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Université des Sciences et Techniques Institut National Supérieur Institut de Recherches

de Masuku d'Agronomie et de Biotechnologies Agronomiques et Forestières


(USTM) (INSAB) (IRAF)

Département de Phytotechnologie
N° d’ordre : N°_ _ _/2021/Phytotechnologie/INSAB
MEMOIRE DE FIN DE CYCLE
Parcours : Ingénieur Agronome
Option : Productions végétales

THÈME :

CARACTERISATION AGRO-
MORPHOLOGIQUE DE DIX LIGNEES DE
TOMATE (Lycopersicum esculentum) DANS
AKANDA AU NORD-OUEST DU GABON

Soutenu par :
BIROUNGOU MANGUINGA Chamforth

Soutenu le 18 /03/ 2022 devant le jury composé de :

Président du jury :

Directeur de mémoire : Pr Samson Daudet MEDZA MVE

Maître de stage : Dr GNACADJA Claude

Examinateur (1) : Dr NZIENGUI IKAPI Hugues

Examinateur (2) : Dr BOUSSIENGUI BOUSSIENGUI Gino

Année académique : 2020 - 2021


TABLE DE MATIERES
TABLE DE MATIERES ............................................................................................................. i

DÉDICACE ............................................................................................................................... iii

REMERCIEMENTS ................................................................................................................. iv

LISTE DES ABREVIATIONS ET SIGLES.............................................................................. v

LISTE DES TABLEAUX ......................................................................................................... vi

LISTE DES FIGURES ............................................................................................................. vii

LISTE DES ANNEXES .......................................................................................................... viii

RESUME ................................................................................................................................... ix

ABSTRACT ............................................................................................................................... x

INTRODUCTION ...................................................................................................................... 1

1 SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE ...................................................................................... 4

1.1 Généralités sur la tomate ............................................................................................. 5

1.1.1 Origine et Systématique ....................................................................................... 5

1.1.2 Description botanique de la tomate ...................................................................... 5

1.1.3 Cycle biologique de la tomate .............................................................................. 7

1.1.4 Ecologie de la plante tomate ................................................................................ 9

1.1.5 Importance alimentaire et nutritionnelle de la tomate ........................................ 10

1.1.6 Contraintes liées à la production de la culture ................................................... 11

1.2 Méthodes d’amélioration et de création variétale chez la tomate.............................. 14

1.2.1 Objectifs de l’amélioration variétale .................................................................. 14

1.2.2 Les principales techniques de sélection.............................................................. 14

1.2.3 Création variétale ............................................................................................... 15

2 MATERIEL ET METHODES ......................................................................................... 17

2.1 Site expérimental ....................................................................................................... 18

2.2 Matériel végétal ......................................................................................................... 18


2.3 Méthodologie pour atteindre l’objectif spécifique 1 ................................................. 19

2.3.1 Dispositif expérimental ...................................................................................... 19

2.3.2 Mise en place de la pépinière ............................................................................. 20

2.3.3 Préparation du terrain ......................................................................................... 20

2.3.4 Repiquage des plants .......................................................................................... 21

2.3.5 Entretien de la culture......................................................................................... 21

2.4 Méthodologie pour atteindre l’objectif spécifique 2 ................................................. 23

2.5 Méthodologie pour atteindre l’objectif spécifique 3 ................................................. 25

2.6 Analyses des données ................................................................................................ 26

3 RESULTATS ET DISCUSSION ..................................................................................... 27

3.1 Résultats..................................................................................................................... 28

3.1.1 Variabilité des caractères agro-morphologiques et potentiels de rendement


(objectifs spécifiques 1 et 2)............................................................................................. 28

3.1.2 Etude de variabilité des caractères étudiés ........................................................ 30

3.1.3 Variabilité liés à l’identification des types et niveaux d’infestation .................. 39

3.2 Discussion .................................................................................................................. 40

3.2.1 Performances des caractères agro-morphologique et potentiels de rendement


(objectifs spécifiques 1 et 2)............................................................................................. 40

3.2.2 Corrélation entre les caractères et regroupement des lignées............................. 42

3.2.3 Expression des lignées liées à l’identification des types et niveaux d’infestation
44

CONCLUSION ET PERSPECTIVES ..................................................................................... 46

REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUE ...................................................................................... I

ANNEXES ............................................................................................................................... VI

Annexe 1 .................................................................................................................................. VI

Annexe 2 .................................................................................................................................VII
DÉDICACE
Je dédie ce modeste travail,

A mes très chers parents, en témoignage de ma reconnaissance pour le soutien, les sacrifices
et tous les efforts qu’ils ont fait pour mon éducation ainsi que ma formation.

Particulièrement à mon père BIROUNGOU MIBIMOU Pierre, pour le goût à l’effort


qu’il a suscité en moi, de par sa rigueur ;

A ma mère MAROUNDOU NZILA Olga, à qui je dois la vie et une part essentielle de
ma personnalité. Qu'elle sache que l'amour qu'elle me donne continue de m'animer et me
permet d'envisager l'avenir comme un défi ;

A ma grand-mère MOULONGOU Alphonsine, qui n’a pas cessé de me conseiller,


encourager et soutenir tout au long de mes études. Je te souhaite une longue vie ;
A mes frères et sœurs (Sergine, Yvan, Laure, Charlène, Daniel, Audrey, Loannis, Jospin,
Cruisse, Geffry, Rosny, Valdo, Khalifa, Flocisse, Chloé, Dave, Naomi, Elvia) qui m’ont
toujours soutenu durant ces années d'étude.
REMERCIEMENTS
Ce mémoire qui représente le couronnement d'un cursus, est le fruit d'un stage que nous avons
effectué à l’Institut de Recherches Agronomiques et Forestières (IRAF). Sa réalisation a été
possible grâce aux efforts conjugués de nombreuses personnes. Qu'il nous soit permis, au terme
de cette étude, d'exprimer notre profonde gratitude et nos sincères remerciements au:

 Pr Maurice OGNALAGA, Directeur Général de l’INSAB, et à tout le corps enseignant


de cet institut pour les efforts consentis pour la réussite de notre formation et pour avoir
contribué à faire de moi un cadre aspirant au développement du monde agricole ;
 Pr Jacques MAVOUNGOU, Directeur Général de l’IRAF et point focal du programme
KAFACI, pour m’avoir permis d’effectuer ce stage au sein de la structure dont il a la lourde
charge de diriger, mais aussi pour les encouragements.
 M. Rolexin ADAMA NGANGORI, Directeur Général de l’Agence de Développement
Agricole du Gabon (ADAG) et représentant pays du programme KAFACI, pour m’avoir
permis d’effectuer ce stage sur le site de l’agence, mais aussi pour les encouragements.
 Pr Samson Daudet MEDZA MVE, mon directeur de mémoire, pour avoir accepté de
m’encadrer, pour sa disponibilité et ses éclairages apportés à l'élaboration du présent
document.
 Dr Claude GNACADJA, mon maître de stage, je tiens à lui témoigner toute ma gratitude
pour avoir créé les conditions favorables pour la réussite de mon stage. Egalement, je lui
suis reconnaissant pour son encadrement, sa constante disponibilité, sa rigueur scientifique
et surtout son amour pour le travail bien fait qui m’a été très bénéfique.
 Dr Ephrem NZENGUE et Ir Armel MOUCKETOU, pour leur contribution à
l’amélioration de la qualité scientifique de ce travail ;
 Le personnel de l’IRAF plus précisément ceux du laboratoire WAVE et celui de l’ADAG,
pour l’accueil, les conseils et les encouragements.
 A ma collègue stagiaire (EFOU NGOUA Epse TCHIAMA Dorisca Princia), pour ce
moment de travail et de sympathie passé ensemble et pour son aide tout au long de ce
travail.
 A tous les étudiants de la 18ème promotion des ingénieurs de l’INSAB, pour l’ambiance, la
solidarité et la fraternité qui a régné tout au long de notre cursus ;
 Tous ceux qui, de près ou de loin ont contribué à ma formation et à la réalisation de ce
travail.
LISTE DES ABREVIATIONS ET SIGLES
ACP: Analyse en Composante Principale

ADAG: Agence de Développement Agricole du Gabon

ADVRC: Centre Asiatique de Recherche et de Développement des légumes

CAH: Classification Ascendante Hiérarchisé

CEMAC: Communauté Economique et Monétaire de l’Afrique Central

FAO: Food and Agriculture Organization of the United Nations

INRAB: Institut National des Recherches Agricoles du Benin

INSAB: Institut National Supérieur d’Agronomie et de Biotechnologie

IRAF: Institut de Recherches Agronomiques et Forestières

JAR: Jour Après Repiquage

JAS: Jour Après Semis

KAFACI: Korea-Africa Food &Agriculture Cooperation Initiative

NKP : Composition azote-phosphore-potassium

OMS : Organisation Mondiale de la Santé

PIB : Produit Intérieur Brut

PRE : Plan de Relance Economique

WAVE: Central and West African Virus Epidemiology


LISTE DES TABLEAUX
Tableau 1 : Position systématique de la tomate ......................................................................... 5
Tableau 2 : Valeur nutritionnelle moyenne pour 100 g de tomate crue mûre .......................... 11
Tableau 3 : Les principaux ravageurs de la tomate .................................................................. 12
Tableau 4 : Les principales maladies biotiques et de la tomate ............................................... 13
Tableau 5 : Liste du matériel végétal ....................................................................................... 18
Tableau 6 : Paramètres liés aux stades phénologiques et paramètres végétatifs. ..................... 22
Tableau 7: Paramètres liés aux composantes de rendement et qualités des fruits ................... 23
Tableau 8: Classification de la sévérité des maladies .............................................................. 26
Tableau 9: Analyse descriptive des variables selon la lignée de tomate .................................. 28
Tableau 10: Statistiques descriptives pour les paramètres de qualités ..................................... 30
Tableau 11 : Matrice des corrélations entre les variables étudiées au seuil de 5%. ................. 32
Tableau 12: Valeurs propres et pourcentage de variation ........................................................ 34
Tableau 13: Variables caractéristiques des clusters ................................................................. 38
Tableau 14: Résultats de l’analyse des caractères liés à l’état sanitaire des plants .................. 39
LISTE DES FIGURES
Figure 1 : Plant de tomate en fructification ................................................................................ 6
Figure 2 : Cycle de développement de la tomate ............................ Erreur ! Signet non défini.
Figure 3: Site d’expérimentation A-Province de l’Estuaire, B- Agence de Développement
Agricole .................................................................................................................................... 18
Figure 4 : Schéma du dispositif expérimental de l'essai........................................................... 19
Figure 5 : Plants en pépinière (C) au 7ème JAS et (D) au 30ème JAS. ................................... 20
Figure 6 : Confection des planches (E) et incorporation de matière organique (F). ................ 21
Figure 7: Mesure de la masse des fruits sains .......................................................................... 24
Figure 8: Différentes formes de tomates utilisées pour décrire une lignée .............................. 25
Figure 9: Rendement des lignées de tomates cultivées ............................................................ 29
Figure 10: Projection des variables quantitatives dans le plan factoriel par les axes 1 et 2
l’Analyse en Composante Principale. ...................................................................................... 35
Figure 11: Projection des lignées dans le plan factoriel par les axes 1 et 2 de l’Analyse en
Composante Principale. ............................................................................................................ 36
Figure 12: Dendrogramme des lignées de tomate issu de la CAH ........................................... 37
Figure 13: Regroupement des individus des clusters ............................................................... 38
Figure 14: Plants de tomate atteint de mildiou (G), jaunisse en cuillère (H) et nécrose apicale
(I) .............................................................................................................................................. 39
LISTE DES ANNEXES
Annexe 1: Fiche de prises de données...................................................................................... VI
Annexe 2: Moyenne des différentes variables quantitatives ...................................................VII
RESUME
La disponibilité de variétés de tomate performantes adaptées aux conditions locales de
production demeure l’une des contraintes majeures pour la filière tomate au Gabon. Ainsi, la
mise au point des variétés made in Gabon s'avère nécessaire. En vue d’augmenter la production
de tomate et surtout la qualité de la semence, une étude a été menée sur le site de l’Agence de
Développement Agricole du Gabon afin de sélectionner les meilleures lignées de tomate
introduites en vue de leur utilisation dans un programme de création et d’amélioration variétale
en se basant sur l’étude des caractéristiques agro-morphologiques de dix (10) lignées de tomate.
Les objectifs poursuivis étaient de déterminer les caractéristiques agro-morphologiques des
lignées, évaluer les composantes de rendement des lignées de tomate et les caractéristiques
qualités des fruits et d’identifier les types et niveaux d’infestation des plants de tomate sur
chaque lignée. Ces lignées ont été évaluées, selon un dispositif en blocs de Fisher avec trois
répétitions. Les observations et mesures ont porté entre autres sur le développement végétatif,
les stades phénologiques, quelques données liées aux paramètres de qualité du fruit, à l'état
sanitaire et les composantes du rendement. Des analyses uni-variées (ANOVA) et multivariées
(ACP, CAH) ont été effectuées sur les données collectées. Les résultats obtenus ont révélé une
variabilité entre les lignées pour l’ensemble des caractères étudiés. L’étude de la phénologie a
montré que le délai de floraison a varié entre 26 et 36 jours après le semis (JAS) et les premières
récoltes ont varié entre 70 et 84 JAS. Pour ces paramètres, les lignées L1, V2 et T ont été
précoces et L9 tardive. L’évaluation des rendements a permis de noter que les lignées L4 et L8
ont été les plus productives avec un rendement net de 26,7 t/ha et 20,5 t/ha. Les fruits les plus
lourds sont ceux des lignées L2 et L4 avec respectivement 87,7 g pour une forme arrondie et
86,6 g pour une forme ovoïde. Une fermeté des fruits est observée chez les lignées L1, L4, L5
et L8. Par ailleurs, un niveau de sensibilité modéré aux maladies et ravageurs a été observé pour
l’ensemble des lignées. Seules les lignées L3 et L10 ont présenté une sensibilité élevée à la
nécrose apicale. Ces résultats permettent d'une part d'avoir une idée sur les performances agro-
morphologiques des lignées, et d'autre part d’identifier les lignées prometteuses pour les
programmes d’amélioration variétale.

