L’amélioration génétique appliquée aux espèces animales porte

essentiellement sur des caractères d’intérêt économique qui font

objet d’observations ou de mesures sur les individus de la population
étudiée  génétique quantitative appliquée aux productions
animales.
L’amélioration génétique vise à produire des types d’animaux à
haut rendement (lait, viande, œuf, etc.) répondant aux besoins de
consommation du marché.

RAPPEL DE NOTIONS RELATIVES A LA BIODIVERSITE ET A

L’AMELIORATION GENETIQUE :

Génome = ensemble des gènes qui constituent un individu d’une

race donne.
Génotype = ensemble des gènes intervenant dans l’expression d’un
caractère.
En un locus : ce sont donc les gènes homologues que possède un
individu.
Homozygote = 2 gènes que porte l’individu sont des exemplaires du
même allèle
Hétérozygote = individu portant 2 exemplaires de gènes allèles
différents.
Phénotype = 1. Expression du génotype et du milieu dans lequel
l’observation est faite ainsi que celle des erreurs possibles.de
mesure. 2. Ensemble de toutes les caractéristiques quantifiables
(mesures) ou qualifiables (visible à l’ œil nu) d’un individu.
Codominance = absence de dominance = hérédité intermédiaire
Létalité = gène létal = provoque mort des individus qui le portent
durant la phase (pré ou post)-natale.
 Allèle létal dominant tue aussi bien un homozygote qu’un
hétérozygote. Peut apparaitre par mutation d’un allèle normal.
 Allèle létal récessif tue seulement les homozygotes pour cet allèle.
Locus = site de localisation du gène sur le chromosome.
 2 gènes au même locus sur les chromosomes homologues sont
dits gènes homologues ou gènes allèles.
Espèce = ensemble d’individus présentant des caractéristiques
morphologiques, physiologiques et chromosomiques assez
semblables et qui peuvent se reproduire entre eux.
Race = subdivision de l’espèce = ensemble d’animaux présentant
entre eux un certain nombre de caractères héréditaires communs.
 Par extension, un individu de race pure = individu qui descend de
parents appartenant a la même race.
Population = ensemble d’individus de la même espèce se
reproduisant effectivement entre eux.
Génétique des populations = décrit la dynamique du polymorphisme
des populations dans le temps et l’espace.
Polymorphisme = variation de type mendélien qui existe dans une
population pour un caractère donne.
Gene = 1. Unité d’information héréditaire située a un endroit précis
(locus) du chromosome.
 Dominance et récessivité d’un gène :
Lorsque le phénotype d’un génotype hétérozygote (A1, A2)
n’extériorise que l’effet d’un seul gène allèle (ex A1) on dit que le
gène A1 est dominant et A2 est récessif (son effet est masque)

RAPPEL SUR LES THEORIES GENETIQUES

Génétique = science de l’hérédité
Hérédité = mécanisme de transmission des caractères

COMPARAISON ENTRE GENETIQUE QUALITATIVE & QUANTITATIVE

 Règles basées sur observer des caractères qualitatifs simples
(mendéliens) disent que la descendance F1 de parents
génétiquement différents serait uniforme hétérozygote tandis que
F2 produirait une ségrégation des types parentaux en plus des
hétérozygotes.
 Règles basées sur observation des caractères qualitatifs
mesurables énoncent que 2 races ou souches pures produiraient une
F1 intermédiaire plutôt uniforme et une F2 intermédiaire très
variable.
 Si un caractère est régi par plusieurs gènes allèles, le phénotype
n’est pas facile à relier directement à un génotype précis. Why ?
Car le nombre d’interactions entre allèles augmente. Il peut exister
aussi des interactions entre gènes non-allèles (situes en des loci
différents)  épistasie. [check diapo for ex.]
La sélection des animaux a été le résultat de l’observation de :
-Variation entre individus.
-Ressemblances entre individus.
-Transmissibilité des caractères.
-Possibilité de faire un tri et un choix des jeunes.

