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PREFACE

Le but de cette premiere partie du cours de biologie generale est de donner aux etudiants de
premiere annee de baccalaureat les bases necessaires a la comprehension de cours plus
specialises communs a tous les programmes de la Iaculte de medecine (histologie, biochimie,
biologie cellulaire et moleculaire, physiologie, genetique. ).

L`objectiI de tout enseignement universitaire n`est pas limite a la transmission d'un savoir,
mais vise aussi a pousser les etudiants a developper une methode qui leur permette d`
"apprendre a apprendre" par eux-mmes. Cette methode comporte de multiples etapes :
recherche de sources de documentation Iiables, comprehension, lecture critique, synthese et,
Iinalement mise en application du savoir acquis.

La matiere qui doit tre matrisee par l`etudiant est deIinie lors du cours en auditoire et nous
encourageons donc vivement les etudiants a prendre des notes. La prise de notes exactes et
completes etant un exercice diIIicile, l'etudiant peut les completer a l'aide des elements
suivants:
- ce syllabus reprend la majorite des explications donnees au cours. Il n'est pas complet mais
constitue une bonne base de notes de cours. Il contient aussi certaines explications
supplementaires donnees a titre indicatiI.
- les schemas dessines au tableau doivent tre recopies le plus Iidelement possible.
- les schemas qui sont projetes Iont egalement partie du cours. L'etudiant doit donc s'exercer a
les reproduire. Ils sont disponibles sur le site internet du cours.
- l`ouvrage de reIerence recommande pour ce cours est Biologie de Campbell et Reece
(disponible a la bibliotheque et dans n`importe quelle librairie). L'ouvrage "Biologie" de
Raven peut egalement tre consulte.
- un Iorum de discussion est egalement a la disposition des etudiants sur le site iCampus pour
repondre aux questions qui subsisteraient.

Ce cours necessite plusieurs niveaux d`apprentissage. Tout d`abord, une serie de notions
doivent tre etudiees par cour : noms des composes, des structures cellulaires, des
processus, etapes de ces processus, etc. N`hesitez pas a utiliser des trucs mnemotechniques
pour vous Iaciliter la tche ! Ensuite, il est indispensable de chercher a comprendre la logique
qui sous-tend les processus biologiques. Cette etape de comprehension va grandement
Iaciliter la memorisation du cours, et surtout, permettra a l`etudiant d`utiliser ce qu`il a appris
pour aborder des matieres nouvelles. Pour chaque aspect de la vie cellulaire, les questions
suivantes doivent tre posees : Comment a marche ? , Pourquoi ? , Quels sont les
avantages d`un mecanisme plutt que d`un autre ? . EnIin, la mise en application des
concepts theoriques permet de resoudre les quelques exercices proposes dans ce cours.
1
Des questions de reIlexion sont proposees aux etudiants a la Iin de chaque partie, de Iaon a
ce qu`ils puissent tester leur niveau de comprehension. Ces questions sont similaires a celles
qui seront posees lors de l`examen ecrit (mais pas identiques - etudier par cour les
reponses n`a aucun intert !). Il est indispensable que l`etudiant reIlechisse lui-mme aux
reponses a apporter a ces problemes, puis qu'il en discute avec d`autres.

L`etude "transversale" est tres importante dans ce cours. Les structures cellulaires doivent
tre associees aux composes chimiques qu`elles contiennent, et aux Ionctions physiologiques
qu`elles remplissent. La comprehension des mecanismes genetiques passe par une bonne
matrise de la physiologie cellulaire (synthese des proteines) et de la division cellulaire
(mitose, replication de l`ADN, chromosomes). Les questions d`examen comporteront souvent
plusieurs elements de reponse situes dans des chapitres diIIerents. Pour preparer l`etudiant a
ce type de questions, il est vivement recommande d`etudier de maniere transversale : apres
avoir vu le cours de maniere lineaire (chapitre par chapitre, dans l`ordre propose dans ce
syllabus), il est utile de le revoir theme par theme : les membranes (composants, structure,
permeabilite, nutrition, metabolisme des lipides) ; l`ADN (structure, noyau, replication,
chromosomes, genes, polymorphisme) ; la mitochondrie (structure, metabolisme, origine) ;
etc. Il est probablement utile de construire un petit resume pour chaque theme transversal.

Lorsque la matiere du cours est acquise, il est essentiel d`tre capable de la restituer de
maniere adequate. Quelques conseils pour l`examen : les schemas qui sont reproduits doivent
tre clairs, comprehensibles et legendes. Quelques phrases sont en general necessaires pour
expliquer un dessin. Il est tout aussi important de repondre precisement a une question : ne
pas systematiquement retranscrire tout le chapitre correspondant, ce qui diminue
automatiquement la valeur de la reponse donnee. Les interrogations et les rapports de travaux
pratiques constitueront un bon entranement.

Bon travail !

Jean-Baptiste Demoulin
Charge de cours

Le 5 juillet 2007.
2


INTRODUCTION


La Biologie est l'etude scientiIique des organismes vivants.
Qu'est-ce que l'etude scientiIique? Que sont les tres vivants?

Obfectifs a atteindre par letudiant .
Etre capable de deIinir et classiIier les tres vivants

1. LA MTHODE SCIENTIFIQUE


L'etude scientiIique se distingue d'autres Iormes de pensees par sa methode: la religion
est issue de la revelation, la philosophie de la reIlexion. La science se caracterise par la
methode experimentale.
Cette methode presente plusieurs phases:
La premiere est l'observation: on accumule une serie de donnees sur le probleme
d'intert, en utilisant le plus souvent des appareillages parIois tres complexes. Un chercheur
doit tre a la Iois curieux et precis dans ses observations. Une decouverte majeure decoule
souvent de l'observation sous un angle nouveau d'un probleme ancien. Les travaux pratiques
constituent une bonne introduction a l'observation scientiIique.
A partir de ces observations decrites, classees, structurees, naissent des questions:
quelle est l'origine, la cause de ce que j'observe? quelle relation unit la cause supposee et
l'eIIet observe? Ces questions entranent par induction, des hypothses explicatives: causes,
relations de cause a eIIet.Un chercheur doit tre imaginatiI.
Ces hypotheses sont alors testes exprimentalement pour en veriIier le bien-Ionde
ou les limites. Si de nombreuses experiences conIirment l'hypothese et quand la communaute
scientiIique l'admet, l'hypothese est alors elevee au rang de thorie. Le chercheur doit tre
impartial et tres prudent. Cette theorie permet alors de Iaire avancer d'un pas la
comprehension du monde qui nous entoure.
De ce Iait, la demarche scientiIique n'est pas inIaillible, contrairement a ce que l'on
pense souvent. Elle possede plusieurs points Iaibles:
- des erreurs peuvent se produire dans les observations : mme prolonges par des instruments,
nos sens ont des limites et on peut calculer l'erreur due aux limites de precision des
instruments;
3
- les hypotheses peuvent ne pas tre suIIisamment puissantes et n'expliquer d'une partie des
observations;
- les experiences peuvent tre mal adaptees au but poursuivi, biaisees ou insuIIisantes en
nombre et variete;
- la soit disant relation trouvee peut n'tre que le Iruit malheureux du hasard : n'oublions
jamais que la statistique, etalon de mesure de la Iiabilite des resultats experimentaux, ne
prouvera jamais que l'hypothese qui sous-tend l'experience est bonne ou mauvaise, elle ne
Iera que mesurer les chances que l'on a de se tromper en l'acceptant.si les lois du hasard
sont respectees;
- la theorie peut surgir trop tt d'une generalisation abusive ou d'une extrapolation a partir
d'un nombre trop restreint de donnees,
- et il arrive mme que des chercheurs soient malhonntes.
Aussi le scientiIique doit-il rester vigilant et n'admettre les theories que "jusqu'a
preuve du contraire", surtout dans un domaine aussi complexe et variable que la biologie.
Ceci constitue indeniablement une des diIIicultes de la biologie: cette incertitude, cette
remise en question constante nous Iait avancer sur un terrain mouvant, alors que nous
imaginons que partout en biologie tout est aussi clair que 2 2 4.

Malgre toutes ses imperIections, la methode scientiIique est l'outil le plus puissant, le
plus eIIicace et le plus sr que l'homme ait invente pour mieux comprendre le monde dans
lequel il vit. Les progres spectaculaires de la medecine depuis qu'elle applique cette methode
en sont la preuve.


2. LES TRES VIVANTS

Curieusement, alors qu'intuitivement on peut aisement distinguer les tres vivants des
choses inanimees, il est diIIicile de deIinir la vie. Commenons par enumerer les
caracteristiques essentielles qui distinguent les tres vivants des tres inanimes.
1 Parmi ces proprietes, la plus apparente est l'organisation : tous les tres vivants sont
organises, structures, quel que soit le niveau observe. Ainsi, une plante superieure, est
composee d'organes (tiges, Ieuilles, racines, Ileurs, Iruits) et chacun d'eux est structure en
tissus remplissant chacun des Ionctions bien precises (assimilation, soutien, protection, etc.).
Les tissus eux-mmes sont Iormes d'un certain nombre d'unites Iondamentales d'organisation
: les cellules.
La cellule a son tour, possede une etonnante richesse de structures et d'organites. Au-dela, et
jusqu'au niveau moleculaire, la matiere vivante demeure tout autant structuree. Chaque
molecule possede une structure bien precise qui lui permet d'operer des Ionctions
particulieres et souvent speciIiques.
4
Si certains corps inanimes montrent parIois une structure complexe (cristaux, par exemple),
celle-ci n'est jamais liee a une Ionction biologiquement explicable.
2 Les tres vivants sont ordonns au sens thermodynamique du terme, ce qui ne peut se
Iaire qu'au prix d'une grande consommation d'energie. De ce Iait, les tres vivants constituent
des systemes thermodynamiques ouverts. Ils ont des relations avec le milieu exterieur dans
lequel ils puisent l'energie (qu'ils transIorment et degradent) et les materiaux necessaires a
leur maintien (homeostasie) et a leur croissance. Il existe entre les tres vivants et le milieu
dans lequel ils vivent, un echange continuel de substances, lie a des echanges d'energies.
3) Chaque structure - depuis la molecule jusqu'a l'organe le plus complexe - possede une
fonction qui lui est propre. Structure et Ionction sont deux aspects indissolublement lies.
Chez l'tre vivant aucune structure n'a de raison d'tre sans la Ionction qui lui est associee et
chaque Ionction ne peut se realiser normalement qu'au sein d'une structure bien precise,
complete et entiere. Cet aspect ne se maniIeste pas chez les objets inanimes.
4 Les tres vivants se reproduisent; c'est la une quatrieme propriete Iondamentale. Ils
sont capables de generer d'autres individus semblables a eux-mmes, possedant la mme
structure Ionctionnelle et la mme autonomie.
Les tres vivants sont donc doues d'autosynthese, d'autoreproduction, et la matiere vivante ne
peut se synthetiser qu'a partir d'elle-mme .
5 EnIin, quoique cette cinquieme propriete soit moins spectaculaire chez les vegetaux
que chez les animaux, tous les tres vivants sont capables de ragir, par des mouvements, a
certaines excitations exterieures et d'y adapter leur comportement. Ils peuvent en outre
s'adapter au milieu dans lequel ils vivent et mme le modiIier a leur avantage ou voluer
pour survivre.

La comparaison entre les tres vivants a montre que l'unite Iondamentale, minimale de
la vie, c'est la cellule.
Une cellule possede une limite qui a la Iois, la separe, l'isole du milieu exterieur et
contrle les transIerts moleculaires. Il s'agit d'une membrane plasmique qui, chez les
vegetaux, est protegee, renIorcee du cte exterieur par une paroi cellulaire. Le contenu
Iondamental de la cellule, le cytoplasme contient les structures et les inIormations
necessaires a toutes les Ionctions de l'tre vivant: nutrition, metabolisme, croissance,
reproduction. L'information est stockee sous Iorme chimique dans l'ADN. Le cytoplasme
possede en plus des chanes enzymatiques qui lui permettent de recuperer de l'energie puisee
a l'exterieur sous Iorme chimique (molecules organiques) ou physique (lumiere) et de la
transformer en ATP. Le cytoplasme possede enIin des systemes enzymatiques necessaires a
l'exploitation de son inIormation en la traduisant sous Iorme de proteines, outils de son
metabolisme et de son autoduplication. Ces Ionctions sont separees dans des territoires
cellulaires diIIerents chez les cellules evoluees.
5
Aux niveaux inIerieurs, les organites intracellulaires, les virus et les molecules
biologiques montrent encore des structures, Ionctions, inIormations typiques de la vie mais ne
les possedent plus toutes. Les virus ne sont donc pas des tres vivants a part entiere.
Aux niveaux superieurs, les tissus, organes, individus et colonies sont composes de
cellules developpant entre-elles des collaborations. La cellule occupera donc une place
centrale dans ce cours de biologie, car c'est a ce niveau que se concretise le plus l'unicite du
monde vivant.

En conclusion, on peut deIinir un tre vivant comme un organisme
capable de crotre et de se reproduire
en se maintenant dans un etat eloigne de l`equilibre, grce a un Ilux continu d`nergie et de
matiere Iourni par l`environnement,
et constitue d`une ou plusieurs cellules.


3 . LA DIVERSIT DU MONDE VIVANT: CLASSIFICATION

Le monde vivant etait classiquement divise en deux regnes : animal et vegetal, etudies
par la zoologie et la botanique. Les animaux sont caracterises par une tendance evolutive
selectionnant des individus avides de relation active et perIectionnee (developpement des
systemes sensoriel, nerveux et locomoteur), au detriment de l'autonomie nutritive
(heterotrophes). Les vegetaux, au contraire privilegient l'autonomie alimentaire par utilisation
de l'energie lumineuse et du gaz carbonique (autotrophes), ce qui entrane une strategie
d'occupation de l'espace, dont les corollaires sont l'ancrage au sol et l'immobilite. Les
champignons, heterotrophes mais utilisant la mme strategie d'occupation etaient consideres
comme des vegetaux inIerieurs. Les tres vivants microscopiques etaient classes dans l'un ou
l'autre regne sur base de leur capacite de photosynthese ou de mobilite. Il apparut cependant
rapidement que beaucoup d'entre eux ne ressemblaient ni aux uns ni aux autres et qu'il Iallait
les classer a part. De plus, une diIIerence Iondamentale apparut dans ce groupe au niveau de
la structure cellulaire et obligea de le scinder en deux. EnIin, une meilleure connaissance des
champignons amena a les considerer a part des vegetaux. Ces considerations ont mene a une
nouvelle classiIication du monde vivant, celle de R.H. WITTAKER, qui se base sur l'existence
de 5 regnes:

Les procaryotes
Ce sont des tres vivants unicellulaires, isoles ou en colonies, dont la structure
cellulaire est extrmement simple. Ils n'ont pas de noyau vrai : l'ADN, de dimension reduite,
n'est pas associe a des proteines, ni entoure d'une membrane (procaryon). Les organites
6
cellulaires entoures d'une membrane sont absents. Ils ne pratiquent pas de veritable
reproduction sexuee. La nutrition se Iait par absorption. La paroi, de structure complexe, est
essentiellement constituee de peptidoglycans, associes a d'autres molecules variables d'apres
les groupes. On distingue les bacteries et les cyanobacteries ("algues bleues").
Les bacteries ont explore et utilisent toutes les niches ecologiques, mais leurs
exigences sont souvent tres strictes, limitant leur developpement a des milieux bien deIinis.
La plupart des bacteries sont heterotrophes: saprophytes parasites ou symbiotiques.
Les cyanobacteries sont des organismes photoautotrophes aerobies. Elles contiennent
de la chlorophylle localisee dans des thylakodes qui pourraient provenir d'invaginations de la
membrane plasmique. Elles seraient a l'origine de l'oxygene atmospherique. On connat de
nombreux cas de symbiose entre algues bleues et divers autres organismes (c'est le cas des
lichens, par exemple).
De par leur simplicite, les procaryotes (aussi appeles moneres) sont consideres comme
les representants des Iormes de vie les moins evoluees, les plus anciennes.
Un groupe restreint de bacteries presente des caracteristiques genetiques et
physiologiques tres particulieres qui semblent adaptees aux conditions climatiques de
l'epoque ou la vie apparut sur Terre. Ce sont les archeobacteries ou archees, dont certains
voudraient Iaire un sixieme regne, voire un domaine, nouveau niveau de classiIication. Il
semble que les eucaryotes soient plus proches des archees que des bacteries. Archees et
eucaryotes pourraient donc avoir un anctre commun.
Les virus, virodes et plasmides ne sont pas consideres comme des tres vivants.

Les protistes
Les protistes renIerment un ensemble heteroclite d'tres vivants Eucaryotes (c'est-a-
dire possedant un vrai noyau entoure de membranes) et unicellulaires ou coloniaux, tres
souvent aquatiques. Ils ont acquis par l'evolution, une serie d'organites specialises dans
diIIerentes Ionctions. On distingue une dizaine d'embranchements (phylla) ayant evolue dans
des directions tres diverses quant a leur metabolisme: heterotrophes par absorption ou
ingestion ou photoautotrophes et, dans ce cas, a photosynthese complete. Souvent mobiles, ils
montrent une reproduction sexuee typique mais pouvant prendre des Iormes tres variables.
Suivant leur metabolisme, les protistes etaient classiquement rattaches aux plantes
(protophytes) ou aux animaux (protozoaires), bien que de nombreux intermediaires existent.
Ils ont evolue a partir de lignees diIIerentes de procaryotes : il n'y a donc pas d'anctre
procaryote unique ayant genere tous les protistes. Pour cette raison, de nombreux
scientiIiques pensent que le groupe des protistes devrait tre scinde en diIIerents regnes.
Le regne des protistes regroupe un certain nombre d'organismes pathogenes, comme
Plasmodium falciparum (malaria), Giardia lamblia (diarrhees graves), et les trypanosomes
(maladie du sommeil et maladie de Chagas).
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Les algues rouges et brunes, autreIois considerees comme des plantes primitives, sont
actuellement classees parmi les protistes, car elles ne possedent pas de veritables organes
diIIerencies et ont evolue a partir de protistes diIIerents des autres plantes. Ces algues
possedent des pigments photosynthetiques diIIerents des algues vertes et des plantes. Ces
pigments sont responsables de la coloration particuliere de ces algues.

Les trois derniers regnes sont tous constitues d'organismes Eucaryotes pluricellulaires
dotes de cellules specialisees produites par un processus appele diffrenciation cellulaire. Ils
se distinguent essentiellement par leur mode de nutrition.

Les myctes ou champignons
Ce sont des organismes Eucaryotes, generalement pluricellulaires, immobiles,
heterotrophes se nourrissant uniquement par absorption de matieres organiques.
L'appareil vegetatiI est Iorme d'hyphes, Iilaments enchevtres, souvent souterrains,
constituant le mycelium. Les cellules sont entourees d'une paroi constituee de chitine. La
reproduction est vegetative ou sexuee agame (pas de diIIerence entre les sexes). La dispersion
se realise au moyen de cellules speciales, les spores.
Les "vrais" champignons ou Eumycetes sont tres nombreux (quelques centaines de
milliers d'especes) et tres varies. Les plus evolues produisent des carpophores, (Iaux tissu
d'hyphes entremles) dans lesquels sont produites les spores; c'est ce que nous appelons
communement le champignon. On distingue dans ce regne, l'apparition d'une diIIerenciation
cellulaire: des groupes de cellules vont acquerir une Iorme et une Ionction particuliere pour
devenir plus eIIicace pour l'ensemble. Cette diversiIication est une acquisition de l'evolution.
De par leur mode de nutrition, ils vivent soit en association symbiotique ou parasitaire
avec d'autres organismes vivants ou decomposent des organismes morts. On leur doit donc
une serie de maladies (mycoses cutanees, aspergilloses systemiques graves), de degradations
(moisissures, merule), mais aussi les Iermentations industrielles (levures permettant la
Iabrication du pain, de la biere, du vin, et de Iromages) et certains medicaments (penicilline).
Certains sont comestibles alors que la majorite est indigeste sinon toxique (amanites).

Les Lichens ne sont pas des champignons a proprement parler mais des organismes
composites dont le thalle est constitue d'un mycelium, le plus souvent d'Ascomycete, entre les
hyphes duquel sont abrites soit une cyanobacterie, soit une algue verte, soit encore les deux
simultanement. La nature exacte des relations nutritives entre les deux organismes constituant
le lichen est variable et souvent encore mal connue.

Les animaux
Ce sont des organismes pluricellulaires, eucaryotes, generalement mobiles,
heterotrophes se nourrissant par ingestion. Les aliments sont d'abord digeres (decomposes en
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molecules plus simples) dans des cavites extracellulaires. L'evolution a selectionne chez eux
une serie de structures, tant inIra- que supracellulaires, adaptees a des Ionctions particulieres
de plus en plus perIormantes et precises. Les animaux se distinguent entre autres par
l'apparition d'un systeme nerveux leur permettant une perception du monde exterieur et une
reaction coordonnee tres poussee. Leur reproduction est essentiellement sexuee.

Les vgtaux
Ce sont des organismes pluricellulaires, diIIerencies, eucaryotes, immobiles,
autotrophes, photosynthetisants, c'est-a-dire capables de transIormer l'energie lumineuse du
soleil en energie chimique necessaire a leur autosynthese.
Les vegetaux sont divises en quatre grands groupes: les charophytes (algues vertes),
les bryophytes (mousses), les ptridophytes (Iougeres) et les spermatophytes (plantes
superieures).
Les algues vertes, comme les autres algues, sont des organismes aquatiques a structure
vegetative peu diIIerenciee, ne comportant ni tige, ni Ieuille, ni racine. Comparees aux autres
algues, les algues vertes sont plus proches des plantes superieures par leur pigments
photosynthetiques (chlorophylles), leur metabolisme et la structure de leur paroi de cellulose.
Les autres groupes ont evolue a partir d'algues vertes ancestrales et regroupent toutes
les plantes terrestres qui ont d s'adapter a ce milieu anhydre en developpant racines, tiges et
Ieuilles. Les cellules sont entourees d'une paroi cellulosique. Les pigments sont
essentiellement des chlorophylles a et b, associees a des carotenes et de la xanthophylle.
La reproduction est principalement sexuee (voir chapitre correspondant). On distingue
plusieurs types de vegetaux:
Les bryophytes possedent un thalle ramiIie ou sont des plantes deja plus evoluees
montrant une tige couverte de petites Ieuilles mais ne possedant pas de racines (mousses). La
Ionction de nutrition est assuree par des cellules longues, specialisees, issues de la tige et que
l'on denomme rhizodes. La reproduction est sexuee. L'alternance de phases est parIaite avec
predominance de la phase haplode, le sporophyte vivant en parasite et se reduisant a une
urne sporangiIere produisant les spores qui assurent la dissemination.
Les ptridophytes (la Iougere par exemple) etablissent le passage vers des vegetaux
plus evolues (plantes dites "superieures"). Ce sont des plantes qui comprennent une tige - le
plus souvent souterraine (rhizome) - des Ieuilles et des racines vraies. Elles possedent un
systeme vasculaire et de soutien. A partir de cet embranchement, c'est la phase diplode qui
devient predominante. La dissemination s'opere encore au moyen de spores. Cependant on
voit apparatre apres la Iecondation, pour la premiere Iois dans l'evolution generale, un
veritable embryon, plante entiere en miniature. Mais cet embryon n'est pas encore protege par
des tissus specialises.
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Les Spermatophytes ou phanrogames representent la majorite de la Ilore actuelle.
Ce sont les plantes et des arbres qui produisent des graines. L'appareil vegetatiI est constitue
de tiges, Ieuilles et racines.

Le tableau suivant recapitule quelques diIIerences entre les regnes.

Bacteries Protistes Mycetes Vegetaux Animaux
Noyau -
Paroi ou - -
Autotrophie ou - ou - - -
Nutrition absorption absorption
ingestion
absorption absorption
ingestion
Mobilite ou - ou - - -
Reserves - ? glycogene amidon
lipides
glycogene
lipides

Chaque regne est ensuite divise en groupes d'tres vivants appeles embranchements. Ceux-
ci sont eux-mmes subdivises en classes, puis en ordres, constitues de familles. chaque
Iamille comprend en general plusieurs genres, qui regroupent un certain nombre d'espces, le
niveau le plus bas de classiIication des tres vivants. Le nom scientiIique d'un tre vivant
reprend toujours son genre et son espece: homo sapiens et homo erectus Iont donc partie du
mme genre homo. Ce systeme, Ionde par Linne a la Iin du XVIII
e
siecle, permet de classer et
nommer tous les tres vivants.

4. L'EVOLUTION

Jusqu'au XIXe siecle, les scientiIiques etaient "Iixistes", c'est-a-dire qu'ils imaginaient
que les tre vivants avaient tous ete crees dans la Iorme qu'ils presentaient actuellement et
que les especes etaient Iixes et immuables. Il Iallut attendre la publication du livre de Darwin
"De l'origine des especes" en 1859, pour qu'emerge la theorie de l'evolution. Selon cette
theorie, la vie est apparue de Iaon tres primitive et a evolue au cours des eres geologiques,
selectionnant les individus qui etaient les mieux adaptes a leur environnement. Celui-ci etant
variable d'un endroit a l'autre et en Ionction du temps, il en a resulte une diversite et une
complexite grandissantes des tres vivants pour repondre aux contraintes du milieu et a la
lutte pour la survie. Fortement combattue a ses origines, cette theorie, bien que non
reproductible en laboratoire, est actuellement suIIisamment etayee par les traces de cette
evolution pour que seuls quelques revisionnistes la contestent encore actuellement.
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On peut donc esquisser une courte histoire de la vie, avec toutes les incertitudes et les
suppositions que cela implique.
Les geologues admettent que la Terre s'est Iormee il y a 4.500 millions d'annees. Les
Iossiles qui montrent des structures semblables a nos procaryotes les plus primitiIs datent de
3.500 millions d'annees. On peut donc supposer que les premiers tres vivants sont apparus
200 a 300 millions d'annees avant. L'origine de la vie reste un mystere. Pour Iaire une cellule,
il Iaut des molecules organiques. Celles-ci ont pu apparatre naturellement dans les conditions
initiales de la Terre, tres diIIerentes des conditions actuelles. Ensuite, il a Iallu qu'elles
s'organisent pour creer :
- une membrane qui permet des conditions internes et externes diIIerentes,
- de quoi stocker et reproduire l'inIormation acquise
- des outils chimiques pour Ionctionner.
Plusieurs hypotheses ont ete emises quant a l'ordre d'apparition de ces trois elements
mais aucune n'est actuellement suIIisamment etayee.
Il y a environ 2700 millions d'annees, des bacteries trouvent le moyen d'utiliser
l'energie inepuisable du soleil pour Iabriquer leur ATP. Le dechet de cette photosynthese est
l'oxygene, molecule extrmement dangereuse pour les Iragiles molecules de l'epoque:
beaucoup d'tre vivants moururent probablement de cette "pollution". Il y a 2000 millions
d'annees, la concentration en oxygene depasse le pourcent dans l'atmosphere. Les organismes
qui y ont survecu l'utilisent pour oxyder completement leur nourriture et en recuperer le
maximum d'energie chimique : c'est le debut de la respiration.
Durant cette periode, les cellules procaryotes evoluent par diIIerents mecanismes,
dont la phagocytose et l'endosymbiose et aboutissent a la Iormation des eucaryotes dont les
premiers Iossiles sont dates de 1500 millions d'annees.
Il Iaut encore environ 800 millions d'annees pour que l'on retrouve les premieres
traces d'animaux pluricellulaires (meduses, vers) et 100 millions d'annees supplementaires
pour qu'apparaissent les invertebres d'une part, les algues d'autre part.
Il y a environ 500 millions d'annees se produit un nouveau changement important : la
vie qui, jusque la s'etait conIinee au milieu aquatique, sort de l'eau et les premiers vegetaux
terrestres Iont leur apparition (bryophytes). Leur activite photosynthetique augmente encore
la concentration en oxygene (10) qui, sous Iorme d'ozone, arrte le bombardement U.V. de
la Terre et permet, il y a 400 millions d'annees, a la vie animale de sortir a son tour de l'eau
(premiers insectes) en mme temps que les vegetaux inventent les grandes tailles (premiers
Pteridophytes) et leurs corollaires (enracinement, systeme conducteur et de soutien).
Dans ce nouveau milieu tres precaire, tres variable, la diversiIication va s'accelerer
Iaisant apparatre de nouveaux groupes : en -350 (millions d'annees), les Iorts remplissent la
terre tandis qu'apparaissent les reptiles; en -300 les Gymnospermes inventent l'ovule; en -250
les dinosaures et la premiere graine; en -200 les mammiIeres; en -150 les angiospermes avec
les premieres Ileurs ainsi que les oiseaux. Les premiers primates voient le jour il y a un peu
11
plus de 50 millions d'annees, les grand singes, 25 millions et l'homme, a peine 5 millions
tandis que du cte vegetal, les prairies prennent une extension considerable au detriment des
Iorts. Tous ces chiIIres ne sont evidemment que des approximations grossieres.


12
Premire partie:


LA COMPOSITION CHIMIQUE DES ORGANISMES VIVANTS


Obfectifs .
-Distinguer les diIIerents groupes de composes biologiques du point de vue de leur structure
chimique et de leurs proprietes physico-chimiques
-Comprendre le concept d`hydrophobicite
-Matriser les bases chimiques du Ionctionnement des genes (structure de l`ADN, de l`ARN
et des proteines)
-Connatre la liste des composes essentiels pour l`homme

INTRODUCTION

Les tres vivants sont constitues des mmes atomes que les choses inanimees. Ils
repondent de la mme maniere aux mmes lois physiques et chimiques. Les mmes causes
produisent les mmes eIIets chez les tres vivants et chez les tres inanimes.
L'analyse chimique determine la nature et les proportions des atomes constitutiIs (ou
elements). Ces atomes s'assemblent en molecules relativement simples (monomres) qui
s'unissent entre elles pour Iormer des macromolecules de plus en plus complexes
(polymres). Beaucoup de ces molecules sont identiques ou Iort semblables chez tous les
tres vivants et constituent les composes principaux: sucres, proteines, acides nucleiques et
lipides.
Suite a la diversiIication du monde vivant, sont apparues des biomolecules que l'on ne
rencontre que dans certains tres vivants. Ce sont les produits secondaires du metabolisme.
Certaines plantes contiennent par exemple des composes uniques, particulierement
interessant en pharmacologie. Certaines de ces molecules sont encore utilisees actuellement,
ou ont servi de modeles pour la synthese des medicaments modernes.
Dans cette partie du cours, nous exposerons l'essentiel des donnees de chimie
biologique, indispensables a la comprehension des problemes que nous traiterons en
cytologie et en physiologie.
L'aspect "encyclopedique" de cette premiere partie ne doit pas eIIrayer l'etudiant non
Iamiliarise avec la chimie organique. Toutes les notions exposees seront concretisees
ulterieurement, et apparatront progressivement plus simples parce que remises dans leur
contexte naturel. L'etudiant est de plus invite a Iaire des liens avec ses cours de chimie
minerale et organique, qui l'aideront a bien comprendre ces notions.
13

RAPPEL: LES LIAISONS CHIMIQUES
_____________________________________________

LES LIAISONS FORTES

Les atomes tendent a realiser autour d'eux la conIiguration electronique du gaz rare le
plus proche dans le tableau periodique. Pour cela ils echangent ou ils mettent en commun
certains des electrons de leur couche peripherique, quand ils sont en contact avec d'autres
atomes.
Dans la liaison ionique, un atome perd un ou plusieurs electrons et se charge
positivement (cation), l'autre accepte cet (ces) electron(s) et se charge negativement (anion).
L'attraction entre ces deux charges unit les deux atomes. C'est ce type de liaison qui intervient
surtout dans les cristaux. Il y a Iormation d'un diple electrique et l'energie de liaison est de
l'ordre de 20 a 50 kJ. En presence d'eau, ces liaisons sont Iortement aIIaiblies.

Dans la liaison covalente, deux atomes mettent en commun des electrons qui tournent
autour des deux noyaux. Si les deux atomes sont identiques, il n'y a pas de diple. L'energie
de cette liaison, plus stable, est de l'ordre de 200 a 400 kJ.
Entre ces deux extrmes, toutes les variantes sont possibles, dependant de l'electronegativite
des deux atomes. La grande majorite des liaisons entre atomes des molecules organiques sont
du type covalent.
Le carbone peut se lier par 4 liaisons covalentes a 4 autres atomes. Ces liaisons sont
disposees en tetraedre et Iorment entre elles des angles de
+
109,5. Il peut aussi Iormer une
double liaison donnant une structure plane ou une triple liaison donnant une structure lineaire.
Les atomes de carbone se lient entre eux pour Iormer le squelette de toutes les molecules
organiques. La presence de doubles liaisons simples ou conjuguees, modiIie cette structure.

Le carbone et l'hydrogene Iorment ensemble des composes stables appeles
hydrocarbures (alcanes et alcenes). Ceux-ci sont apolaires, ne Iorment pas de liaisons
hydrogene et ne sont pas solubles dans l'eau. L'alcane le plus simple est le methane CH
4
. Le
radical -CH
3

est

appele methyle. Ces molecules sont peu utilisees dans le monde vivant, sauI
par certaines bacteries.
En plus du carbone et de l'hydrogene, la majorite des composes biochimiques
contiennent de l'oxygene, qui Iorment plusieurs combinaisons organiques appelees fonctions:
14

- le remplacement d'un H par un groupe hydroxyle -OH sur un
carbone donne un alcool: p. ex. le methanol CH
3
OH
Si l'oxygene est remplace par un atome de souIre, on parlera de thiol.

- le remplacement de 2 H par O donne un groupement carbonyle
CO. Selon que celui-ci se trouve en bout ou a l'interieur d'une chane, il
s'agit d'un aldhyde ou d'une ctone: p. ex. le Iormaldehyde: H
2
CO

- le remplacement de 3 H par O et -OH donne un acide
carboxylique, la Ionction -COOH s'appelant carboxyle. Dans l'eau, il peut
ceder un H

(comportement acide).
Si les 4 H du methane sont remplaces par de l'oxygene, on obtient du
CO
2
.

Deux alcools reagissent entre eux pour donner un ther par perte d'eau:

R-CH
2
-OH HO-CH
2
-R' R-CH
2
-O-CH
2
-R' H
2
O

Un alcool et un acide reagissent entre eux pour donner un ester par perte d'eau:

Le carbone et l'azote Iorment essentiellement des amines qui sont des bases qui peuvent
accepter un proton:

Une amine et un acide reagissent entre eux pour donner une amide par perte d'eau:

R-CH
2
-NH
2
HOOC-R' R-CH
2
-NH-CO-R' H
2
O

LES LIAISONS FAIBLES

Quand l'hydrogene est lie de Iaon covalente avec un atome electronegatiI (O, N), la
paire d'electrons mise en commun est delocalisee vers cet atome. La liaison se polarise et
produit une charge partielle sur H. Cette charge va attirer les atomes d'un autre
groupement montrant une charge -. Il en resulte des liaisons, appelees ponts hydrognes,
15
qui ne sont pas riches en energie (12 a 25 kJ) mais qui peuvent contribuer Iortement a la
stabilite des grosses molecules quand elles sont nombreuses.


Deux atomes eloignes l'un de l'autre ne s'inIluencent pas. Trop proches l'un de l'autre,
ils se repoussent violemment. Il existe une distance intermediaire ou se developpe entre eux
une Iorce d'attraction Iaible appelee Iorce de Van der Waals. Ces Iorces n'ont de
signiIication que dans le cas ou les surIaces de macromolecules s'accolent bien l'une a l'autre.


16

1. LES ATOMES
________________________

L'analyse chimique elementaire determine la nature et les proportions des atomes
rencontres dans les tres vivants. Dans tous les cas, cette analyse revele la presence constante
des onze atomes suivants :
C H O N P S Cl K Ca Na Mg.

Leur concentration varie selon le type et la Ionction des plantes et des cellules.
Quatre atomes C, H, O, N constituent l'essentiel (+ 96) des tres vivants.
Les 4 restants sont representes par les 7 autres atomes presents en proportions de
l'ordre du ainsi que par des elements que l'on trouve en quantite de l'ordre du ppm ou
moins: Fe, B, Cr, Cu, Fe, , Mn, Se, Si, Zn, V, Mo. Ces derniers constituent les
oligolments. Ainsi la nature vivante n'utilise qu'une trentaine des 90 atomes que l'on trouve
dans la crote terrestre. Certains des elements les plus abondants sur Terre, comme
l'aluminium et le silicium, presents dans de nombreuses roches, ne sont pas ou tres peu
utilises par les tres vivants.
La molecule la plus abondante dans tous les tres vivants est l'eau (H
2
O): 70 du
poids d'un homme, expliquant la preponderance de l'hydrogene (l'atome le plus Irequent en
nombre) et l'oxygene (l'atome representant la masse la plus importante). Les composes
organiques (constitues de C, O, H, N, S et P) comptent pour environ 25 du poids total. Les
autres composes se retrouvent sous Iorme d'ions (Na

, K

, Cl
-
, phosphates, carbonates,
sulIates, ammonium.) ou sous Iorme de complexes avec des molecules organiques (Fe, n,
Mg, Cu.).

17
2. L'EAU
_________________

L'eau represente chez l'homme 70 du poids total. Certains tres vivants aquatiques
peuvent contenir plus de 90 d'eau. L'eau (H
2
O) est un "monstre chimique" auquel nous
devons la vie. Par rapport aux autres hydrures comparables (H
2
S , NH
3
) et mme aux autres
liquides, l'eau possede un point de Iusion, un point d'ebullition, une chaleur de vaporisation,
une tension superIicielle, un diple electrique, une constante dielectrique beaucoup plus
eleves. Ces proprietes particulieres sont due a sa structure mme :




ou O et H possedent une charge partielle (

pour H et
-
pour O). Le diple electrique
puissant permet la realisation de ponts hydrogenes. L'angle que Iont les deux H (104,5)
permet la creation d'un reseau dense de ponts H (4 ponts H par molecule d'H
2
O, ce qui
explique la tres Iorte cohesion interne de l'eau (a 37, 15 des molecules d'eau sont encore
liees entre elles).
La Iorte cohesion de l'eau explique ses proprietes physiques: temperature d'ebullition,
tension superIicielle (sans ponts H, l'eau gelerait a -100 et bouillirait a -80). Sa chaleur
d'evaporation (2,3 kJg) l'empche de s'evaporer trop Iacilement: elle reste liquide. Sa chaleur
speciIique importante en Iait a la Iois un bon tampon thermique (homeothermie) et un bon
transmetteur de chaleur. La glace est un des rares solides moins dense que le liquide
correspondant, donc elle Ilotte. Sans cela, toute l'eau de la Terre serait amassee sous Iorme de
glace aux deux ples.
Le diple electrique de l'eau lui permet d'arracher les ions aux cristaux, donc de
solubiliser la plupart des sels et autres composes ioniques (charges). Par rapport aux autres
liquides, l'eau constitue donc un solvant extraordinaire. Sans eau, les molecules, les ions non
solubilises ne se rencontreraient jamais et il n'y aurait pas de reaction chimique donc pas de
vie. Elle permet le transport de nourriture et de dechets. La Iorte adhesion de l'eau aux autres
molecules polaires (appelee hydrophiles) lui permet de "coller" aux parois des cellules
vegetales ("eIIet buvard"). Cette propriete explique la montee de la seve dans les plantes et
les arbres.
18
Inversement, l'eau exclut les molecules avec lesquelles elle n'interagit pas: les
molecules apolaires, appelees aussi hydrophobes. Parmi ces composes, citons les
hydrocarbures et les huiles. Cette propriete est egalement Iondamentale pour les tres vivants.


!
+

L'eau se dissocie en ions hydroxyle basique (OH
-
) et
hydronium acide (H
3
O

). L'acidite d'une solution est mesuree


par le logarithme de la concentration en H
3
O

:
pH - log H
3
O

.
L'eau intervient encore comme reactiI dans de
multiples reactions biochimiques que nous etudierons
ulterieurement.



Il n'est donc pas exagere de dire que la vie, telle qu'elle s'est developpee sur Terre
depuis pres de 4 milliards d'annees, n'a ete possible que grce aux proprietes exceptionnelles
que possede la molecule d'eau.
L'eau est donc a la Iois la molecule la plus Iondamentale et la plus abondante du
monde vivant. Il n'est donc pas etonnant que les scientiIiques qui cherchent la vie sur d'autres
planetes ou dans d'autres systemes solaires cherchent d'abord a detecter la presence d'eau.
19
3. LES COMPOSES CARBONES
_________________________________________________

Les composes organiques sont tres importants et jouent un rle Iondamental dans le
metabolisme cellulaire. Ils comptent pour environ 15 a 25 du poids Irais.
Nous examinerons d'abord quatre groupes de composes organiques toujours presents :
les glucides, les lipides, les protides, les acides nucleiques.
Nous citerons ensuite plusieurs sortes de composes organiques plus particuliers,
moins constants et moins abondants et qui constituent les produits secondaires du
metabolisme.

3.1. LES GLUCIDES

Leur Iormule generale est : C
n
(H
2
O)
m
. A cause de leur Iormule, on les a longtemps
denommes "hydrates de carbone"; cette appellation est abandonnee.
On divise les glucides en deux classes :

1. les oses (ou sucres simples ou monosaccharides) :
- dans la Iormule generale C
n
(H
2
O)
m ;
nm ;

2. les osides (ou polysaccharides)
- dans la Iormule generale C
n
(H
2
O)
m
, nm;
- ce sont des polymeres constitues d'oses. Ils peuvent tre hydrolyses :
soit uniquement en oses; ils sont alors denommes holosides
soit en oses ET une Iraction non glucidique, denommee aglycone ou genine, ce sont alors
des htrosides.

3.1.1 Les oses

Les oses se caracterisent par la presence d'un groupement hydroxyle -OH sur chaque
carbone sauI un qui porte le groupement carbonyle CO. Suivant la position de ce dernier
dans la molecule, on distingue :
- les aldoses dans lesquels il se trouve en position terminale (aldehyde)
- les ctoses dans lesquels il se trouve en position interne (cetone)
Une mme Iormule globale, par exemple C
3
H
6
O
3
, peut correspondre a plusieurs
composes diIIerents, ou l'agencement des atomes est diIIerent. Ces corps sont des isomres.
Ils possedent des proprietes qui peuvent tre tres diIIerentes. Ils peuvent parIois se
transIormer l'un dans l'autre (isomerisation). De nombreux carbones dans les molecules de
sucre sont asymtriques, c'est a dire lies a 4 radicaux diIIerents qui peuvent tre disposes
20
selon deux manieres diIIerentes, les stereoisomeres, D ou L (voir cours de chimie). Les oses
naturels sont de la serie D.
Suivant le nombre d'atomes de carbone (C) on distingue les oses en C
3
ou trioses, en
C
4
ou tetroses, en C
5
ou pentoses, en C
6
ou hexoses, en C
7
ou heptoses ...
Les oses les plus repandus sont :
- des trioses: C
3
H
6
O
3
ex: glyceraldehyde, dihydroxyacetone (cIr glycolyse)
- des pentoses C
5
H
10
O
5
ex: le ribose;
- des hexoses: C
6
H
12
O
6
tels que le glucose et le galactose (aldose)
ou le Iructose (cetose).




Au Iur et a mesure que le nombre de C augmente, le nombre de C asymetriques
augmente aussi, doublant chaque Iois le nombre de stereoisomeres possibles. Toutes les
possibilites ne se rencontrent cependant pas dans la nature, qui n'utilise que certains d'entre-
eux.

Des que le nombre de C atteint 5 (pentoses et hexoses), la Ionction carbonyle (CO)
peut reagir avec un hydroxyle a l'autre extremite de la molecule pour Iormer un hemiacetal
cyclique. Cette reaction est spontanee (elle se produit sans l'intervention d'enzyme) et est
reversible. Cette Iermeture donne un cycle a 5 atomes (Iuranose) ou a 6 atomes (pyranose)
qui possede un C asymetrique supplementaire, donc deux Iormes o et diIIerentes, suivant la
position dans l'espace de l'hydroxyle sur le carbone n1.


21


Pour expliquer toutes les diIIerences entre les isomeres, les chimistes Iont appel, en
plus, a la disposition dans l'espace des chanes Iermees et distinguent la Iorme "chaise" et la
Iorme "bateau". Nous n'aurons pas a Iaire appel a ces particularites. Sans en tenir compte, il
existe deja ainsi 24 isomeres naturels diIIerents chez les hexoses. Tous ont la mme Iormule
generale mais etant de Iorme diIIerente, ils auront des reactivites diIIerentes. Il est important
de garder cette notion a l'esprit.

Comme nous le verrons plus loin, les oses jouent un rle tres important dans le
metabolisme cellulaire ainsi que dans certaines reactions de biosynthese. Les oses ont surtout
une importance alimentaire, car ils presentent des Iormes directement assimilables par
l'organisme (glucose, Iructose).

3.1.2 les drivs des oses

Il existe un certain nombre de molecules qui ne repondent pas exactement a la Iormule
generale des glucides (CH
2
O)n, mais en derivent. Citons:
- le desoxyribose: OH du 2e C est remplace par H : C
5
H
10
O
4
(voir acides nucleiques)
22
- les acides uroniques dont la Ionction alcool terminale est remplacee par COOH: par
exemple l'acide glucuronique derive du glucose (voir cycle des phosphopentoses)
- les osamines proviennent du remplacement d'un OH par un NH
2
: par exemple la
glucosamine ou le remplacement se Iait sur le C
2
et la N-acetyl-glucosamine dans laquelle un
des deux H de NH
2
est lui-mme remplace par le residu acetyle.



Les oses ne sont pas reactionnels. Dans la nature, ils reagissent sous Iorme
phosphorylee. Ils apparaissent suite a une reaction d'esteriIication entre l'acide phosphorique
et la Ionction alcool du sucre la plus eloignee de l'aldehyde.
Parmi les plus importants citons le glyceraldehyde phosphate et son isomere le
phosphate de dihydroxyacetone (PDHA). Parmi les hexoses existent aussi le glucose-6-
phosphate, le glucose-1-phosphate, le glucose-1,6-bisphosphate et les Iructoses
correspondants. Nous les reverrons en physiologie.

3.1.3. Les holosides

Ils proviennent de la reaction de condensation entre deux ou plusieurs oses,
generalement des hexoses sous Iorme cyclique. Cette reaction est la Iormation d'un lien ether
entre deux Ionctions alcool avec perte d'eau (voir plus haut). La reaction inverse est une
hydrolyse.
Par hydrolyse, ces composes ne donnent que des oses. Suivant le nombre d'oses qui
constituent la molecule, on aura des diholosides, des triholosides, des tetraholosides, ... des
polyholosides.

Citons les principaux holosides:
Les diholosides : ils resultent de l'union de deux oses
2 C
6
H
12
O
6
C
12
H
22
O
11
H
2
O


23


Exemples: - le saccharose, extrait de la canne a sucre ou de la betterave, constitue un des
rares aliments consommes a l'etat cristallin (sucre du commerce). Il est
constitue d'un glucose lie au Iructose (voir schema ci-dessus).
- le maltose n'a pas un got aussi sucre que le saccharose. Il est constitue de
deux unites de glucose. Il est le maillon initial des reserves de sucre des tres
vivants (amidon et glycogene).
- le lactose ou "sucre de lait" n' a pas une saveur tres sucree. Le lait de vache
en contient 4, le lait de Iemme, de 5 a 8. Il est constitue d'un galactose lie a
un glucose.

Les oligosaccharides sont composes d'un petit nombre d'hexoses et de leurs derives. Ils sont
tres varies, d'abord parce que les oses sont diIIerents (24 hexoses), ensuite parce que les liens
glycosidiques peuvent se realiser de diIIerentes manieres: il existe ainsi 10 Iaons diIIerentes
de lier du galactose au glucose, donnant 10 diholosides aux proprietes diIIerentes! Si l'on
passe a 3, le nombre depasse deja le millier. Des oses modiIies (N-acetyl-glucosamine, acide
glucuronique...) sont Irequemment incorpores dans les chanes d'oligosaccharides. Il existe
donc un nombre extraordinairement grand d'oligosaccharides diIIerents dont la nature se sert
comme "adresse" ou "etiquette" pour individualiser ou marquer certaines molecules plus
grosses ou cellules particulieres. Entre autres, la speciIicite des groupes sanguins chez
l'homme (groupes A, B, AB, O: voir partie genetique) est determinee par l'existence
d'oligosaccharides particuliers lies aux lipides et aux proteines de la membrane des globules
rouges.

Les polyholosides ou polysaccharides: ils resultent de la condensation, de la polymerisation,
d'un grand nombre d'oses pour Iormer des polymeres.
Ces macromolecules ont des Ionctions tres diverses. Elles constituent en premier lieu
des reserves de nourriture pour la cellule. Ce sont aussi des elements de soutien.

24
Les liaisons se Iont generalement entre le C
1
de la premiere molecule et le C
4
de
l'autre. Cette liaison n'est pas plane. Il en resulte une structure en helice (amidon) si tous les
angles sont orientes dans le mme sens ou bien une structure lineaire (cellulose) si chaque
liaison est placee dans le sens inverse de la precedente.

Exemples :
- l'amidon : de Iormule (C
6
H
10
O
5
)
n
.H
2
O, ou n a une valeur tres elevee.
n (C
6
H
12
O
6
) - (n - 1) H
2
O (C
6
H
10
O
5
)
n
. H
2
O
C'est une substance de reserve, accumulee sous Iorme de granules dans beaucoup de cellules
vegetales (tubercules de pommes de terre; albumen des graines ...). L'amidon est Iorme d'un
melange de deux polymeres dont l'unite de base (monomere) est le glucose. Ces deux
polymeres sont : l'amylose (+ 30) constituant une chane helicodale lineaire, assez lche;
PM 10.000 a 50.000 (60 a 300 glucoses); la Iorme helicodale est due au Iait que les
liaisons sont toutes orientees dans le mme sens et que leurs angles s'additionnent;
l'amylopectine

(+ 70) Iormant une chane helicodale ramiIiee; PM 50.000 a 1.000.000

(300 a 6000 glucoses). L'ensemble de la macromolecule presente l'aspect d'un buisson assez
peu Iourni.
- le glycogne : reserves glucidiques des animaux (dans le Ioie). Sa structure ressemble a
celle des amylopectines (chane helicodale ramiIiee) mais montre un aspect buissonnant plus
dense.
- la cellulose : elle a la mme Iormule globale que l'amidon (C
6
H
10
O
5
)
n
. H
2
O mais les
glucoses sont lies en et les angles s'annulent entre eux si bien que le polymere est lineaire et
non helicodal. C'est le constituant

essentiel des parois des cellules vegetales : PM 300.000
a 500.000

(2.000

a 3.000

glucoses).
- la chitine des animaux Iormee de l'union de N acetyl glucosamines liees en 1-4
- les pectines (polymeres d'acide galacturonique, un derive du galactose) interviennent dans
la constitution de la paroi primaire des cellules vegetales.

Les holosides ont une importance tres grande, tant alimentaire (saccharose, amidon),
qu'industrielle (coton, papier).
Les oses ainsi que les bi- et les triholosides sont des corps sucres cristallisables, tres
solubles dans l'eau. Les polyholosides a poids moleculaire eleve comme l'amidon et la
cellulose, ne sont pas sucres, et presentent une solubilite variable dans l'eau: la cellulose
Iorme des Iibres du Iait d'interaction (ponts hydrogenes) entre molecules. Ces Iibres sont
insolubles, mme si elles peuvent tre mouillees (papier). Les Iibres n'etant pas en solution
mais en suspension dans l'eau, le liquide reste opaque (pte a papier).
L'amidon peut tre solubilise dans l'eau bouillante. Dans ce cas, la solution est transparente.
Dans les cellules vegetales, il se presentent souvent sous Iorme de petits granules insolubles.
25
Les enzymes digestives hydrolysent Iacilement l'amidon, le saccharose et le
glycogene, alors qu'elles ne sont pas capables de rompre les liaisons entre les unites glucoses
de la cellulose. Seules certaines bacteries, presentes notamment dans le tube digestiI des
ruminants, sont capables de degrader la cellulose.

3.1.4 les htrosides

Ce sont des osides dont l'hydrolyse (acide ou enzymatique) donne d'une part des
holosides (qui peuvent tre eux aussi hydrolyses en oses) et d'autre part, une Iraction non
glucidique denommee aglycone ou gnine.
L'aglycone est souvent une proteine ou un lipide donnant respectivement une
glycoproteine ou un glycolipide. Ces molecules, presentes systematiquement sur les
membranes cellulaires, servent de "marqueurs" d'identite cellulaire, de signaux de
reconnaissance. Dans la plante, on trouve en plus des heterosides doues de proprietes
pharmacologiques ou toxiques. Certains medicaments parmi les plus puissants extraits des
plantes (digitaline des digitales par ex.), mais aussi les produits toxiques des plantes
(convallatoxine du muguet) sont des heterosides. Leurs proprietes therapeutiques sont tres
diverses.


3.2 LES LIPIDES

Les lipides ou matieres grasses regroupent un ensemble de corps d'origines diverses.
Ils jouent le rle de reserves d'energie, membranes semi-permeables, elements de structure
intra-cellulaires, elements de protection des epidermes... Ils possedent en commun la
propriete d'tre insolubles dans l'eau (hydrophobes), mais tres solubles dans les solvants
apolaires (alcanes, benzene, cyclohexane, tetrachlorure de carbone). Cette propriete est due a
l'importante Iraction "hydrocarbonee" apolaire de leur molecule.

Leur classiIication se base sur leur structure. Nous distinguons:
- les acides gras
- les lipides saponiIiables
- les sterodes.

Certaines vitamines Iont aussi partie de la classe des lipides: les vitamines A, D, E et K.




26
3.2.1 Les acides gras.

Les acides gras comprennent un chane hydrocarbonee de longueur variable,
comprenant n atomes de carbone lies a des atomes d'hydrogene, et terminee par le
groupement acide carboxylique.

a) les acides gras saturs : leur Iormule globale est CH
3
-CH
2

n-2
-COOH
Citons les plus courants:
- acide palmitique n 16 C
16
H
32
O
2
(decouvert dans la noix palmiste)
- acide stearique n 18 C
18
H
36
O
2

b) les acides gras insaturs. Ils possedent une ou plusieurs doubles liaisons (-CC-)
Citons les derives insatures de l'acide stearique :
- acide oleique C
18
H
34
O
2
une double liaison
- acide linoleique C
18
H
32
O
2
deux doubles liaisons
- acide linolenique C
18
H
30
O
2
trois doubles liaisons

Les acides gras satures ont une Iorme lineaire (par annulation reciproque des angles
du carbone) tandis que les acides insatures Iorment une ligne brisee, ce qui va modiIier les
proprietes physiques des structures dans lesquels ils sont inclus.
Notons des a present que la quasi totalite des acides gras satures naturels possedent un
nombre pair d'atomes de carbone, en raison de leur mode de synthese (voir partie Physiologie
du cours).
La Ionction acide carboxylique possede un pKa d'environ 4, ce qui veut dire que cette
Ionction est ionisee a pH 7, sous Iorme de carboxylate -COO
-
.



27
3.2.2. Les lipides saponifiables

Ils proviennent de l'esteriIication d'un alcool et d'un acide gras:
R-COOH HO-CH
2
-R' -- R-CO-O-CH
2
-R' H
2
O

La reaction inverse (hydrolyse) est denommee saponiIication parce que l'hydrolyse
des graisses naturelles par les bases Iortes (NaOH, KOH...) donne les sels de ces acides gras
lesquels sont typiquement des savons.

Suivant la nature de l'alcool utilise, on distingue:

Les glycrides: l'alcool est un trialcool : le glycerol. Il peut des lors s'unir a 1, 2 ou 3
acides gras Iormant respectivement des mono- des di- ou triglycerides. Ces derniers
constituent la principale Iorme de stockage des lipides chez les plantes et les animaux.
Ils peuvent contenir a la Iois des acides gras satures et insatures. Les triglycerides
satures sont solides a temperature ambiante (graisses), alors que les triglycerides contenant
une majorite d'acides gras insatures sont liquides (huiles).



Les phospholipides resultent de l'esteriIication du glycerol par deux acides gras et par
l'acide phosphorique (H
3
PO
4
). Leur importance est enorme car ils constituent les membranes
biologiques qui delimitent les divers organites cellulaires.
Une seconde Ionction -OH du groupe phosphate est souvent esteriIiee par une amine (serine,
ethanolamine, ou choline), chargee positivement a pH physiologique. On parlera alors de
phosphatidylserine, phosphatidylethanolamine, ou phosphatidylcholine.

Citons aussi les sphingolipides. Dans ce cas, l'alcool est la sphingosine, alcool a
longue chane carbonee. Le plus simple est la sphingomyline. Ces lipides ont une structure
globale et des proprietes proches des phospholipides. Ils peuvent tre couples a des sucres.
Par exemple, les cerebrosides du systeme nerveux et du cerveau et les gangliosides (matiere
grise du cerveau). On attribue a ces composes des rles tres importants au niveau des
membranes externes des cellules animales.
28


Citons enIin les crides. Ce sont des esters Iormes d'un acide gras et d'un alcool
possedant tous les deux une tres longue chane carbonee (jusqu'a 30, 40 C) ; ils constituent la
cire d'abeille, le blanc de baleine, certaines secretions cutanees, les cires recouvrant les
Ieuilles, Ileurs ou Iruits.

3.2.3. Les strodes

Tous les sterols ou sterodes possedent 4 cycles caracteristiques. Ils diIIerent entre eux
par la longueur de la chane laterale, des doubles liaisons et des groupements chimiques
accroches au diIIerents cycles. Contrairement aux acides gras, que l'on retrouve dans tous les
tres vivants, chaque regne possede des sterodes diIIerents.



Le sterode le plus abondant chez les animaux est le cholesterol, un composant important des
membranes cellulaires. Le cholesterol est hydrophobe et insoluble dans l'eau. En derivent
notamment :
- les acides biliaires, charges negativement a pH neutre, qui ont des proprietes tensioactives et
sont necessaires a l'emulsiIication des graisses dans l'intestin;
Representation
schematique d'un
phospholipide.
29
- les androgenes (hormones sexuelles mles), comme la testosterone; et les hormones
sexuelles Iemelles: oestradiol et progesterone;
- la corticosterone, le cortisol et d'autres hormones;
- les vitamines D (calciIerol)

Chez les plantes, on ne retrouve pas de cholesterol, mais d'autres composes de la mme
Iamille, comme les phytosterols. Dans le regne des mycetes, l'ergosterol remplace le
cholesterol dans les membranes.

