CHAPITRE I : Introduction aux biotechnologies

I- Introduction et présentation générale

La question de la capacité de la planète à nourrir ses habitants naît d’inquiétudes liées

à l’évolution de l’offre et de la demande alimentaires mondiales. Cette question suscite des
réflexions et des prises de position sur l’évolution de la productivité des systèmes de
production, les formes d’organisation de l’économie mondiale agricole et la place qu’y
occuperont les nouvelles technologies.

Les techniques biologiques, notamment celles appliquées à l’alimentation, sont aussi

anciennes que l’humanité. Ce qui est manifestement nouveau, c’est le surcroît formidable de
capacité d’action donné à l’homme par les sciences biologiques modernes.

En quelques dizaines d’années, des progrès considérables - préparés par la découverte

déjà ancienne des lois de l’hérédité - ont été accomplis dans la compréhension des
mécanismes fondamentaux de « stockage », d’expression et de reproduction du patrimoine
génétique des êtres vivants. Il reste beaucoup à faire pour comprendre ce patrimoine
génétique, le décoder, saisir les interactions fonctionnelles complexes par lesquelles il
s’exprime. Les scientifiques ont très vite compris qu’il serait intéressant de pouvoir intervenir
pour en modifier tel ou tel élément. Ils ont, en quelques années, développé la capacité
technique à identifier, isoler, multiplier et transférer un ou plusieurs gènes dans un autre
organisme vivant, créant ainsi le génie génétique.

Le stade suivant, celui des applications de la biologie moléculaire et du génie

génétique en vraie grandeur à des fins pratiques, c’est-à-dire des biotechnologies, a été lui-
même franchi très rapidement. Les domaines d’application aujourd’hui les plus importants
sont ceux de la santé humaine à des fins de diagnostic ou de thérapeutique, des applications
agricoles avec l’apparition récente des productions végétales génétiquement modifiées.

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CHAPITRE I : Introduction aux biotechnologies

II- Introduction aux biotechnologies

La biotechnologie a été souvent considérée comme la technologie du 21ème siècle au

même titre que la technologie de l'information. Cela est essentiellement dû aux progrès des
sciences de la vie durant les trois dernières décennies du siècle dernier qui a connu un progrès
fulgurant avec l'avènement de nouvelles techniques dans les sciences biologiques. Ce progrès
a non seulement permis à la recherche scientifique de faire un pas de géant, mais permis
également l'amélioration de la qualité de vie de l'espèce humaine.

Les techniques de l'ADN recombinant, ou le génie génétique, ont bénéficié d’un grand
coup de publicité durant cette période vu qu’on attendait avec beaucoup d’enthousiasme
l’immense soutien que ces techniques nouvelles allaient apporter à la recherche, lequel
soutien s’est finalement manifesté par le développement des capacités industrielles. Revêtant
la même importance que les techniques de l'ADN recombinant, ont été mises au point d’autres
techniques ou manipulations de laboratoire, telles la détermination séquentielle des gènes, la
culture des cellules végétales, la formation d'embryons d'animaux à partir de cellules
provenant de plus de deux donneurs ; les cellules animales hybrides manipulées pour la
production d'un seul type d'anticorps, ainsi que d'autres processus tels la fixation des cellules
sur des matières insolubles en vue d'améliorer la stabilité et le recouvrement. Parallèlement,
des études afférentes à la physiologie animale et à la biologie cellulaire ont montré qu’il existe
des possibilités illimitées concernant l'emploi des matières biologiques complexes dans le
diagnostic et le traitement des maladies affectant l'être humain. A ce titre, il n’y a qu’à citer
l'exemple du traitement du diabète par l'insuline.

La biotechnologie a non seulement contribué au développement des processus

biologiques complétant ainsi les technologies chimiques, mais a surtout développé une
technologie économique, efficace et non polluante. Grâce à l'industrie biotechnologique, des
produits biochimiques sophistiqués ont été mis au point, dont les produits pharmaceutiques,
les techniques de diagnostic et le lessivage bactérien des métaux. Cette technologie à non
seulement suppléé aux technologies chimiques peu efficaces, consommatrices de ressources
naturelles et souvent polluantes, mais a eu un impact positif sur l'environnement, et ce en
ralentissant l'épuisement des précieuses ressources non renouvelables.