Le véritable essor des programmes d’amélioration génétique des

A.D a eu lieu grâce au développement des techniques de
reproduction animale (insémination artificielle, synchronisation,
transfert d’embryons, etc.)

Notions de structure en élevage des A.D

-Structure zootechnique : par rapport aux individus ; comptage
nombre d’effectif par rapport au sexe, l’Age, etc. ex. 5 vaches & 5
vœux.
-Structure génétique : on parle de gènes. On fait appel aux
fréquences. 2 types :
-fréquence allélique= fréquence de gêne  combien de gènes y a-t-
il dans une population ?
-fréquence génotypique  combien de génotypes y a-t-il dans cette
population ?
Ex. fréquence allélique :
AA (10)
Aa (5)
Aa (6)
- - - - - -totalement = 21
Nombre de gènes  2 homologues (A et a) donc 2 fréquences : f(A)
combien de A existe-t-il dans cette population ? et f(a) combien de
(a) existe-t-il dans cette population ?
Ex. fréquence genotypique : (we keep the same ex)
3 génotypes AA, Aa, aa  3 fréquences: f(AA), f(Aa), f(aa)
 La structure génétique c’est à la fois la fréquence génotypique ET
la fréquence allélique.
Objectif : identifier le cheptel pour améliorer la production.

COMPARAISON GENETIQUE & STATISTIQUE ENTRE CARACTERES :

Critères Caractère quantitatif Caractère qualitatif

Observation Dégrée de mesure Nature/Frome

Variation continue Variation discontinue
Type de variation Distribution des Distribution des
phénotypes phénotypes en classes
(mesures) en courbe discrètes
-Faible & -important & discernable
Effet de gène indiscernable -caractère contrôle par 1
-Caractère contrôle petit nombre de gènes
par 1 grand nombre
de gènes (polygones)
Estimation de Dénombrement/comptage
Analyses statistiques paramètres & calcul de proportions
statistiques de la (ratios)
population :
moyenne, écart-type,
cv, corrélation,
régression, etc.

Caractère quantitatif  production (mesure) ; variation continue (ie.

Production laitière illustre par une courbe)
Caractère qualitatif  observation ; variation discontinue (IE. Couleur
de robe illustrée par des classes/catégories)
Effet de milieu :
Pas d’effet de milieu pour caractère qualitatif
Effet de milieu sur les caractères quantitatifs.

Analyse stat :
Expression de phénotype d’1 caractère qualitatif = génotype
Expression d’un phénotype du caractère quantitatif = génotype + effet
de milieu/environnement  P = G + M (2 facteurs)

 2 types d’effets d’environnement :

1- Effet de milieu spécifique  quelques individus seulement
seront affectés par le milieu, ie. Maladie (mammite)
2- Effet de milieu commun  tous les individus seront affectés
par le milieu, ie. Manque de fourrage.

QUESTION: Compléter le schéma ci-dessous par les liens (flèches)

entre les différentes composantes indiquées.
Schéma: Relation entre génotype et phénotype d'un individu pour
un caractère [check diapo]

TYPE D’INFORMATIONS POUR UN PROGRAMME UNE AGAD

L’amélioration génétique des caractères de productions animales
(lait, viandes, œufs, etc.) est conditionnée par le recueil de trois
principaux types d’informations:

1. Des informations sur l’immatriculation des élevages et

l’identification
(N° national) des animaux inscrits dans un schéma de sélection;

2. Des informations de références relatives aux données

généalogiques des animaux obtenues par le contrôle de l’état
civil (déclaration des accouplements et des naissances) et de la
filiation permettant de faire le lien entre les générations ;

3. Des informations techniques relatives aux enregistrements

des performances zootechniques (contrôle de reproduction,
contrôle laitier, contrôle de croissance, engraissement et
morphologie des animaux).
IMPORTANCE DES CARACTERES A DETERMINISME GENETIQUE
SIMPLE