Mots clés : Tomate, lignée, caractérisation, agro-morphologie, performance.


ABSTRACT
The availability of high-performance tomato varieties adapted to local production
conditions remains one of the major constraints for the tomato sector in Gabon. Thus, the
development of varieties made in Gabon is necessary. In order to increase the production of
tomato and especially the quality of the seed, a study was carried out on the site of the
Agricultural Development Agency of Gabon in order to select the best lines of tomato
introduced for their use in a varietal creation and improvement program based on the study of
the agro-morphological characteristics of ten (10) tomato lines. The objectives pursued were
to determine the agro-morphological characteristics of the lines, to evaluate the yield
components of the tomato lines and the quality characteristics of the fruits and to identify the
types and levels of infestation of the tomato plants on each line. These lines were evaluated
according to a Fisher block device with three repetitions. Observations and measurements
focused, among other things, on vegetative development, phenological stages, some data related
to fruit quality parameters, health status and yield components. Univariate (ANOVA) and
multivariate (ACP, CAH) analyzes were performed on the collected data. The results obtained
revealed a variability between the lines for all the traits studied. The phenology study showed
that the flowering time varied between 26 and 36 days after sowing (DAS) and the first harvests
varied between 70 and 84 DAS. For these parameters, L1, V2 and T were early and L9 late.
Yield evaluation showed that lines L4 and L8 were the most productive with a net yield of 26.7
t/ha and 20.5 t/ha. The heaviest fruits are those of the L2 and L4 lines with respectively 87.7 g
for a rounded shape and 86.6 g for an ovoid shape. Fruit firmness is observed in lines L1, L4,
L5 and L8. In addition, a moderate level of susceptibility to diseases and pests was observed
for all lines. Only lines L3 and L10 showed high susceptibility to apical necrosis. These results
allow on the one hand to have an idea on the agro-morphological performances of the lines, and
on the other hand to identify the promising lines for the programs of varietal improvement.

Keywords: Tomato, lineage, characterization, agro-morphology, performance.


INTRODUCTION
La production de fruits et légumes est un secteur agricole vital en Afrique subsaharienne
en raison des revenus économiques importants qu'ils génèrent et de la valeur nutritive de ses
composantes (Kere, 2016). Le Gabon, en dépit du potentiel important qu’il offre au regard de
ses atouts naturels, reste caractérisé par une forte dépendance vis-à-vis de l’extérieur en produits
alimentaires. Le Gabon importe plus de 80% de son alimentation (Yves, 2017) . En effet,
aujourd’hui, moins de 40% des besoins alimentaires des populations vivant au Gabon sont
satisfaits localement. Pour combler son déficit en produits alimentaires, le pays est obligé
d’importer à hauteur de 450 milliards de FCFA des produits alimentaires en provenance
majoritairement des pays voisins (Cameroun, Congo, etc.), soit 20% de son Produit Intérieur
Brut (PIB) (Belfegor, 2021). La FAO (Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et
l’agriculture) rapporte que le Gabon a un rendement de 5,5 t/ha en légumes frais, le plus bas de
la zone CEMAC. Le Gabon représente ainsi 33 % des importations légumières d’Afrique
centrale (Mariella et al., 2017). Parmi les légumes cultivés, la tomate (Solanum lycopersicum
L.) occupe une place de choix car, elle compte parmi les cultures légumières les plus
importantes du monde (Naika et al., 2005). Cultivée pour ses fruits, la tomate se classe en
deuxième position parmi les légumes les plus consommés au monde après la pomme de terre
(Fondio et al., 2013). Elle tient une place importante dans l’alimentation humaine et s’utilise à
l’état frais ou transformée (Rafika, 2009). La tomate est utilisée dans la plupart des préparations
culinaires (Samad Houssein et al., 2008). D'après certaines études, une consommation régulière
de tomates ou de produits à base de tomates réduirait les risques de cancers, mais également de
maladies cardiovasculaires, de diabète et d’ostéoporose (CHANFORAN, 2010). Selon les
données de la FAO, sa production mondiale a rapidement augmenté au cours de la dernière
décennie, passant de 141,4 millions de tonnes en 2009 à 177 millions en 2016. En terme de
production mondiale, la Chine est première avec un volume de tomate produit de 56.308.910
tonnes soit 31,8% du total mondiale. Il s’ensuit l’Inde avec 18.399.000 tonnes mais un
rendement très bas de 2,42 kg/m². Puis les Etats-Unis avec 13.038.410 tonnes et un rendement
de 9,03 kg/m², la Turquie avec 12.600.000 tonnes et en cinquième position, l’Egypte avec
7.943.000 tonnes. Au Gabon, la production de la tomate occupe une superficie de 45 hectares
pour un rendement évalué à 8.511,5 kg/ha avec une production annuelle estimée à 385 tonnes,
soit 0,186 kg de tomate produit par personne. Cette production est loin de satisfaire la demande
croissante de sa population. Ce qui implique des importations massives de tomates pour
combler le déficit de production (PLICHET, 2016).
Plusieurs facteurs sont à l’origine de la faible production de tomates au Gabon. Le
développement de la culture de tomates, à l'instar des autres cultures maraîchères des régions
tropicales, est en proie à d'énormes difficultés, notamment la forte pression parasitaire
combinée à l'influence des facteurs environnementaux et climatiques. A ces facteurs, s’ajoute
la persistance des pratiques agricoles rudimentaires qui concourent fortement à la réduction des
productions. Cependant, l’absence de variétés performantes adaptées aux conditions locales de
production demeure l’une des contraintes majeures. En effet, les variétés vulgarisées ou
commercialisées sont en général sensibles aux facteurs biotiques et abiotiques du pays. Aussi,
le développement de la culture de la tomate nécessite-t-il la sélection de variétés adaptées à ces
conditions locales (Thiérry, 2013). Au Gabon, comme partout ailleurs dans le monde, les
semences sont l’élément le plus important de tous les inputs agricoles car sans une bonne
semence, les producteurs ne pourront pas obtenir de bonnes récoltes. Aucun autre apport :
engrais, pesticide ou équipement ne pourra améliorer les rendements si la semence n’est pas de
bonne qualité. C’est fort de ce constat sur l’absence de matériel végétal développé ou introduit
et dans le soucis réduire les importations alimentaires en générale et celle de la tomate en
particulier qu’il est nécessaire pour le Gabon de disposer d’un programme de recherche
spécialisée sur la production de semences de qualité à partir du matériel végétal issu des plantes
annuelles (céréales, légumineuses, plantes à tubercules, banane plantain, etc.) et pérennes
(plantes oléagineuses, fruitières, industrielles…) que le Programme National de Sélection et
Amélioration Variétale et Production de Semences voit le jour (PNSAV-PS) en 2018. Son
objectif est de répondre aux préoccupations des acteurs du développement agricole notamment
les producteurs, les transformateurs, les multiplicateurs semenciers, …à travers la création
variétale (ou sélection et amélioration variétale) et la production de semences de qualité sur
l’ensemble du territoire national.

A ce jour, très peu de travaux de recherche se sont penchés sur des questions visant à
contribuer à l’amélioration de la productivité de la tomate afin d’apporter une ou des solutions
aux acteurs de la filière tomate qui jusque-là peine à se développer. C’est dans ce contexte, que
le Gabon, à travers l’Institut de Recherche Agronomiques et Forestières (IRAF) et l’Agence de
Développement Agricole du Gabon (ADAG) développe dans le cadre du projet KAFACI
(Korea – Africa Food and Agricultural Coopération Initiative) un programme global de
recherche qui vise un « Renforcement de la production de tomate en Afrique pour un rendement
maximal durable ». Ainsi, notre étude qui constitue un axe de recherche de ce programme a
pour objectif principal de sélectionner les meilleures lignées de tomate introduites en vue de
leur utilisation dans un programme de création et d’amélioration variétale en se basant sur
l’étude des caractéristiques agro-morphologiques.

Pour atteindre cet objectif général, cette étude se propose plus spécifiquement de :

 Déterminer sur le plan agro-morphologique les caractéristiques des lignées de tomates


introduites ;
 Evaluer les composantes de rendement des lignées de tomates et des caractéristiques
liées à la qualité des fruits ;
 Identifier les types et niveaux d’infestation des plants de tomates sur chaque lignée.
Le présent mémoire, qui fait le bilan des travaux conduits ainsi que les résultats obtenus,
comporte trois parties. La première partie présente la synthèse bibliographique. Elle traite des
généralités sur la tomate et le point sur la sélection et l’amélioration variétale. La seconde partie
est axée sur la présentation du matériel et la méthodologie utilisée pour atteindre les objectifs
suscités dans le cadre de notre travail. Et la troisième partie est constituée des résultats obtenus
et la discussion. Ce mémoire s'achève par une conclusion, assortie de recommandations et de
perspectives de recherche.
1 SYNTHESE BIBLIOGRAPHIQUE
1.1 Généralités sur la tomate
1.1.1 Origine et Systématique
La tomate est originaire des Andes d’Amérique du Sud, dans une zone allant du sud de
la Colombie au nord du Chili et de la côte Pacifique, aux contreforts des Andes (Equateur,
Pérou) (SIB, 2017). Elle fut domestiquée au Mexique, puis introduite en Europe au XVIème
siècle par les Espagnols, avant même la pomme de terre et le tabac. De là, sa culture s’est
propagée en Asie du Sud et de l’Est, en Afrique et au Moyen Orient (Naika et al., 2005). Le
genre Lycopersicon comprend neuf (09) espèces, dont une seule Lycopersicon esculentum sous
sa forme sauvage cerasiforme, serait l’ancêtre de nos variétés actuelles et qui pourrait être à
l’origine des autres variétés (Rekibi, 2015). Etymologiquement, le mot tomate est une
déformation du mot «inca Tomalt» et le mot «Lycopersicum» qui signifie en latin "Pêche de
loup", appellation peu alléchante à laquelle on a ajouté au XVIIIe siècle l'adjectif «esculentum»
à cause des propriétés gustatives de ce légume-fruit (LABED, 2018). La classification
taxonomique de la tomate (Tableau 1) se présente comme il suit :

Tableau 1 : Position systématique de la tomate


Règne Plantae
Sous règne Tracheobionta
Division Magnoliophyta
Classe Magnoliopsida

Sous classe Asteridae


Ordre Solanales
Famille Solanaceae
Genre Solanum

Source : (Kheira & Chahrazed, 2020)

1.1.2 Description botanique de la tomate


La tomate, Lycopersicum esculentum (Figure 1), de laquelle découlent presque toutes
les variétés trouvées sur le marché, est une plante annuelle ou vivace grimpante voir rampante
de la famille des solanacées.
Fleurs

Feuilles

Fruits non-matures

Tige principale

Figure 1 : Plant de tomate en fructification


C’est une plante climactérique, diploïde à 2n=24 chromosomes, mais il existe de
nombreux mutants (Hanane, 2018).

