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Sminaire dEpidmiologie Animale

Mthodes de standardisations
La standardisation des taux
Standardisation directe
Exemple : tuberculose bovine
Standardisation indirecte Standardisation indirecte
Tuberculose bovine suite
Standardisation indirecte ou indirecte ?
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()*
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Sminaire dEpidmiologie Animale
Mthodes de standardisations
Le contexte
(ontr+ler le,,et de certains ,acteurs de -con,usion dans une 'des* population(s)
tudie(s).
Exemples:
)a taille des exploitations
Standardisation des taux
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* 2
)a taille des exploitations
)a structure d/ge des animaux
)a race0 le sexe 1
2n dispose din,ormations sur une population de rfrence
Statisti3ues -observes 'taux -bruts* Statisti3ues corriges '-a4ustes*
Mthode utilisable sur des taux dincidence et sur des mesures de risque
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Mthodes de standardisations
(Etude de taux dincidence)
Information disponible
5 strates issues du croisement dun certain nombre de ,acteurs de con,usion
'par exemple des catgories danimaux*
Population tudie
Standardisation directe
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* !
Population tudie
64 7 48% 9 5: 8 poids des strates dans lchantillon E issu de la population tudie.
64 7 48% 9 5: 8 taux dincidence estim par strate dans lchantillon E
Population de rfrence
6S 4 7 48% 9 5: 8 importance relative des strates dans la population de r,rence.
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Mthodes de standardisations
Le taux brut et les taux par strate
Standardisation des taux
( )
4 5 5
4 4 i ; 4
4 % 4 % i 4
i
i 4
m
m m < < m t
t
= =

= = =

)es taux bruts sont des mo=ennes pondrs des taux par strate.
)es poids mesurent limportance relative des strates en > individus
;
unit de temps ?
(1)
(1)
Poids = individus risque pour des standardisation de mesures de Risque
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* @
i
5
i 4
4 ; 4 4
A A
4 %
i i
i % i %
t
m
<
t t

=
= =
= = =


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Mthodes de standardisations
2n dispose de donnes sur des taux de tuberculose bovine au niveau de troupeaux 'ie des
taux dincidence de troupeaux trouvs positi,s* venant de deux rgions -A et -&.
On veut savoir sil existe un effet Rgion
)es animaux sont rpartis en deux catgories 'vaches0 bBu,s*.
Standardisation des taux
' un exemple ,icti, CDEEF ex @.@F*
)es animaux sont rpartis en deux catgories 'vaches0 bBu,s*.
)es proportions de troupeaux -vaches et -bBu,s sont di,,rents entre les deux rgions
)a catgorie danimal est 9 ris3ue vis9vis de la tuberculose bovine.
2n dispose din,ormation sur les taux dincidence provenant de la totalit du territoire doG
proviennent les deux rgions anal=ses.
2n dispose de limportance relative des temps dexposition dans la population de E,rence
6&Bu,s S% 8 "0@" < S2 8 "0H":
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* I
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Mthodes de standardisations
Les donnes
Egion A : %""" troupeaux < Egion & : 2""" troupeaux 'tous* suivis pendant % an
J cas J troupeaux
;
annes pondration taux observs(1)
T=pe n4 t4 K4 j
Standardisation des taux
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* H
T=pe n4 t4 K4 j
Region !
&Bu, %L II" "0II "0"!%
vache @% @I" "0@I "0"$%
Total I8 %""" "#"$%
Region &
&Bu, %" I"" "02I "0"2"
vache %2" %I"" "0LI "0"8"
Total %!" 2""" "#"'$
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Mthodes de standardisations
La taux standardis par la mt(ode directe
s4 8 poids dans strate 4 de la population de E,rence
5
dir s4 ; 4
4 % =
=

Standardisation directe
s4 8 poids dans strate 4 de la population de E,rence
4 8 taux dans la strate de la population tudie 'de lchantillon E 1*
(omparaison de deux taux standardiss : le -Comparative Morbidity Figure '(MM*
(exemple des deux rgions)
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* L
dir
dir
'A*
(MM
'&*

