MB7 : Bactriologie

B3 Gntique bactrienne

GNTIQUE BACTRIENNE

1. Dfinition de la gntique
Science de la variation et de l'hrdit, ne de l'tude chez les organismes dous de reproduction sexue, du croisement ou hybridation entre races ou varits de la mme espce.

taux mutation est de 10-5 pour l'isoniazide (INH) et de 10-7 pour la rifampicine (RIF), la probabilit d'isoler un double mutant rsistant INH-RIF est de 10-12.

2. Les variations gnotypiques bactriennes

2.1. Dfinition de la variation gnotypique Il s'agit d'une modification spontane ou induite, discontinue, stable, rare, spcifique et ie une modification du gnome bactrien (ADN). Ceci dfinit, la mutation. 2.2. Caractres Spontane : l'antibiotique, par exemple, slectionne les rares formes variantes pr-existantes dans une population bactrienne comme dans une tuberculose pulmonaire. Induite : le caractre induit de la mutation bactrienne est bien connu lors de l'utilisation de rayonnements de type UV ou de substances chimiques gnotoxiques. Discontinue ou brusque : elle apparait selon la loi du tout ou rien. Stable : le caractre acquis est alors transmissible la descendance, donc hrditaire. Rare : elle est mesurable par le taux de mutation qui est la probabilit pour une bactrie de muter pendant une unit de temps dfinie (souvent le temps de gnration). Il est caractristique d'un caractre donn, de l'ordre de 10-5 10-10, le taux moyen tant de l'ordre de 10-6. Il convient de savoir qu'il y a une corrlation avec la frquence de mutants ou proportion de mutants qui existe un moment donn dans une culture. Celle-ci est de dtermination aise. Spcificit - Indpendance : la probabilit pour une bactrie de subir simultanment deux mutations distinctes est le produit des probabilits individuelles de ces mutations. Cette notion est d'importance, afin d'viter la slection d'un mutant rsistant, dans l'antibiothrapie, antituberculeuse par exemple. L'instauration d'une monothrapie est suivie de la slection d'une souche rsistante. En effet, une caverne volutive de 2 cm de diamtre peut contenir une population bacillaire de l'ordre de 108 bacilles tuberculeux. Si le Janvier 2007 C. Carrire

Une telle mergence sera vite par une antibiothrapie associant, au-moins deux antituberculeux. Modification de la structure du gne : unit de transmission hrditaire, entrainant quelquefois une modification de la structure primaire de la chaine polypeptidique correspondante. La mutation est une modification de l'ADN, donc de la squence dsoxyribonuclotidique. Divers types de mutation sont connues telles la modification d'une paire de nuclotides ou plus. Leurs effets sont variables: silencieux ou lthal. 2.3. Conclusions Il s'agit d'un mcanisme mineur d'volution bactrienne, car la probabilit d'obtention de mutants spontans est faible souvent sans avantage slectif pour la forme variante, l'exception de la rsistance aux antibiotiques.

3. Transferts de matriel gntique

3.1. Introduction Il en existe trois : la transformation, la conjugaison et la transduction Ces transferts d'acide dsoxyribonuclique (ADN) bactrien doivent tre suivis de recombinaison gntique dite lgitime (s'il provient d'une mme espce ou d'une espce voisine). Dans d'autres circonstances, l'ADN peut ne pas se recombiner (cf plasmide). Ces transferts sont unidirectionnels, le plus souvent partiels (1 2 % du gnome transfr) et d'efficacit faible (frquence de recombinaison de l'ordre de 10-6).

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B3 Gntique bactrienne Cette mergence de la rsistance, la pnicilline G par exemple, a t lente depuis l'introduction des antibiotiques. En fait ce phnonme n'a t possible qu'aprs slection de mutants rsistants (streptocoques buccaux) lors d'antibiothrapie puis de transfert du ou des gnes de cette rsistance par transformation naturelle l'espce pathogne potentielle en situation de portage.

3.2. La transformation bactrienne 3.2.1. Dfinition La transformation "naturelle" ou physiologique est le premier modle connu de transfert de matriel gntique lui-mme (ADN), qui est fix et absorb par des bactries rceptrices, dites en tat de comptence. Ce modle a permis de dmontrer que l'ADN tait le support chimique de l'hrdit en 1944. 3.2.2. Caractristiques D'une part, il doit y avoir de l'ADN libr d'une bactrie (exognote). D'autre part celui-ci doit tre fix sur une bactrie rceptrice en phase de comptence

3.3. Conjugaison ou sexualit bactrienne 3.3.1. Dfinition Processus sexuel strict qui ncessite un contact pralable et un appariemment entre bactries de sexe diffrent avec la formation d'un pont cytoplasmique permettant les changes bactriens dont celui du chromosome. Le facteur de sexualit ou de fertilit (F) permet la synthse de pilis sexuels chez la bactrie donatrice ou mle et donne la polarit au chomosome. Le transfert d'ADN chromosomique est sens unique, orient, progressif et quelquefois total (2 h). 3.3.2. Caractristiques Spcificit - Frquence : Le transfert d'ADN chromosomique suivi de recombinaison est spcifique (intra espces), mais limit, en particulier aux espces Gram ngatif telles E. coli, Salmonella, Pseudomonas aeruginosa et aussi chez les Streptococcus. Diffrenciation sexuelle : Le transfert d'ADN qui est sens unique ou orient (croisements fertiles (F) que dans un sens), met en vidence la diffrenciation sexuelle entre le donneur et le receveur. Elle porte sur la prsence du facteur sexuel, appel encore facteur de fertilit (F), donnant la polarit la bactrie donatrice ou mle (F+). Il s'agit du premier plasmide connu. Son potentiel d'information gntique (de l'ordre de 2 % de celui du chromosome bactrien) code pour la biosynthse d'appendices ou pili sexuels, pour son insertion possible au chromosome bac-

Cette absorption d'ADN polymris est suivie d'une recombinaison gntique lgitime avec acquisition de nouveaux caractres gntiques stables, donc transmissibles la descendance dnomms recombinants ou transformants.

