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Le but de cette premiere partie du cours de biologie generale est de donner aux etudiants de
premiere annee de baccalaureat les bases necessaires a la comprehension de cours plus
specialises communs a tous les programmes de la Iaculte de medecine (histologie, biochimie,
biologie cellulaire et moleculaire, physiologie, genetique. ).
L`objectiI de tout enseignement universitaire n`est pas limite a la transmission d'un savoir,
mais vise aussi a pousser les etudiants a developper une methode qui leur permette d`
"apprendre a apprendre" par eux-mmes. Cette methode comporte de multiples etapes :
recherche de sources de documentation Iiables, comprehension, lecture critique, synthese et,
Iinalement mise en application du savoir acquis.
La matiere qui doit tre matrisee par l`etudiant est deIinie lors du cours en auditoire et nous
encourageons donc vivement les etudiants a prendre des notes. La prise de notes exactes et
completes etant un exercice diIIicile, l'etudiant peut les completer a l'aide des elements
suivants:
- ce syllabus reprend la majorite des explications donnees au cours. Il n'est pas complet mais
constitue une bonne base de notes de cours. Il contient aussi certaines explications
supplementaires donnees a titre indicatiI.
- les schemas dessines au tableau doivent tre recopies le plus Iidelement possible.
- les schemas qui sont projetes Iont egalement partie du cours. L'etudiant doit donc s'exercer a
les reproduire. Ils sont disponibles sur le site internet du cours.
- l`ouvrage de reIerence recommande pour ce cours est Biologie de Campbell et Reece
(disponible a la bibliotheque et dans n`importe quelle librairie). L'ouvrage "Biologie" de
Raven peut egalement tre consulte.
- un Iorum de discussion est egalement a la disposition des etudiants sur le site iCampus pour
repondre aux questions qui subsisteraient.
Ce cours necessite plusieurs niveaux d`apprentissage. Tout d`abord, une serie de notions
doivent tre etudiees par cour : noms des composes, des structures cellulaires, des
processus, etapes de ces processus, etc. N`hesitez pas a utiliser des trucs mnemotechniques
pour vous Iaciliter la tche ! Ensuite, il est indispensable de chercher a comprendre la logique
qui sous-tend les processus biologiques. Cette etape de comprehension va grandement
Iaciliter la memorisation du cours, et surtout, permettra a l`etudiant d`utiliser ce qu`il a appris
pour aborder des matieres nouvelles. Pour chaque aspect de la vie cellulaire, les questions
suivantes doivent tre posees : Comment a marche ? , Pourquoi ? , Quels sont les
avantages d`un mecanisme plutt que d`un autre ? . EnIin, la mise en application des
concepts theoriques permet de resoudre les quelques exercices proposes dans ce cours.
1
Des questions de reIlexion sont proposees aux etudiants a la Iin de chaque partie, de Iaon a
ce qu`ils puissent tester leur niveau de comprehension. Ces questions sont similaires a celles
qui seront posees lors de l`examen ecrit (mais pas identiques - etudier par cour les
reponses n`a aucun intert !). Il est indispensable que l`etudiant reIlechisse lui-mme aux
reponses a apporter a ces problemes, puis qu'il en discute avec d`autres.
L`etude "transversale" est tres importante dans ce cours. Les structures cellulaires doivent
tre associees aux composes chimiques qu`elles contiennent, et aux Ionctions physiologiques
qu`elles remplissent. La comprehension des mecanismes genetiques passe par une bonne
matrise de la physiologie cellulaire (synthese des proteines) et de la division cellulaire
(mitose, replication de l`ADN, chromosomes). Les questions d`examen comporteront souvent
plusieurs elements de reponse situes dans des chapitres diIIerents. Pour preparer l`etudiant a
ce type de questions, il est vivement recommande d`etudier de maniere transversale : apres
avoir vu le cours de maniere lineaire (chapitre par chapitre, dans l`ordre propose dans ce
syllabus), il est utile de le revoir theme par theme : les membranes (composants, structure,
permeabilite, nutrition, metabolisme des lipides) ; l`ADN (structure, noyau, replication,
chromosomes, genes, polymorphisme) ; la mitochondrie (structure, metabolisme, origine) ;
etc. Il est probablement utile de construire un petit resume pour chaque theme transversal.
Lorsque la matiere du cours est acquise, il est essentiel d`tre capable de la restituer de
maniere adequate. Quelques conseils pour l`examen : les schemas qui sont reproduits doivent
tre clairs, comprehensibles et legendes. Quelques phrases sont en general necessaires pour
expliquer un dessin. Il est tout aussi important de repondre precisement a une question : ne
pas systematiquement retranscrire tout le chapitre correspondant, ce qui diminue
automatiquement la valeur de la reponse donnee. Les interrogations et les rapports de travaux
pratiques constitueront un bon entranement.
Bon travail !
Jean-Baptiste Demoulin
Charge de cours
Le 5 juillet 2007.
2
INTRODUCTION
La Biologie est l'etude scientiIique des organismes vivants.
Qu'est-ce que l'etude scientiIique? Que sont les tres vivants?
Obfectifs a atteindre par letudiant .
Etre capable de deIinir et classiIier les tres vivants
1. LA MTHODE SCIENTIFIQUE
L'etude scientiIique se distingue d'autres Iormes de pensees par sa methode: la religion
est issue de la revelation, la philosophie de la reIlexion. La science se caracterise par la
methode experimentale.
Cette methode presente plusieurs phases:
La premiere est l'observation: on accumule une serie de donnees sur le probleme
d'intert, en utilisant le plus souvent des appareillages parIois tres complexes. Un chercheur
doit tre a la Iois curieux et precis dans ses observations. Une decouverte majeure decoule
souvent de l'observation sous un angle nouveau d'un probleme ancien. Les travaux pratiques
constituent une bonne introduction a l'observation scientiIique.
A partir de ces observations decrites, classees, structurees, naissent des questions:
quelle est l'origine, la cause de ce que j'observe? quelle relation unit la cause supposee et
l'eIIet observe? Ces questions entranent par induction, des hypothses explicatives: causes,
relations de cause a eIIet.Un chercheur doit tre imaginatiI.
Ces hypotheses sont alors testes exprimentalement pour en veriIier le bien-Ionde
ou les limites. Si de nombreuses experiences conIirment l'hypothese et quand la communaute
scientiIique l'admet, l'hypothese est alors elevee au rang de thorie. Le chercheur doit tre
impartial et tres prudent. Cette theorie permet alors de Iaire avancer d'un pas la
comprehension du monde qui nous entoure.
De ce Iait, la demarche scientiIique n'est pas inIaillible, contrairement a ce que l'on
pense souvent. Elle possede plusieurs points Iaibles:
- des erreurs peuvent se produire dans les observations : mme prolonges par des instruments,
nos sens ont des limites et on peut calculer l'erreur due aux limites de precision des
instruments;
3
- les hypotheses peuvent ne pas tre suIIisamment puissantes et n'expliquer d'une partie des
observations;
- les experiences peuvent tre mal adaptees au but poursuivi, biaisees ou insuIIisantes en
nombre et variete;
- la soit disant relation trouvee peut n'tre que le Iruit malheureux du hasard : n'oublions
jamais que la statistique, etalon de mesure de la Iiabilite des resultats experimentaux, ne
prouvera jamais que l'hypothese qui sous-tend l'experience est bonne ou mauvaise, elle ne
Iera que mesurer les chances que l'on a de se tromper en l'acceptant.si les lois du hasard
sont respectees;
- la theorie peut surgir trop tt d'une generalisation abusive ou d'une extrapolation a partir
d'un nombre trop restreint de donnees,
- et il arrive mme que des chercheurs soient malhonntes.
Aussi le scientiIique doit-il rester vigilant et n'admettre les theories que "jusqu'a
preuve du contraire", surtout dans un domaine aussi complexe et variable que la biologie.
Ceci constitue indeniablement une des diIIicultes de la biologie: cette incertitude, cette
remise en question constante nous Iait avancer sur un terrain mouvant, alors que nous
imaginons que partout en biologie tout est aussi clair que 2 2 4.
Malgre toutes ses imperIections, la methode scientiIique est l'outil le plus puissant, le
plus eIIicace et le plus sr que l'homme ait invente pour mieux comprendre le monde dans
lequel il vit. Les progres spectaculaires de la medecine depuis qu'elle applique cette methode
en sont la preuve.
2. LES TRES VIVANTS
Curieusement, alors qu'intuitivement on peut aisement distinguer les tres vivants des
choses inanimees, il est diIIicile de deIinir la vie. Commenons par enumerer les
caracteristiques essentielles qui distinguent les tres vivants des tres inanimes.
1 Parmi ces proprietes, la plus apparente est l'organisation : tous les tres vivants sont
organises, structures, quel que soit le niveau observe. Ainsi, une plante superieure, est
composee d'organes (tiges, Ieuilles, racines, Ileurs, Iruits) et chacun d'eux est structure en
tissus remplissant chacun des Ionctions bien precises (assimilation, soutien, protection, etc.).
Les tissus eux-mmes sont Iormes d'un certain nombre d'unites Iondamentales d'organisation
: les cellules.
La cellule a son tour, possede une etonnante richesse de structures et d'organites. Au-dela, et
jusqu'au niveau moleculaire, la matiere vivante demeure tout autant structuree. Chaque
molecule possede une structure bien precise qui lui permet d'operer des Ionctions
particulieres et souvent speciIiques.
4
Si certains corps inanimes montrent parIois une structure complexe (cristaux, par exemple),
celle-ci n'est jamais liee a une Ionction biologiquement explicable.
2 Les tres vivants sont ordonns au sens thermodynamique du terme, ce qui ne peut se
Iaire qu'au prix d'une grande consommation d'energie. De ce Iait, les tres vivants constituent
des systemes thermodynamiques ouverts. Ils ont des relations avec le milieu exterieur dans
lequel ils puisent l'energie (qu'ils transIorment et degradent) et les materiaux necessaires a
leur maintien (homeostasie) et a leur croissance. Il existe entre les tres vivants et le milieu
dans lequel ils vivent, un echange continuel de substances, lie a des echanges d'energies.
3) Chaque structure - depuis la molecule jusqu'a l'organe le plus complexe - possede une
fonction qui lui est propre. Structure et Ionction sont deux aspects indissolublement lies.
Chez l'tre vivant aucune structure n'a de raison d'tre sans la Ionction qui lui est associee et
chaque Ionction ne peut se realiser normalement qu'au sein d'une structure bien precise,
complete et entiere. Cet aspect ne se maniIeste pas chez les objets inanimes.
4 Les tres vivants se reproduisent; c'est la une quatrieme propriete Iondamentale. Ils
sont capables de generer d'autres individus semblables a eux-mmes, possedant la mme
structure Ionctionnelle et la mme autonomie.
Les tres vivants sont donc doues d'autosynthese, d'autoreproduction, et la matiere vivante ne
peut se synthetiser qu'a partir d'elle-mme .
5 EnIin, quoique cette cinquieme propriete soit moins spectaculaire chez les vegetaux
que chez les animaux, tous les tres vivants sont capables de ragir, par des mouvements, a
certaines excitations exterieures et d'y adapter leur comportement. Ils peuvent en outre
s'adapter au milieu dans lequel ils vivent et mme le modiIier a leur avantage ou voluer
pour survivre.
La comparaison entre les tres vivants a montre que l'unite Iondamentale, minimale de
la vie, c'est la cellule.
Une cellule possede une limite qui a la Iois, la separe, l'isole du milieu exterieur et
contrle les transIerts moleculaires. Il s'agit d'une membrane plasmique qui, chez les
vegetaux, est protegee, renIorcee du cte exterieur par une paroi cellulaire. Le contenu
Iondamental de la cellule, le cytoplasme contient les structures et les inIormations
necessaires a toutes les Ionctions de l'tre vivant: nutrition, metabolisme, croissance,
reproduction. L'information est stockee sous Iorme chimique dans l'ADN. Le cytoplasme
possede en plus des chanes enzymatiques qui lui permettent de recuperer de l'energie puisee
a l'exterieur sous Iorme chimique (molecules organiques) ou physique (lumiere) et de la
transformer en ATP. Le cytoplasme possede enIin des systemes enzymatiques necessaires a
l'exploitation de son inIormation en la traduisant sous Iorme de proteines, outils de son
metabolisme et de son autoduplication. Ces Ionctions sont separees dans des territoires
cellulaires diIIerents chez les cellules evoluees.
5
Aux niveaux inIerieurs, les organites intracellulaires, les virus et les molecules
biologiques montrent encore des structures, Ionctions, inIormations typiques de la vie mais ne
les possedent plus toutes. Les virus ne sont donc pas des tres vivants a part entiere.
Aux niveaux superieurs, les tissus, organes, individus et colonies sont composes de
cellules developpant entre-elles des collaborations. La cellule occupera donc une place
centrale dans ce cours de biologie, car c'est a ce niveau que se concretise le plus l'unicite du
monde vivant.
En conclusion, on peut deIinir un tre vivant comme un organisme
capable de crotre et de se reproduire
en se maintenant dans un etat eloigne de l`equilibre, grce a un Ilux continu d`nergie et de
matiere Iourni par l`environnement,
et constitue d`une ou plusieurs cellules.
3 . LA DIVERSIT DU MONDE VIVANT: CLASSIFICATION
Le monde vivant etait classiquement divise en deux regnes : animal et vegetal, etudies
par la zoologie et la botanique. Les animaux sont caracterises par une tendance evolutive
selectionnant des individus avides de relation active et perIectionnee (developpement des
systemes sensoriel, nerveux et locomoteur), au detriment de l'autonomie nutritive
(heterotrophes). Les vegetaux, au contraire privilegient l'autonomie alimentaire par utilisation
de l'energie lumineuse et du gaz carbonique (autotrophes), ce qui entrane une strategie
d'occupation de l'espace, dont les corollaires sont l'ancrage au sol et l'immobilite. Les
champignons, heterotrophes mais utilisant la mme strategie d'occupation etaient consideres
comme des vegetaux inIerieurs. Les tres vivants microscopiques etaient classes dans l'un ou
l'autre regne sur base de leur capacite de photosynthese ou de mobilite. Il apparut cependant
rapidement que beaucoup d'entre eux ne ressemblaient ni aux uns ni aux autres et qu'il Iallait
les classer a part. De plus, une diIIerence Iondamentale apparut dans ce groupe au niveau de
la structure cellulaire et obligea de le scinder en deux. EnIin, une meilleure connaissance des
champignons amena a les considerer a part des vegetaux. Ces considerations ont mene a une
nouvelle classiIication du monde vivant, celle de R.H. WITTAKER, qui se base sur l'existence
de 5 regnes:
Les procaryotes
Ce sont des tres vivants unicellulaires, isoles ou en colonies, dont la structure
cellulaire est extrmement simple. Ils n'ont pas de noyau vrai : l'ADN, de dimension reduite,
n'est pas associe a des proteines, ni entoure d'une membrane (procaryon). Les organites
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cellulaires entoures d'une membrane sont absents. Ils ne pratiquent pas de veritable
reproduction sexuee. La nutrition se Iait par absorption. La paroi, de structure complexe, est
essentiellement constituee de peptidoglycans, associes a d'autres molecules variables d'apres
les groupes. On distingue les bacteries et les cyanobacteries ("algues bleues").
Les bacteries ont explore et utilisent toutes les niches ecologiques, mais leurs
exigences sont souvent tres strictes, limitant leur developpement a des milieux bien deIinis.
La plupart des bacteries sont heterotrophes: saprophytes parasites ou symbiotiques.
Les cyanobacteries sont des organismes photoautotrophes aerobies. Elles contiennent
de la chlorophylle localisee dans des thylakodes qui pourraient provenir d'invaginations de la
membrane plasmique. Elles seraient a l'origine de l'oxygene atmospherique. On connat de
nombreux cas de symbiose entre algues bleues et divers autres organismes (c'est le cas des
lichens, par exemple).
De par leur simplicite, les procaryotes (aussi appeles moneres) sont consideres comme
les representants des Iormes de vie les moins evoluees, les plus anciennes.
Un groupe restreint de bacteries presente des caracteristiques genetiques et
physiologiques tres particulieres qui semblent adaptees aux conditions climatiques de
l'epoque ou la vie apparut sur Terre. Ce sont les archeobacteries ou archees, dont certains
voudraient Iaire un sixieme regne, voire un domaine, nouveau niveau de classiIication. Il
semble que les eucaryotes soient plus proches des archees que des bacteries. Archees et
eucaryotes pourraient donc avoir un anctre commun.
Les virus, virodes et plasmides ne sont pas consideres comme des tres vivants.
Les protistes
Les protistes renIerment un ensemble heteroclite d'tres vivants Eucaryotes (c'est-a-
dire possedant un vrai noyau entoure de membranes) et unicellulaires ou coloniaux, tres
souvent aquatiques. Ils ont acquis par l'evolution, une serie d'organites specialises dans
diIIerentes Ionctions. On distingue une dizaine d'embranchements (phylla) ayant evolue dans
des directions tres diverses quant a leur metabolisme: heterotrophes par absorption ou
ingestion ou photoautotrophes et, dans ce cas, a photosynthese complete. Souvent mobiles, ils
montrent une reproduction sexuee typique mais pouvant prendre des Iormes tres variables.
Suivant leur metabolisme, les protistes etaient classiquement rattaches aux plantes
(protophytes) ou aux animaux (protozoaires), bien que de nombreux intermediaires existent.
Ils ont evolue a partir de lignees diIIerentes de procaryotes : il n'y a donc pas d'anctre
procaryote unique ayant genere tous les protistes. Pour cette raison, de nombreux
scientiIiques pensent que le groupe des protistes devrait tre scinde en diIIerents regnes.
Le regne des protistes regroupe un certain nombre d'organismes pathogenes, comme
Plasmodium falciparum (malaria), Giardia lamblia (diarrhees graves), et les trypanosomes
(maladie du sommeil et maladie de Chagas).
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Les algues rouges et brunes, autreIois considerees comme des plantes primitives, sont
actuellement classees parmi les protistes, car elles ne possedent pas de veritables organes
diIIerencies et ont evolue a partir de protistes diIIerents des autres plantes. Ces algues
possedent des pigments photosynthetiques diIIerents des algues vertes et des plantes. Ces
pigments sont responsables de la coloration particuliere de ces algues.
Les trois derniers regnes sont tous constitues d'organismes Eucaryotes pluricellulaires
dotes de cellules specialisees produites par un processus appele diffrenciation cellulaire. Ils
se distinguent essentiellement par leur mode de nutrition.
Les myctes ou champignons
Ce sont des organismes Eucaryotes, generalement pluricellulaires, immobiles,
heterotrophes se nourrissant uniquement par absorption de matieres organiques.
L'appareil vegetatiI est Iorme d'hyphes, Iilaments enchevtres, souvent souterrains,
constituant le mycelium. Les cellules sont entourees d'une paroi constituee de chitine. La
reproduction est vegetative ou sexuee agame (pas de diIIerence entre les sexes). La dispersion
se realise au moyen de cellules speciales, les spores.
Les "vrais" champignons ou Eumycetes sont tres nombreux (quelques centaines de
milliers d'especes) et tres varies. Les plus evolues produisent des carpophores, (Iaux tissu
d'hyphes entremles) dans lesquels sont produites les spores; c'est ce que nous appelons
communement le champignon. On distingue dans ce regne, l'apparition d'une diIIerenciation
cellulaire: des groupes de cellules vont acquerir une Iorme et une Ionction particuliere pour
devenir plus eIIicace pour l'ensemble. Cette diversiIication est une acquisition de l'evolution.
De par leur mode de nutrition, ils vivent soit en association symbiotique ou parasitaire
avec d'autres organismes vivants ou decomposent des organismes morts. On leur doit donc
une serie de maladies (mycoses cutanees, aspergilloses systemiques graves), de degradations
(moisissures, merule), mais aussi les Iermentations industrielles (levures permettant la
Iabrication du pain, de la biere, du vin, et de Iromages) et certains medicaments (penicilline).
Certains sont comestibles alors que la majorite est indigeste sinon toxique (amanites).
Les Lichens ne sont pas des champignons a proprement parler mais des organismes
composites dont le thalle est constitue d'un mycelium, le plus souvent d'Ascomycete, entre les
hyphes duquel sont abrites soit une cyanobacterie, soit une algue verte, soit encore les deux
simultanement. La nature exacte des relations nutritives entre les deux organismes constituant
le lichen est variable et souvent encore mal connue.
Les animaux
Ce sont des organismes pluricellulaires, eucaryotes, generalement mobiles,
heterotrophes se nourrissant par ingestion. Les aliments sont d'abord digeres (decomposes en
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molecules plus simples) dans des cavites extracellulaires. L'evolution a selectionne chez eux
une serie de structures, tant inIra- que supracellulaires, adaptees a des Ionctions particulieres
de plus en plus perIormantes et precises. Les animaux se distinguent entre autres par
l'apparition d'un systeme nerveux leur permettant une perception du monde exterieur et une
reaction coordonnee tres poussee. Leur reproduction est essentiellement sexuee.
Les vgtaux
Ce sont des organismes pluricellulaires, diIIerencies, eucaryotes, immobiles,
autotrophes, photosynthetisants, c'est-a-dire capables de transIormer l'energie lumineuse du
soleil en energie chimique necessaire a leur autosynthese.
Les vegetaux sont divises en quatre grands groupes: les charophytes (algues vertes),
les bryophytes (mousses), les ptridophytes (Iougeres) et les spermatophytes (plantes
superieures).
Les algues vertes, comme les autres algues, sont des organismes aquatiques a structure
vegetative peu diIIerenciee, ne comportant ni tige, ni Ieuille, ni racine. Comparees aux autres
algues, les algues vertes sont plus proches des plantes superieures par leur pigments
photosynthetiques (chlorophylles), leur metabolisme et la structure de leur paroi de cellulose.
Les autres groupes ont evolue a partir d'algues vertes ancestrales et regroupent toutes
les plantes terrestres qui ont d s'adapter a ce milieu anhydre en developpant racines, tiges et
Ieuilles. Les cellules sont entourees d'une paroi cellulosique. Les pigments sont
essentiellement des chlorophylles a et b, associees a des carotenes et de la xanthophylle.
La reproduction est principalement sexuee (voir chapitre correspondant). On distingue
plusieurs types de vegetaux:
Les bryophytes possedent un thalle ramiIie ou sont des plantes deja plus evoluees
montrant une tige couverte de petites Ieuilles mais ne possedant pas de racines (mousses). La
Ionction de nutrition est assuree par des cellules longues, specialisees, issues de la tige et que
l'on denomme rhizodes. La reproduction est sexuee. L'alternance de phases est parIaite avec
predominance de la phase haplode, le sporophyte vivant en parasite et se reduisant a une
urne sporangiIere produisant les spores qui assurent la dissemination.
Les ptridophytes (la Iougere par exemple) etablissent le passage vers des vegetaux
plus evolues (plantes dites "superieures"). Ce sont des plantes qui comprennent une tige - le
plus souvent souterraine (rhizome) - des Ieuilles et des racines vraies. Elles possedent un
systeme vasculaire et de soutien. A partir de cet embranchement, c'est la phase diplode qui
devient predominante. La dissemination s'opere encore au moyen de spores. Cependant on
voit apparatre apres la Iecondation, pour la premiere Iois dans l'evolution generale, un
veritable embryon, plante entiere en miniature. Mais cet embryon n'est pas encore protege par
des tissus specialises.
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Les Spermatophytes ou phanrogames representent la majorite de la Ilore actuelle.
Ce sont les plantes et des arbres qui produisent des graines. L'appareil vegetatiI est constitue
de tiges, Ieuilles et racines.
Le tableau suivant recapitule quelques diIIerences entre les regnes.
Bacteries Protistes Mycetes Vegetaux Animaux
Noyau -
Paroi ou - -
Autotrophie ou - ou - - -
Nutrition absorption absorption
ingestion
absorption absorption
ingestion
Mobilite ou - ou - - -
Reserves - ? glycogene amidon
lipides
glycogene
lipides
Chaque regne est ensuite divise en groupes d'tres vivants appeles embranchements. Ceux-
ci sont eux-mmes subdivises en classes, puis en ordres, constitues de familles. chaque
Iamille comprend en general plusieurs genres, qui regroupent un certain nombre d'espces, le
niveau le plus bas de classiIication des tres vivants. Le nom scientiIique d'un tre vivant
reprend toujours son genre et son espece: homo sapiens et homo erectus Iont donc partie du
mme genre homo. Ce systeme, Ionde par Linne a la Iin du XVIII
e
siecle, permet de classer et
nommer tous les tres vivants.
4. L'EVOLUTION
Jusqu'au XIXe siecle, les scientiIiques etaient "Iixistes", c'est-a-dire qu'ils imaginaient
que les tre vivants avaient tous ete crees dans la Iorme qu'ils presentaient actuellement et
que les especes etaient Iixes et immuables. Il Iallut attendre la publication du livre de Darwin
"De l'origine des especes" en 1859, pour qu'emerge la theorie de l'evolution. Selon cette
theorie, la vie est apparue de Iaon tres primitive et a evolue au cours des eres geologiques,
selectionnant les individus qui etaient les mieux adaptes a leur environnement. Celui-ci etant
variable d'un endroit a l'autre et en Ionction du temps, il en a resulte une diversite et une
complexite grandissantes des tres vivants pour repondre aux contraintes du milieu et a la
lutte pour la survie. Fortement combattue a ses origines, cette theorie, bien que non
reproductible en laboratoire, est actuellement suIIisamment etayee par les traces de cette
evolution pour que seuls quelques revisionnistes la contestent encore actuellement.
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On peut donc esquisser une courte histoire de la vie, avec toutes les incertitudes et les
suppositions que cela implique.
Les geologues admettent que la Terre s'est Iormee il y a 4.500 millions d'annees. Les
Iossiles qui montrent des structures semblables a nos procaryotes les plus primitiIs datent de
3.500 millions d'annees. On peut donc supposer que les premiers tres vivants sont apparus
200 a 300 millions d'annees avant. L'origine de la vie reste un mystere. Pour Iaire une cellule,
il Iaut des molecules organiques. Celles-ci ont pu apparatre naturellement dans les conditions
initiales de la Terre, tres diIIerentes des conditions actuelles. Ensuite, il a Iallu qu'elles
s'organisent pour creer :
- une membrane qui permet des conditions internes et externes diIIerentes,
- de quoi stocker et reproduire l'inIormation acquise
- des outils chimiques pour Ionctionner.
Plusieurs hypotheses ont ete emises quant a l'ordre d'apparition de ces trois elements
mais aucune n'est actuellement suIIisamment etayee.
Il y a environ 2700 millions d'annees, des bacteries trouvent le moyen d'utiliser
l'energie inepuisable du soleil pour Iabriquer leur ATP. Le dechet de cette photosynthese est
l'oxygene, molecule extrmement dangereuse pour les Iragiles molecules de l'epoque:
beaucoup d'tre vivants moururent probablement de cette "pollution". Il y a 2000 millions
d'annees, la concentration en oxygene depasse le pourcent dans l'atmosphere. Les organismes
qui y ont survecu l'utilisent pour oxyder completement leur nourriture et en recuperer le
maximum d'energie chimique : c'est le debut de la respiration.
Durant cette periode, les cellules procaryotes evoluent par diIIerents mecanismes,
dont la phagocytose et l'endosymbiose et aboutissent a la Iormation des eucaryotes dont les
premiers Iossiles sont dates de 1500 millions d'annees.
Il Iaut encore environ 800 millions d'annees pour que l'on retrouve les premieres
traces d'animaux pluricellulaires (meduses, vers) et 100 millions d'annees supplementaires
pour qu'apparaissent les invertebres d'une part, les algues d'autre part.
Il y a environ 500 millions d'annees se produit un nouveau changement important : la
vie qui, jusque la s'etait conIinee au milieu aquatique, sort de l'eau et les premiers vegetaux
terrestres Iont leur apparition (bryophytes). Leur activite photosynthetique augmente encore
la concentration en oxygene (10) qui, sous Iorme d'ozone, arrte le bombardement U.V. de
la Terre et permet, il y a 400 millions d'annees, a la vie animale de sortir a son tour de l'eau
(premiers insectes) en mme temps que les vegetaux inventent les grandes tailles (premiers
Pteridophytes) et leurs corollaires (enracinement, systeme conducteur et de soutien).
Dans ce nouveau milieu tres precaire, tres variable, la diversiIication va s'accelerer
Iaisant apparatre de nouveaux groupes : en -350 (millions d'annees), les Iorts remplissent la
terre tandis qu'apparaissent les reptiles; en -300 les Gymnospermes inventent l'ovule; en -250
les dinosaures et la premiere graine; en -200 les mammiIeres; en -150 les angiospermes avec
les premieres Ileurs ainsi que les oiseaux. Les premiers primates voient le jour il y a un peu
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plus de 50 millions d'annees, les grand singes, 25 millions et l'homme, a peine 5 millions
tandis que du cte vegetal, les prairies prennent une extension considerable au detriment des
Iorts. Tous ces chiIIres ne sont evidemment que des approximations grossieres.
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Premire partie:
LA COMPOSITION CHIMIQUE DES ORGANISMES VIVANTS
Obfectifs .
-Distinguer les diIIerents groupes de composes biologiques du point de vue de leur structure
chimique et de leurs proprietes physico-chimiques
-Comprendre le concept d`hydrophobicite
-Matriser les bases chimiques du Ionctionnement des genes (structure de l`ADN, de l`ARN
et des proteines)
-Connatre la liste des composes essentiels pour l`homme
INTRODUCTION
Les tres vivants sont constitues des mmes atomes que les choses inanimees. Ils
repondent de la mme maniere aux mmes lois physiques et chimiques. Les mmes causes
produisent les mmes eIIets chez les tres vivants et chez les tres inanimes.
L'analyse chimique determine la nature et les proportions des atomes constitutiIs (ou
elements). Ces atomes s'assemblent en molecules relativement simples (monomres) qui
s'unissent entre elles pour Iormer des macromolecules de plus en plus complexes
(polymres). Beaucoup de ces molecules sont identiques ou Iort semblables chez tous les
tres vivants et constituent les composes principaux: sucres, proteines, acides nucleiques et
lipides.
Suite a la diversiIication du monde vivant, sont apparues des biomolecules que l'on ne
rencontre que dans certains tres vivants. Ce sont les produits secondaires du metabolisme.
Certaines plantes contiennent par exemple des composes uniques, particulierement
interessant en pharmacologie. Certaines de ces molecules sont encore utilisees actuellement,
ou ont servi de modeles pour la synthese des medicaments modernes.
Dans cette partie du cours, nous exposerons l'essentiel des donnees de chimie
biologique, indispensables a la comprehension des problemes que nous traiterons en
cytologie et en physiologie.
L'aspect "encyclopedique" de cette premiere partie ne doit pas eIIrayer l'etudiant non
Iamiliarise avec la chimie organique. Toutes les notions exposees seront concretisees
ulterieurement, et apparatront progressivement plus simples parce que remises dans leur
contexte naturel. L'etudiant est de plus invite a Iaire des liens avec ses cours de chimie
minerale et organique, qui l'aideront a bien comprendre ces notions.
13
RAPPEL: LES LIAISONS CHIMIQUES
_____________________________________________
LES LIAISONS FORTES
Les atomes tendent a realiser autour d'eux la conIiguration electronique du gaz rare le
plus proche dans le tableau periodique. Pour cela ils echangent ou ils mettent en commun
certains des electrons de leur couche peripherique, quand ils sont en contact avec d'autres
atomes.
Dans la liaison ionique, un atome perd un ou plusieurs electrons et se charge
positivement (cation), l'autre accepte cet (ces) electron(s) et se charge negativement (anion).
L'attraction entre ces deux charges unit les deux atomes. C'est ce type de liaison qui intervient
surtout dans les cristaux. Il y a Iormation d'un diple electrique et l'energie de liaison est de
l'ordre de 20 a 50 kJ. En presence d'eau, ces liaisons sont Iortement aIIaiblies.
Dans la liaison covalente, deux atomes mettent en commun des electrons qui tournent
autour des deux noyaux. Si les deux atomes sont identiques, il n'y a pas de diple. L'energie
de cette liaison, plus stable, est de l'ordre de 200 a 400 kJ.
Entre ces deux extrmes, toutes les variantes sont possibles, dependant de l'electronegativite
des deux atomes. La grande majorite des liaisons entre atomes des molecules organiques sont
du type covalent.
Le carbone peut se lier par 4 liaisons covalentes a 4 autres atomes. Ces liaisons sont
disposees en tetraedre et Iorment entre elles des angles de
+
109,5. Il peut aussi Iormer une
double liaison donnant une structure plane ou une triple liaison donnant une structure lineaire.
Les atomes de carbone se lient entre eux pour Iormer le squelette de toutes les molecules
organiques. La presence de doubles liaisons simples ou conjuguees, modiIie cette structure.
Le carbone et l'hydrogene Iorment ensemble des composes stables appeles
hydrocarbures (alcanes et alcenes). Ceux-ci sont apolaires, ne Iorment pas de liaisons
hydrogene et ne sont pas solubles dans l'eau. L'alcane le plus simple est le methane CH
4
. Le
radical -CH
3
est
appele methyle. Ces molecules sont peu utilisees dans le monde vivant, sauI
par certaines bacteries.