• Système racinaire
Le système racinaire est très développé et pivotant avec des nombreuses racines. La
plupart des racines se situent à une profondeur de 30 à 40 cm. En sol profond des racines
peuvent être retrouvées jusqu’à un mètre (LABED, 2018). La racine principale produit une
haute densité de racines latérales et adventices (Naika et al., 2005).

• Tige
La tige est anguleuse, épaisse aux entre-nœuds, poilue, de consistance herbacée en début
de croissance, et tend à devenir un peu ligneuse en vieillissant. La croissance de la tige est
monopodiale au début et devient sympodiale après 4 à 5 feuilles. Les bourgeons axillaires
donnent naissance à des ramifications successives, tandis que les bourgeons terminaux
produisent des fleurs ou avortent (Thiérry, 2013).

• Feuilles et Fleurs
Les feuilles sont bisexuées, régulières et entre 1,5 et 2 cm de diamètre. Le tube du calice
est court et velu, les sépales sont persistants. En général il y a 6 pétales qui peuvent atteindre
une longueur de 1 cm, qui sont jaunes et courbées lorsqu’elles sont mûres. Il y a 6 étamines et
les anthères ont une couleur jaune vif et entourent le style qui a une extrémité stérile allongée.
L’ovaire est supère avec entre 2 et 9 carpelles. En général la plante est autogame, mais la
fécondation croisée peut avoir lieu. Les abeilles et les bourdons sont les principaux
pollinisateurs (Naika et al., 2005). Les fleurs sont hermaphrodites (les organes mâles et femelles
sont dans la même fleur), en grappe et généralement de couleur jaune. Les pétales sont en partie
soudés pour former une corolle étoilée. Les sépales sont verts. Les étamines sont jointes pour
former un tube et le pistil est caché dans ce tube (Djamila, 2015).

• Fruit et Graine
Le fruit est une baie charnue de 2 ou 3 loges, à graines très nombreuses, de taille, de
forme et de couleur très variées. Le pédoncule du fruit présente une zone d'abscission, de sorte
que le fruit mûr se détache en conservant une partie du pédoncule ainsi que le calice. Le fruit à
maturité peut se présenter soit rond et régulier ou côtelés (Naika et al., 2005). Les graines sont
nombreuses, chaque fruit contient un nombre important de graines qui varie de 80 à 500 graines.
Elles sont en forme de rein ou de poire, poilues, beiges, de 3 à 5 mm de long et de 2 à 4 mm de
large. L’embryon est enroulé dans l’albumen (Houichiti et al., 1960).

1.1.3 Cycle biologique de la tomate


Selon (Karim, 2017), le cycle végétatif complet de la graine à la graine de tomate (Figure
2) varie en fonction de la variété, l'époque et les conditions de culture. Il s'étend généralement
en moyenne de 3,5 à 4 mois du semis, jusqu'à la dernière récolte (7 à 8 semaines de la graine à
la fleur et 7 à 9 semaines de la fleur au fruit).

Figure 2 : Cycle de développement de la tomate


On distingue 2 grands types de tiges, celui à croissance déterminée, dont la fonction
végétative s'arrête à la fin d'un cycle de production, à la fructification et les types à croissance
indéterminées dont la plante peut croitre indéfiniment. Chez les variétés à croissance
indéterminée, la plante produit un bouquet floral toutes les 3 feuilles durant toute la vie de la
plante, tandis que chez les variétés à croissance déterminée, la floraison est concentrée sur une
courte durée (Thiérry, 2013). Le développement de la plante de tomate s’accomplit en passant
par des phases successives caractéristiques qui sont :

• Germination
La germination est le stade de levée qui mène la graine jusqu’à la jeune plante capable
de croitre normalement (Djamila, 2015). Elle correspond au passage de la vie ralentie à la vie
active qui se traduit par la sortie des radicules et la coléoptile qui émerge en surface pour se
développer en feuille simple. Chez la tomate la germination qui varie entre 4 à 6 jours est de
type épigé. Pendant cette phase, une température ambiante d'environ 20°C et une humidité
relative de 70 à 80% sont nécessaires (Karim, 2017).

• Croissance
La croissance est l'augmentation de dimension d'un végétal. Selon Chougar (2020), la
croissance de la plante de tomate se déroule en deux phases et en deux milieux différents. En
pépinière : de la levée jusqu'au stade six (06) feuilles, on remarque l'apparition des racines non
fonctionnelles et des pré-feuilles. En plein champ, après l'apparition des feuilles à
photosynthèse et des racines fonctionnelles, les plantes continuent leur croissance. La tige
s'épaissit et augmente le nombre de feuilles.

• Floraison
C'est le développement des ébauches florales par transformation du méristème apical de
l'état végétatif à l'état reproducteur (CHOUGAR, 2020). A un certain moment de sa croissance
(qui dure environ un mois), la tomate entre en parallèle avec la mise à fleur, ces fleurs étaient
auparavant des boutons floraux. La floraison dépend de la température et des besoins en
éléments nutritifs de la plante. Elle ne peut fleurir que si la plante reçoit de la lumière pendant
une durée qui lui est propre en plus d'un rapport équilibré en sève (Sawadogo et al., 2015).
• Fructification et de Maturation
Elle débute durant la phase de floraison. Elle commence par la nouaison des fruits de
l’inflorescence de base et se poursuit par les inflorescences supérieures au fur et à mesure de
l’apparition des inflorescences et de la fécondation des fleurs.

Les fleurs se développent, grossissent et après avoir atteint leur taille définitive, elles
commencent par perdre leur coloration verte au profit du jaune puis au rouge de plus en plus
accentué. Cette phase dure environ deux mois, soit de quatre à six mois après le semis. La durée
du cycle végétatif complet de la tomate est de 4 à 5 mois environ pour les semis directs en
pleine terre et de 5 à 6 mois pour les plants repiqués. En contre saison, le cycle végétatif
s’allonge et peut atteindre 7 mois (Thiérry, 2013).

1.1.4 Ecologie de la plante tomate


• Exigences Hydriques
La tomate est une plante des régions chaudes, dont le développement optimum requiert
des températures comprises entre 21°C et 24°C. La température critique est de -2°C, pourtant
le zéro de végétation est de 14°C minimum et 35°C maximum. La lumière intervient sur la
croissance et la fructification de la tomate par sa durée, son intensité et sa qualité. En effet, une
intensité lumineuse inférieure à 1000 lux retarde la croissance et la floraison (Naika et al.,
2005). L’humidité atmosphérique requise pour la tomate est d’environ 76% lors de la
germination, 75-80% durant le développement en pépinière, 70-80% lors du développement
végétatif, 60-80% durant la floraison et 60-70% pendant le développement des fruits (KANSIE,
2017)

• Exigences en Eau
L’évolution des besoins en eau de la tomate est fonction de ses stades de développement
et l’environnement. La plante est très sensible à l’hygrométrie ; elle ne tolère pas les sols
engorgés, ni l’humidité élevée (plus de 80%) et une hygrométrie relativement ambiante de 60%
à 65% est la meilleure pour la fécondation. En effet, lorsque l’humidité est trop élevée, le pollen
est difficilement libéré. Il est essentiel de prévoir un apport d’eau suffisant pendant la
fructification. Le stress causé par une carence d’eau et les longues périodes arides font tomber
les bourgeons et les fleurs et provoquent le fendillement des fruits (Toufik, 2018). Une bonne
alimentation en eau tout au long de la croissance de la tomate permet de : (a) réduire l’incidence
de la nécrose apicale du fruit ; (b) favoriser le développement uniforme des fruits prévient le
fendillement ; (c) favoriser la croissance du feuillage et réduit le risque d’insolation pour les
fruits ; (d) d’améliorer le calibre des fruits et leur nombre (Schiffers, 2003).

• Exigences Edaphiques
La tomate tolère modérément un large intervalle de valeurs du pH, mais, pousse le
mieux dans des sols ou la valeur du pH varie entre 5,5 et 6,8. Le meilleur équilibre nutritionnel
est assuré à des pH compris entre 6 et 7 (Naika et al., 2005). La tomate n’est pas exigeante quant
à la nature du sol. Cependant, elle préfère les terres limoneuses profondes et bien drainées qui
ont une bonne capacité de rétention en eau et une bonne aération, car elle demande un
enracinement profond (Son, 2018).

1.1.5 Importance alimentaire et nutritionnelle de la tomate


La tomate est cultivée pour ses fruits qui sont consommés soit frais ou cuit, soit
transformés industriellement. Elle est utilisée dans de nombreuses préparations culinaires telles
que la salade, les sauces, les soupes ou est transformée sous forme de jus, de concentré, de
ketchup…(Thiérry, 2013). Elle fait partie des légumes les plus consommés au monde et est
riche en vitamines, en particulier A, B et C, en sels minéraux et en fibres, qui sont importants
pour la nutrition et la santé humaine (Chougourou et al., 2012).

La tomate fait l’objet de nombreuses utilisations, en tant que médicament et produit de


beauté notamment. On peut aussi s’en servir comme antifatigue (un jus frais permet
l’accélération de la formation de sucre dans le sang, apportant ainsi un regain d’énergie), et elle
permet aussi de protéger le foie grâce à son contenu en éléments trace antitoxique (comme le
chlorite et le sulfure). Elle permettrait aussi d’agir positivement sur les reins (car elle contient
du potassium), ce qui signifie une diminution de l’hypertension. Elle soulagerait aussi des coups
de soleil, et son acidité peut être bénéfique contre les problèmes de peau (acné par exemple).
Des études épidémiologiques ont en effet montré que la consommation de tomates et des
produits à base de tomates pourraient prévenir certaines maladies chroniques telles que les
cancers de la cavité buccale, du pharynx, de l’œsophage, de l’estomac, du rectum, de la prostate
et du sein (Vaishampayan et al., 2007). Cet effet protecteur est dû à la présence d’antioxydants.
En effet, les composés antioxydants dans les fruits de la tomate comme les flavonoïdes ou
l'acide phénolique sont potentiellement favorables à la santé car ils sont impliqués dans la
prévention des maladies inflammatoires et cardiovasculaires humaines (Bastien et al., 2014;
Mutanen & Anne-Maria, 2011). Le tableau 2 présente la valeur nutritionnelle de la tomate.
Tableau 2 : Valeur nutritionnelle moyenne pour 100 g de tomate crue mûre
Macroéléments (g)
Eau 93
Protides 1
Glucides 4
Lipides 0,3
Vitamines (mg)
Vitamine BI 0,09
Vitamine B2 0,04
Vitamine C 38
Sels minéraux (mg)
Potassium 280
Magnésium 10
Sodium 3
Phosphore 27
Soufre 11
Zinc 0,24
Divers (g)
Fibres 1,2
Cellulose 0,6

Teneurs en caroténoïdes (μg)


β-carotène 449
α-carotène 101
lycopène 2573
Valeur calorifique 20 Kcal

Source : (Thiérry, 2013)

Une consommation quotidienne de tomates pendant deux semaines au moins augmente


la résistance des cellules à l’oxydation (Toussaint et al., 2010). L’organisation mondiale de la
santé, estime qu’une consommation suffisante de tomate réduirait l’incidence des maladies
cardiaques de 31%, celle des accidents vasculaires cérébraux de 11% et celle des cancers gastro-
intestinaux de 20% à 30%. C'est un aliment diététique riche en eau (93 à 95%) et très pauvre en
calories, soit 8 à 20 kcal pour 100 grammes (Grijalbo et al., 2013).

