EAST AFRICA STAR UNIVERSITY

NUTRITION HUMAINE (BAC 1)

COURS DE BIOCHIMIE GENERALE (30 HEURES)

Février 2023

TITULAIRE DU COURS : MSc NKURUNZIZA Sébastien

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Table des matières

O. INTRODUCTION......................................................................................................................................... 1
I.LA METABOLISME........................................................................................................................................ 1
I.1.L’anabolisme ........................................................................................................................................ 1
I.2. Le catabolisme ou dégradation ........................................................................................................... 2
I.3.Le milieu réactionnel du métabolisme ................................................................................................. 3
I.4.Méthode d’étude du métabolisme ...................................................................................................... 5
II. LES MOLECULES BIOLOGIQUES ................................................................................................................. 5
II.1. Les glucides......................................................................................................................................... 5
II.1.1. Les principaux oses d’intérêt biologiques ................................................................................... 6
II.1.2. Les diholosides(Les disaccharides) .............................................................................................. 9
II.1.3. Triholosides ............................................................................................................................... 13
II.1.4. Polyosides .................................................................................................................................. 14
II.2. Les lipides ......................................................................................................................................... 16
II.2.1. Acides gras (ag).......................................................................................................................... 17
II.2.2. Les lipides simples ..................................................................................................................... 22
II.2.3. Lipides complexes...................................................................................................................... 24
II.3. Les protéines .................................................................................................................................... 29
II.3.1. Les acides aminés ...................................................................................................................... 29
II.3.2. PEPTIDES.................................................................................................................................... 32
II .2.3. PROTEINES ................................................................................................................................ 33
II.4. Les acides nucléiques ....................................................................................................................... 33
II.4.1. Phosphates ................................................................................................................................ 34
II.4.2. Ribose, désoxyribose ................................................................................................................. 34
II.4.3. Purine, Pyrimidine ..................................................................................................................... 35
II.4.4. Nucléosides et nucléotides........................................................................................................ 38
II.4.5. Les acides nucléiques ................................................................................................................ 40
II.5. Les enzymes...................................................................................................................................... 43
II.5.1. Différents types d’enzymes ....................................................................................................... 43
II.5.2. Cofacteurs.................................................................................................................................. 45
II.6. Les vitamines .................................................................................................................................... 46
II.6.1. Classification .............................................................................................................................. 47
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II.7. Les hormones ................................................................................................................................... 56

II.7.1. Les hormones adénohypophysaires (lobe antérieur) ............................................................... 56
II.7.2. Les hormones neurohypophysaires (lobe postérieur) .............................................................. 57
II.7.3 Les hormones thyroïdiennes ...................................................................................................... 58
II.7.4. La Calcitonine ............................................................................................................................ 59
II.7.5. La corticosurrénale .................................................................................................................... 59
II.7.6. La Médullosurrénale.................................................................................................................. 60
II.7.7 Le pancréas ................................................................................................................................. 60
II.7.8. Les gonades ............................................................................................................................... 61
II.7.9. La glande pinéale ....................................................................................................................... 61
II.7.10. Le Thymus................................................................................................................................ 61
III.LA GLYCOLYSE.......................................................................................................................................... 62
III.1. introduction ..................................................................................................................................... 62
III.2. Entrée du glucose dans la cellule .................................................................................................... 63
III.3. Etapes de la glycolyse ...................................................................................................................... 65
III.4. Bilan énergétique de la glycolyse : .................................................................................................. 74
III.5. Régulation de la glycolyse : ............................................................................................................ 74
III.5. Anomalie de la glycolyse dans le foie et dans le pancréa ............................................................... 79
III.6. Entrée dans la glycolyse d’autres oses et diholosides .................................................................... 80
III.6.1. Entrée du fructose dans la glycolyse ........................................................................................ 80
III.6.2. Entrée du galactose dans la glycolyse ...................................................................................... 82
III.6.3. Entrée du mannose dans la glycolyse ...................................................................................... 82
IV.LA DIGESTION DES LIPIDES ...................................................................................................................... 83
IV.1. Activation des acides gras ............................................................................................................... 83
IV.2. La β-oxydation ................................................................................................................................. 84
IV.3. L’hélice de Lynen ............................................................................................................................. 85
VI.4. Bilan de l’oxydation d’un acide gras ............................................................................................... 87
IV.5. Catabolisme particulier ................................................................................................................... 88
V. LE CYCLE DES ACIDES TRICARBOXILIQUES OU CYCLE DE ........................................................................ 90
V.1. Etude des étapes du cycle ................................................................................................................ 90
V.1.1. La formation du citrate ............................................................................................................. 90
V.I.2.L’isomerisation du citrate ........................................................................................................... 91
V.I.3.L’oxydation de l’isocitrate ........................................................................................................... 92
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V.I .4. Décarboxylation oxydative de l’α- cétoglutarate ...................................................................... 92

V.I.5.La transformation du succynylCoA en succinate ........................................................................ 92
V.I.6.L’oxydation du succinate............................................................................................................. 93
V.I.7.Hydratation du fumarate ............................................................................................................ 94
V.I.8.L’oxydation du malate................................................................................................................. 94
VI. PHOSPHORYLATIONOXYDATIVE............................................................................................................. 96
VI.1. Introduction – localisation .............................................................................................................. 96
VI.2. Variation d’énergie libre d’oxydation de NADH,H+ et de FADH2 ................................................... 97
VI.3 les groupes transporteurs des électrons.......................................................................................... 98
VI.3.1. - Complexe I - NADH,H+ - CoQ Réductase (FP1 ) ..................................................................... 98
VI.4. - création de gradient de densité de protons ............................................................................... 100
VI.5. Mécanisme de la synthèse de l'atp - Théorie de Mitchell ............................................................ 101
VII. GLYCOGENOLYSE................................................................................................................................. 102
VII.1.Introdu tion ................................................................................................................................... 102
VII.2. Dégradation du glycogène ou glycogénolyse............................................................................... 103
VII.2.1 SEQUENCE DES REACTIONS ENZYMATIQUES......................................................................... 103
VII.3. Dégradation lysosomale du glycogène ........................................................................................ 105
VII.4. Régulation de la dégradation du glycogène................................................................................. 105
VII.4.1 Régulation hormonale............................................................................................................ 106
VII.4.2. – régulation par le calcium .................................................................................................... 108
VIII. GLYCONEOGENESE ............................................................................................................................. 108
VIII.1. Introduction ................................................................................................................................ 108
VIII.2. Les étapes enzymatiques de la néoglucogenèse ........................................................................ 109
VIII.2.1. Transformation du pyruvate en phosphoenolpyruvate....................................................... 110
VIII.2.2.Transformation du phosphoenolpyruvate en fructose-1,6- BIS ........................................... 111
VIII.2.3. Transformation du fructose 1-6 bisphosphate en glucose .................................................. 112
VIII.3. Les entrées dans la néoglucogenèse ........................................................................................... 113
VIII.4. Bilan energétique ........................................................................................................................ 113
VIII.5 Régulation de la néoglucogenèse ................................................................................................ 114
IX. GLYCOGENOGENESE ............................................................................................................................ 114
IX.1. Etapes enzymatiques..................................................................................................................... 114
IX.2. Régulation de la glycogénogenèse ................................................................................................ 115
X. LIPOGENESE ........................................................................................................................................... 117
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X.1.La biosynthèse des acides gras........................................................................................................ 117

X.1.1. La synthèse cytoplasmique de l’acide palmitique ................................................................... 117
X.2. Formation des triglycérides ............................................................................................................ 123
X.3. Formation des phosphoglycerolipides ........................................................................................... 124
XI. METABOLISMEDESPROTEINES ............................................................................................................. 125
XI.1 Catabolisme des acides aminés dans la cellule animale ................................................................ 126
XI.1.2. Décarboxylation des aminoacides.......................................................................................... 128
XI.1.3. Destinéesde la copule carbonée ............................................................................................ 129
XI. 2.Synthèse des protéines ................................................................................................................. 130
XI.2.1. Quelques définitions .............................................................................................................. 130
XI.2.2. La Transcription ...................................................................................................................... 135
XI.2.3. La Traduction .......................................................................................................................... 136
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BIOCHIMIE GENERALE

O. INTRODUCTION

I.LA METABOLISME

I.1.L’anabolisme
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I.2. Le catabolisme ou dégradation

Notion d’anabolisme et de catabolisme (cycle de coli)

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I.3.Le milieu réactionnel du métabolisme

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Schéma des transformations matérielles du métabolisme (d’après trémolières)

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I.4.Méthode d’étude du métabolisme

II. LES MOLECULES BIOLOGIQUES

II.1. Les glucides
Les glucides appelés auparavant hydrates de carbone sont des biomolécules qui ont
pour formule brute : Cn (H2O) n caractérisées par la présence de chaînons carbonés
porteurs de groupements hydroxyles (OH), et d’une fonction carbonyle
(aldéhydique ou cétonique), et éventuellement de fonctions carboxyle (COOH) ou
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amine (NH2). Ils sont produits dans les plantes par photosynthèse à partir d’eau et
du CO2 de l’air

II.1.1. Les principaux oses d’intérêt biologiques

Les oses appelés aussi sucres simples ou monosaccharides sont des molécules non
hydrolysables qui portent la plupart du temps, de 3 à 7 atomes de carbone et (n-1)
fonction alcool ou hydroxyle et une fonction réductrice carbonylée, soit : -
aldéhyde (-CHO) dans ce cas l'ose est un aldose - ou cétone (>C=O) dans ce cas
l'ose est un cétose

II.1.1.1.Les hexoses
II.1.1.1.1. D-glucose

Le D-glucose est la "molécule carburant" du monde vivant et par là le prototype ou

le modèle des études de structure et des propriétés des oses. Il est abondant à l'état
libre dans le miel et les fruits. Il est hydrosoluble dans les liquides biologiques.
Sous forme polymérisée à partir de l'α-D- glucopyranose, il constitue les réserves
énergétiques (amidon et glycogène) de la plupart des organismes supérieurs.
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II.1.1.1.2. D-galactose

Le plus répandu après le glucose, il entre dans la constitution du lactose du lait des
mammifères. On le trouve combiné dans certains oligosides, hétérosides et
glycoprotéines.

II.1.1.1.3. D-mannose

Il entre dans la constitution des glycoprotéines humaines et des de polyosides

surtout chez les végétaux (les mannanes).

II.1.1.1.4. Fructose

Il porte aussi le nom de lévulose car il est lévogyre. Il est très abondant dans les
plantes, les fruits et le saccharose. Il entre dans la composition du miel auquel il
donne sa consistance à cause de sa cristallisation difficile. Chez l’homme, il
n’existe en quantité importante que dans les sécrétions des vésicules séminales :
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c’est l’aliment de base des spermatozoïdes. La forme la plus stable du Dfructose est
la forme furanique.

II.1.1.2. Les pentoses

II.1.1.2.1. D-ribose

Il est un des composants fondamentaux des nucléosides et des acides

ribonucléiques (ARN) et fait partie de la structure de nombreux coenzymes. Il
est pratiquement toujours sous la forme ß-D ribofuranose.

II.1.1.2.2. Désoxy-2-D-ribose

C’est un l’homologue du D-ribose dans lequel la fonction alcool en C2 a disparu

pour être remplacée par un groupement méthylénique (CH2). Ils entrent dans la
composition des acides désoxyribonucléiques (ADN).
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II.1.2. Les diholosides(Les disaccharides)

Il existe 3 diholosides à l’état libre : le lactose (lait animal), le saccharose
(végétal) et le thréalose (hémolymphe des insectes, champignons). Les autres
proviennent de l’hydrolyse de polyosides résultant de la condensation avec
élimination d’eau de 2 hexoses, leur formule brute est C 12 H22 O11. La
classification des diholosides est basée sur leur caractère réducteur (réaction
avec la liqueur de Fehling). Ainsi, il existe des diholosides réducteurs et d’autres
non réducteurs.

II.1.2.1. Disaccharides réducteurs

Un disaccharide réducteur est un osyl / osido-ose qui possède une fonction OH
hémi-acétalique libre : le diholoside est réducteur et se présente sous deux
formes anomères et une structure linéaire en équilibre pour l'ose réducteur.
Parmi ces diholosides, nous citons :

II.1.2.1.1. . Lactose

C'est le sucre du lait des mammifères à une concentration d'environ 50 g/L. Une
lactase intestinale, ancrée dans la membrane des entérocytes, l'hydrolyse en
glucose et galactose qui peuvent être absorbés. Le lactose est le substrat de
fermentation en acide lactique par des lactobacilles à la base des fermentations
fromagères.
 10

II.1.2.1.2. Maltose

C'est un produit de dégradation de l'amidon et du glycogène. Par hydrolyse, il

donne 2 molécules de glucose

A coté du maltose, il existe aussi l’isomaltose, lui aussi produit de dégradation

de l’amidon et du glycogène. Il est formé de 2 glucoses reliés par une liaison de
type (α1→6).
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II.1.2.1.3.Cellobiose

C'est un produit de dégradation de la cellulose. Par hydrolyse, il donne 2

molécules de glucose.

II.1.2.2. Disaccharides non réducteurs

Un disaccharide non réducteur est un osyl / osido-oside où le type de liaison
(carbone anomérique - carbone anomérique) bloque les 2 oses dans l’une des
formes anomères cycliques (α ou ß). Aucun OH hémi-acétalique n’est libre et le
diholoside n’a aucun pouvoir réducteur. Les plus importants sont :
 12

II.1.2.2.1. Saccharose

C’est un osyl / osido-oside que l’on trouve dans les végétaux. Produit
intermédiaire de la photosynthèse, il est le vecteur glucidique dans les plantes. Il
est mis en réserve dans les tiges de la canne à sucre et dans les racines des
betteraves.

II.1.2.2.2. Tréhalose

C’est un osyl / osido-oside que l’on trouve dans les champignons, les bactéries
ou encore dans l’hémolymphe d’insectes. De nombreux organismes
l'accumulent en réponse à des chocs thermiques (froid) ou à la dessiccation.
 13

II.1.3. Triholosides
Deux triholosides sont trouvés à l’état naturel :

II.1.3.1. Raffinose
Il présent dans la betterave est éliminé lors du raffinage du sucre.
 14

II.1.3.2. Gentianose
Il est isolé à partir des racines de la gentiane.