En plus du carbone et de l'hydrogene, la majorite des composes biochimiques
contiennent de l'oxygene, qui Iorment plusieurs combinaisons organiques appelees fonctions:
14
- le remplacement d'un H par un groupe hydroxyle -OH sur un
carbone donne un alcool: p. ex. le methanol CH
3
OH
Si l'oxygene est remplace par un atome de souIre, on parlera de thiol.
- le remplacement de 2 H par O donne un groupement carbonyle
CO. Selon que celui-ci se trouve en bout ou a l'interieur d'une chane, il
s'agit d'un aldhyde ou d'une ctone: p. ex. le Iormaldehyde: H
2
CO
- le remplacement de 3 H par O et -OH donne un acide
carboxylique, la Ionction -COOH s'appelant carboxyle. Dans l'eau, il peut
ceder un H
(comportement acide).
Si les 4 H du methane sont remplaces par de l'oxygene, on obtient du
CO
2
.
Deux alcools reagissent entre eux pour donner un ther par perte d'eau:
R-CH
2
-OH HO-CH
2
-R' R-CH
2
-O-CH
2
-R' H
2
O
Un alcool et un acide reagissent entre eux pour donner un ester par perte d'eau:
Le carbone et l'azote Iorment essentiellement des amines qui sont des bases qui peuvent
accepter un proton:
Une amine et un acide reagissent entre eux pour donner une amide par perte d'eau:
R-CH
2
-NH
2
HOOC-R' R-CH
2
-NH-CO-R' H
2
O
LES LIAISONS FAIBLES
Quand l'hydrogene est lie de Iaon covalente avec un atome electronegatiI (O, N), la
paire d'electrons mise en commun est delocalisee vers cet atome. La liaison se polarise et
produit une charge partielle sur H. Cette charge va attirer les atomes d'un autre
groupement montrant une charge -. Il en resulte des liaisons, appelees ponts hydrognes,
15
qui ne sont pas riches en energie (12 a 25 kJ) mais qui peuvent contribuer Iortement a la
stabilite des grosses molecules quand elles sont nombreuses.
Deux atomes eloignes l'un de l'autre ne s'inIluencent pas. Trop proches l'un de l'autre,
ils se repoussent violemment. Il existe une distance intermediaire ou se developpe entre eux
une Iorce d'attraction Iaible appelee Iorce de Van der Waals. Ces Iorces n'ont de
signiIication que dans le cas ou les surIaces de macromolecules s'accolent bien l'une a l'autre.
16
1. LES ATOMES
________________________
L'analyse chimique elementaire determine la nature et les proportions des atomes
rencontres dans les tres vivants. Dans tous les cas, cette analyse revele la presence constante
des onze atomes suivants :
C H O N P S Cl K Ca Na Mg.
Leur concentration varie selon le type et la Ionction des plantes et des cellules.
Quatre atomes C, H, O, N constituent l'essentiel (+ 96) des tres vivants.
Les 4 restants sont representes par les 7 autres atomes presents en proportions de
l'ordre du ainsi que par des elements que l'on trouve en quantite de l'ordre du ppm ou
moins: Fe, B, Cr, Cu, Fe, , Mn, Se, Si, Zn, V, Mo. Ces derniers constituent les
oligolments. Ainsi la nature vivante n'utilise qu'une trentaine des 90 atomes que l'on trouve
dans la crote terrestre. Certains des elements les plus abondants sur Terre, comme
l'aluminium et le silicium, presents dans de nombreuses roches, ne sont pas ou tres peu
utilises par les tres vivants.
La molecule la plus abondante dans tous les tres vivants est l'eau (H
2
O): 70 du
poids d'un homme, expliquant la preponderance de l'hydrogene (l'atome le plus Irequent en
nombre) et l'oxygene (l'atome representant la masse la plus importante). Les composes
organiques (constitues de C, O, H, N, S et P) comptent pour environ 25 du poids total. Les
autres composes se retrouvent sous Iorme d'ions (Na
, K
, Cl
-
, phosphates, carbonates,
sulIates, ammonium.) ou sous Iorme de complexes avec des molecules organiques (Fe, n,
Mg, Cu.).
17
2. L'EAU
_________________
L'eau represente chez l'homme 70 du poids total. Certains tres vivants aquatiques
peuvent contenir plus de 90 d'eau. L'eau (H
2
O) est un "monstre chimique" auquel nous
devons la vie. Par rapport aux autres hydrures comparables (H
2
S , NH
3
) et mme aux autres
liquides, l'eau possede un point de Iusion, un point d'ebullition, une chaleur de vaporisation,
une tension superIicielle, un diple electrique, une constante dielectrique beaucoup plus
eleves. Ces proprietes particulieres sont due a sa structure mme :
ou O et H possedent une charge partielle (
pour H et
-
pour O). Le diple electrique
puissant permet la realisation de ponts hydrogenes. L'angle que Iont les deux H (104,5)
permet la creation d'un reseau dense de ponts H (4 ponts H par molecule d'H
2
O, ce qui
explique la tres Iorte cohesion interne de l'eau (a 37, 15 des molecules d'eau sont encore
liees entre elles).
La Iorte cohesion de l'eau explique ses proprietes physiques: temperature d'ebullition,
tension superIicielle (sans ponts H, l'eau gelerait a -100 et bouillirait a -80). Sa chaleur
d'evaporation (2,3 kJg) l'empche de s'evaporer trop Iacilement: elle reste liquide. Sa chaleur
speciIique importante en Iait a la Iois un bon tampon thermique (homeothermie) et un bon
transmetteur de chaleur. La glace est un des rares solides moins dense que le liquide
correspondant, donc elle Ilotte. Sans cela, toute l'eau de la Terre serait amassee sous Iorme de
glace aux deux ples.
Le diple electrique de l'eau lui permet d'arracher les ions aux cristaux, donc de
solubiliser la plupart des sels et autres composes ioniques (charges). Par rapport aux autres
liquides, l'eau constitue donc un solvant extraordinaire. Sans eau, les molecules, les ions non
solubilises ne se rencontreraient jamais et il n'y aurait pas de reaction chimique donc pas de
vie. Elle permet le transport de nourriture et de dechets. La Iorte adhesion de l'eau aux autres
molecules polaires (appelee hydrophiles) lui permet de "coller" aux parois des cellules
vegetales ("eIIet buvard"). Cette propriete explique la montee de la seve dans les plantes et
les arbres.
18
Inversement, l'eau exclut les molecules avec lesquelles elle n'interagit pas: les
molecules apolaires, appelees aussi hydrophobes. Parmi ces composes, citons les
hydrocarbures et les huiles. Cette propriete est egalement Iondamentale pour les tres vivants.
!
+
L'eau se dissocie en ions hydroxyle basique (OH
-
) et
hydronium acide (H
3
O
n-2
-COOH
Citons les plus courants:
- acide palmitique n 16 C
16
H
32
O
2
(decouvert dans la noix palmiste)
- acide stearique n 18 C
18
H
36
O
2
b) les acides gras insaturs. Ils possedent une ou plusieurs doubles liaisons (-CC-)
Citons les derives insatures de l'acide stearique :
- acide oleique C
18
H
34
O
2
une double liaison
- acide linoleique C
18
H
32
O
2
deux doubles liaisons
- acide linolenique C
18
H
30
O
2
trois doubles liaisons
Les acides gras satures ont une Iorme lineaire (par annulation reciproque des angles
du carbone) tandis que les acides insatures Iorment une ligne brisee, ce qui va modiIier les
proprietes physiques des structures dans lesquels ils sont inclus.
Notons des a present que la quasi totalite des acides gras satures naturels possedent un
nombre pair d'atomes de carbone, en raison de leur mode de synthese (voir partie Physiologie
du cours).
La Ionction acide carboxylique possede un pKa d'environ 4, ce qui veut dire que cette
Ionction est ionisee a pH 7, sous Iorme de carboxylate -COO
-
.
27
3.2.2. Les lipides saponifiables
Ils proviennent de l'esteriIication d'un alcool et d'un acide gras:
R-COOH HO-CH
2
-R' -- R-CO-O-CH
2
-R' H
2
O
La reaction inverse (hydrolyse) est denommee saponiIication parce que l'hydrolyse
des graisses naturelles par les bases Iortes (NaOH, KOH...) donne les sels de ces acides gras
lesquels sont typiquement des savons.
Suivant la nature de l'alcool utilise, on distingue:
Les glycrides: l'alcool est un trialcool : le glycerol. Il peut des lors s'unir a 1, 2 ou 3
acides gras Iormant respectivement des mono- des di- ou triglycerides. Ces derniers
constituent la principale Iorme de stockage des lipides chez les plantes et les animaux.
Ils peuvent contenir a la Iois des acides gras satures et insatures. Les triglycerides
satures sont solides a temperature ambiante (graisses), alors que les triglycerides contenant
une majorite d'acides gras insatures sont liquides (huiles).
Les phospholipides resultent de l'esteriIication du glycerol par deux acides gras et par
l'acide phosphorique (H
3
PO
4
). Leur importance est enorme car ils constituent les membranes
biologiques qui delimitent les divers organites cellulaires.
Une seconde Ionction -OH du groupe phosphate est souvent esteriIiee par une amine (serine,
ethanolamine, ou choline), chargee positivement a pH physiologique. On parlera alors de
phosphatidylserine, phosphatidylethanolamine, ou phosphatidylcholine.
Citons aussi les sphingolipides. Dans ce cas, l'alcool est la sphingosine, alcool a
longue chane carbonee. Le plus simple est la sphingomyline. Ces lipides ont une structure
globale et des proprietes proches des phospholipides. Ils peuvent tre couples a des sucres.
Par exemple, les cerebrosides du systeme nerveux et du cerveau et les gangliosides (matiere
grise du cerveau). On attribue a ces composes des rles tres importants au niveau des
membranes externes des cellules animales.
28
Citons enIin les crides. Ce sont des esters Iormes d'un acide gras et d'un alcool
possedant tous les deux une tres longue chane carbonee (jusqu'a 30, 40 C) ; ils constituent la
cire d'abeille, le blanc de baleine, certaines secretions cutanees, les cires recouvrant les
Ieuilles, Ileurs ou Iruits.
3.2.3. Les strodes
Tous les sterols ou sterodes possedent 4 cycles caracteristiques. Ils diIIerent entre eux
par la longueur de la chane laterale, des doubles liaisons et des groupements chimiques
accroches au diIIerents cycles. Contrairement aux acides gras, que l'on retrouve dans tous les
tres vivants, chaque regne possede des sterodes diIIerents.
Le sterode le plus abondant chez les animaux est le cholesterol, un composant important des
membranes cellulaires. Le cholesterol est hydrophobe et insoluble dans l'eau. En derivent
notamment :
- les acides biliaires, charges negativement a pH neutre, qui ont des proprietes tensioactives et
sont necessaires a l'emulsiIication des graisses dans l'intestin;
Representation
schematique d'un
phospholipide.
29
- les androgenes (hormones sexuelles mles), comme la testosterone; et les hormones
sexuelles Iemelles: oestradiol et progesterone;
- la corticosterone, le cortisol et d'autres hormones;
- les vitamines D (calciIerol)
Chez les plantes, on ne retrouve pas de cholesterol, mais d'autres composes de la mme
Iamille, comme les phytosterols. Dans le regne des mycetes, l'ergosterol remplace le
cholesterol dans les membranes.
3.2.4 Proprits physico-chimiques
Si tous les lipides, simples ou complexes, ont en commun la propriete physique d'tre
solubles dans les solvants organiques apolaires, ils montrent aussi une autre particularite: ce
sont des molecules amphipathiques. En eIIet, une extremite, la tte, est hydrophile (le reste
du glycerol, riche en oxygene, l'endroit ou se Iait l'esteriIication) et l'autre partie, la queue, est
hydrophobe. Cette propriete est particulierement importante pour les lipides charges
(phospholipides, acides gras et acides biliaires sous Iorme de carboxylates): ces lipides ont
des proprietes tensioactives. En presence d'eau, les molecules vont se placer dans une
orientation particuliere de Iaon a exposer les parties chargees du cote de l'eau et a rassembler
les parties hydrophobes. Ces molecules agissent comme des detergents: ils sont capables de
solubiliser les graisses dans l'eau en Iormant un Iilm a l'interIace entre eau et graisse, ou
toutes les molecules sont orientees de la mme Iaon (tte hydrophile cte eau, et queues
hydrophobes cte graisse).
Les matieres grasses peuvent tre solides (graisses et cires sur certaines parois
cellulaires) ou liquides (gouttelettes d'huiles ou globules lipidiques dans le cytoplasme).
A poids egal, les matieres grasses sont deux Iois plus energetiques que les glucides.
Elles constituent donc des produits de reserve des animaux qui doivent les transporter. Mais
elles s'accumulent aussi chez les plantes dans le Iruit (olive) ou dans certaines graines dites
"oleagineuses". Au cours de la maturation des graines, les lipides sont mis en reserve. Lors de
la germination, l'embryon va utiliser, pour sa croissance, les produits de la decomposition de
ces graisses.
3.3. LES PROTIDES
Les protides sont les constituants les plus essentiels et les plus complexes de la
matiere vivante.
Ce sont donc des corps construits a partir de 6 atomes : C (+54), O (+ 22), N
(+16) et H (+8), ainsi que S (0,2-2) et P (0,5).
30
Le poids moleculaire des protides est Iort variable et toujours tres eleve (lactalbumine:
17 400; hemoglobine : 64 500). On peut classer les protides en trois categories, integrant des
corps de complexite croissante :
les acides amines,
les peptides et polypeptides
les heteroproteines.
3.3.1. Les acides amins
Ils repondent a la Iormule generale suivante :
NH2 - CH - COOH
R
Comme pour les oses, le carbone lie a l'amine et au groupement R est asymetrique et il
existe deux series d'acides amines, L ou D. Les acides amines naturels sont de la serie L.
Ce sont des composes amphoteres qui se comportent soit comme une base en milieu
acide, grce a la Ionction amine (-NH
2
devient - NH
3
, K
, H
3
O
, Ca
, Na
, Mn
, Fe
...
Au microscope electronique, la mitochondrie se montre limitee exterieurement par
deux membranes de type unitaire separees par un espace clair d'environ 10 nm (l'espace
intermembranaire) delimitant un espace interne : le stroma ou matrice.
La membrane externe (membrane unitaire) est unie. Elle contient environ autant de
proteines que de phospholipides. Elle est permeable a presque toutes les petites molecules
non chargees (grce a diIIerents types de transporteurs proteiques).
La membrane interne s'invagine vers l'interieur et presente des crtes (ou des tubules)
disposees plus ou moins perpendiculairement a la surIace de l'organite: les "crtes
mitochondriales". Celles-ci accroissent enormement la surIace de la membrane interne de la
mitochondrie. Le nombre de crtes varie selon l'activite physiologique de la cellule. Dans les
mitochondries jeunes, les crtes sont peu nombreuses et peu developpees; elles se multiplient
et s'agrandissent au Iur et a mesure de l'accroissement de l'activite cellulaire et regressent
lorsque la cellule vieillit.
La membrane interne de la mitochondrie constitue un exemple typique de membrane
asymetrique. Les Iaces internes des crtes mitochondriales, elles seules, sont tapissees de
spheres de 9 nm de portees par un pedoncule: les "facteurs de couplage" 2 000 a 4 000
unites par m
2
soit 10
4
a 10
5
par mitochondrie. Chacune d'entre elles est constituee d'un
assemblage structure de proteines responsables de la synthese de l'ATP. De ce Iait, on les
appelle aussi ATPases. La membrane interne contient + 80 de proteines et + 20 de
57
phospholipides. Elle est impermeable a presque toutes les molecules et necessite
obligatoirement la participation de transporteurs actiIs.
La membrane interne et la membrane externe ont des compositions chimiques
diIIerentes. Elles diIIerent surtout par la nature des enzymes qu'elles contiennent. Elles jouent
donc des rles diIIerents dans les reactions du metabolisme. Sans entrer ici dans les details,
notons des a present que la membrane interne possede plusieurs Ionctions tres importantes:
elle est le siege de la "chane respiratoire", voie metabolique qui oxyde les coenzymes NADH
ou FADH
2
et recupere l'energie sous Iorme d'ATP dont elle est la source essentielle. Elle
possede en plus plusieurs transporteurs transmembranaires contrlant tres exactement les
entrees et les sorties des composants de la matrice mitochondriale.
Le stroma ou matrice est un gel contenant 50 de proteines. Il apparat comme une
substance claire, homogene, renIermant des ribosomes (des mito-ribosomes, plus legers que
ceux du cytoplasme mais identiques a ceux des bacteries) localises surtout dans la peripherie
de l'organite. Il contient en outre des acides nucleiques : chez les animaux pluricellulaires,
l'ADN mitochondrial est une double helice annulaire (semblable a l'ADN des bacteries);
l'anneau Iormant une helice secondaire de taille variable (16 569 paires de bases chez
l'homme). Par contre chez certains eucaryotes unicellulaires et chez les plantes, l'ADN
mitochondrial est lineaire, parIois avec des extremites simples. La duplication de l'ADN
mitochondrial ne s'eIIectue pas en mme temps que celle de l'ADN du noyau.
Le stroma Iournit la membrane interne en coenzymes reduits grce a plusieurs chanes
metaboliques dont les principales sont la - oxydation des lipides, le cycle de KREBS.
Sa richesse chimique donne a la mitochondrie une importance considerable. C'est a
son niveau que sont oxydees les substances et que se Iorme l'ATP (ADP Pi energie --
ATP). Cette synthese conIere a la mitochondrie un rle de centrale energetique. C'est la
raison pour laquelle elles sont localisees a proximite des structures consommatrices d'energie
(par exemple le long des myoIibrilles responsables du mouvement chez les animaux).
4.6. LES CHLOROPLASTES
Les chloroplastes sont des elements cellulaires propres aux vegetaux (avec la vacuole
et la paroi). Le microscope photonique les montre comme des petits granules lenticulaires de
3 a 10 m de et de 1 a 4 m d'epaisseur. Ils sont donc generalement plus grands que les
mitochondries. Leur nombre par cellule est variable et caracteristique de l'espece et du tissu
examine. On en compte environ 50 par cellule, soit 500 000 par mm
2
de Ieuille.
La chlorophylle, responsable de la couleur verte des plantes y est concentree dans des
petits granules lenticulaires de 0,5 a 2 m de et de 0,2 m d'epaisseur, plus ou moins
58
regulierement disposes, denommes grana et qui donnent au chloroplaste une structure
granulaire. L'ensemble des regions claires, non pigmentees, separant les grana est denomme
stroma ou matrix.
Au microscope electronique, le chloroplaste se montre limite par deux membranes du
type unitaire separees par un espace clair d'environ 10 nm (l'espace intermembranaire)
entourant un espace interne : le stroma ou matrix, comme dans les mitochondries.
Dans le stroma, on trouve des ensembles de membranes paralleles au grand axe et qui
Iorment des sacs Iermes, les thylakodes, independants de l'enveloppe. Il y en a de deux
types: les thylakodes granaires, en Iorme de disque, empiles les uns sur les autres pour
Iormer les grana visibles au microscope optique, et les thylakodes intergranaires ou
lamelles stromatiques ou du stroma qui s'etendent d'un granum a l'autre ainsi que dans le
stroma. Un granum est un empilement cylindrique de sacs ovodes, plats, de 0,3 a 0,6 m de
autour duquel s'enroulent en helice plusieurs lamelles stromatiques regulierement espacees.
Les cavites des lamelles et celles des disques sont en communication si bien que l'ensemble
Iorme une cavite unique totalement independante de l'enveloppe externe. Il y a donc dans le
chloroplaste trois compartiments embotes les uns dans les autres: l'espace intermembranaire,
le stroma, l'espace intrathylakodien, separes par des membranes qui ont des compositions,
des permeabilites et des rles diIIerents. Il y a de 40 a 70 grana par chloroplaste, contenant
chacun de 2 a 60 (moyenne 20) thylakodes.
Les deux membranes de l'enveloppe sont lisses.
Comme dans la mitochondrie, l'externe est permeable tandis que l'interne ne laisse
passer librement que des molecules du type O
2
, CO
2
et necessite des transporteurs specialises
pour les autres molecules.
La membrane unitaire du thylakode est riche en lipides insatures lui conIerant une
tres grande Iluidite. Elle montre des protuberances qui emergent de la couche lipidique, a
savoir :
1) des unites carrees de 15 nm de cte, transmembranaires. Ce sont les complexes
proteiniques du photosysteme deux (PS II). Ils jouent un rle de capteurs de photons
(energie solaire). Ils contiennent environ 300 molecules de chlorophylle et environ 50 de
pigments carotenodes implantees par leur ple hydrophobe dans la couche lipidique de
la membrane unitaire. Ces unites carrees sont associees en un reseau serre, surtout dans
les zones d'empilement des thylakodes.
2) des unites plus petites de 8 nm de , transmembranaires aussi, ayant un rle
physiologique semblable. Elles constituent les unites du PS I.
3) des spheres pedicellees (10 nm de ) exclusivement situees sur la Iace stromatique.
Ce sont les Iacteurs de couplage chlorophylliens qui servent a la synthese d'ATP (tout
comme dans la mitochondrie) et dont le Ionctionnement sera egalement etudie en
physiologie;
59
La repartition de ces trois elements est variable sur la membrane: les PS I se situent
partout, les PS II uniquement la ou les thylakodes s'accolent, les Iacteur de couplage, la ou il
n'y a pas de PS II.
Le stroma incolore, montre une inIrastructure voisine de celle des mitochondries. Il
possede en plus des gouttelettes lipidiques et quelques grains d'amidon. On y a mis aussi en
evidence des ribosomes a l'etat libre.
L'analyse chimique des chloroplastes donne en moyenne les resultats suivants :
- eau : 50 ,
- proteines : 25 (proteines de structure et enzymes),
- lipides : 15 (gouttelettes et membranes),
- glucides : en quantite variable selon l'ge physiologique de la plante,
- chlorophylle : 3 ,
- carotenodes : 2 (carotene, lycopene et xanthophylle),
- ARN: 1 , ADN: 0,5 : d' aspect voisin de celui de la mitochondrie,
- ions mineraux : Mg, Fe, Cu, Mn, n,...,
- coenzymes accepteurs d'hydrogene : NADP, cytochromes I et b
6
...
Le rle des chloroplastes est essentiel a la survie de la Terre: les thylakodes sont
specialises dans la phase claire de la photosynthese qui transIorme l'energie lumineuse solaire
en energie chimique sous Iorme d'ATP et de NADPH. Le stroma utilise cette energie pour
diverses syntheses: synthese des glucides, des acides gras, reduction des nitrates et sulIates,
synthese des acides amines. Les produits sont mis a la disposition non seulement du reste de
la plante, mais de l'ensemble des autres tres vivants. Ils sont donc les producteurs primaires
de toutes les pyramides nutritionnelles.
AUTRES PLASTES
Il existe d'autres types d'organites semblables aux chloroplastes dans les cellules
vegetales, appeles plastes. Les plastes de la cellule adulte presentent divers aspects selon la
nature des substances qu'ils elaborent ou contiennent. Outre les chloroplastes, on distingue :
- les amyloplastes (et leucoplastes) qui elaborent et stockent l'amidon ;
- les chromoplastes qui renIerment des pigments carotenodes: la xanthophylle (jaune), le
carotene (rouge-orange) et le lycopene (rouge). Ce sont les chromoplastes qui sont
responsables de la coloration particuliere de certaines Ileurs (Renoncule, Souci), de certaines
racines (Carotte), de certains Iruits (Tomate) et des diverses teintes des Ieuilles en automne.
- les proteoplastes et les oleoplastes qui accumulent des proteines et des lipides (qui sont
Iabriques ailleurs dans la cellule).
Tous les plastes possedent une double membrane, et des acides nucleiques, comme les
chloroplastes et les mitochondries (qui ne sont cependant pas considerees comme des
plastes). Les plastes proviennent tous de proplastes (que l'on trouve dans le zygote) ou
60
d'autres plastes, par partition. Des interconversions entre plastes sont possibles. Un
chloroplaste peut par exemple se transIormer en chromoplaste.
Il existe une tres etroite collaboration entre l'ADN des plastes et celui du noyau car sa
taille est suIIisante pour coder les ARNt et ARNr necessaires, mais ne peut coder qu'un tiers
des proteines presentes.
Cette interdependance est a mettre en relation avec le probleme de l'origine des
plastes. Selon l'hypothese de MERESCHKOWSKI (1905), les plastes seraient des ex-
procaryotes vivant en symbiose avec une cellule eucaryote incapable de photosynthetiser.
Cette hypothese ne s'est developpee que vers les annees 60, quand des arguments
biochimiques lui donnerent du poids. On retrouve la mme Iorme circulaire de l'ADN,
l'absence de nucleosomes, la similitude des ribosomes, le mme mode de transcription, une
sensibilise aux mmes inhibiteurs de synthese chez les plastes et les bacteries. Mais il ne
s'agirait pas d'une simple relation de symbiose puisque l'ADN des plastes est 20 a 30 Iois plus
petit que celui des bacteries, nettement insuIIisant pour assurer son autonomie; qu'il possede
des introns, caracteristiques de l'ADN des eucaryotes et qu'il y a eu des echanges entre le
noyau et le plaste puisqu'on y retrouve des sequences communes. Il Iaut donc parler de co-
evolution plus que de symbiose.
Des considerations identiques amenent a penser que les mitochondries seraient aussi
des bacteries oxydantes ayant co-evolue avec des cellules eucaryotes Iermentantes.
61
5. LE NOYAU
Le noyau est l'element intracellulaire decouvert en premier lieu par R. BROWN en
1835, dans les cellules des orchidees. Son rle est primordial dans les processus hereditaires
ainsi que dans le contrle de la synthese des proteines. Il subit de proIondes transIormations
cycliques. Nous considerons ici le noyau en interphase, dit "au repos", ou "quiescent", quand
la cellule n'est pas en division. En realite, cette periode correspond a une periode d'intense
metabolisme.
5.1. NOMBRE, FORME, DIMENSION, COMPOSITION CHIMIQUE
1 Nombre : Rappelons d'abord que les organismes primitiIs, les Procaryotes ne possedent
pas de noyau "vrai", mais simplement une masse d'ADN baignant directement dans leur
cytoplasme. Le noyau des Eucaryotes constitue une acquisition de l'evolution.
Chez les Eucaryotes, chaque cellule possede en general, un noyau. Certains eucaryotes
inIerieurs et certains tissus en possedent deux (cellules a dicaryons des champignons
superieurs, certaines cellules du Ioie ou du cartilage) ou mme plusieurs (structure
articulaire de certaines algues, des Iibres musculaires striees, structure symplastique de
certains champignons...). EnIin, les cellules depourvues de noyau (globules rouges,
plaquettes) sont d'anciennes cellules nucleees chez lesquelles le noyau, devenu inutile, a
disparu lors de la diIIerenciation (specialisation) de la cellule.
2 Forme : En general, le noyau est de Iorme spherique ou ovode mais peut devenir,
ellipsode, IusiIorme ou irregulier (comme dans certains globules blancs), suivant la
Iorme et la Ionction de la cellule elle-mme.
3 Dimension : La dimension des noyaux est Iort variable et proportionnelle a la taille des
cellules. Le diametre varie de 1 a 2 m (levures) a plus de 450 m (oospheres de certains
Gymnospermes). Chez les vegetaux et les animaux superieurs, il varie de 5 a 15 m. De
plus, la taille du noyau varie au cours du cycle cellulaire.
4 Composition chimique (a titre d'inIormation): en du poids sec, l'analyse chimique du
noyau revele des proteines (80), des phospholipides (1), de l'ADN (10), de l'ARN
( 4), des ions (Ca
, Mg
, Na
...).
L'ADN et l'ARN sont colores intensement par l'hematoxyline et d'autres colorants utilises
en cytologie et en histologie, qui donnent une couleur particuliere au noyau.
62
5.2. L'ENVELOPPE NUCLEAIRE
Au microscope optique, elle apparat comme une mince pellicule continue separant le
noyau du cytoplasme.
Le microscope electronique montre que l'enveloppe nucleaire est constituee de deux
membranes de type unitaire. Elles sont separees par l'espace perinucleaire, espace clair,
variable en epaisseur (de 10 a 100 nm).
L'enveloppe nucleaire est caracterisee par sa porosite, a l'oppose des membranes des
organites qui sont continues. Elle est percee de pores dont le nombre varie, mais qui
augmente avec l'activite de la cellule (environ 40 a 80 par m
2
, leur surIace totale peut
atteindre 25 de l'enveloppe nucleaire). Les pores sont de reelles ouvertures dans la
membrane, qui mettent en contact direct le cytoplasme et le nucleoplasme. Ils sont constitues
d'un canal aqueux d'environ 10 nm de , entoure sur chacune des Iaces de l'enveloppe d'un
complexe protinique du pore, constitue de 8 sous-unites d'environ 20 nm, disposees en
octogone. Les pores peuvent s'ouvrir et se Iermer, pour laisser passer des particules plus
larges que l'oriIice. Au niveau des complexes du pore, les membranes externe et interne sont
en contact, bien qu'elles restent chimiquement distinctes.
La membrane externe est en relation directe avec le RE dont elle a d'ailleurs une
composition proche. Sa Iace externe est tres souvent recouverte de ribosomes. La membrane
interne est recouverte sur sa Iace interne d'une epaisse couche de proteines, la lamina (+60
nm chez les animaux) qui aurait le double rle de garder la Iorme generale du noyau et
d'accrocher la chromatine deployee a certains points Iixes. L'espace perinucleaire est en
continuite avec les cavites du RE.
Il semble donc que la membrane nucleaire ne soit qu'une portion specialisee du RE
destinee a conIiner en un endroit du cytoplasme les molecules d'ADN deployees aIin d'eviter
qu'elles ne s'entremlent et ne se cassent, tout en maintenant la possibilite des echanges
nombreux et indispensables de grosses molecules avec le cytoplasme (ARN, ribosomes,
enzymes...).
5.3 LES NUCLEOLES
Le noyau "au repos" contient un ou plusieurs nucleoles. Ils sont presents durant
l'interphase et disparaissent au cours de la mitose.
Au microscope photonique, les nucleoles apparaissent comme des globules tres
reIringents, de Iorme spherique ou ovale, de 1 a 5 m de . Leur taille est d'autant plus
grande que l'activite cellulaire est grande. Ils ont l'aspect d'une masse dense.
Le microscope electronique montre que le nucleole ne possede pas de membrane
propre. Il presente l'aspect d'une eponge. On peut y observer deux zones diIIerentes : une
zone fibrillaire et une zone granulaire de repartition tres variable. La zone Iibrillaire est
63
constituee de nombreux Iilaments d'ADN et de milliers de Iibrilles (de 20 a 40 nm de long et
de 4 a 8 nm de ) disposees perpendiculairement a ces ADN, et constituees des molecules
d'ARN en cours de synthese. La zone granulaire est Iormee de ribonucleoproteines
semblables, en dimension et en densite, aux ribosomes du cytoplasme.
Le rle du nucleole a ete demontre par l'experience suivante: il existe une souche
mutante de crapaud Xenopus laevis qui, au lieu de posseder deux nucleoles par noyau, n'en
possede qu'un seul. Si on croise deux de ces mutants, les embryons obtenus constituent une
population dont 25 possedent des noyaux a deux nucleoles, 50 des noyaux a un nucleole,
25 des noyaux sont anucleoles. Ces derniers meurent quatre jours apres l'eclosion, et on
peut constater par marquage radioactiI a l'uridine tritiee qu'ils ne synthetisent que l'ARN
m
et
l'ARN
t
. Ils ont perdu la possibilite de Iabriquer l'ARN ribosomial et ne peuvent utiliser durant
leur courte vie pour la synthese de leurs proteines, que les ribosomes provenant de l'oeuI.
Le nucleole est donc l'endroit ou se synthetisent les milliers de ribosomes de la
cellule: l'inIormation est contenue a plusieurs endroits sur la chromatine des chromosomes
organisateurs nucleolaires. La zone Iibrillaire est constituee de ces morceaux d'ADN sur
lesquels se synthetisent les molecules d'ARNr. Ceux-ci sont alors assembles sur place, grce
a des proteines en provenance de l'exterieur via les pores, en preribosomes (zone granulaire),
acheves et transitent alors vers le cytoplasme, par les mmes pores, pour y Ionctionner. Il
n'est donc pas etonnant que le nucleole disparaisse pendant la mitose: l'ADN etant incorpore
aux chromosomes, aucun preribosome nouveau n'est assemble et ceux qui sont termines
sortent du noyau. De mme en Iin de mitose, l'ADN redevenant disponible, les nucleoles
apparaissent toujours aux mmes endroits. Il y a ainsi 10 organisateurs nucleolaires chez
l'homme, donc 10 petits nucleoles en debut d'interphase, qui Iusionnent tres rapidement en un
seul.
La composition chimique des nucleoles est la suivante:.
a) des proteines (90 du poids sec) : complexes enzymatiques necessaires a la synthese
d'ARN, histones liees a l'ADN, proteines des ribosomes.
b) de l'ARNr en concentration Iort importante (5 a 8 ), reparti dans les zones Iibrillaires et
granulaires.
c) de l'ADN, localise au coeur des zones Iibrillaires, comme deja signale plus haut.
