Comparaison de l’expression génique chez les eucaryotes et chez les bactéries

Eucaryotes Bactéries
Le code génétique est presque universel : l’ADN est lu comme une séquence de 3 nucléotides non
chevauchants appelés codons. Chaque codon (total codons = 61) est traduit en 1 a.a. (total a.a.=20).
Code Le code génétique est ponctué : ORF = open reading frame = séquence codante qui débute au codon
génétique START (AUG = meth, définit le cadre de lecture) et termine au codon STOP (UGA, UAG, UAA)
Le code génétique est redondant : Plusieurs codons codent le même a.a. → Effet des mutations
minimisé.
Initiation
Complexe d’initiation de la transcription = ARN pol II +
facteurs généraux de transcription
Complexe d’initiation de la transcription =
Promoteur comprend une TATA BOX. Des facteurs de
ARN pol bact reconnait direct le promoteur à
transcription dont 1 reconnait la TATA BOX se lient au
l’aide de son facteur sigma et s’y lie
promoteur permettent à l’ARN pol II de reconnaitre le
promoteur et de s’y fixer.
PAS DE TATA BOX
Ajout d’encore quelques facteurs de transcription et
démarrage
Transcription Elongation
Polymérase transcrit dans le sens 5’→3’, pas d’amorce, pas de clamp, activité hélicase, pas de
relecture (pas d’activité exonucléasique)
Terminaison
Séquence spécifique induisant la terminaison =
Séquence spécifique induisant la terminaison
Séquence de polyadénylation transcrite en signal de
= Terminateur (à l’extrémité du gène
polyadénylation. Recrute prot qui induisent :
bactérien)
➢ Clivage de l’ARN 10 à 30 nuc après le signal
→ courte séquence riche en G-C répétée en
➢ Ajout d’une queue poly-A à l’ext 3’
orientation inverse suivie de 8 paires de TA
➢ Dégradation de l’ARN resté associé à la pol par
→ Formation d’une épingle à cheveux
une RNase
→ Ajout d’une coiffe 5’ : 7-méthyl-guanosine
(=nucléotide méthylé) en liaison inverse (5’-5’) à
l’extrémité 5’ après 20 à 40n catalysée par des enzymes
se trouvant dans l’ARN pol II

→ Ajout d’une queue poly-A (200 à 250 nuc) par une

poly-A polymérase (sans matrice) dès le clivage de
l’ARN

→ Epissage (=excision des introns, grande partie du

transcrit) sous l’action des snRNA = ribozyme (U1, U2,
U4, U5 et U6) qui forment un complexe avec une
Maturation 10aine de protéines (=snurp) PAS DE MATURATION
Snurp + protéines + ARNm = spliceosomes
Introns dégradés dans le noyau par des exosomes

Epissage alternatif permet à un gène de coder pour

plusieurs polypeptides légèrement ≠ à.p.d même gène

➢ Rôle de la maturation ?
→ Protéger ARNm de la dégradation enzymatique
→ Rendre l’info continue
→ Faciliter l’exportation de ARNm hors du noyau
→ Aider fixation de l’ARNm au ribosome
PS : UTR conservés lors de la maturation
 ARNm exportés de façon sélective hors du noyau par
Transport de
le complexe du pore nucléaire.
l’ARNm hors PAS BESOIN
➢ Association de ARNM à des prot particulières
du noyau
déterminent s’ils sont exportés ou non
ARNt
Brin de 70-80 nuc replié : En 3D forme=L inversé, à plat forme=trèfle
→ Rôle de navette entre ARNm et protéine
→ Chaque a.a. peut se lier à plusieurs ARNt (48 ARNt humain, 31 ARNt bactériens)
→ Chaque ARNt peut se lier à plusieurs codons (wooble pairing)
→ Liaison de l’a.a. à son ARNt : aminoacyl-ARNt synthétase (1/a.a. et tous ses ARNt accepteurs) :
consomme ATP → AMP
Ribosomes
Petite sous unité : décodage des codons de l’ARNm par les ARNt et ok cadre de lecture
Grande sous unité : formation du lien peptidique
Protéines localisées en périphérie : stabilisation de l’ensemble en permettant les variation de
conformation des ARNr nécessaire à leur activité caralytique
→ Assemblage dans le cytosol au moment ou débute la traduction
Ribosome 70S : 50 protéines
Ribosome 80S : 80 protéines
Sensibles tétracycline et streptomycine
Grande SU = 60S Petite SU = 40S Grande SU = 50S Petite SU = 30S
28S
23S
5,8S 18S 16S
5S
5S
Initiation
ARNt d’initiation port une N-formyl-
ARNt d’initiation porte une méthionine (/!\ ARNt ≠ méthionine (pourra être hydrolysé plus tard
que celui d’une méthionine de chaine) ainsi que les quelques a.a. suivants)

