Smig 10

Master GENOBio-S3 Module SMIG
Module SMIG (M15)

Surveillance et Maintien de
l’Intégrité du Génome
Master GENOBio-S3
MounaModule SMIG
Ababou
Master de Génomique etMaster GENOBio-S3 Module SMIG

Bioinformatique
Semestre 3 – Année universitaire 2023/2024
Module
Partie II : Aspects Epigénétiques
SMIG
III. Epigénétique et environnement



Master GENOBio-S3
Mise en place des modifications Module SMIG
épigénétiques
• Elle n’est pas aléatoire, elle se fait en réponse à une décision de la cellule
• Programmée par des signaux et enclenchée par des facteurs de transcription

• Modifications stables même en absence du signal inducteur
• Mémoire épigénétique permettant à la cellule de maintenir son identité

• Impacts différents selon la molécule d’histone ciblée, le nbre de groupes chimiques
ajoutés et le stade de développement de l’organisme
1. Signal Master GENOBio-S3 Module SMIG
Cellule

Cytoplasme

Noyau
CH3
Master GENOBio-S3 Module SMIG CH3
2. Réponse: FTs CH3 3. Consolidation
Gènes cibles activés épigénétique
ou réprimés Méthylation
Master GENOBio-S3 de l’ADN
Module SMIG
Modifications des
histones
Master GENOBio-S3
Mise en place des modifications Module SMIG
épigénétiques
Différents types de signaux
• Ils peuvent provenir soit de l’intérieur de la cellule, soit des cellules voisines soit de
l’environnement extérieur
Master GENOBio-S3
❖ Signaux Module :SMIG
mécaniques contacts directs entre cellules
❖ Signaux chimiques : courte-distance ou longue distance (hormones)
❖ Signaux biologiques : développement, microbiome, mutations, pathologies
❖ Signaux externes : comportement, environnement


CH3
CH3
CH3

• Les modifications épigénétiques confèrent aux êtres vivants une plasticité à l’égard des
changements de l’environnement et ont certainement contribué à l’évolution des
Master GENOBio-S3
espèces au coursModule SMIGen dépit d’un code génétique immuable
des âges,
Epigénétique et environnement
• Les facteurs environnementaux peuvent induire des altérations tant génétiques
qu'épigénétiques
• Le Master
phénotype d'un organisme
GENOBio-S3 est déterminé par la combinaison de déterminants
Module SMIG
génétiques et épigénétiques
• Les épimutations peuvent contribuer au développement de maladies, mais contrairement

aux mutations génétiques, elles sont réversibles dansGENOBio-S3
Master la plupart des cas SMIG
Module


Sources susceptibles de modifier l’épigénome
• Les épimutations liées à l’environnement peuvent avoir plusieurs origines
❖ Facteurs physico-chimiques : exposition à des composés chimiques
(drogues/médicaments), climat (température), irradiations,…
❖ Facteurs biologiques : alimentation, vieillissement
❖ Facteurs sociaux-culturels : stress, mode de vie
• Dans plusieurs espèces différentes des mammifères, l’environnement
Master GENOBio-S3
est Module SMIG
une source
très importante de signaux épigénétiques vitaux

Chez les plantes
• Les plantes fournissent des exemples remarquables de programmation contrôlée par
le climat (ex: période de floraison induite par le froid (vernalisation))
• Chez Arabidopsis thaliana, le gène FLC (Flowering Locus C) est un puissant
répresseur floral codant pour un FT bloquant l’expression des gènes nécessaires à la
floraison
• L’exposition prolongée au froid déclenche l’extinction épigénétique progressive par
méthylation (H3K27me3) du gène FLC
• Master GENOBio-S3 est
Cette méthylation Module SMIGpar le complexe protéique Polycomb en association avec
assurée
un lncARN COLDAIR (Cold Assisted Intronic Non Coding Master
RNA) GENOBio-S3 Module SMIG

