Lawane Memoire Valide Copie

REPUBLIQUE DU CAMEROUN REPUBLIC OF CAMEROON
Paix-Travail-Patrie Peace-Work-Fatherland
MINISTERE DE MINISTRY OF HIGHER

L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR EDUCATION
UNIVERSITE DE NGAOUNDERE UNIVERSITY OF NGAOUNDERE
INSTITUT UNIVERSITAIRE DE TECHNOLOGIE DE NGAOUNDERE

B.P.: 455 NGAOUNDERE
TEL: 77512108 /77112217/74916057
dstages2004@yahoo.fr
Division des stages de la Formation Permanente et des Relations avec les
milieux Professionnels
Mémoire de fin d’études en vue de l’obtention du Diplôme Universitaire de Technologie
(DUT) à l’Institut Universitaire de Technologie (IUT) de N’Gaoundéré
MENTION: Génie Biologique
PRÉVALENCE DU VIH CHEZ LES ENFANTS EXPOSÉS AGÉS DE 4 A 72

SEMAINES, SUIVIS AU CENTRE MERE ET ENFANT DE LA FONDATION
CHANTAL BIYA: CAS DE DIAGNOSTIC PRÉCOCE
PARCOURS : ABB
Effectué du 11 Avril au 28 Juin 2022

Au Centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya (CME/FCB)
Par
LAWANE DYA
Encadreur industriel Matricule : 20B058IU Encadreur école

M. NGOYA Roger Dr. AGUME NTSO Aurélie
Doctorant PhD en Immuno- Solange
hématologie
Année académique 2020 - 2021 Chargée de Cours à l’IUT de
RAQ au CME/FCB
Ngaoundéré
SOMMAIRE
LISTE DES ABREVIATIONS ............................................................................................ iii
DEDICACES .........................................................................................................................iv
REMERCIEMENTS ............................................................................................................... v
PRESENTATION DE L’ENTREPRISE ...............................................................................vi
RESUME ................................................................................................................................ 1
ABSTRACT............................................................................................................................ 2
INTRODUCTION .................................................................................................................. 3
PREMIERE PARTIE : REVUE DE LA LITTERATURE .................................................... 5
I. GÉNÉRALITÉS SUR LE VIH .......................................................................................... 6
I. 1- Rappels sur l’infection à VIH .................................................................................... 6
I. 1-1- Définitions .......................................................................................................... 6
I. 1-2- Taxonomie .......................................................................................................... 6
II. Épidémiologie ................................................................................................................ 7
1- Situation mondiale de l’épidémie à VIH/SIDA.............................................................. 7
2- Situation de l’épidémie à VIH/SIDA au Cameroun ....................................................... 9
II. Caractéristiques du virus .............................................................................................. 10
II. 1- Morphologie et Structure du VIH ............................................................................ 10
II. 2- Cycle de réplication virale ....................................................................................... 12
III. Les voies de transmissions ........................................................................................... 14
III. 1- Voie sexuelle .......................................................................................................... 14
III.2- Voie sanguine .......................................................................................................... 14
III-2-1- Usage de Drogue par injection......................................................................... 14
III-2-2- Accidents par transfusion de sang contaminé .................................................. 15
III.3-Notion de transmission de la mère à l’enfant ........................................................... 15
III-3-1-Frequence de transmission ................................................................................ 15
III-3-2- Moment de la TME du VIH ............................................................................. 16
III-3-3- Facteur influçant la TME du VIH .................................................................... 19
IV. Diagnostic et dépistage du VIH ............................................................................... 22
IV. 1- Algorithme national................................................................................................ 22
IV. 2- Moleculaire............................................................................................................. 24
PRÉVALENCE DU VIH CHEZ LES ENFANTS EXPOSÉS AGÉS DE 4 A 72 SEMAINES, SUIVIS AU CENTRE
MERE ET ENFANT DE LA FONDATION CHANTAL BIYA: CAS DE DIAGNOSTIC PRÉCOCE
IV. 2-1- PCR ................................................................................................................ 25

IV.2.2. Séquençage de l’ADN : .................................................................................... 27
V. La prophylaxie ARV chez l’enfant né de mère séropositive ....................................... 29
DEUXIEME PARTIE : MATERIEL ET METHODES....................................................... 30
DEUXIEME PARTIE : MATERIEL ET METHODE ......................................................... 30
I. MATERIELS ............................................................................................................... 32
II. METHODOLOGIE...................................................................................................... 33
II. 1- Type d’étude et période d’étude .......................................................................... 33
II. 2- Population d’étude ................................................................................................... 33
II.2.1 Critères d’inclusion ............................................................................................. 33
II.2.2 Critères d’exclusion ............................................................................................ 33
II.3- Echantillonnage ........................................................................................................ 33
II.4- Collecte des données et méthode de prélèvement .................................................... 33
II.4.1-Support de collecte des données ......................................................................... 33
II.4.2-Prélèvements ....................................................................................................... 34
II-5- Principe de la procédure du GeneXpert (Xpert HIV 1- Qual) ...................................... 34
II-6- Procédure du GeneXpert (Xpert HIV 1- Qual) ............................................................ 35
II.7- Analyse et traitement des données ................................................................................ 37
II.8- Interprétation des résultats ............................................................................................ 38
TROISIEME PARTIE : RESULTATS ET DISCUSSION .................................................. 39
QUATRIEME PARTIE: CONCLUSION ET PERSPECTIVES ......................................... 44
CINQUIEME PARTIE: REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES ET WEBOGRAPHIQUES
........................................................................................................................................................ 46
SIXIEME PARTIE: ANNEXE ............................................................................................. 51
LISTE DES FIGURES
Figure 1 : Plan de localisation du Centre Mère et Enfant de la fondation Chantal Biya ................vi
Figure 2 : Organigramme du CME/FCB. Source agenda de la Fondation Chantal Biya 2021 ... viii
Figure 3: Schéma organisationnel du virus VIH (Mouffok, 2018) .............................................. 11
Figure 4: cycle réplicatif des VIH .................................................................................................. 13
Figure 5: Répartition des femmes enceintes séropositives selon la voie d’accouchement (Boubacar,
2019)............................................................................................................................................... 17
Figure 6: Répartition de nouveaux nés selon le mode d’alimentation (Boubacar, 2019) .............. 19
Figure 7 : Algorithme de dépistage VIH chez l’enfant né de mère VIH (Cameroon_National-
Integrated-HIV-Guidelines2014) ................................................................................................... 23
Figure 8 : courbe de température par cycle pendant la PCR (Bogard, 1998) . ........................... 26
Figure 9 : Représentation schématique des trois (03) étapes de la PCR (Bogard, 1998) ............... 27
Figure 11 : SCHEMA SYNOPTIQUE........................................................................................... 31
Figure 12 : Réactif échantillon du test HIV-1 Qual ....................................................................... 35
Figure 13 : Prévalence globale de la PCR 1 ................................................................................... 40
Figure 14: Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction du sexe ................................................ 41
Figure 15 : Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction de l’âge .............................................. 41
Figure 16 : Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction de l’âge .............................................. 43
Page i
LISTE DES TABLEAUX
Tableau 1 : Taxonomie du VIH (GAGARA, 2007) ........................................................................ 6

Tableau 2: fréquence de TME (Cameroon_National-Integrated-HIV-Guidelines2014) ............... 15
Tableau 3: Principaux facteurs de risque de TME du VIH (Cameroon_National-Integrated-HIV-
Guidelines2014) ............................................................................................................................. 21
Tableau 4: Posologies de la NVP chez l'enfant exposé .................................................................. 29
Tableau 5 : Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction de l’âge ....Erreur ! Signet non défini.
Tableau 6 : répartition des patients fonction de résultats de la PCR 2 ........................................... 42
Tableau 7 : Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction du sexe .............................................. 42
Tableau 8 : Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction de l’âge ............................................. 43
Tableau 9 : Prévalence globale de la PCR 1 .................................................................................... 5
Tableau 11 : répartition des résultats de la PCR 1 fonction du sexe ................................................ 5
Tableau 13 : répartition des patients fonction du sexe ..................................................................... 6
Tableau 14 : répartition des patients fonction de tranche d’âge ....................................................... 6
Page ii
LISTE DES ABREVIATIONS
ADN : Acide Désoxyribonucléique

ARN : Acide Ribonucléique
ARVs : Antirétroviraux
CME/FCB : Centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya
HCY : Hôpital Central de Yaoundé
CRC : Croix Rouge Camerounaise
CPC : Centre Pasteur du Cameroun
GX : GeneXpert
CD4 : Classe de Différenciation 4
gp : glycoprotéine
IgG : Immunoglobulines G
IgM : Immunoglobulines M
ONUSIDA: Organisation des Nations Unies/SIDA
p: protéine
pXCA : Protéine d’ordreX de la capside
pXMA : Protéine d’ordreX de la matrice
PCR: Polymerase Chain Reaction
TME : Transmission Mère-Enfant
PTME : Prévention de la Transmission Mère-Enfant
SIDA : Syndrome d’Immunodéficience Acquise
TME: Transmission Mère-Enfant
VIH-1 : Virus de l’Immunodéficience Humaine 1
VIH-2 : Virus de l’Immunodéficience Humaine 2
DBS : Dry blood spots
Page iii
DEDICACES
Je dédie ce modeste travail à

- Mon défunt père M. DYA BEDJE
- la grande famille DYA Fils et Filles
Page iv
REMERCIEMENTS
Au terme de ce travail, nous tenons à exprimer notre profonde gratitude envers tous ceux qui
ont contribué à sa réalisation.
Nos remerciements vont particulièrement à :
 L’Eternel Dieu pour sa protection et sa présence effective pour tous nos faits à l’audit centre ;
 Directeur du Centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya Professeur KOKI
NDOMBO Paul Olivier, pour avoir accepté notre stage au dit Centre ;
 Chef de service du laboratoire du Centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya, Dr
BOULA Angeline, pour son accueil et la supervision de nos travaux ;
 A la Major du laboratoire du Centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya, Madame
KEMAJOU Grace, pour sa disponibilité ;
 Responsable de l’assurance qualité du laboratoire du Centre Mère et Enfant de la Fondation
Chantal Biya, notre coordonnateur et notre maitre de stage, Monsieur NGOYA Roger, pour
sa disponibilité à notre endroit et son souci inestimable pour notre suivi académique et
professionnel ;
 Le Directeur de l’institut universitaire de technologie de N’Gaoundéré (IUT), Professeur
MOUHAMADOU BOUBA Adji, d’avoir mis en œuvre tous les éléments nécessaires pour
réaliser notre stage académique ;
 Chef de division des stages et des relations avec les milieux professionnels, Professeur
TATSADJIEU Léopold, pour l’effort fourni en vue de nous trouver le stage ;
 Nos enseignants de l’IUT de N’Gaoundéré, pour toutes les connaissances et le savoir qu’ils
nous transmettent ;
 La grande famille Dya pour leurs soutiens et contributions à toute ma scolarisation ;
 La famille restreinte MARIAM TALIKOUA, pour leurs soucis inestimable pour ma
scolarisation ;
 Aux personnels du CME/FCB du fait d’avoir travaillé à leur côté, a contribué à faire de ce stage
une expérience humaine vivant.
Page v
PRESENTATION DE L’ENTREPRISE
1- Situation géographique
Le Centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya (CME/FCB), est situé dans la région
du Centre, département du Mfoundi, arrondissement de Yaoundé II, au niveau de la rue Henry
DUNANT. Limité au Nord par l’Hôpital Central de Yaoundé (HCY), au Sud par le siège de la
Croix Rouge Camerounaise (CRC), à l’Est par le Centre Pasteur du Cameroun (CPC) et à l’Ouest
par le quartier du Lac (figure 1).
Figure 1 : Plan de localisation du Centre Mère et Enfant de la fondation Chantal Biya
2- Adresse du CME/FCB
 Siège social : Rue Henri DUNANT