3.2.4 Proprits physico-chimiques

Si tous les lipides, simples ou complexes, ont en commun la propriete physique d'tre
solubles dans les solvants organiques apolaires, ils montrent aussi une autre particularite: ce
sont des molecules amphipathiques. En eIIet, une extremite, la tte, est hydrophile (le reste
du glycerol, riche en oxygene, l'endroit ou se Iait l'esteriIication) et l'autre partie, la queue, est
hydrophobe. Cette propriete est particulierement importante pour les lipides charges
(phospholipides, acides gras et acides biliaires sous Iorme de carboxylates): ces lipides ont
des proprietes tensioactives. En presence d'eau, les molecules vont se placer dans une
orientation particuliere de Iaon a exposer les parties chargees du cote de l'eau et a rassembler
les parties hydrophobes. Ces molecules agissent comme des detergents: ils sont capables de
solubiliser les graisses dans l'eau en Iormant un Iilm a l'interIace entre eau et graisse, ou
toutes les molecules sont orientees de la mme Iaon (tte hydrophile cte eau, et queues
hydrophobes cte graisse).

Les matieres grasses peuvent tre solides (graisses et cires sur certaines parois
cellulaires) ou liquides (gouttelettes d'huiles ou globules lipidiques dans le cytoplasme).
A poids egal, les matieres grasses sont deux Iois plus energetiques que les glucides.
Elles constituent donc des produits de reserve des animaux qui doivent les transporter. Mais
elles s'accumulent aussi chez les plantes dans le Iruit (olive) ou dans certaines graines dites
"oleagineuses". Au cours de la maturation des graines, les lipides sont mis en reserve. Lors de
la germination, l'embryon va utiliser, pour sa croissance, les produits de la decomposition de
ces graisses.

3.3. LES PROTIDES

Les protides sont les constituants les plus essentiels et les plus complexes de la
matiere vivante.
Ce sont donc des corps construits a partir de 6 atomes : C (+54), O (+ 22), N
(+16) et H (+8), ainsi que S (0,2-2) et P (0,5).
30
Le poids moleculaire des protides est Iort variable et toujours tres eleve (lactalbumine:
17 400; hemoglobine : 64 500). On peut classer les protides en trois categories, integrant des
corps de complexite croissante :
les acides amines,
les peptides et polypeptides
les heteroproteines.

3.3.1. Les acides amins

Ils repondent a la Iormule generale suivante :

NH2 - CH - COOH
R

Comme pour les oses, le carbone lie a l'amine et au groupement R est asymetrique et il
existe deux series d'acides amines, L ou D. Les acides amines naturels sont de la serie L.

Ce sont des composes amphoteres qui se comportent soit comme une base en milieu
acide, grce a la Ionction amine (-NH
2
devient - NH
3

), ou comme un acide en milieu alcalin,


grce a la Ionction carboxyle (-COOH devient -COO
-
). En solution neutre, les acides amines
subissent une reaction acide-base interne. Globalement, la molecule est donc neutre, mais elle
est chargee positivement sur l'amine et negativement sur le carboxylate.

Il existe plus de 100 acides amines naturels, mais seuls 20 d'entre eux se retrouvent
dans les proteines. Les acides amines sont identiIies a l'aide d'un code a trois ou une lettre:

glycine gly G alanine ala A
valine* val V leucine* leu L
isoleucine* ile phnylalanine* phe F
lysine* lys K arginine arg R
histidine** his H acide aspartique asp D
acide glutamique glu E tryptophane* trp W
proline pro P cystine cys C
mthionine* met M asparagine asn N
glutamine gln Q srine ser S
thronine* thr T tyrosine tyr Y

Ils diIIerent entre eux par la nature du radical R qui peut tre :
- petit (GL) ou grand (TRP),
31
- polaire, hydrophile (ASN, GLN, SER, THR, TR) ou non polaire, hydrophobe (ALA,
CS, GL, ILE, LEU, MET, PHE, PRO, TRP, VAL),
- acide (ASP, GLU) ou basique (LS, ARG, HIS).
L'homme ne peut pas synthetiser les 8 acides amines (), plus l'histidine chez les enIants.
Il est donc essentiel qu'il puisse les trouver dans les aliments qu'il absorbe. Les vegetaux et
certaines bacteries, par contre, peuvent synthetiser la Ionction -NH
2
et Iabriquer tous les
acides amines, y compris certains qui ne participent pas a la constitution des proteines.

3.3.2. Les peptides

Ces corps resultent de la condensation par liaison amide (ou liaison peptidique) de 2
ou plusieurs acides amines avec chaque Iois une perte d'eau. Deux acides amines Iorment un
dipeptide; trois, un tripeptide; ...

R-COOH NH
2
-R' -- R-CO-NH-R' H
2
O

L'enchanement des acides amines (AA) se realise de maniere lineaire, chaque AA
etant lie par son NH
2
au COOH de l'acide precedent et par son COOH au NH
2
du suivant.

.
Dans un peptide, l'une des extremites est occupee par un groupe amine -NH
2
, l'autre
par un groupe acide -COOH (tous deux sont charges a pH physiologique). On numerote les
rsidus d'acides amins d'un peptide en commenant par celui qui porte le groupement NH
2

libre et en se dirigeant vers celui qui porte le groupement -COOH libre.


Peptide
His-Cys-Val
32
A part ces deux Ionctions terminales, on voit que le lien peptidique empche les autres
Ionctions amines et carboxyles d'intervenir dans les reactions ulterieures. Par contre, les
groupements R peuvent etablir des liaisons (Iaibles ou Iortes) avec d'autres groupements R ou
avec d'autres molecules. Ainsi deux residus cysteines peuvent s'unir par la Iormation d'un
pont disulIure entre leurs groupements -SH, en donnant la Cystine (CS-CS). Cette liaison
a un rle important dans le maintien de la structure tertiaire des proteines (voir plus loin).

3.3.3. Les polypeptides

Le terme peptide est utilise pour des chanes qui contiennent entre 2 et une
cinquantaine d'acides amines (et qui peuvent tre produites par synthese chimique au
laboratoire). Le terme polypeptide (ou holoproteine) est utilise pour de grands peptides, qui
ne peuvent tre Iabriques que par des tres vivants. La distinction entre ces deux termes n'est
cependant pas toujours claire. Par hydrolyse, les peptides et polypeptides ne liberent que des
acides amines.

La diversite et les proprietes speciIiques des polypeptides sont dues a la NATURE, au
NOMBRE et a l'ORDRE dans lequel les acides amines sont ranges.
On peut comparer ces grosses molecules aux mots que nous Iormons avec les lettres
de l'alphabet. Le sens des mots depend des trois mmes Iacteurs comme dans l'exemple
suivant : a partir du mot MAIS, on obtient MARS, MAI, AMIS en modiIiant un des Iacteurs.
Une tres Iaible modiIication (ex. MAS) peut entraner une Iorte diIIerence d'interpretation.
Mais a l'inverse des mots qui depassent rarement 20 lettres, la plupart des polypeptides
contiennent plus de cent acides amines. Changer un seul de ceux-ci revient a modiIier parIois
completement les proprietes d'une proteine.

Les mmes acides amines peuvent se repeter plusieurs Iois dans une mme chane
polypeptidique. Le nombre de combinaisons - et donc de proteines - est theoriquement
illimite (il existe 20
2

400 dipeptides diIIerents, 20
10
dix mille milliards de decapeptides
diIIerents et pour 100 AA, on arrive au nombre inconcevable de 10
130
). Toute la richesse de
la vie est due a cette variete inIinie. Toutes les possibilites ne sont cependant pas utilisees par
la nature et on constate souvent qu'elle utilise regulierement les mmes "motiIs", les mmes
sequences qui se sont montrees eIIicaces.
La sequence des acides amines constitue donc la base des molecules proteiniques.
C'est la structure primaire des proteines.

Les chanes polypeptidiques ne sont pas droites (les angles des liaisons chimiques ne
sont pas de 180) et presentent une certaine conIormation dans l'espace:
- soit sous Iorme d'une helice o dont le pas est dirige vers la droite;
33
- soit sous Iorme d'un Ieuillet etire et plisse (conIormation ).

De tres nombreux ponts hydrogene, internes pour l'helice ou intermoleculaires pour
les Ieuillets plisses , stabilisent ces ediIices.
Ces Iormes caracterisent la structure secondaire de la proteine. Une mme proteine
peut contenir certains segments organises en helices alpha et d'autres en Ieuillets bta.

La structure tertiaire est la Iorme tridimensionnelle des proteines. Elle est engendree
par des interactions qui se realisent entre les radicaux R des acides amines constitutiIs (ponts
hydrogene, ponts disulIures, repulsions hydrophobes, reactions acide-base) qui stabilisent
l'ediIice. Certaines de ces liaisons sont covalentes et donc tres solides comme les ponts
disulIures. D'autres, au contraire ne sont eIIicaces qu'a cause de leur nombre comme les ponts
hydrogene. Il n'est donc pas rare qu'une proteine puisse changer de Iorme selon
l'environnement chimique et que ce changement soit la cause de son activite ou la modiIie
completement (phenomene d'allostrie).


34
D'apres leur structure tertiaire, on distingue deux types de proteines:
- Les proteines Iibrillaires: elles sont Iormees de longues chanes d'acides amines enroulees
autour du mme axe. Elles sont generalement tres resistantes et insolubles dans l'eau. Leur
structure secondaire n'est representee que sous Iorme d'helices o (keratines des peaux,
cheveux, laines, ecailles, plumes, ongles, sabots... et le collagene du tissu conjonctiI) ou de
Ieuillets plisses (Iibrone du ver a soie).
- Les proteines globulaires ont une Iorme tres compacte plus ou moins spherique due a une
succession d'helices alpha et de Ieuillets plisses. Elles sont generalement solubles dans l'eau
et les solutions salines. Elles concentrent en leur centre les chanes laterales hydrophobes, en
tournant vers l'exterieur leurs groupements hydrophiles.

EnIin, plusieurs chanes proteiniques peuvent s'associer pour Iormer des unites
Ionctionnelles supra-moleculaires, ou complexes, qui constituent la structure quaternaire
des proteines. Nous en verrons quelques exemples typiques en physiologie.

3.3.3. Les htroprotines

Les polypeptides, parIois appeles holoproteines, peuvent tre modiIies ou couples a
d'autres types de molecules (sucres, lipides). On parlera alors d'htroprotines.
Polypeptides et heteroproteines sont souvent rassembles sous le terme general de protines.

Les heteroproteines peuvent tre considerees comme resultant de l'union d'une
holoproteine avec un groupement prosthtique non Iorme d'acides amines. Selon la nature
du groupement prosthetique, on distingue plusieurs categories d'heteroproteines :
- les glycoproteines: holoproteine glucides (proteines de surIace, -globulines du sang).
- les lipoproteines : holoproteine lipide.
- les phosphoproteines : holoproteine H
3
PO
4
.
- les metalloproteines: proteine metal (Ierritine stockant le Fe dans le sang).
Certaines proteines sont Iortement colorees du Iait de leur association avec un groupement
prosthetique organometallique colore (Ilavoproteines, catalase, cytochromes, hemoglobine).

Les proteines ont des rles tres divers et tres importants, dont il est diIIicile de Iaire
une liste exhaustive. Certains polypeptides sont des hormones (insuline qui regularise le taux
de sucre dans le sang). D'autres polypeptides sont des antibiotiques (tyrothricine,
gramicidine) ou des poisons (amanitine et phallodine des champignons mortels) ou conIerent
a certaines plantes leur toxicite elevee (la ricine du ricin, la crotine du Croton...).
Citons :
- les enzymes: les plus importants; ce sont eux qui eIIectuent la chimie cellulaire.
- le transport: hemoglobine du sang
35
- le stockage: Ierritine, ovalbumine
- la structure: collagene, Iibrone, keratine
- le mouvement: actine, myosine, tubuline
- la deIense: immunoglobulines
- la regulation: hormones (insuline), represseurs
- les poisons: ricine, amanitine, venins, toxine diphterique.

Les protides (qui regroupent acides amines, peptides et proteines) sont indispensables dans
l'alimentation de l'homme, puisqu'il ne peut pas Iabriquer certains acides amines.


3.4. LES ACIDES NUCLIQUES

Les nucleotides et acides nucleiques sont constitues au depart d'une association de 3
elements chimiques diIIerents: un phosphate, un pentose et une base organique azotee.

3.4.1. Les nuclotides

Dans chaque nuclotide on trouve, outre un groupement phosphate,
- un pentose qui est soit le ribose (dans les ARN et les nucleotides libres), soit le
desoxyribose (dans l'ADN).

- une base azotee. Il en existe 5 qui sont soit du type pyrimidique (un heterocycle carbone
contenant 2 azotes), courtes (cytosine (C), thymine (T), uracyle (U)), soit du type purique
(deux heterocycles carbones accoles contenant 4 azotes) longues (adenine (A), guanine (G)).

36
La liaison entre le C
1'
du sucre et un N de la base donne un nucloside.



La liaison supplementaire entre le C
5'
et un phosphate donne un nuclotide. Les
nucleotides peuvent tre phosphoryles une deuxieme et une troisieme Iois pour donner des
nucleotides di- ou triphosphates. Ces derniers ont un rle essentiel dans les transIerts
d'energie et dans la construction des acides nucleiques. Les liens ester Iormes entre deux
phosphates dans ces reactions sont dits "riches en energie" car leur hydrolyse libere 30,5
kJmol, mais l'energie accumulee n'est pas localisee dans la liaison elle-mme.







Les nucleotides interviennent aussi comme constituants dans d'autres molecules
importantes comme les coenzymes (voir chapitre sur les enzymes).
37
La condensation de nucleotides donne des acides
nucleiques ou polynuclotides. La liaison ester
se Iait entre le C
3'
du premier et le phosphate du
suivant.

Dans l'acide dsoxyribonuclique
(ADN), le sucre en C
5
est le desoxyribose, et les
bases sont l'Adenine, la Guanine, la Cytosine et la
Thymine (A,G,C,T).
Dans l'acide ribonuclique (ARN), le
sucre en C
5
est le ribose, et les bases sont
l'Adenine, la Guanine, la Cytosine et l'Uracyle
(A,G,C,U).



3.4.2. Les acides dsoxyribonucliques

L'ADN a un poids moleculaire tellement eleve
(plusieurs milliards chez l'homme) que son calcul n'a plus
aucun sens. Il est quasiment impossible de ne pas casser
la molecule quand on l'isole.

L'analyse chimique des ADN montre que la concentration en bases puriques (longues)
est egale a la concentration des bases pyrimidiques (courtes) A G C T. Et plus
precisement A T et G C. Or, justement, A et T peuvent s'accoupler par deux ponts
hydrogenes, de mme G et C Iorment 3 ponts hydrogenes entre eux.
En se basant sur ces observations et sur les diagrammes de diIIraction aux rayons X,
WATSON CRICK (1953) proposerent le schema structurel suivant :
La molecule d'ADN est Iormee non pas d'une, mais de deux chanes de nucleotides. Ces deux
chanes sont complementaires l'une de l'autre : a une base purique sur une chane correspond
toujours une base pyrimidique sur l'autre: a A correspond toujours T, G a C et vice versa: T a
A, C a G. Chacune des bases d'une chane est liee a la base correspondante par des ponts
hydrogene.
De plus, les deux chanes C
5
- P - C
5
- P -... ne sont pas droites mais helicodales
(comme dans la structure secondaire des proteines) et antiparalleles (c'est-a-dire que si l'on
considere qu'une chane "monte", l'autre "descend" : voir schema p. suivante).
38
La structure se presente comme une echelle de corde tres longue, tordue sur elle-
mme. Ses montants sont constitues de l'enchanement alternatiI sucre-phosphate. Les
barreaux de l'echelle sont constitues d'une base purique, et d'une base pyrimidique, liees d'un
cte au montant de l'echelle (au carbone 1 du desoxyribose) et liees entre-elles par des ponts
hydrogene. La rupture de ces liaisons hydrogene entre A et T et entre C et G (par une
elevation de temperature entre 85 et 100) provoque la separation des deux montants
polynucleotidiques et ce resultat peut tre obtenu sans que se produisent des ruptures dans les
chanes nucleotidiques.





39
La disposition des bases A,T,C,G Iormant les barreaux de l'echelle est la seule
variable du systeme, et seules 4 combinaisons sont possibles : Adenine-Thymine et Thymine-
Adenine (A-T et T-A) et Guanine-Cytosine et Cytosine-Guanine (G-C et C-G).
Les proprietes de l'ADN dependent de l'ordre dans lequel les paires de bases A-T, T-
A, G-C et C-G sont reunies. Ainsi le nombre de combinaisons - et donc le nombre de sortes
d'ADN - est-il quasi illimite.

Dans sa Iorme "classique", les deux montants de la double helice sont distants de 1,8
nm. Un tour de spire complet est parcouru sur une distance de 3,4 nm et englobe 10 paires de
bases. La hauteur occupee par un nucleotide est donc de 0,34 nm. Les echelons de l'echelle,
mesurant 1,1 nm correspondent a la longueur des bases puriques ou "longues" (0,55 nm), des
ponts hydrogenes (0,3 nm) et des bases pyrimidiques ou "courtes" (0,25 nm). La paire de base
ne passant pas par l'axe de symetrie de la molecule, les deux montants ne sont pas
diametralement opposes. En vue laterale, on observe donc un grand et un petit sillon entre les
montants de l'echelle (cIr schema de la page precedente).

La molecule d'ADN humain est un Iilament extrmement mince : une double helice
reliant la terre au soleil ne peserait que 0,5 g et un homme en possede 200 Iois plus, soit 15 a
30 milliards de km. Une cellule humaine somatique contient 56 x 10
-13
g d'ADN soit 3
milliards de paires de bases ou 1,75 metres d'ADN, decoupe en 46 morceaux de tailles
inegales. Il Iaudrait rassembler tout l'ADN de 60 milliards d'hommes pour en avoir une mole.
La Terre n'a donc jamais compte une mole d'ADN humain.

3.4.3. La chromatine

Les acides nucleiques sont souvent associes a des proteines. Il s'agit bien d'une
association entre deux ou plusieurs molecules et non d'une liaison entre constituants d'une
mme molecule.
Chez les Procaryotes, ou l'ADN est circulaire, on le trouve selon le moment du cycle
vital, soit a l'etat libre, non associe a des proteines, soit agglomere en une super-helice
entouree de proteines.
Chez les Eucaryotes, selon le moment, les nucleoproteines (association d'acides
nucleiques et de proteines) se presentent soit dispersees, sous Iorme de chromatine, soit
condensees sous Iorme de chromosome que nous etudierons plus loin.
La nucleoproteine presente l'aspect d'un collier de perles. Chaque perle, appelee
nuclosome a un diametre de 11 nm et une epaisseur de 5,5 nm. Chaque nucleosome est
constitue au centre d'un groupe de 8 histones (proteines basiques) : H
2A
, H
2B
, H
3
, H
4
en 2
exemplaires chacune, autour desquelles s'enroulent 140 paires de nucleotides de l'ADN sur 1
tour 34. Les histones s'associent au centre par les radicaux hydrophobes de leurs acides
40
amines tandis qu'elles tournent vers l'exterieur leurs radicaux basiques (ARG, LS, HIS).
L'union avec l'ADN se realise alors par simple reaction acide-base. Deux nucleosomes
successiIs sont separes par 15 nm d'ADN (le Iil du collier). A cet endroit se trouve aussi une
cinquieme histone (H
1
) qui intervient dans les condensations ulterieures de la molecule.
les histones H
3
et H
4
sont extraordinairement stables puisqu'on les retrouve pratiquement
identiques aussi bien chez les animaux que chez les vegetaux superieurs... que separent
pourtant 10
9
annees d'evolution divergente.

3.4.4. La structure des ARA

Ces macromolecules sont des
polynucleotides monocatenaires non
apparies mais autocomplementaires par les
reploiements sur elles-mmes de certaines
parties de cette chane (ces repliements
sont appeles structures secondaires).
Outre leurs diIIerences chimiques (ribose a
la place du desoxyribose, et U a la place de
T), les ARN sont en general plus petits et
plus Iragiles que l'ADN.
Il existe plusieurs sortes d'ARN
dont les Ionctions seront etudiees en
physiologie.



les ARN messagers . (ARN
m
) .
Ce sont des ARN libres correspondant a l'enchanement de quelques centaines a
plusieurs milliers de nucleotides. Chaque molecule est Iormee d'une chane unique de
nucleotides dont les bases sont A,U,C,G.
Ils Iorment environ 5 de l'ARN cellulaire total. (c'est pour la decouverte des ARN
m
que
LWOFF, MONOD et JACOB se sont vus decerner le prix Nobel de medecine en 1965).
41

les ARN de transfert (ARN
t
).

Ce sont les plus petits acides nucleiques. Ils comprennent de 70 a 90 nucleotides.
Chaque cellule contient au moins une cinquantaine d'ARN
t
diIIerents. 50 a 60 bases
s'apparient entre-elles, conIerant a la molecule une Iorme de treIle a trois boucles. Dans
l'espace, la Iorme tridimensionnelle (en L ou en boomerang) est la mme pour tous les ARN
t

connus. Ils presentent deux caracteristiques essentielles
1) une extremite (3') toujours terminee par C-C-A, l'autre par G;
2) la boucle du milieu, la plus eloignee des extremites, est Iormee de bases non appariees,
dont 3 constituent l'anticodon.
Les ARN
t
constituent environ 15 de l'ARN total de la cellule.





les ARN ribosomiaux (ARN
r
)

Ils sont constitutiIs des ribosomes dans lesquels ils Iorment, avec des proteines, des
nucleoproteines riches en G et C. Leur poids moleculaire varie entre 500 000 et 1 200 000 et
ils representent environ 80 de l'ARN total de la cellule.





42
3.5. LES AUTRES COMPOSES ORGANIQUES

Les glucides, lipides, protides sont les principaux constituants des tres vivants. Une
serie d'autres composes sont presents en quantites plus Iaibles, ou dans certains organismes
seulement. Mentionnons-en brievement quelques uns: les acides organiques, les pigments, les
alcalodes, les hormones, les vitamines, les essences, les resines et oleoresines, les tanins et
les latex.

Les acides organiques Iorment un groupe restreint d'acides carboxyliques qui se
trouvent au carreIour des diIIerentes voies metaboliques. Ils permettent le passage d'une
classe de composes chimiques a une autre. Ce sont les elements centraux du metabolisme
intermediaire retrouve dans tous les tres vivants (cI. physiologie).

Les vitamines sont des molecules diverses; qui agissent a l'etat de traces, dans
plusieurs cycles essentiels de la vie. L'homme en a absolument besoin mais ne peut pas les
synthetiser ou alors en quantite trop Iaible, il doit les trouver dans son alimentation. On
distingue les vitamines liposolubles (A,D,E,K) deja mentionnees et les vitamines
hydrosolubles (B,C). Ces dernieres jouent surtout un rle en tant que composant de diverses
coenzymes (voir plus loin).

Les porphyrines (et leurs derives les protoporphyrines) sont des molecules
polycycliques planes capables de complexer un atome metallique, comme le Ier dans l'heme,
ou le magnesium dans la chlorophylle. Ces molecules sont souvent inserees au cour de
proteines qui servent de transporteurs d'oxygene (hemoglobine, myoglobine), de
transporteurs d'electrons (cytochromes) ou de capteur de lumiere.



Les plantes sont particulierement riches en composes chimiques divers. On en
decouvre encore chaque jour. Leur arsenal est pratiquement inIini. La raison Iondamentale en
Heme de l'hemoglobine
(Fe-protoporphyrine IX)
43
est que les plantes, incapables de mouvement, ont du inventer un langage chimique soit pour
attirer les animaux dont elles ont besoin pour leur reproduction ou leur dispersion, soit pour
se deIendre des predateurs (herbivores). Parmi ces molecules citons:

Les essences sont des melanges de substances odorantes volatiles que l'on peut
extraire de certains vegetaux. Outre leur rle de condiments, stimulants de l'appetit et de la
digestion (gingembre, muscade, poivre...), elles ont des proprietes diverses, parIois toxiques
ou exploitees en medecine traditionnelle: antiseptiques des voies respiratoires (eucalyptus),
antispasmodiques (camomille), stomachiques (melisse) et abortives a Iorte dose (absinthe,
rue, sabine, thuya, tanaisie). Certaines essences sont utilisees en parIumerie et dans la
preparation des cosmetiques.

Les alcalodes sont des substances organiques azotees complexes presentant une
reaction basique ("alcalis") plus ou moins importante. On connat actuellement +5000
alcalodes naturels diIIerents. Ils ne sont synthetises que par les plantes et exercent des eIIets
physiologiques importants sur les animaux et l'organisme humain.
Certaines Iamilles d'Angiospermes sont reputees pour leur richesse en alcalodes
(Solanacees, Rubiacees, Papaveracees). Une mme plante peut contenir plusieurs alcalodes
(la morphine et 24 autres chez le pavot) et inversement, un mme alcalode peut se trouver
dans des plantes diIIerentes (caIeine des caIeier, colatier, theier...).
Les alcalodes sont responsables de la toxicite des plantes qui en renIerment, mais
sont aussi sources de medicaments tres importants. Certains alcalodes agissent sur le systeme
nerveux (morphine du pavot, atropine de la belladone, caIeine du caIeier, nicotine du tabac).
D'autres agissent au niveau du systeme vasculaire, ce sont des hypotenseurs (reserpine du
rauwolIia...) ou des hypertenseurs (ephedrine de l'ephedra). La colchicine (des colchiques) est
un antimitotique (voir partie sur la division cellulaire et la mitose).
44
Questions de reflexion .
1.1- Comparez les proprietes physicochimiques des phospholipides et des triglycerides.
1.2- Quelle est la sequence complementaire de TGCCATA ? Dessinez la structure bicatenaire
de cet oligonucleotide apparie a sa sequence complementaire, en indiquant les phosphates, les
bases et les sucres. IdentiIiez les extremites 5` et 3`.
1.3- Les acides gras ont un pKa proche de 4. Sous quelle Iorme sont-ils a pH 7 ?
1.4- Le savon de Marseille est Iabrique en hydrolysant de l`huile vegetale a l`aide de KOH.
Ecrivez l`equation chimique de cette reaction.
1.5- Citez trois types de glycoproteines vues au cours (dans les parties suivantes).
1.6- Quels sont les composes biochimiques que l`homme doit absolument trouver dans son
alimentation ? Comment les appelle-t-on ?
45
Deuxime Partie

CYTOLOGIE


Obfectifs .
- Connatre l`architecture cellulaire
- Comprendre la dynamique cellulaire : traIic intracellulaire, reproduction, communication et
mort des cellules.
- Connatre les diIIerences entre les cellules des diIIerents regnes
- Etablir des liens avec les autres chapitres du cours (notamment sur la structure et les
proprietes des membranes, le metabolisme, la meiose).

INTRODUCTION

Tous les tres vivants possedent un caractere commun : ils sont Iormes d'un certain nombre
d'unites biologiques elementaires : les cellules.
Depuis la decouverte de la structure cellulaire des tissus vegetaux par R. HOOKE en
1665, le microscope est l'element indispensable qui a permis le developpement de la
cytologie. Celle-ci a Iait d'enormes progres depuis une quarantaine d'annees grce au
microscope electronique qui a revele l'etonnante richesse des ultra-structures des divers
constituants de la cellule.
L'introduction de techniques nouvelles (chimiques, physiques et genetiques) permet
l'exploration d'un domaine nouveau, celui de la biologie moleculaire qui precise, au niveau
mme des constituants cellulaires, l'agencement et la nature des molecules qui ediIient la
matiere vivante.


1. STRUCTURE GNRALE DE LA CELLULE
______________________________________________________

Les premieres representations cellulaires sont dues a R. HOOKE (1665) qui examina
au microscope, des coupes dans du liege (bouchon). Il y distingua de petites alveoles vides,
juxtaposees, separees par des cloisons et auxquelles il donna le nom de cellula (petite
chambre).
160 ans plus tard DUTROCHET (1824) aIIirma que les cellules etaient les veritables
unites constitutives de tout tre vivant, d'ou decoula en 1838 la "theorie cellulaire" de
46
SCHLEIDEN (botaniste) et SCHWANN (zoologiste) : "la cellule avec sa matiere vivante est
morphologiquement et physiologiquement l'unite elementaire de structure et de Ionction".
Tous les tres vivants possedent au moins une cellule. Chez les tres pluricellulaires,
les cellules se specialisent (phenomene de diffrenciation). Les cellules qui exercent la
mme Ionction se regroupent en ensembles appeles tissus, etudies en histologie.

Les cellules bacteriennes, a l'image de ce que Iurent les premiers tres vivants, ne
contiennent que le minimum pour vivre: leur taille est tres petite (de l'ordre du m); la seule
membrane qu'ils possedent est la membrane plasmique; l'ADN est sous Iorme d'une molecule
unique, circulaire, non associee a des histones, en contact direct avec le reste du cytoplasme;
toutes les reactions se realisent dans un cytoplasme unique, non compartimente; les
possibilites metaboliques sont limitees.
L'evolution a transIorme progressivement les procaryotes en eucaryotes. Les
principales modiIications qui se sont produites sont les suivantes:
- accroissement de la taille d'un Iacteur 10 (le volume augmente donc d'un Iacteur 1000)
ce qui necessite un brassage continuel du cytoplasme (cyclose). Les levures ne depassent pas
5 m, alors que les cellules nucleees des eucaryotes superieurs depassent 10 m. D'une Iaon
tres generale, les cellules animales sont moins grandes (10 - 30 m) que les cellules vegetales
(10 - 200 m); mais l'ovule de poule a 30 mm (jaune d'ouI) et l'ovule humain, 200 m ! Les
dimensions cellulaires varient considerablement, dans la mme espece, en Ionction du type
cellulaire. Certains neurones ont des prolongements (axones) qui peuvent atteindre un metre !
- accroissement de l'inIormation: la longueur de l'ADN est multipliee par 1000, ce qui
necessite une organisation, une coordination nettement plus poussee. Ceci a entrane la
creation du noyau et l'invention de la mitose.
- compartimentation du cytoplasme de la cellule en un grand nombre de petits organites
limites eux-aussi par une membrane unitaire du mme type que la membrane cellulaire.
Chacun de ces organites est specialise dans une Ionction precise, comprenant ses propres
enzymes, et se trouvant dans des conditions physico-chimiques plus adequates a son
Ionctionnement. Le gel dans lequel baignent les organites et le noyau est appele cytosol.
L'evolution a aussi separe les animaux des vegetaux. C'est une consequence de leurs
modes de recuperation energetique. Les animaux trouvant leur energie chimique dans des
composes elabores par d'autres tres vivants, ont developpe une strategie de relation active
avec le milieu, caracterisee par l'acquisition de systemes sensoriel, nerveux et locomoteur. Au
contraire, les vegetaux utilisant l'energie solaire, ont developpe une strategie d'occupation de
l'espace et d'independance nutritionnelle complete dont les corollaires sont la rigidite et la
Iixite (enracinement) ainsi que le developpement de leurs perIormances en biosynthese. Au
niveau cellulaire, cette diIIerence d'evolution se marque par la presence de structures typiques
des vegetaux : ils montrent une paroi rigide importante et des vacuoles.

47

2. LES MEMBRANES CELLULAIRES


Toute cellule vivante est limitee exterieurement par une membrane, la membrane
plasmique (parIois appelee plasmalemme). Elle est trop mince pour tre observee au
microscope photonique mais son existence a d'abord ete deduite de la necessite de garder les
conditions constantes dans la cellule, diIIerentes des conditions exterieures. Elle est semi-
permeable, c'est-a-dire suIIisamment impermeable pour assurer cette constance mais en
mme temps suIIisamment permeable pour permettre des echanges choisis de nourriture et de
dechets avec le milieu exterieur. La membrane plasmique est typiquement une membrane
unitaire selon le modele de SINGER-NICHOLSON (1972).


Les membranes unitaires presentent les caracteristiques suivantes :
1) L'element essentiel est une couche bimoleculaire de lipides, principalement des
phospholipides, opposes par leurs ples hydrophobes. Elle est pratiquement impermeable a
toutes les grosses molecules polaires et a toutes les molecules chargees, specialement aux
ions (Na

, K

, H
3
O

,...). Elle est Iluide, c'est-a-dire que les molecules de phospholipides y


sont capables de mouvements lateraux libres (rotation, translation, diIIusion) tres rapides. Par
contre, les mouvements d'une Iace a l'autre sont rares. La composition chimique est variable
d'une couche a l'autre (asymetrie), d'une espece a l'autre, et, a l'interieur d'une cellule, d'une
membrane a l'autre.
Dans les cellules animales, des molecules de cholesterol s'inserent entre les phospholipides,
leur groupement hydroxyle etant dirige vers l'exterieur. Le cholesterol represente environ
25 du poids de lipides des membranes animales. D'autres types de lipides sont egalement
presents en quantites variables dans les membranes animales: les sphingolipides
(sphingomyeline), et diIIerents types de glycolipides (cerebrosides et gangliosides).
2) De nombreuses proteines sont inserees dans la bicouche lipidique et representent la moitie
du poids total de la membrane. Certaines proteines sont simplement attachee sur une Iace de
la membrane par un groupement lipidique, ce sont les lipoprotines, attachees a la membrane
48
par un acide gras (exemple 3 sur le schema ci-dessous) ou un glyco-phospholipide particulier
(exemple 4). D'autres proteines possedent un domaine hydrophobe qui traverse la membrane,
le plus souvent grce a une ou plusieurs helices alpha (exemples 2 et 5). EnIin, les deux types
d'ancrage peuvent tre combines (exemple 1). Ces proteines contrlent les echanges au
travers de la membrane et permettent a la cellule d'interagir avec son environnement.


3) Ces membranes biologiques unitaires sont asymetriques; elles ont un "endroit" et un
"envers". Leurs Iaces internes et externes renIerment des composants diIIerents auxquels
correspondent des activites biochimiques speciIiques diIIerentes. Sur la Iace externe, les
lipides et les proteines sont regulierement lies a des glucides qui servent de marqueurs. Cette
couche de glucides est particulierement importante chez les animaux, ou elle est appelee
glycocalyx.
4) Ces membranes sont souples. Elles peuvent s'invaginer, creer un petit puits et se reIermer,
emprisonnant ainsi un petit volume du milieu exterieur. Cette vesicule est alors dirigee vers
l'interieur de la cellule pour y tre digeree: c'est le phenomene d'endocytose. Le phenomene
inverse (exocytose) permet a la cellule de deverser ses productions dans le milieu exterieur.
Ces phenomenes, typiques des animaux, sont presents mais moins visibles chez les vegetaux.
Nous reparlerons des transports transmembranaires en physiologie.

L'epaisseur des membranes est d'environ 8 nm. Au microscope electronique, elles
presentent trois couches caracteristiques: la couche centrale paraissant claire, correspond aux
zones hydrophobes des lipides (environ 4 nm) et deux couches sombres correspondant aux
zones hydrophiles des (gluco)lipides et de proteines (environ 2 nm de chaque cte).
Toutes les membranes internes, limitant les organites, sont bties sur ce type (d'ou le
nom de membranes "unitaires") mais diIIerent entre-elles tant par la composition que par les
Ionctions.


49
3. LE CYTOPLASME


3.1 COMPOSITION DU CYTOPLASME

Au microscope photonique, le cytoplasme apparat comme un liquide plus ou moins
visqueux, transparent, incolore, homogene, un peu plus reIringent que l'eau, appele cytosol,
contenant une serie d'inclusions (organites), dont on ne distingue pas les details. Au
microscope electronique, le cytoplasme apparat non homogene et hautement structure, et la
structure des organites qu'il contient peut tre etudiee.
CTOPLASME CTOSOL ORGANITES

Le cytosol comprend :
a) de l'eau: environ 80 ;
b) une solution vraie de petits composes organiques et mineraux solubles: acides amines,
glucides, lipides, nucleotides, sels (notons que chez les animaux superieurs, le cytosol
contient peu de sodium et beaucoup de potassium) ;
c) une solution collodale de molecules plus grosses: proteines globulaires, ARN associes a
des proteines, diverses enzymes (environ 75 de la matiere seche), Iortement imbibees
de solvant et adherant entre elles. Les solutions collodales sont Iormees par la dispersion
de particules de 1 a 100 nm, soit une seule tres grosse molecule (proteine par exemple)
ou un agregat de molecules plus petites (micelles) moins solubles dans le solvant. Le
cytoplasme est constituee d'une solution collodale de type hydrogel, relativement
visqueuse.
d) de ribosomes et de proteasomes (voir plus loin) ;
e) une partie structuree : elle comprend plusieurs types de proteines Iibrillaires et globulaires
s'agenant en microIilaments ( 6 a 10 nm), en Iilaments intermediaires, et en
microtubules ( 25 a 30 nm) Iormant le cytosquelette particulierement important chez les
animaux.

3.2 LE CYTOSQUELETTE

Le cytosquelette est compose de proteines qui peuvent s'assembler (polymrisation)
en Iilaments de plusieurs types. Tous ces Iilaments participent au maintient de la Iorme des
cellules depourvues de paroi. Les microfilaments (actine, myosine) sont responsables des
mouvements musculaires chez les animaux, mais aussi du mouvement interne du cytoplasme
dans toutes les cellules eucaryotes. Les microIilaments se retrouvent aussi dans les
microvillosites des cellules epitheliales de l'intestin.
50
Les microtubules sont des tubes creux de +35 nm de Iormes de 9 a 13
protoIilaments composes de tubuline o et . Ils constituent le Iuseau mitotique lors de la
division nucleaire et la charpente des cils et Ilagelles.
Les filaments intermdiaires sont composes de cytokeratines, dont les molecules
sont agencees comme dans un cble. Ces Iilaments sont presents dans le cytoplasme, ou ils
sont attaches aux desmosomes (voir jonctions cellulaires), et jouent un rle particulier a
l'interieur du noyau (lamina nucleaire).

Le cytosquelette a de multiples Ionctions dans la cellule:
- Il maintient la forme des cellules animales (celle des cellules vegetales est dictee par
leur paroi rigide).
- Il intervient dans la contraction musculaire (qui n'est Iinalement qu'un changement de
Iorme).
- Il joue un rle dans la migration des cellules (qui necessite egalement un changement
de Iorme).
- Il est a la base de tous les mouvements a l'interieur de la cellule (endoexocytose,
cyclose, deplacement de proteines et d'organites). La separation des chromosomes en
mitose et en meiose, grce a un fuseau de microtubules est un cas particulier de
mouvement a l'interieur de la cellule.

Ces deplacements se Iont grce a trois types de mouvements:
(1). Ces Iilaments ne sont pas statiques mais dynamiques, ils se Iont et deIont constamment
au gre des polymerisations et depolymerisations dans le cytoplasme. Ils peuvent donc grandir
ou retrecir, poussant ou attirant les structures qui y sont accrochees.
(2). Deux Iilaments peuvent se deplacer l'un par rapport a l'autre. C'est le cas dans les
phenomenes de contraction cellulaire (cIr cours d'histologie).
(3). Les Iilaments peuvent servir de rails sur lesquels certaines structures peuvent glisser.
Tous ces mouvements consomment de l'energie, le plus souvent Iournie par l'hydrolyse d'un
nucleotide, le GTP, en GDP.

3.3 LA CYCLOSE

Le cytoplasme vivant est doue de mobilite. Il est anime de mouvements de brassage,
visibles par le deplacement des divers organites qui y sont inclus : c'est la cyclose.
La cyclose est necessaire car, etant donne la taille des cellules eucaryotes, la diIIusion
des molecules necessaires, entre autres l'oxygene, ne serait pas suIIisamment rapide pour
alimenter le centre de la cellule.
On peut bien voir la cyclose notamment dans les cellules des Ieuilles de certaines
plantes aquatiques. Si la cellule possede une grande vacuole centrale avec un cytoplasme
51
uniquement parietal, on assiste a une rotation, toujours dans le mme sens, de tout le
cytoplasme (organites compris) autour de la vacuole.
La vitesse de la cyclose varie mais est relativement Iaible : 50m par seconde, (18 cm
par heure) ce qui correspond quand mme a 1 tour complet en + 2 secondes.

3.4 ROLES DU CYTOSOL

Le cytosol apparat comme un carreIour tres important des diIIerentes voies du
metabolisme. En outre, la cyclose permet des echanges plus rapides.
Les divers organites de la cellule puisent et deversent constamment dans le cytosol de
nombreux produits.
EnIin, le cytosol est le siege de plusieurs chanes metaboliques qui lui sont propres:
telles la glycolyse, la synthese des proteines, du glycogene (animaux) et de l'amidon
(plantes), la synthese des acides gras, et le cycle des phosphopentoses... que nous etudierons
dans la partie du cours consacree a la physiologie cellulaire.


4. LES ORGANITES


Les Procaryotes ne possedent pas d'organites. La taille des Eucaryotes les oblige a
compartimenter leur cytoplasme. En eIIet, les chances que deux molecules se rencontrent
pour reagir, diminuent comme le cube du diametre de la cellule. Au sein de du cytoplasme,
baignent donc diverses inclusions et organites cellulaires.
Les inclusions Iorment des agregats plurimoleculaires, souvent des complexes
plurienzymatiques, non pourvus de membrane.
Les organites, au contraire, sont systematiquement entoures d'au moins une membrane
unitaire similaire a la membrane plasmique. Ils permettent d'isoler une petite portion de la
cellule, d'y etablir des conditions physico-chimiques particulieres, d'y concentrer des enzymes
specialisees. Le travail cellulaire se repartit dans des structures specialisees.
Le microscope photonique permet une vision de certains organites mais c'est le
microscope electronique qui en a devoile les structures.
Nous etudierons successivement :
1) les organites limites par une seule membrane unitaire :
- le reticulum endoplasmique;
- l'appareil de GOLGI (dictyosome et vesicules golgiennes);
- les lysosomes et les peroxysomes (ou glyoxysomes);
- les vacuoles.
2) les organites limites par une double membrane unitaire :
52
- les mitochondries;
- les divers plastes dont les chloroplastes (chez les plantes).

4.1. LE RTICULUM ENDOPLASMIQUE

A ce jour, le reticulum endoplasmique (RE), peut tre considere comme un constituant
cellulaire universel chez les eucaryotes. Les bacteries possedent un repli de la membrane
plasmique qui pourrait tre l'ebauche du RE. Le RE a surtout ete etudie en microscopie
electronique (il est invisible au microscope otique) et apparat comme un reseau complexe de
saccules aplatis, vesicules et canalicules Iinement ramiIies et anastomoses de diametre variant
de 20 a 200 nm. Cet ensemble complique s'etend depuis l'enveloppe du noyau jusqu'a la
peripherie de la cellule.

Le RE est limite par une membrane du type unitaire semblable a la membrane
plasmique. La Iace externe des membranes de RE en contact avec le cytoplasme est tapissee
par endroits de granules ovodes de 20 x 30 nm, renIermant + 60 d'ARN et + 40 de
proteines, denommees ribosomes. Ces endroits Iorment le rticulum endoplasmique
rugueux (RER), organise en citernes aplaties proches de la surIace du noyau. Les ribosomes
du RER des eucaryotes sont constitues de deux sous-unites : une sous-unite lourde composee
de +45 proteines diIIerentes et de 3 molecules d'ARN
r
, et en une sous-unite legere Iormee de
+30 proteines diIIerentes et d'une molecule d' ARN
r
. On trouve aussi de nombreux ribosomes
libres dans le cytoplasme. Ces derniers sont des inclusions.
Outre ces zones a ribosomes (RER), il existe des plages lisses sans ribosomes. Elles
Iorment le rticulum endoplasmique lisse (REL) organise en Iins tubules ramiIies.

Parmi les nombreux rles du RE, on peut citer :

1) Il intervient dans la Iormation de la membrane nucleaire: il y a une relation directe
entre l'espace perinucleaire et la cavite du reticulum.
2) C'est au niveau des ribosomes du RER que sont synthetisees les proteines des
membranes et celles qui seront exportees hors de la cellule. Les autres proteines sont
synthetisees au niveau des ribosomes libres dans le cytoplasme.
3) Le REL est responsable de la synthese de lipides. Il intervient par exemple dans la
synthese des sterodes et des phospholipides (mais pas dans la synthese des acides gras).
4) Le RE joue le rle d'organite collecteur, transporteur et distributeur de diverses
substances. Celles-ci, venues du milieu extra- et intracellulaire peuvent se rassembler, se
concentrer dans la cavite du RE et y tre transportees tres rapidement a travers tout le
cytoplasme. Ces rles ont ete demontres aussi bien dans les cellules vegetales que dans
les cellules animales en ce qui concerne les proteines.
53

4.2. L'APPAREIL DE GOLGI

Decouverts par GOLGI en 1898 dans des cellules nerveuses animales, puis observes
dans d'autres cellules animales et vegetales, ces organites ont Iait l'objet de nombreuses
controverses quant a leur structure, leur nature et leur rle.
A l'inverse du RE qui presente une structure tres polymorphe, l'appareil de GOLGI se
reconnat a l'arrangement des cavites qui le constituent.
La taille du "GOLGI" varie avec l'activite de la cellule : il est tres developpe dans les
cellules en pleine activite de synthese et peu developpe dans les cellules au repos.
Schematiquement, l'appareil de GOLGI comprend deux elements:
1. Le dictyosome Iorme d'un empilement de 4 a 6 saccules aplatis, renIles sur leurs bords.
Les saccules ont de 1 a 3 m de diametre et de 10 a 30 nm d'epaisseur. Ils sont limites par une
membrane unitaire. L'espace qui separe deux saccules voisins est de 6 a 10 nm.
2. Une serie de petites vesicules de 50 a 100 nm de diametre, limitees chacune par la
membrane unitaire. Ces vsicules golgiennes sont produites par bourgeonnement de la
peripherie des saccules dont elles se detachent.
L'appareil de GOLGI constitue une structure dynamique Iormee a partir de la
membrane nucleaire ou du RER.
Celui-ci, apres s'tre separe de ses ribosomes, emet des vesicules de transition qui se
rassemblent pour Iormer le premier saccule du dictyosome sur ce qu'on denomme sa face de
formation ou face cis. De nouveaux saccules se Iorment ainsi et repoussent progressivement
les premiers Iormes vers l'autre extremite de l'empilement denommee face de maturation ou
face trans. C'est sur cette derniere que les saccules se resolvent en vesicules golgiennes.
Une autre hypothese, basee sur des calculs de cinetique, estime que les saccules ne se
deplacent pas et que seules les vesicules assurent des transports d'un saccule a l'autre, dans les
deux sens.
La composition chimique des membranes unitaires est intermediaire entre celle du RE
et celle de la membrane plasmique. Elle est riche en enzymes qui accrochent des residus
glycosyles aux proteines, des glycosyltransIerases. Les rles de l'appareil de GOLGI peuvent
se resumer a la "Iinition" (glycosylation), a l'"emballage" et au tri de divers produits.
Citons certains de ces rles :
1) Chez les animaux, les vesicules golgiennes Iusionnent en grains de secretion qui
deversent leur contenu dans le milieu exterieur.
2) Chez les animaux encore, les vesicules golgiennes, riches en glycoproteines,
interviennent dans la synthese de leur revtement externe (glycocalyx).
3) Les lysosomes primaires proviennent des vesicules golgiennes.
4) EnIin, la membrane des vesicules golgiennes intervient dans le renouvellement, le
turn-over des proteines transmembranaires et des lipides de la membrane plasmique.
54

4.3. LES LYSOSOMES ET LES PEROXYSOMES (OU GLYOXYSOMES)

Les lysosomes ont ete decouverts et etudies biochimiquement dans la cellule animale
(cerveau, Ioie, pancreas, rate..) par Ch. de DUVE (prix Nobel 1974) et ses collaborateurs a
l'UCL. Ils ont ensuite ete decrits dans les cellules vegetales.
Ce sont de petites vesicules de 150 a 300 nm de diametre, limitees par une membrane
et contenant des enzymes digestives (des hydrolases acides, parce que leur pH optimal et
compris entre 3 et 6).
Ces hydrolases sont capables de degrader les substances biologiques (glucides,
lipides, proteines) en composes simples (acides amines, acides gras, oses), qui sont ensuite
transIeres dans le cytoplasme. Les lysosomes sont responsables de la digestion des substances
nutritives d'origine extracellulaire. Ils peuvent aussi digerer des portions de la cellule, en cas
de diete severe ou quand les elements en question ne sont plus Ionctionnels, isolees
prealablement du reste du cytoplasme par une membrane unitaire (autophagie cellulaire ou
autolyse).
Les lysosomes proviennent de vesicules golgiennes chargees d'enzymes.

Les peroxysomes (ou glyoxysomes) sont des organites decouverts d'abord dans la
cellule animale (Ch. de DUVE, 1966-1967; TOLBERT coll. 1968). Ce sont des granules,
limites par une membrane unitaire, mesurant de 0,5 a 1,5 m de . Dans les cellules
vegetales, ils sont souvent accoles aux chloroplastes. Ils contiennent des enzymes essentielles
au deroulement de certains cycles particuliers du metabolisme (peroxydation, metabolisme de
certains lipides de reserve), et notamment la catalase qui elimine le peroxyde d'hydrogene ou
eau oxygenee.

4.4. LES VACUOLES

On donne le nom de vacuoles a des organites aqueux, entoures d'une membrane
unitaire, contenus dans le cytoplasme des cellules vegetales. Bien que certains representant
des autres regnes montrent parIois des structures qui ressemblent a des vacuoles, elles
constituent un organite aussi typique des cellules vegetales que sa paroi.
Les vacuoles sont aisement observables lorsqu'elles sont colorees naturellement
(Ilavones, anthocyanes).

Leur origine semble complexe. On peut suivre leur evolution en observant des cellules
meristematiques localisees a l'extremite d'une racine (cellules tres jeunes), ainsi que des
cellules qui en sont de plus en plus eloignees (cellules qui s'hydratent progressivement). Au
Iur et a mesure que l'on s'eloigne de la pointe de la racine et que les cellules grandissent, les
55
vacuoles d'abord petites, a contenu dense, Iort colore, s'agrandissent, conIluent en une
vacuole unique, moins dense, moins coloree, reIoulant le cytoplasme et le noyau contre la
paroi cellulaire.
Le contenu vacuolaire Iorme un pool de composition complexe dont la nature et la
concentration varie en Ionction de l'espece, du type cellulaire et de son etat physiologique.
On a Iait souvent passer la vacuole pour un organite inerte, mais il Iaut reviser notre
conception a ce sujet.
La vacuole est l'organite qui contient le plus d'eau.
Les ions mineraux peuvent s'y accumuler. La membrane qui separe la vacuole du
cytoplasme montre a leur egard une selectivite etonnante, certains ions pouvant y tre
concentres jusqu'a 100x plus qu'a l'exterieur, a l'encontre des lois de la diIIusion, ce qui
consomme de l'energie.
La decouverte la plus etonnante a ete celle d'un riche equipement enzymatique qui
conIirme que la vacuole est a assimiler aux lysosomes de la cellule animale.

On doit donc considerer la vacuole comme un element regulateur essentiel dans la
cellule vegetale:
1) Elle constitue la principale reserve d'eau de la cellule vegetale.
2) Elle contribue a la croissance cellulaire : l'hydratation et le gonIlement subsequent de
la vacuole exerce une pression sur la paroi cellulaire extensible et elastique qui s'etire. La
vacuole ne grandit pas parce que la cellule grandit, mais c'est parce que la vacuole
pousse de l'interieur que, pour ne pas eclater, la cellule doit s'agrandir. En ce sens, elle
permet a la cellule vegetale d'atteindre de tres grandes dimensions a un prix energetique
Iaible: il suIIit d'accumuler de l'eau.
3) Dans les cellules qui ont deja atteint leur taille deIinitive, la persistance d'une
pression vacuolaire interne provoque un etirement supplementaire des parois cellulaires
elastiques. La cellule est alors "turgescente" et cette turgescence assure a la cellule, aux
tissus, a la plante entiere une certaine rigidite. La perte de celle-ci correspond a
l'aIIaissement du tissu ou de l'organe, c'est la Ianaison.
4) Elle joue le rle de grenier, d'estomac et de poubelle en accumulant des substances de
reserve (sels, saccharose...), de dechet (acide oxalique, toxique pour la cellule,
immobilise sous Iorme cristalline...), de deIense (stockage de substances allotoxiques,
c'est-a-dire qui n'ont d'inIluence que sur un predateur eventuel).

56
4.5. LES MITOCHONDRIES

Au microscope optique, les mitochondries apparaissent comme de petits granules,
btonnets de 0,5 a 1,5 m de longueur, disperses dans le cytoplasme. Elles sont entranees par
les mouvements de la cyclose mais sont douees d'une mobilite qui leur est propre. Elles
presentent tres Irequemment des variations de Iorme et de taille.
Les mitochondries se multiplient par bipartition (division) ou bourgeonnement de
mitochondries preexistantes. Toute mitochondrie provient donc d'une mitochondrie. Le
nombre de mitochondries (de quelques centaines a quelques milliers) est relativement
constant dans un type donne de cellules.
Au point de vue chimique, les resultats de l'analyse des mitochondries isolees (par
centriIugation diIIerentielle) donne les resultats suivants (pour inIormation):
eau : 66;
proteines : 22 (proteines de structure et enzymes)
lipides : 11 (surtout des phospholipides)
nucleotides : ADP et ATP, ADN et ARN
coenzymes accepteurs d'hydrogene : FAD, NAD, cytochromes, vitamines ;
ions mineraux : K

, Ca

, Na

, Mn

, Fe

...

Au microscope electronique, la mitochondrie se montre limitee exterieurement par
deux membranes de type unitaire separees par un espace clair d'environ 10 nm (l'espace
intermembranaire) delimitant un espace interne : le stroma ou matrice.
La membrane externe (membrane unitaire) est unie. Elle contient environ autant de
proteines que de phospholipides. Elle est permeable a presque toutes les petites molecules
non chargees (grce a diIIerents types de transporteurs proteiques).
La membrane interne s'invagine vers l'interieur et presente des crtes (ou des tubules)
disposees plus ou moins perpendiculairement a la surIace de l'organite: les "crtes
mitochondriales". Celles-ci accroissent enormement la surIace de la membrane interne de la
mitochondrie. Le nombre de crtes varie selon l'activite physiologique de la cellule. Dans les
mitochondries jeunes, les crtes sont peu nombreuses et peu developpees; elles se multiplient
et s'agrandissent au Iur et a mesure de l'accroissement de l'activite cellulaire et regressent
lorsque la cellule vieillit.
La membrane interne de la mitochondrie constitue un exemple typique de membrane
asymetrique. Les Iaces internes des crtes mitochondriales, elles seules, sont tapissees de
spheres de 9 nm de portees par un pedoncule: les "facteurs de couplage" 2 000 a 4 000
unites par m
2
soit 10
4
a 10
5
par mitochondrie. Chacune d'entre elles est constituee d'un
assemblage structure de proteines responsables de la synthese de l'ATP. De ce Iait, on les
appelle aussi ATPases. La membrane interne contient + 80 de proteines et + 20 de
57
phospholipides. Elle est impermeable a presque toutes les molecules et necessite
obligatoirement la participation de transporteurs actiIs.
La membrane interne et la membrane externe ont des compositions chimiques
diIIerentes. Elles diIIerent surtout par la nature des enzymes qu'elles contiennent. Elles jouent
donc des rles diIIerents dans les reactions du metabolisme. Sans entrer ici dans les details,
notons des a present que la membrane interne possede plusieurs Ionctions tres importantes:
elle est le siege de la "chane respiratoire", voie metabolique qui oxyde les coenzymes NADH
ou FADH
2
et recupere l'energie sous Iorme d'ATP dont elle est la source essentielle. Elle
possede en plus plusieurs transporteurs transmembranaires contrlant tres exactement les
entrees et les sorties des composants de la matrice mitochondriale.

Le stroma ou matrice est un gel contenant 50 de proteines. Il apparat comme une
substance claire, homogene, renIermant des ribosomes (des mito-ribosomes, plus legers que
ceux du cytoplasme mais identiques a ceux des bacteries) localises surtout dans la peripherie
de l'organite. Il contient en outre des acides nucleiques : chez les animaux pluricellulaires,
l'ADN mitochondrial est une double helice annulaire (semblable a l'ADN des bacteries);
l'anneau Iormant une helice secondaire de taille variable (16 569 paires de bases chez
l'homme). Par contre chez certains eucaryotes unicellulaires et chez les plantes, l'ADN
mitochondrial est lineaire, parIois avec des extremites simples. La duplication de l'ADN
mitochondrial ne s'eIIectue pas en mme temps que celle de l'ADN du noyau.
Le stroma Iournit la membrane interne en coenzymes reduits grce a plusieurs chanes
metaboliques dont les principales sont la - oxydation des lipides, le cycle de KREBS.

Sa richesse chimique donne a la mitochondrie une importance considerable. C'est a
son niveau que sont oxydees les substances et que se Iorme l'ATP (ADP Pi energie --
ATP). Cette synthese conIere a la mitochondrie un rle de centrale energetique. C'est la
raison pour laquelle elles sont localisees a proximite des structures consommatrices d'energie
(par exemple le long des myoIibrilles responsables du mouvement chez les animaux).