Chez les plantes
Master GENOBio-S3
Printemps 1 Module SMIG Hiver Printemps 2
Stade dormant Vernalisation Floraison


Crédit : Dr. D. Bourc’his

Floraison réprimée Silencing du gène FLC Floraison

Reine des abeilles et ouvrières
• Reines et ouvrières possèdent le même patrimoine génétique
• La reine des abeilles se distingue des ouvrières par une plus grande taille, une plus
grande longévité, des ovaires actifs et une spermathèque
• Une larve nourrit à la gelée royale pendant son développement (L3) devient reine à l’âge
adulte
• En l'absence de gelée royale, la larve devient ouvrière

• Master GENOBio-S3
Les larves nourries à la gelée royale (futures reines) présentent Module SMIG
une Hypométhylation
globale du génome comparée à la méthylation de celui des larves des futures ouvrières

Crédit : Encyclopædia Universalis France
Reine des abeilles et ouvrières
• >20% des gènes sont exprimés de manière différentielle entre les reines et les ouvrières
• ≈Master
5% desGENOBio-S3
constituantsModule SMIGroyale sont des inhibiteurs de HDAC
de la gelée

• Différences d’expressions des 3 DNMTs observées entre les reines et les ouvrières
• La nourritureMaster
des GENOBio-S3 Module
ouvrières est SMIG
riche en miARNs de plantes qui retardent le
développement larvaire, induisant ainsi une stérilité

Crédit : Pr. E. Heard

Chez les Reptiles ovipares
• Chez la majorité des reptiles ovipares, les œufs ne sont initialement ni ♂ ni ♀
• Les températures subies

pendant le développement Master GENOBio-S3 Module SMIG
embryonnaire déterminent
le sexe de la descendance

• TSD (Temperature Dependent sex
determination) ≠ détermination
chromosomique du sexe Master GENOBio-S3 Module SMIG

Chez les Reptiles ovipares
• C'est la transcription du gène KDM6B (un modificateur de la chromatine) qui est
sensible à la température et confère sa sensibilité au gène Dmrt1, lequel joue un
Master
rôle GENOBio-S3
crucial Module SMIG du sexe
dans la détermination
• À la température de production des ♀ (FPT) : l'expression de KDM6B est régulée à la
baisse → Triméthylation H3K27 du promoteur de Dmrt1 → suppression de
♀ GENOBio-S3 Module SMIG
Master
l'expression de Dmrt1 → développement des
• À la température de production des ♂ (MPT), l'expression de KDM6B est régulée à la

Master
hausseGENOBio-S3
→ KDM6BModule SMIG le promoteur de Dmrt1 → régulation à la hausse de
déméthyle
l'expression de Dmrt1 qui conduit au développement des ♂

Chez les mammifères
• L’épigénome est en constante évolution de la gestation à la vieillesse
• Les épimutations liées à l’environnement qui ont été les mieux décrites sont causées
par l’alimentation et les perturbateurs endocriniens
❖ L’Alimentation : certains compléments sont riches

Master en groupements
GENOBio-S3 méthyles
Module SMIG
-acide folique
-choline Master GENOBio-S3 Module SMIG
-vitamine B12
-bétaïne

❖ Les Perturbateurs Endocriniens (PEs) : substances mimant l’effet des hormones
et pouvant
Master modifier les
GENOBio-S3 profils
Module épigénétiques
SMIG
- Bisphénol A (BPA = Œstrogène xénobiotique) : plastiques et résines, boîtes alimentaires,
boissons,…
- Phtalates (associés au PVC) : adhésifs,Master GENOBio-S3
colles, matériel Module
médical,SMIG
jouets, textiles,
cosmétiques,…
- Vinclozoline : fongicide
Master GENOBio-S3 utilisé
Module en agriculture
SMIG