 Tél : +(237)222 20 00 20/222 23 50 84/22 22 20 00 / Fax : +(237)222 23 05 04
 BP : 1936 Yaoundé-Cameroun
 Site internet : www.fcb@camnet.cm
Page vi
3- Historique du Centre Mère et Enfant
Créé le 23 février 1999, le Centre Mère et Enfant est un sous ensemble d’un grand ensemble
qui est la Fondation Chantal BIYA dont la promotrice est la Première Dame Madame Chantal Biya
et dont le siège se trouve à Melen plus précisément vers le Centre Hospitalier Universitaire (CHU).
Il est une ONG reconnue d’utilité publique dans le pays. Sa création répond à un besoin exprimé
d’une entité mère-enfant. Ledit Centre a été réorganisé en 2005.
4- Organisation du Centre Mère et Enfant de Yaoundé

Le Centre Mère et Enfant de Yaoundé est spécialisé dans la santé de la mère et de l’enfant et
dans la prise en charge des malades indigents. Il dispose d’une unité de formation, de recherches
universitaires et participe à la mise en œuvre des programmes du Ministère de la Santé Publique.
Au Centre Mère et Enfant, les services sont bien repartis de telle manière à favoriser l’accès
facile des visiteurs ou des patients dans la structure, l’administration aisé des soins et le bon
déroulement du travail. Il est organisé comme suit :
Organigramme du CME/FCB
Page vii
DIRECTEUR
Chef DMT Chef DARH Conseiller Médical Conseiller en

Management
Médecins
Chef de service Coordonnatrice

& générale des soins
Major
Ped A Ped B Ped C Ped D Ped E Hemato- Endocrinologie- Moyen Maladie rares Autisme et
oncologie Diabétologie standing et enfants
Orphélines différents
Soins Soins Soins Laboratoire Kinésithérapie Radiologie Triage et Vaccination PG

intensifs intensifs maternels et de biologie et et consultations
polyvalents néonataux consultations clinique réhabilitation externes
prénatales fonctionnelle Imagerie
Urgences NNA NNB Unité du Jour Informatique Pharmacie Bibliothéque Cuisine Service Securité
Pédiatriques cession et médicale Social
s caisse Secrét
aire
Buanderie et Hôtesses et aire de jeux Entretien et Nettoyage et Comptabilité- Statisques, Organisation, Multimedia,
dressage des enfants jardinage hygiene matières Page viiiSuivi de
Infographie, Documentation,
hospitalière projets
Figure 2 : Organigramme du CME/FCB. Source agenda de la Fondation Chantal Biya 2021
5- Présentation du laboratoire
Le Centre Mère et Enfant de Yaoundé dispose de deux laboratoires :
5-1-Le laboratoire d’urgence

Le laboratoire d’urgence comme le nom l’indique est celui-là qui assure la réalisation des
analyses en urgence pour une prise en charge rapide des patients externes ou hospitalisés au CME.
Comme examens réalisés dans ce laboratoire (nous parlerons de ce qui est faits dans les normes de
l’art), nous avons :
 Diagnostic du paludisme (TDR, Goutte épaisse)
 Les tests rapides pour le diagnostic du cholera
 Bactériologie (Cytologie du LCR)
 Parasitologie (Coprologie)
 Biochimie urinaire
 L’immunno-hématologie (détermination du groupe sanguin, test de compatibilité)
 Sérologie du VIH
5-2-Le laboratoire principal

Le laboratoire principal coordonne toutes les activités des 2 laboratoires en plus des analyses
réalisées au Laboratoire d’urgence et des prélèvements de charge virale, y sont effectués :
 Biochimie urinaire (pour femme enceinte recherche des protéines et glucose)
 Bactériologie (Cytologie du LCR)
 Sérologie (Toxoplasmose, Rubéole, Syphilis, VIH, CRP)
 Test moléculaire (diagnostic du VIH, charge virale pour le VIH et diagnostic de la tuberculose
par GeneXpert)
5-3-Personnel
Le laboratoire du CME dans son ensemble est animé par un personnel dynamique sous la
coordination d’:
 Un Médecin biologiste pour la vérification et la validation des résultats des analyses
[Type text] Page ix

 Un Major pour la supervision des activités au sein du laboratoire

 Un Responsable Assurance Qualité qui assure l’intérim en absence du major.
Au total 28 techniciens de niveau académique différent sans oublier une secrétaire qui
enregistre les examens demandés et imprime les résultats.
5-4-Horaires du Laboratoire et Système de roulement
Le laboratoire d’urgence est ouvert tous les jours (même les jours fériés) et fonctionne
24 h/24. Il y existe un système de roulement. Il est de 5x3 ; c’est-à-dire qu’il existe 5 vagues
constituées de 3 techniciens qui travaillent chaque jour. La première vague travaille de 7h30-13h00,
puis la deuxième vague de 12h30-18h00 et la troisième vague assure la garde toute la nuit de 17h30-
7h30.
Le laboratoire principal est ouvert du lundi au vendredi sauf les jours fériés de 7h30 à 15h30.
Le prélèvement s’achève tous les jours à 13h.
[Type text] Page x

RESUME
Au Cameroun, la notion transmission de la mère à l’enfant du VIH-SIDA reste toujours un

problème de santé publique. Pour les enfants de moins de 18 mois, le dépistage fait appel à des
techniques de biologie moléculaire comme la Réaction en chaîne de transcriptase inverse /
polymérase-Acide Nucléique. Notre étude avait pour objectif d’améliorer les connaissances sur la
prévalence du VIH/SIDA chez les enfants exposés de mois de 18 mois à l'aide de la technique
RT/PCR au centre mère et enfant de la fondation Chantal Biya. Il s'agit d'une étude prospective
transversale a visé descriptive du 11 Avril au 28 juin 2022. Nous avons utilisé la technique
moléculaire (PCR), l'extracteur et traitement de l’échantillon automatique par le GeneXpert. Les
résultats sont automatiquement rendus sur la station de travail. La technique de RT/PCR nous a
permis d’obtenir un taux de transmission de 8,08% au VIH-1 à la PCR1 et 20% à la PCR 2. La
moyenne d'âge était de 21,27 Semaines avec un sex ratio (F/H) de 1,36. La grande majorité des
enfants touchés étaient âgé compris de 4 à 21 semaines pour la PCR1 et 58 à 72 semaines pour la
PCR2, avec un allaitement sécurisé. Le taux de transmission du VIH-1 chez les enfants nés des
mères séropositives reste toujours élevé malgré les efforts déployés par le ministère de la santé. Il
est donc nécessaire d'établir un diagnostic précoce pour une meilleure prise en charge des enfants
exposés.
Mots clés : VIH, TME, RT/PCR, GeneXpert, CME/FCB, Cameroun, enfants exposés
Rédigé par LAWANE DYA Page 1

ABSTRACT
In Cameroon, the notion of mother-to-child transmission of HIV/AIDS remains a public health

problem. For children under 18 months of age, screening uses molecular biology techniques such
as Reverse Transcriptase Chain Reaction/Polymerase-Nucleic Acid. Our study aimed to improve
knowledge of the prevalence of HIV/AIDS in exposed children under 18 months of age using the
RT/PCR technique at the Chantal Biya Foundation's Mother and Child Centre. This is a prospective
cross-sectional study aimed descriptive from April 11 to June 28, 2022. We used molecular
technique (PCR), the extractor and processing of the automatic sample by geneXpert. The results
are automatically rendered to the workstation. The RT/PCR technique allowed us to achieve a
transmission rate of 8.08% to HIV-1 to PCR1 and 20% to PCR 2. The average age was 21.27
Weeks with a sex ratio (F/H) of 1.36. The vast majority of children affect were aged 4 to 21 weeks
for PCR1 and 58 to 72 weeks for PCR2, with safe breastfeeding. The rate of HIV-1 transmission
among children born to HIV-positive mothers remains high despite the efforts of the Ministry of
Health. It is therefore necessary to establish an early diagnosis for better care of exposed children.
Keywords: HIV,TME, RT/PCR, GeneXpert, CME/FCB, Cameroon, exposed children

INTRODUCTION
Le virus de l'simmunodéficience humaine ou VIH, (en anglais, human immunodeficiency

viruses ou HIV) est une espèce de rétrovirus infectant l’être humain et responsable du syndrome
d'immunodéficience acquise (sida), qui est un état affaibli du système immunitaire le rendant
vulnérable à de multiples infections opportunistes. Globalement, l'Organisation Mondiale de la
Santé (OMS) estime que 1,7 millions dénfants (0-14 ans) vivaient avec le VIH en 2021. Ces
derniers étaient principalement infectés par voie verticale et 90% de ces infections avaient eu lieu
en Afrique subsaharienne. La transmission verticale est la principale voie par laquelle les enfants
sont infectés par le VIH. En effet, une femme infectée par le VIH peut transmettre ce virus
enveloppé à son bébé pendant la grossesse, le travail, láccouchement ou lállaitement. En lábsence
de toute intervention, le risque combiné de la transmission de la mère à l'enfant (TME) du VIH in
utero et pendant láccouchement est de 10-20% et le risque est accru chez les enfants allaités à 15-
30% (Cameroun nation integrated guidelines, 2014). Le diagnostic de l’infection VIH est basé
sur plusieurs méthodes, mais une seule méthode est applicable chez les nouveau-nés. En effet, chez
l’enfant né de mère séropositive, les anticorps maternels transmis persistent au-delà de 12 mois ;
celle-ci rend donc le diagnostic sérologique d’une éventuelle infection chez l’enfant ininterprétable
avant 18 mois.
Dans les pays développés, le risque de TME du VIH a été réduit à moins à 2%, grâce à la
large diffusion de ládministration du traitement antirétroviral (TARV) chez les femmes enceintes
et chez les enfants exposés au VIH et au recours systématique à l'allaitement artificiel (Khong-
Josses et al, 2002). Inversement, dans les pays africains, les taux de transmission mère-enfant
(TME) du VIH sont généralement élevés du fait de l’usage de monothérapie et/ou de la bithérapie
renforcée pendant la parturition (Diouf et al, 2005), ce qui fait de la prévention de la transmission
du VIH de la mère à l'enfant (PTME) une intervention prioritaire des programmes de lutte contre
le VIH/SIDA. Cette lutte demeure un enjeu de santé publique dans la majorité de ces pays à
ressources limitées, particulièrement en Afrique. Selon l’agence Spectrum, plus de 496.000

personnes vivent avec le VIH en 2021 au Cameroun parmi lesquelles 7% d'enfants de moins de 15
ans et 66% de femmes âgées de 15 à 64 ans.
Pourtant, peu d’étude sur la séroprévalence chez les enfants exposés ont été publiées au
Cameroun. Qu’elle est la prévalence chez les enfants exposés de 4 à 72 semaines? Au regard de
cette insuffisance de données publiées, notre étude menée dans le cas de diagnostic précoce sur les
enfants exposés et âgés de 4 à 72 semaines au centre mère et enfant de la fondation Chantal Biya
avait pour objectif de répondre à cette question en nous intéressant à la technique de la RT-PCR en
temps réel.
Objectif général
L’objectif général visé par cette étude était de contribuer à l’amélioration des connaissances
sur la prévalence du diagnostic du VIH/SIDA chez les enfants âgés de 04 à 72 semaines par PCR.
Objectif spécifique :
 Déterminer la prévalence globale fonction de deux types de PCR ;

 Déterminer la prévalence fonction du sexe ;
 Déterminer la prévalence fonction des tranches d’âges.

