Recherche Bibliographique

LA RECHERCHE BIBLIOGRAPHIQUE
Dr BEN JMAA MAISSA

Service de médecine communautaire et d’épidémiologie
CHU Hédi CHAKER de Sfax

Objectifs
 Interroger avec pertinence les bases de données
scientifiques
 Comprendre comment utiliser et combiner les mots clés
 Apprendre à utiliser correctement les filtres
 Apprendre à utiliser correctement la méthode PICO

Le protocole de
l’enquête
Le protocole de
l’enquête
Conceptualisation Méthodes : Planification

opérationnelle
Ressources
Le protocole de
l’enquête
Conceptualisation Méthodes : Planification

1- Domaine de l’enquête opérationnelle
2- Problématique 1- Choisir le type d’enquête
3- Objectifs de l’enquête 2- Définir la population étudiée
4- Bilan des études 3- Définir la maladie
antérieures 4- Définir la stratégie d’investigation
5- Cadre de l’étude 5- Définir la stratégie d’exploitation
Ressources
1- Moyens à engager
2- Considérations éthiques
3- Calendrier des opérations
4- Monitorage
5- Méthodes de publication des données
INTRODUCTION
Introduction
Pour réaliser un travail scientifique dans n’importe quel
domaine, il faut faire un bilan des études antérieures
= Lire ce que les autres ont pu écrire sur le sujet
Introduction
Pour réaliser un travail scientifique dans n’importe quel
domaine, il faut faire un bilan des études antérieures
= Lire ce que les autres ont pu écrire sur le sujet
RECHERCHE
BIBLIOGRAPHIQUE :
DÉFINITION
Recherche bibliographique : Définition
 Une démarche méthodologique constituée par des

étapes permettant de chercher, identifier, récupérer et
traiter des documents et des informations sur un
sujet donné.
Recherche bibliographique : Définition
 Une démarche méthodologique constituée par des

étapes permettant de chercher, identifier, récupérer et
traiter des documents et des informations sur un
sujet donné.
Recherche bibliographique :
 Des bases de données bibliographiques en accès libre

ou payant sont recommandées pour la recherche des
informations scientifiques et académiques qui sont
fiables.
Une perte de temps ou des lacunes

 Des bases de données bibliographiques en accès libre

ou payant sont recommandées pour la recherche des
informations scientifiques et académiques qui sont
fiables.
Une perte de temps ou des lacunes

 NB: s’assurer de la qualité des sources +++
 Éviter les pages web ou blogs/ Wikipédia/

Youtube : l’information n’est pas vérifiable !!!
 Objectif : repérer les bonnes sources.
LES MOTEURS DE
RECHERCHE
Un moteur de recherche : Définition
 Une application / un logiciel de gestion des bases de

données bibliographiques permettant à un utilisateur
d'effectuer une recherche en ligne

 Trouver l'information recherchée dans des ressources

à partir d'une requête composée de mots clés

 Trouver l'information recherchée dans des ressources

à partir d'une requête composée de mots clés
Un moteur de recherche : Ressources
Les articles
Les livres
Les thèses
Les articles
Les livres
Les thèses
Les articles
Les livres
Les thèses
Les articles
Les livres
Les thèses
COMMENT FAIRE MA
RECHERCHE
BIBLIOGRAPHIQUE DANS
PubMed?
PubMed :
 Le principal moteur de recherche de données bibliographiques de
l'ensemble des domaines de spécialisation de la biologie et de la
médecine.
 Gratuit et donne accès à la base de données bibliographique MEDLINE.
 Interface d’accès à MEDLINE développée conjointement par le National

Center for Biotechnology Information (NCBI) de la National Library of
Medicine (NLM) et les éditeurs de revues biomédicales.
PubMed :
 Le principal moteur de recherche de données bibliographiques de
l'ensemble des domaines de spécialisation de la biologie et de la
médecine.
 Gratuit et donne accès à la base de données bibliographique MEDLINE.
 Interface d’accès à MEDLINE développée conjointement par le National