5.4 LA CHROMATINE
La chromatine est un complexe biochimique Iorme de nucleoproteines a ADN.
Nous avons vu precedemment, la structure proposee pour la nucleoproteine a ADN.
Celle-ci se presente sous la Iorme d'un collier de nucleosomes Iormes chaque Iois de 2x4
histones, entoures par une molecule d'ADN. La chromatine est un stade de condensation plus
eleve: les nucleosomes s'enroulent selon une super-helice d'un de 25 a 30 nm et d'un pas de
64
10 nm. On suppose qu'il y a 6 a 10 nucleosomes par tour de spire et que l'histone H
1
ainsi que
les ions calcium stabiliseraient cet ediIice moleculaire.
Lors de la division nucleaire, la chromatine subit des condensations supplementaires
qui conduisent a la Iorme compacte du chromosome.
La chromatine apparat sous Iorme dispersee appelee euchromatine et sous Iorme
condensee appelee htrochromatine. L'euchromatine est assimilee a la Iraction "active" de
l'ADN qui code les proteines necessaires a la cellule a ce moment la. L'heterochromatine,
plus condensee, se colore plus Iacilement. Elle est generalement inactive au point de vue
genetique et est constituee en partie de sequences repetitives dont on ne connat pas la
Ionction exacte.
Une Iorme particuliere d'heterochromatine est la chromatine sexuelle ou corpuscule de
BARR visible dans l'espece humaine. Elle se presente sous Iorme d'une lentille biconvexe de
+1m de accolee au nucleole ou a la membrane nucleaire. Elle provient de la condensation
et de l'inactivation d'un des deux chromosomes X chez la Iemme normale. Son observation
est tres utile pour la conIirmation d'anomalies hereditaires. L'homme normal, ne possedant
qu'un seul chromosome X, ne montre pas cette chromatine sexuelle.
Rappelons enIin que la chromatine s'accroche regulierement a la membrane nucleaire
au niveau des proteines de la lamina.
5.5 LE NUCLEOPLASME
Le nucleoplasme ou suc nucleaire ou matrice nucleaire est la substance Iluide et
homogene qui remplit le reste de la cavite nucleaire. Le microscope electronique montre
parIois de tres Iins granules ou Iilaments dont on ne connat actuellement ni la constitution
chimique, ni la structure physique.
Le nucleoplasme contient la machinerie enzymatique et les materiaux (nucleotides
libres, importes du cytoplasme) pour Iabriquer les acides nucleiques et les assembler en
nucleoproteines.
5.6 LA FONCTION DU NOYAU
Le noyau contrle le Ionctionnement et la morphologie de la cellule. Une ancienne
experience l'avait deja montre :
Par micromanipulation on peut sectionner une amibe: un petit Iragment contenant le noyau,
l'autre etant anuclee. Le Iragment nuclee continue a vivre. Il peut s'accrotre et se multiplier.
Le Iragment anuclee arrte quasi instantanement ses mouvements; il peut encore ingerer
quelques proies, mais elles ne sont pas assimilees; la synthese des proteines s'arrte, puis la
65
respiration; il meurt apres quelques jours, sans avoir pu s'accrotre. Si on greIIe un noyau au
cytoplasme anuclee, le Iragment reprend son activite.
Le noyau est en quelque sorte l'ordinateur central de la cellule: c'est la, sous Iorme
d'ADN, qu'est stockee toute l'inIormation genetique caracteristique de l'organisme. Une partie
de cet ADN est recopiee (transcrite) dans le noyau en ARN qui permettront la synthese des
proteines. Cette synthese est strictement contrlee au niveau du noyau grce a de nombreuses
inIormations qui sont transmises au noyau par l'intermediaire de proteines regulatrices qui
passent par les pores.
6. PAROI ET MATRICE EXTRACELLULAIRE
La membrane plasmique est relativement Iragile. Dans de nombreux types cellulaires,
elle est doublee a l'exterieur d'une couche protectrice dont la composition varie
considerablement d'un regne a l'autre.
Les cellules vegetales et les bacteries possedent une couche protectrice continue
epaisse, autour de toutes les cellules. Cette couche est appelee la paroi. Sa composition et sa
structure sont tres diIIerentes chez les vegetaux (polysaccharides) et chez les bacteries
(peptidoglycans). Certains protistes et les mycetes possedent egalement une paroi.
Les cellules animales ne possedent pas de paroi. La membrane plasmique de certaines
cellules n'est separee du milieu extracellulaire ou de la cellule voisine que par le glycocalyx,
cette mince couche de sucres lies de Iaon covalente aux lipides et proteines membranaires.
Les cellules qui bordent les cavites et les vaisseaux (epithelium) sont directement accolees les
unes aux autres. Un gel appele matrice extracellulaire collent entre elles les cellules a
l'interieur des tissus. Cette matrice extracellulaire est composees de glycoproteines
(collagene) et de proteoglycans (polysaccharides couples a des proteines).
La structure de la matrice extracellulaire autorise les cellules animales a migrer au
sein de l'organisme, ce qui est exclus dans les tres vivants dotes de parois rigides, qui
emprisonnent les cellules.
LA PAROI VEGETALE
La paroi primaire
Quand une cellule vegetale se divise, les deux nouvelles cellules sont d'abord separees
par un Iine couche de pectine (polyholoside) denommee lamelle mitoyenne. Puis le
cytoplasme de ces cellules contigus synthetise rapidement, chacune pour son propre compte,
66
une mince pellicule de cellulose qui se depose sur la lamelle mitoyenne. L'ensemble de cette
triple couche est denomme paroi primaire.
Lorsque la cellule grandit, la paroi primaire subit un etirement considerable. La
rupture est evitee car le cytoplasme synthetise de nouvelles molecules qui s'incorporent a la
paroi existante. En outre, au cours de l'etirement, la plasticite de la paroi est Iavorisee par une
hormone denommee auxine.
La structure de la paroi ressemble a celle d'un plastique arme: des Iibrilles de cellulose
sont enrobees dans une matrice amorphe.
L'armature est Iormee de cellulose. La cellulose est un polymere diIIicilement
hydrolysable pouvant contenir jusqu'a plusieurs dizaines de milliers de glucoses lies en 1-
4, ce qui, contrairement a l'amidon, lui donne une Iorme en ruban plat. Plusieurs molecules
de cellulose s'associent lateralement par de multiples ponts hydrogene pour Iormer des
microIibrilles. La cellulose est synthetisee au niveau du plasmalemme et se depose en un
Ieutrage lche, non ordonne, parallelement a la surIace de la cellule.
La matrice amorphe, qui "colle" le tout, est composee de pectines, polymeres en
zigzag, d'hemicelluloses, polymeres ramiIies de glucides de nature variable et de proteo-
glucanes. Ces elements sont synthetises dans le cytoplasme et deverses a l'exterieur par les
vesicules golgiennes. Ces polymeres sont assez Iacilement hydrolysables.
La paroi secondaire
Lorsque la cellule a atteint sa taille deIinitive, le cytoplasme des cellules de certains
tissus elabore de nouvelles molecules de cellulose qui se deposent en couches successives sur
chaque Iace de la paroi primaire (phenomene d'apposition). L'ensemble de ces couches
constitue la paroi secondaire. Son epaisseur est tres variable et peut mme remplir la quasi
totalite de la cavite cellulaire.
Chaque couche est Iormee d'un reseau de Iibrilles de cellulose disposees parallelement
a la surIace de la cellule et parallelement entre elles dans une mme couche. Mais d'une
couche a l'autre, l'orientation est diIIerente, ce qui donne a l'ensemble de la paroi secondaire
l'aspect et la solidite du contre-plaque tout en lui gardant une certaine elasticite.
Les modifications secondaires de la paroi cellulaire
La consolidation des parois
Les parois des cellules specialisees dans le soutien (Iibres, sclerites...) vont s'impregner de
lignine. La lignine est un polymere (polyphenols) reticule. Elle est inextensible et
pratiquement non hydrolysable. La ligniIication commence aux endroits les plus Iragiles,
c'est-a-dire aux angles des cellules, au niveau de la couche pectique, puis se propage a
67
l'ensemble de la paroi primaire, puis des parois secondaires contigus. Elle solidarise
l'ensemble des cellules ligniIiees en un bloc solide qui devient du bois.
Certaines parois vont s'impregner de silice ou de calcaire (SiO
2
ou CaCO
3
) surtout au
niveau de l'epiderme (Iougeres).
L'impermabilisation des parois
La cutine, polymere hydrophobe en reseau, chimiquement proche des lipides, impregne la
paroi externe des epidermes, les rend plus ou moins impermeables selon sa densite et
s'oppose ainsi a une trop grande deperdition d'eau par la plante ainsi qu'aux agresseurs
vehicules par le vent (poussieres abrasives, microorganismes).
La cire, Iormee d'esters d'alcools et d'acides a poids moleculaire eleve, Iorme une
couche impermeable s'appliquant sur l'epiderme, cutinise ou non (ex. : la "peau" de certains
Iruits, les Ieuilles de plantes "grasses").
La suberine, substance proche de la cutine, se depose a l'interieur des parois et
impermeabilise l'endoderme des racines et les tissus protecteurs secondaires (liege).
La dissociation des parois
Dans certaines circonstances (chute des Ieuilles, maturation des Iruits), les composes
hydrolysables de la matrice (pectines et hemicelluloses) peuvent tre depolymerises
enzymatiquement. Les cellules deviennent alors partiellement ou totalement libres les unes
par rapport aux autres. C'est entre autres ce que l'on observe dans un Iruit "juteux".
Les roles de la paroi
Les vegetaux ayant opte pour une strategie evolutive extensive, le rle de la paroi est
d'abord un rle de soutien : assurer la rigidite de l'ensemble de la structure. La paroi
secondaire repond deja en partie a cet objectiI. D'autres modiIications secondaires
(ligniIication, mineralisation) vont accrotre cette eIIicacite.
Le second rle essentiel de la paroi vegetale est la protection, specialement pour les
parois externes des cellules epidermiques. La aussi des modiIications secondaires (imper-
meabilisation) vont realiser cet objectiI.
Mais a l'interieur d'un tissu, le volume compris entre les membranes plasmiques de
deux cellules voisines, qui contient la paroi cellulaire, a encore d'autres rles. Il contient
beaucoup d'eau, jusque 70. Il est donc le lieu de transit de nombreuses molecules, dont les
sels mineraux, les glucides, les hormones et certaines molecules de deIense. La paroi d'une
cellule ressemble donc plus a un buvard ou un essuie-tout qu'a une Ieuille de papier glace.
68
Les espaces intercellulaires
Dans un tissu vegetal jeune toutes les cellules sont bien accolees les unes aux autres et
ne laissent entre elles aucun espace libre. Plus tard, au cours de l'accroissement cellulaire, la
pression vacuolaire interne tend a arrondir les angles des cellules. La lamelle mitoyenne
pectique est hydrolysee et la paroi primaire propre a chaque cellule s'arrondit aux angles des
cellules, laissant un espace libre intercellulaire denomme mat. Les lacunes sont des cavites
intercellulaires plus grandes que les meats et proviennent de la conIluence de deux ou
plusieurs meats contigus ou de la destruction, de la lyse, de cellules au sein d'un tissu. Les
lacunes et les meats Iorment un reseau continu, intercellulaire et constituent l'atmosphere
interne de la plante. C'est par eux que circulent les gaz (O
2
,CO
2
,N
2
) dans la plante.
7. LES COMMUNICATIONS ENTRE CELLULES
Les communications entre cellules vgtales :
ponctuations et plasmodesmes
Les couches secondaires de cellulose ne se deposent pas uniIormement sur les parois
primaires. Elles y dessinent parIois des motiIs precis (vaisseaux anneles, spirales,
collenchyme angulaire, etc...).
De plus, mme quand l'epaississement semble continu, on constate que les parois
cellulaires sont, en realite, percees de petits oriIices denommes ponctuations. Celles-ci
proviennent de ce que les couches successives d'apposition ont toutes respecte certaines
plages, Iormant ainsi, vues de proIil, de petits canaux qui debouchent dans la cavite cellulaire
mais qui apparaissent Iermes au niveau de la paroi primaire. Vus de Iace, ces canaux
apparaissent comme des petits points, d'ou leur nom de ponctuations.
Generalement, les ponctuations sont doubles. L'apposition des couches secondaires
dans deux cellules contigus se deroule en respectant les mmes plages de sorte que les
cavites cellulaires ne sont separees en ces endroits que par la paroi primaire commune, de tres
Iaible epaisseur.
Au Iond de chaque ponctuation, la paroi primaire est percee d'une multitude de canalicules
tres Iins denommes plasmodesmes. Ceux-ci sont des manchons cylindriques limites par la
membrane cellulaire des deux cellules contigus. Dans le lumen etroit de chaque canalicule
passent un ou plusieurs Iilaments tres Iins qui sont en contact avec les diverticules du RE. Il y
a donc continuite de la membrane plasmique et du RE de cellule a cellule. Ces observations
sont importantes car les tissus de plantes superieures ne constituent plus alors un ensemble de
cellules independantes et autonomes, mais bien une association de cellules communiquant
entre elles.
69
8. LA DIVISION CELLULAIRE
L'axiome de VIRCHOW (1845) "Omnis cellula e cellula" ou "toute cellule provient
d'une cellule" est toujours considere comme valable. Tout organisme pluricellulaire est issu
de divisions repetees d'une seule cellule initiale : la cellule-oeuI. Chaque division doit assurer
la repartition reguliere de tous les constituants cellulaires et le compartimentage de la cellule.
Toute cellule suit donc un cycle au cours duquel on trouve les phases suivantes, quel
que soit l'tre vivant concerne:
1) le doublement des constituants cellulaires. Il se deroule pendant l'interphase;
2) la division du noyau en deux noyaux-Iils : c'est la mitose (du grec mitosis Iilament)
ou caryocinse;
3) la division de la cellule en deux cellules-Iilles : c'est la cytocinse.
Le mecanisme de division cellulaire est tres semblable chez tous les eucaryotes. Nous
verrons plus loin les quelques diIIerences existant entre les regnes. Le materiel le plus
Iavorable pour l'etude de la mitose, (mitose somatique), est la pointe de jeunes racines de
plantes en croissance, ou les divisions nucleaires et cellulaires sont nombreuses et les noyaux
de grande taille. Les cellules somatiques Iorment l'ensemble des cellules de l'organisme (le
soma), a l'exclusion des cellules sexuelles ou cellules germinales (le germen).
La cellule-oeuI ou zygote provient de la Iecondation, c'est-a-dire de la Iusion des deux
cellules speciales appelees gametes. Si chaque gamete contient n molecules d'ADN
correspondant aux chromosomes, la garniture chromosomique du noyau du zygote est donc
constituee d'un nombre diplode (2n) de chromosomes, dont la moitie (n) provient du parent
paternel et l'autre moitie du parent maternel (au moment de la Iecondation).
Hormis les chromosomes sexuels, les chromosomes provenant du pere et ceux
provenant de la mere sont morphologiquement identiques deux a deux et Iorment des paires
de chromosomes homologues. Nous reviendrons sur ces notions.
Les cellules diplodes humaines possedent environ 1,8 m d'ADN reparti en 46
morceaux, correspondant aux 46 chromosomes. Cet ADN est contenu dans le noyau dont le
diametre est souvent inIerieur a 10 m. Apres duplication, c'est 3,6 m d'ADN qui sont dans le
noyau, et qu'il Iaudra repartir en deux heritages egaux, sans Iaire de noud ni rien casser ! La
cle de la reussite de cet exploit par la cellule en division reside dans le compactage des
molecules d'ADN dupliquees en chromosomes qui sont reduits a quelques micrometres de
longueur lors de la mitose.
Le deroulement du cycle cellulaire s'opere de Iaon continue. Sa duree est tres
variable: de moins d'une heure (jeunes embryons de ttards) a plus d'un an (Ioie d'homme)
70
mais oscille generalement autour d'une journee. La mitose dure generalement de 1 a 2 heures
et c'est la duree tres variable de l'interphase qui determine si le tissu est Iort actiI ou au repos.
8.1. L'INTERPHASE
Les cytologistes ont longtemps cru que l'interphase etait une periode de repos parce
qu'ils n'y decelaient aucune modiIication importante au microscope. En Iait, dans la vie d'une
cellule, l'interphase constitue la periode la plus Ieconde. C'est durant cette periode que la
cellule se Iabrique! Elle double le nombre de ses constituants et surtout elle dedouble le stock
d'inIormation (ADN) dont elle dispose. Le noyau, soit disant en etat de repos, est le lieu d'une
activite metabolique intense; le cytoplasme possede egalement une activite biochimique
maximale. Durant l'interphase, le noyau augmente de taille.
L'interphase se decompose en trois phases denommees G1, S, G2.
1 la phase G1 ("gap" hiatus) a une duree variable selon le type de cellule; elle est de
courte duree chez les mammiIeres (de 4 a 10 heures) mais encore plus raccourcie, voire
nulle chez les cellules cancereuses. Durant cette phase la quantite d'ADN reste constante.
La synthese d'ARNm se realise a partir d'euchromatine et permet une intense synthese
des proteines cellulaires.
2 la phase S a une duree constante de 5 a 8 heures. On assiste a la duplication de la
molecule d'ADN. La quantite d'ADN double. La synthese d'ARNm se poursuit.
3 la phase G2 commence des que la duplication de l'ADN est terminee et dure aussi de
5 a 8 heures. La quantite d'ADN est double de celle observee en G1. La synthese
d'ARNm se poursuit. Dans les cellules animales, le centrosome (constitue de deux
centrioles) est duplique.
Certains agents antimitotiques, tels que les antimetaboliques, les agents alkylants,
certains colorants (proIlavine) peuvent bloquer les cellules en phase G2 .
Par rapport a l'interphase, l'ensemble de la caryocinese ne constitue en Iait "que" le
partage et la repartition en deux lots identiques de l'inIormation contenue dans le noyau.
Si l'on reserve le terme interphase a la periode qui s'ecoule entre deux mitoses successives, on
parle de noyau "au repos" ou "quiescent" quand celui-ci n'est destine qu'a se diviser beaucoup
plus tardivement, voire plus du tout. On parle parIois de phase G0 pour les cellules qui ont
arrte de se diviser.
71
8.2. LA REPLICATION DE L'ADN
Pour qu'un individu puisse se developper, il est indispensable que chaque cellule
possede le stock complet et intact des inIormations. L'ADN des chromosomes est porteur de
ces inIormations. Nous en verrons la demonstration en Genetique. Chaque molecule d'ADN
constitue une molecule codee dans laquelle la succession des bases possede un sens bien
precis et univoque. Toute variation dans l'ordre des nucleotides produit une inIormation
diIIerente.
Pour qu'un individu transmette, depuis l'oeuI Ieconde jusqu'aux cellules
reproductrices, l'ensemble des caracteres qu'il a reu de ses parents, il Iaut qu'a chaque
generation cellulaire, chacune des deux cellules Iilles emporte une copie conIorme de
l'inIormation (ADN) que la cellule oeuI a reu de chacun des parents lors de la Iecondation.
Le mecanisme de l'autoreproduction de l'ADN se deroule de la maniere suivante (il
avait deja ete suggere par WATSON et CRICK en 1953) :
Dans un premier stade, il y a rupture des ponts hydrogene liant les paires de bases qui
Iorment les barreaux de l'echelle, ce qui provoque la separation des deux demi echelles.
Dans le deuxieme stade, chaque demi echelle sert de matrice, de moule pour reconstituer la
demi echelle complementaire a partir des desoxynucleotides libres presents dans le noyau
(dATP, dGTP, dCTP, dTTP) et d'enzymes appelees ADN-polymerases. Ceci est possible
grce a la complementarite des couples A-T et C-G. L'ADN-polymerase utilise des
desoxynucleotides triphosphates, et non des desoxynucleotides monophosphates. La rupture
de deux liaisons phosphates Iournit l'energie necessaire a la Iormation de la liaison entre
desoxynucleotides dans la molecule d'ADN. Notons que l'hydrolyse de l'ADN ne Iournit que
des desoxynucleotides monophosphates.
La duplication est qualiIiee de "semi-conservative" parce que chaque nouvelle
molecule d'ADN est Iormee d'un montant de l'ancienne molecule et d'un montant
nouvellement synthetise.
Ce mecanisme a ete prouve experimentalement (TALOR, 1957), grce a l'emploi de
traceurs radioactiIs et a la technique de l'histoautoradiographie.
TALOR Iit crotre des radicelles de lis (Bellavalia romana) dans une solution
nutritive normale contenant de la desoxythymidine (desoxynucleoside precurseur que l'on ne
retrouve que dans l'ADN). Il les transIere alors dans un milieu contenant de la
desoxythymidine radioactive (marquee par le tritium radioactiI
3
H), ou elles continuent leur
croissance pendant un cycle cellulaire. Apres avoir lave les racines, il les replace dans un
milieu normal. Au cours de l'experience, il preleve a intervalles reguliers des pointes de
racines dans lesquelles il execute des coupes transversales.
72
L'observation directe des molecules d'ADN elles-mmes est impossible. Ce sont les
chromosomes en metaphase qui sont evidemment observes .
Dans le premier milieu normal, toutes les cellules contiennent des chromosomes
normaux.
Dans le milieu marque, on constate apres une generation cellulaire, que les deux
chromatides de tous les chromosomes de chaque cellule sont radioactives.
Replacees dans le milieu normal, apres une nouvelle generation cellulaire, on constate
en metaphase, que chaque chromosome possede une chromatide marquee et une qui ne l'est
pas.
L'explication de ces observations est la suivante:
Dans le milieu normal, la duplication de la molecule d'ADN donne deux molecules
identiques et "normales", puisque les deux demi echelles sont synthetisees a partir de
nucleotides libres, "normaux". Les deux chromatides de chaque chromosome sont donc
normales.
Dans le milieu marque, chaque nouvelle demi echelle complementaire est radioactive
puisqu'elle contient des nucleotides radioactiIs. Comme il est tout a Iait impossible de
distinguer les deux montants de l'echelle (l'ancien et le nouveau), chaque molecule d'ADN
donc les deux chromatides de chaque chromosome apparaissent radioactives.
En milieu normal enIin, la molecule radioactive, en provenance du milieu precedent
se duplique et, de ses deux demi echelles, l'une est radioactive et l'autre pas. Comme les deux
demi echelles complementaires synthetisees ne contiennent pas de thymine tritiee, une des
nouvelles molecules d'ADN demeure "marquee", l'autre pas. Cela revient a observer que pour
chacun des chromosomes, une chromatide est marquee, l'autre pas.
En Iait, il y avait trois hypotheses explicatives de la duplication: la duplication
conservative dans laquelle l'ancienne molecule d'ADN est conservee intacte tandis que la
nouvelle chromatide est construire entierement, l'hypothese semi-conservative expliquee plus
haut et l'hypothese non conservative ou dispersive selon laquelle l'ancien ADN etait
completement demonte et les morceaux reutilises pour Iabriquer deux nouvelles molecules
d'ADN. L'intert methodologique de l' experience de TALOR residait dans le Iait que les 3
hypotheses auraient conduit a trois observations diIIerentes sur les chromosomes et
permettait d'en deduire ce qui se passait dans la molecule d'ADN sans conIusion possible.
Ces resultats ont ete conIirmes l'annee suivante par MESELSON et STAHL par
marquage a l'azote lourd
15
N de l'ADN de bacteries.
73
Comment se droule la duplication ?
On a d'abord admis que le phenomene de duplication debutait a une des extremites et
se propageait jusqu'a l'autre extremite, a la maniere d'une Iermeture eclair aux crochets
dissymetriques. Cette hypothese a ete vite abandonnee car incompatible avec la vitesse
mesuree du phenomene.
Les mecanismes ont ete decouverts chez les bacteries, puis conIirmes chez les tres
superieurs.
La duplication s'eIIectue simultanement en de nombreux points appeles rplicons (on
estime leur nombre a 20 000 chez les mammiIeres!). En outre, la duplication est
bidirectionnelle: elle progresse simultanement dans les deux sens sur chaque brin de l'ADN
vers les replicons voisins.
Le premier point a ete demontre en plaant les cellules en phase S dans un milieu
contenant de la thymidine tritiee pendant un court instant: chaque chromosome apparat
marque en de nombreux sites qui sont autant de replicons. La longueur des segments
chromosomiques marques permet d'estimer la vitesse de la duplication a + 1mminute (chez
les bacteries: 20 mmin). Le second point est demontre en eIIectuant deux marquages
successiIs, l'un avec une Iaible concentration, l'autre avec une Iorte concentration en
thymidine tritiee. Sur une autoradiographie, des images montrent que, de part et d'autre du
replicon, la chane d'ADN est sur une certaine longueur, d'abord Iaiblement radioactive, puis
Iortement radioactive; ce qui correspond aux deux marquages successiIs.
Cette duplication bidirectionnelle observee au microscope est en contradiction avec
les donnees biochimiques. En eIIet, les deux montants de l'ADN sont antiparalleles et les
ADN polymerases travaillent exclusivement dans un seul sens (5'--3'). L'ADN polymerase
ne peut donc pas travailler simultanement dans les deux sens sur la molecule d'ADN. Les
chercheurs ont pu montrer qu'eIIectivement sur un brin de l'ADN (le brin precoce), elle
s'eIIectuait en continu, tandis que sur le brin oppose (le brin tardiI) elle s'eIIectuait de
maniere discontinue par une serie de bonds en avant suivis d'une marche arriere pour recoller
au morceau deja synthetise. Ces Iragments sont appeles Iragments d'OKASAKI.
L'ADN-polymerase n'est pas capable de commencer un nouveau brin, elle ne peut
qu'allonger un brin existant. Chaque brin d'ADN sera des lors commence par une autre
enzyme, une ARN-polymerase, qui synthetise un court morceau d'ARN qui sert d'amorce
pour l'ADN polymerase. Ce morceau d'ARN sera elimine et remplace par de l'ADN
ulterieurement.
74
On peut donc resumer les proprietes de l'ADN polymerase comme suit:
1 Elle synthetise toujours un brin d'ADN dans le sens 5' vers 3'
2 Elle utilise comme substrat des desoxynuleotides triphosphates, qui Iournissent a la
Iois les briques de bases pour la construction de l'ADN (nucleotides monophosphates) et
l'energie necessaire.
3 Elle ne synthetise un brin d'ADN qu'en presence d'un modele : le brin matrice.
4 Elle ne peut commencer un nouveau brin et a donc besoin d'une amorce.
Pour realiser une reaction de synthese d'ADN in vitro, au laboratoire, il Iaudra donc ajouter
dans le tube a essai: l'enzyme, des dNTP, un brin matrice monocatenaire (souvent obtenu par
chauIIage a 95C d'ADN bicatenaire), et une amorce. L'enzyme a en outre besoin d'un
tampon particulier (pH neutre) et d'ions Mg
, Mg
, par exemple).
Exemples:
- la catalase catalyse le destruction d'eau oxygenee en eau et oxygene (voir peroxysome).
- les dehydrogenases catalysent l'enlevement d'hydrogene de substrats, qui peut tre Iixe sur
une coenzyme (ex: lactate dehydrogenase, voir Iermentation).
95
GROUPE 2 :
Les transfrases transIerent un radical d'une molecule a une autre.
Exemples:
- les transaminases transIerent les radicaux -NH
2
d'un acide amine a un acide cetonique.
Elles jouent un rle capital dans le metabolisme des acides amines.
Ac. aspartique ac. pyruvique ac. oxalacetique alanine
- les kinases transIerent un phosphate terminal de l'ATP sur un substrat (le glucose par
exemple) ou inversement.
L'ion Mg
phosphoryle a un deuxieme endroit sur le ribose de l'adenosine.
NAD
et NADP
2 electrons 2 H
NADH H
NADP
2 electrons 2 H
NADPH H
Iorme oxydee
Iorme reduite
Bien que de structures tres voisines, ces deux coenzymes ont des rles tres diIIerents:
le NADH
est une coenzyme de catabolisme servant essentiellement de carburant a la chane
reactionnelle Iabriquant l'ATP, tandis que le NADPH est utilisee dans l'anabolisme, comme
reservoir d'hydrogene pour les syntheses cellulaires, en particulier celle des lipides.
b) Les flavines nuclotides
La vit B
2
ou RiboIlavine (coloration jaune) est un nucleoside Iorme d'une base azotee,
l'isoalloxasine et d'un Iaux sucre en C
5
, le ribitol. Phosphorylee, elle Iorme un nucleotide, la
Ilavine mononucleotide ou FMN.
Comme dans le NAD, le FMN peut s'associer a l'AMP par un lien phospho-diester
pour Iormer la Flavine Adenosine Dinucleotide: FAD.
98
Les Ilavo-proteines sont des proteines dans lesquelles la proteine est Iortement liee a
une Ilavinenucleotide.
FMN et surtout FAD sont donc des accepteurs et donneurs d'hydrogene et passent
reversiblement de la Iorme oxydee (FMN, FAD) a la Iorme reduite (FMNH
2
, FADH
2
).
FMN 2 electrons 2 H
FMNH
2
FAD 2 electrons 2 H
FADH
2
Leur rle est identique a celui de la NAD et de la NADP mais a des niveaux
energetiques diIIerents.
c) La coenzyme Q et la Plastoquinone:
Ces coenzymes ne sont pas des nucleotides mais bien des lipides, qui interviennent
respectivement dans le transport d'hydrogene au niveau de la "chane respiratoire" et de la
phase claire de la photosynthese. Leur rle sera precise ulterieurement :
CoQ H
2
CoQH
2
.
PQ H
2
PQH
2
.
d) Les transporteurs d'lectrons associs aux cytochromes
Ce sont des proteines colorees dont le groupement prosthetique est une porphyrine. Ce
groupement qui contient du Ier, est Iort semblable a l'heme de l'hemoglobine et de la
myoglobine ainsi qu'a la chlorophylle.
Le Ier, par des changements de valence Fe
e
-
Fe
assure le transport
d'electrons dans les chanes reactionnelles d'oxydation cellulaire.
Les cytochromes occupent notamment une place tres importante dans la chane
respiratoire.
LES TRANSPORTEURS D'UN ATOME DE CARBONE
Un derive diphosphorique de la vit B
1
(thiamine ou aneurine), la thiamine
pyrophosphate, intervient dans les processus de decarboxylation de la respiration.
99
LES TRANSPORTEURS DE DEUX ATOMES DE CARBONES
La coenzyme A est Iormee d'un ADP phosphoryle associe a de l'acide pantothenique
(vit B
5
) et de la mercaptoethylamine. Son groupe actiI est le residu sulIhydrile terminal -SH.
On la represente par le symbole CoA-SH.
La coenzyme A est principalement accepteur ou donneur du groupement acetyle CH
3
- CO - a deux atomes de carbone, bien qu'elle transporte aussi des chanes hydrocarbonees
plus longues. La combinaison la plus importante de la coenzyme A est "l'acetyl-CoA"
represente par CH
3
- CO SCoA.
La rupture de la liaison CO S libere 30,5 kJ, qui permettent la Iormation d'ATP a
partir d'ADP. La synthese de cette liaison demande donc autant d'energie, Iournie soit par
l'ATP, soit par la rupture d'une autre liaison. L'action biologique de la coenzyme A est
primordiale. Elle assure une place centrale dans le metabolisme cellulaire.
100
3. LA NUTRITION CELLULAIRE
__________________________________________
Les cellules ont besoin d'absorber un certain nombre de molecules de base pour
synthetiser leurs composants. La nature de ces composes varie enormement d'un type
d'organisme a l'autre. Le principal obstacle a la nutrition cellulaire est le passage des
membranes. Ce chapitre Iait appel a deux phenomenes physiques de base, qui sont la
diIIusion et l'osmose.
3.1. BESOINS CELLULAIRES
L'nergie
Les cellules ont toutes besoin d'une source d'energie. Les organismes qui peuvent utiliser la
lumiere comme source d'energie par photosynthese sont qualiIies de phototrophes (plantes,
certains protistes comme les algues, et les cyanobacteries). Ceux qui, comme nous, ont besoin
de molecules riches en energie chimique (sucres, lipides, protides), sont des chimiotrophes.
L'eau et les minraux
Toutes les cellules ont besoin d'eau et de mineraux en quantites variables.
Le Carbone
Les organismes qui se contentent de dioxyde de carbone gazeux comme source de carbone
sont qualiIies d'autotrophes. Il s'agit evidemment des organismes capables de photosynthese,
mais aussi de certaines bacteries exotiques.
Les htrotrophes ont besoin de carbone sous Iorme organique (sucre, lipides, protides). Ce
sont donc dans ce cas les mmes molecules qui Iournissent l'energie et le carbone
(chimioheterotrophes, souvent appeles simplement heterotrophes). Notons que la survie des
heterotrophes sur Terre depend totalement des autotrophes comme les plantes.
L'ABSORPTION DE L'AOTE
L'azote necessaire a la synthese des acides amines et des bases azotees de l'ADN peut
provenir de trois sources :
- l'azote atmospherique (N
2
), utilise exclusivement par certaines bacteries ;
- l'azote organique (associe a des atomes de carbone) provenant d'autres organismes morts
ou vivants, utilisable par tous les tres vivants ;
- l'azote mineral provenant de mineraux du sol ou bien de la nitriIication, de la
mineralisation de l'azote organique par les microorganismes du sol suivant le schema :
N organique NH
4
NO
2
-
NO
3
-
101
La plupart des plantes utilisent pour leurs syntheses ulterieures l'azote mineral. Soit
sous Iorme ammoniacale (reduite NH
4
. R
-
est non dialysable (la membrane lui est impermeable);
Na
et
Cl
-
tous deux dialysables (ils passent librement par la membrane).