1.1.6 Contraintes liées à la production de la culture


Le développement de la culture de tomate n'est pas sans contraintes. Ces contraintes
varient selon les conditions climatiques. En effet, La culture de tomate peut être sujette à des
contraintes biotiques (attaques de ravageurs, maladies, concurrence de mauvaises herbes,
accidents de végétation) ou à des agressions abiotiques (températures élevées, fortes pluies et
taux d'humidité élevé). Toutefois, les affections les plus destructrices sont les maladies virales,
fongiques et bactériennes, ainsi que les dégâts de nématodes et d'insectes (Thiérry, 2013).
Malgré l'utilisation de variétés hybrides, résistantes, la tomate demeure toujours sujette aux
attaques d’ordre biotique (Bruno, 2011; Toufik, 2018). Les principaux dégâts des ravageurs et
symptômes des maladies sont respectivement récapitulés aux tableaux 3 et 4.

Tableau 3 : Les principaux ravageurs de la tomate

Nématodes à Meloidogyne incognita Des galles sur les racines des plants
galles Chitwood et Meloidogyne attaqués. La tige rabougrit, les feuilles
arenaria Neal. jaunissent, puis la plante dépérit
Acariens Tetranychus urticae La face inférieure des folioles devient
Koch et T. cinnabarinus brune à bronzée. Sur fruit, la peau présente
Boisduval des craquelures
Noctuelles Agrostis segetum Les jeunes chenilles dévorent le collet et
terricoles et Oberdorfer Chloridea entraînent la mort de la plante. Sur fruit,
Noctuelles armígera Hampson, des galeries qui évoluent en pourriture
des fruits
Aleurodes Trialeurodes Rabougrissement des apex et
vaporariorum développement de fumagine sur le miellat
Westwood et Bemisia produit par les larves, transmission des
tabaci Gennadius virus TOCV, TICV et TYLCV
Cicadelles Hialesther obsoletus Transmission du stolbur, mycoplasmose

Mineuses Liriomyza trifolii Burgess, Galeries dans le limbe des feuilles âgées par
Liriomyza strigata Meigen les larves
et Tuta absoluta Meyrick
Pucerons Macrosyphon Enroulement des feuilles, développement
eneuphorbiae Büning de la fumagine et transmission de virus
Myzus persicae Sulzer CMV et PYV
Tableau 4 : Les principales maladies biotiques de la tomate

Maladies Symptôme et dégâts Moyens de lutte

Maladies cryptogamique
-des taches noirâtres sur feuille -utilisation des variétés résistantes
Alternaria -des taches chancreuses sur tige -rotation culturale
-des nécrosent sur fruit -traitement chimique
-Apparition de taches jaunâtre sur -assurer une bonne aération de serres
Oïdium les feuilles

Apparition de taches jaunâtre qui -éviter les excès d’azote et d’eau


Mildiou brunissent rapidement une bonne aération aussi
Maladies bactériennes
-flétrissement unilatéral sur -éviter les terrains infestés
feuilles -aération convenable des serres
Chancre -des coups longitudinaux sur tige -éviter l’apport excessif d’azote
bactérien et pétioles montrent des stries -éviter les excès d’eau
brunâtres -appliquer des fongicides à base de
cuivre
-taches noires sur les feuilles -variétés résistantes
Moucheture -éliminer les plants malades
-des taches brunes nécrotiques
de la tomate
sur fruit
-apparition de taches brunâtres
Gale
entourées d’un halo jaune sur les
bactérienne
feuilles
-ralentissement de la croissance -lutte préventive contre le vecteur
Virose -jaunissement des folioles bemisia tabaci
(TYLCV) -fruit petites et nombreux -utiliser les plants sains

Maladie non parasitaires


-observation des taches brunâtres -irrigation régulière
sur des fruits qui se nécrose par la -apport azotée à base de nitrate -
Nécrose suite ébourgeonnage et effeuillage à temps
apical

-fruit à forme triangulaire, avec -fertilisation potassique avec une


Tomate loges vides et chair moins épaisse. bonne maîtrise d’irrigation et bonne
creuse fermeture des abris pendant la nuit.

Source (Toufik, 2018)


1.2 Méthodes d’amélioration et de création variétale chez la tomate
1.2.1 Objectifs de l’amélioration variétale
Selon Rakotoson & Razafindrakoto (2009), la tomate est une espèce extrêmement plastique,
qui montre une grande souplesse d’adaptation, que l’on cultive dans des conditions variées, et
dont les fruits sont utilisés de différentes façons. Dans chaque cas, il est indispensable d’avoir
des variétés adaptées. Cette adaptation se présente à plusieurs niveaux :

 Adaptation de l'appareil végétatif à divers modes de culture;


 Adaptation des plantes à des stress abiotiques (résistance à des conditions adverses) ;
 Adaptation des plantes à des stress biotiques (résistance aux maladies et parasites) ;
 Adaptation des fruits à diverses destinations et aux exigences des consommateurs
(amélioration de la qualité des fruits).
L’amélioration variétale est un mécanisme très délicat et long qui tient compte de divers
facteurs ; génétiques, physiologiques et pédoclimatiques. Cette amélioration peut utiliser les
techniques de la génétique, du génie génétique, de la biochimie, de la physiologie et de la
biotechnologie (Salah, 2005). L’objectif final de cette amélioration est d’obtenir un matériel
végétal performant, haute production, tolérant aux stress environnementaux, donnant
satisfaction à l’utilisateur et au consommateur, parfaitement homogène pour l’inscription au
catalogue officiel des nouvelles variétés (Gaufichon & Prioul, 2010).

1.2.2 Les principales techniques de sélection


Les premiers facteurs conditionnant le choix des méthodes de sélection et d'amélioration
applicables à une espèce sont le mode de reproduction (sexué ou végétatif) et le type de
pollinisation (allogame ou autogame). Mais la variabilité génétique demeure la base de toute
amélioration des plantes. Elle doit être préservée au cas où elle existe et créée au cas où elle
n'existe pas ou qu'elle s'avère insuffisante (Makan, 2014).

• Sélection massale
C'est la sélection empirique pratiquée depuis des milliers d'années. Les individus qui
participeront à la génération suivante sont choisis phénotypiquement. L'efficacité de cette
sélection massale est liée à la corrélation entre phénotype et génotype et donc à l'héritabilité des
caractères. Ce type de sélection est très proche de la sélection naturelle. C'est donc une méthode
simple mais sommaire, d'autant plus efficace qu'elle s'adresse à des critères en nombre limité,
en corrélation positive et à forte héritabilité (Karim, 2017).
• Sélection généalogique
La sélection généalogique est de loin la méthode la plus utilisée par les sélectionneurs
du monde entier. Elle est efficace pour fixer les caractères à déterminisme génétique simple,
qui sont nombreux chez la tomate et elle permet l’élimination rapide des caractères génétiques
présentant des défauts, en particulier au niveau de l’aspect des fruits (RAKOTOSON &
RAZAFINDRAKOTO, 2009). Ce procédé augmente les possibilités de sélectionner les
caractères recherchés. Le nombre de générations d'autofécondation nécessaires à la création
d'une lignée varie et se situe entre quatre et dix. La méthodologie et le succès d'un programme
de développement des lignées dépendent de l'habileté du sélectionneur, des ressources
disponibles, du testage et de l'évaluation des lignées (Karim, 2017).

• Sélection récurrente
La sélection récurrente est un perfectionnement des méthodes classiques de sélection
caractérisée par la succession de cycles comprenant une phase de brassage, favorisant les
recombinaisons, et une phase de fixation et sélection. Elle présente l'avantage d'améliorer
progressivement des populations, en favorisant la mise en place d'arrangements alléliques
complexes et plus performants, et ainsi d'exploiter au mieux la variabilité génétique disponible.
Il est à noter aussi que l'amélioration en parallèle de sous-populations les unes par rapport aux
autres permet d'aboutir à la sélection de variétés hybrides (Karim, 2017).

1.2.3 Création variétale


La création variétale est une voie privilégiée pour accroître la durabilité et la viabilité
des productions agricoles dans un contexte de fortes contraintes biotiques, abiotiques et socio-
économiques. Elle peut également contribuer à pérenniser, sédentariser et intensifier ces
productions, à accroître la productivité et à améliorer la qualité des produits et leur compétitivité
tout en prenant mieux en compte l’environnement et la santé des consommateurs (Thierry,
2005).

Selon Makan (2014), chez les plantes autogames, la création variétale utilise les
techniques de sélection, d'hybridation, de mutation, de la biologie cellulaire et moléculaire. Les
hybridations consistent à croiser des variétés ou lignées entre elles afin d'incorporer des
caractères intéressants aux descendants.
• L’hybridation
En amélioration des plantes le terme hybride correspond à deux notions. Il peut s’agir
simplement du résultat du croisement entre deux unités parentales qui peuvent être des clones,
des familles ou des populations, de la même espèce, on parle alors d’hybrides in- traspécifiques,
ou d’espèces différentes, on parle alors d’hybrides interspécifiques. L’hybridation correspond
à la réalisation de ce croisement. Mais le terme hybride en amélioration des plantes se réfère en
général à un type de variété commercialisé qui est le résultat du croisement contrôlé à grande
échelle des deux parents de la variété : il serait alors plus correct de parler dans ce cas de variétés
hybrides (Gallais, 2016).

• Biotechnologie
La biotechnologie avec l’usage de la culture des tissus permet aux sélectionneurs
d'échapper aux contraintes du milieu et de réaliser des essais en grand nombre. La biologie
moléculaire à partir des techniques utilisant la réaction en chaîne par polymérase (PCR) met à
la disposition des chercheurs des quantités manipulables d'ADN utilisées pour des études plus
affinées au cours du génotypage, étude d’introgression … (Dufumier, 2006).
2 MATERIEL ET METHODES
2.1 Site expérimental
L’expérimentation a été conduite sur le site de l’Agence de Développement Agricole du
Gabon (ADAG) au quartier Avorbam, situé dans la Commune d’Akanda (0°31'40.69"Nord et
9°23'39.10"Est) Département du Komo-Mondah dans la Province de l'Estuaire au Nord de
Libreville (figure 3).

A B

Figure 3: Site d’expérimentation A-Province de l’Estuaire, B- Agence de Développement


Agricole. (Source : Google Maps)

2.2 Matériel végétal


Le matériel végétal utilisé dans le cadre de notre étude est présenté sur le tableau 5.

Tableau 5 : Liste du matériel végétal


N° Désignation Type Origine
1 CLN3961D Lignée AVDRC
2 CLN4018C Lignée AVDRC
3 CLN3961C Lignée AVDRC
4 CLN4066G Lignée AVDRC
5 CLN4079L Lignée AVDRC
6 CLN4066E Lignée AVDRC
7 CLN4079M Lignée AVDRC
8 CLN4079D Lignée AVDRC
9 CLN4032C-8 Lignée AVDRC
10 CLN3940C Lignée AVDRC
11 Bento 02 (TLCV15) Variété INRAB
12 Bento 02 (Akikon) Variété INRAB
13 LINDO : Témoin Variété COMMERCE

Il est constitué de dix lignées de tomates en provenance du Centre Asiatique de


Recherche et de Développement des légumes (AVDRC), deux variétés de tomates introduites
originaire de l’Institut National des Recherches Agricoles du Benin et une variété utilisée dans
le commerce local.

2.3 Méthodologie pour atteindre l’objectif spécifique 1


(Déterminer au plan agro-morphologique les caractéristiques des lignées de tomates
introduites)

2.3.1 Dispositif expérimental


L'essai a été disposé en blocs de Fischer à 3 répétitions. Le facteur étudié « matériel
végétal » est constitué de 13 variantes dont 10 lignées et 3 variétés. L’expérimentation est
constituée de 39 traitements, 3 répétitions, soit 117 unités expérimentales. La parcelle
élémentaire de culture est constituée d’une planche de 1,5 m de largeur et 6,6 m de longueur
soit une superficie de 10 m². Les plants sont repiqués avec les écartements de 60 cm x 40 cm
(60 cm entre les lignes et 40 cm entre les plants sur la ligne), soit une densité de 21000
plants/hectare. Les variantes sont disposées de façon aléatoire dans chaque bloc comme
l’illustre la figure 4. La distance entre deux parcelles élémentaires a été de 0,5 m. Chaque bloc
a été séparé d’une allée de 1,5 m. La superficie totale de l’essai y compris l’allée de 1,5 m autour
de la parcelle est de 735,3 m2.

28.5m
T L6 V1 L9 L7 L2 L4 L3 L10 V2 L5 L7 L1
Bloc 1

1,5m

L2 L10 L6 L4 L8 T L5 L1 V1 L3 L9 V2 L7
Bloc 2

Gradient

L7 L8 V1 L3 L10 L4 V2 L6 T L1 L2 L5 L9
Bloc 3
25.8m

Figure 4 : Schéma du dispositif expérimental de l'essai.


