Cours Génétique Quantitative BCPST MENAPLN 2024

CPGE - MENAPLN Année académique 2023-2024
BCPST L2 S4
UE: GENETIQUE 3
ECU: Génétique quantitative
(CT = 15 h et TD = 15 h)
Pr Renan Ernest TRAORE
Professeur Titulaire
Génétique et Amélioration des plantes
UFR/SVT-Université Joseph KI-ZERBO
Email: traoreernest@yahoo.fr ou
Février 2024
1
renan.traore@ujkz.bf
Objectifs du cours
- Connaître les principes et les concepts de base de la génétique
quantitative ;
- Connaître le déterminisme génétique des caractères quantitatifs;
- Décrire les différents types d’action des gènes impliqués dans

l’expression d’un caractère quantitatif;
- Connaître la relation entre la génétique quantitative et la sélection

2
PLAN
I- Principe de la génétique quantitative
II- Description d’un caractère quantitatif
III- Déterminisme génétique des caractères quantitatifs
IV- Décomposition de P=G+E
V- Notion d’héritabilité d’un caractère

3
VI- Ressemblance entre apparentés

Bibliographie
1-Griffiths, AJF, Gelbart, WM, Miller, JH & Lewontin, RC 2001.
Analyse Génétique Moderne. De Boeck Université
2-Ridley, M 1997 Evolution Biologique, De Boeck
3-Ressources pédagogiques sur le site du laboratoire:

http://gepv.univ-lille1.fr
4-Réseau d’enseignement en Génétique (GENET)

http://www.univ-tours.fr/genet/ 4
Bibliographie
5-Falconer, D. S. and T. F. C. Mackay (1996). Introduction to

Quantitative Genetics. London, Prentice Hall.
6-Kearsey, M. J. and H. S. Pooni (1996). The Genetical Analysis of

Quantitative Traits, Chapman & Hall.
7-Lynch, M. and B. Walsh (1998). Genetics and Analysis of

Quantitative Traits, Sinauer Associates Inc.
5
Bibliographie
8- Verrier E., Brabant P., Gallais A. (2001). Faits et concepts de base

en génétique quantitative. Polycopié INA Paris-Grignon, 134 p.
http://www.inapg.inra.fr/dsa/uvf/GQ/GQintro.htm
9- Crédits: P. Touzet; C. Dillmann & F. Hospital; E. Verrier, Ph.

Brabant & A. Gallais…
6
Génétique qualitative Génétique quantitative
1. Caractère discret 1. Caractères inscrits dans une gamme
1. Variation discontinue, classes 2. Variation continue, phénotypes répartis

discrètes de phénotypes dans une gamme
2. Effets gène unique discernables 3. Sous contrôle polygénique, effet gène

unique trop faible pour être détectés
3. Concerne des croisements 4. Concerne un groupe d’individus

d’individus et leur descendance représentatifs de tous les croisements
possibles
4. Analyse par comptage et 5. L’analyse statistique permet de donner
rapport une estimation des paramètres
caractéristiques de la population, comme
la moyenne et l’écart type 7
 La génétique quantitative est la génétique des caractères dont

l'observation passe par une mesure.
 Partie de la génétique qui étudie la transmission des différences

individuelles à l'aide de modèles mathématiques et des statistiques.
 A partir de l'estimation des variances imputables aux effets des gènes et

à ceux de l'environnement, les modèles permettent d'estimer l'influence
respective de l'hérédité et du milieu.
8
 C’est est une forme de science pratique de la domestication moderne qui

se situe entre la génétique, les statistiques, les probabilités et dans une
moindre mesure, la physiologie.
 La génétique quantitative n’est en tout cas pas une « science dure »

comme pourrait l’être la chimie, la physique ou la biologie mais une
forme de concept intellectuel, un modèle mathématique qui ne se base
pas sur des mécanismes biologiques et physiologiques mais qui permet
néanmoins de prédire (et donc piloter) la sélection sur des caractères
quantitatifs.
9
 C’est un modèle robuste qui a fait ses preuves depuis sa naissance dans
les années 1920 (Fisher 1918, Haldane 1932, Wright 1921) et qui est
utilisé dans presque tous les modèles de sélection en génétique animale
ou végétale.
 La génétique quantitative est un modèle prédictif (qui marche bien) mais

