République Algérienne Démocratique et Populaire

Ministère de l’enseignement Supérieur et de la recherche Scientifique

Université de Mouloud Mammeri de Tizi-Ouzou

Faculté des sciences biologique et agronomique

Département de Biologie

Spécialité : Biologie des organismes

Exposé d’interaction microbienne

Thème :« Rôles des micro-organismes

dans les Cycles biogéochimiques »

Travail réaliser par :

 Promotion : 2019/2020

SOMMAIRE

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Introduction …………………………………………………………………………………………………………….….……. 1

Les micro-organismes et les cycles biogéochimiques………………………………………………….……... 1

Le cycle du carbone ……………………………………………………………………………………………….……….…. 1

Le cycle du fer ……………………………………………………………………………………………………………….…… 2

a/ L’oxydation du fer ……………………………………………………………………………………………………. 2

b/ La réduction du fer …………………………………………………………………………………………………… 2

Le cycle de soufre ………………………………………………………………………………………………….…………… 2

a/ Oxydation du soufre ………………………………………………………………………………………………… 2

b/ Réduction du soufre ………………………………………………………………………………………………… 3

c/ Transformation abiotique du soufre ………………………………………………………………………… 3

Le cycle de phosphore ………………………………………………………………………………………………………… 3

Conclusion ………………………………………………………………………………………………………………………….. 3

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I / INTRODUCTION :
La vie sur terre ne serait pas possible sans les micro-organismes qui sont responsables
de la moitié de productivité primaire sur terre, malgré cette importance on n’a pas pu
cultiver, identifier et étudier que moins de 1% des espèces microbienne.

L’écologie microbien est l’étude de la dynamique des communautés et de l’interaction a

des micro-organismes entre eux et avec les plantes, les animaux et le milieu où ils vivent.
Energie électrons doivent être disponible, dans un environnement physique, adéquat pour
que les micro-organismes puissent vivre, ceux-ci interagissent avec leur environnement pour
obtenir de l’énergie ; des éléments nutritifs ce qui conduit à un processus appelé
« Recyclage Biogéochimique ».

Quelles sont les rôles des micro-organismes dans les cycles biogéochimiques ?

II/ Les micro-organismes et les cycles biogéochimiques :

Les cycles biogéochimiques sont importants car ils permettent de réactiver les éléments
inertes en une forme utilisable par les organismes vivants donc il y’a une rotation permanente
des éléments.

Au niveau de ces cycles biogéochimiques il y’a un échange important entre lithosphère

atmosphérique hydrosphère. Ces cycles sont essentiellement lies aux activités microbiennes, la
masse la plus importante sur notre planète ce sont les micro-organismes sont étymologique des
petits organismes important et responsable à la biodégradation qui est une décomposition de
matière organique par les micro-organismes comme les bactéries et les champignons et les
algues. Elles jouent un rôle essentiel dans tous les cycles biogéochimiques : cycle de Carbon, le
cycle de fer, le cycle de soufre et le cycle de phosphate.

III/ Le cycle du carbone :

Le cycle du carbone est le cycle biogéochimique du carbone sur une planète. Celui de
la Terre est rendu plus complexe par l'existence d'importantes masses d'eau océaniques, et
surtout par le fait que la vie y tient une place importante. Il est caractérisé par l'importance
relative des stocks emmagasinés dans les quatre grands réservoirs naturels de carbone de la
planète : atmosphère, biosphère, hydrosphère et lithosphère, par les échanges entre ces
réservoirs, et le renouvellement dynamique (appelé turnover) général du carbone du sol qui
inclut généralement la minéralisation (conversion du carbone organique en CO2) et la
transformation d'un réservoir de carbone à un autre (matière organique du sol fraîche et
matière organique humifiée).

1
 L'étude des cycles des principaux éléments chimiques dont le carbone a toujours été
d'un grand intérêt scientifique et technique ; cela permet notamment d'évaluer la
disponibilité, prédire les conditions et zones d'accumulation (pour une exploitation), définir
les leviers à actionner pour optimiser localement une production sensible à un élément.
Le cycle du carbone est très important pour la biosphère, puisque la vie est fondée sur
l'utilisation de composés à base de carbone : la disponibilité en carbone fait partie des
facteurs primordiaux pour le développement des êtres vivants sur Terre.
Enfin l'étude de ce cycle a récemment pris un relief tout particulier dans le cadre de la
question du réchauffement climatique : deux des gaz à effet de serre en cause, le dioxyde de
carbone (CO2) et le méthane (CH4), participent au cycle du carbone, dont ils sont la principale
forme atmosphérique. Plus largement que les questions climatiques, l'étude du cycle du
carbone permettra de déterminer les effets du relargage par les activités humaines du
carbone stocké sous forme de combustibles fossiles.