Ce transfert naturel d'ADN bactrien est limit quelques espces telles Streptococcus dont S. pneumoniae, Neisseria, Haemophilus..... Il est partiel : une partie de l'exognote (1-2% du gnome) pntre et se recombine (si homologie suffisante). 3.2.3. Applications scientifiques En bactriologie mdicale, son intrt est li l'mergence d'espces rsistantes aux antibiotiques comme le pneumocoque ou rcemment, le mningocoque.

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MB7 : Bactriologie trien, pour la mobilisation ou le transfert partiel ou non de ce dernier dans la bactrie rceptrice (F-). La conjugaison est ainsi dnomme sexualit des bactries. Contact ou appariement : Cette phase individualise ce mode de transfert. En effet, le transfert de gnes du donneur au receveur n'est possible qu'aprs la formation de paires ou couples de bactries donatrice-rceptrice. Le rle des pilis sexuels, flexibles ou non (2 3 par donneur) est essentiel, bien qu'incompltement lucid. Leurs extrmits spcifiques, repres par des bactriophages, reconnaissent des zones de contact la surface cellulaire des bactries rceptrices, s'y fixent et se rtractent. Cette rtraction des pilis sexuels a pour effet de rapprocher les deux bactries de sexe diffrent permettant un contact cellulaire troit (pont cytoplasmique de 100 300 m). Transfert de l'ADN chromosomique : La mobilisation du chromosome de la bactrie donatrice peut alors dbuter travers le pont cytoplasmique sous la forme monocatnaire (un des deux brins transmis). Ce transfert est sens unique, orient et progressif, quelquefois total, durant alors une centaine de minutes 37 C. Son interruption artificielle par agitation mcanique a permis l'analyse cintique.

B3 Gntique bactrienne 3.4.2. Caractristiques INCIDENCE : Ce phnomne est en relation avec l'existence de nombreuses souches lysognes. Il est dcrit aussi bien chez les espces bactriennes Gram positif (Staphylocoques, Bacillus) qu' Gram ngatif (Entrobactries, Pseudomonas). TYPES : Trois variantes conditionnent les autres caractres tels spcificit du ou des caractres transduits, frquence de transduction, recombinaison gntique ou non.

Ce transfert partiel de gnes bactriens peut s'accompagner d'une recombinaison lgitime (transduction gnralise) ou non (tr. abortive et quelquefois tr. spcialise). En bactriologie mdicale, on voquera le terme de conversion lysognique qui pourrait tre une autre modalit de transduction ? Plusieurs exemples ont un intrt mdical. 3.5. Conversion lysognique 3.5.1. Dfinition C'est l'acquisition par une bactrie d'un caractre somatique particulier dtermin par le gnome d'un prophage spcifique. Son expression dans toutes les bactries est li l'tat lysogne. Il disparait avec la perte de celui-ci. 3.5.2. Exemples : - toxine du bacille diphtrique - toxine rythrogne par le streptocoque A - certaines cytotoxines (vrotoxines) chez E.coli ECEP

Caractres transfrs - frquence : N'importe quel gne bactrien peut tre transfr comme l'aptitude biosynthtiser un acide amin (thronine, leucine, srine). La frquence de recombinaison est faible, de l'ordre de 10-6. Ce mode de transfert d'information gntique est rencontr lors d'change d'ADN non chromosomique comme l'ADN plasmidique (plasmides conjugatifs). Il s'agit du principal facteur d'volution des bactries, en particulier pour l'acquisition de la rsistance aux antibiotiques. 3.4. Transduction 3.4.1. Dfinition Il s'agit d'un transfert d'ADN bactrien partiel, par l'intermdiaire de bactriophages dont le rle est passif (vecteur). Il est dans ce cas, virulent donc se multiplier dans la bactrie. Lors de la phase d'encapsidation, il incorpore de l'ADN bactrien fragment.

4. Les plasmides
4.1. Dfinition ADN double brin, circulaire, cytoplasmique doues de rplication autonome et de taille variable. Ils sont mdiateurs de nombreuses proprits permettant une meilleure adaptation des bactries, bien que non indispensables au mtabolisme normal de la cellule-hte (endosymbiotes). Leur transmission naturelle d'une cellule l'autre s'effectue habituellement par conjugaison, quoique les autres modes de transfert soient possibles.

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MB7 : Bactriologie 4.2. Principales caractristiques

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On notera l'addition de ces proprits par une mme souche : Autres proprits : Ils sont dous de rplication autonome, assurant sa survie ou son existence. Leur transmission d'une cellule l'autre s'effectue habituellement par conjugaison (codent pour des pilis sexuels), ou encore transduction ou transformation, mais souvent sans spcificit d'hte, d'o une diffusion entre espces bactriennes diffrentes.

4.3. Conclusion lments de l'hrdit extrachromosomique, ils donnent aux nombreuses espces qui les hbergent de nouveaux caractres. Il s'agit du principal processus d'volution rapide des bactries .

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