2.3.2 Mise en place de la pépinière
Un gramme (1 g) de semence de chaque accession a été utilisé pour le semis en ligne
dans des bacs en plastique de dimensions variables et remplis au préalable avec du terreau, un
substrat composé de tourbe noire, compost végétal et de tourbe de coco. Le semis a eu lieu le
08 juillet 2021. L'eau est apportée deux fois par jour (matin et soir). Un ombrage en forme de
tunnel recouverte de film plastique a été construit à 50 cm au-dessus du sol pour protéger les
pépinières, d'une part des pluies et d'autre part contre l’ensoleillement. Pour une croissance
rapide des plants, un apport de N.P.K de formule 15-15-15, à la dose de 17 g/bac a été fait deux
semaines après le semis. La figure 5 montre les plants en pépinière au 7ème et au 30ème jour
après le semis (JAS).

C D

Figure 5 : Plants en pépinière (C) au 7ème JAS et (D) au 30ème JAS.

2.3.3 Préparation du terrain


Sous une serre de 137,75 m2 de superficie, haute de 5m préalablement construit, la
préparation du terrain a consisté à effectuer un labour à une profondeur de 15 à 20 cm sur
chaque parcelle élémentaire à l’aide d’une houe. Ensuite, pour chaque planche de 10 m 2, 300 g
de NPK (15-15-15), 80 kg de fiente de poule, 100 g de super phosphate triple ont été appliqué,
le tout incorporé à une profondeur de 10 à 15 cm à l’aide d’une houe et affiné puis aplani à
l’aide d’un râteau pour obtenir un bon lit de semence (Figure 6).
E F

Figure 6 : Confection des planches (E) et incorporation de matière organique (F).

2.3.4 Repiquage des plants


Les plants de tomates ont été repiqués au bout de 30 jours après le semis, lorsqu’elles
ont eu à peu près 15 cm de hauteur et 5 à 6 feuilles, avec une densité de 60 cm entre les lignes
et 40 cm entre les plants sur la ligne. Le repiquage a eu lieu dans l'après-midi du 6 aout 2021
pour éviter que les plants ne souffrent de l'ensoleillement. Un remplacement des plants morts a
eu lieu quinze jours après repiquage.

2.3.5 Entretien de la culture


Elle comprend les opérations telles que :

 Le tuteurage : des tuteurs de 1, 2 et 1,50 m ont été placés une semaine après la
transplantation ;
 Désherbage : il s’est fait manuellement, pour éviter l’enherbement ;
 La taille : il est fortement recommandé de tailler les plants de tomates pour une
meilleure fructification, aussi bien quantitatif que qualitatif, l’ébourgeonnage et
l’effeuillage ont été réalisés tout au long de la croissance en fonction de la nécessité ;
 Fertilisation : elle a été apportée en six (06) fractions avec quatorze (14) jours
d'intervalle entre deux apports, le premier apport ayant eu lieu au 15ème jour après
repiquage (JAR). Les deux premiers apports sont un mélange de 200 g de NPK (15-15-
15) et 50 g de super phosphate triple(STP) fait par parcelle élémentaire. Les quatre (4)
dernières fractions interviennent dans la phase de nouaison et fructification des plants
sont un mélange par parcelle élémentaire de 50 g de STP et de 150 g de sulfate de
potasse.
 Traitement phytosanitaire : un traitement (insecticide et fongicide) avec du
Lambdacyaholothrine 3ml/10L d’eau et 3L de bouillie/m² a été effectué a lieu au 7ème
JAR.
Pour valider cet objectif, les observations et mesures, pour la plupart sont basées sur le
descripteur de la tomate proposé par IPGRI (2001) comme l’indique le tableau 6.

Tableau 6 : Paramètres liés aux stades phénologiques et paramètres végétatifs.

N° Variables Codes
1 Délai de germination ou de levée Dl
2 Taux de reprise Trp
3 Délai de 50% de floraison Df
4 Délai de maturité Dm
5 Durée du cycle Dc
6 Hauteur à la floraison Hf

Les observations ont été effectuées selon les différents stades de développement des
cultures. Elles sont liées aux caractères agro-morphologiques des lignées (stades phénologiques
et paramètres végétatifs).

 Délai de levée (Dl)


Il définit le nombre de jours du semis à la germination des graines.

 Délais de floraison (Df) et de maturité (Dm)


Les dates phénologiques comme les délais de floraison et de maturité des graines ont
été déterminés lorsque 50 % des plants d’une parcelle élémentaire ont atteint le stade concerné.
Ces variables sont notées en nombre de jours après repiquage (JAR).

 Délai du cycle
Il représente le nombre de jours qui s'écoulent du repiquage au jour où se fait la première récolte
des fruits matures et sains.
 Taux de reprise (Tr)
Quinze (15) jours après le repiquage (JAR), par comptage des plants levé, il a été déterminé le
taux de reprise selon la formule suivante :
Nombre de plantes présentes x 100
Tr =
Nombre de plantes repiquées
 Hauteur au stade floraison (Hf)
La mesure de la taille des plants à ce stade a été faite à partir de la longueur de la tige principale
depuis le collet jusqu’à l’extrémité de la plus haute feuille à l’aide d’un décamètre.
L’échantillonnage a consisté à choisir de manière aléatoire sept (07) plants par parcelle
élémentaire en excluant les pieds de bordure pour la mesure des paramètres.

2.4 Méthodologie pour atteindre l’objectif spécifique 2


(Evaluer les composantes de rendement des lignées de tomates et les caractères qualités fruits)

Les composantes de rendement ont été évaluées sur sept (07) plants par parcelle
élémentaire à partir des récoltes. Par contre, pour les paramètres de qualités du fruit,
l’échantillonnage a consisté à prendre par parcelle élémentaire, de manière aléatoire dix (10)
fruits à maturité pour l’observation et la mesure des paramètres.

Pour valider cet objectif, les notations ont porté sur les paramètres mentionnés dans le tableau 7.

Tableau 7: Paramètres liés aux composantes de rendement et qualités fruits

N° Variables Codes
1 Diamètre du fruit Dmf
2 Longueur du fruit LFr
3 Nombre de fruits avariés Nfa
4 Nombre de fruits sains Nfs
5 Masse moyenne du fruit Mmf
6 Poids des fruits sains Pfs
7 Poids des fruits avariés Pfa
8 Rendement net RdtN
9 Rendement potentiel RdtP
10 Forme du fruit Frf
11 Fermeté du fruit Fmf

Le poids des fruits sains et ceux avariés (Figure 7) de chaque variété a été divisé par la surface
utile de la parcelle élémentaire, puis ramené à l'hectare pour avoir le rendement potentiel (RdtP)
et le rendement net (RdtN) suivant les formules ci-dessous
P P’
RdtP = x 1000 RdtN = ’ x 1000
S S

Avec,

Rdt: Rendement (T/ha)

P : Poids total des fruits sains et avariés (kg)

P' : poids total des fruits sains (kg)

S : Surface utile de la parcelle (m2)

Figure 7: Mesure de la masse des fruits sains

 Longueur du fruit (Lonf)


Relevée sur une section longitudinale du bout de la tige à la partie apicale du fruit avec une
règle graduée.
 Largeur du fruit (Larf)
Relevée sur une section transversale du fruit, au diamètre le plus large à partie d’une règle
graduée.
 Masse moyenne des fruits (Mmf)
Elle est déduite du poids des dix (10) fruits obtenu à l’aide d’une balance électronique pour
chaque lignée à partir de la formule suivante:
Masse totale des dix fruits (g)
Masse moyenne (g) =
𝐧𝐨𝐦𝐛𝐫𝐞 𝐝𝐞 𝐟𝐫𝐮𝐢𝐭 (10)
 Forme prédominante du fruit (Frf)
Elle a été déterminée en comparant les fruits de chaque lignée aux différentes formes décrites
par IPGRl (Figure 8).

1 2 3 4 5 6 7 8
Figure 8: Différentes formes de tomates utilisées pour décrire une lignée

1 : aplati 5 : cordiforme
2 : légèrement aplati 6 : cylindrique
3 : arrondi 7 : pyriforme
4 : allongé arrondi (ovoïde) 8 : ellipsoïde

 Fermeté du fruit
Relevée en pressant dans la paume de la main le fruit dans sa partie la plus large, c’est-à-dire
sur les côtés, 10 jours après la récolte à pleine maturité du fruit :
3 : Molle
5 : Moyenne
7 : Ferme

2.5 Méthodologie pour atteindre l’objectif spécifique 3


(Identifier les types et niveaux d’infestation des plants de tomates sur chaque lignée)

L'identification des maladies et dégâts a consisté en l'observation des symptômes de


maladies fongiques, maladies bactérienne, maladies virales et à noter le degré de sévérité selon
l'échelle de notation de réaction pathogène hôte (Tableau 8). Les observations se sont faites à
partir du stade de 30 JAR.
Tableau 8: Classification de la sévérité des maladies
Indice de Niveau d’atteinte % de Niveau de la maladie Réaction pathogène de
sévérité pieds l’hôte
atteints
1 Aucun pied n’est atteint 0 Pas de maladie Immunité ou non atteint
2 Quelques pieds sont Résistant
atteints ≤ 25 Léger

3 Près de la moitié des pieds 25 à 50 Modéré Modérément sensible


sont atteints
4 Plus de la moitié des pieds 50 à 75 Grave sensible
sont atteints
5 Presque la totalité des 75 à 100 Très grave Très sensible
pieds sont atteints
Source : (Thiérry, 2013)

2.6 Analyses des données


Les données brutes collectées (Annexe I) ont été saisies et traitées par le tableur Excel
version 2013. Les valeurs moyennes des données quantitatives (Annexe II ) obtenues d’une part
sur sept (7) plants choisis de façon aléatoire par lignée par répétition et étiquetés et d’autre part
sur dix (10) fruits choisis de façon aléatoire par traitement et par répétition ont été calculées sur
Excel également.

Une analyse de la variance (ANOVA) à un critère de classification a d’abord été réalisée


pour l’ensemble des paramètres étudiés en vue de montrer l'existence de différences
significatives entre les moyennes. Lorsqu’une différence significative a été observée entre les
différents caractères (p < 0,05), la comparaison des moyennes a été faite à l’aide des tests LSD
de Duncan et de Fisher au seuil de 5% pour classer les moyennes en groupes homogènes.