• Les souris Agouti représentent LE modèle de choix permettant de visualiser les effets
de l’environnement sur les modifications épigénétiques
• Le gène Agouti sauvage (Avy: Agouti Viable Yellow) code pour la production
d’eumélanine noire (gène biméthylé) ou de phéomélanine jaune (gène non méthylé)
• Les variations de méthylation de l’ADN Master

dans laGENOBio-S3 Module
descendance SMIG être suivies
peuvent
facilement
Wolff G.L. et al., 1998 ; Morgan et al., 1999; Takeshita A. et al., 2001
www.pbs.org/wgbh/nova/science- now/3411/02.html
Master GENOBio-S3 Module SMIG méthylation de l’ADN

• La consommation de BPA par la mère induit une hypométhylation de l’ADN qui se
Master GENOBio-S3
répercute Module
sur l’épigénome SMIG
fœtal et donc sur la couleur du pelage de sa progéniture
• Un ajout d’agents donneurs de groupes méthyles

Master (ex. Acide
GENOBio-S3 folique)
Module SMIG au régime à
base de BPA permet d’atténuer son effet en augmentant le taux de méthylation de l’ADN
chez les embryons en développement

+ BPA
+ BPA
+ Acide Folique
❖ Gène Avy non méthylé Master GENOBio-S3 Module SMIG
❖ Prédisposition à l’obésité, ❖ Gène A vy méthylé
au diabète et à divers ❖ Souris en bonne santé

types de tumeurs WolffMaster GENOBio-S3
G.L. et al., 1998 Module
; Morgan et al., 1999; SMIG
Takeshita A. et al., 2001

Chez l’Homme
• Les PEs modifient le signal hormonal en interférant sur le système endocrinien de 3
façons :

• Master GENOBio-S3 Module SMIG

D’autres systèmes concernés (nerveux, digestif,…)
• Plusieurs pathologies humaines sont aujourd’hui

Master GENOBio-S3 Modulesuspectées
SMIG d’être la conséquence
d’une exposition aux PEs (cancers hormono-dépendants, anomalies du développement,
baisse de la fertilité, diabète, autisme,…)
• La gravité des effets des PEs est étroitement liée à l’âge d’exposition (périodes fœto-
embryonnaires, enfance, puberté,…) et n’est pas forcément proportionnelle à la
Master
doseGENOBio-S3 Module SMIG
Chez l’Homme
• Les PEs sont générateurs d’espèces réactives de l’oxygène (ERO) pouvant induire
un stress oxydant (SO) créateur, entre autres, d’épimutations liées à une dérégulation
deMaster GENOBio-S3
la méthylation l’ADN SMIG
deModule
• Ces défauts de méthylation peuvent affecter les gamètes et transmettre aux
descendants des pathologies d’origine épigénétique
https://www.gyneco-online.com/sites/default/files/yves_fig4.jpg

Chez l’Homme
• Des épidémiologistes de l’Université de Columbia ont travaillé sur les conséquences de la
SMIG la 2 guerre mondiale (l’Hiver de la faim,~20 000 ☠)
famine ème
Mastervécue en Hollande
GENOBio-S3 Moduledurant
• Les femmes enceintes avaient passé plusieurs semaines à n’ingérer que quelques
centaines de calories par jour
• Les enfants (et petits enfants) de ces femmes dénutries ont développé des problèmes de
santé liés à un métabolisme dysfonctionnel (petite taille, diabète, obésité,…)
• Une 2ème étude menée en Suède a elle aussi montré un Master GENOBio-S3
effet direct Module SMIG
de la malnutrition
des grands-parents sur l’espérance de vie et le taux élevé de diabète chez les petits-
enfants
• Ces anomalies seraient dues à des modifications épigénétiques causées par la
malnutrition, qui auraient été transmises aux enfants puis aux petits-enfants de femmes
dénutries (The Thrifty phenotype Hypothesis) Master GENOBio-S3 Module SMIG

The thrifty phenotype hypothesis
ou hypothèse du « phénotype d’épargne »