pas explicatif (ne présente pas les mécanismes sous-jacents) : il peut
répondre à des questions du type « combien ? », « dans quelle mesure ?
», « quelle chance ? », « dans combien de temps ? » mais pas à des
questions comme « pourquoi ? », « comment ? »
10
 Construction de la valeur génétique d’un individu
 Nous allons considérer qu’il n’y a AUCUN EFFET DE

l’ENVIRONNEMENT sur le phénotype.
 Les règles de calcul de la génétique quantitative seront simplifiées pour

faciliter la compréhension des principes de base.
 En étudiant les lois de la transmission des gènes, nous nous sommes

servi d’un modèle simple sur un gène qui codait pour la couleur de l’épi. Il
y avait dans ce modèle, deux versions de gène (ou allèles), un allèle «
Jaune » et un allèle « Rouge ».
11
12
 Imaginons désormais un caractère quantitatif quelconque, la longueur de

l’épi de maïs par exemple, qui ne va être codé que par un seul gène.
 Ce que propose le modèle de la génétique quantitative c’est de donner

une valeur génétique quantitative, chiffrée, aux allèles.
 Dans l’exemple ci-dessous, deux individus différents sont représentés, le

premier est de génétique [4-2] et le second de génétique [5-1]. Il existe ici
4 versions différentes pour le gène de la longueur de l’épi : les allèles [1],
[2], [4] et [5].
13
Dans l’exemple ci-contre, deux

individus différents sont
représentés, le premier est de
génétique [4-2] et le second de
génétique [5-1].
Il existe ici 4 versions de gène

différentes pour le gène de la
longueur de l’épi : les allèles
[1], [2], [4] et [5].
14
 La valeur génétique des individus correspond à la somme de la valeur

des allèles (pas la moyenne des valeurs des allèles !).
 Dans cet exemple, nos deux individus ont une valeur génétique de 6
(4+2 ou 5+1).
 Bien qu’ayant une composition allélique différente, ces deux individus

présenteront un épi de 6 cm de long
15
 Pour continuer à se familiariser avec ce principe de valeur génétique des

allèles, imaginons le résultat d’un croisement forcé entre ces deux
individus.
16
 La descendance présentera 4 phénotypes différents :
*25% de plantes avec un épi de 9 cm

*25% de plante avec un épi de 3 cm
17
 Nous avons donc différents éléments en relation les uns avec les autres
 Il y a des allèles qui codent pour des caractères phénotypiques

quantitatifs, chacun de ces allèles possède une valeur génétique
quantitative (un nombre) : c’est la valeur allélique.
 Dans notre exemple il y a 4 allèles différents : [1], [2], [4] et [5].
18
 Quand les allèles se combinent par 2 pour former un génotype complet,

la somme de la valeur allélique des deux allèles engendre la valeur
génétique additive de l’individu (on dit « additive » car c’est le résultat de
l’addition = la somme des valeurs alléliques).
 Cependant, nous allons voir juste après que, parfois, la véritable valeur
génétique observée d’un individu n’est pas exactement égale à la valeur
génétique additive
19
 Un individu avec les allèles [4] et [1] aura par exemple une valeur
génétique de [6] alors que, selon la règle énoncée précédemment on
aurait prédit une valeur génétique de [5]
 Cette différence entre la prédiction du modèle additif et la valeur

observée porte un nom un peu barbare : c’est le résidu de dominance.
 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢 𝑑𝑒 𝑑𝑜𝑚𝑖𝑛𝑎𝑛𝑐𝑒 = 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒 − 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟

𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑎𝑑𝑑𝑖𝑡𝑖𝑣𝑒
20
 Dans notre exemple :
 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢 𝑑𝑒 𝑑𝑜𝑚𝑖𝑛𝑎𝑛𝑐𝑒 = 6−(4+1) = 6−5= +1
 En fait le résidu de dominance est un peu comme une baguette magique

qui sert à combler les lacunes du modèle de la génétique quantitative car
il est complétement imprédictible !
21
 Les allèles [4] et [1] ensemble peuvent donner un individu de valeur [6]
(le résidu est égal à +1) mais les allèles [4] et [2] ensemble peuvent très
bien donner un individu de valeur [5] (le résidu est égal à -1) :
 il n’y a aucune logique, aucune règle !
 Rappelons que le modèle de la génétique quantitative ne sert pas à

comprendre des mécanismes biologiques mais bien à mesurer et prédire
des résultats.
22
 Heureusement pour le modèle de la génétique quantitative, le résidu de

dominance est toujours bien plus faible que la valeur additive.
 Dans la grande majorité des cas, il représente entre -10% et +10% de la

valeur génétique additive.
 Autrement dit, le modèle de la génétique quantitative permet des

prédictions de valeurs génétiques avec une erreur possible d’environ
10%.
23
 Dans le monde des généticiens ou des sélectionneurs, ce résidu de

dominance porte d’autres noms : « l’effet d’épistasie », «effet d’hétérosis»
et « vigueur hybride ».
 Ainsi, on note la valeur génétique d’un individu de la manière suivante :
 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒=𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑎𝑑𝑑𝑖𝑡𝑖𝑣𝑒+ 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢

𝑑𝑒 𝑑𝑜𝑚𝑖𝑛𝑎𝑛𝑐𝑒
24
 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒=𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑎𝑑𝑑𝑖𝑡𝑖𝑣𝑒+ 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢

𝑑𝑒 𝑑𝑜𝑚𝑖𝑛𝑎𝑛𝑐𝑒
Schématisation de la construction de la valeur génétique 25
(pour un gène codant)

 Comme le résidu de dominance est faible par rapport à la valeur additive,

nous allons le mettre de côté pour le moment et nous concentrer
uniquement sur l’aspect additif et prédictible de la valeur génétique, à
savoir :
 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒=𝑆𝑜𝑚𝑚𝑒 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑣𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑑𝑒𝑠 𝑎𝑙𝑙è𝑙𝑒𝑠
26
 Valeur génétique et variance de la population
 Comme dans l’exemple de la construction du phénotype de la couleur de

l’épi de maïs; le phénotype de la longueur de l’épi est codé par des allèles.
 Ces allèles se combinent et se recombinent de génération en génération

grâce à la formation des gamètes et à la fécondation : c’est le brassage
génétique qui permet d’engendrer des individus sans cesse différents et
d’observer une diversité de phénotypes dans une population.
27
 La notion de structure allélique a été déjà utilisée pour décrire les

proportions relatives des allèles dans une population : un pourcentage
d’allèle [rouge] et un pourcentage d’allèle [jaune] qui, en fonction de leurs
fréquences donnent des proportions particulières d’épis rouges [rouge-
rouge], d’épis orange [rouge-jaune] et d’épis jaunes [jaune-jaune].
 Le lien entre la structure allélique (fréquence des allèles) et la structure

phénotypique (fréquence des couleurs d’épis) peut se faire grâce aux
équations d’Hardy-Weinberg.
28
 Nous pouvons appliquer exactement les mêmes équations et les mêmes

raisonnements avec des allèles qui ont des valeurs quantitatives et des
phénotypes quantitatifs (comme la taille de l’épi).
 Pour le moment, imaginons toujours que la taille de l’épi ne soit codée que
par un seul gène et que, dans notre population, il n’y ait que deux allèles
différents sur ce gène.
 Un allèle qui porte la valeur [4] présent à 42% et un allèle qui porte la valeur
[2] présent à 58%.
29
 On note alors :
 p([4]) la proportion de l’allèle [4] dans la population et p([2]) la proportion de

l’allèle [2] dans la population.
 On sait que p([4]) = 42% et p([2]) = 58%
 On peut alors calculer les proportions de tous les phénotypes dans cette
population grâce aux équations de Hardy-Weinberg
30
 p([2-2]) = p([2]) x p([2]) = 0.58 x 0.58 = 0.34 = 34%