Un caractère à déterminisme génétique simple est influencé par une

paire de gènes ou par un petit nombre de gènes.
1. Les gènes concernés provoquent des variations phénotypiques
importantes entre individus qui sont facilement observables. On
parle alors de "polymorphisme visible".
2. Puisque le nombre de ces gènes est faible, ces variations sont
discontinues et les individus se répartissent en classes. Ces
caractères sont appelés aussi caractères qualitatifs.
4. L'étude du déterminisme de ces caractères est fondée sur les lois
de la génétique formelle.
5. Ils sont peu ou pas influencés par le milieu. Généralement, il est
facile de faire le lien entre un allèle et la forme (caractère) qu'il
détermine.

ETAPES D’AMELIORATION GENETIQUE DES CARACTERES

QUALITATIFS (A DETERMINISME GENETIQUE SIMPLE)
L’amélioration génétique des caractères qualitatifs utilise les
passages suivants :
1. Connaitre le mécanisme héréditaire en cause consistant a
déterminer le nombre de gènes et le mode d’expression de
chaque paire de gènes (dom, rec.)
2. Faire l’inventaire des liaisons possibles entre le caractère
recherche et d’autres caractères (analyse des corrélations entre
caractères)
3. Augmenter la fréquence des génotypes recherches
EXEMPLES DE CARACTÈRES AYANT GARDÉ LEUR IMPORTANCE EN
ÉLEVAGE

A) COLORATION DE LA ROBE DES ANIMAUX D'ÉLEVAGE

Chez les animaux d'élevage, la couleur du pelage (appelé aussi robe)

est déterminée par la nature des pigments sécrétés par les cellules
mélanophores, situées dans l'épiderme.
Il existe différents types de robe (pelage ou phénotype) :

-L'aspect uniforme de la robe (= une seule couleur) ;

-L’aspect tacheté de la robe (ex: noir et blanc souvent appelé "pie
noire »)
- la robe peut être d’une couleur diluée (moins foncée) ;
- la robe peut présenter des bandes colorées ou rayures ;

B) COLORATION DE LA LAINE ET DU POIL (OVINS, CAPRINS)

Les caractères de coloration peuvent représenter un intérêt
économique important.
Cela concerne les animaux producteurs de laine ou de poils ayant
une forte valeur marchande.

Ovins
Un exemple intéressant concerne l'obtention, pour des raisons
technologiques évidentes, d'une toison uniformément blanche chez
les ovins.

Caprin Angora
Obtention du poil Mohair donnant une étoffe légère recherchée;

Lapin Angora:
Obtention d'un poil soyeux et long destiné à l'industrie des textiles.
 C) CARACTÈRES SIMPLES ENCORE RECHERCHÉS CHEZ LES
VOLAILLES

CAS 1 : CARACTÈRE LIÉ AU SEXE: LA COLORATION DU PLUMAGE

-Le gène de coloration du plumage est un gène lié au sexe qui
permet de faire un tri facile des poussins mâles et femelles dès leur
éclosion ;

-La coloration du plumage a été recherchée pour des raisons

économiques en production avicole = économie de main d'œuvre
dans le travail de tri des poussins en vue de les orienter vers la
production (mâles pour la viande et femelles pour les œufs).

-L'utilisation d'un gène de coloration du plumage lié au sexe a permis

donc de rendre une souche descendante « autosexable ».