Les évolutions des biotechnologies dans les domaines de l’environnement, de la santé,

de la recherche et de l’industrie conduisent la société à s’interroger sur son devenir. Cette
réflexion a besoin de diagnostics précis, d’analyses fiables et de productions innovantes,
conduites avec un souci d’assurance qualité et de sécurité biologique.
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Les biotechnologies conduites en laboratoires d’analyse ou de production (domaine

médical, pharmaceutique, agroalimentaire…) offrent à l’Homme une source de savoirs et de
savoir-faire novateurs adaptés à l’évolution des exigences indispensables à la préservation de
sa santé et de son environnement.

Les biotechnologies modernes sont déjà parmi nous, même si l’opinion publique n’en
prend que progressivement conscience. Cela sera encore plus vrai demain : on considère que
20 % environ des nouvelles molécules pharmaceutiques mises sur le marché au cours des
prochaines années seront issues des biotechnologies, et que les organismes génétiquement
modifiés (OGM) occupent une place importante dans la production de quelque produit
alimentaire comme le soja et le maïs en Amérique.

1- Qu’est-ce que la biotechnologie ?

Donner une définition unique de la biotechnologie est difficile car le domaine englobe
différentes activités scientifiques et de production. Voici quelques définitions issues de la
bibliographie :

- « La biotechnologie est un ensemble d’outils puissants utilisant des organismes vivants

(ou une partie de ces organismes) pour obtenir ou modifier des produits, améliorer des
espèces végétales et animales ou développer des microorganismes destinés à des usages
spécifiques »
- « La biotechnologie est la technique de manipulation des formes vivantes (organismes)
visant l’obtention de produits utiles à l’humanité »
- « La biotechnologie est l’utilisation industrielle d’organismes vivants ou de techniques
biologiques développées par la recherche fondamentale. Les produits biotechnologiques
comprennent : les antibiotiques, l’insuline, l’interféron, l’ADN recombinant et les
anticorps monoclonaux. Les techniques biotechnologiques comprennent : le génie
génétique, les cultures cellulaires, les cultures de tissus, le biotraitement, l’ingénierie des
protéines, les biocatalyses, les biosenseurs et la bioingénierie »
- « La biotechnologie, ce n’est pas une seule technologie, elle rassemble diverses
techniques qui ont en commun la manipulation des cellules vivantes et de leurs molécules
et l’application pratique de ces procédés afin d’améliorer la vie »
- La définition par liste :

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o ADN/ARN :(génomique, pharmacogénomique, sondes géniques, génie génétique,

détermination de séquences/ synthèse/amplification de l’ADN/ARN, profil de
l’expression génique et utilisation de la technologie antisens);

o protéines et autres molécules : (détermination de séquences/synthèse/ingénierie

des protéines et peptides (y compris les grosses molécules hormonales);
amélioration des méthodes d’administration des médicaments constitués de
molécules de grande taille; protéomique, isolation et purification des protéines,
signalisation, identification des récepteurs cellulaires);

o culture et ingénierie des cellules et des tissus (culture de cellules/tissus, génie

tissulaire, y compris les structures d’échafaudage tissulaires et le génie biomédical,
fusion cellulaire, vaccins/stimulants immunitaires, manipulation embryonnaire);

o techniques biotechnologiques des procédés (fermentation au moyen de

bioréacteurs, procédés biotechnologiques, lixiviation biologique, pulpation
biologique, blanchiment biologique, désulfuration biologique, biorestauration,
biofiltration et phytorestauration);

o vecteurs de gènes et d’ARN (thérapie génique, vecteurs viraux);

bioinformatique (constitution de bases de données sur les génomes, les
séquences de protéines; modélisation de procédés biologiques complexes, y
compris les systèmes biologiques);

o nanobiotechnologie (applique les outils et procédés de nanomicrofabrication pour

construire des dispositifs permettant d’étudier les biosystèmes, avec des
applications dans l’administration des médicaments, les diagnostics, etc.).

