de l’OMS vaccine years ago. Then the money dried up.
We tried like heck to see if we could get investors We tried like heck to see if we could get investors
(2003) or grants to move this into the clinic. (2003) or grants to move this into the clinic.
We just could not generate much interest," a We just could not generate much interest," a
researcher said of the difficulty in getting funding researcher said of the difficulty in getting funding
to test the vaccine in humans” to test the vaccine in humans”
NBC news 2020 NBC news 2020
SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2 SRAS A-t-on suivi les SRAS-Cov2
(2003) recommandations ? (2020) (2003) recommandations ? (2020)
2000 2005 2010 2015 2020 2000 2005 2010 2015 2020
33 34
Prévention Mesures Prévention Mesures
5. Quelles leçons tirer ? Recherche 5. Quelles leçons tirer ? Recherche
Traitement Vaccin Vaccin
Traitement
Facteurs influençant le R
1. Nombre de cas initiaux 1. Financer la recherche fondamentale : connaître
2. Mœurs sociales
3. Mesures gouvernementales
(distanciation sociale, déplacements, etc.) 2. Financer la recherche appliquée: traiter (vaccin)
4. Protection indirecte d’autres vaccins
5. Groupes sanguins
6. Autres facteurs à trouver
3. Être patient
4. Décloisonner la science
5. Faire de l’intégration
6. Prévenir plutôt que réagir: recherche
fondamentale et protection de la biodiversité
7. Se coordonner: être solidaires et travailler
ensemble