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Elevage et Génétique....

Notions et applications pratiques ..


Génétique :
étude des transformations, de génération en génération, du
patrimoine de gènes possédés par une population.

Héréditaire :
Qui se transmet selon les lois génétiques de l'hérédité.Transmission
des caractères génétiques des parents à leurs descendants

Congénital :
Qui est présent à la naissance

Phénotype :
Expression visible des gènes

Génotype :
Ensemble des caractères génétiques d'un être vivant, qu'ils se
traduisent ou non dans son phénotype
Un organisme vivant tel que le chien est constitué de
1012 cellules individuelles
.
Toutes proviennent de la même cellule primordiale résultant de la
fusion d'un l'ovocyte avec un spermatozoïde
Cette première cellule se divisera , deviendra un embryon
et finalement un organisme complet
Lors du développement de l'embryon les cellules se divisent et se
multiplient mais elles conservent toutes plus ou moins la même
structure cellulaire et les mêmes informations génétiques, même
si celles-ci ne sont pas toutes exploitées.
Donc toutes les cellules n'expriment pas les mêmes informations.

Les cellules souches sont de quatre types : totipotentes


pluripotentes , multipotentes et unipotentes.....,
Chaque cellule est un système complexe dont le fonctionnement
nécessite l'intervention d'un nombre important d'éléments
chimiques. Ce sont pour la plupart des protéines (enzymes) qui
participent à des réactions biochimiques,
Une Protéine est un assemblage de molécules d'acides aminés
La cellule dispose d'un nombre limité d'acides aminés.
Tout comme des notes de musique, c'est l'assemblage et la succession de
ces acides aminés dans la molécule qui caractérise chaque protéine
Exemple : l'Albumine

Composée de 580 acides aminés assemblés selon


une succession bien précise.
Ces protéines sont synthétisées par les cellules .

Toutes les cellules disposent des informations identiques et complètes


pour fabriquer n'importe quelle protéine puisqu'elles proviennent
toutes de la même cellule primordiale.

Cependant toutes les cellules ne produisent pas les mêmes protéines.


La production de ces protéines nécessite :

Un catalogue comprenant toutes les informations nécessaires


concernant la composition de chaque protéine .
(comme un CD ou un disque dur)

Un système qui permet la localisation, la lecture et la traduction de


ces informations (comme un lecteur de CD ou une tête de lecture de
disque dur)

Un système qui permet l'exploitation et l'utilisation de ces


informations et donc la fabrication de chaque protéine .
(comme une imprimante)
Le noyau cellulaire contient le support de cette information.
Le matériel génétique est une vaste bibliothèque d'informations qui
permet le fonctionnement de la cellule
Le matériel génétique est formé d'acide désoxyribonucléique : l'ADN.

La molécule d'ADN est formé de deux filaments hélicoidaux reliés


entre eux par des liaisons chimiques.
L'ADN présent dans le noyau peut être condensé ou decondensé.
L'ADN est fragmenté en plusieurs morceaux. Ce sont les
chromosomes. Le chien en possède 78 dont la moitié proviennent du
père et l'autre moitié proviennent de la mère.
L'accès aux informations utiles pour chaque cellule est régulé par des
petites molécules qui se fixent sur l'ADN et qui vérouillent ou dévérouillent
Cet accès . C'est un phénomène épigénétique.
Code génétique = succession de bases .

Trois bases codent pour un acide aminé.

L'assemblage des acides aminés forment une protéine.

Un gène est l'ensemble des bases qui codent pour une protéine
spécifique
Un gène est donc une portion d'ADN, située sur un des chromosomes ,
qui comporte le code permettant de synthétiser une protéine.

Environ 20.000 à 25.000 gènes ont été séquencés. Ce qui ne représente


qu'un faible pourcentage de la totalité du génome (+/- 10% à 15%)
Il existe environs un million de protéines différentes.
Un gène peut coder une dizaine de protéines différentes
Chaque protéine exerce un rôle différent.

Si le génome, peut être considéré comme un livre, c’est l’épigénome


qui dicte quelles pages vont être lues. Ce qui explique qu'une cellule
du foie et une cellule de peau se soient développées differemment
alors qu'elles possèdent le même génome.
Chaque cellule contient, dans son noyau, une copie d'origine maternelle et une
copie d'origine paternelle de chaque gène.
Les deux gènes homologues sont soit identiques (l'invidu sera qualifié de
homozygote pour ce gène) soit différents (l'individu sera qualifié de hétérozygote
pour ce gène).
Considérant qu'une seule copie du gène est activé celui-ci sera préférentiellement
le gène normal, non muté, appelé Gène Dominant ou Sauvage , si l'autre gène
est muté, il sera qualifié de Gène Récessif .
Puisqu'un gène est formé d'une succession de bases, la moindre
modification, substitution ou interversion d'une de ces bases entraîne
une modification du code, donc une modification de l'expression de
ce gène et donc finalement une modification de la fonction de ce
gène qui entrainera la fabrication d'une protéine différente de celle
que ce gène est supposé produire.
Un gène existe donc potentiellement sous différentes formes . On les
qualifie d'allèles .
Un gène a différentes allèles.
Toute altération de cette chaîne de production modifie la structure de
la protéine, ce qui entraîne soit un blocage de la cascade
biochimique dans laquelle la protéine est impliquée, soit une
modification de cette cascade .