- Les biotechnologies modernes : sont basées sur la technologie du DNA

recombiné apparues dans les années soixante dix. Elles sont derrière la révolution
génétique. Elles exigent une formation approfondie en Biochimie et Biologie Moléculaire
afin de pouvoir repérer et caractériser la ou les protéines derrière le caractère d'intérêt,
puis isoler le(s) gène(s) gouvernant l'expression de(s) protéine(s). Les biotechnologies
constituent l'un des moyens de l'amélioration génétique.

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2- Historique, origine et évolution de biotechnologie dans le temps

La biotechnologie ne date pas d’hier, elle était déjà présente dans les sociétés
primitives (les plantes et animaux domestiqué sont les résultats de la reproduction sélective,
L’élaboration et l’utilisation de la levure pour faire lever le pain, l’utilisation de bactérie pour
fabriquer des fromages et pour fermenter les raisins en vin, bière, etc.).

2.1. Les débuts de la biotechnologie :

La biotechnologie est à bien des égards une science ancienne. Ainsi, sans connaître ni
comprendre les principes de la fermentation ou de la génétique, l’humanité utilise depuis
l’Antiquité certains procédés biotechnologiques pour la production de fromage, de pain, de
vin, pour l’élevage sélectif des animaux, la culture sélective des plantes, etc. En ce qui
concerne le terme « biotechnologie », il a été inventé par Karl Ereky en 1919 pour décrire
l’interaction entre la biologie et la technologie. Cependant, la biotechnologie n’est pas que
biologie et technologie, il s’agit d’un effort multidisciplinaire mis en place par l’humanité
depuis plus de 5 000 ans. Avec les débuts de la culture des plantes, de l’élevage des animaux,
de l’élaboration de la bière ou du vin et de la production de fromage, c’était l’application des
principes de la biotechnologie au sens large que l’on mettait en place. En fait, le premier stade
du développement biotechnologique est l’utilisation des techniques de fermentation. Ce n’est
que plus tard, dans les années soixante-dix, que l’on commence à les appliquer aux
spectaculaires résultats des techniques émergentes de la biologie moléculaire. Le terme «
biotechnologie » est apparu dans le langage courant relativement récemment. Voici à présent
les principaux domaines relevant des processus biotechnologiques dans le passé :

• boissons alcoolisées (préhistoire)

• élaboration de bière (3 000 av. J.C.)

• élaboration de pain (3 000 av. J.C.)

• élaboration de vinaigre (XIVe 14ème siècle)

• description des cellules de levure par Leeuwenhoek (1689)

• découverte des propriétés de fermentation des levures par Erxleben (1818).

Les applications traditionnelles de la biotechnologie sont également nombreuses. Un

exemple simple est le compostage, qui augmente la fertilité de la terre via la décomposition de
la matière organique par les microorganismes du sol. D’autres applications fréquentes sont la

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production et l’utilisation de vaccins. L’industrie alimentaire propose également de nombreux

exemples de processus biotechnologiques avec la production de vins, de bière, de fromage, de
yaourt, de pain, etc.

2.2. La biotechnologie moderne

L’intérêt actuel de la biotechnologie réside dans le potentiel impliqué par l’union des
procédés et des méthodes biologiques (anciens et modernes) et les techniques du génie
chimique et de l’électronique. La représentation graphique de la biotechnologie moderne
serait un arbre dont les racines seraient les sciences biologiques (microbiologie, génétique,
biologie moléculaire, biochimie) et les branches, le génie chimique des procédés dans son
acception la plus large.