En vertu des lois de la diIIusion, Na
et Cl
-
vont tendre a egaliser leurs concentrations
respectives (concentrations partielles) de part et d'autre de la membrane, equilibrant ainsi les
charges positives et negatives. R
-
, ne pouvant pas dialyser, provoque un desequilibre des
concentrations totales et donc une diIIerence de potentiel hydrique, mais de plus, il provoque
un nouveau desequilibre, electrique, a cause de sa charge negative qui reste conIinee au
compartiment A. Ce nouveau desequilibre sera compense par une attraction supplementaire
d'ions de signe oppose (Na
de B) et une repulsion d'ions de mme signe (Cl
-
vers B) et cela
a l'encontre de la loi de la diIIusion.
L'equilibre de DONNAN constitue un compromis entre ces tendances opposees. Les
ions mobiles, dialysables sont soumis a deux Iorces de sens opposes: les Iorces osmotiques
qui les tirent dans un sens et les Iorces electriques qui les tirent dans l'autre. Le calcul montre
que le collode attire plus d'ions de signe oppose qu'il ne repousse d'ions de mme signe. Ceci
105
se traduit par une augmentation de la diIIerence des concentrations totales des deux
compartiments et donc par une augmentation de la diIIerence de pression osmotique.
L'exemple ci-dessus peut tre chiIIre et resume de la maniere suivante:
!"
#$% &' ('
Au depart R 10 Cl 20
Na 10 Na 20
apres diIIusion R 05 R 05
Na 15 Na 15
Cl 10 Cl 10 DiIIerence 0
apres osmose R 10 -
Na 15 Na 15
Cl 10 Cl 10
35 25 DiIIerence 10
en tenant compte des charges (equilibre de Donnan)
R
-
10 -
Cl
-
08 Cl
-
12
Na
18 Na
12
36 24 DiIIerence 12
(Dans la resolution de ce cas simpliste, la loi de Donnan indique simplement que les charges
et - doivent s'annuler dans chaque compartiment (A: 18- et 18, B 12- et 12) et que le
produit des concentrations des ions dialysables doit tre identique entre les compartiments
(8x1812x12144)).
OSMOSE APPLIQUEE A LA CELLULE JIJAA1E
On peut considerer la membrane plasmique des cellules comme une membrane semi-
permeable qui laisse passer les molecules d'eau. La concentration en solutes de part et d'autre
de la membrane va donc determiner le sens du passage de l'eau. La cellule contient des
substances dissoutes dont la concentration totale determine une pression osmotique interne P
i
.
Si la cellule est placee dans un liquide hypertonique (P
e
P
i
), par exemple dans une
solution concentree de saccharose (non diIIusible), l'eau est "attiree" du milieu le moins
106
concentre (hypotonique) vers le milieu le plus concentre (hypertonique). L'eau sort de la
cellule et dilue le milieu exterieur. Au Iur et a mesure, le volume de la cellule diminue, la
pression sur la membrane (et la paroi chez les vegetaux) s'aIIaiblit et la cellule se retrecit
comme un ballon qu'on degonIle. Les cellules vegetales vont se decoller de leur paroi rigide
(plasmolyse). L'eau cessera de sortir au moment ou il y aura isotonie entre le milieu
intracellulaire et le milieu exterieur, car a ce moment, P
i
P
e
et donc aussi +s
i
+s
e
.
Si l'on place une cellule dans un milieu hypotonique (par exemple de l'eau pure), on
assiste au phenomene inverse. (+s
e
0 +s
i
) Il y a appel de l'eau du milieu (moins
concentre) vers l'interieur (plus concentre) qui gonIle. Le cytoplasme exerce une pression
centriIuge de plus en plus Iorte sur la membrane plasmique. Si la cellule continue a gonIler,
la membrane se rompt et la cellule est lysee. Les cellules qui possedent une paroi sont plus
resistantes a cette pression du cytoplasme, appelee chez les vegetaux pression de turgescence
(P
t
).
Les diIIerents regnes vivants ont adopte des strategies diIIerentes vis a vis de l'osmose.
Les cellules animales baignent dans du liquide extracellulaire isotonique par rapport
au cytoplasme, mme si les ions et les molecules qui le composent sont diIIerents de ceux
trouves a l'interieur de la cellule. Si une cellule animale placee dans de l'eau pure, l'eau rentre
rapidement dans la cellule qui explose. Inversement, une cellule placee dans une solution
hypertonique par rapport a son cytoplasme perd de l'eau et retrecit. Les animaux ont
developpe des moyens tres eIIicaces pour ajuster l'osmolarite des liquides extracellulaires, en
utilisant un systeme d'excretion tres sophistique (principalement au niveau des reins) qui
contrle les quantites d'eau et de sels presentes dans l'organisme.
Les vgtaux - a l'exception des algues marines - baignent dans un liquide
extracellulaire hypotonique qui contient beaucoup moins de sels que celui des cellules
animales. Les cellules vegetales - ainsi que les bactries - possedent une paroi rigide qui leur
permet de resister a de Iortes pressions osmotiques. Les cellules vegetales utilisent ces
proprietes pour pomper l'eau plus eIIicacement et sont normalement turgescentes (legerement
gonIlees) en milieu hypotonique. Leur vacuole accumule une partie de l'eau qui rentre dans la
cellule et joue une rle important dans l'equilibre hydrique de la cellule. La pression de
turgescence (P
t
) conIere aux tissus une certaine rigidite (comme dans une chambre a air). Un
approvisionnement insuIIisant en eau entrane une deturgescence, parIois suivie d'une
plasmolyse (qui peut tre mortelle) : les parois cellulaires se detendent, les tissus et donc
l'organe s'aIIaissent : c'est la Ianaison. Une nouvelle alimentation en eau retablit la
turgescence : l'organe reprend alors toute sa rigidite.
Certains protistes plonges dans un milieu hypotonique, rejettent l'eau absorbee par
osmose de maniere active (en depensant de l'energie) par des vacuoles contractiles speciales.
107
3.3. LE PASSAGE DES MEMBRANES CELLULAIRES
DIFFUSIOA SIMPLE
Si on considere une membrane artiIicielle composee uniquement d'une double couche
de lipides, la traversee d'un compose est une simple diIIusion sur une distance limitee a deux
molecules. On comprend alors que les membranes soient permeables a certains corps (ils sont
solubles dans les lipides, leur coeIIicient de diIIusion y est eleve) tandis qu'elles sont
impermeables a d'autres (leur coeIIicient de diIIusion dans les lipides est tres Iaible, voir nul).
La notion de permeabilite, d'impermeabilite, de semi-permeabilite est donc une notion
relative. La double couche lipidique est relativement permeable aux molecules hydrophobes
et apolaires (alcanes, O
2
, N
2
). Certaines petites molecules polaires non chargees (CO
2
,
glycerol, uree, alcool, mme dans une certaine mesure l'eau) peuvent passer la membrane, qui
est par contre impermeable aux grosses molecules polaires non chargees (glucose,
saccharose) et surtout aux ions (H
, Na
, K
, Ca
, Cl
-
, HCO
3
-
.). Le saccharose passe 1000
Iois moins vite que l'uree, le Na
10
10
Iois moins vite que l'eau. Le passage d'une molecule
est aisement mesurable experimentalement.
1RAASPOR1S PASSIFS E1 AC1IFS
La membrane unitaire comporte une quantite importante de proteines
transmembranaires qui interviennent passivement ou activement dans le transIert de matiere.
Ces proteines peuvent tre comparees aux enzymes. On peut considerer qu'elles "catalysent"
le transIert (accelerent la vitesse de passage) d'un compose d'un compartiment a l'autre. Elles
possedent des caracteristiques tres similaires a celles des enzymes: pas de changement des
parametres thermodynamiques, speciIicite, vitesse, regulation, inhibition, sensibilite au pH.
Les transporteurs qui laissent passer une molecule dans une direction qui respecte les lois de
la diIIusion (soit dans la direction du gradient de concentration) sont appeles transporteurs
passiIs. Le transport passif est aussi nomme diffusion facilite. D'autres transporteurs
permettent l'accumulation d'un compose dans un compartiment a l'encontre des lois de la
diIIusion. Ce type de transport est qualiIie d'actif et demande un apport d'energie de la part de
la cellule, souvent Iourni par l'ATP.
Les aquaporines sont des canaux proteiques qui laissent passer l'eau au travers de la
membrane (transport passiI). Ils jouent un rle important dans les reins et dans les globules
rouges, notamment.
Les canaux ioniques sont des proteines tubulaires ou des associations de proteines
dont le centre est creux et qui laissent passer un ion donne, par exemple le calcium. Certains
mecanismes de contrle permettent de les ouvrir ou de les Iermer.
108
Certaines proteines transmembranaires changent de conIormation pour laisser passer
un compose. C'est le cas des permeases GLUT qui transportent passivement le glucose. Un
mecanisme similaire existe pour les acides amines.
Parmi les transports actiIs utilisant de l'ATP, on peut citer la pompe a proton, qui
concentre des protons dans certains compartiments comme les lysosomes. Ce type de pompe
est egalement responsable de l'acidiIication de l'estomac.
Certains canaux permettent un echange d'ions. C'est le cas de la pompe
sodiumpotassium (transport actiI), qui reIoule le sodium vers l'exterieur de la cellule et
importe le potassium dans le cytoplasme. Cette pompe utilise de l'ATP comme source
d'energie. Elle joue un rle tres important dans le maintien d'un potentiel electrique de part et
d'autre de la membrane plasmique (essentiel pour la contraction musculaire et les inIlux
nerveux).
Tous les mecanismes actiIs etou passiIs qui ont ete decrits concernant la nutrition
(l'absorption des aliments) sont applicables au phenomene d'excretion. (Le Ionctionnement
des reins en est un excellent exemple).
Notons enIin que tout ce qui vient d'tre explique a propos des echanges
INTERcellulaires est egalement d'application au niveau INTRAcellulaire relatiI aux echanges
entre le cytoplasme et les diIIerents organites.
109
3.4 L'ENDOCYTOSE
Seules certaines molecules relativement petites peuvent passer la membrane
plasmique. La cellule eucaryote peut cependant absorber des particules relativement
importantes par un mecanisme diIIerent, appele endocytose (voir partie cytologie), qui est
visible au microscope electronique. En certains endroits, la membrane plasmique montre des
invaginations, elle apparat comme aspiree vers l'interieur. Dans ces invaginations viennent se
loger, se concentrer des particules ou molecules (proteines, par exemple). L'invagination se
reIerme alors en une vesicule qui se detache de la membrane plasmique et qui constitue un
endosome. L'endosome ainsi Iorme peut Iusionner avec un lysosome dont les enzymes
peuvent alors digerer le contenu. Il existe trois types d'endocytose : la pinocytose, la
phagocytose et l'endocytose via un recepteur.
La pinocytose permet l'internalisation d'une petite quantite de liquide extracellulaire
par la cellule. Cette pinocytose permet aussi un recyclage de la membrane plasmique.
La phagocytose consiste a ingerer une particule solide dans un endosome
relativement plus grand que celui implique dans la pinocytose. Une amibe (protiste) est par
exemple capable d'ingerer une bacterie par phagocytose. Ce phenomene Iait non seulement
appel a une invagination de la membrane plasmique, comme dans la pinocytose, mais aussi a
des pseudopodes, sortes de petits bras cellulaires qui entourent la particule a ingerer. Du Iait
de la presence de la paroi, la phagocytose ne semble pas presente dans les cellules vegetales.
L'endocytose via un rcepteur permet a la cellule d'assimiler des composes choisis,
grce a un recepteur speciIique. Chaque recepteur, constitue d'une ou plusieurs proteines
transmembranaires, reconnat speciIiquement une molecule ou un complexe donne. Apres
Iixation de cette molecule, les recepteurs sont rassembles en un point sur la membrane
cellulaire et internalises par endocytose a l'aide d'une proteine appelee clathrine qui s'associe
a la partie cytoplasmique du recepteur. Ce processus permet de prelever de Iaon tres eIIicace
certains composes du milieu extracellulaire. Chez l'homme, c'est le cas du Ier (associe a la
transIerrine, une proteine qui transporte le Ier), et des lipides (transportes dans le sang en
association avec des proteines appelees apolipoproteines).
110
4. METABOLISME ET PRODUCTION D'ENERGIE
___________________________________________________________
La degradation d'une substance ne se Iait pas de maniere brutale liberant d'un coup
toute l'energie disponible, mais progressivement le long d'une voie mtabolique. Une
substance, produite par une reaction enzymatique se transIorme a son tour en d'autres corps
par l'intermediaire d'autres enzymes speciIiques pour eux et ainsi de suite.
Des corps complexes peuvent ainsi, par etapes successives, tre transIormes en des corps de
plus en plus simples en liberant chaque Iois une petite quantite d'energie. Ces etapes
successives sont couplees avec une reaction endothermique permettant de stocker ces petites
quantites d'energie ainsi liberees, sous Iorme d'energie chimique, essentiellement dans les
liaisons "riches en energie" de l'ATP.
Inversement, dans l'anabolisme, la construction de la matiere s'eIIectue egalement par
"petits bonds successiIs", empruntant l'energie necessaire a ces molecules specialisees. Un
corps A, de niveau energetique determine peut se transIormer en un corps B d'un niveau
energetique superieur a condition qu'il soit active et qu'on lui Iournisse de l'energie. Ceci se
produit aussi le long de voies metaboliques.
Tous les organismes sont capables d'utiliser des composes organiques comme source
d'energie. Ces composes rentrent dans la cellule comme explique dans le chapitre precedent
et sont ensuite degrades pour en recuperer l'energie (catabolisme). Nous verrons d'abord en
detail le catabolisme du glucose, puis celui des lipides, des proteines et des acides nucleiques.
Le catabolisme du glucose utilise quatre grandes voies metaboliques: la glycolyse, le
cycle des phosphopentoses, le cycle de Krebs et la chane respiratoire mitochondriale. Les
deux premieres peuvent Ionctionner en absence d'oxygene (catabolisme anaerobie),
contrairement aux deux suivantes.
4.1 LE CATABOLISME ANAEROBIE DU GLUCOSE
Le glucose qui entre dans la cellule est d'abord transIorme en glucose-6-phosphate par
l'addition d'un groupe phosphate Iourni par l'ATP. Cette reaction de phosphorylation est
catalysee par l'hexokinase en presence d'ions Mg
qui incorpore un phosphate mineral dans la molecule.
Pour chaque molecule de glucose utilisee par la
glycolyse, il y a donc deux molecules de
glyceraldehyde-3-phosphate transIormees en 1,3-
diphosphoglycerate et production de 2 NADH.
7 Cette reaction est importante: c'est une des rares
reactions qui permettent la synthese directe d'ATP par
couplage reactionnel (phosphorylation de l'ATP au
niveau du substrat). La phosphoglycerate-kinase
transIere le phosphate Iixe en C
1
du 1,3-
diphosphoglycerate sur l'ADP, Iormant de l'ATP et du
3-phosphoglycerate.
8 Le groupement phosphate du 3-
phosphoglycerate est deplace en C
2
, sous l'action d'une
isomerase, Iormant le 2-phosphoglycerate.
9 Sous l'action d'une enolase (une lyase), le 2-
phosphoglycerate perd une molecule d'eau, et est
transIorme en phosphoenolpyruvate.
10 Le groupement phosphate du
phosphoenolpyruvate est transIere sur l'ADP pour
Iormer de l'ATP et de l'enolpyruvate sous l'action de la
pyruvate-kinase. C'est la deuxieme reaction de
synthese directe d'ATP par couplage reactionnel.
L'enolpyruvate se transIorme spontanement en
pyruvate.
113
Le bilan de la glycolyse s'ecrit donc :
C
6
H
12
0
6
2 C
3
H
3
O
3
-
2H
2 NAD
2 NADH 2H
2 ADP 2 P
i
2 ATP 2H
2
O
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
1 glucose C
6
H
12
0
6
2 NAD
2 P
i
2 ADP
2 pyruvates C
3
H
3
O
3
-
2 NADH 4H
2 ATP 2H
2
O
A pH physiologique, c'est le pyruvate (et non l'acide pyruvique) qui est produit. La
transIormation spontanee des 2 acides carboxyliques produits au cours de la glycolyse en
carboxylates produits 2 protons supplementaires. Dans l'equation globale, 4 protons sont donc
produits, qui sont necessaires pour equilibrer les charges et les masses dans l'equation
chimique. Ces 4 protons se combineront a l'eau (pour Iormer des ions H
3
O
) ou a des
composes basiques presents dans le cytoplasme.
Les coenzymes NAD
.
La premiere condition regule la glycolyse puisqu'elle empche un gaspillage : le
glucose n'est degrade qu'en cas de besoin energetique. Mais il est aussi necessaire que le
NADH soit reoxyde. Les besoins cellulaires en NADH sont relativement Iaibles, l'anabolisme
utilisant plutt le NADPH. Une autre possibilite est d'oxyder le NADH en NAD
au niveau
des mitochondries pour produire plus d'ATP en presence d'oxygene (voir la chane
respiratoire mitochondriale). C'est la voie habituellement suivie en presence d'oxygene et
appelee glycolyse arobie.
4.1.2 LA FERMEA1A1IOA
La Iermentation est une suite de reactions qui oxydent au maximum le glucose pour
en retirer le plus possible d'energie sous Iorme d'ATP et ceci en absence d'oxygene.
En absence d'oxygene, la cellule ne pourra pas continuer a oxyder le pyruvate en
produisant de l'ATP. D'autre part, le NADH doit tre retransIorme en NAD
. C'est donc a
partir du pyruvate que la cellule va reoxyder le NADH pour pouvoir continuer a produire son
ATP par la glycolyse. Selon le produit Iinal, il existe plusieurs types Iermentations diIIerentes
dont la Iermentation lactique et la Iermentation alcoolique.
La fermentation lactique est celle qui se deroule dans nos muscles en activite intense
quand la consommation en ATP est trop rapide par rapport a la diIIusion de l'oxygene
114
necessaire pour une respiration normale. L'accumulation de lactate provoque alors les
douleurs bien connues des athletes. Le lactate ainsi Iorme peut tre reoxyde en pyruvate puis
en CO
2
, lentement dans le Ioie.
Dans ce cas le NADH est utilise par une oxydoreductase pour reduire directement le
pyruvate :
CH
3
- CO - COO
-
NADH H
NAD
CH
3
- CHOH - COO
-
pyruvate lactate
La Iermentation lactique est aussi provoquee notamment par les bacteries
Lactobacillus bulgaricus et Streptococcus lactis qui utilisent le lactose du lait pendant la
transIormation de celui-ci en yogourt.
La fermentation alcoolique ne se produit pas chez l'homme. Elle est bien connue
depuis les travaux de PASTEUR (1871) sur la levure de biere (Saccharomvces cerevisiae), qui
est un anaerobie IacultatiI. En presence d'oxygene, la levure de biere respire normalement et
se developpe beaucoup: il se Iorme 1 g de levure a partir de 4 g de sucre en milieu de culture.
En absence de O
2
, les levures Iermentent et se developpent tres peu: il se Iorme 1 g de levure
a partir de 100 g de sucre.
Le glucose du jus sucre disparat, de l'alcool ethylique se Iorme et il se degage du
CO
2
. En mme temps, la temperature du jus s'eleve. La reaction globale est la suivante :
C
6
H
12
O
6
2 C
2
H
5
OH 2 CO
2
138 kJ
Lorsque le jus a atteint 10 a 15 d'alcool (pour certains vins, par exemple), la
reaction s'arrte car les levures ne supportent pas un degre d'alcool aussi eleve et meurent.
Cette Iermentation alcoolique s'opere aussi dans les organes riches en glucides (racines de
betteraves, Iruits sucres) lorsqu'ils sont prives d'oxygene.
Suite a la transIormation du glucose en pyruvate, les deux reactions suivantes se produisent:
a) le pyruvate est decarboxyle en acetaldehyde et CO
2
par une decarboxylase;
CH
3
- CO - COO
-
H
CH
3
- CHO CO
2
pyruvate acetaldehyde
b) l'aldehyde acetique est reduit en alcool ethylique par le NADH
CH
3
- COH NADH H
NAD
CH
3
- CH
2
OH (C
2
H
5
OH)
acetaldehyde ethanol
115
Rappelons que grce a l'une ou l'autre des reactions, le bilan en NADH est nul, ce qui
est indispensable pour que la glycolyse puisse se poursuivre. Le bilan de l'ATP est de 2
ATP. La plus grande partie de l'energie contenue dans le glucose est donc encore presente
dans l'ethanol (dont l'oxydation complete Iournit 7 kcalg).
4.1.3. LE CYCLE DES PHOSPHOPEA1OSES
La glycolyse n'est pas la seule voie possible pour degrader le glucose en absence
d'oxygene. Il en existe plusieurs autres, dont le cycle des phosphopentoses. Ce cycle peut
Ionctionner tres activement aussi bien chez les plantes et les animaux superieurs que chez les
micro-organismes.
Dans cette voie, contrairement a la Iermentation, le glucose est completement oxyde
en CO
2
toujours sans intervention de l'oxygene, mais il ne produit pas d'ATP. Au contraire, il
en consomme un. L'objectiI de ce cycle est de produire du NADPH necessaire pour toutes les
reactions de synthese de la cellule (anabolisme). Comme la glycolyse, ce cycle Ionctionne
dans le cytoplasme.
Ce cycle commence par deux reactions d'oxydation, ou deux electrons sont transIeres
aux NADP
H
2
O NADPH acide phosphogluconique
acide phosphogluconique NADP
NADPH CO
2
ribulose-monophosphate (pentose)
Plusieurs molecules de ribulose-monophosphate subissent ensuite une serie de
transIormations complexes qui permettent de regenerer du glucose-6-phosphate. Pour 6
molecules de glucose-6-P qui entrent dans le cycle, une seule est decomposee et 5 sont
regenerees. Une molecule de phosphore inorganique (P
i
) est perdue.
6 Glucose-6P 12 NADP
6 H
2
O 5 Glucose-6P 6 CO
2
12 NADPH Pi
Comme a chaque rotation du cycle, 5 molecules de glucose-6-P sont regenerees et
qu'il ne Iaut alors qu'un apport d'une seule molecule de glucose (phosphorylee par ATP), le
bilan de chaque rotation est donc
C
6
H
12
O
6
12 NADP
ATP 6 H
2
O 12 NADPH
2
ADP P
i
6 CO
2
C'est-a-dire que pour chaque molecule d'hexose degradee, la "turbine" pourra Iournir 12
NADPH. De plus, il permet l'obtention de pentoses necessaires pour la synthese des acides
116
nucleiques, a partir d'hexoses. Il permet d'autre part, l'oxydation complete des pentoses en les
transIormant en glucose qui peut tre degrade dans la glycolyse. EnIin, tous les produits
intermediaires peuvent servir de base a des syntheses ulterieures.
4.2 LA RESPIRATION
La respiration est un phenomene qui se maniIeste exterieurement par des echanges
gazeux : absorption d'oxygene et degagement d'anhydride carbonique. La demonstration est
aisee : on place des champignons (qui ne photosynthetisent pas) dans un bocal
hermetiquement Ierme. On y ajoute dans un godet separe, de la soude caustique (NaOH) et on
Ierme hermetiquement. Apres un certain temps, on constate la Iormation de carbonate de
soude aux depens de NaOH et du CO
2
absorbe tandis que l'atmosphere du bocal est appauvrie
en O
2
:
(2 NaOH CO
2
Na
2
CO
3
H
2
O)
Beaucoup d'images comme la chaudiere ou le moteur Iont penser a une oxydation
directe par l'oxygene. Ce n'est pas le cas ici. L'oxydation directe n'est pas possible car
l'energie thermique degagee est d'une part irrecuperable par la cellule et d'autre part,
tellement brutale que les proteines seraient denaturees et que la cellule mourrait. Les
recherches ont au contraire montre que l'oxygene est la derniere molecule qui intervient dans
un processus progressiI, qui utilise de nombreuses etapes intermediaires. Ce systeme permet
a la cellule de recuperer environ 40 de l'energie degagee sous Iorme d'ATP.
La respiration comprend trois etapes:
- la glycolyse
- le cycle de Krebs
- la chane electronique mitochondriale ou chane respiratoire
4.2.1 LA CLYCOLYSE AEROBIE
La premiere etape est donc commune a la Iermentation et a la respiration. Elle se
deroule dans le cytoplasme. Elle aboutit au depart de glucose a la Iormation de deux
pyruvates et la production de 2 ATP et de 2 NADH:
1 glucose 2 NAD
2 P
i
2 ADP 2 pyruvates 2 NADH 4 H
2 ATP 2 H
2
O
Mais comme nous nous trouvons en conditions aerobies (presence d'oxygene), les
NADH
produits vont tre reoxydes, non plus en reduisant d'autres molecules comme dans la
Iermentation, mais par la chane respiratoire productrice d'ATP.
117
Un probleme se pose cependant: les NADH
sont produits dans le cytoplasme et la
chane respiratoire est localisee dans la mitochondrie. Or la membrane interne de la
mitochondrie est impermeable aux NADH (sinon ils n'y atteindraient jamais une
concentration suIIisante pour demarrer la chane respiratoire).
Il existe donc une "navette" qui va Iaire entrer dans la mitochondrie l'hydrogene des
NADH
sans que ceux-ci n'y rentrent eux-mmes. Ce systeme assez complexe va transIerer les
deux electrons du NADH au FAD avec production de FADH
2
Nous verrons dans le paragraphe sur le chane respiratoire que le FADH
2
produit 2 ATP.
Chacun des NADH produit dans le cytoplasme aboutit donc a la Iormation de 2 ATP dans la
mitochondrie.
Le bilan energetique de la glycolyse dans la respiration est donc de 6 ATP (2 de la
phosphorylation au substrat et 2 x 2 dans la mitochondrie).
4.2.1. LE CYCLE DE KREBS
Le pyruvate penetre dans le stroma de la mitochondrie ou se poursuit la respiration.
Le passage des deux membranes mitochondriales implique l'intervention d'un transport
passiI.
Une premiere reaction va transIormer le pyruvate en acetyl-coenzyme-A :
CH
3
- CO - COO
-
H
CoA-SH CH
3
- CO - CoA CO
2
2 H
2 electrons
NAD
2 H
2 electrons NADH H
-----------------------------------------------------------------------------------------------------
CH
3
- CO - COO
-
CoA-SH NAD
CH
3
- CO - CoA CO
2
NADH
Cette reaction est complexe puisqu'elle comprend a la Iois une decarboxylation (perte
de CO
2
), une oxydoreduction et l'accrochage du residu acetate sur la coenzyme A. Il n'est
donc pas etonnant qu'elle se deroule dans un complexe multienzymatique, exemple typique
de structure "quaternaire" des proteines.
L'acetyl-coenzyme-A enclenche alors le cycle de KREBS, (aussi appele cycle du
citrate): une suite de reactions qui vont oxyder les deux carbones du radical acetyl en 2 CO
2
avec production de coenzymes reduits.
La premiere etape de ce cycle Iixe le radical CH
3
- CO - et une molecule d'eau sur
l'oxaloacetate pour Iormer le citrate (derive de l'acide citrique C
6
H
8
O
7
). Le citrate va ensuite
subir une serie de transIormations qui degagent deux molecules de CO
2
, trois molecules de
NADH, un GTP et un FADH
2
. Le cycle s'acheve par le reIormation d'oxaloacetate, qui peut a
nouveau reagir avec l'acetyl-CoA (voir schema page suivante, donne pour inIormation). Ce
cycle se produit entierement dans le stroma de la mitochondrie.
118
Bilan du cycle de Krebs:
CH
3
- CO S CoA 3 H
2
O 2 CO
2
CoA-SH 8 H
8 electrons
3 NAD
6 H
6 electrons 3 NADH 3 H
FAD 2 H
2 electrons FADH
2
GDP Pi GTP H
2
O
---------------------------------------------------------------------------------
CH
3
- CO S CoA 2 H
2
O 3 NAD
FAD GDP Pi
2 CO
2
CoA-SH 3 NADH 3 H
FADH
2
GTP
Le cycle de Krebs
119
En partant du pyruvate :
CH
3
- CO - COO
-
2 H
2
O 4 NAD
FAD GDP Pi
3 CO
2
4 NADH 3 H
FADH
2
GTP
La glycolyse suivie du cycle de Krebs oxyde donc completement le glucose en CO
2
avec
production de coenzymes reduits (NADH et FADH
2
), de 2 ATP et de 2 GTP (qui peuvent
tre transIormes en 2 ATP). Le NADH et le FADH
2
doivent rapidement tre reoxydes, Iaute
de quoi le cycle s'arrte. Cette reoxydation ne peut se Iaire qu'en presence d'oxygene au
niveau de la chane respiratoire.
4.2.3. LA CHAIAE RESPIRA1OIRE
Dans l'atmosphere primitive de la Terre, il n'y avait pas d'oxygene. Les premiers tres
vivants ne pouvaient donc utiliser que la Iermentation et donc ne recuperer qu'une Iaible
partie de l'energie des molecules de la "soupe originelle". Il est probable qu'ils utilisaient
egalement des sources alternatives d'energie (metabolisme du souIIre, par exemple).
Progressivement, les bacteries photosynthetisantes ont degage de l'oxygene dans
l'atmosphere. Progressivement aussi, certaines bacteries ont appris a supporter cet agent
oxydant tres violent, puis a l'utiliser pour recuperer au maximum l'energie des molecules. Les
mitochondries actuelles sont vraisemblablement des descendants de ces bacteries ayant co-
evolue avec la cellule eucaryote Iermentante ancestrale (endosymbiose).
Nous retrouvons dans les mitochondries une chane respiratoire. Elle consiste en une
suite de reactions d'oxydoreductions qui permettent de transIerer progressivement les
electrons du NADH (et du FADH
2
) a l'oxygene dissout et de produire de l'ATP. Cette chane
est localisee dans la membrane interne de la mitochondrie.
Le mecanisme de couplage entre l'oxydoreduction du NADH et la production d'ATP a
longtemps ete un mystere pour les scientiIiques. MITCHELL a propose en 1961 une hypothese
expliquant la correspondance existant entre les chanes de transport d'electrons et la synthese
d'ATP sans lier cette derniere a des endroits precis de la chane. Selon cette theorie, la chane
respiratoire permet le pompage de protons dans l'espace intermembranaire. Ces protons sont
ensuite utilises par les Iacteurs de couplage pour Iabriquer de l'ATP. Apres avoir ete
vivement combattue pendant 15 ans, la theorie chimiosomotique de Mitchell est maintenant
bien etayee et acceptee.
Ce mecanisme peut tre divise en deux processus distincts: la chane electronique
proprement dite, et la synthese d'ATP par l'ATP synthetase.
120
La chane lectronique
Du point de vue energetique, la reaction du NADH avec l'oxygene peut tre comparee
a la reaction de l'hydrogene gazeux avec l'oxygene. Cette derniere produit une explosion. Au
cours de cette chane reactionnelle, le potentiel redox (cIr cours de chimie) passe
progressivement de -0,32 V (NADHNAD
) a 0,82 V (H
2
0O
2
).
La reaction globale de la chane respiratoire s'ecrit:
NADH H
O
2
H
2
O NAD
AE 1,14 V
Les electrons lorsqu'ils sont transIeres du NADH a l'oxygene parcourent une diIIerence de
potentiel standard de 1,14 V. On peut calculer qu'a cette diIIerence de potentiel correspond
une variation d'energie libre standard AG de -53 kcalmol. La reaction est donc Iortement
exothermique. Dans la mitochondrie, cette liberation d'energie va en Iait se Iaire
progressivement, en de multiples etapes.
Au debut de la chane respiratoire, le NADH cede ses deux electrons a un complexe proteique
transmembranaire qui contient plusieurs atomes de Ier qui prennent en charge
temporairement les electrons (en passant de l'etage d'oxydation 3 a 2) avant de les
transIerer a la coenzyme Q (appelee aussi ubiquinone, abreviation: CoQ).
NADH H
CoQ NAD
CoQH
2
AE 0,42 V
Le complexe utilise l'energie liberee par la reaction pour pomper trois protons de la matrice
mitochondriale vers l'espace intermembranaire. Ensuite, la Iorme reduite de la coenzyme Q
va donner ses electrons a un autre complexe proteique transmembranaire, contenant lui aussi
des atomes de Ier. Ce complexe transIere les electrons a une proteine de l'espace
intermembranaire: le cytochrome C, qui contient un atome de Ier insere dans une structure
particuliere (porphyrine) apparentee a l'heme de l'hemoglobine (voir groupement prosthetique
des proteines). L'energie liberee par cette etape va permettre de pomper 4 protons
supplementaires dans l'espace intermembranaire.
CoQH
2
2 cytochromes C (Fe
) CoQ 2 H
2 cytochromes C (Fe
)
EnIin, le cytochrome C donne ses electrons a un dernier complexe transmembranaire,
contenant des atomes de Ier et de cuivre, qui les transmettra a l'oxygene. Ce complexe pompe
lui aussi 4 protons dans l'espace intermembranaire.