Ensuite, la structuration de la variabilité des lignées à travers le regroupement en


effectuant dans un premier temps par l'Analyse en Composante Principale (ACP), pour évaluer
la ressemblance entre les accessions analysées et comprendre les relations existantes entre elles.
Deuxièmement, la Classification ascendante hiérarchique (CAH) est réalisée pour classer les
accessions en groupes homogènes selon la méthode Ward en utilisant un indice de similarité de
la distance Euclidienne. Ces analyses multivariées ont été réalisées à l’aide du logiciel R
[version 4.1.2].
3 RESULTATS ET DISCUSSION
3.1 Résultats
3.1.1 Variabilité des caractères agro-morphologiques et potentiels de
rendement (objectifs spécifiques 1 et 2)
L’analyse des performances des lignées révèle qu’elles sont significativement
différentes (P < 0,05) de par leurs valeurs moyennes pour les différents caractères étudiés
(Annexe II). Il est remarqué que certaines lignées s’expriment mieux que le témoin, par contre
d’autres se sont exprimées plus faiblement.
Pour les 13 lignées étudiées, il ressort que le délai de levée ou de germination (Dg) est
de 6 jours après semis (JAS) pour l’ensemble des accessions, sauf pour les variétés V1 et V2
pour qui la germination est précoce, soit 4 jours après le semis. En ce qui concerne la date de
floraison, elle est tardive pour la lignée (L9), soit 36 jours après repiquage (JAR) et précoce
pour L1, V2 et T, soit un intervalle de 26 JAR.
Il ressort également de l’analyse descriptive (Tableau 9) que la valeur minimale et
maximale du caractère délai de maturité (Dm) est respectivement de 70 et 84 JAR. Cet intervalle
est de 81 et 92 JAR pour la durée de cycle (Dc). La hauteur à la floraison (Hf) varie quant à elle
entre 55,10 et 71 cm avec moyenne de 63,46 cm.
Tableau 9: Analyse descriptive des variables selon la lignée de tomate

Variable Minimum Maximum Moyenne Ecart- C.V (%) Pr>F Signifiance


type
Dg 4 6 5,69 0,75 12,67 0,002 S
Trp (%) 53 100 87,35 11,8 12,98 0,772 NS
Df (j) 26 36 30,77 3,63 11,34 0,197 NS
Dm (j) 70 84 77,31 4,93 6,13 0,795 NS
Dc (j) 81 92 87,85 4,33 4,74 0,522 NS
Hf (cm) 55,1 71 63,46 4,54 6,88 0,278 NS
LFr (cm) 4,8 7,9 7,05 0,85 11,63 0,278 NS
lFr (cm) 3,3 7,7 5,46 1,26 22,3 0,009 S
Nfs 12 570 181,2 144,36 76,56 0,106 NS
Nfa 3 231 99,92 58,51 56,25 0,565 NS
Mmf (g) 40,1 87,8 73,22 16,052 21,06 0,087 NS
Pmfs (Kg) 0,6 26,7 12,83 8,2 61,41 0,672 NS
Pmfa (Kg) 0,3 18,4 7 4,54 62,38 0,520 NS
RdtN T/ha 0,6 26,7 12,83 8,2 61,41 0,672 NS
RdtP T/ha 0,9 38,6 19,85 10,24 49,6 0,959 NS
Dg : délai de germination ; Trp : taux de reprise ; Df : délai de germination ; Dm : délai de maturité ; Dc : durée
du cycle ; Hf : hauteur à la floraison ; LFr : longueur du fruit ; lFr : largeur du fruit ; Nfs : nombre de fruits sains ;
Nfa : nombre de fruits avariés ; Mmf : masse de fruit ; Pmfs : poids du fruit sains ; Pmfa : poids de fruit avarié ;
RdtN : rendement net ; RdtP : rendement potentiel
La même analyse montre une variabilité des composantes de rendements et la qualité de fruits.
On note que la longueur du fruit varie entre 4,8 cm et 7,9 cm et la largeur des fruits est comprise
entre 3,3 cm et 7,7 cm avec une moyenne de 5,46±1,26cm. Pour le nombre de fruits sains (Nfs)
et ceux avariés (Nfa), il varie respectivement de 12 et 570 fruits avec une moyenne globale de
181,2±144,36. Le nombre de fruit produits par les différentes lignées et variétés oscillent entre
3 et 213 fruits avec une moyenne globale de 99,92±58,5 fruits. La variable masse moyenne de
fruits (Mmf) récoltés par lignée (Mmf) varie de 40,10 à 87,80 g de fruits/lignée. Par rapport au
poids des fruits sains (Pmfs) on observe également une variabilité de 0,6 à 26,7 0kg pour une
moyenne globale de 12,83±8,2 kg. Pour le poids des fruits avariés (Pmfa), il varie entre 0,3 et
18,4 kg avec une moyenne de 7±4,54 kg. Le rendement potentiel en tonne à l’hectare (RdtP)
est compris entre 0,90 et 38,60t/ha et celui du rendement net en tonne à l’hectare (RdtN) se
situe entre 0,60 et 26,70t/ha. La figure 9 présente les rendements par hectare de chaque lignée
ou variétés éprouvé.

40
35
Rendemnt en t/ha

30
25
20
15
10
5
0
L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7 L8 L9 L10 V1 V2 T
Lignées de tomates

Rendement Net (t/ha) Rendement Potentiel (t/ha)

Figure 9: Rendement des lignées de tomates cultivées


Les lignées L2, L4, L5, L8, V1 et T ont des rendements, aussi bien théoriques que potentiels,
supérieurs à 15 tonne par hectare.
Les fréquences des modalités des caractères qualités de fruits sont présentées dans le tableau
10 qui montre une variabilité importante des caractères.
Tableau 10: Statistiques descriptives pour les paramètres qualités

Variables Modalités Effectif/Modalités Fréquence par modalité


(%)
Allongé ovoïde 4 30.76
Arrondi 2 15.38
Forme (Frf) Cordiforme 3 23.08
Cylindrique 1 7.69
Légèrement aplati 3 23.08
Ferme 4 30.76
Fermeté (Fmf) Molle 1 7.69
Moyennement ferme 8 61.53

Pour la forme des fruits, 30,76 % sont allongée arrondie (ovoïde) pour les lignées L4, L5 L6
ainsi que le témoin Lindo. On trouve 23,08 % de forme cordiforme (L7, L8 et L9) et légèrement
aplatie (L1, L10 et V1) et 15,38 % avec une forme arrondie (L2 et L3). Seule la variété V2
présente une forme cylindrique.
Pour la plupart des lignées, notamment L2, L3, L6, L7, L9, V1 et T, la fermeté est moyenne
soit 61,53%. La variété V1 est la seule à présenter une fermeté molle.

3.1.2 Etude de variabilité des caractères étudiés


Le premier niveau d'analyse (ANOVA à un facteur) a permis de révéler l'existence de
différences significatives (P < 0,05) entre les lignées pour les paramètres étudiés. Toutefois,
elle ne permet pas d'apprécier le niveau d'interaction qui existe entre les variables elles-mêmes
d'une part et entre les variables et les lignées d'autres part. L’ACP générée pour établir la matrice
de corrélation de Pearson pour voir les relations entre les variables quantitatives et les
corrélations significatives (P < 0,05) est présentée dans le Tableau 11. Ce tableau révèle des
corrélations hautement positives entre le délai de germination (Dg) et la largeur du fruit (lFr) (r
= 0,69), puis entre le délai de germination (Dg) et la masse moyenne du fruit (Mmf) (r = 0,77).
De même, on observe des corrélations positives entre le taux de reprise (Tpr) et le délai de
floraison (Df) avec r = 0,65; le délai de floraison et le délai de de maturité (Dm) (r = 0,68).
Cette corrélation existe également entre la hauteur à la floraison (Hf) et la longueur du fruit
(LFr), la hauteur à la floraison et la largeur du fruit avec r équivalent respectivement à 0,55 et
0,56. On observe aussi une positivité de la corrélation entre le nombre de fruits saints (Nfs) et
poids moyen des fruits sains (Pmfs) (r = 0,76), nombre de fruits saints (Nfs) et rendement net
(RdtN) (r = 0,76), nombre de fruits saints (Nfs) et rendement potentiel (Rdtp) ( r=0,66), nombre
de fruits avariés (Nfa) et poids moyen des fruits avariés (Pmfa) (r = 0,84), nombre de fruits
avariés (Nfa) et rendement potentiel (Rdtp) (r = 0,66), masse moyenne du fruit (Mmf) et
rendement potentiel (Rdtp) (r = 0,65), poids moyen des fruits sains (Pmfs) et rendement net
(RdtN) (r = 1), poids moyen des fruits sains (Pmfs) et rendement potentiel (Rdtp) (r = 0,90),
poids moyen des fruits avariés (Pmfa) et rendement potentiel (Rdtp) (r = 0,63) et en fin entre
rendement net (RdtN) et rendement potentiel (Rdtp) (r = 0,90) ou la corrélation positive élevée.

Par ailleurs, les corrélations négatives sont observées entre le délai de maturité (Dm) et
la longueur du fruit (LFr) (r = -0,57) et la longueur du fruit (LFr) et nombre de fruits avariés
(Nfa) ainsi qu’entre la longueur du fruit (LFr) et nombre de fruits saints (Nfs) avec des valeurs
respectives de r de -0,56 et -0,55.
Tableau 11 : Matrice des corrélations entre les variables étudiées au seuil de 5%.

Dg Trp Df Dm Dc Hf LFr lFr Nfs Nfa Mmf Pmfs Pmfa RdtN RdtP
Dg 1,00
Trp 0,16 1,00
Df 0,16 0,65** 1,00
Dm -0,20 0,46 0,68** 1,00
Dc -0,43 0,40 0,45 0,33 1,00
Hf 0,29 -0,30 -0,07 -0,49 0,06 1,00
LFr 0,39 -0,19 -0,30 -0,57 -0,31 0,55 1,00
lFr 0,68** -0,14 0,23 -0,24 -0,45 0,56 0,54 1,00
Nfs -0,46 -0,03 -0,01 0,00 0,33 0,10 -0,54* -0,33 1,00
Nfa -0,25 -0,15 -0,10 -0,20 0,01 -0,14 -0,55* -0,26 0,54 1,00
Mmf 0,77** 0,06 -0,15 -0,54 -0,28 0,37 0,18 0,38 0,00 0,19 1,00
Pmfs 0,06 0,04 -0,15 -0,41 0,19 0,44 -0,07 -0,02 0,76** 0,36 0,53 1,00
Pmfa 0,21 -0,11 -0,10 -0,37 -0,21 -0,02 -0,24 0,02 0,13 0,84** 0,52 0,23 1,00
RdtN 0,06 0,04 -0,15 -0,41 0,19 0,44 -0,07 -0,02 0,76** 0,36 0,53 1** 0,23 1,00
RdtP 0,14 -0,01 -0,17 -0,50 0,06 0,34 -0,16 -0,01 0,66** 0,66** 0,65** 0,90** 0,63** 0,90** 1,00
** :corr. Positif Hautement significative (p<0.05). * :corr. négatif significative (p<0.05)
• Structuration de la variabilité des lignées
Le Regroupement des lignées par ACP du tableau 12 présente les valeurs propres et le
pourcentage de variance des caractères quantitatifs qui contribuent à la variation totale. D’après
le critère de kaiser (Akanvou et al., 2012) , qui suit le principe de l’inertie minimale, tout axe
dont la valeur propre est supérieure à 1 doit être retenu pour l’analyse.
Tableau 12: Valeurs propres et pourcentage de variation

Composantes AXE 1 AXE 2 AXE 3


Variance propre 4,91 3,78 2,23
%Variance totale (%) 32,71 25,22 14,87
%variance totale accumulée (%) 32,71 57,93 72,81
Dg -0,20 -0,70** 0,49
Trp -0,18 0,30 0,74**
Df -0,31 0,26 0,80**
Dm -0,65** 0,50 0,38
Dc -0,06 0,61** 0,38
Hf 0,40 -0,48 0,21
LFr -0,01 -0,84** -0,01
lFr 0,11 -0,75** 0,34
Nfs 0,59 0,67** 0,01
Nfa 0,58 0,48 -0,28
Mmf 0,71** -0,41 0,29
Pmfs 0,88** 0,19 0,21
Pmfa 0,59 0,05 -0,16
RdtN 0,88** 0,19 0,21
RdtP 0,96** 0,18 0,10

** : Variables contribuant le plus à la formation des axes indiqués


Dg : délai de germination ; Trp : taux de reprise ; Df : délai de germination ; Dm : délai de maturité ; Dc : durée
du cycle ; Hf : hauteur à la floraison ; LFr : longueur du fruit ; lFr : largeur du fruit ; Nfs : nombre de fruits sains ;
Nfa : nombre de fruits avariés ; Mmf : masse de fruit ; Pmfs : poids du fruit sains ; Pmfa : poids de fruit avarié ;
RdtN : rendement net ; RdtP : rendement potentiel
Les trois premiers axes ont été retenus afin de décrire la variabilité totale des accessions
de tomate. Ces axes permettent à eux seuls d’expliquer 72,80 % de l’information totale entre
les lignées. Ils cumulent respectivement 32,71 %, 25,22 % et 14,87 % de la variance totale.
Le cercle de corrélation (Figure 10) obtenu après ACP avec les deux premiers axes qui
cumulent à 57,93 % explique le degré de représentation et la corrélation entre les variables.

Figure 10: Projection des variables quantitatives dans le plan factoriel par les axes 1 et 2
l’Analyse en Composante Principale.