-> il y a 34% d’épis de 4 cm (2+2)
 p([4-4]) = p([4]) x p([4]) = 0.42 x 0.42 = 0.18 = 18%

-> il y a 18% d’épis de 8 cm (4+4)
 p([4-2]) = 2 x p([4]) x p([2]) = 2 x 0.42 x 0.58 = 0.48 = 48%

-> il y a 48% d’épis de 6 cm (4+2)
31
32
 Valeur génétique moyenne de la population
 A partir de notre connaissance de la structure phénotypique de la

population sur les longueurs des épis il est possible de calculer la
valeur génétique moyenne de la population.
 Pour calculer cette moyenne, il est nécessaire de multiplier, pour

chaque phénotype la valeur génétique avec sa fréquence et de faire la
somme de toutes ces valeurs.
33
 Valeur génétique moyenne de la population
 Dans notre exemple :
 (0.34 x 4) + (0.18 x 8) + (0.48 x 6) = 1.36 + 1.44 + 2.88 = 5.7 cm
 La moyenne de la longueur des épis de cette population est de 5.7

cm.
34
 Variance génétique de la population
 On peut aussi calculer un autre indicateur qui va se révéler crucial

pour la suite : c’est la mesure de la diversité génétique de la
population sur le caractère quantitatif étudié.
 On utilise le calcul de la variance génétique pour décrire la dispersion

des valeurs génétiques de longueur d’épi autour de la moyenne de 6
cm.
35
 Pour les matheux, la variance exprime la moyenne des carrés des

écarts à la moyenne.
 Nous allons présenter la formule et l’utiliser dans notre exemple mais il

n’est pas nécessaire de savoir faire le calcul pour comprendre la suite.
 Où x est la moyenne des valeurs et xi la valeur d’un individu i et n le

36
nombre d’individu.
 Imaginons 2 classes de 4 élèves.
 Les élèves sont évalués sur un devoir noté sur 20.
 Dans la 1ère classe, les élèves obtiennent les notes 1, 2 ,18 et 19.
 Dans la 2nd classe, les élèves obtiennent les notes 8, 9, 11 et 12.
37
38
 Dans les deux classes, la moyenne des notes est la même : 10.
 Mais la dispersion est très différente : il y a beaucoup plus de

dispersion (aspect d’hétérogénéité, de diversité) dans la première
classe.
 Pour mesurer cette dispersion, on calcule la variance.
39
40
 Ici, pour le calcul de la variance des notes de classe, nous avions

accès à chacune des notes individuelles :
 pour la première classe un élève avait une note de 1, un autre une

autre de 2, un troisième une note de 18 et le dernier une note de 19.
 Ces valeurs forment une série qui est la suivante : 1, 2, 18, 19.
41
 On peut aussi résumer les résultats de la classe en les présentant

d’une autre manière : 25 % des élèves ont obtenu une note de 1, 25 %
une note de 2, 25 % une note de 18 et 25 % une note de 19.
 Les données que nous avons obtenues sur la dispersion des

longueurs des épis dans notre population sont présentées de cette
même façon (34 % d’épis de 4 cm, 48 % d’épis de 6 cm,…).
42
 Pour calculer la variance génétique d’une population à partir des

différentes valeurs génétiques individuelle que l’on trouve dans la
population et leur proportion relative, il est nécessaire d’apporter une
petite modification à la formule du calcul de la variance.
 Ainsi :
 Où p(i) est la proportion relative des individus de valeur génétique xi

43
dans la population.
 Appliquons cette formule à nos valeurs génétiques de longueur d’épi.
 Pour rappel, la population est composée de 34 % d’épis de 4 cm, 48