Hales, C. N. & Barker, D. J. The thrifty phenotype hypothesis. Br. Med. Bull. 60, 5–20 (2001)
Chez l’Homme

• Des études sur des jumeaux
monozygotes suggèrent qu'à la
naissance, les jumeaux partagent aussi
bien des génomes que des épigénomes Master GENOBio-S3 Module SMIG
similaires
• Plusieurs exemples ont montré qu’en

vieillissant et en étant exposés à des Master GENOBio-S3 Module SMIG
régimes et à des environnements
différents, ces jumeaux Master GENOBio-S3 Module SMIG
présentent
quelques différences phénotypiques

Chez l’Homme
• Une étude espagnole réalisée sur 160 jumeaux monozygotes âgés de 3 à 74 ans a
montré l’existence d’une discordance phénotypique entre eux (M.Fraga et al., 2005)
• Alors que les jeunes jumeaux ne présentaient aucune différence, 35% des jumeaux plus
âgés ont montré des différences significatives d'expression génique
Visualisation des différents degrés de méthylation par Hybridation

Master GENOBio-S3 Génomique
Module SMIG
Comparative (CGH)
Chromosomes 1 Chromosomes 3 Chromosomes 12 Chromosomes 17
Master GENOBio-S3
3 ans Module
50 ans SMIG
3 ans 50 ans 3 ans 50 ans GENOBio-S3
Master 3 ans 50 ans SMIG
Module
Adapté de M.Fraga et al., PNAS 2005
couleur jaune couleurs rouge Master GENOBio-S3 Module SMIG

= épigénomes et vert
identiques = épigénomes Master GENOBio-S3 Module SMIG
différents
• Les profils épigénétiques de jumeaux élevés séparément Master

ouGENOBio-S3 Module
ayant eu des viesSMIG
très
différentes, diffèrent plus que ceux de jumeaux ayant vécu ensemble plus longtemps
ou ayant
Master partagé des
GENOBio-S3 environnements
Module SMIG et des expériences similaires
Le projet EpiTwin
www.epitwin.eu


www.twinsuk.ac.uk
Master15GENOBio-S3 Module
000 jumeaux, SMIG
138 études
Vieillissement
• Avec l’avancée en âge, la machinerie épigénétique régulatrice se dérégule
progressivement
• L’accessibilité à l’ADN est altérée, entraînant ainsi une expression génique aberrante,
l’insertion de nouveaux éléments transposables et une instabilité génomique

DOI : 10.1126/sciadv.1600584

Vieillissement
• Tout au long de la vie l’épigénome est altéré de façon permanente sous l’effet de
l’environnement (dérive épigénétique)
• L'épigénome âgé ne parvient pas à répondre aux facteurs environnementaux
(inflexibilité de l'épigénome âgé), ce qui conduit à une perte de marqueurs
épigénétiques actifs et une hyperméthylation de l'ADN
• Détériorations épigénétiques accumulées entraînant un mosaïcisme épigénomique
dans les cellules souches → Réduction de la capacité de régénération + épuisement
Master
du poolGENOBio-S3 Module SMIG
de ces cellules

• Certaines de ces modifications
s'accumulent suffisamment
régulièrement pour que leur Master GENOBio-S3 Module SMIG
surveillance se soit avérée être un
doi.org/10.2217/epi-2016-0078
moyen fiable d'évaluer l'âge Master GENOBio-S3 Module SMIG

