Université Mohammed V- Rabat, Maroc

Faculté des Sciences,

Département de Biologie

Master 2
Année universitaire 2020 - 2021

Module de Phytopathologie
Séance 7 et 8

Pr. A. ELAISSAMI
 Champignons
phytopathogènes
(suite)

2
3-1-2 Euascomycètes
Asques agrégés, contenus dans un cleistothèce Pleictomycètes
(ascocarpes globuleux entièrement clos)

Asques agrégés, contenus dans un Pyrénomycètes

périthèce (ascocarpe globuleux, pourvu d’un ostiole)

Asques agrégés, contenus dans des cavités Loculoascomycètes

Asques au sein d’un strome = locules

Asques agrégés dans une apothécie Discomycètes

(Ascocarpe enforme de coupe)

cleistothèce périthèce apothécie Locule ou pseudotheice

3
 Euascomycètes
asques contenus dans un ascocarpe

b- Série des C- Série des

a- Série des
pyrénomycètes discomycètes Loculoascomycètes
pleictomycètes

O/ pezizales

O/ Erysiphale O/hypocréales
O/sphaériales
Périthèces rouge,
Périthèce
blanc ou violé
noire
Couleur vive
Couleur sombre

4
 (cleistotèce)
a- S/C Les pleictomycètes
O/ Erysiphales
G- Erysiphe

Parasites obligatoires: ap. vég., hyphe cloisonné grêle,

supérficiel qui ne pénètre jamais à l’intérieur des tissus
Les blancs = oïdiums
- Les feuilles
Suçoirs Powdery mildews
- Les jeunes pousses
maldies très répandues
- Les boutons floraux
facilement
- Les fruits reconnaissables

5
O/ Erysiphales (pleictomycètes) (cleistotèce)

Oïdium des feuilles Oïdium sp. ( le blanc )

6
O/ Erysiphales (pleictomycètes) (suite)

7
 b- S/C Loculoascomycètes Locule ou pseudotheice

septoriose
G/ Mycosphaerella cercosporiose

Genre Mycosphaerella

C’est l’un des plus grands genres des champignons

phytopathogènes, ayant plus de 1000 espèces connues, dont
beaucoup causent des maladies economiquement importantes
dans les pays tempérés et tropicaux.

8
 Locule ou
Loculoascomycètes pseudotheice

9
10
 c- S/C pyrénomycètes
O/ Sphaériales ( Périthèce noire)

Agents de tavelures G/ Venturia

Feuilles
maladies
Fruits
extrêmement
dommageables Rameaux (Chancre)

11
 Tavelures (tâches)
G/ Venturia inaequalis
tâche noire
superficielle

12
O/hypocréales
Périthèce: blanc, violet ou rouge
Claviceps sp. (pyrénomycètes) Alcaloïdes mortels

Ergot des graminées

le seigle, le blé
Extrêmement répandu dans le
Ray gras, fétuque,
monde entier, il attaque en
dactyle, Fléole, les
particulier
graminées à gazon

13
Périthèce rouge

14
O/hypocréales

15
O/hypocréales

automneHiver (t°basse)
Germination des
Le diéthylamide de l'acide lysergique sclérotes
(LSD, LSD-25)

Graminées attaqués grains

Sclérotes: masses allongées Noires
( blanc violacé à l’intérieur) Sol

16
d- S/c Discomycètes
O/ pezizales

ex 1: G/ Pseudopeziza sp Tâches communes

Apothécie
= pézize

asques

17
Ex 2:

18
Ex 2:

19
Ex3: Monilinia fruticola, agent de moniliose et de
momification des arbres fruitiers
(-Flétrissement, Chancre, Formation de couches concentriques beiges ou marrons)

20
Thalle septé, Spores sexuées naissant typiquement au nombre de 4 dans une cellule appelée baside

3-3 Basidiomycota
* Baside cloisonnée * Baside siphonnée

S/C Proto basidiomycètes S/C Auto basidiomycètes

21
 Baside siphonnée

Baside cloisonnée

22
 3-3-1 S/C Protobasidiomycètes
baside cloisonnée, absence de basidiocarpe

Basides issues de clamydospores Basides issues de téleutospores

Portant des basidiospores sessiles Portant des basidiospores sur un
stérigmate

O/ Ustilaginales O/ Urédinales

23
O/ Maladies dues aux Ustilaginales
Basides issues de chlamydospores
Portant des basidiospores sessiles

Ustilago maydis Maïs

charbon
Ustilago tritici avoine
Tilletia caries blé carie
les organes attaqués contiennent une
Poudre noire (spores)

24
25
 - Les charbons sont des maladies cryptogamiques causées par
des champignons multicellulaires, se caractérisant généralement par des masses noires et
poussiéreuses.