Traduction 1. S’installe au site P de la petit SU 1. ARNt d’initiation et ARNm se lient à la

→ Utilisation 2. ARNm recruté grâce à sa coiffe par la petite SU petite SU dans n’importe quel ordre
GTP 3. Petit SU scanne ARNm dans le sens 5’→3’ 2. Appariement de base entre RBS
4. Anticodon reconnait codon initiateur grâce à la (=Séquence de Shine-Dalgarno : en
séquence Kozak (ACCAUGG) AMONT du site d’initiation) et ARNr
5. Union de la grosse SU 16S → positionne bien l’ARNm
3. Anticodon de l’ARNt s’apparie au
➔ Nécessite GTP et facteurs d’initiation codon de départ
4. Grosse SU se fixe
Elongation
1. Aminoacyl-ARNt dont l’anticodon est complémentaire au codon exposé se positionne au site A
2. ARNr 23S ou 28S de la grande SU catalyse la formation du lien peptidique entre le nouvel a.a.
et le polypeptide en cours de synthèse.
3. Ribosome avance vers la droite de 3 nuc guidé par des facteurs d’élongation (grosse SU d’abord)
➢ ARNt san a.a. passe du site P au E et est éjecté
➢ Peptidyl-ARNt passe du site A au site P
➢ Codon suivant est exposé au site A
PS : ARNm traverse tjrs le ribosome 5’ en avant, ARNm et ribosome bougent en sens inverse et cycle se
répète à chaque a.a. ajouté
Terminaison
Facteur de terminaison eRF1 se lie au codon d’arrêt et
eRF3 l’aide à ajouter une molécule d’eau à la place
Même mécanisme MAIS 2 facteurs de
d’un a.a. → polypeptide se libère
terminaison de spécificité différente
Activité GTPase :
RF1 : UAA et UAG
1. Hydrolyse du1er GTP= relargage des 2 eRF
RF2 : UAA et UGA
2. Hydrolyse du 2ème GTP = dissociation
complète du complexe de traduction
 Polyribosome circulaire ! ARN traduit par plusieurs
Même principe mais linéaire
ribosomes en même temps.
Poly
Formation du polyribosome : pont protéique entre
ribosome + possibilité de transcription + traduction en
poly-A et coiffe 5’
même temps
→ Signe une activité importante de synthèse protéique
→ Dirige l’arrimage du ribosome au RE
1. Peptide signal reconnu par SRP (=1 ARN +
6prot), interrompt la synthèse du polypept en
cours
2. SRP se fixe au peptide signal + au ribosome
3. SRP/ribo recruté par récepteur membranaire +
canal de translocation + peptidase
4. SRP se détache
Peptide signal utilisé pour faire le tri entre
Peptide 5. Synthèse du polypep reprend
les protéines qui restent à demeure et celles
signal 6. Le polype terminé est soit inséré dans la
destinées à l’exportation
membrane du REG soit libéré dans la lumière
→ Peptide signal en général clivé et dégradé mais est
parfois conservé et sert de site d’ancrage dans la memb

Aussi peptide signal pour les prot des organites mais

traduction complète dans cytosol : sert à l’adressage
vers l’organite (reconnu par récepteur membranaire et
souvent translocation ATP)
Protéines Chaperons moléculaires et chaperonines facilitent le reploiement des protéines
chaperon Rem : Prions des mammifères = mauvais repliement des protéines → maladie de Crezfelt-Jacob
ARN polycistronique→plusieurs polypeptides

ARN monocistronique → un polypeptide → Plusieurs séquences codantes regroupées

Cistron et
en opérons (transcrits à partir d’une même
opéron
Mais oublie pas : épissage alternatif région régulatrice en un seul ARNm)
→ Traduction initiée au début de chaque
séquence codante => plusieurs RBS