Center for Biotechnology Information (NCBI) de la National Library of
Medicine (NLM) et les éditeurs de revues biomédicales.
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PubMed :
 Base de données bibliographique regroupant la littérature relative

aux sciences biologiques et biomédicales : biochimie, médecine clinique,
éthique, odontologie, pharmacologie, toxicologie, …
 Contenait plus de 21 millions d'articles, en augmentation constante.
 Mise à jour quotidienne : + 650 000 références / an !
 Période de couverture : 1949-aujourd’hui

PubMed :
Outil de travail quotidien indispensable

des chercheurs en biologie et des
médecins.
PubMed :
Outil de travail quotidien indispensable

des chercheurs en biologie et des
médecins.
Medline ne couvre pas la littérature

médicale du monde entier !
PubMed :
 Langage d’interrogation de PubMed
= langage d’indexation
 Medline utilise un vocabulaire particulier
pour indexer (classer) les articles
 En utilisant les mots de ce vocabulaire,
pertinence des résultats accrue.
Qu’est-ce qu’un MeSH ?
 Le MeSH (Medical Subject Heading)
 Un thésaurus biomédical publié et mis à jour par la National Library

of Medicine (US), et utilisé notamment pour l'indexation des
références bibliographiques de MEDLINE
 La recherche effectuée par mots clés MeSH (Descripteurs MeSH)
donne un résultat plus ciblé
 Descripteurs hiérarchisés sous forme d’arborescence, du descripteur

le plus générique au descripteur le plus spécifique

le plus générique au descripteur le plus spécifique :
- Plus les mots clés MeSH sont précis, moins la liste est longue.
- Cependant, plus les mots clefs sont restrictifs, et plus il y a un risque

de passer à côté d’une référence.

le plus générique au descripteur le plus spécifique
 En plus des descripteurs, le thesaurus MeSH contient des

qualificatifs (subheadings)
 descripteur/qualificatif = spécificité et précision

Affinités descripteur/qualificatif :
Chaque catégorie de descripteur a ses propres qualificatifs qui
servent à préciser sur quel aspect du sujet doit porter la recherche
Maladies : diagnostic, traitement, complications, épidémiologie…
Médicaments : effets indésirables, pharmacologie, toxicité…
Investigations diagnostiques : normes, méthodes, …
Descripteurs MeSH en langue anglaise
Vous n’y arrivez pas avec ces MeSH en

anglais ? Don’t panic !
De langue anglaise, il est traduit dans de

nombreuses autres langues, notamment
en français par et
Traducteurs de MeSH
http://mesh.inserm.fr/mesh/
Traducteurs de MeSH
http://www.chu-rouen.fr/cismef/
Traducteurs de MeSH
Traducteurs de MeSH
 HeTOP (Health Terminology / Ontology Portal)
− Portail terminologique de santé fait partie du Cismef (Catalogue et

index des sites médicaux de langue française), géré par le CHU de
Rouen.
Traducteurs de MeSH
 HeTOP (Health Terminology / Ontology Portal)
− Portail terminologique de santé fait partie du Cismef (Catalogue et

index des sites médicaux de langue française), géré par le CHU de
Rouen.
Marche à suivre
Marche à suivre
1. Chercher le terme dans la MeSH Database
Depuis la page d'accueil de PubMed, accédez à la MeSH Database, le

répertoire des descripteurs MeSH
Marche à suivre
2. En anglais, saisissez le mot clé et cliquez sur Search. Selon qu'il

existe un ou plusieurs descripteurs associés, observer la notice
descriptive pour choisir le descripteur le plus adapté à notre
requête.
Cette étape est particulièrement importante car elle permet de

s'assurer que le descripteur correspond effectivement au concept
recherché.
9 descripteurs sont proposés
avec leurs définitions
11 descripteurs sont proposés
avec leurs définitions
On choisit le descripteur le plus
adapté à notre requête
On affiche la notice descriptive
Marche à suivre
3. Des options de recherche peuvent êtres sélectionnées:
- Cocher un/des subheadings pour s'intéresser seulement à un/des
aspect(s) du descripteur
- Cochez la case Restrict to MeSH Major Topic si le descripteur doit être un

sujet majeur des articles
- Cochez la case Do not include MeSH terms found below this term in the
MeSH hierarchy pour annuler l'explosion par défaut. La recherche se fera
alors uniquement sur le descripteur en question et ne sera pas étendue à
ses descripteurs spécifiques.
La liste des qualificatifs (subheadings)
pouvant être associés au descripteur « asthma
2-On clique le bouton
Add to search buider
1-On coche la case