- Il affecte plus particulièrement les plantes cultivées notamment les céréales.

- Les maladies du charbon du blé sont importantes car elles affectent le rendement et la qualité
du grain et des sous-produits du blé et sont soumises aux réglementations phytosanitaires
nationales et internationales.
• Les champignons responsables des charbons englobe environ 1 700 espèces
pour 150 genres
• Les espèces du genre Ustilago et Urocystis sont les plus connues

Ustilago Urocystis
Exemples

Charbon nu de l'orge
Charbon de la canne à sucre
Agents : Ustilago nuda Charbon du maïs
Agents : Ustilago scitaminea
Hôtes :Orge, genre Hordeum Agents : Ustilago maydis
Hôtes : Saccharum officinarum
Hôte : Zea mays

les grains sont remplacés par une masse noirâtre de spores

 Le charbon de la canne a sucre dans le monde

La maladie du charbon causée par Ustilago scitaminea

1877 1940
La première En hémisphère
de l’ouest dans 1971
fois au Natal En Guyane,
en Afrique du la région du
Tucuman en Hawaii
sud
Argentine,

1930 1957 1998

Des dégâts Le L’Australie
très champignon après avoir été
importants s’est installé le seul pays
en Inde et en bolivie saccharicole
d’autres indemne dans
pays en Asie le monde
29
▪ Antony (2008) a examiné de manière exhaustive la situation du charbon
de canne à sucre en Australie et a discuté de l'économie politique liée à la
biosécurité suscitée par la gravité de la maladie. Plus de 70% des variétés
de canne à sucre australiennes étaient sensibles au charbon avant 1998

▪ La stratégie de gestion immédiate conçue consistait à préconiser le

débardage des cannes infectées à plus de 5% et le passage à des
variétés résistantes

▪ Depuis lors, la résistance au charbon est devenue un objectif de la

sélection variétale en Australie

30
 Le charbon : situation au Maroc
- Cas de la canne a sucre
• En 1993 : La canne à sucre au Maroc a été confrontée à l 'un des principaux
défis qui puissent menacer sérieusement son existence: le charbon causé par
Ustilago scitaniinea.
• Cette maladie a sévi à un moment où les deux périmètres canniers du Royaume
(Gharb et Loukkos) étaient plantés dans leur quasi totalité par des cultivars
assez sensibles
• Des niveaux d’infection variant de 15.000 à 20.000 fouets/ha au Gharb et
15.000 à 40.000 fouets/ha au Loukkos ont été enregistrés
des interdictions applicables, les boutures de canne à sucre originaires ou
en provenance de tout pays ne sont autorisées à l’importation que si elles
sont reconnues officiellement indemnes:
des bactéries, des champignons et des virus figurant dans le tableau « B »
annexé au présent arrêté , ainsi que de toutes les maladies ou ravageurs
n’existant pas au Maroc et pouvant porter préjudice directement ou
indirectement à la culture de la canne à sucre marocaine.

32
Cas des céréales
•Les charbons nu et couvert se rencontrent dans toutes les régions de culture
d'orge au Maroc, les dégâts sont généralement sporadiques et de faible
importance
• Le charbon foliaire ( Urocystis agropyri ) se développe sur le blé dur, qui
est aussi présent au Maroc mais passe souvent inaperçu
 Moyens de lutte
❑ Traitement (chimique préventif) des semences par des fongicides
Comme le Raxil star de Bayer / Celest Orge Net / Rancona pour les semences
d’orge et d’avoine contre le charbon nu
Comme carboxyn / benomyl / Agroneb

❑ Utilisation des semences certifiées

❑ Utilisation des variétés résistantes (pour le cas de la canne à

sucre au Maroc)
Moyens de lutte
❑ Pratiquer des semis tardifs en automne ou précoces au printemps, pour
décaler le stade de floraison.

