21/10/2022

Chapitre 1 :
Génétique
bactérienne

Définition

La génétique (du grec genno = donner naissance) est la

science qui étudie l’hérédité et les gènes.

La génétique formelle ou mendélienne, s'intéresse à la

transmission, apparition ou disparition des caractères
héréditaires, de manière permanente entre des géniteurs et
leur descendance.

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Apports de la génétique
bactérienne

Bien que la génétique moderne ait commencée par

étudier les mouches à fruits, le maïs… ; la nature de
l’information génétique, la structure du gène, le code
génétique, les mutations ont été élucidés par des
expériences sur les BACTÉRIES.

Apports de la génétique
bactérienne

Pour étudier les évolutions génétiques, on s’intéresse au phénotype (les

aspects que vont prendre les bactéries).

Les bactéries présentent cependant des inconvénients : leur petite taille,

les caractères morphologiques discrets (aspect de la colonie),
auxotrophie / prototrophie (la capacité ou non de certaines bactéries à
synthétiser certains éléments qui ne sont pas présents dans le milieu),
résistance aux antibiotiques.

Ce sont des caractères pas toujours faciles à mettre en évidence.

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Apports de la génétique
bactérienne

Le gros avantage avec les bactéries c’est leur temps de génération.

On est capable de générer une descendance très rapidement :

Dans les conditions optimales de croissance, E. coli peut se diviser

toutes les 20 minutes, ce qui permet d’étudier plusieurs générations et
très rapidement et de voir l’acquisition de caractères dans des temps
relativement limités.

Apports de la génétique
bactérienne

Le grand apport de la génétique

bactérienne a été les travaux qui ont
permis à Watson et Crick (1953) de
déterminer la structure de l’ADN

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Les variations phénotypiques

et génotypiques

L’ADN bactérien peut être l’objet de variations qui se traduisent par

l’apparition des différences héréditaires dans les structures et/ou les
fonctions permanentes des bactéries.

Pourquoi deux bactéries de la même espèce n’ont pas le même matériel

génétique ? (polymorphisme)

Les variations phénotypiques

et génotypiques

Adaptation induite, réversible, instable, non fixée

héréditairement et affectant l’ensemble d’une
population.
Les cellules subissent un changement physiologique en
réponse directe à une modification du milieu, les
rendant mieux aptes à survivre : les variations de ce type
affectent le comportement des bactéries.

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Les variations phénotypiques

et génotypiques

- Également dites ‘variations génétiques’

- Affectent le génome bactérien dans sa séquence

nucléotidique.

Les variations phénotypiques

et génotypiques

- Résultent des :
• Mutations
• Transferts génétiques (transfert de matériel génétique
d’une bactérie à une autre) : Recombinaisons
• Éléments mobiles (les transposons et les intégrons)

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

• Une mutation est une modification de la séquence normale

d’ADN (ou bien d'ARN pour un virus à ARN).

• Elle peut engendrer des modifications phénotypiques.

• Il peut s’agir du changement du nombre, de l’ordre ou du type

de bases.

• Transmissible à la descendance.

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
ORIGINE :
• Une erreur survenue dans la reproduction conforme au cours de la
réplication de l'ADN
• Une instabilité des bases nucléiques (tautomères) ou des liaisons N-
glycosidiques
• Des lésions diverses provoquées par des agents chimiques ou physiques

Mutation naturelle : survient dans des conditions physiologiques

normales (mutation spontanée)
Mutation induite : survient sous l’influence de facteurs externes
(interaction provoquée entre l’ADN et un agent extérieur ou mutagène)

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

CARACTÉRISTIQUES :
Stables Très rares

Spécifiques Spontanées

Discontinues
(brusques)

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Rareté

Le taux de mutation est entre 10-6 et 10-8

Taux de mutation = nombre de bactéries mutées /

nombre total de bactéries dans une colonie

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Spontanéité
• La mutation survient d’une façon sporadique dans une génération.
• Pour révéler la présence d’un mutant, il est nécessaire d’utiliser un
moyen sélectif (milieu de culture avec un antibiotique ou un milieu
minimum additionné d’un seul acide aminé) :
L’expérience des LEDERBERGS (le test des répliques au tampon de
velours) : sans contact avec l’agent sélecteur

Incubation
.