La naissance de la biotechnologie moderne est associée au développement des

procédés de fabrication de la pénicilline à l’échelle industrielle. Pendant la Seconde Guerre
Mondiale, la demande en antibiotiques était très forte, ce qui a donné l’ impulsion aux efforts
collectifs des ingénieurs en chimie et des microbiologistes, qui ont cherché à produire en
masse de la pénicilline à l’aide de méthodes de fermentation. Par la suite, l’industrie
biotechnologique moderne s’est fixé un objectif, utiliser les enzymes. Les enzymes sont les
principes actifs des microorganismes et les véritables responsables des bio-réactions. À la
différence des microorganismes, les enzymes peuvent être manipulées de façon presque
analogue à une molécule chimique, elles ne présentent pas autant de réactions secondaires et
ne se multiplient pas, ce qui évite les problèmes de biomasse. Cependant, ce dernier facteur
peut devenir inconvénient car la plupart du temps, les enzymes ont besoin de coenzymes ou
de médiateurs pour agir et une fois désactivées, elles sont inutiles dans les bio-réactions. Les
premières applications des enzymes dans l’industrie biotechnologique ont été la fabrication
d’édulcorants (par exemple l’obtention de sirop de fructose à partir du blé) et l’utilisation de
lipases et de protéases dans les lessives pour l’élimination des taches difficiles. L’utilisation
des enzymes spécifiques, souvent issues de microorganismes manipulés génétiquement,
annonce la seconde génération de la biotechnologie industrielle (ou biotechnologie moderne),
qui intègre déjà clairement la microbiologie, la biochimie et le génie des procédés.

2.3. La dernière génération de la biotechnologie

La biotechnologie commence à être considérée comme une science moderne dans les
années soixante-dix grâce aux progrès de la biologie moléculaire et de la génétique. Ces

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progrès sont à l’origine des techniques de clonage et d’ADN recombinant qui ont permis aux
scientifiques de mieux connaître les fonctions cellulaires et leurs composants chez les êtres
vivants et ont rendu possible le développement des nouvelles méthodes d’isolement des
cellules mères et des gènes des organismes vivants afin de produire in vitro les produits de
leur métabolisme, qu’auparavant on ne pouvait obtenir qu’à l’aide de l’organisme vivant. La
biotechnologie moderne n’abandonne pas son passé, bien au contraire puisqu’elle l’a intégré à
ses nouvelles méthodes et techniques. Ainsi, elle englobe une vaste gamme de produits et de
services qui reposent sur les progrès actuels spectaculaires des techniques du génie génétique.
La capacité à manipuler l’information génétique la plus fondamentale, l’ADN, a entraîné une
augmentation exponentielle du nombre d’entreprises biotechnologiques se consacrant aux
techniques de l’ADN recombinant. Bon nombre de produits pharmaceutiques sont déjà
fabriqués à l’aide des enzymes et de microorganismes de synthèse ; il s’agit de produits qui
renferment des substances telles que l’insuline, l’interféron ou les plasmides activateurs et qui
étaient très compliqués ou très chers à fabriquer dans le passé. Cependant, limiter la
biotechnologie aux techniques de l’ADN recombinant est une erreur : la biotechnologie
moderne, c’est bien plus que cela, il s’agit de l’application, dans de nombreux domaines,
d’organismes manipulés ou sélectionnés à l’aide de ces techniques dans le but d’obtenir des
produits de haute valeur ajoutée. En conséquence, les technologies englobées dans le concept
moderne de la biotechnologie sont :

• l’ADN recombinant (génie génétique),

• la culture des tissus végétaux,
• la culture des cellules de mammifères,
• les biocatalyseurs,
• le traitement et la réutilisation des produits résiduaires via des méthodes
biotechnologiques (biorémédiation),
• les fermentations,
• l’obtention biotechnologique de combustible et de matière première organique comme
alternative au pétrole,
• le génie des procédés biotechnologiques.

3- Comment on utilise la biotechnologie :

Aujourd’hui on utilise la biotechnologie de trois façons :

- Utilisation directe des cellules

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o Placer la levure dans un bioréacteur pour fermenter les raisins

- Utilisation des protéines/enzymes fait les cellules

o Isoler les antibiotiques des bactéries pour les médicaments humaines

- Utilisation du matériel génétique à l’intérieur de la cellule

o Identification génétique

4- Les différents domaines d’application de la biotechnologie

Devant les innombrables applications des biotechnologies, la profession a senti le besoin

de clarifier et classifier les domaines d’utilisation. Plutôt connues dans le grand public par leur
usage controversé dans l’industrie agro-alimentaire, il était important de ne pas mettre dans le
même sac toutes les déclinaisons de ce mariage entre sciences du vivant et… toutes les autres
sciences et technologies. C’est ainsi que sont nées les grandes branches des biotechnologies,
baptisées par des noms de couleurs : biotechnologie verte, biotechnologie rouge,
biotechnologie blanche, biotechnologie jaune et biotechnologie bleue.