❑ La rotation des cultures en intercalant des plantes insensibles à cette

maladie comme le soja ou des céréales. La culture du seigle peut avoir un
effet nettoyant.

❑ Éviter les semis profonds

❑ La destruction par le feu des plants infectés ; en effet, les spores se

propagent dans le sol et hivernent jusqu'à la saison de la culture suivante.
 O/ Urédinales agents de rouille
Basides issues de téleutospores
puccinia graminis blé rouille noire
Puccinia recondita blé rouille brune
Puccinia coronata ray Grass rouille couronnée

Champignons parasites, attaquent

principalement les feuilles et les tiges

Dégâts graves

36
37
 Les urédinomycètes agents de rouille

urédosores Téleutospores
basides basidiospores
(Cellule mère
des basides)

Les autres formes reproductrices: les écidiospores et les spermaties se

forment sur l’hôte alternatif, qui n’est pas toujours connu

38
Les autres formes reproductrices: les écidiospores et les spermaties se
forment sur l’hôte alternatif, qui n’est pas toujours connu

C’est le cas de la rouille du caféier causé

par Heimileia vastatrix

Les ravages causés par la maladie de la rouille orangée sont probablement la

cause de la vulnérabilité de la culture du café aux changements climatiques.

39
Remarque: Une rouille peut être autoxène, c’est-à-dire
qu’elle effectue tout son cycle de développement sur la
même plante:
Exemple: la rouille du rosier causée par Phragmidium
tuberculatum,
ou encore Puccinia albescens, sur la moscatelline, Adoxa
moschatellina.)
 3-3-2 S/c Auto basidiomycètes
basides siphonnées
Absence de Basidiocarpe en Basidiocarpe à
basidiocarpes mycélium forme de chapeau croissance centrifuge,
endophyte produisant continue, en forme de
des basides à la surface porté par un pied croûte ou de console
des organes infectés Présentant des
lamelles à la face Rarement en chapeau
inférieure Hyménium lisse ou
formé de pores,
O/ Exobasidiales rarement en lamelles

O/ Agaricales
O/ Aphyllophorales

41
 3-3-2 S/c Auto basidiomycètes
basides siphonnées
O/ Agaricales
O/ Aphyllophorales
O/ Exobasidiales

42
 O/ Exo basidiales
Abcence de basidiocarpe
Les basides sont formés sur le tissu infecté

G/ Exobasidium

Tige
Agent de Galle
feuille
Plantes
ornommentales fleur

43
 Maladies dues aux autobasidiomycète

Agaricus Pourridié des arbres

O/ Agaricales
Armellaria mellea Dépérissement des
arbres

Stereum purpureum Plomb parasitaire O/ Aphyllophorales

D’autres basidiomycètes s’attaquent au bois mort et des

arbres malades

44
 autobasidiomycètes
O/ Aaricales: Armellaria, Agaricus, Coprinus,…

O/ Aphyllophorales:Stereum purpureum,…

45
 3-2 Deutéromycètes
Forme imparfaite, la reproduction sexuée n’est pas connue
Agents de très nombreuses maladies
leur Classification les conidies et leur naissance
Conidies naissent sur un stroma
Conidies naissent dans Conidies naissent sur
dans les tissus de l’hôte =
un organe clos, qui l’hyphe à la surface des
s’ouvre par un pore = acervule tissus de l’hôte
pycnide Et deviennent externes à
maturité

O/ sphaeropsidales O/Moniliales = hyphales

O/ Mélanconiales
G/ Sphaeropsis G/ Fusarium
G/ Colletotrichum
G/Septoria G/ Alternaria
G/ Coryneum
G/Ascochyta, ... G/Botrytis, ...
G/Gloeosporium, ...

46
 3-2-1 O/ sphaeropsidales (pycnide)
G/Phoma, Septoria, ...
*Agent de gangrène des tubercules pourriture sèche
* Nécrose feuillage
• Les septorioses
• Les anthracnoses.