Milieu avec
streptomycine

La souche E. coli utilisée est

Milieu standard sensible à la streptomycine

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.. .

Incubation

Ensemencement
Incubation
Milieu avec
Milieu standard Milieu standard streptomycine

» Une culture en bouillon d’une bactérie sensible

à la streptomycine; 3. 109 germes sont étalés à
la surface d’une boite contenant un MC,

» Après incubation et apparition d’une culture en

nappe, on fait une réplique de celle-ci sur un
milieu gélosé contenant la streptomycine.
Quelques colonies Str résistantes apparaissent,

» Elles proviennent nécessairement de cellules

préexistantes sur la boite initiale,

» On repère l’endroit correspondant à une de ces

colonies sur le milieu d’origine,

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» On le prélève et on l’ensemence sur un

autre tube de bouillon,

» Après culture, on étale à nouveau sur un

milieu solide sans Str une aliquote plus
faible que précédemment (l’inoculum
contient une grande proportion de
résistants),

» On répète la même opération plusieurs

fois,

» Le nombre de mutants augmente sur les

milieux dépourvus d’antibiotique pour
donner finalement une culture pure de
germes résistants.

» Les milieux avec Str ont servi

uniquement au repérage des
mutants.

» Etant donné que la population

obtenue n’a jamais été au contact
de l’antibiotique, ceci montre que la
mutation se produit spontanément
en l’absence de l’agent sélectif.

La bactérie mutante préexiste au sein de la

population avant même tout contact avec
l’agent sélectif

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Discontinuité
La mutation ne se fait pas à la suite d’une longue période
d’adaptation progressive, mais habituellement en une seule étape :

Loi du tout ou rien : Soit elle est là soit elle n’est pas là.

« C’est un phénomène ponctuel et non continu »

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Stabilité
» L’expérience des LEDERBERGS : Le mutant résistant à la
Str peut être cultivé de multiples fois sur un milieu sans
Str en conservant son nouveau caractère: on dit que la
mutation est un phénomène héréditaire et stable.

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Stabilité
» La mutation est transmissible à la descendance :
héréditaire (au cas où la mutation touche le chromosome)
» La mutation pourrait être perdue si elle touche le plasmide
(non transmise).
» Le retour au caractère d’origine est possible par mutation
reverse.

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Spécificité

» Chaque mutation est indépendante de l’autre.

» La mutation n’affecte qu’un seul caractère.
» La mutation d’un caractère donné ne modifie
pas la probabilité de mutation d’un autre
caractère.

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
On distingue plusieurs types de mutations :

Macro-insertion : Délétion : Micro-insertion :

insertion d’une suppression insertion d’un
séquence d’une séquence nucléotide

Mutation
Micro-délétion :
ponctuelle :
suppression d’un
remplacement
nucléotide
d’un nucléotide

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

TRANSITION : une purine est

remplacée par une purine / une
Mutation
ponctuelle : pyrimidine est remplacée par une
remplacement pyrimidine
d’un nucléotide
TRANSVERSION : une purine est
remplacée par une pyrimidine (ou
l’inverse)

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Mutation
ponctuelle :
remplacement
d’un nucléotide

» Mutation synonyme (silencieuse) :

substitution d’un codon par un autre codon
qui code par le même acide aminé (ce qui est
le plus souvent pour les modifications
affectant la troisième base du triplet) à cause
Mutation de la dégénérescence du code génétique.
ponctuelle :
remplacement » Mutation non-sens : mutation d’un codon
d’un nucléotide spécifiant un acide aminé en codon stop.

» Mutation faux-sens : mutation d’un codon

spécifiant un acide aminé en un codon
spécifiant un autre acide aminé.