4.6. LES CHLOROPLASTES

Les chloroplastes sont des elements cellulaires propres aux vegetaux (avec la vacuole
et la paroi). Le microscope photonique les montre comme des petits granules lenticulaires de
3 a 10 m de et de 1 a 4 m d'epaisseur. Ils sont donc generalement plus grands que les
mitochondries. Leur nombre par cellule est variable et caracteristique de l'espece et du tissu
examine. On en compte environ 50 par cellule, soit 500 000 par mm
2
de Ieuille.
La chlorophylle, responsable de la couleur verte des plantes y est concentree dans des
petits granules lenticulaires de 0,5 a 2 m de et de 0,2 m d'epaisseur, plus ou moins
58
regulierement disposes, denommes grana et qui donnent au chloroplaste une structure
granulaire. L'ensemble des regions claires, non pigmentees, separant les grana est denomme
stroma ou matrix.
Au microscope electronique, le chloroplaste se montre limite par deux membranes du
type unitaire separees par un espace clair d'environ 10 nm (l'espace intermembranaire)
entourant un espace interne : le stroma ou matrix, comme dans les mitochondries.
Dans le stroma, on trouve des ensembles de membranes paralleles au grand axe et qui
Iorment des sacs Iermes, les thylakodes, independants de l'enveloppe. Il y en a de deux
types: les thylakodes granaires, en Iorme de disque, empiles les uns sur les autres pour
Iormer les grana visibles au microscope optique, et les thylakodes intergranaires ou
lamelles stromatiques ou du stroma qui s'etendent d'un granum a l'autre ainsi que dans le
stroma. Un granum est un empilement cylindrique de sacs ovodes, plats, de 0,3 a 0,6 m de
autour duquel s'enroulent en helice plusieurs lamelles stromatiques regulierement espacees.
Les cavites des lamelles et celles des disques sont en communication si bien que l'ensemble
Iorme une cavite unique totalement independante de l'enveloppe externe. Il y a donc dans le
chloroplaste trois compartiments embotes les uns dans les autres: l'espace intermembranaire,
le stroma, l'espace intrathylakodien, separes par des membranes qui ont des compositions,
des permeabilites et des rles diIIerents. Il y a de 40 a 70 grana par chloroplaste, contenant
chacun de 2 a 60 (moyenne 20) thylakodes.
Les deux membranes de l'enveloppe sont lisses.
Comme dans la mitochondrie, l'externe est permeable tandis que l'interne ne laisse
passer librement que des molecules du type O
2
, CO
2
et necessite des transporteurs specialises
pour les autres molecules.
La membrane unitaire du thylakode est riche en lipides insatures lui conIerant une
tres grande Iluidite. Elle montre des protuberances qui emergent de la couche lipidique, a
savoir :
1) des unites carrees de 15 nm de cte, transmembranaires. Ce sont les complexes
proteiniques du photosysteme deux (PS II). Ils jouent un rle de capteurs de photons
(energie solaire). Ils contiennent environ 300 molecules de chlorophylle et environ 50 de
pigments carotenodes implantees par leur ple hydrophobe dans la couche lipidique de
la membrane unitaire. Ces unites carrees sont associees en un reseau serre, surtout dans
les zones d'empilement des thylakodes.
2) des unites plus petites de 8 nm de , transmembranaires aussi, ayant un rle
physiologique semblable. Elles constituent les unites du PS I.
3) des spheres pedicellees (10 nm de ) exclusivement situees sur la Iace stromatique.
Ce sont les Iacteurs de couplage chlorophylliens qui servent a la synthese d'ATP (tout
comme dans la mitochondrie) et dont le Ionctionnement sera egalement etudie en
physiologie;
59
La repartition de ces trois elements est variable sur la membrane: les PS I se situent
partout, les PS II uniquement la ou les thylakodes s'accolent, les Iacteur de couplage, la ou il
n'y a pas de PS II.
Le stroma incolore, montre une inIrastructure voisine de celle des mitochondries. Il
possede en plus des gouttelettes lipidiques et quelques grains d'amidon. On y a mis aussi en
evidence des ribosomes a l'etat libre.
L'analyse chimique des chloroplastes donne en moyenne les resultats suivants :
- eau : 50 ,
- proteines : 25 (proteines de structure et enzymes),
- lipides : 15 (gouttelettes et membranes),
- glucides : en quantite variable selon l'ge physiologique de la plante,
- chlorophylle : 3 ,
- carotenodes : 2 (carotene, lycopene et xanthophylle),
- ARN: 1 , ADN: 0,5 : d' aspect voisin de celui de la mitochondrie,
- ions mineraux : Mg, Fe, Cu, Mn, n,...,
- coenzymes accepteurs d'hydrogene : NADP, cytochromes I et b
6
...
Le rle des chloroplastes est essentiel a la survie de la Terre: les thylakodes sont
specialises dans la phase claire de la photosynthese qui transIorme l'energie lumineuse solaire
en energie chimique sous Iorme d'ATP et de NADPH. Le stroma utilise cette energie pour
diverses syntheses: synthese des glucides, des acides gras, reduction des nitrates et sulIates,
synthese des acides amines. Les produits sont mis a la disposition non seulement du reste de
la plante, mais de l'ensemble des autres tres vivants. Ils sont donc les producteurs primaires
de toutes les pyramides nutritionnelles.

AUTRES PLASTES

Il existe d'autres types d'organites semblables aux chloroplastes dans les cellules
vegetales, appeles plastes. Les plastes de la cellule adulte presentent divers aspects selon la
nature des substances qu'ils elaborent ou contiennent. Outre les chloroplastes, on distingue :
- les amyloplastes (et leucoplastes) qui elaborent et stockent l'amidon ;
- les chromoplastes qui renIerment des pigments carotenodes: la xanthophylle (jaune), le
carotene (rouge-orange) et le lycopene (rouge). Ce sont les chromoplastes qui sont
responsables de la coloration particuliere de certaines Ileurs (Renoncule, Souci), de certaines
racines (Carotte), de certains Iruits (Tomate) et des diverses teintes des Ieuilles en automne.
- les proteoplastes et les oleoplastes qui accumulent des proteines et des lipides (qui sont
Iabriques ailleurs dans la cellule).
Tous les plastes possedent une double membrane, et des acides nucleiques, comme les
chloroplastes et les mitochondries (qui ne sont cependant pas considerees comme des
plastes). Les plastes proviennent tous de proplastes (que l'on trouve dans le zygote) ou
60
d'autres plastes, par partition. Des interconversions entre plastes sont possibles. Un
chloroplaste peut par exemple se transIormer en chromoplaste.
Il existe une tres etroite collaboration entre l'ADN des plastes et celui du noyau car sa
taille est suIIisante pour coder les ARNt et ARNr necessaires, mais ne peut coder qu'un tiers
des proteines presentes.
Cette interdependance est a mettre en relation avec le probleme de l'origine des
plastes. Selon l'hypothese de MERESCHKOWSKI (1905), les plastes seraient des ex-
procaryotes vivant en symbiose avec une cellule eucaryote incapable de photosynthetiser.
Cette hypothese ne s'est developpee que vers les annees 60, quand des arguments
biochimiques lui donnerent du poids. On retrouve la mme Iorme circulaire de l'ADN,
l'absence de nucleosomes, la similitude des ribosomes, le mme mode de transcription, une
sensibilise aux mmes inhibiteurs de synthese chez les plastes et les bacteries. Mais il ne
s'agirait pas d'une simple relation de symbiose puisque l'ADN des plastes est 20 a 30 Iois plus
petit que celui des bacteries, nettement insuIIisant pour assurer son autonomie; qu'il possede
des introns, caracteristiques de l'ADN des eucaryotes et qu'il y a eu des echanges entre le
noyau et le plaste puisqu'on y retrouve des sequences communes. Il Iaut donc parler de co-
evolution plus que de symbiose.
Des considerations identiques amenent a penser que les mitochondries seraient aussi
des bacteries oxydantes ayant co-evolue avec des cellules eucaryotes Iermentantes.


61

5. LE NOYAU


Le noyau est l'element intracellulaire decouvert en premier lieu par R. BROWN en
1835, dans les cellules des orchidees. Son rle est primordial dans les processus hereditaires
ainsi que dans le contrle de la synthese des proteines. Il subit de proIondes transIormations
cycliques. Nous considerons ici le noyau en interphase, dit "au repos", ou "quiescent", quand
la cellule n'est pas en division. En realite, cette periode correspond a une periode d'intense
metabolisme.

5.1. NOMBRE, FORME, DIMENSION, COMPOSITION CHIMIQUE

1 Nombre : Rappelons d'abord que les organismes primitiIs, les Procaryotes ne possedent
pas de noyau "vrai", mais simplement une masse d'ADN baignant directement dans leur
cytoplasme. Le noyau des Eucaryotes constitue une acquisition de l'evolution.
Chez les Eucaryotes, chaque cellule possede en general, un noyau. Certains eucaryotes
inIerieurs et certains tissus en possedent deux (cellules a dicaryons des champignons
superieurs, certaines cellules du Ioie ou du cartilage) ou mme plusieurs (structure
articulaire de certaines algues, des Iibres musculaires striees, structure symplastique de
certains champignons...). EnIin, les cellules depourvues de noyau (globules rouges,
plaquettes) sont d'anciennes cellules nucleees chez lesquelles le noyau, devenu inutile, a
disparu lors de la diIIerenciation (specialisation) de la cellule.
2 Forme : En general, le noyau est de Iorme spherique ou ovode mais peut devenir,
ellipsode, IusiIorme ou irregulier (comme dans certains globules blancs), suivant la
Iorme et la Ionction de la cellule elle-mme.
3 Dimension : La dimension des noyaux est Iort variable et proportionnelle a la taille des
cellules. Le diametre varie de 1 a 2 m (levures) a plus de 450 m (oospheres de certains
Gymnospermes). Chez les vegetaux et les animaux superieurs, il varie de 5 a 15 m. De
plus, la taille du noyau varie au cours du cycle cellulaire.
4 Composition chimique (a titre d'inIormation): en du poids sec, l'analyse chimique du
noyau revele des proteines (80), des phospholipides (1), de l'ADN (10), de l'ARN
( 4), des ions (Ca

, Mg

, Na

...).
L'ADN et l'ARN sont colores intensement par l'hematoxyline et d'autres colorants utilises
en cytologie et en histologie, qui donnent une couleur particuliere au noyau.




62
5.2. L'ENVELOPPE NUCLEAIRE

Au microscope optique, elle apparat comme une mince pellicule continue separant le
noyau du cytoplasme.
Le microscope electronique montre que l'enveloppe nucleaire est constituee de deux
membranes de type unitaire. Elles sont separees par l'espace perinucleaire, espace clair,
variable en epaisseur (de 10 a 100 nm).
L'enveloppe nucleaire est caracterisee par sa porosite, a l'oppose des membranes des
organites qui sont continues. Elle est percee de pores dont le nombre varie, mais qui
augmente avec l'activite de la cellule (environ 40 a 80 par m
2
, leur surIace totale peut
atteindre 25 de l'enveloppe nucleaire). Les pores sont de reelles ouvertures dans la
membrane, qui mettent en contact direct le cytoplasme et le nucleoplasme. Ils sont constitues
d'un canal aqueux d'environ 10 nm de , entoure sur chacune des Iaces de l'enveloppe d'un
complexe protinique du pore, constitue de 8 sous-unites d'environ 20 nm, disposees en
octogone. Les pores peuvent s'ouvrir et se Iermer, pour laisser passer des particules plus
larges que l'oriIice. Au niveau des complexes du pore, les membranes externe et interne sont
en contact, bien qu'elles restent chimiquement distinctes.
La membrane externe est en relation directe avec le RE dont elle a d'ailleurs une
composition proche. Sa Iace externe est tres souvent recouverte de ribosomes. La membrane
interne est recouverte sur sa Iace interne d'une epaisse couche de proteines, la lamina (+60
nm chez les animaux) qui aurait le double rle de garder la Iorme generale du noyau et
d'accrocher la chromatine deployee a certains points Iixes. L'espace perinucleaire est en
continuite avec les cavites du RE.
Il semble donc que la membrane nucleaire ne soit qu'une portion specialisee du RE
destinee a conIiner en un endroit du cytoplasme les molecules d'ADN deployees aIin d'eviter
qu'elles ne s'entremlent et ne se cassent, tout en maintenant la possibilite des echanges
nombreux et indispensables de grosses molecules avec le cytoplasme (ARN, ribosomes,
enzymes...).

5.3 LES NUCLEOLES

Le noyau "au repos" contient un ou plusieurs nucleoles. Ils sont presents durant
l'interphase et disparaissent au cours de la mitose.
Au microscope photonique, les nucleoles apparaissent comme des globules tres
reIringents, de Iorme spherique ou ovale, de 1 a 5 m de . Leur taille est d'autant plus
grande que l'activite cellulaire est grande. Ils ont l'aspect d'une masse dense.
Le microscope electronique montre que le nucleole ne possede pas de membrane
propre. Il presente l'aspect d'une eponge. On peut y observer deux zones diIIerentes : une
zone fibrillaire et une zone granulaire de repartition tres variable. La zone Iibrillaire est
63
constituee de nombreux Iilaments d'ADN et de milliers de Iibrilles (de 20 a 40 nm de long et
de 4 a 8 nm de ) disposees perpendiculairement a ces ADN, et constituees des molecules
d'ARN en cours de synthese. La zone granulaire est Iormee de ribonucleoproteines
semblables, en dimension et en densite, aux ribosomes du cytoplasme.
Le rle du nucleole a ete demontre par l'experience suivante: il existe une souche
mutante de crapaud Xenopus laevis qui, au lieu de posseder deux nucleoles par noyau, n'en
possede qu'un seul. Si on croise deux de ces mutants, les embryons obtenus constituent une
population dont 25 possedent des noyaux a deux nucleoles, 50 des noyaux a un nucleole,
25 des noyaux sont anucleoles. Ces derniers meurent quatre jours apres l'eclosion, et on
peut constater par marquage radioactiI a l'uridine tritiee qu'ils ne synthetisent que l'ARN
m
et
l'ARN
t
. Ils ont perdu la possibilite de Iabriquer l'ARN ribosomial et ne peuvent utiliser durant
leur courte vie pour la synthese de leurs proteines, que les ribosomes provenant de l'oeuI.
Le nucleole est donc l'endroit ou se synthetisent les milliers de ribosomes de la
cellule: l'inIormation est contenue a plusieurs endroits sur la chromatine des chromosomes
organisateurs nucleolaires. La zone Iibrillaire est constituee de ces morceaux d'ADN sur
lesquels se synthetisent les molecules d'ARNr. Ceux-ci sont alors assembles sur place, grce
a des proteines en provenance de l'exterieur via les pores, en preribosomes (zone granulaire),
acheves et transitent alors vers le cytoplasme, par les mmes pores, pour y Ionctionner. Il
n'est donc pas etonnant que le nucleole disparaisse pendant la mitose: l'ADN etant incorpore
aux chromosomes, aucun preribosome nouveau n'est assemble et ceux qui sont termines
sortent du noyau. De mme en Iin de mitose, l'ADN redevenant disponible, les nucleoles
apparaissent toujours aux mmes endroits. Il y a ainsi 10 organisateurs nucleolaires chez
l'homme, donc 10 petits nucleoles en debut d'interphase, qui Iusionnent tres rapidement en un
seul.
La composition chimique des nucleoles est la suivante:.
a) des proteines (90 du poids sec) : complexes enzymatiques necessaires a la synthese
d'ARN, histones liees a l'ADN, proteines des ribosomes.
b) de l'ARNr en concentration Iort importante (5 a 8 ), reparti dans les zones Iibrillaires et
granulaires.
c) de l'ADN, localise au coeur des zones Iibrillaires, comme deja signale plus haut.

5.4 LA CHROMATINE

La chromatine est un complexe biochimique Iorme de nucleoproteines a ADN.
Nous avons vu precedemment, la structure proposee pour la nucleoproteine a ADN.
Celle-ci se presente sous la Iorme d'un collier de nucleosomes Iormes chaque Iois de 2x4
histones, entoures par une molecule d'ADN. La chromatine est un stade de condensation plus
eleve: les nucleosomes s'enroulent selon une super-helice d'un de 25 a 30 nm et d'un pas de
64
10 nm. On suppose qu'il y a 6 a 10 nucleosomes par tour de spire et que l'histone H
1
ainsi que
les ions calcium stabiliseraient cet ediIice moleculaire.
Lors de la division nucleaire, la chromatine subit des condensations supplementaires
qui conduisent a la Iorme compacte du chromosome.
La chromatine apparat sous Iorme dispersee appelee euchromatine et sous Iorme
condensee appelee htrochromatine. L'euchromatine est assimilee a la Iraction "active" de
l'ADN qui code les proteines necessaires a la cellule a ce moment la. L'heterochromatine,
plus condensee, se colore plus Iacilement. Elle est generalement inactive au point de vue
genetique et est constituee en partie de sequences repetitives dont on ne connat pas la
Ionction exacte.
Une Iorme particuliere d'heterochromatine est la chromatine sexuelle ou corpuscule de
BARR visible dans l'espece humaine. Elle se presente sous Iorme d'une lentille biconvexe de
+1m de accolee au nucleole ou a la membrane nucleaire. Elle provient de la condensation
et de l'inactivation d'un des deux chromosomes X chez la Iemme normale. Son observation
est tres utile pour la conIirmation d'anomalies hereditaires. L'homme normal, ne possedant
qu'un seul chromosome X, ne montre pas cette chromatine sexuelle.
Rappelons enIin que la chromatine s'accroche regulierement a la membrane nucleaire
au niveau des proteines de la lamina.

5.5 LE NUCLEOPLASME

Le nucleoplasme ou suc nucleaire ou matrice nucleaire est la substance Iluide et
homogene qui remplit le reste de la cavite nucleaire. Le microscope electronique montre
parIois de tres Iins granules ou Iilaments dont on ne connat actuellement ni la constitution
chimique, ni la structure physique.
Le nucleoplasme contient la machinerie enzymatique et les materiaux (nucleotides
libres, importes du cytoplasme) pour Iabriquer les acides nucleiques et les assembler en
nucleoproteines.

5.6 LA FONCTION DU NOYAU

Le noyau contrle le Ionctionnement et la morphologie de la cellule. Une ancienne
experience l'avait deja montre :
Par micromanipulation on peut sectionner une amibe: un petit Iragment contenant le noyau,
l'autre etant anuclee. Le Iragment nuclee continue a vivre. Il peut s'accrotre et se multiplier.
Le Iragment anuclee arrte quasi instantanement ses mouvements; il peut encore ingerer
quelques proies, mais elles ne sont pas assimilees; la synthese des proteines s'arrte, puis la
65
respiration; il meurt apres quelques jours, sans avoir pu s'accrotre. Si on greIIe un noyau au
cytoplasme anuclee, le Iragment reprend son activite.
Le noyau est en quelque sorte l'ordinateur central de la cellule: c'est la, sous Iorme
d'ADN, qu'est stockee toute l'inIormation genetique caracteristique de l'organisme. Une partie
de cet ADN est recopiee (transcrite) dans le noyau en ARN qui permettront la synthese des
proteines. Cette synthese est strictement contrlee au niveau du noyau grce a de nombreuses
inIormations qui sont transmises au noyau par l'intermediaire de proteines regulatrices qui
passent par les pores.


6. PAROI ET MATRICE EXTRACELLULAIRE


La membrane plasmique est relativement Iragile. Dans de nombreux types cellulaires,
elle est doublee a l'exterieur d'une couche protectrice dont la composition varie
considerablement d'un regne a l'autre.
Les cellules vegetales et les bacteries possedent une couche protectrice continue
epaisse, autour de toutes les cellules. Cette couche est appelee la paroi. Sa composition et sa
structure sont tres diIIerentes chez les vegetaux (polysaccharides) et chez les bacteries
(peptidoglycans). Certains protistes et les mycetes possedent egalement une paroi.
Les cellules animales ne possedent pas de paroi. La membrane plasmique de certaines
cellules n'est separee du milieu extracellulaire ou de la cellule voisine que par le glycocalyx,
cette mince couche de sucres lies de Iaon covalente aux lipides et proteines membranaires.
Les cellules qui bordent les cavites et les vaisseaux (epithelium) sont directement accolees les
unes aux autres. Un gel appele matrice extracellulaire collent entre elles les cellules a
l'interieur des tissus. Cette matrice extracellulaire est composees de glycoproteines
(collagene) et de proteoglycans (polysaccharides couples a des proteines).
La structure de la matrice extracellulaire autorise les cellules animales a migrer au
sein de l'organisme, ce qui est exclus dans les tres vivants dotes de parois rigides, qui
emprisonnent les cellules.

LA PAROI VEGETALE

La paroi primaire

Quand une cellule vegetale se divise, les deux nouvelles cellules sont d'abord separees
par un Iine couche de pectine (polyholoside) denommee lamelle mitoyenne. Puis le
cytoplasme de ces cellules contigus synthetise rapidement, chacune pour son propre compte,
66
une mince pellicule de cellulose qui se depose sur la lamelle mitoyenne. L'ensemble de cette
triple couche est denomme paroi primaire.
Lorsque la cellule grandit, la paroi primaire subit un etirement considerable. La
rupture est evitee car le cytoplasme synthetise de nouvelles molecules qui s'incorporent a la
paroi existante. En outre, au cours de l'etirement, la plasticite de la paroi est Iavorisee par une
hormone denommee auxine.
La structure de la paroi ressemble a celle d'un plastique arme: des Iibrilles de cellulose
sont enrobees dans une matrice amorphe.
L'armature est Iormee de cellulose. La cellulose est un polymere diIIicilement
hydrolysable pouvant contenir jusqu'a plusieurs dizaines de milliers de glucoses lies en 1-
4, ce qui, contrairement a l'amidon, lui donne une Iorme en ruban plat. Plusieurs molecules
de cellulose s'associent lateralement par de multiples ponts hydrogene pour Iormer des
microIibrilles. La cellulose est synthetisee au niveau du plasmalemme et se depose en un
Ieutrage lche, non ordonne, parallelement a la surIace de la cellule.
La matrice amorphe, qui "colle" le tout, est composee de pectines, polymeres en
zigzag, d'hemicelluloses, polymeres ramiIies de glucides de nature variable et de proteo-
glucanes. Ces elements sont synthetises dans le cytoplasme et deverses a l'exterieur par les
vesicules golgiennes. Ces polymeres sont assez Iacilement hydrolysables.

La paroi secondaire

Lorsque la cellule a atteint sa taille deIinitive, le cytoplasme des cellules de certains
tissus elabore de nouvelles molecules de cellulose qui se deposent en couches successives sur
chaque Iace de la paroi primaire (phenomene d'apposition). L'ensemble de ces couches
constitue la paroi secondaire. Son epaisseur est tres variable et peut mme remplir la quasi
totalite de la cavite cellulaire.
Chaque couche est Iormee d'un reseau de Iibrilles de cellulose disposees parallelement
a la surIace de la cellule et parallelement entre elles dans une mme couche. Mais d'une
couche a l'autre, l'orientation est diIIerente, ce qui donne a l'ensemble de la paroi secondaire
l'aspect et la solidite du contre-plaque tout en lui gardant une certaine elasticite.

Les modifications secondaires de la paroi cellulaire

La consolidation des parois
Les parois des cellules specialisees dans le soutien (Iibres, sclerites...) vont s'impregner de
lignine. La lignine est un polymere (polyphenols) reticule. Elle est inextensible et
pratiquement non hydrolysable. La ligniIication commence aux endroits les plus Iragiles,
c'est-a-dire aux angles des cellules, au niveau de la couche pectique, puis se propage a
67
l'ensemble de la paroi primaire, puis des parois secondaires contigus. Elle solidarise
l'ensemble des cellules ligniIiees en un bloc solide qui devient du bois.
Certaines parois vont s'impregner de silice ou de calcaire (SiO
2
ou CaCO
3
) surtout au
niveau de l'epiderme (Iougeres).

L'impermabilisation des parois
La cutine, polymere hydrophobe en reseau, chimiquement proche des lipides, impregne la
paroi externe des epidermes, les rend plus ou moins impermeables selon sa densite et
s'oppose ainsi a une trop grande deperdition d'eau par la plante ainsi qu'aux agresseurs
vehicules par le vent (poussieres abrasives, microorganismes).
La cire, Iormee d'esters d'alcools et d'acides a poids moleculaire eleve, Iorme une
couche impermeable s'appliquant sur l'epiderme, cutinise ou non (ex. : la "peau" de certains
Iruits, les Ieuilles de plantes "grasses").
La suberine, substance proche de la cutine, se depose a l'interieur des parois et
impermeabilise l'endoderme des racines et les tissus protecteurs secondaires (liege).

La dissociation des parois
Dans certaines circonstances (chute des Ieuilles, maturation des Iruits), les composes
hydrolysables de la matrice (pectines et hemicelluloses) peuvent tre depolymerises
enzymatiquement. Les cellules deviennent alors partiellement ou totalement libres les unes
par rapport aux autres. C'est entre autres ce que l'on observe dans un Iruit "juteux".

Les roles de la paroi

Les vegetaux ayant opte pour une strategie evolutive extensive, le rle de la paroi est
d'abord un rle de soutien : assurer la rigidite de l'ensemble de la structure. La paroi
secondaire repond deja en partie a cet objectiI. D'autres modiIications secondaires
(ligniIication, mineralisation) vont accrotre cette eIIicacite.
Le second rle essentiel de la paroi vegetale est la protection, specialement pour les
parois externes des cellules epidermiques. La aussi des modiIications secondaires (imper-
meabilisation) vont realiser cet objectiI.
Mais a l'interieur d'un tissu, le volume compris entre les membranes plasmiques de
deux cellules voisines, qui contient la paroi cellulaire, a encore d'autres rles. Il contient
beaucoup d'eau, jusque 70. Il est donc le lieu de transit de nombreuses molecules, dont les
sels mineraux, les glucides, les hormones et certaines molecules de deIense. La paroi d'une
cellule ressemble donc plus a un buvard ou un essuie-tout qu'a une Ieuille de papier glace.



68
Les espaces intercellulaires

Dans un tissu vegetal jeune toutes les cellules sont bien accolees les unes aux autres et
ne laissent entre elles aucun espace libre. Plus tard, au cours de l'accroissement cellulaire, la
pression vacuolaire interne tend a arrondir les angles des cellules. La lamelle mitoyenne
pectique est hydrolysee et la paroi primaire propre a chaque cellule s'arrondit aux angles des
cellules, laissant un espace libre intercellulaire denomme mat. Les lacunes sont des cavites
intercellulaires plus grandes que les meats et proviennent de la conIluence de deux ou
plusieurs meats contigus ou de la destruction, de la lyse, de cellules au sein d'un tissu. Les
lacunes et les meats Iorment un reseau continu, intercellulaire et constituent l'atmosphere
interne de la plante. C'est par eux que circulent les gaz (O
2
,CO
2
,N
2
) dans la plante.

7. LES COMMUNICATIONS ENTRE CELLULES


Les communications entre cellules vgtales :
ponctuations et plasmodesmes

Les couches secondaires de cellulose ne se deposent pas uniIormement sur les parois
primaires. Elles y dessinent parIois des motiIs precis (vaisseaux anneles, spirales,
collenchyme angulaire, etc...).
De plus, mme quand l'epaississement semble continu, on constate que les parois
cellulaires sont, en realite, percees de petits oriIices denommes ponctuations. Celles-ci
proviennent de ce que les couches successives d'apposition ont toutes respecte certaines
plages, Iormant ainsi, vues de proIil, de petits canaux qui debouchent dans la cavite cellulaire
mais qui apparaissent Iermes au niveau de la paroi primaire. Vus de Iace, ces canaux
apparaissent comme des petits points, d'ou leur nom de ponctuations.
Generalement, les ponctuations sont doubles. L'apposition des couches secondaires
dans deux cellules contigus se deroule en respectant les mmes plages de sorte que les
cavites cellulaires ne sont separees en ces endroits que par la paroi primaire commune, de tres
Iaible epaisseur.
Au Iond de chaque ponctuation, la paroi primaire est percee d'une multitude de canalicules
tres Iins denommes plasmodesmes. Ceux-ci sont des manchons cylindriques limites par la
membrane cellulaire des deux cellules contigus. Dans le lumen etroit de chaque canalicule
passent un ou plusieurs Iilaments tres Iins qui sont en contact avec les diverticules du RE. Il y
a donc continuite de la membrane plasmique et du RE de cellule a cellule. Ces observations
sont importantes car les tissus de plantes superieures ne constituent plus alors un ensemble de
cellules independantes et autonomes, mais bien une association de cellules communiquant
entre elles.
69

8. LA DIVISION CELLULAIRE


L'axiome de VIRCHOW (1845) "Omnis cellula e cellula" ou "toute cellule provient
d'une cellule" est toujours considere comme valable. Tout organisme pluricellulaire est issu
de divisions repetees d'une seule cellule initiale : la cellule-oeuI. Chaque division doit assurer
la repartition reguliere de tous les constituants cellulaires et le compartimentage de la cellule.

Toute cellule suit donc un cycle au cours duquel on trouve les phases suivantes, quel
que soit l'tre vivant concerne:
1) le doublement des constituants cellulaires. Il se deroule pendant l'interphase;
2) la division du noyau en deux noyaux-Iils : c'est la mitose (du grec mitosis Iilament)
ou caryocinse;
3) la division de la cellule en deux cellules-Iilles : c'est la cytocinse.
Le mecanisme de division cellulaire est tres semblable chez tous les eucaryotes. Nous
verrons plus loin les quelques diIIerences existant entre les regnes. Le materiel le plus
Iavorable pour l'etude de la mitose, (mitose somatique), est la pointe de jeunes racines de
plantes en croissance, ou les divisions nucleaires et cellulaires sont nombreuses et les noyaux
de grande taille. Les cellules somatiques Iorment l'ensemble des cellules de l'organisme (le
soma), a l'exclusion des cellules sexuelles ou cellules germinales (le germen).

La cellule-oeuI ou zygote provient de la Iecondation, c'est-a-dire de la Iusion des deux
cellules speciales appelees gametes. Si chaque gamete contient n molecules d'ADN
correspondant aux chromosomes, la garniture chromosomique du noyau du zygote est donc
constituee d'un nombre diplode (2n) de chromosomes, dont la moitie (n) provient du parent
paternel et l'autre moitie du parent maternel (au moment de la Iecondation).
Hormis les chromosomes sexuels, les chromosomes provenant du pere et ceux
provenant de la mere sont morphologiquement identiques deux a deux et Iorment des paires
de chromosomes homologues. Nous reviendrons sur ces notions.
Les cellules diplodes humaines possedent environ 1,8 m d'ADN reparti en 46
morceaux, correspondant aux 46 chromosomes. Cet ADN est contenu dans le noyau dont le
diametre est souvent inIerieur a 10 m. Apres duplication, c'est 3,6 m d'ADN qui sont dans le
noyau, et qu'il Iaudra repartir en deux heritages egaux, sans Iaire de noud ni rien casser ! La
cle de la reussite de cet exploit par la cellule en division reside dans le compactage des
molecules d'ADN dupliquees en chromosomes qui sont reduits a quelques micrometres de
longueur lors de la mitose.
Le deroulement du cycle cellulaire s'opere de Iaon continue. Sa duree est tres
variable: de moins d'une heure (jeunes embryons de ttards) a plus d'un an (Ioie d'homme)
70
mais oscille generalement autour d'une journee. La mitose dure generalement de 1 a 2 heures
et c'est la duree tres variable de l'interphase qui determine si le tissu est Iort actiI ou au repos.


8.1. L'INTERPHASE

Les cytologistes ont longtemps cru que l'interphase etait une periode de repos parce
qu'ils n'y decelaient aucune modiIication importante au microscope. En Iait, dans la vie d'une
cellule, l'interphase constitue la periode la plus Ieconde. C'est durant cette periode que la
cellule se Iabrique! Elle double le nombre de ses constituants et surtout elle dedouble le stock
d'inIormation (ADN) dont elle dispose. Le noyau, soit disant en etat de repos, est le lieu d'une
activite metabolique intense; le cytoplasme possede egalement une activite biochimique
maximale. Durant l'interphase, le noyau augmente de taille.

L'interphase se decompose en trois phases denommees G1, S, G2.

1 la phase G1 ("gap" hiatus) a une duree variable selon le type de cellule; elle est de
courte duree chez les mammiIeres (de 4 a 10 heures) mais encore plus raccourcie, voire
nulle chez les cellules cancereuses. Durant cette phase la quantite d'ADN reste constante.
La synthese d'ARNm se realise a partir d'euchromatine et permet une intense synthese
des proteines cellulaires.

2 la phase S a une duree constante de 5 a 8 heures. On assiste a la duplication de la
molecule d'ADN. La quantite d'ADN double. La synthese d'ARNm se poursuit.

3 la phase G2 commence des que la duplication de l'ADN est terminee et dure aussi de
5 a 8 heures. La quantite d'ADN est double de celle observee en G1. La synthese
d'ARNm se poursuit. Dans les cellules animales, le centrosome (constitue de deux
centrioles) est duplique.
Certains agents antimitotiques, tels que les antimetaboliques, les agents alkylants,
certains colorants (proIlavine) peuvent bloquer les cellules en phase G2 .

Par rapport a l'interphase, l'ensemble de la caryocinese ne constitue en Iait "que" le
partage et la repartition en deux lots identiques de l'inIormation contenue dans le noyau.
Si l'on reserve le terme interphase a la periode qui s'ecoule entre deux mitoses successives, on
parle de noyau "au repos" ou "quiescent" quand celui-ci n'est destine qu'a se diviser beaucoup
plus tardivement, voire plus du tout. On parle parIois de phase G0 pour les cellules qui ont
arrte de se diviser.

71
8.2. LA REPLICATION DE L'ADN

Pour qu'un individu puisse se developper, il est indispensable que chaque cellule
possede le stock complet et intact des inIormations. L'ADN des chromosomes est porteur de
ces inIormations. Nous en verrons la demonstration en Genetique. Chaque molecule d'ADN
constitue une molecule codee dans laquelle la succession des bases possede un sens bien
precis et univoque. Toute variation dans l'ordre des nucleotides produit une inIormation
diIIerente.
Pour qu'un individu transmette, depuis l'oeuI Ieconde jusqu'aux cellules
reproductrices, l'ensemble des caracteres qu'il a reu de ses parents, il Iaut qu'a chaque
generation cellulaire, chacune des deux cellules Iilles emporte une copie conIorme de
l'inIormation (ADN) que la cellule oeuI a reu de chacun des parents lors de la Iecondation.
Le mecanisme de l'autoreproduction de l'ADN se deroule de la maniere suivante (il
avait deja ete suggere par WATSON et CRICK en 1953) :
Dans un premier stade, il y a rupture des ponts hydrogene liant les paires de bases qui
Iorment les barreaux de l'echelle, ce qui provoque la separation des deux demi echelles.
Dans le deuxieme stade, chaque demi echelle sert de matrice, de moule pour reconstituer la
demi echelle complementaire a partir des desoxynucleotides libres presents dans le noyau
(dATP, dGTP, dCTP, dTTP) et d'enzymes appelees ADN-polymerases. Ceci est possible
grce a la complementarite des couples A-T et C-G. L'ADN-polymerase utilise des
desoxynucleotides triphosphates, et non des desoxynucleotides monophosphates. La rupture
de deux liaisons phosphates Iournit l'energie necessaire a la Iormation de la liaison entre
desoxynucleotides dans la molecule d'ADN. Notons que l'hydrolyse de l'ADN ne Iournit que
des desoxynucleotides monophosphates.

La duplication est qualiIiee de "semi-conservative" parce que chaque nouvelle
molecule d'ADN est Iormee d'un montant de l'ancienne molecule et d'un montant
nouvellement synthetise.
Ce mecanisme a ete prouve experimentalement (TALOR, 1957), grce a l'emploi de
traceurs radioactiIs et a la technique de l'histoautoradiographie.
TALOR Iit crotre des radicelles de lis (Bellavalia romana) dans une solution
nutritive normale contenant de la desoxythymidine (desoxynucleoside precurseur que l'on ne
retrouve que dans l'ADN). Il les transIere alors dans un milieu contenant de la
desoxythymidine radioactive (marquee par le tritium radioactiI
3
H), ou elles continuent leur
croissance pendant un cycle cellulaire. Apres avoir lave les racines, il les replace dans un
milieu normal. Au cours de l'experience, il preleve a intervalles reguliers des pointes de
racines dans lesquelles il execute des coupes transversales.
72
L'observation directe des molecules d'ADN elles-mmes est impossible. Ce sont les
chromosomes en metaphase qui sont evidemment observes .

Dans le premier milieu normal, toutes les cellules contiennent des chromosomes
normaux.
Dans le milieu marque, on constate apres une generation cellulaire, que les deux
chromatides de tous les chromosomes de chaque cellule sont radioactives.
Replacees dans le milieu normal, apres une nouvelle generation cellulaire, on constate
en metaphase, que chaque chromosome possede une chromatide marquee et une qui ne l'est
pas.

L'explication de ces observations est la suivante:
Dans le milieu normal, la duplication de la molecule d'ADN donne deux molecules
identiques et "normales", puisque les deux demi echelles sont synthetisees a partir de
nucleotides libres, "normaux". Les deux chromatides de chaque chromosome sont donc
normales.
Dans le milieu marque, chaque nouvelle demi echelle complementaire est radioactive
puisqu'elle contient des nucleotides radioactiIs. Comme il est tout a Iait impossible de
distinguer les deux montants de l'echelle (l'ancien et le nouveau), chaque molecule d'ADN
donc les deux chromatides de chaque chromosome apparaissent radioactives.
En milieu normal enIin, la molecule radioactive, en provenance du milieu precedent
se duplique et, de ses deux demi echelles, l'une est radioactive et l'autre pas. Comme les deux
demi echelles complementaires synthetisees ne contiennent pas de thymine tritiee, une des
nouvelles molecules d'ADN demeure "marquee", l'autre pas. Cela revient a observer que pour
chacun des chromosomes, une chromatide est marquee, l'autre pas.
En Iait, il y avait trois hypotheses explicatives de la duplication: la duplication
conservative dans laquelle l'ancienne molecule d'ADN est conservee intacte tandis que la
nouvelle chromatide est construire entierement, l'hypothese semi-conservative expliquee plus
haut et l'hypothese non conservative ou dispersive selon laquelle l'ancien ADN etait
completement demonte et les morceaux reutilises pour Iabriquer deux nouvelles molecules
d'ADN. L'intert methodologique de l' experience de TALOR residait dans le Iait que les 3
hypotheses auraient conduit a trois observations diIIerentes sur les chromosomes et
permettait d'en deduire ce qui se passait dans la molecule d'ADN sans conIusion possible.
Ces resultats ont ete conIirmes l'annee suivante par MESELSON et STAHL par
marquage a l'azote lourd
15
N de l'ADN de bacteries.




73
Comment se droule la duplication ?

On a d'abord admis que le phenomene de duplication debutait a une des extremites et
se propageait jusqu'a l'autre extremite, a la maniere d'une Iermeture eclair aux crochets
dissymetriques. Cette hypothese a ete vite abandonnee car incompatible avec la vitesse
mesuree du phenomene.
Les mecanismes ont ete decouverts chez les bacteries, puis conIirmes chez les tres
superieurs.

La duplication s'eIIectue simultanement en de nombreux points appeles rplicons (on
estime leur nombre a 20 000 chez les mammiIeres!). En outre, la duplication est
bidirectionnelle: elle progresse simultanement dans les deux sens sur chaque brin de l'ADN
vers les replicons voisins.
Le premier point a ete demontre en plaant les cellules en phase S dans un milieu
contenant de la thymidine tritiee pendant un court instant: chaque chromosome apparat
marque en de nombreux sites qui sont autant de replicons. La longueur des segments
chromosomiques marques permet d'estimer la vitesse de la duplication a + 1mminute (chez
les bacteries: 20 mmin). Le second point est demontre en eIIectuant deux marquages
successiIs, l'un avec une Iaible concentration, l'autre avec une Iorte concentration en
thymidine tritiee. Sur une autoradiographie, des images montrent que, de part et d'autre du
replicon, la chane d'ADN est sur une certaine longueur, d'abord Iaiblement radioactive, puis
Iortement radioactive; ce qui correspond aux deux marquages successiIs.

Cette duplication bidirectionnelle observee au microscope est en contradiction avec
les donnees biochimiques. En eIIet, les deux montants de l'ADN sont antiparalleles et les
ADN polymerases travaillent exclusivement dans un seul sens (5'--3'). L'ADN polymerase
ne peut donc pas travailler simultanement dans les deux sens sur la molecule d'ADN. Les
chercheurs ont pu montrer qu'eIIectivement sur un brin de l'ADN (le brin precoce), elle
s'eIIectuait en continu, tandis que sur le brin oppose (le brin tardiI) elle s'eIIectuait de
maniere discontinue par une serie de bonds en avant suivis d'une marche arriere pour recoller
au morceau deja synthetise. Ces Iragments sont appeles Iragments d'OKASAKI.
L'ADN-polymerase n'est pas capable de commencer un nouveau brin, elle ne peut
qu'allonger un brin existant. Chaque brin d'ADN sera des lors commence par une autre
enzyme, une ARN-polymerase, qui synthetise un court morceau d'ARN qui sert d'amorce
pour l'ADN polymerase. Ce morceau d'ARN sera elimine et remplace par de l'ADN
ulterieurement.



74
On peut donc resumer les proprietes de l'ADN polymerase comme suit:
1 Elle synthetise toujours un brin d'ADN dans le sens 5' vers 3'
2 Elle utilise comme substrat des desoxynuleotides triphosphates, qui Iournissent a la
Iois les briques de bases pour la construction de l'ADN (nucleotides monophosphates) et
l'energie necessaire.
3 Elle ne synthetise un brin d'ADN qu'en presence d'un modele : le brin matrice.
4 Elle ne peut commencer un nouveau brin et a donc besoin d'une amorce.
Pour realiser une reaction de synthese d'ADN in vitro, au laboratoire, il Iaudra donc ajouter
dans le tube a essai: l'enzyme, des dNTP, un brin matrice monocatenaire (souvent obtenu par
chauIIage a 95C d'ADN bicatenaire), et une amorce. L'enzyme a en outre besoin d'un
tampon particulier (pH neutre) et d'ions Mg

(associes aux nucleotides).



Quand la rplication a-t-elle lieu?

C'est au cours de la phase S de l'interphase que s'opere la duplication. Tous les
replicons ne Ionctionnent pas simultanement, mais par vagues successives, en correlation
avec les bandes colorees des chromosomes. En Iin d'interphase (G2), la quantite d'ADN est
double de celle observee lors de la phase G1. Les deux molecules d'ADN identiques restent
associees grce a des proteines appelees cohesines. La quantite d'ADN reste constante durant
la prophase et la metaphase et est reduite de moitie lors de la dissociation des chromatides
(anaphase).
La quantite totale d'ADN demeure donc constante d'une mitose a l'autre, tout en
variant cycliquement du simple au double a chaque mitose.

8.3. LA MITOSE

La mitose (phase M du cycle cellulaire), bien que se deroulant aussi de Iaon
continue, est generalement divisee en 4 phases pour la commodite des descriptions
cytologiques: la PROPHASE (30-45'), la METAPHASE (5-10'), l'ANAPHASE (15-20') et la
TELOPHASE (20-35') au total de 70 a 110 minutes. Son deroulement est tres similaire chez
tous les eucaryotes.

8.3.1 LA PROPHASE

La prophase debute par convention au moment ou les chromosomes deviennent
visibles. Les phenomenes principaux qui s'y deroulent sont :
- la Iormation et le clivage chromosomique
- la Iormation du Iuseau achromatique
- la disparition des nucleoles
75
- la desorganisation de l'enveloppe nucleaire.
La formation et le clivage des chromosomes

Ce phenomene condense les longues molecules de nucleoproteine a ADN en des
ensembles compacts, Iacilement transportables et peu Iragiles. En plusieurs etapes
successives, chaque Iilament de chromatine va se raccourcir et s'epaissir jusqu'a une
condensation maximale: il prend alors le nom de chromosome.
Chaque chromosome apparat double, clive dans le sens longitudinal en deux
chromatides identiques qui sont reunies en un point peu colore, le centromre. Celui-ci peut
tre en position centrale, subterminale ou terminale sur le chromosome. Au niveau du
centromere, sur chaque chromatide, se trouve un kintochore (ou cinetochore), amas
structure de proteines qui sera le moteur du mouvement des chromosomes. Les chromatides
restent associees par les cohesines.
A la Iin de la prophase, chaque chromosome est donc Iorme d'une paire de
chromatides reunies au niveau du centromere. Ces deux chromatides sont le resultat de la
replication de l'ADN, et sont donc strictement identiques, non seulement morphologiquement
mais aussi au niveau de leur sequence.
Le clivage ne devient visible qu'en Iin de prophase mais il existe deja en phase G2 de
l'interphase. A ce stade, il est masque par suite de l'etirement et de l'enchevtrement de la
chromatine.

La formation du fuseau mitotique

Simultanement, le cytoplasme perinucleaire se modiIie en une zone claire qui
s'accrot peu a peu aux deux ples du Iutur Iuseau : ce sont les calottes polaires. Dans les
cellules animales, ces calottes polaires sont centrees sur les centrosomes.
Les calottes polaires s'allongent en cnes. Elles rejoignent les ples opposes de la
cellule tandis que leur bases se conIondent.
Il se Iorme un fuseau mitotique, parIois aussi appele Iuseau achromatique (parce que
peu colorable par les colorants de la chromatine) de consistance plus ou moins gelatineuse et
relativement solide. A ce stade, les deux ples de la cellule sont reunis par un Iaisceau de 500
a 600 microtubules, les fibres fusoriales. Il en existe trois types:
- les fibres continues qui sont constituees de deux microtubules partant de chaque ple
(centrosome) et se rejoignant au centre. Elles maintiennent la distance entre les deux ples.
- les fibres chromosomiques qui relient chacun des 2 kinetochores de chaque chromosome
au ple qui lui Iait Iace.
- les Iibres de l'aster, situe autour de chaque ple, et qui ancre celui-ci dans le cytoplasme.


76

La disparition des nucloles et de l'enveloppe nuclaire

Au cours de la prophase, le ou les nucleoles se Iragmentent et disparaissent. Au Iur et
a mesure que leur ADN constitutiI s'integre aux chromosomes en Iormation, la synthese
d'ARNr s'arrte, donc la zone Iibrillaire disparat. Ensuite, les derniers ARNr Iormes
s'associent aux proteines pour Iormer les preribosomes. Ceux-ci se terminent puis migrent
vers le cytoplasme. Il ne reste donc plus rien des constituants du nucleole.

La disparition de la membrane nucleaire a lieu pendant la Iormation du Iuseau. Elle se
Iragmente en portions relativement grandes qu'il n'est plus possible de distinguer du RE
avoisinant. La lamina et les complexes des pores se desagregent. Certains auteurs appellent
promtaphase, la periode qui separe la disparition de la membrane nucleaire de la metaphase
proprement dite.

8.3.2. LA METAPHASE

La metaphase est caracterisee par la mise en place, a l'equateur du Iuseau, des
chromosomes clives longitudinalement.
Les chromosomes ont atteint le degre de condensation maximale. Au sens strict, le
chromosome, c'est ce que l'on observe uniquement a ce stade la. Au sens plus large, le
chromosome, c'est le paquet de chromatine correspondant a ce chromosome, quelle que soit
la phase.
Chaque centromere est relie aux deux ples par des microtubules. Des equilibres
dynamiques de polymerisation reversible dans ces structures amenent le centromere juste a
mi-chemin entre les ples.
Tous les centromeres agissent de la mme Iaon. Ils seront donc tous places au mme
niveau, sur le plan equatorial du Iuseau.
Les chromatides sont bien separees sur toute leur longueur, sauI au centromere. Selon
l'espace disponible, elles se disposent a plat au mme niveau que le centromere (plaque
quatoriale) ou bien leurs bras s'orientent au hasard vers un des deux ples. C'est a ce stade
que l'etude des caracteristiques morphologiques des chromosomes est la plus aisee (voir plus
loin, le caryotype).

8.3.3. L'ANAPHASE

Au cours de cette phase a lieu :
1 la dissociation des chromatides,
2 la migration des chromatides vers chaque ple,
77
3 le tassement des chromatides en amas symetriques aux ples (tassement polaire).

1 La dissociation des chromatides commence brutalement au niveau du centromere. Ce
processus debute en mme temps pour tous les chromosomes.
On pense que le centromere est egalement dedouble comme le reste du chromosome en
interphase mais que les chromatides restaient unies par un phenomene d'agglutination de
la chromatine (grce a leurs proteines).
A partir de ce moment, chaque chromatide est autonome, bien individualisee et devient
un chromosome-fils.

2 La migration des chromosomes se realise de Iaon synchrone : ils montent tous en mme
temps au ple correspondant du Iuseau achromatique. La vitesse d'ascension polaire est
rapide (a l'echelle de la cellule) : de l'ordre de 5 a 10 m par minute. Les centromeres
sont generalement bien alignes et orientes vers les ples. Les chromosomes atteignent
celui-ci et s'y groupent en deux amas symetriques : c'est le tassement polaire. Ce
phenomene dispose les bras des chromosomes en cordons sensiblement paralleles, tasses
les uns contre les autres tandis que les extremites sont dirigees vers l'ancienne plaque
equatoriale. Chacune des deux chromatides de chaque chromosome etant strictement
identique a l'autre et chacune partant vers un ple diIIerent, les deux amas de
chromosomes arrivant a chaque ple seront aussi strictement identiques.

Le mecanisme d'attraction des chromosomes vers les ples a Iait l'objet de
nombreuses etudes recentes. Chez les animaux, deux phenomenes diIIerents interviennent
pour separer les chromatides: une depolymerisation et donc un raccourcissement des Iibres
chromosomiques au niveau du kinetochore ainsi qu'un allongement des Iibres continues.
Chez les vegetaux, le phenomene a ete moins etudie, mais l'allongement du Iuseau n'est pas
possible a cause de la paroi cellulaire.
Sous l'action de certaines substances cytotoxiques (colchicine, vincristine.), les
chromosomes ne se separent pas (donnant un noyau de restitution 4n) ou le Iont de maniere
deIectueuse ou se Iragmentent, ce qui engendre des cellules-Iilles anormales (cI. mutations).

8.3.4. LA TELOPHASE

La telophase se caracterise par la reIormation de deux noyaux-Iils a partir des deux
parties qui se sont separees durant l'anaphase.
Chacun des lots identiques de chromosomes Iorme une masse conIuse au ple du
Iuseau (suite au tassement polaire), leurs extremites toujours dirigees vers l'equateur du
Iuseau. Les chromosomes subissent alors les transIormations inverses de celles observees en
prophase: ils se despiralisent progressivement en s'etirant, ce qui entrane la Iormation d'un
78
nouveau reseau chromatique. Durant ces transIormations, les nucleoles prennent naissance au
voisinage des zones nucleolaires des chromosomes organisateurs de nucleoles (ce sont les
zones codantes de l'ARNr). Le nombre de chromosomes organisateurs de nucleoles d'un
noyau somatique varie suivant les especes: le MAS en possede 2, l'Homme 10
(chromosomes 13,14,15,21,22).
Une nouvelle enveloppe nucleaire se reIorme a partir du RE, des debris de la lamina
et des complexes des pores du noyau initial.
Le Iuseau intervient dans la cytocinese, puis les microtubules se repartissent dans le
cytoplasme.

8.3.5. LES VARIANTES DE LA MITOSE

Quelques diIIerences existent dans le processus de mitose dans les diIIerents regnes.
Les animaux et certains thallophytes, mais pas les vegetaux superieurs, presentent a
proximite immediate de leur noyau interphasique, un petit granule de structure complexe
entoure d'une areole claire, denomme centrosome. Au centre de celui-ci, on observe deux
structures tubulaires identiques disposees a angle droit (longueur 500 nm, 150 nm) : les
centrioles. Les deux centrioles Iorment le diplosome.
Chaque centriole est constitue de 9 Iaisceaux de 3 microtubules de 25 nm de ,
adjacents, disposes concentriquement.
Chacun des centrioles se duplique durant l'interphase. Au debut de la prophase, les
deux couples, centriole mere-centriole Iils se separent et migrent en deux points opposes du
noyau et y constituent les deux centrosomes. Chacun apparat alors entoure d'un systeme de
stries rayonnantes de cytoplasme : les asters.
Rappelons que chez les Procaryotes (archees, algues bleues, bacteries...) la division du
materiel genetique (une seule molecule d'ADN circulaire, egalement appelee chromosome,
malgre l'absence de proteines et de condensation) se realise simplement par separation de
l'ADN apres duplication.


8.4. LA DIVISION CELLULAIRE OU CYTOCINESE

La division de la cellule en deux compartiments, la cytocinse, suit la division du
noyau ou caryocinese. Chez les vegetaux superieurs et les animaux, la cytocinese debute au
debut de la telophase. Elle se deroule diIIeremment chez les animaux et les vegetaux.

Cytocinse chez les animaux

79
Dans les cellules animales, les cellules-Iilles sont Iormees suite a un etranglement equatorial
de plus en plus prononce. Le cytosquelette joue un rle important dans cet etranglement. La
separation complete des deux cellules necessite evidemment une desorganisation du Iuseau
mitotique (Iibres continues).

Cytocinse chez les vgtaux

Du Iait de la rigidite de la paroi, un etranglement n'est pas possible chez les vegetaux. La
cytocinese se deroule selon le schema suivant :
1) Les vesicules golgiennes, emises par les dictyosomes, se disposent a l'equateur du Iuseau
achromatique. Elles sont particulierement riches en pectines, matrice amorphe de la paroi
cellulaire. Elles conIluent sauI aux endroits ou les microtubules du Iuseau traversent. Elles
Iorment ainsi la plaque cellulaire ou phragmoplaste.
2) Le phragmoplaste s'etend sur le pourtour, de maniere centriIuge, en mme temps que le
Iuseau qui s'elargit et sans sortir de celui-ci. Quand les microtubules externes du Iuseau sont
en contact avec le plasmalemme lateral, la membrane entourant le phragmoplaste Iusionne
avec lui et la cellule se trouve separee en deux compartiments par la plaque cellulaire qui
prend alors le nom de lamelle mitoyenne.
3) Chacun des cytoplasmes synthetise alors pour son propre compte, une mince couche de
cellulose qui s'applique sur la lamelle mitoyenne pectique. La triple couche pectocellulosique
constitue la paroi primaire qui separe ainsi les deux cellules-Iilles. Les divers organites se
sont repartis au hasard, d'une maniere plus ou moins equivalente entre les deux nouvelles
cellules Iormees.
Les trous dans la plaque equatoriale, par lesquels passaient les microtubules,
constituent les plasmodesmes gardant en communication les plasmalemmes et les
cytoplasmes des deux cellules. Ces cellules ne sont pas completement independantes les unes
des autres, contrairement a ce qui se passe chez les animaux.


8.5. LES CHROMOSOMES

Nous venons de voir que cycliquement, la chromatine se structure en chromosomes.
Ce sont eux qui ont attire l'attention des cytologistes qui ont decouvert la mitose. Ils peuvent
tre le mieux observes lors de la metaphase (plaque equatoriale vue de Iace). La notion de
chromosome etait donc au depart restreinte aux btonnets colores observes en mitose.
En langage scientiIique courant, on appellera egalement chromosomes les molecules
d'ADN sous Iorme de chromatine dans les cellules en phase G1 ou G0. Si on accepte cette
derniere deIinition, un chromosome sera donc constitue soit d'une seule molecule d'ADN
(phase G0G1), soit de deux molecules d'ADN identiques (phase G2, prophase et metaphase).
80
Lors de l'anaphase et de la telophase, pour eviter toute conIusion, seuls les termes
chromatides ou chromosomes-Iils seront utilises.

Leur etude montre qu'ils presentent une serie de caracteristiques propres a l'espece,
constantes dans celle-ci au point de servir de reIerence.

Morphologie, dimensions, position du centromre

1 La morphologie des chromosomes est variee: grains, btonnets, Iilaments arques. On
retrouve les mmes Iormes dans les mmes proportions dans toutes les cellules de tous
les individus d'une mme espece.
2 Leur dimension varie egalement. Les chromosomes punctiIormes mesurent quelques
dixiemes de m seulement, tandis que les chromosomes en btonnets ont une longueur
de 2 a 20 m et un de 1 a 4 m. Les chromosomes de l'homme mesurent de 1 m (les
plus petits, n21 et 22) a 10 m (le plus long, n1); ceux de lAscaris (ver parasite de
l'intestin) 20 m.
Dans toutes les mitoses de tous les individus de la mme espece, on observe toujours les
mmes categories de longueurs, la mme proportion entre les diIIerentes categories et le
mme nombre de chromosomes pour chacune des categories. Chez la Drosophile,
possedant 8 chromosomes, il y aura toujours 4 chromosomes longs, deux moyens et deux
tres courts.
3 On observe une zone d'etranglement qui prend peu la coloration de la chromatine : le
centromere. Sa position deIinit l'indice centromrique, c'est-a-dire le rapport de la
longueur du bras court du chromosome sur la longueur totale
La position du centromere peut tre:
-terminale : chromosome acrocentrique (souvent a satellite)
-submediane : chromosome submetacentrique ( submediocentrique)
-mediane : chromosome metacentrique ( mediocentrique).
ParIois un etranglement secondaire, pres de l'extremite, separe une partie terminale : le
satellite.
Dans toutes les mitoses de tous les individus de la mme espece, les mmes types
d'insertion apparaissent dans les mmes proportions et ces types sont lies a la mme
categorie de longueur chromosomique.
De mme, les chromosomes a satellites reapparatront toujours en nombre egal et pair, et
toujours lies au mme type d'insertion et au mme type de longueur.

Aombre de chromosomes

81
Toutes les cellules somatiques des vegetaux ou animaux superieurs possedent un
nombre pair et constant de chromosomes. Ces cellules possedent un nombre diplode de
chromosomes semblables 2 a 2 et que l'on represente par le symbole 2n .
Par contre, les cellules reproductrices ou cellules germinales ou gametes sont
haplodes et leur noyau ne renIerme que n chromosomes. Quoique le mme nombre diplode
de chromosomes (2n) puisse se trouver chez des individus tres diIIerents (le sapin et le lis ont
tous deux 24 chromosomes), il varie d'une espece a l'autre : oseille (8), epinard (12), mas
(20), lis (24), tabac (48), Iougere (100 et plus)...ascaris (2), drosophile (8), poule (32),
chimpanze, macaque (46), homme (46)...

On rencontre, dans certains tissus vegetaux, des noyaux possedant 4n, 6n, 8n
chromosomes. Ce sont des noyaux polyplodes. Ces noyaux apparaissent exceptionnellement
a la suite d'une non Iormation du Iuseau ou de son non Ionctionnement; les chromatides se
dissocient mais elles ne montent pas aux ples et se retrouvent a l'interieur d'une membrane
nucleaire unique. L'absence de Iuseau peut se realiser naturellement (endopolyplodie) ou tre
provoquee artiIiciellement par certains produits chimiques (agents mitoclasiques tels que la
colchicine). La polyplodie se maintient durant les mitoses suivantes. Notons que de
nombreuses especes vegetales cultivees sont polyplodes.