47
Ascochyta sp
Agent d’anthracnoses.
L’origine du terme anthracnose vient du grec « anthrax », c’est une altération
nécrotique des parties aériennes de la plante. Ils provoquent souvent des dégâts
importants dans toutes les zones de production des protéagineuses.

dégâts sont importants

 Au Maroc
▪ Les espèces d'Ascochyta sont généralement des parasites
facultatifs
▪ Au Maroc, presque tous les parasites responsables d’anthracnoses
ont été observés sur les principales espèces de légumineuses; la
maladie est qualifiée de contrainte biotique majeure sur certaines
cultures.
▪ Les pertes de rendement du pois chiche peuvent aller de 50 à 90%
pour les variétés tolérantes et jusqu’à la destruction totale pour les
cultures sensibles.
 Ascochyta (suite)

A. rabiei vue au microscope (G : 400)

L’ observation microscopique montre:

• des pycnides libres: genre Ascochyta

• des pycnidiospores engluées dans un mucus, elles sont hyalines ovales ou oblongues
droites ou légèrement incurvées et arrondies a leurs extrémités. Généralement
monocellulaire: espèce rabiei
 Hôtes et symptômes
• Pois chiche (Cicer arietinum L.)
Agent: A. rabiei
Symptômes:

Grains, taille réduit

et souvent échaudés

les gousses, lésions

Feuille, lésions arrondies portant
Tige, lésions des pycnides très
elliptique nécrotiques
distinctes
marron-claires

Nécrose de la racine et de l’hypocotyle

( la photo est prise après un mois du
semi d’une graine contaminée)
 Pisum sativum L.)
agent: A. pisi

Symptômes:

• Pois (

Taches allongées sur Taches arrondies creuses sur

taches jaune beige les gousses
les tiges
Taches Taches
arrondies sur les
feuilles
Une ponctuation brun foncé à noire se forme dans ces taches. Ce sont les
pycnides formées par le champignon
• La fève (Vicia faba)
Agent: A. fabae
Symptômes:

Taches plus ou moins Nécrose de toute la gousse Les graines nécrosé

irrégulières

Une abondante ponctuation noire, souvent en cercles concentriques, apparaît au

milieu de ces taches; ce sont les pycnides formées par l’anamorphe
• Blé
Agent: A. tritici

Symptômes:
- Taches plus ou moins ovales, parfois allongées, de
couleur claire et entourées d’une marge brune.

- Ces taches qui deviennent brunes et dans

lesquelles une ponctuation de couleur foncée ou
noire ne tarde pas à apparaître.

- Ce sont les pycnides formées par le champignon

NB: Les symptômes, sont parfois proches de ceux causés par la septoriose foliaire
 Cycle biologique
Le cycle des anthracnoses est caractérisé par une succession de
symptômes sur chacun des organes et sur les différentes parties des
plantes.
.

La base des plantes est généralement plus attaquée que l’apex. La

maladie apparait en premier lieu sous forme de plages où les plantes
présentent une couleur jaune à marron en plein champ.

Quand les conditions sont favorables, la taille de ces plages

augmente rapidement et le champ entier peut être détruit
 Cycle biologique

•
Ascochyta Didymella

Le cycle de vie de l'anthracnose du pois chiche

Rahmani 2015)
 Pouvoir pathogène

De nombreuses études ont montré une diversité du pouvoir pathogène

parmi les isolats d’une espèce particulière d’Ascochyta par des
dépistages (screening) des génotypes différentiels ou des cultivars des
plantes.

Plusieurs
pathotypes
• un groupe d’isolats se distingue de la même espèce par sa virulence sur
un hôte spécifique
• Il Contribue a une différence qualitative du niveau de la sévérité de la
maladie
 Pouvoir pathogène
Culture dans des conditions contrôlées en serre de n génotypes de plantes
inoculées et n isolats d'Ascochyta

Déterminer les pathotypes en fonction de :

• La gravité de l'infection sur les quatre premières feuilles et des entre-nœuds
• Le degré de développement de lésions sur les feuilles
• La spécificité se de l'infection des feuilles et de la tige.

Choisir les isolats appropriés pour les utiliser dans des programmes
d'amélioration des plantes
 Caractéristiques morphologiques

Morphologie des isolats marocains d’A. rabiei

• IPC1: thalle cotonneux blanchâtre avec un mycélium aérien abondant.