Vieillissement
• Grâce à l’étude du méthylome nous pouvons déterminer l’âge d’un individu
• Les « horloges
Master épigénétiques
GENOBio-S3 Module SMIG» sont des modèles mathématiques utilisant les profils
de méthylation des sites CpG associés à l’âge comme biomarqueurs pouvant
mesurer précisément l’âge de nos cellules/tissus et/ou organes
• Ces horloges sont capables de prédire Master
la mortalité, indépendamment
GENOBio-S3 Module SMIG des facteurs
environnementaux pouvant affecter l’épigénome


doi:10.1371/journal.pone.0067378.g002
doi.org/10.1016/j.mad.2022.111695

Vieillissement
• Les horloges épigénétiques permettent aussi d’étudier les effets de l’environnement
sur le vieillissement
• Plusieurs expositions environnementales et facteurs liés au mode de vie peuvent
induire des accélérations du vieillissement épigénétique et génétique (raccourcicement
des télomères) et donc un risque accru de maladies liées à l'âge

doi.org/10.3389/fcell.2022.985274

Concept de la DOHaD*
• A vu le jour grâce aux travaux de Barker qui démontraient pour la 1ère fois
le Master
lien entre une exposition
GENOBio-S3 Module SMIGprécoce défavorable et la survenue
d’une pathologie à l’âge adulte (Barker et al., Lancet, 1989)
• Il s’agit d’une approche transversale reposant sur le principe que les modifications
épigénétiques fixent la mémoire des expositions environnementales subies
précocement Master GENOBio-S3 Module SMIG
• En couplant les informations dévoilées par l’épigénétique à celles sur le mode vie,
Master GENOBio-S3
il a permis Module SMIG
des changements majeurs en termes de politiques de santé publique

?
Adapté de Agarwal et al 2018

Master GENOBio-S3
*Developmental Module
Origins of SMIG
Health and Diseases
Partie
Master GENOBio-S3 ModuleIISMIG
: Aspects Epigénétiques
Module
SMIG

IV. Epigénétique et Hérédité


Epigénétique et Hérédité
• L’épigénétique intervient à 3 niveaux

❖ Individu : différenciation et maintien de
l’identité ¢ aire
❖ Générations : transmission des épigénomes

à la descendance
❖ Master
TempsGENOBio-S3
évolutifs : évolution des espèces
Module SMIG

• Au moins 3 catégories de transmission
de l’épigénome
❖ De cellule à cellule (mitose)
❖ Des parents à l’enfant durant la
méiose (intergénérationnelle)
❖ Entre les générations (transgénérationnelle)
Héritabilité mitotique
• L’héritabilité épigénétique cellulaire a été clairement démontrée
• Master
Bien queGENOBio-S3 Module
n’ayant jamais été SMIG
soumises au "signal épigénétique" de départ, les cellules
filles maintiennent la même identité que les cellules mères

signal
épigénétique
• Master
Transmission
GENOBio-S3 autonome et
Module SMIG
fidèle du statut Master GENOBio-S3 Module SMIG
épigénétique évitant toute
instabilité épigénétique
• Contribue à la mémoire cellulaire

Master des Module SMIG
GENOBio-S3
marques épigénétiques

• Indispensable à la constitution de tissus/organes
homogènes au cours du développement
Crédit : Dr. D. Bourc’his
Transmissions inter et trans-générationnelles
• La transmission intergénérationnelle de l’épigénome de la génération F0 à ses
descendances F1 et F2 peut s’expliquer par l’exposition in utero de ces dernières aux
Master
mêmes GENOBio-S3
signaux Module SMIG
épigénétiques (fœtus, gamètes du fœtus)
• Si l’épigénome est transféré avec succès de la génération F1 à la génération F3 (ou F2
chez les ♂ ou les ♀ non gestantes) et au-delà (sans exposition au signal
épigénétique), il s’agit alors d’un phénotypeMaster GENOBio-S3 Module SMIG
transgénérationnel

Signal épigénétique
Adaptée de Aliya Feroe et al., 2017

Transmission
Intergénérationnelle
Master GENOBio-S3 Module
(exposition directe) SMIG
Transmission
Transgénérationnelle Master GENOBio-S3 Module SMIG
(pas d’exposition
directe)
Transmission intergénérationnelle
• La transmission intergénérationnelle de marques épigénétiques a clairement été
démontrée chez plusieurs espèces vivantes
❖ Plantes, reptiles, insectes,… (changements de température, nutriments, UVs,…)
❖ Mammifères (changements nutritifs, stress, expositions aux polluants et/ou PEs,…)