II.1.4. Polyosides

II.1.4.1. Amidon
L’amidon est un polyoside végétal le plus abondant comme réserve glucidique.
Il est synthétisé dans les grains d'amyloplastes des cellules végétales. Son poids
moléculaire est variable selon l'espèce végétale et peut atteindre plusieurs
millions. Il est constitué d'une chaîne principale faite de glucoses unis en
(α1→4) : l’amylose et de ramifications (ou branchements) faites de glucoses
unis en (α1→6) : l’amylopectine. L’amidon est constitué de 20 % d’amylose et
de 80 % d’amylopectine.
 15

II.1.4.2. Glycogène
Il représente la forme de réserves chez les insectes et les mollusques et chez les
mammifères au niveau du foie et du muscle. Son poids moléculaire varie de 106
à 5×106 . Sa structure est voisine de celle de l’amylopectine ; La longueur
moyenne d’une chaine est de 10 à 15 résidus glucosyl. Le glycogène alimentaire
est dégradé comme l'amylopectine. Dans le foie et le muscle, une glycogène-
phosphorylase activée le glucagon dans le foie, ou l’adrénaline dans le muscle,
dégrade séquentiellement le glycogène en libérant un résidu α-glucose-1-
phosphate.

II.1.4.3. Cellulose
Joue un rôle structural dans les membranes végétales. C’est un polymère
linéaire de ß-D-Glucose unis par des liaisons ß(1- 4) stabilisées par des liaisons
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hydrogène contenant 1 500 à 10 000 résidus. Leur hydrolyse totale fournit du ß-

D-glucose alors que l’hydrolyse partielle donne du cellobiose.

II.2. Les lipides

Les lipides sont des substances insolubles en milieu aqueux, mais solubles dans
les solvants organiques : éthanol, chloroforme, éther, etc. Ce sont les huiles
(liquides) et les graisses (gélifiées ou solides).

Rôle biologique :

Les lipides naturels jouent de nombreux rôles dans le monde vivant :

- Les lipides représentent environ 20 % du poids du corps. - Ils constituent une

réserve énergétique mobilisable (les TG) : 1 g de lipides donne 9 Kcal.

- Ils ont un rôle de précurseurs : stéroïdes, vitamines, prostaglandines.

- Deux acides gras polyinsaturés sont des facteurs nutritionnels essentiels car ils
ne sont pas synthétisés par l’organisme et doivent lui être apportés par
l’alimentation. Ce sont des acides gras indispensables : l’acide linoléique et
l’acide linoléique.

- Les membranes ont une structure lipidique.

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II.2.1. Acides gras (ag)

Les acides gras sont des acides carboxyliques R-COOH dont le radical R est une
chaîne aliphatique de type hydrocarbure contenant un nombre pair de carbone
de longueur variable (4-30) qui donne à la molécule son caractère hydrophobe
(gras). La grande majorité des acides gras naturels présentent les caractères
communs suivants : - monocarboxylique (un seul COOH) - chaîne linéaire avec
un nombre pair de carbones variant entre 4 et 30 - saturés ou en partie insaturés
avec un nombre de double liaisons maximal de 6

II.2.1.1. Cas des acides gras saturés

Pour les acides gras saturés, le symbole est Cn:0 (0 indique que la chaîne est
saturée) et le nom courant rappelle son origine. Le nom de l’acide gras saturé est
déterminé de la manière suivante :

Exemple : Acide palmitique (n-hexadécanoique) C16 H32 O2 : C16 :0

Acides gras saturés les plus courants

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II.2.1.2. Cas des acides gras insaturés

La plupart des acides gras insaturés ont des longueurs de chaînes de 16 à 20
carbones. Ils possèdent soit :

- une seule double liaison : c’est les acides gras monoéniques ou

monoinsaturés.

- ou plusieurs doubles liaisons : c’est les polyéniques ou polyinsaturés

II.2.1.2.1. Principaux acides gras mono-insaturés

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II.2.1.2.1.1.Acide palmitoléique C16 :1 ω 7

- Nom systématique : acide cis-9-hexadécénoïque ou acide n hexadéca ∆ 9–

monoènoique (Trans)

-notation :

II.2.1.2.1.2 Acide oléique C18 : 1 ω 9

Le nom l’acide oléique vient de l’huile d’olive dont il constitue 55 à 80%

. - Nom systématique : acide cis-9-octadécénoïque ou acide n-octadéca ∆ 9–

monoènoïque (Trans)

Notation : C18:1 Δ 9 ou C18:1ω 9

II.1.2.3. . Acides gras polyinsaturés

II.1.2.3.1. Acide linoléique C18 : 2 ω6
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L’acide linoléique est un acide gras indispensable (besoins quotidiens : 3 à 4 g).

Il est dit essentiel car c’est le précurseur des Acides Gras de la famille des
oméga-6 (ω 6).

- Nom systématique : acide cis-cis-9,12-octadécadiénoïque ou acide n-octadéca

∆ 9,12–diènoïque (Trans)

- Notation : C18:2 Δ 9, 12 ou C18:2 ω 6

II.1.2.3. 2.Acide arachidonique C20 :4 ω6

- Nom systématique : tout cis-5,8,11,14-éicosatétraènoïque ou acide n-oéicosa

∆ 5,8,11,14– tétraènoïque (Trans).

- Notation : C20 :4 Δ 5, 8, 11, 14 ou C20 :4 ω-6

Il possède 4 doubles liaisons en ɷ6, 9, 12, 15. C’est l’acide linoléique qui
donne naissance dans l’organisme à l’acide arachidonïque. En l’absence d’acide
linoléique dans l’alimentation, l’acide arachidonïque devient indispensable
 21

II.1.2.3.3. L’acide α-linolénique

L’acide α-linolénique est un acide gras essentiel, c’est le principal acide gras du
groupe des oméga-3 (ω 3).

- Nom systématique : acide cis-cis-9,12-octadécadiénoïque ou acide n-octadéca

∆ 9,12–diènoïique (Trans).

- Notation : C18:3 Δ 9,12,15 ou C18 : 3; ω 3

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II.2.2. Les lipides simples

II .2.2.1. Les glycérides

Ce sont des esters d’acides gras et de glycerol. Les fonctions alcool du glycerol
se trouvent estérifiées par des acides gras. On distingue selon le nombre de
fonction alcool estérifiées du glycérol : - les
monoglycérides ou monoacylglycerol
- les diglycérides ou diacylglycerol
- les triglycérides ou triacylglycerol

Il y a deux façon de distinguer les atomes du glycerol. Soit 1, 2, 3 soit α, ß, α’.

La nomenclature actuelle retient 1, 2, 3. Lorsque les molécules d'acides gras
constituant le di ou triglycéride sont identiques, on parlera de diacylglycérol ou
triacylglycérol homogènes, dans le cas contraire de diacylglycérol ou
triacylglycérol mixtes. Les triacylglycérols sont des lipides neutres.

II.2.2.2. Glycéroglycolipides
Les carbones C1et C2 du glycérol sont estérifiés par des acides gras. L’alcool du
carbone C à la différence des acylglycérols n’est pas estérifié mais lié à un ose
par une liaison osidique. Ces lipides sont très rares dans le monde animal mais
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sont beaucoup plus nombreux dans le monde végétal. Ils sont également
présents chez certaines bactéries.

II .2.2.3. . Stérides
Ce sont des esters d’acides gras et d’alcool cycliques : les sterols.

Les stérols : sont des alcools saturés ou non dérivant du noyau stéroïde, produit
de la condensation de 4 cycles dont l'hydroxyle est une fonction alcool
secondaire toujours à la même position. Le plus représentatif est le cholestérol.

Exemple : palmitate de cholestéryle

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II.2.3. Lipides complexes

II.2.3.1. Phosphoglycérolipides ou phospholipides

Exemple :Acide phosphatidique

C’est le plus simple et le plus proche de la structure des TG. Isolé

principalement des végétaux. Il est insoluble dans l’acétone et soluble dans le
benzène et le chloroforme. Il est composé d’un glycérol, 2 acides gras et un
acide phosphorique (H3 PO4 ).

II.2.3.2. Sphingolipides
L’alcool est la sphingosine qui est un aminoalcool à longue chaine de carbone
(18 carbones et une double liaison)

Le principal sphingolipide est la sphingomyeline. Ce sont des lipides

membranaires du tissu nerveux.
 25

II.2.3.3. Glycolipides

Ce sont des lipides non phosphorés, caractérisés par la présence dans leur
molécule d’un ose : monoglycolipides ou de plusieurs oses les polyglycolipides.
 26

II.2.3.4. Stéroïdes
Leur squelette est un carbure tétracyclique : le stérane
(cyclopentanoperhydrophénantrène), résultant de la condensation du
cyclohexane sur le phénantrène réduit.

II.2.3.4.1. Stérols
 27

Ils ont déjà été mentionnés dans le sous-groupe des stérides des lipides simples.
Le principal stérol est le cholestérol qui est d’origine animale. Le cholestérol :
C'est un monoalcool secondaire, polycyclique et insaturé de formule brute
C27H45OH. Il dérive du noyau stérane par substitution de groupement méthyles
(en 10 et 13), d'un hydroxyle en 3, d'une double liaison dans le cycle B en 5-6 et
enfin d'une chaîne latérale à 8 atomes de carbones en 17.

II.2.3.4.2. Acides et sels biliaires

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IIV 2.3.4.3. Stéroïdes hormonaux

e cholestérol est le précurseur du pregnenolene qui est à l’origine de la synthèse de

la progestérone et d’autres hormone (l’aldosterone, la testostérone, l’œstradiol, le
cortisol).

IV.2.3.4.4. Vitamines D et autres dérivés

 29

Les deux substances naturelles abondantes que l'on trouve sont la vitamine D2 ou
ergocalciférol, formée à partir de l'ergostérol (végétaux), et la vitamine D3 ou
cholécalciférol formée à partir du 7- déhydrocholestérol (huiles de poissons).

II.3. Les protéines

II.3.1. Les acides aminés
Un acide aminé ou aminoacide est un composé comportant toujours une chaîne
carbonée plus ou moins longue, une fonction acide carboxylique (-COOH) et une
amine qui, à une exception près est une amine primaire (-NH2). Dans les AA
naturels, qui constituent les peptides et protéines, ces deux fonctions sont
supportées par le même carbone, noté carbone α, d’où le terme d’acides α aminés.
La formule générale est donc :
30
31
 32

II.3.2. PEPTIDES
Un peptide est une molécule résultant de la condensation de deux ou plusieurs
acides aminés liés les uns aux autres par des liaisons peptidiques. Cette liaison
résulte de la réaction entre la fonction : –COOH du 1er AA et la fonction : –NH2
du 2ème AA avec élimination d’une molécule d’eau.
 33

II .2.3. PROTEINES
Les protéines sont des constituants fondamentaux des organismes vivants, ce sont
des polymères d’acides aminés (nombre d’AA < 100), de haut poids moléculaire
pouvant atteindre 1 000 000 D, (la plupart entre 25 000 D et 200 000 D). Une
protéine peut être formée d’une seule chaîne polypeptidique (monomère) ou de
plusieurs (dimère, tétramère, …)

Exemple :

II.4. Les acides nucléiques

Les molécules biologiques qui contiennent l’information génétique sont les acides
nucléiques. • Les acides nucléiques sont composés de
molécules simples comme l’acide phosphorique (PO4H3), des oses à 5 carbones
(pentoses) et des bases azotées (purines ou pyrimidines).
• Le phosphate inorganique est un ion stable formé à partir de l’acide phosphorique
PO4H3. On l’écrit souvent Pi.
• Des esters de phosphate peuvent se former entre un phosphate et un groupement
hydroxyle libre (alcool, énol, phénol...). • La condensation d’un phosphate et d’un
 34

autre acide, par exemple un autre phosphate, donne un anhydride. Il y a aussi des
anhydrides mixtes avec les acides carboxyliques par exemple. • Le pyrophosphate
est un ion dérivé de l’acide pyrophosphorique (P2O7H4), qui est lui-même un
anhydride d’acide phosphorique.

