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BIOSYNTHESE DES ACIDES

AMINES

Présenté par :Dr AOUAT Encadré par: Pr HABBAK


Dr HAMOUCHI
PLAN
Introduction
I- Aperçu sur la biosynthèse des acides aminés.
II- Biosynthèse des acides aminés.
A-Biosynthèse des acides aminés non
indispensables.
B-Biosynthèse des acides aminés
indispensables.
Conclusion.
INTRODUCTION.
Les acides amines sont les constituants fondamentaux des
protéines.
Ils peuvent être d’origine endogène résultant du catabolisme des
protéines, ou exogènes apportés par l’alimentation.
Dans l’ensemble des 20 acides aminés, on distingue :
-Huit acides aminés indispensables: Lys, Met, Thr, Ile, Val, Leu,
Phe, Trp qui doivent être apportés par l’alimentation(animales et
végétales).
-Douze acides amines non indispensables: Glu, Gln, Arg, Pro, Asp,
Asn, Ala, Ser, Gly, Cys, His, Tyr, qui peuvent être synthétisés a
partir d’intermédiaire métaboliques avec consommation d’ATP.
NB: l’arginine et l’histidine peuvent être considérés comme des
acides aminés semi-indispensables car ils sont synthétisés par
l’organisme en quantité insuffisante.
I-Aperçu sur la biosynthèse des acides aminés.
Comment peut-on synthétiser ces AA ?
a. Deux substrats essentiels :
- Un squelette carboné fourni principalement par des
intermédiaires des voies métaboliques (glycolyse, cycle de
Krebs, voie des pentoses phosphates).
- Un (des) groupement (s) aminé (s) trouvant l’origine
généralement dans le Glu et la Gln.
- Un AA peut être le précurseur d’un autre (d’autres) AA (s).
b. Trois voies possibles :
- Transamination à partir du Glutamate (Glu) sur des acides
α-cétoniques.
- Amination réductive (synthèse du Glu).
- Amidation (synthèse de la Gln et de l’Asn).
Précurseurs des acides aminés .
Oxaloacetate 3-Phosphoglycerate a-cetoglutarate

aspartate Serine gluTamate Glutamine

Lysine
Proline
Cysteine Glycine Arginine
Asparagine Methionine Threonine

ISOLEUCINE Phosphoenolpyruvate
Pyruvate + Ribose-5-
erythrose-4- phosphate
phosphate

Phenylalanine
Alanine Leucine Tyrosine Tryptophane
Valine
Histidine
Tyrosine
II-Biosynthèse des acides aminés.
II-A-Biosynthèse des acides aminés non indispensables.
1- A partir de alpha-cetoglutarate :
1-a-Synthese de glutamate: Amination réductrice.

La glutamate deshydrogénase catalyse le transfert d’un groupement ammonium vers le


le a-cetoglutarate avec formation du glutamate.

IL s’agit d’une forme d’assimilation de l’ammonium libre.

NB: le glutamate peut également être synthétisé par:


 Transamination de l’α-cétoglutarate avec l’alanine ou l’aspartate, catalysé respectivement par
ALAT ou ASAT.
 Catabolisme de l’histidine via le N-Formimino-Glutamate.
 Amidation du groupement carboxyle latérale du
glutamate en glutamine :

La glutamate synthétase catalyse le transfert d’un groupement


ammoniac vers le glutamate avec formation du glutamine.

Cette amidation est activée par l’hydrolyse de l’ATP.


1-b.Synthèse de la proline.
γ-glutamyl
kinase

glutamate γ-semi-
aldhyde
désydrogénase.

delta- pyroline
5carboxylate
réductase.
La proline est synthétisée a partir du glutamate suivant la
séquence ci-dessous:
 Phosphorylation du glutamate en glutamate5-phosphate en
présence d’ATP, la réaction est catalysée par γ-glutamyl
kinase.
 Réduction de cet acyl-phosphate par NADPH en semi-
aldéhyde glutamique, en présence d’une glutamate γ-semi-
aldhyde désydrogénase.
 Aprés déshydratation, cyclisation du glutamate semi-
aldhyde en delta pyroline-5 carboxylate.
 Réduction du delta pyroline-5 carboxylate par le NADPH,
pour former la proline en présence de delta- pyroline
5carboxylate réductase.
1-C-Synthèse de l’arginine.
L’arginine est synthétisée a partir du glutamate via le cycle de
l’urée:
 Le glutamate subit une réaction de transamination avec
l’oxaloacétate pour donner l’aspartate. La réaction est
catalysée par ASAT.

 L’aspartate ainsi obtenu se condense avec la citruline pour


former l’arginosuccinate, en présence de l’arginosuccinate
synthétase.