• IPC4: thalle cotonneux de couleur crémeuse, avec un mycélium aérien
peu abondant
• IPC9 : thalle poudreux verdâtre avec plusieurs stries concentriques.
 la variabilité morphologique est elle accompagnée par une
variabilité du pouvoir pathogène?
Les isolats d’ Ascochyta rabiei provenant de différentes régions agro-écologiques de
l'Inde présentaient des caractères culturels et morphologiques variés:
• la taille et la couleur des thalles
• la taille des pycnides et des pycnidiospores
• la sporulation.
 Variation culturelle et morphologique chez A. rabiei

• Les colonies présentaient diverses nuances de gris et de blanc, avec une

coloration distincte au centre.
 Variation du pouvoir pathogène de A. rabiei sur le pois chiche

• Les 14 isolats d'A. Rabiei différaient par leur profil de virulence contre les lignées
de pois chiches en environnement contrôlé
• Aucun génotype n'avait montré une résistance complète contres un isolat
de A. rabiei
 Variation du pouvoir pathogène de A. rabiei sur le pois chiche

• ces différentes isolat peuvent être regroupés dans plusieurs pathotype.

• Les analyses RFLP montrant qu'il a une faible corrélation entre la variabilité
morphologique et la variabilité du pouvoir pathogène.
• Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) est une méthode
moléculaire d’analyse génétique qui permet d’identifier des individus sur la
base des coupure par enzymes de restriction
 Moyens de lutte
Les pratiques culturelles
• Réduire la quantité de l’inoculum primaire ( les semences infectées, les
déchets de de plante infectés et l’inoculum transmis par le sol )
• les semences doivent être produites dans les zones à faible pluviosité
pour réduire le risque d'infection.
• Les semences peuvent être testées avant utilisation pour déterminer
leurs niveau d'infection.
• la rotation des cultures
Les variétés résistantes
• Il existe plusieurs variétés INRA avec un assez bon niveau de résistance à
Ascochyta rabiei qui sont inscrites au Catalogue Officiel, telles que: Rizki,
Douyet, Farihane, Moubarak et Zahor.
• Deux nouvelles variétés «Hiba» (fève) et «Zina» (féverole), crées par
l’INRA (Centre Régional de Meknès) ont été inscrites au catalogue officiel
en fin 2018.
• Elles se caractérisent par leur résistance à plusieurs fléaux dont
essentiellement le Botrytis et l’anthracnose.

% % %
Fin de la septieme
Séance

Merci de votre
Attention

66
Université Mohammed V- Rabat, Maroc
Faculté des Sciences,
Département de Biologie

Master 2
Année universitaire 2020 - 2021

Module de Phytopathologie
Séance 8

Pr. A. ELAISSAMI
 Champignons
phytopathogènes
(suite)

68
 3-2-2 O/ Mélanconiales ( acervule)
G/Colletotrichum, Gleosporium, Cylindrosporium, ...
Agents de l’ Antrachnose

69
O/ Mélanconiales ( acervule) suite

Colletotrichum

a – c) Les symptômes de type I sont

caractérisés par des lésions enfoncées brun
foncé à noires avec un bord légèrement
surélevé et de nombreux acervules noirs à la
surface, qui produisaient des masses
conidiennes blanches sales dans des
conditions humides.
(d – f) Les symptômes de type II
comprennent des lésions enfoncées brun
foncé à noires avec de nombreux acervules
noirs à la surface, qui produisent des masses
conidiennes visqueuses de couleur rose dans
des conditions humides.
(g – i) Les symptômes de type III
comprennent des lésions brunes à noir clair à
brun foncé, enfoncées avec des masses
conidiennes
Symptômes typiques de l'anthracnose
du poivron

70
 (A) Vue de dessus d'une
colonie sur PDA
(B) vue inversée de la
colonie sur PDA;
(C) micrographies de
conidies de Colletotrichum
spp .;
(D) micrographies
d'appressorias conidiales
de Colletotrichum spp .;
(E) micrographies
d'appressoria mycélienne
de Colletotrichum spp .;
(F) les conidiophores.
Barres d'échelle = 10 μm
pour (C – E); 20 μm pour
(F).