II.4.1. Phosphates

II.4.2. Ribose, désoxyribose

• Le ribose est un pentose de la série D, dont tous les hydroxyles sont orientés à
droite (représentation de Fisher). Dans les acides ribonucléiques (RNA), il est
cyclisé en ribofuranose : anomère β spécifiquement.
• Le désoxyribose, composant des acides désoxyribonucléiques (DNA) est dérivé
du ribose par une réduction de la fonction alcool secondaire du carbone n°2. Le
désoxyribose confère à cet acide nucléique une plus grande stabilité propre à sa
fonction de conservation de l’information génétique.
 35

II.4.3. Purine, Pyrimidine

• Les bases azotées des acides nucléiques appartiennent à deux classes de
molécules selon le noyau aromatique qui en constitue le squelette.
• Le noyau pyrimidine est le plus simple : c’est un noyau aromatique à six atomes,
quatre carbones et deux azotes ; les deux azotes en position méta (n° 1 et 3).
• Le noyau purine est constitué de deux noyaux hétérocycliques accolés, un de six
atomes et l’autre de cinq atomes, ayant deux carbones en commun au milieu. Par
rapport à ces carbones communs, les azotes occupent des positions symétriques (n°
1 et 3 à gauche, n° 7 et 9 à droite). •
Les différentes bases rencontrées dans les acides nucléiques en dérivent selon les
substituants que portent les atomes de ces noyaux. De nombreux médicaments
appartiennent aussi à ces deux classes de bases azotées.
 36

II.4.3.1. Bases puriques

• Les purines ont un double noyau aromatique comportant à gauche un cycle
hexagonal de 4 carbones et 2 azotes et à droite un cycle pentagonal de 3 carbones
(dont 2 communs avec le précédent) et 2 azotes.
• L’adénine est constituée d’un noyau purine dont le carbone 6 est substitué par une
fonction amine. Elle est la seule des bases nucléiques dont la formule ne contient
pas d’atome d’oxygène. • La guanine est constituée
d’un noyau purine dont le carbone 2 est substitué par une fonction amine et le
carbone 6 par une fonction cétone.
 37

II.4.3.2. Bases pyrimidiques

• Les bases pyrimidiques sont au nombre de 3 : la cytosine, l’uracile et la thymine.
• Les pyrimidines ont un noyau aromatique hexagonal de 4 carbones et 2 azotes.
• La cytosine est constituée d’un noyau pyrimidine dont le carbone 4 est substitué
par une fonction amine et le carbone 2 par une fonction cétone.
• L’uracile est constituée d’un noyau pyrimidine dont les carbones 2 et 4 portent
des fonctions cétone. • La thymine est aussi constituée d’un noyau
pyrimidine dont les carbones 2 et 4 portent des fonctions cétone, mais dont le
carbone 5 est substitué par un méthyl.
 38

II.4.4. Nucléosides et nucléotides

• Les sucres (ribose ou désoxyribose) se lient aux bases azotées par des liaisons
impliquant un des azotes de la base (azote n°1 des pyrimidines ou azote n°9 des
purines) et le carbone n°1 de l’ose (carbone réducteur ou fonction semi-acétalique).
Ce sont des liaisons N-osidiques. • La
liaison d’une base azotée avec un des sucres donne un nucléoside. Un nucléoside
est donc formé d’une base et d’un sucre liés par une liaison N-osidique. Dans un
nucléoside, on numérote les atomes de la base par des chiffres : 1, 2, 3, etc... et
pour les distinguer, les carbones du sucre sont numérotés 1’, 2’, 3’, etc...
• La liaison d’un nucléoside avec un phosphate se fait par une estérification de la
fonction alcool primaire (carbone n°5’) du sucre et une des trois fonctions acides du
phosphate. • L’ester obtenu est un
nucléotide. Un nucléotide est donc formé d’une base azotée, liée par une liaison
osidique avec un sucre, lui-même lié par une liaison ester avec un phosphate.
• Dans le métabolisme des acides nucléiques interviennent des substrats riches en
 39

énergie, les nucléosides triphosphates. Un nucléoside triphosphate est un nucléotide

dont le phosphate est lui-même lié à un ou deux autres phosphates par des liaisons
anhydride d’acides.
 40

II.4.5. Les acides nucléiques

II.4.5.1. Acide ribonucléique

• Pour former un acide ribonucléique les nucléotides (GMP, AMP, UMP, CMP),
sont condensés les uns sur les autres avec des liaisons phosphodiester entre le
carbone 3’ d’un premier nucléotide et le carbone 5’ du nucléotide suivant.
• De sorte que ces liaisons définissent un sens à la molécule : le début étant le
nucléotide dont le phosphate en 5’ ne serait lié à aucun autre nucléotide et la fin
 41

correspond au nucléotide dont la fonction alcool en 3’ n’est pas estérifiée.

• Selon leurs fonctions, on distingue plusieurs espèces d’acides ribonucléiques :
— rRNA = acide ribonucléique ribosomique, qui participe à la structure des
ribosomes ; — tRNA = acide ribonucléique
de transfert, transporteur des acides aminés activés pour la traduction ;
— mRNA = acide ribonucléique messager, produit de la transcription d’un gène
qui porte l’information à traduire.
 42

II.4.5.2Acide désoxyribonucléique

• Les molécules d’acide désoxyribonucléiques sont formées de deux chaînes dont

les nucléotides sont hybridés deux à deux sur toute la longueur.
• Les deux chaînes sont antiparallèles, c’est à dire que l’extrémité 5’ de l’une est du
côté de l’extrémité 3’ de l’autre.
• Pour que tous les nucléotides puissent s’hybrider ; il faut que l’ordre dans lequel
ils sont liés ensemble soit complémentaire de la chaîne opposée.
• Les bases azotées liées par les liaisons hydrogènes sont tournées vers l’intérieur,
tandis que les riboses et les acides phosphoriques, hydrophiles sont tournés vers
l’extérieur. • La chaleur peut
dissocier les deux chaînes : c’est la fusion du DNA. Cette fusion est réversible : les
deux chaînes peuvent s’hybrider à nouveau.
 43

II.5. Les enzymes

Protéine présentant des propriétés de catalyse spécifiques d’une réaction chimique
du métabolisme de l’être vivant qui la produit. Les protéines enzymatiques sont des
catalyseurs, c’est-à-dire qu’en agissant à des concentrations très petites, elles
augmentent la vitesse des réactions chimiques, sans en modifier le résultat. Les
enzymes agissent en très faible quantité, ne sont pas consommées au cours de la
réaction (c’est-à-dire qu’elles se retrouvent intactes à la fin de la réaction) et ont
une spécificité de substrat et de réaction, c’est-à-dire qu’une enzyme transforme un
substrat donné grâce à une réaction donnée. Les protéines enzymatiques sont
synthétisées par les êtres vivants, synthèse déterminée génétiquement.

II.5.1. Différents types d’enzymes

II.5.1.1. Les enzymes d'oxydoréduction

• En biochimie, les oxydoréductases sont des enzymes catalysant les réactions
d'oxydoréduction en transférant les ions H+ et des électrons. • Elles sont associées à
des coenzymes d'oxydoréduction : NAD+ , FAD, FMN, etc. • Plusieurs de ces
enzymes sont connues en tant que : -oxydases
- réductases
- peroxydases- oxygénases déshydrogénases

II.5.1.2. Les transférases

Elles catalysent le transfert d’un atome ou groupement d’atomes entre deux

substrats. Elles nécessitent également un coenzyme.

Exemple :

• Les transaminases qui transfèrent les radicaux aminés d’un acide aminé à un acide
cétonique accepteur. Le coenzyme est le phosphate de pyridoxal (dérivé de la
pyridoxine ou vitamine B6).
 44

• Les phosphokinases ou kinases qui transfèrent un groupement phosphate sur une

molécule d’aDP. L’ion magnésium est indispensable.

• Les transacétylases qui transfèrent les radicaux acétyles (-CH2-COOH). Le

coenzyme est le coenzyme A.• Les transméthylases qui transfèrent les radicaux
méthyles (-CH3) d’une molécule à une autre. Le coenzyme est l’acide
tétrahydrofolique (dérivé de l’acide folique ou vita-mine B9).

II.5.1.3.Les hydrolases :

Elles catalysent la rupture d’une liaison avec fixation des éléments d’une molécule
d’eau. Exemples : • Les estérases qui hydrolysent les esters en acides gras et
alcool. • Les lipases qui hydrolysent les glycérides en glycérol et acides gras. • Les
osidases qui hydrolysent les osides. • Les enzymes protéolytiques qui hydrolysent
les liaisons peptidiques.

II.5.1 .4. lyases :

: Elles catalysent la rupture des liaisons autrement que par hydrolyse.
Exemples :
• Les décarboxylases d’acides cétoniques qui enlèvent un CO2 aux acides
cétoniques. Le coenzyme est la thiamine pyrophosphate (dérivé de la thiamine ou
vitamine B1). • Les
décarboxylases d’acides aminés dont le coenzyme est le phosphate de pyridoxal.

II.5.1.5.Les isomérases :

Elles catalysent le déplacement de groupes à l’intérieur d’une molécule sans que la

formule brute varie. Exemples :
• Les épimérases qui provoquent des interconversions d’oses.
• Les mutases qui catalysent le transfert d’un radical d’une partie d’une molécule à
une autre.
 45

II.5.1.6:ligases
Elles catalysent la condensation de deux molécules avec consommation d’énergie
sous forme d’ATP.

II.5.2. Cofacteurs

II.5.2.1. Définition
Les cofacteurs sont des substances chimiques non protéiques qui interviennent dans
la réaction enzymatique, mais ne sont pas transformés définitivement à la fin de
cette réaction. Ils interviennent :
- pour transporter ou compléter un substrat.
- pour accepter un produit
- comme participant à la structure de l’enzyme.

II.5.2.2. Classification
Les cofacteurs peuvent être classés en deux catégories :
- Cofacteurs métalliques.
- Les coenzymes.

II.5.2.2.1. Cofacteurs métalliques

Représentés par des ions métalliques (Mg++, Ca++, Fe++, Zn++, Cu++) qui
peuvent jouer deux rôles possibles:
- Fixation de substrat et formation d’un complexe organométallique
- Peuvent servir de centre actif.

Exemple :
Le fer indispensable pour l’activité de la catalase. Toutes les kinases sont activées
par le Mg++. Le Zinc pour l’activité de l’anhydrase carbonique.
 46

N.B: l’absence de ces cofacteurs métalliques peut provoquer l’inactivation totale

ou partielle de l’enzyme

II.5.2.2.2. Les coenzymes

• Les coenzymes sont des molécules biologiques c’est à dire que leur synthèse
naturelle ne peut être faite que par des cellules vivantes.
• Lorsque cette synthèse n’est pas inscrite dans le patrimoine génétique d’une
espèce, alors tout ou partie de la molécule du coenzyme doit être apporté à cette
espèce par son alimentation : cet aliment indispensable s’appelle une vitamine.

Les coenzymes sont des cofacteurs donc des molécules indispensables à la catalyse
enzymatique

II.6. Les vitamines

Les vitamines sont des substances organiques indispensables à l’organisme, sans
valeur énergétique propre. L’homme ne pouvant les synthétiser en quantité
suffisante, elles doivent être fournies par l’alimentation. Elles sont un groupe de
substances chimiques très hétérogènes.

Le terme « vitamine » vient du latin « vita » qui signifie vie, et du suffixe « amine »
; les chimistes croyant pouvoir classer ce type de substance parmi les amines, ce
qui s’avéra faux par la suite.

Treize substances répondent à cette définition :

– Vitamine A ou rétinol
– Vitamine D ou calciférol
– Vitamine E ou tocophérol
– Vitamine K
– Vitamine C
– Vitamine B1 ou thiamine
 47

– Vitamine B2 ou riboflavine
– Vitamine B3 ou PP ou niacine
– Vitamine B5 ou acide pantothénique
– Vitamine B6 ou pyridoxine
– Vitamine B8 ou biotine
– Vitamine B9 ou acide folique
– Vitamine B12 ou cobalamine

II.6.1. Classification
Les vitamines sont classées en deux groupes selon leur solubilité. On oppose les
vitamines liposolubles (A, D, E et K) et les vitamines hydrosolubles (B1, B2, B3,
B5, B-, B8 B9, B12 et C). Cette différence de solubilité a des conséquences sur le
métabolisme des vitamines, en particulier sur leur absorption et leur stockage

II.6.1.1 les vitamines liposolubles

II.6.1.1.1. Vitamine A

L'apport alimentaire en vitamine A est réalisé sous 2 formes : les esters de rétinyle
et les provitamines A

II.6.1.1.2. Vitamine D
 48

Contrairement aux autres vitamines, la source majeure de vitamine D n'est pas

alimentaire mais endogène pour les sujets vivants entre l'équateur et les 60 degrés
de latitude : cette vitamine est produite par les cellules des couches profondes de
l'épiderme sous l'action d'un rayonnement ultra-violet. Cette production cutanée
contribue de façon majeure à l'établissement et au maintien des réserves en
vitamine D. Concernant les sources alimentaires, la vitamine D est essentiellement
présente dans les poissons, le foie, certaines viandes, ainsi que dans les œufs et les
produits laitiers. Cet apport alimentaire correspond à 30 à 40 % des besoins
quotidiens chez l'adulte

II.6.1.1.3. Vitamine E

Les germes des graines (céréales, farines, maïs) et les huiles végétales (soja, olive,
tournesol) constituent la principale source naturelle de tocophérols . La plupart des
margarines sont également des sources de vitamine E. On en trouve également dans
 49

certains fruits comme la mûre. Les amandes et les noix sont en général de bonnes
sources de vitamine E

II.6.1.1.4. Vitamine K

Chez l'homme la vitamine K a deux origines : la première, exogène, est constituée

par la VK1 et les MK-n apportées par l’alimentation ; et la seconde, endogène, est
constituée par les MK-n synthétisées in situ par la flore intestinale normale. On
estime que les apports endogènes couvrent au minimum 50 % des besoins
quotidiens. Concernant les aliments courants, les légumes verts (brocolis, choux de
Bruxelles, choux vert, laitue, persil) et les huiles végétales constituent la principale
source de VK1
 50

II.6.1.2. Les vitamines hydrosolubles

II.6.1.2.1. Vitamine C

Les fruits (particulièrement les agrumes), et les légumes (essentiellement les

crucifères) constituent la principale source alimentaire de vitamine C

II.6.1.2.2. Vitamines du groupe B

II.6.1.2.2.1 Vitamine B1

La vitamine B1 est essentiellement apportée par l'alimentation et est présente dans

la plupart des aliments (principalement dans les viandes, les volailles, les poissons,
les céréales et légumes secs)
 51

II.6.1.2.2.2 Vitamine B2

La vitamine B2 est synthétisée en très faible quantité par les bactéries intestinales.
L'apport alimentaire est la principale source chez l'homme. Selon l'enquête de
Guilland et al, l'apport en vitamine B2 se fait principalement sous forme de
produits laitiers (lait, yaourts, fromages). La viande, le poisson, les œufs, les
légumes et les fruits ainsi que le pain, les pommes de terre et les céréales
constituent également une source d’apport non négligeable
 52

II.6.1.2.2.3. Vitamine B3

La niacine est surtout d'origine alimentaire : elle existe dans tous les aliments mais
est particulièrement abondante dans les viandes, les poissons, les levures et les
champignons. Une synthèse endogène est possible à partir d'un acide aminé, le
Tryptophane, mais cette synthèse n'est pas suffisante pour subvenir aux besoins de
l'organisme.