Transmission transgénérationnelle
• Très bien décrite chez les plantes

doi.org/10.1002/1438-390X.12018
• Maintien transgénérationnel de la répression par

méthylation du gène Lcyc (cycloidea) impliqué dans
le contrôle de l’assymétrie florale chez Linaria
vulgaris
Transmission transgénérationnelle
• Changement de couleur des yeux chez Drosophila melanogaster dépendant
directement d’une exposition des œufs à la chaleur
• Modification épigénétique stable, transmissible
sur plusieurs générations
• Associée à des changements de méthylation
des histones de gènes gouvernant la couleur
des yeux
• Implique le complexe protéique à activité histone méthyltransférase PRC2 (Polycomb-
Repressive Complex 2) qui est très bien conservé au sein des êtres vivants
• Les épiallèles alternatifs sont caractérisés par des niveaux différentiels de la marque
H3K27me3
doi:10.1038/ng.3848

• Certains travaux de recherches sur les rats et souris ont permis de mettre en évidence
une transmission transgénérationnelle de marques épigénétiques
• Persistance sur 4 générations de dysméthylation apparue suite à l’exposition d’une
ratte gestante à un PE (Skinner, 2005)


Adapté de INRA Prod. Anim., 2010, 23 (1), 23-42
Effets transgénérationnels de la vinclozoline sur la fonction testiculaire,

corrélés avec des altérations dans la méthylation de l’ADN

• La transmission par l’épigénome reste une situation exceptionnelle plutôt qu’une règle
• Les mécanismes épigénétiques connus ne permettent pas à eux seuls d’expliquer une
transmission héréditaire transgénérationnelle chez les mammifères
• Chez l’Homme, le manque de recul n’a pas encore permis d’établir clairement si les
marques épigénétiques acquises pouvaient traverser plus de deux générations
• Il est très difficile de faire la distinction entre ce qui résulte de changements dans
Master
l’ADN (génétique) et GENOBio-S3 Module
ce qui est causé parSMIG
une marque épigénétique
• Beaucoup d’études récentes se contredisent entreMaster GENOBio-S3

elles, ce Module
qui suscite SMIG
de nombreux
débats
• Contrairement aux plantes, les profils épigénétiques des mammifères sont

Master GENOBio-S3
globalement remis à zéro après fécondation (reprogrammation Module SMIG
épigénétique)

Reprogrammation épigénétique durant le développement
• La machinerie cellulaire est équipée d’un système d’effacement/reprogrammation des
Master GENOBio-S3
marques épigénétiquesModule SMIG
de méthylation qui intervient à chaque génération
• On assiste à une déméthylation massive qui efface (quasi) toute régulation provenant
des cellules germinales parentales → épigénome vierge
• Remise à zéro qui permet au fœtus de développer ensuite au cours de sa croissance et
de sa vie, et en fonction de son propre environnement, ses propres marques de
méthylation

• Les marques épigénétiques sont effacées à deux reprises
❖ 1 ère reprogrammation : chez le zygote (après fécondation)
❖ 2ème reprogrammation : dans la lignée germinale (gamétogenèse)

Master
• L’effacement touchant les cellules germinales GENOBio-S3
primordiales Module
(PGC) permetSMIG
l’acquisition d’un
épigénome totipotent

Balhorn, R. (2007). Genome Biol. 8, 227
• Après la fécondation, la déméthylation du génome paternel se fait de manière active
Master
alors que GENOBio-S3 Module
celle du génome SMIG est passive
maternel
Discov Med 10(52):225-233, septembre 2010


• Dans les cellules somatiques, certaines séquences, comme celles des
rétrotransposons et des gènes soumis à empreinte génomique parentale (~100),
Master GENOBio-S3
échappent à cetteModule SMIG
déméthylation
Empreinte Parentale
• Chez les mammifères, la parthénogenèse naturelle n’a jamais été observée
• La présence d’un génome maternel ET paternel est indispensable pour le
développement embryonnaire