Chez l'homme, un nombre anormal de chromosomes, appele aneuplodie, est presque
toujours pathologique, comme la trisomie 21 (voir partie genetique). Que ce soit chez les
vegetaux ou chez les animaux, l'aneuplodie ne perturbe pas le deroulement de la mitose, qui
genere toujours des cellules Iilles possedant le mme nombre de chromosomes que la cellule
mere. Donc, un zygote trisomique 21 produira par mitose un individu dont toutes les cellules
somatiques diplodes possedent 3 chromosomes 21.

Caryotype

Ces caracteristiques permettent d'etablir pour chaque espece, un tableau precis de la
garniture chromosomique qui la caracterise. Ce caryotype est actuellement un element
important de la description des especes car il permet de distinguer deux especes voisines
conIondues sur base d'autres criteres morphologiques. Il est aussi utilise pour conIirmer le
diagnostic de maladies hereditaires dues a des anomalies chromosomiques.
Le caryotype d'une espece peut tre visualise par un idiogramme. On photographie
des chromosomes metaphasiques bien etales puis on les classe par ordre de taille decroissante
en tenant compte de leur morphologie. Des techniques de coloration speciales ("banding" des
chromosomes ou "bandes chromosomiques") permettent de localiser de Iaon tres detaillee
les parties successives des chromosomes. Ces techniques de coloration sont largement
82
utilisees en genetique medicale. De nouvelles techniques encore plus precises sont basees sur
des colorations par Iluorescence ("FISH").
Ce caryotype (idiogramme) peut tre realise pendant la grossesse, sur des cellules
presentes dans le liquide amniotique, qui sont issues de l'embryon. Il permet de determiner si
l'enIant a natre possede un caryotype normal. Ce test est utile chez les Iemmes ayant un
risque plus eleve d'avoir un enIant trisomique.

De ce qui precede, nous pouvons degager les caracteres chromosomiques constants
qui reapparaissent a chaque mitose : la longueur des chromosomes, leur nombre, l'indice
centromerique, les particularites morphologiques (satellites, bandes.) et la quantite totale
d'ADN.

Anomalies chromosomiques

Nous avons deja mentionne les aneuplodies, ou l'on observe un nombre anormal de
chromosomes morphologiquement normaux.
Les produits cytotoxiques et les radiations ionisantes (rayons U.V., rayons X, rayons
o, , ...) produisent des aberrations chromosomiques plus ou moins graves qui aboutissent a
des Iragmentations ou des associations anormales de chromosomes, creant des mutants
chromosomiques generalement deIicients ou non viables. Certaines alterations peuvent
cependant conduire a un dereglement du cycle cellulaire et a l'apparition de cellules
cancereuses, dont le caryotype est souvent anormal. Le caryotype est donc egalement utilise
dans le diagnostic du cancer.

L'infrastructure du chromosome

Les chromosomes metaphasiques sont Iormes de chromatine dans son etat le plus
condense aIin de leur permettre de se repartir sans dommage, lors de la caryocinese, en deux
exemplaires absolument identiques. Ainsi par exemple, le chromosome humain le plus long
(10m) contient environ 8 cm d'ADN, ce qui implique un Iacteur de condensation de 8000.
La transition entre l'etat deploye de la nucleoproteine Iilamenteuse (de + 30 nm de )
typique en interphase et son etat condense en chromosome metaphasique, se deroule
progressivement durant toute la prophase.
En debut de prophase, le chromosome est deja compose de deux Iilaments plus ou
moins spirales, d'epaisseur variable, qui correspondent aux deux chromatides produites en
phase S de l'interphase. Sur les chromatides, on distingue au microscope des points plus
colores: les chromomeres qui correspondent a des endroits ou la condensation a deja atteint
un stade plus avance. On y observe aussi des etranglements qui correspondent au centromere
et a l'eventuelle constriction secondaire des chromosomes a satellites.
83
La suite du processus n'etait pas comprehensible par la simple observation en
microscopie optique. Il a Iallu utiliser plusieurs techniques biochimiques et de microscopie
electronique pour comprendre. Les descriptions se basent sur des etudes Iaites sur des
chromosomes humains de cellules Hela, cellules cultivees au laboratoire a partir d'une tumeur
cancereuse :

1) Lorsqu'on extrait d'abord les histones du chromosome sans detruire la molecule d'ADN, le
chromosome apparat Iorme d'une charpente proteinique appele "core" ou "me" qui epouse
la Iorme caracteristique du chromosome en metaphase. L'me est entouree d'un halo constitue
d'un grand nombre (+2000) boucles ou "domaines" d'ADN pur. Chaque boucle part de la
charpente et s'y rattache en un point adjacent. La longueur des boucles varie de 20000 a
100000 paires de bases.
2) En eliminant ensuite l'ADN au moyen d'une nuclease (ADNase), on a pu isoler cette
charpente. Elle a la mme Iorme que celle des chromosomes intacts : dedoublement
longitudinal caracteristique des deux chromatides avec un seul pont de contact au centromere.
Elle est constituee de proteines, notamment de cohesines et de condensines.
3) EnIin, le microscope a balayage montre que la surIace des chromatides intactes est
herissee de protuberances allongees de quelque 50 nm de , denommees microconvules.
L'elimination partielle des proteines acides Iait apparatre des globules de chromatine (ADN
histones) d'environ 25 a 30 nm de .

La dimension des boucles et leur condensation ne presentent pas la mme intensite
tout au long des chromatides, ce qui explique les diverses intensites de coloration mettant en
evidence les bandes sombres et claires des chromosomes. Environ 1000 bandes ont ete
repertoriees sur les chromosomes humains. On constate aussi que les zones limites entre
bandes voisines representent une Iragilite particuliere puisque 90 des cassures realisees par
des radiations ionisantes s'y produisent.

84
Questions de reflexion .
2.1- Representez toutes les etapes de la mitose d`une cellule somatique humaine d`un patient
trisomique 21. Ne dessinez que les chromosomes 1 et 21.

2.2- A l`aide de schemas, expliquez toutes les etapes de la mitose d`une cellule cancereuse
apres que les chromosomes 1 et 2 ont subi une translocation reciproque.

2.3- Faites un schema detaille de la membrane plasmique d`une cellule humaine, en illustrant
tous ses constituants et ses contacts avec la matrice extracellulaire et le cytosquelette. Faites
egalement le schema correspondant pour une cellule vegetale.

2.4- Reprenez dans un tableau toutes les diIIerences entre les cellules animales et vegetales.

2.5- Comparez la mitochondrie au noyau du point de vue de sa Ionction, de son contenu et de
ses membranes.

2.6- En quoi l`appareil de Golgi intervient dans l`exocytose et l`endocytose ?

2.7- Combien de molecules d`ADN et de chromosomes il y a-t`il dans une cellule somatique
humaine en phase G2 ? JustiIiez.


85
1roisime Partie

PHYSIOLOGIE CELLULAIRE


Obfectifs .
- Comprendre comment Ionctionnent les enzymes
- Comprendre la base des echanges de la cellule avec le milieu exterieur
- Connatre les grandes orientations du metabolisme cellulaire
- Comprendre le mecanisme de synthese des proteines et tre capable de resoudre des
exercices de transcription et traduction.

INTRODUCTION

La premiere caracteristique des tres vivants, c'est leur organisation. C'etait le point de
vue d'ou nous avons observe les tres vivants dans la premiere partie du cours. Dans cette
troisieme partie, nous verrons comment les tres vivants mettent cette organisation a proIit
pour Ionctionner, c'est-a-dire puiser a l'exterieur l'energie et les materiaux qui leur sont
necessaires, et transIormer ceux-ci en leur propre substance. Comme auparavant, l'accent sera
mis sur les Ionctions qui sont communes a tous les tres vivants, tout en n'oubliant pas les
caracteristiques typiques des tres humains. Chaque Iois que ce sera possible, nous
montrerons les relations entre la Iorme et la Ionction.
Les deux premiers chapitres s'interessent aux reactions biologiques et a leurs
catalyseurs, les enzymes.
Ensuite nous etudierons la nutrition cellulaire: comment les materiaux penetrent-ils et
circulent-ils dans une cellule? Par extension, comment passent-ils d'un organite a un autre
dans une cellule?
Une autre partie sera consacree a la recuperation energetique. L'energie est contenue
dans les molecules absorbees par la cellule ou dans le rayonnement solaire. Sous quelle Iorme
et comment les tres vivants absorbent-ils et transIorment-ils cette energie?
Nous verrons ensuite comment ces materiaux et cette energie sont utilises pour
construire les molecules constitutives et quelles sont les diIIerentes interconnexions entre les
voies metaboliques.

86
1. LA THERMODYNAMIQUE DU VIVANT


Tous les processus biologiques, comme toutes les reaction physicochimiques, doivent
respecter les lois de la thermodynamique (voir cours de chimie et de physique). La
thermodynamique nous permet de predire la probabilite qu'un processus (par exemple une
reaction biochimique) se produise, en analysant les transIormations d'energie qui y sont
associees.

1.1 CONSERJATION DE LENERGIE

La premiere loi de la thermodynamique nous dit que l'energie n'est ni creee, ni detruite
(sauI dans un reacteur thermonucleaire, non applicable au vivant), mais seulement
transIormee. Les types d'energie qui interessent le vivant sont: l'energie lumineuse (qui
permet la photosynthese), l'energie chimique (contenue par exemple dans des molecules
comme le glucose ou les graisses), l'energie cinetique (associees aux mouvements) et
l'energie thermique (chaleur).

1.2 LENTROPIE

Le seconde loi de la thermodynamique dit que toute transIormation d'energie doit
s'accompagner d'une augmentation de l'entropie de l'univers. L'entropie est un concept
physicochimique qui s'apparente au "desordre". La production d'un gaz a partir d'un liquide et
la production de chaleur sont des processus qui augmentent generalement l'entropie.

Les tres vivants en se developpant gardent et augmentent mme leur organisation
interne et, leur structure. Ils sont donc tres "ordonnes". Ceci peut sembler incompatible avec
la seconde loi de la thermodynamique. En Iait, si on considere non pas l'tre vivant isole mais
l'univers dans lequel il vit, on observe que l'entropie augmente: l'tre vivant garde certes son
organisation tout au long de sa vie, mais transIorme constamment des molecules de haut
contenu energetique en chaleur et en dechets liberes dans l'environnement. On dit que ce se
sont des systemes thermodynamiquement ouverts, c'est-a-dire des systemes qui echangent de
l'energie avec l'exterieur.

1.3 ENERGIE LIBRE

L'energie libre est l'energie utilisable par la cellule pour realiser un travail (synthese
chimique, mouvement.).
87
Elle peut tre calculee par la Iormule suivante, ou G represente l'energie libre, H l'enthalpie
(energie chimique) , S l'entropie et T la temperature.

G H - T.S
La probabilite qu'une reaction se realise d'un point de vue thermodynamique est liee au
changement d'energie G au cours de la reaction.
- Si G diminue, la reaction est tres Iavorable d'un point de vue thermodynamique.
- Si G est proche de zero, la reaction sera equilibree.
- Si G augmente, la reaction sera deIavorable.

De nombreuses reactions biologiques, par exemple la synthese des proteines a partir
d'acides amines, s'accompagnent d'une augmentation de l'energie libre. Ces reactions sont
cependant possibles en les couplant avec une reaction qui libere beaucoup d'energie, de Iaon
a ce que le bilan global soit Iavorable. L'energie est souvent Iournie par l'hydrolyse d'un
nucleotide triphosphate, l'ATP, en nucleotide di- ou mono-phosphate, l'ADP ou l'AMP.
L'hydrolyse d'une liaison phosphate libere environ 7,3 kilocalories par mole d'ATP (soit 30,5
kJmol):

ATP H
2
O ADP Pi AG -7.3 kcalmol (Pi : phosphate)

L'hydrolyse des deux liaisons phosphates libere a peu pres le double d'energie et de
l'AMP, qui peut tre retranIorme en ADP par la reaction suivante:

AMP ATP 2 ADP

La production d'ATP a partir d'ADP est couplee a la degradation des composes
cellulaires, notamment du glucose, des acides gras et des acides amines. On appelle
l'ensemble des reactions de degradation des composes cellulaires le catabolisme. L'ensemble
des reactions de synthese des composes cellulaires est appele anabolisme. L'anabolisme
consomme des quantites importantes d'energie sous Iorme d'ATP.

Le lieu principal de production d'ATP a partir d'ADP est la mitochondrie, en
particulier au niveau des Iacteurs de couplage de sa membrane interne (voir plus loin). La
mitochondrie contient egalement plusieurs voies cataboliques essentielles, comme la -
oxydation des acides gras et le cycle de Krebs. Nous verrons cependant qu'une petite quantite
d'ATP peut egalement tre Iabriquee dans le cytoplasme.

Ces regles thermodynamiques s'appliquent non seulement aux reaction biochimiques
mais aussi aux autres processus cellulaires, comme le transport de molecules dans la cellule,
88
ou les mouvements. Dans ces deux cas, l'ATP pourra aussi Iournir l'energie necessaire.
Certaines reactions utiliseront d'autres nucleotides comme source d'energie (UTP, CTP,
GTP). Dans le cas des mouvements, c'est souvent du GTP qui est hydrolyse par la cellule.
L'UTP est quant a lui utilise pour la synthese des polysaccharides, comme le glycogene et le
CTP dans la synthese des lipides. Les diIIerents nucleotides sont des sources d'energie
interconvertibles grce aux reactions suivantes:

ATP GDP ADP GTP
ATP UDP ADP UTP
ATP CDP ADP CTP

La seule reaction endothermique qui se deroule sans l'apport d'energie en provenance
du catabolisme est la photosynthese. Celle-ci permet, a une echelle suIIisamment vaste pour
que la vie subsiste sur Terre, de transIormer l'energie solaire en energie chimique sous Iorme
de sucre a partir d'eau, et d'air ! Et toutes les autres reactions du metabolisme, tant chez les
animaux que chez les vegetaux, dependent de la recuperation de cette energie-la. L'ensemble
de toutes ces reactions biochimiques constitue le mtabolisme cellulaire.

89
2. LES ENZYMES
_____________________

La quasi totalite des reactions chimiques du metabolisme de la cellule vivante, a
l'exception des reactions acide-base, sont extrmement lentes si on essaie de les reproduire
dans un tube a essai. Par exemple, l'hydrolyse du saccharose en glucose et Iructose est
associee a un AG de - 29 kJmol, et est donc tres Iavorable thermodynamiquement. En
pratique, le saccharose present dans les conIitures et les sucreries est tres stable ! Cette
stabilite est due a la tres Iaible vitesse de la reaction d'hydrolyse. Dans les tre vivants, elle
est rendue possible grce a l'action de catalyseurs biochimiques denommes en:vmes.
Ce sont des substances qui, a Iaible dose et sans se detruire, declenchent, accelerent et
orientent les reactions qui s'operent dans la cellule.
Les enzymes ne modiIient pas les produits d'une reaction, ne deplacent pas son point
d'equilibre, mais augmentent Iortement la vitesse a laquelle cet equilibre est atteint, dans des
conditions compatibles avec la vie cellulaire. En outre, elles peuvent transIormer une masse
de reactiIs de loin superieure a leur propre masse.
La grande majorite des enzymes connues sont des proteines. Quelques ARN ont
montre une activite enzymatique. Nous ne les aborderons pas ici.


2.1. MODE D'ACTION

On peut se rendre compte de l'activite d'une enzyme de la maniere suivante: soit une
enzyme E
1
attaquant un substrat (un corps) A pour donner deux autres corps B et C qui
possedent une energie libre totale plus Iaible que A. La transIormation de A en B C est
thermodynamiquement possible et se realise avec un degagement d'energie (reaction
exothermique). Si aucune "barriere" n'existe entre A et BC, la reaction est spontanee et, des
son apparition, A se transIorme directement en BC.
TouteIois, une "barriere energetique" existe souvent entre A et BC empchant cette
transIormation spontanee, rendant A relativement stable. La hauteur de cette barriere
caracterise la stabilite du corps A.
La transIormation directe de A en BC necessite donc une "energie d'activation" pour
Iranchir cette barriere energetique. L'energie d'activation peut tre Iournie par une elevation
de la temperature (comme pour toute reaction chimique ordinaire, par exemple la chaleur de
l'allumette pour declencher la combustion du papier), mais l'importance de celle-ci est
souvent incompatible avec la vie cellulaire. L'enzyme contourne ou evite cette "barriere
energetique" en prenant un chemin reactionnel indirect entre A et BC, necessitant une
energie d'activation moindre.
90
L'abaissement provient du Iait que l'enzyme e
1
Iorme avec le corps A un complexe
enzyme-substrat active AE
1
instable, dont la Iormation exige une energie d'activation
beaucoup plus Iaible. AE
1
se transIorme alors spontanement en B C stables en regenerant
l'enzyme e
1
et en rendant au systeme l'energie d'activation :

A e
1
AE
1
B C e
1


La premiere etape consiste donc en la reconnaissance de l'enzyme et de son substrat et
la Iixation de celui-ci sur un site de Iixation. Le site de Iixation est une partie de la surIace de
l'enzyme qui est "complementaire" de celle du substrat. L'union entre les deux molecules
modiIie la Iorce des liaisons dans la molecule de substrat et la rend plus vulnerable a l'action
d'un reactiI. Le site catalytique est l'endroit ou se Iait la reaction elle-mme. Le site de
Iixation et le site catalytique Iorment le site actif de l'enzyme, tres generalement conIondus
au mme endroit.
Il arrive souvent que la reaction ne puisse se Iaire sans l'intervention d'une troisieme
molecule, la coenzyme. Les coenzymes peuvent tre de nature minerale (Fe, Cu, n, Mg) ou
de nature organique (nucleotides, certaines vitamines,...). Le rle des coenzymes est variable:
agent de liaison enzyme-substrat, support intermediaire dans les reactions de transIert, centre
"actiI", proprement dit.

Beaucoup de reactions enzymatiques sont par ailleurs rversibles puisqu'elles ne Iont
qu'accelerer la vitesse avec laquelle on atteint l'equilibre.
Voici un exemple du mode d'action d'un enzyme : dans la transIormation de l'eau
oxygenee H
2
O
2
H
2
O 12 O
2
, par molecule-gramme d'eau oxygenee a degrader, une
energie de 75 kJ est necessaire pour declencher la reaction. Un catalyseur chimique (la
mousse de platine) abaisse cette energie d'activation a 50 kJ. Un enzyme, la catalase, l'abaisse
a 30 kJ et la reaction est alors suIIisamment rapide pour qu'elle puisse se derouler a la
temperature de la cellule.

2.2. SPCIFICIT

Les enzymes ont la Iaculte d'operer une reaction bien determinee parmi d'autres
possibles et de ne catalyser que celle-la.

Cette possibilite determine la speciIicite de l'enzyme.
Certaines enzymes ont une speciIicite au substrat (speciIicite etroite) et ne degradent
qu'une molecule strictement determinee a l'exclusion de toute autre y compris ses isomeres
91
les plus proches (l'amylase, enzyme qui hydrolyse l'amidon en glucose est incapable
d'hydrolyser la cellulose, pourtant Iormee aussi de glucose).
Par contre, d'autres enzymes peuvent agir non seulement sur une substance determinee
mais encore sur toutes les substances qui possedent des proprietes communes engendrees par
une Ionction chimique commune : ces enzymes ont une speciIicite Ionctionnelle ou
speciIicite large (par exemple la pepsine de notre estomac hydrolyse la plupart des proteines).
C'est le site actiI de l'enzyme qui est responsable de la speciIicite au substrat. En eIIet,
pour que la reaction se passe, il Iaut que substrat et site de Iixation soient bien "moules" l'un
sur l'autre. Leurs Iormes doivent donc tre complementaires. Or cette Iorme est determinee
par la position et la nature des residus des acides amines de la surIace de l'enzyme, donc par
sa structure tertiaire. On comprend donc qu'un site actiI ne convienne qu'a une substance et
pas a son isomere (qui necessiterait des positions diIIerentes des residus des acides amines
pour tre complementaires et donc une structure primaire de la proteine enzymatique tres
diIIerente).
Notons cependant qu'il arrive regulierement que le contact entre substrat et enzyme
provoque une modiIication de la Iorme du site actiI (allostrie), ce qui aboutit a un contact
plus intime encore. Ainsi donc tout Iacteur qui modiIie la structure, la Iorme du site actiI,
modiIie automatiquement l'activite intrinseque de l'enzyme. C'est dans cette optique qu'il
Iaudra comprendre l'inIluence des diIIerents Iacteurs qui peuvent modiIier l'activite d'une
enzyme.

Dans le cas de voies metaboliques comportant parIois plusieurs dizaines d'enzymes, il
Iaut que le rendement global soit satisIaisant et la vitesse suIIisamment rapide. Or les contacts
entre un substrat et le site actiI de l'enzyme sont le Iruit du hasard et de l'agitation thermique
des molecules. Pour Iaciliter le processus, les enzymes d'une mme voie metabolique sont
toujours localisees dans un compartiment cellulaire donne. De plus, ces enzymes sont souvent
associees de Iaon a ce que leurs sites actiIs soient proches et qu'une molecule transIormee
sur le site actiI d'une premiere enzyme soit directement happee par le site actiI de la suivante.
Une autre technique consiste a "immobiliser" les enzymes sur la surIace d'une membrane, ce
qui reduit les deplacements moleculaires a deux dimensions de l'espace.

2.3. VITESSE D'ACTION

L'activite moleculaire d'une enzyme est le nombre de molecules de substrat
transIormees en une minute par une molecule d'enzyme placee dans des conditions donnees.
Les vitesses habituelles sont de l'ordre de 1000 molecules transIormees par seconde, mais
certaines enzymes peuvent atteindre une vitesse de 10
6
molecules par seconde. Cette vitesse
varie en Ionction de nombreux Iacteurs: la vitesse de la reaction enzymatique, la temperature,
le pH, la concentration en enzyme et en substrat, les eIIecteurs. De plus, l'activite
92
enzymatique d'une cellule doit tre constamment ajustee de telle Iaon que les produits
satisIassent au plus juste les besoins de la cellule.

1) La temprature :
La courbe de reponse de l'activite enzymatique aux variations de temperature presente
les caracteristiques suivantes :
- une temperature minimale en-dessous de laquelle aucune reaction n'est possible ;
- une courbe ascendante, exponentielle, comme pour toute reaction chimique (la vitesse
double tous les 10C);
- une temperature optimale, correspondant a l'activite maximale (variable pour chaque
enzyme, souvent situee autour de 40C);
- une chute plus ou moins brutale due a la denaturation des enzymes qui sont toutes des
proteines thermolabiles (rupture des ponts hydrogene et des autres liaisons Iaibles de la
structure tertiaire et donc transIormation du site actiI );
- une temperature maximale au-dessus de laquelle l'enzyme est completement denaturee (vers
60 - 70C).
La temperature optimale est donc un compromis entre le Iait que l'elevation de
temperature augmente la vitesse de la reaction et que, en mme temps, elle denature l'enzyme.
Notons que certaines enzymes sont encore actives a des temperatures avoisinant les 70C.
C'est le cas des enzymes de bacteries vivant dans des sources chaudes. Ces enzymes
particulieres sont tres utiles au laboratoire.

2) L'acidit du milieu
Elle inIluence la vitesse parce qu'elle determine les charges portees par l'enzyme
(residus d'acides amines acides et basiques: glu, asp, lys, arg, his, cys.) et dans certains cas
par le substrat. Il existe pour chaque enzyme un pH optimal pour lequel les charges du site
actiI sont complementaires a celles du substrat. Ce pH optimal est generalement voisin de la
neutralite, compris entre 5 et 8, mais peut s'en eloigner assez Iort. Il est par exemple de 2,2
pour la pepsine (la plus importante des enzymes digestives contenues dans le suc gastrique) et
de 9 pour la trypsine (enzyme du suc pancreatique qui poursuit dans l'intestin la digestion des
proteines entamee dans l'estomac).

3) La concentration en substrat
La vitesse de reaction d'une enzyme depend de la concentration en substrat. Dans la
majorite des cas, la vitesse initiale de la reaction enzymatique augmente lineairement et
rapidement avec l'accroissement de la concentration en substrat jusqu'a atteindre
asymptotiquement une vitesse maximum (V
max
), par saturation de tous les sites actiIs. Cette
valeur est importante pour la determination d'une enzyme, mais diIIicile a estimer
exactement. On preIere caracteriser une enzyme par la constante de MICHAELIS (K
M
),
93
concentration du substrat pour laquelle la vitesse de la reaction correspond a la moitie de la
vitesse maximale (V
max
2). Alors que V
max
est proportionnelle a la concentration en
enzyme, K
M
reste la mme quelle que soit la concentration en enzyme. De plus K
M
est
beaucoup plus Iacile a mesurer experimentalement. Si K
M
est Iaible, cela signiIie que la
demi-saturation de l'enzyme est obtenue avec relativement peu de substrat et donc que
l'aIIinite entre l'enzyme et le substrat est grande. Les valeurs rencontrees pour K
M
sont de
l'ordre de 10
-1
a 10
-8
Molaires.

4) La concentration en enzyme
Dans les conditions naturelles ou experimentales, les reactions enzymatiques se Iont
generalement en presence d'un exces de substrat. Dans ces conditions, la vitesse de reaction,
qui correspond a V
max
, est au depart proportionnelle a la concentration en enzyme dans le
milieu.

5) La prsence d'effecteurs
Certains composes chimiques peuvent accelerer (ils sont denommes "activateurs"),
ralentir ou inhiber (ce sont alors des "inhibiteurs"), le deroulement des reactions
enzymatiques.

Parmi les activateurs, citons certains ions qui stimulent a tres Iaibles doses, l'action
des enzymes (Mn

, Mg

.). Leur rle est important pour l'equilibre des charges au


moment de la Iixation. Ainsi, les ions Mg

sont indispensables pour la decarboxylase de


l'acide pyruvique.

Les inhibiteurs sont des substances qui ralentissent les reactions enzymatiques en
agissant sur l'enzyme elle-mme. On en connat de trois types:
- les inhibiteurs comptitifs: ils ont une structure tres proche du substrat et se substituent a
lui sur le site de Iixation entranant la Iormation d'un complexe E-I inactiI. Dans ce cas, il y
a competition entre le substrat S et l'inhibiteur I pour occuper le site actiI de l'enzyme et
l'aIIinite apparente de l'enzyme pour son substrat diminue, donc le K
M
augmente. L'addition
d'un inhibiteur competitiI ne modiIie pas la V
max
de la courbe de MICHAELIS mais il Iaut
mettre des quantites plus grandes de substrat pour obtenir cette vitesse maximale.
- les inhibiteurs non comptitifs: ils n'empchent pas la Iormation du complexe enzyme-
substrat ES mais ils se combinent avec ce complexe pour donner un autre complexe ESI
qui est inactiI. L'inhibiteur I va se Iixer sur un site reactionnel de l'enzyme autre que celui sur
lequel se Iixe le substrat. Ils ne modiIient pas la constante de Michaelis, mais correspondent a
une diminution de la concentration en enzyme, donc a une diminution de la vitesse maximale.
- les inhibiteurs irrversibles: ils se Iixent de Iaon irreversible sur l'enzyme, souvent par un
lien covalent stable. Qu'ils empchent ou non la Iixation du substrat, l'enzyme est
94
deIinitivement inactive, ce qui se traduit par une diminution de la concentration en enzyme et
donc par une diminution de Vmax.

Le Iait que l'on peut inhiber speciIiquement telle ou telle enzyme presente un intert
pratique certain pour la pharmacologie. Par exemple, le developpement et la proliIeration des
microbes peuvent tre arrtes lorsque l'on bloque speciIiquement le Ionctionnement des
enzymes qui catalysent certaines des reactions essentielles de leur metabolisme, et cela sans
bloquer les reactions du malade. C'est le cas des penicillines, qui bloquent une enzyme
essentielle pour la synthese de la paroi bacterienne. Cette enzyme n'existe pas chez l'homme,
et les penicillines n'ont donc pas d'eIIets sur les cellules humaines, mais empchent
eIIicacement la proliIeration bacterienne chez un patient inIecte.
De tres nombreux autres exemples de medicaments qui agissent en inhibant une enzyme
existent. Citons encore les inhibiteurs de la synthese du cholesterol (lovastatine), utilises pour
traiter les hypercholesterolemies, ou les inhibiteurs d'enzymes stimulant la croissances des
cellules tumorales (imatinib).


2.4. CLASSIFICATION DES ENZYMES

Classiquement, on designe les enzymes
- soit par un terme indiquant le type de reaction catalysee termine par le suIIixe "ase" :
oxydase, transIerase, dehydrogenase...
- soit par le nom du substrat attaque auquel on ajoute le mme suIIixe : amylase, protease,
ribonuclease...
Cette classiIication n'est cependant pas rationnelle, chaque nom d'enzyme etant en
general choisi par les scientiIiques qui l'etudient. Le tres grand nombre d'enzymes connues
(plusieurs milliers rien que chez l'homme) cree des problemes de terminologie et de
classiIication. Dans un but de clarte, la Commission des Enzymes de l'Union Internationale
de Biochimie a mis au point un systeme de classiIication qu'il est recommande de suivre. Six
groupes d'enzymes, classes dans un ordre deIini, ont ete distingues, suivant le type de
reactions catalysees. Des sous-groupes precisent les substrats attaques.

GROUPE 1 :
Les oxydorductases catalysent les reactions d'oxydation et de reduction. La plupart de ces
enzymes possedent une coenzyme capable de transporter des electrons (NAD

, par exemple).
Exemples:
- la catalase catalyse le destruction d'eau oxygenee en eau et oxygene (voir peroxysome).
- les dehydrogenases catalysent l'enlevement d'hydrogene de substrats, qui peut tre Iixe sur
une coenzyme (ex: lactate dehydrogenase, voir Iermentation).
95

GROUPE 2 :
Les transfrases transIerent un radical d'une molecule a une autre.
Exemples:
- les transaminases transIerent les radicaux -NH
2
d'un acide amine a un acide cetonique.
Elles jouent un rle capital dans le metabolisme des acides amines.

Ac. aspartique ac. pyruvique ac. oxalacetique alanine

- les kinases transIerent un phosphate terminal de l'ATP sur un substrat (le glucose par
exemple) ou inversement.
L'ion Mg

est indispensable a l'action de ces enzymes.



Glucose ATP Glucose-6-phosphate ADP

hexokinase
- les polymrases sont des nucleotidyl-transIerases.

GROUPE 3 :
Les hydrolases catalysent la rupture des liaisons dans un polymere, avec Iixation, au niveau
de celles-ci, des constituants de la molecule d'eau, ou inversement.
Suivant le type de liaison rompue, on distingue :
- les glycosidases qui hydrolysent les liaisons glycosidiques entre les oses
l'amylase transIorme l'amidon en maltose,
la maltase transIorme le maltose en glucose,
la saccharase transIorme le saccharose en glucose plus Iructose.
- les peptidases et les protases qui scindent les liens peptidiques - CO - NH - en liberant les
acides amines.
- les estrases qui hydrolysent les liens esters, telle la lipase qui transIorme le lipide en
glycerol et acide(s) gras.
- les nuclases qui hydrolysent l'ADN et l'ARN en nucleotides.

GROUPE 4 :
Les lyases catalysent le clivage d'une liaison C-C, C-O, C-N, C-S avec Iormation d'une
double liaison dans un des produits. Les reactions catalysees par des lyases sont souvent
reversibles.
Exemples
- l'aldolase catalyse la coupure du Iructose-diphosphate en deux trioses phosphates.
Inversement, elle catalyse la Iormation d'une liaison carbone - carbone entre la Ionction
96
aldehyde de l'aldehyde phosphoglycerique et la Ionction alcool du phosphate de
dihydroxyacetone (voir glycolyse).

GROUPE 5 :
Les isomrases catalysent des rearrangements intramoleculaires.
Exemples :
- les isomerases permettent le changement de place de certains atomes dans la molecule pour
donner des isomeres : par exemple, la glucose-6-phosphate isomerase transIorme le glucose-
6-phosphate en Iructose-6-phosphate (voir glycolyse).

GROUPE 6 :
Les ligases catalysent les reactions de soudure de deux molecules en utilisant l'ATP comme
source d'energie.
Exemples :
- la Iixation d'un acide amine sur un ARN de transIert (voir physiologie, synthese des
proteines).
L'acide amine est d'abord active :
AA ATP ARN
t
AA ARN
t
AMP 2Pi

Il en va des noms en enzymologie comme en chimie organique: il y a ceux qu'on utilise et
ceux que l'on devrait utiliser. Ainsi par exemple, la glucokinase (ou hexokinase) est une
enzyme qui active le glucose en Iixant un phosphate de l'ATP sur son C
6
. Son nom oIIiciel
est "ATP D-Glucose 6 phosphotransIerase" et son numero de code EC 2.7.1.2 : 2 parce qu'il
s'agit d'une transIerase, 7 parce que c'est un transIert de phosphate, 1 parce que l'accepteur est
une Ionction alcool, 2 parce que c'est la deuxieme enzyme repertoriee dans ce groupe. Au
laboratoire, les termes glucokinase et hexokinase restent les plus utilises pour des raisons
evidentes de Iacilite.

2.5. LES COENZYMES

Rappelons que les coenzymes sont soit des ions metalliques, soit des molecules
organiques, beaucoup plus simples et plus stables que les enzymes elles-mmes.
Les ions metalliques ont comme rle d'assurer ou de Iaciliter la Iixation de l'enzyme
au substrat ou interviennent directement dans la reaction: Cu dans la cytochrome oxydase, la
plastocyanine, n dans quelques ADN polymerases et l'anhydrase carbonique, Mo dans la
nitrate reductase, Ni dans l'urease.
Les coenzymes organiques participent a la reaction comme transporteurs d'energie,
d'electrons, d'atomes ou de groupements Ionctionnels, lesquels sont transIeres d'une molecule
97
a une autre molecule lors de la reaction enzymatique. Ils appartiennent ou derivent souvent
des vitamines du groupe B.

LES NUCLETOTIDES TRANSPORTEURS D'ENERGIE

Nous avons deja vu le rle joue par les nucleotides triphosphate, en particulier l'ATP, qui
Iournit de l'energie et du phosphate lors de nombreuses reactions enzymatiques.

LES TRANSPORTEURS D'ELECTRONS

Ce sont les coenzymes de nombreuses oxydoreductases. Elles assurent le transport de
deux electrons, associes a un ou deux protons. De ce Iait, ces transporteurs sont parIois
consideres comme des transporteurs d'hydrogene (H
2
).
Ces transporteurs sont souvent des nucleotides particuliers.

a) Les nicotinamide-nuclotides
Le NAD

ou nicotinamide adenine dinucleotide. Il comprend deux nucleotides: un AMP et un


autre nucleotide Iorme par la nicotinamide (vit B
3
, base azotee) et un ribose phosphoryle. Les
deux nucleotides sont unis par un lien phospho-diester (entre les deux groupes phosphates).
Le NADP

ou nicotinamide adenine dinucleotide phosphate correspond au NAD


phosphoryle a un deuxieme endroit sur le ribose de l'adenosine.
NAD

et NADP

sont tous les deux susceptibles de Iixer ou de ceder des atomes


d'hydrogene, passant ainsi, reversiblement, de la Iorme oxydee a la Iorme reduite :

NAD

2 electrons 2 H

NADH H

NADP

2 electrons 2 H

NADPH H

Iorme oxydee

Iorme reduite


Bien que de structures tres voisines, ces deux coenzymes ont des rles tres diIIerents:
le NADH

est une coenzyme de catabolisme servant essentiellement de carburant a la chane
reactionnelle Iabriquant l'ATP, tandis que le NADPH est utilisee dans l'anabolisme, comme
reservoir d'hydrogene pour les syntheses cellulaires, en particulier celle des lipides.

b) Les flavines nuclotides
La vit B
2
ou RiboIlavine (coloration jaune) est un nucleoside Iorme d'une base azotee,
l'isoalloxasine et d'un Iaux sucre en C
5
, le ribitol. Phosphorylee, elle Iorme un nucleotide, la
Ilavine mononucleotide ou FMN.
Comme dans le NAD, le FMN peut s'associer a l'AMP par un lien phospho-diester
pour Iormer la Flavine Adenosine Dinucleotide: FAD.
98
Les Ilavo-proteines sont des proteines dans lesquelles la proteine est Iortement liee a
une Ilavinenucleotide.
FMN et surtout FAD sont donc des accepteurs et donneurs d'hydrogene et passent
reversiblement de la Iorme oxydee (FMN, FAD) a la Iorme reduite (FMNH
2
, FADH
2
).

FMN 2 electrons 2 H

FMNH
2

FAD 2 electrons 2 H

FADH
2

Leur rle est identique a celui de la NAD et de la NADP mais a des niveaux
energetiques diIIerents.

c) La coenzyme Q et la Plastoquinone:
Ces coenzymes ne sont pas des nucleotides mais bien des lipides, qui interviennent
respectivement dans le transport d'hydrogene au niveau de la "chane respiratoire" et de la
phase claire de la photosynthese. Leur rle sera precise ulterieurement :

CoQ H
2
CoQH
2
.
PQ H
2
PQH
2
.

d) Les transporteurs d'lectrons associs aux cytochromes
Ce sont des proteines colorees dont le groupement prosthetique est une porphyrine. Ce
groupement qui contient du Ier, est Iort semblable a l'heme de l'hemoglobine et de la
myoglobine ainsi qu'a la chlorophylle.
Le Ier, par des changements de valence Fe

e
-
Fe

assure le transport
d'electrons dans les chanes reactionnelles d'oxydation cellulaire.
Les cytochromes occupent notamment une place tres importante dans la chane
respiratoire.


LES TRANSPORTEURS D'UN ATOME DE CARBONE

Un derive diphosphorique de la vit B
1
(thiamine ou aneurine), la thiamine
pyrophosphate, intervient dans les processus de decarboxylation de la respiration.





99
LES TRANSPORTEURS DE DEUX ATOMES DE CARBONES

La coenzyme A est Iormee d'un ADP phosphoryle associe a de l'acide pantothenique
(vit B
5
) et de la mercaptoethylamine. Son groupe actiI est le residu sulIhydrile terminal -SH.
On la represente par le symbole CoA-SH.
La coenzyme A est principalement accepteur ou donneur du groupement acetyle CH
3

- CO - a deux atomes de carbone, bien qu'elle transporte aussi des chanes hydrocarbonees
plus longues. La combinaison la plus importante de la coenzyme A est "l'acetyl-CoA"
represente par CH
3
- CO SCoA.



La rupture de la liaison CO S libere 30,5 kJ, qui permettent la Iormation d'ATP a
partir d'ADP. La synthese de cette liaison demande donc autant d'energie, Iournie soit par
l'ATP, soit par la rupture d'une autre liaison. L'action biologique de la coenzyme A est
primordiale. Elle assure une place centrale dans le metabolisme cellulaire.



100

3. LA NUTRITION CELLULAIRE
__________________________________________

Les cellules ont besoin d'absorber un certain nombre de molecules de base pour
synthetiser leurs composants. La nature de ces composes varie enormement d'un type
d'organisme a l'autre. Le principal obstacle a la nutrition cellulaire est le passage des
membranes. Ce chapitre Iait appel a deux phenomenes physiques de base, qui sont la
diIIusion et l'osmose.

3.1. BESOINS CELLULAIRES

L'nergie
Les cellules ont toutes besoin d'une source d'energie. Les organismes qui peuvent utiliser la
lumiere comme source d'energie par photosynthese sont qualiIies de phototrophes (plantes,
certains protistes comme les algues, et les cyanobacteries). Ceux qui, comme nous, ont besoin
de molecules riches en energie chimique (sucres, lipides, protides), sont des chimiotrophes.

L'eau et les minraux
Toutes les cellules ont besoin d'eau et de mineraux en quantites variables.

Le Carbone
Les organismes qui se contentent de dioxyde de carbone gazeux comme source de carbone
sont qualiIies d'autotrophes. Il s'agit evidemment des organismes capables de photosynthese,
mais aussi de certaines bacteries exotiques.
Les htrotrophes ont besoin de carbone sous Iorme organique (sucre, lipides, protides). Ce
sont donc dans ce cas les mmes molecules qui Iournissent l'energie et le carbone
(chimioheterotrophes, souvent appeles simplement heterotrophes). Notons que la survie des
heterotrophes sur Terre depend totalement des autotrophes comme les plantes.

L'ABSORPTION DE L'AOTE
L'azote necessaire a la synthese des acides amines et des bases azotees de l'ADN peut
provenir de trois sources :
- l'azote atmospherique (N
2
), utilise exclusivement par certaines bacteries ;
- l'azote organique (associe a des atomes de carbone) provenant d'autres organismes morts
ou vivants, utilisable par tous les tres vivants ;
- l'azote mineral provenant de mineraux du sol ou bien de la nitriIication, de la
mineralisation de l'azote organique par les microorganismes du sol suivant le schema :
N organique NH
4


NO
2
-
NO
3
-

101
La plupart des plantes utilisent pour leurs syntheses ulterieures l'azote mineral. Soit
sous Iorme ammoniacale (reduite NH
4

), soit sous Iorme nitrate (oxydee NO


3
-
). Certaines
plantes montrent une preIerence marquee pour l'un ou l'autre ion. Un Iacteur qui inIluence ce
choix est le pH du sol : en sol acide, ce sont les ions nitrates qui sont les plus absorbes, en sol
alcalin, ce sont les ions ammonium.
Les plantes, contrairement aux animaux, sont capables d'absorber et de reduire les
nitrates. Cette reduction des nitrates peut deja s'eIIectuer dans les racines pour certaines
especes. Mais c'est surtout au niveau des Ieuilles, dans les chloroplastes, que les nitrates sont
transIormes en ions ammonium. Ce passage necessite 8 electrons qui sont Iournis par le
NADH des mitochondries a l'obscurite mais surtout le NADPH de la phase claire de la
photosynthese. L'ion NH
4

etant toxique, comme le nitrite, NO
2
-
, il est directement utilise
pour la synthese des acides amines.
Les animaux n'utilisent que l'azote organique sous Iorme d'acides amines. Tous les
tres vivants peuvent aussi assimiler de l'azote organique, du moins s'il s'agit de petites
molecules. Certaines plantes carnivores s'en Iont mme une specialite.
EnIin, une Iamille de plantes, les Fabacees, utilisent indirectement l'azote
atmospherique grce a une symbiose au niveau des nodules racinaires avec une bacterie
(Rhi:obium) capable d'operer la transIormation N
2
NO
3
. Grce a ce systeme tres eIIicace,
les graines de ces plantes (petits pois, haricots, lentilles.) sont particulierement riches en
proteines et constituent une source de protides alimentaires importante pour les vegetariens et
les populations qui n'ont pas un acces suIIisant a la viande et au poisson.


3.2. LA DIFFUSION ET L'OSMOSE

La diIIusion est le phenomene par lequel une substance se deplace de l'endroit ou elle
a le potentiel chimique le plus eleve vers le potentiel chimique le plus Iaible. Ce potentiel
etant Ionction de sa concentration, toute substance tend donc a uniformiser sa concentration
dans tout le volume qui lui est oIIert. Cette loi s'applique tant aux gaz, qu'aux melanges de
liquides, qu'aux substances dissoutes dans un solvant.
De l'eau et de l'alcool, mis en contact, diIIusent rapidement l'un dans l'autre jusqu'a
obtention d'un liquide homogene. De mme, entre une solution sucree a 10 et de l'eau pure,
le sucre passe du milieu le plus concentre en sucre vers le milieu le moins concentre et les
molecules d'eau passent de la solution la moins concentree (l'eau pure donc 100 en eau)
vers la solution la plus concentree (10 en sucre donc logiquement, 90 en eau). Il cesse
quand il y a egalite de concentration en sucre et en eau dans les 2 solutions.
En Iait, pour l'eau, le phenomene n'est pas si simple. En eIIet, chaque molecule de solute (le
sucre dans ce cas) est enrobee de molecules d'eau agglutinees sur sa surIace. La quantite
totale d'eau n'a donc pas diminue de 10. Par contre, la quantite d'eau "libre", disponible
102
pour les mouvements, son potentiel hydrique (+s), a diminue d'une valeur proportionnelle a
la concentration du solute, que l'on appelle potentiel osmotique (+o). Nous y reviendrons au
point suivant.
Toute substance mobile, soluble (molecules, ions) se deplace naturellement,
passivement, du milieu ou elle est la plus concentree (ou son potentiel est le plus eleve) vers
le milieu ou elle est la moins concentree (potentiel plus Iaible). Ceci n'implique pas que le
mouvement soit rapide.
La quantite de matiere qui passe d'un point a un autre est Ionction (loi de Fick)
- de la diIIerence de concentration: generalement tres Iaible chez les tres vivants
- de la temperature : agitation thermique des molecules
- du coeIIicient de diIIusion: caracteristique propre d'un corps solubilise dans un solvant
determine
- de la distance: pour les distances superieures a 1 m cette vitesse de diIIusion devient trop
lente et provoquerait l'asphyxie du centre d'une cellule eucaryote, ce qui explique la necessite
de la cyclose.

L'OSMOSE

L'osmose est un phenomene de diIIusion entre 2 compartiments separes par une
membrane semi-permeable. Une membrane "semi-permeable" est une membrane qui laisse
passer l'eau mais est impermeable a certains corps dissous.
Si une solution de glucose a 10 dans un Ilacon A Ierme par une membrane "semi-
permeable" est deposee dans une cuvette B remplie d'eau pure, les molecules de sucre ne
pourront pas diIIuser du Ilacon dans la cuvette, mais les molecules d'eau de la cuvette
pourront diIIuser dans le Ilacon. Ces dernieres vont du compartiment ou elles ont le potentiel
hydrique le plus haut, vers celui qui a le potentiel le plus bas.
Le potentiel hydrique d'une solution est donne par
+s +o P.
+s est le potentiel hydrique de la solution
+o est le potentiel osmotique de la solution
P est la pression ou la depression que l'on applique eventuellement sur la
solution (en A).
Par convention le potentiel hydrique (+s) de l'eau pure a pression atmospherique est
egal a zero.
Le potentiel osmotique est toujours une valeur negative, puisqu'il y a moins de
molecules d'eau "libres" dans une solution que dans l'eau pure.
La solution de glucose du Ilacon A va donc se diluer; mais l'augmentation de volume
induit une pression interne qui augmente le potentiel hydrique dans A. Le mouvement de
103
l'eau s'arrtera quand la valeur de cette surpression equilibrera le potentiel osmotique de la
solution (+o P 0). Cette pression, qu'il est necessaire d'appliquer sur la solution A pour
arrter le mouvement de l'eau s'appelle la pression osmotique (p). Cette pression peut tre
mesuree en raccordant un manometre au Ilacon.
Le potentiel osmotique de la solution et sa pression osmotique sont donc deux valeurs
inverses l'une de l'autre a pression atmospherique.
+o p
Cette notion de potentiel hydrique est importante pour comprendre les mouvements de
la seve dans les plantes. En pratique cependant dans les mouvements cellulaires de l'eau on se
contente de se servir de la pression osmotique.

Entre deux solutions, separees par une membrane semi permeable, le mouvement de
l'eau se Iait depuis la solution qui possede le potentiel hydrique le plus eleve vers celle qui
possede le potentiel le plus Iaible, donc depuis la solution dont la pression osmotique est la
plus Iaible vers celle qui est la plus Iorte.

La pression osmotique d'une solution (et donc son potentiel osmotique) est
proportionnelle :
a) a la concentration totale en corps dissous C (qu'ils soient purs ou en melanges), c'est-a-dire
au nombre de particules dissoutes par unite de volume de solvant, quelles que soient leur
taille, leur nature, leur charge electrique.
Donc : P.O. p K
1
C K n V
b) a la temperature absolue T (en Kelvin)(Loi de VAN'T HOFF)
Donc : p K
2
T
p KTC K n T V ou pV KnT
ou la constante K est egale a R, constante des gaz parIaits pV R n T.
Si p est exprimee en hectopascals et V en litres, K 0,082;
et donc pour une solution molaire, a 0 C : p 0,082 . 273 . 1 22,4 atm 22 691,2 hPa.

De ces lois, il resulte que :
- si deux solutions de concentrations inegales sont separees par une membrane semi-
permeable, la solution la plus concentree (hvpertonique) possede un potentiel osmotique plus
grand que l'autre solution (hvpotonique) et son potentiel hydrique est donc plus negatiI; le
mouvement de l'eau se Iera donc de la solution hypotonique vers la solution hypertonique
jusqu'a egalite des concentrations (ou "activites") totales des deux solutions (jusqu'a l'isotonie
des deux solutions).

104
- les solutions collodales ne renIerment qu'un petit nombre de particules, etant donne la taille
des macromolecules et des micelles, et donc ne developpent que des potentiels osmotiques
tres Iaibles.

- un corps insoluble dans un solvant n'y induit aucun potentiel osmotique puisque n 0. La
cellule vegetale proIite de cette particularite pour regler son potentiel hydrique grce a la
reaction reversible : amidon insoluble glucose soluble.

On peut mesurer la pression osmotique d'une solution inconnue soit directement au
moyen d'un osmometre qui est constitue d'un Ilacon comportant une membrane semi-
permeable, reliee a un manometre, soit indirectement par crvoscopie. En eIIet, une solution
molaire possede une P de 22,4 atm et abaisse le point de congelation de l'eau de 1,86 C. En
mesurant l'abaissement du point de congelation d'une solution inconnue, on deduit la valeur
de la PO par la Iormule :
PO 22,4 x (D C) 1,86 atm

L'EQUILIBRE DE DOAAAA

Nous n'avons jusqu'a present considere que le cas de particules non chargees. Or, les
charges electriques peuvent induire des modiIications aux lois de l'osmose.

Considerons le cas le plus simple : deux compartiments A et B separes par une
membrane semi-permeable. Le premier compartiment A contient par exemple une solution
RNa dissociee en ses ions R
-
Na

. R
-
est non dialysable (la membrane lui est impermeable);
Na

passe librement. Le compartiment B contient une solution de NaCl qui s'ionise en Na

et
Cl
-
tous deux dialysables (ils passent librement par la membrane).
En vertu des lois de la diIIusion, Na

et Cl
-
vont tendre a egaliser leurs concentrations
respectives (concentrations partielles) de part et d'autre de la membrane, equilibrant ainsi les
charges positives et negatives. R
-
, ne pouvant pas dialyser, provoque un desequilibre des
concentrations totales et donc une diIIerence de potentiel hydrique, mais de plus, il provoque
un nouveau desequilibre, electrique, a cause de sa charge negative qui reste conIinee au
compartiment A. Ce nouveau desequilibre sera compense par une attraction supplementaire
d'ions de signe oppose (Na

de B) et une repulsion d'ions de mme signe (Cl
-
vers B) et cela
a l'encontre de la loi de la diIIusion.

L'equilibre de DONNAN constitue un compromis entre ces tendances opposees. Les
ions mobiles, dialysables sont soumis a deux Iorces de sens opposes: les Iorces osmotiques
qui les tirent dans un sens et les Iorces electriques qui les tirent dans l'autre. Le calcul montre
que le collode attire plus d'ions de signe oppose qu'il ne repousse d'ions de mme signe. Ceci
105
se traduit par une augmentation de la diIIerence des concentrations totales des deux
compartiments et donc par une augmentation de la diIIerence de pression osmotique.
L'exemple ci-dessus peut tre chiIIre et resume de la maniere suivante:


!"
#$% &' ('

Au depart R 10 Cl 20
Na 10 Na 20

apres diIIusion R 05 R 05
Na 15 Na 15
Cl 10 Cl 10 DiIIerence 0

apres osmose R 10 -
Na 15 Na 15
Cl 10 Cl 10

35 25 DiIIerence 10

en tenant compte des charges (equilibre de Donnan)
R
-
10 -
Cl
-
08 Cl
-
12
Na

18 Na

12

36 24 DiIIerence 12

(Dans la resolution de ce cas simpliste, la loi de Donnan indique simplement que les charges
et - doivent s'annuler dans chaque compartiment (A: 18- et 18, B 12- et 12) et que le
produit des concentrations des ions dialysables doit tre identique entre les compartiments
(8x1812x12144)).

OSMOSE APPLIQUEE A LA CELLULE JIJAA1E

On peut considerer la membrane plasmique des cellules comme une membrane semi-
permeable qui laisse passer les molecules d'eau. La concentration en solutes de part et d'autre
de la membrane va donc determiner le sens du passage de l'eau. La cellule contient des
substances dissoutes dont la concentration totale determine une pression osmotique interne P
i
.
Si la cellule est placee dans un liquide hypertonique (P
e
P
i
), par exemple dans une
solution concentree de saccharose (non diIIusible), l'eau est "attiree" du milieu le moins
106
concentre (hypotonique) vers le milieu le plus concentre (hypertonique). L'eau sort de la
cellule et dilue le milieu exterieur. Au Iur et a mesure, le volume de la cellule diminue, la
pression sur la membrane (et la paroi chez les vegetaux) s'aIIaiblit et la cellule se retrecit
comme un ballon qu'on degonIle. Les cellules vegetales vont se decoller de leur paroi rigide
(plasmolyse). L'eau cessera de sortir au moment ou il y aura isotonie entre le milieu
intracellulaire et le milieu exterieur, car a ce moment, P
i
P
e
et donc aussi +s
i
+s
e
.
Si l'on place une cellule dans un milieu hypotonique (par exemple de l'eau pure), on
assiste au phenomene inverse. (+s
e
0 +s
i
) Il y a appel de l'eau du milieu (moins
concentre) vers l'interieur (plus concentre) qui gonIle. Le cytoplasme exerce une pression
centriIuge de plus en plus Iorte sur la membrane plasmique. Si la cellule continue a gonIler,
la membrane se rompt et la cellule est lysee. Les cellules qui possedent une paroi sont plus
resistantes a cette pression du cytoplasme, appelee chez les vegetaux pression de turgescence
(P
t
).

Les diIIerents regnes vivants ont adopte des strategies diIIerentes vis a vis de l'osmose.

Les cellules animales baignent dans du liquide extracellulaire isotonique par rapport
au cytoplasme, mme si les ions et les molecules qui le composent sont diIIerents de ceux
trouves a l'interieur de la cellule. Si une cellule animale placee dans de l'eau pure, l'eau rentre
rapidement dans la cellule qui explose. Inversement, une cellule placee dans une solution
hypertonique par rapport a son cytoplasme perd de l'eau et retrecit. Les animaux ont
developpe des moyens tres eIIicaces pour ajuster l'osmolarite des liquides extracellulaires, en
utilisant un systeme d'excretion tres sophistique (principalement au niveau des reins) qui
contrle les quantites d'eau et de sels presentes dans l'organisme.
Les vgtaux - a l'exception des algues marines - baignent dans un liquide
extracellulaire hypotonique qui contient beaucoup moins de sels que celui des cellules
animales. Les cellules vegetales - ainsi que les bactries - possedent une paroi rigide qui leur
permet de resister a de Iortes pressions osmotiques. Les cellules vegetales utilisent ces
proprietes pour pomper l'eau plus eIIicacement et sont normalement turgescentes (legerement
gonIlees) en milieu hypotonique. Leur vacuole accumule une partie de l'eau qui rentre dans la
cellule et joue une rle important dans l'equilibre hydrique de la cellule. La pression de
turgescence (P
t
) conIere aux tissus une certaine rigidite (comme dans une chambre a air). Un
approvisionnement insuIIisant en eau entrane une deturgescence, parIois suivie d'une
plasmolyse (qui peut tre mortelle) : les parois cellulaires se detendent, les tissus et donc
l'organe s'aIIaissent : c'est la Ianaison. Une nouvelle alimentation en eau retablit la
turgescence : l'organe reprend alors toute sa rigidite.
Certains protistes plonges dans un milieu hypotonique, rejettent l'eau absorbee par
osmose de maniere active (en depensant de l'energie) par des vacuoles contractiles speciales.

107
3.3. LE PASSAGE DES MEMBRANES CELLULAIRES

DIFFUSIOA SIMPLE

Si on considere une membrane artiIicielle composee uniquement d'une double couche
de lipides, la traversee d'un compose est une simple diIIusion sur une distance limitee a deux
molecules. On comprend alors que les membranes soient permeables a certains corps (ils sont
solubles dans les lipides, leur coeIIicient de diIIusion y est eleve) tandis qu'elles sont
impermeables a d'autres (leur coeIIicient de diIIusion dans les lipides est tres Iaible, voir nul).
La notion de permeabilite, d'impermeabilite, de semi-permeabilite est donc une notion
relative. La double couche lipidique est relativement permeable aux molecules hydrophobes
et apolaires (alcanes, O
2
, N
2
). Certaines petites molecules polaires non chargees (CO
2
,
glycerol, uree, alcool, mme dans une certaine mesure l'eau) peuvent passer la membrane, qui
est par contre impermeable aux grosses molecules polaires non chargees (glucose,
saccharose) et surtout aux ions (H

, Na

, K

, Ca

, Cl
-
, HCO
3
-
.). Le saccharose passe 1000
Iois moins vite que l'uree, le Na

10
10
Iois moins vite que l'eau. Le passage d'une molecule
est aisement mesurable experimentalement.

1RAASPOR1S PASSIFS E1 AC1IFS

La membrane unitaire comporte une quantite importante de proteines
transmembranaires qui interviennent passivement ou activement dans le transIert de matiere.
Ces proteines peuvent tre comparees aux enzymes. On peut considerer qu'elles "catalysent"
le transIert (accelerent la vitesse de passage) d'un compose d'un compartiment a l'autre. Elles
possedent des caracteristiques tres similaires a celles des enzymes: pas de changement des
parametres thermodynamiques, speciIicite, vitesse, regulation, inhibition, sensibilite au pH.
Les transporteurs qui laissent passer une molecule dans une direction qui respecte les lois de
la diIIusion (soit dans la direction du gradient de concentration) sont appeles transporteurs
passiIs. Le transport passif est aussi nomme diffusion facilite. D'autres transporteurs
permettent l'accumulation d'un compose dans un compartiment a l'encontre des lois de la
diIIusion. Ce type de transport est qualiIie d'actif et demande un apport d'energie de la part de
la cellule, souvent Iourni par l'ATP.