« drug therapy »
la requête apparait dans
la boite »PubMed search builder
On lance la recherche
par le bouton
search PubMed
Marche à suivre
- Cochez la case Restrict to MeSH Major Topic si le descripteur doit être un

sujet majeur des articles  focaliser la recherche sur les articles dont
le sujet principal correspond au descripteur retenu
Restreint la recherche aux seuls articles
dont le sujet majeur est l’asthme
Marche à suivre
- Cocher la case Restrict to MeSH Major Topic si le descripteur doit être un

sujet majeur des articles
- Cocher la case Do not include MeSH terms found below this term in the
MeSH hierarchy pour annuler l'explosion par défaut. La recherche se fera
alors uniquement sur le descripteur en question et ne sera pas étendue à
ses descripteurs spécifiques.
On peut annuler l’explosion
par défaut en cochant
cette case
On obtient 19554 références
on a gagné en spécificité avec les champs majr et noexp
CONSTRUIRE UNE EQUATION DE
RECHERCHE AVEC LE MeSH
Les opérateurs
booléens
Opérateurs booléens
Dans PubMed, il est possible d’associer plusieurs descripteurs MeSH
entre eux à l’aide des opérateurs booléens.
Trois opérateurs booléens
ET / AND: croise
OU / OR : unit
SAUF / NOT : exclut

Trouve les références contenant les 2 mots à
la fois
Utile pour préciser/restreindre la recherche
ET / AND: croise  ↗ la spécificité  Moins de références
Exemple: influenza AND vaccine
La recherche portera sur les articles traitant à
la fois «influenza » et « vaccine »
Trouve les références contenant l’un des 2 mots
ou les deux
Utile pour élargir la recherche  ↗ la sensibilité
 Plus de références
OU / OR : unit
Exemple: neoplasms OR cancer
La recherche portera sur les articles mentionnant
SOIT «neoplasms » SOIT «cancer» SOIT les deux
notions à la fois
Trouve les références contenant l’un des mots,

sauf l’autre
Utile pour exclure des éléments de la recherche
SAUF / NOT : exclut Exemple: influenza NOT avian influenza
La recherche portera sur les articles qui traitent
«influenza» SANS mentionner «avian influenza»
Combiner des termes
Notre exemple :
Nous cherchons les plus récentes publications, sous

forme de revue publiées au cours des 2 dernières
années, concernant le traitement de l’asthme par les
bronchodilatateurs.
Combiner des termes
Notre exemple :

bronchodilatateurs.
Combiner des termes
Étape 1:
Nous allons chercher le descripteur MeSH correspondant à «Asthme» grâce
au Portail électronique HeTOP
Combiner des termes
Étape 1:
Nous allons chercher le descripteur MeSH correspondant à «Asthme» grâce
au Portail électronique HeTOP
Pubmed  MeSH Database  Saisir le descripteur correspondant à la

première notion recherchée : « Asthma »  afficher la notice du descripteur
« Asthma »  cocher les éventuelles options de recherche (qualificatifs,
pondération, explosion) : on va cocher le qualitatif « Drug therapy » , et les
options Restrict to MeSH Major Topic et Do not include MeSH terms found
below this term in the MeSH hierarchy  on l’ajoute au « Search Builder ».
ON NE LANCE PAS DE RECHERCHE.