Morphologie et caractéristiques culturelles de l’ anthracnose du poivron causé par

Colletotrichum spp.

71
O/ Mélanconiales ( acervule) suite

Colletotrichum musae sur banane

Gleosporium sp sur pomme

72
 O/ Mélanconiales ( acervule) Coryneum agent de criblure

Le Coryneum impacte fortement les pêchers, les nécroses laissent apparaitre des
trous d’où son nom « maladie de la criblure ».

▪ Cette maladie attaque les feuilles, les fruits, les jeunes rameaux. Sur la
feuille, il provoque, dès le printemps, l’apparition de petites taches cerclées
d’une zone brun-rouge.

▪ Les tissus atteints meurent, laissant les feuilles criblées de trous. Les feuilles
très atteintes tombent prématurément, ce qui affaiblit les arbres.

▪ Les fruits envahis se détachent ou sont marqués de taches brunes. Sur les
rameaux apparaissent de petits chancres avec gommose.

73
 Les causes de l'apparition du Coryneum
▪ Le champignon hiverne dans les bourgeons de la plante hôte. Il reste actif
toute l'année.

Prévention et traitement bio du Coryneum

▪ Application de bouillie bordelaise de façon préventive, en hiver sur les fruitiers

et les haies de lauriers.

▪ Traitement de la maladie déclarée (hors floraison) :

Par le mélange de la bouillie bordelaise en diminuant le dosage par
une décoction de prèle diluée à 20%.

74
3-2-3 O/ Moniliales = hyphales
Les conidies naissent directement sur l’hyphe

75
Brunissement
des vaisseaux
conducteurs

76
épinastie

77
Moniliale
Alternariose
G/ Alternaria

78
Alternaria alternata
▪ Espèce saprophyte, elle peut également être pathogène sur plusieurs espèces
végétales.

▪ Elle cause la pourriture des légumes et fruits.

Alternaria alternata : Agents de mycoses végétale et animale
Les spores sont allergènes et chez l’Homme, ils peuvent causer des maladies
respiratoires des infections cutanées et des nécroses des organes chez les sujets
vulnérables.

Alternaria alternata Nécrose causée par Alternaria

de la tomate: Blancard et al, 2012 alternata au niveau du rein chez
l’Homme (Raza et al., 2015).
Alternaria alternata
• Mycélium constitué de filaments bruns, cloisonnés et ramifiés: hyphes.

• Le champignon produit des spores de grande taille disposées en chaine

portées par des filaments septées appelées conidiophores.

Conidies en chaine

Hyphes
Conidiophore
Moniliale G- Botrytis

82
Botrytis agent Moisissure, Pourriture, …

Mycélium grisâtre

aubergine
raisin

83
Pourriture molle de la pomme causée par, Botrytis cinerea

Mycélium aérien
développé

Conidies groupées en tête Conidies

sèches sur de petites ovées
denticules Conidiophore
 Champignons épiphytes
G/ Capnodium: mycélium brun – noir + fructifications
❑ Champignons non parasites mais nocifs
❑ Ces champignons vivent en saprophytes dans
le liquide sucré: miellat secrété par les insectes Agrumes,
à la surface des feuilles olivier,
❑ Formation d’une couche noire : la fumagine avocatier,
néflier, lierres,
❑ qui masque la face supérieure du végétal ...

Perturbation de la photosynthèse, la
respiration et la transpiration

85
 fumagine
olivier Schefflera

86
 Fumagine
▪ Les cochenilles excrètent de grandes quantités de miellat
sur lequel se développe un mycélium dense, noir:
▪ La fumagine.
▪ Ce feutrage peut recouvrir les feuilles (diminution de la
photosynthèse) et les fruits (dépréciation de la qualité)

87
 4 – Comparaison:
Ascomycètes - Deutéromycètes

88
 Comparaison: Ascomycètes - Deutéromycètes
Plusieurs ressemblances:
▪ forme du mycélium
▪ les conidies
▪ les structures mères des spores,
▪ les formes de résistance
▪ les caractères parasitaires
▪ les symptômes ...