La première composante principale (axe 1) avec 32,71 % de la variation totale est forte
et les caractères liés au rendement potentiel (RdtP), rendement net (RdtN), poids moyen des
fruits sains (Pmfs), masse moyenne du fruit (Mmf) sont positivement corrélés avec le poids
moyen des fruits avariés (Pmfa), le nombre de fruits sains (Nfs) et le nombre de fruits avariés
(Nfa). Il est cependant négativement corrélé avec la variable délai de maturité (Dm). Il peut
donc être décrit comme l’axe de productivité et de qualité des lignées.
La seconde composante principale (axe 2) décrit 25,22 % de la variabilité. Elle regroupe
selon l’importance de leurs contributions, d’une part, les caractères nombre de fruits sains (Nfs)
et délai du cycle (Dc) qui sont fortement et positivement corrélés, puis d’autre part, les
caractères délai de germination (Dg), longueur du fruit (LFr) et largeur du fruit (lFr) qui sont
fortement et négativement corrélés. Cet axe rend compte du stade phénologique des plantes et
dimensions des fruits.
La troisième composante (axe 3) qui explique 14,87 % de la variation fait ressortir les
liens entre les variables délai de floraison (Df) et taux de reprise (Trp) qui sont fortement et
positivement corrélés. L’axe 3 apporte des informations complémentaires à celles de l’axe 2
relative au stade phénologique de la plante.

Figure 11: Projection des lignées dans le plan factoriel par les axes 1 et 2 de l’Analyse en
Composante Principale.
L’analyse des contributions et des cosinus carrés indique que ce sont les lignées qui ont le plus
contribué à la formation des axes.
• Regroupement des lignées par CAH
La Classification Ascendante Hiérarchique (CAH) a été effectuée sur la base des variables
quantitatives étudiées. Le dendrogramme réalisé (Figure 12) selon la méthode de Ward (1963)
a permis d’identifier trois groupes (clusters). Les individus des clusters présentent généralement
pour les variables étudiées, une similarité illustrée par leur regroupement sur le graphe de la
figure 13 qui montre un nuage de points plus ou moins réunis.
Figure 12: Dendrogramme des lignées de tomate issu de la CAH
Dim 2 (25,22%)
Figure 13: Regroupement des individus des clusters

Le résultat de la CAH a permis d’identifier trois groupes ainsi que les individus constituant ces
différents clusters. Le groupe 1 est composé des lignées L7, L9, L10 et V2. Le groupe 2 est
constitué uniquement de V1 tandis que le groupe 3 regroupe les lignées L1, L2, L3, L4, L5, L6,
L8 et le témoin Lindo (T).
Les v-test (valeurs tests) obtenues (Tableau 13) ont servi à trier les variables afin d’identifier
celles qui caractérisent les clusters.

Tableau 13: Variables caractéristiques des clusters


V. test
Variables cluster1 cluster2 cluster3
Dg -2,34
Trp
Df
Dm 2,16 -2,82
Dc
Hf
LFr -2,74
lFr
Nfs 2,80
Nfa -2,25
Mmf -2,20 2,90
Pmfs -2,51
Pmfa -2,20 2,08
RdtN -2,51
RdtP -2,99 2,44

Légende : Dg : délai de germination ; Trp : taux de reprise ; Df : délai de germination ; Dm : délai de maturité ;
Dc : durée du cycle ; Hf : hauteur à la floraison ; LFr : longueur du fruit ; lFr : largeur du fruit ; Nfs : nombre de
fruits sains ; Nfa : nombre de fruits avariés ; Mmf : masse de fruit ; Pmfs : poids du fruit sains ; Pmfa : poids de
fruit avarié ; RdtN : rendement net ; RdtP : rendement potentiel

Ce tableau révèle que sept variables ont servi au regroupement des individus du cluster 1, il
s’agit de " délai de maturité, masse moyenne de fuit, poids des fruits sains, poids des fruits
avariés, nombre des fruits avariés, rendement net et le rendement potentiel" ; pour le cluster 2,
il s’agit de "délai de germination, longueur du fruit, et nombre de fruits sains"; quant au cluster
3 il regroupe les lignées suivant les variables "délai de germination, masse moyenne du fruit,
poids des fruits avariés et rendement potentiel.
3.1.3 Variabilité liés à l’identification des types et niveaux d’infestation
Des cas de maladies fongiques comme le mildiou ont été observés chez certaines
variétés. De même, des enroulements de feuilles avec des symptômes de jaunisse en cuillère
ont été observés. Les maladies de nécrose apicale ont été également identifiées (Figure 14).

Toutefois,
G le niveau de sévérité de laHmaladie varie d’une lignée à une
I autre (tableau 15).

Figure 14: Plants de tomate atteint de mildiou (K), jaunisse en cuillère (L) et nécrose
apicale (M)
La plupart des accessions ont été peu infectées par ces maladies (Tableau 14).

Tableau 14: Résultats de l’analyse des caractères liés à l’état sanitaire des plants

Variables Modalités Effectifs


léger 7,69
Mildiou modéré 23,08
pas de maladie 69,23

léger 7,69
Jaunisse en cuillère modéré 23,08
pas de maladie 69,23

grave 15,38
Nécrose apicale léger 53,84
modéré 23,08
pas de maladie 7,69
Des signes de plages noires, pâles, irrégulières, d’aspect huileux sur les feuilles, les
tiges et les fruits qui noircissent et durcissent avec un aspect bosselé, ont été observé sur les
lignées L4, L5 et L6 pour un niveau de maladie modéré (23,08 %) et sur la lignée L1 pour un
faible niveau de maladie (léger). On note que ces symptômes sont caractéristiques du mildiou.
Le témoin n’a pas enregistré cette maladie.
Des symptômes typiques de la maladie de la jaunisse en cuillère (enroulement des
feuilles, jaunissement, rabougrissement) ont été observés chez la lignée L8 et L9 pour un niveau
de maladie léger mais modéré pour L7 et la variété V2. Le dégât physiologique évalué a été la
présence de nécrose apicale reconnaissable par une tâche noire à l’extrémité du fruit, rendant
ce dernier non commercialisable. Le niveau d’atteinte le plus grave a été observé pour les
lignées L3 et L10 (15,38 %) et le niveau modéré pour L1, L2 et L4. On note que seule la
variété V2 n’a enregistré aucune forme de nécrose apicale.

3.2 Discussion
3.2.1 Performances des caractères agro-morphologique et potentiels de
rendement (objectifs spécifiques 1 et 2)
Les résultats de l’analyse de la variance ont mis en évidence l’existence d’une variabilité
pour l’ensemble des caractères étudiés. Les variétés en provenance de l’INRAB ont eu un délai
de germination court (4 jours). Tandis que celles provenant de l’AVDRC et le témoin Lindo
ont un délai de germination plus important (6 jours). (Senan et al., 2015) ont également
remarqué que les variétés issues de l'AVRDC avaient eu un faible pouvoir germinatif comparé
aux variétés locales sous les conditions de climat tropical chaud humide. Cet écart de
germination serait lié à la différence de l’état de dormance dans lequel les graines ne peuvent
pas germer même dans des conditions favorables. Ces résultats sont en accord avec les travaux
de (Aya et al., 2011) qui montrent que la dormance et la germination des graines sont contrôlées
par l’action combinée de plusieurs gènes et de deux hormones principales. L’acide abscissique
(ABA) induit et maintient la dormance tandis que l’acide gibbérellique (GA) favorise la levée
de dormance et la germination. Les mêmes auteurs soulignent que ce processus décrit est sous
l’influence des facteurs environnementaux.

Le taux de reprise pour l’ensemble de la collection testée est supérieur à 50%. La lignée
L8 a le meilleur taux de reprise soit 100% contre le plus faible (53%) pour L1. Cette bonne
reprise se justifierait par l'adaptation des plantes au milieu mais aussi à la sélection des plantules
vigoureuses opérée avant le repiquage. En effet, il est probable que la vigueur des plantules en
pépinière ait influencé leur reprise en champ. Selon (SIB, 2017), la germination des graines, la
croissance et le développement de la tomate sont influencées par l’environnement et en
particulier le climat. De nombreuses études, notamment celles de (Hope et al., 2017), (Ojetayo
et al., 2011) ont montré que les taux de reprise du chou pommé, de la tomate, de l’épinard et de
l’oignon étaient similaires sur des sols fertilisés et non fertilisés. Ils ont montré qu’en effet la
reprise des plantules ne dépend pas des éléments minéraux contenus dans le sol.
Concernant les stades phénologiques, les résultats ont distingué des lignées précoces et
tardives en rapport avec le délai de floraison, le délai de maturité et la durée du cycle. En effet,
le délai de floraison (Df) et le délai maturité (Dm) seraient liés à la différence entre leur cycle
de culture et à l’effet environnemental. En effet, les variétés à cycle court fleurissent
précocement et celles à cycle long tardivement. Les résultats obtenus corroborent ceux de
(Fondio et al. (2013) et Coulibaly et al (2019) qui indiquent que de la floraison jusqu’au
murissement des fruits, plusieurs phénomènes endogènes d’ordre physiologiques et
biochimiques interviennent, notamment, la mobilisation des éléments minéraux pour l’initiation
florale et le remplissage des fruits. La capacité de chaque lignée à puiser les éléments minéraux
et l’eau pour les besoins métaboliques de la plante, sous l’effet des facteurs environnementaux
(lumière, température…) varie fortement et influence la durée de floraison, la fructification et
le murissement des fruits. Par ailleurs, Fondio et al. (2013) soulignent que la différence entre
les variétés pour la durée de la production peut être due à des facteurs extérieurs dont les
attaques de maladies fongiques, bactériennes ou virales qui peuvent agir sur le développement
des plantes réduisant ainsi leur capacité de production.
Les résultats obtenus sur les rendements potentiels et nets ont montré une variabilité
entre les lignées. Ainsi, la lignée L4 présente le meilleur rendement (26,7 t/ha) devant le témoin
Lindo (20,7 t/ha). La lignée L9 a obtenu le rendement le plus faible (0,6 t/ha). Cette différence
serait expliquée d’une part par les fortes pluies enregistrées au cours de l’essai, pourtant réaliser
en saison sèche, qui ont favorisé chez certaines lignées le phénomène de pourriture apicale et
d’autre part, la sensibilité aux nuisibles (insectes et pathogènes) qui ont occasionné la pourriture
d’un nombre élevé de fruits. Ces résultats sont similaires aux travaux de (KANSIE, 2017) qui
ont montré que la faible production constatée pourrait s'expliquer par plusieurs facteurs d’ordre
climatique et environnemental. Toutefois, l'on ne peut écarter l'hypothèse que cette faible
production soit imputable aux lignées car ces dernières, sélectionnées dans le cadre de notre
étude, possèdent des capacités productives déjà prouvées dans leurs régions d’origine (Annexe
III). Ainsi, la culture de la plupart d'entre elles serait peu adaptée aux conditions locales de la
zone expérimentale. Certaines lignées se sont distinguées favorablement des autres bien
qu'ayant toutes subi les mêmes traitements.
Les caractères qualités de fruits font ressortir l'existence d'une variabilité au sein des
lignées. En effet, pour le caractère forme, cinq modalités ont été observées, montrant de ce fait
une très grande variabilité. Selon Gilles (2018) l’obtention d’une grande variabilité signifie
l’existence d’un grand potentiel exploitable à des fins d’amélioration variétale. De même,
Kansie (2017) souligne que la forme du fruit fait partie des critères importants en sélection
variétale de la tomate. Cette diversité de forme serait liée à l’environnement et à la variété elle-
même. Ce résultat corrobore avec ceux du CIRAD et GRET (2009) qui montrent que la grosseur
des tomates varie avec la fertilité du sol, la température et le nombre de fruits portés par la
plante. Les variations ont été observées sur la fermeté des fruits avec une moyenne globale de
61,53%. Les fruits les plus fermes ont été ceux des lignées L1, L5, L8 et du témoin. Des résultats
proches ont été observés par Karim (2017) après évaluation respectives de 57 accessions de
tomates qui ont présenté 81,82% de fruits assez fermes. Cette fermeté de la tomate constitue un
critère de choix dans l'appréciation de la qualité et de l'état physico-chimique des fruits. Elle
permet de déterminer la qualité du fruit à supporter la manutention et le transport. A ce effet,
la différence dans la fermeté résulterait selon Garane (2019) de la disponibilité plus ou moins
permanente des éléments minéraux pour la plante tout au long du cycle, qui détermineraient la
fermeté des fruits. De plus le même auteur souligne que la température et la durée de
conservation influencent la fermeté des fruits. Cette fermeté pourrait aussi être d’origine
génétique.