121
2 cytochromes C (Fe
) 2 H
O
2
H
2
O 2 cytochromes C (Fe
)
Cette reaction termine la chane electronique. Chaque reaction est en Iait subdivisee en de
multiples petits transIerts entre atomes metalliques (Ier, cuivre). Si cette reaction se
produisait en une seule etape, l'energie liberee serait incontrlable. La multiplication des
etapes permet de recuperer un maximum d'energie, utilisee pour pomper des protons dans
l'espace intermembranaire.
Notons au passage que l'oxygene absorbe par la respiration ne sert pas directement a
Iabriquer le CO
2
, mais est transIorme en eau !
A1P synthtase et force protomotrice
Lors de chaque etape de la chane electronique, plusieurs protons sont pompes dans
l'espace intermembranaire. Il resulte de ce transport que le stroma mitochondrial tend a
s'alcaliniser, et l'espace intermembranaire a s'acidiIier. Comme la membrane est impermeable
aux protons, il se cree une diIIerence de pH de l'ordre de 1 unite. Les charges electriques
(H
S'accompagne de la production de 2 ATP (glycolyse) 2 ATP (Krebs)
Les electrons et les protons sont pris en charge par 12 coenzymes reduits :
2 NADH (Glycolyse, cytoplasme) 2 FADH
2
(mitochondrie)
8 NADH 2 FADH
2
(Krebs, mitochondrie)
La chane respiratoire reoxydera les 12 coenzymes en utilisant de l'oxygene avec Iormation
de (2 . 2) (8 . 3) (2 . 2) 32 molecules ATP (phosphorylation oxydative):
6 O
2
24 electrons 24 H
12 H
2
O
L'equation globale devient :
C
6
H
12
O
6
6 O
2
36 ADP + 36 Pi 6 CO
2
6 H
2
O 36 ATP + 36 H
2
O
Le resultat de la respiration est la liberation de l'energie chimique accumulee dans les
produits organiques synthetises par la cellule vivante. L'oxydation chimique d'une mole de
glucose libere 2870 kilojoules. Mais comme nous l'avons deja souligne, la cellule ne pourrait
supporter cette Iorme d'oxydation brutale des substrats organiques.
Au contraire, dans la respiration, l'oxydation realisee etape par etape permet de
conserver une grande partie de cette energie sous Iorme d'ATP. Le rendement de la
respiration du glucose peut tre calcule :
- l'oxydation d'une mole de glucose libere 2 870 kJoules.
- lors de la respiration, il se Iorme 36 moles d'ATP qui renIerment chacune 30,5 kJoules.
Par consequent, la cellule vivante a conserve 36 . 30,5 1100 kJoules sous Iorme d'ATP, soit
+ 40 de l'energie disponible (par comparaison, dans le meilleur moteur a combustion, le
taux de recuperation est d'environ 25 ).
En nutrition, on preIere compter en calories plutt qu'en kilojoules. 2870 kJ
equivalent a 686 kcal. Le glucose ayant un poids moleculaire de 180 Da, la valeur
energetique du glucose - et des glucides en general - est donc de 686180 3,8 kcalgramme.
123
4.2.5. L'U1ILI1E DU CA1ABOLISME DU CLUCOSE
L'utilite premiere du catabolisme du glucose est evidemment la recuperation
energetique. L'energie chimique transIeree dans l'ATP sera utilisee a l'execution de divers
travaux ou activites dont les principaux sont :
1 le travail osmotique et notamment dans le transport actiI des aliments qui se Iait a
l'encontre du gradient de concentration;
2 le travail mecanique : (energie cinetique) exige pour l'execution de mouvements divers
intracellulaires ou des deplacements; elle est utilisee egalement pour le travail
musculaire.
3 le travail chimique : la synthese des molecules complexes lors de l'anabolisme;
4 lemission de chaleur: chez les animaux a sang chaud, l'energie liberee par la respiration
sous Iorme de chaleur est utilisee pour elever ou maintenir la temperature de l'organisme.
Certains organismes sont egalement capables d'emettre de la lumiere (phosphorescence).
Mais l'ensemble des mecanismes de degradation du glucose: glycolyse, cycle de
KREBS, cycle des phosphopentoses Iournissent aussi des materiaux intermediaires qui servent
de point de depart a d'autres syntheses. Par exemple :
- l'acetylcoenzyme A est au depart de la synthese des acides gras et du cholesterol;
- le phosphodihydroxyacetone peut tre reduit en glycerol (utilise dans les phospholipides et
les triglycerides);
- de nombreux intermediaires, comme le pyruvate, peuvent tre transIormes en acides amines
par ajout d'une Ionction amine.
Le catabolisme du glucose constitue donc un grand carreIour du metabolisme cellulaire.
4.3 CATABOLISME DES LIPIDES
Les triglycerides et phospholipides peuvent tre hydrolyses par des lipases en acides
gras et glycerol. Le glycerol est transIorme en phosphodihydroxyacetone et degrade en
suivant la glycolyse.
Les acides gras contiennent une grande quantite d'energie: 9 kcalg. Ils sont utilises
pour le stockage d'energie chimique a long terme. Leur oxydation ne peut se Iaire qu'en
presence d'oxygene, car elle Iait appel au NAD
lumiere O
2
NADPH H
L'oxygene libere provient de la scission de molecules d'eau et non du CO
2
. Ceci a ete
demontre par Ruben en 1941 en marquant l'eau ou le CO
2
a l'aide d'un isotope lourd de
l'oxygene:
18
O. Cet isotope ne se retrouvera dans l'oxygene libere par la plante que s'il etait
present au depart dans l'eau.
Cette reaction d'oxydoreduction se deroule grce a deux complexes proteiques inseres dans la
membrane des grana: les photosystemes I et II. Ces photosystemes utilisent l'energie
lumineuse pour activer les electrons donnes par l'eau, ce qui permet de les transIerer au
NADP
.
D'autre part, l'energie absorbee par la chlorophylle est aussi utilisee pour pomper des
protons dans l'espace a l'interieur des grana. Ceci permet, par un mecanisme semblable a
celui que nous avons vu dans la mitochondrie, de synthetiser de l'ATP a partir d'ADP et de
phosphate grce a une ATP synthetase utilisant la Iorce protomotrice.
128
La phase claire produit donc des coenzymes riches en energie (NADPH et ATP)
utilisables par les voies anaboliques de la plante.
La phase sombre de la photosynthse
Les principaux resultats concernant la seconde phase de la photosynthese sont dus a
CALVIN et ses collaborateurs (1955). Pour cette raison, cette phase est Irequemment appelee
"cycle de Calvin". Cette voie, qui se deroule dans le stroma des chloroplastes, utilise le
NADPH et l'ATP produits par la phase claire pour reduire le carbone du CO
2
et l'incorporer
dans des sucres. La Iixation d'une molecule de CO
2
consomme 2 NADPH et au moins 3 ATP.
Le premier sucre Iabrique est le glyceraldehyde-3-phophate (voir glycolyse), qui peut tre
utilise pour Iabriquer du glucose et d'autres composes.
6 CO
2
12 NADPH 12 H
18 ATP C
6
H
12
O
6
12 NADP
18 ADP 18 Pi
Le carbone et l'oxygene du glucose proviennent donc du CO
2
, alors que l'hydrogene provient
de l'eau, par l'intermediaire du NADPH.
Le rendement energetique global de la photosynthese (quantite d'energie lumineuse absorbee
divisee par la quantite d'energie chimique stockee dans les sucres produits) est de l'ordre de
20.
La photosynthese a joue un rle essentiel dans l'evolution des tres vivants en
introduisant l'oxygene sur Terre, ce qui a permis le developpement de la respiration. On
pense que tout l'oxygene de l'atmosphere terrestre a ete produit par photosynthese, par les
vegetaux, les cyanobacteries et les algues. De plus, la photosynthese est le seul mecanisme
eIIicace permettant de Iabriquer de grandes quantites de composes organiques riches en
energie chimique, base de l'alimentation des animaux, des champignons, de certains protistes
et de nombreuses bacteries. Si la vie sur Terre est possible sans photosynthese, sous Iorme de
bacteries exotiques, elle n'aurait jamais atteint ce niveau de complexite sans ce mecanisme
capable de capter l'energie du soleil.
5.3 LA SYNTHESE DES ACIDES GRAS ET DU CHOLESTEROL
Les lipides ou matieres grasses assurent dans le metabolisme et dans les structures
cellulaires un grand nombre de Ionctions importantes : reserves d'energie, recouvrement
impermeable de l'epiderme, structure des membrane cellulaire, etc. Chez les animaux, les
129
reserves de lipides sont particulierement importantes puisqu'a poids egal elles permettent
d'emporter deux Iois plus d'energie que le glycogene. Chez l'homme, ce dernier suIIit aux
besoins d'une journee, tandis que ses reserves de graisses lui permettent de survivre pendant
un mois. Chez les plantes, les reserves lipidiques se trouvent surtout dans les graines
oleagineuses.
Synthse des acides gras
Les acides gras naturels possedent en general un nombre pair d'atomes de carbone. Ils
proviennent en eIIet de l'accrochage cyclique suivi de la reduction de plusieurs unites en C
2
:
l'acetate actiI ou acetyl-coenzyme A, qui provient de la decarboxylation du pyruvate
provenant lui-mme de la glycolyse. Les acides gras peuvent donc tre synthetises aussi bien
a partir de sucres que de certains acides amines. L'utilisation de l'acetyl-coA comme
precurseur des acides gras explique que la majorite des acides gras naturels possedent un
nombre pair d'atomes de carbone. Les acides gras les plus importants possedent 16 ou 18
atomes de carbones.
La synthese et la desynthese des lipides doivent se realiser en des endroits diIIerents
car a l'equilibre, ce sont les reactions de desynthese qui sont Iavorisees. Nous avons vu que la
desynthese par la -oxydation se Iaisait dans le stroma de la mitochondrie. La synthese se
realise dans le cytoplasme chez les animaux et dans le chloroplaste chez les vegetaux.
La synthese des acides gras consomme une quantite importante d'energie, sous Iorme
de NADPH (produit notamment par le cycle des phosphopentoses) et d'ATP.
Les acides gras sont ensuite esteriIies avec du glycerol en triglycerides (stockage) ou
en phospholipides (membranes cellulaires) au niveau du reticulum endoplasmique lisse.
Synthse des strodes
Les sterodes, comme le cholesterol, sont produits par une voie de synthese tres
diIIerente de celle des acides gras, trop complexe pour tre exposee ici, mais qui utilise la
mme brique de base: l'acetyl-coenzyme A. Elle se deroule dans le reticulum endoplasmique.
130
6. DU GENE A LA PROTEINE
____________________________________________
L'assemblage des acides amines, la synthese des proteines, revt une importance toute
particuliere. En eIIet, alors que les glucides et les lipides englobent un nombre "relativement
limite" - quoique tres eleve ! - de varietes chimiques diIIerentes et constituent principalement
des produits de reserve temporaires, le nombre de proteines diIIerentes est incalculable et leur
rle est primordial dans la vie cellulaire.
La Ionction de chaque proteine depend de sa structure tertiaire et quaternaire
provenant elle-mme des replis de la chane des acides amines constitutiIs de la proteine.
Cette ediIication precise n'est possible que si la structure primaire de la proteine s'est
parIaitement realisee ... laquelle est determinee par le nombre, la nature et l'ordre des acides
amines impliques dans cet ediIice moleculaire. La synthese des proteines doit tre executee
en suivant scrupuleusement un protocole extrmement precis transmis invariablement d'une
generation cellulaire a l'autre. L'inIormation qui permet la synthese de chaque proteine est
codee par un gene. Le gene ne permet pas la synthese directe d'une proteine, mais la synthese
d'ARN messager, qui sert d'intermediaire dans le processus de Iabrication de toutes les
proteines.
La deIinition precise du gne est : un segment d'ADN qui contient l'inIormation
necessaire a la synthese d'un ARN, et en general (si cet ARN est un ARN messager) d'une
proteine. Chaque gene a une position precise sur un chromosome. On appelle cette position le
locus du gene (au pluriel, loci). Il existe au moins 30000 genes diIIerents dans le genome
humain, c'est-a-dire dans l'ensemble du materiel genetique (ADN) humain. Certains genes
(environ 500 dans le genome humain) encodent des ARN ribosomaux et des ARN de transIert
qui n'encodent pas de proteines mais jouent un rle important dans leur synthese. Les autres
encodent des ARN messagers.
L'etape de synthese d'un ARN a partir d'un gene s'appelle transcription. L'etape au
cours de laquelle un ARN messager est lu pour synthetiser une proteine s'appelle traduction.
6.1 LE CODE GENETIQUE
Sachant que la sequence lineaire des acides amines d'une proteine correspond a une
sequence lineaire de bases de l'ADN, les chercheurs ont pu determiner le systeme de codage
ou code gntique qui permet de representer les 20 acides amines au moyen des 4 bases de
l'ADN (A, T, G, C). La logique conduit a penser qu'a chaque acide amine correspond non pas
une, mais plusieurs bases de l'ADN.
Si chaque acide amine etait represente par 2 bases (deux nucleotides successiIs), le
nombre de combinaisons possibles que l'on peut realiser, donc d'acides amines que l'on peut
131
coder, serait de 4
2
16 : ce qui est insuIIisant. Si un acide amine est code par un groupement
de 3 bases successives de l'ADN (un triplet), le nombre de combinaisons possibles est de 4
3
64. C'est la solution retenue par la nature. Il existe donc plus de triplets (64) que d'acides
amines codes (20). On aurait pu imaginer qu'un certain nombre de triplets ne correspondent a
aucun acide amine. Cette solution ne serait pas viable car 23 des triplets seraient non-sens et
la moindre mutation bloquerait la synthese des proteines. Dans la nature, plusieurs triplets
diIIerents peuvent speciIier le mme acide amine. On dit que le code est dgnr. Par
contre, un triplet donne code toujours le mme acide amine. Cette solution a l'avantage qu'une
mutation peut passer inaperue ou ne modiIier que legerement la sequence. Nous y
reviendrons.
Dans les annees 60, les chercheurs ont dechiIIre pas a pas le code, c'est-a-dire la
correspondance exacte entre chacun des 64 triplets et un acide amine. Ils ont pu montrer que:
- Trois triplets TGA, TAG et TAA ne correspondent a aucun acide amine et provoquent
l'arrt de la synthese proteique: ce sont les triplets de terminaison ou les triplets STOP.
- Seuls deux acides amines ne sont codes que par un seul triplet : la methionine (triplet
ATG) et le tryptophane (TGG).
- 9 acides amines sont codes par deux triplets diIIerents: dans ce cas la troisieme base est
soit T ou C (n'importe quelle base courte), soit A ou G (n'importe quelle base longue)
- A l'exception de l'isoleucine qui est codee par 3 triplets diIIerents, tous les autres acides
amines sont codes par au moins 4 triplets diIIerents et dans ce cas, les deux premieres
bases sont Iixes et la troisieme n'a plus d'importance (base "Ilottante"). C'est le cas de la
leucine: CTA, CTG, CTT, ou CTC.
Les triplets sont contigus et non chevauchants: une base ne Iait partie que d'un seul triplet.
Les recherches entreprises jusqu'ici concluent que le code genetique est universel;
autrement exprime : le mme triplet code le mme acide amin chez tous les tres vivants,
des bactries aux vgtaux et l'homme. Cette regle ne souIIre que de tres rares exceptions
dans les mitochondries et chez certains protozoaires, ou le code est legerement diIIerent.
6.2. LE MECANISME DE LA PROTEOSYNTHESE
L'ADN, situe dans le noyau, n'intervient pas directement dans la synthese des
proteines, qui se realise par l'intermediaire des ARNm qui sont produits dans le noyau et en
sortent avant d'tre traduits au niveau des ribosomes. Les autres types d'ARN, ARNt et ARNr,
interviennent aussi dans la synthese. Celle-ci est catalysee par des enzymes speciIiques et
l'energie necessaire aux diverses reactions biochimiques est Iournie par l'ATP et le GTP.
132
LA TRANSCRIPTION
La premiere etape est la transcription du "dialecte" ADN en "dialecte" ARN, deux
dialectes de 4 lettres (bases) tres voisins, appartenant au mme langage nucleique. Le passage
de l'un a l'autre est aise puisqu'il s'agit d'une simple copie ou transcription de mots genetiques
respectant l'ordre des lettres. A chaque base de l'ADN correspond une base de l'ARN. Les T
sont simplement remplaces par des U, et le desoxyribose des nucleotides par du ribose.
Un groupe d'enzymes ouvre l'ADN bicatenaire du gene en separant les deux brins, et
l'ARN-polymerase synthetise l'ARN
m
au contact d'un seul des deux brins de l'ADN par
accrochage successiI des bases complementaires. Le brin qui sert de matrice est appele par
convention brin ngatif. Il est complementaire de l'ARN. L'autre brin d'ADN est appele brin
positif, il est lui aussi complementaire du brin negatiI et correspond donc a la sequence de
l'ARN, les U etant remplaces par des T. Les unites de base dont se sert l'ARN-polymerase
sont des nucleotides triphosphates. Lors de l'accrochage, deux phosphates sont detaches du
nucleotide, ce qui libere l'energie necessaire a la Iormation du lien entre le nucleotide et
l'ARN en Iormation. Comme pour tous les acides nucleiques, l'ARN est Iabrique dans le sens
5' vers 3'. Dans les cellules eucaryotes, la synthese de l'ARN se deroule evidemment dans le
noyau.
#$%&
'()#*)#+)*+++)*+++#++#)**++###++##+##*+###*#))++**+))*#,,, -(.
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0
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LA MATURATION DE LARN MESSAGER
Chez les eucaryotes, l'ARN
m
est "retravaille" dans le noyau. Certaines sequences de
bases denommees introns sont excisees du message et les parties restantes, les exons, sont
ressoudees. Cette etape est appelee pissage de l'ARN (l'anglais "splicing" egalement utilise).
Un groupe chimique est ensuite ajoute au debut de l'ARN (sur l'extremite 5'), il s'agit de la
coiffe. En Iin de message, une sequence de 100 a 250 bases adenine appelee "poly A"
prolonge l'extremite 3'. On passe ainsi d'un ARN-premessager a l'ARN-messager. Ces
operations prennent du temps, si bien que l'ARNm eIIicace ne se retrouve dans le cytoplasme
133
qu'une vingtaine de minutes apres le debut de sa synthese. L'ARNm sort du noyau par les
pores nucleaires. Cette etape de maturation n'existe pas chez les bacteries.
LA TRADUCTION
Le groupe de trois bases de l'ARN
m
correspondant au triplet de l'ADN, s'appelle
CODOA. Chaque triplet ne pouvant tre transcrit qu'en un seul codon, chaque codon
correspond un seul acide amin. Il "suIIit" donc de lire les codons pour connatre la
sequence de la proteine correspondante. Voici, a titre d'exemple, le tableau des codons et
leurs acides amines correspondants.
1e 2e base 3e
U C A G
U
PHE
PHE
LEU
LEU
SER
SER
SER
SER
TYR
TYR
STOP
STOP
CYS
CYS
STOP
TRP
U
C
A
G
C
LEU
LEU
LEU
LEU
PRO
PRO
PRO
PRO
HIS
HIS
GLN
GLN
ARG
ARG
ARG
ARG
U
C
A
G
A
ILE
ILE
ILE
MET
THR
THR
THR
THR
ASN
ASN
LYS
LYS
SER
SER
ARG
ARG
U
C
A
G
G
VAL
VAL
VAL
VAL
ALA
ALA
ALA
ALA
ASP
ASP
GLU
GLU
GLY
GLY
GLY
GLY
U
C
A
G
ARN de transfert
La traduction se prepare dans le cytoplasme. Les ARNt prennent en charge un acide
amine bien speciIique qui est lie de Iaon covalente par une ligase qui utilise de l'ATP.
L'acide amine est toujours Iixe par son COOH a l'extremite 3' CCA de l' ARNt (voir schema
ci-dessous). Plusieurs ARNt portant des anti-codons diIIerents peuvent ainsi tre charges par
le mme acide amine. Certains ARNt peuvent aussi reconnatre plusieurs codons qui
correspondent au mme acide amine. Il existe en eIIet seulement 48 ARNt diIIerents chez
l'homme, pour 20 acides amines et 64 codons. Chaque ARNt possede une sequence de trois
nucleotides complementaires du codon correspondant a l'acide amine qu'il porte: l'anti-
codon. Cet anti-codon est localise dans une boucle a l'oppose de l'extremite qui porte l'acide
amine.
Dans ce tableau, les codons se
lisent de la gauche vers la
droite. Par exemple, PHE
correspond a UUU ou UUC.
134
Les ribosomes
La suite de la traduction se deroule au niveau des ribosomes du cytoplasme. Les
ribosomes sont visibles sous Iorme de petits grains au microscope electronique. Au depart, les
ribosomes ont ete isoles et etudies par sedimentation (mesuree en unites Svedberg S, cIr cours
de physique). En 2000, leur structure precise a ete determinee par cristallisation et diIIraction
aux rayons X. Ils sont constitues de deux sous-unites, appelees sous-unite lourde 60S et sous-
unite legere 40S (chez les eucaryotes). Chaque sous-unite contient une grande molecule
d'ARN ribosomal (ARNr 28S et 18S, pour les sous-unites lourde et legere, respectivement) et
des proteines. La sous-unite lourde contient deux petites molecules d'ARNr supplementaires
(5S). Les ARNr, qui representent deux tiers du poids du ribosome, constituent non seulement
sa charpente, mais aussi son site actiI. Plusieurs etapes essentielles de la synthese des
proteines sont en eIIet directement catalysees par les ARNr. Il s'agit donc d'un des rares
exemples d'activite enzymatique portee par un ARN et non par une proteine. Le ribosome est
une ribozyme. Le ribosome bacterien est tres semblable au ribosome eucaryote mais il est
plus petit (70S au total, deux sous-unites de 50S et 30S). Les ribosomes Ionctionnent de la
mme Iaon dans tous les tres vivants.
L'initiation de la traduction
L'initiation de la synthese de la proteine est relativement complexe. Ou commencer
la lecture de l'ARNm ? Une erreur de positionnement du premier codon entranerait la
production d'une proteine diIIerente puisque tous les codons seraient decales. Le codon
initiateur de la proteosynthese est AUG (triplet ATG de l'ADN). Il permet la mise en place
d'un ARN
t
AA particulier, dont l'anti-codon est CAU et qui est porteur de l'acide amine
methionine. Grce a l'intervention de 3 proteines particulieres (Iacteurs d'initiation) et d'un
Structure d'un ARNt
135
GTP Iournissant l'energie, la partie legere du ribosome s'associe a l'ARN
m
et a ce premier
ARN
t
Met. Ce complexe peut alors recevoir la partie lourde (60 S) du ribosome et devenir
Ionctionnel. Cet ensemble est localise sur le site P P pour "peptide" de la sous-unite lourde
60 S.
L'longation
Suit alors le cycle de l'elongation de la proteine. Chaque tour du cycle ajoute un acide
amine a la proteine naissante, et les mmes operations sont chaque Iois repetees, quelque soit
la longueur deja synthetisee de la proteine.
a) Un nouveau complexe ARN
t
AA vient se Iixer a l'ARNm au niveau du site A du
ribosome (A pour Acide Amine ou Accrochage), juste a cote du site P. Cette Iixation
consomme un GTP. Pour que cette Iixation ait lieu, il Iaut que l'anticodon de l'ARN
t
(les
3 bases non appariees de la boucle terminale) soit complementaire du codon de l'ARN
m
.
Il s'agit du codon adjacent a celui qui vient d'tre lu. Par exemple, au codon GAG de
l'ARN
m
se couple l'anticodon CUC de l'ARN
t
porteur de lacide glutamique (E).
b) Une enzyme du ribosome catalyse la Iormation d'un lien peptidique entre le COOH de
l'acide amine Met (ou de l'extremite COOH de la chane polypeptidique deja presente) au
site P et le NH
2
libre du nouvel acide amine au site A.
Cette reaction decroche la chane polypeptidique de l'ARN
t
(ici Met, M) Iixe au site P et
l'accroche a l'acide amine (Glu, E) de l'ARN
t
Iixe au site A.
La chane s'est ainsi allongee d'un nouveau maillon : Met - Glu.
c) Il se realise un "deplacement relatiI" du ribosome par rapport au complexe ARN
m
-ARN
t
-
proteine : l'ARN
m
"avance" d'un codon et deplace ainsi le complexe ARN
t
-peptide (ici
Met-Glu) du site A au site P. L'ARNt qui portait Met se retrouve au site E ("exit"), d'ou il
136
est expulse du ribosome. Ces mouvements necessitent un deuxieme GTP, expose un
nouveau codon au systeme de lecture du ribosome.
d) Le cycle recommence au point a). Si par exemple le nouveau codon lu est GUG, il y
aura liaison de l'anti-codon CAC de l'ARNt charge de la valine (Val) au site A. Il en
resultera un nouvel allongement de la chane polypeptidique : Met - Glu - Val, et ainsi de
suite.
Ainsi, tandis que l'ARN
m
est lu de bout en bout par le ribosome, les acides amines
correspondants se lient les uns aux autres, dans un ordre determine, realisant au Iur et a
mesure de leur agencement, les structures secondaires et tertiaires de la proteine.
La terminaison
L'elongation de la chane s'arrte (terminaison) quand est reconnu au niveau du site A
un des 3 codons UAA, UAG, UGA (provenant des triplets TAA, TAG, TGA), auxquels ne
correspondent pas d'ARNt mais une proteine appelee facteur de terminaison. A ce moment,
le complexe enzymatique qui liait les acides amines agit comme une hydrolase et decroche la
proteine terminee de l'ARN
t
.
La partie d'une sequence d'acide nucleique (ARN ou ADN) qui va du codontriplet de
depart AUGATG jusqu'au STOP s'appelle le cadre ouvert de lecture (open reading Irame
ou ORF en anglais). C'est la seule partie du gene et de l'ARN qui code pour la proteine. Les
autres parties du gene (introns, sequence avant le depart et apres le stop) sont dites non
codantes.
Les diIIerentes parties impliquees Iinalement dans cette chane metabolique, a savoir :
la sous-unite lourde, la sous-unite legere, l'ARN
m
ainsi que le dernier ARN
t
, se separent alors
137
simultanement. L'ARNm pourra tre traduit une deuxieme Iois par un autre ribosome, ou tre
degrade en nucleotides monophosphate.
6.3. LIEUX DE PRODUCTION ET TRAFIC
Certaines proteines restent dans le cytoplasme, d'autres sont exportees. Les premieres
sont synthetisees par les ribosomes libres du cytoplasme, les secondes, par ceux du RE
rugueux.
A quel niveau et comment se realise cette distinction ? L'explication de BLOBEL et
DOBBELSTEIN est la suivante :
La synthese des proteines a exporter debute sur des ribosomes libres du cytoplasme.
La premiere sequence synthetisee, longue de 20 a 30 acides amines, appelee squence signal
est composee d'acides amines hydrophobes. Une particule de reconnaissance du signal bloque
la suite de la synthese et accroche la partie lourde du ribosome au RER, au complexe de
translocation, constitue de proteines transmembranaires, au travers desquelles la sequence
signal s'insinue jusque dans la lumiere du RER, comme un Iil dans le chas d'une aiguille. La
synthese de la proteine reprend et elle sort lineairement de la partie lourde du ribosome et
migre directement dans la cavite du RE. Les reploiements que la chane polypeptidique subit
ulterieurement dans la cavite du RE l'empcheront de ressortir vers le cytoplasme. La
sequence signal est alors excisee pour obtenir la proteine deIinitive.
Les proteines Iabriquees sur le RE sont ensuite envoyees dans l'appareil de Golgi, ou
elles subissent une glycosylation (accrochage de residus sucres) et sont exportees:
- vers l'exterieur (secretion);
- vers certains organites, il s'agit notamment des enzymes des lysosomes;
- vers la membrane plasmique (certaines proteines transmembranaires);
- certaines proteines retournent dans le RE.
Rappelons aussi que les mitochondries et les chloroplastes, disposant d'ADN et de ribosomes
sont capables d'une semi-autonomie et donc de synthetiser une partie de leurs proteines. Les
autres sont synthetisees entierement dans le cytoplasme, puis transIerees dans la
mitochondrie ou le chloroplaste par un mecanisme de translocation complexe.
Notons aussi que les proteines destinees a la matrice du noyau (histones, polymerases.) sont
synthetisees dans le cytoplasme et rentrent dans le noyau par les pores nucleaires.
6.4. DEGRADATION DES PROTEINES
La synthese des proteines est extrmement contrlee et precise. Cependant, il arrive
que le ribosome "se trompe" avec une Irequence relativement Iaible (de l'ordre d'11000). Le
remplacement d'un acide amine par un autre suite a une erreur peut tre sans consequence
138
pour la proteine, si cet acide amine n'est pas essentiel pour sa structure et sa Ionction. Une
seule interversion peut aussi empcher la proteine d'acquerir sa Iorme deIinitive. Dans ce cas,
cette proteine doit tre eliminee.
Certaines proteines cellulaires peuvent aussi, suite a un stress par exemple, tre
dnature, c'est-a-dire qu'elles perdent leur structure tertiaire. Une proteine denaturee peut
rarement recuperer sa Iorme initiale et doit tre degradee, au mme titre que les proteines mal
synthetisees. En regle generale, toutes les proteines cellulaires sont remplacees regulierement,
la duree de vie moyenne des proteines de l'organisme variant entre une heure et quelques
jours. Certaines proteines particulierement resistantes, comme les immunoglobulines
(anticorps) presentes dans le sang peuvent rester Ionctionnelles pendant quelques mois.
Il existe aussi une serie de situations ou la cellule doit se debarrasser de certaines
proteines. Chaque etape du cycle cellulaire (G1, S, G2 et M) est contrlee par certaines
enzymes regulatrices (des proteine-kinases) qui doivent tre eliminees pour passer au stade
suivant.
Les proteines qui doivent tre degradees - soit parce qu'elles sont denaturees, soit
parce que la cellule veut s'en debarrasser - sont marquees par couplage covalent avec une
petite proteine appelee ubiquitine. Ce processus, appele ubiquitination, permet de
reconnatre les proteines qui doivent tre detruites.
Le principal systeme de degradation des proteines dans tous les organismes vivants,
des bacteries aux hommes, est appele le protasome. Il s'agit d'un assemblage de proteines en
une espece de tube. A une extremite, les chanes polypeptidiques des proteines ubiquitinees
qui doivent tre degradees sont deroulees (denaturees), aIin de Iaire rentrer la chane dans le
tube du proteasome. Cette etape consomme de l'energie sous Iorme d'ATP. Au centre du
proteasome se trouve une serie de proteases (hydrolases) qui decoupent la proteine en
peptides d'une dizaine d'acides amines, qui ressortent a l'autre bout du tube. Le proteasome se
comporte donc comme un hachoir a proteines. On ne le distingue pas au microscope
electronique classique, mais sa structure a ete determinee avec precision par diIIraction aux
rayons X. Il existe de tres nombreux proteasomes dans une cellule. La masse totale des
proteasomes cellulaires represente environ 1 de toutes les proteines cellulaires.
Les peptides generes par le proteasome sont ensuite degrades en acides amines par
d'autres proteases, notamment dans le cytoplasme. Les acides amines peuvent ensuite tre
recycles (couples a des ARNt pour servir a synthetiser d'autres proteines), ou tre metabolises
(transIormes en d'autres acides amines, en sucres, en lipides ou en energie).
139
6.5. CONTROLE DE L'EXPRESSION DES GENES
L'ADN de toutes les cellules d'un individu renIerme l'inIormation necessaire a la
synthese de toutes les proteines dont l'organisme entier peut avoir besoin. Parmi ces
proteines, certaines n'interviennent qu'exceptionnellement, ou uniquement dans certaines
cellules ou certains organes; d'autres enIin, ne sont necessaires qu'en quantite tres Iaible.
Il doit donc exister un systme de rgulation de la proteosynthese au sein de la
matiere vivante qui permette a une cellule de disposer au moment opportun de la quantite de
proteines dont elle a besoin et d'en arrter la production au moment ou elle n'en a plus besoin.
La quantite de chaque proteine dans la cellule est contrlee a diIIerents niveaux.
Globalement, elle depend de l'equilibre entre le niveau de synthese de la proteine et sa
degradation.
- Nous venons de voir que les proteines sont recyclees dans la cellule. Pour un rythme de
production similaire, les proteines dont la duree de vie est courte seront donc presentes en
plus Iaibles quantites que les proteines tres stables.
- La Iabrication d'une proteine donnee par la cellule depend avant tout de l'expression du
gene correspondant, c'est-a-dire du nombre de molecules d'ARNm Iabriquees par ce gene.
- La duree de vie de chaque ARNm peut egalement tre modulee. Si un ARNm a une duree
de vie longue, il sera traduit un plus grand nombre de Iois et permettra donc la synthese de
plus de proteine.
L'expression d'un gene depend du rythme avec lequel l'ARN-polymerase va transcrire
ce gene pour produire l'ARNm correspondant. Ceci depend tout d'abord de l'accessibilite du
gene, c'est-a-dire de l'etat de la chromatine a l'endroit ou se trouve le gene. Pour qu'un gene
soit transcrit, il est en eIIet necessaire que la chromatine puisse tre deroulee et que les
histones de decrochent. Une serie de mecanismes regulateurs complexes permet de
determiner dans une cellule quels genes sont accessibles et quels genes ne le sont pas.