PREMIERE PARTIE : REVUE DE LA

LITTERATURE
PREMIERE PARTIE :
REVUE DE
LA LITTERATURE

I. GÉNÉRALITÉS SUR LE VIH

I. 1- Rappels sur l’infection à VIH
I. 1-1- Définitions
Le virus de l'immunodéficience humaine ou VIH, (en anglais, human immunodeficiency

viruses ou HIV) est une espèce de rétrovirus infectant l’être humain et responsable du syndrome
d'immunodéficience acquise (sida), qui est un état affaibli du système immunitaire le rendant
vulnérable à de multiples infections opportunistes. Une fois dans l’organisme, ses cellules cibles
sont nombreuses mais les principales sont : les lymphocytes CD4 et cellules présentatrices
d’antigène (LEROY et DABIS, 1999)
I. 1-2- Taxonomie
Tableau 1 : Taxonomie du VIH (GAGARA, 2007)
Classification selon l’ICTV
Royaume Riboviria
Règne Pararnavirae
Embranchement Artverviricota
Classe Revtraviricetes
Ordre Ortervirales
Famille Retroviridae
Sous-famille Orthoretrovirinae
Genre Lentivirus
Espèce
Human immunodeficiency virus 1 et 2
ICTV 19931

II. Épidémiologie
1- Situation mondiale de l’épidémie à VIH/SIDA
Selon ONUSIDA, les statistiques mondiales sur le VIH sont reparties comme suite :
 28.2 millions de personnes avaient accès à la thérapie antirétrovirale au 30 juin 2021.
 37.7 millions [30.2 millions–45.1 millions] de personnes vivaient avec le VIH en 2020.
 1.5 million [1.0 million–2.0 millions] de personnes sont devenues nouvellement infectées par
le VIH en 2020.
 680 000 [480 000–1.0 million] de personnes sont décédées de maladies liées au sida en 2020.
 79.3 millions [55.9 millions–110 millions] de personnes ont été infectées par le VIH depuis le
début de l'épidémie.
 36.3 millions [27.2 millions–47.8 millions] de personnes sont décédées de suite de maladies
liées au sida depuis le début de l'épidémie.
Personnes vivant avec le VIH
 En 2020, 37.7 millions [30.2 millions–45.1 millions] de personnes vivraient avec le VIH.
o 36.0 millions [28.9 millions–43.2 millions] d'adultes.
o 1.7 million [1.2 million–2.2 millions] d'enfants (0-14 ans).
o 53 % de l'ensemble des personnes vivant avec le VIH sont des femmes et des filles.
 84% [67–>98%] de toutes les personnes vivant avec le VIH connaissaient leur statut
sérologique en 2020.

 Environ 6.1 millions [4.9 millions-7.3 millions] de personnes ne savaient pas qu'elles vivaient
avec le VIH en 2020.
Personnes vivant avec le VIH ayant accès à un traitement antirétroviral
 À la fin juin 2021, 28.2 millions de personnes avaient accès au traitement antirétroviral, soit
une augmentation de 7.8 millions [6.9 millions-7.9 millions] par rapport à 2010.
 En 2020, 73% [56–88%] de toutes les personnes vivant avec le VIH avaient accès au traitement.
o 74% [57-90%] des adultes de 15 ans et plus vivant avec le VIH ont eu accès au traitement,
tout comme 54% [37-69%] des enfants de 0-14 ans.
o 79% [61-95%] des femmes adultes de 15 ans et plus ont eu accès au traitement, cependant
seulement 68% [52-83%] des hommes adultes de 15 ans et plus y avaient accès.
 85% [63- >98%] des femmes enceintes vivant avec le VIH avaient accès à des médicaments
antirétroviraux pour prévenir la transmission du VIH à leurs bébés en 2020.
Nouvelles infections à VIH
 Les nouvelles infections au VIH ont été réduites de 52% depuis le pic de 1997.
o En 2020, environ 1.5 million [1.0 million–2.0 millions] de personnes étaient nouvellement
infectées par le VIH, contre 3.0 millions [2.1 millions–4.2 millions] en 1997.
 Depuis 2010, les nouvelles infections au VIH ont diminué de 31 %, passant de 2.1 millions [1.5
million-2.9 millions] à 1.5 million [1.0 million-2.0 millions] en 2020.
o Depuis 2010, les nouvelles infections au VIH chez les enfants ont diminué de 53 %, passant
de 320 000 [210 000-510 000] en 2010 à 150 000 [100 000-240 000] en 2020.

Décès liés au sida
 Les décès liés au sida ont été réduits de 64 % depuis le pic de 2004 et de 47% depuis 2010.
o En 2020, environ 680 000 [480 000-1 million] personnes mourront de maladies liées au sida
dans le monde, contre 1.9 million [1.3 million-2.7 millions] de personnes en 2004 et 1.3
million [910 000-1.9 million] de personnes en 2010.
La mortalité liée au sida a diminué de 53 % chez les femmes et les filles et de 41% chez les
hommes et les garçons depuis 2010.
2- Situation de l’épidémie à VIH/SIDA au Cameroun
Selon l’agence Spectrum, plus de 496.000 personnes vivent avec le VIH en 2021 au
Cameroun, parmi lesquelles 7% d'enfants de moins de 15 ans et 66% de femmes âgées de 15 à 64
ans.
Entre 2004 et 2020 le taux de prévalence du VIH est passé de 5,6% à 2,7% au sein de la
population âgée entre 15 et 49 ans. Le nombre estimé de nouvelles infections a également connu
une baisse considérable, de 47.958 en 2004 à 11.175 (Spectrum 2021). Ces chiffres montrent à
suffisance que le Cameroun tient le bon bout, concernant la riposte contre cette pandémie. Malgré
ces améliorations, de nombreux défis restent à relever, à l'instar de la réduction du taux de
prévalence chez la jeune fille âgée entre 15 et 24 ans, qui se trouve 9 fois plus contaminée que le
jeune garçon de la même tranche d'âge.

II. Caractéristiques du virus
II. 1- Morphologie et Structure du VIH
Les VIH sont des virus enveloppés de 80 à 120 nm de diamètre, sortant de la cellule par
bourgeonnement à travers la membrane cytoplasmique. Ils apparaissent dans leur forme typique
comme ayant une forme sphérique cernée par une enveloppe faite d’une couche lipidique à la
surface de laquelle sortent des spicules au nombre théorique de 72.
Ces spicules, qu’il s’agisse de VIH-1 ou de VIH-2, ont une longueur de 9 à 10 nm au-dessus
de la couche lipidique et une largeur maximale voisine de 14 nm. (ROSENHEIM et ITOUA –
NGAPORO, 1989)
Une particule virale mature comprend :
 Un génome représenté par deux copies identiques d’ARN simple brin, linéaire.
 Trois enzymes : la transcriptase inverse, la protéase et l’intégrase.
 la transcriptase inverse p66/p51 ou rétrotranscriptase qui rétrotranscrit l'ARN viral en ADN

viral ;
 l’intégrase p32 qui intègre l'ADN viral à l'ADN cellulaire;
 la protéase p12 qui participe à l'assemblage du virus en clivant les précurseurs protéiques Gag
p55 et Gag-Pol p160. La protéase est présente dans la capside. (Welker et al, 2000).
 La protéine de nucléocapside p7NC, dont les copies forment une nucléocapside conique
dans laquelle se trouvent le génome et les enzymes.
 Une capside de symétrie icosaédrique englobant la nucléocapside et constituée de copies
de la protéine p24CA.
 Une couche de protéine de matrice p17MA qui recouvre la capside.
 Une enveloppe dérivée de la membrane plasmique cellulaire, formée de la bicouche

lipidique habituelle associée à deux glycoprotéines virales :
□ La glycoprotéine transmembranaire gp41 pour le VIH-1, gp36 pour le VIH-2.

□ La glycoprotéine externe gp120 pour le VIH-1, gp125 pour le VIH-2. (MAMADOU,

2003).
Le schéma organisationnel du VIH-1 nous est donné par la figure 3 :
Figure 3: Schéma organisationnel du virus VIH (Mouffok, 2018)

II. 2- Cycle de réplication virale
Ce cycle de multiplication est composé principalement de 8 étapes (Dr. CHOUIKHA, 2018)

:
La phase d’attachement : La phase d’attachement. Le virus, grâce à la glycoprotéine gp120

située sur sa membrane, reconnaît la protéine CD4 située sur la membrane des lymphocytes T CD4
et se fixe sur elle.
La phase de fusion et de pénétration : La protéine gp41 achève la fixation et permet la

fusion des membranes virales et cellulaires. Le matériel génétique du virus (l’ARN viral) est alors
injecté dans le cytoplasme de la cellule désormais contaminée.
La décapsidation : Au cours de cette étape, le virus une fois à l'intérieur de la cellule, elle
se désagrège, libérant les deux brins d'ARN et les enzymes qu'elle contenait.
La phase de transcription inverse de l’ARN viral : Cet ARN viral est rétro- transcrit en
ADN grâce à l’action d’une enzyme : la transcriptase inverse.
La phase d’intégration de l’ADN viral : L’ADN viral est intégré au génome de la cellule
infectée grâce l’action d’une enzyme, l’intégrase. Cet ADN proviral est ensuite transcrit en
plusieurs ARN viraux grâce au système de réplication de la cellule.
La phase de traduction : Les ARN viraux ainsi produits sont lus et traduits en précurseurs
protéiques
La phase de clivage et d’assemblage des protéines virales : Les protéines virales ainsi
formées vont être clivées puis assemblées en nouveaux virions. Le clivage et la maturation des
protéines virales sont assurés par une enzyme, la protéase.
La phase de libération des nouveaux virions : Les virions formés bourgeonnent à la surface
de la cellule infectée avant d’être libérés dans l’organisme pour un nouveau cycle viral.

Figure 4: cycle réplicatif des VIH
(Dr. CHOUIKHA, 2018)
La connaissance des différentes étapes du cycle réplicatif des VIH est essentielle pour la
compréhension de la physiopathologie de l’infection, chacune de ces étapes étant une cible
potentielle des thérapeutiques antivirales.

