Master Génomique et

Bioinformatique

Présenté par:
AFSAHI Ziade
BOUARGALNE Ismail 2023 - 2024 Pr. L. SBABOU
 Plan :

Conclusion
Avantage et Limitations 04

PRINCPE DU TECHNIQUE 02 03 ETAPE DE SEQUENCAGE

INTRODUCTION
01 (Présentation du Ion Torrent)
Présentation du Ion Torrent
o Séquençage d’ADN basée sur la
H+
détection d’ions d’hydrogène

2010
Chip 314
Chip 318
Chip 316

• Séquençage par synthèse (PCR)

Techniques • Fluorescence / chimiluminescence

• durée de séquençage : 2 heures

propriétés • Capacité de séquençage : >10Mb >100Mb >1Gb
Principe :

chaque incorporation réussie de nucléotide par l'ADN polymérase libère une molécule H + et du
pyrophosphate.
Principe :
 Préparation de Préparation de la Données de
Séquençage
librairie matrice de séquençage séquençage
ADN génomique (1µg ou 100ng)

Fragmentation
Méthode de ligation

Amplification par
Sélection de la taille PCR (4 à 5 cycles)
des fragments d'ADN

Ligation
Préparation de Préparation de la Données de
Séquençage
librairie matrice de séquençage séquençage
Emulsion :
PCR en Emulsion
Ion Sphere Particles Procédé permettant de générer des Récupération des ISP
microréacteurs PCR dans l’huile

ADN matrice

ePCR Primers
 Préparation de Préparation de la Données de
Séquençage
librairie matrice de séquençage séquençage
 Préparation des ISP enrichies avant chargement sur puce ion torrent

Initialisation des PGM Chargements des puce Séquençage via PGM

 Préparation de Préparation de la Données de
Séquençage
librairie matrice de séquençage séquençage
 Préparation des ISP enrichies avant chargement sur puce ion torrent

Initialisation des PGM Chargements des puce Séquençage via PGM

Préparation de Préparation de la Données de
Séquençage
librairie matrice de séquençage séquençage
4. Les applications de Ion torrent
Recherches sur les Les maladies infectieuses
cancers
 L´étude des épidémies d'agents
 Séquençage simple et évolutif pathogènes

 Rapports optimisés
 Identification des mutations

-LeSoir.be -santepubliqueottawa.ca

Les maladies complexes Agro-génomique

 Vise à comprendre comment la  Découverte de
génétique et l´environnement caractéristiques qui
influence le développement des permettent de relever des
maladies complexes défis liés à l´alimentation d
´une population

-Sante.journaldesfemmes.fr -Crag 5
 Conclusion :
Avantages :
 Ion Torrent génère des longueurs de
lecture d'environ 200 pb.
 La courte durée d'exécution de cette
technique facilite également plusieurs
exécutions pour la génération de plus de
données dans un temps donné
Limitations :
La longueur de lecture de 200 pb se situe entre
les technologies NGS de longueur de lecture
courte et longue. Alors que les technologies de
lecture courte sont facilitées par une énorme
génération de données, Ion est à la traîne dans
la production totale de données. De cette façon,
Ion Torrent doit faire ses preuves en tant que
technique de séquençage autonome pour les
projets de séquençage de novo de gros
génomes.
Merci de votre
attention