On choisit le descripteur le plus
adapté à notre requête
4-On clique le bouton
Add to search buider
2-Restreint la recherche aux seules

1-On coche la case
« drug therapy »
notices
dont le sujet majeur est l’asthme
3 -On coche cette case pour

empêcher l’explosion
la requête apparait dans
la boite PubMed search builder
Combiner des termes
Étape 2:
Nous allons chercher le descripteur MeSH correspondant à « bronchodilatateur »
grâce au Portail électronique HeTOP
Combiner des termes
Étape 2:
Dans MeSH Database, saisir dans la barre de recherche le descripteur
correspondant à la deuxième notion recherchée : « Bronchodilator agents »
.
On constate que le premier descripteur
MeSH est bien conservé dans
la fenêtre de recherche à droite.
Combiner des termes
Étape 2:
Afficher la notice du deuxième descripteur « Bronchodilator agents »
 cocher les éventuelles options de recherche : on va cocher le qualitatif
« Therapeutic use » seulement  à l’aide du menu déroulant disponible dans le «
Search Builder », sélectionner l’opérateur booléen que nous désirons utiliser.
L’opérateur booléen par défaut est « AND ».
Cliquer sur « Add to Search Builder ».
On choisit le 1er résultat
qui nous est proposé
3-On clique sur Add to
search builder
2-L’opérateur booléen AND

est présent par défaut
dans ce menu déroulant
1-On choisit le qualificatif
le mieux adapté
à notre recherche
Notez la syntaxe de PubMed :
les deux descripteurs sont reliés par
l’opérateur booléen en majuscule
Combiner des termes
Étape 2:
Afficher la notice du deuxième descripteur « Bronchodilator agents »
 cocher les éventuelles options de recherche : on va cocher le qualitatif
« Therapeutic use » seulement  à l’aide du menu déroulant disponible dans le «
Search Builder », sélectionner l’opérateur booléen que nous désirons utiliser.
L’opérateur booléen par défaut est « AND ».
Cliquer sur « Add to Search Builder ».
Cliquer sur « Search PubMed » pour lancer la recherche.
cliquer sur « Search PubMed » pour lancer
La recherche
Combiner des termes
MAIS une autre condition reste à vérifier
Combiner des termes
MAIS une autre condition reste à vérifier
Notre exemple :
bronchodilatateurs.
Appliquer des filtres à sa recherche
Les filtres apparaissent à

gauche de la page de
résultats  Permettent
de restreindre les
résultats obtenus
Text availability pour sélectionner les références qui

présentent :
• Un résumé (Abstract available).
• Un lien vers le texte intégral en libre accès (Free full
text available)
• Un lien vers l’éditeur et possiblement le texte
intégral de l’article (Full text available).
Article types pour sélectionner si nécessaire un ou

plusieurs types de texte
Publication dates, pour choisir la date, ou la période de

publication des références.
La rubrique Show additonal filters étend les possibilités

de filtres,
Species: Humans or Animals, pour distinguer les études
expérimentales, portant sur l'animal, des études concernant l’homme.
Languages, pour choisir une ou plusieurs langues parmi les sept
les plus courantes proposées. Quelle que soit la langue
sélectionnée, l’information présentée dans PubMed est toujours
en anglais.
Sex, pour choisir entre le genre Male (Masculin) et le genre
Female (Féminin).
Ages, pour choisir une ou plusieurs tranches d'âge parmi les 13
proposées.
2021 2022
2021
2022
NE PAS OUBLIER de supprimer les filtres en cliquant sur « Clear all
» si vous voulez effectuer de nouvelles recherches sans prendre en
compte ces critères.
RECHERCHE AVANCÉE:
MÉTHODE PICO
Recherche avancée: Méthode PICO
 Pour utiliser au mieux les moteurs de recherche disponibles, la
question de recherche doit être clairement formulée.
 La méthode PICO vous aide à la formuler et raffiner votre
question
Patient (population, problème)

Intervention (ou exposition)
Comparaison
Outcome (issue, conséquence, résultat)
Y a-t-il un intérêt (O) à vacciner contre la varicelle (I) les enfants d’âge
préscolaire (P) plutôt que de laisser se développer spontanément les
épidémies en milieu scolaire (C) ?
Patient : à qui s’adresse l’intervention? Hommes, femmes, d’une certaine

tranche d’âge, ayant telle caractéristique, telle pathologie?
Intervention : cherche-t-on des renseignements sur un traitement
médicamenteux, un traitement physique, une action d’éducation à la santé ?
Comparaison : à quoi éventuellement doit être comparée l’intervention décrite
ci-avant ? Méthode de référence, alternative? placebo ?
Outcome : Issue clinique, Guérison, Mortalité, Amélioration, Effets
indésirables, …






indésirables, …
Y a-t-il un intérêt (O) à vacciner contre la varicelle (I) les enfants
d’âge préscolaire (P) plutôt que de laisser se développer
spontanément les épidémies en milieu scolaire (C) ?