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Mthodes de standardisations
Standardisation directe
' lexemple ,icti,*
J cas J troupeaux
;
annes pondration taux observs
n4 t4 population Ks4 j
Region !
&Bu, %L II" "0@"" "0"!%
vache @% @I" "0H"" "0"$%
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* 8
vache @% @I" "0H"" "0"$%
Total I8 %""" "#"')
Region &
&Bu, %" I"" "0@"" "0"2"
vache %2" %I"" "0H"" "0"8"
Total %!" 2""" "#"$'
taux standardis 8
taux standardis 8
= + = di * r * (A) 0,031 0,091 0,40 0,60 0,067
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Mthodes de standardisations
*onclusions
&ien 3ue les taux dNincidences par strate soient plus levs dans les strates de la
rgion A
le taux brut global est moins lev dans A '"0"I8* 3ue dans & '"0"HI* parce 3ue la
proportion de vaches = est %0L ,ois plus ,aible 'LI#@I*
Standardisation directe
proportion de vaches = est %0L ,ois plus ,aible 'LI#@I*
alors 3ue les vaches ont un ris3ue plus lev dans les deux rgions :
'Egion A : "0"$%#"0"!% 8 20$ < rgion & : "0"8"#"0"2" 8 @0"*
&iais : sousestimation du ris3ue dans la rgion A par rapport 9 & car moins de vaches
dans A 1
)es taux ramens 9 mOme structure 6&Bu,s8@"P < vaches8H"P: indi3uent un taux
dNincidence suprieur dans la rgion A '"0"HL contre "0"IH pour &*.
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* $
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Mthodes de standardisations
*onclusions (suite)
)e ris3ue de tuberculose bovine est %0%$H ,ois plus lev dans la rgion A.
Standardisation directe
dir
dir
'A* "0"HL
(MM %0%$H
'&* "0"IH

= = =

Qntervalle de con,iance au niveau $IP :


(1)
(e ratio nest pas signi,icativement di,,rent de % au niveau de ris3ue IP.
2n peut considrer 3ue les deux rgions ont le mOme ris3ue.
(1)
lments de calculs en annexe
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %"
dir'&* "0"IH
( ) [ ]
Q( (MM<$IP "0L8H < %0@8H =
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Mthodes de standardisations
2n peut aussi comparer un taux standardis au taux de la population de E,rence
)es calculs sont 3uasi identi3ues avec une simpli,ication due au ,ait 3uil n= a pas
Standardisation directe
)es calculs sont 3uasi identi3ues avec une simpli,ication due au ,ait 3uil n= a pas
dincertitude sur lestimation des taux par strate et du taux global dans la population
de E,rence.
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %%
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Mthodes de standardisations
Les informations disponibles
2n ne dispose pas de la rpartition des > individus
;
units de temps ? dans la population
de E,rence :
6S 4 7 48% 9 5: non disponible
Standardisation indirecte
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %2
2n dispose par contre des taux par strate dans cette population :
6 S 4 7 48% 9 5: 8 taux dincidence par strate dans la population de rfrence
2n a les mOmes in,ormation dans la 'les* population's* tudies.
4 7 48% 9 5: 8 importance relative des strates dans lchantillon E issu de la population
tudie.
64 7 48% 9 5: 8 taux dincidence estim par strate dans lchantillon E
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Mthodes de standardisations
(alcul dun taux a4ust en appli3uant aux taux de la population de E,rence les poids
de lchantillon issu de la population tudie.
Standardisation indirecte
5
indir 4 ; s4
4 % =
=

28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %!


2n en dduit un nombre > attendu ? de cas dans la population tudie.
Rue lon compare au nombre de cas observ -m en calculant un ratio
-StandardiSed +ortalit= Ratio
(1)
8
(1)
!tandardi"ed #ncidence Ratio (SIR) plus correct quand on analyse des incidences$
A
indir ; i
i %
t E
=
=