II.6.1.2.2.4. Vitamine B5

La plupart des aliments d’origine animale ou végétale contienne de l’acide

pantothénique. Les sources naturelles les plus riches en acide pantothénique sont la
gelée royale, la levure de boulanger et le foie (de génisse, de veau, de volaille).
Mais dans l'alimentation occidentale, l'apport journalier provient essentiellement
des viandes, poissons, œufs et produits laitiers
 53

II.6.1.2.2.5. Vitamine B6

La vitamine B6 est retrouvée partout dans l’alimentation. Selon une étude

américaine, les apports en vitamines B6 sont pour moitié d'origine animale, et pour
moitié d'origine végétale
 54

II.6.1.2.2.6. Vitamine B8

La biotine est très répandue dans les tissus animaux et végétaux. Les principales
sources alimentaires de biotine sont, par ordre décroissant, la levure sèche, foie,
rognons, œufs, champignons, haricots, lentilles, viandes, poissons, pain complet,
laitages, fromages, légumes et fruits

II.6.1.2.2.7. Vitamine B9

Les apports en folates sont exclusivement d'origine alimentaire car l'homme ne peut
en effectuer la synthèse. La teneur en folate est très variable selon les aliments.
Parmi les aliments à très forte teneur en folates, on peut citer : les protéines
animales (les foies de bœuf et de poulet), les légumes (épinards, asperges, salade
verte, petits pois, haricots, avocats, les fruits (oranges, pamplemousses, melons), les
céréales ainsi que les fruits secs.
 55

II.6.1.2.2.8. Vitamine B12

La vitamine B12 est presque exclusivement synthétisée par les micro-organismes.

Cet exemple illustre la dépendance du règne animal par rapport à l'activité de
synthèse bactérienne. Ce nutriment est présent à l'état de trace dans les aliments.
Les principales sources alimentaires sont les abats, le poisson, les fruits de mer, les
œufs, le fromage et la viande
 56

II.7. Les hormones

Une hormone est une substance libérée dans l’espace extracellulaire ou dans les
capillaires de la glande, agissant sur le métabolisme d’autres cellules à distance.
Une hormone peut être polypeptidique (formée de nombreux AA et hydrosoluble)
ou stéroïde (formée à partir du cholestérol et liposoluble). Les stéroïdes sont
sécrétées par les gonades et les surrénales.

L’hormone n’est active que sur certaines cellules (cellules-cibles), ralentissant ou

accélérant leurs processus normaux. Une hormone a donc son action soumise à
l’activité de base de la cellule-cible. Par exemple, seules les musculaires lisses des
vaisseaux sanguins se contractent sous l’effet de l’adrénaline.

II.7.1. Les hormones adénohypophysaires (lobe antérieur)

⇒ 4 des 6 hormones antéhypophysaires sont des stimulines régissant le
fonctionnement hormonal d'autres glandes endocrines :

• La Thyréotrophine (Thyroïd Stimulating Hormone), libérée sous l'influence de la

TRH (T releasing H) hypothalamique, stimule le développement et la sécrétion des
hormones thyroïdiennes. Celles-ci contrôlent par rétro-inhibition l'hypothalamus et
l'adénohypophyse.

• La Corticotrophine (AdrenoCorticoTropic Hormone) provoque, sous l'action du

CRF (Corticotrophin releasing factor) hypothalamique, la libération des hormones
corticosurrénaliennes. Le CRF, lui-même neurotransmetteur central, suit un rythme
diurne, maximal le matin au lever, et dépend de l'état général, le stress, la fièvre ou
l'hypoglycémie provoquant la sécrétion de CRF et donc de l'ACTH.
• Les Gonadotrophines (FollicleStimulatingHormone et LuteinizingHormone)
régissent le fonctionnement des gonades (ovaires et testicules). La FSH stimule la
production des gamètes alors que la LH provoque la sécrétion des hormones. La
FSH, en synergie avec la LH, entraîne la maturation du follicule ovarien, la LH
 57

seule déclenchant l'ovulation et stimulant la sécrétion de la progestérone et des

œstrogènes. Chez l'homme, la LH favorise la sécrétion de testostérone.

Les taux de FSH et de LH augmentent à la puberté, sous l'influence de la LH-RH

hypothalamique. Les taux de testostérone ou d'oestrogènes et de progestérone sont
retroinhibiteurs sur la FSH et la LH.

⇒ deux hormones agissent sur des cibles non endocriniennes :

• La Somatotrophine (ou GrowthHormone) ou hormone de croissance. Elle

provoque la croissance et la division des cellules de l'organisme, notamment os et
muscles squelettiques. C'est une hormone anabolisante, stimulant la synthèse des
protéines et la régulation de la glycémie (lipolyse et production d'énergie à partir
des acides gras libres). Son taux maximal journalier est atteint pendant le sommeil.
La Somatocrinine (GH-RH) et la Somatostatine (GH-IH), hormones
hypothalamiques antagonistes, contrôlent la sécrétion de la GH.

• La Prolactine (PRL) stimule la lactation, sous la dépendance du PRF (libération)

et du PIF (inhibition). Le PIF est prédominant chez l'homme et hors des périodes de
lactation chez la femme, contrôlé par de faibles sécrétions d'oestrogènes. Les taux
plus forts d'oestrogènes en fin de cycle conditionne le gonflement des seins, en fin
de grossesse, la sécrétion est maximale, renforcée après la naissance par la succion.

II.7.2. Les hormones neurohypophysaires (lobe postérieur)

• L'Ocytocine est un stimulant des contractions utérines (et un peu des fibres
musculaires lisses vasculaires) et de la sécrétion lactée. Dans 3 l'utérus, le nombre
de récepteurs à l'ocytocine augmente en fin de grossesse, rendant toute stimulation
de plus en plus efficace. Les mouvements foetaux et la pression sur le col utérin
provoquent un stimulus nerveux vers l'hypothalamus qui synthétise et libère
l'ocytocine, elle-même responsable de l'augmentation des contractions utérines.
 58

L'ocytocine provoque l'éjection du lait sécrété sous l'action de la prolactine, la aussi

par rétro-activation, la succion déclenchant et activant le processus.

• L'Hormone anti-diurétique inhibe la formation de l'urine, en agissant sur les

tubules rénaux, qui vont réabsorber plus d'eau et donc former une urine plus
concentrée. Le sang va ainsi rester plus riche en eau, ce qui constitue le signal
d'arrêt de sécrétion de l'ADH.

II.7.3 Les hormones thyroïdiennes

Elles sont synthétisées à partir de la Thyroglobuline (préhormone), par les cellules
thyroïdiennes pour la Thyroxine (T4), ou par les cellules cibles pour la
Triiodothyronine (T3). Riches en iode, elles interviennent sur :

• le métabolisme de base, en stimulant l'apport d'O2 aux cellules, le catabolisme du

glucose, la sécrétion d'adrénaline et de Noradrénaline, l'effet du système nerveux
sympathique.

• le métabolisme des lipides et des protides, mobilisation des lipides, sécrétion

hépatique du cholestérol, synthèse des protéines.

• le système nerveux, développement foetal et du nourrisson, fonctionnement

adulte.

• sur le cœur, les muscles, le squelette, le système digestif, le système génital et la

peau, en général par optimisation de la croissance, de l'activité normale des organes
et par stimulation des différentes fonctions sécrétrices (sucs digestifs, lactation,
sébum...)
 59

II.7.4. La Calcitonine
Produite par les cellules parafolliculaires de la Thyroïde, elle abaisse le taux
sanguin de calcium, en inhibant la destruction et en stimulant la construction
osseuse. Elle est directement antagoniste de la parathormone et est surtout active
dans l'enfance.

II.7.5. La corticosurrénale
Entourant le cœur de la glande, elle synthétise, à partir du cholestérol, une trentaine
d'hormones corticoïdes

a) Minéralocorticoïdes
Le + puissant est l'Aldostérone, qui intervient dans la régulation des concentrations
des sels minéraux sanguins Sodium (ion + le plus abondant dans le milieu
extracellulaire) et Potassium. L'aldostérone réduit l'excrétion rénale, sudorale,
salivaire et digestive du sodium (ce qui entraîne une réduction de l'élimination de
l'eau), active au contraire l'élimination du potassium et régule l'équilibre acido-
basique du sang.

b) Glucocorticoïdes
Ils influent sur le métabolisme cellulaire et contribuent à la résistance au stress. Les
principaux glucocorticoïdes sont le cortisol (seul à être sécrété en quantité notable
dans l'organisme), la cortisone et la corticostérone. La régulation des
glucocorticoïdes se fait par rétro-inhibition, la CRF hypothalamique provoquant la
sécrétion d'ACTH,, qui déclenche elle-même la libération du cortisol.

c) Gonadocorticoïdes
Les surrénales synthétisent et libèrent, avant la naissance et au moment de la
puberté, des hormones sexuelles (testostérone, oestrogènes et progestérone). La
quantité sécrétée ensuite est nettement moindre que la production gonadique, mais
 60

peut reprendre chez la femme après la ménopause. La testostérone surrénalienne

serait à l'origine de la libido chez la femme.

II.7.6. La Médullosurrénale
Elle sécrète les catécholamines (adrénaline et Noradrénaline), substances élaborées
également par les extrémités synaptiques. Lors d'un stress, le système neuro-
sympatique provoque ↑de la glycémie, une vasoconstriction générale, une
tachycardie, une dérivation préférentielle du sang vers le cerveau, le cœur et les
muscles striés, et la sécrétion des catécholamines. Celles-ci majorent les réactions,
stimulant aussi la fréquence respiratoire et le métabolisme cellulaire. La réaction de
lutte ou de fuite est ainsi optimisée. L'action des catécholamines est très brève,
rapidement pris en relais si nécessaire par l'hypothalamus.

II.7.7 Le pancréas
C'est un organe charnu, de forme triangulaire, situé dans l'abdomen, dans le cadre
duodénal, en arrière de l'estomac. C'est une glande endocrine et exocrine
(production d'enzymes digestives déversées dans le duodénum par le canal de
Wirsung). Les cellules endocrines, regroupées dans les îlots de Langherans-
Laguesse, sont de 2 types :

• Cellules Alpha, synthétisant le Glucagon

• Cellules Bêta, synthétisant l'Insuline.

II.7.7.1. Le Glucagon
C'est un polypeptide hyperglycémiant extrêmement puissant (1 molécule provoque
la libération de 100 millions de molécules de glucose dans le sang).
L'hypoglycémie provoque la sécrétion de glucagon, lequel agit sur le foie, qui
transforme ses réserves de glycogène en glucose et synthétise du glucose à partir
des triglycérides et des AA sanguins.
 61

II.7.7.2. L'Insuline
C'est un polypeptide hypoglycémiant, sécrétée lorsque la glycémie s'élève. Elle
provoque l'absorption du glucose circulant par les cellules (principalement
musculaires et adipeuses), ainsi que la glycogènogénèse hépatique. Au contraire,
elle inhibe la glycogénolyse, et la transformation des acides gras et aminés en
glucose.

II.7.8. Les gonades

Sur le plan endocrinien, elles sécrètent, à partir de la puberté, des hormones
sexuelles identiques aux hormones surrénaliennes. Les oestrogènes et la
testostérone sont responsables de la maturation des organes sexuels, du
développement des gamètes et du développement corporel. Pendant la grossesse, la
progestérone est sécrétée surtout par le placenta. Les gonades sont régies par les
gonadotrophines hypophysaires.

II.7.9. La glande pinéale

C'est une glande conique, située en arrière du 3ème ventricule. Elle sécrète, sur un
rythme circadien et saisonnier, la mélatonine et réagit aux principaux neuro-
médiateurs impliqués dans les phénomènes de la thymie. La mélatonine intervient
sur le comportement sexuel, inhibant la libération de LH-RH chez l'enfant, et sur
les rythmes physiologiques de la température corporelle, du sommeil, de l'appétit.

II.7.10. Le Thymus
C'est une glande bilobée située dans le thorax, en arrière du sternum. Elle varie de
taille et d'activité selon l'âge, elle est plus volumineuse et plus active dans l'enfance,
régressant ensuite progressivement (fibro-adipose).

Le thymus sécrète la thymopoïétine et la thymosine dont le rôle concerne

l'immunité. Les lymphocytes immatures produits par la moelle osseuse, lors de leur
passage dans le thymus, sous l'influence de ces hormones, se divisent rapidement et
se transforment en Lymphocytes T.
 62

III.LA GLYCOLYSE
III.1. introduction
La glycolyse, voie métabolique décrite par Embden et Meyerhoff, consiste en
l’oxydation progressive d’une molécule de glucose à 6C en deux molécules de
pyruvate à 3C et la phosphorylation couplée de l’ADP en ATP. Elle a donc pour
but de transférer et de produire de l’énergie. Elle est présente dans le cytosol de
toutes les cellules. Elle n’est pas seulement la voie principale du métabolisme du
glucose, mais elle est aussi la voie du fructose et du galactose présent dans
l’alimentation. Cette voie est particulière car elle peut utiliser l’oxygène s’il est
disponible à travers la chaine respiratoire de la mitochondrie (aérobiose) ou elle
peut fonctionner totalement en absence d’oxygène (anaérobiose).

Parmi les métabolites de la glycolyse, certains sont des carrefours métaboliques

importants :

- le G6P conduit à la synthèse du glycogène, des pentoses P, de la glucosamine,

constituant des glycoprotéines.

- les trioses P sont en relation avec le fructose, les pentoses P et le glycérol 3 P - le

pyruvate produit final de la glycolyse, est en relation directe dans le cytosol, avec le
lactate et l’alanine, et dans mitochondries avec l’acétylCoA et l’oxaloacétate.

La glycolyse aérobie conduit à la formation de 2 molécules de pyruvate, 2ATP,

2NADH, H+. C’est une phase indispensable à la formation du pyruvate et sa
conversion mitochondriale en AcétylCoA, élément essentiel du cycle de Krebs. Le
glucose, dans ces conditions, subit une oxydation totale en CO2 et H2O. La

Glycolyse anaérobie produit également 2 molécules de pyruvate, 2 ATP, et 2

NADH, H+. Les réactions suivantes dépendent à la fois de l’équipement
 63

enzymatique de la cellule et de la disponibilité en oxygène. Elles conduisent à la

réoxydation du NADH, H+ avec une production finale :

• Soit du lactate (fermentation lactique) : c’est ce système qui fournit de l’ATP aux
cellules qui ne possèdent pas de mitochondries comme les globules rouges et aux
cellules en hypoxie comme les muscles striés en contraction rapide.

• Soit de l’éthanol (fermentation alcoolique).

III.2. Entrée du glucose dans la cellule

Le glucose, petite molécule hydrosoluble, est transporté dans le sang sous forme
libre. Le taux sanguin, ou glycémie, est relativement constant entre 0,70 et 1,10 g/l.