Les aquaporines sont des canaux proteiques qui laissent passer l'eau au travers de la
membrane (transport passiI). Ils jouent un rle important dans les reins et dans les globules
rouges, notamment.
Les canaux ioniques sont des proteines tubulaires ou des associations de proteines
dont le centre est creux et qui laissent passer un ion donne, par exemple le calcium. Certains
mecanismes de contrle permettent de les ouvrir ou de les Iermer.
108
Certaines proteines transmembranaires changent de conIormation pour laisser passer
un compose. C'est le cas des permeases GLUT qui transportent passivement le glucose. Un
mecanisme similaire existe pour les acides amines.
Parmi les transports actiIs utilisant de l'ATP, on peut citer la pompe a proton, qui
concentre des protons dans certains compartiments comme les lysosomes. Ce type de pompe
est egalement responsable de l'acidiIication de l'estomac.
Certains canaux permettent un echange d'ions. C'est le cas de la pompe
sodiumpotassium (transport actiI), qui reIoule le sodium vers l'exterieur de la cellule et
importe le potassium dans le cytoplasme. Cette pompe utilise de l'ATP comme source
d'energie. Elle joue un rle tres important dans le maintien d'un potentiel electrique de part et
d'autre de la membrane plasmique (essentiel pour la contraction musculaire et les inIlux
nerveux).
Tous les mecanismes actiIs etou passiIs qui ont ete decrits concernant la nutrition
(l'absorption des aliments) sont applicables au phenomene d'excretion. (Le Ionctionnement
des reins en est un excellent exemple).
Notons enIin que tout ce qui vient d'tre explique a propos des echanges
INTERcellulaires est egalement d'application au niveau INTRAcellulaire relatiI aux echanges
entre le cytoplasme et les diIIerents organites.


109
3.4 L'ENDOCYTOSE

Seules certaines molecules relativement petites peuvent passer la membrane
plasmique. La cellule eucaryote peut cependant absorber des particules relativement
importantes par un mecanisme diIIerent, appele endocytose (voir partie cytologie), qui est
visible au microscope electronique. En certains endroits, la membrane plasmique montre des
invaginations, elle apparat comme aspiree vers l'interieur. Dans ces invaginations viennent se
loger, se concentrer des particules ou molecules (proteines, par exemple). L'invagination se
reIerme alors en une vesicule qui se detache de la membrane plasmique et qui constitue un
endosome. L'endosome ainsi Iorme peut Iusionner avec un lysosome dont les enzymes
peuvent alors digerer le contenu. Il existe trois types d'endocytose : la pinocytose, la
phagocytose et l'endocytose via un recepteur.
La pinocytose permet l'internalisation d'une petite quantite de liquide extracellulaire
par la cellule. Cette pinocytose permet aussi un recyclage de la membrane plasmique.
La phagocytose consiste a ingerer une particule solide dans un endosome
relativement plus grand que celui implique dans la pinocytose. Une amibe (protiste) est par
exemple capable d'ingerer une bacterie par phagocytose. Ce phenomene Iait non seulement
appel a une invagination de la membrane plasmique, comme dans la pinocytose, mais aussi a
des pseudopodes, sortes de petits bras cellulaires qui entourent la particule a ingerer. Du Iait
de la presence de la paroi, la phagocytose ne semble pas presente dans les cellules vegetales.
L'endocytose via un rcepteur permet a la cellule d'assimiler des composes choisis,
grce a un recepteur speciIique. Chaque recepteur, constitue d'une ou plusieurs proteines
transmembranaires, reconnat speciIiquement une molecule ou un complexe donne. Apres
Iixation de cette molecule, les recepteurs sont rassembles en un point sur la membrane
cellulaire et internalises par endocytose a l'aide d'une proteine appelee clathrine qui s'associe
a la partie cytoplasmique du recepteur. Ce processus permet de prelever de Iaon tres eIIicace
certains composes du milieu extracellulaire. Chez l'homme, c'est le cas du Ier (associe a la
transIerrine, une proteine qui transporte le Ier), et des lipides (transportes dans le sang en
association avec des proteines appelees apolipoproteines).
110

4. METABOLISME ET PRODUCTION D'ENERGIE
___________________________________________________________

La degradation d'une substance ne se Iait pas de maniere brutale liberant d'un coup
toute l'energie disponible, mais progressivement le long d'une voie mtabolique. Une
substance, produite par une reaction enzymatique se transIorme a son tour en d'autres corps
par l'intermediaire d'autres enzymes speciIiques pour eux et ainsi de suite.
Des corps complexes peuvent ainsi, par etapes successives, tre transIormes en des corps de
plus en plus simples en liberant chaque Iois une petite quantite d'energie. Ces etapes
successives sont couplees avec une reaction endothermique permettant de stocker ces petites
quantites d'energie ainsi liberees, sous Iorme d'energie chimique, essentiellement dans les
liaisons "riches en energie" de l'ATP.
Inversement, dans l'anabolisme, la construction de la matiere s'eIIectue egalement par
"petits bonds successiIs", empruntant l'energie necessaire a ces molecules specialisees. Un
corps A, de niveau energetique determine peut se transIormer en un corps B d'un niveau
energetique superieur a condition qu'il soit active et qu'on lui Iournisse de l'energie. Ceci se
produit aussi le long de voies metaboliques.
Tous les organismes sont capables d'utiliser des composes organiques comme source
d'energie. Ces composes rentrent dans la cellule comme explique dans le chapitre precedent
et sont ensuite degrades pour en recuperer l'energie (catabolisme). Nous verrons d'abord en
detail le catabolisme du glucose, puis celui des lipides, des proteines et des acides nucleiques.
Le catabolisme du glucose utilise quatre grandes voies metaboliques: la glycolyse, le
cycle des phosphopentoses, le cycle de Krebs et la chane respiratoire mitochondriale. Les
deux premieres peuvent Ionctionner en absence d'oxygene (catabolisme anaerobie),
contrairement aux deux suivantes.


4.1 LE CATABOLISME ANAEROBIE DU GLUCOSE

Le glucose qui entre dans la cellule est d'abord transIorme en glucose-6-phosphate par
l'addition d'un groupe phosphate Iourni par l'ATP. Cette reaction de phosphorylation est
catalysee par l'hexokinase en presence d'ions Mg

. Elle est irreversible. Rappelons qu'une


"kinase" est une enzyme qui catalyse le transIert d'un phosphate terminal de l'ATP sur un
accepteur, ici un hexose, d'ou le nom de "hexokinase".
Cette reaction permet d'activer le glucose, de le rendre reactionnel. De plus, elle
emprisonne le glucose dans la cellule, car le glucose-6-phophate n'est pas capable d'en
ressortir (molecule chargee pour laquelle il n'existe pas de transporteur).
111
Apres cette etape, le glucose-6-phophate peut soit tre utilise pour Iabriquer du
glycogene (animaux), de l'amidon (vegetaux), de l'energie sous Iorme d'ATP et du pyruvate
(glycolyse) ou du NADPH et des pentoses (cycle des phosphopentoses). Le glycogene et
l'amidon permettent de stocker le glucose pour plus tard, lorsque la cellule en aura besoin.
C'est par exemple ce qui se produit dans les cellules du Ioie et des muscles juste apres un
repas riche en sucres (glucose, saccharose ou polysaccharides).

4.1.1 LA CLYCOLYSE

La glycolyse a ete decouverte par les biochimistes Embden, MeyerhoII et Parnas. Elle
part du glucose et aboutit a la Iormation de pyruvate et a la recuperation d'un petit nombre
d'ATP. La glycolyse se deroule dans le cytoplasme. Il s'agit d'une suite de reactions
presentant 2 phases qui sont: (1) l'activation du glucose et sa scission en deux trioses
phosphates et (2) leur oxydation en pyruvate qui permet la recuperation d'ATP.


1 Phosphorylation du glucose par l'hexokinase comme
decrite ci-dessus.

2 Le glucose-6-phosphate est isomerise en Iructose-6-
phosphate. L'isomerisation (reversible) est catalysee
par la "glucose-6-phosphate isomerase".

3 Le Iructose-6-phosphate est phosphoryle en Iructose
1,6-bisphosphate par transIert d'un phosphate terminal
de l'ATP sous l'action d'une enzyme, la
"phosphoIructo-kinase" .

4 Le Iructose 1, 6-diphosphate est ensuite scinde
sous l'action d'une aldolase (lyase) en 2 molecules de
triose-phosphate : une molecule de
phosphodihydroxyacetone (carbones 1 a 3) et une
molecule de glyceraldehyde-3-phosphate (carbones 4 a
6). La reaction est reversible.

5 Le phosphodihydroxyacetone s'isomerise en
glyceraldehyde-3-phosphate. Comme dans la reaction
(2), il s'agit d'une transIormation reversible d'un
aldose-phosphate en cetose-phosphate.

112


Le bilan de ces 5 premieres etapes est l'investissement
de 2 molecules d'ATP pour transIormer une molecule
de glucose en deux molecules de glyceraldehyde-3-
phosphate.

6 La glycolyse se poursuit a partir des 2
glyceraldehyde-3-phosphate qui sont oxydes en 1,3-
diphosphoglycerate par une oxydoreductase a NAD


qui incorpore un phosphate mineral dans la molecule.
Pour chaque molecule de glucose utilisee par la
glycolyse, il y a donc deux molecules de
glyceraldehyde-3-phosphate transIormees en 1,3-
diphosphoglycerate et production de 2 NADH.

7 Cette reaction est importante: c'est une des rares
reactions qui permettent la synthese directe d'ATP par
couplage reactionnel (phosphorylation de l'ATP au
niveau du substrat). La phosphoglycerate-kinase
transIere le phosphate Iixe en C
1
du 1,3-
diphosphoglycerate sur l'ADP, Iormant de l'ATP et du
3-phosphoglycerate.

8 Le groupement phosphate du 3-
phosphoglycerate est deplace en C
2
, sous l'action d'une
isomerase, Iormant le 2-phosphoglycerate.

9 Sous l'action d'une enolase (une lyase), le 2-
phosphoglycerate perd une molecule d'eau, et est
transIorme en phosphoenolpyruvate.

10 Le groupement phosphate du
phosphoenolpyruvate est transIere sur l'ADP pour
Iormer de l'ATP et de l'enolpyruvate sous l'action de la
pyruvate-kinase. C'est la deuxieme reaction de
synthese directe d'ATP par couplage reactionnel.
L'enolpyruvate se transIorme spontanement en
pyruvate.
113
Le bilan de la glycolyse s'ecrit donc :

C
6
H
12
0
6
2 C
3
H
3
O
3
-
2H


2 NAD

2 NADH 2H


2 ADP 2 P
i
2 ATP 2H
2
O
-------------------------------------------------------------------------------------------------------
1 glucose C
6
H
12
0
6
2 NAD

2 P
i
2 ADP
2 pyruvates C
3
H
3
O
3
-
2 NADH 4H

2 ATP 2H
2
O

A pH physiologique, c'est le pyruvate (et non l'acide pyruvique) qui est produit. La
transIormation spontanee des 2 acides carboxyliques produits au cours de la glycolyse en
carboxylates produits 2 protons supplementaires. Dans l'equation globale, 4 protons sont donc
produits, qui sont necessaires pour equilibrer les charges et les masses dans l'equation
chimique. Ces 4 protons se combineront a l'eau (pour Iormer des ions H
3
O

) ou a des
composes basiques presents dans le cytoplasme.

Les coenzymes NAD

et ADP ne sont presents qu'en quantite catalytique dans le


cytoplasme. La glycolyse ne peut donc se realiser que dans la mesure ou l'ATP est
retransIorme en ADP (consommation d'energie) et ou le NADH est reoxyde en NAD

.
La premiere condition regule la glycolyse puisqu'elle empche un gaspillage : le
glucose n'est degrade qu'en cas de besoin energetique. Mais il est aussi necessaire que le
NADH soit reoxyde. Les besoins cellulaires en NADH sont relativement Iaibles, l'anabolisme
utilisant plutt le NADPH. Une autre possibilite est d'oxyder le NADH en NAD

au niveau
des mitochondries pour produire plus d'ATP en presence d'oxygene (voir la chane
respiratoire mitochondriale). C'est la voie habituellement suivie en presence d'oxygene et
appelee glycolyse arobie.

4.1.2 LA FERMEA1A1IOA

La Iermentation est une suite de reactions qui oxydent au maximum le glucose pour
en retirer le plus possible d'energie sous Iorme d'ATP et ceci en absence d'oxygene.
En absence d'oxygene, la cellule ne pourra pas continuer a oxyder le pyruvate en
produisant de l'ATP. D'autre part, le NADH doit tre retransIorme en NAD

. C'est donc a
partir du pyruvate que la cellule va reoxyder le NADH pour pouvoir continuer a produire son
ATP par la glycolyse. Selon le produit Iinal, il existe plusieurs types Iermentations diIIerentes
dont la Iermentation lactique et la Iermentation alcoolique.

La fermentation lactique est celle qui se deroule dans nos muscles en activite intense
quand la consommation en ATP est trop rapide par rapport a la diIIusion de l'oxygene
114
necessaire pour une respiration normale. L'accumulation de lactate provoque alors les
douleurs bien connues des athletes. Le lactate ainsi Iorme peut tre reoxyde en pyruvate puis
en CO
2
, lentement dans le Ioie.
Dans ce cas le NADH est utilise par une oxydoreductase pour reduire directement le
pyruvate :

CH
3
- CO - COO
-
NADH H

NAD

CH
3
- CHOH - COO
-

pyruvate lactate

La Iermentation lactique est aussi provoquee notamment par les bacteries
Lactobacillus bulgaricus et Streptococcus lactis qui utilisent le lactose du lait pendant la
transIormation de celui-ci en yogourt.

La fermentation alcoolique ne se produit pas chez l'homme. Elle est bien connue
depuis les travaux de PASTEUR (1871) sur la levure de biere (Saccharomvces cerevisiae), qui
est un anaerobie IacultatiI. En presence d'oxygene, la levure de biere respire normalement et
se developpe beaucoup: il se Iorme 1 g de levure a partir de 4 g de sucre en milieu de culture.
En absence de O
2
, les levures Iermentent et se developpent tres peu: il se Iorme 1 g de levure
a partir de 100 g de sucre.
Le glucose du jus sucre disparat, de l'alcool ethylique se Iorme et il se degage du
CO
2
. En mme temps, la temperature du jus s'eleve. La reaction globale est la suivante :

C
6
H
12
O
6
2 C
2
H
5
OH 2 CO
2
138 kJ

Lorsque le jus a atteint 10 a 15 d'alcool (pour certains vins, par exemple), la
reaction s'arrte car les levures ne supportent pas un degre d'alcool aussi eleve et meurent.
Cette Iermentation alcoolique s'opere aussi dans les organes riches en glucides (racines de
betteraves, Iruits sucres) lorsqu'ils sont prives d'oxygene.

Suite a la transIormation du glucose en pyruvate, les deux reactions suivantes se produisent:

a) le pyruvate est decarboxyle en acetaldehyde et CO
2
par une decarboxylase;
CH
3
- CO - COO
-
H

CH
3
- CHO CO
2

pyruvate acetaldehyde

b) l'aldehyde acetique est reduit en alcool ethylique par le NADH
CH
3
- COH NADH H

NAD

CH
3
- CH
2
OH (C
2
H
5
OH)
acetaldehyde ethanol

115
Rappelons que grce a l'une ou l'autre des reactions, le bilan en NADH est nul, ce qui
est indispensable pour que la glycolyse puisse se poursuivre. Le bilan de l'ATP est de 2
ATP. La plus grande partie de l'energie contenue dans le glucose est donc encore presente
dans l'ethanol (dont l'oxydation complete Iournit 7 kcalg).

4.1.3. LE CYCLE DES PHOSPHOPEA1OSES

La glycolyse n'est pas la seule voie possible pour degrader le glucose en absence
d'oxygene. Il en existe plusieurs autres, dont le cycle des phosphopentoses. Ce cycle peut
Ionctionner tres activement aussi bien chez les plantes et les animaux superieurs que chez les
micro-organismes.
Dans cette voie, contrairement a la Iermentation, le glucose est completement oxyde
en CO
2
toujours sans intervention de l'oxygene, mais il ne produit pas d'ATP. Au contraire, il
en consomme un. L'objectiI de ce cycle est de produire du NADPH necessaire pour toutes les
reactions de synthese de la cellule (anabolisme). Comme la glycolyse, ce cycle Ionctionne
dans le cytoplasme.

Ce cycle commence par deux reactions d'oxydation, ou deux electrons sont transIeres
aux NADP

pour produire du NADPH:



glucose-6-phosphate NADP

H
2
O NADPH acide phosphogluconique

acide phosphogluconique NADP

NADPH CO
2
ribulose-monophosphate (pentose)

Plusieurs molecules de ribulose-monophosphate subissent ensuite une serie de
transIormations complexes qui permettent de regenerer du glucose-6-phosphate. Pour 6
molecules de glucose-6-P qui entrent dans le cycle, une seule est decomposee et 5 sont
regenerees. Une molecule de phosphore inorganique (P
i
) est perdue.

6 Glucose-6P 12 NADP

6 H
2
O 5 Glucose-6P 6 CO
2
12 NADPH Pi

Comme a chaque rotation du cycle, 5 molecules de glucose-6-P sont regenerees et
qu'il ne Iaut alors qu'un apport d'une seule molecule de glucose (phosphorylee par ATP), le
bilan de chaque rotation est donc

C
6
H
12
O
6
12 NADP

ATP 6 H
2
O 12 NADPH
2
ADP P
i
6 CO
2

C'est-a-dire que pour chaque molecule d'hexose degradee, la "turbine" pourra Iournir 12
NADPH. De plus, il permet l'obtention de pentoses necessaires pour la synthese des acides
116
nucleiques, a partir d'hexoses. Il permet d'autre part, l'oxydation complete des pentoses en les
transIormant en glucose qui peut tre degrade dans la glycolyse. EnIin, tous les produits
intermediaires peuvent servir de base a des syntheses ulterieures.


4.2 LA RESPIRATION

La respiration est un phenomene qui se maniIeste exterieurement par des echanges
gazeux : absorption d'oxygene et degagement d'anhydride carbonique. La demonstration est
aisee : on place des champignons (qui ne photosynthetisent pas) dans un bocal
hermetiquement Ierme. On y ajoute dans un godet separe, de la soude caustique (NaOH) et on
Ierme hermetiquement. Apres un certain temps, on constate la Iormation de carbonate de
soude aux depens de NaOH et du CO
2
absorbe tandis que l'atmosphere du bocal est appauvrie
en O
2
:

(2 NaOH CO
2
Na
2
CO
3
H
2
O)

Beaucoup d'images comme la chaudiere ou le moteur Iont penser a une oxydation
directe par l'oxygene. Ce n'est pas le cas ici. L'oxydation directe n'est pas possible car
l'energie thermique degagee est d'une part irrecuperable par la cellule et d'autre part,
tellement brutale que les proteines seraient denaturees et que la cellule mourrait. Les
recherches ont au contraire montre que l'oxygene est la derniere molecule qui intervient dans
un processus progressiI, qui utilise de nombreuses etapes intermediaires. Ce systeme permet
a la cellule de recuperer environ 40 de l'energie degagee sous Iorme d'ATP.

La respiration comprend trois etapes:
- la glycolyse
- le cycle de Krebs
- la chane electronique mitochondriale ou chane respiratoire

4.2.1 LA CLYCOLYSE AEROBIE

La premiere etape est donc commune a la Iermentation et a la respiration. Elle se
deroule dans le cytoplasme. Elle aboutit au depart de glucose a la Iormation de deux
pyruvates et la production de 2 ATP et de 2 NADH:

1 glucose 2 NAD

2 P
i
2 ADP 2 pyruvates 2 NADH 4 H

2 ATP 2 H
2
O

Mais comme nous nous trouvons en conditions aerobies (presence d'oxygene), les
NADH

produits vont tre reoxydes, non plus en reduisant d'autres molecules comme dans la
Iermentation, mais par la chane respiratoire productrice d'ATP.
117
Un probleme se pose cependant: les NADH

sont produits dans le cytoplasme et la
chane respiratoire est localisee dans la mitochondrie. Or la membrane interne de la
mitochondrie est impermeable aux NADH (sinon ils n'y atteindraient jamais une
concentration suIIisante pour demarrer la chane respiratoire).
Il existe donc une "navette" qui va Iaire entrer dans la mitochondrie l'hydrogene des
NADH

sans que ceux-ci n'y rentrent eux-mmes. Ce systeme assez complexe va transIerer les
deux electrons du NADH au FAD avec production de FADH
2
Nous verrons dans le paragraphe sur le chane respiratoire que le FADH
2
produit 2 ATP.
Chacun des NADH produit dans le cytoplasme aboutit donc a la Iormation de 2 ATP dans la
mitochondrie.
Le bilan energetique de la glycolyse dans la respiration est donc de 6 ATP (2 de la
phosphorylation au substrat et 2 x 2 dans la mitochondrie).

4.2.1. LE CYCLE DE KREBS

Le pyruvate penetre dans le stroma de la mitochondrie ou se poursuit la respiration.
Le passage des deux membranes mitochondriales implique l'intervention d'un transport
passiI.
Une premiere reaction va transIormer le pyruvate en acetyl-coenzyme-A :

CH
3
- CO - COO
-
H

CoA-SH CH
3
- CO - CoA CO
2

2 H

2 electrons
NAD

2 H

2 electrons NADH H


-----------------------------------------------------------------------------------------------------
CH
3
- CO - COO
-
CoA-SH NAD

CH
3
- CO - CoA CO
2

NADH

Cette reaction est complexe puisqu'elle comprend a la Iois une decarboxylation (perte
de CO
2
), une oxydoreduction et l'accrochage du residu acetate sur la coenzyme A. Il n'est
donc pas etonnant qu'elle se deroule dans un complexe multienzymatique, exemple typique
de structure "quaternaire" des proteines.

L'acetyl-coenzyme-A enclenche alors le cycle de KREBS, (aussi appele cycle du
citrate): une suite de reactions qui vont oxyder les deux carbones du radical acetyl en 2 CO
2

avec production de coenzymes reduits.
La premiere etape de ce cycle Iixe le radical CH
3
- CO - et une molecule d'eau sur
l'oxaloacetate pour Iormer le citrate (derive de l'acide citrique C
6
H
8
O
7
). Le citrate va ensuite
subir une serie de transIormations qui degagent deux molecules de CO
2
, trois molecules de
NADH, un GTP et un FADH
2
. Le cycle s'acheve par le reIormation d'oxaloacetate, qui peut a
nouveau reagir avec l'acetyl-CoA (voir schema page suivante, donne pour inIormation). Ce
cycle se produit entierement dans le stroma de la mitochondrie.
118
Bilan du cycle de Krebs:

CH
3
- CO S CoA 3 H
2
O 2 CO
2
CoA-SH 8 H

8 electrons
3 NAD

6 H

6 electrons 3 NADH 3 H


FAD 2 H

2 electrons FADH
2

GDP Pi GTP H
2
O
---------------------------------------------------------------------------------
CH
3
- CO S CoA 2 H
2
O 3 NAD

FAD GDP Pi
2 CO
2

CoA-SH 3 NADH 3 H

FADH
2
GTP





Le cycle de Krebs
119
En partant du pyruvate :
CH
3
- CO - COO
-
2 H
2
O 4 NAD

FAD GDP Pi
3 CO
2

4 NADH 3 H

FADH
2
GTP

La glycolyse suivie du cycle de Krebs oxyde donc completement le glucose en CO
2
avec
production de coenzymes reduits (NADH et FADH
2
), de 2 ATP et de 2 GTP (qui peuvent
tre transIormes en 2 ATP). Le NADH et le FADH
2
doivent rapidement tre reoxydes, Iaute
de quoi le cycle s'arrte. Cette reoxydation ne peut se Iaire qu'en presence d'oxygene au
niveau de la chane respiratoire.

4.2.3. LA CHAIAE RESPIRA1OIRE

Dans l'atmosphere primitive de la Terre, il n'y avait pas d'oxygene. Les premiers tres
vivants ne pouvaient donc utiliser que la Iermentation et donc ne recuperer qu'une Iaible
partie de l'energie des molecules de la "soupe originelle". Il est probable qu'ils utilisaient
egalement des sources alternatives d'energie (metabolisme du souIIre, par exemple).
Progressivement, les bacteries photosynthetisantes ont degage de l'oxygene dans
l'atmosphere. Progressivement aussi, certaines bacteries ont appris a supporter cet agent
oxydant tres violent, puis a l'utiliser pour recuperer au maximum l'energie des molecules. Les
mitochondries actuelles sont vraisemblablement des descendants de ces bacteries ayant co-
evolue avec la cellule eucaryote Iermentante ancestrale (endosymbiose).

Nous retrouvons dans les mitochondries une chane respiratoire. Elle consiste en une
suite de reactions d'oxydoreductions qui permettent de transIerer progressivement les
electrons du NADH (et du FADH
2
) a l'oxygene dissout et de produire de l'ATP. Cette chane
est localisee dans la membrane interne de la mitochondrie.
Le mecanisme de couplage entre l'oxydoreduction du NADH et la production d'ATP a
longtemps ete un mystere pour les scientiIiques. MITCHELL a propose en 1961 une hypothese
expliquant la correspondance existant entre les chanes de transport d'electrons et la synthese
d'ATP sans lier cette derniere a des endroits precis de la chane. Selon cette theorie, la chane
respiratoire permet le pompage de protons dans l'espace intermembranaire. Ces protons sont
ensuite utilises par les Iacteurs de couplage pour Iabriquer de l'ATP. Apres avoir ete
vivement combattue pendant 15 ans, la theorie chimiosomotique de Mitchell est maintenant
bien etayee et acceptee.

Ce mecanisme peut tre divise en deux processus distincts: la chane electronique
proprement dite, et la synthese d'ATP par l'ATP synthetase.


120
La chane lectronique

Du point de vue energetique, la reaction du NADH avec l'oxygene peut tre comparee
a la reaction de l'hydrogene gazeux avec l'oxygene. Cette derniere produit une explosion. Au
cours de cette chane reactionnelle, le potentiel redox (cIr cours de chimie) passe
progressivement de -0,32 V (NADHNAD

) a 0,82 V (H
2
0O
2
).

La reaction globale de la chane respiratoire s'ecrit:

NADH H

O
2
H
2
O NAD

AE 1,14 V

Les electrons lorsqu'ils sont transIeres du NADH a l'oxygene parcourent une diIIerence de
potentiel standard de 1,14 V. On peut calculer qu'a cette diIIerence de potentiel correspond
une variation d'energie libre standard AG de -53 kcalmol. La reaction est donc Iortement
exothermique. Dans la mitochondrie, cette liberation d'energie va en Iait se Iaire
progressivement, en de multiples etapes.

Au debut de la chane respiratoire, le NADH cede ses deux electrons a un complexe proteique
transmembranaire qui contient plusieurs atomes de Ier qui prennent en charge
temporairement les electrons (en passant de l'etage d'oxydation 3 a 2) avant de les
transIerer a la coenzyme Q (appelee aussi ubiquinone, abreviation: CoQ).

NADH H

CoQ NAD

CoQH
2
AE 0,42 V

Le complexe utilise l'energie liberee par la reaction pour pomper trois protons de la matrice
mitochondriale vers l'espace intermembranaire. Ensuite, la Iorme reduite de la coenzyme Q
va donner ses electrons a un autre complexe proteique transmembranaire, contenant lui aussi
des atomes de Ier. Ce complexe transIere les electrons a une proteine de l'espace
intermembranaire: le cytochrome C, qui contient un atome de Ier insere dans une structure
particuliere (porphyrine) apparentee a l'heme de l'hemoglobine (voir groupement prosthetique
des proteines). L'energie liberee par cette etape va permettre de pomper 4 protons
supplementaires dans l'espace intermembranaire.

CoQH
2
2 cytochromes C (Fe

) CoQ 2 H

2 cytochromes C (Fe

)

EnIin, le cytochrome C donne ses electrons a un dernier complexe transmembranaire,
contenant des atomes de Ier et de cuivre, qui les transmettra a l'oxygene. Ce complexe pompe
lui aussi 4 protons dans l'espace intermembranaire.

121
2 cytochromes C (Fe

) 2 H

O
2
H
2
O 2 cytochromes C (Fe

)

Cette reaction termine la chane electronique. Chaque reaction est en Iait subdivisee en de
multiples petits transIerts entre atomes metalliques (Ier, cuivre). Si cette reaction se
produisait en une seule etape, l'energie liberee serait incontrlable. La multiplication des
etapes permet de recuperer un maximum d'energie, utilisee pour pomper des protons dans
l'espace intermembranaire.
Notons au passage que l'oxygene absorbe par la respiration ne sert pas directement a
Iabriquer le CO
2
, mais est transIorme en eau !

A1P synthtase et force protomotrice

Lors de chaque etape de la chane electronique, plusieurs protons sont pompes dans
l'espace intermembranaire. Il resulte de ce transport que le stroma mitochondrial tend a
s'alcaliniser, et l'espace intermembranaire a s'acidiIier. Comme la membrane est impermeable
aux protons, il se cree une diIIerence de pH de l'ordre de 1 unite. Les charges electriques
(H

) s'accumulant sur la Iace externe de la membrane interne, il se cree aussi un potentiel de


membrane d'environ 0,16V. Ce potentiel s'ajoute a la diIIerence de pH pour creer une force
protomotrice suIIisante pour Iaire reIluer les protons vers le stroma, au travers des Iacteurs
de couplage (constitues de proteines). C'est au niveau de ces Iacteurs de couplage que
l'energie du courant H

(force protomotrice) est utilisee pour realiser la reaction ADP Pi


ATP H
2
O. Ce complexe enzymatique Ionctionne donc comme un transporteur actiI de
proton dont les Ilux seraient inverses: au lieu d'utiliser de l'ATP pour Iaire passer les protons
vers un compartiment qui s'acidiIie (comme les lysosomes), les protons sortent spontanement
de l'espace intermembranaire et entranent la synthese d'ATP au passage. Les Iacteurs de
couplage, ou ATP synthetases, peuvent donc tre compares a des turbines a protons.

La synthese d'ATP au niveau de la chane mitochondriale s'appelle phosphorylation
oxydative, par opposition a la synthese d'ATP directe dans le cycle de Krebs et la glycolyse,
qui s'appelle phosphorylation au niveau du substrat, comme nous l'avons vu precedemment.

Le NADH permet le passage d'un nombre de protons suIIisant pour la synthese de 3
ATP. Si la premiere coenzyme de la chane est le FADH
2
, il transIere aussi ses electrons a la
CoQ, mais la diIIerence energetique de FAD a CoQ ne permet pas de pomper autant de
protons. Au total, une molecule de FADH
2
ne permettra que de produire 2 ATP. Rappelons
que le NADH produit au niveau du cytosol donnera un FADH
2
dans la mitochondrie et donc
deux ATP.

122
4.2.4. BILAA EAERCE1IQUE DE L'OXYDA1IOA DU CLUCOSE

En tenant compte des reactions que nous avons decrites dans la glycolyse et le cycle
de KREBS, nous pouvons ecrire :

C
6
H
12
O
6
6 H
2
O 6 CO
2
24 electrons 24 H


S'accompagne de la production de 2 ATP (glycolyse) 2 ATP (Krebs)
Les electrons et les protons sont pris en charge par 12 coenzymes reduits :
2 NADH (Glycolyse, cytoplasme) 2 FADH
2
(mitochondrie)
8 NADH 2 FADH
2
(Krebs, mitochondrie)

La chane respiratoire reoxydera les 12 coenzymes en utilisant de l'oxygene avec Iormation
de (2 . 2) (8 . 3) (2 . 2) 32 molecules ATP (phosphorylation oxydative):

6 O
2
24 electrons 24 H

12 H
2
O

L'equation globale devient :

C
6
H
12
O
6
6 O
2
36 ADP + 36 Pi 6 CO
2
6 H
2
O 36 ATP + 36 H
2
O

Le resultat de la respiration est la liberation de l'energie chimique accumulee dans les
produits organiques synthetises par la cellule vivante. L'oxydation chimique d'une mole de
glucose libere 2870 kilojoules. Mais comme nous l'avons deja souligne, la cellule ne pourrait
supporter cette Iorme d'oxydation brutale des substrats organiques.
Au contraire, dans la respiration, l'oxydation realisee etape par etape permet de
conserver une grande partie de cette energie sous Iorme d'ATP. Le rendement de la
respiration du glucose peut tre calcule :
- l'oxydation d'une mole de glucose libere 2 870 kJoules.
- lors de la respiration, il se Iorme 36 moles d'ATP qui renIerment chacune 30,5 kJoules.
Par consequent, la cellule vivante a conserve 36 . 30,5 1100 kJoules sous Iorme d'ATP, soit
+ 40 de l'energie disponible (par comparaison, dans le meilleur moteur a combustion, le
taux de recuperation est d'environ 25 ).

En nutrition, on preIere compter en calories plutt qu'en kilojoules. 2870 kJ
equivalent a 686 kcal. Le glucose ayant un poids moleculaire de 180 Da, la valeur
energetique du glucose - et des glucides en general - est donc de 686180 3,8 kcalgramme.



123
4.2.5. L'U1ILI1E DU CA1ABOLISME DU CLUCOSE

L'utilite premiere du catabolisme du glucose est evidemment la recuperation
energetique. L'energie chimique transIeree dans l'ATP sera utilisee a l'execution de divers
travaux ou activites dont les principaux sont :
1 le travail osmotique et notamment dans le transport actiI des aliments qui se Iait a
l'encontre du gradient de concentration;
2 le travail mecanique : (energie cinetique) exige pour l'execution de mouvements divers
intracellulaires ou des deplacements; elle est utilisee egalement pour le travail
musculaire.
3 le travail chimique : la synthese des molecules complexes lors de l'anabolisme;
4 lemission de chaleur: chez les animaux a sang chaud, l'energie liberee par la respiration
sous Iorme de chaleur est utilisee pour elever ou maintenir la temperature de l'organisme.
Certains organismes sont egalement capables d'emettre de la lumiere (phosphorescence).

Mais l'ensemble des mecanismes de degradation du glucose: glycolyse, cycle de
KREBS, cycle des phosphopentoses Iournissent aussi des materiaux intermediaires qui servent
de point de depart a d'autres syntheses. Par exemple :
- l'acetylcoenzyme A est au depart de la synthese des acides gras et du cholesterol;
- le phosphodihydroxyacetone peut tre reduit en glycerol (utilise dans les phospholipides et
les triglycerides);
- de nombreux intermediaires, comme le pyruvate, peuvent tre transIormes en acides amines
par ajout d'une Ionction amine.
Le catabolisme du glucose constitue donc un grand carreIour du metabolisme cellulaire.

4.3 CATABOLISME DES LIPIDES

Les triglycerides et phospholipides peuvent tre hydrolyses par des lipases en acides
gras et glycerol. Le glycerol est transIorme en phosphodihydroxyacetone et degrade en
suivant la glycolyse.
Les acides gras contiennent une grande quantite d'energie: 9 kcalg. Ils sont utilises
pour le stockage d'energie chimique a long terme. Leur oxydation ne peut se Iaire qu'en
presence d'oxygene, car elle Iait appel au NAD

et au FAD, qui ne doivent tre re-oxydes par


la chane respiratoire. Les acides gras sont transIormes en acyl-coenzyme A par liaison au
CoA-SH, puis degrades progressivement par un cycle appele bta-oxydation, qui se deroule
dans la mitochondrie. A chaque cycle, deux carbones sont detaches de l'acide gras sous Iorme
d'un acetyl-coenzyme A, en reduisant un NAD

et un FAD. Comme le NADH est produit


dans la mitochondrie (contrairement a celui produit par la glycolyse), il permet de synthetiser
3 ATP en presence d'oxygene, plus 2 pour le FADH
2
. L'acetyl-coenzyme A est ensuite
124
degrade dans le cycle de Krebs (12 ATP). L'acide gras de depart se reduira a deux atomes de
carbone: l'acetyl-coenzyme A. Une molecule d'acide stearique, un des acides gras satures les
plus repandus (18 atomes de carbone), donnera donc 9 acetyl-CoA en 8 cycles, soit (12 . 9)
(5 . 8) 148 molecules d'ATP, moins deux pour activer l'acide gras en acyl-Coenzyme A,
soit 146 ATPmolecule d'acide stearique !

La structure polycyclique du cholesterol et des sterodes ne peut pas tre detruite dans
les cellules humaines. Le cholesterol est oxyde en acides biliaires, qui sont excretes dans la
bile et jouent un rle important dans la digestion des lipides. Cette oxydation ne Iournit
qu'une Iaible quantite d'energie.


4.4 CATABOLISME DES ACIDES AMINES

Bien que les protides contiennent presque autant d'energie que les glucides (environ 4
kcalg), les tres vivants puisent normalement dans leurs glucides pour couvrir leurs besoins
energetiques. Ils n'utilisent leurs proteines que quand les autres reserves sont epuisees. La
raison en est simple: la synthese d'un acide amine et des proteines est une operation
complexe, coteuse en energie, diIIicile au point que nous ne sachions pas en Iabriquer nous
mmes 8 sur les 20 que nous utilisons.
Certains animaux mangent une quantite importante de proteines, qui Iournissent par
hydrolyse plus d'acides amines que ce qui est necessaire pour la synthese des proteines
cellulaires. Dans ce cas, les acides amines peuvent tre oxydes pour Iabriquer de l'ATP.
Chez les mammiIeres, certains organes, comme le cerveau, ont un besoin vital de
glucose, dont la concentration sanguine doit tre maintenue a un certain niveau, Iaute de quoi
l'individu tombe dans le coma. Pour maintenir cette concentration entre les repas, le Ioie
utilise d'abord ses reserves de glycogene. Lorsque celles-ci sont epuisees, des acides amines
(provenant de proteines) seront utilises pour Iabriquer du glucose par une voie appelee
neoglucogenese, qui emprunte de nombreuses reactions reversibles de la glycolyse. Les
cellules du Ioie ne peuvent pas utiliser de lipides pour Iabriquer le glucose, car cette voie de
synthese n'existe pas chez l'homme. Par contre, elle existe chez les plantes, dans les
peroxysomes.
L'hydrolyse des proteines en acides amines ne produit pas d'energie. Au contraire, elle
en consomme un peu (voir proteasomes). Chaque acide amine est ensuite degrade selon une
voie qui lui est propre mais qui aboutit toujours a une molecule qui peut tre oxydee par les
mmes reactions que celles du catabolisme du glucose. A titre d'exemple :
ALA, CS, SER, GL, THR donnent du pyruvate,
LEU, LS, PHE, TR, TRP donnent de l'acetyl-coenzyme A,
ILE, MET et VAL donnent le succinyl-CoA (cycle de Krebs),
125
PHE et TR le Iumarate (cycle de Krebs),
ASN et ASP l'oxalacetate (cycle de Krebs),
ARG, GLN, HIS et PRO se transIorment en GLU (glutamate) qui par transamination
donne le cetoglutarate (cycle de Krebs).

Les acides amines peuvent tre completement oxydes en CO
2
avec liberation d'azote
sous Iorme d'ure, qui est excretee dans l'urine. Certains animaux, comme les oiseaux,
excretent des sels d'ammonium. Pour les animaux et l'homme, l'azote qui est transIorme en
uree ou en ammonium est perdu: il ne peut pas tre reincorpore dans des acides amines et doit
tre excrete. L'uree et surtout les ions ammonium peuvent mme tre toxiques s'ils
s'accumulent dans l'organisme.
Un systeme enzymatique Iaisant appel a des amino-transIerases permet de conserver le
groupement amine d'un acide amine qui est degrade, aIin de Iabriquer un autre type d'acide
amine. On appelle ce type de reaction une transamination: la Ionction amine est transIeree
d'une molecule a l'autre. Ainsi, la degradation d'un acide amine peut tre couplee a la
synthese d'un autre dont la cellule a besoin. Ce mecanisme est important car la proportion des
diIIerents acides amines dans l'alimentation ne correspond pas toujours aux besoins reels des
cellules. C'est particulierement le cas des proteines alimentaires d'origine vegetale. Les
animaux degradent donc les acides amines en trop tout en gardant les Ionctions amines pour
synthetiser ceux dont ils ont besoin. Ce mecanisme est bien sr limite aux acides amines que
l'individu peut synthetiser (12 pour l'homme).


4.5 CATABOLISME DES ACIDES NUCLEIQUES

Les acides nucleiques ne sont normalement pas presents en quantites importantes dans
l'alimentation. De plus, digerer ses propres acides nucleiques correspondrait a un suicide.
Seuls les acides nucleiques "en trop" sont donc degrades, d'abord en nucleotides par
hydrolyse (sans liberation ni consommation d'ATP). Les nucleotides donnent ensuite:
- du phosphate, qui peut tre reutilise ou excrete.
- du ribose (ou desoxyribose), qui est oxyde et permet de recuperer une quantite appreciable
d'ATP.
- une base azotee : les bases pyrimidiques sont oxydees en CO2 et uree, alors que les bases
puriques sont transIormees en acide urique, qui est excrete. Une accumulation d'acide urique
dans l'organisme, suite a un probleme d'excretion peut conduire a une precipitation d'acide
urique dans les articulations, extrmement douloureuse. Cette maladie est appelee "la goute",
et peut tre traitee a l'aide d'un inhibiteur d'une des enzymes qui degradent les bases puriques.
126

5. L'ANABOLISME
____________________________________

Nous ne verrons que quelques-unes des voies anaboliques utilisees par les cellules,
sans entrer dans les details des reactions biochimiques. La synthese des proteines sera traitee
dans un chapitre separe, ainsi que la synthese des acides nucleiques.

5.1 LA SYNTHESE DU GLUCOSE

Nous avons deja mentionne le Iait que chez l'homme, le glucose soit necessaire au bon
Ionctionnement du cerveau. Entre les repas, lorsque le glycogene est epuise, le Ioie doit
synthetiser du glucose a partir d'autres molecules : les acides amines. Cette synthese, qui
demande un investissement en energie sous Iorme d'ATP et de NADH, s'appelle la
noglucogense. Elle utilise les mmes intermediaires que la glycolyse et se deroule
egalement dans le cytoplasme. Certaines reactions equilibrees de la glycolyses (notamment
les isomerisations) sont utilisees par la neoglucogenese, alors que d'autres sont catalysees par
des enzymes diIIerentes. Un systeme complexe de regulation de l'activite des enzymes
permet a la cellule d'empcher que les deux voies, glycolyse et neoglucogenese, Ionctionnent
en mme temps, ce qui produirait un cycle Iutile.

Les hommes sont incapables de transIormer les acides gras en glucose, car l'acetyl-
coenzyme A ne peut pas tre transIorme en pyruvate (la reaction inverse est irreversible). Les
plantes par contre, possedent une serie d'enzymes capables de transIormer l'acetyl-coenzyme
A en glucose. Cette transIormation permet notamment aux graines qui contiennent beaucoup
de graisses de synthetiser le glucose dont elles ont besoin pour Iabriquer la cellulose des
parois cellulaires. Cette voie metabolique implique notamment les peroxysomes.

5.2 LA PHOTOSYNTHESE

Les plantes, les cyanobacteries et certains protistes (algues) sont capables d'utiliser
l'energie lumineuse pour synthetiser leurs composants.
La croissance des plantes, la synthese de leur propre substance - en l'absence de tout
systeme digestiI visible - a Iait l'objet de recherches anciennes. Le belge VAN HELMONT en
1648 et une serie d'autres chercheurs mirent au point progressivement une equation generale
de la photosynthese :

127

CO2 H2O O2 amidon
lumiere, chloroplaste


Contrairement aux autres organismes, en presence de lumiere, les plantes absorbent du CO
2

et degagent de l'O
2
. De plus, on savait depuis 1779 que la photosynthese ne se realise que
dans les tissus verts, qui contiennent de la chlorophylle presente dans les chloroplastes. La
chlorophylle est une molecule plane de la Iamille de porphyrines, apparentee a l'heme de
l'hemoglobine et des cytochromes. Elle contient un atome de magnesium (au lieu du Ier de
l'heme). La chlorophylle a la propriete d'absorber la lumiere, avec un maximum dans le rouge
(entre 650 et 700 nm) et un autre - un peu plus eleve - dans la region du bleu au violet (de 400
a 450 nm). Elle absorbe relativement peu le vert, ce qui explique sa couleur.
La photosynthese se deroule en deux etapes: la phase dite "claire", qui ne se deroule
qu'en presence de lumiere, et la phase "sombre".

La phase claire de la photosynthse

Lors de la phase claire, qui se deroule dans la membrane des grana, l'energie des
photons absorbes par la chlorophylle est utilisee pour arracher deux electrons a un atome
d'oxygene d'une molecule d'eau, et les transIerer au NADP

, en suivant une chane de


transIert d'electrons comparable a celle des mitochondries. L'equation de cette phase s'ecrit:

H
2
O NADP

lumiere O
2
NADPH H



L'oxygene libere provient de la scission de molecules d'eau et non du CO
2
. Ceci a ete
demontre par Ruben en 1941 en marquant l'eau ou le CO
2
a l'aide d'un isotope lourd de
l'oxygene:
18
O. Cet isotope ne se retrouvera dans l'oxygene libere par la plante que s'il etait
present au depart dans l'eau.
Cette reaction d'oxydoreduction se deroule grce a deux complexes proteiques inseres dans la
membrane des grana: les photosystemes I et II. Ces photosystemes utilisent l'energie
lumineuse pour activer les electrons donnes par l'eau, ce qui permet de les transIerer au
NADP

.

D'autre part, l'energie absorbee par la chlorophylle est aussi utilisee pour pomper des
protons dans l'espace a l'interieur des grana. Ceci permet, par un mecanisme semblable a
celui que nous avons vu dans la mitochondrie, de synthetiser de l'ATP a partir d'ADP et de
phosphate grce a une ATP synthetase utilisant la Iorce protomotrice.

128
La phase claire produit donc des coenzymes riches en energie (NADPH et ATP)
utilisables par les voies anaboliques de la plante.

La phase sombre de la photosynthse

Les principaux resultats concernant la seconde phase de la photosynthese sont dus a
CALVIN et ses collaborateurs (1955). Pour cette raison, cette phase est Irequemment appelee
"cycle de Calvin". Cette voie, qui se deroule dans le stroma des chloroplastes, utilise le
NADPH et l'ATP produits par la phase claire pour reduire le carbone du CO
2
et l'incorporer
dans des sucres. La Iixation d'une molecule de CO
2
consomme 2 NADPH et au moins 3 ATP.
Le premier sucre Iabrique est le glyceraldehyde-3-phophate (voir glycolyse), qui peut tre
utilise pour Iabriquer du glucose et d'autres composes.

6 CO
2
12 NADPH 12 H

18 ATP C
6
H
12
O
6
12 NADP

18 ADP 18 Pi

Le carbone et l'oxygene du glucose proviennent donc du CO
2
, alors que l'hydrogene provient
de l'eau, par l'intermediaire du NADPH.
Le rendement energetique global de la photosynthese (quantite d'energie lumineuse absorbee
divisee par la quantite d'energie chimique stockee dans les sucres produits) est de l'ordre de
20.

La photosynthese a joue un rle essentiel dans l'evolution des tres vivants en
introduisant l'oxygene sur Terre, ce qui a permis le developpement de la respiration. On
pense que tout l'oxygene de l'atmosphere terrestre a ete produit par photosynthese, par les
vegetaux, les cyanobacteries et les algues. De plus, la photosynthese est le seul mecanisme
eIIicace permettant de Iabriquer de grandes quantites de composes organiques riches en
energie chimique, base de l'alimentation des animaux, des champignons, de certains protistes
et de nombreuses bacteries. Si la vie sur Terre est possible sans photosynthese, sous Iorme de
bacteries exotiques, elle n'aurait jamais atteint ce niveau de complexite sans ce mecanisme
capable de capter l'energie du soleil.


5.3 LA SYNTHESE DES ACIDES GRAS ET DU CHOLESTEROL

Les lipides ou matieres grasses assurent dans le metabolisme et dans les structures
cellulaires un grand nombre de Ionctions importantes : reserves d'energie, recouvrement
impermeable de l'epiderme, structure des membrane cellulaire, etc. Chez les animaux, les
129
reserves de lipides sont particulierement importantes puisqu'a poids egal elles permettent
d'emporter deux Iois plus d'energie que le glycogene. Chez l'homme, ce dernier suIIit aux
besoins d'une journee, tandis que ses reserves de graisses lui permettent de survivre pendant
un mois. Chez les plantes, les reserves lipidiques se trouvent surtout dans les graines
oleagineuses.

Synthse des acides gras

Les acides gras naturels possedent en general un nombre pair d'atomes de carbone. Ils
proviennent en eIIet de l'accrochage cyclique suivi de la reduction de plusieurs unites en C
2
:
l'acetate actiI ou acetyl-coenzyme A, qui provient de la decarboxylation du pyruvate
provenant lui-mme de la glycolyse. Les acides gras peuvent donc tre synthetises aussi bien
a partir de sucres que de certains acides amines. L'utilisation de l'acetyl-coA comme
precurseur des acides gras explique que la majorite des acides gras naturels possedent un
nombre pair d'atomes de carbone. Les acides gras les plus importants possedent 16 ou 18
atomes de carbones.
La synthese et la desynthese des lipides doivent se realiser en des endroits diIIerents
car a l'equilibre, ce sont les reactions de desynthese qui sont Iavorisees. Nous avons vu que la
desynthese par la -oxydation se Iaisait dans le stroma de la mitochondrie. La synthese se
realise dans le cytoplasme chez les animaux et dans le chloroplaste chez les vegetaux.
La synthese des acides gras consomme une quantite importante d'energie, sous Iorme
de NADPH (produit notamment par le cycle des phosphopentoses) et d'ATP.
Les acides gras sont ensuite esteriIies avec du glycerol en triglycerides (stockage) ou
en phospholipides (membranes cellulaires) au niveau du reticulum endoplasmique lisse.

Synthse des strodes

Les sterodes, comme le cholesterol, sont produits par une voie de synthese tres
diIIerente de celle des acides gras, trop complexe pour tre exposee ici, mais qui utilise la
mme brique de base: l'acetyl-coenzyme A. Elle se deroule dans le reticulum endoplasmique.

130

6. DU GENE A LA PROTEINE
____________________________________________

L'assemblage des acides amines, la synthese des proteines, revt une importance toute
particuliere. En eIIet, alors que les glucides et les lipides englobent un nombre "relativement
limite" - quoique tres eleve ! - de varietes chimiques diIIerentes et constituent principalement
des produits de reserve temporaires, le nombre de proteines diIIerentes est incalculable et leur
rle est primordial dans la vie cellulaire.
La Ionction de chaque proteine depend de sa structure tertiaire et quaternaire
provenant elle-mme des replis de la chane des acides amines constitutiIs de la proteine.
Cette ediIication precise n'est possible que si la structure primaire de la proteine s'est
parIaitement realisee ... laquelle est determinee par le nombre, la nature et l'ordre des acides
amines impliques dans cet ediIice moleculaire. La synthese des proteines doit tre executee
en suivant scrupuleusement un protocole extrmement precis transmis invariablement d'une
generation cellulaire a l'autre. L'inIormation qui permet la synthese de chaque proteine est
codee par un gene. Le gene ne permet pas la synthese directe d'une proteine, mais la synthese
d'ARN messager, qui sert d'intermediaire dans le processus de Iabrication de toutes les
proteines.
La deIinition precise du gne est : un segment d'ADN qui contient l'inIormation
necessaire a la synthese d'un ARN, et en general (si cet ARN est un ARN messager) d'une
proteine. Chaque gene a une position precise sur un chromosome. On appelle cette position le
locus du gene (au pluriel, loci). Il existe au moins 30000 genes diIIerents dans le genome
humain, c'est-a-dire dans l'ensemble du materiel genetique (ADN) humain. Certains genes
(environ 500 dans le genome humain) encodent des ARN ribosomaux et des ARN de transIert
qui n'encodent pas de proteines mais jouent un rle important dans leur synthese. Les autres
encodent des ARN messagers.
L'etape de synthese d'un ARN a partir d'un gene s'appelle transcription. L'etape au
cours de laquelle un ARN messager est lu pour synthetiser une proteine s'appelle traduction.

6.1 LE CODE GENETIQUE

Sachant que la sequence lineaire des acides amines d'une proteine correspond a une
sequence lineaire de bases de l'ADN, les chercheurs ont pu determiner le systeme de codage
ou code gntique qui permet de representer les 20 acides amines au moyen des 4 bases de
l'ADN (A, T, G, C). La logique conduit a penser qu'a chaque acide amine correspond non pas
une, mais plusieurs bases de l'ADN.
Si chaque acide amine etait represente par 2 bases (deux nucleotides successiIs), le
nombre de combinaisons possibles que l'on peut realiser, donc d'acides amines que l'on peut
131
coder, serait de 4
2
16 : ce qui est insuIIisant. Si un acide amine est code par un groupement
de 3 bases successives de l'ADN (un triplet), le nombre de combinaisons possibles est de 4
3

64. C'est la solution retenue par la nature. Il existe donc plus de triplets (64) que d'acides
amines codes (20). On aurait pu imaginer qu'un certain nombre de triplets ne correspondent a
aucun acide amine. Cette solution ne serait pas viable car 23 des triplets seraient non-sens et
la moindre mutation bloquerait la synthese des proteines. Dans la nature, plusieurs triplets
diIIerents peuvent speciIier le mme acide amine. On dit que le code est dgnr. Par
contre, un triplet donne code toujours le mme acide amine. Cette solution a l'avantage qu'une
mutation peut passer inaperue ou ne modiIier que legerement la sequence. Nous y
reviendrons.

Dans les annees 60, les chercheurs ont dechiIIre pas a pas le code, c'est-a-dire la
correspondance exacte entre chacun des 64 triplets et un acide amine. Ils ont pu montrer que:
- Trois triplets TGA, TAG et TAA ne correspondent a aucun acide amine et provoquent
l'arrt de la synthese proteique: ce sont les triplets de terminaison ou les triplets STOP.
- Seuls deux acides amines ne sont codes que par un seul triplet : la methionine (triplet
ATG) et le tryptophane (TGG).
- 9 acides amines sont codes par deux triplets diIIerents: dans ce cas la troisieme base est
soit T ou C (n'importe quelle base courte), soit A ou G (n'importe quelle base longue)
- A l'exception de l'isoleucine qui est codee par 3 triplets diIIerents, tous les autres acides
amines sont codes par au moins 4 triplets diIIerents et dans ce cas, les deux premieres
bases sont Iixes et la troisieme n'a plus d'importance (base "Ilottante"). C'est le cas de la
leucine: CTA, CTG, CTT, ou CTC.
Les triplets sont contigus et non chevauchants: une base ne Iait partie que d'un seul triplet.

Les recherches entreprises jusqu'ici concluent que le code genetique est universel;
autrement exprime : le mme triplet code le mme acide amin chez tous les tres vivants,
des bactries aux vgtaux et l'homme. Cette regle ne souIIre que de tres rares exceptions
dans les mitochondries et chez certains protozoaires, ou le code est legerement diIIerent.

6.2. LE MECANISME DE LA PROTEOSYNTHESE

L'ADN, situe dans le noyau, n'intervient pas directement dans la synthese des
proteines, qui se realise par l'intermediaire des ARNm qui sont produits dans le noyau et en
sortent avant d'tre traduits au niveau des ribosomes. Les autres types d'ARN, ARNt et ARNr,
interviennent aussi dans la synthese. Celle-ci est catalysee par des enzymes speciIiques et
l'energie necessaire aux diverses reactions biochimiques est Iournie par l'ATP et le GTP.


132
LA TRANSCRIPTION

La premiere etape est la transcription du "dialecte" ADN en "dialecte" ARN, deux
dialectes de 4 lettres (bases) tres voisins, appartenant au mme langage nucleique. Le passage
de l'un a l'autre est aise puisqu'il s'agit d'une simple copie ou transcription de mots genetiques
respectant l'ordre des lettres. A chaque base de l'ADN correspond une base de l'ARN. Les T
sont simplement remplaces par des U, et le desoxyribose des nucleotides par du ribose.

Un groupe d'enzymes ouvre l'ADN bicatenaire du gene en separant les deux brins, et
l'ARN-polymerase synthetise l'ARN
m
au contact d'un seul des deux brins de l'ADN par
accrochage successiI des bases complementaires. Le brin qui sert de matrice est appele par
convention brin ngatif. Il est complementaire de l'ARN. L'autre brin d'ADN est appele brin
positif, il est lui aussi complementaire du brin negatiI et correspond donc a la sequence de
l'ARN, les U etant remplaces par des T. Les unites de base dont se sert l'ARN-polymerase
sont des nucleotides triphosphates. Lors de l'accrochage, deux phosphates sont detaches du
nucleotide, ce qui libere l'energie necessaire a la Iormation du lien entre le nucleotide et
l'ARN en Iormation. Comme pour tous les acides nucleiques, l'ARN est Iabrique dans le sens
5' vers 3'. Dans les cellules eucaryotes, la synthese de l'ARN se deroule evidemment dans le
noyau.


#$%&

'()#*)#+)*+++)*+++#++#)**++###++##+##*+###*#))++**+))*#,,, -(.
////////////////////////////////////////////////////////
-(#)+#)*#+***#+***)**)#++**)))**))*))*+)))+)##**++*##+),,, '(!

0
#1%&

'(2#*2#+2*+++2*+++#++#2**++###++##+##*+###*#22++**+22*#,,, -(.


LA MATURATION DE LARN MESSAGER

Chez les eucaryotes, l'ARN
m
est "retravaille" dans le noyau. Certaines sequences de
bases denommees introns sont excisees du message et les parties restantes, les exons, sont
ressoudees. Cette etape est appelee pissage de l'ARN (l'anglais "splicing" egalement utilise).
Un groupe chimique est ensuite ajoute au debut de l'ARN (sur l'extremite 5'), il s'agit de la
coiffe. En Iin de message, une sequence de 100 a 250 bases adenine appelee "poly A"
prolonge l'extremite 3'. On passe ainsi d'un ARN-premessager a l'ARN-messager. Ces
operations prennent du temps, si bien que l'ARNm eIIicace ne se retrouve dans le cytoplasme
133
qu'une vingtaine de minutes apres le debut de sa synthese. L'ARNm sort du noyau par les
pores nucleaires. Cette etape de maturation n'existe pas chez les bacteries.

LA TRADUCTION

Le groupe de trois bases de l'ARN
m
correspondant au triplet de l'ADN, s'appelle
CODOA. Chaque triplet ne pouvant tre transcrit qu'en un seul codon, chaque codon
correspond un seul acide amin. Il "suIIit" donc de lire les codons pour connatre la
sequence de la proteine correspondante. Voici, a titre d'exemple, le tableau des codons et
leurs acides amines correspondants.