 L’arginosuccinate lyase clive l’arginosuccinate et libère du


fumarate et l’arginine.
2- A partir de 3-phosphoglycérate.
2-a-Synthese de la serine.

3-pg Aminotransférase Phosphosérine


déshydrogénase.
phosphatase
La synthèse de la serine se fait a partir d’un intermédiaire de la
glycolyse: le 3 phosphoglycerate, suivant la séquence si
dessous:
 Oxydation du 3-phosphoglycerate par le NAD+ en 3-
hydroxypyruvate ,en présence de 3-
phosphoglyceratedeshydrogénase.

 Transamination avec le glutamate pour former la 3-


phosphoserine, par une aminotransférase à coenzyme PLP.

 Hydrolyse de la phosphosérine en sérine par une


phosphosérine phosphatase.
2-b-Synthese de glycine.

 La glycine est synthétisée a partir de la sérine par


élimination d’un radical hydroxymethyl.
 La réaction est catalysee par sérine
hydroxyméthyltransférase utilisant le tétrahydrofolate
comme coenzyme.
2-c-Synthese de cystéine.
La cystéine est synthétisé a partir de la sérine et la
méthionine via la synthèse de l’homocystéine.
 l’homocystéine réagit avec la sérine dans une réaction
catalysée par la cystathionine ᴃ-synthétase avec formation
de la cystathionine.

 la cystathioninase, enzyme nécessitant du PLP, catalyse


l’élimination d’ammoniaque et le clivage de la cystathionine
pour donner de la cystéine libre et a-cytobutyrate.
Pathologies liées aux métabolisme de la cystéine.
L’Homocystinurie.

L’homocystinurie est du à un déficit anzymatique en Cystathionine-B-Synthase.


Clinique: Atteinte squelettique(syndrome marphanoide)
Atteinte oculaire (subluxation de cristallin, cataracte, myopie).
Retard mental.
Diagnostic: Hyperhomocystéine dans le sang et les urines.
Hyperméthioninémie.
Traitement: Régime pauvre en méthionine et enrichie en cystéine, acide folique et
vitamine B12.
Pathologies liées aux métabolisme de la cystéine.
La cystinurie.

Etiologie: c’est une anomalie du transport des acides aminés dans le tubule rénal
caractérisée par la formation récurrente de calculs rénaux de cystine, ce qui conduit à
leur précipitation.
Clinique: Tubulopathie.
Lithiase urinaire bilatérale.
Pathologies liées aux métabolisme de la cystéine.
Cystinose.

Etiologie: C’est une affection lysosomale rare, caractérisée par un défaut


de transport de la cystine, qui entraine le dépôt de cristaux de cystine
dans différents tissus, endommageant surtout les yeux et les reins.
3- A partir de l’oxloacetate.
3-a-Synthèse de l’aspartate.

 L’aspartate est formé par transamination de l’oxaloacetate.


 Le groupement a-aminé est donné par le glutamate.
 La réaction est catalysée par L’aspartate amino tansférase.
3-b-Synthese de l’asparagine.

 Dans la réaction de l'asparagine synthétase, l'ATP est


utilisé pour activer l'aspartate, formant le β-aspartyl-AMP.

 Par transamination, la glutamine cède son groupement


amine au β-aspartyl-AMP avec formation de l’asparagine
et l’AMP libre.
4- A partir du Pyruvate.
4-a-Synthèse de l’alanine.

 Alanine est formé par transamination du pyruvate.

 Le groupement a-aminé est donné par le glutamate.

 La réaction est catalysée par alanine aminotransférase .


5-A partir du phosphoénolpyruvate et érythrose-4- phosphate.
5-a-Synthese de la tyrosine.

PAH

 La tyrosine est synthétisée par hydroxylation de la


phénylalanine, grâce à la phénylalanine hydroxylase .
 Le coenzyme est la tetrahydrobioptérine (BH4).
Anomalies liées au métabolisme de Phénylalanine.

L-Phénylalanine
NADP + BH4
BH2 réductase PAH
NADPH,H+ BH2

L-Tyrosine

Hyperphénylalaninémie Phénylcétonurie
maligne

↑↑↑ Phenylalanine
↑↑↑Phénylpyruvate
↑↑↑ Phénylacétate
↑↑↑ Phényllactate
Anomalies liées au métabolisme du Phénylalanine.
Physiopathologie:
L’augmentation de la concentration de phénylalanine, phénylpyruvate,
phénylacétate est responsable d’une toxicité nerveuse.
Le déficit en PAH est responsable egalement d’un déficit en Tyr qui
devient un AA essentiel.
Il en résulte une altération de la synthèse protéique intracérébrale et de la
synthèse des neurotransmetteurs.
Clinique: Retard mental, psychomoteur.
Convulsions.
Hypopigmentation.
Diagnostic: est purement biologique, il repose sur la détermination de la
concentration de phénylanine par fluorémétrie.
Traitement: Régime pauvre en phénylalanine, interdisant le lait, les
produits laitiers,les oeufs, les pattes……
Anomalies liées au métabolisme de la tyrosine.
L- Phénylalanine

L- Tyrosine
Tyrosinémie TYPE II Tyrosine aminotrasférase.
4- Hydroxyphénylpyruvate

Tyrosinémie TYPE III 4-OH phénylpyruvate dioxygénase.