m
SME
E
=
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Mthodes de standardisations
Taux dincidence dans la population de r,rence 6vaches S%8"0"2I < bBu,s S%8"0"8I :
Standardisation indirecte
' retour de lexemple ,icti,*
J cas J troupeaux
;
annes pondration taux standards
e,,ecti,s
attendus
T=pe n4 t4 K4 sj E4
Region !
&Bu, %L II" "0II "0"2I %!0LI
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %@
&Bu, %L II" "0II "0"2I %!0LI
vache @% @I" "0@I "0"8I !802I
Total I8 %""" I2
Region &
&Bu, %" I"" "02I "0"2I %20I
vache %2" %I"" "0LI "0"8I %2L0I
Total %!" 2""" %@"
< ... Boeufs *
58
E (A) 550 13,75 SMR 0 (A) 1,115
52
,025 = = = =
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Mthodes de standardisations
Egion A Egion &
SME %0%%I "0$2$
SMEin, "08@L "0LLH
Standardisation indirecte
CSMEin, < SMEsupF 8 intervalle de con,iance des SME au niveau $IP
(dtails en annexes)
Qnterprtation1
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %I
SMEin, "08@L "0LLH
SMEsup %0@@2 %0%"!
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Mthodes de standardisations
Information ncessaire
Standardisation directe
: rpartition par strate de la population de E,rence
: taux par strate de la population tudie
Standardisation indirecte ou indirecte ,
{ }
{ }
s4
4
74 %0...T
74 %0...T
=
=
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %H
Standardisation indirecte
: rpartition par strate de la population tudie
: taux par strate de la population de E,rence
)e choix dpend des in,ormations disponibles sur la Uopulation de E,rence
)ors3ue lob4ecti, est le calcul de taux standardiss le seule mthode disponible est
la mthode de standardisation directe 1
{ }
{ }
4
s4
74 %0...T
74 %0...T
=
=
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Mthodes de standardisations
-lments de bibliograp(ie
&ou=er0 V.0 Wmon0 X.0 (ordier0 S.0 Xerriennic0 M.0 QStYTer0 Q.0 Stenger0 &.0 (lavel0 V. : Epidmiologie %
Principes et mt&odes quantitatives Z )es Editions QASEEM0 %$$!.
&resloK0 A.E.0 Xa=0 A.E. Statistical methods in cancer research Dolume QQ. The Xesign and anal=sis
o, cohort studies. QAE( )=on Mrance %$8L.
Xohoo0 Q.0 Martin0 [.0 Str=hn0 W. : 'eterinary Epidemiologic Researc& 2""! AD( Qnc.
Samuels0 S.V.0 &eaumont0 V.V.0 &resloK0 A.E. UoKer and detectable risT o, seven test ,or
standardiSed mortalit= ratios. AmV Epidemiol %$$% .//: %%$%%%$L
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %L
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Mthodes de standardisations
*omplments *omplments
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %8
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Mthodes de standardisations
)a variance du taux dincidence standardis scrit :
( ) ( )
( )
2
4 5
dir s4
2
4 %
m
var 'A*
=
=

Standardisation directe
(alcul de lintervalle de con,iance du (omparative Morbidit= Migure '(MM*
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* %$
2G :
s4 reprsente le poids de la strate 4 dans la population de E,rence.
m4 reprsente le nombre de -cas observs dans la strate 4 de lchantillon anal=s
reprsente le nombre dindividu
;
unit de temps dans la strate 4 de lchantillon
( ) ( )
( )
dir s4
2
4 %
i 4
var 'A*
t
=

i 4
t

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Mthodes de standardisations
)intervalle de con,iance sur )og'(MM* est calcul en ,aisant l h=poth\se de normalit de la
distribution de )og'(MM* :
( ) ( ) ( ) ( )
( ) ( ) ( ) ( )
in, ; )og (MM )og (MM %0$H var )og (MM
)og (MM )og (MM %0$H var )og (MM
=
= +
Standardisation directe
(alcul de lintervalle de con,iance du (omparative Morbidit= Migure '(MM*
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* 2"
)es bornes de lintervalle de con,iance calcul sur le )og du (MM sont ensuite soumises 9 la
trans,ormation -exponentielle pour obtenir un intervalle de con,iance de (MM :
( ) ( ) ( ) ( )
sup ; )og (MM )og (MM %0$H var )og (MM = +
( ) ( )
in, in, sup sup (MM exp )og'(MM* < (MM exp )og'(MM* = =
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Mthodes de standardisations
0est du S+R
)h=poth\se > SME 8 % ? traduit un nombre attendu de cas dans la population
tudie identi3ue 9 celui de la population de E,rence pour une structure de
rpartition de la population 9 ris3ue entre les strates identi3ue 9 celle de la
population de E,rence.
Standardisation indirecte
'SME : test et intervalle de con,iance *
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* 2%
population de E,rence.
Test '&resloK et Xa=0 %$8L* :
Sous lh=poth\se > SME 8 % ? :
(pproximation dune loi de Poisson (loi de m) par une loi )ormale$
2
2 2
'%*
%
m E
2
'seuil 8!08@*
E




=
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Mthodes de standardisations
0est du S+R 1
Si E est petit 'E ] %"*
Test 'Samuels et al. %$$%* :
Standardisation indirecte
'SME : test et intervalle de con,iance *
2
%
!
2 2
% E
$ m %



=
28!"#"$#2"%% Service &iomtrie '()* 22
Test 'Samuels et al. %$$%* :
m; 8 m si m E < m 8 m^% sinon
Intervalle de confiance 1
S
'%#2*
8 percentile %#2
(1*+, au niveau de risque -.)
2 2
; ;
'%*
;
% E
$ m %
$ m; m;


=





!
'% *
2
in, ;
;
;
!
'% *
2
;
;
;
m % S
SME %
E $ m
! m
m % % S
SMEsup %
E $ 'm %*
! m %


=


+
= +

+
+

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