• En période alimentaire, le glucose provient de l’intestin. L’augmentation de la

glycémie déclenche la sécrétion d’insuline par les cellules B du pancréas. Le foie,
premier tissu traversé par le sang portal, capte 30 à 40 % du glucose. Le glucose
restant se répartit entre les autres tissus : cerveau, GR, muscles, tissu adipeux…il
est dégradé en pyruvate par la voie de la glycolyse et stocké par la voie de la
glycogénogénèse dans le foie et les muscles.

• En situation de jeûne, le glucose sanguin provient du foie, à partir de la

glycogénolyse et de la néoglucogenèse sous l’influence des taux élevés de glucagon
sécrété par les cellules A du pancréas. Le glucose ne peut pas pénétrer dans la
cellule par simple diffusion. Son entrée est assurée par les deux mécanismes
suivants :

 Transport facilité : le glucose franchit la membrane phospholipidique et

hydrophobe des cellules par un mécanisme de diffusion facilitée, à l’aide de
transporteurs passifs. Ces transporteurs, appelés GLUT (glucose transporter)
sont codés par des gènes différents, et classés suivant l’ordre chronologique
de leur découverte. Ce sont des glycoprotéines transmembranaires. La
 64

fixation du glucose sur la face extracellulaire de la membrane provoque un

changement de conformation de la protéine ce qui fait passer l’ose sur la face
interne où il est libéré. On connait actuellement 5 transporteurs
membranaires de glucose appelés GLUT numérotés de 1 à 5 soit GLUT 1 à
GLUT 5. Ce sont des protéines qui ont une certaine ressemblance dans les
premières séquences mais présentent ensuite des séquences spécifiques à
leurs membranes d’accueil.

Les transporteurs GLUT s’expriment plus ou moins selon les types cellulaires et se
distinguent par leur Km pour le glucose

C’est ainsi que les GLUT 1 abondants dans le GR, ont une Km voisine de 1mM,
concentration nettement inférieure à la glycémie (voisine de 5mM) ; ils favorisent
ainsi la pénétration du glucose dans le globule rouge (GR) quand la glycémie est
basse, en période de jeûne

Les GLUT 3 abondants dans le cerveau, possèdent les mêmes caractéristiques que
les GLUT 1.

Les GLUT 4 prépondérants dans les graisses corporelles (tissu adipeux) et les
muscles ont une Km voisine de 5mM ; la synthèse et l’affinité des GLUT 4 pour le
glucose, sont régulées par l’insuline.

 Transport actif : processus qui consomme de l’énergie. Le glucose est

transporté contre un gradient de concentration, c'est-à-dire d’un milieu à
concentration faible en glucose vers l’intérieur de la cellule à concentration
plus élevée en glucose. Le glucose et le NA+ sont transportés dans le même
sens et en même temps à travers la membrane. Ce type de transport intervient
dans les cellules épithéliales, dans l’intestin, dans le rein etc….
 65

III.3. Etapes de la glycolyse

La glycolyse est une série de 10 réactions catalysées par 10 enzymes localisées
dans le cytosol. Tous les intermédiaires de la glycolyse sont phosphorylés. Ces
groupements étant chargés négativement cela les empêche de traverser la
membrane plasmique.

A / Phosphorylation du glucose par l’ATP

Pour entrer dans la voie de la glycolyse, le glucose doit être phosphorylé en glucose
6 phosphate. Cette réaction est catalysée par une hexokinase. Cependant, dans les
cellules hépatiques et dans les cellules des îlots pancréatiques cette fonction est
effectuée par la glucokinase dont l’activité dans le foie est soumise aux variations
de l’état nutritionnel. L’hexokinase est inhibée de façon allostérique par le produit
direct qui est le glucose 6 phosphate. L’hexokinase rencontrée dans toutes les
cellules montre une affinité élevée (faible Km) pour son substrat, le glucose. Elle a
pour fonction d’assurer l’apport de glucose dans les tissus, même en présence de
faibles concentrations sanguines de glucose. Elle agit sur les anomères α et β du
glucose et elle catalyse aussi la phosphorylation des autres hexoses, mais à une
vitesse plus lente que celle du glucose.

La glucokinase a pour fonction d’éliminer le glucose du sang après les repas.

Contrairement à l’hexokinase, la glucokinase a une Km élevée pour le glucose et
son activité est optimale à des concentrations de glucose sanguin au-dessus de 5
mmol/l (0,90 g/l). Elle est spécifique au glucose. C’est la première grande étape.
Elle est consommatrice d’une molécule d’ATP (ou d’une liaison phosphate riche en
énergie). La réaction est irréversible. Comme dans toutes les phosphorylations le
Mg++ est indispensable à la réaction. La réaction catalysée est la suivante :
 66

B/ Isomérisation du glucose 6P en fructose 6P :

C’est une réaction d’isomérisation, réversible, catalysée par la phosphoglucose

isomérase (PGI). Elle est spécifique de ces deux composés au point qu’en partant
de l’un on arrive toujours au même équilibre

C/ Phosphorylation du fructose 6P en fructose 1,6 biP :

La réaction est assurée par la phosphofructokinase 1 (PFK1) comme suit :

 67

Le Mg+ est indispensable à la réaction qui est totalement irréversible. L’UTP et

l’ITP peuvent remplacer l’ATP. La phosphofructokinase est une enzyme
allostérique dont l’activité joue un rôle important dans la régulation du taux de la
glycémie.

D/ Scission du fructose 1,6 biP et interconversion des trioses phosphates :

 68

Lors du clivage de fructose 1,6 biP, la réaction réversible est catalysée par une
aldolase (fructose 1,6 biphosphatealdolase). Il existe plusieurs aldolases différentes
comportant toutes quatre sous-unités. L’aldolase A existe dans la plupart des tissus
et l’aldolase B, dans le foie et le rein. Seul le glycéraldéhyde 3P est dégradé dans la
suite des réactions de la glycolyse. Le 3 phosphodihydroxyacétone est l’isomère le
plus stable, mais il ne peut pas entrer directement dans la voie de la glycolyse. Il
faut d’abord qu’une triose phosphate isomérase convertisse cette molécule en
glycéraldéhyde 3 phosphate en passant par un intermédiaire énediol pour que la
glycolyse puisse se poursuivre. Cette réaction termine la première phase de la
glycolyse.

E/ Formation d’ATP et oxydation du glycéraldéhyde 3P :

L’enzyme qui catalyse la réaction est la 3 phosphoglycéraldéhyde déshydrogénase.

Elle exige la présence du phosphate minéral. Le groupe carboxyle issu de
l’oxydation de la fonction aldéhyde est lié par une liaison riche en énergie au
phosphate. Le produit obtenu est le 1,3 biphosphoglycérate. Les électrons libérés
sont pris en charge par le NAD+. La réaction est réversible.
 69

F/ Transfert du phosphate sur l’ADP et synthèse de l’ATP :

Il est catalysé par la 3 phosphoglycérate kinase (phosphotransférase). La réaction

est réversible.

En résumé, par l’intermédiaire des deux enzymes (complexe multienzymatique de

la glycéraldéhyde 3 phosphate déshydrogénase), on a la réaction suivante qui
conduit à la formation d’ATP

G/ Isomérisation du 3 phosphoglycérate en 2 phosphoglycérate :

 70

Le phosphate est déplacé de la position 3 à la position 2. La réaction est catalysée

par la phosphoglycératemutase (isomérisation par transfert intramoléculaire de
radical) ; le Mg++ est indispensable et la réaction est réversible.

La phosphoglycératemutase catalyse la conversion réversible du 3

phosphoglycérate en 2 phosphoglycérate. La phosphoglycératemutase lie le 3
phosphoglycérate et le phosphoryle transitoirement en 2,3 biphosphoglycérate qui
est rapidement converti en 2 phosphoglycérate.

La quantité requise de 2, 3 biphosphoglycérate est fournie par une dérivation de la

glycolyse, la voie de Rapoport-Lubering :

Le 2,3 BPG est une molécule qui constitue un régulateur allostérique. Une
augmentation de sa concentration favorise la dissociation du complexe Hb-O2 par
diminution de l’affinité de l’hémoglobine pour l’oxygène. Un effet opposé est
observé en cas de diminution de la concentration en 2,3 biphosphoglycérate.

Le globule rouge peut modifier sa concentration interne en 2,3 biphosphoglycérate

en fonction des besoins en oxygène de l’organisme et du taux d’hémoglobine libre.
Ce mécanisme est mis à profit lors des modifications adaptatives de la fonction
respiratoire du sang (vie en altitude à p(O2) basse, anoxie, anémie, etc …) pour
assurer un apport optimal d’oxygène aux tissus (lorsque la concentration en 2, 3
biphosphoglycérate augmente, l’hémoglobine voit son affinité pour l’oxygène
diminuer et libère plus facilement l’O2 aux tissus)
 71

H/ Déshydratation du 2 phosphoglycérate en phosphoénolpyruvate:

C’est la seconde réaction qui va donner naissance à la formation d’une liaison

phosphate riche en énergie. Elle est catalysée par une énolase. Cette déshydratation
entraine un réarrangement électronique et donc une redistribution de l’énergie à
l’intérieur de la molécule. Le phosphate en position 2 devient riche en énergie et il
y a formation du phosphoénolpyruvate (c’est la molécule la plus riche en énergie
fabriquée par la cellule). L’énolase est inhibée par le fluorure. Cette propriété est
utile lorsqu’il est nécessaire d’empêcher la glycolyse avant de mesurer le glucose
sanguin. L’enzyme nécessite aussi la présence de Mg++ ou de Mn++

I/ Transfert du phosphate du phosphoénolpyruvate sur l’ADP :

Le phosphate à haute énergie du phosphoénolpyruvate est transféré sur l’ADP par

une pyruvate kinase pour générer 2 molécules d’ATP par molécule de glucose
oxydé. Cette réaction passe par un intermédiaire énolique, l’énolpyruvate qui se
 72

réarrange spontanément par réaction non enzymatique en la forme cétonique du

pyruvate. C’est une réaction irréversible qui nécessite la présence de Mg++ ou de
Mn++. On connait plusieurs variétés moléculaires de la pyruvate kinase : la forme
L (hépatique), la forme M (musculaire) et la forme A (autres tissus). La formation
du pyruvate termine la séquence des réactions de la glycolyse

Schéma condensé de la glycolyse

73
 74

III.4. Bilan énergétique de la glycolyse :

Pour chaque glucose il y a eu :

-consommation de 2 ATP lors de la formation du G6P et du F1,6 biP.

- chaque molécule de glucose donne 2 glycéraldéhyde 3P. Au niveau de chaque
triose phosphate, il y a formation d’un NADH, H+, de 2 ATP et d’un pyruvate.

Le bilan final conduit à la formation de 4 ATP et consommation de 2 ATP. La

dégradation d’une molécule de glucose dans la glycolyse conduit donc à la
synthèse de 2 ATP et à la formation de 2 NADH,H+ et de 2 pyruvates, d’où la
réaction globale :

Dans les cellules aérobies, les hydrogènes et électrons du NADH, H+ sont

transportés dans les mitochondries par des systèmes navettes pour être oxydés par
la chaine respiratoire. Dans les cellules anaérobies, le NADH, H+ réduit le pyruvate
en lactate dans le cytosol.

III.5. Régulation de la glycolyse :

A/ Régulation métabolique :

La glycolyse fournit à la fois de l’ATP, essentiel pour couvrir les besoins

énergétiques des organismes anaérobies et des précurseurs biosynthétiques. La
vitesse de la glycolyse s’établit de manière à satisfaire ces deux besoins. Dans les
voies métaboliques les réactions irréversibles sont souvent les lieux de contrôle.
Les 3 sites de régulation se situent au niveau des 3 enzymes allostériques catalysant
les réactions irréversibles de la glycolyse à savoir : l’hexokinase, la
phosphofructokinase 1 (PFK 1) et la pyruvate kinase

1 er point de contrôle :
 75

Dans les conditions normales, le sang fournit du glucose à toutes les cellules. La
faible Km de l’hexokinase (0,1mM) signifie que même à basse concentration, le
glucose qui pénètre dans une cellule est rapidement converti en G6P, lequel
s’engage alors dans la voie de la glycolyse. A mesure que les besoins énergétiques
de la cellule se trouvent satisfaits, la concentration du G6P augmente réduisant
ainsi l’activité de l’hexokinase. Après un repas riche en glucides, la concentration
de glucose augmente car l’hexokinase est complètement saturée. Ceci va augmenter
le flux de glucose au contact de la glucokinase hépatique. Cependant celle-ci ne
peut opérer à une vitesse proche de sa V max que si les niveaux du glucose sont ≥ à
1O Mm de sa Km

Ainsi, dans le cas où le glucose se trouve en excès par rapport à la demande

normale, l’action réciproque des deux enzymes permet d’assurer sa conversion
spécifique dans le foie en G6P lequel est ensuite stocké sous forme de glycogène
hépatique.

2 ème point de contrôle :


Augmentée par l’ADP ou l’AMP :

Lorsqu’une cellule se trouve à faible niveau d’énergie, les quantités d’ADP et

d’AMP sont plus élevées que la normale alors que l’ATP est peu abondante. Dans
ces conditions l’enzyme est entièrement activée et présente une forte affinité pour
son substrat le F6P.
 76

 Inhibée par l’ATP, le NADH, H+, le citrate :

• Lorsque la cellule se trouve à haut niveau d’énergie, la concentration d’ATP est

élevée et celles d’AMP et d’ADP sont faibles. Dans ce cas l’ATP s’attache à un site
régulateur de l’enzyme pour ralentir son activité. L’enzyme a maintenant une
affinité plus faible pour son substrat et la vitesse de la réaction décroît.
• L’enzyme est également inhibée par le citrate qui est un intermédiaire du cycle de
l’acide citrique. Un taux élevé de citrate signifie que les précurseurs
biosynthétiques sont abondants et ainsi une quantité supplémentaire de glucose ne
doit pas être dégradée dans ce but. Le citrate inhibe la PFK en augmentant l’effet
inhibiteur de l’ATP.
• Le NADH, H+ inhibe également l’activité de la PFK en potentialisant l’effet
inhibiteur de l’ATP. Cette inhibition sera levée dès que le NADH, H+ est réoxydé
en NAD+

 Autre régulateur de la glycolyse : le fructose 2,6 BIP est un activateur très

puissant de la PFK1 dans le foie. Il augmente son affinité pour le F6P et
diminue l’effet inhibiteur de l’ATP.