89
Exemple Mycoses de maïs

Fusarium
Deuteromycete
moniliale

Giberella
Ascomycète
hypocréale

90
Exemples
Mycosphaerella Septoria
Erysiphe Deux formes oidium
pour un même
Didymella Ascochyta
Giberella
champignon Fusarium
Forme parfaite Forme imparfaite
Deutéromycètes
Ascomycètes

Mêmes symptômes
- Les pourritures, ...
- Maladies vasculaires

Difficulté du diagnostic

91
5- Maladies dues aux agonomycètess
Certains septomycètes n’ont aucune forme de
reproduction: ni spores, ni gamètes
Ils peuvent

• Persister dans les tissus de l’hôte sous forme d’un mycélium latent
• Se transformer en chlamydospores
• se condenser sous forme de sclérotes

92
 Agonomycètes
5-1 Généralités

▪ Le groupe des Agonomycètes contient environ 200 espèces décrites

▪ Celles-ci ne produisent pas de conidies, mais certains genres peuvent

produire des propagules telles que les sclérotes et les chlamydospores

▪ Elles se développent essentiellement par la multiplication végétative

Pour cette raison, les Agonomycètes ont été appelés mycéliums stériles ou
champignons stériles.
 Agonomycètes
Généralités
▪ Ce sont des champignons qui ne produisent pas de conidies
▪ Cependant, n’importe quel mycélium non fructifié ne rentre pas dans
cette catégorie
▪ Les Agonomycétes typiques ont des structures constantes et
reconnaissables
▪ Ce sont des formes de conservation plus au moins massives (agrégats de
cellules) tels que sclérotes ( à cortex et médulle distincts ) , et bulbilles (
sans cortex différencié)

Exemples de propagules
d’ Agonomycètes

(Nasraoui, 2008; Kiffer,1997)

 5-2 Exemples d’ agonomycètes
phytopathogènes

Agents phytopathogénes Maladies

Rhizoctonia cerealis Parasite des céréales

R. fragariae Agent de la pourriture racinaire du fraise

R. oryzae-sativae Parasite du riz

R. solani Agent du rhizoctone de nombreuses espèces

végétales

Sclerotium rolfsii Agent de pourriture

S. cepivorum Agent de la pourriture blanche de l’oignon

S. coffeicolum Agent des taches foliaires du caféier

Rhizoctonia
▪ Le genre Rhizoctonia compte environ 15 espèces.
Les caractères importants sont la formation de sclérotes de taille et de forme
irrégulières, mais de texture uniforme et d’une couleur brune ou noire

▪ Ce sont des nécrotrophes facultatifs, capables d’une existence prolongée en

tant que saprophyte dans le sol causant des maladies comme la fonte de semis
et la pourriture des racines .
Exemple 1
R. cerealis

▪ Ce champignon est présent dans toutes les régions productrices de blé tempérées
du monde

▪ Sous forme de mycélium ou de sclérote dans les débris des végétaux

▪ L’infection des plantes se produit au niveau des tissus racinaires à tout moment de
la saison de croissance
R. cerealis

▪ Les symptômes de R. cerealis sont visibles sur les gaines

généralement à partir de la montaison , avec une accentuation
et une pénétration des tiges jusqu’à l’épiaison.

▪ Il est important de noter qu’il ne génère aucun symptôme au

niveau des racines.

▪ Le mycélium présent sur les taches s’enlève facilement en

frottant avec un doigt humide.

98
 Situations à risques

R. cerealis présente un très large spectre d’hôte.

▪ Outre les céréales à paille ainsi que les graminées adventices,

▪ Il est connu pour générer des symptômes sur les gazons et de

nombreuses cultures légumières.

Moyens de lutte contre R. cerealis

▪ Il existe un traitement de semences utilisable contre cette

maladie.

▪ Aucun traitement fongicide en végétation n'a montré, à ce jour,

une efficacité significative.

99
 Exemple 2
R. fragariae
• infecte les racines et le collet des plants de fraisier et provoque la
pourriture racinaire noire.

• L’infection est favorisée par des températures comprises entre 15 °C et

25 °C et une forte humidité.