Homogentisate
ALCAPTONURIE Homogénisate oxydase.
Maléylacétoacétate
Succinylacétoacétate
Fumarylacétoacétate
Fumarylacetoacate
Tyrosinémie TYPE I hydrolase. Succinylacétone

Fumarate Acétoacétate
Les Hypertyrosinémies.
TYROSINEMIE ETIOLOGIE CLINIQUE DIAGNOSTIC TRAITEMENT

Déficit en  Insuffisance Sang: tyrosine + Restriction en


TYPE I Fumarylacétoacét hépatique foeto-protéine. tyrosine et en
Phénylalanine dans
ate.  Cholestase Urines: ↑↑ Succinyl
l’attente de
 Diarrhée acétone et Ac. Delta transplantation
 Hépatocarcinom aminolévunilique. hépatique.
(sans traitement). NTBC: inhibiteur de
4-OHppdioxygénase

Déficit en  Atteinte Sang:Tyrosine Restriction


TYPE II Tyrosine oculaire. contrôlée en
Aminotransférase  Atteinte cutanée phénylalanine et
 Retard mental
en tyrosine.
dans 50% des cas

TYPE III Déficit en 4-  Retard de Sang:Tyrosine Restriction


Hydroxyphényl développement. Urines: contrôlée en
4-
Pyruvate  Tremblements hydroxyphénylpyruvate, phénylalanine et
Dioxygénase.  Agitation 4- hydroxyphényllactate, en tyrosine.
4- hydrophénylacétate.
excessive.
6- A partir ribose 5 phosphate.
6-a-Synthese de l’histidine.
La synthèse de l’histidine fait intervenir 3 précurseurs:
 Ribose 5 phosphate(PRPP).
 ATP.
 Glutamine.
Cette biosynthèse s’effectue chez les végétaux et les bactéries,
mais absente chez l’Homme.
II-B-Biosynthèse des acides aminés essentiels.
II-B-Biosynthèse des acides amines essentiels.
Dans l’ensemble des 20 AA, l’homme est incapable de
synthétiser 8 acides aminés par défaut des acides α-cétoniques
correspondants ou de transaminases correspondantes.
Mais, ils sont synthétisés par les animaux et les végétaux.
Sur ces 8 acides aminés :
- 2 sont synthétisés à partir du phosphoenolpyruvate,
intermédiaire de la glycolyse et de l’erythrose-4-phosphate,
intermédiaire de la voie des pentoses phosphate, à savoir,
le tryptophane et la phénylalanine.
- 2 sont synthétisés à partir du pyruvate, intermédiaire de la
glycolyse: la leucine et la valine.
-4 sont synthétisés, via de l’aspartate, à partir de l’oxaloacétate,
intermédiaire du cycle de l’acide citrique: la lysine, la
thréonine, l’isoleucine et la méthionine.
Hystérique, Le Très Lyrique Trystan Fait Vachement Marrer Iseult.

H HISTIDINE
Le LEUCINE
T THREONINE
LY LYSINE
TRY TRYPTOPHANE
F PHENYLALANINE
V VALINE
M METHIONINE
I ISOLEUCINE
CONCLUSION
L’homme ne peut pas synthétiser 8 AA (indispensables : apportés par l’alimentation) :
Lys*, Met*, Thr*, Ile*, Val*, Leu*, Phe*, Trp*.
Les autres AA peuvent être synthétisés en utilisant :
 Deux substrats : un squelette carboné (intermédiaire métabolique) et une source
de groupements aminés (Glu, Gln) + ATP.
 Trois moyens possibles : Transamination, Amination réductive et Amidation.

C’est ainsi que:

 A- cétoglutarategluate Proline, Arginine, Glutmate, Glutamine.

 3-Phosphoglycérate Sérine, Cystéine, Glycine.

 Oxaloacétate Aspartate, Asparagine, Méthionine ,Thréonine,


Isoleucine, Leucine.

 Pyruvate Alanine, Valine.

 PEP et erythrose-4-P Phényalanine, Tryptophane, Tyrosine.

 Ribose-5-P Histidine seulement chez les bactéries et végétaux.

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