Ce fructose 2,6 BIP est formé par phosphorylation du F6P grâce à la PFK2. D’autre
part, le fructose 2,6 BIP est hydrolysé en F6P par une phosphatase spécifique : la
fructose biphosphatase 2.

La PFK 2 et la fructose biphosphatase 2 sont toutes deux présentes dans une seule
et unique chaîne polypeptidique appelée enzyme en tandem.

Le F6P accélère la synthèse de F 2,6 BIP et inhibe son hydrolyse. De ce fait, une
augmentation de la disponibilité en F6P conduit à une concentration plus élevée de
F 2,6 BIP qui elle-même stimule la PFK1.
 77

De plus, les activité de la PFK2 et la fructose biphosphatase 2 sont réciproquement

contrôlées par phosphorylation d’un seul résidu sérine.

Quand le taux de glucose est bas, une augmentation dans le sang du glucagon
déclenche une cascade de réactions conduisant à la phosphorylation de cette
enzyme bifonctionnelle. Cette phosphorylation active la fructose biphosphatase 2 et
inhibe la PFK2 diminuant ainsi le taux de F2,6 BIP. Cela signifie que la glycolyse
est freinée.

Inversement, quand le taux de glucose est augmenté, l’enzyme perd le groupement

phosphate qui lui était attaché, ce qui conduit à une augmentation du niveau de
F2,6 BIP et donc à une accélération de la glycolyse

3 ème point de contrôle :

 Type L : foie
 Type M : muscle et cerveau
 Type A : autres tissus

Ces variétés sont appelées isoenzymes : elles ont la même structure architecturale
et le même mécanisme catalytique mais diffèrent par leur mécanisme de régulation.
 78

• Les propriétés catalytiques de l’isoenzyme L sont également contrôlées par une

phosphorylation réversible : quand le taux de glucose sanguin est bas, le glucagon
déclenche une cascade de réactions qui augmente la proportion de pyruvate kinase
phosphorylée (forme moins active). Le rôle de cette phosphorylation est
d’empêcher le foie de consommer du glucose quand il est beaucoup plus urgent
d’en fournir au cerveau et au muscle.
• L’isoenzyme M à l’inverse n’est pas phosphorylée de manière réversible
• L’isoenzyme A est intermédiaire entre M et L dans sa susceptibilité au contrôle
par modification covalente.

La pyruvate kinase, enzyme allostérique, est activée par le F 1,6 BIP et le PEP. Elle
est inhibée par l’ATP, le citrate et les acides gras à longues chaines.

L’activité de la pyruvate kinase est régulée de manière analogue à celle de la PFK.

Les deux enzymes sont inhibées quand la cellule se trouve dans un état d’énergie
élevé ou lorsque sont disponibles d’autres combustibles (AG) que le glucose.

Quand la concentration d’ATP est basse, la PFK est activée ; elle produit le F 1,6
BIP (activateur de la pyruvate kinase) lequel est converti en un second activateur le
PEP.

Quand la concentration d’ATP est élevée l’activité de la pyruvate kinase et celle de

la PFK sont réduites ce qui entraine une augmentation de la concentration du F6P,
et par là même une augmentation de la concentration du G6P inhibant de ce fait
l’hexokinase.

La glycolyse est donc contrôlée dans toutes les cellules par ces trois enzymes. Si
des cellules se trouvent à un niveau énergétique élevé ou si le glucose y est
abondant, sous l’action de la glucokinase celui-ci est capturé par le foie où il sera
stocké sous forme de glycogène.
 79

B/ Régulation hormonale :

III.5. Anomalie de la glycolyse dans le foie et dans le pancréa

La découverte de mutations sur le gène de la glucokinase a permis de caractériser
un diabète monogénique à début précoce appelé diabète MODY 2
(MaturityOnsetDiabetes of the Young, type 2). La diminution de l’activité
enzymatique de la glucokinase est associée dans les cellules B du pancréas à une
diminution du flux glycolytique pour un niveau glycémique donné. Ce défaut se
 80

traduit par l’élévation du seuil glycémique induisant la sécrétion d’insuline ; celle-

ci est globalement diminuée de moitié. Dans les hépatocytes, le stockage du
glucose en glycogène est diminué et la néoglucogénèse augmentée expliquant
l’hyperglycémie. Ce type de diabète est donc à la fois une maladie hépatique et
pancréatique.

III.6. Entrée dans la glycolyse d’autres oses et diholosides

III.6.1. Entrée du fructose dans la glycolyse

81
 82

III.6.2. Entrée du galactose dans la glycolyse

III.6.3. Entrée du mannose dans la glycolyse

 83

IV.LA DIGESTION DES LIPIDES

IV.1. Activation des acides gras

 84

IV.2. La β-oxydation
 85

IV.3. L’hélice de Lynen

86
 87

VI.4. Bilan de l’oxydation d’un acide gras

 88

IV.5. Catabolisme particulier

89
 90

V. LE CYCLE DES ACIDES TRICARBOXILIQUES OU CYCLE DE KREBS

V.1. Etude des étapes du cycle

V.1.1. La formation du citrate
 91

V.I.2.L’isomerisation du citrate
 92

V.I.3.L’oxydation de l’isocitrate

V.I .4. Décarboxylation oxydative de l’α- cétoglutarate

V.I.5.La transformation du succynylCoA en succinate

 93

V.I.6.L’oxydation du succinate
 94

V.I.7.Hydratation du fumarate

V.I.8.L’oxydation du malate

V.2.Schèma de synthèse des étapes du cycle de KREBS

95
 96

VI. PHOSPHORYLATIONOXYDATIVE
VI.1. Introduction – localisation
En suivant la logique de la production de l’énergie à partir du glucose en présence
d’oxygène nous arrivons après l’oxydation des 6 carbones au bilan suivant :

Glucose + 2 ADP + 2 GDP + 4 Pi + 10 NAD+ +2 FAD →6 CO2 + 2 ATP + 2 GTP

+ 10 NADH,H+ + 2 FADH2.

Comme nous pouvons le constater, seules 4 liaisons phosphates, riches en énergie,

sont directement formées, ce qui représente seulement 10,5 % de l’énergie totale
susceptible d’être libérée par le glucose. Mais son oxydation complète en CO2,
dans la cellule, s’accompagne de la formation de 10 NADH,H+ et de 2 FADH2.
Ces derniers alimentent le transport d’électrons dans les mitochondries des
hétérotrophes et des autotrophes, à travers des séquences de réactions
d’oxydoréductions respiratoires, jusqu’à l’oxygène, accepteur final. Ce processus
est responsable de la formation de la majeure partie de l’ATP. La synthèse d'ATP,
couplée à ce transport d'électrons, est appelée Phosphorylation oxydative. Tous
les êtres vivants, pouvant vivre en présence d’oxygène, possèdent la capacité de
produire de l’ATP par phosphorylation oxydative.

La phosphorylation oxydative se déroule dans les mitochondries possédant :

 97

 Une membrane externe, semi-perméable

 Une membrane interne, présentant des invaginations appelées crêtes,
intrinsèquement imperméable aux ions et aux petites molécules. Ces derniers
ne peuvent la traverser que s’ils disposent de transporteur spécifique. Elle
renferme les différents complexes impliqués dans le transport d’électrons et
la synthèse de l’ATP.
 Un espace intermembranaire
 Un milieu intérieur, appelé matrice, entouré par la membrane interne

Chaque membrane ou compartiment possède ses enzymes ou ses complexes

spécifiques, voir tableau 39, résumant la distribution des enzymes dans la
mitochondrie.

VI.2. Variation d’énergie libre d’oxydation de NADH,H+ et de FADH2

Les deux principaux coenzymes, donneurs d'électrons dans la chaîne respiratoire,
sont le NADH,H+ et le FADH2 . Les électrons sont transportés jusqu'à l'oxygène.
L'énergie libre d'oxydation de NADH,H+ et de FADH2 peut être calculée à partir
de la formule liant DE°’ et DG'o . Les réactions globales d’échange des électrons
entre les couples rédox sont :

L’énergie libérée par l’oxydation de ces cofacteurs réduits est disponible au niveau
de la cellule pour la production de l’ATP mais la cellule ne peut supporter de
brusques variations de potentiel ni d'énergie libre de telle ampleur, qui conduiraient
à sa destruction. Pour s’en protéger la cellule met en œuvre une séquence de
groupes de transporteurs. Les électrons sont alors transportés par étape à travers
 98

une série de complexes multienzymatiques. La variation de potentiel ou d’énergie

se fait donc par fractions et par escaliers depuis le cofacteur réduit jusqu'à
l’oxygène

VI.3 les groupes transporteurs des électrons

On distingue 4 groupes qui sont des complexes multi-enzymatiques :

Complexe I - NADH,H+ - CoQ Réductase (FP1)

Complexe II - Succinate - CoQ Réductase (FP2).
Complexe III – CoQH2 - Cytochrome c réductase
Complexe IV - Cytochrome c oxydase

VI.3.1. - Complexe I - NADH,H+ - CoQ Réductase (FP1 )

C'est un complexe multi-enzymatique qui transporte les électrons de NADH,H+ au
coenzyme Q appelé encore Ubiquinone à travers une séquence où apparaissent des
protéines Fer-Soufre (FeS): La circulation des électrons est spontanée et se fait
dans le sens d’une augmentation du potentiel.

L’enzyme principale de ce complexe I est la NADH,H+ déshydrogénase à FMN.

C’est une flavoprotéine appelée FP1, de masse moléculaire de 250 000 daltons.
Cette enzyme est inhibée par l'Amytal, la roténone et la ptéricidine. L’un de ces
composés inhibe le transport des élections dans le complexe I.

VI.3.2 Complexe II - Succinate - CoQ réductase (FP2 ).

Ce complexe enzymatique transporte les électrons du succinate jusqu'au coenzyme
Q. L’enzyme principale du complexe est la succinatedéshydroogénase à FAD.
C’est la flavoprotéine FP2. Ici encore les protéines FeS interviennent pour donner
la séquence suivante :
 99

D'autres complexes de moindre importance, non impliqués dans la chaîne

respiratoire, transportent aussi des électrons jusqu'au niveau du coenzyme Q pour
alimenter le transport des électrons. Les plus importants sont les suivant

VI.3.3. Complexe III - CoQH2 - Cytochrome c réductase

Ce complexe multi-enzymatique transporte les électrons entre le coenzyme Q

réduit (CoQH2) et le cytochrome c suivant la séquence suivante :

CoQH2 →Cyt b →Fe-S →Cyt c1 →Cyt c Le transfert des électrons dans ce

complexe est spontané. Il est inhibé entre le cyt b et le cyt c1 par l'ANTIMYCINE
A.

VI.3.4. Complexe IV - Cytochrome c oxydase

Il transporte les électrons jusqu'à l'oxygène. On obtient :

Le transfert des électrons entre le cyt a3 et l'oxygène est inhibé par l’azide, par le
CO et par les cyanures qui constituent des poisons respiratoires violents

VI.3.5 Organisation du transport des électrons dans la chaîne respiratoire

 100

L’organisation du transport montre l’ordre d’intervention des différents complexes

et coenzymes. . Deux coenzymes, le coenzyme Q et le cytochrome c ne sont pas
fixés aux membranes et peuvent s’y mouvoir.

VI.4. - création de gradient de densité de protons

Lors du transport des électrons un gradient de densité de protons (gradient
électrochimique) est créé à travers la membrane mitochondriale interne. Des
protons sont pompés de façon unidirectionnelle de la matrice vers l'espace
intermembranaire. Au niveau des complexes I, III et IV. il existe, dans la
membrane mitochondriale interne, des complexes protéiques qui se comportent
comme des pompes à protons, alimentées par l’énergie libre fournie par le transport
des électrons. Ceci constitue la théorie chimioosmotique postulée par P. Mitchell en
1968.

Le pH à l'intérieur de la matrice augmente et devient supérieur à celui de l'espace

intermembranaire. Il se crée un ΔpH négatif. Les protons sont pompés au niveau de
3 sites

- site 1 : Complexe NADH,H+ - CoQ réductase (FP1)

- site 2 : Complexe CoQH2 - Cytochrome c réductase
- site 3 : Cytochrome c oxydase

Le passage des électrons à chaque site crée un ΔE°’. Le ΔG°’ correspondant sera
utilisé pour la synthèse de l'ATP. Ainsi l'oxydation de NADH,H+, dont les
électrons circulent à travers les 3 sites, provoque la formation de 3 ATP; celle de
FADH2, dont les électrons entrent au niveau du site 2 provoque la formation de 2
ATP. Les électrons qui entrent au niveau du site 3 permettent la formation de 1
ATP
 101

La création d'un gradient de densité de protons par le flux des électrons à travers les
3 sites de conservation de l'énergie implique que les protéines de transport de
protons fonctionnent de façon irréversible et asymétrique de telle façon que les
protons puissent être pompés du côté matriciel vers le côté cytoplasmique.

VI.5. Mécanisme de la synthèse de l'atp - Théorie de Mitchell

Les étapes sont les suivantes :

 En tout premier lieu, le transport des électrons à travers la chaîne respiratoire

est nécessaire.
 La formation de l'ATP exige la création de gradient de densité de protons
entre la matrice et l'espace intermembranaire. c'est le potentiel
électrochimique créé qui fournit l’énergie nécessaire à la synthèse de l'ATP.
 Une fois le gradient créé, la synthèse de l'ATP est effectuée par une enzyme
contenue dans des protubérances sphériques situées sur le côté matriciel de la
membrane mitochondriale interne. Ces sphères sont connues sous le nom de
facteur de couplage 1 ou F1. Son rôle physiologique est de catalyser la
synthèse de l'ATP. Il contient l'ATPase ou l'ATP synthétase.
 A la base de F1 et constituant son pédoncule membranaire, il existe une
autre unité protéique essentielle appelée Fo ou canal protonique. La liaison
entre Fo et F1 est assurée par plusieurs autres protéines dont l'ensemble est le
complexe Fo-F1. Le facteur Fo assure le reflux des protons de l’espace
intermembranaire vers la matrice à travers la membrane interne et permet la
libération de l’énergie nécessaire à la synthèse de l'ATP.