1e 2e base 3e
U C A G
U
PHE
PHE
LEU
LEU
SER
SER
SER
SER
TYR
TYR
STOP
STOP
CYS
CYS
STOP
TRP
U
C
A
G
C
LEU
LEU
LEU
LEU
PRO
PRO
PRO
PRO
HIS
HIS
GLN
GLN
ARG
ARG
ARG
ARG
U
C
A
G
A
ILE
ILE
ILE
MET
THR
THR
THR
THR
ASN
ASN
LYS
LYS
SER
SER
ARG
ARG
U
C
A
G
G
VAL
VAL
VAL
VAL
ALA
ALA
ALA
ALA
ASP
ASP
GLU
GLU
GLY
GLY
GLY
GLY
U
C
A
G

ARN de transfert

La traduction se prepare dans le cytoplasme. Les ARNt prennent en charge un acide
amine bien speciIique qui est lie de Iaon covalente par une ligase qui utilise de l'ATP.
L'acide amine est toujours Iixe par son COOH a l'extremite 3' CCA de l' ARNt (voir schema
ci-dessous). Plusieurs ARNt portant des anti-codons diIIerents peuvent ainsi tre charges par
le mme acide amine. Certains ARNt peuvent aussi reconnatre plusieurs codons qui
correspondent au mme acide amine. Il existe en eIIet seulement 48 ARNt diIIerents chez
l'homme, pour 20 acides amines et 64 codons. Chaque ARNt possede une sequence de trois
nucleotides complementaires du codon correspondant a l'acide amine qu'il porte: l'anti-
codon. Cet anti-codon est localise dans une boucle a l'oppose de l'extremite qui porte l'acide
amine.
Dans ce tableau, les codons se
lisent de la gauche vers la
droite. Par exemple, PHE
correspond a UUU ou UUC.
134

Les ribosomes

La suite de la traduction se deroule au niveau des ribosomes du cytoplasme. Les
ribosomes sont visibles sous Iorme de petits grains au microscope electronique. Au depart, les
ribosomes ont ete isoles et etudies par sedimentation (mesuree en unites Svedberg S, cIr cours
de physique). En 2000, leur structure precise a ete determinee par cristallisation et diIIraction
aux rayons X. Ils sont constitues de deux sous-unites, appelees sous-unite lourde 60S et sous-
unite legere 40S (chez les eucaryotes). Chaque sous-unite contient une grande molecule
d'ARN ribosomal (ARNr 28S et 18S, pour les sous-unites lourde et legere, respectivement) et
des proteines. La sous-unite lourde contient deux petites molecules d'ARNr supplementaires
(5S). Les ARNr, qui representent deux tiers du poids du ribosome, constituent non seulement
sa charpente, mais aussi son site actiI. Plusieurs etapes essentielles de la synthese des
proteines sont en eIIet directement catalysees par les ARNr. Il s'agit donc d'un des rares
exemples d'activite enzymatique portee par un ARN et non par une proteine. Le ribosome est
une ribozyme. Le ribosome bacterien est tres semblable au ribosome eucaryote mais il est
plus petit (70S au total, deux sous-unites de 50S et 30S). Les ribosomes Ionctionnent de la
mme Iaon dans tous les tres vivants.

L'initiation de la traduction

L'initiation de la synthese de la proteine est relativement complexe. Ou commencer
la lecture de l'ARNm ? Une erreur de positionnement du premier codon entranerait la
production d'une proteine diIIerente puisque tous les codons seraient decales. Le codon
initiateur de la proteosynthese est AUG (triplet ATG de l'ADN). Il permet la mise en place
d'un ARN
t
AA particulier, dont l'anti-codon est CAU et qui est porteur de l'acide amine
methionine. Grce a l'intervention de 3 proteines particulieres (Iacteurs d'initiation) et d'un
Structure d'un ARNt
135
GTP Iournissant l'energie, la partie legere du ribosome s'associe a l'ARN
m
et a ce premier
ARN
t
Met. Ce complexe peut alors recevoir la partie lourde (60 S) du ribosome et devenir
Ionctionnel. Cet ensemble est localise sur le site P P pour "peptide" de la sous-unite lourde
60 S.

L'longation

Suit alors le cycle de l'elongation de la proteine. Chaque tour du cycle ajoute un acide
amine a la proteine naissante, et les mmes operations sont chaque Iois repetees, quelque soit
la longueur deja synthetisee de la proteine.



a) Un nouveau complexe ARN
t
AA vient se Iixer a l'ARNm au niveau du site A du
ribosome (A pour Acide Amine ou Accrochage), juste a cote du site P. Cette Iixation
consomme un GTP. Pour que cette Iixation ait lieu, il Iaut que l'anticodon de l'ARN
t
(les
3 bases non appariees de la boucle terminale) soit complementaire du codon de l'ARN
m
.
Il s'agit du codon adjacent a celui qui vient d'tre lu. Par exemple, au codon GAG de
l'ARN
m
se couple l'anticodon CUC de l'ARN
t
porteur de lacide glutamique (E).
b) Une enzyme du ribosome catalyse la Iormation d'un lien peptidique entre le COOH de
l'acide amine Met (ou de l'extremite COOH de la chane polypeptidique deja presente) au
site P et le NH
2
libre du nouvel acide amine au site A.
Cette reaction decroche la chane polypeptidique de l'ARN
t
(ici Met, M) Iixe au site P et
l'accroche a l'acide amine (Glu, E) de l'ARN
t
Iixe au site A.
La chane s'est ainsi allongee d'un nouveau maillon : Met - Glu.
c) Il se realise un "deplacement relatiI" du ribosome par rapport au complexe ARN
m
-ARN
t
-
proteine : l'ARN
m
"avance" d'un codon et deplace ainsi le complexe ARN
t
-peptide (ici
Met-Glu) du site A au site P. L'ARNt qui portait Met se retrouve au site E ("exit"), d'ou il
136
est expulse du ribosome. Ces mouvements necessitent un deuxieme GTP, expose un
nouveau codon au systeme de lecture du ribosome.
d) Le cycle recommence au point a). Si par exemple le nouveau codon lu est GUG, il y
aura liaison de l'anti-codon CAC de l'ARNt charge de la valine (Val) au site A. Il en
resultera un nouvel allongement de la chane polypeptidique : Met - Glu - Val, et ainsi de
suite.



Ainsi, tandis que l'ARN
m
est lu de bout en bout par le ribosome, les acides amines
correspondants se lient les uns aux autres, dans un ordre determine, realisant au Iur et a
mesure de leur agencement, les structures secondaires et tertiaires de la proteine.

La terminaison

L'elongation de la chane s'arrte (terminaison) quand est reconnu au niveau du site A
un des 3 codons UAA, UAG, UGA (provenant des triplets TAA, TAG, TGA), auxquels ne
correspondent pas d'ARNt mais une proteine appelee facteur de terminaison. A ce moment,
le complexe enzymatique qui liait les acides amines agit comme une hydrolase et decroche la
proteine terminee de l'ARN
t
.
La partie d'une sequence d'acide nucleique (ARN ou ADN) qui va du codontriplet de
depart AUGATG jusqu'au STOP s'appelle le cadre ouvert de lecture (open reading Irame
ou ORF en anglais). C'est la seule partie du gene et de l'ARN qui code pour la proteine. Les
autres parties du gene (introns, sequence avant le depart et apres le stop) sont dites non
codantes.
Les diIIerentes parties impliquees Iinalement dans cette chane metabolique, a savoir :
la sous-unite lourde, la sous-unite legere, l'ARN
m
ainsi que le dernier ARN
t
, se separent alors
137
simultanement. L'ARNm pourra tre traduit une deuxieme Iois par un autre ribosome, ou tre
degrade en nucleotides monophosphate.

6.3. LIEUX DE PRODUCTION ET TRAFIC

Certaines proteines restent dans le cytoplasme, d'autres sont exportees. Les premieres
sont synthetisees par les ribosomes libres du cytoplasme, les secondes, par ceux du RE
rugueux.
A quel niveau et comment se realise cette distinction ? L'explication de BLOBEL et
DOBBELSTEIN est la suivante :
La synthese des proteines a exporter debute sur des ribosomes libres du cytoplasme.
La premiere sequence synthetisee, longue de 20 a 30 acides amines, appelee squence signal
est composee d'acides amines hydrophobes. Une particule de reconnaissance du signal bloque
la suite de la synthese et accroche la partie lourde du ribosome au RER, au complexe de
translocation, constitue de proteines transmembranaires, au travers desquelles la sequence
signal s'insinue jusque dans la lumiere du RER, comme un Iil dans le chas d'une aiguille. La
synthese de la proteine reprend et elle sort lineairement de la partie lourde du ribosome et
migre directement dans la cavite du RE. Les reploiements que la chane polypeptidique subit
ulterieurement dans la cavite du RE l'empcheront de ressortir vers le cytoplasme. La
sequence signal est alors excisee pour obtenir la proteine deIinitive.
Les proteines Iabriquees sur le RE sont ensuite envoyees dans l'appareil de Golgi, ou
elles subissent une glycosylation (accrochage de residus sucres) et sont exportees:
- vers l'exterieur (secretion);
- vers certains organites, il s'agit notamment des enzymes des lysosomes;
- vers la membrane plasmique (certaines proteines transmembranaires);
- certaines proteines retournent dans le RE.

Rappelons aussi que les mitochondries et les chloroplastes, disposant d'ADN et de ribosomes
sont capables d'une semi-autonomie et donc de synthetiser une partie de leurs proteines. Les
autres sont synthetisees entierement dans le cytoplasme, puis transIerees dans la
mitochondrie ou le chloroplaste par un mecanisme de translocation complexe.
Notons aussi que les proteines destinees a la matrice du noyau (histones, polymerases.) sont
synthetisees dans le cytoplasme et rentrent dans le noyau par les pores nucleaires.

6.4. DEGRADATION DES PROTEINES

La synthese des proteines est extrmement contrlee et precise. Cependant, il arrive
que le ribosome "se trompe" avec une Irequence relativement Iaible (de l'ordre d'11000). Le
remplacement d'un acide amine par un autre suite a une erreur peut tre sans consequence
138
pour la proteine, si cet acide amine n'est pas essentiel pour sa structure et sa Ionction. Une
seule interversion peut aussi empcher la proteine d'acquerir sa Iorme deIinitive. Dans ce cas,
cette proteine doit tre eliminee.
Certaines proteines cellulaires peuvent aussi, suite a un stress par exemple, tre
dnature, c'est-a-dire qu'elles perdent leur structure tertiaire. Une proteine denaturee peut
rarement recuperer sa Iorme initiale et doit tre degradee, au mme titre que les proteines mal
synthetisees. En regle generale, toutes les proteines cellulaires sont remplacees regulierement,
la duree de vie moyenne des proteines de l'organisme variant entre une heure et quelques
jours. Certaines proteines particulierement resistantes, comme les immunoglobulines
(anticorps) presentes dans le sang peuvent rester Ionctionnelles pendant quelques mois.
Il existe aussi une serie de situations ou la cellule doit se debarrasser de certaines
proteines. Chaque etape du cycle cellulaire (G1, S, G2 et M) est contrlee par certaines
enzymes regulatrices (des proteine-kinases) qui doivent tre eliminees pour passer au stade
suivant.
Les proteines qui doivent tre degradees - soit parce qu'elles sont denaturees, soit
parce que la cellule veut s'en debarrasser - sont marquees par couplage covalent avec une
petite proteine appelee ubiquitine. Ce processus, appele ubiquitination, permet de
reconnatre les proteines qui doivent tre detruites.
Le principal systeme de degradation des proteines dans tous les organismes vivants,
des bacteries aux hommes, est appele le protasome. Il s'agit d'un assemblage de proteines en
une espece de tube. A une extremite, les chanes polypeptidiques des proteines ubiquitinees
qui doivent tre degradees sont deroulees (denaturees), aIin de Iaire rentrer la chane dans le
tube du proteasome. Cette etape consomme de l'energie sous Iorme d'ATP. Au centre du
proteasome se trouve une serie de proteases (hydrolases) qui decoupent la proteine en
peptides d'une dizaine d'acides amines, qui ressortent a l'autre bout du tube. Le proteasome se
comporte donc comme un hachoir a proteines. On ne le distingue pas au microscope
electronique classique, mais sa structure a ete determinee avec precision par diIIraction aux
rayons X. Il existe de tres nombreux proteasomes dans une cellule. La masse totale des
proteasomes cellulaires represente environ 1 de toutes les proteines cellulaires.

Les peptides generes par le proteasome sont ensuite degrades en acides amines par
d'autres proteases, notamment dans le cytoplasme. Les acides amines peuvent ensuite tre
recycles (couples a des ARNt pour servir a synthetiser d'autres proteines), ou tre metabolises
(transIormes en d'autres acides amines, en sucres, en lipides ou en energie).

139
6.5. CONTROLE DE L'EXPRESSION DES GENES

L'ADN de toutes les cellules d'un individu renIerme l'inIormation necessaire a la
synthese de toutes les proteines dont l'organisme entier peut avoir besoin. Parmi ces
proteines, certaines n'interviennent qu'exceptionnellement, ou uniquement dans certaines
cellules ou certains organes; d'autres enIin, ne sont necessaires qu'en quantite tres Iaible.

Il doit donc exister un systme de rgulation de la proteosynthese au sein de la
matiere vivante qui permette a une cellule de disposer au moment opportun de la quantite de
proteines dont elle a besoin et d'en arrter la production au moment ou elle n'en a plus besoin.
La quantite de chaque proteine dans la cellule est contrlee a diIIerents niveaux.
Globalement, elle depend de l'equilibre entre le niveau de synthese de la proteine et sa
degradation.
- Nous venons de voir que les proteines sont recyclees dans la cellule. Pour un rythme de
production similaire, les proteines dont la duree de vie est courte seront donc presentes en
plus Iaibles quantites que les proteines tres stables.
- La Iabrication d'une proteine donnee par la cellule depend avant tout de l'expression du
gene correspondant, c'est-a-dire du nombre de molecules d'ARNm Iabriquees par ce gene.
- La duree de vie de chaque ARNm peut egalement tre modulee. Si un ARNm a une duree
de vie longue, il sera traduit un plus grand nombre de Iois et permettra donc la synthese de
plus de proteine.

L'expression d'un gene depend du rythme avec lequel l'ARN-polymerase va transcrire
ce gene pour produire l'ARNm correspondant. Ceci depend tout d'abord de l'accessibilite du
gene, c'est-a-dire de l'etat de la chromatine a l'endroit ou se trouve le gene. Pour qu'un gene
soit transcrit, il est en eIIet necessaire que la chromatine puisse tre deroulee et que les
histones de decrochent. Une serie de mecanismes regulateurs complexes permet de
determiner dans une cellule quels genes sont accessibles et quels genes ne le sont pas.
Si le gene est accessible, son expression depend principalement de son promoteur :
une sequence d'ADN situee juste avant la partie transcrite du gene (exons et introns). La taille
d'un promoteur est souvent diIIicile a determiner avec precision : quelques centaines de
paires de bases, en general. Chaque promoteur contient deux types d'inIormation :
- le promoteur indique le debut de la partie transcrite du gene (debut de l'exon 1) par
une sequence particuliere, appelee "bote TATA" (ou TATA box en anglais), sur laquelle
l'ARN-polymerase vient s'accrocher et commence son travail.
- en amont de cette sequence se trouvent une serie de sites de Iixation pour des
proteines particulieres appelees facteurs de transcription. La presence de ces Iacteurs de
transcription est necessaire pour activer l'ARN-polymerase.
140
Il existe des centaines de Iacteurs de transcription diIIerents, qui contrlent
l'expression de genes diIIerents. Chaque Iacteur se Iixe sur un motiI diIIerent de l'ADN. Par
exemple, le Iacteur de transcription SREBP2 active la transcription de tous les genes qui
codent pour les enzymes de la synthese du cholesterol en se Iixant sur le motiI suivant, qui se
trouve (souvent legerement modiIie) dans le promoteur de tous ces genes :

5' ATCACCCCAC
3' TAGTGGGGTG

De cette Iaon, la cellule peut augmenter la quantite d'enzymes qui synthetisent le cholesterol
simplement en activant le Iacteur de transcription SREBP2.
La transcription d'un gene peut egalement tre inIluencee par des rpresseurs: ces
proteines Ionctionnent comme des Iacteurs de transcription, en se Iixant sur le promoteur,
mais inhibent l'ARN-polymerase au lieu de l'activer.
Retenons donc que le promoteur est une sequence du gene qui n'est pas transcrite ni
traduite, mais qui contrle l'expression du gene, en donnant le point de depart de la
transcription et en recrutant des Iacteurs de transcription et des represseurs, qui determinent
l'intensite de la transcription du gene.

6.6. SYNTHESE DES PROTEINES CHEZ LES PROCARYOTES

La synthese des proteines Ionctionne de la mme Iaon dans tous les organismes
vivants, sur base du mme code genetique. L'equation : gene (ADN) ARN Proteine est
donc valable pour tous les regnes. Certaines diIIerences existent cependant, principalement
entre eucaryotes et bacteries :
(1). Il n'y a pas d'intron dans les genes bacteriens, et pas de maturation de l'ARN messager
chez les procaryotes: ni epissage, ni coiIIe, ni polyadenylation. L'ARN commence par
l'extremite triphosphate du premier nucleotide.
(2). Comme il n'y a pas de noyau dans les procaryotes, et que l'ARNm ne doit pas tre
mature, sa traduction peut commencer avant mme qu'il soit termine. De plus, un seul ARN
m

peut s'inserer sur plusieurs ribosomes (polysome) ; cela signiIie que, lorsqu'un ribosome a
reconnu le message Iourni par l'ARN
m
et a participe a la Iormation d'une proteine, plusieurs
autres ribosomes peuvent Iaire de mme et concourir a la Iormation d'une mme proteine. De
ce Iait, plusieurs ribosomes portant des polypeptides a divers degres d'achevement peuvent
tre enIiles sur le mme ARN
m
.
(3). Un mme promoteur gere generalement plusieurs genes (cistrons) d'une voie
metabolique commune, regroupes en un opron. Les genes d'un operon donne sont contrles
ensemble : ils sont transcrits en un seul ARNm. Cet ARN messager polycistronique contient
141
donc plusieurs cadres de lecture, chacun possedant son site d'attachement au ribosome, son
codon d'initiation et son codon de terminaison. Il sera donc traduit en plusieurs proteines.
(4). Les ribosomes Ionctionnent de la mme Iaon mais sont plus petits chez les procaryotes
(sous-unites de 50S et 30S au lieu de 60S et 40S chez les eucaryotes). Les bacteries
contiennent egalement des proteasomes.
(5). Les bacteries utilisent la Iormyl-methionine au lieu de la methionine pour l'initiation de la
synthese proteique (codon AUG).
Notons que les archeobacteries presentent des caracteristiques intermediaires entre les
bacteries et les eucaryotes. Elles sont depourvues de noyau, mais possedent des introns dans
certains genes et utilisent la methionine lors de l'initation.





142
Questions de reflexion .
3.1- Faites un schema d`une mitochondrie en y indiquant toutes les voies biochimiques qui
s`y deroulent.
3.2- Ou sont synthetisees les enzymes mitochondriales ?
3.3- Expliquez la structure de la membrane plasmique d`une cellule humaine en y indiquant
tous ses constituants. Expliquez sur le mme schema comment l`ion sodium peut passer cette
membrane et dans quelle direction.
3.4- Expliquez comment le glucose passe la membrane plasmique, dans quel sens, et quelle
est l`inIluence de l`hexokinase sur ce passage. Que se passe t'il si la concentration en glucose
dans la cellule excede la concentration en glucose a l'exterieur ?
3.5- Ou le collagene est-il synthetise ? Comment est-il secrete ?
3.6- Quelle voie biochimique transIorme les acides gras en glucose et vice-versa ?
3.7- Comparer l`ATP synthetase de la mitochondrie avec un transporteur actiI d`ions
(NaK, par exemple).
3.8- Comment la cellule peut-elle produire de l`energie (ATP) en absence d`oxygene ? Dans
quelle partie de la cellule cela se produit-il ? Quel est le rle physiologique de cette voie chez
les mammiIeres ?
3.9- Soit une translocation reciproque entre deux chromosomes dont les points de cassures si
situent dans un intron du gene BCR et dans un intron du gene ABL. Expliquez a l`aide d`un
schema la structure de ces genes apres translocation (promoteur et exons). Deduisez-en la
structure des deux proteines correspondantes si les cadres de lecture restent en phase.
3.10- Expliquez toutes les etapes de la traduction de l`ARN messager suivant :
CGGUGCAAGAUUUAUGAAGGAGUGAUAGCAUUUAUAAAAAAAAAAAAA
3.11- Quels sont les constituants des ribosomes et ou sont-ils synthetises ?
3.12- Deux cellules animales peuvent-elles echanger des proteines ? des ions ? Expliquez.
Comparez avec les cellules vegetales.
143
Quatrime Partie

GENETIQUE


Obfectifs .
- Comprendre pourquoi nous sommes tous diIIerents
- Comprendre comment les caracteres sont transmis des parents aux enIants et tre capable de
resoudre des exercices de genetique mendelienne
- Comprendre le mecanisme de la meiose et pouvoir l`appliquer a la genetique mendelienne.

1. INTRODUCTION


HIS1ORIQUE E1 DEFIAI1IOAS

La gntique est la science qui etudie l'heredite, qui la transmission des caracteres
d'une generation a l'autre, par l'intermediaire des genes. L'ensemble des caracteres d'un
individu est appele son phnotype. Le phenotype d'un individu ne depend pas seulement de
la nature de ses genes (gnotype), mais evidemment aussi du milieu dans lequel il vit.
Par exemple, chez les lapins, il existe une race russe denommee "Himalaya". Ce
phenotype particulier est hereditaire. Les individus ont le corps recouvert de poils blancs,
sauI aux extremites qui sont recouvertes de poils noirs. Si on rase les poils blancs d'une partie
du corps et que l'on place l'animal dans une chambre Iroide, les poils qui repousseront seront
noirs. Inversement, si l'on rase les poils des oreilles et que l'on recouvre celles-ci d'un
bandage pour les maintenir a une certaine temperature, les nouveaux poils Iormes seront
blancs. Ce n'est donc pas la couleur qui est heritee mais l'inIormation pour Iormer ou non des
pigments selon la temperature de la region du corps. Et si, dans les conditions naturelles, le
lapin montre des extremites du corps noires, c'est que la circulation sanguine y est moins bien
assuree et maintient dans ces regions une temperature qui permet la Iormation du pigment
noir.

Dans l'etat actuel de nos connaissances, l'heredite trouve son explication au niveau
moleculaire, d'ou son nom de gntique molculaire. Mais il n'en a pas toujours ete ainsi. Au
milieu du XIX
e
siecle, MENDEL demontra que les caracteres ne se transmettaient pas
directement, mais que c'etaient des "Iacteurs" contenus dans les cellules qui se transmettaient.
La nature de ces "Iacteurs" etait inconnue. La premiere etape Iut de decouvrir quelle etait la
nature du materiel genetique.
144
Un premier pas Iut Iranchi lorsque plusieurs scientiIiques redecouvrent les lois de
Mendel vers 1900. Ils avaient vu au microscope les chromosomes passant au travers de la
mitose et de la meiose et en ont conclu que les "Iacteurs" de MENDEL ne pouvaient tre que
des morceaux de chromosomes puisqu'ils suivaient les mmes lois de transmission.
L'analyse chimique montra que les chromosomes etaient Iormes de deux composes,
l'ADN et les proteines. Instinctivement, les chercheurs estimerent que l'ADN etait une
molecule trop simple que pour tre le support d'une inIormation tellement riche (elle ne
comprenait que 4 monomeres diIIerents et sa structure lineaire etait inconnue), tandis que les
proteines, elles, presentaient tellement de variabilite dans leur structures, dans leurs Iormes,
que c'etait de leur cte qu'il Iallait pousser les recherches.

Bien que les acides nucleiques soient connus depuis 1868 (MIESCHER), leur rle
biologique, ne Iut reconnu que plus d'un demi-siecle plus tard. Des 1928, GRIFFITH,
travaillant sur la bacterie de la pneumonie, (Streptococcus pneumoniae) decouvre le transIert
d'inIormation genetique d'une bacterie a l'autre. Ces pneumocoques ne sont virulents que s'ils
possedent une capsule gelatineuse, polyosidique, qui les protege de la phagocytose par les
macrophages. En culture, l'aspect de leurs colonies est lisse. On connat des souches
diIIerentes, genetiquement stables, caracterisees par la nature de leur capsule et designees par
S
1
,S
2
,S
3
... (Ssmoothlisse).
Environ une cellule S sur dix millions donne naissance a une colonie rugueuse du type
R (R rough rugueux), dont les cellules sont sans capsule et non-virulentes. Il s'agit d'une
mutation, comme nous le verrons plus loin. Les types S et R sont hereditaires et se
transmettent de generation en generation. Les cellules R peuvent subir une mutation inverse
et redonner le type S. Mais dans ce cas, le type S Iinal est identique au type S initial (S3 peut
donner R3, qui redonnera S3).

Si on injecte des bacteries R (non virulentes) a une souris, elle demeure en vie. De
mme, si on injecte des bacteries S mortes (tuees par la chaleur), la souris demeure aussi en
vie. Mais si l'on injecte simultanement des bacteries S
3
tuees et des R
2
vivantes, la souris
meurt de pneumonie et l'on retire de cette souris, des bacteries S
3
vivantes. Or ces S
3
ne
peuvent pas avoir ete produites par mutation de R
2
!

R
2
S
3
tuees S
3
vivantes

On pouvait en conclure que les bacteries S, detruites par la chaleur, contiennent une
substance capable de modiIier les potentialites hereditaires de R en transIormant precisement
R non virulent en S pathogene. GRIFFITH crut que ce "principe transIormant" etait un des
constituants de la capsule.
145
Il a Iallu attendre jusqu'en 1944 pour que AVER, MAC LEOD , ET MAC CART
identiIient le "principe transIormant" a l'ADN. Par des methodes chimiques, ils extraient
l'ADN de cellules S puis l'injectent en mme temps que des cellules R vivantes, a des souris.
Celles-ci meurent de pneumonie et l'on en retire des cellules S vivantes. Or, ni cet ADN
prealablement degrade par l'ADNase (enzyme qui hydrolyse l'ADN), ni un quelconque extrait
ou constituant macromoleculaire (proteine) de S ne possedent ce pouvoir de transIormer R en
S. C'est donc bien l'ADN intact qui est capable d'induire des phenomenes hereditaires et
donc:

R
2
ADN de S
3
S
3
.

L'ADN extrait dans ces experiences n'etait pas pur a 100 et il Iallut des etudes
complementaires (HERSHE et CHASE, 1952) sur la replication des virus bacteriens T
2
(bacteriophages ou phages) a l'interieur de la cellule-hte pour prouver deIinitivement que
l'ADN etait bien le materiel hereditaire.
Ces bacteriophages sont des virus dissymetriques constitues d'une tte et d'une queue,
limites par une enveloppe proteinique et renIermant une matrice egalement de nature
proteinique. La tte contient de l'ADN. Il n'y a donc que de l'ADN et des proteines dans ces
phages. On peut se demander si ces deux composants sont necessaires a la production de
nouveaux individus, ou si un seul suIIit pour constituer le materiel genetique.
L'ADN contient beaucoup de phosphore, mais pas de souIre. Il peut donc tre marque
au
32
P. Inversement, les proteines contiennent beaucoup de souIre et peuvent tre
diIIerenciees par marquage au
35
S. En incorporant dans le milieu de culture, soit du
35
S, soit
du
32
P, on obtiendra des phages qui seront radioactiIs soit au niveau de leurs proteines (riche
en S) soit au niveau de leur ADN (riche en P).
Lorsque des phages marques au
32
P inIectent des bacteries non radioactives, celles-ci
le deviennent et cette radioactivite est transmise a la generation suivante de phages. Lorsque
des phages marques au
35
S inIectent des bacteries, celles-ci ne deviennent pas radioactives, et
on retrouve cette radioactivite dans les enveloppes vides.

Ces deux experiences montrent que seul l'ADN du phage a ete injecte a la bacterie
(alors que la capsule vide, ou Iantme est restee au dehors) et contient a lui seul l'inIormation
necessaire a la reconstitution de l'ADN et des proteines des nouveaux phages Iormes, avec
leurs caracteres morphologiques et leur pouvoir inIectieux.
L'ADN est donc la substance Iondamentale des genes qui contrlent la synthese des
proteines selon un mecanisme que nous avons deja explique.



146

CEAIE CEAE1IQUE

Les experiences de AVER, MAC LEOD , ET MAC CART ouvrirent de nouvelles
possibilites en recherche, et servirent de base au genie genetique moderne. Le Iait qu'on
puisse transIormer une bacterie avec de l'ADN est en eIIet utilise dans tous les laboratoires de
biologie moleculaire et de genetique moderne.
On peut aussi ajouter un gene dans des cellules eucaryotes : ce processus est appele
transIection. Plus recemment, certains chercheurs ont decouvert le moyen d'ajouter ou
supprimer un gene dans un organisme entier (mas, souris, rat, porc, saumon.), produisant
des organismes transgeniques. Nous parlerons de ces nouveaux developpements dans le
dernier chapitre de la partie "genetique".

CEAES & CEAOMES

Le segment d'ADN responsable de l'exteriorisation d'un caractere est appelee gne.
Nous preciserons ulterieurement cette notion. L'ensemble du materiel genetique (et donc de
l'ADN) caracteristique d'une espece est appele gnome. Il contient donc tous les genes ainsi
que les sequences d'ADN qui se trouvent entre les genes. Ces sequences sont souvent
repetitives et de longueur tres variable (parIois tres longues) chez les animaux et les plantes
les plus evolues. Le genome des mammiIeres atteint 3 milliards de paires de bases (pour une
copie), et contient environ 30000 genes diIIerents (ce nombre n'est pas encore determine avec
certitude, les estimations actuelles vont de 25000 a 40000 genes).
Les bacteries possedent dix Iois moins de genes - entre 500 et 5000 - contenus dans
un genome mille Iois plus petit: 0,5 a 5 millions de paires de bases. Les genes bacteriens sont
en moyenne un peu plus petits, du Iait de l'absence d'intron, et les sequences d'ADN qui
separent les genes sont beaucoup plus courtes.
Le genome humain a ete sequence recemment. En 2000, une premiere version du
genome a ete publiee, couvrant la majorite de l'ADN correspondant a l'euchromatine
humaine. Cette version a ete amelioree en 2004. Les genomes de nombreux organismes sont
maintenant sequences partiellement ou totalement, notamment ceux de la souris, du rat, du
chimpanze, du porc, de la drosophile, de la levure, du riz, du protiste responsable de la
malaria (plasmodium falsiparum) et de nombreuses bacteries. La liste des genomes decryptes
s'allonge chaque annee. Notons que le genome des plantes est aussi riche et complexe que
celui des animaux, et que les genes du chimpanze sont presque 99 identiques aux ntres.
Ces etudes ont un impact considerable sur la recherche biologique et medicale.
L'heterochromatine possedent des sequences tres repetitives qui sont techniquement
diIIiciles a sequencer. Elle contient tres peu de genes et son rle n'est pas bien compris.
147
Rappelons qu'elle est visible dans le noyau en microscopie electronique sous Iorme d'amas
denses.
HEREDI1E & REPRODUC1IOA

Puisque nous savons actuellement que le materiel hereditaire est l'ADN, il nous suIIit
de connatre comment s'opere la transmission de l'ADN de generation en generation.

Chez les tres unicellulaires, la division et la reproduction s'eIIectuent simultanement.
La transmission de l'inIormation s'opere par la simple duplication de l'ADN : les deux
cellules-Iilles sont identiques entre-elles et identiques a la cellule-mere (certains phenomenes
complexes de conjugaison, transduction et transIormation permettent cependant aux bacteries
de Iaire varier leur potentiel genetique). La genetique microbienne ne sera pas abordee ici.
Nous y Ierons parIois reIerence quand elle nous permet de mieux comprendre ce qui se passe
chez les eucaryotes.

Chez les organismes pluricellulaires, tous eucaryotes, la mitose permet la
"multiplication cellulaire" tandis qu'une nouvelle generation ne peut apparatre que suite aux
phenomenes tres importants de meiose et de Iecondation.
Ces mecanismes doivent tre bien assimiles par l'etudiant avant d'entreprendre toute
etude de la genetique...(qu'elle soit moleculaire ou mendelienne).
148
2. LA REPRODUCTION



2.1. LES MODES DE REPRODUCTION

Nous avons vu dans l'introduction qu'une des caracteristiques essentielles des tres
vivants est leur capacite a se reproduire. La reproduction sexuee nous apparat d'emblee
comme "le" moyen de multiplier les tres vivants. Or elle n'est pas toujours indispensable;
elle ne Iut pas la premiere; elle n'est pas la plus econome en moyens consacres a cet objectiI.
Pourquoi donc s'est elle imposee tant chez les animaux que les vegetaux?
Chez les tres primitiIs, unicellulaires, la simple mitose suIIit a produire deux
individus identiques a partir d'un seul. Le procede est Iiable et econome. Mais les deux
nouveaux individus sont non seulement identiques entre eux mais identiques a la cellule
mere. Le seul moteur d'evolution possible, se trouve dans le hasard des mutations, dont nous
verrons qu'elles sont generalement deIavorables.

La reproduction asexue et multiplication vgtative

La multiplication vgtative est de rigueur chez beaucoup d'organismes inIerieurs
(bacteries, champignons). Elle assure la reproduction de l'espece par le developpement de
certains Iragments de l'organisme mere. Elle ne necessite pas obligatoirement la production
d'organes specialises: les boutures de nos plantes superieures en sont un exemple. Ces
dernieres sont possibles grce a la totipotence des cellules vegetales, c'est-a-dire la capacite
qu'a chacune d'elles de regenerer un organisme complet. Mais d'une part, certaines plantes
ont developpe des organes specialises dans la reproduction vegetative (stolons du Iraisier,
bulbilles) et d'autre part des animaux (hydres, vers marins) sont capables de regenerer deux
individus entiers si on les coupe en deux. Ce type de reproduction produit des jeunes
genetiquement identiques a leurs parents.

Chez les vegetaux, la reproduction de l'espece peut se Iaire par reproduction asexuee
ou agame, grce a des cellules speciales denommees spores produites par l'organisme parent.
Disseminees, les spores donnent naissance a des individus nouveaux.

EnIin, la parthnogense chez certains animaux resulte du developpement d'oeuIs
non Iecondes, donnant des individus ayant un seul parent. C'est la cas de certains lezards.


149
La reproduction sexue

La reproduction sexuee est un cycle qui implique la constitution de lignees
germinales specialisees (rappelons qu'on distingue parmi les cellules d'un organisme, des
cellules germinales, dont le rle est de participer a la reproduction de l'individu et des
cellules somatiques, qui Iorment le corps, le reste de l'individu). Les organismes Iorment des
cellules reproductrices, des gamtes qui s'uniront 2 a 2 selon un processus denomme
fcondation pour Iormer un oeuf ou zygote. La Iecondation implique successivement l'union
des cytoplasmes et la Iusion des noyaux.
Chaque gamete, possede un nombre haplode de chromosomes n, le zygote possedera
un nombre diplode (2n) de chromosomes. Il se divisera en un certain nombre de mitoses
somatiques diplodes successives pour donner un nouvel individu. Pour passer a la
generation suivante, l'individu doit donc produire a son tour des gametes haplodes (n
chromosomes) alors qu'il est diplode. Un processus special appele miose permet de
repasser de 2n a n chromosomes.
Attention : la miose ne produit pas forcment des gamtes. Cela ne se passe que
chez les animaux. Dans les autres regnes vivants qui utilisent la reproduction sexuee
(vegetaux, mycetes), la meiose produit des spores. Les spores se developpent en un nouvel
individu haplode, diIIerent de celui qui les a produit. C'est cet individu la qui va produire
des gametes, lesquels par Iecondation deviennent le point de depart d'un nouvel organisme
diplode.
Fecondation et meiose se presentent donc comme deux mecanismes compensateurs
qui assurent la permanence du lot chromosomique au cours des generations successives en
Iaisant alterner cycliquement les phases haplodes et diplodes. Nous en verrons quelques
illustrations dans les cycles de developpement.
Il y a isogamie lorsque la reproduction sexuee s'eIIectue entre des gametes
semblables (de Iorme, de taille, de structure generale). Ce mode de reproduction primitiI
n'existe que chez certains thallophytes et mycetes. Il y a htrogamie lorsque la reproduction
sexuee se Iait entre deux gametes diIIerents:
- le gamete mle est nomme spermatozode chez les animaux. Il est petit, pauvre en
cytoplasme, generalement mobile; il penetre dans le gamete Iemelle pour assurer la
Iecondation.
- le gamete Iemelle denomme ovule chez les animaux.

2.2. LES AVANTAGES DE LA REPRODUCTION SEXUEE

Quand un organisme se reproduit de Iaon asexuee, la grande energie investie dans la
descendance est utilisee eIIicacement car celle-ci a de Iortes chances d'arriver a l'etat adulte.
Par contre la reproduction sexuee semble un gaspillage enorme (le pourcentage de
150
spermatozodes "utiles" sur une vie humaine est ridiculement Iaible; il suIIirait de deux
pepins sur la vie d'un pommier pour disseminer l'espece; quelle est l'energie depensee par un
mle pour trouver et garder une harde de Iemelles?).
Ces desavantages energetiques certains sont compenses des points de vue adaptation
et evolution:
- Du point de vue des individus, la Iecondation est associee dans l'evolution a la
creation d'tres vivants diplodes qui additionnent les qualites apportees par chacun
des potentiels genetiques des gametes. De plus, l'etat diplode permet de surmonter
les eIIets neIastes d'une mutation negative: l'inIormation intacte peut Ionctionner a
elle seule de maniere suIIisante (voir mutations recessives).

- La meiose redistribue les inIormations genetiques au hasard dans la descendance: les
enIants sont diIIerents entre eux et diIIerents de leurs parents. Chaque enIant herite
d'une partie des caracteres de la mere et du pere, creant une combinaison nouvelle.
Les meilleures combinaisons genetiques procurent un avantage selectiI. Ce systeme
permet une evolution rapide des especes et augmente donc les chances de survie de
l'espece (au detriment des l'individus). Tous les gametes produits sont diIIerents. Si
les conditions changent brutalement, il y a plus de chance qu'une des nouvelles
combinaisons produites soit eIIicace dans le nouvel environnement.

2.3. LES CYCLES DE DEVELOPPEMENT

Le cycle de developpement de tout tre sexue est donc caracterise par la Iecondation
qui double le nombre de chromosomes et la meiose qui reduit de moitie le nombre double par
la Iecondation. Ces deux phenomenes partagent le cycle en deux phases distinctes : la phase
haplode comprenant l'ensemble des generations cellulaires haplodes (ne possedant qu'un lot
unique de chromosomes) et la phase diplode comprenant l'ensemble des generations
cellulaires diplodes (contenant un lot double de chromosomes).

De ce qui precede, il est evident que l'evolution a selectionne progressivement les
organismes ou la phase haplode est la plus courte. Chez les animaux, cette phase est reduite
aux gametes produits directement par la meiose. Chez les vegetaux, on distingue encore une
alternance de phases. La phase haplode commence a la meiose et s'acheve a la Iecondation;
on l'appelle gamtophyte car c'est la partie de la plante qui Iorme les gametes haplodes pour
la Iecondation. La phase diplode debute a la Iecondation et s'acheve a la meiose, c'est le
sporophyte ou partie de la plante qui Iorme les spores capables de se developper seules, en
une plante haplode. Selon l'importance relative des phases, on peut distinguer 3 cycles.


151
Le cycle diplophasique :
L'individu est diplode. Les cellules de la lignee germinale subissent la meiose et produisent
directement les gametes. L'etat haplode est reduit aux gametes. La Iecondation unit les
gametes en un oeuI diplode qui se developpe en un nouvel individu egalement diplode. La
reduction precede donc immediatement la gametogenese et la Iecondation. Ce cycle se
rencontre chez tous les animaux pluricellulaires (depuis les spongiaires jusqu'aux
mammiIeres), ainsi que chez certaines algues (Fucus).

Le cycle haplophasique :
La plante est haplode. Les gametes sont directement produits par la plante et s'unissent en
zygote. Les deux premieres divisions de l'oeuI constituent la meiose, et il se Iorme une
nouvelle plante haplode. L'etat diplode est reduit au zygote. La reduction suit donc
immediatement la Iecondation. Ce cycle de developpement se rencontre chez les
champignons et certaines algues Iilamenteuses (Spirogvra).

Le cycle haplo-diplophasique
La plante comporte deux phases vegetatives. Une premiere debute a la meiose et se termine a
la Iecondation : c'est le gamtophyte qui contient les noyaux haplodes et qui produit les
gametes lors de la gametogenese. Une seconde commence a la Iecondation et se termine a la
meiose : c'est le sporophyte qui contient les noyaux diplodes. La lignee germinale y subit la
sporogense comprenant la meiose donnant ainsi les spores haplodes. Ces dernieres
redemarrent la phase haplode. L'organisme est haplo-diplophasique. Ce cycle se rencontre
chez la plupart des plantes.
Remarquons dans ce cycle que:
- la meiose ne se Iait ni juste avant, ni juste apres la Iecondation, une phase vegetative les
separe toujours;
- la meiose ne donne donc pas directement des gametes comme chez les animaux;
- l'appareil vegetatiI de la plante est represente soit par le gametophyte, soit par le
sporophyte, soit par les deux. Dans les plantes superieures (angiospermes), la phase haplode
est reduite aux organes reproducteurs de la Ileur.

2.4. LA MEIOSE

La cellule qui entre en meiose est Iorcement diplode. Elle descend de l'oeuI diplode
cree par la Iecondation. Son lot de chromosomes est double. Tous les chromosomes Iorment
des paires homologues, quasi identiques 2 a 2, dont un exemplaire provient du gamete d'un
sexe, et l'autre du gamete de l'autre sexe. L'objectiI de la meiose est de produire des cellules
contenant un et un seul chromosome de toutes ces paires homologues.
152
Une interphase premeiotique qui a double l'ADN precede la meiose (cIr phase S du cycle
cellulaire et replication de l'ADN), qui comporte deux caryocineses successives:
- La meiose I ou division rductionnelle, tres diIIerente d'une mitose normale, qui
donne deux cellules dont le nombre chromosomique est reduit de 2n a n ;
- La meiose II, ou division quationnelle, qui suit immediatement la precedente et
donne naissance a un groupe de quatre noyaux haplodes (n chromosomes).

LA MEIOSE I OU DIJISIOA REDUC1IOAAELLE

Elle comporte 4 phases, comme la mitose somatique : la prophase I, la metaphase I,
l'anaphase I et la telophase I.

PROPHASE I

La prophase I est de longue duree et s'etend couramment sur plusieurs jours. Bien
qu'elle se deroule de Iaon continue, on y distingue pour plus de commodite, plusieurs stades
dont les principaux sont : leptotene, zygotene, pachytene, diplotene et diacinese. Ces termes
sont en rapport avec l'aspect des chromosomes a chacun des stades.

Stade leptotene
Dans le noyau gonIle, les molecules d'ADN commencent a se condenser en chromosomes,
qui deviennent visibles. Bien que deja Iormes de deux chromatides, le clivage longitudinal
n'est generalement pas visible.

Stade zygotene
Ce stade est le plus important: pour separer les paires homologues, il Iaut d'abord les
rassembler, apparier les chromosomes homologues. Ce phenomene s'appelle "synapsis".

Durant ce stade, les chromosomes homologues se rapprochent et s'accolent sur toute
leur longueur par l'intermediaire d'une structure proteinique double, en Iorme d'echelle, le
complexe synaptonmal.
Celui-ci se compose de deux elements proteiniques lateraux de 50 nm de largeur
presentant une alternance de bandes epaisses et Iines encastrees dans la chromatine de
chacune des chromatides des chromosomes homologues. Un espace clair de 100 nm qui
montre un element proteinique central plus dense de 20 nm de largeur, separe les
chromatides sur toute leur longueur.
La Iormation de ce complexe synaptonemal debute deja a la Iin du stade leptotene : ce
sont d'abord les elements lateraux qui se placent le long des chromatides des chromosomes
homologues; puis se Iorme l'element central qui se diIIerencie a partir de l'extremite des
153
chromatides vers le centre de celles-ci lorsqu'elles se sont rapprochees sur toute leur
longueur. L'appariement est tres precis, chaque gene se retrouvant Iace a son homologue.
Chaque paire de chromosomes ainsi reunie Iorme un bivalent. Le nombre de
bivalents est donc egal au nombre de chromosomes haplode (n) de l'espece. Chaque bivalent
contient donc deux chromosomes homologues constitues chacun de deux chromatides
identiques (soit 4 molecules d'ADN en tout par bivalent). Notons que les deux chromosomes
sexuels s'apparient egalement en un bivalent.

Stade pachytene
Le stade pachytene commence lorsque la synapsis est achevee. Les chromosomes se
contractent et s'epaississent. Ils sont etroitement associes, plus ou moins enroules l'un sur
l'autre. A ces endroits, il y a rupture puis echange et enIin resoudure de segments
chromosomiques entre chromatides de chromosomes homologues. C'est le crossing-over ou
enjambement. Ce phenomene tres important permet une recombinaison intra-
chromosomique c'est-a-dire la creation de chromatides "mixtes", recombinantes, possedant
une partie de l'inIormation en provenance du pere de l'individu qui est train de se reproduire
et l'autre de sa mere. C'est une des cleIs essentielles de la variabilite de la descendance. Mais
le phenomene lui-mme n'est pas visible a ce stade.

Stade diplotene
On observe la disparition du complexe synaptonemal. Le clivage de chaque chromosome
devient apparent. Dans chaque bivalent, les chromosomes sont separes sur leur plus grande
longueur et semblent se repousser mais les chromatides des chromosomes homologues
demeurent attaches en plusieurs endroits, la ou se trouvent les sites de recombinaison. Ces
endroits Iurent decouverts par JANSSENS (UCL 1909) et appeles chiasmas. Il predit
clairement leur rle dans le crossing-over sans pouvoir le prouver. Dans chaque bivalent, les
chromatides soeurs demeurent plus ou moins paralleles.
Chez la Iemme, ce stade est atteint pour 400 000 ovocytes I dans les 4 a 7 mois du
Ioetus. Ce n'est qu'a la puberte que l'un de ceux-ci continue son evolution par cycle, et ce,
jusqu'a la menopause. Ce stade peut donc durer pres d'un demi-siecle!

Stade diacinese
La spiralisation des chromosomes s'accentue encore et ils deviennent tres epais et tres courts.
C'est a ce moment aussi que le nucleole et la membrane nucleaire disparaissent et que se
Iorme le Iuseau achromatique.
Le Iuseau presente une particularite: les Iibres chromosomiques ne relient pas chaque
centromere aux deux ples comme dans une mitose. Chaque chromosome homologue n'est
relie qu'a un seul ple. Les chromosomes homologues d'un bivalent sont relies a des ples
opposes. Il y a donc que deux kinetochores par bivalent (et un seul par chromosome).
154
METAPHASE I

Les chromosomes clives se disposent a l'equateur du Iuseau. Contrairement a la
mitose, ce ne sont pas les centromeres qui se trouvent a l'equateur du Iuseau mais les
chiasmas qui unissent les chromatides des bivalents. La repartition des chromosomes
d'origine paternelle et maternelle par rapport a ce plan est due au hasard et engendre les
recombinaisons interchromosomiques. Chez l'homme, par exemple, qui possede 23 bivalents,
tous les chromosomes d'origine paternelle se retrouveront du mme cte dans un cas sur 2
22

soit 14194304 ! Les Iibres chromosomiques relient les centromeres de chacun des
chromosomes des bivalents a un seul des deux ples du Iuseau.

ANAPHASE I

Les chromosomes homologues se separent. Chaque centromere, tire par ses Iibres
chromosomiques monte vers un des ples entranant avec lui ses deux chromatides. La
dissociation anaphasique separe donc les chromosomes entiers clives en deux chromatides, et
non pas les chromatides entre elles comme dans la mitose somatique normale.
Le lot chromosomique que reoit chaque Iutur noyau-Iils est constitue d'un melange
de chromosomes d'origine paternelle et maternelle. De plus ces chromosomes renIerment des
segments echanges lors du crossing-over.

TELOPHASE I

Les chromosomes clives sont parvenus a chaque ple. Dans certains cas, de nouvelles
enveloppes nucleaires se Iorment. Les chromosomes restent sous Iorme condensee et ne
subissent guere de modiIications.
Une cytocinese termine en general la division reductionnelle, pour donner deux
cellules Iilles, qui contiennent chacune n chromosomes constitues chacun de deux
chromatides encore reunies au niveau du centromere.

LA MEIOSE II OU DIJISIOA EQUA1IOAAELLE

La meiose II Iorme, a partir de chacun des deux noyaux haplodes (n chromosomes a
2 chromatides) obtenus a la division precedente, 2 nouveaux noyaux renIermant aussi n
chromosomes a une chromatide.
Il n'y a pas d'interphase entre les deux divisions de la meiose. Les noyaux
telophasiques I entrent immediatement en prophase II de la seconde division. Il n'y a donc
pas de nouvelle duplication de l'ADN ! La prophase II est de courte duree puisque les
chromosomes sont deja condenses. Elle consiste surtout en la mise en place des Iuseaux.
155
Notons que les deux Iuseaux se disposent perpendiculairement au Iuseau unique de la
premiere mitose. Comme dans toute mitose, chaque chromatide possede ses kinetochores; le
centromere est donc relie aux deux ples.
En metaphase II, les chromosomes clives s'inserent par leur centromere a l'equateur
du Iuseau.
A l'anaphase II s'opere le dedoublement des centromeres et les chromatides de chaque
paire se repartissent au hasard dans les deux noyaux.
La telophases II reconstituent au total, 4 noyaux haplodes a n chromosomes.
Apres cytocinese, on obtient une tetrade de cellules dont le patrimoine genetique est
diIIerent.

Les diIIerences Iondamentales avec deux mitoses successives sont les suivantes :
1) Chaque mitose somatique est precedee d'une duplication de l'ADN (Iormation de deux
chromatides par chromosome) au cours de l'interphase (phase S); ce phenomene est
compense par la dissociation anaphasique des chromatides.
Durant la meiose, il n'y a qu'une seule duplication premeiotique puisque l'interphase
entre les deux divisions de la meiose est escamotee.
2) Il y a deux dissociations anaphasiques diIIerentes. L'anaphase I separe des chromosomes
entiers (a 2 chromatides) tandis que l'anaphase II dissocie les chromatides.
3) La repartition de l'ADN, de l'inIormation, est Iondamentalement diIIerente.
Dans une mitose somatique, suite a la dissociation des chromatides genetiquement
identiques, les deux noyaux reoivent des garnitures chromosomiques identiques, portant
les mmes inIormations. Dans deux mitoses somatiques successives, les 4 noyaux Iormes
possedent donc les mmes inIormations genetiques.
Par contre dans la meiose, l'anaphase I separe deux lots de chromosomes equivalents en
nombre mais portant des inIormations genetiques diIIerentes, puisque le phenomene de
crossing-over s'est deroule en prophase I et que les chromosomes sont d'origine sexuelle
diIIerente. En Iin de meiose, les quatre noyaux Iormes possedent des inIormations
genetiques diIIerentes.
3) A la metaphase de chaque mitose somatique, les centromeres des chromosomes sont
situes a l'equateur du Iuseau et sont relies aux deux ples du Iuseau.
A la metaphase I de la meiose, les centromeres des chromosomes sont situes de part et
d'autre du plan equatorial. En plus, chacun d'eux n'est relie qu'a un seul ple du Iuseau.
156
3. POLYMORPHISME ET MUTATIONS
__________________________________________________

Dans une population d'tres vivants d'une mme espece utilisant la reproduction
sexuee, tous les individus sont diIIerents. Ceci est d a un ensemble de petites diIIerences au
niveau de l'ADN de ces individus, appele polymorphisme. Il s'agit principalement de
changements d'un seul nucleotide. Ces nucleotides variables sont souvent appeles SNP par
les geneticiens (prononce "snip": de l'anglais "single nucleotide polymorphism"). A ces
modiIications s'ajoutent de petites deletions et insertions.

Chez l'homme, on estime qu'un nucleotide sur 1000 varie entre les individus, les 999
autres etant constants. Nos genomes sont donc 99,9 identiques. Un genome diplode
totalisant 6 milliards paires de bases, ceci correspond a un nombre total de nucleotides
variables de 6 millions !! Ce sont ces diIIerences qui expliquent pourquoi chaque individu est
unique (a l'exception des vrais jumeaux).

De nombreux polymorphismes sont situes en dehors des genes et ont un impact
diIIicile a evaluer (probablement Iaible, voire nul). Les variations ponctuelles qui sont situees
dans les genes crees des Iormes diIIerentes du mme gene, appelees les allles du gene. Tous
les hommes possedent donc les mmes genes dans leurs genomes, mais pas necessairement
les mmes alleles. Les individus diplodes possedant deux copies de chaque gene, il peuvent
soit posseder deux Iois le mme allele, soit deux alleles diIIerents.

La majorite de ces variations ne sont pas deleteres. Elles conduisent simplement a des
diIIerences physiques et physiologiques entre individus. A cote des variations normales du
genome de chaque espece, des modiIications anormales peuvent aussi survenir, liees a
l'apparition d'une maladie. Dans certains cas, la notion de normalite est cependant diIIicile a
apprecier. Certaines mutations peuvent tre liees a une meilleure resistance a telle ou telle
maladie, ou au contraire conIerer un risque plus eleve, par exemple Iace a un type d'inIection.
ParIois, une modiIication genetique peut en mme temps donner un avantage Iace a un agent
pathogene et un risque accru de developper une autre maladie.

De nouveaux polymorphismes (mutations) apparaissent sans cesse. Leurs
consequences sont tres variables. Elles peuvent conIerer un avantage ou un desavantage, en
Ionction de l'environnement, des maladies auxquelles la population doit Iaire Iace, etc. Dans
la nature, ces mutations sont le moteur de l'evolution telle qu'elle a ete decrite par Darwin:
elles produisent sans cesse des individus diIIerents, qui, selon les circonstances, sont plus ou
moins Iavorises et auront plus ou moins de chances de pouvoir se reproduire.
157

Ces mutations sont invisibles au niveau des chromosomes au microscope. Les
modiIications qui sont visibles au niveau des chromosomes (voir plus loin "alterations
chromosomiques") sont presque toujours pathologiques, et peuvent tre responsables de
deIiciences graves.

3.1 CONSEQUENCES D'UNE MUTATION SUR LA TRADUCTION

Un changement d'un nucleotide de la sequence d'ADN peut avoir des consequences
tres variables, suivant la localisation de celui-ci. Il en est de mme pour une deletion ou une
insertion. Un grand nombre de mutations sont situees en dehors des genes et ont un impact
tres Iaible ou nul. Certaines mutations dans les parties non traduites des genes (promoteur du
gene, introns, parties 5' et 3' non traduites de l'ARNm) ont des consequences souvent
diIIiciles a estimer. Par contre, les mutations situees dans les parties traduites peuvent tre
analysees de Iaon rationnelle:

- Le code genetique etant "degenere"; il est possible que le triplet mute code le mme
acide amine, auquel cas aucune diIIerence ne sera decelee. On parlera de mutation
silencieuse.
- Si le triplet mute encode un autre acide amine, on parlera de mutation ponctuelle de
la sequence de la proteine. La diIIerence ne sera pas Iorcement visible pour l'individu.
En eIIet, si l'acide amine en question n'a pas de Ionction importante et ne change pas
la structure proteine, celle-ci (par exemple une enzyme) gardera son activite et la
mutation n'aura pas d'eIIet. Dans le cas inverse, l'activite de la proteine sera diminuee
entranant des consequences physiologiques etou morphologiques visibles. Sur la
base de la sequence primaire de la proteine, ces consequences sont diIIiciles a prevoir.
Exemple: la drepanocytose est une maladie due a une mutation ponctuelle dans le
gene de l'hemoglobine (voir plus loin).
- Une mutation dite "non sens" peut Iaire apparatre ou disparatre les triplets TGA ou
TAG ou TAA (STOP). Dans cas, la synthese de la proteine s'arrte prematurement,
produisant une proteine dont il manque une partie. Ce type de proteine est tres souvent
non Ionctionnel.
- Une deletion ou insertion d'un multiple de trois nucleotides supprime ou ajoute un ou
plusieurs acides amines dans une proteine, avec des consequences variable en Ionction
de l'endroit ou cette modiIication survient.
- La mutation genique peut aussi entraner la perte (deletion) ou l'insertion d'une ou
deux paire de bases, decalant la lecture de tous les triplets suivants et donc la nature
de la proteine construite. On parle alors d'un dcalage du cadre ouvert de lecture. La
partie de la proteine situee apres la mutation n'a en eIIet plus rien a voir avec la
158
proteine normale. La taille de la proteine est egalement modiIiee, puisque le ribosome
devra utiliser un autre codon stop. Une telle mutation se traduit habituellement par une
enzyme non Ionctionnelle et a donc des repercussions qui sont nettement plus
importantes qu'une simple modiIication de base.

Exemples :

1 addition d'une base dans l'ADN
#1%& #2*!#+2!+**!##*!2+#!+2#!#+*!#22!#**!+22!,,,
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devient
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2 perte d'une base dans l'ADN
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3.2 ALTERATIONS CHROMOSOMIQUES

Les chromosomes peuvent subir un certain nombre de modiIications visibles au
microscope, lors de la realisation d'un caryotype. Un nombre anormal de chromosomes
normaux peut tre observe: on parlera de polyplodie si ce nombre reste un multiple de n
(Irequent chez les plantes), d'aneuplodie si ce n'est pas le cas. Certains chromosomes
peuvent aussi tre anormaux, suite a une deletion, une inversion, une insertion ou une
translocation. Contrairement a ce qui a ete vu plus haut, il s'agit de modiIications impliquant
un grand segment d'ADN, et donc un grand nombre de genes.
Ces modiIications peuvent survenir dans des cellules somatiques ou germinales.
Seules les alterations germinales seront hereditaires. Chez l'homme, les modiIications
germinales des chromosomes sont presque toujours pathologiques, et les individus qui les
portent sont en general incapables de se reproduire.
Chez les animaux superieurs, certaines alterations des chromosomes des cellules
somatiques peuvent conduire au developpement d'un cancer.