4-1- Les biotechnologies vertes : Concernent la valorisation des productions

agricoles, l’agro-alimentaire et regroupent une série de technologies utilisant
l’organisme des plantes et leurs cellules pour produire et transformer des produits
alimentaires, des biomatériaux et de l’énergie (la culture in vitro, la culture des tissus
végétaux, micropropagation, fusion de protoplaste et transgenèse végétale). Les
biotechnologies vertes constituent les biotechnologies les plus anciennes.

4-2- Les biotechnologies rouges : Touchent le domaine de la santé humaine

(biomédecine) et animale (la culture des cellules de mammifère), en particulier
l’industrie pharmaceutique, la production de médicaments issus d'organismes vivants ou
de leurs composants cellulaires. C'est dans cette catégorie que les efforts les plus
importants ont été entrepris. On estime qu’en 2010, 80% des nouveaux médicaments
seront issus, directement ou indirectement, des biotechnologies modernes (exemple
d'application: Biotechnologies et médicaments du futur, une grande partie de la
recherche actuelle repose sur les biotechnologies)

4-3- Les biotechnologies blanches : Elles emploient de systèmes biologiques

(bacteries) pour la fabrication, la transformation ou la dégradation de molécules grâce à

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des procédés enzymatiques ou de fermentation dans un but industriel. Elles regroupent

les applications industrielles, par l’emploi de systèmes biologiques comme alternative
aux procédés chimiques classiques. Les premières utilisations sont dans les secteurs des
polymères, des carburants, des dissolvants, de la construction, du textile, et de tous les
produits à dominante chimique.

4-4- Les biotechnologies jaunes : Elles rassemblent toutes les biotechnologies se

rapportant à la protection de l’environnement et au traitement ou à l’élimination des
pollutions (biodépollution, bioremédiation, phytoremédiation, ..).

4-5- Les biotechnologies bleues : Elles développent des produits en liaison avec la
biodiversité marine : santé, cosmétique, aquaculture, agro-alimentaire. Elles concernent
la vie marine dont la valorisation des matières premières (agarose, alginates, chitine,
chitosane,..).

Les biotechnologies peuvent être subdivisées en 5 classes:

5- Domaines industriels concernés

Il nous semble important de citer deux autres applications actuelles de la

biotechnologie qui, à l’image du secteur de la santé, impliquent l’utilisation du génie

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génétique : la biorémédiation et les technologies plus propres. Les méthodes de traitement

des déchets toxiques et organiques sont généralement onéreuses chères et elles peuvent
entraîner de nouveaux problèmes environnementaux. La manipulation génétique a permis
d’obtenir des microorganismes peu dangereux et des enzymes spécifiques de dégradation et
de métabolisation des produits résiduaires toxiques. Dans le secteur du traitement des
déchets, cette utilisation des microorganismes manipulés ou sélectionnés ou des enzymes
qu’ils produisent est appelée biorémédiation. Voici quelques exemples de techniques de
biorémédiation :

- obtention de méthane et de gaz à partir de déchets solides urbains,

- digestion de déchets végétaux via bactéries, épurateurs biologiques,
- obtention de biomasse à partir de sous-produits organiques, digestion des nappes de
pétrole via microorganismes, etc.

D’autre part, différents secteurs industriels appliquent actuellement des techniques

biotechnologiques afin de remplacer les techniques industrielles dangereuses pour
l’environnement ou qui le polluent. L’utilisation de microorganismes ou d’enzymes constitue
une technique plus propre ou moins polluante et des déchets plus biodégradables. Il y a ainsi
réduction in situ des effets nocifs des déchets, ainsi que de leur quantité, mais également très
souvent réduction des coûts d’eau et d’énergie.

6- Les nanotechnologies et leurs applications

Les nanotechnologies se situent au millionième de millimètre. A cette échelle là, on

trouve des atomes, des molécules mais également certains virus dont la taille peut varier de
quelques dizaines à quelques centaines de nanomètres.