% d’épis de 6 cm et 18% d’épis de 8 cm.
 La moyenne des valeurs génétique de cette population est de 5.7 cm.
44
 La variance génétique mesure la dispersion des valeurs génétique sur

un caractère quantitatif dans une population.
 D’une manière générale, plus la variance est élevée, plus la diversité

génétique est élevée (diversité allélique + équilibre entre les
proportions alléliques). 45
 Si la variance génétique est égale à 0, cela signifie qu’il n’y a pas de

diversité allélique sur le caractère en question et donc pas de
possibilité de modifier la structure allélique.
 Autrement dit, sans variance génétique, l’amélioration d’un caractère

quantitatif par sélection massale n’est pas possible.
46
47
48
 Quelques exemples de caractères quantitatifs
 Caractères biométriques
 Taille des individus, poids, croissance
 Pression artérielle, taux de cholestérol, glycémie
 Caractères agronomiques
 Taille de portée chez les animaux, production laitière
 Teneur en huile chez le maïs
 Nombre de grains par épi de blé
 Date de floraison
49
 Maladies multifactorielles
 Diabète, prédisposition à l'obésité
 Résistance quantitative face aux pathogènes chez les plantes
 Caractères impliqués dans l’adaptation

 Précocité de floraison, fertilité, tolérance à des facteurs du milieu
(sécheresse, salinité, etc…)
50
51
 Origine de la continuité des caractères quantitatifs
52
53
54
55
56
57
58
59
Nombre de génotypes possibles selon les nombres de locus
et d’allèles par locus
60
 Modèle polygénique infinitésimal
61
62
63
64
 Modèle polygénique infinitésimal (gènes majeurs)
65
 Modèle polygénique infinitésimal (gènes majeurs)
66
IV- Décomposition P = G + E
67
 Modèle à un locus
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
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79
80
81
 Types d’action des gènes
 Effet additif (A)
•C’est l’effet moyen d’un allèle
•Chaque gène/allèle additionnel augmente l’expression du

caractère par des incrément égaux
•Si chaque allèle dominant augmente l’expression du

caractère par 1 unité, alors:
82
•aabb= 0, Aabb= 1, AABb= 3, AABB = 4

 Effets d’interactions
•Dominance (D): interaction entre allèles d’un même locus.
•C’est la déviation de l’additivité qui fait que

l’hétérozygote se ressemble à un parent plus que l’autre
•Trois types: dominance incomplète, dominance complète,

superdominance
83
•Epistasie (I): interaction entre allèles de différents loci

 Dominance
84
 Importance de la dominance en sélection
 La dominance et la superdominance constituent les deux
hypothèses qui ont été formulées pour expliquer le
phénomène d'hétérosis, essentiellement présent chez les
espèces allogames.
 Il s’agit de l ’augmentation de vigueur engendrée par le

croisement entre individus non apparentés.
 A l’inverse, on observe une dépression due à la

consanguinité après reproduction entre individus apparentés.
85
 Hypothèse de la dominance (complète ou partielle) : Pour
un caractère quantitatif, l ’hétérosis serait dû à la réunion
dans un même génotype d ’un grand nombre d ’allèles
dominants.
 On suppose implicitement que la dominance est favorable

(d > 0), ce qui va dans le sens de la sélection naturelle.
 L’allogamie autorise l’accumulation d ’allèles récessifs

défavorables à faible fréquence à de nombreux loci : c’est
86
le fardeau génétique.
 En effet, les allèles récessifs défavorables sont masqués à
l’état hétérozygote.
 L’autofécondation fait alors apparaître ces gènes à l’état

homozygote, d’où l ’effet dépressif de la consanguinité.
 En fait, les homozygotes construits avec des allèles

récessifs défavorables mettent en évidence le fardeau
génétique et les homozygotes construits avec des allèles
dominants favorables permettent de fixer l ’hétérosis.
87
 Sous l’hypothèse de dominance complète, la fixation de
l’hétérosis à long terme est envisageable, ce qui influe
naturellement sur le choix d’une stratégie de sélection
(lignées ou hybrides).
 Hypothèse de la superdominance : La supériorité de

l’hybride par rapport aux parents viendrait de la supériorité
de l ’état hétérozygote à certains loci.
 C’est la combinaison de deux gènes à l’état hétérozygote qui

88
entraînerait une potentialité supérieure à celle des homozygotes.