159
Polyplodie

Ce type de modiIication survient surtout chez les plantes. Elles ne sont pas viables
chez l'homme (pas de developpement embryonnaire). Nous avons vu que l'haplodie ou
monoplodie (n chromosomes) caracterise des cellules ou des individus qui ne possedent que
le genome de base n (certaines plantes, mles de l'abeille issus de gametes Iemelles non
Iecondes...). La diplodie (2n) : constitue l'etat normal d'un animal ou d'un vegetal superieur.
La meiose peut s'y derouler normalement. Haplodie et diplodie constituent des etats
successiIs normaux d'un cycle haplo-diplophasique de la reproduction sexuee.
La triplodie (3n) : provient de la Iusion d'un gamete normal (n) et d'un gamete Iorme
sans reduction meiotique (2n). Dans un organisme triplode, la mitose peut se derouler
normalement mais pas la meiose. En prophase I de la meiose les 3 chromosomes homologues
s'associent en un trivalent ou un bivalent et un univalent. La repartition de chromosomes en
anaphase de la meiose est irreguliere et aboutit a des gametes aneuplodes. Les individus
triplodes qui peuvent se developper sont donc peu Iertiles sinon steriles.
La ttraplodie (4n) : on y distingue les autottraplodes et les allottraplodes.
Les autotetraplodes proviennent de la Iusion de gametes diplodes ou bien du
doublement naturel ou artiIiciel du nombre chromosomique diplode. Chez les organismes
autotetraplodes, par suite de la presence d'un nombre pair de chromosomes homologues, les
appariements au stade zygotene peuvent se realiser soit sous la Iorme de 2 bivalents soit sous
la Iorme d'un quadrivalent. Dans ce dernier cas, la separation en anaphase I est souvent
irreguliere et les gametes produits sont aneuplodes comme chez les triplodes. Lorsque la
repartition est reguliere, les gametes produits sont diplodes et, en Iusionnant, redonnent des
individus tetraplodes. Ces organismes sont alors Iertiles.
Un nombre important d'especes utilisees en agriculture (ble, avoine, seigle, tabac,
coton...) sont des autotetraplodes naturels ou crees par les agronomes. Il en va de mme pour
les hexaplodes (6n) et octoplodes (8n). Ils presentent generalement une taille cellulaire plus
importante, qui se traduit par une dimension des organes (Ileurs, Iruits, graines) souvent
accrue et un meilleur rendement.
Les allotetraplodes sont issus d'un zygote reunissant deux gametes diplodes d'especes
diIIerentes; ils constituent des hybrides inter-spcifiques. Les hybrides interspeciIiques issus
de la Iusion de gametes haplodes sont generalement des plantes tres luxuriantes.
Malheureusement, elles demeurent steriles car la meiose ne peut pas se realiser. En doublant
le nombre de chromosomes de l'hybride interspeciIique, chacun des chromosomes possede
son homologue et l'appariement au zygotene peut se realiser normalement.
En 1928, Karpechenko voulut obtenir une plante possedant les Ieuilles du chou (Brassica
oleracea) et les racines du radis (Raphanus sativus) Le croisement a donne un hybride
interspeciIique sterile, mais par polyplodisation, il a obtenu une nouvelle espece tetraplode
160
Iertile: le chou-navet (Raphano-brassica) qui malheureusement possedait les racines du chou
et les Ieuilles du navet! De mme le tabac utilise actuellement est un hybride tetraplode
obtenu a partir de 2 especes Nicotiana glauca et Nicotiana svlvatica. La creation de nouvelles
varietes horticoles utilise Irequemment l'allotetraplodie.
La polyplodie naturelle est Irequente chez les vegetaux mais rare chez les animaux a
cause de la complexite de la balance hormonale des mecanismes determinant le sexe.

L'aneuplodie

- L'individu est monosomique lorsqu'il a 2n-1 chromosomes. Le seul cas de
monosomie connu chez l'homme est le syndrome de TURNER (44 un seul chr. X 45
chromosomes, note X0). Les individus (Iilles) qui en souIIrent sont steriles, possedent des
ovaires atrophies et sont sexuellement immatures.

- L'individu est polysomique quand il possede un ou plusieurs chromosomes
surnumeraires.
Il y a trisomie quand un des chromosomes est present en triple exemplaire.
- Trisomie au niveau des chromosomes sexuels :
- chez la Iemme 44 XXX, syndrome du triple X (Iemmes normales et Iertiles
pouvant parIois presenter un leger retard de developpement).
- le syndrome de KLINEFELTER: 44 XX, (organes sexuels mles, tendance
a la Ieminisation des caracteres sexuels secondaires: voix aigu, Iaible pilosite,
poitrine Iort developpee..)
- chez l'homme hypermasculinise 44 X. Ce genotype est present chez 1,1
des hommes. Chez les hommes de grande taille, la proportion de X pourrait
atteindre 20, mais beaucoup de ces individus passent inaperus tant dans leur
phenotype que dans leur comportement. Cette hypermasculinisation peut avoir
des incidences sociales, bien que les enqutes soient contradictoires: les X
seraient plus agressiIs et auraient une probabilite six Iois superieure de
sejourner en prison que les X ! Mais ces Iaits n'ont jamais ete etablis
scientiIiquement et les journalistes ont qualiIie trop htivement de "tueur" ce
chromosome superIlu.
- Le mongolisme ou syndrome de DOWN resulte d'une non disjonction de la paire
d'autosomes n21 de telle sorte que les deux chromosomes passent dans le mme
gamete, aucun dans l'autre. Les gametes 2n1 et 2n-1 donnent apres Iecondation des
trisomiques 2n1 47 chromosomes et des individus monosomiques 2n-1 45
chromosomes, non viables. On a etabli une correlation etroite entre l'ge de la mere et
la probabilite de naissance d'un enIant trisomique 21: 11500 entre 20 et 30 ans; 1300
entre 40 et 45 ans et 160 au dela de 45 ans.
161
- Chez l'homme les cas de trisomie pour les chromosomes 8, 21 et X restent vivants.
Les trisomies 13, 18, 22 ont une duree de survie apres la naissance de quelque jours a
quelques annees (le plus ge des trisomiques 22 recenses avait 12 ans). Les trisomies
1, 2, 9, 16 provoquent des avortements plus ou moins precoces. On n'a jamais repere
de trisomie sur les autres chromosomes, qui bloquent probablement le developpement
embryonnaire a un stade tres precoce. On evalue que 25 a 50 des avortements
spontanes seraient dus a une anomalie chromosomique.

Rappelons que toutes ces anomalies sont dues a une mauvaise disjonction soit en
anaphase I soit en anaphase II de la meiose. Par exemple, X provient d'une non
disjonction des chromatides du chromosome lors de l'anaphase II de la meiose chez le pere,
ce qui produit des spermatozodes 22 .

La Deletion

Elle consiste en la perte d'un Iragment de chromosome. Ce Iragment peut tre terminal
ou situe dans une partie intermediaire du chromosome.
Une deletion entrane des troubles plus ou moins graves suivant l'importance des
phenomenes physiologiques contrles par les genes dont une copie est perdue. Elle
correspond en Iait a une monosomie partielle.
Chez l'homme, la deletion du bras court du chromosome 5 conduit au syndrome du
"cri du chat" ainsi denomme a cause du cri caracteristique qu'emettent les nourrissons qui en
sont aIIectes.

La Duplication

Elle consiste en la presence d'un Iragment surnumeraire dans un chromosome normal.
Elle correspond a une trisomie partielle. Ce Iragment supplementaire peut tre attache au
chromosome d'ou il provient, ou a un autre. La duplication apporte une dose anormalement
elevee d'alleles recessiIs etou dominants: les genes presents dans la zone dupliquee sont en
eIIet presents en trois exemplaires dans le genome.

L'inversion

Elle consiste en un retournement de la sequence des genes disposes lineairement sur le
chromosome. Par exemple, il se Iorme une boucle, terminale ou intercalaire, qui est suivie de
rupture et de resoudure. Une inversion peut modiIier le phenotype, ce qui montre que l'action
des genes ne depend pas uniquement de leur presence ou de leur absence mais aussi de l'ordre
dans lequel ils sont normalement places sur le chromosome. C'est ce qu'on appelle l'eIIet de
162
position. Notons aussi, que dans le cas d'une inversion heterozygote (1 seul des 2
chromosomes montre un segment inverse), l'appariement de la region concernee est plus
diIIicile, et les crossing-over qui s'y produisent aboutissent a des deletions, duplications et
translocations nombreuses. Finalement, les genes situes au niveau des points de rupture
peuvent tre modiIies.

La Translocation

Lorsqu'un Iragment de chromosome est transIere a un chromosome non homologue,
on dit qu'il y a translocation simple. Lorsque deux chromosomes non homologues echangent
des Iragments, on parle de translocation rciproque. Les changements que l'on peut
observer sont dus a l'eIIet de position et a la modiIication du gene situe au point de rupture.
En Iait, la translocation reciproque est un crossing-over illegitime qui se produit entre
deux chromosomes non-homologues.
Un type particulier de translocation est la translocation robertsonienne (Robertson,
1916) dite aussi Iusion centromerique qui s'opere entre chromosomes acrocentriques. Dans ce
cas, la translocation a lieu au niveau du centromere, les deux bras courts et leurs satellites
sont perdus et les deux chromosomes Iusionnes ne possedent plus qu'un seul centromere.
Chez l'homme, le cas le mieux connu est celui de la translocation entre chromosomes 13 et
21, qui se traduit par le mongolisme hereditaire. A titre d'inIormation, les grands singes
possedent 48 chromosomes. Notre chromosome 2 provient tres vraisemblablement d'une
translocation robertsonienne entre les chromosomes acrocentriques "2
p
" et "2
q
" de ces singes
que l'on ne retrouve pas chez nous.
Tous ces arrangements chromosomiques necessitent la cassure des chromosomes qui
peut se realiser a un moment quelconque du cycle cellulaire. Bien que se remarquant
nettement en meiose, la mutation chromosomique ne se produit pas a ce moment. Les causes
en sont encore inconnues, mais le vieillissement des cellules pourrait tre un Iacteur
determinant.
Chez les malades atteints de leucemie myelode chronique, on retrouve toujours un
chromosome 22 anormal (denomme chromosome "Philadelphie") dont la taille semble reduite
de moitie. En Iait il s'agit d'une translocation reciproque entre le extremites des bras longs des
chromosomes 9 et 22. Sur chacun de ces chromosomes, la rupture se Iait au milieu d'un gene:
ABL dans le chromosome 9 et BCR dans le chromosome 22. Le resultat de la translocation
est la creation de deux genes hybrides, BCRABL et ABLBCR. BCRABL est un oncogene,
c'est-a-dire un gene qui code pour une nouvelle proteine hybride anormale, qui deregle le
cycle cellulaire et induit une proliIeration anarchique des cellules, caracteristique du cancer.


163
3.3 APPARITION DES MUTATIONS

3.3.1 les mutations spontanees

La mutation spontanee des genes est peu Irequente et varie beaucoup d'un gene a
l'autre. Dans l'espece humaine, la taux moyen de mutation spontanee varie entre 10
-4
(1
gamete sur 10000 pour ce gene) et 10
-7
. Certains alleles nouveaux peuvent donc apparatre
spontanement. Mais, etant donne le nombre tres grand de genes portes par l'homme, des
calculs speculatiIs estiment qu'environ 23 des hommes pourraient porter dans leur genome au
moins une mutation nouvelle. D'autres calculs tout aussi speculatiIs n'arrivent qu'a 2. Quelle
que soit le chiIIre reel, les mutants ne sont pas rares. Ajoutons que les agents mutagenes, dont
nous parlerons plus loin, augmentent artiIiciellement la Irequence des mutations.

Ces mutations spontanees sont notamment dues a des erreurs de l'ADN polymerase
lors de la replication de l'ADN en phase S du cycle cellulaire. Dans ce cas, l'enzyme ne
respecte pas la complementarite AT et GC. La Irequence de ces erreurs est tres basse, mais
etant donne la grande taille de notre genome, leur nombre peut tre signiIicatiI. Notons que
des systemes de securite veriIient que l'ADN polymerase Iait bien son travail et corrigent
certaines erreurs, diminuant encore la Irequence de mutations.


3.3.2 les agents mutagenes

Les mutations naturelles etant rares, les geneticiens ont cherche a les provoquer
artiIiciellement dans des tres vivants dans des laboratoires (bacteries, mouches, souris.),
pour suivre leur transmission en recherchant des agents mutagenes. Ils se sont ainsi rendus
compte que le nombre de ceux-ci etait important. Parmi les principaux agents capables
d'induire des mutations, citons les radiations ionisantes et les substances chimiques.

Les radiations ionisantes

Les ondes electromagnetiques, pourvu qu'elles aient un pouvoir de penetration
suIIisant, sont capables de provoquer des aberrations au niveau du materiel hereditaire de par
l'energie (e hv ) qu'elles transportent (RX; ; rayons cosmiques) et sont donc sources de
mutations ponctuelles. Il en va de mme indirectement pour les rayonnements corpusculaires
(o; ; neutrons). Nous subissons environ une dose de rayonnement de 0,3 reman emanant des
sources naturelles (rayonnement cosmique, radon de l'atmosphere, rayons du sol,
40
K et
14
C
de notre propre corps). Une dose moyenne equivalente provient d'expositions medicales
164
(radiologie, radiotherapie). Cette dose n'est evidemment pas repartie de Iaon uniIorme et
depend des traitements subis. Les autres rayonnements d'origine humaine (centrales
nucleaires, essais nucleaires, irradiateurs industriels) sont normalement negligeables.

Il a ete demontre sur des drosophiles que le taux de mutation augmentait en Ionction
de la dose reue. Pour les cellules haplodes (gametes, bacteries...) il suIIit que le materiel
genetique soit touche une Iois pour que le gene puisse tre inactive. Le taux de mutations
induites est proportionnel a la dose . Pour les cellules diplodes, il Iaut que les deux garnitures
chromosomiques (les chromosomes homologues) soient touches simultanement pour Iaire
apparatre directement une mutation recessive.
L'eIIet mutagene des radiations depend donc surtout de leur quantite. Leur eIIet est
cumulatiI (en premiere approximation): que la dose soit appliquee en 1 ou en 10 Iois, l'eIIet
total reste le mme. Cette loi se revele touteIois inexacte aux tres Iaibles doses repetitives car
l'organisme possede des systemes enzymatiques capables de reparer le mieux possible, les
degts causes par les radiations.

On pense que l'eIIet toxique des radiations est principalement d a leurs eIIets sur
l'ADN: ruptures de chromosomes et mutations ponctuelles dans les cellules. Les cellules les
plus sensibles aux rayonnements sont les cellules en croissance car les rayonnements
bloquent la mitose (cellules de la moelle osseuse, cellules qui regenerent la muqueuse
intestinale, lymphocytes du systeme immunitaire). Une Iorte irradiation totale d'un homme
produit une destruction de toutes les cellules qui regenerent le sang, une maladie generalisee
et la mort quelques jours apres l'exposition. Une Iorte dose locale de rayonnements provoque
des brlures.
La sensibilite particuliere des cellules en croissance a conduit a une utilisation
therapeutique des rayonnements ionisants (la radiothrapie) pour traiter certains types de
cancers. Ce type de traitement n'est evidemment pas sans eIIets secondaires, mais est encore
utilise actuellement. Les rayonnements sont delivres a l'aide de machines complexes qui
concentrent la dose de rayons sur la tumeur en epargnant au maximum les tissus sains.

De part leur eIIet mutagene, l'exposition chronique a de Iortes doses de rayonnements
ionisants augmenterait le risque de cancer, notamment de certaines leucemies. Cet eIIet n'est
cependant pas aussi important qu'on le croit generalement. Le seul cancer qui a augmente de
Iaon importante apres l'accident de Tchernobyl est la cancer de la thyrode, du Iait de
l'accumulation d'isotopes radioactiIs de l'iode dans cet organe chez les personnes exposees.
Les Iortes doses d'U.V. (bronzage, banc solaire), a Iaible pouvoir penetrant, ont un
eIIet mutagene sur la peau et peuvent declencher des cancers de la peau comme le melanome.
Cet eIIet est bien demontre. L'action de ces radiations se traduit souvent par la liaison de 2
thymines successives sur la chane d'ADN: cette structure bloque completement la duplication
165
de la molecule avec les consequences que l'on devine. L'organisme humain possede
heureusement des mecanismes de reparation qui peuvent eliminer ces dimeres. Les malades
atteints d'une maladie genetique particuliere, la xerodermie pigmentee, presentent un deIaut
de reparation de l'ADN, et ont un risque tres eleve de cancer de la peau. La xerodermie
pigmentee est une deIicience genetique du mecanisme qui elimine les dimeres de thymine. Il
en resulte de serieux degts au niveau de la peau, suivis de cancers multiples. Il est a noter par
ailleurs que le nombre de cancers de la peau a Iortement augmente dans les pays occidentaux
et en Australie, depuis une vingtaine d'annees. Notons qu'une petite dose d'UV est cependant
necessaire a la synthese de la Iorme active de la vitamine D dans l'organisme.

Les rayonnements ionisants sont donc dangereux, mais leur eIIets toxiques ont
souvent ete exageres. Il sont utiles en medecine pour traiter certains cancers (radiotherapie) et
en radiographie.

Les substances chimiques

De nombreuses substances chimiques ont un pouvoir mutagene. En reagissant
chimiquement avec l'ADN, elles peuvent induire des mutations ponctuelles, des deletions ou
des insertions d'une paire de bases. Il s'agit de substances naturelles, souvent presentes a tres
Iaibles doses dans l'alimentation, de substances synthetisees par l'homme (notamment des
medicaments), et de produits de combustions.
De nombreuses plantes contiennent des substances mutagenes. Les doses varient
considerablement. Parmi les substances les plus dangereuses, citons l'aIlatoxine B, un
compose trouve dans un mycete qui contamine les recoltes d'arachides en AIrique et qui
provoque des cancers du Ioie.
Dans le passe, un certains nombre de substances mutagenes ont ete synthetisees et
utilisees parIois massivement par l'homme (pesticides, medicaments, additiIs alimentaires
comme le jaune de beurre.). Les substances chimiques utilisees par l'industrie Iont
actuellement l'objet de recherches et de contrles tres stricts, qui tendent a reduire les risques.
L'eIIet d'une exposition chronique (toute une vie !) a de Iaibles doses de certaines substances
est cependant diIIicile a evaluer.
Certains types de medicaments anticancereux induisent des alterations de l'ADN qui
bloquent la proliIeration des cellules, notamment des cellules tumorales. Ces medicaments
sont souvent les seuls disponibles pour traiter certains types de cancers, parIois avec succes.
Ils ont des proprietes mutagenes et provoquent des eIIets secondaires non negligeables. Leur
utilisation par le personnel hospitalier se Iait dans des conditions de securite stricte.
Un autre type de substances mutagenes provient des reactions de combustion: Iumees,
barbecue, incinerateurs, cigarettes, combustion des derives du petrole. Un des composes
166
mutagenes les plus etudies et les plus puissants est le benzopyrene, qui est un dangereux
cancerigene.

Les etudes sur l'action mutagene des substances chimiques sont actuellement un des
grands objets de recherche des laboratoires de toxicologie, specialement en ce qui concerne
les produits nouvellement synthetises par l'homme. Il est parIois tres diIIicile de determiner si
un produit est vraiment mutagene et dangereux. Pour toute substance, la dose a laquelle une
personne est exposee est un parametre tres important, qui determinera les consequences
toxicologiques et cliniques d'une exposition.

Comme pour les alterations de l'ADN induites par les radiations, les alterations dues
aux produits chimiques mutagenes peuvent, dans de nombreux cas, tre reparees par des
systmes de rparation de l'ADN perIectionnes.
Nos cellules, en particulier celles du Ioie, sont aussi equipees d'enzymes qui
permettent de degrader et eliminer les produits chimiques "etrangers" (appeles
xnobiotiques). Les medicaments Iont partie des substances degradees par ces enzymes. Ces
reactions enzymatiques particulieres constituent le metabolisme des xenobiotiques, qui sera
vu dans les cours des annees ulterieures.


3.4. MUTATIONS ET EVOLUTION

Nous venons de voir que des mutations apparaissent constamment dans une
population d'tres vivants, suite a des erreurs de l'ADN polymerase ou a des expositions a des
rayonnements et a des composes naturels (ou plus recemment, artiIiciels). Ces mutations
apparaissent au hasard n'importe ou dans le genome. Certaines mutations sont sans
consequence: elles n'auront donc pas d'impact. D'autres inactivent des genes essentiels. Si
leur eIIet est dominant, ou que les deux alleles sont atteints, elles peuvent conduire a la mort
de la cellule.
Lorsque ces mutations se produisent dans les cellules germinales, elles peuvent tre
transmises a la descendance de l'individu. Ces mutations peuvent inIluencer (positivement ou
negativement) de nombreux Iacteurs, comme le developpement de l'embryon jusqu'a l'ge
adulte, la capacite a resister a certaines maladies, la capacite a survivre dans certaines
conditions environnementales, la Iertilite. De ce Iait, certains individus seront Iavorises par
rapport a d'autres, et auront plus de chance de procreer et donc de transmettre leur caracteres
aux generations suivantes. Ce mecanisme est la base de la theorie de l'evolution, dont les
Iondements ont ete etablis par Darwin au XIX
e
siecle. Cette theorie est scientiIiquement bien
etayee.

167

4. LES LOIS DE MENDEL
__________________________________________________

4.1 INTRODUCTION ET HISTORIQUE

Connaissant actuellement la nature du materiel genetique, l'ADN des chromosomes, la
maniere dont ceux-ci se transmettent a la generation suivante via la meiose et la Iecondation,
connaissant par ailleurs le mode d'expression des genes, il nous est Iacile de comprendre les
regles qui president a la transmission de caracteres parentaux a leur descendance.
N'oublions cependant pas que les lois Iondamentales de l'heredite ont ete decouvertes
bien avant que tous ces elements sur lesquels nous nous Iondons (ADN, chromosomes,
mitose, meiose, proteosynthese) ne soient decouverts, ni mme souponnes.
Le Iondateur de la genetique est Gregor MENDEL. Ses travaux peuvent encore de nos
jours, tre pris comme exemple de rigueur scientiIique dans le raisonnement et de
perspicacite dans la conduite d'un programme experimental. C'est entre 1856 et 1863 que
Johann Gregor MENDEL (1822-1884), moine augustin de Moravie (Tchecoslovaquie), realisa
ses experiences de croisement sur des pois cultives dans les jardins du monastere de Brnn.
Les resultats de ses travaux sur l'heredite Iurent publies en 1866 dans le Bulletin de la Societe
des Naturalistes de Brnn, et demeurerent pratiquement ignores jusqu'en 1900 (une dizaine
de citations par d'autres auteurs). C'est a cette epoque que ses resultats Iurent redecouverts
par plusieurs biologistes travaillant separement sur des materiaux divers ( de VRIES en
Hollande, CUENOT en France, CORRENS en Allemagne, von TSCHERMAK en Autriche,
BATESON en Angleterre). Ils s'aperurent alors, en Iaisant leur bibliographie, qu'ils avaient
ete devances d'un tiers de siecle.
Bien que des experiences de croisements Iurent eIIectuees avant MENDEL (MOREAU
de MAUPERTUIS, 1750; KOLREUTER, 1770; KNIGHT, 1841; NAUDIN,1861...), l'absence de
donnees numeriques et d'explications satisIaisantes les ont maintenues dans l'empirisme.

Le succes de Mendel a ete conditionne par plusieurs Iacteurs :

1) Le choix judicieux du matriel expriment:
Le pois (Pisum sativum L) est une plante qui crot rapidement. Les organes sexuels
de la plante (etamines et pistil) arrivent a maturite avant l'ouverture de la Ileur (avant
l'anthese), si bien que l'autoIecondation y est de regle . La Ileur et ses organes sont
suIIisamment grands pour que l'on puisse realiser l'excision des etamines avant leur maturite,
suivie de la pollinisation par du pollen provenant d'une autre Ileur. L'experimentateur peut
donc realiser de Iaon contrlee une Iecondation croisee, Iecondation reciproque ou une
168
autoIecondation. De plus il existe un nombre assez important de varietes pures et stables dans
le temps.

2) La mthode de travail:
- MENDEL a eu soin d'eIIectuer des castrations et les Iecondations croisees d'une
maniere meticuleuse et systematique qui lui permettait de "diriger" les croisements qu'il
operait. En eIIet, d'une part, il eliminait tout danger de souillure pollinique etrangere et,
d'autre part, il annulait l'eIIet eventuel d au sexe des parents;
- MENDEL a eu soin de ne choisir, pour ses experiences d'hybridation, que des varietes
qui possedent des caracteres phenotypiques aisement discernables et qui se transmettent par
autoIecondation normale, de generation en generation: coloration rouge ou blanche de la
Ileur, coloration jaune ou verte du Iruit, Iorme ronde ou ridee de la graine...
- MENDEL a eu soin d'appliquer le second principe de DESCARTES, a savoir qu'il Iaut
toujours diviser les problemes complexes en une suite de problemes simples. Pour ce Iaire, il
commena par etudier la transmission d'un seul caractere, avant de se pencher sur des
problemes plus vastes.

3) L'analyse numrique
MENDEL eut le grand merite de quantiIier exactement ses resultats, d'etayer son
hypothese par un modele mathematique coherent et de les soumettre a une analyse
statistique appropriee. On estime ainsi qu'il observa quelque 27000 plants appartenant a 34
varietes diIIerentes et qu'il compta plus de 300 000 graines. Pour son epoque, c'etait une
revolution! Ses hypotheses, qui sont maintenant des lois, Iurent alors experimentees sur
d'autres plantes, telles le haricot mange-tout pour en veriIier le bien Ionde.

4) La chance:
Il est certain que la chance Iavorisa MENDEL car il ne pouvait savoir qu'en choisissant
les Pois comme materiel experimental, il s'adressait a une plante diplode, chez laquelle la
reproduction sexuee se deroule normalement et chez laquelle aussi, l'heredite des caracteres
retenus etait simple... Mais ne dit-on pas que la chance ne Iavorise que ceux qui s'y sont
prepares?...
Et quoi qu'il en soit, les lois decouvertes par Mendel constituent le Iondement de la
genetique moderne, et a ce seul titre, ce chercheur merite toute notre admiration.

4.2. LA PREMIERE LOI DE MENDEL


Pour suivre la transmission des caracteres hereditaires, il Iaut croiser des individus qui
sont de races pures qui diIIerent par un ou plusieurs caracteres. En eIIet, si les parents sont
identiques, il sera impossible de savoir de qui proviennent les caracteres transmis. Le cas le
169
plus simple est celui ou les parents diIIerent par un seul caractere bien apparent (en genetique
vegetale, ce cas est generalement appele monohybridisme).
Dans une premiere experience, MENDEL croise deux varietes de pois (Pisum sativum
L): l'une donne des pois ronds, l'autre des pois rides. Ces varietes sont des races ou des
lignes pures, car par reproduction naturelle (autofcondation), elles montrent toujours ces
mmes caracteres. Ce sont des varietes bien Iixees et constantes.

Lorsqu'on croise des varietes parentales, designees par P, le pollen de la variete a pois
ronds est depose sur les stigmates de la variete a pois rides et reciproquement, le pollen de la
variete a pois rides est depose sur le stigmate de la variete a pois ronds (croisement
rciproque, ce qui elimine une inIluence eventuelle du sexe); dans tous les cas, toutes les
graines obtenues sont rondes.
La caracteristique de cette premiere generation filiale (denommee F
1
) est donc
l'uniformit, tous les individus ont le mme aspect exterieur, entrainant comme corollaire, la
disparition du caractere dun des parents.
Par autoIecondation des plantes de la F
1
, on obtient une deuxieme generation F
2
.
MENDEL constate en F
2
que, sur 8023 pois obtenus, 6022 sont ronds et 2001 rides. Le
caractre rid rapparat avec ses particularites completement developpees et ce dans la
proportion de 3 ronds pour 1 ride.

Ces constatations provoquerent chez MENDEL une suite d'intuitions que les
experiences ulterieures allaient etayer.
La principale est que, contrairement aux idees de son epoque, l'heredite ne se realise
pas par transmission directe du caractere, car en eIIet, comment expliquer que les plantes a
pois ronds aient donne des pois rides? Pour que le caractere ride reapparaisse en F
2
, il doit
necessairement exister en F
1
, intact mais cache. MENDEL introduit alors les notions de
caractere dominant et rcessif.
Pour expliquer les resultats de la F
2
, MENDEL imagina que ces caracteres etaient
portes par des "Iacteurs" provenant de chacun des parents. Le parent de race pure rond, Iut
note R, l'autre parent, ride, recessiI, r. Lors de la Iormation des cellules reproductrices,
chacune de celles-ci emportait un exemplaire de ce Iacteur. Lors de la Iecondation, les
individus de la F
1
, hybrides, avaient donc comme Iormule Rr. La seconde intuition de Mendel
Iut que, au cours de la Iormation des gametes des hybrides de la F
1
, chacun de ceux-ci
n'emportait qu'un seul des deux facteurs. Il y avait sgrgation, separation qui produisait
50 des gametes possedant le "Iacteur" R et 50 le "Iacteur" r.
La troisieme intuition de MENDEL Iut que la Iecondation se realisait au hasard, c'est-a-
dire qu'un gamete mle R avait autant de probabilite de Ieconder un gamete Iemelle R qu'un
gamete Iemelle r. Il en allait de mme pour les gametes mles r; ce qui aboutissait aux
170
proportions observees de 3 plantes a pois ronds pour 1 plante a pois rides (3 : 1) comme le
montre le tableau suivant

mles
Iemelles
50R 50r
50R 25RR 25Rr
50r 25Rr 25rr

Dans notre exemple, les individus ne portant qu'un seul type de Iacteur pour le
caractere couleur (R pois ronds; r pois rides) sont dits homozygotes pour ce caractere. Plus
tard, les geneticiens ont etabli que les homozygotes possedaient deux "Iacteurs" identiques
(RR ou rr). Les individus qui possedent simultanement deux Iacteurs diIIerents se rapportant
au mme caractere sont denommees htrozygotes.

Une premiere preuve de l'exactitude des hypotheses de MENDEL se situe au niveau de
l'etude des individus de la F
3
produite par autoIecondation des individus de la F
2
.
Si l'hypothese est juste, les plantes a pois rides (r) de la F
2
ne devraient produire que des
plantes a pois rides puisqu'elles sont de race pure. Parmi les plantes a pois ronds de la F
2
, une
partie (13) sont identiques aux parents ronds purs R et ne devraient donner que des plantes a
pois ronds; les autres (23), semblables a leurs parents de la F
1
(Rr) devraient donner une
descendance composee de 3 plantes a pois ronds pour 1 plante a pois rides. C'est
eIIectivement ce qu'il observa.

Pour veriIier que l'hybride produit deux types de gametes et en nombres egaux,
MENDEL imagina un test encore couramment utilise aujourd'hui, connu sous le nom de
rtrocroisement ou back-cross. L'hybride Rr est croise avec le parent pur recessiI rr.
Sachant que le parent rr ne peut produire que des gametes r, si l'hybride Rr Iournit 50 de
gametes R et 50 de gametes r, le retrocroisement doit Iournir 50 de plantes Rr a pois
ronds, et 50 de plantes r a pois rides. C'est aussi ce qu'il constata; quel que soit le sens du
croisement (croisements reciproques, Rr Iecondant r ou r Iecondant Rr).
Ce test permet en outre de determiner la "purete" genetique d'un individu puisqu'un
hybride donnera 50 des deux phenotypes tandis que le parent de race pure donnera 100
d'individus de son propre phenotype comme dans la premiere etape P -- F
1
. C'est dans ce but
que ce test est surtout utilise actuellement en botanique ou en genetique animale. Notons que
le back-cross est la seule methode utilisable chez les plantes unisexuees et chez les animaux
ou il ne saurait tre question d'autoIecondation au sens reel du terme.

171
MENDEL Iit des observations identiques a celles decrites plus haut a propos de six
autres caracteres simples etudies sur les pois : (pois jaunes ou vert; teguments colores ou
incolores; cosse pleine ou plissee; cosse ridee ou rond; Ileur axillaire ou terminale; variete
naine ou geante) et il enona sa premiere loi:

Loi de l'uniIormite en F1 et de la segregation en F
2
:

Lorsqu'on croise deux races qui ne diIIerent entre elles que par un seul caractere
(monohybridisme), les hybrides de la F
1

sont tous semblables entre eux et presentent
l'association des caracteres des parents, compte tenu de la dominance. En seconde generation
F
2
, issue des hybrides de la F
1
, il y a disjonction (segregation) des caracteres parentaux et
apparition de 25 d'individus de race pure paternelle, 25 d'individus de race pure
maternelle et 50 d'individus semblables aux hybrides de la F
1
. Ces derniers individus se
dissocient a la generation suivante et indeIiniment de la mme maniere.

L'interprtation actuelle des faits

La Iorme des pois est contrlee par un gne R, dont il existe deux allles diIIerents:
un allele R dominant qui produit des pois rond, et un allele r recessiI qui produit des pois
rides. Le pois etant une plante diplode comme la majorite des plantes superieures, il possede
deux copies du gene r, situees sur deux chromosomes homologues, au mme endroit (appele
locus du gene).
Lors de la meiose, les chromosomes homologues se retrouvent dans des gametes
diIIerents. Si les deux chromosomes portent le mme Iacteur R (individus homozygotes
ronds), tous les gametes produits porteront ce Iacteur R et seront donc identiques. De mme
les gametes issus du parent "ride" seront tous identiques. Si les deux chromosomes portent
des alleles diIIerents (R et r dans l'experience de Mendel, individus htrozygotes), 50 des
gametes porteront l'allele R et 50 l'allele r. Lors de la Iecondation, les gametes mles et
Iemelles s'associent de maniere aleatoire et on peut utiliser les regles mathematique de
probabilites:

En deuxieme generation (croisement Rr x Rr):

p(RR) p(gamete R) . p(gamete R) 0,5 . 0,5 0,25 soit 25
p(Rr) p(gamete R) . p(gamete r) p(gamete r) . p(gamete R)
0,50 . 0,5 0,5 . 0,5 0.25 0.25 0.5 soit 50
avec p(RR), la probabilite d'obtenir un individu RR
p(gamete R) la probabilite que la mere produise un gamete R

172
Puisque deux genotypes diIIerents exteriorisent le mme phenotype, la connaissance
de celui-ci ne permet pas de connatre automatiquement le genotype. Il Iaudra Iaire un
rtrocroisement pour voir si des individus a phenotype dominant sont homozygotes ou
heterozygotes (RR ou Rr). Encore que, sur un petit nombre d'observations (p ex la
descendance d'animaux), il est statistiquement possible, que par le seul hasard, un
heterozygote retrocroise avec le recessiI ne donne que des individus de phenotype dominant,
Iaisant croire a un homozygote! Dans la descendance d'un retrocroisement, l'existence d'un
seul phenotype recessiI constitue la preuve que le parent teste etait heterozygote mais
l'absence totale de phenotype recessiI ne constitue pas la preuve absolue que l'individu teste
soit homozygote! (Tout au plus peut-on calculer la probabilite de se tromper en aIIirmant
qu'il l'est). Dans les experiences relatives a l'etablissement des proportions phenotypiques, il
est essentiel de considerer un grand nombre d'individus. Selon cette loi, les resultats observes
se rapprochent d'autant plus des resultats attendus theoriquement que le nombre d'individus
testes est grand. Des tests statistiques ("chi carre") permettent de calculer la concidence entre
les observations et les previsions theoriques de l'hypothese qu'une experience est censee
veriIier. Les tests permettent d'accepter une hypothese (ou de la rejeter quand elle prevoit des
resultats trop eloignes des observations reelles) mais ne prouvent jamais qu'une hypothese est
bonne. Ils mesurent simplement les chances qu'on a de se tromper en acceptant cette
hypothese. Dans le cas d'analyse de transmission de genes chez l'homme, le nombre
d'individus sera souvent limite et la plus grande prudence s'impose quant aux conclusions qui
peuvent tre tirees.

L'explication de la dominance

Le phenomene de dominance est parIois complexe. Dans certains cas simples, l'allele
recessiI produit une enzyme non Ionctionnelle se traduisant par un phenotype "absence
de.". Prenons l'exemple du lapin: la graisse sous-cutanee du lapin sauvage est blanche
tandis que celle du lapin domestique est jaune. Si l'on croise deux de ces lapins, les hybrides
ont une graisse blanche. En seconde generation, il y a disjonction et on obtient 3 lapins a
graisse blanche pour un lapin a graisse jaune. L'allele graisse blanche domine donc l'allele
graisse jaune.
La diIIerence de couleur entre les deux graisses provient de la presence ou de
l'absence de xanthophylles non degradees. La graisse du lapin sauvage est blanche parce que
les xanthophylles presentes normalement dans sa nourriture sont degradees en substances
incolores par une enzyme localisee dans le Ioie. Au contraire, le lapin domestique a perdu la
Iaculte de synthetiser cette enzyme, les xanthophylles (jaunes) s'incorporent telles quelles
dans sa graisse et la colorent. Le lapin hybride Bb possede une graisse blanche parce que
l'allele B (la portion d'ADN) code la Iormation de l'enzyme speciIique en quantite suIIisante
pour degrader la xanthophylle ingeree. Dans ce cas, les genotypes BB et Bb produisent le
173
mme phenotype. Mais en derniere analyse, ce phenotype jaune ou blanc depend d'un Iacteur
externe, d'un Iacteur du milieu : la presence de xanthophylle dans la nourriture. Il est evident
que si l'on nourrit le lapin domestique avec une nourriture depourvue de xanthophylle, il aura
comme le lapin sauvage une graisse blanche. Ceci souligne le Iait sur lequel nous avons deja
insiste, a savoir qu'un gene determine une potentialite et que l'exteriorisation de cette
potentialite est conditionnee par le milieu.
Les groupes sanguins et l'hemophilie, comme nous le verrons dans la suite, constituent
deux autres exemples ou l'allele recessiI code une proteine non Ionctionnelle, et ou une seule
copie normale produit suIIisamment de proteine normale pour que le phenotype des individus
hererozygotes soit le mme que celui des individus homozygotes.

4.3 APPLICATIONS A L'HOMME

CARAC1ERES DOMIAAA1S

On a repertorie chez l'homme plus de 1500 genes dominants transmis selon les lois de
MENDEL. Il en est ainsi vraisemblablement de la pigmentation normale des cheveux, des
taches de rousseur, de l'absence de poils sur tout le corps (a ne pas conIondre avec la
calvitie), de la Iorme et de la densite des sourcils (a l'exception des sourcils minces), des
cheveux boucles, des cheveux noirs par rapport aux cheveux blonds, du prognathisme, de la
mal articulation des dents, de la Iaculte de rouler ou de plier la langue, du lobe de l'oreille
detache, de la sensibilite gustative a la phenylthiouree, de la Iorme du nez, des empreintes
digitales, de la couleur des yeux (en realite de la couleur de l'iris; dans ce dernier exemple, les
yeux noirs ou bruns Ionces sont dominants par rapport aux yeux bleus)...

Entre la dominance complete (absolue) et l'absence de dominance (ou presence de
codominance), certains caracteres presentent une dominance incomplte. Dans ce cas, le
phenotype des heterozygotes n'est pas identique a celui des homozygotes pour l'allele
dominant.

Chez l'homme, la recherche de maladies hereditaires rares se Iait par l'analyse des
arbres genealogiques des Iamilles ou on la rencontre. Une maladie autosomique dominante se
repere par les caracteristiques suivantes:
1) il y a des individus atteints a chaque generation;
2) si le conjoint est "normal", environ la moitie (si le patient est heterozygote) ou la totalite
(homozygote) de la descendance montre la tare;
3) les enIants non atteints ne la transmettent pas a leur descendance;
4) la transmission n'est pas inIluencee par le sexe du porteur.
174
Actuellement les techniques de genie genetique permettent de conIirmer ces analyses en
sequenant directement les alleles des individus, permettant de determiner s'ils sont
homozygotes ou heterozygotes. Ce type d'analyse, reservee au depart aux laboratoires de
recherche, est maintenant accessible dans des laboratoires de routine hospitaliere. Ceci n'est
bien sr possible que si le gene responsable de la maladie a ete identiIie, ce qui n'est pas
toujours le cas.
Parmi les maladies transmises selon le mode dominant, citons la choree de
Huntington, l'achondroplasie, l'osteogenese imparIaite et certaines Iormes de syndactylie.

CARAC1ERES RECESSIFS

Tout homme possede dans son patrimoine hereditaire des alleles recessiIs (tare
quelconque, malIormation, maladie...) qu'il ne remarque pas. Seul l'examen de la descendance
pourrait les devoiler, puisque, dans ce cas, un back-cross est inconcevable! On a estime
d'apres le nombre de maladies hereditaires recessives, letales et leur Irequence d'apparition,
que chaque individu pourrait tre porteur de huit genes letaux! Si 1 de la population
possede l'allele recessiI d'une tare, il n'y a une probabilite de (1)
2
soit 110 000 que la tare
apparaisse. A l'inverse, il s'en suit que des proches parents, dont les genes sont en partie
derives des mmes sources, ont une probabilite beaucoup plus elevee de transmettre a leur
descendance une tare recessive a l'etat homozygote, que ceux qui ne sont pas apparentes.
C'est pourquoi des troubles et des malIormations rares apparatront plus souvent dans la
descendance d'unions consanguines. Cette observation (connue bien longtemps avant les lois
de l'heredite) est peut-tre la raison pour laquelle les lois civiles et religieuses deIendent les
unions entre personnes etroitement apparentees: Irere-soeur, oncle-niece...et certaines lois
deIendent mme les unions entre cousins germains. Deux cousins germains ont encore un
huitieme de leurs genes en commun. Leurs descendants sont donc homozygotes pour 116 de
leurs genes.

On connat plus de 1200 maladies ou malIormations recessives chez l'homme:
l'albinisme, le nanisme vrai, l'idiotie inIantile, la cecite totale aux couleurs, la mucoviscidose,
l'anemie IalciIorme... Il existe actuellement des bases de donnees accessibles a partir
d'internet repertoriant les maladies congenitales connues et leur type de transmission
(notamment la banque de donnees OMIM "Online Mendelian Inheritance In Man" ,
accessible a partir du site http:www.ncbi.nlm.nih.gov).

Un caractere recessiI se remarque dans une genealogie parce que :
1) si une personne l'exteriorise, il n'apparat pas Iorcement chez ses parents ni ses enIants,
mais peut apparatre chez certains Ireres et soeurs;
175
2) en moyenne (si l'on regroupe un grand nombre de Iamilles ou un enIant presente ce
caractere), un enIant sur quatre est atteint;
3) les parents peuvent presenter une certaine consanguinite.

CARAC1ERES CODOMIAAA1S: LES CROUPES SAACUIAS

Le gne ABO

Un des exemples classiques en genetique est l'heredite des groupes sanguins (systeme
ABO). Cet exemple permet d'illustrer deux nouveaux concepts: la codominance et la
polyallelie. Dans les cas de codominances, deux alleles diIIerents peuvent tous les deux
s'exprimer en mme temps. La polyallelie veut simplement dire qu'au lieu d'avoir seulement
deux alleles diIIerents pour un mme gene, il peut exister un grand nombre d'alleles. Il est
evident qu'une cellule diplode ne possedant que deux copies de chaque gene, ne possedera
qu'un ou deux des alleles existants.

Dans le cas du systeme ABO, il existe quatre alleles diIIerents d'un mme gene.
Les globules rouges (hematies) possedent en surIace des polysaccharides particuliers,
denommes agglutinogenes. La nature de ces sucres se transmet selon les lois de Mendel avec
la participation de 4 alleles diIIerents :
L'allele I
a1
encode une enzyme qui produit l'agglutinogene A
1
;
L'allele I
a2
encode une enzyme qui produit l'agglutinogene A
2
;
L'allele I
b
encode une enzyme qui produit l'agglutinogene B;
L'allele I
o
n'entrane la Iormation d'aucun agglutinogene.
L'allele I
a1
est dominant par rapport a I
a2
. I
a1
et I
a2
sont codominants vis-a-vis de I
b

et ils peuvent s'exprimer simultanement. I
o
est Iorcement recessiI par rapport aux autres. En
Belgique, 80 a 90 des sujets A sont A
1
et le reste A
2
. Dans la pratique medicale, la
distinction A1-A2 n'a pas beaucoup d'intert, et les deux alleles sont souvent appeles
simplement "A".

Par ailleurs, le serum Iabrique quelques mois apres la naissance des anticorps appeles
agglutinines. Elles proviennent des reactions d'immunodeIense de notre corps et ne sont pas
transmises genetiquement. Il en existe de deux sortes: o et . Par reaction antigene-anticorps,
l'agglutinine o (ou anti-A) agglutine les globules rouges qui portent l'agglutinogene A
1
ou
A
2
. De mme l'agglutinine (ou anti-B) agglutine les hematies contenant l'agglutinogene B.
Il est clair qu'un individu ne possede jamais simultanement A et o ou B et sinon, il y
aurait auto-agglutination de ses hematies, ce qui est incompatible avec la vie. On ne peut
donc eIIectuer de transIusion sanguine qu'entre individus dont le sang est compatible.

176
Le tableau suivant montre qu'il existe ainsi 10 genotypes possibles, mais comme
certains exteriorisent le mme phenotype, il n'existe que 4 phenotypes, 4 groupes sanguins
diIIerents ; A, B , AB et O. Des variantes existent, assez rares.

genotype phenotype groupe sanguin agglutinine

I
a1
I
a1
A
1
A
I
a1
I
a2
A
1
A
I
a1
I
o
A
1
A
I
a2
I
a2
A
2
A
I
a2
I
o
A
2
A
I
b
I
b
B B a
I
b
I
o
B B a
I
a1
I
b
A
1
B AB aucune
I
a2
I
b
A
2
B AB aucune
I
o
I
o
O O a et

Les transIusions permises peuvent tre schematisees comme suit en ce qui concerne les
globules rouges uniquement:
O---- O, A, B, AB ("donneur universel")
A---- A, AB
B---- B, AB
AB----AB ("receveur universel")

Notons que le terme de "donneur universel" n'est pas tres heureux puisqu'il ne
s'applique qu'aux globules rouges. En eIIet, lorsque l'on donne du sang O a un receveur du
groupe A, ce dernier reoit, non seulement les globules rouges mais aussi le serum. Or, le
serum du groupe O contient des agglutinines o et . Si l'agglutinine a peu d'importance
pour le receveur A, l'agglutinine o va se trouver en presence de l'agglutinogene A et pourrait
provoquer l'agglutination. Heureusement, quand la transIusion est peu abondante,
l'agglutinine o injectee est Iortement diluee dans la masse sanguine du receveur A et elle se
repartit, sans dommage, sur un important volume de globules rouges. Il existe touteIois des
"donneurs universels dangereux" qui possedent des agglutinines particulierement puissantes
et qui constituent un risque grave pour les globules rouges du receveur. C'est pourquoi, on
preIere toujours transIuser du sang appartenant au mme groupe que le receveur. Ce n'est
qu'en cas d'urgence que l'on transIusera du sang de groupe O a des personnes de groupe
sanguin inconnu.
On determine les groupes sanguins a partir de serums prepares avec du sang de
donneurs A et B possedant des agglutinines, et o, puissantes.
177
On procede de la maniere suivante: une goutte de sang inconnu est mis en contact separement
avec les serums o et (tableau ci-apres). Si o agglutine les globules rouges et pas , c'est que
le sang est du groupe A; si c'est l'inverse, le sang est du groupe B; si o et agglutinent le
sang, celui-ci est du groupe AB et enIin, s'il n'y a aucune agglutination, le sang est du groupe
O.
Globules rouges inconnus:
agglutination par ! --- Gr sanguin
- A
- B
AB
- - O
La technique inverse permet de determiner le groupe sanguin d'un serum inconnu a partir de
la mme reaction d'agglutination sur des globules rouges appartenant aux groupes A et B.

L'explication de ces antigenes est la suivante: tous nos globules rouges
possedent en surIace, accroches tant a certaines proteines qu'a certains lipides, un
polysaccharide schematise ci-dessous :

m
e
m
b
r
a
n
e
1 2 3 2
4
5

1 glucose, 2 galactose, 3 N acetylglucosamine, 4 Iucose.
Tel quel, ce polysaccharide n'a pas d'eIIet antigenique.
L'allele I
a
code pour une glucosyltransIerase qui ajoute en 5 du N acetylgalactosamine
L'allele I
b
code pour une glucosyltransIerase qui ajoute en 5 du galactose
L'allele I
o
n'ajoute rien
Entre I
a
et

I
b
, il y a 4 bases qui changent, donc 4 triplets diIIerents, donc 4 acides amines
diIIerents.
Le site actiI de la glucosyltransIerase est de ce Iait un peu modiIie :
l'enzyme synthetise par I
a
utilise l'UDP-N acetylgalactosamine
l'enzyme synthetise par I
b
utilise l'UDP-galactose
Ils s'expriment donc tous les deux et sont donc codominants
I
o
a subi une deletion ponctuelle. Il a perdu une base. Cela entrane un decalage du cadre de
lecture d'ADN, ce qui conduit a une proteine non Ionctionnelle. Il n'a donc pas de sucre
ajoute en 5 et l'allele est recessiI.

178
Le facteur Rhsus

Outre ces incompatibilites, le Iacteur rhesus joue egalement un rle important dans la
transIusion sanguine. Ce Iacteur Iur decouvert en 1940 (LANDSTEINER WIENER -
MOUREAU a Liege). Lorsqu'on injecte pour la premiere Iois du sang d'un singe macaque
(Macacus rhesus) a un lapin, celui-ci demeure en vie. Mais apres une seconde injection
pratiquee un mois apres la premiere, le lapin meurt car son serum a agglutine les globules
rouges du macaque. Les globules rouges du macaque contiennent un agglutinogene Rh qui
provoque la Iormation, chez le lapin, d'anticorps (agglutinine) anti-Rh. La premiere injection
induit la Iormation (lente) des anti-Rh dont la quantite devient alors suIIisante pour
provoquer l'agglutination du sang lors de la seconde injection.
Chez 85 des hommes de type caucasien, les globules rouges possedent un
agglutinogene Rh equivalent a celui du macaque. Ils Iorment le groupe Rh

. Les 15
restants n'ont pas cet agglutinogene mais peuvent Iormer des agglutinines anti-Rh identiques
a celles du lapin. Ils Iorment le groupe Rh
-
.
Comme le Iacteur Rh caracterise indiIIeremment le sang des groupes A, B, AB ou O,
il est indispensable d'imposer lors d'une transIusion, les mmes mesures de securite que pour
les groupes sanguins. En eIIet, si l'on donne du sang O

a un receveur O
-
, la premiere
transIusion n'aura pas d'eIIet immediat, mais le receveur Iabriquera des agglutinines anti-Rh
qui le mettront hors d'etat de supporter une nouvelle transIusion de sang O

.
Le Iacteur Rh est hereditaire et depend tres schematiquement d'une paire d'alleles: D
exteriorise Rh

et domine l'allele d qui exteriorise Rh


-
. Les genotypes DD et Dd
correspondent au groupe Rh

et dd au groupe Rh
-
.
Dans les unions entre un homme Rh

et une Iemme Rh
-
(un couple sur dix est dans ce
cas) il peut se poser de graves problemes en cas de naissance d'un enIant Rh. Il n'y aura
jamais de problemes si l'enIant est Rh- comme sa mere (possible si le pere est heterozygote).
La naissance du premier enIant Rh

ne pose pas de probleme. Mais lors de l'accouchement,
une Iaible quantite de son sang peut passer accidentellement dans le sang de la mere. Celle-ci
va donc recevoir une Iaible quantite de globules rouges Rh

qui peut tre suIIisante pour


declencher la Iabrication d'anticorps anti-Rh. Si un second enIant Rh

est conu, les


agglutinines anti-Rh Iabriquees par la mere peuvent traverser le placenta et detruire le sang du
nouveau Ioetus Rh

au Iur et a mesure qu'il se Iorme. Il se peut donc que le Ioetus n'acheve


pas son developpement, et s'il nat malgre tout, il sera atteint de la maladie hemolytique du
nouveau-ne. Lorsque le nouveau-ne est atteint de la maladie hemolytique, on peut pratiquer
une exsanguino-transIusion a la naissance et mme in utero. Il est evident que la situation des
enIants Rh

suivants est de plus en plus grave. Fort heureusement, il existe un grand


desaccord entre les donnees theoriques et la realite: un seul cas de maladie hemolytique sur
200 naissances. Cela est d a plusieurs Iacteurs: la barriere placentaire peut tre plus ou
moins eIIicace pour le transIert d'anticorps; la mere peut reagir plus ou moins energiquement
179
aux antigenes de son enIant. De plus, il ne Iaut pas oublier l'existence des groupes A, B, O. Si
la mere est O
-
et que l'enIant rhesus positiI n'est pas du groupe O (A

ou B

), le serum de la
mere possede deja les anticorps o et qui vont eliminer les globules rouges A et B de l'enIant
qui passent dans son propre circuit sanguin avant qu'ils n'y declenchent la reaction
d'immunisation.
Actuellement, on protege la mere Rh
-
par une injection intramusculaire de
immunoglobulines anti-Rh dans les 72 heures qui suivent la naissance de l'enIant Rh

. Ces
immunoglobulines sont preparees a partir de plasma sanguin de donneurs sensibilises
(donneurs Rh
-
auxquels on a injecte une petite quantite de Rh

). Elles detruisent les


eventuels globules rouges Rh

que la mere aurait reus de l'enIant avant que celle-ci ne


Iabrique elle-mme ses propres anti-Rh. Ulterieurement, ces immunoglobulines anti-Rh
injectees sont detruites naturellement et disparaissent de la circulation sanguine de la mere,
puisqu'elle n'en synthetise pas elle-mme. L' injection d' immunoglobulines anti-Rh doit tre
renouvelee apres chaque naissance d'enIant Rh

.

D'apres les statistiques du Centre de TransIusion Sanguine a Woluwe, la repartition
des groupes sanguins en Belgique est la suivante : 42,5 Iont partie du groupe O; 42,5 Iont
partie du groupe A ; 12 Iont partie du groupe B; 3 Iont partie du groupe AB. Il y a
environ 85 de Rh

et 15 de Rh
-


En plus des systemes "ABO" et "Rh", d'autres ont ete decouverts dont le systeme
"MN" tres simple. L'heredite de M et de N, responsables de l'apparition a la surIace des
globules rouges des antigenes M et N est independante de celle qui regit les systemes ABO et
Rh. Dans la population, on rencontre les trois phenotypes MM, MN, NN. L'existence de
chacun des antigenes M et N est due a la presence des alleles codominants L
M
et L
N
. Les
genotypes sont L
M
L
M
, L
M
L
N
, L
N
L
N
. Notons que les antigenes M et N n'ont aucune
importance lors des transIusions sanguines car l'homme ne possede pratiquement jamais les
anticorps correspondants. Ils sont surtout utilises dans les problemes d'identiIication de sang.

Mendel etudia dans ses travaux des systemes ou plus de deux alleles du mme gene
etaient presents. Les botanistes ont garde le terme polyhybridisme pour designer ce type de
situation.

4.4 LES NOTATIONS EN GENETIQUE

Pour diIIerencier les alleles, MENDEL a introduit la notation suivante : la premiere
lettre de l'allele dominant est en majuscule (R pour rond, V pour violet), la lettre minuscule
correspondante pour l'allele recessiI (r pour ride, v pour blanc).
180
Les scientiIiques qui etudient la drosophile, comme Morgan, et qui ont beaucoup
contribue au developpement de la genetique, ont adopte une autre notation. Quel que soit le
caractere etudie, l'allele responsable de l'expression du phenotype "sauvage" ("wild-type",
c'est-a-dire celui que l'on rencontre dans la nature, l'allele normal) est note par "". Un
homozygote sauvage est donc represente par . L'allele nouveau, mutant, que l'on etudie est
note par une ou deux lettres de son nom (anglais generalement). Cette lettre est minuscule si
l'allele est recessiI par rapport au type sauvage, majuscule si par contre il est dominant. Ainsi,
par exemple, une souris albinos est donc ww (w white; minuscule parce que recessiI). Une
souris normale est representee par ou w selon qu'elle est homozygote ou heterozygote.
Quand on etudie plusieurs caracteres a la Iois, il est cependant utile de preciser le gene avec
lequel l'individu est "sauvage". Dans ce cas le genotype devient w

et w devient w

w,
le phenotype etant code w

.
Une autre notation, utilisee surtout dans les questions de crossing-over (voir plus loin)
est par exemple w

w rappelant ainsi que les alleles sont portes par les chromosomes
homologues associes. Ces symboles peuvent suivre (en exposant) le nom du gene (ex :
couleur

, ou couleur

), ce qui evite bien des conIusions lorsque plusieurs genes sont


presents. Ce systeme est aussi utilise en genetique murine (souris de laboratoire). Le signe "-"
indique generalement un allele "nul" (gene inactive).
En genetique humaine, on utilise souvent le nom du gene suivi d`une lettre etou d`un
chiIIre pour identiIier l`allele. Par exemple, les alleles du gene du groupe sanguin ABO sont
A1, A2, B ou O. Autre exemple : le gene d`histocompatibilite HLA-A (qui est lie aux rejets
de greIIes) possede de multiples alleles representes par un nombre : HLA-A1, HLA-A2,
HLA-A3. Attention, HLA-B et HLA-C representent dans ce cas des genes diIIerents
(qui sont eux aussi lies aux rejets de greIIes), et non des alleles du gene HLA-A.
Les trois systemes d'ecriture seront utilises ici. S`ils ne sont pas deIinis dans l`enonce, il est
essentiel de commencer l'exercice par deIinir quels symboles vous utiliserez pour chacun des
genes et alleles impliques, en suivant une des conventions que nous venons de detailler.


4.5 LA VARIATION DES EFFETS PRODUITS PAR LES GENES

La loi de MENDEL indique que des qu'un allele dominant est present sur un des deux
chromosomes homologues, le phenotype correspondant apparat. Cette regle presente des
exceptions : un gene dominant ne s'exprime pas toujours, et quand il s'exprime ce n'est pas
toujours avec la mme intensite.