Les nanobiotechnologies s’intéressent aux plus petites entités pouvant encore

accomplir une fonction. Ces technologies travaillent donc la matière (atomes, molécules) à
l’échelle nanométrique pour l’organiser d’une manière spécifique et aboutir à des
nanoparticules, nanomatériaux ou nanosystèmes aux propriétés particulières et d’intérêt. On a
ainsi généré des nouvelles molécules comme les nanotubes de carbone, de nouveaux
matériaux ou encore des nanocristaux comme le dioxyde de titane utilisé dans certaines
crèmes solaires par exemple. On peut enfin créer des nanosystèmes dans lesquels les éléments
de base sont des nano-objets, qu’il s’agisse d’atomes ou de molécules. Mais les
nanotechnologies ne sont pas qu’une question de taille. Comme déjà indiqué, à cette échelle

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de grandeur, le travail de la matière a généré l’apparition d’objets aux propriétés modifiées si

ce n’est inédit. Il en est ainsi des nanotubes de carbone qui, comparés à l’acier utilisé
industriellement par exemple, sont plus légers et plus résistants que ce métal.

Tableau 1 applications potentielles des nanotechnologies à tous les stades de la chaîne

alimentaire

7- L’utilisation des nanotechnologies dans le domaine du vivant

Le médical est le principal domaine du vivant où les nanotechnologies ont trouvé des
débouchés à l’heure actuelle. Nous allons nous intéresser plus précisément aux champs
d’application des « nanobiotechnologies ». Tout d’abord la nanomédecine. Il s’agit
notamment de la mise au point de nanoparticules capables de ciblage de certaines cellules,
groupes de cellules ou organes du corps humain. Ces nanoparticules, molécules ou protéines

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de synthèse, pourraient intervenir dans l’acheminement des médicaments pour aller s’attacher
aux seules parties du corps humain à traiter et le faire au moment précis où elles sont utiles.
Certaines de ces nanoparticules appelées « points quantiques » sont, pour leur part, utilisée
pour suivre le trajet de molécules dans le corps humain ou détecter visuellement des tumeurs
cancéreuses par exemple, du fait de leurs propriétés à devenir très brillantes par effet de
confinement. Dans le même ordre d’idée, des nanoparticules d’or sont utilisées pour se lier
spécifiquement à certains peptides présents à la surface de tumeurs : sous l’effet d’un rayon
laser appliqué de l’extérieur, ces nouvelles particules éliminent les cellules tumorales par
échauffement de l’or qu’elles contiennent.

D’autres travaux concernent également la mise au point de ce qui est appelé les
interfaces neuro-électroniques : il s’agit d’établir une interface fine entre un cerveau humain
et un ordinateur capable de transcrire les signaux nerveux du cerveau.

D’autres domaines de recherche encore très spéculatifs ne seront pas évoqués ici,
comme la mise au point de nanorobots capables de repérer et de réparer des lésions dans le
corps humain ou les recherches s’inscrivant dans la nébuleuse de la « biologie synthétique ».

Un autre exemple d’application concerne une action directe sur les gènes. Il s’agit de
la mise au point de gènes « calculateurs » (computational gene). Le principe est assez simple
mais l’application n’est pas pour tout de suite : mettre au point un automate moléculaire
comprenant notamment un gène dans sa version fonctionnelle. Présents dans les cellules, de
tels automates détecteraient une mutation apparaissant au sein d’un gène et seraient alors
capables de s’activer eux-mêmes pour conduire à l’expression du gène fonctionnel et
compenser ainsi la mutation apparue.

Citons enfin les biopuces. Il s’agit de molécules - ADN, anticorps, enzymes, ou toute
autre protéine - qui sont fixées sur un support et permettent alors de conduire des analyses
d’échantillons biologiques. Annoncées comme plus puissantes et plus rapides que les analyses
PCR pour l’ADN par exemple, ces biopuces seraient surtout utilisées comme outils de
diagnostic ou de suivi d’une thérapie, la finalité étant de pouvoir détecter plus vite une
maladie et d’observer son évolution en temps réel.

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