Si le gene est accessible, son expression depend principalement de son promoteur :
une sequence d'ADN situee juste avant la partie transcrite du gene (exons et introns). La taille
d'un promoteur est souvent diIIicile a determiner avec precision : quelques centaines de
paires de bases, en general. Chaque promoteur contient deux types d'inIormation :
- le promoteur indique le debut de la partie transcrite du gene (debut de l'exon 1) par
une sequence particuliere, appelee "bote TATA" (ou TATA box en anglais), sur laquelle
l'ARN-polymerase vient s'accrocher et commence son travail.
- en amont de cette sequence se trouvent une serie de sites de Iixation pour des
proteines particulieres appelees facteurs de transcription. La presence de ces Iacteurs de
transcription est necessaire pour activer l'ARN-polymerase.
140
Il existe des centaines de Iacteurs de transcription diIIerents, qui contrlent
l'expression de genes diIIerents. Chaque Iacteur se Iixe sur un motiI diIIerent de l'ADN. Par
exemple, le Iacteur de transcription SREBP2 active la transcription de tous les genes qui
codent pour les enzymes de la synthese du cholesterol en se Iixant sur le motiI suivant, qui se
trouve (souvent legerement modiIie) dans le promoteur de tous ces genes :
5' ATCACCCCAC
3' TAGTGGGGTG
De cette Iaon, la cellule peut augmenter la quantite d'enzymes qui synthetisent le cholesterol
simplement en activant le Iacteur de transcription SREBP2.
La transcription d'un gene peut egalement tre inIluencee par des rpresseurs: ces
proteines Ionctionnent comme des Iacteurs de transcription, en se Iixant sur le promoteur,
mais inhibent l'ARN-polymerase au lieu de l'activer.
Retenons donc que le promoteur est une sequence du gene qui n'est pas transcrite ni
traduite, mais qui contrle l'expression du gene, en donnant le point de depart de la
transcription et en recrutant des Iacteurs de transcription et des represseurs, qui determinent
l'intensite de la transcription du gene.
6.6. SYNTHESE DES PROTEINES CHEZ LES PROCARYOTES
La synthese des proteines Ionctionne de la mme Iaon dans tous les organismes
vivants, sur base du mme code genetique. L'equation : gene (ADN) ARN Proteine est
donc valable pour tous les regnes. Certaines diIIerences existent cependant, principalement
entre eucaryotes et bacteries :
(1). Il n'y a pas d'intron dans les genes bacteriens, et pas de maturation de l'ARN messager
chez les procaryotes: ni epissage, ni coiIIe, ni polyadenylation. L'ARN commence par
l'extremite triphosphate du premier nucleotide.
(2). Comme il n'y a pas de noyau dans les procaryotes, et que l'ARNm ne doit pas tre
mature, sa traduction peut commencer avant mme qu'il soit termine. De plus, un seul ARN
m
peut s'inserer sur plusieurs ribosomes (polysome) ; cela signiIie que, lorsqu'un ribosome a
reconnu le message Iourni par l'ARN
m
et a participe a la Iormation d'une proteine, plusieurs
autres ribosomes peuvent Iaire de mme et concourir a la Iormation d'une mme proteine. De
ce Iait, plusieurs ribosomes portant des polypeptides a divers degres d'achevement peuvent
tre enIiles sur le mme ARN
m
.
(3). Un mme promoteur gere generalement plusieurs genes (cistrons) d'une voie
metabolique commune, regroupes en un opron. Les genes d'un operon donne sont contrles
ensemble : ils sont transcrits en un seul ARNm. Cet ARN messager polycistronique contient
141
donc plusieurs cadres de lecture, chacun possedant son site d'attachement au ribosome, son
codon d'initiation et son codon de terminaison. Il sera donc traduit en plusieurs proteines.
(4). Les ribosomes Ionctionnent de la mme Iaon mais sont plus petits chez les procaryotes
(sous-unites de 50S et 30S au lieu de 60S et 40S chez les eucaryotes). Les bacteries
contiennent egalement des proteasomes.
(5). Les bacteries utilisent la Iormyl-methionine au lieu de la methionine pour l'initiation de la
synthese proteique (codon AUG).
Notons que les archeobacteries presentent des caracteristiques intermediaires entre les
bacteries et les eucaryotes. Elles sont depourvues de noyau, mais possedent des introns dans
certains genes et utilisent la methionine lors de l'initation.
142
Questions de reflexion .
3.1- Faites un schema d`une mitochondrie en y indiquant toutes les voies biochimiques qui
s`y deroulent.
3.2- Ou sont synthetisees les enzymes mitochondriales ?
3.3- Expliquez la structure de la membrane plasmique d`une cellule humaine en y indiquant
tous ses constituants. Expliquez sur le mme schema comment l`ion sodium peut passer cette
membrane et dans quelle direction.
3.4- Expliquez comment le glucose passe la membrane plasmique, dans quel sens, et quelle
est l`inIluence de l`hexokinase sur ce passage. Que se passe t'il si la concentration en glucose
dans la cellule excede la concentration en glucose a l'exterieur ?
3.5- Ou le collagene est-il synthetise ? Comment est-il secrete ?
3.6- Quelle voie biochimique transIorme les acides gras en glucose et vice-versa ?
3.7- Comparer l`ATP synthetase de la mitochondrie avec un transporteur actiI d`ions
(NaK, par exemple).
3.8- Comment la cellule peut-elle produire de l`energie (ATP) en absence d`oxygene ? Dans
quelle partie de la cellule cela se produit-il ? Quel est le rle physiologique de cette voie chez
les mammiIeres ?
3.9- Soit une translocation reciproque entre deux chromosomes dont les points de cassures si
situent dans un intron du gene BCR et dans un intron du gene ABL. Expliquez a l`aide d`un
schema la structure de ces genes apres translocation (promoteur et exons). Deduisez-en la
structure des deux proteines correspondantes si les cadres de lecture restent en phase.
3.10- Expliquez toutes les etapes de la traduction de l`ARN messager suivant :
CGGUGCAAGAUUUAUGAAGGAGUGAUAGCAUUUAUAAAAAAAAAAAAA
3.11- Quels sont les constituants des ribosomes et ou sont-ils synthetises ?
3.12- Deux cellules animales peuvent-elles echanger des proteines ? des ions ? Expliquez.
Comparez avec les cellules vegetales.
143
Quatrime Partie
GENETIQUE
Obfectifs .
- Comprendre pourquoi nous sommes tous diIIerents
- Comprendre comment les caracteres sont transmis des parents aux enIants et tre capable de
resoudre des exercices de genetique mendelienne
- Comprendre le mecanisme de la meiose et pouvoir l`appliquer a la genetique mendelienne.
1. INTRODUCTION
HIS1ORIQUE E1 DEFIAI1IOAS
La gntique est la science qui etudie l'heredite, qui la transmission des caracteres
d'une generation a l'autre, par l'intermediaire des genes. L'ensemble des caracteres d'un
individu est appele son phnotype. Le phenotype d'un individu ne depend pas seulement de
la nature de ses genes (gnotype), mais evidemment aussi du milieu dans lequel il vit.
Par exemple, chez les lapins, il existe une race russe denommee "Himalaya". Ce
phenotype particulier est hereditaire. Les individus ont le corps recouvert de poils blancs,
sauI aux extremites qui sont recouvertes de poils noirs. Si on rase les poils blancs d'une partie
du corps et que l'on place l'animal dans une chambre Iroide, les poils qui repousseront seront
noirs. Inversement, si l'on rase les poils des oreilles et que l'on recouvre celles-ci d'un
bandage pour les maintenir a une certaine temperature, les nouveaux poils Iormes seront
blancs. Ce n'est donc pas la couleur qui est heritee mais l'inIormation pour Iormer ou non des
pigments selon la temperature de la region du corps. Et si, dans les conditions naturelles, le
lapin montre des extremites du corps noires, c'est que la circulation sanguine y est moins bien
assuree et maintient dans ces regions une temperature qui permet la Iormation du pigment
noir.
Dans l'etat actuel de nos connaissances, l'heredite trouve son explication au niveau
moleculaire, d'ou son nom de gntique molculaire. Mais il n'en a pas toujours ete ainsi. Au
milieu du XIX
e
siecle, MENDEL demontra que les caracteres ne se transmettaient pas
directement, mais que c'etaient des "Iacteurs" contenus dans les cellules qui se transmettaient.
La nature de ces "Iacteurs" etait inconnue. La premiere etape Iut de decouvrir quelle etait la
nature du materiel genetique.
144
Un premier pas Iut Iranchi lorsque plusieurs scientiIiques redecouvrent les lois de
Mendel vers 1900. Ils avaient vu au microscope les chromosomes passant au travers de la
mitose et de la meiose et en ont conclu que les "Iacteurs" de MENDEL ne pouvaient tre que
des morceaux de chromosomes puisqu'ils suivaient les mmes lois de transmission.
L'analyse chimique montra que les chromosomes etaient Iormes de deux composes,
l'ADN et les proteines. Instinctivement, les chercheurs estimerent que l'ADN etait une
molecule trop simple que pour tre le support d'une inIormation tellement riche (elle ne
comprenait que 4 monomeres diIIerents et sa structure lineaire etait inconnue), tandis que les
proteines, elles, presentaient tellement de variabilite dans leur structures, dans leurs Iormes,
que c'etait de leur cte qu'il Iallait pousser les recherches.
Bien que les acides nucleiques soient connus depuis 1868 (MIESCHER), leur rle
biologique, ne Iut reconnu que plus d'un demi-siecle plus tard. Des 1928, GRIFFITH,
travaillant sur la bacterie de la pneumonie, (Streptococcus pneumoniae) decouvre le transIert
d'inIormation genetique d'une bacterie a l'autre. Ces pneumocoques ne sont virulents que s'ils
possedent une capsule gelatineuse, polyosidique, qui les protege de la phagocytose par les
macrophages. En culture, l'aspect de leurs colonies est lisse. On connat des souches
diIIerentes, genetiquement stables, caracterisees par la nature de leur capsule et designees par
S
1
,S
2
,S
3
... (Ssmoothlisse).
Environ une cellule S sur dix millions donne naissance a une colonie rugueuse du type
R (R rough rugueux), dont les cellules sont sans capsule et non-virulentes. Il s'agit d'une
mutation, comme nous le verrons plus loin. Les types S et R sont hereditaires et se
transmettent de generation en generation. Les cellules R peuvent subir une mutation inverse
et redonner le type S. Mais dans ce cas, le type S Iinal est identique au type S initial (S3 peut
donner R3, qui redonnera S3).
Si on injecte des bacteries R (non virulentes) a une souris, elle demeure en vie. De
mme, si on injecte des bacteries S mortes (tuees par la chaleur), la souris demeure aussi en
vie. Mais si l'on injecte simultanement des bacteries S
3
tuees et des R
2
vivantes, la souris
meurt de pneumonie et l'on retire de cette souris, des bacteries S
3
vivantes. Or ces S
3
ne
peuvent pas avoir ete produites par mutation de R
2
!
R
2
S
3
tuees S
3
vivantes
On pouvait en conclure que les bacteries S, detruites par la chaleur, contiennent une
substance capable de modiIier les potentialites hereditaires de R en transIormant precisement
R non virulent en S pathogene. GRIFFITH crut que ce "principe transIormant" etait un des
constituants de la capsule.
145
Il a Iallu attendre jusqu'en 1944 pour que AVER, MAC LEOD , ET MAC CART
identiIient le "principe transIormant" a l'ADN. Par des methodes chimiques, ils extraient
l'ADN de cellules S puis l'injectent en mme temps que des cellules R vivantes, a des souris.
Celles-ci meurent de pneumonie et l'on en retire des cellules S vivantes. Or, ni cet ADN
prealablement degrade par l'ADNase (enzyme qui hydrolyse l'ADN), ni un quelconque extrait
ou constituant macromoleculaire (proteine) de S ne possedent ce pouvoir de transIormer R en
S. C'est donc bien l'ADN intact qui est capable d'induire des phenomenes hereditaires et
donc:
R
2
ADN de S
3
S
3
.
L'ADN extrait dans ces experiences n'etait pas pur a 100 et il Iallut des etudes
complementaires (HERSHE et CHASE, 1952) sur la replication des virus bacteriens T
2
(bacteriophages ou phages) a l'interieur de la cellule-hte pour prouver deIinitivement que
l'ADN etait bien le materiel hereditaire.
Ces bacteriophages sont des virus dissymetriques constitues d'une tte et d'une queue,
limites par une enveloppe proteinique et renIermant une matrice egalement de nature
proteinique. La tte contient de l'ADN. Il n'y a donc que de l'ADN et des proteines dans ces
phages. On peut se demander si ces deux composants sont necessaires a la production de
nouveaux individus, ou si un seul suIIit pour constituer le materiel genetique.
L'ADN contient beaucoup de phosphore, mais pas de souIre. Il peut donc tre marque
au
32
P. Inversement, les proteines contiennent beaucoup de souIre et peuvent tre
diIIerenciees par marquage au
35
S. En incorporant dans le milieu de culture, soit du
35
S, soit
du
32
P, on obtiendra des phages qui seront radioactiIs soit au niveau de leurs proteines (riche
en S) soit au niveau de leur ADN (riche en P).
Lorsque des phages marques au
32
P inIectent des bacteries non radioactives, celles-ci
le deviennent et cette radioactivite est transmise a la generation suivante de phages. Lorsque
des phages marques au
35
S inIectent des bacteries, celles-ci ne deviennent pas radioactives, et
on retrouve cette radioactivite dans les enveloppes vides.
Ces deux experiences montrent que seul l'ADN du phage a ete injecte a la bacterie
(alors que la capsule vide, ou Iantme est restee au dehors) et contient a lui seul l'inIormation
necessaire a la reconstitution de l'ADN et des proteines des nouveaux phages Iormes, avec
leurs caracteres morphologiques et leur pouvoir inIectieux.
L'ADN est donc la substance Iondamentale des genes qui contrlent la synthese des
proteines selon un mecanisme que nous avons deja explique.
146
CEAIE CEAE1IQUE
Les experiences de AVER, MAC LEOD , ET MAC CART ouvrirent de nouvelles
possibilites en recherche, et servirent de base au genie genetique moderne. Le Iait qu'on
puisse transIormer une bacterie avec de l'ADN est en eIIet utilise dans tous les laboratoires de
biologie moleculaire et de genetique moderne.
On peut aussi ajouter un gene dans des cellules eucaryotes : ce processus est appele
transIection. Plus recemment, certains chercheurs ont decouvert le moyen d'ajouter ou
supprimer un gene dans un organisme entier (mas, souris, rat, porc, saumon.), produisant
des organismes transgeniques. Nous parlerons de ces nouveaux developpements dans le
dernier chapitre de la partie "genetique".
CEAES & CEAOMES
Le segment d'ADN responsable de l'exteriorisation d'un caractere est appelee gne.
Nous preciserons ulterieurement cette notion. L'ensemble du materiel genetique (et donc de
l'ADN) caracteristique d'une espece est appele gnome. Il contient donc tous les genes ainsi
que les sequences d'ADN qui se trouvent entre les genes. Ces sequences sont souvent
repetitives et de longueur tres variable (parIois tres longues) chez les animaux et les plantes
les plus evolues. Le genome des mammiIeres atteint 3 milliards de paires de bases (pour une
copie), et contient environ 30000 genes diIIerents (ce nombre n'est pas encore determine avec
certitude, les estimations actuelles vont de 25000 a 40000 genes).
Les bacteries possedent dix Iois moins de genes - entre 500 et 5000 - contenus dans
un genome mille Iois plus petit: 0,5 a 5 millions de paires de bases. Les genes bacteriens sont
en moyenne un peu plus petits, du Iait de l'absence d'intron, et les sequences d'ADN qui
separent les genes sont beaucoup plus courtes.
Le genome humain a ete sequence recemment. En 2000, une premiere version du
genome a ete publiee, couvrant la majorite de l'ADN correspondant a l'euchromatine
humaine. Cette version a ete amelioree en 2004. Les genomes de nombreux organismes sont
maintenant sequences partiellement ou totalement, notamment ceux de la souris, du rat, du
chimpanze, du porc, de la drosophile, de la levure, du riz, du protiste responsable de la
malaria (plasmodium falsiparum) et de nombreuses bacteries. La liste des genomes decryptes
s'allonge chaque annee. Notons que le genome des plantes est aussi riche et complexe que
celui des animaux, et que les genes du chimpanze sont presque 99 identiques aux ntres.
Ces etudes ont un impact considerable sur la recherche biologique et medicale.
L'heterochromatine possedent des sequences tres repetitives qui sont techniquement
diIIiciles a sequencer. Elle contient tres peu de genes et son rle n'est pas bien compris.
147
Rappelons qu'elle est visible dans le noyau en microscopie electronique sous Iorme d'amas
denses.
HEREDI1E & REPRODUC1IOA
Puisque nous savons actuellement que le materiel hereditaire est l'ADN, il nous suIIit
de connatre comment s'opere la transmission de l'ADN de generation en generation.
Chez les tres unicellulaires, la division et la reproduction s'eIIectuent simultanement.
La transmission de l'inIormation s'opere par la simple duplication de l'ADN : les deux
cellules-Iilles sont identiques entre-elles et identiques a la cellule-mere (certains phenomenes
complexes de conjugaison, transduction et transIormation permettent cependant aux bacteries
de Iaire varier leur potentiel genetique). La genetique microbienne ne sera pas abordee ici.
Nous y Ierons parIois reIerence quand elle nous permet de mieux comprendre ce qui se passe
chez les eucaryotes.
Chez les organismes pluricellulaires, tous eucaryotes, la mitose permet la
"multiplication cellulaire" tandis qu'une nouvelle generation ne peut apparatre que suite aux
phenomenes tres importants de meiose et de Iecondation.
Ces mecanismes doivent tre bien assimiles par l'etudiant avant d'entreprendre toute
etude de la genetique...(qu'elle soit moleculaire ou mendelienne).
148
2. LA REPRODUCTION
2.1. LES MODES DE REPRODUCTION
Nous avons vu dans l'introduction qu'une des caracteristiques essentielles des tres
vivants est leur capacite a se reproduire. La reproduction sexuee nous apparat d'emblee
comme "le" moyen de multiplier les tres vivants. Or elle n'est pas toujours indispensable;
elle ne Iut pas la premiere; elle n'est pas la plus econome en moyens consacres a cet objectiI.
Pourquoi donc s'est elle imposee tant chez les animaux que les vegetaux?
Chez les tres primitiIs, unicellulaires, la simple mitose suIIit a produire deux
individus identiques a partir d'un seul. Le procede est Iiable et econome. Mais les deux
nouveaux individus sont non seulement identiques entre eux mais identiques a la cellule
mere. Le seul moteur d'evolution possible, se trouve dans le hasard des mutations, dont nous
verrons qu'elles sont generalement deIavorables.
La reproduction asexue et multiplication vgtative
La multiplication vgtative est de rigueur chez beaucoup d'organismes inIerieurs
(bacteries, champignons). Elle assure la reproduction de l'espece par le developpement de
certains Iragments de l'organisme mere. Elle ne necessite pas obligatoirement la production
d'organes specialises: les boutures de nos plantes superieures en sont un exemple. Ces
dernieres sont possibles grce a la totipotence des cellules vegetales, c'est-a-dire la capacite
qu'a chacune d'elles de regenerer un organisme complet. Mais d'une part, certaines plantes
ont developpe des organes specialises dans la reproduction vegetative (stolons du Iraisier,
bulbilles) et d'autre part des animaux (hydres, vers marins) sont capables de regenerer deux
individus entiers si on les coupe en deux. Ce type de reproduction produit des jeunes
genetiquement identiques a leurs parents.
Chez les vegetaux, la reproduction de l'espece peut se Iaire par reproduction asexuee
ou agame, grce a des cellules speciales denommees spores produites par l'organisme parent.
Disseminees, les spores donnent naissance a des individus nouveaux.
EnIin, la parthnogense chez certains animaux resulte du developpement d'oeuIs
non Iecondes, donnant des individus ayant un seul parent. C'est la cas de certains lezards.
149
La reproduction sexue
La reproduction sexuee est un cycle qui implique la constitution de lignees
germinales specialisees (rappelons qu'on distingue parmi les cellules d'un organisme, des
cellules germinales, dont le rle est de participer a la reproduction de l'individu et des
cellules somatiques, qui Iorment le corps, le reste de l'individu). Les organismes Iorment des
cellules reproductrices, des gamtes qui s'uniront 2 a 2 selon un processus denomme
fcondation pour Iormer un oeuf ou zygote. La Iecondation implique successivement l'union
des cytoplasmes et la Iusion des noyaux.
Chaque gamete, possede un nombre haplode de chromosomes n, le zygote possedera
un nombre diplode (2n) de chromosomes. Il se divisera en un certain nombre de mitoses
somatiques diplodes successives pour donner un nouvel individu. Pour passer a la
generation suivante, l'individu doit donc produire a son tour des gametes haplodes (n
chromosomes) alors qu'il est diplode. Un processus special appele miose permet de
repasser de 2n a n chromosomes.
Attention : la miose ne produit pas forcment des gamtes. Cela ne se passe que
chez les animaux. Dans les autres regnes vivants qui utilisent la reproduction sexuee
(vegetaux, mycetes), la meiose produit des spores. Les spores se developpent en un nouvel
individu haplode, diIIerent de celui qui les a produit. C'est cet individu la qui va produire
des gametes, lesquels par Iecondation deviennent le point de depart d'un nouvel organisme
diplode.
Fecondation et meiose se presentent donc comme deux mecanismes compensateurs
qui assurent la permanence du lot chromosomique au cours des generations successives en
Iaisant alterner cycliquement les phases haplodes et diplodes. Nous en verrons quelques
illustrations dans les cycles de developpement.
Il y a isogamie lorsque la reproduction sexuee s'eIIectue entre des gametes
semblables (de Iorme, de taille, de structure generale). Ce mode de reproduction primitiI
n'existe que chez certains thallophytes et mycetes. Il y a htrogamie lorsque la reproduction
sexuee se Iait entre deux gametes diIIerents:
- le gamete mle est nomme spermatozode chez les animaux. Il est petit, pauvre en
cytoplasme, generalement mobile; il penetre dans le gamete Iemelle pour assurer la
Iecondation.
- le gamete Iemelle denomme ovule chez les animaux.
2.2. LES AVANTAGES DE LA REPRODUCTION SEXUEE
Quand un organisme se reproduit de Iaon asexuee, la grande energie investie dans la
descendance est utilisee eIIicacement car celle-ci a de Iortes chances d'arriver a l'etat adulte.
Par contre la reproduction sexuee semble un gaspillage enorme (le pourcentage de
150
spermatozodes "utiles" sur une vie humaine est ridiculement Iaible; il suIIirait de deux
pepins sur la vie d'un pommier pour disseminer l'espece; quelle est l'energie depensee par un
mle pour trouver et garder une harde de Iemelles?).
Ces desavantages energetiques certains sont compenses des points de vue adaptation
et evolution:
- Du point de vue des individus, la Iecondation est associee dans l'evolution a la
creation d'tres vivants diplodes qui additionnent les qualites apportees par chacun
des potentiels genetiques des gametes. De plus, l'etat diplode permet de surmonter
les eIIets neIastes d'une mutation negative: l'inIormation intacte peut Ionctionner a
elle seule de maniere suIIisante (voir mutations recessives).
- La meiose redistribue les inIormations genetiques au hasard dans la descendance: les
enIants sont diIIerents entre eux et diIIerents de leurs parents. Chaque enIant herite
d'une partie des caracteres de la mere et du pere, creant une combinaison nouvelle.
Les meilleures combinaisons genetiques procurent un avantage selectiI. Ce systeme
permet une evolution rapide des especes et augmente donc les chances de survie de
l'espece (au detriment des l'individus). Tous les gametes produits sont diIIerents. Si
les conditions changent brutalement, il y a plus de chance qu'une des nouvelles
combinaisons produites soit eIIicace dans le nouvel environnement.
2.3. LES CYCLES DE DEVELOPPEMENT
Le cycle de developpement de tout tre sexue est donc caracterise par la Iecondation
qui double le nombre de chromosomes et la meiose qui reduit de moitie le nombre double par
la Iecondation. Ces deux phenomenes partagent le cycle en deux phases distinctes : la phase
haplode comprenant l'ensemble des generations cellulaires haplodes (ne possedant qu'un lot
unique de chromosomes) et la phase diplode comprenant l'ensemble des generations
cellulaires diplodes (contenant un lot double de chromosomes).
De ce qui precede, il est evident que l'evolution a selectionne progressivement les
organismes ou la phase haplode est la plus courte. Chez les animaux, cette phase est reduite
aux gametes produits directement par la meiose. Chez les vegetaux, on distingue encore une
alternance de phases. La phase haplode commence a la meiose et s'acheve a la Iecondation;
on l'appelle gamtophyte car c'est la partie de la plante qui Iorme les gametes haplodes pour
la Iecondation. La phase diplode debute a la Iecondation et s'acheve a la meiose, c'est le
sporophyte ou partie de la plante qui Iorme les spores capables de se developper seules, en
une plante haplode. Selon l'importance relative des phases, on peut distinguer 3 cycles.
151
Le cycle diplophasique :
L'individu est diplode. Les cellules de la lignee germinale subissent la meiose et produisent
directement les gametes. L'etat haplode est reduit aux gametes. La Iecondation unit les
gametes en un oeuI diplode qui se developpe en un nouvel individu egalement diplode. La
reduction precede donc immediatement la gametogenese et la Iecondation. Ce cycle se
rencontre chez tous les animaux pluricellulaires (depuis les spongiaires jusqu'aux
mammiIeres), ainsi que chez certaines algues (Fucus).
Le cycle haplophasique :
La plante est haplode. Les gametes sont directement produits par la plante et s'unissent en
zygote. Les deux premieres divisions de l'oeuI constituent la meiose, et il se Iorme une
nouvelle plante haplode. L'etat diplode est reduit au zygote. La reduction suit donc
immediatement la Iecondation. Ce cycle de developpement se rencontre chez les
champignons et certaines algues Iilamenteuses (Spirogvra).
Le cycle haplo-diplophasique
La plante comporte deux phases vegetatives. Une premiere debute a la meiose et se termine a
la Iecondation : c'est le gamtophyte qui contient les noyaux haplodes et qui produit les
gametes lors de la gametogenese. Une seconde commence a la Iecondation et se termine a la
meiose : c'est le sporophyte qui contient les noyaux diplodes. La lignee germinale y subit la
sporogense comprenant la meiose donnant ainsi les spores haplodes. Ces dernieres
redemarrent la phase haplode. L'organisme est haplo-diplophasique. Ce cycle se rencontre
chez la plupart des plantes.
Remarquons dans ce cycle que:
- la meiose ne se Iait ni juste avant, ni juste apres la Iecondation, une phase vegetative les
separe toujours;
- la meiose ne donne donc pas directement des gametes comme chez les animaux;
- l'appareil vegetatiI de la plante est represente soit par le gametophyte, soit par le
sporophyte, soit par les deux. Dans les plantes superieures (angiospermes), la phase haplode
est reduite aux organes reproducteurs de la Ileur.
2.4. LA MEIOSE
La cellule qui entre en meiose est Iorcement diplode. Elle descend de l'oeuI diplode
cree par la Iecondation. Son lot de chromosomes est double. Tous les chromosomes Iorment
des paires homologues, quasi identiques 2 a 2, dont un exemplaire provient du gamete d'un
sexe, et l'autre du gamete de l'autre sexe. L'objectiI de la meiose est de produire des cellules
contenant un et un seul chromosome de toutes ces paires homologues.
152
Une interphase premeiotique qui a double l'ADN precede la meiose (cIr phase S du cycle
cellulaire et replication de l'ADN), qui comporte deux caryocineses successives:
- La meiose I ou division rductionnelle, tres diIIerente d'une mitose normale, qui
donne deux cellules dont le nombre chromosomique est reduit de 2n a n ;
- La meiose II, ou division quationnelle, qui suit immediatement la precedente et
donne naissance a un groupe de quatre noyaux haplodes (n chromosomes).
LA MEIOSE I OU DIJISIOA REDUC1IOAAELLE
Elle comporte 4 phases, comme la mitose somatique : la prophase I, la metaphase I,
l'anaphase I et la telophase I.
PROPHASE I
La prophase I est de longue duree et s'etend couramment sur plusieurs jours. Bien
qu'elle se deroule de Iaon continue, on y distingue pour plus de commodite, plusieurs stades
dont les principaux sont : leptotene, zygotene, pachytene, diplotene et diacinese. Ces termes
sont en rapport avec l'aspect des chromosomes a chacun des stades.
Stade leptotene
Dans le noyau gonIle, les molecules d'ADN commencent a se condenser en chromosomes,
qui deviennent visibles. Bien que deja Iormes de deux chromatides, le clivage longitudinal
n'est generalement pas visible.
Stade zygotene
Ce stade est le plus important: pour separer les paires homologues, il Iaut d'abord les
rassembler, apparier les chromosomes homologues. Ce phenomene s'appelle "synapsis".
Durant ce stade, les chromosomes homologues se rapprochent et s'accolent sur toute
leur longueur par l'intermediaire d'une structure proteinique double, en Iorme d'echelle, le
complexe synaptonmal.
Celui-ci se compose de deux elements proteiniques lateraux de 50 nm de largeur
presentant une alternance de bandes epaisses et Iines encastrees dans la chromatine de
chacune des chromatides des chromosomes homologues. Un espace clair de 100 nm qui
montre un element proteinique central plus dense de 20 nm de largeur, separe les
chromatides sur toute leur longueur.
La Iormation de ce complexe synaptonemal debute deja a la Iin du stade leptotene : ce
sont d'abord les elements lateraux qui se placent le long des chromatides des chromosomes
homologues; puis se Iorme l'element central qui se diIIerencie a partir de l'extremite des
153
chromatides vers le centre de celles-ci lorsqu'elles se sont rapprochees sur toute leur
longueur. L'appariement est tres precis, chaque gene se retrouvant Iace a son homologue.
Chaque paire de chromosomes ainsi reunie Iorme un bivalent. Le nombre de
bivalents est donc egal au nombre de chromosomes haplode (n) de l'espece. Chaque bivalent
contient donc deux chromosomes homologues constitues chacun de deux chromatides
identiques (soit 4 molecules d'ADN en tout par bivalent). Notons que les deux chromosomes
sexuels s'apparient egalement en un bivalent.
Stade pachytene
Le stade pachytene commence lorsque la synapsis est achevee. Les chromosomes se
contractent et s'epaississent. Ils sont etroitement associes, plus ou moins enroules l'un sur
l'autre. A ces endroits, il y a rupture puis echange et enIin resoudure de segments
chromosomiques entre chromatides de chromosomes homologues. C'est le crossing-over ou
enjambement. Ce phenomene tres important permet une recombinaison intra-
chromosomique c'est-a-dire la creation de chromatides "mixtes", recombinantes, possedant
une partie de l'inIormation en provenance du pere de l'individu qui est train de se reproduire
et l'autre de sa mere. C'est une des cleIs essentielles de la variabilite de la descendance. Mais
le phenomene lui-mme n'est pas visible a ce stade.
Stade diplotene
On observe la disparition du complexe synaptonemal. Le clivage de chaque chromosome
devient apparent. Dans chaque bivalent, les chromosomes sont separes sur leur plus grande
longueur et semblent se repousser mais les chromatides des chromosomes homologues
demeurent attaches en plusieurs endroits, la ou se trouvent les sites de recombinaison. Ces
endroits Iurent decouverts par JANSSENS (UCL 1909) et appeles chiasmas. Il predit
clairement leur rle dans le crossing-over sans pouvoir le prouver. Dans chaque bivalent, les
chromatides soeurs demeurent plus ou moins paralleles.
Chez la Iemme, ce stade est atteint pour 400 000 ovocytes I dans les 4 a 7 mois du
Ioetus. Ce n'est qu'a la puberte que l'un de ceux-ci continue son evolution par cycle, et ce,
jusqu'a la menopause. Ce stade peut donc durer pres d'un demi-siecle!
Stade diacinese
La spiralisation des chromosomes s'accentue encore et ils deviennent tres epais et tres courts.
C'est a ce moment aussi que le nucleole et la membrane nucleaire disparaissent et que se
Iorme le Iuseau achromatique.
Le Iuseau presente une particularite: les Iibres chromosomiques ne relient pas chaque
centromere aux deux ples comme dans une mitose. Chaque chromosome homologue n'est
relie qu'a un seul ple. Les chromosomes homologues d'un bivalent sont relies a des ples
opposes. Il y a donc que deux kinetochores par bivalent (et un seul par chromosome).
154
METAPHASE I
Les chromosomes clives se disposent a l'equateur du Iuseau. Contrairement a la
mitose, ce ne sont pas les centromeres qui se trouvent a l'equateur du Iuseau mais les
chiasmas qui unissent les chromatides des bivalents. La repartition des chromosomes
d'origine paternelle et maternelle par rapport a ce plan est due au hasard et engendre les
recombinaisons interchromosomiques. Chez l'homme, par exemple, qui possede 23 bivalents,
tous les chromosomes d'origine paternelle se retrouveront du mme cte dans un cas sur 2
22
soit 14194304 ! Les Iibres chromosomiques relient les centromeres de chacun des
chromosomes des bivalents a un seul des deux ples du Iuseau.