III. Les voies de transmissions
Le VIH est présent dans de nombreux fluides organiques. On en a retrouvé dans la salive,
les larmes et l'urine, mais en des concentrations insuffisantes pour que des cas de transmission
soient enregistrés. La transmission par ces fluides est considérée de ce fait comme négligeable. En
revanche des quantités de VIH suffisamment importantes pour déclencher une infection ont été
détectées dans le sang, le lait maternel, la cyprine, le sperme, ainsi que le liquide précédant
l'éjaculation (Les rétrovirus) et la concentration du virus dans les sécrétions génitales (sperme et
sécrétions au niveau du col de l’utérus chez la femme) sont de bons prédicteurs du risque de
transmission du VIH à une autre personne.
III. 1- Voie sexuelle

La transmission sexuelle du virus représente 75 à 85% des infections par le VIH, Plus de
70% de ces cas sont imputables à une transmission hétérosexuelle et les 5 à 10% restants à la
transmission homosexuelle (Jackson et al, 2003). C’est la principale source de l’épidémie au
niveau mondiale. Les facteurs augmentant le risque de transmission sexuelle sont les stades de
primo-infection et le SIDA qui sont les stades où la virémie est élevée. D’autres facteurs de risque
peuvent être cités : un taux de CD4 <200/mm3, une antigénemie P24 positive, une charge virale
élevée non contrôlée ou multi résistance aux antirétroviraux. Le risque est aussi augmenté en cas
d'infections génitales, de rapports sexuels pendant les règles, de violences sexuelles.
III.2- Voie sanguine
III-2-1- Usage de Drogue par injection

Le risque de transmission du VIH est très élevé lors de la réutilisation et du partage
d’aiguilles ou de seringues. Les personnes s’injectant des drogues peuvent réduire
considérablement ce risque en utilisant systématiquement des aiguilles neuves et des seringues
jetables ou en stérilisant correctement les aiguilles et les seringues réutilisables avant utilisation.
La transmission dans le cadre sanitaire peut être réduite si le personnel de soin respecte les
précautions universelles. (Jackson et al, 2003)

III-2-2- Accidents par transfusion de sang contaminé

Les transfusions sont responsables de 5-10% des cas adultes de SIDA et jusqu’à 25% des
cas pédiatriques. Le risque est extrêmement élevé (supérieur à 90 %) de contracter le VIH au cours
d’une transfusion de sang et de produits sanguins contaminés. Toutefois, la mise en place de normes
de sécurité du sang garantit des réserves de sang et de produits sanguins sans danger, adaptées et
de bonne qualité à tous les patients et patientes ayant besoin d’une transfusion. La sécurité du sang
implique de soumettre tous les dons de sang à un dépistage du VIH et d’autres pathogènes
transmissibles par le sang, ainsi que de sélectionner correctement les donneurs et donneuses.
(Jackson et al, 2003)
III.3-Notion de transmission de la mère à l’enfant

Une mère peut transmettre le VIH à son enfant au cours de la grossesse, de l’accouchement
et de l’allaitement. Le risque de transmission de la mère à l'enfant est généralement de 15 % à 30
% avant et pendant l’accouchement. Il dépend de plusieurs facteurs, en particulier de la charge
virale de la mère au moment de la naissance (le risque augmente avec la charge). La mère peut
également transmettre le virus à son enfant après l’accouchement, pendant l’allaitement. Le taux
de transmission du VIH à l’enfant est extrêmement faible si la mère suit une thérapie antirétrovirale
au cours de la grossesse et de l’allaitement.
III-3-1-Frequence de transmission
Tableau 2: fréquence de TME (Cameroon_National-Integrated-HIV-Guidelines2014)
Fréquence estimée du risque de TME du VIH par

période.
Pendant la grossesse 10-20%
Pendant le travail et l’expulsion 30-40%
Pendant l’allaitement 15-30%
Taux de transmission sans allaitement 15-25%
Taux de transmission avec allaitement jusqu’à 6mois 25-35%

Taux de transmission avec allaitement jusqu’à 6- 12 mois 30-45%
III-3-2- Moment de la TME du VIH
a- Transmission in utero
Le placenta par l’intermédiaire du trophoblaste, constitue une barrière efficace contre
l’infection du fœtus. Ce rôle protecteur est très important, car environ 80% des nouveau-nés ne
sont pas infectés à la naissance. (ASSANA, 1998)
La transmission in utero se ferait par l’intermédiaire des cellules macrophagiques

placentaires plutôt que par les cellules trophoblastiques qui ne sont pas réceptives au VIH. Des
virions ou des cellules infectées pourraient traverser passivement les infractions de la membrane
syncytiotrophoblastique au cours des échanges sanguins fœto-maternels. Ces derniers sont très
intenses en fin de grossesse, notamment pendant le travail et la délivrance. (MAMADOU, 2003).
Des rares cas de transmission précoce in utero ont été décrits. Une équipe a réalisé l’analyse
par polymerase chain reaction (PCR) du génome du VIH de tissus thymiques fœtaux provenant de
99 produits d’avortement ou d’enfants mort-nés. Ce travail n’a révélé que deux fœtus infectés, avec
des signes de réplication virale importante. Cette étude met l’accent sur l’extrême rareté des
infections précoces in utero chez des fœtus a priori viables.
La possibilité d’infection in utero (dans les semaines précédant l’accouchement dans 1/3 des
cas) est connue depuis de longue date par la mise en évidence d’une virémie voire même des signes
cliniques chez l’enfant. Il semble aujourd’hui que cette transmission in utero ait lieu
essentiellement dans les dernières semaines de la grossesse. Il est important de noter que la part
relative de la transmission in utero est augmentée lorsque la mère présente une charge virale élevée
ou un déficit immunitaire avancé (Berebi, 2001).

b- Lors de l’accouchement
La contamination ascendante, à travers des membranes rompues ou intactes, peut se faire à
partir des voies génitales maternelles. (ASSANA, 1998). L’enfant se contamine lors de son passage
dans la filière génitale du fait de son exposition directe au sang et aux secrétions cervico-vaginales
contenant des particules virales libres ou des cellules infectées. Cependant, les échanges sanguins
fœto-maternels se poursuivent jusqu’à ce que le cordon ombilical soit coupé. Il y a donc cumul des
risques et multiples expositions de l’enfant à l’infection virale au moment de sa naissance.
Une étude utilisant l’ensemble des données virologiques obtenues chez 95 enfants infectés a
permis d’estimer la proportion d’enfants infectés avant et pendant l’accouchement. La transmission
virale était survenue au cours du dernier trimestre in utero chez un tiers des enfants infectés et le
jour de l’accouchement chez deux tiers d’entre eux. (CHAIX-BAUDIER et al, 1998).
L’observation selon laquelle les premiers jumeaux sont deux fois plus souvent infectés que les
seconds jumeaux plaident en faveur d’une contribution majeure des sites cervico-vaginaux.
(MORAND-JOBERT et al, 1996). L’effet protecteur d’une césarienne à membranes intactes et
avant le début du travail est désormais établi. En revanche, le taux de transmission n’est pas
diminué en cas de césarienne en cours de travail ou à membranes rompues. (GIRARD et al, 2004)
Voie basse Cesarienne
18%
82%
Figure 5: Répartition des femmes enceintes séropositives selon la voie d’accouchement (Boubacar, 2019)

c- Lors de l’allaitement
Le virus est présent dans le lait, soit sous forme de virions libres, soit sous forme provirale
intégrée dans les lymphocytes TCD4 infectés. (CHAIX-BAUDIER et al, 1998)
La transmission post-natale du VIH par le lait maternel demeure un problème de santé

publique important dans les pays en développement, avec un taux d’ordre de 14%. Une estimation
très proche a été obtenue en utilisant une PCR diagnostique du VIH-1 dans le sang d’enfants allaités
par des mères infectées. Un enfant est considéré comme ayant été contaminé par le lait maternel si
la PCR est négative à la naissance et positive à 6 mois. Une analyse récente de quatre études en
Afrique subsaharienne menée en Côte d’Ivoire, au Kenya et au Rwanda (à Butaré et Kigali) a
montré que le risque de transmission post-natale au-delà de deux mois et demi (en moyenne jusqu’à
8 mois après la naissance) est de 3,2 infections à VIH par an pour 100 enfants nourris au sein. Le
pouvoir contaminatif relatif du colostrum par rapport au lait maternel dit « intermédiaire » (1 à 2
mois) ou « tardif » (supérieur à 3 mois) n’est pas connu, mais il pourrait être plus important compte
tenu de la concentration élevée de cellules dans le colostrum par rapport au lait intermédiaire.
Cependant des cas de contamination tardive par le lait maternel ont été décrits. Le risque de
transmission post-natale par le lait maternel dépend de la durée de l’allaitement, et donc de la
quantité de virus ingérée. Pour Datta et al, 32% des infections par le VIH étaient associés à un
allaitement au-delà de 15 mois.
Le type d’allaitement pourrait être plus important que la durée de l’allaitement. Selon une
étude de Nduati et al, au Kenya, le risque global de transmission du VIH à 24 mois est diminué en
moyenne de 16% chez les enfants nourris par le lait artificiel par rapport aux enfants allaités au
sein. (BECQUART et al, 2002)

29%
71%
Allaitement Maternel Exclusif Allaitement Artificiel
Figure 6: Répartition de nouveaux nés selon le mode d’alimentation (Boubacar, 2019)
III-3-3- Facteur influçant la TME du VIH

Selon Cameroon National-Integrated-HIV-Guidelines, plusieurs facteurs augmentent le risque
de la TME du VIH.
III.3.3.1. Facteurs viraux

Le VIH1, du fait de sa réplication plus rapide et de sa plus grande virulence par rapport au
VIH2, présente un plus grand risque de transmission de la mère a l’enfant. Ce risque est estimé à
25% pour le VIH1 et seulement de 1% pour le VIH2.
III. 3.3.2. Facteurs maternels

Stade avancé de l’infection à VIH (SIDA)
Primo infection
Taux de CD4 abaissé
Charge virale élevée
Mauvais état nutritionnel

Anémie
Carence en vitamine A
III. 3.3.3. Facteurs obstétricaux
 Accouchement vaginal plus que par césarienne

 Accouchement instrumental (par forceps ou ventouse)
 Rupture prolongée des membranes (>4 heures)
 Travail prolongé
 Manœuvre par version externe ou interne
 Procédures obstétriques invasives : épisiotomie, rupture artificielle des membranes,
amniocentèse, biopsie des villosités chorioniques, etc.
III. 3.3.4. Facteurs fœtaux
 Prématurité
 Hypotrophie
 Premier né dans un accouchement multiple
III. 3.3.5. Facteurs liés aux modalités de l’allaitement
 Allaitement maternel non protégé (par les ARV)

−  Allaitement mixte
−  Allaitement prolongé dans le temps
−  Lésions mammaires : mastite, fissures de mamelon, abcès du sein
−  Mauvais état nutritionnel de la mère
−  Affections buccales chez le bébé : candidose, stomatite, ulcérations…
De tous ces facteurs, la charge virale élevée de la mère est celui qui augmente le plus le
risque de TME du VIH. Certains cofacteurs infectieux sont susceptibles de limiter le bénéfice du
traitement antirétroviral ou d’augmenter le risque de TME du VIH. Il s’agit :
− De la chorioamniotite

− Des IST
− Du paludisme (augmente la TME du VIH par le biais d’une placentite)