3.2.2 Corrélation entre les caractères et regroupement des lignées


Les corrélations existantes entre les variables quantitatives étudiées porteraient dans
certains cas une importance particulière en sélection et amélioration variétales. Selon Beket &
Dje (2011), les coefficients de corrélations sont des outils primordiaux pour tout sélectionneur
dans le choix des caractères à prendre en considération pour des programmes d’amélioration.
Cela implique par conséquent une variation existante entre les lignées. La variable nombre de
fruits avariés influence négativement le rendement obtenu, à contrario, le nombre de fruits sains
influence positivement la masse moyenne et la moyenne masse influence positivement le
rendement. Cela pourrait s’expliquer par la sensibilité de certaines lignées aux facteurs
biotiques et abiotiques qui entrainent ainsi le rejet de fruits. Ces rejets induisent les faibles
niveaux de rendements nets enregistrés chez certaines lignées. L’augmentation du rendement
est liée au nombre de fruits récolté (NFR) et au poids moyen, caractères associés à l’expression
génotypique et phénotypique de la variété (Souza et al., 2012).
Le regroupement des lignées a permis d’identifier 4 lignées pour le cluster1, une pour
le cluster 2 et 8 lignées pour le cluster 3 dont le témoin Lindo. Les valeurs tests (v-test) obtenues
ont permis de distinguer les variables qui caractérisent fortement les individus de chaque
cluster. Les valeurs tests jouent un rôle important dans la caractérisation d'une classe. Il s'agit
d'un paramètre statistique qui mesure l'écart de la moyenne dans la classe à la moyenne globale
en nombre d'écart type d'une normale. On considère qu’il y a un écartement significatif
lorsqu’elle est supérieure, en valeur absolue. Plus elle est grande en valeur absolue, et plus la
variable est caractéristique de cette classe. Par ailleurs, les v-test positifs indiquent que la
moyenne des individus de la classe est supérieure à la moyenne de l'ensemble de la collection.

Le cluster 3 qui regroupe plus de la moitié des individus de l’essai présents pour les
variables masse moyenne du fruit, poids des fruits avariés et rendement. Son écart est
significatif en termes de comparaison de moyenne du groupe et plus élevée à celle de la
collection. Remarquons qu’à l’exception du délai de maturité, toutes les autres variables qui
caractérisent bien le cluster 1 regroupent les individus à faibles performances agronomiques,
car pour ces variables, les moyennes dans le groupe par rapport à celles de la collection sont
très faibles (v-test négatives). Donc le cluster 1 regroupe les lignées ayant de faibles valeurs
pour les descripteurs agro-morphologiques évalués. Quant au cluster 2, il présente pour les
variables délai de germination et longueur du fruit les v-tests négatives seul la variable nombre
de fruits sains présente un v-test positif. Ces valeurs indiquent dans ce cluster, des moyennes
relativement moins élevées que celles de la collection.

Les résultats de la Classification Ascendante Hiérarchique (CAH), indiquent que les


variables affectant le rendement (le nombre de fruits sains, la masse moyenne du fruit, le poids
des fruits avariés et le rendement potentiel des fruits) puis le délai de maturité et le nombre de
fruits sains sont ceux qui discriminent les classes. Ainsi, une variabilité non négligeable existe
au sein des lignées mais celle existant entre les groupes reste la plus importante. Selon Kansie
(2017), une variabilité génétique intra-accession plus faible qu’une variabilité inter-accessions
serait le propre des espèces autogames. Cette affirmation vient conforter les résultats obtenus
vu que la tomate est une espèce autogame. Les individus du cluster 3 pour la plupart avec le
témoin donnent des fruits de bon calibre. Cela signifie que les lignées à masse moyenne élevée
seraient prédisposées à donner des gros fruits qui auront un effet significatif sur leur
commercialisation. De plus, la variable nombre de fruits sains élevés qui pourrait traduire la
tolérance aux facteurs biotiques et abiotiques et le délai de maturité précoce discriminent
respectivement les clusters 2 et 1. Ils ont des traits intéressants et exploitables pour la sélection
variétale. En effet, des croisements pourraient s’opérer pour améliorer les performances
agronomiques ou la qualité des fruits. Les résultats de la classification hiérarchique ascendante
ont révélé des accessions performantes que sont L2, L5, L4, L6, L7 et L8. Seules les lignées
L2 et L5 se distinguent nettement du témoin. Ces lignées élites peuvent être utilisées comme
des géniteurs ou des lignées parentales dans des programmes d’amélioration variétale.

3.2.3 Expression des lignées liées à l’identification des types et niveaux


d’infestation
L’indice de sévérité modéré pour l’ensemble des maladies et dégâts enregistrés sur les
lignées pourrait s'expliquer d’une part par le traitement préventif effectué une semaine après le
repiquage et d’autre part par le niveau de tolérance acceptables de ces lignées contre ces
maladies. La maladie fongique, le mildiou, observé est causée par Phytophthora infestans. Le
mildiou peut s’attaquer à tous les organes aériens de la plante (Hadjer, 2013). La pression
parasitaire bien que faible combinée à l'influence du milieu pourrait justifier néanmoins les
rendements faibles obtenus. La prolifération des pathogènes seraient induite par les facteurs
environnementaux défavorables à la culture de tomate (Torres, 2020).
La plupart des variétés testées se sont montrées tolérantes à la jaunisse en cuillère.
Tomato Yellow Leaf Curl (TYLC) est la maladie qui provoque l’enroulement et le jaunissement
des feuilles de tomate (Rebolledo, 2007). TYLCV est transmis par la mouche blanche, Bemisia
tabaci Gennadius, qui appartient au groupe des «Géminivirus» (Zi et al., 2010). Elle est
considérée comme l'une des maladies virales dévastatrices des cultures de tomates. Les dégâts
peuvent être de 50 à 70% si l’attaque est tardive et de 100% si elle se produit en pépinière
(Basak, 2016). Le niveau de prolifération bas de la virose serait dû d'une part, par le traitement
effectué qui auraient limité la propagation du vecteur et ainsi freiner l'expansion de la maladie.
Et d'autre part, par le fait que notre zone de culture et ses conditions n'étaient favorables à la
prolifération du vecteur (Bemisia tabacci). Ces résultats sont similaires à ceux de (Zi et al.,
2010) qui montrent que la pullulation du vecteur B. tabacci intervenait plus en saison sèche et
que les symptômes étaient plus importants sur les variétés en cette saison.
La nécrose apicale observée sur les lignées avec un niveau d’atteinte le plus grave pour
les lignées L3 et L10 (15,38 %) traduit la sensibilité de ces derniers face à cette maladie,
réduisant ainsi les rendements. Ces résultats pourraient être dus à des pluies survenues lors de
la phase de fructification, ce qui aurait entrainé un taux d’avarie en fruits beaucoup plus
important. Des résultats identiques ont été obtenus au sud de la Cote d’Ivoire au cours de
l’évaluation de neuf variétés de tomates. Il a été observé non seulement le flétrissement
bactérien mais aussi des avaries ayant entrainé des rejets dus à une absorption excessive de
calcium dans les cellules suite à un excès d’eau d’irrigation, entrainant de faibles rendements
(Fondio et al., 2013).
CONCLUSION ET PERSPECTIVES
La tomate est une denrée alimentaire importante car fortement consommée par toutes
les populations du monde. La connaissance de la diversité de ses caractères au sein d’une
population de plantes cultivées est une donnée fondamentale en amélioration variétale.
L’objectif de cette étude était d’évaluer les caractéristiques agro-morphologiques de dix lignées
de tomates.

Il ressort des résultats obtenus qu'il existe une variabilité agro-morphologique dans la
collection de lignées étudiées. L‘évaluation morphologique selon les descripteurs de l’IPGRI a
montré une variabilité au niveau de la forme, la fermeté et la sensibilité aux stress biotiques et
abiotiques. Les variations constatées pour ces caractères seraient dues aux facteurs exogènes,
notamment, environnementaux mais aussi endogènes à la lignée elle-même. La variabilité des
caractères quantitatifs repose entre autres sur les caractères comme le taux de reprise, les dates
phénologiques et les composantes de rendement. Les différentes analyses effectuées ont permis
de regrouper les lignées en trois (03) groupes en fonction des caractères communs qu’elles
partagent. On a ressorti les variables affectant le rendement (le nombre de fruits sains, la masse
moyenne du fruit, le poids des fruits avariés et le rendement potentiel des fruits). Le délai de
maturité et le nombre de fruits sains sont les variables qui discriminent les groupes. Ainsi
l’étude a permis de retenir 6 génotypes que sont L2, L5, L4, L6, L7 et L8 qui présentent des
performances agronomiques intéressants. Cette étude donne une idée à la recherche sur les
lignées d'intérêt pour une éventuelle amélioration variétale. Ceci permettra de mettre au point
de nouvelles variétés performantes.

En termes de perspectives, il est indispensable de réaliser les essais multi-locaux pour


conforter les résultats et valider les données préliminaires. Une caractérisation moléculaire
s’avère importante afin de confirmer ou d’infirmer les variations observées et avoir un meilleur
aperçu du potentiel génétiques du matériel éprouvé.
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ANNEXES
Annexe 1: Fiche de prises de données
Paramètres agro-morphologiques
Date de notation : / / observation :…………………………..
Réplétion N° Lignées code plant plant plant 3 plant plant plant Plant
1 2 4 5 6 7
1 CLN3961D L1
2 CLN4018C L2
3 CLN3961C L3
4 CLN4066G L4
5 CLN4079L L5
6 CLN4066E L6
7 CLN4079M L7
8 CLN4079D L8
1
9 CLN4032C-8 L9
10 CLN3940C L10
11 Bento 02 V1
(TLCV15)
12 Bento 02 (Akikon) V2
13 LINDO : Témoin T

1 CLN3961D L1
2 CLN4018C L2
3 CLN3961C L3
4 CLN4066G L4
5 CLN4079L L5
2
6 CLN4066E L6
7 CLN4079M L7
8 CLN4079D L8
9 CLN4032C-8 L9
10 CLN3940C L10
11 Bento 02 V1
(TLCV15)
12 Bento 02 (Akikon) V2
13 LINDO : Témoin T

1 CLN3961D L1
2 CLN4018C L2
3 CLN3961C L3
4 CLN4066G L4
5 CLN4079L L5
Annexe 2: Moyenne des différentes variables quantitatives

Lignées Dg Trp Df Dm Dc Hf LFr lFr Nfs Nfa Mmf Pmfs Pmfa RdtN RdtP

L1 6,0 53,0 26,0 70,0 84,0 71,0 7,7 7,2 171,0 108,0 82,4 14,0 8,5 14,0 22,4

L2 6,0 95,2 32,0 72,0 89,0 66,7 7,3 6,5 189,0 117,0 87,7 17,2 8,8 17,2 26,1

L3 6,0 90,0 32,0 77,0 84,0 58,6 6,5 5,6 51,0 213,0 80,2 3,9 18,4 3,9 22,4

L4 6,0 90,5 32,0 75,0 92,0 68,7 7,4 5,5 306,0 147,0 86,6 26,7 11,9 26,7 38,6

L5 6,0 86,7 28,0 75,0 84,0 62,3 7,5 6,0 195,0 93,0 79,3 17,0 5,3 17,0 22,3

L6 6,0 81,0 27,0 75,0 81,0 61,7 7,2 5,0 126,0 90,0 80,2 10,1 8,1 10,1 18,3

L7 6,0 95,2 34,0 84,0 92,0 67,6 6,8 5,3 99,0 48,0 72,8 7,9 3,5 7,9 11,4

L8 6,0 100,0 34,0 75,0 92,0 67,4 7,6 6,0 240,0 66,0 83,5 20,5 5,1 20,5 25,6

L9 6,0 91,7 36,0 84,0 84,0 63,3 7,9 7,7 12,0 3,0 50,2 0,6 0,3 0,6 0,9

L10 6,0 95,7 34,0 84,0 92,0 55,1 6,1 4,4 66,0 60,0 71,0 4,8 4,8 4,8 9,6

T1 4,0 85,7 33,0 84,0 92,0 59,6 4,8 3,7 570,0 198,0 50,1 19,7 7,1 19,7 26,8

T2 4,0 80,3 26,0 75,0 92,0 61,4 7,8 3,3 93,0 69,0 40,1 3,7 2,7 3,7 6,5

T3 6,0 90,5 26,0 75,0 84,0 61,6 7,1 4,8 237,0 87,0 87,8 20,7 6,5 20,7 27,1

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