Ceci provoque donc finalement des pathologies ou des modifications


diverses.....
De légères variations du génotype peuvent engendrer des variations
importantes du phénotype
Le principe de Hardy-Weinberg
Dans une population ou la reproduction est aléatoire , la grande
majorité des gènes sont présents sous forme hétérozygote . Par contre,
une reproduction contrôlée, maîtrisée, mono-raciale, basée
essentiellement sur le phénotype entraîne une homozygotie de la
plupart des gènes. Ceci peut être utile ou délétère en fonction des
gènes sélectionnés.
Applications pratiques

 Typage ADN
 Tests de filiation
 Recherche concernant des pathologies héréditaires
 Guidance de l'élevage
 Thérapies géniques
 Reprogrammation et clonage
 Biotechnologies du génome
 Applications en médecine humaine
L'identification par l'analyse du génome.

L'empreinte génétique de chaque individu permet de réaliser les tests


de filiation, sa carte d'identité génétique, ses prédispositions
pathologiques

Un bref retour en arrière......

Il y a environs ... 4 milliard d'années


LUCA : Last Universal Common Ancestor
Le dernier ancètre universel commun
Typage ADN ou profil ADN

 Le génome canin comporte environ 20 000 gènes codants pour des


protéines . Cela représente seulement 5 % du génome.
 Le reste du génome code pour des substances qui régulent le
fonctionnement des gènes (Micro-ARN) ou n'est pas codant.
(erreurs de copies, mutations etc..)
 Pour réaliser un profil ADN, les laboratoires choisissent des gènes
situés sur les 39 paires de chromosomes incluant les chromosomes
sexués X ou Y. Les endroits comparés peuvent être des
microsatellites, des STRs (short tandem repeats), ou des VNTRs
(variable number tandem repeats). Ce sont des endroits où certaines
séquences d’ADN se répètent. On compte alors le nombre de
chaque répétition sur cette région.
Typage ADN ou profil ADN

Pour un typage, le laboratoire compare 21 endroits particuliers sur les


différents chromosomes. On appelle ces parties d’ADN des région
d’ADN ou locus (loci ).
Les généticiens ont donné un nom à chaque région des chromosomes.
Le nom commence par une lettre suivie du numéro du chromosome sur
lequel le gène est situé. Puis à nouveau une lettre et une série de
chiffres.

Par exemple, certains vont avoir 11 copies de la séquence ATGC sur un


locus particulier D16S539. Tandis que d’autres auront 9, 10, 12, 13, 14
copies.
L'analyse du génome de chaque
individu permet non seulement de
réaliser les tests de filiation, sa carte
d'identité génétique mais permet
également de détecter la présence
d'anomalies génétiques et dans une
certaine mesure ses prédispositions à
développer des pathologiques induites
par ces anomalies

Actuellement environs 300 maladies


d'origine génétique ont été décrites
chez le chien
Génome canin : Applications en médecine humaine

Dogs really are man’s best


friend —Canine genomics has
applications in veterinary and
human medicine!
Mike P. Starkey, Timothy J. Scase, Cathryn S. Mellersh and Sue Murphy

L'espèce humaine et canine ont 85% de leur génome en commun.


Des petites variations dans ce génome provoquent parfois de grandes
différences morphologiques = génotype et phénotype
Génome canin : application en médecine humaine

Par rapport à d'autres espèces animales, le chien développe le plus de


maladies héréditaires d'origine génétique, hormis l'espèce humaine
Parmi les maladies héréditaires connues chez le chien, au moins la
moitié de celles-ci ont un équivalent humain.
Au moins 30 de ces maladies héréditaires sont dues à une mutation sur
un seul gène.
La majorité de ces mutations se retrouvent sur le même gène humain,
causant la même pathologie chez celui-ci.
Peut-on par la reproduction et la sélection détecter
des individus les plus aptes à réaliser certaines
activités, et peut-on garantir que ces
caractéristiques se maintiennent dans leurs
descendance ?

Le déterminisme génétique
Génétique et sélection

Génétique Mendéléenne : sélection selon le phénotype

Génétique quantitative : sélection selon des caractères


mesurables

Biotechnologies : sélection par clonage


d'individus ayant des
aptitudes particulières
Déterminisme génétique des aptitudes au travail chez le chien
et perspectives pour la sélection de l'espèce canine ,
par Jean-François COURREAU

Bull. Acad. Vét. de France, 1998, 70, 217-224

« des aptitudes dont l'expérience ancestrale des utilisateurs a permis de


classer les chiens en deux catégories: ceux qui possèdent l'expression
recherchée et ceux qui ne la possèdent pas. A titre d'exemples, on peut
citer: donner de la voix ou non lors de la quête, chasser la tête en l'air ou
au sol, aller à l'eau ou non, intérêt pour ce qui vole ou non, sensibilité
auditive (coup de feu) ou non. »
Déterminisme génétique des aptitudes au travail chez le chien
et perspectives pour la sélection de l'espèce canine ,
par Jean-François COURREAU