 En fait, la superdominance apparaît souvent comme un
phénomène marginal: on parle de superdominance
marginale.
 L’hétérozygote présente un comportement plus stable sur

l’ensemble des milieux ou sur l ’ensemble de la vie d ’une
plante, sans jamais avoir été avantagé dans des conditions
précises.
 La superdominance est alors la conséquence de89
l’accumulation de simple dominance dans différents milieux.

 Par ailleurs, la superdominance au niveau d ’un caractère
complexe peut être le résultat de gènes à effets
pléïotropiques (la pléïotropie est l ’action simultanée d ’un
gène sur plusieurs caractères).
 Sous l’hypothèse de superdominance: l’hétérosis est

infixable, et par conséquent les variétés hybrides resteront
toujours justifiées.
90
 Par ailleurs, la multiplication végétative ou la multiplication
par apomixie (développement d ’une graine sans
fécondation) permettra de reproduire à l ’identique les
meilleures combinaisons hétérozygotes par voie non sexuée
(variétés clones).
91
 En conclusion, la relation entre la dominance et le système
de reproduction est immédiate.
 L’allogamie permettant le développement du fardeau

génétique, la fraction d ’hétérosis fixable peut être
importante pour ce système de reproduction
 A l’inverse, le fardeau génétique étant quasiment inexistant

chez les espèces autogames (les allèles récessifs
défavorables ont été éliminés ou n ’ont pas pu se développer
92
sous l’action de la sélection naturelle),

 Ces dernières sont moins sujettes à la dépression de
consanguinité, ce qui n ’exclut pas l’hétérosis dû à la
superdominance.
 La seule possibilité de fixer la superdominance réside dans

la duplication du génome diploïde: c’est l’allopolyploïdie.
93
 Le blé, avec ses trois génomes élémentaires juxtaposés, est
un représentant typique de ce processus (le non-
appariement à la méiose des génomes répétés confère un
comportement diploïde aux espèces allopolyploïdes ,
contrairement aux espèces autopolyploïdes).
94
95
96
97
98
99
100
 Notion d’héritabilité
101
102
103
104
Partition de la variance
et héritabilité chez
Drosophila melanogaster
105
106
107
108
Partition de la variance du poids des nouveau-nés chez l'Homme
Cause de la variation % du total
Génétique
Additive 15
Non additive 1
Sex 2
Total génotypique 18
Environnement
Génotype maternel 20
Environnement maternel général 18
Environnement maternel immédiat 6
Age de la mère 1
Rang de naissance 7
Cause non identifiée 30109
Total environnement 82
110
111
 Héritabilité et Sélection
112
113
Autrement dit:
µ’ = µ + h² (µs - µ)
µ’ : moyenne de la génération fille

µ : moyenne de la population parentale
µs : moyenne de la sous population sélectionnée
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
 Les notions de parenté (et de consanguinité) sont anciennes et
centrales en génétique des populations et en génétique quantitative.
 Elles permettent :
• de décrire la constitution génétique d'une population
• d’estimer la variation phénotypique d’origine génétique (héritabilité)
 RAPPELS:
Deux individus sont apparentés s'ils possèdent au moins un ancêtre
commun.
127
 Un individu est consanguin si ses deux parents sont
apparentés.
 La parenté concerne des paires d'individus.
 On est apparenté, ou non, à quelqu'un.
 La consanguinité concerne des individus.
 On est consanguin (à un certain degré) ou on ne l’est pas.

128
129
130
131
132
133
134
135
 Calcul du coefficient de parenté
136
137
138
139
 Marqueurs ADN et parenté moléculaire
140
141
142

Cours Génétique Quantitative BCPST MENAPLN 2024

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- Connaître le déterminisme génétique des caractères quantitatifs;

- Décrire les différents types d’action des gènes impliqués dans

- Connaître la relation entre la génétique quantitative et la sélection

II- Description d’un caractère quantitatif

III- Déterminisme génétique des caractères quantitatifs

IV- Décomposition de P=G+E

V- Notion d’héritabilité d’un caractère

VI- Ressemblance entre apparentés

2-Ridley, M 1997 Evolution Biologique, De Boeck

3-Ressources pédagogiques sur le site du laboratoire:

4-Réseau d’enseignement en Génétique (GENET)

5-Falconer, D. S. and T. F. C. Mackay (1996). Introduction to

6-Kearsey, M. J. and H. S. Pooni (1996). The Genetical Analysis of

7-Lynch, M. and B. Walsh (1998). Genetics and Analysis of

8- Verrier E., Brabant P., Gallais A. (2001). Faits et concepts de base

9- Crédits: P. Touzet; C. Dillmann & F. Hospital; E. Verrier, Ph.