Quant à la synthèse de l'ATP on sait peu de choses. On pense que son initiation
débute grâce à l'action directe du flux de protons à travers Fo sur F1. Le Pi est
activé et, simultanément, est attaqué par l'ADP pour donner l'ATP
 102

La vitesse de phosphorylation oxydative est conditionnée par le besoin en ATP.

Dans les conditions physiologiques le transport des électrons est étroitement lié
à la synthèse de l'ATP. Le facteur le plus important qui détermine la vitesse de
phosphorylation est le taux d'ADP dans la cellule. Le transport des électrons,
nécessaire à la formation du gradient de densité de protons, et la synthèse de
l'ATP sont deux processus couplés. Sur le plan expérimental on a montré que
l’ADP stimule la respiration en présence de NADH,H+ et entraîne la conversion
de l'ADP en ATP. La régulation de la vitesse de phosphorylation oxydative par
le taux d'ADP est appelée contrôle respiratoire. La signification physiologique
est évidente. La consommation d'ATP entraîne l'augmentation du taux d'ADP
qui constitue un signal important qui déclenche l’écoulement des électrons dans
la chaîne respiratoire à partir de NADH,H+ et de FADH2.

VII. GLYCOGENOLYSE
VII.1.Introdu tion
Une source constante de glucose sanguin est absolument indispensable à la vie
humaine. Le glucose est le substrat énergétique préférentiel du cerveau, ou une
source d’énergie fondamentale pour certaines cellules sans mitochondries comme
les globules rouges. Les muscles squelettiques, en contraction rapide, ont besoin
d’un approvisionnement important en glucose, qui seul, par l’intermédiaire de la
glycolyse, fournit l’énergie requise. Le glucose sanguin provient de 3 origines :

- glucose alimentaire ingéré au moment de la prise des repas,

- la néoglucogenèse, voir le chapitre correspondant,
- le glycogène (polymère du glucose) du foie

La source du glucose alimentaire (disaccharide, amidon et glycogène) est

sporadique et n’est pas fiable. La néoglucogenèse est souvent trop lente pour
 103

répondre à une demande immédiate. En revanche l’organisme des animaux a

développé dans le foie et dans les muscles striés un processus de mobilisation
rapide en réponse à une demande immédiate en l’absence du glucose alimentaire.
Ce processus est la glycogénolyse ou dégradation du glycogène. Alors que le
glycogène hépatique est mobilisé pour maintenir le taux du glucose sanguin et pour
alimenter les tissus périphériques, le glycogène stocké dans les muscles est
mobilisé et consommé sur place pour leur fonctionnement.

Les réserves en glycogène du foie augmentent quand les animaux sont bien nourris
et peuvent diminuer pendant le jeûne prolongé jusqu’à épuisement. Les réserves en
glycogène des muscles sont peu affectées par un jeûne prolongé, et elles peuvent
être reconstituées après une activité qui en a consommé une partie. Que ce soit dans
le foie ou dans les muscles, le glycogène est synthétisé à partir de glucose 6-è
comme précurseur. La synthèse du glycogène est la glycogénogenèse.

VII.2. Dégradation du glycogène ou glycogénolyse

L’enzyme principale de la dégradation du glycogène endogène (hépatique et
musculaire) est la glycogène phosphorylase qui libère des glucose1-è et une
dextrine limite. Deux autres enzymes, une glycosyltransférase et une a(1-6)
glucosidase interviennent dans la conversion complète du glycogène en glucose 6-
è. Seul le foie peut transformer le glucose-6-è en glucose, excrété dans le sang.

VII.2.1 SEQUENCE DES REACTIONS ENZYMATIQUES

VII.2.1.1. Phosphorolyse du glycogène

La phosphorolyse proprement dite est catalysée par la glycogène phosphorylase.

Cette enzyme coupe la liaison α(1-4) à partir de l'extrémité non réductrice et fixe,
sur le carbone 1 du glucose libéré, un groupement phosphate, apporté par l'ATP, en
donnant du glucose 1-è. La phosphorolyse est répétée de façon séquentielle sur le
 104

glycogène jusqu'à 4 résidus glycolyses sur chaque chaîne avant la liaison α(1-6). La
structure résiduelle est appelée dextrine limite, résistant à l’action plus poussée de
la phosphorylase

VII.2.1.2. Glycosyl-4,4-transférase

La glucosyl-4,4-transférase intervient sur la dextrine limite en enlevant sur chaque

chaîne de la dextrine limite un oligosyle formé de 3 résidus glucose pour aller
allonger une autre chaîne de la dextrine limite permettant ainsi la reprise de la
phosphorolyse sur cette chaîne. Après l’action de cette enzyme il demeure à la
place de la chaîne latérale un glucose lié par la liaison α(1-6).

VII.2.1.3 α(1- 6) Glucosidase

Enfin une α-glucosidase hydrolyse les résidus glucose reliés par la liaison a(1-6) et
libère les glucose.

Après l’action de ces trois enzymes le glycogène libère essentiellement du glucose

1- è (par phosphorolyse) et une faible quantité de glucose (hydrolyse). Le glucose1-
è est isomérisé en glucose-6-è par la phosphoglucomutase. Le glucose 6-è peut
entrer dans la glycolyse dans le foie et dans le muscle. Mais l’objectif de la
dégradation du glycogène hépatique est avant tout le maintien de la glycémie. Pour
ce faire seul le foie, après dégradation du glycogène, dispose de la glucose 6-
phosphatase, permettant l’hydrolyse du glucose 6-è en glucose et l’excrétion de ce
dernier dans le sang. Les deux réactions catalysées sont les suivantes :
 105

Schéma du glycogénolyse

VII.3. Dégradation lysosomale du glycogène

Une faible quantité du glycogène est dégradée par une a(1-
4)glucosidaselysosomale. Le rôle de cette dégradation est inconnu. Mais une
déficience en cette enzyme provoque une accumulation du glycogène dans les
vacuoles, et constitue une véritable maladie du stockage du glycogène du type II
(Maladie de POMPE).

VII.4. Régulation de la dégradation du glycogène

Le métabolisme du glycogène fait partie intégrante du métabolisme énergétique. Il
est sous contrôle hormonal. L’adrénaline et le glucagon dirigent le catabolisme et la
production de l’énergie ; l’insuline contrôle l’anabolisme orienté vers le stockage
de l’énergie. Les effets de ces 2 groupes d’hormones sont antagonistes, ce qui
nécessite une régulation coordonnée que nous verrons plus loin. En ce qui concerne
 106

la dégradation du glycogène nous distinguerons la régulation hormonale et la

régulation par les ions Calcium

VII.4.1 Régulation hormonale

Le glucagon et l’adrénaline (épinéphrine) sont les deux principales hormones qui
contrôlent la dégradation ou la mobilisation du glycogène. Pour bien comprendre le
mécanisme mis en jeu, il est indispensable de connaître d’abord les éléments qui y
participent.

· Il existe deux glycogène phosphorylases, l'une musculaire et l'autre hépatique.

Chacune existe sous deux formes, forme a (active) et forme b (pratiquement
inactive). La phosphorylase musculaire est formée de 4 sous-unités, groupées en
dimères (forme inactive), possédant chacune un groupement séryle. Lorsque les
OH des sérines sont phosphorylés, les dimères s'assemblent en tétramère (forme
active). La phosphorylase hépatique est dimérique. La forme dimérique (b) inactive
peut passer à la forme dimérique (a) active par phosphorylation. Les deux formes,
que ce soit dans le muscle ou dans le foie, s'interconvertissent l'une dans l'autre
grâce à l'action de deux enzymes : la phosphorylase kinase (passage de la forme
inactive à la forme active par phosphorylation) et la phosphorylase phosphatase
(hydrolyse du groupement phosphate).

· La phosphorylase kinase qui phosphoryle la phosphorylase hépatique ou

musculaire existe aussi sous deux formes : l'une active (phosphorylée) et l'autre
inactive (déphosphorylée). L'interconversion entre la forme inactive et la forme
active est assurée par une protéine kinase.

· La protéine kinase est formée de deux sous-unités dont l'une est catalytique
(active) et l'autre régulatrice. La forme inactive est l’assemblage des deux
sousunités, la sous unité régulatrice masquant le site catalytique de la sous-unité
active. L'activation de la protéine kinase est assurée par l'AMPc (AMP cyclique)
 107

qui en se combinant à la partie régulatrice libère le site catalytique de la sous-unité

active

· L'AMPc est formé dans le cytosol à partir de l'ATP par l’adénylate cyclase
membranaire, qui est activée par deux hormones principales : adrénaline
(épinéphrine) ou le glucagon.

La régulation hormonale est en fait le résultat de la transduction d’un signal

chimique conduisant à des effets intracellulaires qui correspondent ici à la
mobilisation du glycogène. Les mécanismes d’action de l’adrénaline et du glucagon
sont similaires, une fois que chacune de ces hormones est fixée sur son récepteur
membranaire spécifique. La formation du complexe récepteur-ligand déclenche une
cascade de réactions que nous pouvons résumer ains

 La fixation de chacune des hormones sur son récepteur membranaire

spécifique entraîne l’activation d’une adénylate cyclase (adénylcyclase)
membranaire.
 L’adénylate cyclase activée catalyse, par hydrolyse de l’ATP, la formation
de l’AMP cyclique (AMPc), considéré comme un second messager.
 L’AMPc se fixe sur une protéine kinase A (AMPc dépendante) et se
combine à la sousunité régulatrice pour libérer la sous-unité catalytique
(Protéine kinase A active).
 La protéine kinase A (active) phosphoryle, en présence de l’ATP, la
glycogène phosphorylase kinase qui devient active sous forme
phosphorylée.
 Enfin cette dernière phosphoryle la glycogène phosphorylase en la faisant
passer de la forme b à la forme a qui catalyse la phosphorolyse du
glycogène.
 108

VII.4.2. – régulation par le calcium

La glycogène phosphorylase kinase activée par phosphorylation est l’enzyme
déterminante qui initie le processus de la mobilisation du glycogène. Nous avons
vu plus haut le mécanisme de contrôle hormonal. Un autre processus, de moindre
importance mais actif dans les muscles striés, est déclenché par le relargage de
grandes quantités d’ions Ca2+ par le réticulum endoplasmique. Le mécanisme fait
intervenir une petite protéine, la calmoduline, qui fixe 4 ions Ca2+ pour former un
complexe calmoduline-Ca2+ actif. Ce dernier se comporte ensuite comme une
sous-unité activatrice d’une protéine kinase calmoduline dépendante. La protéine
kinase activée, en présence d’ATP, phosphoryle la glycogène phosphorylase
kinase. Ainsi la régulation par le calcium peut venir renforcer la régulation
hormonale et améliorer la dégradation du glycogène surtout dans les cas où il faut
anticiper les besoins en glucose.

VIII. GLYCONEOGENESE
VIII.1. Introduction
Certains tissus comme le cerveau, les globules rouges, la région médullaire du rein,
le cristallin, la cornée de l’œil, et le muscle en contraction rapide ont besoin d’un
approvisionnement continu en glucose. Seul le foie est capable d’assurer cette
fonction par mobilisation du glycogène et par néoglucogenèse. Les réserves du foie
sous forme de glycogène sont évaluées à 190 g. Les besoins journaliers en glucose
sont estimés à 120 g pour le cerveau, 40 g pour le reste de l'organisme. Dans les
fluides, circulent 20 g de glucose à l'état dissous. On en déduit que les réserves en
glucose hépatique ne couvrent que les besoins d'un jour en l’absence d’alimentation
glucidique

Le glucose peut être synthétisé par la voie de la néoglucogenèse ou gluconéogénèse

à partir de précurseurs comme le pyruvate, le lactate, le glycérol issu de l’hydrolyse
 109

des triglycérides et des ceto-acides provenant de la désamination des acides aminés

glucoformateurs. La majeure partie du glucose néoformé (90 %) est synthétisée
dans le foie et les 10 % restants dans les reins. Les reins jouent ainsi un rôle mineur
sauf dans le cas de jeûne prolongé où leur contribution devient très importante. La
néoglucogenèse est activée dans le cas du jeûne et dans le diabète. En cas
d’exercice physique pendant lequel le glucose musculaire est dégradé en lactate, la
néoglucogenèse hépatique est stimulée ; pour retransformer en glucose, le lactate,
issu de la glycolyse musculaire. Voir cycle des Cori.

Bien que la néoglucogenèse soit habituellement définie comme la transformation

du pyruvate en glucose et que la glycolyse soit la dégradation du glucose en
pyruvate, la néoglucogenèse n'est pas l'inverse de la glycolyse. En effet, trois
réactions de la glycolyse sont irréversibles et se situent au niveau des sites de
contrôle.

Pour contourner ces 3 difficultés, la cellule fait appel à d’autres réactions

thermodynamiquement plus favorables avec la coopération des mitochondries.

VIII.2. Les étapes enzymatiques de la néoglucogenèse

La plupart des étapes qui conduisent du pyruvate au glucose sont catalysées par les
enzymes de la glycolyse qui interviennent en sens inverse (réactions réversibles).
Les trois réactions irréversibles sont remplacées par d'autres réactions à équilibre
thermodynamique plus favorable et catalysées par des enzymes spécifiques de la
néoglucogenèse. Le démarrage de la néoglucogenèse exige la conversion du
 110

pyruvate en phosphoénolpyruvate. Deux pyruvates sont nécessaires pour faire un

glucose.

VIII.2.1. Transformation du pyruvate en phosphoenolpyruvate

C'est la première étape. Elle ne peut être réalisée par l'action de la pyruvate kinase
selon la réaction suivante qui est endergonique.

Pour obtenir cette phosphorylation du pyruvate il y a coopération entre la

mitochondrie et le cytosol.