IV/ LE CYCLE DE FER :

Ce cycle consiste en changement de fer ferreux en fer ferrique.

a/ L’oxydation du fer : effectué à un petit neutre aux quelles les micro-organismes

croissent sur des substrats organiques, on les classe parmi les chimio-organotrophes. Ils
utilisent nitrate, le chlorate, le perchlorate comme accepteur d’électrons.

b/ La réduction du fer : Conduit à l’accumulation d’ions ferreux. Les micro-organique

puissent réduire de fer au cours de leur métabolisme partie est le fait de micro-organisme
spécialisés dans la respiration du fer.

V/ LE CYCLE DE SOUFRE :
Cycle de soufre Le cycle de soufre compte parmi les grands cycles biogéochimiques. Le
soufre, comme le carbone et l'azote, est nécessaire aux organismes vivants comme
constituant des protéines. Les végétaux supérieurs captent habituellement le soufre sous
forme de sulfate. Les animaux l'obtiennent sous forme d'acides aminés (cystine, cystéine et
méthionine) présents dans leur nourriture, à partir de protéines végétales, ou animales ou
par des microorganismes comme c'est le cas pour les ruminants. Les microorganismes quant
à eux, captent le soufre par d'autres voies. Est différentes activités microbiennes qui
s'inscrivent dans un cycle général contribuent dans la transformation des composés soufrés
dans les différents réservoirs.

a) Oxydation du soufre : Les formes réduites du soufre inorganique, incluant non

seulement le sulfure et le soufre élémentaire, mais aussi le thiosulfate et d'autres ions, peuvent
être oxydés par différents groupes de micro-organismes ce processus est appelé oxydation du
soufre. Les bactéries photosynthétiques utilisent le sulfure d'hydrogène (H2S), produit par le
réducteur de sulfate (SO4 2 -) des milieux anaérobies, comme accepteurs d'électron pour la
réduction du CO2 nécessaire à la synthèse des composés organiques. Les bactéries sulfureuses
pourpres et vertes appartiennent à ce groupe d'organismes ce processus est appelé « Des
bactéries non-photosynthétiques » oxydent également des formes réduites de soufre.
Certaines sont chimiolithotrophes, elles utilisent les composés soufrés réduits comme source
d'énergie et puisent dans les substances inorganiques le carbone nécessaire à leur croissance.

b) Réduction du soufre : Le groupe de bactéries réductrices du soufre le mieux connu

est celui des bactéries sulfato-réductrices qui utilisent les composés organiques comme source
de carbone et les sulfates comme accepteurs d'électrons pour la respiration des sulfates.
Certaines d'entre elles utilisent également l'hydrogène gazeux comme source d'énergie et ont
une croissance autotrophe par fixation du CO2. Le processus de réduction des sulfates est aussi
appelé sulfato-réduction dissimulatrice pour le distinguer du processus d'assimilation par
réduction des sulfates par lequel les plantes, les algues et beaucoup de bactéries aérobies
obtiennent le soufre nécessaire à la synthèse d'acides aminés.

c) Transformation abiotique du soufre : Lorsque les conditions de pH et d'oxydo-

réduction sont favorables, plusieurs transformations essentielles dans le cycle du soufre se
produisent également par des réactions chimiques normales en l'absence de microorganismes.
Un important exemple d'un tel processus abiotique est l'oxydation du sulfure en soufre
élémentaire. Ceci se déroule à pH neutre avec une demi-vie d'environ 10 minutes pour le
sulfure à température ambiante.

VI/ LE CYCLE DU PHOSPHORE :

Le cycle du phosphore est un cycle biogéochimique mettant en jeu le phosphore. C’est
un constituant indispensable de la matière organique, même si son importance pondérale est
relativement faible par rapport à l'azote ou au potassium. Son principale rôle est lié au
stockage et transfert d'énergie (ATP), et à la formation de nombreux composés structurels
(acides nucléiques, nucléotides, phospholipides, coenzymes,…).
Le cycle du phosphore est unique parmi les cycles biogéochimiques majeurs, car il ne
possède pas de composante gazeuse ; il n’affecte pratiquement pas l'atmosphère.

VII/ CONCLUSION :