181
La Irequence avec laquelle un gene dominant s'exprime reellement est appelee
pntrance. C'est le rapport entre le nombre d'individus qui presentent reellement ce
caractere et le nombre de ceux qui devraient le presenter parce que possedant le genotype
adequat. Elle peut tre elevee (90-100) ou au contraire tres Iaible (5 - 10) et mme
irreguliere (cas de la polydactylie). Une penetrance incomplete complique la tche du
chercheur car dans la pratique, cela se traduit par le phenomene de saut de generation: grand-
pere et petit-Iils sont atteints, mais le pere est indemne, bien que possedant le genotype
correspondant a la tare. Une autre consequence est que dans le cas de penetrance incomplete
d'une tare dominante, il n'est plus certain qu'un individu sain n'ait qu'une descendance saine,
car il peut tre soit genetiquement recessiI, soit genetiquement dominant non exprime! En
outre, quand la penetrance est tres Iaible (10), il devient tres diIIicile d'etablir si un
caractere est ou non hereditaire. On parlera alors de "risque" accru de contracter une maladie
donnee, associe a un genotype particulier. Certains alleles peuvent augmenter le risque de
developper un cancer du colon ou du sein, une maladie cardiovasculaire ou la maladie
d'Alzheimer.

L'intensite avec laquelle un phenotype s'exteriorise, quand il s'exprime, est appelee
expressivit. Le mme genotype peut Iournir des individus tres Iortement atteints ou au
contraire ne laisser apparatre qu'une Iorme tres attenuee du mme caractere.
Les raisons de la penetrance incomplete et de l'expressivite variable sont nombreuses
et varient d'un cas a l'autre. C'est surtout le milieu qui est le principal Iacteur modulant, tant le
milieu externe que le milieu interne (hormonal, psychique, sexuel...). Le contexte genetique
(les autres genes de l'individu) jouent aussi un rle important.
SauI indication contraire, dans les exercices, nous considererons que la penetrance est
de 100.

4.6. LES GENES LETAUX

Un gene letal est un gene qui inhibe un caractere ou une Ionction indispensable a la
vie, conduisant a une mort au stade embryonnaire ou a la naissance.
La disparition d'une partie de la descendance modiIie evidemment les proportions
phenotypiques attendues sans que le processus lui-mme ne soit modiIie, surtout si l'eIIet
letal se maniIeste tres tt.
L'eIIet letal peut se maniIester a tous les stades du developpement: gamete (un des
gametes produits par un heterozygote peut tre letal dans un des deux sexes); Iecondation
(incompatibilite entre certains alleles, pour eviter l'autoIecondation par exemple chez
certaines plantes); developpement embryonnaire (c'est le cas de la plupart des deIiciences
metaboliques); ou dans l'enIance.
182
Certains alleles peuvent causer la mort a l'ge adulte (ex: la choree de Huntington).
Dans ce dernier cas, si l'individu procree avant que l'eIIet ne se maniIeste, il n'y a pas de
modiIication aux lois de MENDEL. Aussi restreint-on generalement la letalite genetique a une
tare mortelle qui agit avant l'ge de la procreation.

Comme tout autre gene, un gene letal peut tre recessiI, dominant ou codominant.
S'il est dominant, il ne se transmet pas, puisque tous les individus porteurs meurent
avant de pouvoir procreer et il disparat de la population. Il ne peut apparatre que
Iugacement, le temps d'une generation, suite a une mutation. C'est le cas de certaines Iormes
letales d'osteogenese imparIaite.
S'il est recessiI, il ne se maniIeste qu'a l'etat homozygote et ne pourra provenir que de
parents tous deux heterozygotes. Si son action est precoce, au stade embryonnaire, seul le
phenotype normal dominant sera observable dans la descendance. L'eIIet letal ne pourra tre
souponne que suite a l'observation d'une baisse de natalite ou d'une proportion trop elevees
de mort-nes.
L'etude des genes letaux n'est Iinalement possible que dans les cas d'alleles
codominants ou de dominance partielle, ou l'heterozygote montre une Iorme intermediaire,
non mortelle de la tare. C'est le cas de nombreuses maladies humaines dominantes. Les
heterozygotes presentent souvent un phenotype malade moins severe que les homozygotes,
qui succombent souvent precocement.

183

5. TRANSMISSION DE PLUSIEURS CARACTERES
&
LOCALISATION DES GENES
_______________________________________________________________

Lorsque l'on etudie la transmission de plusieurs caracteres en mme temps, plusieurs
possibilites doivent tre envisagees en Ionction de la localisation de ces genes dans le
genome. Nous verrons ici les cas suivants, qui doivent toujours tre envisages lors de la
resolution d'un exercice:
- genes localises sur des chromosomes diIIerents (appeles genes independants)
- genes localises sur le mme chromosome
- genes localises sur un chromosome sexuel
- genes localises dans le genome mitochondrial.

5.1. LES GENES INDEPENDANTS

MENDEL avait constate que le caractere jaune dominait le caractere vert et que le
caractere rond dominait le caractere ride, respectivement pour la couleur et la Iorme des pois.
Il croisa alors des plantes de race pure (homozygote) qui diIIeraient par deux caracteres a la
Iois: une variete donnant des pois jaunes et ronds (bidominant) Iut croisee avec une variete
donnant des pois verts et rides (birecessiI). Ici encore, il Iit des croisements reciproques.
En F
1
tous les individus possedent des pois jaunes et ronds. Ce resultat etait attendu
puisque les alleles responsables des caracteres jaune et rond etaient dominants sur les alleles
vert et ride. Cette generation F
1
Iut denommee dihybride, parce qu'elle est hybride pour les
deux caracteres, pour les deux paires alleliques.
Par autoIecondation de la F
1
, il obtint les resultats suivants en F
2
: 916 des plantes
ont des pois jaunes et ronds, 316 des pois jaunes et rides, 316 des pois verts et ronds et 116
des pois verts et rides. Le rapport phenotypique est 9 : 3 : 3 : 1.

Outre les deux phenotypes parentaux (jaune et rond, vert et ride), il apparat deux
phenotypes nouveaux qui recombinent les caracteres des parents: jaune et ride, vert et rond.

Si l'on envisage separement les paires d'alleles, on constate que, pour la couleur, 34
des graines sont jaunes (916 316 1216) et 14 sont vertes ( 316 116 416). De
mme pour la Iorme 34 (316 916) sont rondes et 14 (316 116) sont ridees. On
retrouve donc pour chacun des caracteres isoles de l'ensemble, les proportions 3:1 de la
premiere loi.
184
L'analyse plus detaillee des resultats montre que parmi les graines jaunes, 34 sont
rondes (912) et 14 ridees (312). Il en va de mme parmi les graines vertes. On Iait la mme
constatation pour la repartition des classes de couleur dans chaque classe de Iorme. Ainsi le
rapport phenotypique 9331 ne serait que le produit de la combinaison des deux rapports
31.
(3J 1j) x (3R 1r) 9JR 3Jr 3jR 1jr. ou (3 1)
2
.

Par ailleurs le calcul des probabilites demontre que le rapport phenotypique 9:3:3:1
repond aux lois statistiques du hasard. Cette loi dit que "lorsque deux Iaits se deroulent
independamment l'un de l'autre, la probabilite pour qu'ils apparaissent simultanement est
egale au produit de leurs probabilites individuelles".
Ainsi la probabilite d'avoir des pois jaunes est de 34 , celle d'avoir des pois ronds est
de 34 et la probabilite d'avoir des pois jaunes et ronds est de 34 x 34 916, si c'est bien le
hasard qui preside a leur association! Le mme raisonnement s'applique aux autres
phenotypes.
Mendel en deduisit sa deuxieme loi , dite de l'assortiment independant:
"Lorsquon considere la transmission a la descendance de deux couples dalleles, leur
segregation sopere de maniere totalement independante".

C'est ici que la Iormation mathematique de MENDEL a Iait Iaire un pas decisiI a la
genetique. L'idee que les caracteres puissent se transmettre de maniere independantes les uns
des autres etait en eIIet totalement contraire a la pensee scientiIique de l'epoque, pensee selon
laquelle une espece animale ou vegetale etait caracterisee par une "essence" immuable (Iixite
des especes) et transmissible en un seul bloc insecable. Cette hypothese allant a contresens de
l'idee dominante est peut tre la raison Iondamentale pour laquelle ses travaux demeurerent
meconnus jusqu'a ce que la decouverte des chromosomes ne lui donne raison.

L'interprtation actuelle des faits

Si J designe la coloration jaune et j la coloration verte, si R designe la Iorme ronde et r
la Iorme ridee, les parents ont alors comme Iormule JJRR (jaune et rond) et jjrr (vert et ride).
Les gametes produits emportent avec eux un seul exemplaire complet de
l'inIormation, les deux alleles d'une mme paire se separent toujours l'un de l'autre. Les
gametes sont donc respectivement JR et jr (jamais 11 ou rr ou une autre formule!)
Le dihybride de la F
1
a comme Iormule JjRr produisant le phenotype jaune et rond.
Dans ses gametes, l'allele J s'associe indiIIeremment avec l'allele R ou l'allele r et il en est de
mme pour j. La disjonction et la repartition dans les gametes de la paire J - j s'eIIectue
independamment de la disjonction et de la repartition de la paire R - r. Les paire d'alleles
n'ont aucun lien entre-elles et seul le hasard conditionne leur assortiment.
185

Au point de vue cytologique, la deuxieme loi de MENDEL s'explique si:
1 chacune des paires alleliques est portee par des chromosomes homologues independants
2 l'orientation des bivalents a la metaphase I de la meiose est due au hasard.
Une paire de chromosomes homologues porte les alleles ronds et rides (R et r) et une
autre paire de chromosomes homologues porte la paire d'alleles verts et jaunes (j et J). A la
prophase I il se Iorme des bivalents Jj et Rr qui en metaphase I peuvent s'orienter de deux
manieres diIIerentes. A l'anaphase I, un chromosome J a autant de chance de se diriger vers le
ple ou va le chromosome porteur de R que vers le ple ou va le chromosome r. Le mme
raisonnement s'applique pour j. Il en resulte quatre sortes de gametes en nombres egaux: JR,
Jr, jR et jr. Cela se realise aussi bien lors de la Iormation des gametes mles que des gametes
Iemelles. La Iecondation des gametes Iemelles par les gametes mles se Iaisant au hasard, on
obtiendra donc 16 combinaisons possibles que nous detaillerons plus loin.
Une conIirmation de l'association au hasard des caracteres est donnee par le
retrocroisement de la F
1
(JjRr) avec les plantes birecessives (jjrr). Si les gametes de l'hybride
sont produits en nombres egaux, on doit obtenir quatre phenotypes diIIerents en nombres
egaux:
P JjRr x jjrr
gametes JR x jr -- JjRr : jaune et rond
Jr Jjrr : jaune et ride
jR jjRr : vert et rond
jr jjrr : vert et ride
C'est eIIectivement ce que prouve l'experience, montrant par la mme que J et R se
transmettent independamment l'un de l'autre.

Les quatre types de gametes produits et par les mles et par les Iemelles permettent
d'etablir un tableau de croisement. Ce tableau montre qu'il existe neuI genotypes diIIerents
exprimes par quatre phenotypes : deux identiques aux parents et deux combinaisons
nouvelles denommees recombinants.

mles
Iemelles
JR Jr jR jr
JR JJRR JJRr JjRR JjRr
Jr JJRr JJrr JjRr Jjrr
jR JjRR JjRr jjRR jjRr
jr JjRr Jjrr jjRr jjrr

186
phenotype parental
jaune-rond
combinaisons nouvelles
jaune-ride vert-rond
phenotype parental
vert-ride
916 316 316 116
1 JJRR
2 JJRr
2 JjRR
4 JjRr
1 JJrr
2 Jjrr
1 jjRR
2 jjRr
1 jjrr

Chez l'homme, les genes ABO et Rhesus sont situes sur des chromosomes diIIerents et
sont donc transmis de Iaon independante: ABO est sur l'extremite longue (q) du
chromosome 9 et Rh sur le bras court du chromosome 1.

En conclusion, lorsqu'on etudie la transmission de plusieurs genes situes sur des
chromosomes diIIerents, il suIIit d'etudier la transmission de chaque gene separement, puis
d'appliquer les regles de probabilites pour des evenements independants.


5.2. L'HEREDITE LIEE AU SEXE

Le probleme de l'heredite liee au sexe, repose de maniere plus generale, celui de la
reproduction sexuee. Rappelons que l'objectiI essentiel de cette reproduction sexuee est la
rencontre, la Iecondation de deux gametes provenant de parents diIIerents, donc de genotypes
diIIerents, ceci aIin de permettre les recombinaisons genetiques propices a l'evolution. Les
solutions adoptees sont extraordinairement variees. La plupart des plantes et certains animaux
(vers de terre, escargots.) sont hermaphrodites, c'est-a-dire qu'ils sont producteurs des
deux types de gametes. Certaines plantes et la plupart des animaux sont dioques, c'est-a-dire
qu'ils ne produisent qu'un seul type de gamete, mle ou Iemelle. Chez les especes dioques, la
determination du sexe est en relation avec des particularites chromosomiques (chromosomes
sexuels). Les especes hermaphrodites ne presentent bien sur pas de diIIerences
chromosomiques, puisque tous les individus sont sexuellement identiques.

5.2.1 les chromosomes sexuels

On s'est aperu tres tt que la garniture chromosomique n'etait pas absolument
identique chez les mles et chez les Iemelles dans de nombreuses especes: tous les
chromosomes sont identiques 2 a 2 dans les 2 sexes sauI pour une paire. Les premiers sont
appeles autosomes, la paire qui n'est pas entierement homologue est appelee chromosomes
sexuels (ou heterosomes).
187
Dans un sexe, dit homogamtique, les 2 heterosomes sont identiques (denommes X),
tandis que dans l'autre, dit htrogamtique, l'un des 2 heterosomes est morphologiquement
diIIerent, generalement nettement plus court (), ou mme absent (O). Dans la grande
majorite des cas, c'est la Iemelle qui porte les 2 heterosomes identiques et le mle les deux
chromosomes sexuels diIIerents. Chez les oiseaux, les reptiles, les amphibiens et les
lepidopteres, c'est l'inverse. Pour eviter les conIusions, on les appelle WW et W. Chez
certains insectes, l'un des deux sexes ne possede qu'un seul chromosome sexuel: ainsi chez
les libellules, il manque un chromosome au mle, tandis que c'est l'inverse chez certains
papillons.
Chez l'homme, les noyaux des cellules somatiques possedent 46 chromosomes: 22
paires d'autosomes et une paire d'heterosomes: XX chez la Iemme (homogametique: tous ses
gametes ont la mme Iormule 22 X); X chez l'homme (heterogametique: il produit deux
types de gametes diIIerents en nombres egaux 22 X et 22 ). Le sexe de l'enIant depend
donc du pere et est determine des la Iecondation.

5.2.2 l'heredite liee au sexe

On sait depuis longtemps que les chromosomes X et ne possedent qu'un petite
partie homologue, situee sur deux segments proches des telomeres appeles rgions
pseudoautosomiques. Les autres genes qui sont portes par le chromosome X n'ont pas
d'homologues sur le chromosome et reciproquement. En 2005, la sequence complete de
l'euchromatine des chromosomes sexuels humains a ete publiee, revelant que X porte environ
un millier de genes diIIerents, dont seulement une cinquantaine sont presents sur . Les
genes localises sur les parties non homologues des heterosomes obeissent a des lois de
repartition qui leurs sont propres: tous les genes situes sur la partie non homologue de X chez
la Iemme possedent leur homologue sur l'autre X et obeissent donc aux mmes regles que les
genes portes par les autosomes. Par contre, chez le mle qui ne possede qu'un seul X, les
genes localises sur la partie non homologue de X n'ont pas d'homologue sur . Il n'y a donc
pas d'homozygote ni d'heterozygote pour ces genes. Ils sont dits hmizygotes et quelle que
soit leur puissance d'expression, dominant ou recessiI, ils vont s'exprimer.
C'est le cas de l'hmophilie. Cette maladie provient de l'incapacite qu'a le malade de
coaguler le sang, lequel peut donc s'ecouler jusqu'a epuisement par une blessure. Dans
l'espece humaine, l'hemophilie aIIecte uniquement les hommes (0,01) et est transmise par
les Iemmes qui n'en paraissent pas aIIectees. Elle est due a un allele qui se transmet comme
X.
X
h
est le chromosome porteur du caractere hemophile et X
H
est le chromosome
porteur de l'allele dominant H normal. En ne considerant que les chromosomes sexuels, un
homme normal a comme Iormule X
H
, un homme malade X
h
. Une Iemme normale a
comme Iormule X
H
X
H
ou X
H
X
h
. Dans le deuxieme cas, elle est porteuse de l'allele mute et
188
peut le transmettre a sa descendance. Les Iemmes X
h
X
h
sont en theorie hemophiles mais ce
cas est extrmement rare car il implique une union entre un homme hemophile et une Iemme
porteuse. En Iait, il semble que cette combinaison soit letale chez la Iemme (hemorragies
incontrlables).
Il est aise de prevoir la composition de la descendance lors des 3 types de mariages possibles
entre personnes malades :
1 malade x saine : X
h
x X
H
X
H
-- X
H
et X
H
X
h
-- garons sains et Iilles
apparemment saines mais porteuses de la mutation.
2 sain ( x transmettrice : X
H
x X
H
X
h
-- X
H
, X
h
, X
H
X
H
, X
H
X
h
-- garon sain,
garon malade, Iille saine, Iille porteuses de la mutation comme sa mere.
3 EnIin l'union tres peu probable (20 chances sur 1 milliard, sauI en cas d'union
consanguine) : malade x transmettrice X
h
x X
H
X
h
-- X
H
et X
h
et X
H
X
h
et X
h
X
h
-- garon sain, garon malade, Iille transmettrice, Iille hemophile letale.

La myopathie de Duchenne est un type de dystrophie musculaire liee aussi au
chromosome X. Elle se caracterise par un aIIaiblissement progressiI des muscles et une perte
graduelle de la coordination dont l'aboutissement est la mort vers l'ge de 20 ans.
Tout comme l'hemophilie, le daltonisme est d a un Iacteur recessiI porte par le
segment non homologue de X. Ainsi, l'homme daltonien a comme Iormule generale X
d
et la
Iemme pouvant transmettre le daltonisme X
D
X
d
.
Seule l'union de ces deux dernieres personnes pourra donner naissance, dans un cas sur quatre
a une Iille homozygote X
d
X
d
reellement daltonienne. La composition de la descendance se
trouve de la mme maniere que pour l'hemophilie. En Iait, la transmission est un peu plus
complexe. Il existe deux sortes de daltonisme: a l'allele normal X
D
s'oppose l'allele X
d1
,
responsable de la protanopie (l'individu ne voit pas le rouge) et l'allele X
d2
, responsable de la
deuteranopie (l'individu ne voit pas le vert). Pour qu'une Iemme soit reellement daltonienne,
elle doit tre X
d1
X
d2
, ce qui est plus rare.
Par ailleurs, les alleles h de l'hemophilie et d du daltonisme sont localises tous deux
sur la partie non homologue du chromosome X et rien n'empche qu'ils ne soient localises
simultanement sur le mme chromosome. Dans ce cas, leur transmission ne se Iera pas de
maniere independante (voir plus loin les genes lies).

Un autre probleme relatiI aux chromosomes sexuels a beaucoup intrigue les
chercheurs. Chez les Iemelles homozygotes pour un gene a dominance incomplete lie au
chromosome X (X
N
X
N
par exemple) le phenotype ne s'exprime jamais de maniere plus
intense que chez les mles qui ne possedent qu'un seul chromosome X (X
N
par exemple).
Autrement dit, si N apporte une "dose", il devrait y avoir une diIIerence d'expression entre la
Iemelle qui possede 2 doses et le mle qui n'en possede qu'une seule. Ce n'est pas le cas!
189
Dans les cellules somatiques de la Iemme, une partie d'un des deux chromosomes X
reste condensee en Iin de mitose et est donc inactive, sous Iorme d'un corpuscule visible dans
le noyau et appele corpuscule de BARR. Seul l'autre chromosome X donne l'inIormation
homologue a celle qui etait portee par la partie condensee. Ce chromosome X actiI peut aussi
bien tre celui d'origine paternelle que d'origine maternelle. Le "decision" d'inactiver l'un ou
l'autre des 2 X est due au hasard pour chacune des cellules et est prise relativement tt dans le
developpement embryonnaire (vers la 10
e
semaine). Une Iois cette "decision" prise, tous les
clones de cellules somatiques decoulant par mitoses successives de chacune de ces cellules
restent "Iideles" a la decision prise et inactivent toujours le mme chromosome X. Ceci
explique entre autres l'existence Irequente de mosaques de caracteres que l'on peut rencontrer
chez les Iemelles heterozygotes (par exemple, juxtaposition de taches de couleurs diIIerentes
(pelage des chattes), codees chacune par un allele, et non pas une couleur intermediaire
uniIorme).

EnIin, il est utile de Iaire remarquer que, tout comme X possede une partie absente
chez , ce dernier possede aussi un segment de chromosome qui n'existe pas chez X. Seuls
une quinzaine de genes ont ete identiIies sur cette courte portion d'ADN, qui determine une
heredite holandrique qui se transmet exclusivement de pere en Iils (ex: hypertrichose des
oreilles).

5.2.3 l'heredite inIluencee par le sexe

Il ne Iaut pas conIondre l'heredite liee au sexe avec l'heredite inIluencee par le sexe.
Cette derniere concerne des caracteres portes par les autosomes, qui montrent des
phenotypes diIIerents selon le sexe, alors que le genotype pour les genes impliques est
identique dans les deux sexes. Le cas le plus courant est l'inversion de dominance pour des
genes qui sont localises sur des autosomes.

Chez l'homme, certains caracteres sont plus Irequents chez l'homme que chez la
Iemme comme la meche de cheveux blancs et le bec de lievre. De mme la calvitie precoce
est dominante chez l'homme et recessive chez la Iemme.
Le pis des vaches est sous contrle d'un gene, mais il est evident que le caractere
"grand pis" n'apparatra que chez les vaches et jamais chez les taureaux. Le caractere
"plumage de coq" est dominant et porte par un autosome. Il existe donc des coqs recessiIs
"plumage de poule". Mais par contre, on ne voit jamais de poules portant le plumage de coq
car ce caractere, mme a l'etat homozygote dominant, ne se maniIeste que chez les mles.
Dans ces exemples, il est certains que les hormones sexuelles jouent un grand rle
notamment dans la penetrance et l'expressivite du gene. Elles modiIient le milieu interne dans
lequel les caracteres doivent s'exprimer.
190

5.2.4 Le sexe "inIluence" par l'heredite

Il existe un certain nombre de cas ambigus quant a l'appartenance sexuelle de
l'individu. Nous distinguerons deux categories: les etats intersexues et les anomalies
chromosomiques concernant les heterosomes.

Chez les individus intersexus vrais, le sexe est chromosomiquement determine (XX
ou X) mais l'expression phenotypique n'y correspond pas, soit en tout, soit en partie. Les
causes de cette intersexualite, qui peut aller jusqu'a l'hermaphrodisme et l'inversion de sexe
apparent, sont independantes des heterosomes eux-mmes.
Dans 13 des cas connus, les causes ne semblent pas dues a l'heredite mais bien a une
deviation hormonale survenue au cours de l'embryogenese.
Dans les autres cas, on a pu mettre en evidence la cause du probleme. Rappelons que
les embryons masculins et Ieminins sont indiIIerencies sexuellement pendant les 5 premieres
semaines. A ce stade, un gene SR de (decouvert en 1984) induit le developpement des
testicules (stimulus ), lesquels produisent d'autres hormones (testosterones) qui aboutissent a
la masculinisation du Ioetus (atrophie des ovaires). En l'absence de SR (chez les Iemmes,
ou chez les hommes qui ont subi une deletion de ce gene) ou de leurs recepteurs (hommes
mutants qui possedent un SR actiI mais pas les recepteurs membranaires capables de
comprendre ce signal), ce sont les ovaires qui se developpent normalement avec Ieminisation
de l'embryon. Il existe donc des individus genetiquement X, mais qui ont toutes les
apparences d'une splendide Iemme! Il existe aussi des individus XX qui sont des hommes
suite a une mutation , une translocation du bout de qui contient SR sur le X du pere!
D'autres genes induisent la Ieminisation de l'embryon.
Rappelons aussi que l'absorption trop importante d'hormones de l'autre sexe peut avoir
une inIluence visible sur le sexe apparent d'un individu. C'est d'ailleurs en implantant des
testicules de coq dans des poussins Iemelles qui se transIormerent en coq, que l'on decouvrit
l'existence des hormones.
EnIin, nous avons vu qu'une serie d'anomalies du nombre de chromosomes sexuels
(aneuplodie) peut inIluencer les caracteres sexuels de l'individu (voir syndromes de Turner et
KlineIelter).


191
5.3 LES GENES LIES

Nous possedons plus de 25000 genes disperses sur 23 chromosomes. Les genes portes
par le mme chromosome restent associes lors de la Iormation des gametes. Les alleles de ces
genes sont donc transmis ensemble et ne respectent pas les lois de l'assortiment independant
de Mendel. Ce phenomene est appele "linkage" ou liaison.
Ces liaisons Iurent montrees des 1910 par MORGAN et ses collaborateurs. Ils ont
distingue chez la mouche drosophile plus de 400 caracteres mendeliens repartis en 4 groupes
de caracteres lies: 3 de ces groupes renIerment chacun 120-150 caracteres et le quatrieme ne
renIerme que 3 caracteres. Or le caryogramme de la drosophile montre quatre paires de
chromosomes dont une paire de tres petits, punctiIormes.
Un exemple de liaison est donne par le croisement suivant: une mouche au corps gris
(G) et aux ailes longues (L) est croisee avec une mouche au corps noir (g) et aux ailes tres
courtes (l). Les hybrides de la F
1
sont gris et ont les ailes longues: leur Iormule genetique est
GgLl. Si les hybrides obeissent a la loi de la disjonction independante il devrait se Iormer
quatre types de gametes GL, Gl, gL, gl en nombres egaux comme le montre les resultats d'un
back-cross GgLl x ggll.
Le croisement entre un mle GgLl et une Iemelle ggll ne donne que 50 de GL (gris
a ailes longues) et 50 de gl (noirs a ailes courtes). Cela signiIie que le mle n'a produit
que deux sortes de gametes GL et gl et qu'il y a chez lui liaison absolue entre G et L et entre g
et l. G et L sont portes par un chromosome et g et l par le chromosome homologue.
Mais en general, ce lien, ce "linkage" n'est pas absolu puisqu'en prophase I de la
meiose, le crossing-over permet l'echange de segments entre chromatides de chromosomes
homologues, donc l'echange de groupes de genes entre des chromatides d'origines diIIerentes
(mle et Iemelle) et qui aboutit a une redistribution, a une recombinaison intra-
chromosomique des genes dans les gametes.
Chez la mouche, les recombinaisons ne se produisent que chez la Iemelle (ce n'est pas
le cas chez l'homme). En reprenant le mme exemple, mais en croisant une Iemelle GgLl
avec un mle ggll, on obtient 4 sortes de phenotypes dans les proportions suivantes: GgLl
41,5, Ggll 8,5, ggLl 8,5 et ggll 41,5. Cela signiIie que la Iemelle produit 4 sortes de
gametes : 41,5 GL, 8,5 Gl, 8,5 gL et 41,5 gl et que G et L d'une part et g et l d'autre
part tendent a rester combines. TouteIois, cette liaison a ete rompue 17 Iois (8,5 8,5) sur
100 par crossing-over pour donner des combinaisons nouvelles (recombinants) Ggll et ggLl.

Deux genes strictement lis sont tellement proches l'un de l'autre qu'on ne constate
jamais l'existence d'un crossing over entre eux. Dans ce cas, les alleles qui sont associes sur
un mme chromosome sont transmis ensemble, sans reassortiment.


192
LES CAR1ES CHROMOSOMIQUES

L'equipe de MORGAN a etudie le pourcentage de crossing-over entre des genes lies.
Ce pourcentage etant toujours le mme entre deux genes donnes, MORGAN conclut que ces
genes occupaient des endroits precis et constants sur le chromosome (les loci).
Par ailleurs, la localisation d'un crossing-over etant due au hasard, deux genes ont
d'autant plus de chance d'tre separes par un crossing-over qu'ils sont plus eloignes l'un de
l'autre. Par consequent, il existe une correlation entre la distance qui separe deux genes et le
pourcentage de crossing-over. L'etude du pourcentage de crossing-over ou de recombinants,
permet donc de localiser les emplacements relatiIs des genes sur un chromosome.
Pour etablir une carte chromosomique (c'est-a-dire pour determiner les distances
relatives entre les genes d'un mme chromosome), on admet par convention que l'unite de
distance relative ou unite MORGAN ou centimorgan est celle qui separe deux genes entre
lesquels on constate 1 de recombinants.
Par exemple, un chromosome porte trois genes: A, B et C. les experiences de
croisement montrent qu'il y a 8 de crossing-over entre A et B (les recombinants de
ABC.abc sont Ab- et aB-). La distance A-B represente 8 unites MORGAN. Entre B et C, on
constate qu'il y a 2 de crossing-over (les recombinants de ABC.abc sont -Bc et -bC). Sur le
chromosome C peut se trouver a droite ou a gauche de B. Il Iaut donc determiner le
pourcentage d'echanges entre A et C. S'il y a 6 de crossing over entre A et C, c'est que C se
trouve entre A et B. Si l'experience montre qu'il y a 10 de crossing-over, c'est que C se
trouve au dela de B a deux unites de lui et a 10 de A. Dans le croisement des drosophiles
explique plus haut, le back-cross donnait 17 de recombinants 8,5 de Ggll et 8,5 de ggLl. La
distance entre les deux paires alleliques G-g et L-l est de 17 unites MORGAN.
La technique d'etude est donc toujours la mme. On Iabrique le double heterozygote
auquel on applique la technique du test-cross pour compter les diIIerents gametes produits.
C'est par cette methode que l'on a pu dresser avec beaucoup de precision la carte
chromosomique de certaines especes (drosophile, mas...).
La deIinition mme de la distance unitaire ou unite MORGAN suppose que les genes
sont disposes lineairement sur le chromosome et que chaque gene y occupe toujours la mme
place (le mme locus). C'est ce qu'ont demontre de nombreuses experiences genetiques. Le
centimorgan est une unite relative et ne peut s'exprimer en mm ou en m. La solidite du
chromosome etant variable sur toute sa longueur, certains endroits sont plus Iragiles ou plus
exposes. Certains genes peuvent ainsi tre souvent separes par un crossing-over alors que
d'autres techniques montrent qu'ils sont physiquement proches l'un de l'autre, ou inversement:
certains longs segments de chromatides ne subissent pratiquement jamais le crossing-over.

Lorsqu'on recherche la distance entre genes Iort eloignes l'un de l'autre, on constate
que la methode enoncee plus haut doit tre corrigee. En eIIet, le pourcentage d'echanges
193
mesure est toujours inIerieur au pourcentage calcule. En Iait, le pourcentage de
recombinaison observe ne peut depasser 50 (equivalent a une repartition independante).
Ceci s'explique si l'on tient compte du Iait qu'un crossing-over double peut se produire entre
deux genes eloignes et n'entrane aucune recombinaison visible.
Supposons deux chromosomes homologues portant respectivement les alleles A,B,C
et a,b,c. Si entre A et B et entre B et C, on trouve respectivement 8 et 7 de recombinants,
on doit s'attendre a trouver 15 entre A et C. Les recombinants produits par les crossing-over
simples sont Abc, aBC, ABc et abC. En realite, le pourcentage d'echange mesure entre les
genes A et C est plus petit : 13,9. Un crossing-over double produira les recombinants AbC
et aBc, mais A et C resteront sur la mme chromatide n'entranant aucune recombinaison
visible entre eux. Il Iaut donc ajouter ces cas pour obtenir le chiIIre calcule a partir de la
somme des sections.
On a constate qu'un crossing-over double ne se produit generalement qu'entre deux
genes distants de plus de 5 unites MORGAN. Ceci se comprend si l'on songe que les
operations chimiques du crossing-over (coupure, echange, soudure) se Iont au sein de nodules
de recombinaisons qui ont quand mme 90nm de . Par consequent, pour connatre la
distance entre deux genes eloignes, on Iait la somme des distances entre des genes
intermediaires qui ne sont separes que par 1 a 4 unites. Dans l'exemple choisi plus haut, la
distance reelle entre A et C serait determinee en cherchant le pourcentage d'echange entre A
et L, L et B, B et M, M et C et en en Iaisant la somme; L et M etant des genes intermediaires
entre A et B et C.

Signalons que dire qu'il y a 8 de crossing-over entre les alleles A et B de l'hybride
"cis" AB.ab ("cis" indique que les deux alleles dominants sont sur le mme chromosome
homologue), cela signiIie que les gametes Iormes par cet hybride sont de 4 types, dans les
proportions suivantes: 46 de AB, 46 de ab, 4 de Ab et 4 de aB.
Si le linkage etait parIait entre A et B, on aurait 50 AB et 50 ab. Si nous
supposons l'hybride "trans" Ab.aB (A et b sur le mme chromosome, a et B sur le
chromosome homologue) et 6 d'echanges lors de la Iormation des gametes, on a alors 47
de Ab, 47 de aB, 3 AB et 3 ab. Si le linkage est complet: 50Ab et 50 aB.

Remarquons que si un individu est homozygote pour deux caracteres lies et que la
distance est connue entre des deux caracteres, le Iait d'tre homozygote empche la
visualisation du crossing-over puisque les recombinants sont identiques aux parents. Mais le
phenomene lui-mme du crossing-over s'est eIIectivement realise et ce, dans les mmes
proportions que chez les heterozygotes.
Dans le cas des chromosomes sexuels ou heterosomes, les crossing-over se deroulent
absolument normalement sur toute la longueur des 2 X chez la Iemelle. Par contre chez le
mle, ce phenomene ne peut avoir lieu qu'entre les parties homologues de X et .
194

En genetique medicale, on utilise des sequences polymorphiques, dont l'emplacement
sur les diIIerents chromosomes est connu, comme marqueurs dans la recherche des genes
responsables de maladies genetiques. Lorsqu'on observe qu'un allele d'un marqueur donne est
toujours transmis en mme temps que la maladie etudiee, on en deduit que le gene
responsable de la maladie est localise sur le mme chromosome pres de ce marqueur, ce qui
permet d'orienter les recherches vers le ou les quelques genes de la region consideree.

5.4 LES GENES MITOCHONDRIAUX

Les phenomenes de l'heredite etudies jusqu'a present obeissent aux lois de MENDEL et
dependent des genes portes par l'ADN des chromosomes. Il est apparu tres tt
(CORRENS,1909) que la transmission d'un certain nombre de caracteres ne pouvait pas
s'expliquer d'apres les lois de MENDEL :
- l'absence de segregation reguliere;
- les pourcentages phenotypiques tres variables;
- les resultats de croisements reciproques diIIerents : le croisement de
mle A x Iemelle B est diIIerent de celui mle B x Iemelle A;
- l'heredite de type maternel.
Ces resultats s'expliquent a la Iois par la presence de genes dans l'ADN des mitochondries (et
des chloroplastes chez les plantes), ainsi que par des phenomenes epigenetiques (voir chapitre
suivant).
Dans les cellules eucaryotes, deux organites cellulaires possedent de l'ADN. Il s'agit
des mitochondries et des chloroplastes. L'existence et les caracteristiques "procaryotiques" de
cet ADN sont un des elements qui supportent le mieux l'hypothese selon laquelle ces
organites seraient des endosymbiotes qui auraient subi une coevolution avec la cellule
eucaryote depuis tres longtemps. Outre ce Iait, la transmission des organites cytoplasmiques
ne se realise pas selon les lois de MENDEL et chacun des parents ne contribue pas de la mme
Iaon a la constitution du cytoplasme de l'oeuI. Le cas extrme est evidemment la
transmission monoparentale dans laquelle le cytoplasme de l'oeuI provient exclusivement
d'un seul parent, generalement via l'ovule.

L'ADN des mitochondries est petit (16,5 kb chez l'homme, 80 kb chez les levures, 140
kb chez les plantes superieures et 200 kb chez les protistes). Il ne gouverne qu'une partie du
Ionctionnement et de la structure mitochondriale. L'autre partie est sous dependance
d'inIormations contenues dans le noyau. Par exemple tous les ARN necessaires a la
proteosynthese dans la mitochondrie sont produits a l'interieur de celle-ci mais les ARN
polymerases, les proteines ribosomiales et les ligases qui couplent les AA a leur ARNt sont
toutes sous contrle de l'ADN nucleaire.
195
Lors de la Iecondation, chez les animaux superieurs, les mitochondries du
spermatozode ne penetrent pas dans l'ovule et seules les mitochondries de ce dernier sont
transmises a la descendance. C'est typiquement un eIIet maternel. Il n'y a donc pas de
recombinaison possibles entre des genes mitochondriaux du pere et de la mere et comme
l'ADN mitochondrial montre un taux de mutation nettement plus eleve que celui du noyau, on
a pu etablir un arbre genealogique de l'ADN humain.

Chloroplastes

L'ADN des chloroplastes comporte environ 150 kb et code pour environ 80 proteines,
specialement celles qui sont impliquees dans la synthese d'ARN et de proteines dans le
chloroplaste, ainsi que et les proteines de la membrane des thylakodes. Mais comme pour la
mitochondrie, cette inIormation est insuIIisante pour gerer tout son Ionctionnement et, entre
autres les proteines de l'antenne photoreceptrice et certaines molecules des Iacteurs de
couplages sont codees dans le noyau. Lors de la Iecondation l'antherozode (gamete mle des
vegetaux) n'apporte que peu ou pas de chloroplastes avec lui, si bien qu'ici aussi, il s'agit d'un
eIIet maternel. S'il se produit une mutation dans l'ADN d'un chloroplaste, cette mutation est
transmises a ses descendants a l'interieur de la cellule, les autres chloroplastes de cette cellule
restant intacts. Dans ce cas, chaque cellule possede donc une certaine proportion de
chloroplastes normaux et mutes. Lors des mitoses, les organites sont repartis au hasard entre
les cellules Iilles, si bien que certaines cellules peuvent se trouver avec une majorite de
chloroplastes normaux alors que d'autres ne seront pourvues en majeure partie que de
chloroplastes mutes. Il en resultera des cellules et puis des plages cellulaires qui montreront
une eIIicacite photosynthetique diIIerente.

196
6. HEREDITE EPIGENETIQUE
______________________________________________

Les eleveurs de mulets, ont observe, il y a 3000 ans, qu`une jument croisee avec un
ne produisait un mulet alors qu`un etalon croise avec une nesse produisait un bardot, aux
oreilles plus courtes, aux jambes plus Iortes, a la criniere et a la queue plus epaisses que le
mulet; ce qui indiquait une inIluence reliee au sexe des parents sur le phenotype. Les deux
types d'hybrides possedent des chromosomes non homologues (d'especes proches mais
diIIerentes) et sont steriles.
La comprehension de ce phenomene a Iait l'objet de nombreux debat. Certains ont
imagines que le cytoplasme pouvait porter certains caracteres ("heredite cytoplasmique"). On
sait maintenant que ces phenomenes sont lies a l'ADN, tout comme les autres types d'heredite.
Cependant, contrairement a tout ce que nous avons vu jusqu'a present, ce n'est pas la sequence
d'ADN qui est en cause, mais certains types de modiIication des bases de l'ADN ou de la
chromatine, qui peuvent tre transmises des parents a leur progeniture. Ce type de
modiIications qui ne concernent pas directement la sequence de l'ADN sont qualiIiees
d'pigntiques.

Sans rentrer dans les details, certains de nos genes sont marques diIIeremment suivant
qu'ils proviennent de notre pere ou de notre mere. Cette empreinte gnomique parentale se
maintient dans nos cellules, et est remise a zero dans nos gametes. Cette marque correspond a
une modiIication chimique des bases de l'ADN (methylation de certaines cytosines), qui
change l'expression des genes. Suivant le gene etudie, seul l'allele paternel ou maternel du
gene sera exprime. Le phenotype des individus heterozygotes pour ce gene pourra donc tre
diIIerent de celui predit par les lois de Mendel.
Le syndrome de Prader-Willi est d a ce phenomene d'empreinte parentale. Les
individus qui en souIIrent sont caracterises par une petite taille, un retard mental modere, un
tonus musculaire Iaible et une boulimie conduisant a l'obesite. Ce syndrome est lie au gene
SNRPN, sur le chromosome 15. La copie maternelle du gene est generalement inactivee par
methylation. Si l'allele transmis par le pere est mute, l'enIant (heterozygote) ne possede aucun
allele actiI du gene SNRPN et souIIre de Prader-Willi, comme s'il etait homozygote pour
l'allele mute.
Notons que l'inactivation du chromosome X dans les cellules des individus Iemelles
(corpuscule de Barr) est aussi produite par methylation de ce chromosome, et constitue donc
un autre exemple de phenomene epigenetique.
197

7. GENETIQUE DES POPULATIONS
______________________________________________

Une population est un ensemble suIIisamment vaste d'individus de la mme espece
vivant sur un espace continu et Ierme. Une population est dite panmictique quand les
croisements peuvent se Iaire absolument au hasard entre les individus qui la composent.
Quand une population colonise un nouveau milieu, son eIIectiI augmente jusqu'a
atteindre une limite stable determinee entre autres par les possibilites nutritives du milieu.
Dans une population en tel equilibre, l'eIIectiI est a peu pres constant.
Pour une population ainsi caracterisee, il est possible de determiner son avenir
genetique en Ionction d'observations numeriques Iaites sur les phenotypes. Il s'agit donc
d'inIerences statistiques a partir d'observations.
Ceci est particulierement interessant en genetique humaine ou il est inconcevable de
provoquer des croisements pour etudier la transmission de maladies ou de tares.

6.1. LA LOI DE HARDY - WEINBERG

Cette loi, decouverte simultanement par HARD en Angleterre et WEINBERG en
Allemagne en 1908 permet de prevoir l'evolution d'une population en equilibre.
"Dans une population panmictique a lequilibre, la proportion des alleles est constante dune
generation a la suivante".

Cette loi est absolument theorique et sous-entend des conditions qui ne sont jamais respectees
dans la realite:
1 La population doit tre "inIiniment" large et les individus s'y croiser au hasard
2 Il n'y a pas de selection: chaque genotype est egalement eIIicient dans la reproduction
3 La population est Iermee: ni immigration, ni emigration ne viennent modiIier les
proportions
4 Il n'y a pas de mutation d'un allele en un autre
5 La meiose est normale, conduisant a une disjonction au hasard des alleles.

Nous verrons d'abord les applications de cette loi et ensuite, les correctiIs qu'il Iaut lui
apporter suite au non respect des conditions theoriques.

CALCUL DES FREQUENCES ALLELIQUES

198
Envisageons la transmission d'un gene dont les deux alleles sont A et a. Si les
croisements se Iont reellement au hasard, la proportion des individus AA, Aa et aa dependra
de la Irequence des alleles A et a. On calcule la Irequence des alleles de la Iaon suivante:
- si N individus se subdivisent en X homozygotes AA, heterozygotes Aa et homozygotes
aa, avec NX;
- p la Irequence de l'allele A, c'est-a-dire le rapport entre le nombre de gametes A et le
nombre total de gametes, est donnee par
p (2X ) 2N p est compris entre 0 et 1.
La Irequence de l'allele a est q (2 ) 2N et il est evident que p + q 1 ou q 1 - p.

La Iecondation au hasard entre p gametes A et q gametes a donne les trois genotypes
dans des proportions trouvees par developpement du binme
(pA + qa)
2
soit p
2
AA + 2pq Aa + q
2
aa
Les individus AA produiront 2 gametes A, les aa 2 gametes a et les heterozygotes, un
de chaque sorte, si bien que dans l'ensemble des gametes produits par cette nouvelle
generation, la proportion de A sera 2 x p
2
1 x 2pq divise par le nombre total de gametes 2 x
(p
2
2pq q
2
) c'est-a-dire 2p(pq)2(pq)
2
, c'est-a-dire p puisque (pq)1. On calcule de la
mme maniere que la proportion de gametes a reste egale a q.
Les proportions observees dans les lois de Mendel 1:2:1 representent le cas particulier
ou pq0,5.
Voyons comme exemples la transmission des groupes sanguins.

APPLICATION A LA DOMINANCE COMPLETE

Nous avons vu que 85 des europeens sont Rhesus positiI. Quelle est la Irequence
des alleles D et d?
Soit p la Irequence de D et q celle de d. Les Rhesus negatiI (dd) constituent les 15
restant de la population et leur proportion est q
2.
On a donc q 0,15 0,39. Pratiquement
donc, 2 gametes sur 5 sont porteurs de l'allele d.

APPLICATION a LA NON DOMINANCE

Une etude statistique de MOUREAU dans la region de Liege montre que 28,9 sont du
groupe M, 50,3 du groupe MN et 20,8 du groupe N. Quelles sont les Irequences des
alleles L
M
et L
N
?
Chaque individu M donne deux gametes L
M
, chaque individu MN n'en donne qu'un.
La Irequence m de l'allele L
M
est donc (2x28,9 50,3)2x100 0,54.
De mme la Irequence n de l'allele L
N
est (2x20,8 50,3)2x100 0,46.

199
APPLICATION A LA POLYALLELIE

Si p,q,r sont les Irequences des alleles A, B, O telles que p q r 1, la Irequence
des genotypes est (pA qB rO)
2
p
2
AA q
2
BB r
2
OO 2pqAB 2prAO 2qrBO.
Les Irequences phenotypiques sont donc A p
2
2pr
B q
2
2qr
O r
2

AB 2pq
Les statistiques du centre de transIusion a Woluwe montrent qu'il y a 42,5 de
donneurs A, 42,5 de O, 12 de B et 3 de AB. Quelles sont les Irequences alleliques?
La Irequence r de l'allele O est r
2
0,425 0,65
La Irequence des alleles A et O est rp (rp)
2
vr
2
2rp p
2
. Or cette derniere valeur
nous est donnee par la somme des Irequences phenotypiques de A p
2
2pr et de O r
2
rp 0,425 0,425 0,85 0,92
On en deduit que p 0,92 - 0,65 0,27 et, puisque p q r 1, q 1 - 0,92 0,08
Dans nos regions, il y a donc 27 de gametes A, 8 de gametes B et 65 de gametes O.

GENERALISATION

En generalisant, quelle est la probabilite d'avoir un homme qui soit homozygote en O,
M et D pour son sang?
La probabilite d'avoir OO est (0,65)
2
0,425
La probabilite d'avoir MM est 0,289
La probabilite d'avoir DD est (1 - 0,39)
2
0,372
La probabilite d'avoir un individu OOMMDD est 0,425x0,289x0,372 0,0457, soit moins de
5 d'tre a la Iois homozygote pour les trois alleles les plus Irequents dans les groupes
sanguins.

Inversement, bien que des maladies recessives n'apparaissent que rarement, la
Irequence des alleles correspondants dans la population n'est pas negligeable. C'est ce que
certains appellent le "Iardeau genetique".
Par exemple, suite a une mutation, un allele recessiI se trouve en proportion de 1
dans la population. La maladie n'apparatra que dans (0,01)
2
des cas soit un cas sur 10000, ce
qui est peu. Mais la Irequence des personnes qui portent cet allele est plus importante: elle est
egale a 2pq 2 x 0,01 x 0,99 1,98. C'est ainsi que pour l'albinisme, qui n'apparat que
dans un cas sur 20000, q 0,00005 0,007 et la proportion d'heterozygotes qui portent
l'allele sans le savoir est 2pq 1,39


200
APPLICATION AUX CHROMOSOMES SEXUELS

Le calcul se complique un peu. Chez les homogametiques (XX) le calcul s'eIIectue
comme precedemment, tandis que chez les heterogametiques (X), ne possedant qu'un seul
exemplaire de l'allele, la proportion des phenotypes est egale a celle des gametes.
Si l'on rencontre 5 de daltoniens, quelle est la proportion de Iemmes transmettrices?
5 de daltoniens X
d
, signiIie que la proportion q de l'allele X
d
est 0,05.
La proportion des transmettrices X
D
X
d
est 2 x 0,05 x 0,95 soit 9,5


6.2. MODIFICATIONS AUX LOIS DE HARDY-WEINBERG

1- Les proportions calculees d'apres la loi de HARD-WEINBERG sont theoriques. On s'en
rapproche quand la population tend vers l'inIini. En pratique, il y a des Iluctuations
statistiques autour de ces valeurs: c'est ce qu'on appelle la drive gntique ("genetic
drift").
Ces variations n'ont pas beaucoup d'importance dans les grandes populations, mais par
contre peuvent tre un Iacteur d'evolution dans les populations restreintes. En eIIet,
supposons l'existence d'un allele dont la Irequence est Iaible dans une petite population. Dans
cette population le nombre total de gametes est Iaible et a Iortiori le nombre de gametes
possedant l'allele en question. Il peut donc arriver par hasard, qu'a une generation determinee,
aucun gamete possedant cet allele ne soit implique dans aucune des Iecondations. Dans ce
cas, l'allele disparat et la population se retrouve homozygote pour l'autre.
A cause de la derive genetique, une Iaible population tend a devenir homozygote pour
un nombre croissant de caracteres. Pour la mme raison, deux populations isolees dans un
ensemble plus grand tendent a se diIIerencier diIIeremment et donc a acquerir des caracteres
divergents. C'est un des moteurs de l'evolution. Ce sont ces diIIerences notees sur des oiseaux
isoles dans des les du PaciIique qui ont permis a Darwin d'etayer son hypothese sur
l'evolution.
Mme les populations normalement vastes sont susceptibles a certaines epoques d'tre
reduites a un petit nombre de survivants. C'est ce qu'on appelle un goulet d'etranglement.
Dans ces conditions aussi, un certain nombre d'alleles rares peuvent tre perdus par la
population.
Aussi, lorsqu'une espece se repand sur un nouveau territoire, des populations peuvent
tre Iondees par un petit nombre de pionniers. Et si l'image des pionniers du Iar-west est la
premiere qui vienne a l'esprit, de nombreuses especes vegetales ou animales se sont
retrouvees dans cette situation. Il est tres vraisemblable que ces pionniers ne possedent pas
l'ensemble des alleles de la population souche et donc les alleles non transposes ne se
retrouveront pas dans la nouvelle population, la diIIerenciant ainsi de l'ancienne. De mme si
201
l'un des pionniers possede un allele rare, sa proportion sera anormalement elevee dans la
nouvelle population. C'est ce qu'on appelle l'eIIet Iondateur.
En rapport avec cet eIIet Iondateur, se greIIe aussi le probleme de la consanguinit.
Dans une Iaible population isolee (tribu sur une le par exemple), les mariages aboutissent
apres quelques generations a creer des liens de parente entre la plupart des membres. Si donc
un individu Iondateur d'une de ces communautes est porteur d'un caractere recessiI, il risque
de la transmettre a une Iorte proportion de sa descendance, augmentant ainsi sa Irequence par
rapport a celle qui serait observee dans une population plus large. Il en resulte une proportion
anormalement elevee d'homozygotes presentant un phenotype recessiI particulier. Plus un
allele est rare, plus on constate que les individus qui presentent le phenotype recessiI
correspondant proviennent de lignees ou l'on constate des mariages consanguins.
La consanguinite augmente donc les chances d'apparition d'un phenotype recessiI
anormal, mais diminue le nombre d'alleles deIectueux grce a la derive genetique.

Le cas s'est entre autres, presente dans une communaute d'Amish en Pennsylvanie, ou un des peres
Iondateurs d'une nouvelle communaute etait porteur a l'etat heterozygote d'une Iorme tres rare de nanisme avec
polydactylie connue sous le nom de syndrome de Ellis-van Creveld. On constate dans les 8000 habitants de cette
population, la presence de 50 cas de ce nanisme, par ailleurs absente d'autres communautes Amish descendantes
d'autres anctres.
Il s'est presente aussi dans une le polynesienne ou la Irequence de l'allele albinos s'est trouvee
Iortement augmentee, multipliant ainsi les cas d'albinisme. au grand dam des meres qui Iurent accusees
d'amours extraconjugales avec des blancs de passage. et executees.

2 - Une autre condition n'est guere respectee: la population devrait tre panmictique,
c'est-a-dire que les croisements devraient s'y Iaire au hasard. Deja dans les experiences de
MENDEL ce n'etait pas le cas puisqu'il Iorait les autoIecondations, ce qui Iaisait decrotre la
proportion d'heterozygotes de generations en generations.
Dans la race humaine aussi, la population n'est pas panmictique. Qu'il suIIise de
rappeler les innombrables barrieres sociales, religieuses, culturelles, linguistiques. que
l'homme a erigees pour isoler certaines populations. De plus le choix de son partenaire est
tout sauI le Iruit du hasard. Chez les animaux aussi, les accouplements sont generalement
non-aleatoires. Notons que les accouplements non-aleatoires modiIient les proportions des
genotypes mais pas la proportion des alleles.

3 - Chacun des phenotypes produits devrait avoir la mme eIIicience dans la
reproduction, c'est-a-dire ne pas avoir de valeur selective. Or on constate dans la nature que
c'est l'inverse qui se produit et l'existence de mles ou de Iemelles dominants dans les hardes
d'animaux sauvages prouve bien que tous les gametes d'une population n'ont pas la mme
chance d'tre utilises. Lorsque le succes de la reproduction varie selon le genotype, la
diIIerence qui resulte directement de caracteres hereditaires a ete appelee slection naturelle
202
par Darwin. L'application de la loi de Hardy-Weinberg, implique l'absence de selection
naturelle.
L'existence d'alleles letaux ou semi-letaux modiIie aussi les proportions alleliques.
L'allele de l'anemie IalciIorme aurait d normalement disparatre de la population etant donne
le lourd handicap qu'il inIlige a ses possesseurs, mais comme la mauvaise qualite de leur sang
les protege des piqres des moustiques transmetteurs de la malaria, il procure un avantage
selectiI.

4 - On remarque aussi que dans le croisement entre lignees pures, l'heterozygote
possede une vigueur superieure a celle de ses parents, c'est le phenomene d'heterosis. La
proportion d'heterozygotes dans une population va donc augmenter par l'avantage qu'elle
possede. C'est aussi une des raisons pour lesquelles un allele recessiI neIaste ne disparat pas
d'une population.

5 - On suppose une population Iermee et on ne tient pas compte des migrations
d'individus ou de pollinisations par du pollen etranger pour les plantes. Ces phenomenes
modiIient les proportions des alleles. Si les migrations ont lieu dans les deux sens, il y a
attenuation des diIIerences. Quand la migration s'eIIectue preIerentiellement dans un sens, on
parle d'introgression des alleles et des caracteres d'une population vers l'autre.

6 - Les Irequences alleliques peuvent aussi tre modiIiees si des mutations
spontanees ou artiIicielles se produisent a un taux suIIisamment eleve pour tre decelables.
Sans mutation spontanee, l'allele de l'hemophilie aurait disparu depuis longtemps.


203
Questions de reflexion .

4.1- Comparer la mitose et la meiose du point de vue des chromosomes sexuels.
4.2- Pourquoi les mariages consanguins (entre Ireres et sours, entre cousins germains)
posent-ils un probleme d`un point de vue genetique ?
4.3- Quelle est la diIIerence entre un crossing-over (enjambement) et une
translocation reciproque ?
4.4- Expliquez comment les mitochondries se multiplient dans la cellule et quelles sont les
regles de transmission des mitochondries d`un individu a l`autre.
4.5- Lors de l`experience de clonage de l`agneau Dolly, une petite Iraction du materiel
genetique de Dolly ne provenait pas de sa mere genetique mais d`un autre mouton. A quoi
correspond cet ADN et d`ou vient-il ?
4.6- Comparez l`anaphase de la mitose, et de la meiose (anaphase 1 et 2) a l`aide de schemas
en en representant les chromosomes 1, X et .
4.7- Quelle pourraient tre les consequences d`une deletion dans la sequence signal d`une
proteine ?
4.8- Quel est le degre de diIIerence entre les sequences des chromatides sours d`un mme
chromosome en mitose et en meiose ?
4.9- Quels sont les organismes qui peuvent se reproduire de Iaon sexuee ?
4.10- Etablissez la liste des modiIications du patrimoine genetique (ADN, chromosomes) qui
peuvent conduire a une maladie.
204
TABLE DES MATIERES

Introduction 3

I - Composition chimique des tres vivants 13

1 Les atomes 17
2 L`eau 18
3 Les composs carbons 20
3.1 Les glucides
3.2 Les lipides
3.3 Les proteines
3.4 Les acides nucleiques
3.5 Autres

II - Cytologie: l`unit de base du vivant: la cellule 46

1 Structure gnrale de la cellule 46
2 La membrane plasmique 48
3 Le cytoplasme 50
3.1 Composition
3.2 Cytosquelette
3.3 Cyclose
3.4 Rles
4 Les organites 52
4.1 Reticulum endoplasmique
4.2 Appareil de Golgi et transport par vesicules
4.3 Lysosomes et Peroxysomes
4.4 Vacuoles
4.5 Mitochondries
4.6 Chloroplastes
5 Le noyau 62
6 Paroi et matrice extracellulaire 66
7 Contacts et communication entre cellules 69
8 Division cellulaire 70
8.1 Introduction
8.2 La replication de l`ADN
8.3 Comparaison procaryotes et eucaryotes
8.4 La mitose
8.5 Les chromosomes

III - Physiologie cellulaire 86

1 Flux d`nergie et thermodynamique 87
2 Enzymes 90
3 Nutrition cellulaire 101
3.1 Besoins nutritiIs
3.2 Modes de nutrition
4 Mtabolisme et production d`nergie 111
4.1 Catabolisme du glucose : la glycolyse
205
4.2 Respiration
4.3 Catabolisme des acides gras
4.4 Catabolisme des acides amines
4.5 Catabolisme des acides nucleiques
5 Anabolisme 127
5.1 Anabolisme du glucose
5.2 Photosynthese
5.3 Anabolisme des lipides
6 Du gne la protine 131
6.1 Introduction
6.2 Code genetique
6.3 Mecanisme de synthese
6.4 Lieux de production et traIic
6.5 Degradation des proteines
6.6 Contrle de l`expression des genes
6.7 Comparaison procaryotes eucaryotes
6.8 Virus

IV - Reproduction et Gntique 144

1 Introduction 144

2 Reproduction, fcondation et miose 149

3 Polymorphisme 157

4 Hrdit: lois de Mendel 168

5 Hrdit: cas particuliers 184

6 Hrdit pigntique 197

7 Gntique des populations 198


206