Tableau 3: Principaux facteurs de risque de TME du VIH (Cameroon_National-Integrated-HIV-
Guidelines2014)
Grossesse Travail et accouchement Allaitement maternel
Charge virale élevée Charge virale élevée (infection Charge virale élevée
(infection récente ou stade
récente ou stade avancée du sida (infection récente ou stade
avancée du sida avancée du sida
Infection virale, Rupture des membranes de plus de 4 − Durée et mauvaise pratiques
bactérienne ou heures de l’allaitement au sein
parasitaire du placenta − Maladies des seins :
(paludisme) mastites, crevasses,
infections…
Infections sexuellement Procédures invasives de Introduction avant 6 mois de
transmissibles (IST) l’accouchement qui augmentent le l’alimentation de complément
contact avec le sang infecté des (aliments, liquides et ou du
muqueuses génitales de la femme lait artificiel)
(épisiotomie, monitoring du scalp
fœtale)
Malnutrition maternelle Premier né d’un accouchement Alimentation insuffisante ou
(cause indirecte) multiple déséquilibrée de la mère
Chorioamniotite Affections buccales chez

l’enfant (muguet, stomatite,
ulcérations, etc.)
Les étapes de PTME,

Les étapes de cette PTME, qui sont le counselling, le dépistage volontaire, la prise des
antirétroviraux lors de la grossesse ou pendant l’accouchement, les attitudes pratiques en salle

d’accouchement, l’allaitement ou l’alimentation artificielle, (Francette, 2007) la prise d’ARV

(antirétroviral) par les nouveau-nés de mères porteuses du virus VIH/SIDA a été largement décrite
dans la littérature.
IV. Diagnostic et dépistage du VIH
IV. 1- Algorithme national

Selon Cameroon National Integrated-HIV-Guidelines, le dépistage de l’infection à VIH chez
l’enfant né de mère séropositive doit se faire suivant l’algorithme national, qui stipule :
A 6 semaines : test de dépistage par PCR

Le test utilise pour le diagnostic précoce à 6 semaines est la PCR-ADN. Le prélèvement de
sang se fait au niveau du talon du nourrisson. Il est recueilli et séché sur du papier buvard (DBS =
Dry Blood Spots). Les échantillons ainsi prélevés et séchés sont empaquetés et acheminés vers les
laboratoires de référence grâce au système de transport en vigueur dans la localité. Le laboratoire
de référence effectuent le test de la PCR-ADN et renvoient les résultats aux sites de prélèvement
pour guider la prise en charge de l’enfant. Le test à la PCR lorsqu’il est positif permet d’affirmer
la présence du virus du VIH dans le sang, et donc le diagnostic de l’infection à VIH.
Entre 9 et 18 mois : Dépistage par sérologie d’abord et ensuite, confirmation de la

sérologie positive par PCR.
Les enfants nés des mères séropositives possèdent dans leur sang des anticorps du VIH
transmis par leur mère au cours de la vie intra-utérine. Ces anticorps sont éliminés progressivement
à partir de la naissance et c’est à l’âge de 18 mois que l’enfant les a déjà complètement éliminés.
Leur persistance dans le sang de l’enfant positive le test du VIH par la sérologie en l’absence de
véritable infection à VIH.
Ainsi, pour les enfants entre l’âge de 9 mois et 18 mois, et pour diminuer le cout du dépistage
du VIH, on effectue d’abord une sérologie afin d’identifier ceux qui possèdent les anticorps du
VIH. On effectue ensuite le test par la PCR chez ceux qui présentent une sérologie positive pour
discriminer ceux qui sont effectivement infectés par le VIH chez qui le traitement doit être initié

sans délai de ceux qui présentent une sérologie positive en l’absence d’infection à VIH et du seul
fait de la persistance des anticorps maternels. Ceux-ci ne nécessitent pas de traitement ARV.
Les enfants de plus de 18 mois : Diagnostic par la sérologie :

Dans cette tranche d’âge, les enfants ont déjà complétement éliminé les anticorps maternels.
Ils devraient alors avoir un test par la sérologie négatif et seuls ceux avec une infection à VIH
vont présenter une sérologie positive. Le dépistage de l’infection à VIH chez ces enfants se fait
par la seule sérologie et selon le même algorithme national de dépistage qui est utilisé chez les
adultes.
Algorithme de dépistage du VIH chez l’enfant né de mère VIH
Figure 7 : Algorithme de dépistage VIH chez l’enfant né de mère VIH (Cameroon_National-Integrated-HIV-

Guidelines2014)

IV. 2- Moleculaire
Les techniques moléculaires sont les tests de diagnostic les plus spécifiques et les plus
sensibles. Ils sont capables de détecter le génome viral entier ou des parties du génome viral.
(virology-online.com (consulté le 3 juin 2022)).
La réaction en chaîne par polymérase est une méthode de biologie moléculaire permettant
d’amplifier énormément le nombre de copies d’une séquence spécifique d’ADN (l’amplicon),
même si la quantité initiale est très faible.
L’amplification est effectuée par la répétition de cycles de dénaturation/

hybridation/extension qui assure une duplication exponentielle de chaque brin. (KAPLAN et
DELPECH, 1989)
Il existe plusieurs types de PCR, qui sont :
 Real-Time PCR (quantitative PCR or qPCR) dans lequel les molécules d’ADN sont
marquées à l’aide d’un colorant fluorescent, qui est utilisé pour surveiller et quantifier les
produits PCR en temps réel
 Reverse-Transcriptase (RT–PCR) – crée de l’ADN complémentaire (ADNc) en
transcrivant l’ARN en ADN à l’aide de la transcriptase inverse
 Multiplex PCR – utilise un certain nombre d’amorces pour multiplier plusieurs fragments
dans un seul échantillon d’AND
 Nested PCR – après les 25 à 35 cycles initiaux de PCR, une PCR supplémentaire est
effectuée à l’aide de nouvelles amorces « imbriqués » dans les amorces d’origine, ce qui
réduit le risque de produits indésirables.
 Hot Start PCR – dans lequel la chaleur est utilisée pour dénaturer les anticorps utilisés
pour inactiver la Taq polymérase
 Long-range PCR – de plus longues gammes d’ADN sont formées en utilisant un mélange
de polymérases
 Assembly PCR – les fragments d’ADN plus longs sont amplifiés en utilisant des amorces
qui se chevauchent

 Asymmetric PCR – un seul brin de l’ADN cible est amplifié

 In situ PCR – PCR qui a lieu dans les cellules, ou dans les tissus fixes sur un sl
Nous nous intéresserons ici à la RT-PCR, car elle est celle qui répond à notre
appareillage : le GeneXpert
IV. 2-1- PCR

Mise au point en 1983 par Karry Mullis, la PCR est une technique de biologie moléculaire
qui permet de repérer un fragment d’ADN ou de gêne précis, même présent en quantité infime dans
un mélange, puis de l’amplifier exponentiellement. Les réactifs nécessaires à la réalisation d’une
réaction de PCR sont :
 La protease K, pour libérer l’ADN de la cellule ;

 LÀDN généralement sous forme de double brin contenant le fragment à amplifier ;
 Deux amorces sens et anti-sens qui sont de petits brins d’ADN (d’environ 20 bases) appelés
oligonucléotides.
 Ils sont capables d’hybrider de façon spécifique, grâce à la complémentarité des bases sur le
brin d’ADN ou sur son brin complémentaire ;
 Une enzyme, l’ADN Polymérase qui est une ADN polymérase thermorésistante extraite de la
bactérie Thermos aquatis.
 La température optimale d’action de la Taq est de 72°et elle est capable de résister à des
passages successifs à 95°, ce qui permet l’automatisation de la procédure.
 Quatre nucléotides : dGTP, dATP, dTTP, dCTP, appelés globalement dNTPs qui sont des
éléments de base utilisés par la Taq polymérase pour synthétiser les brins d’ADN
complémentaires ;
 Le MnCl2 permet une meilleure dissociation de l’ADN double brin et fidélise l’action de la
polymérase (Bogard, 1998).
 Principe de la PCR
La PCR est basée sur la capacité de l’ADN polymérase à synthétiser le brin complémentaire
d’un ADN servant de matrice. Pour initier le processus, un segment d’acide nucléique doit s’y

associer afin de servir d’amorce. Cette amorce (ou primer), de séquence complémentaire à celle du
brin à amplifier, est un oligonucléotide synthétique d’une longueur de 17 à 30 bases. Son
association à l’ADN aboutissant ainsi à la synthèse d’un ADN double brin. La PCR consiste en
une succession cyclique de trois étapes. Le milieu tamponné comprend tous les éléments
indispensables : le précurseur tri nucléotidiques (dATP, dCTP, dTTP, dGTP), le cation Mg2+
indispensable au bon fonctionnement de l’enzyme et à l’incorporation correcte des précurseurs,
l’ADN polymérase et les amorces. A ce milieu, est ajouté l’ADN extrait du milieu biologique à
étudier (Coulibaly, 2005).
 Réaction de PCR
Une réaction de PCR correspond à la succession d’une trentaine de cycles comportant chacun
3 étapes :
- Dénaturation de l’ADN (94-95°) : les doubles brins d’ADN se séparent
-Hybridation ou annelage des amorces (55-57°) : les amorces reconnaissent leur séquence
complémentaire et hybrident chacune sur leur brin respectif.
-Elongation ou extension des amorces (72°): la Taq Polymérase permet d’ajouter des
nucléotides aux amorces hybridées, dans le sens 5‟-3‟ (Bogard, 1998).
Figure 8 : courbe de température par cycle pendant la PCR (Bogard, 1998) .

Figure 9 : Représentation schématique des trois (03) étapes de la PCR (Bogard, 1998)
IV.2.1.1- RT-PCR (Reverse Transcriptase-Polymérase Chain Réaction)

La PCR est une technique qui amplifie l’ADN. Par conséquent, pour étudier l’ARN par PCR,
il faut passer par une étape intermédiaire, la transcription inverse ou reverse transcription (RT), qui
transforme l’ARN en son ADN complémentaire (ADNc).
On peut alors réaliser une PCR. Une enzyme, la transcriptase inverse, qui est une ADN
polymérase ARN-dépendante, transforme l’ARN en son ADNc. Cet ADNc pourra être amplifié
par la technique de PCR déjà décrite. Pour agir, cette enzyme a besoin, de la même manière que
l’ADN polymérase, d’une amorce (Holodniy et al, 1991). Le domaine d’application de la RT-PCR
pour le diagnostic clinique comprend l’étude de la charge virale des virus à ARN, l’analyse du
produit de l’expression des gènes (Cave et al, 2003).
IV.2.2. Séquençage de l’ADN :

 Principe
Le séquençage de l’ADN consiste à déterminer l’ordre des nucléotides sur la molécule

d’ADN. C’est le niveau de résolution le plus élevé pour rechercher la présence de mutations
ponctuelles dans un gène. La méthode utilisée aujourd’hui, proposée par F. Sanger en 1977 (prix
Nobel de chimie en 1980), repose sur l’utilisation de nucléotides particuliers appelés
didésoxynucléotides, qui bloquent la synthèse d’ADN par les ADN polymérases après leur
incorporation. Ce blocage est dû à l'impossibilité qu'ont ces nucléotides de former une liaison

phosphodiester avec un autre nucléotide en raison de l'absence du groupement hydroxyle sur le

carbone 3'. Depuis 1977, la méthode a considérablement évolué grâce à la mise au point de
séquenceurs automatiques et de marquages des nucléotides à l’aide de fluor chromes. Elle est
devenue aujourd’hui une technique rapide et fiable utilisée fréquemment dans le diagnostic de
certaines maladies héréditaires mais, reste néanmoins coûteuse et réservée à certains gènes en
nombre limités et de petites tailles
IV.2.2.1. Objet de la bio-informatique :

La bio-informatique est une discipline basée sur les acquis de la biologie, des mathématiques,
et de l’informatique. Elle consiste en l’ensemble des méthodes et programmes pour gérer,
organiser, comparer, analyser, explorer, l’information génique et génomique stockée dans les bases
de données dans le but de prédire et produire de nouvelles connaissances et de développer aussi de
nouveaux concepts (Dembélé, 2005).
IV.2.2.2. Analyse des séquences

L’analyse bio-informatique fondamentale et principale réalisée sur les séquences d’ADN est
l’alignement. Il s’agit de comparer des séquences grâce à des algorithmes.
L’objet d’un alignement de séquences est en général pour :
 Quantifier et localiser la similarité

 Trouver la meilleure mise en correspondance des résidus qui conservent l’ordre des séquences.
(Score de l’alignement)
 Prendre en compte des mutations ponctuelles qui se résument en trois événements majeurs :
Insertion, Délétion et Substitution. 3nalyse bio-informatique fondamentale et principale
réalisée sur les séquences d’ADN est l’alignement. Il s’agit de comparer des séquences grâce à
des algorithmes.