McGrath et Solter, Surani et al., 1984

Empreinte Parentale
• Bien que leur constitution génique soit identique, les 2 génomes parentaux ne sont
pas équivalents → Asymétrie épigénétique
• Ils portent des marques épigénétiques distinctes au niveau des gènes soumis à
empreinte (genomic imprinting)


• Ces marques sont apposées dans les ¢ germinales primordiales (PGCs) au cours de
l’ovogenèse ou de la spermatogenèse
• Lors de la spermatogenèse, les histones sont

remplacées par des protamines Master GENOBio-S3 Module SMIG
(10-15% des gènes restent protégés par des histones)
Empreinte Parentale
• Dès que la différenciation sexuelle est initiée, on assiste à un écrasement total des
marques parentales dans les PGCs
• Par la suite, des marques épigénétiques spécifiques au sexe sont à nouveau établies
au cours de la gamétogenèse durant la méiose
• L'apposition des marques paternelles a lieu avant
Master la naissance
GENOBio-S3 alors
Module SMIGque celles des
maternelles a lieu à partir de la puberté

doi.org/10.1038/nrg2295

Empreinte Parentale
• Un gène est soumis à empreinte parentale lorsque, l'allèle hérité du père et l’allèle hérité
de la mère ne sont pas exprimés de manière identique
• Dans les ¢ somatiques, il y a une expression monoallélique de ces gènes avec
répression de l’allèle maternel ou paternel selon que l’on ait une empreinte maternelle
ou paternelle respectivement
• Cette différence d'expression allélique se maintient au cours du développement et
peut ne s'exprimer que dans un tissu ou à un moment donné (activation ou répression
spatio-temporelle)
INRA Prod. Anim., 2010, 23 (1), 23-42


Empreinte Parentale
Principe de Transmission

• Les gènes cibles de
Master GENOBio-S3 Module SMIG l'empreinte génomique ne sont
Master GENOBio-S3
pas identiques Module
chez la ♀SMIG
et
chez l’♂
• Une ♀ doit reprogrammer les
gènes à empreinte paternelle
Mastersur les chromosomes
GENOBio-S3 Module hérités
SMIG de
son père en gènes à empreinte
maternelle et vice versa
• Dans les Master GENOBio-S3 Module SMIG
spermatozoïdes,
écrasement de toutes • Dans les ovules,
les marques puis Master
écrasement GENOBio-S3
de toutes les Module SMIG
réapposition des marques puis
empreintes réapposition des
paternelles SMIG empreintes maternelles
Empreinte Parentale
• L’effacement des empreintes parentales dans les PGCs s’effectue par une perte de
méthylation de l’ADNModule SMIG
Master GENOBio-S3
• Des éléments de contrôle, appelés DMR (Differentially Methylated Regions) ont été
identifiés sur la plupart de ces gènes
Wolf Reik and Jörn Walter, NATURE REVIEWS |

• Expression monoallélique contrôlée par une
méthylation allélique différentielle au niveau
Master GENOBio-S3CpG
des dinucléotides Module SMIG
des DMR
GENETICS, 2001
• Implication également de PTMs des histones
• Selon qu'ils viennent du père ou de la

mère, ces gènes sont plus ou moins Master GENOBio-S3 Module SMIG
exprimés, voire parfois totalement
silencieux (Anti-Mendel!!!) Master GENOBio-S3 Module SMIG