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Micro-insertion : L’une ou l’autre des situations entraine un

insertion d’un décalage dans la lecture et la traduction des
nucléotide
codons en acides aminés : déphasage

Micro-délétion : Un nouveau cadre de lecture

suppression d’un
nucléotide

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Micro-insertion :
insertion d’un
nucléotide

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Micro-délétion :
suppression d’un
nucléotide

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations

Les grandes mutations (les

Macro-insertion :
insertion d’une mutations larges)
séquence
Ces mutations sont plus
fréquentes dans certaines
Délétion : régions d’ADN que dans
suppression
d’une séquence d’autres (ce sont ‘les points
chauds’)

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

Un mutagène est un agent naturel ou résultant de

l’activité humaine, physique ou chimique qui peut
altérer la structure de l’ADN. Il augmente ainsi le nombre
de mutations génétiques au-dessus du taux naturel : La
fréquence d’apparition des mutations se voit augmenter
à 10-3 sous l’action des agents mutagènes (mutations
spontanées de 10-6 à 10-8).

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

Les radiations ionisantes : les rayons X et

gamma sont assez énergétiques pour produire des ions
réactifs quand ils interagissent avec les molécules
biologiques.
Elles ont des effets différents sur l’ADN selon le type de
rayonnement et son intensité : mutations ponctuelles,
insertions/délétions, ou des lésions plus graves et
importantes de l’ADN

Les rayons X et gamma γ (1) induisent :

» des altérations ou pertes de bases (2) ;
» des ruptures dans l'un (3) ou les deux brins (4) qui peuvent
conduire à des réarrangements, délétions, perte de fragments de
chromosome, ou la mort de la cellule.

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Les radiations ionisantes

Il y a une relation
entre la dose de
rayonnement et le
taux de mutations
car l'effet des
radiations est
cumulatif

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

Les radiations non ionisantes :

les rayons UV (environ 260 nm) agissent en formant des liaisons
entre thymines adjacentes qui vont bloquer l’action de l’ADN polymérase.
S’en suivent alors des erreurs lors de la synthèse de la nouvelle molécule
d’ADN.

Ces erreurs peuvent conduire à la mort de la cellule ou à sa cancérisation.

D’ailleurs le nombre de cancer de la peau augmente chez les personnes
s’exposant le plus au soleil.

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

La chaleur : provoque des coupures de l’ADN par

hydrolyse

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

3 types :
» Agents intercalants
» Analogues des bases
» Agents désaminants et alkylants

Agents intercalants
Exemple : Acridine orange, Bromure d’éthidium.
Molécules planes (1) qui s’intercalent entre deux brins de l'ADN. Elles
provoquent l’étirement de l’ADN (2). Lors de la réplication, l’ADN
polymérase insère alors une base surnuméraire en face de la molécule
étrangère (micro-insertion) (3) entraînant des mutations de changement
de cadre de lecture, ou reste bloquée (4).

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Analogues de bases
Il s'agit de molécules ressemblant aux bases azotées. Elles
sont parfois incorporées à l’ADN lors de la réplication.
Ex: 5-BU est semblable à la thymine, il existe sous deux formes en solution:
• non ionisée (forme cétone), la plus fréquente, s’apparie avec A
• ionisée (forme énol) très rare s’apparie avec G et provoquera la
transition A-T→ G-C.

Agents désaminants (Acide nitreux)

Agents alkylants (Méthyl méthane sulfonate, Ethyl
méthane sulfonate…)
Interagissent avec l’ADN. Provoquent un changement chimique
d’une base et un mauvais appariement.
Mutagènes puissants, fréquence de mutation plus forte qu’avec
les analogues des bases.

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Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

Mutations par insertion d’éléments transposables

dans l’ADN et inactivation des genes.

Les variations phénotypiques

et génotypiques : Mutations
Les agents mutagènes

Technique in vitro (utilisation d’ADN synthétique) qui permet

le remplacement d’une base à une position précise par une
autre base ; remplacement d’un AA par un autre AA.

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