V. La prophylaxie ARV chez l’enfant né de mère séropositive

A tout enfant né de mère séropositive qui est allaité au sein ou qui reçoit une alimentation
de substitution, le personnel de la maternité ou du suivi de la mère et de l’enfant doit débuter la
prophylaxie ARV le plus tôt possible après l’accouchement ou bien dès que l’on a connaissance de
son exposition.
Au Cameroun, cette prophylaxie ARV est constituée par la Névirapine à donner en une
seule prise chaque jour pendant six semaines.
Le tableau ci-dessous donne la dose de la Névirapine prophylactique à administrer à l’enfant
né de mère séropositive en fonction de son poids de naissance.
Tableau 4: Posologies de la NVP chez l'enfant exposé

(Cameroon_National-Integrated-HIV-Guidelines2014)
Ages Doses quotidiennes
De la naissance à 6 semaines
10 mg en une seule prise (1 ml)
 Poids : 2000 à 2499 gr 15 mg en une seule prise (1,5ml)
 Poids ≥ 2500 gr
NB: Chez le nouveau-né avec un petit poids à la naissance (<2000 gr), commencer par 2 mg
/kg (0,2 ml/kg) par jour jusqu'à ce qu'il atteigne 2000 gr
1ml = 10 mg de NVP

DEUXIEME PARTIE : MATERIEL ET

METHODES
DEUXIEME PARTIE : MATERIEL

ET METHODE

SCHEMA SYNOPTIQUE
Accueil et enregistrement des

patients
Collecte des données

sociodémographiques
Prélèvement
Analyse des
échantillons
Traitement de
données collectées
Interprétation des
résultats
Figure 10 : SCHEMA SYNOPTIQUE

I. MATERIELS
 Matériels biologiques
 Echantillon (le sang) ;
 Matériels Chimique
 Le diluant ;
 Matériels de prélèvement
 Épicrânien ;
 Tube EDTA ;
 Coton ;
 Alcool à 70° ;
 Garrot ;
 Pipettes Pasteur.
 Matériels didactiques
 Registres du laboratoire ;
 Fiche de collecte de données personnelles ;
 Apparaillage : le GeneXpert ;
 Cartouche de l’appareil.

II. METHODOLOGIE
La méthode de diagnostic précoce du VIH chez les nouveau-nés obéis a plusieurs PCR, mais
dans le cadre de notre étude nous nous limiterons à deux PCR (PCR1 et PCR2) qui obéissent à une
même méthodologie.
II. 1- Type d’étude et période d’étude

Il s’agissait d’une étude prospective transversale a visé descriptive, dont la collecte des
données va du 11 avril au 28 juin 2022
II. 2- Population d’étude

Notre étude concernait les enfants âgés de 6 à 72 semaines et nés de mères séropositives.
II.2.1 Critères d’inclusion

 Être né d’une mère séropositive infectée par le VIH-1 ;
 Être âgé de moins de 18 mois.
II.2.2 Critères d’exclusion

 Les enfants âgés de plus de 18 Mois ;
 Tous les enfants non suivis au CME/FCB
II.3- Echantillonnage
L’échantillon était de type exhaustif portant sur tous les enfants nés de mères séropositives
suivis au CME/FCB, et répondant aux critères d’inclusion, soit 260 patients.
II.4- Collecte des données et méthode de prélèvement
II.4.1-Support de collecte des données

Une fiche de collecte et/ou de renseignements avait été élaborée (voir annexe 1).

 Pour cette l’étude (étude prospective transversal), la collecte des données se fait dès l’entrée
du patient dans la salle de prélèvement comme présenté sur la figure 11.
II.4.2-Prélèvements
Il s’agissait de 2 à 3 ml de sang total dans des tubes EDTA prélevés chez des enfants nés de
mères séropositives au niveau de la salle de prélèvement du laboratoire du CME/FCB. Ces
prélèvements peuvent aussi se faire dans les différents centres prescripteurs à Yaoundé, notamment
l’Hôpital central de Yaoundé, Hôpital de district de soa, Hôpital de district d’Efoulan, la croix
rouge et autres. Puis seront acheminé dans laboratoire principal du CME/FCB.
 Technique de prélèvement
 Repérer la veine de ponction (au niveau de l’avant-bras ou du bras ou encore celle
du niveau du pli de coude) ;
 Poser le garrot entre 7 à 10 cm du lieu de ponction veineux
 Prélever 2 à 3 ml de sang veineux dans des tubes EDTA (bouchon violet).
 Les tubes héparines et les tubes secs ne doivent pas être utilisés.
 Homogénéiser selon les techniques de prélèvements habituels pour éviter la
formation de caillots.
 Remplir correctement la fiche de demande (par le médecin), le laboratoire doit
vérifier que la fiche est bien remplie.
La méthode que nous avons utilisée ici était la méthode moléculaire par PCR par l’appareil
nommé le GeneXpert.
II-5- Principe de la procédure du GeneXpert (Xpert HIV 1- Qual)

Les systèmes d’instrument GeneXpert (GX) automatisent et intègrent la préparation des
échantillons, l’extraction et l’amplification des acides nucléiques et la détection de la séquence
cible dans des échantillons simples ou complexes par PCR après transcription inverse (RT-PCR)
en temps réel. Les systèmes comportent un instrument, un ordinateur personnel et un logiciel
préinstallé pour l’exécution des tests et l’affichage des résultats. Les systèmes nécessitent

l’utilisation des cartouches GeneXpert jetables à usage unique qui contiennent les réactifs RT-PCR
et hébergent les processus RT-PCR. Les cartouches étant closes, la contamination croisée entre les
échantillons est réduite au minimum. Pour obtenir une description complète du système, consulter
le Manuel d’utilisation du GeneXpert Dx System ou le Manuel d’utilisation du système GeneXpert
Infinity (Annexe 2). Le test HIV-1 Qual comprend les réactifs pour la détection des acides
nucléiques totaux du HIV-1 dans les échantillons ainsi qu’un contrôle interne pour assurer le
traitement adéquat de la cible et surveiller la présence d’inhibiteurs dans les réactions de RT et de
PCR. Le contrôle de vérification de la sonde (CVS) consiste à vérifier la réhydratation des réactifs,
le remplissage des tubes de PCR dans la cartouche, l’intégrité de la sonde et la stabilité du
fluorochrome.
II-6- Procédure du GeneXpert (Xpert HIV 1- Qual)

Avant de commencer, retirer le flacon de réactif échantillon du kit et, s’il était réfrigéré, le
laisser s’équilibrer à la température ambiante. Voir Figure11 Si le flacon n’était pas conservé en
position verticale, s’assurer que le tampon est bien déposé dans le fond en secouant fermement le
flacon.
Figure 11 : Réactif échantillon du test HIV-1 Qual
Remarque Un film plastique mince recouvre l’anneau interne de 13 orifices sur la cartouche
de test. Ce film ne doit pas être retiré.
Important Démarrer le test dans les 30 minutes qui suivent l’ajout de l’échantillon à la
cartouche.
L'échantillon, sang total

 Porter des gants de protection jetables.

 Étiqueter le flacon de réactif échantillon avec l’identification de l’échantillon.
 Examiner la cartouche de test pour vérifier qu’elle n’est pas endommagée. Si elle est
endommagée, ne pas l’utiliser.
 Ouvrir le couvercle de la cartouche.

 Utiliser la pipette de transfert de 1mL fournie ou une pipette automatique
pour transférer 750 µL du réactif échantillon dans la chambre échantillon de la cartouche
Remarque Laisser le réactif échantillon s’équilibrer à la température ambiante et mélanger le

flacon en l’inversant avant le transfert dans la cartouche. Transférer exactement 750 µL dans la
chambre échantillon de la cartouche
 Mélanger l’échantillon de sang total en inversant le tube (tube microtainer EDTA

ou tube EDTA à bouchon couleur lavande) au moins sept fois. Transférer immédiatement 100µL
en utilisant la micropipette fournie (voir Figure) en comprimant la poire supérieure puis en
relâchant pour aspirer le sang. Comprimer de nouveau pour déposer le sang dans la chambre
échantillon de la cartouche où il sera mélangé au réactif échantillon qui se trouve déjà dans la
chambre échantillon (Figure). Une pipette automatique peut également être utilisée pour déposer
le sang dans la chambre échantillon de la cartouche (voir Figure4). Ne PAS verser l’échantillon
dans la chambre échantillon!
Remarque Vérifier que 100 µL de sang ont été ajoutés au réactif échantillon qui se trouve
déjà dans la chambre échantillon.

II.7- Analyse et traitement des données

Les données obtenues ont été traités par le logiciel Microsoft Excel 2010, logiciel utilisé pour
le tracé des graphes et des tableaux. Les différentes prévalences ont été obtenues par la formule :
Prévalence :
P= n / N x 100
N : le nombre de cas total, n : le nombre de cas, P : la prévalence
Sexe ration :
r= (a / b) x 100
Avec
r; le ratio a; le nombre de genre le plus représente b; le nombre de genre le moins représente

II.8- Interprétation des résultats
Résultat Interprétation
HIV-1 DÉTECTÉ (HIV-1 DETECTED) Les acides nucléiques cibles du HIV-1 sont détectés.
HIV-1 NON DÉTECTÉ (HIV-1 NOT Les acides nucléiques cibles du HIV-1 ne sont pas
DETECTED) détectés.
NON VALIDE (INVALID) La présence ou l’absence des acides nucléiques cibles

du HIV-1 est impossible à déterminer.
ERREUR (ERROR) La présence ou l’absence des acides nucléiques cibles

PAS DE RÉSULTAT La présence ou l’absence des acides nucléiques cibles

(NO RESULT)

TROISIEME PARTIE : RESULTATS

ET DISCUSSION
TROISIEME PARTIE :
RESULTATS ET DISCUSSION

I- RESULTATS ET DISCUSSION
Au cours de cette étude, nous avons recensé 260 patients répondant à nos critères d’inclusion,
soit un sex ratio de 1,36 avec pour moyenne âge de 21,27 semaines.
 Prévalence globale de la PCR 1
POURCENTAGES
Détecté
8%
Non-Détecté
92%
Figure 12 : Prévalence globale de la PCR 1
La figure 12 montre la prévalance globale de la PCR1 chez les nouveau-nées, il se dégage que
8,08% sont testé positifs. Ces résultats rejoignent celui obtenu par BOUBACAR sur une étude faite
à Bamako en 2019.

 Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction du sexe
57,70%
Pourcentage
42,30%
60,00%
50,00%
40,00%
30,00% 6,00% 10,90%
20,00%
10,00%
0,00%
Féminin Masculin sexe
Pourcentage globale d'age Pourcentage des detecte fonction du sexe
Figure 13: Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction du sexe

La figure 13 montre la répartition des résultats de la PCR1 fonctions du sexe. De cette figure,
il se dégage que le sexe le plus touché était le sexe masculin.
 Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction de l’âge
Prevalences
78,94%
58,46%
50%
23,03% 15,38% 12,50% 3,08% 12,50%
[4 – 21] [22 – 39] [40 – 57] [58 – 72]

Tranche d'ages
Pourcentages dans la nôtre population Pourcentages des cas
Figure 14 : Prévalence des résultats de la PCR 1 fonction de l’âge

La figure 15 montre la répartition des résultats de la PCR1 fonctions de l’âge. De cette figure,
il se dégage que la tranche d’âge la plus touché était celle comprise entre 4 et 21 semaines. Ces
résultats concordent avec celui obtenu par RAZINA en 2008 sur une étude fait à Bamako. Cette
différence s’explique par le fait qu’à cette tranche d’âge l’enfant est plus s’explose du fait d’être
rapproche de sa mère et de sa vulnérabilité.
Tableau 5 : répartition des patients fonction de résultats de la PCR 2
RESULTAT PCR2 POURCENTAGES

Détecté 20%
Non-Détecté 80%
TOTAL 100%
Le tableau 6 montre que les résultats sur les analyses de la PCR. De ce tableau, il ressort que 20%
de nouveau-né sont testé positifs. Par contre, une étude faite en 2011 montre que 22% des
nourrissons sont testés positifs en PCR au Sénégal (chatterjee et al, 2011). Cette différence légère
de résultats peut s’expliquer par le fait qu’au Cameroun, les mesures de la PTME prennent le dessus
dans ce centre hospitalier.
 Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction du sexe
Tableau 6 : Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction du sexe

SEXE POURCENTAGES
Féminin 46,67%
Masculin 53,33%
Total 100%
Il ressort du tableau 7 une prédominance du sexe masculin ce qui concorde avec notre première
PCR.

 Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction de l’âge
Tableau 7 : Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction de l’âge
Ages (en semaines) [4 – 21] [22 – 39] [40 – 57] [58 – 72]
Pourcentages dans la nôtre 0% 40% 40% 20%
population
Pourcentages des cas 0% 0% 16,67% 66,67%
Prevalences
66,67%
40% 40%
20%
16,67%
0% 0% 0%
[4 – 21] [22 – 39] [40 – 57] [58 – 72]

Tranche d'age
Pourcentages dans la nôtre population Pourcentages des cas
Figure 15 : Prévalence des résultats de la PCR 2 fonction de l’âge
La figure 15 montre la répartition des résultats de la PCR2 fonctions de l’âge. De cette figure, il se
dégage que la tranche d’âge la plus touché était celle comprise entre 58 et 72 semaines. Ces résultats
sont toute de même différents avec celui obtenu à la PCR1 avec un écart très significatif. Cette
différence s’explique par une autre forme de contamination pour certain car a la première PCR
leurs résultats était négatif. Ceci laisse dont penser que cette tranche d’âges l’enfant est expose au
risque majeur de transmission tel que le type d’allaitement, l’usage des certains outils souille et
bien d’autre.

QUATRIEME PARTIE:
CONCLUSION ET PERSPECTIVES
QUATRIEME PARTIE :
CONCLUSION
ET
PERSPECTIVES

CONCLUSION
L’étude de la prévalence du VIH chez les enfants exposés âgés de 4 à 72 semaines, suivis au
centre Mère et Enfant de la Fondation Chantal Biya: cas de diagnostic précoce nous a permis de
relever les particularités suivantes :
Tous les patients de notre étude avaient au moins un antécédent parental porteur du VIH-
1, la majorité des patientes étaient de sexe féminin et sont les plus atteints. Les tranches d’âge les
plus infectées sont celles situées en majeur partie dans la tranche d’âge de 4 à 21 semaines pour la
PCR 1 et 58 à 72 pour la PCR2.
Dans cette étude, nous avons enregistré vingt-sept enfants infectés par le VIH, soit un taux
de transmission de 8,08% pour la PCR1 et 20% pour la PCR2.
Cette étude bien qu’ayant montré les insuffisances dans la prévention de la transmission
mère-enfant du VIH, nous interpelle sur les solutions à apporter pour améliorer le niveau de
prévention de la transmission mère-enfant du VIH.
De ce travail, découlent les perspectives suivantes :

 Etudier la suivit de l’évolution de l’infection avec l’âge chez ces enfants ;
 Etudier la TME fonction des paramètres sociodémographiques de la mère.

CINQUIEME PARTIE: REFERENCES

BIBLIOGRAPHIQUES ET
WEBOGRAPHIQUES

BIBIOGRAPHIE ET WEBOGRAPHIE
 ASSAN A. Etude épidémio-clinique du SIDA pédiatrique dans les services de
pédiatrie, Hôpital National de Niamey. Thèse de médecine Niamey 1998, (1013) : 101
 BECQUART P, HOCINI H, BELEC L. Transmission du virus de l’immunodéficience
humaine par le lait maternel:données physiopathologiques récentes et rationnel pour
la prévention. Rev. Virologie 2002, 6 : 189-97.
 BECQUART P, HOCINI H, BELEC L. Transmission du virus de l’immunodéficience
humaine par le lait maternel:données physiopathologiques récentes et rationnel pour
la prévention. Rev. Virologie 2002, 6 : 189-97.
 Biochemical and Structural Analysis of Isolated Mature Cores of Human
Immunodeficiency Virus Type 1 [archive] de Welker R, Hohenberg H, Tessmer U,
Huckhagel C, Kräusslich HG en 2000
 Bogard M LJ. Biologie moléculaire et biologie clinique: méthodes .elsevier, TOME
1. 1998
 Boubacar Macky TALL, These doctorat pharmaceutique, edition 2019
 Cave H, Acquaviva C, Bieche I, Brault D, DE Fraipont F FF et al. [RT-PCR in
clinical diagnosis]. Ann Biol Clin 2003, 61, pp.635–644.
 Cellular Targets [archive], sur le site du National Institute of Allergy and Infectious Diseases
 Cellular Targets [archive], sur le site du National Institute of Allergy and Infectious
Diseases
 CHAIX-BAUDIER M-L, BURGARD M, NGO N, ROUZIOUX C. La transmission materno-
fœtale du VIH. Rev. Virologie 1998, 2 : 471-80.
 CHAIX-BAUDIER M-L, BURGARD M, NGO N, ROUZIOUX C. La transmission
materno-fœtale du VIH. Rev. Virologie 1998, 2 : 471-80
 Coulibaly K. Génotypage et exploration du polymorphisme nucléotidique du CCR5,
Récepteur de Chimio kinés et Corécepteur Majeur du VIH-1.de Bamako 05-M-38.
DE BAMAKO. 2005.
 Dembélé D. Cours de bioinformatique. Strasbourg. France, 2005

 Diouf A, Avril A, Cissé ML, Bouaicha JC, Sow F, Cissé G. Prévention de la transmission mère
enfant du VIH en milieu hospitalier à Dakar au Sénégal. Journal de la SAGO 2005 ;6(1) : 13-
20
 Dr. CHOUIKHA Anissa MA Universitaire à l’Institut Pasteur de Tunis Laboratoire de
Virologie Clinique. Infection à VIH : aspects virologiques et histoire naturelle. Novembre
2010. Disponible à l’URL :http : //www.infectiologie.org.tn. [consulté le 05/07/2018]
 Francette AM. Prévention de la transmission mère-enfant du VIH. Expérience du CHU de

Libreville. [Thèse]. Med : Libreville ; 27 Mars 2007 .103p.
 GAGARA ISSOUFOU MADOUGOU A. Séroprévalence de l’hépatite C chez les
personnes vivant avec le VIH au Niger. Thèse de médecine, Niamey 2007 (N° 1491),
86p.
 GIRARD P-M, KATLAMA CH, PIALOUX G. VIH. Edition 2004,6ème édition,

635p.
 GIRARD P-M, KATLAMA CH, PIALOUX G. VIH. Edition 2004,6ème édition, 635
p.
 HAMIDINE I. Introduction de la charge virale dans le suivi biologique des patients
vivant avec le VIH au Niger : résultats préliminaires à propos de 83 cas. Thèse de
médecine Niamey 2007, (1503).
 Holodniy M, Katzenskein DA, Sengupta S,Wang AM,Casipit C SD. Détection and
quantification of human immunodéficiency virus rna in patients serum by use of the
polymerase chain reaction. J Infect Dis 1991;163:862–6.
 Jackson JB, Musoke P, Fleming T, Guay LA, Sherman J, Bakaki P et al. Intrapartum and
neonatal single- dose nevirapine compared with zidovudine for prevention of mother- to- child
transmission of HIV- 1 in Kampala, Uganda: 18- month follow- up of the HIVNET 012
randomised trial. Lancet.2003 Sep 13;362(9387) :859-68
 Jackson JB, Musoke P, Fleming T, Guay LA, Sherman J, Bakaki P et al. Intrapartum and
neonatal single- dose nevirapine compared with zidovudine for prevention of mother- to- child

transmission of HIV- 1 in Kampala, Uganda: 18- month follow- up of the HIVNET 012
randomised trial. Lancet.2003 Sep 13;362(9387) :859-68
 KAPLAN J-C, DELPECH M. Biologie moléculaire et médecine. Médecine-
Sciences Edition Flammarion 1989 : 610
 Khong-Josses MA, Khelil N, Guillaume AS, Ekoukou D. Infection à VIH et grossesse : étude
rétrospective de 124 cas. Pathologie Biologie 2002 ; (50) :544-6.
 LEROY V, DABIS F. Réduction de la transmission mère-enfant du VIH en Afrique :
de la recherche clinique aux programmes de santé publique. Rev. Médecine tropicale
1999, .59 (4) : 456-64.
 MAMADOU S. Diversité génétique du VIH-1 au Niger : Etude des variants des groupes M et
O. Thèse de doctorat d’état Es sciences pharmaceutiques, Dakar 2003 : 167.
 MAMADOU S. Diversité génétique du VIH-1 au Niger : Etude des variants des
groupes M et O. Thèse de doctorat d’état Es sciences pharmaceutiques, Dakar 2003 :
167.
 MOHAMED ALI Ag SOULEYMAN, extrait mémoire doctorat medecine, 2019
 MORAND-JOBERT L, LEFRERE J-J, BROSSARD Y, VITTECOQ D,
BARRESINOUSSI F, BRUN-VEZINET F. Les virus de l’immunodéficience
humaine. Les virus transmissibles par le sang, médecine sciences sélection. John
Libbey Eurotext 1996, 357 : 105-48.
 Mouffok N. Infectiologie-CHU Oran :VIH/SIDA cours novembre
2013.Disponible à l’URL : http://fr.slideshare.net. [Consulté le 20/05/2022]
 ONUSIDA. Fiche d’information. Dernière statistique sur l’épidémie de Sida.
 RAZINA Ali ADA, mémoire doctorat pharmaceutique, 2008.
 ROSENHEIM M, ITOUA –NGAPORO A. SIDA. Infection à VIH, Aspects en zone
tropicale. Editions Marketing/ Ellipses, 1989 : 336
 https://fr.wikipedia.org/wiki/Laboratoire_de_diagnostic_des_infections_virales
 www. Bibliosanté.ml
 (Diagnostic Methods in Virology, Virological Methods, Virus Culture, Virus