ANAPHASE I
Les chromosomes homologues se separent. Chaque centromere, tire par ses Iibres
chromosomiques monte vers un des ples entranant avec lui ses deux chromatides. La
dissociation anaphasique separe donc les chromosomes entiers clives en deux chromatides, et
non pas les chromatides entre elles comme dans la mitose somatique normale.
Le lot chromosomique que reoit chaque Iutur noyau-Iils est constitue d'un melange
de chromosomes d'origine paternelle et maternelle. De plus ces chromosomes renIerment des
segments echanges lors du crossing-over.
TELOPHASE I
Les chromosomes clives sont parvenus a chaque ple. Dans certains cas, de nouvelles
enveloppes nucleaires se Iorment. Les chromosomes restent sous Iorme condensee et ne
subissent guere de modiIications.
Une cytocinese termine en general la division reductionnelle, pour donner deux
cellules Iilles, qui contiennent chacune n chromosomes constitues chacun de deux
chromatides encore reunies au niveau du centromere.
LA MEIOSE II OU DIJISIOA EQUA1IOAAELLE
La meiose II Iorme, a partir de chacun des deux noyaux haplodes (n chromosomes a
2 chromatides) obtenus a la division precedente, 2 nouveaux noyaux renIermant aussi n
chromosomes a une chromatide.
Il n'y a pas d'interphase entre les deux divisions de la meiose. Les noyaux
telophasiques I entrent immediatement en prophase II de la seconde division. Il n'y a donc
pas de nouvelle duplication de l'ADN ! La prophase II est de courte duree puisque les
chromosomes sont deja condenses. Elle consiste surtout en la mise en place des Iuseaux.
155
Notons que les deux Iuseaux se disposent perpendiculairement au Iuseau unique de la
premiere mitose. Comme dans toute mitose, chaque chromatide possede ses kinetochores; le
centromere est donc relie aux deux ples.
En metaphase II, les chromosomes clives s'inserent par leur centromere a l'equateur
du Iuseau.
A l'anaphase II s'opere le dedoublement des centromeres et les chromatides de chaque
paire se repartissent au hasard dans les deux noyaux.
La telophases II reconstituent au total, 4 noyaux haplodes a n chromosomes.
Apres cytocinese, on obtient une tetrade de cellules dont le patrimoine genetique est
diIIerent.
Les diIIerences Iondamentales avec deux mitoses successives sont les suivantes :
1) Chaque mitose somatique est precedee d'une duplication de l'ADN (Iormation de deux
chromatides par chromosome) au cours de l'interphase (phase S); ce phenomene est
compense par la dissociation anaphasique des chromatides.
Durant la meiose, il n'y a qu'une seule duplication premeiotique puisque l'interphase
entre les deux divisions de la meiose est escamotee.
2) Il y a deux dissociations anaphasiques diIIerentes. L'anaphase I separe des chromosomes
entiers (a 2 chromatides) tandis que l'anaphase II dissocie les chromatides.
3) La repartition de l'ADN, de l'inIormation, est Iondamentalement diIIerente.
Dans une mitose somatique, suite a la dissociation des chromatides genetiquement
identiques, les deux noyaux reoivent des garnitures chromosomiques identiques, portant
les mmes inIormations. Dans deux mitoses somatiques successives, les 4 noyaux Iormes
possedent donc les mmes inIormations genetiques.
Par contre dans la meiose, l'anaphase I separe deux lots de chromosomes equivalents en
nombre mais portant des inIormations genetiques diIIerentes, puisque le phenomene de
crossing-over s'est deroule en prophase I et que les chromosomes sont d'origine sexuelle
diIIerente. En Iin de meiose, les quatre noyaux Iormes possedent des inIormations
genetiques diIIerentes.
3) A la metaphase de chaque mitose somatique, les centromeres des chromosomes sont
situes a l'equateur du Iuseau et sont relies aux deux ples du Iuseau.
A la metaphase I de la meiose, les centromeres des chromosomes sont situes de part et
d'autre du plan equatorial. En plus, chacun d'eux n'est relie qu'a un seul ple du Iuseau.
156
3. POLYMORPHISME ET MUTATIONS
__________________________________________________
Dans une population d'tres vivants d'une mme espece utilisant la reproduction
sexuee, tous les individus sont diIIerents. Ceci est d a un ensemble de petites diIIerences au
niveau de l'ADN de ces individus, appele polymorphisme. Il s'agit principalement de
changements d'un seul nucleotide. Ces nucleotides variables sont souvent appeles SNP par
les geneticiens (prononce "snip": de l'anglais "single nucleotide polymorphism"). A ces
modiIications s'ajoutent de petites deletions et insertions.
Chez l'homme, on estime qu'un nucleotide sur 1000 varie entre les individus, les 999
autres etant constants. Nos genomes sont donc 99,9 identiques. Un genome diplode
totalisant 6 milliards paires de bases, ceci correspond a un nombre total de nucleotides
variables de 6 millions !! Ce sont ces diIIerences qui expliquent pourquoi chaque individu est
unique (a l'exception des vrais jumeaux).
De nombreux polymorphismes sont situes en dehors des genes et ont un impact
diIIicile a evaluer (probablement Iaible, voire nul). Les variations ponctuelles qui sont situees
dans les genes crees des Iormes diIIerentes du mme gene, appelees les allles du gene. Tous
les hommes possedent donc les mmes genes dans leurs genomes, mais pas necessairement
les mmes alleles. Les individus diplodes possedant deux copies de chaque gene, il peuvent
soit posseder deux Iois le mme allele, soit deux alleles diIIerents.
La majorite de ces variations ne sont pas deleteres. Elles conduisent simplement a des
diIIerences physiques et physiologiques entre individus. A cote des variations normales du
genome de chaque espece, des modiIications anormales peuvent aussi survenir, liees a
l'apparition d'une maladie. Dans certains cas, la notion de normalite est cependant diIIicile a
apprecier. Certaines mutations peuvent tre liees a une meilleure resistance a telle ou telle
maladie, ou au contraire conIerer un risque plus eleve, par exemple Iace a un type d'inIection.
ParIois, une modiIication genetique peut en mme temps donner un avantage Iace a un agent
pathogene et un risque accru de developper une autre maladie.
De nouveaux polymorphismes (mutations) apparaissent sans cesse. Leurs
consequences sont tres variables. Elles peuvent conIerer un avantage ou un desavantage, en
Ionction de l'environnement, des maladies auxquelles la population doit Iaire Iace, etc. Dans
la nature, ces mutations sont le moteur de l'evolution telle qu'elle a ete decrite par Darwin:
elles produisent sans cesse des individus diIIerents, qui, selon les circonstances, sont plus ou
moins Iavorises et auront plus ou moins de chances de pouvoir se reproduire.
157
Ces mutations sont invisibles au niveau des chromosomes au microscope. Les
modiIications qui sont visibles au niveau des chromosomes (voir plus loin "alterations
chromosomiques") sont presque toujours pathologiques, et peuvent tre responsables de
deIiciences graves.
3.1 CONSEQUENCES D'UNE MUTATION SUR LA TRADUCTION
Un changement d'un nucleotide de la sequence d'ADN peut avoir des consequences
tres variables, suivant la localisation de celui-ci. Il en est de mme pour une deletion ou une
insertion. Un grand nombre de mutations sont situees en dehors des genes et ont un impact
tres Iaible ou nul. Certaines mutations dans les parties non traduites des genes (promoteur du
gene, introns, parties 5' et 3' non traduites de l'ARNm) ont des consequences souvent
diIIiciles a estimer. Par contre, les mutations situees dans les parties traduites peuvent tre
analysees de Iaon rationnelle:
- Le code genetique etant "degenere"; il est possible que le triplet mute code le mme
acide amine, auquel cas aucune diIIerence ne sera decelee. On parlera de mutation
silencieuse.
- Si le triplet mute encode un autre acide amine, on parlera de mutation ponctuelle de
la sequence de la proteine. La diIIerence ne sera pas Iorcement visible pour l'individu.
En eIIet, si l'acide amine en question n'a pas de Ionction importante et ne change pas
la structure proteine, celle-ci (par exemple une enzyme) gardera son activite et la
mutation n'aura pas d'eIIet. Dans le cas inverse, l'activite de la proteine sera diminuee
entranant des consequences physiologiques etou morphologiques visibles. Sur la
base de la sequence primaire de la proteine, ces consequences sont diIIiciles a prevoir.
Exemple: la drepanocytose est une maladie due a une mutation ponctuelle dans le
gene de l'hemoglobine (voir plus loin).
- Une mutation dite "non sens" peut Iaire apparatre ou disparatre les triplets TGA ou
TAG ou TAA (STOP). Dans cas, la synthese de la proteine s'arrte prematurement,
produisant une proteine dont il manque une partie. Ce type de proteine est tres souvent
non Ionctionnel.
- Une deletion ou insertion d'un multiple de trois nucleotides supprime ou ajoute un ou
plusieurs acides amines dans une proteine, avec des consequences variable en Ionction
de l'endroit ou cette modiIication survient.
- La mutation genique peut aussi entraner la perte (deletion) ou l'insertion d'une ou
deux paire de bases, decalant la lecture de tous les triplets suivants et donc la nature
de la proteine construite. On parle alors d'un dcalage du cadre ouvert de lecture. La
partie de la proteine situee apres la mutation n'a en eIIet plus rien a voir avec la
158
proteine normale. La taille de la proteine est egalement modiIiee, puisque le ribosome
devra utiliser un autre codon stop. Une telle mutation se traduit habituellement par une
enzyme non Ionctionnelle et a donc des repercussions qui sont nettement plus
importantes qu'une simple modiIication de base.
Exemples :
1 addition d'une base dans l'ADN
#1%& #2*!#+2!+**!##*!2+#!+2#!#+*!#22!#**!+22!,,,
3456789:& ;<)!)=1!#1*!>?@!@<1!><2!)=1!A><!#1*!><2,,,
devient
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2 perte d'une base dans l'ADN
#1%& #2*!#+2!+**!#!*!2+#!+2#!#+*!#22!#**!+22!,,,
3456789:& ;<)!)=1!#1*!>?@!@<1!><2!)=1!A><!#1*!><2,,,
devient
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3.2 ALTERATIONS CHROMOSOMIQUES
Les chromosomes peuvent subir un certain nombre de modiIications visibles au
microscope, lors de la realisation d'un caryotype. Un nombre anormal de chromosomes
normaux peut tre observe: on parlera de polyplodie si ce nombre reste un multiple de n
(Irequent chez les plantes), d'aneuplodie si ce n'est pas le cas. Certains chromosomes
peuvent aussi tre anormaux, suite a une deletion, une inversion, une insertion ou une
translocation. Contrairement a ce qui a ete vu plus haut, il s'agit de modiIications impliquant
un grand segment d'ADN, et donc un grand nombre de genes.
Ces modiIications peuvent survenir dans des cellules somatiques ou germinales.
Seules les alterations germinales seront hereditaires. Chez l'homme, les modiIications
germinales des chromosomes sont presque toujours pathologiques, et les individus qui les
portent sont en general incapables de se reproduire.
Chez les animaux superieurs, certaines alterations des chromosomes des cellules
somatiques peuvent conduire au developpement d'un cancer.
159
Polyplodie
Ce type de modiIication survient surtout chez les plantes. Elles ne sont pas viables
chez l'homme (pas de developpement embryonnaire). Nous avons vu que l'haplodie ou
monoplodie (n chromosomes) caracterise des cellules ou des individus qui ne possedent que
le genome de base n (certaines plantes, mles de l'abeille issus de gametes Iemelles non
Iecondes...). La diplodie (2n) : constitue l'etat normal d'un animal ou d'un vegetal superieur.
La meiose peut s'y derouler normalement. Haplodie et diplodie constituent des etats
successiIs normaux d'un cycle haplo-diplophasique de la reproduction sexuee.
La triplodie (3n) : provient de la Iusion d'un gamete normal (n) et d'un gamete Iorme
sans reduction meiotique (2n). Dans un organisme triplode, la mitose peut se derouler
normalement mais pas la meiose. En prophase I de la meiose les 3 chromosomes homologues
s'associent en un trivalent ou un bivalent et un univalent. La repartition de chromosomes en
anaphase de la meiose est irreguliere et aboutit a des gametes aneuplodes. Les individus
triplodes qui peuvent se developper sont donc peu Iertiles sinon steriles.
La ttraplodie (4n) : on y distingue les autottraplodes et les allottraplodes.
Les autotetraplodes proviennent de la Iusion de gametes diplodes ou bien du
doublement naturel ou artiIiciel du nombre chromosomique diplode. Chez les organismes
autotetraplodes, par suite de la presence d'un nombre pair de chromosomes homologues, les
appariements au stade zygotene peuvent se realiser soit sous la Iorme de 2 bivalents soit sous
la Iorme d'un quadrivalent. Dans ce dernier cas, la separation en anaphase I est souvent
irreguliere et les gametes produits sont aneuplodes comme chez les triplodes. Lorsque la
repartition est reguliere, les gametes produits sont diplodes et, en Iusionnant, redonnent des
individus tetraplodes. Ces organismes sont alors Iertiles.
Un nombre important d'especes utilisees en agriculture (ble, avoine, seigle, tabac,
coton...) sont des autotetraplodes naturels ou crees par les agronomes. Il en va de mme pour
les hexaplodes (6n) et octoplodes (8n). Ils presentent generalement une taille cellulaire plus
importante, qui se traduit par une dimension des organes (Ileurs, Iruits, graines) souvent
accrue et un meilleur rendement.
Les allotetraplodes sont issus d'un zygote reunissant deux gametes diplodes d'especes
diIIerentes; ils constituent des hybrides inter-spcifiques. Les hybrides interspeciIiques issus
de la Iusion de gametes haplodes sont generalement des plantes tres luxuriantes.
Malheureusement, elles demeurent steriles car la meiose ne peut pas se realiser. En doublant
le nombre de chromosomes de l'hybride interspeciIique, chacun des chromosomes possede
son homologue et l'appariement au zygotene peut se realiser normalement.
En 1928, Karpechenko voulut obtenir une plante possedant les Ieuilles du chou (Brassica
oleracea) et les racines du radis (Raphanus sativus) Le croisement a donne un hybride
interspeciIique sterile, mais par polyplodisation, il a obtenu une nouvelle espece tetraplode
160
Iertile: le chou-navet (Raphano-brassica) qui malheureusement possedait les racines du chou
et les Ieuilles du navet! De mme le tabac utilise actuellement est un hybride tetraplode
obtenu a partir de 2 especes Nicotiana glauca et Nicotiana svlvatica. La creation de nouvelles
varietes horticoles utilise Irequemment l'allotetraplodie.
La polyplodie naturelle est Irequente chez les vegetaux mais rare chez les animaux a
cause de la complexite de la balance hormonale des mecanismes determinant le sexe.
L'aneuplodie
- L'individu est monosomique lorsqu'il a 2n-1 chromosomes. Le seul cas de
monosomie connu chez l'homme est le syndrome de TURNER (44 un seul chr. X 45
chromosomes, note X0). Les individus (Iilles) qui en souIIrent sont steriles, possedent des
ovaires atrophies et sont sexuellement immatures.
- L'individu est polysomique quand il possede un ou plusieurs chromosomes
surnumeraires.
Il y a trisomie quand un des chromosomes est present en triple exemplaire.
- Trisomie au niveau des chromosomes sexuels :
- chez la Iemme 44 XXX, syndrome du triple X (Iemmes normales et Iertiles
pouvant parIois presenter un leger retard de developpement).
- le syndrome de KLINEFELTER: 44 XX, (organes sexuels mles, tendance
a la Ieminisation des caracteres sexuels secondaires: voix aigu, Iaible pilosite,
poitrine Iort developpee..)
- chez l'homme hypermasculinise 44 X. Ce genotype est present chez 1,1
des hommes. Chez les hommes de grande taille, la proportion de X pourrait
atteindre 20, mais beaucoup de ces individus passent inaperus tant dans leur
phenotype que dans leur comportement. Cette hypermasculinisation peut avoir
des incidences sociales, bien que les enqutes soient contradictoires: les X
seraient plus agressiIs et auraient une probabilite six Iois superieure de
sejourner en prison que les X ! Mais ces Iaits n'ont jamais ete etablis
scientiIiquement et les journalistes ont qualiIie trop htivement de "tueur" ce
chromosome superIlu.
- Le mongolisme ou syndrome de DOWN resulte d'une non disjonction de la paire
d'autosomes n21 de telle sorte que les deux chromosomes passent dans le mme
gamete, aucun dans l'autre. Les gametes 2n1 et 2n-1 donnent apres Iecondation des
trisomiques 2n1 47 chromosomes et des individus monosomiques 2n-1 45
chromosomes, non viables. On a etabli une correlation etroite entre l'ge de la mere et
la probabilite de naissance d'un enIant trisomique 21: 11500 entre 20 et 30 ans; 1300
entre 40 et 45 ans et 160 au dela de 45 ans.
161
- Chez l'homme les cas de trisomie pour les chromosomes 8, 21 et X restent vivants.
Les trisomies 13, 18, 22 ont une duree de survie apres la naissance de quelque jours a
quelques annees (le plus ge des trisomiques 22 recenses avait 12 ans). Les trisomies
1, 2, 9, 16 provoquent des avortements plus ou moins precoces. On n'a jamais repere
de trisomie sur les autres chromosomes, qui bloquent probablement le developpement
embryonnaire a un stade tres precoce. On evalue que 25 a 50 des avortements
spontanes seraient dus a une anomalie chromosomique.
Rappelons que toutes ces anomalies sont dues a une mauvaise disjonction soit en
anaphase I soit en anaphase II de la meiose. Par exemple, X provient d'une non
disjonction des chromatides du chromosome lors de l'anaphase II de la meiose chez le pere,
ce qui produit des spermatozodes 22 .
La Deletion
Elle consiste en la perte d'un Iragment de chromosome. Ce Iragment peut tre terminal
ou situe dans une partie intermediaire du chromosome.
Une deletion entrane des troubles plus ou moins graves suivant l'importance des
phenomenes physiologiques contrles par les genes dont une copie est perdue. Elle
correspond en Iait a une monosomie partielle.
Chez l'homme, la deletion du bras court du chromosome 5 conduit au syndrome du
"cri du chat" ainsi denomme a cause du cri caracteristique qu'emettent les nourrissons qui en
sont aIIectes.
La Duplication
Elle consiste en la presence d'un Iragment surnumeraire dans un chromosome normal.
Elle correspond a une trisomie partielle. Ce Iragment supplementaire peut tre attache au
chromosome d'ou il provient, ou a un autre. La duplication apporte une dose anormalement
elevee d'alleles recessiIs etou dominants: les genes presents dans la zone dupliquee sont en
eIIet presents en trois exemplaires dans le genome.
L'inversion
Elle consiste en un retournement de la sequence des genes disposes lineairement sur le
chromosome. Par exemple, il se Iorme une boucle, terminale ou intercalaire, qui est suivie de
rupture et de resoudure. Une inversion peut modiIier le phenotype, ce qui montre que l'action
des genes ne depend pas uniquement de leur presence ou de leur absence mais aussi de l'ordre
dans lequel ils sont normalement places sur le chromosome. C'est ce qu'on appelle l'eIIet de
162
position. Notons aussi, que dans le cas d'une inversion heterozygote (1 seul des 2
chromosomes montre un segment inverse), l'appariement de la region concernee est plus
diIIicile, et les crossing-over qui s'y produisent aboutissent a des deletions, duplications et
translocations nombreuses. Finalement, les genes situes au niveau des points de rupture
peuvent tre modiIies.
La Translocation
Lorsqu'un Iragment de chromosome est transIere a un chromosome non homologue,
on dit qu'il y a translocation simple. Lorsque deux chromosomes non homologues echangent
des Iragments, on parle de translocation rciproque. Les changements que l'on peut
observer sont dus a l'eIIet de position et a la modiIication du gene situe au point de rupture.
En Iait, la translocation reciproque est un crossing-over illegitime qui se produit entre
deux chromosomes non-homologues.
Un type particulier de translocation est la translocation robertsonienne (Robertson,
1916) dite aussi Iusion centromerique qui s'opere entre chromosomes acrocentriques. Dans ce
cas, la translocation a lieu au niveau du centromere, les deux bras courts et leurs satellites
sont perdus et les deux chromosomes Iusionnes ne possedent plus qu'un seul centromere.
Chez l'homme, le cas le mieux connu est celui de la translocation entre chromosomes 13 et
21, qui se traduit par le mongolisme hereditaire. A titre d'inIormation, les grands singes
possedent 48 chromosomes. Notre chromosome 2 provient tres vraisemblablement d'une
translocation robertsonienne entre les chromosomes acrocentriques "2
p
" et "2
q
" de ces singes
que l'on ne retrouve pas chez nous.
Tous ces arrangements chromosomiques necessitent la cassure des chromosomes qui
peut se realiser a un moment quelconque du cycle cellulaire. Bien que se remarquant
nettement en meiose, la mutation chromosomique ne se produit pas a ce moment. Les causes
en sont encore inconnues, mais le vieillissement des cellules pourrait tre un Iacteur
determinant.
Chez les malades atteints de leucemie myelode chronique, on retrouve toujours un
chromosome 22 anormal (denomme chromosome "Philadelphie") dont la taille semble reduite
de moitie. En Iait il s'agit d'une translocation reciproque entre le extremites des bras longs des
chromosomes 9 et 22. Sur chacun de ces chromosomes, la rupture se Iait au milieu d'un gene:
ABL dans le chromosome 9 et BCR dans le chromosome 22. Le resultat de la translocation
est la creation de deux genes hybrides, BCRABL et ABLBCR. BCRABL est un oncogene,
c'est-a-dire un gene qui code pour une nouvelle proteine hybride anormale, qui deregle le
cycle cellulaire et induit une proliIeration anarchique des cellules, caracteristique du cancer.
163
3.3 APPARITION DES MUTATIONS
3.3.1 les mutations spontanees
La mutation spontanee des genes est peu Irequente et varie beaucoup d'un gene a
l'autre. Dans l'espece humaine, la taux moyen de mutation spontanee varie entre 10
-4
(1
gamete sur 10000 pour ce gene) et 10
-7
. Certains alleles nouveaux peuvent donc apparatre
spontanement. Mais, etant donne le nombre tres grand de genes portes par l'homme, des
calculs speculatiIs estiment qu'environ 23 des hommes pourraient porter dans leur genome au
moins une mutation nouvelle. D'autres calculs tout aussi speculatiIs n'arrivent qu'a 2. Quelle
que soit le chiIIre reel, les mutants ne sont pas rares. Ajoutons que les agents mutagenes, dont
nous parlerons plus loin, augmentent artiIiciellement la Irequence des mutations.
Ces mutations spontanees sont notamment dues a des erreurs de l'ADN polymerase
lors de la replication de l'ADN en phase S du cycle cellulaire. Dans ce cas, l'enzyme ne
respecte pas la complementarite AT et GC. La Irequence de ces erreurs est tres basse, mais
etant donne la grande taille de notre genome, leur nombre peut tre signiIicatiI. Notons que
des systemes de securite veriIient que l'ADN polymerase Iait bien son travail et corrigent
certaines erreurs, diminuant encore la Irequence de mutations.
3.3.2 les agents mutagenes
Les mutations naturelles etant rares, les geneticiens ont cherche a les provoquer
artiIiciellement dans des tres vivants dans des laboratoires (bacteries, mouches, souris.),
pour suivre leur transmission en recherchant des agents mutagenes. Ils se sont ainsi rendus
compte que le nombre de ceux-ci etait important. Parmi les principaux agents capables
d'induire des mutations, citons les radiations ionisantes et les substances chimiques.
Les radiations ionisantes
Les ondes electromagnetiques, pourvu qu'elles aient un pouvoir de penetration
suIIisant, sont capables de provoquer des aberrations au niveau du materiel hereditaire de par
l'energie (e hv ) qu'elles transportent (RX; ; rayons cosmiques) et sont donc sources de
mutations ponctuelles. Il en va de mme indirectement pour les rayonnements corpusculaires
(o; ; neutrons). Nous subissons environ une dose de rayonnement de 0,3 reman emanant des
sources naturelles (rayonnement cosmique, radon de l'atmosphere, rayons du sol,
40
K et
14
C
de notre propre corps). Une dose moyenne equivalente provient d'expositions medicales
164
(radiologie, radiotherapie). Cette dose n'est evidemment pas repartie de Iaon uniIorme et
depend des traitements subis. Les autres rayonnements d'origine humaine (centrales
nucleaires, essais nucleaires, irradiateurs industriels) sont normalement negligeables.
Il a ete demontre sur des drosophiles que le taux de mutation augmentait en Ionction
de la dose reue. Pour les cellules haplodes (gametes, bacteries...) il suIIit que le materiel
genetique soit touche une Iois pour que le gene puisse tre inactive. Le taux de mutations
induites est proportionnel a la dose . Pour les cellules diplodes, il Iaut que les deux garnitures
chromosomiques (les chromosomes homologues) soient touches simultanement pour Iaire
apparatre directement une mutation recessive.
L'eIIet mutagene des radiations depend donc surtout de leur quantite. Leur eIIet est
cumulatiI (en premiere approximation): que la dose soit appliquee en 1 ou en 10 Iois, l'eIIet
total reste le mme. Cette loi se revele touteIois inexacte aux tres Iaibles doses repetitives car
l'organisme possede des systemes enzymatiques capables de reparer le mieux possible, les
degts causes par les radiations.
On pense que l'eIIet toxique des radiations est principalement d a leurs eIIets sur
l'ADN: ruptures de chromosomes et mutations ponctuelles dans les cellules. Les cellules les
plus sensibles aux rayonnements sont les cellules en croissance car les rayonnements
bloquent la mitose (cellules de la moelle osseuse, cellules qui regenerent la muqueuse
intestinale, lymphocytes du systeme immunitaire). Une Iorte irradiation totale d'un homme
produit une destruction de toutes les cellules qui regenerent le sang, une maladie generalisee
et la mort quelques jours apres l'exposition. Une Iorte dose locale de rayonnements provoque
des brlures.
La sensibilite particuliere des cellules en croissance a conduit a une utilisation
therapeutique des rayonnements ionisants (la radiothrapie) pour traiter certains types de
cancers. Ce type de traitement n'est evidemment pas sans eIIets secondaires, mais est encore
utilise actuellement. Les rayonnements sont delivres a l'aide de machines complexes qui
concentrent la dose de rayons sur la tumeur en epargnant au maximum les tissus sains.
De part leur eIIet mutagene, l'exposition chronique a de Iortes doses de rayonnements
ionisants augmenterait le risque de cancer, notamment de certaines leucemies. Cet eIIet n'est
cependant pas aussi important qu'on le croit generalement. Le seul cancer qui a augmente de
Iaon importante apres l'accident de Tchernobyl est la cancer de la thyrode, du Iait de
l'accumulation d'isotopes radioactiIs de l'iode dans cet organe chez les personnes exposees.
Les Iortes doses d'U.V. (bronzage, banc solaire), a Iaible pouvoir penetrant, ont un
eIIet mutagene sur la peau et peuvent declencher des cancers de la peau comme le melanome.
Cet eIIet est bien demontre. L'action de ces radiations se traduit souvent par la liaison de 2
thymines successives sur la chane d'ADN: cette structure bloque completement la duplication
165
de la molecule avec les consequences que l'on devine. L'organisme humain possede
heureusement des mecanismes de reparation qui peuvent eliminer ces dimeres. Les malades
atteints d'une maladie genetique particuliere, la xerodermie pigmentee, presentent un deIaut
de reparation de l'ADN, et ont un risque tres eleve de cancer de la peau. La xerodermie
pigmentee est une deIicience genetique du mecanisme qui elimine les dimeres de thymine. Il
en resulte de serieux degts au niveau de la peau, suivis de cancers multiples. Il est a noter par
ailleurs que le nombre de cancers de la peau a Iortement augmente dans les pays occidentaux
et en Australie, depuis une vingtaine d'annees. Notons qu'une petite dose d'UV est cependant
necessaire a la synthese de la Iorme active de la vitamine D dans l'organisme.
Les rayonnements ionisants sont donc dangereux, mais leur eIIets toxiques ont
souvent ete exageres. Il sont utiles en medecine pour traiter certains cancers (radiotherapie) et
en radiographie.
Les substances chimiques
De nombreuses substances chimiques ont un pouvoir mutagene. En reagissant
chimiquement avec l'ADN, elles peuvent induire des mutations ponctuelles, des deletions ou
des insertions d'une paire de bases. Il s'agit de substances naturelles, souvent presentes a tres
Iaibles doses dans l'alimentation, de substances synthetisees par l'homme (notamment des
medicaments), et de produits de combustions.
De nombreuses plantes contiennent des substances mutagenes. Les doses varient
considerablement. Parmi les substances les plus dangereuses, citons l'aIlatoxine B, un
compose trouve dans un mycete qui contamine les recoltes d'arachides en AIrique et qui
provoque des cancers du Ioie.
Dans le passe, un certains nombre de substances mutagenes ont ete synthetisees et
utilisees parIois massivement par l'homme (pesticides, medicaments, additiIs alimentaires
comme le jaune de beurre.). Les substances chimiques utilisees par l'industrie Iont
actuellement l'objet de recherches et de contrles tres stricts, qui tendent a reduire les risques.
L'eIIet d'une exposition chronique (toute une vie !) a de Iaibles doses de certaines substances
est cependant diIIicile a evaluer.
Certains types de medicaments anticancereux induisent des alterations de l'ADN qui
bloquent la proliIeration des cellules, notamment des cellules tumorales. Ces medicaments
sont souvent les seuls disponibles pour traiter certains types de cancers, parIois avec succes.
Ils ont des proprietes mutagenes et provoquent des eIIets secondaires non negligeables. Leur
utilisation par le personnel hospitalier se Iait dans des conditions de securite stricte.
Un autre type de substances mutagenes provient des reactions de combustion: Iumees,
barbecue, incinerateurs, cigarettes, combustion des derives du petrole. Un des composes
166
mutagenes les plus etudies et les plus puissants est le benzopyrene, qui est un dangereux
cancerigene.
Les etudes sur l'action mutagene des substances chimiques sont actuellement un des
grands objets de recherche des laboratoires de toxicologie, specialement en ce qui concerne
les produits nouvellement synthetises par l'homme. Il est parIois tres diIIicile de determiner si
un produit est vraiment mutagene et dangereux. Pour toute substance, la dose a laquelle une
personne est exposee est un parametre tres important, qui determinera les consequences
toxicologiques et cliniques d'une exposition.
Comme pour les alterations de l'ADN induites par les radiations, les alterations dues
aux produits chimiques mutagenes peuvent, dans de nombreux cas, tre reparees par des
systmes de rparation de l'ADN perIectionnes.
Nos cellules, en particulier celles du Ioie, sont aussi equipees d'enzymes qui
permettent de degrader et eliminer les produits chimiques "etrangers" (appeles
xnobiotiques). Les medicaments Iont partie des substances degradees par ces enzymes. Ces
reactions enzymatiques particulieres constituent le metabolisme des xenobiotiques, qui sera
vu dans les cours des annees ulterieures.
3.4. MUTATIONS ET EVOLUTION
Nous venons de voir que des mutations apparaissent constamment dans une
population d'tres vivants, suite a des erreurs de l'ADN polymerase ou a des expositions a des
rayonnements et a des composes naturels (ou plus recemment, artiIiciels). Ces mutations
apparaissent au hasard n'importe ou dans le genome. Certaines mutations sont sans
consequence: elles n'auront donc pas d'impact. D'autres inactivent des genes essentiels. Si
leur eIIet est dominant, ou que les deux alleles sont atteints, elles peuvent conduire a la mort
de la cellule.
Lorsque ces mutations se produisent dans les cellules germinales, elles peuvent tre
transmises a la descendance de l'individu. Ces mutations peuvent inIluencer (positivement ou
negativement) de nombreux Iacteurs, comme le developpement de l'embryon jusqu'a l'ge
adulte, la capacite a resister a certaines maladies, la capacite a survivre dans certaines
conditions environnementales, la Iertilite. De ce Iait, certains individus seront Iavorises par
rapport a d'autres, et auront plus de chance de procreer et donc de transmettre leur caracteres
aux generations suivantes. Ce mecanisme est la base de la theorie de l'evolution, dont les
Iondements ont ete etablis par Darwin au XIX
e
siecle. Cette theorie est scientiIiquement bien
etayee.
167
4. LES LOIS DE MENDEL
__________________________________________________
4.1 INTRODUCTION ET HISTORIQUE
Connaissant actuellement la nature du materiel genetique, l'ADN des chromosomes, la
maniere dont ceux-ci se transmettent a la generation suivante via la meiose et la Iecondation,
connaissant par ailleurs le mode d'expression des genes, il nous est Iacile de comprendre les
regles qui president a la transmission de caracteres parentaux a leur descendance.
N'oublions cependant pas que les lois Iondamentales de l'heredite ont ete decouvertes
bien avant que tous ces elements sur lesquels nous nous Iondons (ADN, chromosomes,
mitose, meiose, proteosynthese) ne soient decouverts, ni mme souponnes.