Bull. Acad. Vét. de France, 1998, 70, 217-224

Les épreuves de travail n'ont-elles qu'une vocation sportive ou


veulent-elles servir l'amélioration génétique ?

telles qu'elles sont conçues, les épreuves permettent-elles la pleine


expression des qualités qu'on souhaite étudier et sélectionner ?

l'objectivité des jugements et leur répétabilité sont-elles indiscutables ?

les résultats des compétitions sont-ils consignés sans omission et de


façon suffisamment standardisée, collectés sans perte et archivés selon un
mode qui en facilite l'exploitation?
Déterminisme génétique des aptitudes au travail chez le chien
et perspectives pour la sélection de l'espèce canine ,
par Jean-François COURREAU Bull. Acad. Vét. de France, 1998, 70, 217-224

• sur 636 bergers belges malinois, les valeurs d'héritabilité trouvées


pour les qualités exprimées par le chien de défense à travers les épreuves
du concours en ring sont les suivantes :

- suite du maître en laisse 0,03


- suite du maître sans laisse 0,09
- défense du conducteur 0,00
- attente en l'absence du conducteur 0,28
- refus d'appât en l'absence du conducteur 0,00
- attaque 0,54
- score total 0,17

une valeur est faible au-dessous de 0,2 et forte au-dessus de 0,4


Déterminisme génétique des aptitudes au travail chez le chien
et perspectives pour la sélection de l'espèce canine ,
par Jean-François COURREAU
Bull. Acad. Vét. de France, 1998, 70, 217-224
Sur 736 spitz finlandais, l'héritabilité a été estimée pour différentes
qualités de chasse s'exprimant lors d'épreuves sur gibier à plumes
pratiquées en Finlande :

- aptitude à la recherche 0,07


- découverte des oiseaux 0,11
- marquage des oiseaux 0,04
- aboiement 0,02
- tenue des oiseaux 0,18
- suivi des oiseaux 0,10
- score total 0,11

une valeur est faible au-dessous de 0,2 et forte au-dessus de 0,4


Les biotechnologies

Le clonage ?

Est-ce la solution ?
Health and temperaments of cloned working dogs
Min Jung Kim, Hyun Ju Oh, Sun Young Hwang, Tai Young Hur, Byeong Chun Lee
J Vet Sci. 2018 Sep; 19(5): 585–591

Que constate-t-on dans les programmes de sélection concernant les chiens de travail ?
Des programmes de gestion de l'élevage de chiens ont été développés pour maintenir des
aptitudes spécifiques grâce à l'utilisation de méthodes sélection mais seulement environ
la moitié des chiens élevés de manière conventionnelle et entraînés sont finalement
qualifiés pour poursuivre une carrière de chiens de travail.

Exemple : Parmi 200 chiens de race berger allemand admis au sein des forces armées
suédoises, seuls 52 % se sont avérés avoir des tempéraments appropriés pour intégrer le
service.

Guide Dogs for the Blind Inc., Australie, seulement 42,6 % (313/735) des chiots
sélectionnés ont été entraînés avec succès comme chiens de travail.

L'école de chiens-guides Seeing Eye aux États-Unis, 56% des 2 033 chiens ont obtenu
leur diplôme de chiens-guides qualifiés.
Tous ces programmes de sélection représentent une dépense considérable en terme de
temps, d'énergie et de financements.
Dogs cloned from adult somatic cells

Byeong Chun Lee, Min Kyu Kim, Goo Jang, Hyun Ju Oh, Fibrianto
Yuda, Hye Jin Kim, M. Hossein Shamim, Jung Ju Kim, Sung Keun Kang,
Gerald Schatten & Woo Suk Hwang
Nature volume 436, page641 (2005)
Health and temperaments of cloned working dogs
Min Jung Kim, Hyun Ju Oh, Sun Young Hwang, Tai Young Hur, Byeong Chun Lee
J Vet Sci. 2018 Sep; 19(5): 585–591

Les chiens de travail clonés ont des


caractéristiques anatomiques,
physiologiques, neurologiques et de
croissance similaires, ainsi que des modèles
de comportement similaires, à ceux de leurs
donneurs de cellules.

De plus, il s'avère que les chiens clonés


peuvent avoir une durée de vie similaire à
celle des chiens élevés naturellement.
"Ce sont les premiers chiens renifleurs clonés au
monde déployés au travail", a déclaré à l'AFP Park
Jeong-Heon, porte-parole des douanes à l'aéroport
international d'Incheon.

"Ils ont montré de meilleures performances dans la


détection de drogues illégales pendant la formation que
les autres chiens renifleurs nés naturellement que nous
avons."

Trois chiens renifleurs clonés sont actifs à l'aéroport


international d'Incheon, le plus grand aéroport du pays,
et dans trois bureaux de douane dans les villes
d'Incheon, Gimpo et Daegu.

Les autorités douanières ont déclaré avoir créés les


clones en reproduisant un "superbe" chien renifleur
canadien Labrador Retriever, appelé Chaser.
Clonage par transfert nucléaire
La Phylogénétique
FIN

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