1. Variation discontinue, classes 2. Variation continue, phénotypes répartis

2. Effets gène unique discernables 3. Sous contrôle polygénique, effet gène

3. Concerne des croisements 4. Concerne un groupe d’individus

 La génétique quantitative est la génétique des caractères dont

 Partie de la génétique qui étudie la transmission des différences

 A partir de l'estimation des variances imputables aux effets des gènes et

 C’est est une forme de science pratique de la domestication moderne qui

 La génétique quantitative n’est en tout cas pas une « science dure »

 La génétique quantitative est un modèle prédictif (qui marche bien) mais

 Nous allons considérer qu’il n’y a AUCUN EFFET DE

 Les règles de calcul de la génétique quantitative seront simplifiées pour

 En étudiant les lois de la transmission des gènes, nous nous sommes

 Imaginons désormais un caractère quantitatif quelconque, la longueur de

 Ce que propose le modèle de la génétique quantitative c’est de donner

 Dans l’exemple ci-dessous, deux individus différents sont représentés, le

Dans l’exemple ci-contre, deux

Il existe ici 4 versions de gène

 La valeur génétique des individus correspond à la somme de la valeur

 Bien qu’ayant une composition allélique différente, ces deux individus

 Pour continuer à se familiariser avec ce principe de valeur génétique des

 La descendance présentera 4 phénotypes différents :

*25% de plantes avec un épi de 9 cm

 Il y a des allèles qui codent pour des caractères phénotypiques

 Dans notre exemple il y a 4 allèles différents : [1], [2], [4] et [5].

 Quand les allèles se combinent par 2 pour former un génotype complet,

 Cette différence entre la prédiction du modèle additif et la valeur

 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢 𝑑𝑒 𝑑𝑜𝑚𝑖𝑛𝑎𝑛𝑐𝑒 = 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒 − 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟

 Dans notre exemple :

 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢 𝑑𝑒 𝑑𝑜𝑚𝑖𝑛𝑎𝑛𝑐𝑒 = 6−(4+1) = 6−5= +1

 En fait le résidu de dominance est un peu comme une baguette magique

 il n’y a aucune logique, aucune règle !

 Rappelons que le modèle de la génétique quantitative ne sert pas à

 Heureusement pour le modèle de la génétique quantitative, le résidu de

 Dans la grande majorité des cas, il représente entre -10% et +10% de la

 Autrement dit, le modèle de la génétique quantitative permet des

 Dans le monde des généticiens ou des sélectionneurs, ce résidu de

 Ainsi, on note la valeur génétique d’un individu de la manière suivante :

 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒=𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑎𝑑𝑑𝑖𝑡𝑖𝑣𝑒+ 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢

 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒=𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑎𝑑𝑑𝑖𝑡𝑖𝑣𝑒+ 𝑅é𝑠𝑖𝑑𝑢

Schématisation de la construction de la valeur génétique 25

(pour un gène codant)

 Comme le résidu de dominance est faible par rapport à la valeur additive,

 𝑉𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑔é𝑛é𝑡𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑟é𝑒𝑙𝑙𝑒=𝑆𝑜𝑚𝑚𝑒 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝑣𝑎𝑙𝑒𝑢𝑟 𝑑𝑒𝑠 𝑎𝑙𝑙è𝑙𝑒𝑠

 Comme dans l’exemple de la construction du phénotype de la couleur de

 Ces allèles se combinent et se recombinent de génération en génération

 La notion de structure allélique a été déjà utilisée pour décrire les

 Le lien entre la structure allélique (fréquence des allèles) et la structure