Le Iondateur de la genetique est Gregor MENDEL. Ses travaux peuvent encore de nos
jours, tre pris comme exemple de rigueur scientiIique dans le raisonnement et de
perspicacite dans la conduite d'un programme experimental. C'est entre 1856 et 1863 que
Johann Gregor MENDEL (1822-1884), moine augustin de Moravie (Tchecoslovaquie), realisa
ses experiences de croisement sur des pois cultives dans les jardins du monastere de Brnn.
Les resultats de ses travaux sur l'heredite Iurent publies en 1866 dans le Bulletin de la Societe
des Naturalistes de Brnn, et demeurerent pratiquement ignores jusqu'en 1900 (une dizaine
de citations par d'autres auteurs). C'est a cette epoque que ses resultats Iurent redecouverts
par plusieurs biologistes travaillant separement sur des materiaux divers ( de VRIES en
Hollande, CUENOT en France, CORRENS en Allemagne, von TSCHERMAK en Autriche,
BATESON en Angleterre). Ils s'aperurent alors, en Iaisant leur bibliographie, qu'ils avaient
ete devances d'un tiers de siecle.
Bien que des experiences de croisements Iurent eIIectuees avant MENDEL (MOREAU
de MAUPERTUIS, 1750; KOLREUTER, 1770; KNIGHT, 1841; NAUDIN,1861...), l'absence de
donnees numeriques et d'explications satisIaisantes les ont maintenues dans l'empirisme.
Le succes de Mendel a ete conditionne par plusieurs Iacteurs :
1) Le choix judicieux du matriel expriment:
Le pois (Pisum sativum L) est une plante qui crot rapidement. Les organes sexuels
de la plante (etamines et pistil) arrivent a maturite avant l'ouverture de la Ileur (avant
l'anthese), si bien que l'autoIecondation y est de regle . La Ileur et ses organes sont
suIIisamment grands pour que l'on puisse realiser l'excision des etamines avant leur maturite,
suivie de la pollinisation par du pollen provenant d'une autre Ileur. L'experimentateur peut
donc realiser de Iaon contrlee une Iecondation croisee, Iecondation reciproque ou une
168
autoIecondation. De plus il existe un nombre assez important de varietes pures et stables dans
le temps.
2) La mthode de travail:
- MENDEL a eu soin d'eIIectuer des castrations et les Iecondations croisees d'une
maniere meticuleuse et systematique qui lui permettait de "diriger" les croisements qu'il
operait. En eIIet, d'une part, il eliminait tout danger de souillure pollinique etrangere et,
d'autre part, il annulait l'eIIet eventuel d au sexe des parents;
- MENDEL a eu soin de ne choisir, pour ses experiences d'hybridation, que des varietes
qui possedent des caracteres phenotypiques aisement discernables et qui se transmettent par
autoIecondation normale, de generation en generation: coloration rouge ou blanche de la
Ileur, coloration jaune ou verte du Iruit, Iorme ronde ou ridee de la graine...
- MENDEL a eu soin d'appliquer le second principe de DESCARTES, a savoir qu'il Iaut
toujours diviser les problemes complexes en une suite de problemes simples. Pour ce Iaire, il
commena par etudier la transmission d'un seul caractere, avant de se pencher sur des
problemes plus vastes.
3) L'analyse numrique
MENDEL eut le grand merite de quantiIier exactement ses resultats, d'etayer son
hypothese par un modele mathematique coherent et de les soumettre a une analyse
statistique appropriee. On estime ainsi qu'il observa quelque 27000 plants appartenant a 34
varietes diIIerentes et qu'il compta plus de 300 000 graines. Pour son epoque, c'etait une
revolution! Ses hypotheses, qui sont maintenant des lois, Iurent alors experimentees sur
d'autres plantes, telles le haricot mange-tout pour en veriIier le bien Ionde.
4) La chance:
Il est certain que la chance Iavorisa MENDEL car il ne pouvait savoir qu'en choisissant
les Pois comme materiel experimental, il s'adressait a une plante diplode, chez laquelle la
reproduction sexuee se deroule normalement et chez laquelle aussi, l'heredite des caracteres
retenus etait simple... Mais ne dit-on pas que la chance ne Iavorise que ceux qui s'y sont
prepares?...
Et quoi qu'il en soit, les lois decouvertes par Mendel constituent le Iondement de la
genetique moderne, et a ce seul titre, ce chercheur merite toute notre admiration.
4.2. LA PREMIERE LOI DE MENDEL
Pour suivre la transmission des caracteres hereditaires, il Iaut croiser des individus qui
sont de races pures qui diIIerent par un ou plusieurs caracteres. En eIIet, si les parents sont
identiques, il sera impossible de savoir de qui proviennent les caracteres transmis. Le cas le
169
plus simple est celui ou les parents diIIerent par un seul caractere bien apparent (en genetique
vegetale, ce cas est generalement appele monohybridisme).
Dans une premiere experience, MENDEL croise deux varietes de pois (Pisum sativum
L): l'une donne des pois ronds, l'autre des pois rides. Ces varietes sont des races ou des
lignes pures, car par reproduction naturelle (autofcondation), elles montrent toujours ces
mmes caracteres. Ce sont des varietes bien Iixees et constantes.
Lorsqu'on croise des varietes parentales, designees par P, le pollen de la variete a pois
ronds est depose sur les stigmates de la variete a pois rides et reciproquement, le pollen de la
variete a pois rides est depose sur le stigmate de la variete a pois ronds (croisement
rciproque, ce qui elimine une inIluence eventuelle du sexe); dans tous les cas, toutes les
graines obtenues sont rondes.
La caracteristique de cette premiere generation filiale (denommee F
1
) est donc
l'uniformit, tous les individus ont le mme aspect exterieur, entrainant comme corollaire, la
disparition du caractere dun des parents.
Par autoIecondation des plantes de la F
1
, on obtient une deuxieme generation F
2
.
MENDEL constate en F
2
que, sur 8023 pois obtenus, 6022 sont ronds et 2001 rides. Le
caractre rid rapparat avec ses particularites completement developpees et ce dans la
proportion de 3 ronds pour 1 ride.
Ces constatations provoquerent chez MENDEL une suite d'intuitions que les
experiences ulterieures allaient etayer.
La principale est que, contrairement aux idees de son epoque, l'heredite ne se realise
pas par transmission directe du caractere, car en eIIet, comment expliquer que les plantes a
pois ronds aient donne des pois rides? Pour que le caractere ride reapparaisse en F
2
, il doit
necessairement exister en F
1
, intact mais cache. MENDEL introduit alors les notions de
caractere dominant et rcessif.
Pour expliquer les resultats de la F
2
, MENDEL imagina que ces caracteres etaient
portes par des "Iacteurs" provenant de chacun des parents. Le parent de race pure rond, Iut
note R, l'autre parent, ride, recessiI, r. Lors de la Iormation des cellules reproductrices,
chacune de celles-ci emportait un exemplaire de ce Iacteur. Lors de la Iecondation, les
individus de la F
1
, hybrides, avaient donc comme Iormule Rr. La seconde intuition de Mendel
Iut que, au cours de la Iormation des gametes des hybrides de la F
1
, chacun de ceux-ci
n'emportait qu'un seul des deux facteurs. Il y avait sgrgation, separation qui produisait
50 des gametes possedant le "Iacteur" R et 50 le "Iacteur" r.
La troisieme intuition de MENDEL Iut que la Iecondation se realisait au hasard, c'est-a-
dire qu'un gamete mle R avait autant de probabilite de Ieconder un gamete Iemelle R qu'un
gamete Iemelle r. Il en allait de mme pour les gametes mles r; ce qui aboutissait aux
170
proportions observees de 3 plantes a pois ronds pour 1 plante a pois rides (3 : 1) comme le
montre le tableau suivant
mles
Iemelles
50R 50r
50R 25RR 25Rr
50r 25Rr 25rr
Dans notre exemple, les individus ne portant qu'un seul type de Iacteur pour le
caractere couleur (R pois ronds; r pois rides) sont dits homozygotes pour ce caractere. Plus
tard, les geneticiens ont etabli que les homozygotes possedaient deux "Iacteurs" identiques
(RR ou rr). Les individus qui possedent simultanement deux Iacteurs diIIerents se rapportant
au mme caractere sont denommees htrozygotes.
Une premiere preuve de l'exactitude des hypotheses de MENDEL se situe au niveau de
l'etude des individus de la F
3
produite par autoIecondation des individus de la F
2
.
Si l'hypothese est juste, les plantes a pois rides (r) de la F
2
ne devraient produire que des
plantes a pois rides puisqu'elles sont de race pure. Parmi les plantes a pois ronds de la F
2
, une
partie (13) sont identiques aux parents ronds purs R et ne devraient donner que des plantes a
pois ronds; les autres (23), semblables a leurs parents de la F
1
(Rr) devraient donner une
descendance composee de 3 plantes a pois ronds pour 1 plante a pois rides. C'est
eIIectivement ce qu'il observa.
Pour veriIier que l'hybride produit deux types de gametes et en nombres egaux,
MENDEL imagina un test encore couramment utilise aujourd'hui, connu sous le nom de
rtrocroisement ou back-cross. L'hybride Rr est croise avec le parent pur recessiI rr.
Sachant que le parent rr ne peut produire que des gametes r, si l'hybride Rr Iournit 50 de
gametes R et 50 de gametes r, le retrocroisement doit Iournir 50 de plantes Rr a pois
ronds, et 50 de plantes r a pois rides. C'est aussi ce qu'il constata; quel que soit le sens du
croisement (croisements reciproques, Rr Iecondant r ou r Iecondant Rr).
Ce test permet en outre de determiner la "purete" genetique d'un individu puisqu'un
hybride donnera 50 des deux phenotypes tandis que le parent de race pure donnera 100
d'individus de son propre phenotype comme dans la premiere etape P -- F
1
. C'est dans ce but
que ce test est surtout utilise actuellement en botanique ou en genetique animale. Notons que
le back-cross est la seule methode utilisable chez les plantes unisexuees et chez les animaux
ou il ne saurait tre question d'autoIecondation au sens reel du terme.
171
MENDEL Iit des observations identiques a celles decrites plus haut a propos de six
autres caracteres simples etudies sur les pois : (pois jaunes ou vert; teguments colores ou
incolores; cosse pleine ou plissee; cosse ridee ou rond; Ileur axillaire ou terminale; variete
naine ou geante) et il enona sa premiere loi:
Loi de l'uniIormite en F1 et de la segregation en F
2
:
Lorsqu'on croise deux races qui ne diIIerent entre elles que par un seul caractere
(monohybridisme), les hybrides de la F
1
sont tous semblables entre eux et presentent
l'association des caracteres des parents, compte tenu de la dominance. En seconde generation
F
2
, issue des hybrides de la F
1
, il y a disjonction (segregation) des caracteres parentaux et
apparition de 25 d'individus de race pure paternelle, 25 d'individus de race pure
maternelle et 50 d'individus semblables aux hybrides de la F
1
. Ces derniers individus se
dissocient a la generation suivante et indeIiniment de la mme maniere.
L'interprtation actuelle des faits
La Iorme des pois est contrlee par un gne R, dont il existe deux allles diIIerents:
un allele R dominant qui produit des pois rond, et un allele r recessiI qui produit des pois
rides. Le pois etant une plante diplode comme la majorite des plantes superieures, il possede
deux copies du gene r, situees sur deux chromosomes homologues, au mme endroit (appele
locus du gene).
Lors de la meiose, les chromosomes homologues se retrouvent dans des gametes
diIIerents. Si les deux chromosomes portent le mme Iacteur R (individus homozygotes
ronds), tous les gametes produits porteront ce Iacteur R et seront donc identiques. De mme
les gametes issus du parent "ride" seront tous identiques. Si les deux chromosomes portent
des alleles diIIerents (R et r dans l'experience de Mendel, individus htrozygotes), 50 des
gametes porteront l'allele R et 50 l'allele r. Lors de la Iecondation, les gametes mles et
Iemelles s'associent de maniere aleatoire et on peut utiliser les regles mathematique de
probabilites:
En deuxieme generation (croisement Rr x Rr):
p(RR) p(gamete R) . p(gamete R) 0,5 . 0,5 0,25 soit 25
p(Rr) p(gamete R) . p(gamete r) p(gamete r) . p(gamete R)
0,50 . 0,5 0,5 . 0,5 0.25 0.25 0.5 soit 50
avec p(RR), la probabilite d'obtenir un individu RR
p(gamete R) la probabilite que la mere produise un gamete R
172
Puisque deux genotypes diIIerents exteriorisent le mme phenotype, la connaissance
de celui-ci ne permet pas de connatre automatiquement le genotype. Il Iaudra Iaire un
rtrocroisement pour voir si des individus a phenotype dominant sont homozygotes ou
heterozygotes (RR ou Rr). Encore que, sur un petit nombre d'observations (p ex la
descendance d'animaux), il est statistiquement possible, que par le seul hasard, un
heterozygote retrocroise avec le recessiI ne donne que des individus de phenotype dominant,
Iaisant croire a un homozygote! Dans la descendance d'un retrocroisement, l'existence d'un
seul phenotype recessiI constitue la preuve que le parent teste etait heterozygote mais
l'absence totale de phenotype recessiI ne constitue pas la preuve absolue que l'individu teste
soit homozygote! (Tout au plus peut-on calculer la probabilite de se tromper en aIIirmant
qu'il l'est). Dans les experiences relatives a l'etablissement des proportions phenotypiques, il
est essentiel de considerer un grand nombre d'individus. Selon cette loi, les resultats observes
se rapprochent d'autant plus des resultats attendus theoriquement que le nombre d'individus
testes est grand. Des tests statistiques ("chi carre") permettent de calculer la concidence entre
les observations et les previsions theoriques de l'hypothese qu'une experience est censee
veriIier. Les tests permettent d'accepter une hypothese (ou de la rejeter quand elle prevoit des
resultats trop eloignes des observations reelles) mais ne prouvent jamais qu'une hypothese est
bonne. Ils mesurent simplement les chances qu'on a de se tromper en acceptant cette
hypothese. Dans le cas d'analyse de transmission de genes chez l'homme, le nombre
d'individus sera souvent limite et la plus grande prudence s'impose quant aux conclusions qui
peuvent tre tirees.
L'explication de la dominance
Le phenomene de dominance est parIois complexe. Dans certains cas simples, l'allele
recessiI produit une enzyme non Ionctionnelle se traduisant par un phenotype "absence
de.". Prenons l'exemple du lapin: la graisse sous-cutanee du lapin sauvage est blanche
tandis que celle du lapin domestique est jaune. Si l'on croise deux de ces lapins, les hybrides
ont une graisse blanche. En seconde generation, il y a disjonction et on obtient 3 lapins a
graisse blanche pour un lapin a graisse jaune. L'allele graisse blanche domine donc l'allele
graisse jaune.
La diIIerence de couleur entre les deux graisses provient de la presence ou de
l'absence de xanthophylles non degradees. La graisse du lapin sauvage est blanche parce que
les xanthophylles presentes normalement dans sa nourriture sont degradees en substances
incolores par une enzyme localisee dans le Ioie. Au contraire, le lapin domestique a perdu la
Iaculte de synthetiser cette enzyme, les xanthophylles (jaunes) s'incorporent telles quelles
dans sa graisse et la colorent. Le lapin hybride Bb possede une graisse blanche parce que
l'allele B (la portion d'ADN) code la Iormation de l'enzyme speciIique en quantite suIIisante
pour degrader la xanthophylle ingeree. Dans ce cas, les genotypes BB et Bb produisent le
173
mme phenotype. Mais en derniere analyse, ce phenotype jaune ou blanc depend d'un Iacteur
externe, d'un Iacteur du milieu : la presence de xanthophylle dans la nourriture. Il est evident
que si l'on nourrit le lapin domestique avec une nourriture depourvue de xanthophylle, il aura
comme le lapin sauvage une graisse blanche. Ceci souligne le Iait sur lequel nous avons deja
insiste, a savoir qu'un gene determine une potentialite et que l'exteriorisation de cette
potentialite est conditionnee par le milieu.
Les groupes sanguins et l'hemophilie, comme nous le verrons dans la suite, constituent
deux autres exemples ou l'allele recessiI code une proteine non Ionctionnelle, et ou une seule
copie normale produit suIIisamment de proteine normale pour que le phenotype des individus
hererozygotes soit le mme que celui des individus homozygotes.
4.3 APPLICATIONS A L'HOMME
CARAC1ERES DOMIAAA1S
On a repertorie chez l'homme plus de 1500 genes dominants transmis selon les lois de
MENDEL. Il en est ainsi vraisemblablement de la pigmentation normale des cheveux, des
taches de rousseur, de l'absence de poils sur tout le corps (a ne pas conIondre avec la
calvitie), de la Iorme et de la densite des sourcils (a l'exception des sourcils minces), des
cheveux boucles, des cheveux noirs par rapport aux cheveux blonds, du prognathisme, de la
mal articulation des dents, de la Iaculte de rouler ou de plier la langue, du lobe de l'oreille
detache, de la sensibilite gustative a la phenylthiouree, de la Iorme du nez, des empreintes
digitales, de la couleur des yeux (en realite de la couleur de l'iris; dans ce dernier exemple, les
yeux noirs ou bruns Ionces sont dominants par rapport aux yeux bleus)...
Entre la dominance complete (absolue) et l'absence de dominance (ou presence de
codominance), certains caracteres presentent une dominance incomplte. Dans ce cas, le
phenotype des heterozygotes n'est pas identique a celui des homozygotes pour l'allele
dominant.
Chez l'homme, la recherche de maladies hereditaires rares se Iait par l'analyse des
arbres genealogiques des Iamilles ou on la rencontre. Une maladie autosomique dominante se
repere par les caracteristiques suivantes:
1) il y a des individus atteints a chaque generation;
2) si le conjoint est "normal", environ la moitie (si le patient est heterozygote) ou la totalite
(homozygote) de la descendance montre la tare;
3) les enIants non atteints ne la transmettent pas a leur descendance;
4) la transmission n'est pas inIluencee par le sexe du porteur.
174
Actuellement les techniques de genie genetique permettent de conIirmer ces analyses en
sequenant directement les alleles des individus, permettant de determiner s'ils sont
homozygotes ou heterozygotes. Ce type d'analyse, reservee au depart aux laboratoires de
recherche, est maintenant accessible dans des laboratoires de routine hospitaliere. Ceci n'est
bien sr possible que si le gene responsable de la maladie a ete identiIie, ce qui n'est pas
toujours le cas.
Parmi les maladies transmises selon le mode dominant, citons la choree de
Huntington, l'achondroplasie, l'osteogenese imparIaite et certaines Iormes de syndactylie.
CARAC1ERES RECESSIFS
Tout homme possede dans son patrimoine hereditaire des alleles recessiIs (tare
quelconque, malIormation, maladie...) qu'il ne remarque pas. Seul l'examen de la descendance
pourrait les devoiler, puisque, dans ce cas, un back-cross est inconcevable! On a estime
d'apres le nombre de maladies hereditaires recessives, letales et leur Irequence d'apparition,
que chaque individu pourrait tre porteur de huit genes letaux! Si 1 de la population
possede l'allele recessiI d'une tare, il n'y a une probabilite de (1)
2
soit 110 000 que la tare
apparaisse. A l'inverse, il s'en suit que des proches parents, dont les genes sont en partie
derives des mmes sources, ont une probabilite beaucoup plus elevee de transmettre a leur
descendance une tare recessive a l'etat homozygote, que ceux qui ne sont pas apparentes.
C'est pourquoi des troubles et des malIormations rares apparatront plus souvent dans la
descendance d'unions consanguines. Cette observation (connue bien longtemps avant les lois
de l'heredite) est peut-tre la raison pour laquelle les lois civiles et religieuses deIendent les
unions entre personnes etroitement apparentees: Irere-soeur, oncle-niece...et certaines lois
deIendent mme les unions entre cousins germains. Deux cousins germains ont encore un
huitieme de leurs genes en commun. Leurs descendants sont donc homozygotes pour 116 de
leurs genes.
On connat plus de 1200 maladies ou malIormations recessives chez l'homme:
l'albinisme, le nanisme vrai, l'idiotie inIantile, la cecite totale aux couleurs, la mucoviscidose,
l'anemie IalciIorme... Il existe actuellement des bases de donnees accessibles a partir
d'internet repertoriant les maladies congenitales connues et leur type de transmission
(notamment la banque de donnees OMIM "Online Mendelian Inheritance In Man" ,
accessible a partir du site http:www.ncbi.nlm.nih.gov).
Un caractere recessiI se remarque dans une genealogie parce que :
1) si une personne l'exteriorise, il n'apparat pas Iorcement chez ses parents ni ses enIants,
mais peut apparatre chez certains Ireres et soeurs;
175
2) en moyenne (si l'on regroupe un grand nombre de Iamilles ou un enIant presente ce
caractere), un enIant sur quatre est atteint;
3) les parents peuvent presenter une certaine consanguinite.
CARAC1ERES CODOMIAAA1S: LES CROUPES SAACUIAS
Le gne ABO
Un des exemples classiques en genetique est l'heredite des groupes sanguins (systeme
ABO). Cet exemple permet d'illustrer deux nouveaux concepts: la codominance et la
polyallelie. Dans les cas de codominances, deux alleles diIIerents peuvent tous les deux
s'exprimer en mme temps. La polyallelie veut simplement dire qu'au lieu d'avoir seulement
deux alleles diIIerents pour un mme gene, il peut exister un grand nombre d'alleles. Il est
evident qu'une cellule diplode ne possedant que deux copies de chaque gene, ne possedera
qu'un ou deux des alleles existants.
Dans le cas du systeme ABO, il existe quatre alleles diIIerents d'un mme gene.
Les globules rouges (hematies) possedent en surIace des polysaccharides particuliers,
denommes agglutinogenes. La nature de ces sucres se transmet selon les lois de Mendel avec
la participation de 4 alleles diIIerents :
L'allele I
a1
encode une enzyme qui produit l'agglutinogene A
1
;
L'allele I
a2
encode une enzyme qui produit l'agglutinogene A
2
;
L'allele I
b
encode une enzyme qui produit l'agglutinogene B;
L'allele I
o
n'entrane la Iormation d'aucun agglutinogene.
L'allele I
a1
est dominant par rapport a I
a2
. I
a1
et I
a2
sont codominants vis-a-vis de I
b
et ils peuvent s'exprimer simultanement. I
o
est Iorcement recessiI par rapport aux autres. En
Belgique, 80 a 90 des sujets A sont A
1
et le reste A
2
. Dans la pratique medicale, la
distinction A1-A2 n'a pas beaucoup d'intert, et les deux alleles sont souvent appeles
simplement "A".
Par ailleurs, le serum Iabrique quelques mois apres la naissance des anticorps appeles
agglutinines. Elles proviennent des reactions d'immunodeIense de notre corps et ne sont pas
transmises genetiquement. Il en existe de deux sortes: o et . Par reaction antigene-anticorps,
l'agglutinine o (ou anti-A) agglutine les globules rouges qui portent l'agglutinogene A
1
ou
A
2
. De mme l'agglutinine (ou anti-B) agglutine les hematies contenant l'agglutinogene B.
Il est clair qu'un individu ne possede jamais simultanement A et o ou B et sinon, il y
aurait auto-agglutination de ses hematies, ce qui est incompatible avec la vie. On ne peut
donc eIIectuer de transIusion sanguine qu'entre individus dont le sang est compatible.
176
Le tableau suivant montre qu'il existe ainsi 10 genotypes possibles, mais comme
certains exteriorisent le mme phenotype, il n'existe que 4 phenotypes, 4 groupes sanguins
diIIerents ; A, B , AB et O. Des variantes existent, assez rares.
genotype phenotype groupe sanguin agglutinine
I
a1
I
a1
A
1
A
I
a1
I
a2
A
1
A
I
a1
I
o
A
1
A
I
a2
I
a2
A
2
A
I
a2
I
o
A
2
A
I
b
I
b
B B a
I
b
I
o
B B a
I
a1
I
b
A
1
B AB aucune
I
a2
I
b
A
2
B AB aucune
I
o
I
o
O O a et
Les transIusions permises peuvent tre schematisees comme suit en ce qui concerne les
globules rouges uniquement:
O---- O, A, B, AB ("donneur universel")
A---- A, AB
B---- B, AB
AB----AB ("receveur universel")
Notons que le terme de "donneur universel" n'est pas tres heureux puisqu'il ne
s'applique qu'aux globules rouges. En eIIet, lorsque l'on donne du sang O a un receveur du
groupe A, ce dernier reoit, non seulement les globules rouges mais aussi le serum. Or, le
serum du groupe O contient des agglutinines o et . Si l'agglutinine a peu d'importance
pour le receveur A, l'agglutinine o va se trouver en presence de l'agglutinogene A et pourrait
provoquer l'agglutination. Heureusement, quand la transIusion est peu abondante,
l'agglutinine o injectee est Iortement diluee dans la masse sanguine du receveur A et elle se
repartit, sans dommage, sur un important volume de globules rouges. Il existe touteIois des
"donneurs universels dangereux" qui possedent des agglutinines particulierement puissantes
et qui constituent un risque grave pour les globules rouges du receveur. C'est pourquoi, on
preIere toujours transIuser du sang appartenant au mme groupe que le receveur. Ce n'est
qu'en cas d'urgence que l'on transIusera du sang de groupe O a des personnes de groupe
sanguin inconnu.
On determine les groupes sanguins a partir de serums prepares avec du sang de
donneurs A et B possedant des agglutinines, et o, puissantes.
177
On procede de la maniere suivante: une goutte de sang inconnu est mis en contact separement
avec les serums o et (tableau ci-apres). Si o agglutine les globules rouges et pas , c'est que
le sang est du groupe A; si c'est l'inverse, le sang est du groupe B; si o et agglutinent le
sang, celui-ci est du groupe AB et enIin, s'il n'y a aucune agglutination, le sang est du groupe
O.
Globules rouges inconnus:
agglutination par ! --- Gr sanguin
- A
- B
AB
- - O
La technique inverse permet de determiner le groupe sanguin d'un serum inconnu a partir de
la mme reaction d'agglutination sur des globules rouges appartenant aux groupes A et B.
L'explication de ces antigenes est la suivante: tous nos globules rouges
possedent en surIace, accroches tant a certaines proteines qu'a certains lipides, un
polysaccharide schematise ci-dessous :
m
e
m
b
r
a
n
e
1 2 3 2
4
5
1 glucose, 2 galactose, 3 N acetylglucosamine, 4 Iucose.
Tel quel, ce polysaccharide n'a pas d'eIIet antigenique.
L'allele I
a
code pour une glucosyltransIerase qui ajoute en 5 du N acetylgalactosamine
L'allele I
b
code pour une glucosyltransIerase qui ajoute en 5 du galactose
L'allele I
o
n'ajoute rien
Entre I
a
et
I
b
, il y a 4 bases qui changent, donc 4 triplets diIIerents, donc 4 acides amines
diIIerents.
Le site actiI de la glucosyltransIerase est de ce Iait un peu modiIie :
l'enzyme synthetise par I
a
utilise l'UDP-N acetylgalactosamine
l'enzyme synthetise par I
b
utilise l'UDP-galactose
Ils s'expriment donc tous les deux et sont donc codominants
I
o
a subi une deletion ponctuelle. Il a perdu une base. Cela entrane un decalage du cadre de
lecture d'ADN, ce qui conduit a une proteine non Ionctionnelle. Il n'a donc pas de sucre
ajoute en 5 et l'allele est recessiI.
178
Le facteur Rhsus
Outre ces incompatibilites, le Iacteur rhesus joue egalement un rle important dans la
transIusion sanguine. Ce Iacteur Iur decouvert en 1940 (LANDSTEINER WIENER -
MOUREAU a Liege). Lorsqu'on injecte pour la premiere Iois du sang d'un singe macaque
(Macacus rhesus) a un lapin, celui-ci demeure en vie. Mais apres une seconde injection
pratiquee un mois apres la premiere, le lapin meurt car son serum a agglutine les globules
rouges du macaque. Les globules rouges du macaque contiennent un agglutinogene Rh qui
provoque la Iormation, chez le lapin, d'anticorps (agglutinine) anti-Rh. La premiere injection
induit la Iormation (lente) des anti-Rh dont la quantite devient alors suIIisante pour
provoquer l'agglutination du sang lors de la seconde injection.
Chez 85 des hommes de type caucasien, les globules rouges possedent un
agglutinogene Rh equivalent a celui du macaque. Ils Iorment le groupe Rh
. Les 15
restants n'ont pas cet agglutinogene mais peuvent Iormer des agglutinines anti-Rh identiques
a celles du lapin. Ils Iorment le groupe Rh
-
.
Comme le Iacteur Rh caracterise indiIIeremment le sang des groupes A, B, AB ou O,
il est indispensable d'imposer lors d'une transIusion, les mmes mesures de securite que pour
les groupes sanguins. En eIIet, si l'on donne du sang O
a un receveur O
-
, la premiere
transIusion n'aura pas d'eIIet immediat, mais le receveur Iabriquera des agglutinines anti-Rh
qui le mettront hors d'etat de supporter une nouvelle transIusion de sang O
.
Le Iacteur Rh est hereditaire et depend tres schematiquement d'une paire d'alleles: D
exteriorise Rh
et dd au groupe Rh
-
.
Dans les unions entre un homme Rh
et une Iemme Rh
-
(un couple sur dix est dans ce
cas) il peut se poser de graves problemes en cas de naissance d'un enIant Rh. Il n'y aura
jamais de problemes si l'enIant est Rh- comme sa mere (possible si le pere est heterozygote).
La naissance du premier enIant Rh
ne pose pas de probleme. Mais lors de l'accouchement,
une Iaible quantite de son sang peut passer accidentellement dans le sang de la mere. Celle-ci
va donc recevoir une Iaible quantite de globules rouges Rh
ou B
), le serum de la
mere possede deja les anticorps o et qui vont eliminer les globules rouges A et B de l'enIant
qui passent dans son propre circuit sanguin avant qu'ils n'y declenchent la reaction
d'immunisation.
Actuellement, on protege la mere Rh
-
par une injection intramusculaire de
immunoglobulines anti-Rh dans les 72 heures qui suivent la naissance de l'enIant Rh
. Ces
immunoglobulines sont preparees a partir de plasma sanguin de donneurs sensibilises
(donneurs Rh
-
auxquels on a injecte une petite quantite de Rh
.
D'apres les statistiques du Centre de TransIusion Sanguine a Woluwe, la repartition
des groupes sanguins en Belgique est la suivante : 42,5 Iont partie du groupe O; 42,5 Iont
partie du groupe A ; 12 Iont partie du groupe B; 3 Iont partie du groupe AB. Il y a
environ 85 de Rh
et 15 de Rh
-
En plus des systemes "ABO" et "Rh", d'autres ont ete decouverts dont le systeme
"MN" tres simple. L'heredite de M et de N, responsables de l'apparition a la surIace des
globules rouges des antigenes M et N est independante de celle qui regit les systemes ABO et
Rh. Dans la population, on rencontre les trois phenotypes MM, MN, NN. L'existence de
chacun des antigenes M et N est due a la presence des alleles codominants L
M
et L
N
. Les
genotypes sont L
M
L
M
, L
M
L
N
, L
N
L
N
. Notons que les antigenes M et N n'ont aucune
importance lors des transIusions sanguines car l'homme ne possede pratiquement jamais les
anticorps correspondants. Ils sont surtout utilises dans les problemes d'identiIication de sang.
Mendel etudia dans ses travaux des systemes ou plus de deux alleles du mme gene
etaient presents. Les botanistes ont garde le terme polyhybridisme pour designer ce type de
situation.
4.4 LES NOTATIONS EN GENETIQUE
Pour diIIerencier les alleles, MENDEL a introduit la notation suivante : la premiere
lettre de l'allele dominant est en majuscule (R pour rond, V pour violet), la lettre minuscule
correspondante pour l'allele recessiI (r pour ride, v pour blanc).
180
Les scientiIiques qui etudient la drosophile, comme Morgan, et qui ont beaucoup
contribue au developpement de la genetique, ont adopte une autre notation. Quel que soit le
caractere etudie, l'allele responsable de l'expression du phenotype "sauvage" ("wild-type",
c'est-a-dire celui que l'on rencontre dans la nature, l'allele normal) est note par "". Un
homozygote sauvage est donc represente par . L'allele nouveau, mutant, que l'on etudie est
note par une ou deux lettres de son nom (anglais generalement). Cette lettre est minuscule si
l'allele est recessiI par rapport au type sauvage, majuscule si par contre il est dominant. Ainsi,
par exemple, une souris albinos est donc ww (w white; minuscule parce que recessiI). Une
souris normale est representee par ou w selon qu'elle est homozygote ou heterozygote.
Quand on etudie plusieurs caracteres a la Iois, il est cependant utile de preciser le gene avec
lequel l'individu est "sauvage". Dans ce cas le genotype devient w
et w devient w
w,
le phenotype etant code w
.
Une autre notation, utilisee surtout dans les questions de crossing-over (voir plus loin)
est par exemple w
w rappelant ainsi que les alleles sont portes par les chromosomes
homologues associes. Ces symboles peuvent suivre (en exposant) le nom du gene (ex :
couleur
, ou couleur