indésirables, …
Y a-t-il un intérêt (O) à vacciner contre la varicelle (I) les enfants
d’âge préscolaire (P) plutôt que de laisser se développer
spontanément les épidémies en milieu scolaire (C) ?

indésirables, …
Application pratique
Situation 2
Est-ce que la vitaminothérapie par voie
intraveineuse est efficace pour traiter
l’ostéoporose chez les femmes âgées ?
Situation 2
identifier les PICO :

• P (problème)
• I (intervention)
• C (comparison)
• O (outcome)
Situation 2
identifier les PICO :

• P (problème) Osteoporosis
• I (intervention) Intravenous/ vitamin
• C (comparison) No treatment
• O (outcome) Bone density
173 résultats
Comment raffiner notre
recherche?
Les filtres: langue, date, genre…
Comment raffiner notre
recherche?
Les filtres: langue, date, genre…
60 résultats
26 résultats
MERCI et bonnes recherches !

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 Apprendre à utiliser correctement les filtres

 Apprendre à utiliser correctement la méthode PICO

Conceptualisation Méthodes : Planification

Conceptualisation Méthodes : Planification

 Une démarche méthodologique constituée par des

 Une démarche méthodologique constituée par des

 Des bases de données bibliographiques en accès libre

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Une perte de temps ou des lacunes

 NB: s’assurer de la qualité des sources +++

 Éviter les pages web ou blogs/ Wikipédia/

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 Trouver l'information recherchée dans des ressources

 Gratuit et donne accès à la base de données bibliographique MEDLINE.

 Interface d’accès à MEDLINE développée conjointement par le National

 Gratuit et donne accès à la base de données bibliographique MEDLINE.

 Interface d’accès à MEDLINE développée conjointement par le National

 Base de données bibliographique regroupant la littérature relative

 Contenait plus de 21 millions d'articles, en augmentation constante.

 Mise à jour quotidienne : + 650 000 références / an !

 Période de couverture : 1949-aujourd’hui

Outil de travail quotidien indispensable

Outil de travail quotidien indispensable

Medline ne couvre pas la littérature

 Un thésaurus biomédical publié et mis à jour par la National Library

 Descripteurs hiérarchisés sous forme d’arborescence, du descripteur

 Descripteurs hiérarchisés sous forme d’arborescence, du descripteur

- Cependant, plus les mots clefs sont restrictifs, et plus il y a un risque

 Descripteurs hiérarchisés sous forme d’arborescence, du descripteur

 En plus des descripteurs, le thesaurus MeSH contient des

 descripteur/qualificatif = spécificité et précision

Vous n’y arrivez pas avec ces MeSH en

De langue anglaise, il est traduit dans de

− Portail terminologique de santé fait partie du Cismef (Catalogue et

− Portail terminologique de santé fait partie du Cismef (Catalogue et

1. Chercher le terme dans la MeSH Database

Depuis la page d'accueil de PubMed, accédez à la MeSH Database, le

2. En anglais, saisissez le mot clé et cliquez sur Search. Selon qu'il

Cette étape est particulièrement importante car elle permet de

- Cochez la case Restrict to MeSH Major Topic si le descripteur doit être un

1-On coche la case

- Cochez la case Restrict to MeSH Major Topic si le descripteur doit être un

- Cocher la case Restrict to MeSH Major Topic si le descripteur doit être un

SAUF / NOT : exclut

Trouve les références contenant l’un des mots,

Nous cherchons les plus récentes publications, sous

Nous cherchons les plus récentes publications, sous

Pubmed  MeSH Database  Saisir le descripteur correspondant à la

ON NE LANCE PAS DE RECHERCHE.

2-Restreint la recherche aux seules

3 -On coche cette case pour

2-L’opérateur booléen AND

Les filtres apparaissent à

Text availability pour sélectionner les références qui

Article types pour sélectionner si nécessaire un ou

Publication dates, pour choisir la date, ou la période de

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