• Le dérèglement de ce mécanisme d’expression est corrélé à une instabilité
épigénétique (LOH) pouvant conduire à plusieurs pathologies humaines (chapitre V)
Empreinte Parentale
Exemple : locus Igf2/H19 chez la souris
• Igf2
Master GENOBio-S3
(Insulin-like Module
growth gene) code pour un facteur de croissance analogue à
factorSMIG
l’insuline 2 et est essentiel pour le développement embryonnaire
• H19, codant pour un lncARN, joue un rôle dans la régulation négative du poids corporel
et de la prolifération cellulaire
• L'allèle Igf2 paternel est exprimé alors que l’allèle maternel est silencieux
• Master
L'allèleGENOBio-S3 Module
H19 maternel SMIG
est exprimé alors que l’allèle paternel est silencieux

Empreinte Parentale

LIGRE TIGRON
Tigresse x Lion Lionne x Tigre


Reprogrammation épigénétique et Empreinte Parentale
• Superposition de 2 cycles
❖ Le cycle de la méthylation globale
❖ Le cycle de l’empreinte parentale

DOI: 10.1051/medsci/2010265497

Reprogrammation épigénétique artificielle
• Des cellules matures/spécialisées peuvent redevenir des ¢ souches pluripotentes
après effacement des marques épigénétiques (Prix Nobel de médecine 2012)

https://www.futura- Master GENOBio-S3 Module SMIG

sciences.com/sante/actualites/
medecine-nobel-medecine-
2012-cellules-souches-
induites-honneur-41723/
Reprogrammation épigénétique artificielle

• Reprogrammation des cellules
somatiques en ¢ pluripotentes
(injectionModule
Master GENOBio-S3 de 4 FTs)
SMIG

• Reprogrammation des cellules

différenciées d’un type à un
autre sans passer par Master le GENOBio-S3 Module SMIG
stade pluripotent (FTs
spécifiques de chaque tissus)
Master GENOBio-S3
Adaptés de Waddington Module
(1957). The strategy of SMIG
the genes, et d’Edith Heard (2014)
Master GENOBio-S3 ModuleClasse

SMIG inversée 2
Rôles des modifications épigénétiques

Master dans
GENOBio-S3 Module SMIG
l’inactivation du chromosome X
MAROUR
Master GENOBio-S3 Module AHMED
SMIG
LOUKILI AHMED
DAOU ALI

Vendredi 15
Master GENOBio-S3 Module SMIG Module
Classes inversées 3-7 SMIG
1. Thérapies ciblant l’instabilité épigénétique

LEHMISSI NAJLAA
EL IDRISSI SMIG
HANANE
SOIDIHANE AIMANE
2. Techniques d’analyse de l’épigénome

OBAYD HANAN Master GENOBio-S3 Module SMIG
DIAFI KARIMA
CHICHAOUI WALID
3. Régulation épigénétique du cycle cellulaire
BERRIM NIZAR
ICHQARRNE ISMAIL
AGOURRAM ZINEB
4. Régulation épigénétique de la réparation

Master de l’ADN
GENOBio-S3 Module SMIG
EL AMRANI KHAOULA
EL MHAMDI WISSAL
EL OUADAA LINA
5. Régulation épigénétique de l’apoptose

NEJJARI ALAA
GUENNOUN HIBA
Master GENOBio-S3 Module KHADIJA
BOUKATE SMIG

Smig 10

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Module SMIG (M15)

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Master de Génomique etMaster GENOBio-S3 Module SMIG

Master GENOBio-S3 Module SMIG

III. Epigénétique et environnement

Master GENOBio-S3 Module SMIG

Master GENOBio-S3 Module SMIG

Master GENOBio-S3 Module SMIG

Master GENOBio-S3 Module SMIG

Master GENOBio-S3 Module SMIG

Master GENOBio-S3 Module SMIG

• Programmée par des signaux et enclenchée par des facteurs de transcription

• Mémoire épigénétique permettant à la cellule de maintenir son identité

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Master GENOBio-S3 Module SMIG

• Les épimutations peuvent contribuer au développement de maladies, mais contrairement

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• En l'absence de gelée royale, la larve devient ouvrière

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• Les températures subies

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• À la température de production des ♂ (MPT), l'expression de KDM6B est régulée à la