Hyphe à
angle 90°
 Moyens de lutte contre R. fragariae

Principales méthodes recommandées:

▪ Utiliser un matériel de plantation sain et éviter les terrains

infestés par R. fragariae

▪ Employer des cultivars de fraisier résistants

▪ utiliser le bromure de méthyle seul ou mélangé avec de la

chloropicrine
Exemple 3
R. oryzae-sativae
La pourriture des tiges est sans aucun doute la maladie
la plus facilement identifiable par les riziculteurs.

Ramification branchée
à 90°

Une feuille de riz présentant des lésions typiques associées à la

maladie de la brûlure de la gaine causée par R. oryzea-sativae

102
R. Oryzae - sativae

▪ Les infections tardives du riz entraînent une action qui affecte à la fois la
. quantité et la qualité du rendement

▪ Parfois, les rendements sont si faibles que les riziculteurs choisissent de

ne pas récolter.

les attaques les plus graves pouvent détruire toute la production,

les riziculteurs font souvent valoir que les pertes négligeables,
peuvent aller jusqu’à 25%
 Moyens de lutte contre R. oryzae-sativae
Principales méthodes recommandées:

▪ Détruire le chaume en brûlant, après la récolte, lorsque le champ a été gravement

attaqué.

▪ Eviter la stagnation de l’eau dans la rizière et d’utiliser une eau adéquate pour la
régénérer.

▪ Adopter une fertilisation rationnelle en utilisant la quantité minimale d'azote requise

pour permettre l'optimisation de la production et en utilisant également des engrais à
base de potassium et de phosphore
Exemple 4
Rhizoctonia solani

En 1858
Julius Kühn fondateur de la pathologie végétale, nomma un champignon phytopathogène
R. solani

En 1920 jusqu’au milieu des années 1970

Première identification de R. solani sur la fétuque rouge R. solani
le seul champignon associé à des maladies du gazon, appelées «tache brune».

Actuellement
Ce type de champignon se rencontre partout dans le monde, dans pratiquement tous les
types de sol.
 Les caractéristiques d’agent pathogène

Rhizoctonia solani
▪ Ce pathogène cause une altération de la qualité marchande des
tubercules; ce qui induit de sérieuses pertes économiques et la diminution
du rendement jusqu’à 50%

Tâches noires finiront par envahir la

totalité du tubercule de pomme de terre

impropre à la consommation

106
Rhizoctonia solani

107
Biologie de R. Solani

108
 Moyens de lutte contre R. solani
Principales méthodes de lutte recommandées:
▪ Utiliser des tubercules bien germés. Éviter une plantation précoce et en profondeur par
temps froid. Pratiquer de longues périodes de rotation. Appliquer des fongicides avant
la plantation.

▪ La lutte biologique contre l’agent de la fonte des semis, R. solani, peut s’envisager en
utilisant un nématode mycéliophage Aphelenchus avenae.

▪ Les souches de Trichoderma secrètent une grande quantité d’antibiotique inhibant le

développement de R. solani de 79-82%.
F- Source de l’inoculum fongique,
diagnoatic et méthodes de lutte

110
 1- Source de l’inoculum fongique
- Spores Conditions
- Organes de conservation
Germination
favorables
- Débris de végétaux malades
- Semences contaminées

Pratiques impropres
Blessures, Insectes,
Eaux d’irrigation,
…

Attaque d’autres plantes hôtes

111
 2- Diagnostic

❑ Diagnostic visuel

❑ observation des symptômes

caractéristiques

plusieurs champignons Diagnostic difficile, voir

provoquent les mêmes même impossible
symptômes

112
 Diagnostic difficile, voir
même impossible

Recours à d’autres moyens de diagnostic

1. Les méthodes biologiques : détection d’entité

infectieuse de l’agent pathogène (Postulats de Koch)

2. Les méthodes sérologiques : mise en évidence de

molécules immunogènes

3. Les méthodes moléculaires : révélation de séquences

d’acides nucléiques du parasite

113
3- Les principales méthodes de lutte contre les
champignons phytopathogènes sont :

• Les pratiques culturales

• La sélection variétale
• La lutte mécanique et physique
• La lutte biologique et biotechnique
• La lutte chimique

114
 Fin de Chapitre
Champignons Phytopathogènes

115