2.1.1 - Phase mitochondriale

Le pyruvate, exporté dans la mitochondrie, est d'abord carboxylé par la pyruvate

carboxylase, située dans la matrice. L’enzyme est une ligase à biotine. L’ATP est
nécessaire. La pyruvate carboxylase se rencontre dans les mitochondries du foie et
des reins mais pas dans celles des muscles.

L’oxaloacétate formé est réduit en malate par la malatedéshydrogenase

mitochondriale. Le malate est ensuite transporté de la mitochondrie dans le cytosol.
 111

2.1.2 - Phase cytosolique

Le malate est réoxydé en oxaloacétate par la malate déshydrogénasecytosolique.

Enfin l'oxaloacétate est transformé en phosphoénolpyruvate, suivant une réaction

réversible) en présence du GTP par laphosphoénolpyruvatecarboxykinase
(PEPcarboxykinase), enzyme spécifique de la néoglucogenèse.

En résumé la réaction globale de la transformation du pyruvate en

phosphoénolpyruvate est :

Chez certains micro-organismes et végétaux, la phosphorylation du pyruvate en

PEP est réalisée par une réaction complètement différente, catalysée, en une seule
étape, par une pyruvate orthophosphatedikinase :

VIII.2.2.Transformation du phosphoenolpyruvate en fructose-1,6- BIS Phosphate

La séquence des réactions qui vont conduire du PEP au glucose est cytosolique. La
transformation du phosphoénolpyruvate en furctose-1,6-bis phosphate est réalisée
par la séquence des réactions glycolytiques réversibles, fonctionnant en sens
inverse. Nous nous contenterons de les écrire en rappelant les noms des enzymes
 112

VIII.2.3. Transformation du fructose 1-6 bisphosphate en glucose

Une séquence de 3 réactions, dont une réversible, conduit au glucose.

2.3.1 - Déphosphorylation du fructose-1,6-bis phosphate en fructose 6-

phosphate

On connaît la réaction qui transforme le fructose 6-phosphate en fructose 1-6 bisè.

Cette réaction qui est catalysée par la phosphofructokinase 1 (transférase) est
irréversible. La réaction inverse qui enlève le groupement phosphate est catalysée
par la fructose-1,6 bisphosphatase (FBP1), enzyme clé et site de régulation
principal de la voie.

2.3.2 - Isomérisation du fructose 6-phosphate en glucose 6-phosphate

La réaction est catalysée par la phosphogluco-isomérase (PGI)

 113

2.3.3 - Déphosphorylation du glucose 6-posphate en glucose

VIII.3. Les entrées dans la néoglucogenèse

VIII.4. Bilan energétique

Le bilan de la formation du glucose à partir de 2 pyruvate est le suivant :
 114

Sur le plan énergétique la synthèse du glucose consomme 4 ATP + 2 GTP soit

l’équivalent de 6 liaisons phosphates riches en énergie.

VIII.5 Régulation de la néoglucogenèse

IX. GLYCOGENOGENESE
La glycogénogenèse correspond au stockage du glucose sous forme d’un
polysaccharide, le glycogène. Cette synthèse du glycogène se fait au niveau du
cytosol, uniquement dans le foie et le muscle squelettique, grâce à la glycogène-
synthase.

IX.1. Etapes enzymatiques

Le G6P est isomérisé en glucose 1 phosphate (G1P), lui-même activé par de l’UTP
(uridine triphosphate) entraînant la formation d’UDP-glucose ; ces deux premières
étapes consomment 2 ATP.

Une fois activés, les UDP-glucoses se lient les uns après les autres à une molécule
de glycogène en cours d’élongation par des liaisons α1-4, grâce à la glycogène-
synthase. Quand la chaîne linéaire atteint une vingtaine d’unités glucose, la
glycosyl-4,6-transférase (ou enzyme branchante) transfère un bloc de 5 à 8 unités
glucose par des liaisons α1-6, entraînant la formation d’une ramification ; la
synthèse reprend ensuite jusqu’à la ramification suivante. L’ajout de chaque
 115

molécule de glucose sur la molécule de glycogène en cours d’élongation consomme

2 ATP, il s’agit donc d’un processus endergonique.

IX.2. Régulation de la glycogénogenèse

La régulation de la synthèse de glycogène (figure 3) est basée sur l’activation de la
glycogènesynthase qui peut exister sous 2 formes : une active (déphosphorylée) et
l’autre inactive (phosphorylée). La phosphorylation/déphosphorylation de cette
enzyme est régulée par 2 enzymes : une protéine phosphatase de type 1 (PP1) et la
glycogène-synthase kinase 3 (GSK3), qui sont régulées par des facteurs
nutritionnels et environnementaux.

En période alimentaire, l’insuline va activer d’une part PP1 qui va déphosphoryler

la glycogène-synthase et donc l’activer, et d’autre part inhiber GSK3 et la PKA ce
qui maintient la glycogène-synthase sous sa forme active. Ainsi, l’insuline favorise
la synthèse de glycogène, tout comme le glucose qui est un activateur allostérique
de la glycogène-synthase. En situation de jeûne, le glucagon est sécrété par les
 116

cellules α du pancréas et se fixe sur son récepteur, un récepteur à 7 domaines

membranaires couplé à des protéines Gs au niveau du foie. Cette liaison permet
l’activation de l’adénylylcyclase, ce qui augmente les taux intracellulaires d’AMPc
et active la PKA. Celle-ci inhibe la glycogène-synthase en la phosphorylant et il
inhibe la PP1 ce qui maintient alors la glycogène-synthase sous sa forme
phosphorylée inactive et inhibe la synthèse de glycogène. De même, les
catécholamines (adrénaline et noradrénaline) et le cortisol sont libérés lors d’un
jeûne prolongé ou en conditions de stress, et l’AMPK, inhibent la synthèse de
glycogène en inactivant la glycogène-synthase par phosphorylation

En période alimentaire (entouré et en bleu), l’insuline va d’une part activer la PP1

(protéine phosphatase de type 1) activant la glycogène-synthase, et d’autre part
inhiber la GSK3 (glycogène-synthase kinase 3) et la PKA (protéine kinase A) ce
qui maintient la glycogène-synthase sous sa forme active. Ainsi, l’insuline favorise
la synthèse de glycogène, tout comme le glucose qui est un activateur allostérique
de la glycogène-synthase. En condition de jeûne (encadré et en rose), le glucagon
 117

inhibe PP1 et active la GSK3 via l’activation de la PKA : la synthèse de glycogène

est alors inhibéeX. LIPOGENESE

X.1.La biosynthèse des acides gras

X.1.1. La synthèse cytoplasmique de l’acide palmitique

X.1.1.1. La formation du malonyl coenzyme A
 118

X.1.1.2.Acylcarrienprotein
119
 120

X.1.1.3. Les étapes de la biosynthèse de l’acide palmitique

121
 122

X.1.1.4. Bilan de la synthèse de l’acide palmitique

 123

X.2. Formation des triglycérides

 124

X.3. Formation des phosphoglycerolipides

 125

XI. METABOLISMEDESPROTEINES
Une protéine est une molécule comportant de l’azote et composée d’une séquence
d’acides aminés (au nombre de 20) reliés par des liaisons peptidiques. La séquence
détermine la structure primaire de la protéine. La configuration de la chaine
peptidique dans l’espace détermine les structures secondaires et tertiaires.
L’association de plusieurs chaînes peptidiques détermine la structure quaternaire.
Par convention, une protéine comportant moins de 50 acides aminés est appelée
peptide. La taille d’une protéine est extrêmement variable de quelques centaines à
plusieurs millions de kilo-daltons. De même, les protéines ont de très nombreuses
fonctions : protéines de structure (collagène...), protéines contractiles (myosine...),
protéines de transport (albumine...), protéines immunitaires (immunoglobulines),
protéines enzymatiques, hormones, etc.
 126

XI.1 Catabolisme des acides aminés dans la cellule animale

XI.1.1.la désamination oxydative
127
 128

XI.1.2. Décarboxylation des aminoacides

 129

XI.1.3. Destinéesde la copule carbonée

 130

Exemple

XI. 2.Synthèse des protéines

XI.2.1. Quelques définitions
 Acide désoxyribonucléiques
 131

• L’acide désoxyribonucléique (ADN ou DNA) est constitué de deux chaînes

de nucléosides monophosphates liés chacun par une liaison ester entre son
carbone 3’ (alcool secondaire) et le carbone 5’ (alcool primaire) du
nucléotide suivant.
• Ces deux chaînes de nucléotides sont unies entre elles par des liaisons
hydrogènes pour former un hybride en forme de double hélice (modèle de
J.D. Watson et F.H.C. Crick, 1953) dont les deux brins sont :
— antiparallèles : l’un est constitué d’un enchaînement commençant à
gauche et se poursuivant vers la droite, l’autre commençant à droite et se
poursuivant vers la gauche ;
— complémentaires : chaque adénine (A) d’un des deux brins est liée par
deux liaisons hydrogène avec une thymine (T) de l’autre brin, et chaque
guanine (G) d’un brin est liée par trois liaisons hydrogène avec une cytosine
(C) de l’autre brin.
• De sorte que si on désigne les nucléotides par les lettres A, C, G et T en
fonction des bases azotées qu’ils contiennent, on peut lire sur cette figure le
texte suivant :

 Un gène :

Un gène est une séquence de nucléotides de l’acide désoxyribonucléique contenant

l’information nécessaire pour la synthèse d’un acide ribonucléique ou une protéine
 132

• Pour permettre la biosynthèse d’une protéine, il doit y avoir dans la structure du

DNA d’un sujet, une séquence de nucléotides qui constitue le gène de cette
protéine.

• Dans la séquence du gène on distingue des séquences en amont (éléments

régulateurs, promoteur), un site d’initiation de la transcription, une suite variable
d’exons et d’introns : exons non-traduits ou traduits, introns comportant
éventuellement d’autres séquences régulatrices, et enfin la fin de la transcription à
la fin du dernier exon.
• L’ensemble des mécanismes qui à partir de la séquence du gène conduisent à la
production d’un acide ribonucléique ou d’une protéine est désigné sous le terme
d’expression de ce gène.
 133

Expression d’un gène :

L’expression d’un gène est une suite de synthèses chimiques et de réactions

aboutissant à la production d’un acide ribonucléique ou d’une protéine.
 Un codon :
 134

Un codon est un ensemble de trois nucléotide de la séquence nucléiques

d’un acide nucléique portant l’information génétique permettant
l’incorporation d’un acide aminé dans la séquence primaire d’une protéine
 Code génétique :

• La séquence codante est une suite de codons dont chacun permet d’incorporer
spécifiquement un acide aminé dans la synthèse d’une protéine.
• Le code génétique est le même pour tous les êtres vivants de la biosphère
(universel). Il existe quelques variations (codons propres à la biosynthèse des
protéines dans les mitochondries).

• Le code génétique comporte 61 codons pour signifier les 20 acides aminés

qui participent à la synthèse des protéines : chaque acide aminé peut être codé
par plusieurs codons (de un à six) qui diffèrent en général par leur troisième
nucléotide. On dit que le code est dégénéré.
 135

 Code dégénéré :

• En écrivant le code génétique dans l’autre sens, de l’acide aminé vers les codons,
on montre que beaucoup d’acides aminés ont des codons homonymes.
• Certains ont six codons différents, d’autres quatre, trois ou deux.

XI.2.2. La Transcription
La transcription est la lecture par une ARN- polymérase qui synthétise un acide
ribonucléique dont la structure primaire reproduit celle du brin « sens » de ce gène

• L’expression du génome aboutit à la synthèse dans les cellules de

macromolécules acides nucléiques et protéines, dont la structure primaire est
déterminée par celle du DNA.
• Cette expression se fait par deux mécanismes principaux :
— la structure primaire du DNA s’exprime d’abord par la synthèse d’acides
ribonucléiques dont la structure primaire est parallèle à celle du DNA. C’est la
transcription.
 136

— la structure transcrite sur certains RNA, dits « messagers », s’exprime enfin par
la synthèse de protéines dont la structure primaire traduit en acides aminés
l’information portée par la structure primaire du DNA. C’est la traduction

• La transcription est conduite par plusieurs enzymes :

— RNA-polymérase I qui synthétise les RNA cytoplasmiques : RNA ribosomiques
(18 S5,8 S- 28 S) — RNA-
polymérase II qui synthétise les RNA messagers qui contiennent l’information
destinée à la traduction et certains des snRNA
— RNA-polymérase III qui synthétise les petits RNA (tRNA, rRNA 5 S, snRNA,
7SLRNA).

XI.2.3. La Traduction
La traduction est la lecture d’un ARN –messager par des ribosomes qui
synthétisent des protéines dont la structure primaire est déterminée par celle de ce
ARN –messager.

• La traduction est faite dans le cytoplasme des cellules :

— soit pour libérer des protéines cytoplasmiques,
— soit pour conduire ces protéines dans les membranes ou les organites de la
cellule (reticulum endoplasmique, appareil de Golgi, membrane plasmique,
lysosomes, mitochondries, noyau, etc...), — soit
pour excréter ces protéines à travers les membranes vers l’extérieur de la cellule
 137

• L’expression d’un gène est une suite de synthèses chimiques et de réactions

aboutissant à la production d’un acide ribonucléique ou d’une protéine.
• Dans un premier temps a lieu la synthèse d’un acide ribonucléique, dont la
séquence est complémentaire d’un des deux brins du gène donc identique à celle de
l’autre brin: c’est la transcription.
• La séquence de l’acide ribonucléique est identique à celle du brin sens et orientée
dans le même sens. Elle se construit de 5’ vers 3’ en complémentarité de celle qui
est « lue » sur le brin antisens.

• Après des réactions de maturation le transcrit primaire (RNA) devient RNA

messager (mRNA) et sort du noyau vers le cytoplasme.
• Dans le second temps, le RNA messager est « lu » par groupe de trois nucléotides
(lettres) grâce à un RNA complémentaire qui porte l’acide aminé correspondant.
• La « lecture » du mRNA se fait de 5’ vers 3’ et la synthèse de la protéine se fait
en même temps de l’extrémité NH2 terminale vers l’extrémité COOH terminale.
• Après des réactions de maturation, la protéine « mature » est prête à remplir sa
fonction dans la cellule.