Isolation » [archive], virology-online.com (consulté le 3 janvier 2018)

 https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset/UNAIDS_FactSheet_fr.pdf
 https://www.voaafrique.com/a/le-sida-la-tuberculose-et-le-paludisme-le-trio-reste-mortel-au-
cameroun/5954922.html#:~:text=Selon%20l%27agence%20Spectrum%2C%20plus,de%2015
%20à%2064%20ans.
 https://www.unaids.org/fr/frequently-asked-questions-about-hiv-and-
aids#:~:text=Le%20VIH%20se%20transmet%20par,accouchement%20et%20de%20l%27alla
itement.
 https://fr.wikipedia.org/wiki/Virus_de_l%27immunodéficience_humaine#Cycle_de_réplicati
on
 http://untori2.crihan.fr/unspf/2010_Lille_Goffard_Virologie/co/05_diagnostic_indirect.html
 https://www.minsante.cm/site/?q=en/node/4092

SIXIEME PARTIE: ANNEXE

Annexe 1 : fiche de collecte de données

PREVALENCE DU VIH PAR PCR CHEZ LES ENFANTS AGES DE 6 SEMAINES
À 18 MOIS EXPOSES AU CENTRE MERE ET ENFANT
CODE INFOS TYPE Accouchmt Traitement RESULTAT
PATIENT MAMAN D’ALLAITEMEN
SEXE
AGE
T
SST CV Mat Arti Mixt Bass Césa Cotr ARV PCR1 PCR2
Rédigé par LAWANE DYA

Annexe 2
Démarrage du test
Cette section énumère les étapes de base pour l’exécution du test. Pour des instructions
détaillées, consulter le Manuel d’utilisation du GeneXpert Dx System ou le Manuel d’utilisation
du système GeneXpert Infinity, selon le modèle utilisé.
1. Mettre le système d’instrument GeneXpert sous tension: • Avec l’instrument GeneXpert
Dx, commencer par mettre l’instrument sous tension, puis allumer l’ordinateur. Le logiciel
GeneXpert démarrera automatiquement. Si ce n’est pas le cas, double-cliqué sur l’icône de
raccourci du logiciel GeneXpert Dx sur le bureau Windows®. Ou • Si l’instrument GeneXpert
Infinity est utilisé, allumer l’instrument. Le logiciel Xpertise démarrera automatiquement. Si ce
n’est pas le cas, double-cliqué sur l’icône de raccourci du logiciel Xpertise sur le bureau Windows.
2. Se connecter au logiciel du système d’instrument GeneXpert en saisissant votre nom
d’utilisateur et votre mot de passe.
3. Dans la fenêtre du système GeneXpert, cliquer sur Créer un test (Create Test) (GeneXpert
Dx) ou cliquer sur Commandes (Orders) et Commander test (Order Test) (Infinity).
4. Lire le N° ID du patient (Patient ID) (facultatif). S’assurer, le cas échéant, de saisir
correctement le N° ID du patient (Patient ID). Le N° ID du patient (Patient ID) est associé aux
résultats du test et indiqué dans la fenêtre Afficher les résultats (View Results).
5. Scanner ou saisir le N° ID de l’échantillon (Sample ID). S’assurer, le cas échéant, de
saisir correctement le N° ID de l’échantillon (Sample ID). Le N° ID de l’échantillon (Sample ID)
est associé aux résultats du test et indiqué dans la fenêtre Afficher les résultats (View Results) ainsi
que dans tous les rapports. La boîte de dialogue Lire le code-barres de la cartouche (Scan Cartridge
Barcode) s’affiche.
6. Lire le code-barres sur la cartouche du test HIV-1 Qual. La fenêtre Créer un test (Create
Test) s’affiche. Grâce aux informations du code-barres, le logiciel remplit automatiquement les
cases des champs suivants: Sélectionner un test (Select Assay), N° du lot (Reagent Lot ID), Numéro
de série de la cartouche (Cartridge S/N) et Date d’expiration (Expiration Date). 7. Cliquer sur
Démarrer le test (Start Test) (GeneXpert Dx) ou sur Soumettre (Submit) (Infinity). Saisir le mot de
passe s’il est demandé. 8. Pour le système GeneXpert Infinity, placer la cartouche sur le tapis
roulant. La cartouche sera automatiquement chargée, le test sera exécuté et la cartouche usagée
sera placée dans le conteneur à déchets.
Ou Pour l’instrument GeneXpert Dx:
A. Ouvrir la porte du module de l’instrument avec le voyant vert clignotant et charger la
cartouche.

B. Fermer la porte. Le test commence et le voyant vert arrête de clignoter. Lorsque le test
est terminé, le voyant s’éteint.
C. Attendre que le système déverrouille la porte du module avant de l’ouvrir et de retirer la
cartouche.
D. Éliminer les cartouches usagées dans un conteneur à déchets pour échantillons approprié,
conformément aux pratiques standard de l’établissement.
Important Avant de démarrer le test, s’assurer que le fichier de définition du test (ADF) du
test HIV-1 Qual est importé dans le logiciel
Annexe 3

Annexe 4
Tableau 8 : Prévalence globale de la PCR 1
RESULTAT PCR1 EFFECTIFS POURCENTAGES

Détecté 21 8,08%
Non-Détecté 239 91,92%
TOTAL 260 100%
Annexe 5
Ages (en semaines) [4 – 21] [22 – 39] [40 – 57] [58 – 72]
Pourcentages dans la nôtre 58,46% 23,03% 15,38% 3,08%
population
Pourcentages des cas 8,55% 5% 12,5% 12,5%
Annexe6
Tableau 10 : répartition des résultats de la PCR 1 fonction du sexe
Détectés a la PCR1 Fonction du EFFECTIFS POURCENTAGES

sexe
Masculin 12 57,14%
Féminin 9 42,86%
TOTAL 21 100%
Annexe 7
Ages (en semaines) [4 – 21] [22 – 39] [40 – 57] [58 – 72]
Pourcentages dans la nôtre 0% 40% 40% 20%
population
Pourcentages des cas 0% 0% 50% 33,3%

Annexe 8
Tableau 12 : répartition des patients fonction du sexe
SEXE EFFECTIFS POURCENTAGES

Féminin 110 42,3%
Masculin 150 57,7%
Total 260 100%
Annexe 9
Tableau 13 : répartition des patients fonction de tranche d’âge
AGES (Semaines) EFFECTIFS POURCENTAGES

[4 – 21] 152 58,46%
[22 – 38] 60 23,08%
[39 – 55] 40 15,38%
[56 – 72] 8 3,08%
TOTAL 260 100%


Lawane Memoire Valide Copie

Transféré par

Informations du document

Copyright

Formats disponibles

Partager ce document

Partager ou intégrer le document

Options de partage

Avez-vous trouvé ce document utile ?

Ce contenu est-il inapproprié ?

Droits d'auteur :

Formats disponibles

Lawane Memoire Valide Copie

Transféré par

Droits d'auteur :

Formats disponibles

REPUBLIQUE DU CAMEROUN REPUBLIC OF CAMEROON

MINISTERE DE MINISTRY OF HIGHER

INSTITUT UNIVERSITAIRE DE TECHNOLOGIE DE NGAOUNDERE

PRÉVALENCE DU VIH CHEZ LES ENFANTS EXPOSÉS AGÉS DE 4 A 72

Effectué du 11 Avril au 28 Juin 2022

Encadreur industriel Matricule : 20B058IU Encadreur école

IV. 2-1- PCR ................................................................................................................ 25

LISTE DES TABLEAUX

Tableau 1 : Taxonomie du VIH (GAGARA, 2007) ........................................................................ 6

LISTE DES ABREVIATIONS

ADN : Acide Désoxyribonucléique

Je dédie ce modeste travail à

Nos remerciements vont particulièrement à :

Figure 1 : Plan de localisation du Centre Mère et Enfant de la fondation Chantal Biya

 Siège social : Rue Henri DUNANT

3- Historique du Centre Mère et Enfant

4- Organisation du Centre Mère et Enfant de Yaoundé

Chef DMT Chef DARH Conseiller Médical Conseiller en

Chef de service Coordonnatrice

Soins Soins Soins Laboratoire Kinésithérapie Radiologie Triage et Vaccination PG

5-1-Le laboratoire d’urgence

5-2-Le laboratoire principal

[Type text] Page ix

 Un Major pour la supervision des activités au sein du laboratoire

5-4-Horaires du Laboratoire et Système de roulement

[Type text] Page x

Au Cameroun, la notion transmission de la mère à l’enfant du VIH-SIDA reste toujours un

Rédigé par LAWANE DYA Page 1

In Cameroon, the notion of mother-to-child transmission of HIV/AIDS remains a public health

Keywords: HIV,TME, RT/PCR, GeneXpert, CME/FCB, Cameroon, exposed children

Rédigé par LAWANE DYA Page 2

Le virus de l'simmunodéficience humaine ou VIH, (en anglais, human immunodeficiency

Rédigé par LAWANE DYA Page 3

 Déterminer la prévalence globale fonction de deux types de PCR ;

Rédigé par LAWANE DYA Page 4

PREMIERE PARTIE : REVUE DE LA

Rédigé par LAWANE DYA Page 5

I. GÉNÉRALITÉS SUR LE VIH

Le virus de l'immunodéficience humaine ou VIH, (en anglais, human immunodeficiency

Tableau 1 : Taxonomie du VIH (GAGARA, 2007)

Classification selon l’ICTV

Rédigé par LAWANE DYA Page 6

1- Situation mondiale de l’épidémie à VIH/SIDA

 28.2 millions de personnes avaient accès à la thérapie antirétrovirale au 30 juin 2021.

Personnes vivant avec le VIH

o 36.0 millions [28.9 millions–43.2 millions] d'adultes.

o 1.7 million [1.2 million–2.2 millions] d'enfants (0-14 ans).

Rédigé par LAWANE DYA Page 7

Personnes vivant avec le VIH ayant accès à un traitement antirétroviral

Nouvelles infections à VIH

Rédigé par LAWANE DYA Page 8

Décès liés au sida

2- Situation de l’épidémie à VIH/SIDA au Cameroun

Rédigé par LAWANE DYA Page 9

II. Caractéristiques du virus

II. 1- Morphologie et Structure du VIH

Une particule virale mature comprend :

 la transcriptase inverse p66/p51 ou rétrotranscriptase qui rétrotranscrit l'ARN viral en ADN

 Une couche de protéine de matrice p17MA qui recouvre la capside.

 Une enveloppe dérivée de la membrane plasmique cellulaire, formée de la bicouche

Rédigé par LAWANE DYA Page 10

□ La glycoprotéine externe gp120 pour le VIH-1, gp125 pour le VIH-2. (MAMADOU,

Le schéma organisationnel du VIH-1 nous est donné par la figure 3 :

Figure 3: Schéma organisationnel du virus VIH (Mouffok, 2018)