CAS 2: LE FORMAT NAIN CHEZ LA POULE DU À UN GÈNE RÉCESSIF LIÉ

AU SEXE

-Les chercheurs généticiens ont mis en évidence l'existence de gènes,

récessifs qui sont responsables de formes de nanisme.
-Il s’agit souvent d’anomalie défavorable du point de vue
économique. Des actions sont généralement menées pour éliminer
le gène responsable

D) AUTRES CARACTÈRES SIMPLES OBSERVES DANS LES ELEVAGES

CAS 1: GÈNES DE L'HYPERTROPHIE MUSCULAIRE CHEZ LES BOVINS

Chez les bovins charolais, des animaux présentent une hypertrophie
musculaire du dessus et de l'arrière train. C’est une anomalie due à
un gène déterminisme simple: La croissance de ces animaux est lente
et les femelles sont moins fertiles et moins bonnes laitières.
CAS 2: GÈNES RESPONSABLES D'ANOMALIES CATASTROPHIQUES.
C'est le cas du Syndrome d'Arthrogrypose et de Palatoschisis (SAP)
ou caractère "Palais fondu" observé chez des veaux de race
Charolaise. Les veaux naissent avec une fissure du palais de la langue
qui est souvent accompagnée d’une ankylose (genoux et jarrets). Le
veau atteint meurt à défaut de tétées.

CAS 3: GÈNE LIÉ AU CORNAGE CHEZ LES CAPRINS ET RESPONSABLE

D'ANOMALIES DE REPRODUCTION.

Le cornage chez les caprins est régi par un couple de gènes (P, p). Le
gène récessif (p) influence la présence de cornage et le gène
dominant (P) influence l’absence de cornage. (P= Polled = motte =
absence biologique de cornes).

Remarque:
Il faut disposer au moins d’un parent caprincornu pour éviter une
descendance avec de nombreuses anomalies

DESCRIPTION GENETIQUE D’UNE POPULATION ANIMALE

Nécessite à la fois la détermination des fréquences alléliques &

génotypiques
Fréquence génotypique (fréquence des génotypes)
Se définit par le nombre d’individu de chaque génotype rapporte au
nombre totale d’individus des génotypes de la population pour le
caractère considère.
Fréquence allélique (fréquence des gènes)
Se définit par le nombre de gènes de chaque type rapporte au
nombre totale de gènes ou d’allèles (stock de gènes) de la population
pour le caractère considère.
exemple
AA= 30 (N1) ;
Aa= 15 (N2)
aa= 5 (N3)
----------------totaux = 50 (T)

f(AA) = 30/50
f(A) = (2N1 + N2)/2N
2N : 2types de gènes ( A & a)
We have 2 (A) in N1  2N1
And 1 (A) in N2  N2
Application numérique:
F(A)=(2x30 + 15)/2 = (60+15)/2
F(a) = (2x5 +15)/2 = (10 + 15)/2

Note: the results in this example are not representative of the

theoric results we’re supposed to get (check other ie for correct
results)

f(AA) = N1/N (p)

f(Aa) = N2/N
f(aa) = N3/N
Q+P+R=1
N1 + N2 + N3 = N

p+q=1

MODE D’ESTIMATION ALLELIQUE

1- Utilisant les effectifs génotypiques (previous exemple)
p = (2N1 + N2)
q = (2N3 + N2) / 2N avec p + q = 1
2- Méthode utilisant les fréquences génotypiques
N1 = 0,6
N2 = 0,2
N3 = 0,1
(not nombres d’individu but frequencies génotypiques)
N1 = p X p  p = 0,6
N3 = q x q  q = 0,1
Application :
ie : cas d’anémie causée par le gène S responsable des hématies
falciformes (S = sickled) le gène A = normal. Qst : calculer les
fréquences des gènes.
Génotypes Fréquences Réponse
Hb^A Hb^A 0,659 p(A) = 0,814
Hb^A Hb^S 0,310 q(S) = 0,186
Hb^S Hb^S 0,031
T=1 p+q=1

ie2: répartition de 500 individus selon les groupes sanguins dans 1

population humaine. Qst : calculer les fréquences des gènes.

Groupe M MN N Totaux
Génotype MM MN NN
Nombre 119 242 139 500

Réponse : p(M) = (2N1 + N2)/2 ; N = 0,48

q(N) = (2N2 + N2)/2 ; N = 0,52

p+q=1

[check diapo for more details on this part]